View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0174_low_7 (Length: 308)

Name: NF0174_low_7
Description: NF0174
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0174_low_7
NF0174_low_7
[»] chr1 (29 HSPs)
chr1 (1-222)||(34066718-34066939)
chr1 (15-203)||(7635284-7635472)
chr1 (1-203)||(11668322-11668524)
chr1 (1-203)||(41058598-41058800)
chr1 (15-204)||(27332066-27332255)
chr1 (1-203)||(20398478-20398680)
chr1 (1-203)||(45941041-45941243)
chr1 (16-203)||(28110697-28110883)
chr1 (1-199)||(21018766-21018964)
chr1 (1-203)||(23022220-23022422)
chr1 (1-189)||(34732670-34732857)
chr1 (12-203)||(21107587-21107778)
chr1 (15-203)||(45961041-45961229)
chr1 (12-203)||(49853374-49853565)
chr1 (12-203)||(905985-906176)
chr1 (12-203)||(3797122-3797313)
chr1 (15-203)||(31204477-31204665)
chr1 (15-203)||(37184160-37184348)
chr1 (15-204)||(6071249-6071438)
chr1 (12-203)||(2405146-2405337)
chr1 (15-203)||(27536583-27536770)
chr1 (63-185)||(37907560-37907682)
chr1 (85-203)||(2793937-2794055)
chr1 (104-203)||(42022402-42022502)
chr1 (110-203)||(1950751-1950845)
chr1 (87-203)||(49498794-49498910)
chr1 (125-203)||(673369-673448)
chr1 (74-139)||(13431492-13431557)
chr1 (108-203)||(29643517-29643613)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-218)||(5259562-5259779)
chr6 (1-203)||(11188212-11188414)
chr6 (1-203)||(28665560-28665762)
chr6 (1-203)||(30655069-30655271)
chr6 (12-203)||(11125992-11126183)
chr6 (1-203)||(10289598-10289800)
chr6 (1-203)||(11401882-11402084)
chr6 (1-218)||(13004814-13005031)
chr6 (12-203)||(2845938-2846129)
chr6 (1-203)||(26942731-26942933)
chr6 (18-203)||(3597078-3597263)
chr6 (15-211)||(28108077-28108273)
chr6 (1-218)||(14281802-14282022)
chr6 (1-213)||(6512878-6513089)
chr6 (1-203)||(2378855-2379057)
chr6 (15-211)||(28112053-28112249)
chr6 (1-203)||(20185370-20185572)
chr6 (1-203)||(22150419-22150621)
chr6 (1-203)||(11247384-11247589)
chr6 (12-203)||(18856321-18856512)
chr6 (67-203)||(12988422-12988557)
chr6 (12-203)||(28230231-28230422)
chr6 (15-203)||(24399819-24400007)
chr6 (67-203)||(13021551-13021686)
chr6 (12-203)||(19475639-19475830)
chr6 (12-203)||(26898165-26898356)
chr6 (15-203)||(31071944-31072132)
chr6 (67-203)||(11192876-11193011)
chr6 (48-203)||(22561460-22561615)
chr6 (12-201)||(4512109-4512298)
chr6 (15-203)||(24409939-24410127)
chr6 (63-203)||(9839691-9839831)
chr6 (108-203)||(9953695-9953791)
chr6 (60-182)||(8850494-8850616)
chr6 (125-203)||(23388393-23388472)
chr6 (126-204)||(28848592-28848670)
chr6 (1-58)||(15543635-15543692)
chr6 (68-203)||(1126032-1126159)
chr6 (85-203)||(5738381-5738499)
chr6 (154-203)||(24371052-24371101)
chr6 (12-73)||(13942200-13942261)
chr6 (150-203)||(13946792-13946846)
chr6 (159-218)||(2372108-2372168)
chr6 (70-125)||(7918066-7918123)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-218)||(53094130-53094347)
chr4 (1-203)||(39501271-39501473)
chr4 (1-203)||(19820351-19820553)
chr4 (1-203)||(40903380-40903582)
chr4 (1-203)||(24150295-24150497)
chr4 (1-203)||(27677351-27677553)
chr4 (3-201)||(27691442-27691640)
chr4 (1-203)||(48637128-48637330)
chr4 (6-203)||(15436766-15436963)
chr4 (1-201)||(8875060-8875260)
chr4 (1-203)||(19827113-19827315)
chr4 (1-203)||(24044437-24044639)
chr4 (1-203)||(48415826-48416028)
chr4 (1-203)||(52531232-52531434)
chr4 (6-203)||(15430152-15430349)
chr4 (1-203)||(3718747-3718949)
chr4 (1-203)||(38283785-38283987)
chr4 (1-203)||(52006827-52007029)
chr4 (1-203)||(40794625-40794827)
chr4 (12-203)||(44164417-44164608)
chr4 (1-203)||(8877798-8878000)
chr4 (1-203)||(12782528-12782730)
chr4 (1-203)||(34018078-34018279)
chr4 (11-203)||(29545170-29545362)
chr4 (12-203)||(8448839-8449030)
chr4 (35-201)||(48014349-48014512)
chr4 (15-203)||(15405381-15405569)
chr4 (15-203)||(56195164-56195352)
chr4 (12-203)||(25961692-25961883)
chr4 (12-203)||(40493664-40493854)
chr4 (35-203)||(29324482-29324650)
chr4 (15-203)||(33926604-33926792)
chr4 (15-203)||(34320214-34320402)
chr4 (15-203)||(46955775-46955963)
chr4 (35-203)||(56198510-56198678)
chr4 (12-203)||(35509599-35509790)
chr4 (12-203)||(53009854-53010045)
chr4 (39-203)||(15163853-15164017)
chr4 (12-203)||(21419422-21419614)
chr4 (12-178)||(18673392-18673558)
chr4 (68-203)||(37740059-37740193)
chr4 (15-203)||(11195312-11195501)
chr4 (15-203)||(44809252-44809440)
chr4 (12-170)||(30392207-30392364)
chr4 (125-206)||(5677702-5677783)
chr4 (85-203)||(5672588-5672709)
chr4 (68-218)||(19859803-19859952)
chr4 (85-203)||(27013970-27014088)
chr4 (85-203)||(5670269-5670391)
chr4 (108-218)||(19864794-19864904)
chr4 (81-189)||(18911257-18911365)
chr4 (87-203)||(5681137-5681253)
chr4 (108-203)||(15431808-15431904)
chr4 (108-203)||(15438422-15438518)
chr4 (133-203)||(33408614-33408685)
chr4 (135-212)||(33493981-33494059)
chr4 (108-203)||(37103511-37103607)
chr4 (108-203)||(15812434-15812532)
chr4 (125-204)||(22172669-22172751)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (35-206)||(9595-9766)
[»] chr3 (74 HSPs)
chr3 (1-218)||(32287592-32287809)
chr3 (1-203)||(11190235-11190437)
chr3 (1-203)||(25584396-25584598)
chr3 (6-204)||(22360160-22360357)
chr3 (1-203)||(2873273-2873475)
chr3 (12-203)||(17544336-17544526)
chr3 (1-203)||(20728930-20729132)
chr3 (1-203)||(41976724-41976926)
chr3 (1-203)||(3840225-3840427)
chr3 (1-203)||(30220292-30220494)
chr3 (1-203)||(34984136-34984338)
chr3 (1-203)||(54723450-54723652)
chr3 (1-203)||(30690444-30690647)
chr3 (1-203)||(16243583-16243784)
chr3 (1-203)||(24125208-24125410)
chr3 (1-203)||(24128485-24128687)
chr3 (1-203)||(29344158-29344360)
chr3 (6-204)||(22370063-22370260)
chr3 (1-203)||(7486279-7486481)
chr3 (1-203)||(28008353-28008555)
chr3 (1-203)||(45896089-45896291)
chr3 (1-203)||(49743203-49743405)
chr3 (1-203)||(2775191-2775392)
chr3 (1-203)||(2778434-2778635)
chr3 (1-203)||(27091603-27091805)
chr3 (1-203)||(43926544-43926746)
chr3 (6-204)||(22993981-22994177)
chr3 (22-199)||(52309845-52310022)
chr3 (12-200)||(19301791-19301979)
chr3 (7-202)||(22783307-22783502)
chr3 (7-202)||(22787671-22787866)
chr3 (2-203)||(17040305-17040506)
chr3 (12-200)||(19304975-19305163)
chr3 (67-203)||(11636608-11636743)
chr3 (12-203)||(22417117-22417308)
chr3 (12-203)||(43809299-43809490)
chr3 (12-203)||(54719691-54719882)
chr3 (13-210)||(46884674-46884870)
chr3 (15-203)||(50461832-50462020)
chr3 (9-203)||(25443143-25443337)
chr3 (15-203)||(35751177-35751365)
chr3 (12-203)||(12561517-12561708)
chr3 (12-203)||(52988125-52988316)
chr3 (15-203)||(47054648-47054836)
chr3 (12-203)||(15195585-15195776)
chr3 (12-203)||(17141128-17141319)
chr3 (15-204)||(18542273-18542463)
chr3 (60-211)||(27308297-27308448)
chr3 (1-156)||(31548965-31549119)
chr3 (15-203)||(47051218-47051406)
chr3 (12-203)||(10881200-10881391)
chr3 (60-211)||(27298737-27298889)
chr3 (12-199)||(32367416-32367603)
chr3 (13-203)||(48064318-48064508)
chr3 (85-203)||(55035143-55035262)
chr3 (12-203)||(11784485-11784676)
chr3 (60-178)||(27308887-27309005)
chr3 (85-203)||(9392529-9392645)
chr3 (15-203)||(3293244-3293418)
chr3 (85-203)||(8461770-8461889)
chr3 (85-203)||(6435061-6435179)
chr3 (85-203)||(28265673-28265791)
chr3 (85-198)||(10884651-10884764)
chr3 (111-203)||(52199731-52199824)
chr3 (108-203)||(10106882-10106978)
chr3 (85-203)||(35412308-35412426)
chr3 (85-203)||(53815621-53815739)
chr3 (133-203)||(538666-538737)
chr3 (113-203)||(16184971-16185062)
chr3 (125-204)||(38386818-38386898)
chr3 (127-203)||(31857650-31857727)
chr3 (133-203)||(17529040-17529111)
chr3 (85-167)||(18645025-18645106)
chr3 (108-203)||(6922561-6922657)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-203)||(7270640-7270842)
chr5 (1-199)||(34831387-34831585)
chr5 (1-203)||(33551745-33551947)
chr5 (1-203)||(41306823-41307025)
chr5 (1-203)||(18239792-18239994)
chr5 (1-203)||(26752998-26753200)
chr5 (1-203)||(30065966-30066168)
chr5 (1-203)||(41877061-41877263)
chr5 (1-203)||(4099813-4100020)
chr5 (1-203)||(18952317-18952519)
chr5 (6-203)||(17664181-17664378)
chr5 (1-203)||(26895900-26896102)
chr5 (15-204)||(31575055-31575244)
chr5 (12-203)||(26907751-26907942)
chr5 (12-203)||(40582884-40583075)
chr5 (15-203)||(7624740-7624928)
chr5 (35-203)||(22129923-22130090)
chr5 (12-203)||(34133279-34133470)
chr5 (12-203)||(34143510-34143701)
chr5 (15-203)||(14016435-14016623)
chr5 (12-203)||(12087593-12087784)
chr5 (12-203)||(17748075-17748266)
chr5 (12-203)||(23043800-23043990)
chr5 (12-203)||(26292426-26292617)
chr5 (1-147)||(18032082-18032227)
chr5 (15-203)||(20055412-20055600)
chr5 (12-203)||(12058788-12058979)
chr5 (73-202)||(21914818-21914946)
chr5 (82-203)||(21332978-21333099)
chr5 (85-203)||(31863407-31863526)
chr5 (82-203)||(21335994-21336115)
chr5 (85-203)||(22937234-22937352)
chr5 (85-203)||(42062629-42062747)
chr5 (35-204)||(563518-563686)
chr5 (96-211)||(18765929-18766044)
chr5 (85-203)||(28441431-28441549)
chr5 (114-203)||(43491491-43491581)
chr5 (113-203)||(28787619-28787710)
chr5 (1-66)||(2836998-2837063)
chr5 (124-203)||(11959466-11959546)
chr5 (108-203)||(14376104-14376202)
chr5 (82-203)||(32837725-32837844)
chr5 (150-203)||(2837075-2837129)
chr5 (167-203)||(39192118-39192154)
[»] chr2 (51 HSPs)
chr2 (1-203)||(5105332-5105534)
chr2 (1-203)||(40781078-40781280)
chr2 (1-203)||(43723307-43723509)
chr2 (6-203)||(30926158-30926355)
chr2 (1-203)||(9185722-9185923)
chr2 (1-203)||(6826378-6826580)
chr2 (1-203)||(42369008-42369210)
chr2 (1-203)||(9188950-9189152)
chr2 (1-203)||(25959986-25960188)
chr2 (1-218)||(22020674-22020890)
chr2 (1-203)||(11348193-11348395)
chr2 (1-203)||(37279974-37280176)
chr2 (1-203)||(43208187-43208389)
chr2 (2-203)||(8888242-8888444)
chr2 (1-203)||(24234701-24234903)
chr2 (1-203)||(24237973-24238175)
chr2 (1-203)||(27266394-27266596)
chr2 (1-203)||(13972191-13972393)
chr2 (12-203)||(12219412-12219603)
chr2 (12-203)||(16791056-16791247)
chr2 (12-203)||(17876308-17876499)
chr2 (15-203)||(45453494-45453682)
chr2 (15-203)||(45456781-45456969)
chr2 (12-203)||(22630459-22630649)
chr2 (35-203)||(38015158-38015326)
chr2 (12-203)||(1386719-1386910)
chr2 (12-203)||(16178744-16178935)
chr2 (9-203)||(40259436-40259630)
chr2 (15-203)||(31427839-31428027)
chr2 (35-203)||(33310306-33310474)
chr2 (16-204)||(35521661-35521850)
chr2 (16-203)||(37937516-37937703)
chr2 (12-203)||(3874906-3875094)
chr2 (1-92)||(30189942-30190033)
chr2 (87-203)||(25821143-25821259)
chr2 (108-203)||(31586238-31586334)
chr2 (85-203)||(25139229-25139348)
chr2 (85-203)||(36808739-36808857)
chr2 (110-203)||(26365647-26365741)
chr2 (35-103)||(9966701-9966769)
chr2 (80-203)||(17876791-17876914)
chr2 (108-203)||(25870496-25870592)
chr2 (108-203)||(25873887-25873983)
chr2 (15-86)||(31430104-31430175)
chr2 (85-203)||(29440213-29440331)
chr2 (126-203)||(10600676-10600754)
chr2 (1-59)||(31586347-31586405)
chr2 (133-203)||(5666255-5666326)
chr2 (85-203)||(45493453-45493571)
chr2 (85-203)||(45501195-45501313)
chr2 (150-203)||(30275066-30275120)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-203)||(18562835-18563036)
chr7 (1-203)||(4695135-4695337)
chr7 (1-203)||(23225207-23225409)
chr7 (1-203)||(4596310-4596512)
chr7 (7-203)||(7227144-7227340)
chr7 (12-203)||(13809814-13810005)
chr7 (1-203)||(9865028-9865230)
chr7 (1-203)||(17730426-17730627)
chr7 (12-203)||(3068278-3068469)
chr7 (15-203)||(14683745-14683933)
chr7 (12-203)||(10468766-10468957)
chr7 (12-203)||(26136429-26136620)
chr7 (12-203)||(26144809-26145000)
chr7 (15-203)||(6603083-6603271)
chr7 (12-203)||(20081019-20081210)
chr7 (1-203)||(9273421-9273623)
chr7 (9-203)||(37166448-37166642)
chr7 (12-203)||(9133061-9133251)
chr7 (15-203)||(13842265-13842453)
