View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0172_low_7 (Length: 374)

Name: NF0172_low_7
Description: NF0172
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0172_low_7
NF0172_low_7
[»] chr3 (63 HSPs)
chr3 (13-369)||(12497799-12498155)
chr3 (13-362)||(14876729-14877078)
chr3 (13-369)||(17489401-17489757)
chr3 (13-369)||(16370964-16371320)
chr3 (13-369)||(16492404-16492760)
chr3 (13-369)||(16807149-16807505)
chr3 (13-362)||(16691711-16692060)
chr3 (13-369)||(9522270-9522626)
chr3 (25-369)||(10905773-10906117)
chr3 (13-361)||(15348476-15348824)
chr3 (25-369)||(10005163-10005507)
chr3 (25-363)||(48425010-48425348)
chr3 (20-369)||(26792622-26792971)
chr3 (25-369)||(13252253-13252597)
chr3 (25-369)||(15589615-15589959)
chr3 (25-369)||(16635336-16635680)
chr3 (25-369)||(43162660-43163004)
chr3 (13-369)||(15402733-15403089)
chr3 (13-369)||(15725157-15725512)
chr3 (13-369)||(16412505-16412861)
chr3 (25-369)||(20062277-20062621)
chr3 (13-369)||(53385241-53385597)
chr3 (13-369)||(5425153-5425508)
chr3 (13-369)||(15208442-15208798)
chr3 (13-369)||(15338820-15339176)
chr3 (13-369)||(6600298-6600654)
chr3 (13-369)||(16756808-16757164)
chr3 (40-369)||(15247725-15248054)
chr3 (31-321)||(15227228-15227518)
chr3 (40-314)||(13972387-13972661)
chr3 (13-356)||(14571409-14571752)
chr3 (31-356)||(13322877-13323202)
chr3 (49-356)||(15953193-15953500)
chr3 (14-349)||(10383531-10383866)
chr3 (31-356)||(18134571-18134896)
chr3 (14-349)||(47123506-47123841)
chr3 (201-369)||(15015967-15016135)
chr3 (40-314)||(14086261-14086535)
chr3 (13-341)||(10420285-10420613)
chr3 (49-356)||(8759307-8759614)
chr3 (79-314)||(12850546-12850781)
chr3 (49-356)||(13941621-13941928)
chr3 (49-356)||(41177119-41177426)
chr3 (13-355)||(11303999-11304341)
chr3 (28-314)||(16329926-16330212)
chr3 (31-348)||(12360775-12361092)
chr3 (28-303)||(11961312-11961587)
chr3 (13-356)||(44776808-44777151)
chr3 (40-314)||(16836777-16837045)
chr3 (188-349)||(18748401-18748562)
chr3 (172-335)||(8274656-8274819)
chr3 (49-321)||(16381190-16381459)
chr3 (172-349)||(16742946-16743123)
chr3 (13-157)||(31945033-31945177)
chr3 (13-155)||(31689049-31689191)
chr3 (172-349)||(15576470-15576647)
chr3 (172-335)||(13975302-13975465)
chr3 (250-335)||(17192892-17192977)
chr3 (250-335)||(6712666-6712751)
chr3 (10-66)||(320781-320836)
chr3 (188-335)||(267515-267662)
chr3 (13-74)||(12854365-12854426)
chr3 (322-359)||(14183145-14183182)
[»] chr5 (62 HSPs)
chr5 (13-369)||(23573606-23573962)
chr5 (13-364)||(23440089-23440440)
chr5 (13-362)||(18775641-18775990)
chr5 (48-361)||(20798659-20798972)
chr5 (13-369)||(21984471-21984827)
chr5 (13-369)||(23516405-23516761)
chr5 (13-361)||(25423053-25423401)
chr5 (13-369)||(22134532-22134888)
chr5 (13-369)||(14999905-15000261)
chr5 (13-369)||(22333053-22333409)
chr5 (13-369)||(27610218-27610574)
chr5 (13-369)||(27685566-27685922)
chr5 (13-369)||(19769824-19770180)
chr5 (13-369)||(37291662-37292018)
chr5 (25-369)||(40708656-40709000)
chr5 (13-369)||(27668656-27669012)
chr5 (25-369)||(34566370-34566714)
chr5 (27-369)||(26738871-26739213)
chr5 (25-369)||(16356378-16356722)
chr5 (13-369)||(27518271-27518627)
chr5 (13-369)||(41770706-41771062)
chr5 (38-369)||(22348314-22348643)
chr5 (13-359)||(23471093-23471439)
chr5 (13-369)||(29476239-29476595)
chr5 (13-356)||(20468275-20468618)
chr5 (92-362)||(21498209-21498479)
chr5 (13-254)||(20573385-20573626)
chr5 (25-227)||(21343666-21343868)
chr5 (40-356)||(23442472-23442788)
chr5 (31-356)||(21890938-21891263)
chr5 (31-356)||(24735790-24736115)
chr5 (31-356)||(24749733-24750058)
chr5 (31-347)||(22461816-22462132)
chr5 (50-321)||(21564180-21564451)
chr5 (31-309)||(24737011-24737289)
chr5 (13-321)||(28923982-28924290)
chr5 (10-356)||(22236099-22236445)
chr5 (13-349)||(20773606-20773942)
chr5 (13-321)||(28895156-28895464)
chr5 (14-349)||(37545682-37546018)
chr5 (14-349)||(14887177-14887512)
chr5 (13-275)||(21662300-21662561)
chr5 (28-364)||(21404715-21405035)
chr5 (28-314)||(24798618-24798904)
chr5 (14-314)||(25847922-25848222)
chr5 (14-349)||(20342129-20342464)
chr5 (31-349)||(20821317-20821635)
chr5 (28-349)||(23080275-23080596)
chr5 (225-369)||(21339452-21339596)
chr5 (49-275)||(21665761-21665986)
chr5 (28-314)||(22381060-22381346)
chr5 (28-314)||(22502540-22502826)
chr5 (49-356)||(17269512-17269819)
chr5 (172-349)||(11210880-11211057)
chr5 (172-335)||(24581216-24581379)
chr5 (172-335)||(27011089-27011252)
chr5 (172-335)||(21937388-21937551)
chr5 (188-349)||(23503464-23503625)
chr5 (13-98)||(21625382-21625467)
chr5 (223-341)||(25244546-25244664)
chr5 (223-341)||(25308698-25308816)
chr5 (280-314)||(21831964-21831998)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (13-369)||(16355169-16355525)
chr4 (13-369)||(16252169-16252525)
chr4 (13-369)||(12523608-12523964)
chr4 (13-369)||(14680499-14680855)
chr4 (13-362)||(18227177-18227526)
chr4 (46-359)||(15149740-15150053)
chr4 (13-369)||(7090365-7090720)
chr4 (13-369)||(19778517-19778873)
chr4 (25-369)||(23955691-23956035)
chr4 (25-369)||(12476544-12476888)
chr4 (25-369)||(18297149-18297493)
chr4 (13-356)||(14652240-14652583)
chr4 (25-369)||(8386356-8386700)
chr4 (13-369)||(14303702-14304057)
chr4 (13-369)||(27711268-27711624)
chr4 (25-369)||(29039128-29039472)
chr4 (13-362)||(14159424-14159773)
chr4 (13-362)||(40472972-40473321)
chr4 (13-369)||(14851090-14851446)
chr4 (13-369)||(14266623-14266979)
chr4 (13-369)||(8053347-8053703)
chr4 (25-278)||(15364330-15364583)
chr4 (31-356)||(15003361-15003686)
chr4 (13-194)||(14927158-14927339)
chr4 (216-369)||(16676427-16676580)
chr4 (14-349)||(3264798-3265133)
chr4 (28-356)||(15070360-15070688)
chr4 (14-349)||(11207235-11207570)
chr4 (31-356)||(16145862-16146187)
chr4 (31-314)||(1649316-1649599)
chr4 (13-356)||(15245856-15246199)
chr4 (14-349)||(29453541-29453876)
chr4 (197-320)||(15415059-15415182)
chr4 (28-347)||(33222865-33223184)
chr4 (28-314)||(20890930-20891215)
chr4 (225-362)||(1640156-1640293)
chr4 (28-349)||(44661870-44662191)
chr4 (49-356)||(51606178-51606485)
chr4 (13-98)||(18607825-18607910)
chr4 (130-356)||(15359087-15359313)
chr4 (172-349)||(27900477-27900654)
chr4 (172-335)||(16445230-16445393)
chr4 (148-358)||(9849473-9849683)
chr4 (188-349)||(12132413-12132574)
chr4 (174-335)||(55375376-55375537)
chr4 (172-335)||(13247736-13247899)
chr4 (172-335)||(15293175-15293338)
chr4 (49-260)||(42702871-42703082)
chr4 (172-335)||(14997407-14997570)
chr4 (153-314)||(16752665-16752826)
chr4 (172-335)||(9290926-9291089)
chr4 (68-194)||(18164348-18164474)
chr4 (181-364)||(18550049-18550234)
chr4 (31-123)||(15415209-15415301)
chr4 (241-359)||(8706078-8706196)
chr4 (271-356)||(15077825-15077910)
chr4 (250-335)||(12342881-12342966)
chr4 (13-146)||(15319515-15319648)
chr4 (188-349)||(16685361-16685522)
chr4 (13-45)||(15351934-15351966)
chr4 (31-84)||(15359326-15359379)
[»] chr8 (66 HSPs)
chr8 (13-362)||(30313578-30313927)
chr8 (13-362)||(16408479-16408828)
chr8 (13-369)||(15533378-15533734)
chr8 (13-369)||(19977965-19978321)
chr8 (13-369)||(21166964-21167320)
chr8 (13-369)||(32600142-32600498)
chr8 (13-369)||(22046372-22046727)
chr8 (13-362)||(22164625-22164974)
chr8 (13-369)||(21250940-21251295)
chr8 (13-362)||(22133475-22133824)
chr8 (13-369)||(21394292-21394648)
chr8 (13-369)||(21788785-21789141)
chr8 (13-369)||(17674450-17674806)
chr8 (13-369)||(23650039-23650395)
chr8 (13-322)||(22032030-22032339)
chr8 (13-369)||(21922162-21922518)
chr8 (25-369)||(19112700-19113044)
chr8 (13-369)||(20018177-20018533)
chr8 (13-369)||(19485297-19485653)
chr8 (13-369)||(22120601-22120957)
chr8 (13-369)||(22987199-22987555)
chr8 (13-254)||(15441179-15441420)
chr8 (28-356)||(20396565-20396893)
chr8 (13-288)||(23948887-23949162)
chr8 (13-356)||(21681910-21682253)
chr8 (162-369)||(22377880-22378087)
chr8 (162-369)||(22384055-22384262)
chr8 (49-321)||(20388133-20388405)
chr8 (31-314)||(20010382-20010665)
chr8 (31-356)||(20007866-20008191)
chr8 (13-356)||(23654925-23655268)
chr8 (31-314)||(1266255-1266538)
chr8 (14-349)||(6679110-6679445)
chr8 (13-356)||(21840415-21840758)
chr8 (13-349)||(22061880-22062216)
chr8 (31-314)||(19851427-19851710)
chr8 (31-314)||(19857463-19857746)
chr8 (31-356)||(21324849-21325175)
chr8 (14-314)||(804155-804455)
chr8 (31-350)||(31416920-31417239)
chr8 (14-314)||(14565141-14565441)
chr8 (14-349)||(6603657-6603992)
chr8 (49-356)||(31571282-31571589)
chr8 (28-314)||(29303908-29304194)
chr8 (13-287)||(16265127-16265401)
chr8 (253-352)||(23949158-23949257)
chr8 (28-314)||(12304771-12305057)
chr8 (14-290)||(28982356-28982632)
chr8 (14-290)||(28987576-28987852)
chr8 (172-338)||(21196960-21197126)
chr8 (172-349)||(20652780-20652957)
chr8 (170-314)||(22051018-22051162)
chr8 (172-335)||(21850798-21850961)
chr8 (14-225)||(27347225-27347436)
chr8 (291-369)||(18856853-18856931)
chr8 (172-335)||(16877556-16877719)
chr8 (188-335)||(22315364-22315511)
chr8 (318-369)||(22040162-22040213)
chr8 (172-335)||(22982593-22982756)
chr8 (181-362)||(19863223-19863404)
chr8 (181-362)||(19867860-19868041)
chr8 (248-335)||(22283229-22283316)
chr8 (223-358)||(24818054-24818189)
chr8 (198-341)||(25282314-25282457)
chr8 (273-335)||(23157472-23157534)
chr8 (13-45)||(22179309-22179341)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (13-369)||(65369-65724)
scaffold0042 (13-221)||(39924-40132)
scaffold0042 (271-369)||(39806-39904)
[»] chr2 (53 HSPs)
chr2 (13-369)||(21325790-21326146)
chr2 (13-369)||(22756987-22757343)
chr2 (13-369)||(24675052-24675408)
chr2 (13-369)||(24708006-24708362)
chr2 (13-369)||(23188571-23188927)
chr2 (37-369)||(23063664-23063996)
chr2 (19-361)||(21145562-21145904)
chr2 (25-369)||(16924835-16925179)
chr2 (25-369)||(16998575-16998919)
chr2 (13-369)||(24261933-24262289)
chr2 (25-369)||(16981727-16982071)
chr2 (25-369)||(17063292-17063636)
chr2 (13-369)||(24709596-24709952)
chr2 (13-369)||(44386093-44386449)
chr2 (25-369)||(9609711-9610055)
chr2 (13-369)||(24878519-24878875)
chr2 (13-369)||(27370832-27371188)
chr2 (13-364)||(22325385-22325736)
chr2 (25-369)||(10868425-10868769)
chr2 (25-369)||(27217591-27217935)
chr2 (13-324)||(23138600-23138911)
chr2 (13-324)||(23550390-23550701)
chr2 (13-277)||(27377087-27377351)
chr2 (25-369)||(17066953-17067294)
chr2 (112-364)||(24825811-24826063)
chr2 (13-321)||(23087013-23087321)
chr2 (28-355)||(30211455-30211782)
chr2 (33-359)||(45529100-45529420)
chr2 (40-314)||(27365658-27365932)
chr2 (14-349)||(31830222-31830557)
chr2 (13-356)||(23276339-23276682)
chr2 (31-356)||(23293539-23293864)
chr2 (28-349)||(11358418-11358739)
chr2 (13-190)||(41609047-41609224)
chr2 (14-314)||(20832549-20832849)
chr2 (14-349)||(1063315-1063650)
chr2 (49-356)||(27787340-27787647)
chr2 (49-356)||(12573952-12574259)
chr2 (51-290)||(24653946-24654185)
chr2 (273-334)||(27368391-27368452)
chr2 (172-335)||(22276001-22276164)
chr2 (190-349)||(25128387-25128546)
chr2 (28-110)||(24833356-24833438)
chr2 (172-335)||(12640477-12640640)
chr2 (49-221)||(24944966-24945138)
chr2 (172-335)||(24831745-24831908)
chr2 (188-335)||(22762127-22762274)
chr2 (13-57)||(45676685-45676729)
chr2 (274-349)||(23817597-23817672)
chr2 (188-349)||(24570212-24570373)
chr2 (13-56)||(23599834-23599877)
chr2 (263-335)||(14708900-14708972)
chr2 (34-74)||(17967577-17967617)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (13-369)||(14323-14679)
scaffold0044 (13-369)||(583-939)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (15-363)||(278823-279171)
scaffold0005 (13-356)||(164709-165052)
scaffold0005 (13-369)||(308622-308978)
scaffold0005 (13-356)||(260271-260614)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (13-359)||(17319-17665)
chr7 (13-369)||(11553095-11553451)
chr7 (13-369)||(12687422-12687778)
chr7 (13-369)||(14954541-14954897)
chr7 (13-362)||(15154652-15155001)
chr7 (13-369)||(8707526-8707882)
chr7 (13-369)||(15161050-15161406)
chr7 (13-369)||(18551751-18552107)
chr7 (25-369)||(8198561-8198905)
chr7 (13-369)||(10870916-10871272)
chr7 (13-369)||(14332318-14332674)
chr7 (13-369)||(11237206-11237562)
chr7 (13-364)||(14037728-14038079)
chr7 (13-364)||(14347758-14348109)
chr7 (13-369)||(18177663-18178019)
chr7 (13-369)||(13685984-13686341)
chr7 (25-369)||(44791344-44791688)
chr7 (13-363)||(23516768-23517118)
chr7 (13-358)||(15203800-15204145)
chr7 (79-356)||(15624539-15624816)
chr7 (31-356)||(12206784-12207109)
chr7 (13-355)||(15102586-15102928)
chr7 (31-356)||(19147151-19147476)
chr7 (31-356)||(20746550-20746875)
chr7 (13-314)||(14264270-14264571)
chr7 (28-364)||(21661900-21662233)
chr7 (31-356)||(11388412-11388736)
chr7 (31-314)||(16072320-16072603)
chr7 (14-349)||(49152224-49152559)
chr7 (14-314)||(11306289-11306589)
chr7 (31-314)||(8212154-8212437)
chr7 (31-356)||(13665493-13665813)
chr7 (205-364)||(35964848-35965007)
chr7 (269-369)||(9596234-9596334)
chr7 (49-356)||(16950455-16950762)
chr7 (49-356)||(18053937-18054244)
chr7 (10-356)||(6413430-6413776)
chr7 (241-359)||(11772244-11772362)
chr7 (13-314)||(14129795-14130096)
chr7 (13-314)||(14433613-14433914)
chr7 (49-356)||(14286360-14286667)
chr7 (28-349)||(13021294-13021615)
chr7 (49-320)||(23199763-23200034)
chr7 (49-320)||(23505890-23506161)
chr7 (28-349)||(12455640-12455960)
chr7 (172-349)||(4440008-4440185)
chr7 (188-335)||(14936443-14936590)
chr7 (133-349)||(26118596-26118812)
chr7 (49-356)||(1391-1698)
chr7 (13-74)||(12254326-12254387)
chr7 (172-333)||(21674562-21674723)
chr7 (49-314)||(26288063-26288327)
chr7 (172-335)||(7823980-7824143)
chr7 (172-335)||(12368603-12368766)
chr7 (172-335)||(27107801-27107964)
chr7 (188-335)||(15364036-15364183)
chr7 (181-364)||(41144-41327)
chr7 (172-349)||(17923760-17923938)
chr7 (190-347)||(12193654-12193811)
chr7 (188-349)||(45146652-45146812)
chr7 (49-160)||(15340454-15340565)
chr7 (31-155)||(15479323-15479447)
chr7 (192-332)||(17145288-17145428)
chr7 (187-357)||(5764588-5764758)
chr7 (187-352)||(20466877-20467041)
chr7 (188-335)||(13353247-13353394)
chr7 (28-107)||(26118817-26118896)
chr7 (273-349)||(13378879-13378955)
chr7 (252-314)||(12456940-12457002)
chr7 (248-349)||(23641673-23641774)
chr7 (248-320)||(5432638-5432710)
chr7 (13-45)||(13634038-13634070)
chr7 (250-314)||(15340590-15340654)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (13-369)||(17045071-17045427)
chr1 (13-369)||(19106314-19106670)
chr1 (13-369)||(16078708-16079045)
chr1 (13-369)||(20249797-20250153)
chr1 (13-369)||(20136725-20137081)
chr1 (13-369)||(16350655-16351011)
chr1 (13-369)||(33391085-33391441)
chr1 (13-362)||(50620307-50620656)
chr1 (13-369)||(21747482-21747837)
chr1 (13-369)||(51333549-51333905)
chr1 (13-369)||(21830250-21830606)
chr1 (13-356)||(19760935-19761278)
chr1 (13-369)||(21836897-21837253)
chr1 (13-369)||(41354525-41354881)
chr1 (36-369)||(16369267-16369600)
chr1 (13-239)||(50612602-50612828)
chr1 (31-356)||(19664945-19665270)
chr1 (13-167)||(21163227-21163381)
chr1 (49-341)||(20940147-20940439)
chr1 (31-356)||(19854279-19854604)
chr1 (31-347)||(20856839-20857155)
chr1 (14-314)||(37677027-37677328)
chr1 (28-314)||(20294374-20294660)
chr1 (28-314)||(31550292-31550578)
chr1 (13-349)||(22433192-22433528)
chr1 (148-314)||(11382676-11382842)
chr1 (28-314)||(20075170-20075456)
chr1 (79-356)||(20835957-20836237)
chr1 (132-356)||(41307891-41308115)
chr1 (49-303)||(20244183-20244437)
chr1 (172-335)||(20831482-20831645)
chr1 (172-335)||(46518827-46518990)
chr1 (14-224)||(20395194-20395404)
chr1 (172-349)||(20914316-20914493)
chr1 (13-95)||(24476927-24477009)
chr1 (188-341)||(21202371-21202524)
chr1 (273-338)||(22135645-22135710)
chr1 (248-340)||(20184364-20184456)
chr1 (172-234)||(22142232-22142294)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (15-362)||(12497824-12498171)
chr6 (15-362)||(12510730-12511077)
chr6 (13-369)||(19864483-19864839)
chr6 (15-362)||(12505153-12505500)
chr6 (13-369)||(16963496-16963852)
chr6 (13-369)||(25765419-25765774)
chr6 (13-369)||(5839348-5839704)
chr6 (13-369)||(16927769-16928125)
chr6 (19-369)||(1543213-1543563)
chr6 (13-307)||(21833172-21833466)
chr6 (13-369)||(25609990-25610346)
chr6 (13-363)||(22078823-22079173)
chr6 (13-369)||(18408072-18408428)
chr6 (13-369)||(23078265-23078621)
chr6 (13-369)||(24313297-24313653)
chr6 (13-369)||(16626846-16627202)
chr6 (13-369)||(28263326-28263682)
chr6 (13-369)||(28342075-28342431)
chr6 (25-369)||(29592049-29592393)
chr6 (13-369)||(25112348-25112704)
chr6 (13-362)||(27331569-27331918)
chr6 (13-362)||(27392309-27392658)
chr6 (13-369)||(27187232-27187588)
chr6 (13-369)||(27261652-27262008)
chr6 (13-369)||(2874932-2875288)
chr6 (13-369)||(22762584-22762940)
chr6 (13-369)||(28292501-28292857)
chr6 (13-237)||(17032358-17032582)
chr6 (39-369)||(18197676-18198006)
chr6 (28-314)||(21471412-21471698)
chr6 (13-150)||(22433793-22433930)
chr6 (13-308)||(25750605-25750900)
chr6 (31-349)||(15459150-15459468)
chr6 (40-314)||(14131363-14131637)
chr6 (49-314)||(25768023-25768288)
chr6 (13-356)||(22796774-22797117)
chr6 (31-314)||(18794504-18794787)
chr6 (31-314)||(19879112-19879395)
chr6 (40-314)||(21564316-21564590)
chr6 (28-349)||(10468998-10469319)
chr6 (67-314)||(34645770-34646017)
chr6 (42-314)||(11287782-11288054)
chr6 (28-349)||(24364223-24364544)
chr6 (42-314)||(11280689-11280961)
chr6 (275-369)||(22433927-22434021)
chr6 (223-323)||(11291818-11291918)
chr6 (100-356)||(17415369-17415625)
chr6 (31-349)||(8766297-8766615)
chr6 (49-356)||(27560759-27561066)
chr6 (145-356)||(18800870-18801081)
chr6 (115-356)||(14381609-14381850)
chr6 (162-321)||(1640717-1640876)
chr6 (172-349)||(25743236-25743413)
chr6 (171-295)||(25750900-25751024)
chr6 (172-335)||(16098005-16098168)
chr6 (172-335)||(23996203-23996366)
chr6 (172-335)||(16382536-16382699)
chr6 (49-356)||(28282955-28283262)
chr6 (188-335)||(18571622-18571769)
chr6 (172-349)||(18838057-18838234)
chr6 (190-338)||(25655456-25655604)
chr6 (188-335)||(1648947-1649094)
chr6 (31-138)||(18787702-18787809)
chr6 (172-349)||(15078513-15078690)
chr6 (188-335)||(21413101-21413248)
chr6 (175-349)||(16233167-16233341)
chr6 (31-128)||(1640613-1640710)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (13-369)||(33560-33916)
scaffold0109 (13-369)||(8559-8915)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (13-369)||(5977-6333)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (13-369)||(64018-64374)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (13-369)||(4392-4748)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (13-369)||(639-995)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (13-369)||(681-1036)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (13-361)||(5986-6334)
scaffold0120 (49-356)||(1524-1831)
scaffold0120 (172-349)||(22816-22993)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (13-369)||(180180-180536)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (13-369)||(5184-5540)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (13-369)||(127186-127542)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (19-369)||(43123-43473)
scaffold0028 (13-362)||(8448-8797)
scaffold0028 (216-350)||(13832-13966)
scaffold0028 (40-314)||(50556-50830)
scaffold0028 (172-335)||(106594-106757)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (13-369)||(219404-219760)
scaffold0012 (13-369)||(229006-229362)
scaffold0012 (172-335)||(33016-33179)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (13-369)||(810-1165)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (13-364)||(32744-33095)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (13-369)||(6335-6691)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (13-363)||(1102-1452)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (13-362)||(7340-7689)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (13-361)||(14002-14350)
scaffold0106 (13-340)||(31373-31700)
scaffold0106 (265-369)||(17657-17761)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (19-369)||(109798-110148)
scaffold0029 (31-314)||(112540-112823)
scaffold0029 (13-349)||(96009-96345)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (13-369)||(9306-9662)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (13-369)||(377-733)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (13-362)||(15456-15804)
scaffold0333 (227-362)||(15832-15967)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (13-369)||(14840-15196)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (13-312)||(26-325)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (13-347)||(16950-17284)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (13-359)||(16462-16808)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (13-314)||(27930-28231)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (13-364)||(448022-448373)
scaffold0001 (13-333)||(162076-162396)
scaffold0001 (49-356)||(90932-91239)
scaffold0001 (172-349)||(78636-78813)
scaffold0001 (139-214)||(175352-175427)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (13-369)||(6900-7258)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (13-347)||(3995-4329)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (115-369)||(21932-22186)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (25-359)||(26530-26864)
scaffold0011 (13-356)||(195703-196045)
scaffold0011 (31-314)||(148551-148834)
scaffold0011 (13-221)||(68575-68783)
scaffold0011 (172-335)||(121971-122134)
scaffold0011 (273-335)||(180147-180209)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (114-369)||(7854-8109)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (25-347)||(3115-3437)
[»] scaffold0877 (1 HSPs)
scaffold0877 (26-364)||(252-590)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (13-356)||(15079-15422)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (13-364)||(12969-13320)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (13-356)||(111984-112327)
scaffold0004 (13-314)||(203510-203811)
scaffold0004 (49-356)||(322703-323010)
scaffold0004 (14-356)||(117532-117874)
scaffold0004 (28-349)||(385797-386118)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (49-359)||(1-311)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (63-362)||(49506-49805)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (13-347)||(968-1301)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (28-356)||(116905-117233)
scaffold0037 (172-335)||(98137-98300)
scaffold0037 (172-236)||(23586-23650)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (13-364)||(16408-16759)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (28-356)||(886-1214)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (28-356)||(25719-26047)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (13-235)||(16920-17142)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (28-359)||(25068-25399)
scaffold0234 (172-314)||(16213-16355)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (28-359)||(5588-5918)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (175-361)||(7522-7708)
[»] scaffold0507 (3 HSPs)
scaffold0507 (127-364)||(9047-9284)
scaffold0507 (13-125)||(6940-7052)
scaffold0507 (172-338)||(351-517)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (28-364)||(86496-86832)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (151-369)||(767-985)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (31-321)||(10774-11064)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (49-356)||(47123-47430)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (40-356)||(26132-26448)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (49-356)||(3874-4181)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (13-356)||(13901-14244)
scaffold0034 (85-349)||(4960-5224)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (31-356)||(27500-27825)
scaffold0139 (13-356)||(1149-1491)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (13-356)||(18537-18880)
scaffold0326 (13-74)||(3637-3698)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (13-356)||(9761-10099)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (49-320)||(28805-29076)
scaffold0064 (49-320)||(40796-41067)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (31-349)||(10090-10408)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (13-355)||(13362-13704)
scaffold0298 (13-355)||(17132-17474)
scaffold0298 (40-314)||(19973-20247)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (40-356)||(21671-21987)
scaffold0235 (248-335)||(26004-26091)
[»] scaffold0058 (4 HSPs)
scaffold0058 (94-314)||(58448-58668)
scaffold0058 (50-349)||(19120-19419)
scaffold0058 (188-341)||(74038-74191)
scaffold0058 (28-86)||(59042-59100)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (49-356)||(51863-52170)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (49-356)||(37201-37508)
scaffold0026 (130-350)||(38180-38400)
scaffold0026 (130-310)||(27383-27563)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (40-314)||(7078-7352)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (13-355)||(10851-11193)
scaffold0124 (40-355)||(400-715)
scaffold0124 (172-335)||(7831-7994)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (49-314)||(5956-6220)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (13-356)||(14049-14391)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (31-314)||(18830-19113)
scaffold0090 (133-314)||(23094-23275)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (31-356)||(79-404)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (31-350)||(3872-4191)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (31-349)||(6164-6483)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (13-356)||(42333-42676)
scaffold0010 (13-356)||(47399-47742)
scaffold0010 (152-230)||(2252-2330)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (31-321)||(172-462)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (40-314)||(1211-1485)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (64-214)||(4567-4717)
scaffold0023 (13-128)||(36974-37089)
scaffold0023 (250-369)||(4441-4560)
scaffold0023 (49-98)||(18996-19045)
scaffold0023 (265-320)||(58969-59024)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (31-356)||(27207-27531)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (60-356)||(4760-5056)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (49-356)||(5002-5309)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (31-350)||(14257-14576)
scaffold0203 (31-194)||(9039-9202)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (13-356)||(49033-49376)
scaffold0053 (13-314)||(57859-58159)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (49-356)||(2750-3057)
scaffold0035 (187-362)||(13189-13364)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (40-314)||(33719-33993)
scaffold0076 (172-335)||(40380-40543)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (13-349)||(61220-61556)
scaffold0067 (13-349)||(52186-52522)
scaffold0067 (49-349)||(67608-67908)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (31-314)||(509-792)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (13-356)||(39702-40045)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (40-258)||(1167-1385)
scaffold0165 (13-74)||(26203-26264)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (31-349)||(49214-49532)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (31-314)||(25907-26190)
scaffold0113 (28-314)||(16654-16940)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (14-314)||(38929-39229)
[»] scaffold0114 (4 HSPs)
scaffold0114 (31-338)||(20103-20410)
scaffold0114 (16-349)||(43471-43804)
scaffold0114 (16-349)||(44483-44816)
scaffold0114 (31-214)||(36036-36219)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (28-314)||(16755-17041)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (28-349)||(26239-26560)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (49-349)||(248612-248912)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (13-260)||(4235-4482)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (271-369)||(3706-3804)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (49-356)||(7238-7543)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (49-356)||(12781-13088)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (172-350)||(1916-2094)
[»] scaffold1032 (1 HSPs)
scaffold1032 (49-194)||(2028-2173)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (51-349)||(42784-43082)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (188-349)||(14661-14822)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (205-349)||(1241-1385)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (301-369)||(12738-12806)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (49-229)||(13380-13560)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (13-209)||(136082-136278)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (15-110)||(6238-6333)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (172-335)||(46276-46439)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (148-314)||(5311-5477)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (172-335)||(3281-3444)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (181-356)||(1-176)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (188-349)||(1061-1222)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (172-349)||(393-570)
[»] scaffold0551 (1 HSPs)
scaffold0551 (172-349)||(8217-8394)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (174-335)||(23518-23679)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (172-349)||(13030-13207)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (13-74)||(7498-7559)
scaffold0101 (271-341)||(5467-5537)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (172-335)||(3896-4059)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (172-335)||(28287-28450)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (172-326)||(940-1094)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (188-349)||(8898-9059)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (172-349)||(14779-14956)
scaffold0132 (249-349)||(43737-43837)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (172-335)||(14758-14921)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (265-356)||(3355-3446)
scaffold0222 (13-137)||(3487-3611)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (172-335)||(24002-24165)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (188-320)||(10493-10625)
scaffold0447 (188-320)||(5879-6011)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (188-349)||(9125-9286)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (40-137)||(45835-45932)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (188-320)||(8488-8620)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (197-349)||(13398-13550)
scaffold0021 (273-349)||(71442-71518)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (188-335)||(3965-4112)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (248-349)||(1431-1532)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (175-335)||(10781-10941)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (248-335)||(26178-26265)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (13-118)||(9182-9287)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (283-338)||(14370-14425)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (273-335)||(18332-18394)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (172-349)||(10891-11068)
[»] scaffold1508 (1 HSPs)
scaffold1508 (31-107)||(886-962)
[»] scaffold1068 (1 HSPs)
scaffold1068 (248-338)||(820-910)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 63)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 12497799 - 12498155
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12497799 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 12497898  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12497899 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 12497998  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12497999 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12498098  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12498099 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12498155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 14877078 - 14876729
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14877078 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 14876979  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14876978 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14876879  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876878 cacaggagtaactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14876779  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14876778 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtctgctgaacaatctc 14876729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 17489401 - 17489757
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489401 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 17489500  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17489501 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 17489600  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17489601 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17489700  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17489701 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 17489757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 16370964 - 16371320
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16370964 acatcatcactctggatcacatgagatggatctagaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgacatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16371063  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16371064 ccactcaatacgccaccgtcccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16371163  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371164 cacaggagtgactctcaaaaacacgtagtcttcttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16371263  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16371264 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16371320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16492760 - 16492404
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  16492760 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16492661  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  16492660 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgactttaaagctcgtccaacaccagt 16492561  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16492560 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16492461  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16492460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 16492404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16807505 - 16807149
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16807505 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacataattccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 16807406  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16807405 ccactcgatacgccaccgttccaaattttttcgatatctgatacggaccgaaaaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 16807306  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  16807305 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataattcttctgtcgactttgcgacgctttc 16807206  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16807205 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16807149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 16691711 - 16692060
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16691711 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16691810  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16691811 ccacacgatatgccaccgttccaaccctttccgatatttgatacgacccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16691910  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16691911 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcttgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 16692010  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16692011 attttctcttgaatcatcttaactttttcagtagtctgctgaacaatctc 16692060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 9522270 - 9522626
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  9522270 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaaac 9522369  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9522370 ccactcggtacgccaccgttccaactctttttgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9522469  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9522470 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaagtcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 9522569  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  9522570 atcttttcttgaatcattttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 9522626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 10905773 - 10906117
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  10905773 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10905872  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10905873 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10905972  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10905973 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10906072  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10906073 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10906117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15348824 - 15348476
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  15348824 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 15348725  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15348724 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15348625  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348624 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15348525  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15348524 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatct 15348476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 10005163 - 10005507
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  10005163 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 10005262  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10005263 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10005362  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  10005363 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 10005462  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10005463 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10005507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 48425010 - 48425348
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  48425010 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 48425109  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48425110 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 48425209  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  48425210 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 48425309  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48425310 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 48425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26792971 - 26792622
Alignment:
Q  20 cactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcg 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||  |||||||    
T  26792971 cactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaatccactcg 26792872  T
Q  120 atacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacagga 219  Q
     || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  26792871 gtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacactagtcatagga 26792772  T
Q  220 gtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 319  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26792771 gtgactcttaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttct 26792672  T
Q  320 cttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  26792671 cttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 26792622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 13252253 - 13252597
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  13252253 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 13252352  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  13252353 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 13252452  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  13252453 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttcattttctcttgg 13252552  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13252553 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13252597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15589959 - 15589615
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  15589959 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15589860  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15589859 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15589760  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15589759 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 15589660  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15589659 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15589615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 16635336 - 16635680
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  16635336 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16635435  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16635436 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16635535  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16635536 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16635635  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16635636 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16635680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 43162660 - 43163004
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  43162660 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 43162759  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  43162760 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 43162859  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  43162860 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 43162959  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43162960 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15403089 - 15402733
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |    
T  15403089 acatcgtcactctggattacatgagatggatctggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15402990  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  15402989 ccactcggtaagccaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacatcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15402890  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402889 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaaaatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15402790  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15402789 attttctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15402733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15725512 - 15725157
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15725512 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15725413  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  15725412 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgt 15725313  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15725312 cataggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 15725213  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15725212 attttctcttggatcatccgaa-tttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15725157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16412861 - 16412505
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16412861 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatggaaaacgttgtccaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16412762  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16412761 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16412662  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  16412661 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcatgaaactcaaggtcattcctacgcttatcatgataactcttttgccaactctgcgacgctttc 16412562  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16412561 attttctcttggatcatctgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16412505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20062621 - 20062277
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  20062621 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 20062522  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20062521 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagtcataggagtgac 20062422  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20062421 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 20062322  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20062321 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20062277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 53385597 - 53385241
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  53385597 acatcgtcgctctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 53385498  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  53385497 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaactttttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 53385398  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385397 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 53385298  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53385297 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 53385241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5425508 - 5425153
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  5425508 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 5425409  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5425408 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 5425309  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5425308 cataggagtgactctc-aaagcacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 5425210  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5425209 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5425153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15208442 - 15208798
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| |||| |    
T  15208442 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggttgtaaac 15208541  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  15208542 ccactcgatactccaccgttccaattctttctgatatctgattcggaccaataaacctcggagtcaacttcttttacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15208641  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15208642 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaatgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 15208741  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15208742 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15208798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15338820 - 15339176
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |    
T  15338820 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 15338919  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  15338920 ccactcggtaagctaccgttccaattctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacgccagt 15339019  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15339020 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15339119  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  15339120 atttgctcttggatcatctgaaccttctcagtagtttgatgaacaatctctggtcct 15339176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 6600298 - 6600654
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  6600298 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 6600397  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  6600398 ccactcggtaagccaccgtcccaactttttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 6600497  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6600498 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttgaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 6600597  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6600598 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 6600654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16757164 - 16756808
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16757164 acatcgtcactctgaatgacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16757065  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | || ||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16757064 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatatgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16756965  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16756964 cataggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgccttc 16756865  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16756864 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16756808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 40 - 369
Target Start/End: Original strand, 15247725 - 15248054
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15247725 ggatccagaacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggttgtaaacccactcgatacgccaccgttccaattc 15247824  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  15247825 tttccgatatctaatacggaccaatacacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaatacatg 15247924  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 339  Q
     ||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  15247925 atctccttcttgaaactcattgtttttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttc 15248024  T
Q  340 tcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15248025 tcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15248054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Original strand, 15227228 - 15227518
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15227228 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15227327  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15227328 ttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 15227427  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15227428 aaacacatggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttctct 15227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13972661 - 13972387
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13972661 ggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 13972562  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    |||| || |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  13972561 tttctgaaatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 13972462  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13972461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 13972387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 14571409 - 14571752
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| || |||||||  || |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||| || |    
T  14571409 acatcatctctcgggataacatgcgaaggatccgctacgtacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaagc 14571508  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  14571509 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttaggagtcaaattcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14571608  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14571609 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcacggtaactcttcagtcgactctgcgacgctttc 14571708  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  14571709 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtggtctgatgaac 14571752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13323202 - 13322877
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| || || |  | ||| ||||| |    
T  13323202 acatgcgacggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatggaatacaccatgcaaattcgaaagatgtggtggaaaaccaatcctatatgccactg 13323103  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||  || ||| ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  13323102 ttccaatcctctccaatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 13323003  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||   ||||||    
T  13323002 aaacacatggtctccctcctgaaacccaagatctttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatcctttctatgatcatc 13322903  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  13322902 ttgactttctctgtagtctgatgaac 13322877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15953500 - 15953193
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |||||||| || || ||||    
T  15953500 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactgttccaaccctctcagata 15953401  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| || || ||||| ||    
T  15953400 tctgatacgaaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcgtacacccgtcataggagtaaatctcagaaatacatgatctccctc 15953301  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  15953300 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctctgtagtc 15953201  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  15953200 tgatgaac 15953193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 10383531 - 10383866
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  10383531 catcatccctcgggatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgtggtggcaaacc 10383630  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||| |||    
T  10383631 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 10383730  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  10383731 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 10383830  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  10383831 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 10383866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18134896 - 18134571
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  18134896 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactg 18134797  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||     
T  18134796 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtaactctcag 18134697  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| ||  | || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||     
T  18134696 aaatacaagatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctccgatcatt 18134597  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || ||||| || |||||||| |||||    
T  18134596 ttgactttatctgtagtctgatgaac 18134571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 47123506 - 47123841
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  47123506 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacctccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 47123605  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  47123606 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 47123705  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||||||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  47123706 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 47123805  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  47123806 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 47123841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15016135 - 15015967
Alignment:
Q  201 tccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactc 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15016135 tccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactc 15016036  T
Q  301 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||| |||||   ||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15016035 tgagacgctttcatcttctccctaatcaacttaaccttctctgtagtttgttgaacaatttctggtcct 15015967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Original strand, 14086261 - 14086535
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  14086261 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 14086360  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14086361 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 14086460  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14086461 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 14086535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10420613 - 10420285
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  10420613 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 10420514  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | | || ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  10420513 caattctatacgccacagttccgactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 10420414  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10420413 cataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 10420314  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
    || ||||||  ||||||| | ||||||||    
T  10420313 atcttctctctaatcatcctgactttctc 10420285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8759614 - 8759307
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  8759614 acatacttccgcagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 8759515  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  8759514 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 8759415  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  8759414 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 8759315  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  8759314 tcctgaac 8759307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12850781 - 12850546
Alignment:
Q  79 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtca 178  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| || |||| ||||||  |||||||||    
T  12850781 acatcatgcaaattccaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtca 12850682  T
Q  179 acttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 278  Q
    ||||||| ||||||||  |||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| | ||||||||||||||  | ||  | ||||| ||    
T  12850681 acttcttagacttcaacgcacgacctatacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatcttcctcttgaaactcaagggcctttattcgcttgtc 12850582  T
Q  279 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12850581 atggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcat 12850546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 13941621 - 13941928