chr7 (1-102)||(9405868-9405969)
chr7 (9-203)||(22611908-22612102)
chr7 (38-203)||(16165396-16165561)
chr7 (1-103)||(23234460-23234562)
chr7 (1-203)||(20593889-20594076)
chr7 (15-203)||(48645099-48645287)
chr7 (12-203)||(10344836-10345027)
chr7 (15-203)||(11398327-11398515)
chr7 (9-183)||(9080796-9080970)
chr7 (83-203)||(5242454-5242574)
chr7 (63-203)||(5796226-5796364)
chr7 (82-198)||(26557192-26557308)
chr7 (84-203)||(4546563-4546682)
chr7 (81-203)||(13450077-13450199)
chr7 (108-203)||(8276702-8276798)
chr7 (133-204)||(24917938-24918009)
chr7 (85-203)||(45287370-45287488)
chr7 (167-203)||(45290715-45290751)
chr7 (160-204)||(2090376-2090420)
chr7 (167-203)||(2441580-2441616)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (1-203)||(16953397-16953599)
chr8 (12-218)||(38248680-38248887)
chr8 (1-203)||(5980609-5980811)
chr8 (12-203)||(21280065-21280255)
chr8 (12-203)||(12582640-12582831)
chr8 (35-203)||(30784585-30784752)
chr8 (7-202)||(5614025-5614220)
chr8 (12-203)||(8911279-8911470)
chr8 (9-205)||(31284299-31284495)
chr8 (15-203)||(17930616-17930804)
chr8 (15-203)||(18824691-18824879)
chr8 (12-203)||(10498510-10498701)
chr8 (80-218)||(45155551-45155690)
chr8 (15-203)||(18826184-18826372)
chr8 (15-203)||(22174220-22174408)
chr8 (15-203)||(33419291-33419479)
chr8 (12-203)||(13196480-13196680)
chr8 (85-203)||(23613245-23613363)
chr8 (15-203)||(36710933-36711140)
chr8 (12-103)||(2560221-2560312)
chr8 (85-203)||(14421449-14421567)
chr8 (85-204)||(18721577-18721696)
chr8 (85-203)||(25594954-25595072)
chr8 (12-120)||(23620687-23620794)
chr8 (85-204)||(5539069-5539180)
chr8 (60-203)||(23643499-23643642)
chr8 (108-203)||(25591775-25591871)
chr8 (85-203)||(10663604-10663722)
chr8 (133-203)||(23619660-23619731)
chr8 (125-203)||(43682167-43682246)
chr8 (137-205)||(25230836-25230905)
chr8 (165-201)||(4868039-4868075)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-203)||(19019-19221)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-203)||(4085-4287)
[»] scaffold0520 (2 HSPs)
scaffold0520 (1-203)||(4276-4478)
scaffold0520 (64-203)||(8515-8654)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (1-203)||(4976-5178)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (15-213)||(48689-48887)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (1-147)||(84864-85009)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (12-203)||(57886-58077)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (12-203)||(58979-59170)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (13-203)||(3308-3498)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (15-203)||(89407-89595)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (35-203)||(118742-118911)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-203)||(1381-1572)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (12-203)||(18930-19121)
scaffold0084 (12-203)||(29000-29191)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (12-203)||(24456-24647)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (12-203)||(67821-68012)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-203)||(30729-30920)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (37-199)||(2373-2535)
[»] scaffold0187 (1 HSPs)
scaffold0187 (63-185)||(31395-31517)
[»] scaffold1684 (1 HSPs)
scaffold1684 (15-140)||(1-125)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (85-203)||(3579-3696)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (35-147)||(28-139)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (111-203)||(62250-62343)
scaffold0035 (108-195)||(63598-63686)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (108-203)||(292753-292849)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (108-203)||(19085-19182)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (84-203)||(197855-197973)
[»] scaffold1785 (1 HSPs)
scaffold1785 (108-195)||(988-1076)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (85-189)||(26896-27000)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (85-203)||(5695-5814)
[»] scaffold0270 (3 HSPs)
scaffold0270 (108-189)||(3734-3816)
scaffold0270 (108-189)||(10864-10946)
scaffold0270 (108-203)||(360-456)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (170-203)||(1-34)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (159-203)||(10190-10235)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 29)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34066939 - 34066718
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34066939 ccttctatcagttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 34066840  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34066839 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcttgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 34066740  T
Q  201 tatattaacaccaaataatctg 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  34066739 tatattaacaccatataatctg 34066718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 7635284 - 7635472
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7635284 atgtatgttttaattctttcattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagttaaatctcttagagattaggtgtgagatgattctgatgtaacc 7635383  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7635384 ctaatttaaacatgttgatgtgaaactctatttcttatgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttagtgctttttatat 7635472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11668524 - 11668322
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  11668524 ccttctatcagttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgtgtagctaaatctcttagagattaggtcttagatg 11668425  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11668424 attctg-tgtaaccctaattaaaacatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 11668326  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  11668325 atat 11668322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41058800 - 41058598
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41058800 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 41058701  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41058700 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 41058602  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  41058601 atat 41058598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27332255 - 27332066
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  27332255 atgtatgttttaattctttcattgattatgctatctgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttaaagattaggtctgaaatgattctgatgtaacc 27332156  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27332155 ctaatttaaacatgttgctatgaaactttatttcttgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttattaatgctttttatata 27332066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20398478 - 20398680
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20398478 ccttctatcagtttgtgtatgttttaattccgctattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 20398577  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20398578 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 20398676  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  20398677 atat 20398680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 45941041 - 45941243
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45941041 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaaatatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 45941140  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||| | ||| || ||||||| |||||||| ||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45941141 attct-ttgtaacctttattgaaccatgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 45941239  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  45941240 atat 45941243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 28110697 - 28110883
Alignment:
Q  16 tgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccc 115  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||    
T  28110697 tgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgtaaccc 28110795  T
Q  116 taatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28110796 taattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatg-tttttatat 28110883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21018964 - 21018766
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21018964 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 21018865  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||  ||||| ||  |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  21018864 attct-ttgtaacaataattgaacaatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgttcttaacgcttttt 21018766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23022422 - 23022220
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||  || |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23022422 ccttctatcagttaatgtatgttttactttcactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 23022323  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23022322 attat-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatacttttt 23022224  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  23022223 atat 23022220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34732857 - 34732670
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  34732857 ccttctatcagttcatgtatgttttaattcctatattgattatgttatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctattagagattaggcctgagatg 34732758  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttctt 189  Q
    ||| || ||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34732757 attctg-tgtaaccct-attgaaatatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttctt 34732670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21107778 - 21107587
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  21107778 ttcatgtatgttttgatttcattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatcttatagagattaggtctgagatgattct-ttgta 21107680  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21107679 accctaattgaaccatgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgctttttatat 21107587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45961229 - 45961041
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||    
T  45961229 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-tttcttgtaacc 45961131  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45961130 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 45961041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 49853565 - 49853374
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  49853565 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatacattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 49853467  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49853466 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 49853374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 906176 - 905985
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  906176 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaacccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 906078  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  906077 accctaattgaaccatgttattgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 905985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3797313 - 3797122
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |  ||||    
T  3797313 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgaatagctaaatccattaaaggttaggtatgagatgattct-ttgta 3797215  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3797214 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 3797122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 31204477 - 31204665
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   | |||||    
T  31204477 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttataacc 31204575  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31204576 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 31204665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37184348 - 37184160
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  37184348 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 37184250  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37184249 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 37184160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6071438 - 6071249
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||     
T  6071438 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgaatct-ttgtaact 6071340  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6071339 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgccttttatata 6071249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 2405146 - 2405337
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  2405146 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 2405244  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  2405245 accctaattgactcatgttgttgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttcatat 2405337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27536770 - 27536583
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  27536770 atgtatgttttaattttttcattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 27536672  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag--ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||  ||||||  | | |||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27536671 ctaattgatccatgttgttgtgaaa--ctatttattattaatgacaatctagttttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 27536583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37907682 - 37907560
Alignment:
Q  63 atgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaat 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | |  || |||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  37907682 atgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatgaatctgatgtaatcatgtttgaaacatgtggttgtgaaactatattgcttatgaatatcaat 37907583  T
Q  163 ctagttttattcaattcaattgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  37907582 ctagttttattcaattcaattgt 37907560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 2793937 - 2794055
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2793937 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 2794035  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  2794036 gttcttaatgctttttatat 2794055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Original strand, 42022402 - 42022502
Alignment:
Q  104 ttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttata 202  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42022402 ttgatgaaaccctaattaaaacatattgctgtgaaattctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttata 42022501  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  42022502 t 42022502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1950845 - 1950751
Alignment:
Q  110 taaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1950845 taaccctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 1950751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 49498910 - 49498794
Alignment:
Q  87 ttaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgt 185  Q
    |||||| |||||||||| |  |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  49498910 ttaggtctgagatgattctt-tgtaacctcaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgt 49498812  T
Q  186 tcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| |||||||||||||    
T  49498811 tcttaatgctttttatat 49498794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 673448 - 673369
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  673448 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 673369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13431557 - 13431492
Alignment:
Q  74 aatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| || |||| || |||||||    
T  13431557 aatctcttagagattaggtctgagatgattccgatgtaaccctaattgaaccatgctgctgtgaaa 13431492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29643613 - 29643517
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||  | |||||  |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  29643613 tgtaactctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattttgaatgacaatttagtttttattcaattaaattgttcttaatgttttttatat 29643517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 5259562 - 5259779
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  5259562 ccttctatcagttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatatgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggcctgagatg 5259661  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5259662 attctg-tgtaaccctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 5259760  T
Q  200 atatattaacaccaaataa 218  Q
    | ||||| |||||| ||||    
T  5259761 agatattgacaccatataa 5259779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11188414 - 11188212
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11188414 ccttctatcagttcatgtatgttttggttccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagatcaggtctgagatg 11188315  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11188314 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 11188216  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  11188215 atat 11188212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28665762 - 28665560
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28665762 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 28665663  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  28665662 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatatttttt 28665564  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  28665563 atat 28665560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 30655069 - 30655271
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30655069 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 30655168  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30655169 attct-ttgtaaccctaattgaaccatattgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 30655267  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  30655268 atat 30655271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11126183 - 11125992
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  11126183 ttcatgtatgtattgatttatatattgattatgctatttgtaaactcgattatgggtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgta 11126085  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11126084 accctaattgaaccatgttgttgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11125992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 10289598 - 10289800
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10289598 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtaactaaatctcttagagattaggtctgagatg 10289697  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10289698 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatacatttgttcttaatgcttttt 10289796  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  10289797 atat 10289800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11401882 - 11402084
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11401882 ccttctatcggttcgtttatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 11401981  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11401982 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 11402080  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  11402081 atat 11402084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 13004814 - 13005031
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13004814 ccttctatcagttcatgtatgttttaattccattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 13004913  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |   | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  13004914 attct-tcgcaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattgaatttaattgttcttgatccttttt 13005012  T
Q  200 atatattaacaccaaataa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  13005013 atatattgacaccatataa 13005031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 2845938 - 2846129
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||     
T  2845938 ttcatgtatgttttaattcttatattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattagctctgagatgattct-atgtc 2846036  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2846037 accccaattgaaatatgttgttgtgaaactctatatattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 2846129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26942933 - 26942731
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26942933 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 26942834  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  26942833 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctcgtttttattcaattcaattgttcttaatgtttttt 26942735  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  26942734 atat 26942731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3597263 - 3597078
Alignment:
Q  18 tatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacccta 117  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||    
T  3597263 tatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgtaacccta 3597165  T
Q  118 atttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3597164 attgaaccatgttgctgtgaaactctatttattttgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 3597078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28108273 - 28108077
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||| |  |||||||    
T  28108273 atgtatgttttaattctttcattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttatatattaggtctgggatgattct-ttgtaacc 28108175  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacac 211  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28108174 ctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttactatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacac 28108077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14282022 - 14281802
Alignment:
Q  1 ccttctatcaatt---catgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgag 97  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14282022 ccttctatcaattgatcatgtatgttttaattccattattgattatgctatttggaaactcaattatgtgtagctaaatctcttaaagattaggtctgag 14281923  T
Q  98 atgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctt 196  Q
    |||||| |  ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  14281922 atgattct-ttgtaaccataattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattttgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctt 14281824  T
Q  197 tttatatattaacaccaaataa 218  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  14281823 tttatatattgacaccatataa 14281802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 6512878 - 6513089
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6512878 ccttctatcagttcatgtatgttttaattctattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtttgatatg 6512977  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  6512978 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtg-acctctatttattgtgaatgacaatctagtttttactcaattcaattgttcttaatacttttt 6513075  T
Q  200 atatattaacacca 213  Q
    ||||||| ||||||    
T  6513076 atatattgacacca 6513089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2378855 - 2379057