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  13941621 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 13941720  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  13941721 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 13941820  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  13941821 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 13941920  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  13941921 tcctgaac 13941928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 41177119 - 41177426
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  41177119 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 41177218  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  41177219 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 41177318  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  41177319 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 41177418  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  41177419 tcctgaac 41177426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11304341 - 11303999
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||  | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  11304341 acatcatcactaggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacaagaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 11304242  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| |||||  ||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11304241 caactctatatgccactattccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgt 11304142  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||    ||||||| ||| || || || || ||||||||||||||| | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11304141 catagggaaaactctcagaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagagccttcatacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgacgctttc 11304042  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||| ||| ||||    
T  11304041 atcttttctcttatcatctttaccttctccgtagcctgatgaa 11303999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16330212 - 16329926
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  16330212 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 16330113  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16330112 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaactacctcgacttcaatgcacgtccaacacctgtcaaaggagtgaccct 16330013  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16330012 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctttgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgtgaagctttcat 16329926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12361092 - 12360775
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  12361092 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 12360993  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||  | || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | || |||||  ||||||| ||||  |||| || ||| |||||||     
T  12360992 ttccaaccttctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgatttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaactctcag 12360893  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||    ||||||    
T  12360892 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttttcccttatcatc 12360793  T
Q  331 ttaactttctcagtagtc 348  Q
    || |||||||| ||||||    
T  12360792 ttgactttctctgtagtc 12360775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 11961587 - 11961312
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || || || ||  | |||| ||| ||||    
T  11961587 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgggggcaaatcaactctataagcca 11961488  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |  |||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||| | ||||||||  ||||||  ||||  |||| ||||||||| ||    
T  11961487 ctattccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcctcgacttcaatgcacgtcgtacactcgtcaaaggagtgaccct 11961388  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 303  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11961387 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 11961312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 44776808 - 44777151
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  44776808 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 44776907  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||||||||| |  || || || ||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  44776908 caactctatatgccaccgttccgatcctctctgaaatctgatacgggccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacctgt 44777007  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||||||||| | ||| || || || || ||||| ||||||||  | ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44777008 catcggagtgactcttagaaatacatgatcaccctcttggaactcaagggccttcctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 44777107  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || ||||||   |||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  44777108 atcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtctcctgaac 44777151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16837045 - 16836777
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |      |||| ||||| || || |||| ||| | |||||||||||  |    
T  16837045 ggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagt------ggtgtggtggcaaaccaactctatatgtcaccgttccaatcc 16836952  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || || ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||    
T  16836951 tctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatg 16836852  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  16836851 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 16836777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 18748401 - 18748562
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||| || || ||  ||||||||||||  |  ||||| | |||||||||||||||    
T  18748401 acttcaaagcacgtccaacaccagttacagggttcactcttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgttcttcctcctcttatcatgataact 18748500  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18748501 cttctgtctactctgagacactttcatcttatcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 18748562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8274819 - 8274656
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  8274819 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8274720  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8274719 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 8274656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 16381459 - 16381190
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  16381459 acatatttccgaagctgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 16381360  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| || || || || ||    
T  16381359 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttaaaaatacatgatcaccatc 16381260  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
      ||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16381259 ccgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactc---tgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 16381190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 16743123 - 16742946
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || |    
T  16743123 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgacactcaatatcctttctcc 16743024  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  16743023 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 16742946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Original strand, 31945033 - 31945177
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  31945033 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 31945132  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacg 157  Q
    | |||  ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31945133 caactttatatgccactgttccaaccctttctgatatctgatacg 31945177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31689191 - 31689049
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||  || |    
T  31689191 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgtcaaac 31689092  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgata 155  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  31689091 caactctatatgccactgttccaaccctttctgatatctgata 31689049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 15576470 - 15576647
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  15576470 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 15576569  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  15576570 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 15576647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13975465 - 13975302
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  13975465 ggagtcaacttcctacacttcaaaacacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 13975366  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13975365 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagatgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 13975302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Original strand, 17192892 - 17192977
Alignment:
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17192892 tgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 17192977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6712751 - 6712666
Alignment:
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6712751 tgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcttttgaatcatcttaac 6712666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 320781 - 320836
Alignment:
Q  10 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgc 66  Q
    ||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  320781 tggacatcatctctttggatcacg-gagatggatccggagcatacttccgaagttgc 320836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 267662 - 267515
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    ||||||||||| || |||||||  | || ||| | || ||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  267662 acttcaaatcatgttcaacaccgattactggattaaccctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaat 267563  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||  || | || ||| ||| ||||||| || || | ||||||||||||    
T  267562 ctcctgcctaccctgagacactttcatgttttcctaaatcatcttaac 267515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12854426 - 12854365
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12854426 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 12854365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14183182 - 14183145
Alignment:
Q  322 tgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14183182 tgaatcatcttaaccttctcaatagtctgctgaacaat 14183145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 23573606 - 23573962
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23573606 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23573705  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23573706 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23573805  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23573806 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23573905  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23573906 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23573962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 23440089 - 23440440
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23440089 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23440188  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23440189 cctctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcattgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23440288  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440289 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23440388  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23440389 attttctcttgaatcattttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 23440440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 290; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 18775641 - 18775990
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18775641 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 18775740  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  18775741 ccactcgatacatcaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcagggcacgtccaacaccagt 18775840  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18775841 cacaggagtgactctcaaaaagacgtggtctccctcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 18775940  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18775941 attctctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 18775990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 48 - 361
Target Start/End: Original strand, 20798659 - 20798972
Alignment:
Q  48 aacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgat 147  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  20798659 aacatatttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccaatcgatatgccaccggtccaactctttctgat 20798758  T
Q  148 atctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 247  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798759 atttgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 20798858  T
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20798859 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagt 20798958  T
Q  348 ctgctgaacaatct 361  Q
    ||||||||||||||    
T  20798959 ctgctgaacaatct 20798972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21984827 - 21984471
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21984827 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacctctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaaggtgcggtggtaatc 21984728  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21984727 ccactcgatacgccaccgttccagctctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccaat 21984628  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21984627 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccctcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 21984528  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21984527 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 21984471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 23516405 - 23516761
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23516405 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgggaaatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23516504  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23516505 caactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctaatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23516604  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23516605 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23516704  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23516705 atcttttcttgaatgatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatctctggtcct 23516761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 25423053 - 25423401
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25423053 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatagttccgaagttgcaacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25423152  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  25423153 ccacctgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaacttctttcacttcaacgcacgtccaacaccagt 25423252  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25423253 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 25423352  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  25423353 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 25423401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22134532 - 22134888
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22134532 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22134631  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  22134632 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 22134731  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134732 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22134831  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134832 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22134888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15000261 - 14999905
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15000261 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15000162  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15000161 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15000062  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15000061 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14999962  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14999961 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14999905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22333409 - 22333053
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  22333409 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 22333310  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22333309 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22333210  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22333209 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22333110  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22333109 attttctcttggatcatccggactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22333053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27610218 - 27610574
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  27610218 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagttgcggtggtaaac 27610317  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27610318 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27610417  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27610418 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcggcgctttc 27610517  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27610518 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27610574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27685922 - 27685566
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27685922 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27685823  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  27685822 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 27685723  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685722 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 27685623  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27685622 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27685566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19769824 - 19770180
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  19769824 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 19769923  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19769924 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19770023  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19770024 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19770123  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19770124 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19770180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37292018 - 37291662
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  37292018 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacttactttcgaagttgagacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 37291919  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  37291918 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttttttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 37291819  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37291818 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 37291719  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37291718 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 37291662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 40708656 - 40709000
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  40708656 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 40708755  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40708756 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 40708855  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  40708856 tctcaaaaacacgcggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 40708955  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40708956 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 40709000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27669012 - 27668656
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  27669012 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 27668913  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27668912 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27668813  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27668812 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27668713  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27668712 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27668656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 34566370 - 34566714
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  34566370 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 34566469  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  34566470 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 34566569  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  34566570 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 34566669  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34566670 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 34566714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 27 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26739213 - 26738871
Alignment:
Q  27 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcc 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  26739213 gatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcttgcaaattcgaaagatgcgttggtaaacccactcgatacgcc 26739114  T
Q  127 accgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 226  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26739113 accgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacatccaacaccagtcacaggagtgaccc 26739014  T
Q  227 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 326  Q
    ||||||| |  || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26739013 tcaaaaatatatgatctctttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 26738914  T
Q  327 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| ||||    
T  26738913 catcttaactttctcagtagtttgttgtacaatttctggtcct 26738871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 16356378 - 16356722
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  16356378 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggagaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 16356477  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  16356478 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 16356577  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16356578 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16356677  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16356678 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16356722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27518271 - 27518627
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  27518271 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgtgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27518370  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27518371 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27518470  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27518471 cataggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27518570  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27518571 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27518627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 41770706 - 41771062
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  41770706 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 41770805  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41770806 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41770905  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  41770906 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgccttc 41771005  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41771006 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 41771062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 22348314 - 22348643
Alignment:
Q  38 atggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  22348314 atggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtaggccaccgttccaac 22348413  T
Q  138 tctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacg 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  22348414 tctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacg 22348513  T
Q  238 tggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactt 337  Q
    |||||||||||  |||||||||||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22348514 tggtctccttcccgaaactcaaga--ttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgattctgcgacgctttaattttctcttgaatcatctgaactt 22348611  T
Q  338 tctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22348612 tctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 22348643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Original strand, 23471093 - 23471439
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |    
T  23471093 acatcatctctttggatcacatgtgatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcgttggtaaac 23471192  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23471193 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatacctgatacggaccaataaacctccaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 23471292  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||  |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23471293 cacttgagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtcttgcctacgcttatcatgattactcttttgccgactctgagacgctttc 23471392  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||    
T  23471393 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaat 23471439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29476595 - 29476239
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  29476595 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 29476496  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||    
T  29476495 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatacctgatatggaccaatgaacttcgtggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacatccgt 29476396  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  29476395 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgtgacgccttc 29476296  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29476295 attttctcttggatcatccgaactttttcagtagtctgttgaacaatctctggtcct 29476239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20468618 - 20468275
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  20468618 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 20468519  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||||||||| ||| | | ||||||  |||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20468518 ccactcaatacgccactgtttctattctttctaatatctgacacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20468419  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  20468418 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaattcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttcagtcaactctgcgacgctttc 20468319  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20468318 atcttttcttggatcaacttaacattctcagtagtttgctgaac 20468275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 92 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21498479 - 21498209
Alignment:
Q  92 tcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgactt 191  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21498479 tcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacaccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgactt 21498380  T
Q  192 caaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 291  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  21498379 caattcacgtccaacaccggtcacaagagtgactctcaaaactacatgatctccctcttgaaactcgatgtctatcctacgcttatcatggtaactcttt 21498280  T
Q  292 tgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  21498279 tgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctc 21498209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 20573385 - 20573626
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20573385 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 20573484  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20573485 ccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatatctgatacggaccaataaaccttgaagtcaacttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 20573584  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 254  Q
    ||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20573585 cagtggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaa 20573626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21343868 - 21343666
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21343868 tggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 21343769  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21343768 ccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaccagtcacaggagtgac 21343669  T
Q  225 tct 227  Q
    |||    
T  21343668 tct 21343666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23442788 - 23442472
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||   || ||||| |||||||| |    
T  23442788 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaaccactttgtatgccactgttccaaccc 23442689  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||| ||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23442688 tctcagataactgatacggaccaatgaactttggagtcaacatcttagacttcaacacacgtcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 23442589  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 339  Q
     ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||    
T  23442588 atctccctcttgaaactcaagagccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttc 23442489  T
Q  340 tcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||    
T  23442488 tctgtagtctgatgaac 23442472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21891263 - 21890938
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  21891263 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 21891164  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| |||||||||| ||| || |||||||     
T  21891163 ttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacatcctacaccagtcataggtgtaactctcag 21891064  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  21891063 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 21890964  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  21890963 ttgactttctctgtagtctgatgaac 21890938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24736115 - 24735790
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24736115 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24736016  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24736015 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24735916  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  24735915 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24735816  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24735815 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24735790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24750058 - 24749733
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24750058 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24749959  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24749958 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24749859  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  24749858 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 24749759  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  24749758 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 24749733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Original strand, 22461816 - 22462132
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  22461816 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 22461915  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  22461916 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 22462015  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||    
T  22462016 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctaatcatc 22462115  T
Q  331 ttaactttctcagtagt 347  Q
    || |||||||| |||||    
T  22462116 ttgactttctctgtagt 22462132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21564451 - 21564180
Alignment:
Q  50 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| || | |||||| || |||||    
T  21564451 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactgtccaaactctatcagatat 21564352  T
Q  150 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 249  Q
    |||||| |||| |||||| |  |||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||  |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21564351 ctgatatggaccaataaaccgtggagtcaaattcttagacttcaaagcacgactaacacgtgtcacatgagtgactctcagaaacacatggtctccttct 21564252  T
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  21564251 tgaaactcaaggtcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgccgactttgcgacactttcgtcttctct 21564180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 24737289 - 24737011
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  24737289 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 24737190  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  24737189 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaa 24737090  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 309  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24737089 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgct 24737011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28924290 - 28923982
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28924290 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28924191  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  28924190 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28924091  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28924090 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28923991  T
Q  313 attttctct 321  Q
    || ||||||    
T  28923990 atcttctct 28923982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22236445 - 22236099
Alignment:
Q  10 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggta 109  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  22236445 tggacatcatccctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 22236346  T
Q  110 atcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacacc 209  Q
    | || |||| ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||    
T  22236345 aaccaactctatatgacactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 22236246  T
Q  210 agtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 309  Q
     |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22236245 cgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgct 22236146  T
Q  310 ttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| ||||||   | |||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  22236145 ttcatcttctctctgaccatcttgactttctctgtagtctgatgaac 22236099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Original strand, 20773606 - 20773942
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20773606 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatctggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 20773705  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||| || || ||    
T  20773706 caactctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacgcccgt 20773805  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20773806 cataggagtaaccctcagaaaaacatggcccccttcctgaaactgaagctctttccgacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 20773905  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || ||||||  ||||||||| |||||||| |||||||    
T  20773906 atcttctctctaatcatcttgactttctctgtagtct 20773942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 28895464 - 28895156
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  28895464 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 28895365  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  28895364 caactctatacgccagagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 28895265  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28895264 cataggagtaactctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 28895165  T
Q  313 attttctct 321  Q
    || ||||||    
T  28895164 atcttctct 28895156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 37546018 - 37545682
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  37546018 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37545919  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37545918 aactctatatgccacagtaccaactctctcagaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37545819  T
Q  214 acaggagtgactctca-aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    | ||||||||| |||| |||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  37545818 aaaggagtgaccctcagaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactgttctgtcgactctgcgaagctttc 37545719  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  37545718 atcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 37545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 14887512 - 14887177
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  14887512 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14887413  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14887412 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14887313  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  14887312 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 14887213  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  14887212 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 14887177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21662561 - 21662300
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||| || |    
T  21662561 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccgatacatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaac 21662462  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||  |    
T  21662461 ccactctatacgtcattgttccaactctttccgatatctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctat 21662363  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgctt 275  Q
    || |||||||||||| | |||||| || ||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21662362 cataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttcttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21662300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Original strand, 21404715 - 21405035
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||| |||||| |    
T  21404715 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgtggtggtaaacccactctatacgcaa 21404814  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||||||||||| ||||||||||  | |||||| | ||||||||  |||||||| || |   ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21404815 ctgtcccaactctttccgaaatctgatacgagccaataaaccacggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 21404914  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     |||||||| || |||||||                 ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||| || |||  ||||    
T  21404915 aaaaaacacatgatctcctt----------------gttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacaccttcatattttctctaatc 21404998  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21404999 aacttaaccttctcagtagtctgttgaacaatgtctg 21405035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24798904 - 24798618
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24798904 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24798805  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24798804 cagtaccaactctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtcaaaggagtgactct 24798705  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  24798704 cagaaaaacatgatcaccctccagaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctcat 24798618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 25847922 - 25848222
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| |||||||||| |||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  25847922 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttctgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 25848021  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     ||||  || ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||  | || |||||| ||||||||||||| |||    
T  25848022 aactctgtatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaatttaggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtccaacacccgtc 25848121  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||||||||||||||| || || || || || |||||||||||||| ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25848122 aaaggagtgactctcaaaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 25848221  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  25848222 t 25848222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 20342129 - 20342464
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  20342129 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 20342228  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20342229 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacctgtc 20342328  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||| |||||||||| ||| || || || |  || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20342329 aaaggggtgactctcagaaaaacatgatcacgctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 20342428  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  20342429 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 20342464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 20821317 - 20821635
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || | || ||||||||| |    
T  20821317 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaattctatacgccacag 20821416  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20821417 ttccaaccctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 20821516  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || || ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  20821517 aaaaacatgatcaccttcctgaaattcaaggtctttcttacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 20821616  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||| |||||||    
T  20821617 ctaactttctctgtagtct 20821635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23080596 - 23080275
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||    
T  23080596 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggtaaaccaactctataagcca 23080497  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| |||| ||||||||| ||    
T  23080496 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcttacacccgtcataggagtgaccct 23080397  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||  ||  | || || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||    |||    
T  23080396 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactatagggcctttctccgcttgtcatgataactcttctgtcgaatctgcgacgctttcatcttttcccttatc 23080297  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  23080296 atcttgactttctcagtagtct 23080275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 225 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21339596 - 21339452
Alignment:
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  21339596 tctcaaaaatacttggtctcgttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttga 21339497  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  21339496 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 21339452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21665986 - 21665761
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21665986 acatatttccgaagttgcgacacttgaaatacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggcaaacccactctatacgtcattgttccaactctttccgata 21665887  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||||  || |||||| |||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||| | |||||| || ||| ||||    
T  21665886 tctgatac-aaccaataaacctcgaagtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctatcataggagtgactcttagaaacacatgatctgcttc 21665788  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgctt 275  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21665787 ttgaaattcaaggtctttcctacgctt 21665761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 22381060 - 22381346
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22381060 atcacatgtgacggatctgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 22381159  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  22381160 ccgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtgaccct 22381259  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22381260 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 22381346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 22502540 - 22502826
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  22502540 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 22502639  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  22502640 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 22502739  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  22502740 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcat 22502826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17269819 - 17269512
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || |    
T  17269819 acatacttccggagttgtgacacgtgaaatacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 17269720  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  17269719 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 17269620  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  17269619 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 17269520  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  17269519 tcctgaac 17269512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11211057 - 11210880
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  11211057 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatctttcctcc 11210958  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11210957 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcttaactttttccgtagtct 11210880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 24581216 - 24581379
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || || | ||||||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  24581216 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttacaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 24581315  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24581316 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24581379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 27011089 - 27011252
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  27011089 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 27011188  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27011189 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27011252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21937551 - 21937388
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  21937551 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 21937452  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21937451 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 21937388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 23503464 - 23503625
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    ||||||||  ||| |||||||| |||||| || | || || |||||||| || || ||   ||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  23503464 acttcaaaggacgaccaacaccggtcacatgattcaccctaaaaaacacatgatcaccaatttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 23503563  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  23503564 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 23503625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Original strand, 21625382 - 21625467
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaag 98  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || ||||||   |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21625382 acatcatctctcggaatcacatgcgaaggatccactacatactttcaaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaag 21625467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25244664 - 25244546
Alignment:
Q  223 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 322  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| | ||| |    ||||||||| ||||  |    
T  25244664 actctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatcttcttct 25244565  T
Q  323 gaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25244564 gaatcatcttaacattctc 25244546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 25308816 - 25308698
Alignment:
Q  223 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 322  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||||| ||| | ||| |    ||||||||| ||||  |    
T  25308816 actctcaaaaacacatgatctccaacttgaaactcaatatctttcatcctcttatgatgataactctcttgcctactgtcacgcgctttcatcttcttct 25308717  T
Q  323 gaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25308716 gaatcatcttaacattctc 25308698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21831998 - 21831964
Alignment:
Q  280 tgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21831998 tgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21831964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16355525 - 16355169
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16355525 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16355426  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16355425 ccactcgatacgccaccgttccaagtctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16355326  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16355325 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataattattttgtcgactctgcgacgctttc 16355226  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16355225 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16252525 - 16252169
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  16252525 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaatc 16252426  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16252425 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16252326  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16252325 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttt 16252226  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16252225 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaagaatctctggtcct 16252169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 12523608 - 12523964
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12523608 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 12523707  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  12523708 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12523807  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12523808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12523907  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12523908 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12523964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14680499 - 14680855
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14680499 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14680598  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  14680599 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttatttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14680698  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14680699 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctcgttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 14680798  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14680799 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14680855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18227526 - 18227177
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  18227526 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatacggtggtaatc 18227427  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18227426 ccactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18227327  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227326 cacaggagtgactctcaaaaacacgtgctctccttcctgaaactcaagattcttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18227227  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18227226 attttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtcttctgaacaatctc 18227177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 46 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15150053 - 15149740
Alignment:
Q  46 ggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccg 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15150053 ggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatcccactcgatacgtcaccgttccaactctttccg 15149954  T
Q  146 atatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15149953 atatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc 15149854  T
Q  246 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagta 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15149853 ttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcaata 15149754  T
Q  346 gtctgctgaacaat 359  Q
    ||||||||||||||    
T  15149753 gtctgctgaacaat 15149740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 7090365 - 7090720
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  7090365 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 7090464  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  7090465 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgagc-aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcatccaacaccagt 7090563  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7090564 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactcttcgacgctttc 7090663  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7090664 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7090720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19778873 - 19778517
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19778873 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19778774  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19778773 ccactcgataagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19778674  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778673 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19778574  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19778573 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19778517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 23955691 - 23956035
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  23955691 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttatgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 23955790  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23955791 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 23955890  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23955891 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgg 23955990  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23955991 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23956035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 12476544 - 12476888
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |    
T  12476544 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgatacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaacccactcggtaag 12476643  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12476644 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 12476743  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  12476744 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 12476843  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  12476844 atcatctgaacttcctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 12476888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 18297149 - 18297493
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  18297149 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 18297248  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18297249 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 18297348  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18297349 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 18297448  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18297449 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18297493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 14652240 - 14652583
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |    
T  14652240 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 14652339  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14652340 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14652439  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14652440 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14652539  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  14652540 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 14652583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 8386356 - 8386700
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  8386356 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8386455  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8386456 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8386555  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8386556 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8386655  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8386656 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8386700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14304057 - 14303702
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14304057 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14303958  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  14303957 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcgg-gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggt 14303859  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  14303858 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 14303759  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14303758 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14303702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27711268 - 27711624
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  27711268 acatcgtcactttgaattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 27711367  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27711368 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27711467  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27711468 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27711567  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27711568 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27711624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29039472 - 29039128
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  29039472 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29039373  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  29039372 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 29039273  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29039272 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29039173  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29039172 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29039128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 14159424 - 14159773
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14159424 acatcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttccgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14159523  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14159524 ccactcggtaagccaccgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 14159623  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||| |||||||  ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14159624 catgggagtaactctcaggaacacatgatctcctccttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 14159723  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  14159724 atcttctcttgaatcatcttaaccttttcagtagtctgttgaacaatctc 14159773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 40472972 - 40473321
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  40472972 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 40473071  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  40473072 ccactcggtaagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 40473171  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40473172 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 40473271  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40473272 attttctcttgaatcatttgaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 40473321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14851446 - 14851090
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14851446 acatcatctcttgggagcacatgagatggatccggaacatacttccgaatttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14851347  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  14851346 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcctatatctgatacggaccaataaacctcggagttaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccggt 14851247  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14851246 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtttttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14851147  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||| |||| ||||    
T  14851146 atcttctcttgtatcatcttaaccttctcaatagtttgttgaacaatttctggtcct 14851090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14266979 - 14266623
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  14266979 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 14266880  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  14266879 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcatacaccagt 14266780  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14266779 cataggggtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14266680  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||   ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14266679 attttctctcagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 14266623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8053703 - 8053347
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  8053703 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 8053604  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||| || || |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8053603 ccacacggtaagccatcgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8053504  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8053503 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctcttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8053404  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8053403 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 8053347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 278
Target Start/End: Original strand, 15364330 - 15364583
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  15364330 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacatatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 15364429  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15364430 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 15364529  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 278  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  15364530 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatc 15364583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15003686 - 15003361
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  15003686 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 15003587  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||  ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  15003586 ttccaactctctcagatatctgatatggatcaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcaa 15003487  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||   ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  15003486 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggattttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 15003387  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  15003386 ttgactttctccgtagtctgatgaac 15003361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14927339 - 14927158
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14927339 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14927240  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 194  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  14927239 ccactcagtacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaaattctttgacttcaa 14927158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 216 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16676580 - 16676427
Alignment:
Q  216 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16676580 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttgctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttcatt 16676481  T
Q  316 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16676480 ttctcttaaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16676427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3265133 - 3264798
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  3265133 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 3265034  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  3265033 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 3264934  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  3264933 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 3264834  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  3264833 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 3264798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 15070360 - 15070688
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  || ||||    
T  15070360 atcacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccaccctgtatgcca 15070459  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| ||  ||||||| || |||| ||||||  ||| |||||||||| |  |||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||    
T  15070460 ctgttccaactctctcaaatatctggtatggaccaataaacttcgtagtcaacttcataaacttcaacacacgacctacacccgtcataggagtgactct 15070559  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||    
T  15070560 cagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatc 15070659  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15070660 atcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15070688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11207570 - 11207235
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  11207570 catcatccctcggtatcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaacc 11207471  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11207470 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11207371  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||||||||||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11207370 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11207271  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  11207270 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 11207235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 16145862 - 16146187
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  16145862 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacag 16145961  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16145962 ttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16146061  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||| |    
T  16146062 aaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcacc 16146161  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  16146162 ttgactttctccgtagtctgatgaac 16146187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1649599 - 1649316
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1649599 acatgtgaaggatccgctacatacttccgtagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaacccaactctatatgccacag 1649500  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||  || || |||||||||||||||| ||| ||  | | |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |     
T  1649499 ttccaatcctctctgatatctgatacggaccaatgaacttggaagtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacacccgtcataggagtaactcttag 1649400  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1649399 aaatacatgatcgccctcctgaaactcaaggtccttcctccgcttgtcgtggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 1649316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 15245856 - 15246199
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| || |    
T  15245856 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15245955  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     |||||  || ||||| |||||||| || || | |||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  15245956 gcactctgtatgccactgttccaaccctctctgttatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15246055  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||| || ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||   | ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15246056 cataggggtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaaggccttcctacgtttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15246155  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||  |||||||| |||||    
T  15246156 atcttttctcttatcatctttaccttcttcgtagtctgatgaac 15246199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29453876 - 29453541
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  29453876 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 29453777  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| | || |||||||| |||    
T  29453776 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 29453677  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  29453676 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 29453577  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  29453576 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 29453541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 197 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15415182 - 15415059
Alignment:
Q  197 cacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcg 296  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15415182 cacgaccaacacctatcacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcg 15415083  T
Q  297 actctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  15415082 actctgcgacgctttcatcttctc 15415059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 347
Target Start/End: Original strand, 33222865 - 33223184
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  33222865 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatgttcgaaagatggggtggcaaaccaactctatatgcca 33222964  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| |  || ||||||||||||| ||| ||  | || ||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  33222965 ctgttccaactctctttgaaatctgatacggaccaatgaactttggtgtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcaaaggagtgaccct 33223064  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||    
T  33223065 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagttcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 33223164  T
Q  328 atcttaactttctcagtagt 347  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  33223165 aacttgactttctcagtagt 33223184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 20890930 - 20891215
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||  | ||| ||||    
T  20890930 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtgttggaaa-cccatcctatatgcca 20891028  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | |||||||| || || || |||||||||| || ||||||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20891029 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacgaaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20891128  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20891129 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20891215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 225 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 1640293 - 1640156
Alignment:
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1640293 tctcaaaaatacatgatctccttcttggaactcaaggtctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgccttcatcttttcttga 1640194  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1640193 atcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 1640156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44662191 - 44661870
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  44662191 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 44662092  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||   |||| |||||||| |||| |||||| || ||    
T  44662091 ctgttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtaaccct 44661992  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  44661991 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcacggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 44661892  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  44661891 aacctgactttctcagtagtct 44661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51606485 - 51606178
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  51606485 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 51606386  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  51606385 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 51606286  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  51606285 ttgaaactcaagggcctttctccgtttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 51606186  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  51606185 tcctgaac 51606178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 18607910 - 18607825
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaag 98  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18607910 acatcttcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaag 18607825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15359313 - 15359087
Alignment:
Q  130 gttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 229  Q
    |||||||| || || |||||||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||     
T  15359313 gttccaaccctctctgatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgatttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcg 15359214  T
Q  230 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 329  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||    
T  15359213 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgaaaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcat 15359114  T
Q  330 cttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15359113 ctttaccttctccgtagtctgatgaac 15359087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 27900477 - 27900654
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||  |||| |||||| || |||| ||| || || || || || ||||||||||| |||||||| |    
T  27900477 ggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgttctacactcgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctac 27900576  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  27900577 gcttgtcatgatagctcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 27900654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16445393 - 16445230
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| || || |||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  16445393 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 16445294  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16445293 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16445230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9849683 - 9849473
Alignment:
Q  148 atctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 247  Q
    |||||||| |||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |    |||||||||||||  || |||||      
T  9849683 atctgataaggaccaataaaacacggtgtcaacttcttggacttcaaagcacgaccaacaccggtcactaggtcaactctcaaaaacatttgatctccga 9849584  T
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    ||||||| |||| ||| |||||  | ||||||||| ||||||| |  | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||||    
T  9849583 cttgaaattcaatatccttcctctgtttatcatgacaactcttctacctactctacgatgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttctccatagt 9849484  T
Q  348 ctgctgaacaa 358  Q
    |||||||||||    
T  9849483 ctgctgaacaa 9849473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12132574 - 12132413
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| | |||||||||| ||||    
T  12132574 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgacaact 12132475  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| || | ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  12132474 cttctgcctactttgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 12132413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 55375537 - 55375376
Alignment:
Q  174 agtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgc 273  Q
    |||||||||| |  |||||||| | || ||||||||||| |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |    
T  55375537 agtcaacttcatacacttcaaagctcgaccaacaccagttacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctc 55375438  T
Q  274 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  55375437 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctactgaatcatcttaac 55375376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 13247736 - 13247899
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| || | ||||||||  ||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| |||||| || |    
T  13247736 ggagtcaacttcctacacttcaaagcaagaccaacaccgatcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcttttctcc 13247835  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13247836 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 13247899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15293338 - 15293175
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| || || ||| |||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  15293338 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccattcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 15293239  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15293238 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15293175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 260
Target Start/End: Original strand, 42702871 - 42703082
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  42702871 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 42702970  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  42702971 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttataaatacatgatcaccctc 42703070  T
Q  249 ttgaaactcaag 260  Q
    ||||||||||||    
T  42703071 ttgaaactcaag 42703082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 14997407 - 14997570
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  14997407 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaagattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14997506  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  14997507 tcttatcatgatgactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaac 14997570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Original strand, 16752665 - 16752826
Alignment:
Q  153 atacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttga 252  Q
    |||||||| ||| ||  ||||||| |||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || || |||    
T  16752665 atacggaccaatgaacttcggagttaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctga 16752764  T
Q  253 aactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16752765 aactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 16752826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 9290926 - 9291089
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| || | |||||| | ||||||||| | || |||||||| || || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  9290926 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacatcggtcacaggattcaccctcaaaaatacctgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 9291025  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9291026 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 9291089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18164474 - 18164348
Alignment:
Q  68 acacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaa 167  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||    
T  18164474 acacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaa 18164375  T
Q  168 tctcggagtcaacttctttgacttcaa 194  Q
      | ||||||| |||||| ||||||||    
T  18164374 ctttggagtcagcttcttagacttcaa 18164348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18550234 - 18550049
Alignment:
Q  181 ttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 280  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||  || |  | ||| |||||||| |    |||||| ||||||||||    
T  18550234 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaacaaatgatacctttcctgaaactccaatgatttccttcgcttatcat 18550135  T
Q  281 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat--tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    |||| |||||||||| | | || || ||||||||  | ||||| ||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||    
T  18550134 gatagctcttttgtctattttgtgatgctttcattctctctctcgaatcattttgactttttctgtcgtctgctgaacaatctctg 18550049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15415301 - 15415209
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatac 123  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||||||| ||||    
T  15415301 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaggatgtggtggcaaacccactctatac 15415209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 241 - 359
Target Start/End: Original strand, 8706078 - 8706196
Alignment:
Q  241 tctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 340  Q
    |||||||| | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||   || | ||||||||| |    
T  8706078 tctccttccttaaattcaaggtctttcctacgcttgtcgtgataactcttgtgtcgattctgcgacgctttcatcttttctcttattagcttaacttttt 8706177  T
Q  341 cagtagtctgctgaacaat 359  Q
    |  ||||||| ||||||||    
T  8706178 ctatagtctggtgaacaat 8706196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Original strand, 15077825 - 15077910
Alignment:
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15077825 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 15077910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12342966 - 12342881
Alignment:
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||| ||  ||||| | |||||||||||||||||| || | |||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  12342966 tgaaactcaatattcttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactctgagacgcccttatattctcttgaatcatcttaac 12342881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 15319515 - 15319648
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| ||||||| |||||| | || |||||||||| ||| ||||| || | ||| || |    
T  15319515 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttctgaagttgtgacacaggaaacacatcatgcagatttgaaagatgtgctggcaaac 15319614  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccga 146  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| |||||    
T  15319615 ccactctgtatgccactgttccaactctctccga 15319648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 16685361 - 16685522
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||  |||||||| || ||| || | |||||||||||| | || || ||  ||||||| | || ||| ||| | | ||||||||||||| |    
T  16685361 acttcaaagcacacccaacaccggttacatgattcactctcaaaaacccatgatcaccaacttgaaattaaatatccttcatcctcttatcatgataaat 16685460  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     || || | |||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  16685461 tttctgcctactctgagacgctctcatcttctcctgaatcatcttaactttcttcgtagtct 16685522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 15351966 - 15351934
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 45  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15351966 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 15351934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15359379 - 15359326
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatca 84  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15359379 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatca 15359326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 66)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 30313927 - 30313578
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30313927 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaatc 30313828  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30313827 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 30313728  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30313727 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 30313628  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30313627 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 30313578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16408828 - 16408479
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16408828 acatcatcactctggatcacatgagatagatccgggacacacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16408729  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16408728 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 16408629  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16408628 cacaagagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttggaacttaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacactttc 16408529  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408528 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 16408479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 15533378 - 15533734
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15533378 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 15533477  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15533478 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15533577  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15533578 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 15533677  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15533678 atcttctcttgtatcattttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 15533734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19977965 - 19978321
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19977965 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 19978064  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19978065 ccactcgttacgccaccgttccaactatttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 19978164  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19978165 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19978264  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19978265 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 19978321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21167320 - 21166964
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21167320 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatattttcgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaacc 21167221  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21167220 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 21167121  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21167120 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21167021  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21167020 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21166964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 32600142 - 32600498
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  32600142 acatcatcactttggatcacatgagatagatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagacgtggtggtaatc 32600241  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32600242 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 32600341  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32600342 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 32600441  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32600442 attttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctactgaacaatctctggtcct 32600498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22046372 - 22046727
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22046372 acatcatcactttg-atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22046470  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22046471 ctactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22046570  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22046571 cactggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctaaaactcaagatccttcctgcgtttatcatgataactcttttgtcgactatgcgacactttc 22046670  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22046671 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22046727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22164974 - 22164625
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22164974 acatcatcactttggatcacatgtgatggatccgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22164875  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22164874 ccactcgatgcgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttatttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22164775  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22164774 cacatgagtgactttcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22164675  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164674 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22164625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21250940 - 21251295
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21250940 acatcatcactttggatcacatgggatggatctggtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21251039  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21251040 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21251139  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21251140 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 21251239  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    | | |||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21251240 a-tctctctttaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 21251295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 22133824 - 22133475
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  22133824 acatcatcactttggatcacatgtgatggattcgggacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtattc 22133725  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22133724 cgactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 22133625  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||| |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22133624 cacatgagtgtctctcaaaaacacaatgtctccttcctgaaactcaagatctttcctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22133525  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22133524 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctc 22133475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21394648 - 21394292
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21394648 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21394549  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21394548 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21394449  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21394448 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21394349  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21394348 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21394292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21789141 - 21788785
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21789141 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttctgaagttgcgacacaggaaacacatcgtgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 21789042  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  21789041 ccactcggtacgccaccgttacgactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagaacgtccaacaccagt 21788942  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21788941 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcatgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 21788842  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21788841 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctaaacaatctctggtcct 21788785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17674806 - 17674450
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  17674806 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 17674707  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  17674706 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 17674607  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17674606 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 17674507  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17674506 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17674450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 23650039 - 23650395
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23650039 acattatcactttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcaacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23650138  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  23650139 caactcgataagccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 23650238  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  23650239 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttt 23650338  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23650339 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 23650395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 322
Target Start/End: Original strand, 22032030 - 22032339
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  22032030 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgaaacatggaaaacatcgtgtaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22032129  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22032130 ctactcgatacgccaacgtttcaactctttccgatatctgatacaaaccaataaatctcggagtcaatttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 22032229  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22032230 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccatcctaaaactcaagatccttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22032329  T
Q  313 attttctctt 322  Q
    ||||||||||    
T  22032330 attttctctt 22032339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21922518 - 21922162
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21922518 acatcatcgctttggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21922419  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  21922418 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaatatatctcggagtcaacttcttcgacttcaaagcttgtccaacaccagt 21922319  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21922318 cacatgagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtggactctgcgacactttc 21922219  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21922218 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21922162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 19112700 - 19113044
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  19112700 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 19112799  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19112800 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 19112899  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19112900 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 19112999  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  19113000 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaataatctctggtcct 19113044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20018533 - 20018177
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  20018533 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 20018434  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  20018433 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 20018334  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20018333 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctcaaattcaagatcttttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 20018234  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  20018233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 20018177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19485653 - 19485297
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  19485653 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 19485554  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19485553 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 19485454  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19485453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 19485354  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  19485353 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 19485297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22120957 - 22120601
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | |||||| ||||| ||||||||||| |    
T  22120957 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacgttgttcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 22120858  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  22120857 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttccttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 22120758  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22120757 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 22120658  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22120657 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgatcct 22120601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 22987199 - 22987555
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22987199 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtattacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22987298  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  22987299 ccactcgatacgccaccgttccaattctttatgatatctgatacggaccaataaacttcagagtcaacttctttgacttcaatgcatgtccaacatcagt 22987398  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22987399 cactggagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaaatcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgctttc 22987498  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||||| | |||||||    
T  22987499 atcttctcttgaatcatattatctttctcaatagtttgttgaacaatttatgctcct 22987555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 254
Target Start/End: Original strand, 15441179 - 15441420
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  15441179 acatcatcactttggatcacatgagatggatccaaaacatacttacgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaatc 15441278  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  15441279 aaacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagc 15441378  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15441379 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtcaccttcttgaaa 15441420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20396893 - 20396565
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20396893 atcacatgagatggatccgaaacacacttccgaagttgttacacatgaaatgcatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaacccactcgatacgcca 20396794  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |  || ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||  ||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20396793 ctatttcaattctttctgatatctgatacagaccaataaatcttagagtcagtttccttgacttcaatgcacgtcctacaccggtcacaggagtgactct 20396694  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||    
T  20396693 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataacacttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcgcatc 20396594  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | |||||| ||||||||||| || |||||    
T  20396593 aacttaaccttctcagtagtttgttgaac 20396565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 288
Target Start/End: Original strand, 23948887 - 23949162
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23948887 acatcatctcttgggatcacatgagactgatccgaaacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgaaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23948986  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||    
T  23948987 ccactcgctacgccaccgtactaattctttctgatatctgatacggaccaacaaacctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtctaaaaccagt 23949086  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  23949087 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtccttcctacgcttatcataataactc 23949162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21682253 - 21681910
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| || |    
T  21682253 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgtttcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 21682154  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  21682153 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 21682054  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21682053 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 21681954  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21681953 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaac 21681910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 162 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22378087 - 22377880
Alignment:
Q  162 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaga 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||||| |    
T  22378087 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaata 22377988  T
Q  262 tctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| |    
T  22377987 tctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaattt 22377888  T
Q  362 ctgctcct 369  Q
    ||| ||||    
T  22377887 ctggtcct 22377880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 162 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22384262 - 22384055
Alignment:
Q  162 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaga 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||||| |    
T  22384262 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcactggagtgaccctcaaaaatacatgatctgcttcctgaaactcaata 22384163  T
Q  262 tctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||| |    
T  22384162 tctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaaccttctccgtagtttgtttaacaattt 22384063  T
Q  362 ctgctcct 369  Q
    ||| ||||    
T  22384062 ctggtcct 22384055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 321
Target Start/End: Original strand, 20388133 - 20388405
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||| ||| | ||| || |||||||| || ||||    
T  20388133 acatacttccgaaattgcgacacattaaacacatcatgcacattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgtcactgtcccaactctctcagata 20388232  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||| ||| |||| |||||| |  || ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20388233 tctaatatggaccaataaaccgtggggtcaacttcttagacttcaaagcacgaccaacacctgtcactagagtgactctcagaaacacatggtctccttc 20388332  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20388333 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttctct 20388405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20010665 - 20010382
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  20010665 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 20010566  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||     
T  20010565 ttccaaccctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacccacacccgtcatcggagtgactctcag 20010466  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20010465 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcttacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 20010382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 20007866 - 20008191
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||| ||| ||||| |    
T  20007866 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtagcaaacccactctatatgccactg 20007965  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||| ||  | ||||||| ||| || ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  20007966 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaatgaactttggagtcaccttgttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 20008065  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||| ||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||   ||||||    
T  20008066 aaacacatgatctccctcttggaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactatgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20008165  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20008166 tttaccttctccgtagtctgatgaac 20008191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 23654925 - 23655268
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  23654925 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23655024  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||| |  |||  |||| |||| ||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23655025 ccaatatatataccactgttcaaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 23655124  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| |||||  || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23655125 cataggagtaactctcagaaacaaatgatctccgtcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgacgctttc 23655224  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23655225 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 23655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 1266255 - 1266538
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  1266255 acatgcgaaggatccgttacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 1266354  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||  ||||| |||||||     
T  1266355 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcag 1266454  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266455 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 1266538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 6679110 - 6679445
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  6679110 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6679209  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| |||    
T  6679210 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtc 6679309  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6679310 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6679409  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  6679410 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 21840415 - 21840758
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |    
T  21840415 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtggaatacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaac 21840514  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     |||||  || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||| ||| ||||| ||    
T  21840515 tcactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcagtgcacctcctacacctgt 21840614  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
     | |||||| ||||| | |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||     
T  21840615 tataggagtaactcttagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagtgccttccttcgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttt 21840714  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  21840715 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 21840758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22062216 - 22061880
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  22062216 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 22062117  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  22062116 caactctatatgccacagttccaaccctctctgatatttgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgt 22062017  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22062016 cataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22061917  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || || | |   |||||||| |||||||| |||||||    
T  22061916 atcttttttctgatcatcttgactttctctgtagtct 22061880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 19851427 - 19851710
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19851427 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19851526  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19851527 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19851626  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19851627 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19851710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 19857463 - 19857746
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||| |    
T  19857463 acatgcgaaggatccgctacgtactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgtatgccactg 19857562  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||| | ||||  |||||||||||||     
T  19857563 ttccaaccctctcagatatctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacaaccgtcaacggagtgactctcag 19857662  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19857663 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 19857746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21325175 - 21324849
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagg-tgcggtggtaatcccactcgatacgccacc 129  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | || ||||| || || |||| ||| |||||     
T  21325175 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatgatgtggtggcaaaccaactctatatgccact 21325076  T
Q  130 gttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 229  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||    
T  21325075 gttccaaccctctatgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctca 21324976  T
Q  230 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 329  Q
     ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||   |||||    
T  21324975 gaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgttttcatcttttctcttatcat 21324876  T
Q  330 cttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||    
T  21324875 cttgactttctctgtagtctgatgaac 21324849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 804455 - 804155
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  804455 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 804356  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  804355 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 804256  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  804255 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 804156  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  804155 t 804155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 31417239 - 31416920
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| ||  | |||| ||| ||||| |    
T  31417239 acatgcgaaggatccgctacatacttccgtagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagcaactctatatgccactg 31417140  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  31417139 ttccaaccctttctgaaatctaatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataagagtaactctcag 31417040  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca--ttttctcttgaatca 328  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||    
T  31417039 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttatccgcttatcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcaccttttccctt--atca 31416942  T
Q  329 tcttaactttctcagtagtctg 350  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  31416941 tcttgactttctcagtagtctg 31416920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 14565141 - 14565441
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  14565141 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacaaatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 14565240  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  14565241 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 14565340  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  14565341 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgaagctttca 14565440  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  14565441 t 14565441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 6603657 - 6603992
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  6603657 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 6603756  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || || |||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| | || |||||||| |||    
T  6603757 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatttgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 6603856  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  6603857 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 6603956  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  6603957 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 6603992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31571589 - 31571282
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  31571589 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 31571490  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  31571489 tctgatacgggccaatgaatttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 31571390  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  31571389 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 31571290  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  31571289 tcctgaac 31571282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29304194 - 29303908
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || ||||||   |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  29304194 atcacatgtgaaggatcctctacatacttcctaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagcca 29304095  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||| ||| || || |||||||||||||  || |   | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||  |||||||| ||    
T  29304094 ctgttccaattctctctgaaatctgatacggacctatgatctttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcattggagtgaccct 29303995  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29303994 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgaagctttcat 29303908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 16265401 - 16265127
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || || |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  16265401 acatcatccctttgaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 16265302  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  16265301 caactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacatccaacacccgt 16265202  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    || ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  16265201 caaaggagtgaccctcagaaagacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaact 16265127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 253 - 352
Target Start/End: Original strand, 23949158 - 23949257
Alignment:
Q  253 aactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 352  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23949158 aactcaaggtccttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatcatcttaactttctcagtagtttgct 23949257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 12304771 - 12305057
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  12304771 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 12304870  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||| |||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12304871 ctgtttcaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12304970  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12304971 aagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12305057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 28982356 - 28982632
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  28982356 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28982455  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  28982456 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28982555  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 290  Q