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  2378855 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctaagatg 2378954  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||  |  ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2378955 atact-ttgtaaccctaattgaaccatattgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgcttttt 2379053  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  2379054 atat 2379057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28112249 - 28112053
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatt-ttgatgtaac 113  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||  |||||    
T  28112249 atgtatgttttaattctttaattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctacgatgattcttg--gtaac 28112152  T
Q  114 cctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacac 211  Q
    | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28112151 cttaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttactgtgaatgacaaactagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatatattaacac 28112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20185370 - 20185572
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  20185370 ccttccatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgggtagctaaatcccttagagattaggtctgagatt 20185469  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20185470 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgctgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttt 20185568  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  20185569 atat 20185572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22150621 - 22150419
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||     
T  22150621 ccttccatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgggtagctaaatcccttagagattaggtctgagatt 22150522  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||| ||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22150521 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgctgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttt 22150423  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  22150422 atat 22150419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11247384 - 11247589
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcct---atattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgag 97  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| |   |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11247384 ccttctatcagttcatgtatattttaattctttatatattgattatgttatttgtaaactcaactatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgag 11247483  T
Q  98 atgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctt 196  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11247484 atgactttg-tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaagtctatctattgtgaatgataatctagtttttattaaattcaattgttcttaatgctt 11247582  T
Q  197 tttatat 203  Q
    |||||||    
T  11247583 tttatat 11247589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18856512 - 18856321
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  18856512 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 18856414  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18856413 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 18856321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12988557 - 12988422
Alignment:
Q  67 gtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12988557 gtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattctgatgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaagctcta-ttattgtgaatatcaatctag 12988459  T
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  12988458 ttttattcaattcaatatttcttaatgctttttatat 12988422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 28230231 - 28230422
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  28230231 ttcatgtatgcattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 28230329  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28230330 accctaattgtaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatat 28230422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 24399819 - 24400007
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| |  |||||||    
T  24399819 atgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacatcattatgagtagctaaatccattagaggttaggtcttagatgattct-ttgtaacc 24399917  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24399918 ctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 24400007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13021686 - 13021551
Alignment:
Q  67 gtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag 166  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  13021686 gtagctaaatctcttagaggataggtctgagatgattctgatgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaagctcta-ttattgtgaatatcaatctag 13021588  T
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  13021587 ttttattcaattcaatatttcttaatgctttttatat 13021551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 19475639 - 19475830
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| |  ||||    
T  19475639 ttcatttatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctaagatgattct-ttgta 19475737  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  19475738 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcatttgttcttaatgctttttatat 19475830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26898356 - 26898165
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |   |||    
T  26898356 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaataccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tcgta 26898258  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26898257 agcctaattgaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatat 26898165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 31071944 - 31072132
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  31071944 atgtatgttttaattcttccatttattatgttatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 31072042  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| || ||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31072043 ctaattgatccatgttgctgcgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 31072132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11193011 - 11192876
Alignment:
Q  67 gtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11193011 gtagctaaatctcgtagagattaggtctgagaaaattctgatgtaaccctaattgaatcatattgttgtgaaactcta-ttattgtgaatatcaatctag 11192913  T
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  11192912 ttttattcaatttaattgttcttaatgctttctatat 11192876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22561615 - 22561460
Alignment:
Q  48 tttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctattt 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  22561615 tttgtaaactcaattatgagtagctaaatcttttagagattaggtctgagatgattct-ttataaccctaattgaatcatgttgctgtgaaactctattt 22561517  T
Q  148 cctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
      ||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22561516 attgtgaaggacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 22561460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 201
Target Start/End: Original strand, 4512109 - 4512298
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  | ||    
T  4512109 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgactagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttata 4512207  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttat 201  Q
    ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4512208 accttaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttat 4512298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 24409939 - 24410127
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  24409939 atgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttctaaacaccattatgagtagctaaatgcattagaggttaggtctgagatgattct-ttgtaacc 24410037  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
     || || |  ||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24410038 ttacttgactcatgttgctgtgaaactctatttatggtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 24410127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9839831 - 9839691
Alignment:
Q  63 atgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaat 162  Q
    |||||| ||||| | | ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||||  ||||    
T  9839831 atgagttgctaacttttttagagattagatctgagatgattttg-tgtaagcctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaat 9839733  T
Q  163 ctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9839732 ctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 9839691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 9953695 - 9953791
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9953695 tgtaacccttattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttgttaatgctttttatat 9953791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8850616 - 8850494
Alignment:
Q  60 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtatga-gatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||| |  || |||||| | | | |||||||||||| | | |||||||    
T  8850616 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtttgaagatgaatctgatgtaacc-tgtttgaaacatatggctatgaaactctattgcttatgaatat 8850518  T
Q  159 caatctagttttattcaattcaat 182  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  8850517 taatctagttttattcaattcaat 8850494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23388472 - 23388393
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23388472 catgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 23388393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 28848592 - 28848670
Alignment:
Q  126 atgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  28848592 atgttgttgtgaaactctgtttcatatgaatatcaatataggtttattcaattcaactgttcttaatgttttttatata 28848670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 15543635 - 15543692
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactc 58  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15543635 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactc 15543692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1126159 - 1126032
Alignment:
Q  68 tagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagt 167  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||        |||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  1126159 tagctaattttcttagagagtaggtctgagatgattctg-tgtaaccctaat--------gttgctgtgaaactctattcattgtgaatgacaatctagt 1126069  T
Q  168 ttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1126068 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 1126032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5738499 - 5738381
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  5738499 gattaggtctgagatgattctt-tgtaaccttaattgatctatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 5738401  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  5738400 gttcttaatgttttttatat 5738381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 203
Target Start/End: Original strand, 24371052 - 24371101
Alignment:
Q  154 aatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24371052 aatatcattctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 24371101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 13942200 - 13942261
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagcta 73  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13942200 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagcta 13942261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 13946792 - 13946846