    |  |||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  28982556 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28982632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 290
Target Start/End: Original strand, 28987576 - 28987852
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  28987576 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatatttccgaagctgagaaacatgaaacacgtcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 28987675  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||| | ||||||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  28987676 aactctatatgccactgtaccaattctctctgaaatctgatacggtccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtc 28987775  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 290  Q
    |  |||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  28987776 aacggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactctt 28987852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21197126 - 21196960
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  ||||||||  ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||| || || ||| | |||||||||| ||| || || |    
T  21197126 ggagtcaacttcctacacttcaaagtacgaccaactccagttacaggattcactctcaaaaacacatgatcacctacctgaaactcaatatcctttctcc 21197027  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
     |||||||||||||||| | || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21197026 tcttatcatgataactcctctgccaactctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 21196960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 20652957 - 20652780
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | ||||||||||| || || || ||  |||||||||| | ||| || || |    
T  20652957 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactctatatcctttctcc 20652858  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  20652857 tcttataatgataactcttctgtccactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttctccgtagtct 20652780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 314
Target Start/End: Original strand, 22051018 - 22051162
Alignment:
Q  170 tcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcct 269  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||| || || || || ||||||||||||||  | |||||    
T  22051018 tcggagtcaacttccttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactttcaaaaatacatgatcaccctcttgaaactcaagggccttcct 22051117  T
Q  270 gcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  22051118 ccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 22051162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21850961 - 21850798
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||| | |    
T  21850961 ggagtcaacttcctacacttcaaatcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcatcc 21850862  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  21850861 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 21850798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 27347225 - 27347436
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||  || ||    
T  27347225 catcatccctcggaatcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgccaaacc 27347324  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||  ||| ||||| || ||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27347325 aactttatatgccactgtcccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 27347424  T
Q  214 acaggagtgact 225  Q
    | ||||||||||    
T  27347425 aaaggagtgact 27347436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 369
Target Start/End: Original strand, 18856853 - 18856931
Alignment:
Q  291 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18856853 ttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatccgaactttcttagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18856931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16877719 - 16877556
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  16877719 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 16877620  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16877619 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16877556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 22315364 - 22315511
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| || ||||| || |||||| | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  22315364 acttcaaagcacgacctacaccggttacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 22315463  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22315464 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22315511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 318 - 369
Target Start/End: Original strand, 22040162 - 22040213
Alignment:
Q  318 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22040162 ctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22040213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 22982593 - 22982756
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| ||||| || | ||||| |||||| | || || ||  | |||||||||| |||||| |  |    
T  22982593 ggagtcaacttctgacacttcaaagcacgaccaacaccaatcacatgattcactctaaaaaacgcatgatcaccaacctgaaactcaatatcttttcacc 22982692  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22982693 ttttatcatgataactcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22982756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 19863223 - 19863404
Alignment:
Q  181 ttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 280  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| |  |||||||    
T  19863223 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19863322  T
Q  281 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19863323 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19863404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 362
Target Start/End: Original strand, 19867860 - 19868041
Alignment:
Q  181 ttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 280  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| |  |||||||    
T  19867860 ttcttagacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatcgccttcctgaaactccaatgatttccttcttttatcat 19867959  T
Q  281 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||| ||||| ||||||| || || || || || |||||||||||||||||    
T  19867960 gatagctcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtctgctgaacaatctc 19868041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Original strand, 22283229 - 22283316
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||||| |  | |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  22283229 cttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataactcttctacctactctgagacactctcattttctcctgaatcatcttaac 22283316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 223 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 24818189 - 24818054
Alignment:
Q  223 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 322  Q
    ||||| |||||||| || ||| |  |||||||||||  ||||||||| | || |||||| |||||||| |  | |||||| |||| |||||| || || |    
T  24818189 actcttaaaaacacatgatcttcaacttgaaactcagtatctttccttctctcatcatggtaactcttcttcctactctgagacgatttcatcttttcct 24818090  T
Q  323 gaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 358  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||| |||||||    
T  24818089 gaatcatcttaaccttttatgtagtctgttgaacaa 24818054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 341
Target Start/End: Original strand, 25282314 - 25282457
Alignment:
Q  198 acgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcga 297  Q
    |||||||||||  || ||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||| |  || ||||| | ||||| |||||||||||| || | |    
T  25282314 acgtccaacactggttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcgatgtccttcctcctcttattatgataactcttctgccta 25282413  T
Q  298 ctctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||| | ||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25282414 ctccgagacactctcatcttctcttgaatgatcttaaccttctc 25282457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23157534 - 23157472
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||||||| | | || | |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23157534 cttatcatgataactcctctatctattctgagatgctttcatattctcttgaatcatcttaac 23157472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 22179341 - 22179309
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22179341 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 22179309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 65369 - 65724
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  65369 acatcatcact-tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 65467  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  65468 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacgccagt 65567  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65568 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 65667  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  65668 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 65724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40132 - 39924
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  40132 acatcatcactctggatcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaagacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 40033  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40032 caactcaatacgccaccgttccaactctttcccatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaaattctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 39933  T
Q  213 cacaggagt 221  Q
    |||||||||    
T  39932 cacaggagt 39924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 39904 - 39806
Alignment:
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  39904 cgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 39806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 53)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 21326146 - 21325790
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21326146 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21326047  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21326046 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 21325947  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21325946 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21325847  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  21325846 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtggtttgttgaacaatctctggtcct 21325790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22757343 - 22756987
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22757343 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22757244  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22757243 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgatttcaaagcacgtccaacaccagt 22757144  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22757143 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctctttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 22757044  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  22757043 atcttctcttgaatcaccttaactttctcagtaatctgttgaacaatctctggtcct 22756987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24675052 - 24675408
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24675052 acatcatcactctggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 24675151  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24675152 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24675251  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24675252 cacaggggtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 24675351  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24675352 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 24675408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24708362 - 24708006
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24708362 acatcatcactgtggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgtcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 24708263  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24708262 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaaaaaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 24708163  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24708162 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgatatttcttttgtcgactctgcgacgctttc 24708063  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24708062 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatttctggtcct 24708006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 23188571 - 23188927
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23188571 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 23188670  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23188671 tcactcgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 23188770  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23188771 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtctccttcctgacactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23188870  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23188871 attttctcttgaatctatttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 23188927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 37 - 369
Target Start/End: Original strand, 23063664 - 23063996
Alignment:
Q  37 gatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 136  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23063664 gatggatctggtacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaa 23063763  T
Q  137 ctctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 236  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  23063764 ctctttcagatatctgaaacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctaaaaaaaac 23063863  T
Q  237 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaact 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23063864 gtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacc 23063963  T
Q  337 ttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  23063964 ttctcggtagtttgttcaacaatctctggtcct 23063996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21145904 - 21145562
Alignment:
Q  19 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactc 118  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21145904 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 21145805  T
Q  119 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacagg 218  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||| |||    
T  21145804 gataagccatcgttccaactctttccaatatctgatacagatcaataaacttcggggtcaacttctttgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatagg 21145705  T
Q  219 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21145704 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 21145605  T
Q  319 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21145604 tcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctggacaatct 21145562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 16924835 - 16925179
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  16924835 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16924934  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16924935 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16925034  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16925035 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16925134  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16925135 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16925179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 16998575 - 16998919
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  16998575 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16998674  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16998675 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16998774  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16998775 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16998874  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16998875 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16998919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24261933 - 24262289
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |    
T  24261933 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaac 24262032  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24262033 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24262132  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262133 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24262232  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24262233 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24262289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 16981727 - 16982071
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  16981727 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 16981826  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  16981827 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 16981926  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16981927 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 16982026  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16982027 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 16982071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 17063292 - 17063636
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  17063292 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 17063391  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17063392 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17063491  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  17063492 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17063591  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17063592 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17063636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 24709596 - 24709952
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  24709596 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtacaaattcgcaagatgcggcggtaaac 24709695  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24709696 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctaatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24709795  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24709796 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24709895  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24709896 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24709952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44386449 - 44386093
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  44386449 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 44386350  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  44386349 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 44386250  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44386249 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 44386150  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44386149 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44386093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 9609711 - 9610055
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  9609711 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 9609810  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  9609811 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccggtcataggagtgac 9609910  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  9609911 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 9610010  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9610011 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 9610055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24878875 - 24878519
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  24878875 acatcgtcactctggattacttgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacagatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 24878776  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24878775 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 24878676  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24878675 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 24878576  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24878575 attttctcttgaatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24878519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27370832 - 27371188
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| |||||      
T  27370832 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaat 27370931  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  27370932 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacatcctacaccagt 27371031  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27371032 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 27371131  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27371132 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27371188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22325736 - 22325385
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  22325736 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 22325637  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22325636 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttgtttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 22325537  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22325536 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 22325437  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22325436 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctg 22325385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 10868425 - 10868769
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  10868425 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 10868524  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10868525 ccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 10868624  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||     
T  10868625 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgatagctcttttgtcgactctgcgacaccttcattttctcttgg 10868724  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10868725 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10868769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 27217591 - 27217935
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  27217591 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 27217690  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  27217691 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagtcataggagtgac 27217790  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27217791 tctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgt 27217890  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27217891 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaaaaatctctggtcct 27217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 23138600 - 23138911
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23138600 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23138699  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23138700 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23138799  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138800 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23138899  T
Q  313 attttctcttga 324  Q
    || || ||||||    
T  23138900 atcttttcttga 23138911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 324
Target Start/End: Original strand, 23550390 - 23550701
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23550390 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacaccatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23550489  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23550490 ctactcgatatgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 23550589  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23550590 cacaagagtgactctcaaaaatacctggtctccttcttgaaactcgaggtctttcgtacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 23550689  T
Q  313 attttctcttga 324  Q
    || || ||||||    
T  23550690 atcttttcttga 23550701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27377351 - 27377087
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  27377351 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 27377252  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  27377251 caacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 27377152  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttat 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27377151 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcccgcgcttat 27377087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 17066953 - 17067294
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |  ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||  | |    
T  17066953 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaag-tgcgacacatgaaaaacgt-gtgc-aattcgaaagatgcggcggtaaacccactcgtaaag 17067049  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17067050 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 17067149  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  17067150 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 17067249  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  17067250 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 17067294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24826063 - 24825811
Alignment:
Q  112 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccag 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  24826063 cccactcgatacgccaccgtcccaattctttctgatatctgatacgaaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccag 24825964  T
Q  212 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 311  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |  |||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24825963 tcacaggagtgactcttaaaaatacattatctccttcctaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcctttgtcgactctgcgacgcttt 24825864  T
Q  312 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24825863 catcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatttctg 24825811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 23087013 - 23087321
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  |||| ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  23087013 acatcatctcttgggataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 23087112  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||| ||    
T  23087113 acactctatacgccactgttccaactctctcagatatctgatatggaccaataaacctcggcgtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgt 23087212  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | || || | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23087213 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggacctttctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 23087312  T
Q  313 attttctct 321  Q
    || ||||||    
T  23087313 atcttctct 23087321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30211782 - 30211455
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |    
T  30211782 atcacatgagattgatccaaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccactttatacgcaa 30211683  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    ||   |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| || |   | ||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  30211682 ccaccccaactttttccgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcccgtccaacaccggtcacatgggtgactct 30211583  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||  ||||    
T  30211582 aaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcacggtaactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttttctctaatc 30211483  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  30211482 aacttaaccttctcagtagtctgttgaa 30211455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 359
Target Start/End: Original strand, 45529100 - 45529420
Alignment:
Q  33 atgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgtt 132  Q
    |||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| | || ||| |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||     
T  45529100 atgagagggatctgaaacatgcttccgaagttgtgacacatgaaacacatcacgtaagttcaaaagatgcagtggtaaacccactctatacgcaaccgtc 45529199  T
Q  133 ccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||||||||||  |||||||| || |   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45529200 ccaactctttccgaaatctgatatgggtcaataaacctcggagtcagtttctttgattttagcgcacgtccaacaccagtcacaagagtgactctcataa 45529299  T
Q  233 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctt 332  Q
    |||| |||      |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||  ||||| |||    
T  45529300 acacatgg------tcttcaaactcaagatccttcctaggcttatcatgataactcttttgtctactctgcgatgctttcatcttttctctaatcaactt 45529393  T
Q  333 aactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  45529394 aaccttcttagtagtctgttgaacaat 45529420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27365932 - 27365658
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27365932 ggattcggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaactctatacgccacagttccaactc 27365833  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    |||| || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27365832 tttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatg 27365733  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27365732 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 27365658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 31830222 - 31830557
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || ||    
T  31830222 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 31830321  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  31830322 aactctatatgccacagtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 31830421  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||||||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  31830422 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttca 31830521  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  31830522 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 31830557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 23276339 - 23276682
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  23276339 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 23276438  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||| ||||  | ||||||||  ||||||| |||||  |    
T  23276439 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcgacttactcgacttcaatgcacgtcccacacccat 23276538  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| | ||||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23276539 cataggagtaaatctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttc 23276638  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || ||||||   |||||| | |||||||| |||||||| |||||    
T  23276639 atcttctctctgatcatcatgactttctccgtagtctgatgaac 23276682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 23293539 - 23293864
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  23293539 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttagaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 23293638  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  23293639 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 23293738  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  23293739 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttccgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 23293838  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || ||||||||  ||||||| |||||    
T  23293839 ttgactttctctatagtctgatgaac 23293864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11358739 - 11358418
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  11358739 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 11358640  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||| | || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  11358639 ctgtaccaactttctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgactct 11358540  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  11358539 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 11358440  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  11358439 aacctgactttctcagtagtct 11358418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 41609224 - 41609047
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||  |||| |    
T  41609224 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccaaagttgcgacacgtggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggctgtaaac 41609125  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgact 190  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  41609124 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgact 41609047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 20832549 - 20832849
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  20832549 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 20832648  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| | || |||||||| |||    
T  20832649 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 20832748  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  20832749 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttca 20832848  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  20832849 t 20832849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 1063315 - 1063650
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||  |    
T  1063315 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaagc 1063414  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||| ||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| | || |||||||| |||    
T  1063415 aactctatatgccacagtaccaattctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtc 1063514  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  1063515 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctctca 1063614  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  1063615 tcttttctcttatcaaccttactttctcagtagtct 1063650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 27787340 - 27787647
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  27787340 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccgattctctctgaaa 27787439  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  27787440 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 27787539  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||| || ||||||    
T  27787540 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcaccttgactttttctgtagtc 27787639  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  27787640 tcctgaac 27787647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 12573952 - 12574259
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| |||||||| ||||  || || || |    
T  12573952 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccaatcctctctgaaa 12574051  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  || || || || | ||| || || || || ||    
T  12574052 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggggtaacccttagaaatacatgatcaccctc 12574151  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  12574152 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 12574251  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  12574252 tcctgaac 12574259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 290
Target Start/End: Original strand, 24653946 - 24654185
Alignment:
Q  51 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  |  | || |||    
T  24653946 atacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccttcactgaaatc 24654045  T
Q  151 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 250  Q
    |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || || |    
T  24654046 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcaagtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcct 24654145  T
Q  251 gaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactctt 290  Q
    ||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24654146 gaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactctt 24654185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 273 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27368452 - 27368391
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27368452 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaa 27368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 22276001 - 22276164
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |   ||||||| |||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  22276001 ggagtcaacttcctacccttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 22276100  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22276101 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 22276164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Original strand, 25128387 - 25128546
Alignment:
Q  190 ttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactct 289  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||  || ||||| |  | ||||||||||||||    
T  25128387 ttcaaagcgcgtccaacaccagtcacatggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatgtccttcctcctttcatcatgataactct 25128486  T
Q  290 tttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | |||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25128487 tctgtctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 25128546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 24833438 - 24833356
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaa 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  24833438 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaa 24833356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12640640 - 12640477
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| ||||| || |||||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  12640640 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccgacaccggtcaccggattcaccctcaagaacacatgatctccaacctgaaactcaatatccttcctcc 12640541  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12640540 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 12640477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Original strand, 24944966 - 24945138
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || |  || |    
T  24944966 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacccatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctttgaaa 24945065  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagt 221  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||    
T  24945066 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttccttgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagt 24945138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24831908 - 24831745
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| || || ||||||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||| | |    
T  24831908 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacccactccagtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcgttc 24831809  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24831808 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctgaatcatcttaac 24831745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22762274 - 22762127
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| | ||||||||| ||| || | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||    
T  22762274 acttcaaaccacgactaacaccagttacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatctttcatcctcttgtcatgataact 22762175  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22762174 cttcttcctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 22762127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 45676729 - 45676685
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45676729 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttc 45676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23817672 - 23817597
Alignment:
Q  274 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  23817672 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttgatcttctcttggatcatcttaactttttccgtagtct 23817597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 24570373 - 24570212
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || || || ||  | |||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  24570373 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 24570274  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| | || |||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||| || || |||||||    
T  24570273 cttctatctactctgagacgttttcatcttctcttgattcatcttaaccttttccgtagtct 24570212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 56
Target Start/End: Original strand, 23599834 - 23599877
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatactt 56  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599834 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactt 23599877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 335
Target Start/End: Original strand, 14708900 - 14708972
Alignment:
Q  263 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||| |||||||| ||||  || |||||||||||    
T  14708900 ctttcctccgcttatcatgataactcttctgtctactccacgatgctttcatcttcttctggatcatcttaac 14708972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17967617 - 17967577
Alignment:
Q  34 tgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17967617 tgagatggatcgggaacatactttcgaagttgggacacatg 17967577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14323 - 14679
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14323 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagtttcgacacatggaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14422  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14423 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 14522  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14523 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtatccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14622  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14623 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 583 - 939
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  583 acatcgtcactttggattacatgagatggatccgaaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 682  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  683 ccacttggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 782  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  783 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatggtgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 882  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  883 attttctcttggatcatctgaactttcttactagtctgctgaacaatctctggtcct 939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 279171 - 278823
Alignment:
Q  15 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccc 114  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  279171 atcatcactctgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 279072  T
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  279071 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcttgtcccacaccagtca 278972  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278971 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 278872  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 363  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278871 tttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 278823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 165052 - 164709
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |    
T  165052 acatcatctctttgaatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacatatgaaacacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtgaac 164953  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  164952 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 164853  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164852 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 164753  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  164752 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaac 164709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 308622 - 308978
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  308622 acatcgtcactttggattacatgagatggatccagaacatactttcgaagttacgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 308721  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  | || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  308722 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaactttggggttaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 308821  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  308822 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 308921  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  308922 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 308978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 260271 - 260614
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| |  ||||| || |    
T  260271 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatatggtggcaaac 260370  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
      |||| ||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || || ||| ||||||| ||||| ||    
T  260371 aaactctatatgccaccgttctaatcctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgattttaaagcacgtcctacacccgt 260470  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||| ||||||||||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  260471 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 260570  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||    |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  260571 atcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtctgatgaac 260614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17665 - 17319
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17665 acatcatcagtttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17566  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17565 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17466  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17465 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataacttttttgtcgactctgcgacgctttc 17366  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17365 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 17319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11553451 - 11553095
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| |    
T  11553451 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 11553352  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  11553351 ccactcgataagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 11553252  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11553251 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcaactctgcgacgctttc 11553152  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11553151 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11553095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 12687422 - 12687778
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  12687422 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgtcgtgcaaatttgaaagatgcggtggtaaac 12687521  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  12687522 ccactcgataagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 12687621  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12687622 cataggagtgactcgcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 12687721  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  12687722 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgttggacaatctctggtcct 12687778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14954541 - 14954897
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14954541 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatggaaaacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14954640  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  14954641 tcactcgataagccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaccaataaactttggggtcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacaccagt 14954740  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954741 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcctttctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14954840  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  14954841 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctggacaatctctggtcct 14954897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15155001 - 15154652
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  15155001 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacgtgaaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaaac 15154902  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15154901 ccactcggtaagccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15154802  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    
T  15154801 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactcggtgacactttc 15154702  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15154701 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15154652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 8707526 - 8707882
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  8707526 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 8707625  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8707626 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 8707725  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707726 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8707825  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  8707826 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 8707882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15161406 - 15161050
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  15161406 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 15161307  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15161306 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 15161207  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15161206 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15161107  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15161106 attctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 15161050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18552107 - 18551751
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  18552107 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 18552008  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18552007 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 18551908  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551907 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 18551808  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18551807 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18551751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Original strand, 8198561 - 8198905
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  8198561 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 8198660  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  8198661 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 8198760  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  8198761 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 8198860  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  8198861 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 8198905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 10870916 - 10871272
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  10870916 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 10871015  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  10871016 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacctcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 10871115  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10871116 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 10871215  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10871216 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 10871272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14332318 - 14332674
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  14332318 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 14332417  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14332418 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccagtatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 14332517  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14332518 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14332617  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  14332618 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 14332674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11237562 - 11237206
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  11237562 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 11237463  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  11237462 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 11237363  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  11237362 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 11237263  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  11237262 attctctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 11237206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 14037728 - 14038079
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14037728 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14037827  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14037828 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14037927  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14037928 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14038027  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14038028 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 14347758 - 14348109
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  14347758 acatcatcactttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 14347857  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14347858 ccactcgatacgccaccattcaaactctttccgatatctgatatgaaccaataaatcttggtgtcaacttctttgacttcaatgcacgcccaacaccagt 14347957  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14347958 cataggagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgtgacgctttc 14348057  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  14348058 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctg 14348109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 18177663 - 18178019
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  18177663 acatcgtcactctgaattacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 18177762  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  18177763 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgttctacaccagt 18177862  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18177863 tataggagtgactctcaagaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 18177962  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18177963 attttctctcgaatcatctaaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 18178019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 13685984 - 13686341
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaa-catcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaat 111  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| ||||  |||||     
T  13685984 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcgacggtaaa 13686083  T
Q  112 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccag 211  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13686084 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatttgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 13686183  T
Q  212 tcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgcttt 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13686184 tcataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgcttt 13686283  T
Q  312 cattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13686284 cattctctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 13686341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44791688 - 44791344
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || |    
T  44791688 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaacccactcggtaag 44791589  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  44791588 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaatttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 44791489  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  44791488 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 44791389  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  44791388 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 44791344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23517118 - 23516768
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  23517118 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaatatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 23517019  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23517018 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 23516919  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23516918 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgccttc 23516819  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 363  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23516818 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctct 23516768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 358
Target Start/End: Original strand, 15203800 - 15204145
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15203800 acatcatctctttcgatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15203899  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| |  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||    
T  15203900 ccactcgatactctaccgttccaattctttctgtaatctgatacagaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcggccaacaccagt 15203999  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204000 cacaaaagtgactctaaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15204099  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaa 358  Q
    || || || || |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15204100 atcttttcatggatcaacttaaccttctctgtagtttgctgaacaa 15204145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Original strand, 15624539 - 15624816
Alignment:
Q  79 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtca 178  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||||    
T  15624539 acatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatctgatatgaaccaataaacctcggagtca 15624638  T
Q  179 acttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatc 278  Q
    | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  15624639 atttccttgacttcaatgcacgtccaacaccagtcacatgagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctaagcttatc 15624738  T
Q  279 atgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  15624739 atgataactcttctatcgactctgcgacgctttcatcttctcttggatcaacttaaccttctaagtagtttgatgaac 15624816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12207109 - 12206784
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  12207109 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccactg 12207010  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    || ||||||| || |||||||| |||| || ||||||  |||| |||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12207009 ttgcaactctctcagatatctggtacgaaccaataaacttcggcgtcaacttctttgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggagtgactctcaa 12206910  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||      
T  12206909 aaacacatggtctccttcttgaaacttaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttttatcaat 12206810  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || || || ||||||||||||||    
T  12206809 ttgaccttttctgtagtctgctgaac 12206784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15102928 - 15102586
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  15102928 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 15102829  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  15102828 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 15102729  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15102728 cataggagtaactctcaaaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 15102629  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    ||||| |||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  15102628 attttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 15102586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 19147151 - 19147476
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  19147151 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 19147250  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  19147251 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 19147350  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  19147351 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 19147450  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  19147451 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 19147476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 20746550 - 20746875
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| || | |||||  || ||||| |    
T  20746550 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaactcactctgtatgccactg 20746649  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  20746650 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcag 20746749  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  20746750 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatc 20746849  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||||||| |||||    
T  20746850 ttgaccttctccgtagtctgatgaac 20746875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14264571 - 14264270
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || ||||| || |    
T  14264571 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcaggcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14264472  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  14264471 ccactctatatgccactgttccaaccctttcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 14264372  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14264371 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagcgccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14264272  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  14264271 at 14264270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Original strand, 21661900 - 21662233
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||  | ||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||   |||||| |    
T  21661900 atcacatgagatggatatgaaacatacttttgtagttgtgacacatgaaacacatcatgtaagttcgaaagatgcggtggtaaacccacgttatacgcaa 21661999  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||||||| | |||||| |||||||| |  |||||||| || |   | ||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  21662000 ccgccccaactctttgcgaaatctgatacgggccaataaacctcggagttagtttctttgattttagtgcccgtccaacaccggtaagaggggtgactct 21662099  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||  ||||    
T  21662100 caaaaacacatggtctcctt---gaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgtgacgctttcatcttttctctaatc 21662196  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    | |||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  21662197 aacttaacattttcattagtctgttgaacaatgtctg 21662233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11388736 - 11388412
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  11388736 acatgcgaaggatccggtacatacttccgtaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactg 11388637  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  11388636 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 11388537  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||   |||| |    
T  11388536 gaacacatgatctcc-tcttgaaactcatggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcatctgttctcttatcaac 11388438  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || || ||||||||||||||    
T  11388437 ttaaccttttctgtagtctgctgaac 11388412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16072603 - 16072320
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    | ||||| |    
T  16072603 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactttgcatgccactg 16072504  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  16072503 ttccaaccctctcagatatctgatatggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 16072404  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16072403 aaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 16072320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 349
Target Start/End: Original strand, 49152224 - 49152559
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  49152224 catcatctctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 49152323  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||| |||    
T  49152324 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcccgtccaacacccgtc 49152423  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  49152424 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 49152523  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | || |||   |||| | | ||||||||||||||||    
T  49152524 tcttttctcttatcaacctgactttctcagtagtct 49152559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11306589 - 11306289
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  11306589 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 11306490  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  11306489 aactctatatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 11306390  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | ||||||||| |||| ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11306389 aaaggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttca 11306290  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  11306289 t 11306289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8212437 - 8212154
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  8212437 acatgagaaggatccgcaacatacttccgaagttgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgccactg 8212338  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  8212337 taccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccctcag 8212238  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8212237 aaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 8212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 13665493 - 13665813
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  13665493 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 13665592  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||     | ||  | |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  13665593 ttccaaccctttctgaaatctgatacgg-----tgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 13665687  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || ||| | ||||||||||||||  | ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  13665688 aaatacatgatcttcctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtgatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 13665787  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| ||||| || |||||    
T  13665788 ttgactttctctgtagtttgatgaac 13665813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 35965007 - 35964848
Alignment:
Q  205 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35965007 acactagtcacaggagtgactctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaagatccttcctacgcttatcatgataactcttttgtctactctgcg 35964908  T
Q  305 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    |||| ||||| || |||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  35964907 acgccttcatcttttctctaatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaacaatgtctg 35964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 269 - 369
Target Start/End: Original strand, 9596234 - 9596334
Alignment:
Q  269 tgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9596234 tgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcc 9596333  T
Q  369 t 369  Q
    |    
T  9596334 t 9596334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16950762 - 16950455
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||| || ||||  || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  16950762 acatacttccgaagctgcgacacataaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgccaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgaaa 16950663  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  16950662 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctc 16950563  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     ||||||||| |  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||| |||||||||||||||    
T  16950562 ctgaaactcatgggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtc 16950463  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  16950462 tgatgaac 16950455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18054244 - 18053937
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||||||||| | ||| || || |    
T  18054244 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttcctattctctctgaaa 18054145  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  18054144 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactctcagaaatacatgatcaccctc 18054045  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  18054044 ttgaaactcaagggccttcctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 18053945  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  18053944 tcctgaac 18053937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 6413430 - 6413776
Alignment:
Q  10 tggacatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggta 109  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||| || ||||||   ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| |    
T  6413430 tggacatcatctctcggaataacatgcgaaggatccactacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggca 6413529  T
Q  110 atcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacacc 209  Q
    | || |||| ||| ||||| |||||||| || || || ||||||| || || ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||| |||||    
T  6413530 aaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgaaatctgattcgaaccaatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacc 6413629  T
Q  210 agtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgct 309  Q
     |||| |||||| || |||| |||||| || || || || ||||||||||   | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  6413630 cgtcataggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaaaggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgct 6413729  T
Q  310 ttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6413730 ttcatgttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 6413776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 241 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11772362 - 11772244
Alignment:
Q  241 tctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  11772362 tctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgttttcatcatttcttgaatcatcttaaccttct 11772263  T
Q  341 cagtagtctgctgaacaat 359  Q
    ||||||| || ||||||||    
T  11772262 cagtagtttgttgaacaat 11772244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 14129795 - 14130096
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  14129795 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14129894  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||  || ||  | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||  ||    
T  14129895 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14129994  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14129995 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14130094  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  14130095 at 14130096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 14433613 - 14433914
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| || |    
T  14433613 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagc 14433712  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| |||| ||||||||  || ||  | ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||  ||    
T  14433713 caactctatatgccatcgttccaatcctctctaaaatctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacactcgt 14433812  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14433813 catcggagtaactctaaaaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 14433912  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  14433913 at 14433914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14286667 - 14286360
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||  || |  || |    
T  14286667 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaatcctatatgaaa 14286568  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  14286567 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacctgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 14286468  T
Q  249 ttgaaactcaa-gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
     |||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||    |||||||| || |||||||| ||    
T  14286467 ctgaaactcaagggtcttt-ctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgt 14286369  T
Q  348 ctgctgaac 356  Q
    ||| |||||    
T  14286368 ctgatgaac 14286360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 13021294 - 13021615
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  13021294 atcacatgtgaaagatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataagcca 13021393  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||| ||||||  | |||||| ||||| | ||||||||  |||||   || || |||| ||||||||| ||    
T  13021394 ctgttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaataaactttggagtccacttcctcgacttcaatgcacgttttacgcccgtcataggagtgaccct 13021493  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || ||||||||||| ||  | ||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||    
T  13021494 cagaaaaacatgatcaccgtcttgaaactctagggcctttttccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 13021593  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||| || |||||||||||||    
T  13021594 atcttgaccttctcagtagtct 13021615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23200034 - 23199763
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23200034 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23199935  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23199934 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23199835  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23199834 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23199763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23506161 - 23505890
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| | || |||||| |  || || || |    
T  23506161 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgtcatcgttccgatcctctctgaaa 23506062  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  23506061 tctgatacggaccaatgaatttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 23505962  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23505961 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctc 23505890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 12455640 - 12455960
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  |||||||| || ||||| || || | || ||| ||||    
T  12455640 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgc-acacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaattctataagcca 12455738  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | |||| |||||| || || ||||||||| ||| ||| ||  | ||| |||||||| | ||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  12455739 ctgttctaactctctctgaaatctgataccgaccaatgaactttggattcaacttcctcgacttcaatgcacatccaacacccgtcaaaggagtgaccct 12455838  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||| ||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||    
T  12455839 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatc 12455938  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  12455939 accttgactttctcagtagtct 12455960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 4440008 - 4440185
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||| |||  | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| |    
T  4440008 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcc 4440107  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4440108 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 4440185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 14936443 - 14936590
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  14936443 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 14936542  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14936543 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 14936590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26118812 - 26118596
Alignment:
Q  133 ccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 232  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||| | |||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||    
T  26118812 ccaactctatctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagagcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccctcagaa 26118713  T
Q  233 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat--tttctcttgaatcatc 330  Q
    | || || || || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| |    
T  26118712 aaacatgatcaccctcctgaaactcaagctccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcctttctctt--atcaac 26118615  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
     | ||||||||||||||||    
T  26118614 ctgactttctcagtagtct 26118596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1698 - 1391
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| |||||  | |    
T  1698 acatccttccgaagctgagacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccagtgttccaaccctttcttaaa 1599  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||| ||| || || || || ||    
T  1598 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcatagaagtaactttcacaaaaacatgatcaccctc 1499  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||||||  | || || | ||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||    
T  1498 ctgaaactcaagggcctttctcctcttgtcatggtaactcttctgtcgaatctgtgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtagtc 1399  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  1398 tgatgaac 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 12254387 - 12254326
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12254387 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 12254326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 21674723 - 21674562
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||| |||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||| |  | |||||||||||||| || || ||  ||||||| ||||  || ||||| |    
T  21674723 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaataccaatcacaaggttcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaattcaatgtccttcctcc 21674624  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctta 333  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21674623 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagacgctttcatcttctcttgaatcatctta 21674562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26288327 - 26288063
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||| ||| ||||| || |    
T  26288327 acatattttcgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttcaaaccctttctgaaa 26288228  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||||| || ||| ||| | |||||||||||| | ||||||||  | ||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  26288227 tctgatacgtaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcgcgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatgatcaccctc 26288128  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| || ||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26288127 ctgaaa-tctagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctgcgacgctttcat 26288063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 7823980 - 7824143
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  7823980 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 7824079  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7824080 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7824143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12368766 - 12368603
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| || | |||||||  |||||| || | ||||||||||||||||| || ||  | ||||| |||| ||| || || |    
T  12368766 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacactggtcacaagattcactctcaaaaacacgtgatcaccaacctgaaagtcaatatcctttctcc 12368667  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12368666 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcattttctcttggatcatcttaac 12368603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 27107964 - 27107801
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  27107964 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 27107865  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27107864 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 27107801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 15364036 - 15364183
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  15364036 acttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttatcatgataact 15364135  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15364136 cttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 15364183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41327 - 41144
Alignment:
Q  181 ttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 280  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |  | ||| || || |||||||    
T  41327 ttcttagacttcaaagcacgtccaacgcccgtcaccggagtgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaattattttcttcgtttatcat 41228  T
Q  281 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    |||| ||||| |||| | | || || |||||||||| |||  ||||| | || || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  41227 gatagctcttctgtctaatttgtgatgctttcatttcctcccgaatcgttttgaccttctcggtcgtctgctgaacaatctctg 41144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 17923760 - 17923938
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaa-cacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctg 270  Q
    |||||||| |||||  |||||||| |||||||| |||| || || ||| | ||||| ||||| ||| || || ||  | ||||||||||  ||  ||||     
T  17923760 ggagtcaatttcttacacttcaaagcacgtccaccaccggttaccggattcactcttaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccatcctc 17923859  T
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | |||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17923860 ctcttatcatgacaactcttctgcctattctgagacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttttccgtagtct 17923938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 347
Target Start/End: Original strand, 12193654 - 12193811
Alignment:
Q  190 ttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactct 289  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||| | || |||||||| || || || ||  | ||||| ||||  || ||||| | |||| ||||||||||||    
T  12193654 ttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaaatcaatgtcattcctcctcttaacatgataactct 12193753  T
Q  290 tttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    | || | |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12193754 tctgcctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttctccgtagt 12193811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 45146652 - 45146812
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || | | |||||||||||| || || ||  |||||||| |||  || ||||| | ||||| |||||||||    
T  45146652 acttcaaagcacgtccaacaccagtc-catgattcattctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaacacaatgtccttcctactcttataatgataact 45146750  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| | |  |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  45146751 cttctatttactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaacattttccgtagtct 45146812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 160
Target Start/End: Original strand, 15340454 - 15340565
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  15340454 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 15340553  T
Q  149 tctgatacggac 160  Q
    ||||||||||||    
T  15340554 tctgatacggac 15340565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15479447 - 15479323
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||| |    
T  15479447 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacatgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacag 15479348  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgata 155  Q
    |||||||||| || || ||||||||    
T  15479347 ttccaactctctcagagatctgata 15479323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17145428 - 17145288
Alignment:
Q  192 caaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttt 291  Q
    |||| ||||||||||||| || |||  | | ||||| |||||||| ||  ||||  |||||||||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||     
T  17145428 caaaacacgtccaacaccggttacattattcactcttaaaaacacatgagctccaacttgaaactcaatatccttcatcctcttatcatgataactcttc 17145329  T
Q  292 tgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatctt 332  Q
    || | |||||| || |||||||| || ||||||||||||||    
T  17145328 tgcctactctgagaagctttcatattttcttgaatcatctt 17145288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 357
Target Start/End: Original strand, 5764588 - 5764758
Alignment:
Q  187 gacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataac 286  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| || || | | ||||||| || |  |  ||||| |||||| |||||||||    
T  5764588 gacttcaaagcacgatcaacgcccatcactggagtgactctaaaaaacacatgatcccgtacttgaaattccaattacttccttcgcttaccatgataac 5764687  T
Q  287 tcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaaca 357  Q
    |||| || |   | ||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5764688 tcttctgcctgatttgcgatgccttcatcctctcttgaatcattttaactttctcagtagtctgttgaaca 5764758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 352
Target Start/End: Original strand, 20466877 - 20467041
Alignment:
Q  187 gacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataac 286  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||| |  ||| |  || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20466877 gacttcaaagcacgaccaacaccggtcacggggttaactctaaaaaacacattatcttcaactagaaactcaatatccttcctccgcttatcatgataac 20466976  T
Q  287 tcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgct 352  Q
    | || || | |||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||| |||| || || ||||||||||    
T  20466977 tattctgcctactctgagattctttcatcttctcctgaatcatcataacctt-tctgtagtctgct 20467041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 13353247 - 13353394
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||  | || ||   ||| |||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  13353247 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacagtattcactctcagaaacacaagatcaccaatttggaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 13353346  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| ||   |||||| || ||| || | ||||||| ||||||||||||    
T  13353347 cttctgcgtactctgagatgctctcgtcttctcttaaatcatcttaac 13353394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26118896 - 26118817
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgg 107  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||    
T  26118896 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtgg 26118817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 349
Target Start/End: Original strand, 13378879 - 13378955
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13378879 cttatcataataacgcttctgtctactctgagatgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 13378955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 252 - 314
Target Start/End: Original strand, 12456940 - 12457002
Alignment:
Q  252 aaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12456940 aaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 12457002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Original strand, 23641673 - 23641774
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||||| |||| ||   | |||| ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||  |||||    
T  23641673 cttgaaactcaatatccttcctccttttatcatgataagtcttctgcttattctgagacgctttcatcttatcctgaatcatctgaactttcttcgtagt 23641772  T
Q  348 ct 349  Q
    ||    
T  23641773 ct 23641774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 5432710 - 5432638
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| || | ||| || |||||| |||| |||||    
T  5432710 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataactcttctgcctactttgagacgctctcatcttctc 5432638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 13634070 - 13634038
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatcc 45  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13634070 acatcatcactttggatcacatgagatggatcc 13634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 250 - 314
Target Start/End: Original strand, 15340590 - 15340654
Alignment:
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15340590 tgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgtgacgctttcat 15340654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17045427 - 17045071
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17045427 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 17045328  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  17045327 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggt 17045228  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17045227 cacaggagtgactctcaaaaacacatggtctccttcctgaaactcaagatccttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 17045128  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17045127 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 17045071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19106314 - 19106670
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19106314 acatcgtcactctagatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 19106413  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  19106414 caactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatatggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcctacaccagt 19106513  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19106514 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctccgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19106613  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  19106614 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 19106670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16079045 - 16078708
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16079045 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgtagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16078946  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16078945 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 16078846  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078845 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcc-------------------ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16078765  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16078764 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 16078708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 20249797 - 20250153
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  20249797 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 20249896  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  20249897 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatcttatacggaacaataaatttcggagtcaacttctttgacttcaacgctcgtccaacaccagt 20249996  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20249997 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 20250096  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||    
T  20250097 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacgatctctggtcct 20250153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 20136725 - 20137081
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20136725 acatcatcactttggatcacatgagatggatcaaaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgccgtggtaaac 20136824  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20136825 caacacgatacgccactgtcccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 20136924  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20136925 cacaggagtgactctcaaaaacacgaggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttc 20137024  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20137025 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 20137081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16351011 - 16350655
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  16351011 acatcgtcattctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 16350912  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16350911 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16350812  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16350811 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 16350712  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  16350711 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatttctggtcct 16350655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33391441 - 33391085
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  33391441 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 33391342  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  33391341 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 33391242  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391241 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 33391142  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  33391141 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 33391085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 50620656 - 50620307
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  50620656 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50620557  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50620556 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50620457  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  50620456 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 50620357  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||    
T  50620356 atcttttgttgaatcatcttaaccttctcagtagtttattgaacaatctc 50620307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21747482 - 21747837
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| |    
T  21747482 acatcatcactttggattacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggtaaac 21747581  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21747582 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctcggattcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 21747681  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21747682 cacaggagtgactctcaaacatatgtggtctccttctagaaactcaagatcttt-ctacgcttattatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21747780  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21747781 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21747837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 51333905 - 51333549
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  51333905 acatcgtcactttggatcacatgagatggatccagaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 51333806  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  51333805 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatatgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 51333706  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51333705 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttattggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 51333606  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  51333605 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 51333549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21830250 - 21830606
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  21830250 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 21830349  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21830350 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21830449  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21830450 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 21830549  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21830550 attttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 21830606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19761278 - 19760935
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19761278 acatcatctcttgggatcacatgagacggatccgaaacatactaccgaagttgcgatacatgaaacatatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaaac 19761179  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  19761178 ccactcgatacgccaccgttccaattctttcggatatctgatacggtccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccaat 19761079  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19761078 cacaagagtgactctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttc 19760979  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  19760978 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgctgaac 19760935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 21836897 - 21837253
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  21836897 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatacttttgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 21836996  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21836997 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 21837096  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21837097 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgctgatcatgataactcttttgtcgactatgcgacgccttc 21837196  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21837197 attttctcttggatcatctgaactgtctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 21837253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 41354881 - 41354525
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  41354881 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 41354782  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41354781 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcgaggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 41354682  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41354681 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 41354582  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  41354581 attttctctcggatcatctgaactttctcagtggtttgctgaacaatctctggtcct 41354525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 369
Target Start/End: Original strand, 16369267 - 16369600
Alignment:
Q  36 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttcca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || |||||||||||||||    
T  16369267 agatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaaccaacacggtacgccaccgttcca 16369366  T
Q  136 actctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaaca 235  Q
    |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  16369367 actctttctgatatctgatatagaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacttgtcacaggagtgactctcaaaaata 16369466  T
Q  236 cgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    | || ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  16369467 catgatctccttcttggaattcaaggtctttcctacgcttatcatgataacccttttgtcgactctacgacgctttcatcttttcttgaatcatctttac 16369566  T
Q  336 tttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
     || ||| |||| || ||||||||||||| ||||    
T  16369567 cttttcaatagtttgttgaacaatctctggtcct 16369600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 50612828 - 50612602
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  50612828 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatacggtggtaaac 50612729  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50612728 ccactcgatatgccaccattccaactctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 50612629  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50612628 cacaggagtgactctcaaaaatacgtg 50612602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19665270 - 19664945
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19665270 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 19665171  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| || || |||| |||||| |||||||     
T  19665170 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacccccgtcataggagtaactctcag 19665071  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  19665070 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggctttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19664971  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19664970 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19664945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 21163227 - 21163381
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||||||||| |    
T  21163227 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaatgtcgtgcaaattcgaaatatgcggtggtaaac 21163326  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaa 167  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21163327 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaa 21163381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20940439 - 20940147
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || ||||    
T  20940439 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgata 20940340  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  20940339 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 20940240  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
     |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  20940239 ctgaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 20940147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 19854279 - 19854604
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  19854279 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatttggtggcaaaccaactctatatgccactg 19854378  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  | || || ||||| |||| |||||| |||||||     
T  19854379 ttccaaccctctctgaaatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcccgacctacacccgtcataggagtaactctcag 19854478  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||   ||||||    
T  19854479 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgacgctttcatcttctctctgatcatc 19854578  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  19854579 ttgactttctctgtagtctgatgaac 19854604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20857155 - 20856839
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| |    
T  20857155 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatacgccacag 20857056  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||||||| || ||||| || |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  20857055 ttccaactctttctgaaatctggtaaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggagtaaccctcag 20856956  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||||    
T  20856955 aaaaacatggtcaccttcctgaaacgcaaggtccttcctacgcttgtcgtgatagctcttttgtcgactctgcgacactttcatcttctccctaatcatc 20856856  T
Q  331 ttaactttctcagtagt 347  Q
    || |||||||| |||||    
T  20856855 ttgactttctccgtagt 20856839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Original strand, 37677027 - 37677328
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||    
T  37677027 catcatccctcggaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagagacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaacc 37677126  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     ||||  || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  37677127 aactctgtatgccactgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtc 37677226  T
Q  214 acaggagtgactctcaa-aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    | ||||||||| ||||| ||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  37677227 aaaggagtgaccctcaagaaaaacatgatcaccctcctgaaactccagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttc 37677326  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  37677327 at 37677328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 20294374 - 20294660
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  20294374 atcacatgcgaaggatccgccacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 20294473  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||||| || || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20294474 ctgtaccaactctctctgaaatctgatatggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20294573  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20294574 cagaaaaacatgatcaccctcttgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 20294660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31550578 - 31550292
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||  || ||||    
T  31550578 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctgtatgcca 31550479  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| | || |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31550478 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcccgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 31550379  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  31550378 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactttgcgaagctttcat 31550292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 22433528 - 22433192
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| || ||||| || |    
T  22433528 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcatattcgaaagatgtggtggcaaac 22433429  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| ||| |||| || || || |||||||||| ||  || ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22433428 caactctataggccacagttgcaaccctctctgaaatctgatacgaaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgt 22433329  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || ||||  ||||| || || || || |||||||||||    || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22433328 cataggagtaaccctcaggaacacatgatcaccctcctgaaactcaaggggctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 22433229  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  22433228 atcttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 22433192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 314
Target Start/End: Original strand, 11382676 - 11382842
Alignment:
Q  148 atctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 247  Q
    ||||||||||||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || || || || |    
T  11382676 atctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgtccaacacccgtcaaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccct 11382775  T
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  11382776 cctgaaactcaagatccttccttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcat 11382842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20075456 - 20075170
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || ||||| |  |||||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||  ||| ||||    
T  20075456 atcacatgcgaaggatctgctacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgcca 20075357  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  20075356 ctgttcccactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 20075257  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     | ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| ||||||||    
T  20075256 tagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttctccgcttgtcatggtaactcttctatcgactttgcgaagctttcat 20075170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20836237 - 20835957
Alignment:
Q  79 acatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtca 178  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||    
T  20836237 acatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtca 20836138  T
Q  179 acttcttt---gacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgctt 275  Q
    |||||||    ||||| ||   |||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || || | ||||| |||  | ||||  |||||    
T  20836137 acttcttcttcgacttaaatgtacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaaaacatgatcaccctcctaaaacttaagggccttccaacgctt 20836038  T
Q  276 atcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  20836037 gtcatgataactcttatgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 20835957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 132 - 356
Target Start/End: Original strand, 41307891 - 41308115
Alignment:
Q  132 tccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaa 231  Q
    |||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||||  ||||||  ||||| |||| |||||| || |||| |    
T  41307891 tccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaacttaggagtcaactttttagacttcaatgcacgtcatacacccgtcataggagtaaccctcaga 41307990  T
Q  232 aacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatct 331  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   || || |    
T  41307991 aacacatggtctccctcttgaaactcaaggggctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttattattt 41308090  T
Q  332 taactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | |||||||| |||||||| |||||    
T  41308091 tgactttctccgtagtctgatgaac 41308115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Original strand, 20244183 - 20244437
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || || |    
T  20244183 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaactctataggccactgttccaaccctctctgaaa 20244282  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  20244283 tctgatatggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcatgtcccacacccgtcataggagtaaccctcagaaagacatgatcaccctc 20244382  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgc 303  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20244383 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgc 20244437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20831645 - 20831482
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20831645 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20831546  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20831545 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 20831482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 46518827 - 46518990
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  46518827 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 46518926  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||  || || ||||| ||||||||||||||    
T  46518927 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgtcttaatcttctcctgaatcatcttaac 46518990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20395404 - 20395194
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || || | ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  20395404 catcatccctcggaatcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgagaaatatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 20395305  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| |||||  |||||||||| || || |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||| | ||||||||| |||| || ||||| |||    
T  20395304 aactctatatgccactattccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaaattcctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtc 20395205  T
Q  214 acaggagtgac 224  Q
    | |||||||||    
T  20395204 aaaggagtgac 20395194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 20914316 - 20914493
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  20914316 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 20914415  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
      |||| |||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  20914416 atttataatgataactcttctctctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 20914493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Original strand, 24476927 - 24477009
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcga 95  Q
    |||||||| ||| | |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24476927 acatcatctctcggaatcacatgcgagggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgaaaattcga 24477009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21202524 - 21202371
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    ||||||||  |||||||||||| || | |||| | |||||||||||||  || || ||  | |||||||||| ||| ||  | | |||||||||||||||    
T  21202524 acttcaaagtacgtccaacaccggttataggattcactctcaaaaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttgtcctcttatcatgataact 21202425  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||| || |  ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21202424 cttctgccttctctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttctc 21202371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22135710 - 22135645
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22135710 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgctttcatcttcccctgaatcatcttaacttt 22135645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 340
Target Start/End: Original strand, 20184364 - 20184456
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttct 340  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||| || | |||||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  20184364 cttgaaactcaatatctttcctcctcttatcattataactcttctgcctactctgagacactcacatcttctcttggatcatcttcactttct 20184456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22142294 - 22142232
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaac 234  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  22142294 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactctcaaaaac 22142232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 12497824 - 12498171
Alignment:
Q  15 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccc 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12497824 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12497923  T
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  12497924 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12498023  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498024 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12498123  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12498124 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12498171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12511077 - 12510730
Alignment:
Q  15 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccc 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12511077 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatccc 12510978  T
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  12510977 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12510878  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510877 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12510778  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12510777 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 12510730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 19864483 - 19864839
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19864483 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatgaaagacatcatacaaattcgaaagatgcggtggtaatc 19864582  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19864583 ccactcgatacgccaccgttccaaatctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacatccaacaccagt 19864682  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19864683 cacaggagtgactctaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 19864782  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19864783 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaccaatctctggtcct 19864839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 15 - 362
Target Start/End: Original strand, 12505153 - 12505500
Alignment:
Q  15 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccc 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12505153 atcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgaaaaatcgaaagatgcggtggtaatccc 12505252  T