Alignment:
Q  150 tgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13946792 tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 13946846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 2372108 - 2372168
Alignment:
Q  159 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacaccaaataa 218  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  2372108 caatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgttttttatatattgacaccatataa 2372168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 7918123 - 7918066
Alignment:
Q  70 gctaaatctcttagagattaggtat--gagatgattttgatgtaaccctaatttaaac 125  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  7918123 gctaaatctcttagagattaggtttgagagatgatttttttgtaaccctaattgaaac 7918066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 53094130 - 53094347
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  53094130 ccttctatcagttcatgtatgttttaattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctaagatg 53094229  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  |||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  53094230 attttg-tgtaaccctgattgaaacatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctaatttttattcaattaaattgttcttaatgcttttt 53094328  T
Q  200 atatattaacaccaaataa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  53094329 atatattgacaccatataa 53094347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 39501271 - 39501473
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39501271 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 39501370  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39501371 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 39501469  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  39501470 atat 39501473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19820351 - 19820553
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19820351 ccttttatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 19820450  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19820451 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 19820549  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  19820550 atat 19820553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40903582 - 40903380
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40903582 ccttctatcatttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 40903483  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40903482 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 40903384  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  40903383 atat 40903380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24150295 - 24150497
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24150295 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 24150394  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24150395 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 24150493  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24150494 atat 24150497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27677553 - 27677351
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27677553 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 27677454  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  27677453 attgt-ttgtaaccctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgttcaattcaattgttcttaatgtttttt 27677355  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  27677354 atat 27677351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 27691640 - 27691442
Alignment:
Q  3 ttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgat 102  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27691640 ttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgat 27691541  T
Q  103 tttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttat 201  Q
    | |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  27691540 tct-ttgtaaccctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttat 27691442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 48637128 - 48637330
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48637128 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 48637227  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48637228 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 48637326  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  48637327 atat 48637330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15436963 - 15436766
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  15436963 tatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactgaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct 15436864  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
      ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15436863 -ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15436766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 8875260 - 8875060
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8875260 ccttctattagttcatgtatgttttaattcctatattgattatgttatttgtaaactcgattgtgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatg 8875161  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8875160 attct-ttgtaaccctaattgaaaaatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 8875062  T
Q  200 at 201  Q
    ||    
T  8875061 at 8875060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19827113 - 19827315
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19827113 ccttttatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgaaatg 19827212  T
Q  101 att-ttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttt 198  Q
    ||| |||  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19827213 attcttg--gtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt 19827310  T
Q  199 tatat 203  Q
    |||||    
T  19827311 tatat 19827315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24044639 - 24044437
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24044639 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattaattatgctatttgtaaactcaattatgattagctaaatctcttagaggttaggtctgagatg 24044540  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24044539 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 24044441  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24044440 atat 24044437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48416028 - 48415826
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48416028 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgttatttgtaaactcaaatatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 48415929  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48415928 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 48415830  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  48415829 atat 48415826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52531434 - 52531232
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52531434 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 52531335  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52531334 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttctgaatgcttttt 52531236  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  52531235 atat 52531232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15430349 - 15430152
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  15430349 tatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactgaattatgagtagctaaatctcttagagattaggcctgagatgattct 15430250  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
      ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15430249 -ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15430152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3718747 - 3718949
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3718747 ccttctatcaattcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgaatagctaaatctcttaaagattaggtctgagatg 3718846  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3718847 attct-ttgtaaccctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatacttttt 3718945  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  3718946 atat 3718949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38283987 - 38283785
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38283987 ccttctatcagatcatgtatgttttgattccactaatgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 38283888  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  |||||||||  || || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38283887 attct-ttgtaacccttgttgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 38283789  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  38283788 atat 38283785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 52007029 - 52006827
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52007029 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 52006930  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |  |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  52006929 attct-ttgtaatcctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcgattgttcttaatgtttttt 52006831  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  52006830 atat 52006827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 40794625 - 40794827
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40794625 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaactcgagtatgagtagttaaatctcttcgagattaggtctgagatg 40794724  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  40794725 attct-ttgtaactctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcgattgttcttaatgcttttt 40794823  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  40794824 atat 40794827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 44164417 - 44164608
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  44164417 ttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgta 44164515  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  44164516 accataattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttatttcaattgttcttaatgttttttatat 44164608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8878000 - 8877798
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||| | || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8878000 ccttctataagttaatgtttgttttaattcctatattgattatgctatttgtaaactcgtttatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 8877901  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |  |||  ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8877900 attct-ttgtaaccctaattgaaacatgctgctgtgaaactctatctattgtagatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 8877802  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  8877801 atat 8877798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12782528 - 12782730
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12782528 ccttctatcatttcatgaatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagaggttaggtctgagatg 12782627  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||| |  |||||| | ||||||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  12782628 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgagtgacaatcttgtttttattcatttcagttgttcttaatacttttt 12782726  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  12782727 atat 12782730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34018279 - 34018078