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  12505253 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgttacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgaattcaaggcacgtccaacaccggtca 12505352  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505353 caagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 12505452  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12505453 attctcttgaatcatcttaacattctcagtagtatgatgaacaatctc 12505500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16963852 - 16963496
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16963852 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 16963753  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16963752 caacacgatacgccatcgttccaactatttccgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcttttacttcaaagcacgtccaacaccagt 16963653  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963652 cacaggagtgactctcaaaaacacttggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16963553  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16963552 atcttttcttgaatcatctttactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16963496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25765774 - 25765419
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  25765774 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccaaagttacgacacatggaacacatcgtgcaagttcgaaagatgcggtggtaatc 25765675  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25765674 ccactcgatacaccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 25765575  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25765574 caca-gcgtgactctcaaaagcacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctacgacgctttc 25765476  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25765475 attttctcttgaatcatctttactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 25765419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 5839704 - 5839348
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  5839704 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 5839605  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  5839604 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacctgt 5839505  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5839504 cataggagtgactctcaaaaacgtgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 5839405  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  5839404 attttctcttaaatcatcttgactttctctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 5839348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16928125 - 16927769
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16928125 acatcatcactctgtatcacatgagatggatccggtacatactttcgaagttgcgacacatgtaatatatcgtgcgaattcgaaagatgcggtggtaatc 16928026  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16928025 caagacgatacgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacactagt 16927926  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16927925 cacaagagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttttcgactctgcggcgctttc 16927826  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16927825 atcttttcttgaatcatctttactttccctgtagtctgctgaacaatctctggtcct 16927769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1543563 - 1543213
Alignment:
Q  19 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1543563 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 1543464  T
Q  119 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacagg 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||    
T  1543463 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacagaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 1543364  T
Q  219 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1543363 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgggacgctttcattttc 1543264  T
Q  319 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1543263 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 1543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21833466 - 21833172
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21833466 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 21833367  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21833366 ccactcgatacgccaccattccaactctttccgatatctgatacggacctataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacctccaacaccagt 21833267  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833266 cacaggagtgactctcaaaaacatgtggtttccttcttgaaattcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacg 21833172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25610346 - 25609990
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25610346 acatcatcactttggatcacatgggatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgcgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 25610247  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25610246 caacacgatacgccaccgttccaactctttccgatatctaatacggaccaataaatctcggaatcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccggt 25610147  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25610146 cacaggtgtgactctcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgtgacgctttc 25610047  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  25610046 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgctgaacaatctctggtcct 25609990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22079173 - 22078823
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22079173 acatcatcactttggatcacatgggatggatcaggaacatacttccgaagttgctacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22079074  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |    
T  22079073 ccactcgatacgccaccgtaccaactctttccgatatctgatacggacgaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccaat 22078974  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22078973 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctaagcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 22078874  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 363  Q
    || || ||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22078873 atcttttctggaatcatcttaaccttctcagtggtttgttgaacaatctct 22078823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18408428 - 18408072
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408428 acatcatcactttggatcacatgggatgaatccggtgcatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 18408329  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18408328 ccacccgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 18408229  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18408228 cacacgagttactctcaaaaatacgtggtcttcttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactattttgtcgactctacgacgctttc 18408129  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  18408128 atcttctcttgaattatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 18408072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 23078265 - 23078621
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  23078265 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgtaatacttcttgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 23078364  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||    
T  23078365 ccactcgatacgccaccgtttaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgcccaacaccagt 23078464  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23078465 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgatgctttc 23078564  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  23078565 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 23078621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24313653 - 24313297
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  24313653 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 24313554  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  24313553 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 24313454  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24313453 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctatgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 24313354  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24313353 attttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 24313297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16627202 - 16626846
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||| ||||| |    
T  16627202 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggcggtaaac 16627103  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16627102 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 16627003  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16627002 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 16626903  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  16626902 attttctcttggatcatctgaactttctcaatagtttgctgaacaatctctggtcct 16626846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28263682 - 28263326
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28263682 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28263583  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28263582 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28263483  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28263482 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28263383  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28263382 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28263326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28342431 - 28342075
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28342431 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28342332  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28342331 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 28342232  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28342231 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28342132  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28342131 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28342075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 25 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29592393 - 29592049
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || |    
T  29592393 tggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgtggcggtaaacccactcggtaag 29592294  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29592293 ccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgac 29592194  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  29592193 tctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcattttctcttgg 29592094  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29592093 atcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 29592049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 25112348 - 25112704
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  25112348 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttctgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 25112447  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25112448 ccactcggtaagccaccgttccgactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcagcttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 25112547  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25112548 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataagtcttttgtcgactctgcgacgcttta 25112647  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||    
T  25112648 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacgatcgctggtcct 25112704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27331918 - 27331569
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27331918 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27331819  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  27331818 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27331719  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27331718 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27331619  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27331618 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27331569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 27392658 - 27392309
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27392658 acatcatcactttggatcacatgggatggatccagaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 27392559  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  27392558 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatatggaccaataaatctcggagtcaacttcctttacttcaatgcacgtccaacaccagt 27392459  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27392458 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatccccttcttgaaactcaaggtcttttctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 27392359  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  27392358 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacattctc 27392309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 27187232 - 27187588
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  27187232 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27187331  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27187332 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27187431  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27187432 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27187531  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27187532 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27187588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27262008 - 27261652
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||| |    
T  27262008 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgctgcggtaaac 27261909  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  27261908 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaatttcggggtcaacttcttcgacttcaaagcacgtcctacaccagt 27261809  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27261808 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttcttcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 27261709  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27261708 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 27261652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2875288 - 2874932
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  2875288 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 2875189  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  2875188 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttatttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 2875089  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2875088 cataggagtgactctcaaaaactcgtggtctccttcttgaaactcaaaatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgattctgcgacgccttc 2874989  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2874988 attttctcttggatcatccgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 2874932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22762940 - 22762584
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22762940 acatcatcactttggatcacatgggagggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacaaagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 22762841  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22762840 ccacttgatacgccatcgttccaactctttccgatatctgattcggaccaataaatctcggggtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 22762741  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||  |||||    
T  22762740 cacaggagtgactctcacaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctgtcctacgcttatcattgtaactctattgtcgactctccgaaactttc 22762641  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| |||| |||| | || ||||||||||||| ||||    
T  22762640 atcttctcttgaatcatcttaaccttctaagtaatttgttgaacaatctctggtcct 22762584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 28292857 - 28292501
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  28292857 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaac 28292758  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  28292757 ccactcggtaagccaccgtcccaactctttccaaaatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttaacttcaaagcacgtcctacaccagt 28292658  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28292657 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttccttaaattcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 28292558  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28292557 attttctctcggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 28292501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 17032358 - 17032582
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17032358 acatcgtcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17032457  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  17032458 ccactcggtaagccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaacttcggggtcaacttctttgacttcaacgcacgtcccacaccagt 17032557  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacg 237  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  17032558 cataggagtgactctcaaaaacacg 17032582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18198006 - 18197676
Alignment:
Q  39 tggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaact 138  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||  || |    
T  18198006 tggatccagaacatacttccgaagttgcgaaacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggcaaacccactcgatacgccactgtttaaatt 18197907  T
Q  139 ctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgt 238  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  |||||| |||||||| ||| ||| || |    
T  18197906 ctttccgatatcttatacagaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaattcgcgtcctacacttgtcacaagagtgactttcagaaatacat 18197807  T
Q  239 ggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
    | | ||| |||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| || ||    
T  18197806 gatatccctcttgaaacttaaggtctttccgacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttcatcttttcttaaatcatctttacctt 18197707  T
Q  339 ctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  18197706 ctcagtagtctgttaaacaatcgctggtcct 18197676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 21471412 - 21471698
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||    
T  21471412 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 21471511  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||| || || |||| ||||||||||||    
T  21471512 ctgttccaactctctcagatatctggtacggatcaataaacttcggagtcaacttcttagatttcaacgcacgtcctacccccgtcataggagtgactct 21471611  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || |||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21471612 cagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 21471698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Original strand, 22433793 - 22433930
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22433793 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 22433892  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22433893 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 22433930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 25750605 - 25750900
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  25750605 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagatgcgacacatgaaacatatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 25750704  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||| ||    
T  25750705 ccactctgtatgccactgttccaactctctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcttacacccgt 25750804  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgc 308  Q
    |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25750805 cacaagagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgc 25750900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 15459150 - 15459468
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || || ||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  15459150 acatgcgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgatacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatcccactctatacgccacag 15459249  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  15459250 ttccaactctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtaaccctcag 15459349  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  15459350 aaaaacatggtcaccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttgtcatggtagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctaatcatc 15459449  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
     | |||||||| |||||||    
T  15459450 ctgactttctccgtagtct 15459468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14131637 - 14131363
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  14131637 ggatccgttacatacttccgtaactgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgttgtggcaaacccactctatatgccactgttccaactc 14131538  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||| |||| |||||| ||    
T  14131537 tctcagatatctgatacggaccaataaacttcgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacctgtcataggagtgaccctcagaaacacatg 14131438  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     |||||||| |||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14131437 atctccttcctgaaactccaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcat 14131363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Original strand, 25768023 - 25768288
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||| || ||||    
T  25768023 acatacttccgaagctgcgacacgtgaaacacatcatgcaaattggaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactctctcagata 25768122  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||| ||||||| ||||||  | | |||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | |||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  25768123 tctggtacggaccaataaactttgaagtcaatttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgtcataagagtgactctcagaaacacatgatctccttc 25768222  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25768223 ttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 25768288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22797117 - 22796774
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  22797117 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctgcatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 22797018  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||| ||| ||||||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  22797017 ccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatatgatacagaccaataaacttaggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 22796918  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  22796917 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtagactttgcgacgctttc 22796818  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  22796817 atcttttcccttatcatcttaaccttctctgtagtctgatgaac 22796774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 18794504 - 18794787
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || | ||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  18794504 acatgcgacggatccggtacatactttcgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactcgatatgccactg 18794603  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || |  ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18794604 ttccaaccctcttagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaaggcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 18794703  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| || ||||| |||||||||| ||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18794704 gaacacatgatctccctcttgaaactgaaggtctttcctacgattgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 18794787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 19879112 - 19879395
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  19879112 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 19879211  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || |||||  |||| || ||||| | || |||||||||||||||    
T  19879212 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagatttcaatgcacggcctacacctgccataggagtgactctcaa 19879311  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19879312 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgaccctttcat 19879395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21564590 - 21564316
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| |||| || || || || ||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  21564590 ggatccggtacatacttccgtaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattctaaagatgaggcggcaaacccactctatacgccactgttccaaccc 21564491  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  21564490 tctcagatatctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcaaaggagtgactctcaagaacacatg 21564391  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21564390 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgtttgtcatgatagctcttctgtcgactctacgacgctttcat 21564316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10469319 - 10468998
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  10469319 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaggttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 10469220  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | |||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  10469219 cagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 10469120  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  10469119 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 10469020  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  10469019 aacctgactttctcagtagtct 10468998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 34646017 - 34645770
Alignment:
Q  67 gacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataa 166  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || | |||||    
T  34646017 gacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggtaatccaattctatacgccacagttccaactctctcagatatctgatatgggccaataa 34645918  T
Q  167 atctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttt 266  Q
    |  | |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  34645917 actttggagtcaacttcttagattttaatgcacgacccacacctgtcataggagtgaccctcaagaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtcctt 34645818  T
Q  267 cctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34645817 cctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 34645770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11288054 - 11287782
Alignment:
Q  42 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctt 141  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||     
T  11288054 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11287955  T
Q  142 tccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggt 241  Q
    || ||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || |    
T  11287954 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacccgtcataggggtgactctcaagaacacatgat 11287855  T
Q  242 ctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11287854 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11287782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 24364223 - 24364544
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  24364223 atcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgcca 24364322  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||  | |||||||   |||| |||||||| |||| ||||||||| ||    
T  24364323 ctgtaccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcagcgcacgaccaacacccgtcaaaggagtgaccct 24364422  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||    
T  24364423 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttctcttatc 24364522  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | | | ||||||||||||||||    
T  24364523 aacctgactttctcagtagtct 24364544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11280961 - 11280689
Alignment:
Q  42 atccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctt 141  Q
    |||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||||||     
T  11280961 atccggtacatagttccgcaactgtgacacatggaacacgtcatgcaaatttgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactgttccaactctc 11280862  T
Q  142 tccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggt 241  Q
    || ||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || ||  || |||| ||||| |||| ||| |||| |||||| ||||| || |    
T  11280861 tcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcatgtcctacacctgtcataggtgtgattctcaagaacacatgat 11280762  T
Q  242 ctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11280761 ctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 11280689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 275 - 369
Target Start/End: Original strand, 22433927 - 22434021
Alignment:
Q  275 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22433927 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 22434021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 223 - 323
Target Start/End: Original strand, 11291818 - 11291918
Alignment:
Q  223 actctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11291818 actctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacacttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctctt 11291917  T
Q  323 g 323  Q
    |    
T  11291918 g 11291918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 356
Target Start/End: Original strand, 17415369 - 17415625
Alignment:
Q  100 tgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcac 199  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  |||    
T  17415369 tgcggtggcaaacccactctatatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcac 17415468  T
Q  200 gtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgact 299  Q
    |||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || || |||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  17415469 gtcctacacccgtcataggagtaactctcataaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgccatggtaactcttctgtcgact 17415568  T
Q  300 ctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  17415569 ctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 17415625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 8766615 - 8766297
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  8766615 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 8766516  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| || |  |||| || ||| || ||||     
T  8766515 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacccttgtcatagaagtaaccctcag 8766416  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||   ||||||    
T  8766415 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgacgccttcatcttttctctgatcatc 8766316  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  8766315 ttgactttctctgtagtct 8766297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27561066 - 27560759
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| |||||||||||||  || || || |    
T  27561066 acatacttccgcaactgtgacacgtggaacacatcatgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaa 27560967  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  27560966 tctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactcttagaaatacatgatcaccctc 27560867  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||| || ||||||    
T  27560866 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctccctgatcatcttgactttttctgtagtc 27560767  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  27560766 tcctgaac 27560759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 145 - 356
Target Start/End: Original strand, 18800870 - 18801081
Alignment:
Q  145 gatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctc 244  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||  | | |||||||| ||| |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || |    
T  18800870 gatatctgatatggaccaatgaactttgaagtcaactgcttcgacttcaattcacgtcttacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatccc 18800969  T
Q  245 cttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagt 344  Q
    | ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||| |||||||| ||    
T  18800970 cctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatcttgactttctccgt 18801069  T
Q  345 agtctgctgaac 356  Q
    |||||| |||||    
T  18801070 agtctgatgaac 18801081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14381850 - 14381609
Alignment:
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  14381850 actctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 14381751  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  14381750 taggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcgtgataactcttctgtccactctgcgacgctttcat 14381651  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
     || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  14381650 cttttctcttatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 14381609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Original strand, 1640717 - 1640876
Alignment:
Q  162 aataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaaga 261  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||||| | |||||| || |||||||| | ||| |||||     
T  1640717 aataaacctcggggtcaacttcttcgatttcaaggcacgaccaacacctgtcacaggggtgactcttagaaacacatgatctccttcctaaaattcaagg 1640816  T
Q  262 tctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1640817 tcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctct 1640876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25743413 - 25743236
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  25743413 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaagattctccctcaaaaacacttgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 25743314  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  25743313 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 25743236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 295
Target Start/End: Original strand, 25750900 - 25751024
Alignment:
Q  171 cggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctg 270  Q
    ||||||| ||||||| || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||     
T  25750900 cggagtccacttcttagatttcaacgcacgtcctacacccgtcacaggagtgactctcagaaacacatgatctccttcttgaaactcaagatcctttcta 25750999  T
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtc 295  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  25751000 cgcttgtcatggtaactcttctgtc 25751024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 16098005 - 16098168
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  16098005 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 16098104  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  16098105 tcttatcatgataactcttctgtctactctaagacgctttcatcttctcttggatcatcttaac 16098168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 23996203 - 23996366
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  23996203 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 23996302  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23996303 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 23996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16382699 - 16382536
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  16382699 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 16382600  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16382599 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 16382536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28283262 - 28282955
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| |  || ||||| || || ||||| ||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| |||||||| || |  || || || |    
T  28283262 acatacttccgcaactgtgacacgtgaaacacatcgtgcaagttcgatagatgtggtggcaagccaactctatatgccaccgtcccgatcctctctgaaa 28283163  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||| | ||| ||  |||||||||||||  | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| | ||| || || || || ||    
T  28283162 tctgatacgggccaatgaacttcggagtcaactttctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtcactcttagaaatacatgatcaccctc 28283063  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||| ||||| || ||||||    
T  28283062 ttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgtgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttttctgtagtc 28282963  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    | ||||||    
T  28282962 tcctgaac 28282955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Original strand, 18571622 - 18571769
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||| | |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  18571622 acttcaaagcacgaccaacatcggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 18571721  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18571722 cttctgtctactctgagacgctttccttttctcctgaatcatcttaac 18571769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18838234 - 18838057
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| || | |||||||| ||||||||| | || | ||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  18838234 ggagtcaacttcctacacttcaaagcatgaccaacaccggtcacaggattcacccacaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 18838135  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| | |  |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||    
T  18838134 tcttatcatgataactcttctatgtactctgagacgccttcatcttttcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 18838057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 338
Target Start/End: Original strand, 25655456 - 25655604
Alignment:
Q  190 ttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactct 289  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |   || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || || || | ||||| |||||||||||    
T  25655456 ttcaaagcacgaccaacaccagttatcagattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtcctttctcctcttattatgataactct 25655555  T
Q  290 tttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25655556 tctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 25655604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1649094 - 1648947
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||| ||    
T  1649094 acttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgatagct 1648995  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  1648994 cttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 1648947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 18787702 - 18787809
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || | ||| || ||||||| ||| ||||| |    
T  18787702 acatgcgaaggatccgctacatactttcgaagttgcgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaatatgtgatggcaaacccactctatatgccactg 18787801  T
Q  131 ttccaact 138  Q
    ||||||||    
T  18787802 ttccaact 18787809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 15078690 - 15078513
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||| ||| | | ||||||||| || || || ||  | |||||||| | ||| || ||      
T  15078690 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcactggattcagtctcaaaaatacatgatcaccaacctgaaactcgatatcctttctct 15078591  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||||||||| || || |||||||    
T  15078590 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttttctcggatcatcttaaccttttccgtagtct 15078513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21413248 - 21413101
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||| | |||| ||| ||||  || || ||  | |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  21413248 acttcaaagcacgaccaacaccagttacaggattcactcacaagaacatatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 21413149  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||  ||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21413148 cttcggtctactctgagacgctttcatcttttcttggatcatcttaac 21413101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 349
Target Start/End: Original strand, 16233167 - 16233341
Alignment:
Q  175 gtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgct 274  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||| ||||| || ||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | ||    
T  16233167 gtcaacttcctacacttcaacgcacgaccaactccggtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctct 16233266  T
Q  275 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||    
T  16233267 tatcatgataactcttctgtctactttgagacgccttcatcttttcttgaataatcttaaccttttccgtagtct 16233341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 1640613 - 1640710
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccac 128  Q
    ||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| ||| |||||    
T  1640613 acatgtgaaggatccgctacgtacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccac 1640710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 285; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33916 - 33560
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33916 acatcatcactctggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtagtaatc 33817  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33816 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 33717  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33716 cacatgagtgactttcaataacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 33617  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33616 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 33560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 8559 - 8915
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  8559 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 8658  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8659 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 8758  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8759 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 8858  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8859 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6333
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5977 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagctgcggtggtaatc 6076  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6077 caactcgatacgccaccattccaactctttctaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtcaaacaccagt 6176  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 cacaggagtgactcttaaaaacacgtggtctccctcttgaaactcaagatcctgcctgcgcttattatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6276  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  6277 atcttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgcacaatctctggtcct 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 64374 - 64018
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  64374 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcaaaagatgcggtggtaatc 64275  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  64274 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacggaccaatgaatctcacagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaactccagc 64175  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  64174 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttggaactcaagatctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 64075  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  64074 atcttctcttgaatcatcttaattttctcagtagtctgctgaacaatatctggtcct 64018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4748 - 4392
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4748 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccaaagttgcgacacatggaaaacttcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 4649  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4648 ccactcgatacgccactgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagttaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 4549  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4548 cacaagagtgactttcaataacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 4449  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4448 attttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtctgttgaacaatctctggtcct 4392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 639 - 995
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  639 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaagc 738  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  739 caacacgatacgccaccattccaaccctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 838  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  839 cacaggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctatgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 938  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  939 atcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1036 - 681
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1036 acatcaccactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgctccacatgaaacacatcctgcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 937  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  936 ccacacgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 837  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  836 cacacgagggactctc-aaaacacgtggtctccttcttgaaacttaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttc 738  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  737 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 5986 - 6334
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  5986 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacaagaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 6085  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6086 ccactcgatacgccaccgtcccaactctttccgatatctgatacgggccaataaatcttggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 6185  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6186 cacaggtgtgactctcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgatgctttc 6285  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||    
T  6286 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatct 6334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1524
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  1831 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgggaaaccaactctatatgccactgttccaaccctttctgata 1732  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||  ||| || || ||| |  |    
T  1731 tctgatacggactaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctccgaaatacatgatcttccac 1632  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||||  |||||    
T  1631 ctgaaactcaagggccttcctacacttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttctctctagtc 1532  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  1531 tgatgaac 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 22816 - 22993
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||| |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  22816 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacaaccaacaccggtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 22915  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  22916 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagactccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 22993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 180180 - 180536
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  180180 acatcaacactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacttgaaagacatcatgaaaattcgaaagatgcggtggtaagc 180279  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  180280 caactcgatacgccactgttctaactctttctgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcaggtccaacaccagt 180379  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  180380 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaactcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 180479  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  180480 atcttctcttgaatcatcttaactttctcaatagtctgctgaacaatatctggtcct 180536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 5184 - 5540
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5184 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacataattacgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcagtggtaatc 5283  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5284 ccactcgatacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcgacttccttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 5383  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5384 cacaggagtgactctcaaaaatatgtggtctccttctttaaactcaagatctttcctgcgtttaccatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 5483  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  5484 atcttttcttgaatcatcttaaccttttcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 5540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 127542 - 127186
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  127542 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgtaaattcgaaagatgcggtggtaaac 127443  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  127442 ccactcgatacgccaccattccaactctttctgatatctgatacggatcaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 127343  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  127342 cacatgagtgactctcaaaaacacgtgatctccttcttggaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctggaacgctttc 127243  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  127242 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 127186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Original strand, 43123 - 43473
Alignment:
Q  19 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactc 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  43123 tcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacattgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactc 43222  T
Q  119 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacagg 218  Q
      || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||    
T  43223 agtatgccaccgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgccctacaccagtcatagg 43322  T
Q  219 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43323 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctgcacttatcatggtaactcttttgtcgactttgcgacgctttcattttc 43422  T
Q  319 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  43423 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 43473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 8448 - 8797
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  8448 acatcgtcactctagatttcatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 8547  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  8548 ccactcggtaagccacccttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaggcacgtcctacaccagt 8647  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8648 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 8747  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8748 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 8797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 216 - 350
Target Start/End: Original strand, 13832 - 13966
Alignment:
Q  216 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 315  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13832 aggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctaaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 13931  T
Q  316 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  13932 ttctcttgaatcatctgaactttcttagtagtctg 13966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 50830 - 50556
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| |  | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  50830 ggatccggtacatacttccgcaactacgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 50731  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || ||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  50730 tctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 50631  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50630 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgttatgacagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 50556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 106757 - 106594
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| || | |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  106757 ggagtcaacttcctacactttaaagcaggaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 106658  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  106657 tcttatcatgataaatcttatgtctactctgagatgctttcatcttctcctgaatcatcctaac 106594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 219760 - 219404
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  219760 acatcatctctttggatcacatgagatggatctggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 219661  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  219660 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccagt 219561  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  219560 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatcttcttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 219461  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||| ||||    
T  219460 atcttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacgatttctggtcct 219404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 229006 - 229362
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  229006 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcatattcgaaagatgcggtggtaacc 229105  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  229106 ctattcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaacaaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtcccacaccagt 229205  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
     | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  229206 aataggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttgaaattcaaggtcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 229305  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  229306 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatctctggtcct 229362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33179 - 33016
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  33179 ggagtcaacttcttacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggtttcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 33080  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  33079 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 33016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1165 - 810
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  1165 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgtaatacatcatgcaatttcgaaagttgctgtggtaatc 1066  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||||||||  ||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1065 caactcgatattccacctttccatctttttcttatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 966  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  965 cacaggagtgactctcaaaaa-acgtggtctccttcttggaactcaagatcttttctacgcttttcatgataactcttttgtcgactctgtgacgcttcc 867  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  866 atcttctcttgaatcatcttaactttctcggtagtttgttgaacaatctctggtcct 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32744
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  33095 acatcatcactttggatcacatgagatggatccgtaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 32996  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  32995 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcgaagtcaacttctttaacttcaatgcaagtccaacaccagt 32896  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  32895 cacaagagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttaaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgaccctacgatgctttc 32796  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  32795 atcttttcttgaatcatcttaaccttcttagtagtttgttgaacaatttctg 32744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 6335 - 6691
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6335 acatcatcacctaggatcacatgggatggatccagtacatacttccgaagttgcgacacatgaaacatatcgtgcaaattcgaaagatgcggtgttaatc 6434  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6435 ccactcgatataccaccatcccaactctttccaatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 6534  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535 cacatgagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttctacgtttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 6634  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6635 atctactcttgaatcatcttaaccttctctgtagtttgctgaacaatctctggtcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1452
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||| |||||||||||      
T  1102 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccgaagttgcaacacataaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaat 1201  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  1202 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaacaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtcgaacaccagt 1301  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1302 cacaggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctacacttatcatggtaacttttttgtcgactctgcgacgctttc 1401  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctct 363  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||    
T  1402 atcttatcttgaatcatcttaaccttctcggtagtttgttgaacaatctct 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 7340 - 7689
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||| |    
T  7340 acatcgtcactctggattacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagatgaggtggtaaac 7439  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  7440 ccactcgctaagccaccgttccaactctctccaatatctgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 7539  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7540 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgtttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 7639  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7640 attttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtctgttgaacagtctc 7689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 14002 - 14350
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||| | |||||||||||  |||||| | | ||||||||| |||||||||||||||| || ||||  | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14002 acatcatcagtttggatcacatggaatggattctgtacatacttcggaagttgcgacacatgaaacacatagttcaaattcgaaagatgcggtggtaatc 14101  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14102 tcactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctcatacagaccaataaatctcggagtcaactactttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 14201  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14202 cacaggagtgactatcaaaaacatgtggtctccttcttgaaactcaagatctctcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 14301  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||    
T  14302 atcttctcttgaatcatcttaaccttcttggtagtttgctgaacaatct 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 340
Target Start/End: Original strand, 31373 - 31700
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  31373 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacaaaaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 31472  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  31473 caactctatatgccactgttccaaacctatcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 31572  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || || ||| ||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31573 catagaagtaactctcagaaacacatgatatccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttc 31672  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttct 340  Q
    || || |||   |||||||| |||||||    
T  31673 atcttttctctgatcatcttgactttct 31700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 265 - 369
Target Start/End: Original strand, 17657 - 17761
Alignment:
Q  265 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17657 ttcctacgcttatcattataacacttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttcttagtagtctgctgaacaatctctg 17756  T
Q  365 ctcct 369  Q
     ||||    
T  17757 gtcct 17761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 19 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 110148 - 109798
Alignment:
Q  19 tcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactc 118  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  110148 tcactctgaattacatgagagggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaagacattgtgcaaattcgaaagatgcggcggtaaacccactc 110049  T
Q  119 gatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacagg 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  110048 ggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcatagg 109949  T
Q  219 agtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttc 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  109948 agtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcattttc 109849  T
Q  319 tcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  109848 tcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 109798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 112540 - 112823
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| ||||| | ||| ||||| |    
T  112540 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaactgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggtaaacccaccctataagccactg 112639  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || | ||||||  | |||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  112640 ttccaactctctcagatatctgatatgggccaataaactttggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaa 112739  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  112740 gaacacatgatctccctcttgaaactcaagatccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 112823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 96345 - 96009
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || ||||| || ||||||||||| |  || |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  96345 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatcaggtacatacttccgcaactgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 96246  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | | || ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  || ||  | |||||||||||  | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  96245 caattctatacgccacagttccaactctttctgaaatctgataaggaccgatgaactttggagtcaactttctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 96146  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  96145 cataggagtaaccctcaaaaaaacatggtcaccttcctgaaattcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttc 96046  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || |||||    |||| | |||||||||| |||||||    
T  96045 atcttctccctgatcaccctaactttctccgtagtct 96009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 9306 - 9662
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  9306 acatcatcactttggatcacatgggatggatctagaacatactttcgaagttgcgacacatgaaacacatagtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 9405  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9406 ccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacagaccaataaatctaggagtcaccttctttgacttcaaagctcgtccaacaccagt 9505  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9506 cacaggagtgactctcaacaatacgtggtctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgccttc 9605  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| || | ||||||||||| ||||    
T  9606 atcttctcttgaatcatcttaacctactcggtagtttgttaaacaatctctggtcct 9662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 377 - 733
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  377 acatcgtcactctgaattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgcaagatgcggtggtaaac 476  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  477 ccactcggtaagccactgttccaactctttccaatatctgatacggaccaatgaatttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagt 576  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  577 cataggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaattcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgccttc 676  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  677 gttttctcttggatcatctgaactttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 362
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15804
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||  || |||||||| |    
T  15456 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttccgaagttgcgacccatgaaacacatcgtgcaaattcgaaaa-tgtggtggtaaac 15554  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15555 ctactcgatatgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgaaccaataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagt 15654  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655 cacaagaatgactgtcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 15754  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15755 atcttttcttgaatcattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 227 - 362
Target Start/End: Original strand, 15832 - 15967
Alignment:
Q  227 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 326  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15832 tcaaaaatacgtggtctccttcttgaaactcgaggtatttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaat 15931  T
Q  327 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15932 cattttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 15967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 14840 - 15196
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  14840 acatcatctctctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgcggtggtaagc 14939  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  14940 ccactcggtacgccaccgttccaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttatttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 15039  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15040 cacaggagtgactatcaaaaatacatgatctccttcatgaaactcaaggtctttcctaagcttatcatgataactcatatgtcgactctgagacgctttc 15139  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||    
T  15140 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctggtcct 15196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 325 - 26
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  325 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgatacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 226  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  225 tcactcgatacgccaccgttccaacactttccgatatctgatacggaccaataaatctcagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 126  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  125 cacatgagtgactctaaaaaatacatgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttc 26  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 16950 - 17284
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16950 acatcatctctttggatcacatgagatgcatccagaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17049  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |    
T  17050 ccacttgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacacaaat 17149  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17150 cacatgagtgactctcaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacactttc 17249  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    || || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17250 atcttttcttgaatcatcttaaccttcacagtagt 17284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16808 - 16462
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16808 acatcatcactttggatcacatgagatggatccggaacatacttctgaagttttaatacatggaacatatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16709  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  16708 ccactcgatacgccaccgttccaactcttttcgatatctgatacggaccagtaaacctctgagtcaacttctttgacttcaatgtgcgtccaacaccagt 16609  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16608 cacaggagtgactctcaaaaatacgtgatctccctcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcaactctgcgacgctttc 16509  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    || || | ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  16508 atcttttattgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 16462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 27930 - 28231
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  27930 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 28029  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28030 caactcgatacgccactgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctaggattcaacttctttgacttcacagcacgtccaacaccagt 28129  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28130 caccggagtaactctcaaaaacacatgatcaccctcttgaaattcaagatcctttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 28229  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  28230 at 28231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Original strand, 448022 - 448373
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  448022 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaaaatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 448121  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||    
T  448122 ccacttgatgcgccaccgttccaattctttccgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgctcgtccaacaatagt 448221  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  448222 tacaggagtgactctaaaaaatacgtgatctccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgatagctcttctgtcgactctgcgacactttc 448321  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  448322 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 448373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Original strand, 162076 - 162396
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  162076 acatcatcactttggatcacatgggatggatccggaacatacttctgaagttgcgaaacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 162175  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||||    
T  162176 ccactcggtacgccaccgttccaactctttctgatatctgatacgggccaataaatctcggagtcaagttctttgacttcgacgctcgtccaacaccagt 162275  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  162276 cataggagtgactctcaaaaatacgtggtctacttcttgaaacacaagatcttttttacgcttatcatgataactcttttgttgactctgcgacgctttc 162375  T
Q  313 attttctcttgaatcatctta 333  Q
    | | | |||| ||||||||||    
T  162376 actctttcttaaatcatctta 162396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 91239 - 90932
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  91239 acatacttccgcagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 91140  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||| ||| |||||||||||  | | |||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||  |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||    
T  91139 tctaatatggactaataaactttgaagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcgtaggagtaactctcagaaacacatgatctccctc 91040  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  91039 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 90940  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  90939 tgatgaac 90932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 78813 - 78636
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  78813 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactcctgtcacatgattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 78714  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| | |||| || || ||||| ||||  ||||||||| |||| || || |||||||    
T  78713 tcttatcatgataactcttctgtctaatctgagatgccttcatcttctactgaatcatcataaccttttccgtagtct 78636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 175352 - 175427
Alignment:
Q  139 ctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  175352 ctttccgatatctgatacggaccaataaacttcgggatcaacttctttgacttcaatgcacgtcctacacccgtca 175427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 369
Target Start/End: Original strand, 6900 - 7258
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaagg-tgcggtggtaat 111  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| |||||     
T  6900 acatcgtcactttggattacatgagatggatccggaacatactttcgaagttgcgacacatggaaaacgttgtgcaaattcgaaagaatgcggcggtaaa 6999  T
Q  112 cccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccag 211  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7000 cccactcggtaagccaccgttccaactctttccaatatctgatatggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccag 7099  T
Q  212 tcacaggagtgactctcaaaa-acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7100 tcataggagtgactctcaaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatcttttccacgcttatcgtgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 7199  T
Q  311 tcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7200 tcattttctcttagatcatctgaaccttctcagtagtttgctgaacaatctctggtcct 7258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 3995 - 4329
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  3995 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacaaatcatgcaaattcgaaagatgcggtagtaaac 4094  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  4095 ccacttgatacgccaccgttccaatcctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagt 4194  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4195 cacaggagtgactctcaaaaatacatgatctccttcttaaaactcaaggtctttcctacgcttatcatagtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 4294  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4295 atcttttcttggatcatcttaaccttctcagtagt 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 115 - 369
Target Start/End: Original strand, 21932 - 22186
Alignment:
Q  115 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  21932 actcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaagcacgtccaacaccagtcg 22031  T
Q  215 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22032 caggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatccttcctgcacttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcat 22131  T
Q  315 tttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22132 cttctcttgaatcattttaactttctcaatagtctgctgaacaatctctggtcct 22186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 25 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 26864 - 26530
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26864 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatcaaacacatcatggaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacg 26765  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||| |||  ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26764 ccaccgtttcaatcctttctgatatctgatacgggccaataaacctcggagtcaacttctttcacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtaac 26665  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26664 tctcaaaaatacgtgatctccttcctggaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttga 26565  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26564 atcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaat 26530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 196045 - 195703
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  196045 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 195946  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||  | || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  195945 caactctatatgccactgttccaaccttctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctagacttcaatgcacgtcctacacccgt 195846  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  195845 cataggagtaaccctcagaaa-acatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgtctctacgacgctttc 195747  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  195746 atcttctctatgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 195703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 148551 - 148834
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  || ||||| |    
T  148551 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacctactctgtatgccactg 148650  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || ||  ||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  148651 ttccaaccctctctcatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 148750  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| || || || || ||||  |||| |||  | || || || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  148751 aaatacatgatcaccctcttagaacttaagggcctttctacggttgtcatggtaactcttccgtcgactctgcgacgctttcat 148834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 68783 - 68575
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  68783 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 68684  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  68683 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgt 68584  T
Q  213 cacaggagt 221  Q
    || ||||||    
T  68583 cataggagt 68575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 122134 - 121971
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  122134 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 122035  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  122034 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatgttaac 121971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 180147 - 180209
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  180147 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgacttcatcttctcctgaatcatcttaac 180209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 114 - 369
Target Start/End: Original strand, 7854 - 8109
Alignment:
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  7854 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccggtc 7953  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954 accgaagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcctgaaactcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttca 8053  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8054 ttttctcttgaatcatcttaaccttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 8109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 347
Target Start/End: Original strand, 3115 - 3437
Alignment:
Q  25 tggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacg 124  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  3115 tggatcacgtaagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactcgatacg 3214  T
Q  125 ccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgac 224  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3215 ccaccgttccaattctttcaaatatctgatacgaaccaataaacctcgaagtcaacttctttgacttcaatgcgcgtccaacaccagtcacaggagtgac 3314  T
Q  225 tctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttga 324  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||     
T  3315 tctcaaaaatacatgatctccttcttgaaacttaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttgg 3414  T
Q  325 atcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  3415 atcatcttaaccttctcagtagt 3437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0877 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0877
Description:

Target: scaffold0877; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 590 - 252
Alignment:
Q  26 ggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  590 ggatcacatgagatggatccataacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgc 491  T
Q  126 caccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgact 225  Q
    |||| ||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  490 caccattccaatcctttctgatatctgatacggaccaataaatctcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtccaacaccggttacaggattgact 391  T
Q  226 ctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaa 325  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  390 ctcaaaaacacatggtccccttcttgaaactcaatgtctttcctacgcttatcatggtagttgttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgga 291  T
Q  326 tcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  290 tcatcttaaccttctcagtagtttgctgtacaatttctg 252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 15422 - 15079
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15422 acatcatctcttgggatgacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 15323  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15322 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacagaccaattaaccttagagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 15223  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15222 cacatgagtgactctcaaagatacatgatctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgatgctttc 15123  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||    
T  15122 atcttttcttggatcaacttaaccttctcagtagtttgttgaac 15079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13320 - 12969
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| || |||||||| |    
T  13320 acatcatctcttaggatcatatgagatggatccgaaaaatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgtaaattcaaaagttgtggtggtaaac 13221  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| |||||| ||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  13220 ccactccatacgctaccattcccattctttctgatatctgatacgaactaataaatctcgaagtcaatttcttagacttcaatgcacgtccaacaccagt 13121  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13120 cacaggagtgactctcaataacacatggtctccttcttgaaattcaagatctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13021  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13020 atcttttcttggatcatctaaactttctcagtagtttgctgaagaatttctg 12969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 111984 - 112327
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  111984 acatcatctcttgggatcacatgagatggatccgaaacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 112083  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  112084 ccactcgatacgccaccgttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacctgggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 112183  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  112184 cacaggagtgactctcaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtccttcttacgcttatcatgatatctcttttgtcgactctgtgatgctatc 112283  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||||| |||| |||||| |||||| |||| || |||||    
T  112284 atcttttcttggatcaacttaaccttctcaatagtttgttgaac 112327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 203811 - 203510
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  203811 acatcatccctcggaatcacatgcgatggatccaatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 203712  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||    
T  203711 ccactctatatgccactgttccaactcttttagatatctgatacggaccaataaacctcggcgtcaacttctttggcttcaaagcacggccagcacctgt 203612  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  203611 cacaagagtgactcttagaaacacatggtctccttcttgaaattcaaggtctttcctgcgcttatcgtgataaatcttctgtcgactctgcgacgctttc 203512  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  203511 at 203510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 322703 - 323010
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||  |||||||| || || ||||    
T  322703 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccattgttccaaccctctctgata 322802  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || || || ||    
T  322803 tctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcaccctc 322902  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  322903 ctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtc 323002  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  323003 tgatgaac 323010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 356
Target Start/End: Original strand, 117532 - 117874
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||    
T  117532 catcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacc 117631  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||  |||    
T  117632 aactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcccacactcgtc 117731  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  117732 ataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgtgacgctttca 117831  T
Q  314 ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | ||||||   |||||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  117832 tcttctctctgatcatcttgactttctccgtagtatgatgaac 117874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 385797 - 386118
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||    
T  385797 atcacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgcca 385896  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || |||||||| || | ||  |||||  ||||||||||||||||  |||||||  |||  || ||||| |||  ||||||||||||    
T  385897 ctgttccaactctctcagatatctggtatgaacctataaacttcggagtcaacttcttatacttcaacgcacaacctacacccgtcgtaggagtgactct 385996  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa-gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 326  Q
    || ||| |  || ||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||   ||    
T  385997 cagaaatagatgatctccctcttgaaactcaagggtcttt-cttcgcttgtcatggtaactcttctgtggactctgcgacgctttcatcttttctcttat 386095  T
Q  327 catcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||||||| ||||| |||||||    
T  386096 catcttaaccttctccgtagtct 386118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 49 - 359
Target Start/End: Original strand, 1 - 311
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1 acatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgaaaatttgaaagatgcggtggtaaaccaactcgatatgccactattccaactctttccgata 100  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |  || ||    
T  101 tctgatacggaccaataaatctcggagtcaactttttttacttcaaagcacgtccaacaccagtcaccggattgactctcaaaaacacatgataaccctc 200  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  201 ttgaaactcaagatcctttctacggttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgactcatcttaactttctcaatagtc 300  T
Q  349 tgctgaacaat 359  Q
    |||||||||||    
T  301 tgctgaacaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 63 - 362
Target Start/End: Original strand, 49506 - 49805
Alignment:
Q  63 ttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggacta 162  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  49506 ttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcggtacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgggcca 49605  T
Q  163 ataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagat 262  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  49606 ataaatctaggagtcaacttctttgacttcaaagctcgtccaacaacaatcacaggagtgactctaaaaaatatgtggtctccttcttgaaactcaaggt 49705  T
Q  263 ctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  49706 ctttcctacgcttatcatgataaatcttttgccaactctgcgacgctttcctcttttcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgttgaacaatctc 49805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 968 - 1301
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  968 acatcatcaccttggatcacataagatggatccagaacatactttcgaagttgcgttacatgaaagacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 1067  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1068 ccactcggtacgccaacgttccaactctttccgatatccgatacggaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagt 1167  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    |||||| ||||||||||| || || || ||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1168 cacaggggtgactctcaagaatacatgatctccttctttgaactcaaggtcttttctacgcttatcatgataactcttttgccgactctgcgacgatttc 1267  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    | ||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  1268 actttttctt-aatcgtcttaaccttctcagtagt 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 117233 - 116905
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  117233 atcacatgagatagatctgaaacatacttccgaagttacgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaatatacggtggtaaacccactcgatacgcca 117134  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    ||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  117133 ccgttacaattctttctgatatttgatacggaccaataaacctcggagtcaacttctttgacttcaatgcacgtccaacactattcacatgagtgactct 117034  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    |||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||    
T  117033 caaaaatacttgttctctttcttgaaactcaaggtctttcctacgtttatcatgataactcttttgtcgactctgcaacgctttcatcttttcttggatc 116934  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  116933 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 116905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 98137 - 98300
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||| |||| | || || ||||||||||| || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  98137 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcataggattcacccttaaaaacacgtgatcaccaacttgaaactcaatatccttactcc 98236  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  98237 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 98300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23650 - 23586
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacac 236  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  23650 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacac 23586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16759 - 16408
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||| |    
T  16759 acatcatctctttggatcacatgagatggatcccgaacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcgtacaaattcgaaagatgcggtggtaaac 16660  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | ||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |    
T  16659 ctacatgatacgccaccattccaattctttctgatatcttatacggaccaataaatctcggtgtcaacttcttcgacttcaatgcacgtccaacaccaat 16560  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||   |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16559 cactggagtgaccctaaaaaatacatgatctccttcttgaaatataagatcctccctacgcttatcatgataactcttttgtcgagtctgcgacgctttc 16460  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||    
T  16459 atcttttcttgaatcatcttaaccttctcagtagtttgttgaacaatttctg 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 886 - 1214
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  886 atcacatgagatggatccgaaacatacttccaaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcatattcgaaagatgcggtggtaaacccaatcgatatgcca 985  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||| |||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  986 ctgttccaattctttctgatatctgatatggaccaataaacctcggattcaatttctttcatttcaatgcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 1085  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||| |||    
T  1086 aaaaaatacatggtctccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatgataactcttttgtcaaatctgcgacgctttaatcttttcttggatc 1185  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
      |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  1186 cacttaatcttctcagtagtttgctgaac 1214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26047 - 25719
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26047 atcacatgagatggatccgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaaacccactcgatacgcca 25948  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||  || |||| |  ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25947 cggttccaattctttctgatatctgatacggaccaataaacatccgagttagtttccttgacttcaatgcacgtccaaccccagtcataggagtgactct 25848  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     ||||| || |||| |||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||     
T  25847 aaaaaatacatggtttccttcctgaaactcaaagtccttcctacgcttatcatgataattcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggatt 25748  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25747 aacttaaccttctcagtagtttgctgaac 25719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Original strand, 16920 - 17142
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  16920 acatcatcactctggatcacatgaaatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaaaacatcatgcaaattcgaaagatgcggtggtaaac 17019  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17020 caactcaatacgccaccgttaaaactctttccgatatctgatacgaacaaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaggcacgtccaacaccagt 17119  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaaca 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  17120 cacatgagtgactctcaaaaaca 17142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25399 - 25068
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||    
T  25399 atcacatgtgatggatccgatacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgcca 25300  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| | ||||||||||| || |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25299 ctgttccaactctttccgatatctgatacgagccaataaacctcagcgtcaacttcttcgatttcaaagcacgaccaacacctgtcacaggagtgactct 25200  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     | |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| || || || |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||     
T  25199 tagaaacacatggtctcctgcttgaaattcaagatctttcctacgtttgtcgtgataagtcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctcttatt 25100  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    | |||||| || || |||||||| ||||||||    
T  25099 agcttaaccttttctgtagtctggtgaacaat 25068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16355 - 16213
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| | |||||| ||||||||| | || || |||||||| || || ||  ||||||| || | ||| ||||| |    
T  16355 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgacaaacaccggtcacaggattcacccttaaaaacacatgatccccaacttgaaagtctatatccttcctcc 16256  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16255 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcat 16213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 5918 - 5588
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||| |||||| |    
T  5918 atcacatgagatggatccggaacatacttccgatgttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaactcactctatacgcaa 5819  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | || ||||||||||  || || ||||||| || | |||| ||||||| ||  ||||| ||||| |   | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5818 ctgtcccaactctttatgaaatatgatacgaaccattaaacctcggagacagtttcttcgactttagtgctcgtccaacaccggtcacaggagtgactct 5719  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  5718 caaaaatacatggtctccttcttgaaactcaagatcctt-ttgcgcttatcatgataactcttttgtctactctgcgacgctttcatcttctctctaatc 5620  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaat 359  Q
    | |||||| ||||| || || || ||||||||    
T  5619 aacttaaccttctctgttgtttgttgaacaat 5588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 361
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7708
Alignment:
Q  175 gtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgct 274  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  7522 gtcaacttctttgacttcaaagcacgtcctacaccagtcataggagtgactctcaaaaatacgtggtctccttcctgaaactcaagatcttttctacgct 7621  T
Q  275 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatct 361  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7622 tatcatgataactcatttgtcgactttgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtttgctgaacaatct 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 127 - 364
Target Start/End: Original strand, 9047 - 9284
Alignment:
Q  127 accgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactc 226  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9047 accgttccaattctttctgatatctgatacagaccaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaacgcacgtccaacaccggtcacaggagtgactc 9146  T
Q  227 tcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 326  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  9147 tcaaaaatacatgatccccttcttgaaactcaaggtctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttggat 9246  T
Q  327 catcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
     |||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  9247 tatcttaaccttctcagcagtttgttgaacaatttctg 9284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7052
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  6940 acatcatctctttggatcacatgagatggatccggaacatactttctaagttgtgacacttgaaacacatcatgcaaattcgaaacatgcggtggcaaac 7039  T
Q  113 ccactcgatacgc 125  Q
    |||||||||||||    
T  7040 ccactcgatacgc 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 517 - 351
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||| ||| |||||| | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| ||||| |    
T  517 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactagttacaggattcactctcaagaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatccttcctcc 418  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
     |||||||||||||||||| || | |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  417 tcttatcatgataactcttctgcctactctgagatgctttcatcttctcttgaatcatcttaacttt 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 86832 - 86496
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  86832 atcacatgagatggatctgaaacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgtaggttcgaaagttgcggtggtaaacccactctatacgcaa 86733  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |||  |||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||| || |   ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  86732 ccgacccaactctttccgaaatttgatacgggccaataaacctcgaagtcagtttctttgattttagtgcacgtccaacaccggtcacaagagtgactct 86633  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||   |||    
T  86632 aaaaaacacatggtatccttcttgaaactcaagatccttcctacgattatcatgataactcttttgtctactctgtgacgcttccatcttttctcttatc 86533  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctg 364  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  86532 aacttaaccttctcagtagtctgttgaaaaatgtctg 86496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 151 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 985 - 767
Alignment:
Q  151 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 250  Q
    |||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  985 tgatacggaccaatgaacttcggggtcaacttctttgacttcagtgcacgtcctacaccagtcataggagtgactctaaaaaatacgtggtctccttcct 886  T
Q  251 gaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 350  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  885 taaactcaagatcttttctacgcttatcatgataactcttttgtcgactctacgacgctttcattttctcttgaatcatctgaactttctcagtagtttg 786  T
Q  351 ctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  785 ctgaacaatctctggtcct 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 11064 - 10774
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || ||||| ||  |||||| ||| ||||| |    
T  11064 acatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaatccactctatatgccactg 10965  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||||| | || ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||| || |||||  |||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  10964 ttccaactttctcagatatctgatatggaccaataaacctcggtgtcaacttcttcgatttcaaggcacgacctatacctgtcacaggagtgactctcaa 10865  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10864 aaacacatggtctccttcttgtaactcaagatcctttctacacttgtcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 10774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 47123 - 47430
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  47123 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagata 47222  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || | |||||| || |||| |||||| || ||||| ||    
T  47223 tctgatacggaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgttataggagtaaccctcagaaacacatgatctccctc 47322  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  47323 ttgaaactcaagggccttcctacgcttttcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtc 47422  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  47423 tgatgaac 47430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Original strand, 26132 - 26448
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  26132 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacgtcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaactc 26231  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26232 tctcagatatctggtacggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacggcctacacccgtcataggagtgactctcaaaaacacatg 26331  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 339  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |||   |||||||| || |||    
T  26332 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtaatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttgatcttttctcttatcatcttgaccttc 26431  T
Q  340 tcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||    
T  26432 tccgtagtctgatgaac 26448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4181
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  3874 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaacactctcagata 3973  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||| ||| |||||| || ||||| ||    
T  3974 tctgatatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactatcagaaacacatgatctccctc 4073  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| ||||||    
T  4074 ttgaaactcaaggactttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgattctccgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtc 4173  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  4174 tgatgaac 4181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14244 - 13901
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  14244 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaacc 14145  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  14144 caactctatatgccactgttccaatcctttctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaatttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 14045  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttc 13945  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || ||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13944 atcttttcccttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 13901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5224 - 4960
Alignment:
Q  85 tgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttct 184  Q
    ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||     
T  5224 tgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcc 5125  T
Q  185 ttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgata 284  Q
    | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||  | || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||    
T  5124 tcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatcatcctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgata 5025  T
Q  285 actcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  5024 actcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtct 4960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 27500 - 27825
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  27500 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactg 27599  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || ||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  27600 ttccaaccctctctgatatcttatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcgatgcacgtcctacacctgtcataggagtaactctcag 27699  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| || |||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  27700 aaacacatgatctccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 27799  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27800 ttgactttctctgtagtctgatgaac 27825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1491 - 1149
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || |||   || |    
T  1491 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaatacatcattcaaattcgaaagatgtggtttcaaac 1392  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||   || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||    
T  1391 ctactttttatgccactgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataact-tcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacccgt 1293  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||| ||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  1292 cataggaatgattctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttc 1193  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  1192 atcttttctcttatcatcttgactttcttcgtagtctgatgaac 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18880 - 18537
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| || |    
T  18880 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggaaaac 18781  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||  || ||||| |||| ||| || || ||||||||||||  || ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||    
T  18780 ccactctgtatgccactgttctaaccctctctgatatctgatacaaaccaataaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacatcctacacccgt 18681  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18680 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 18581  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  18580 atcttttctcttatcatcttgactttctccgtagtctgatgaac 18537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3698 - 3637
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3698 acatcatctctccgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatg 3637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 9761 - 10099
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| || ||||| || |    
T  9761 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcaaaagatgtggtggcaaac 9860  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |     
T  9861 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatctgataaggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgtcctacacccgc 9960  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |     |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9961 cataggagtaactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcacg-----tcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 10055  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  10056 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 10099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 29076 - 28805
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  29076 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 28977  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28976 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 28877  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  28876 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 28805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 49 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 41067 - 40796
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || || | |||  | ||||||| ||| ||||| || |||||||| || || |    
T  41067 acatacttctgaagttgcgacacatgaagcacatcatgcaaattcgagagatgtgatgggtaacccactctatatgccactgtcccaactctctcagaga 40968  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| |||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40967 tctgatatggaccaataaaccgtggagtcaacttctttgacttcaaagcacgacagacacctgtcacatgagtgactctcaaaaacacatggtctccttc 40868  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    |||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  40867 ttgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactttgcgatgctttcatcttctc 40796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 10408 - 10090
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  10408 acatgcgaaggatccggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgccacag 10309  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  10308 ttccaactctttctgaactctgatatggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 10209  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || || || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||   ||||||    
T  10208 aaatacatgatcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgatgctttcatcttctctctgatcatc 10109  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
    || |||||||| |||||||    
T  10108 ttgactttctctgtagtct 10090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 13704 - 13362
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  13704 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 13605  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  13604 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 13505  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||| | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13504 cataggagtaactcttagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 13405  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  13404 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 17474 - 17132
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  17474 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 17375  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  17374 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 17275  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || || | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17274 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 17175  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  17174 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 17132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Original strand, 19973 - 20247
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||      
T  19973 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaacct 20072  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||    
T  20073 tctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtaaacttcttcgacttcaacgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatg 20172  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20173 atctccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatgataactcttttgtcgactctgggacgctttcat 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 40 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21987 - 21671
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  21987 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 21888  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | |||||||||| |||||||| ||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||    
T  21887 tctccgatatcttatacggaccaatgaacttcggaatcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatg 21788  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 339  Q
    ||  || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||    
T  21787 gttaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttc 21688  T
Q  340 tcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||||||||| |||||    
T  21687 tcagtagtctgatgaac 21671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Original strand, 26004 - 26091
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26004 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactatgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 26091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 4)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 94 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 58668 - 58448
Alignment:
Q  94 gaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttca 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  58668 gaaagatgcggtggtaaacccactctatacgcaaccgtcccaattctttctgaaatctgatacgggccaataaacctcggagtcagtttctttgatttca 58569  T
Q  194 aatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttg 293  Q
       || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  58568 gtgcatgtccaacaccggtcacatgagtggctctcaaaaacacatggtctccttcttgaaactcaagatccttcctatgcttatcatgataactcttttg 58469  T
Q  294 tcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  58468 tctactatgcgacgctttcat 58448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 349
Target Start/End: Original strand, 19120 - 19419
Alignment:
Q  50 catacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatat 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19120 catacttccgaagttgcgacacatgaaacacaacatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccctctccgatat 19219  T
Q  150 ctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttct 249  Q
    |||||||| || ||| ||| | |||||||||||| | ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||| || |||| ||| || || || || ||     
T  19220 ctgatacgaaccaatgaattttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccatcc 19319  T
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||||||||| || || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||||||| |||||||| |||||||    
T  19320 tgaaactcaaggtcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttccctgatcatcttgactttctctgtagtct 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 341
Target Start/End: Original strand, 74038 - 74191
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||||| || ||  |  | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  74038 acttcaaagcacgtccaacaccggttacaggattcactctcagaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatctttcctgctcttatcatgatagct 74137  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||| || | |||||| || ||| || | ||||   ||||||||||||| |||||    
T  74138 cttatgcctactctgagatgctctcgtcttcttgagaatcatcttaaccttctc 74191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 59100 - 59042
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatg 86  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  59100 atcacatgagatggatccgaaacatacatccgaagttgtgacacatgaaacacatcatg 59042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 52170 - 51863
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  52170 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 52071  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||| |||| | ||||  | |||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  52070 tctgatatggaccactaaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctc 51971  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||     
T  51970 ttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgaagctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtt 51871  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  51870 tgatgaac 51863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 37201 - 37508
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37201 acatacttccgaagttgcgagacatgtaacacatcatgcaaatttgaaagatgaggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctttcagata 37300  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| ||| |||||||| | |||||| || ||||   |    
T  37301 tctgatatagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggggtgactctaagaaacacatgatctctccc 37400  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  37401 ttgaaactcaatggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttaactttctccgtagtc 37500  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  37501 tgatgaac 37508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 38400 - 38180
Alignment:
Q  130 gttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 229  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  38400 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 38301  T
Q  230 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 329  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||    
T  38300 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcttggtaactcttctgtcgactctgcgacgcttccatcttttctctaatcat 38201  T
Q  330 cttaactttctcagtagtctg 350  Q
    ||| |||||||| ||||||||    
T  38200 cttgactttctccgtagtctg 38180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27563 - 27383
Alignment:
Q  130 gttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 229  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  27563 gttccaaccctctcagatatctgatacggaccaattaatttttgagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctca 27464  T
Q  230 aaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctt 310  Q
     ||| || || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27463 gaaatacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcgtggtaactcttctgtcgactctgcgacgctt 27383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7078
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| ||||||||||    
T  7352 ggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactgttccaactc 7253  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||||||| || |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||    
T  7252 tctcagatatctggtatggaccaatgaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtaaccctcagaaacacatg 7153  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||| |||||||  |||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7152 atctccctcttgacactcaagggcttttctacgcttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcat 7078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 10851 - 11193
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||| || |    
T  10851 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttctaaagatgtggtggcaaac 10950  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  10951 caactctatatgccactgttccaaccctctccgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 11050  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || || | ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11051 cataggagtaaccctaagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttc 11150  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaa 355  Q