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34018279 ccttctatcggttcgtgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 34018180  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34018179 attct-ttgtaa-cctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacagtctagtttttattcaattcaattgttcttaatgtttttt 34018082  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  34018081 atat 34018078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29545362 - 29545170
Alignment:
Q  11 attcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgt 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||| |  |||    
T  29545362 attcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtcagagatgattct-ttgt 29545264  T
Q  111 aaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29545263 aaccctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 29545170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8449030 - 8448839
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||| |||  |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  8449030 ttcatgtatgttttaattatttcatttattatgctatttgtaaactcaattatgagtaactaaatctcttagagattaggtccgagatgaatttg-tgta 8448932  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  8448931 accctaattaaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattgttaatgctttttatat 8448839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 48014512 - 48014349
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||    
T  48014512 attgattatgttatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattgggtctgagat--ttttgatgtaaccttaattgaaccatgttgctg 48014415  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttat 201  Q
    ||||||| || ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48014414 tgaaactata-ttattgtcaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttat 48014349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15405569 - 15405381
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  15405569 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 15405471  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15405470 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15405381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 56195164 - 56195352
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  56195164 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 56195262  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56195263 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 56195352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 25961692 - 25961883
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  25961692 ttcatgtatgtattgattcctataatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 25961790  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25961791 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactatattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaagctttttatat 25961883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40493854 - 40493664
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||    ||||    
T  40493854 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaa-tccattagaggttaggtctgagatgattcct-tgta 40493757  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40493756 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 40493664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 29324482 - 29324650
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  29324482 attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaaccctaattgatccatgttgctg 29324580  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| ||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29324581 tgaaactcgatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 29324650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 33926604 - 33926792
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |   | |||||    
T  33926604 atgtatgttttaattctttcattgattatactatttgtaaactcaattatgagtaactaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttctaacc 33926702  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33926703 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 33926792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34320402 - 34320214
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  34320402 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 34320304  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
     ||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34320303 ataattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 34320214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46955963 - 46955775
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  46955963 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttaaagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 46955865  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  46955864 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaatgctttttatat 46955775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 56198510 - 56198678
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||| |  ||||||  ||    
T  56198510 attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattagatctgagatgattccg-tgtaaccctaattgattcatgtttctg 56198608  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||  | | |||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56198609 tgaaactctatttattattaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 56198678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 35509599 - 35509790
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||| || |||||||||| |  ||||    
T  35509599 ttcatgtatgtattgatccctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaattcattagaggttatgtctgagatgattct-ttgta 35509697  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35509698 accctgattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 35509790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 53010045 - 53009854
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  53010045 ttcatgtatgtattgatccctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccatcagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 53009947  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatcta-gttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53009946 atcctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaggttttattcaattcaattgttcttaatactttttatat 53009854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Original strand, 15163853 - 15164017
Alignment:
Q  39 attatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaa 138  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||   ||||| ||||||| || ||||||| ||||||    
T  15163853 attatgctatttgtaaacttgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtcagagatta-ttccttgtaatcctaattgaaccatgttgctgtgaa 15163951  T
Q  139 actctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  15163952 actctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattctattgttcttaatgttttttatat 15164017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 21419422 - 21419614
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgt- 110  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    ||||| |||| | |||||||||| |  |||     
T  21419422 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaattcactagaggttagttttgagatgattct-ttgta 21419520  T
Q  111 aaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21419521 aaccctaattaacacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 21419614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18673558 - 18673392
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  18673558 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 18673460  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaatt 178  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  18673459 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaatt 18673392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 68 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37740193 - 37740059
Alignment:
Q  68 tagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagt 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| || |||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  37740193 tagctaaatctcttagtgattaggtctgaaatgattctgttgtaactctaattgaatcatgttgttgtgaaactcta-ttattgtgaatattaatctagt 37740095  T
Q  168 tttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  37740094 tttattcaattcaattgttgttaatgctttttatat 37740059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 11195312 - 11195501
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||| |  |||||||    
T  11195312 atgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagacgttaggtctgagatgattct-ttgtaacc 11195410  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtg-aaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| || ||||||| |||| |||||||||||  ||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11195411 ctaattgaaccatgttgctgtgaaaactctatttattgtgagtgacaatctggtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11195501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44809440 - 44809252
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  44809440 atgtatgttttaatttttccattggttatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 44809342  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  44809341 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaatttcattgttcttaatgctttttatat 44809252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 170
Target Start/End: Original strand, 30392207 - 30392364
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||| |  ||||    
T  30392207 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaagtctgagatgattct-ttgta 30392305  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt 170  Q
    |||||| || |||||||||| |||||||||||||||  | |||||  ||||||||||||    
T  30392306 accctagttgaaacatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttt 30392364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 125 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5677783 - 5677702
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatatt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  5677783 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttactcaattcatctgttcttaatgctttttatatatt 5677702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 5672588 - 5672709
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatat--caatctag-ttttattcaattcaa 181  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  5672588 gattaggtctgagatgattctggtgtaaccttaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattcaa 5672687  T
Q  182 ttgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  5672688 ttgttcttaatgctttttatat 5672709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19859952 - 19859803
Alignment:
Q  68 tagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagt 167  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||  |||||||  || ||||||    
T  19859952 tagctaattttctaagagattaggtttgagatgtttctt-tgtaaccctaattgaactatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaca-tctagt 19859855  T
Q  168 ttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacaccaaataa 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19859854 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataa 19859803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 27013970 - 27014088
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  27013970 gattaggtctgagatgatcttg-tgtaacccttattgaaccatgttgttgtgaaaatctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 27014068  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  27014069 gttcttaatgttttttatat 27014088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 5670269 - 5670391