    || ||||||   |||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11151 atcttctctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaa 11193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 400
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |||||||| |    
T  715 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacgccatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaaccc 616  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || || | ||| || ||    
T  615 tctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcgtcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctaagaaatacatg 516  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttc 339  Q
     || || || |||||||||||  | ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||||    
T  515 atcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgtttgtcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttgactttc 416  T
Q  340 tcagtagtctgctgaa 355  Q
    || |||||||| ||||    
T  415 tctgtagtctgatgaa 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7994 - 7831
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| ||||| |    
T  7994 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatccttcctcc 7895  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7894 tcttatcatgatagctcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 7831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6220 - 5956
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  6220 acatacttccgaagttgcgacacatg-aaaacatcaagcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctatatgccacagttccaactctctcagata 6122  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||| || |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| || |||| |||||| ||  |||| ||    
T  6121 tctggtatggaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaatgcacgacctacacccgtcataggagtaaccctcagaaacacatgagctccctc 6022  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6021 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgacactttcat 5956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 14049 - 14391
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  14049 acatcatccctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaac 14148  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||   || ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||| ||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| ||    
T  14149 ccactttgtatgccactgttccaac-ctttcagatatctagtacgaaccgataaacttcggagtcaacttcttcgacttcaacgcacgacctacacccgt 14247  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14248 cataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggcctttctatgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 14347  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  14348 atcttttctcttatcatcttgacattctccgtagtctgatgaac 14391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 18830 - 19113
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||  | ||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  18830 acatgcgaaggatccggtacatacttccacaattgtgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatacgccactg 18929  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    | |||||||| || ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||||    
T  18930 tcccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaa 19029  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  19030 gaacacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 19113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 314
Target Start/End: Original strand, 23094 - 23275
Alignment:
Q  133 ccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaa 232  Q
    |||||||| || ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  23094 ccaactctctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcaaga 23193  T
Q  233 acacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23194 acacatggtctccctcttgaaactcaaggtccttcatacgcttgtcatgatagctcttctgttgactctgcgacgctttcat 23275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 79 - 404
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||  || ||||| |    
T  79 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgtggtggtaaacccactctgtatgccactg 178  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||| |||||||     
T  179 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaaagcacgtcatacacccgtcataggagtaactctcag 278  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||||||  |  | || ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||    ||||||    
T  279 aaatacatgatctccctcttgaaactcaagggcccttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctacgatgctttcatcttttcccttatcatc 378  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  379 ttgactttctctgtagtctgatgaac 404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Original strand, 3872 - 4191
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || || || ||  | |||   || ||||| |    
T  3872 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacataatgcaaattcgaaagatgtggaggcaaaacaactatgtatgccactg 3971  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  3972 ttccaaccctctcagatatctgatacagaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcag 4071  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||    
T  4072 aaacacatgatctccatcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttatgtcgactctacgacgctttcatcttttctcttatcatc 4171  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctg 350  Q
    || |||||||| ||||||||    
T  4172 ttgactttctccgtagtctg 4191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Original strand, 6164 - 6483
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||||  | | ||| || || | || ||| ||||| |    
T  6164 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagaagagatggcaaaccaaatctatatgccacag 6263  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  6264 ttccaaatctttctgaaatctgataaggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 6363  T
Q  231 -aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcat 329  Q
     ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  6364 gaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctctatgatcat 6463  T
Q  330 cttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  6464 cttgactttctcagtagtct 6483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42676 - 42333
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| || |    
T  42676 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 42577  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||| ||    
T  42576 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacttcctacacccgt 42477  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  42476 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 42377  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  42376 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 42333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47742 - 47399
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| || ||||| || |    
T  47742 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatggaacacatcaagcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 47643  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||  ||| ||||| ||    
T  47642 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcatttcctacacccgt 47543  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  47542 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcaccctcctgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttcagtcgactctgcgacgcttcc 47443  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  47442 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtctgatgaac 47399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 230
Target Start/End: Original strand, 2252 - 2330
Alignment:
Q  152 gatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  2252 gatacggaccaataaacctcagagtcaacttctttgatttcaatgcacgtccaacacctatcactagagtgactctcaa 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 31 - 321
Target Start/End: Original strand, 172 - 462
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||| ||| ||||| |    
T  172 acatgcgaaggatctggtacatacttccgcaattgcgacacatgaaatacgtcatgcaaattcgaaagatgaggaggcaaaccaactctatatgccacag 271  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||  |||||||  ||||||| | ||| |||| |||||| || ||||     
T  272 ttccaactctttctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaagttcttcaacttcaacgcacgtcctatacccgtcataggagtaaccctcag 371  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctct 321  Q
    ||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  372 aaaaacatggtcaccctcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctct 462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1211
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || | |   || ||||| |||||||| |    
T  1485 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaatttcgaaagatgtggtggcaaacctattttttatgccactgttccaaccc 1386  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  1385 tctctgatatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcagaaacacatg 1286  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1285 atctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 1211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 4717 - 4567
Alignment:
Q  64 tgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaa 163  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4717 tgcgacagatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgcgatggtaaacccactcgatacgccaccgttccaattctttccgatacctgatacggaccaa 4618  T
Q  164 taaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4617 taaatctcggagtaaacttctttgacttcaatgcacgtccaacaccagtca 4567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 37089 - 36974
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  37089 acatcatcattctggatcacatcagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatgaaagacatcatgcaaattcgtaagaggcggtggtaatc 36990  T
Q  113 ccactcgatacgccac 128  Q
    | ||| ||||||||||    
T  36989 caactagatacgccac 36974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 250 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4560 - 4441
Alignment:
Q  250 tgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||| |    
T  4560 tgaaactcgagatctttcctacgcttatcatggtaactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttttcttgaatcatcttaagcttgtcagtagttt 4461  T
Q  350 gctgaacaatctctgctcct 369  Q
    | |||||||| |||| ||||    
T  4460 gttgaacaatttctggtcct 4441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 19045 - 18996
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaag 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19045 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaag 18996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 265 - 320
Target Start/End: Original strand, 58969 - 59024
Alignment:
Q  265 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  58969 ttcctacgctgatcatgataacgcttttgtctactctacgacgctttcatcttctc 59024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 356
Target Start/End: Original strand, 27207 - 27531
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  || ||||| |    
T  27207 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaatcccactctgtatgccacgg 27306  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | || |||||| |||||||     
T  27307 ttccaaccctctctgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccgacataggagtaactctcag 27406  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || | ||| |||||||| |||||  | ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||| || |||   ||||||    
T  27407 aaatacatgatatccctcttgaaattcaag-gccttcctacgctcgtcatggtaactcttctgtcgactctacggcgctttcatcttttctcttatcatc 27505  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || |||||||| |||||||| |||||    
T  27506 ttgactttctccgtagtctgatgaac 27531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 60 - 356
Target Start/End: Original strand, 4760 - 5056
Alignment:
Q  60 aagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacgga 159  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||    
T  4760 aagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaatttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcttatacgga 4859  T
Q  160 ctaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaa 259  Q
    | ||| ||  | |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || ||||| |||||||||||||    
T  4860 ccaatgaactttggagtcaatttcttagacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcttgaaactcaa 4959  T
Q  260 gatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    |  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4960 gggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgactttctcagtagtctgatgaac 5056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5309 - 5002
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||   || ||||  |||||||| || |  ||||    
T  5309 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcattcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactatgtatgccagtgttccaaccctcttagata 5210  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || ||||| ||    
T  5209 tctgatacgaaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacacacaacctacacccgtcataggagtgattctcagaaacacatgatctccctc 5110  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| || |||    
T  5109 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtggtc 5010  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  5009 tgatgaac 5002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14576 - 14257
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  14576 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 14477  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| || ||||     
T  14476 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaaccctcag 14377  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    ||| || || || || || | |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    
T  14376 aaatacatgatcaccctcctaaaactcaagggccttcctacgcttatcatgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctttgatcatc 14277  T
Q  331 ttaactttctcagtagtctg 350  Q
    || ||| ||||  |||||||    
T  14276 ttgactatctctatagtctg 14257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9202 - 9039
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||  ||| ||||| |    
T  9202 acatgcgaaggatccggtacatacttccgaagttgcgacacctgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactttatatgccactg 9103  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 194  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||    
T  9102 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaa 9039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49376 - 49033
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| || |    
T  49376 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacattatgaaaattcgaaagatgtggtggcaaac 49277  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||   || ||| | |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| ||    
T  49276 ccactttgtatgccgctgttccaaccctctcagatatctgatacggaccaataaactttggagtcaacttcttagacttcaacgcacttcctacacctgt 49177  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || ||| || ||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  49176 cataggtgttactctcagaaacacatgatttccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcatggtaactcttctatcgactctgcgatgctttc 49077  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  49076 atcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 49033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 58159 - 57859
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  58159 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 58060  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| |||||||||||||  || || || ||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  58059 caactctatatgccaccgttccaatcctctctgaaatctgatacagaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgt 57960  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    ||  ||||| ||||||||||| || || || || |  |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  57959 catcggagtaactctcaaaaatacatgatcacccttctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaact-ttttgtcaactctgcgacgctttc 57861  T
Q  313 at 314  Q
    ||    
T  57860 at 57859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Original strand, 2750 - 3057
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| || || ||||    
T  2750 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctctgata 2849  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| || || | ||| ||    
T  2850 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttctcagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtaactctcataaatacatgatatccctc 2949  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||    |||||||| |||||||| || |||    
T  2950 ttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaacccttctgtcgactctgcgacactttcatcttttcccttatcatcttgactttctctgttgtc 3049  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  3050 tgatgaac 3057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 13364 - 13189
Alignment:
Q  187 gacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataac 286  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |    |||||| || ||||||||||| |    
T  13364 gacttcaaagcacgcccaacgcccgtcaccggattgactcttaaaaatacatgatccccttcctgaaactccaatgatttccttcgtttatcatgatagc 13265  T
Q  287 tcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctc 362  Q
    |||| |||| ||| || || ||||||||| ||||| ||||||| || || || || || || ||||||||||||||    
T  13264 tcttctgtctactttgtgatgctttcattctctctcgaatcattttgaccttttcggtcgtttgctgaacaatctc 13189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 40 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33993 - 33719
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||| ||||||||||| |  |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| | ||| ||||| || || ||||    
T  33993 ggatccggtacatacttccgcaactgcgacacgtggaacacgtcatgcaaattcgaaagatgagggggcaaacccaccctataagccactgtcccgactc 33894  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | || ||||||||||| || | ||||||  |||||||||||||||| || || ||  |||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  33893 tctcagatatctgatatgggccaataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcacggcctacacctgtcataggagtgactctcaagaacacatg 33794  T
Q  240 gtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33793 atctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcatgatagctcttctgtcgactctgcgacgctttcat 33719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 40380 - 40543
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| || ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  40380 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaactccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 40479  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40480 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 40543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 61556 - 61220
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |    
T  61556 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaac 61457  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |    
T  61456 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 61357  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  61356 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 61257  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  61256 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 52522 - 52186
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  52522 acatcatctctcggaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaatttcgaaagatgaggtggcaaac 52423  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |    
T  52422 ccactctatatgccactgttccaacccttttagatatctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccat 52323  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| || |||| ||| || || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  52322 cataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttc 52223  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  52222 atcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 52186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 67908 - 67608
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||| ||||| |||||||| ||||  ||||    
T  67908 acatacttccgaagctgcgacacatgaaacacgtcatgcaaattcgaaagatgaggtggcaaacccactctatatgccactgttccaacccttttagata 67809  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||  ||| |||||| || |||| ||| || || || || ||    
T  67808 tctgatacagaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcctacacccatcataggagtaaccctcagaaatacatgatcgccctc 67709  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| |||||||| ||||||    
T  67708 ctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtc 67609  T
Q  349 t 349  Q
    |    
T  67608 t 67608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Original strand, 509 - 792
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  509 acatgtgaaggatccgctacatactttggaagttccgacacatggaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtaagccactg 608  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || || ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || || ||  |||  || ||||| |||| |||||| ||||||||    
T  609 ttccaaccctctctgaaatttgatacggaccgataaacttcggagtcaacttcttagattttaatgcactgcctacacctgtcataggagtaactctcaa 708  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
     ||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  709 gaacacatgatctccctcttgaaactcaaggtccttcctacgcttgtcacgatagctcttatgtcgactctgcgacgctttcat 792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Original strand, 39702 - 40045
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||| || |    
T  39702 acatcatctctcggaataacatgagaaggatccgctacatacttccgaagttgtgacacatgaaacacatcatgcaaattcgagagatgtggtggcaaac 39801  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    ||||||  || ||||| |||||||| || || |||||| ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||| |   | ||||| ||||| ||    
T  39802 ccactctgtatgccactgttccaaccctctcagatatcggatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttgagtgcgcgtcctacacccgt 39901  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttc 312  Q
    || |||||| ||||||| ||| || || ||||| || ||||||||||| || || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39902 cataggagtaactctcagaaatacatgatctccctcctgaaactcaaggtcctttctacgcttgtcatagtaactcttctgtcgactctgcgacgctttc 40001  T
Q  313 attttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    || || |||   || ||||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  40002 atcttttctcttataatcttgactttctcgttagtctgatgaac 40045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 258
Target Start/End: Original strand, 1167 - 1385
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactc 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |||||||| |    
T  1167 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactgttccaaccc 1266  T
Q  140 tttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtg 239  Q
    | |  |||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  1267 tctaagatatctgatacagaccaataaacttcggagtcaacttcttagacttcaacgcacgacctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatg 1366  T
Q  240 gtctccttcttgaaactca 258  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  1367 atctccctcttgaaactca 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26264 - 26203
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26264 acatcatcactttggatcacatgagatggatccagaacatacttccgaagttacgatacatg 26203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 31 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 49532 - 49214
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||| |    
T  49532 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgatacatgtaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacag 49433  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||     
T  49432 ttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcccacacccgtcataggaatgaccctcag 49333  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   ||||||    
T  49332 aaacacatgatcaccctcttgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatc 49233  T
Q  331 ttaactttctcagtagtct 349  Q
    || ||||| || |||||||    
T  49232 ttgactttttctgtagtct 49214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26190 - 25907
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||| || ||||| || |||||||  || ||||| |    
T  26190 acatgcgaaggatccgctacatatttccgaagttgcgacgcatgaaacacatcatgcaagtttgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgccactg 26091  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||| |||||||     
T  26090 ttccaaccctttttgatatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacatcctacacccgtcataggagtaactctcag 25991  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    ||| || || || || ||||||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25990 aaatacatgatccccctcttgaaactcaagggcctttctacgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgagacgctttcat 25907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Original strand, 16654 - 16940
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || |||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || || | ||| ||||    
T  16654 atcacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaacactatatgcca 16753  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    |  ||||||| || || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  16754 ctattccaaccctctctgaaatctgatacggaccaatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 16853  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  16854 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgccgactctgcgaagctttcat 16940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39229 - 38929
Alignment:
Q  14 catcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcc 113  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || || || ||||| ||| |||| || ||||| || ||    
T  39229 catcatccctctgaatcacatgagaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacttcgtgcaagttctaaagatgtggtggcaaacc 39130  T
Q  114 cactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtc 213  Q
     |||| ||| ||||| | ||||||||| || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||  |||| || ||||| |||    
T  39129 aactctatatgccactgctccaactctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaggcacgaccgacacccgtc 39030  T
Q  214 acaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca 313  Q
    | |||||||||||||| ||| || || || || || ||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  39029 aaaggagtgactctcagaaaaacatgatcaccctcctgaaattcaagatcctttcttcgcttgtcatgataactcttctgtcgactctacgaagctttca 38930  T
Q  314 t 314  Q
    |    
T  38929 t 38929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 338
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20410
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| |||||      
T  20103 acatgcgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 20202  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaa 230  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| | |||| || ||||     
T  20203 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtcataagagtaaccctcag 20302  T
Q  231 aaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatc 330  Q
    |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||    
T  20303 aaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctaatcatc 20402  T
Q  331 ttaacttt 338  Q
    || |||||    
T  20403 ttgacttt 20410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 43471 - 43804
Alignment:
Q  16 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 115  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |    
T  43471 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 43570  T
Q  116 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcac 215  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | || |||||  ||||||| || || ||||     
T  43571 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 43670  T
Q  216 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 315  Q
    |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| |||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  43671 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 43770  T
Q  316 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  43771 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 43804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 16 - 349
Target Start/End: Original strand, 44483 - 44816
Alignment:
Q  16 tcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatccca 115  Q
    ||||| ||||| || ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |    
T  44483 tcatctctctgaataacatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaaccaa 44582  T
Q  116 ctcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcac 215  Q
    ||| ||| ||||| |||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | || |||||  ||||||| || || ||||     
T  44583 ctctataggccacagttccaaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgaattcaatgcacgtcctaccccggtcat 44682  T
Q  216 aggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatt 315  Q
    |||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||  | || || ||||| |||||  ||||||| | |||||||| ||||||||||||     
T  44683 aggagtaaccctcagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctccgcttgtcatggcaactcttctatcgactctacgacgctttcatc 44782  T
Q  316 ttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    || |||   |||||||||||||| || |||||||    
T  44783 ttttctctgatcatcttaactttttctgtagtct 44816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 36036 - 36219
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccg 130  Q
    ||||| || |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| |||||      
T  36036 acatgcgaaggatccgctacatacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcttgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataggccacaa 36135  T
Q  131 ttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtca 214  Q
    ||||||| || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  36136 ttccaacactctctgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcttcgacttcaatgcacgtcccacacccgtca 36219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17041 - 16755
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| ||||    
T  17041 atcacatgtgaaggatccgcaacatacttccgaagctgagaaacatgaaacacatcgtgcaagttcgaaagatgaggtggcaaaccaactctatatgcca 16942  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||||||||| || || |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||| |||| ||||||||| ||    
T  16941 ctgttccaactctctctgaaatctaatacggaccaatgaacttaggagtcaactttctcgacttcaaagcacgaccgacacccgtcaaaggagtgaccct 16842  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  16841 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagatcctttcttcgcttgtcatggtaactcttctgtcggctctgcgaagctttcat 16755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Original strand, 26239 - 26560
Alignment:
Q  28 atcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgcca 127  Q
    |||||||| ||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  ||| ||| ||||    
T  26239 atcacatgcgaaagatccgccacatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccagctctataagcca 26338  T
Q  128 ccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactct 227  Q
    | ||||| || || || || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  26339 ctgttcccaccctctctgaaatctgatacggaccgatgaacttaggagtcaacttcctcgacttcaaagcacgtccaacacccgtcaaaggagtgaccct 26438  T
Q  228 caaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatc 327  Q
    || ||| || || || || || |||||||||||| | || || | ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    |||    
T  26439 cagaaaaacatgatcaccctcctgaaactcaagagcctttcttcacttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgaagctttcatcttttcccttatc 26538  T
Q  328 atcttaactttctcagtagtct 349  Q
    | | ||||||||||||||||||    
T  26539 aacctaactttctcagtagtct 26560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 349
Target Start/End: Original strand, 248612 - 248912
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||| |||||  |||||||| | || || |    
T  248612 acatacttccgaagttgtgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccacttttccaactttctctgaaa 248711  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || || || ||    
T  248712 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctcagaaaaacatgatcaccctc 248811  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||| ||    || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  248812 ctgaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtc 248911  T
Q  349 t 349  Q
    |    
T  248912 t 248912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4482 - 4235
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  4482 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaaac 4383  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagt 212  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| || |  || |||||||||||||  || ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4382 caactctatatgccacagttccaaccctctttgaaatctgatacggaccgatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgt 4283  T
Q  213 cacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaag 260  Q
    || |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||||||||    
T  4282 cataggagtaactcttaaaaacacatgatccccctcttgaaactcaag 4235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3804 - 3706
Alignment:
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||| ||||    
T  3804 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcatcttctcttgaatcatcttaactttctcgttagtttgctgaactatctctggtcct 3706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7543 - 7238
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||   ||| || |    
T  7543 acatacttccgaagttgcaacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaatatgtggtggcaaaccaactctatatgccactgttccaacc--ttctgaaa 7446  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||  ||| || ||| || |||| ||| || || || || ||    
T  7445 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccatcatagaagtaaccctcagaaatacatgatcaccctc 7346  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     ||||||| |||  | ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||   |||||||| |||||||| |||| |    
T  7345 ctgaaacttaagggccttcctacgcttgtcatgataactcttatgtcgactctgcgatgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagac 7246  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  7245 tgatgaac 7238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13088 - 12781
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||  || |||||||||||||  || || || |    
T  13088 acatacttccgaagctgtgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggcaagccaactctgtatgccaccgttccaatcctctctgaaa 12989  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttc 248  Q
    ||| |||||||| ||| ||  ||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  12988 tctaatacggaccaatgaacttcggagttaacttccttgatttcaaagcacgttctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccctc 12889  T
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
     |||||||||||  | || || ||||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||| || ||    |||||||| || |||||||| |||    
T  12888 ctgaaactcaagggcctttctccgcttatcatggtaacttttctatcgactctacgacgctttcatcttttcccttatcatcttgaccttctcagtcgtc 12789  T
Q  349 tgctgaac 356  Q
    || |||||    
T  12788 tgatgaac 12781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 350
Target Start/End: Original strand, 1916 - 2094
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||      
T  1916 ggagtcaacttcttagacttcaatgcacgtcctacacctgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctat 2015  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttca--ttttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctg 350  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||    
T  2016 gcttgtcatggtaactcttttgtcgactctgcgtcgctttcaccttttctctt--atcatcttgaccctctccgtagtctg 2094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1032 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1032
Description:

Target: scaffold1032; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2173 - 2028
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||  || ||||| |||||||| || |||||||    
T  2173 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtgtaaaacccactctgtatgccactgttccaaccctctccgata 2074  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaa 194  Q
    |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  2073 tctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcttagacttcaa 2028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 349
Target Start/End: Original strand, 42784 - 43082
Alignment:
Q  51 atacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatc 150  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||  | || || |||    
T  42784 atacttccgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcaaaagatgtggtggcaaaccaactctataagccactgttccaaccttctctgaaatc 42883  T
Q  151 tgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttctt 250  Q
    |||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||| || | ||| || || || || || |    
T  42884 tgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgaccctaagaaaaacatgatcaccctcct 42983  T
Q  251 gaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||||||| ||    || || ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||    |||||||| ||||||| ||||||||    
T  42984 gaaactctagggactttctccgcttgtcatggtaactattctgtcgactctgcgacgctttcatcttttcccttatcatcttgactttcttagtagtct 43082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 14661 - 14822
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  14661 acttcaaagcacgtccaacaccagtcacatgattcactctcaaaaacacatgatccccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 14760  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| || |||||||    
T  14761 cttctgtctactctgagactctttcatcttctcttcaatcatcttaaatttttccgtagtct 14822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 205 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1241
Alignment:
Q  205 acaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcg 304  Q
    ||||| |||| |||||| || |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1385 acacccgtcataggagtaaccctcagaaaaacatggtcaccttcctgaaactcaaggtctttcctacgcttgtcatgatagctcttttgtcaactctgcg 1286  T
Q  305 acgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||||||| |||||   ||||||||| |||||||| |||||||    
T  1285 acgctttcatcttctccctaatcatcttgactttctccgtagtct 1241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 301 - 369
Target Start/End: Original strand, 12738 - 12806
Alignment:
Q  301 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctgctcct 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12738 tgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaacaatctctggtcct 12806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13560 - 13380
Alignment:
Q  49 acatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaactctttccgata 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||  || | ||| |||||||| || || ||||    
T  13560 acatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaaagatgtggtggcaaacccactctgtatgtcactgttccaaccctctcagata 13461  T
Q  149 tctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctca 229  Q
    ||||||||  || ||| ||  | |||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  13460 tctgatacttaccaattaactttggagtcaacttcttagacttcaatgcatgtcctacacccgtcataggagtaactctca 13380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 209
Target Start/End: Original strand, 136082 - 136278
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| |||| ||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  136082 acatcatctctcgggataacatccgaaggatccgctacatacttccgaagttgcgacacgtgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtggaaaac 136181  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaactctttccgatatctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacacc 209  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||    
T  136182 caactctatatgccacagttccaactctctctgaaatctgatacggaccaatgaactttggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacc 136278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 6238 - 6333
Alignment:
Q  15 atcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaa 110  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  6238 atcatcactttggatcacatgggatggatccggtacatacttccaaagttgcgacacatgaaacacatcgtgcaaattcgaaagatgcggtggtaa 6333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 46276 - 46439
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| || |||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  46276 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggttacaggatttaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 46375  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  46376 tcttatcatgataactcttttgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 314
Target Start/End: Original strand, 5311 - 5477
Alignment:
Q  148 atctgatacggactaataaatctcggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctcctt 247  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| | || |||||| ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||| || || || || |    
T  5311 atctgatacggaccaatgaacttcggagtcaacttcctcgatttcaaagcacgtcctacacccgtcatcggagtaactctcaaaaatacatgatcaccct 5410  T
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcat 314  Q
    | |||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  5411 cctgaaactcaagggccttcctccgcttatcatggtaacttttctgtcgactctgcgacgctttcat 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 3281 - 3444
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| || || ||  | |||||||| |  || || || |    
T  3281 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaataccggtcacaggattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcgatgtcctttctcc 3380  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3381 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaac 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 356
Target Start/End: Original strand, 1 - 176
Alignment:
Q  181 ttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcat 280  Q
    ||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||    
T  1 ttcttagacttcaatgcacgtcctacacccgtcataggagtgactctcagaaacacatgatctccctcttgaaactcaagggccttcctacgcttgtcat 100  T
Q  281 gataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    | |||||||| || |||||||  ||||||||||| || |||   |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  101 ggtaactcttctgccgactctatgacgctttcatcttttctcttatcatcttgaccttctccgtagtctgatgaac 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1222 - 1061
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| || || || ||  |  ||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  1222 acttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcactctaaaaaatacatgatcgccaaccagaaactcaatatcttttctcctcttatcatgataact 1123  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || || |||||||    
T  1122 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggaccatcttaaccttttccgtagtct 1061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 570 - 393
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  ||| |||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| ||  | ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  570 ggagtcaacttcctacactccaaagcacggccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgagcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 471  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||    
T  470 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtct 393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 8217 - 8394
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  || ||||| |||| |||||||| |||||| || | || |||||||| || || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  8217 ggagtcaacttcctacacatcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaatacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 8316  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     ||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8317 tcttatcatgataagtcttctgtctactctgagacgctttcatattctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 8394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 23518 - 23679
Alignment:
Q  174 agtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgc 273  Q
    |||||||||| |  |||||||| |||| ||||| || |||||| || | || |||||||||||||| || |   |||||||||||| ||| || || | |    
T  23518 agtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaactccggtcacatgattcaccctcaaaaacacgtgatcactaacttgaaactcaatatcctttctcctc 23617  T
Q  274 ttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23618 ttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 13030 - 13207
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||| ||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  13030 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacagggttcactctcaacaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 13129  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||    
T  13130 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcattttaaccttttccgtagtct 13207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7559 - 7498
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatg 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7559 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacaaacttccgaagttgcgacacatg 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5537 - 5467
Alignment:
Q  271 cgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctc 341  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||   |||||||| ||||||||    
T  5537 cgcttgtcatggtaactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttttctctgatcatcttgactttctc 5467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 3896
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||| ||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||| |||||||| || ||  |  | |||||||||| ||| || || |    
T  4059 ggagtcaacttcctacactttaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcactcttaaaaacacatgatcatcaacctgaaactcaatatcctttctcc 3960  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3959 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaac 3896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28450 - 28287
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| |||||| || | || ||||||||||| || || ||| |||| ||||||| ||| || || |    
T  28450 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcacctacttgtaactcaatatcctttctcc 28351  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28350 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 28287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1094 - 940
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  1094 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccggtcacaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 995  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaat 326  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  994 tcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgccttcatcttctcctgaat 940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9059 - 8898
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| || ||| || | || ||||||||||  || || ||  | ||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  9059 acttcaaagcacgaccaacaccggtgacatgattcaccctcaaaaacagatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctcttatcatgataact 8960  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  8959 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttccgtagtct 8898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 14779 - 14956
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||| | || || |||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || |    
T  14779 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcacaggattcaccctaaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcc 14878  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
     ||||||||||||||| || |||| |||||| ||| | ||||| ||||| | |||||||||||| || || |||||||    
T  14879 tcttatcatgataacttttctgtctactctgagacaccttcatcttctcctaaatcatcttaaccttttccgtagtct 14956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 249 - 349
Target Start/End: Original strand, 43737 - 43837
Alignment:
Q  249 ttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtc 348  Q
    ||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  43737 ttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttatgtctactctgagacgctttcatcttctcctgaatcatcttaaccttttccgtagtc 43836  T
Q  349 t 349  Q
    |    
T  43837 t 43837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14921 - 14758
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||  |||||| || | || ||||||||||| || || ||  | ||||| |||| ||| || || |    
T  14921 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacactggtcacatgattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaattcaatatcctttctcc 14822  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14821 tcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttctcttgaatcatcttaac 14758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3446 - 3355
Alignment:
Q  265 ttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtctgctgaac 356  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3446 ttcctacgtttatcacgataactcttctgtcgactctgcgacgctttcatcttctctctgatcatcttaactttctctgtagtctgatgaac 3355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 3611 - 3487
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||| || |    
T  3611 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttccgaagtagcgacacatgatacacatcatgcaagttcgaaagatgaggtggcaaac 3512  T
Q  113 ccactcgatacgccaccgttccaac 137  Q
    | |||| ||| ||||| ||||||||    
T  3511 caactctatatgccactgttccaac 3487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 335
Target Start/End: Original strand, 24002 - 24165
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || |    
T  24002 ggagtcaacttcctacacttcaaagcacgaccaacaccagtcaccggattaactctaaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcc 24101  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
     |||||||||||||||||| |||| ||| || || ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24102 tcttatcatgataactcttctgtctactttgagatgctttaatcttctcctgaatcatcttaac 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 10493 - 10625
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  10493 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaaaggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 10592  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  10593 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 10625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 5879 - 6011
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  5879 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 5978  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  5979 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 6011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 349
Target Start/End: Original strand, 9125 - 9286
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||| || | |||||||| || || || || ||  | |||||||||| ||| || ||   |||||||||||| ||    
T  9125 acttcaaagcacgaccaacaccagttacatgattcactctcaagaatacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcatcttatcatgatagct 9224  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  9225 cttctatctactctgagacgctttcatcttctcttgaatcatcttaaccttttctgtagtct 9286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 40 - 137
Target Start/End: Original strand, 45835 - 45932
Alignment:
Q  40 ggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatcccactcgatacgccaccgttccaac 137  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||    
T  45835 ggatccgctacatacttccgaagttgcgacacatgaaacacatcatgcaaattcgaatgatgtggtggaaaaccaactctatatgccactgttccaac 45932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 320
Target Start/End: Original strand, 8488 - 8620
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| | || ||||||||||| || || ||  ||||| |||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  8488 acttcaaagcacgaccaacaccggtcataggattcaccctcaaaaacacatgatcaccaacttgatactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 8587  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctc 320  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  8588 cttctgtctactctgagacgctttcatcttctc 8620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 349
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13550
Alignment:
Q  197 cacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcg 296  Q
    |||| ||||||||||| |||||| | |||||||| || ||||| || ||  | |||||||||| ||| || || |  ||||||||||| ||||| | ||     
T  13398 cacgaccaacaccagttacaggattaactctcaagaatacgtgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctccttttatcatgatagctcttctatct 13497  T
Q  297 actctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  13498 actctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttctgtagtct 13550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 273 - 349
Target Start/End: Original strand, 71442 - 71518
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||    
T  71442 cttatcatgataactcttctgtctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagtct 71518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4112 - 3965
Alignment:
Q  188 acttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataact 287  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||   | | |||||||||||||| || || ||  | |||||||||| ||| || || | |||||||||||||||    
T  4112 acttcaaagcacgaccaacaccggtcaccaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataact 4013  T
Q  288 cttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||| |||| ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4012 cttatgtctactttgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 3965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 1532 - 1431
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagt 347  Q
    |||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||    
T  1532 cttgaaactcaatatcctttctcttcttatcatgataactcttctatctactctgagacgctttcatcttctcttggatcatcttaaccttttccgtagt 1433  T
Q  348 ct 349  Q
    ||    
T  1432 ct 1431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 335
Target Start/End: Original strand, 10781 - 10941
Alignment:
Q  175 gtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgcgct 274  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||| || |||  | | |||||||||||||| || || ||  | ||||||||||  || ||||| | ||    
T  10781 gtcaacttctaacacttgaaagcacgtccaacaccggttacaaaattcactctcaaaaacacatgatcaccaacctgaaactcaatgtccttcctcctct 10880  T
Q  275 tatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    ||||||| |||||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10881 tatcatggtaactcttctgcctactatgagacgctctcatcttctcttgaatcatcttaac 10941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26265 - 26178
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||| ||| || || | |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||    
T  26265 cttgaaactcaatatcctttctcctcttatcatgataactcttctgtctactctgagacgccttcatcttttcctgaatcatcttaac 26178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Original strand, 9182 - 9287
Alignment:
Q  13 acatcatcactctggatcacatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtggtaatc 112  Q
    |||||||| ||| | || ||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||    
T  9182 acatcatctctcggaataacatgtgaaggatccgctacatacttctgaagttgcgacatatgaaccacatcatgcaaattcgaaagatatggtggcaatc 9281  T
Q  113 ccactc 118  Q
    ||||||    
T  9282 ccactc 9287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 338
Target Start/End: Original strand, 14370 - 14425
Alignment:
Q  283 taactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
    |||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14370 taactcttctgtctactctgagatgctttcattttctcttgattcatcttaacttt 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 18332 - 18394
Alignment:
Q  273 cttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaac 335  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18332 cttatcatgataactcttctgcctactctgagacgccttcatcttctcctgaatcatcttaac 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 349
Target Start/End: Original strand, 10891 - 11068
Alignment:
Q  172 ggagtcaacttctttgacttcaaatcacgtccaacaccagtcacaggagtgactctcaaaaacacgtggtctccttcttgaaactcaagatctttcctgc 271  Q
    |||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||  |||| || ||| || || | |||||| || || || || |||||||||||  | || || |    
T  10891 ggagtcaacttcctcgacttcaatgcacgtcctacacatgtcatagaagtaaccctaagaaacacatgatcaccctcctgaaactcaagggcctttctcc 10990  T
Q  272 gcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaactttctcagtagtct 349  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||   |||||||| |||||||| |||||||    
T  10991 gcttgtcatggtaactcttctgtcgactctaagacgcattcatcttttctctgatcatcttgactttctctgtagtct 11068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1508 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1508
Description:

Target: scaffold1508; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 962 - 886
Alignment:
Q  31 acatgagatggatccggaacatacttccgaagttgcgacacatggaaaacatcatgcaaattcgaaaggtgcggtgg 107  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  962 acatgtgaaggatccgctacatacttctgaagctgcgacacatgaaacacatcatgcaagttcgaaagatgtggtgg 886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1068 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1068
Description:

Target: scaffold1068; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 820
Alignment:
Q  248 cttgaaactcaagatctttcctgcgcttatcatgataactcttttgtcgactctgcgacgctttcattttctcttgaatcatcttaacttt 338  Q
    |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | |||||| || || ||||| || || | |||||||||||||||    
T  910 cttgaaactcaatatccttcctcctcttatcatgataaatcttctgcctactctgagatgcattcatcttttcctaaatcatcttaacttt 820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 889 times since January 2019
Visitors: 2241