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccct-aatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatat--caatctagtttt-attcaattca 180  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||| | |||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  5670269 gattaggtctgagatgattctggtgtaacctttaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatatgacaatctagtttttattcaattca 5670368  T
Q  181 attgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  5670369 attgttcttaatgctttttatat 5670391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 19864904 - 19864794
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatatt 206  Q
    ||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||  |||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19864904 tgtaaccctaattgaaccatgtagctgtgaaactctatttattgtgaatgac-atctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatatt 19864806  T
Q  207 aacaccaaataa 218  Q
     |||||| ||||    
T  19864805 gacaccatataa 19864794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 189
Target Start/End: Original strand, 18911257 - 18911365
Alignment:
Q  81 tagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattc 179  Q
    ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||    
T  18911257 tagaggttaggtttgagatgattctg-tgtaatcctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattc 18911355  T
Q  180 aattgttctt 189  Q
    ||||||||||    
T  18911356 aattgttctt 18911365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Original strand, 5681137 - 5681253
Alignment:
Q  87 ttaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgt 185  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5681137 ttaggtctgagatgattctt-tgtaaccttaattgaatcatattgctgtgaaactcaatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgt 5681235  T
Q  186 tcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| ||| |||||||||    
T  5681236 tcttaatgttttttatat 5681253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 15431808 - 15431904
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15431808 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15431904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 15438422 - 15438518
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15438422 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15438518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33408685 - 33408614
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33408685 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgctttttatat 33408614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33494059 - 33493981
Alignment:
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatg-ctttttatatattaacacc 212  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||    
T  33494059 tgaaactctatttcatatgaatatcaatttagttttatttaattcaattgttgttaatgtttttttatatattgacacc 33493981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37103607 - 37103511
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| ||  |||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  37103607 tgtaatcctaattgaaccatgttgctggtaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgctttatatat 37103511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15812532 - 15812434
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtg--aatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | |   |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15812532 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattatattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 15812434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22172751 - 22172669
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgt--gaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  22172751 catgttgttgtgaaactctgtttcatatatgaatatcaatatagttttgattcaattcaattgttattaatgatttttatata 22172669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 206
Target Start/End: Original strand, 9595 - 9766
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  9595 attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagatattaggtctgagatgattctgatgtatccctaatttaaacatgttgctg 9694  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatatt 206  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9695 tgaaactctatttcttatgaatatcaatatagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatatt 9766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 74)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 32287809 - 32287592
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32287809 ccttctatcagttcatgtatgttttaattccattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 32287710  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32287709 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgtttttt 32287611  T
Q  200 atatattaacaccaaataa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  32287610 atatattgacaccatataa 32287592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 11190235 - 11190437
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11190235 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 11190334  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11190335 attct-ttgtaaccctaattgaatcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 11190433  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  11190434 atat 11190437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 25584396 - 25584598
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25584396 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 25584495  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25584496 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgtttttt 25584594  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  25584595 atat 25584598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 22360160 - 22360357
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22360160 tatcaattcatgtatgttttaattcttccattgtttatgctatttgtatactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattat 22360259  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22360260 g-tgtaaccctaatttaaacatgttgatgtgaaactcaatttcttgtgaatatcaatctatttatattcaattcaattgttcttaatgttttttatata 22360357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2873273 - 2873475
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2873273 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 2873372  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2873373 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 2873471  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  2873472 atat 2873475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 17544336 - 17544526
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||    
T  17544336 ttcatgtatgttttaatttctatattgattatgctatttgtaaacttgattatgagtagttaaatctcttagaaattaggtctgagatgattctg-tgta 17544434  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||    
T  17544435 accctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttattcaattcaattgatcttaatgttttttatat 17544526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20729132 - 20728930
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20729132 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 20729033  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20729032 attct-ttgtaaccctaattgaaccacgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 20728934  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  20728933 atat 20728930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 41976724 - 41976926
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41976724 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 41976823  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  |||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41976824 attct-ttgtagccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgctcttaatgcttttt 41976922  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  41976923 atat 41976926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3840225 - 3840427
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3840225 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaagtcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 3840324  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3840325 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 3840423  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  3840424 atat 3840427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30220494 - 30220292
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30220494 ccttctatcagttcatgtatattttcattcctatattgattatgttatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagatattaggtctgagatg 30220395  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30220394 attct-ttgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctcttt 30220296  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  30220295 atat 30220292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34984338 - 34984136
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  34984338 ccttctatcagttcatgtatgctttgattccactattgattatgctatttgtaaagtcaattatgagtagctaaatctcttagatattaagtctgagatg 34984239  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34984238 attgt-ttgtaaccctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 34984140  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  34984139 atat 34984136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 54723450 - 54723652
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54723450 ccttctatcggttcgtgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 54723549  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54723550 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 54723648  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  54723649 atat 54723652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 30690444 - 30690647
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30690444 ccttctattagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaattcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtgtgagatg 30690543  T
Q  101 attttgatgtaa-ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttt 198  Q
    ||| |  ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30690544 attct-ttgtaacccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttactgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttt 30690642  T
Q  199 tatat 203  Q
    |||||    
T  30690643 tatat 30690647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16243583 - 16243784
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16243583 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccca-attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtacctaaatctcttagaaattaggtctgagatg 16243681  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    |||||  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16243682 atttt-ttttaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttt 16243780  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  16243781 atat 16243784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24125208 - 24125410
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24125208 ccttctatcagtttgtgtatgttttaattccgctattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 24125307  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24125308 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 24125406  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24125407 atat 24125410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24128485 - 24128687
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24128485 ccttctatcagtttgtgtatgttttaattccgctattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 24128584  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24128585 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 24128683  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24128684 atat 24128687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29344360 - 29344158
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29344360 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtttgagatg 29344261  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||||  |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29344260 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtcaaactctatttattgtgaatgacaatccagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 29344162  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  29344161 atat 29344158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Original strand, 22370063 - 22370260
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  22370063 tatcaattcatatatgttttaattcttccattgattatactatttgtatactccattatgagtagcaaaatctcttagagattaggtctgagatgattat 22370162  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  22370163 g-tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactcaatttctcgtgaatatcaatctatttatattcaattcaattgttcttaatgttttttgtata 22370260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7486279 - 7486481
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7486279 ccttctatcagtttgtgtatgttttaattccgctattgattatgttatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 7486378  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7486379 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 7486477  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  7486478 atat 7486481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28008555 - 28008353
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28008555 ccttctatcagttcatgtatgttatgattccattattgattatgccatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagtttaggtctgagatg 28008456  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  28008455 attat-ttgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgcttttt 28008357  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  28008356 atat 28008353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 45896089 - 45896291
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45896089 ccttctatcagtttgtgtatgttttaattccgctattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 45896188  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45896189 attct-ttgtaaccctaattgaaccatattgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 45896287  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  45896288 atat 45896291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 49743405 - 49743203
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49743405 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaaatatgagtagttaaatctcttagggattaggtctgagatg 49743306  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49743305 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 49743207  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  49743206 atat 49743203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2775191 - 2775392
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2775191 ccttctatcggttcgtttatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagaga-taggtctgagatg 2775289  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2775290 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 2775388  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  2775389 atat 2775392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2778434 - 2778635
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  2778434 ccttctatcggttcgtttatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagaga-taggtctgagatg 2778532  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2778533 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 2778631  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  2778632 atat 2778635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27091603 - 27091805
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27091603 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattattctatttgtaaactctattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 27091702  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||| | ||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27091703 attct-ttgtaacctttattgattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttgttaatgcttttt 27091801  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  27091802 atat 27091805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 43926544 - 43926746
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43926544 ccttctatcggttcgtgtatgttttgattccactattgattatgatatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 43926643  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43926644 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtaaatgacaatctagtttttattcaattcagttgttcttaatgcttttt 43926742  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  43926743 atat 43926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22994177 - 22993981
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  22994177 tatcagttcatgtatgttttaattcttccattgaatatgctatttgtaa-ctcaattatgagtagctaaatctctcagagattaggtctgagatgattat 22994079  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    | || |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  22994078 g-tgaaaccgtaatttaaacatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatatcaatctagttttattcaattcaatttttcttaatgttttttatata 22993981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52310022 - 52309845
Alignment:
Q  22 ttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaattt 121  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  |||||||||||||     
T  52310022 ttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagatattaggtctgagatgattct-ttgtaaccctaattg 52309924  T
Q  122 aaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52309923 aaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 52309845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19301979 - 19301791
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  19301979 ttcatgtatattttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaactctcttagagattaggtctgagatgattct-ctgta 19301881  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 200  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19301880 accctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgcttttta 19301791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 22783307 - 22783502
Alignment:
Q  7 atcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttg 106  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  22783307 atcagttcatgtatgttttaattcttccattgattatgccatttgtaaactcaattataagtagctaaatctcttagagattaggtctgatatgattct- 22783405  T
Q  107 atgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttata 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22783406 ttgtaaccctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttata 22783502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Original strand, 22787671 - 22787866
Alignment:
Q  7 atcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttg 106  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  22787671 atcagttcatgtatgttttaattcttccattgattatgccatttgtaaactcaattataagtagctaaatctcttagagattaggtctgatatgattct- 22787769  T
Q  107 atgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttata 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22787770 ttgtaaccctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttata 22787866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17040506 - 17040305
Alignment:
Q  2 cttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatga 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17040506 cttctatcagttcatgtatgttttgattccattactgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatga 17040407  T
Q  102 ttttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 200  Q
    || |  |||| |||||||| |  |||| || ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  17040406 ttct-ttgtatccctaattgatccatgctgatgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactattta 17040308  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  17040307 tat 17040305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19305163 - 19304975
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  19305163 ttcatgtatgttttgattcaattatttattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaactctcttagagattaggtctgagatgattct-ctgta 19305065  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 200  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19305064 accctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgcttttta 19304975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 203
Target Start/End: Original strand, 11636608 - 11636743
Alignment:
Q  67 gtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  11636608 gtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattctgatgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactcta-ttattgtgaatatcaatctag 11636706  T
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11636707 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11636743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22417308 - 22417117
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  22417308 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 22417210  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22417209 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 22417117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 43809299 - 43809490
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  43809299 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatattatttgtaaacaccattatgagtagttaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 43809397  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43809398 accctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 43809490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 54719691 - 54719882
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| |  ||||    
T  54719691 ttcatgtatgtattgattcctcgaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtgtaagatgattct-ttgta 54719789  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  54719790 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 54719882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 46884674 - 46884870
Alignment:
Q  13 tcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||  || ||  |||||    
T  46884674 tcatgtatgtattgattcctctaatgattaggttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagaatatctt--tgtaa 46884771  T
Q  113 ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaaca 210  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  46884772 ccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatataaaca 46884870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50462020 - 50461832
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  50462020 atgtatgttttaatttttccattgattatgctaattgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 50461922  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50461921 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 50461832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25443337 - 25443143
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  |    
T  25443337 caattcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tt 25443239  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25443238 gtaaccctaattgattcatgtttctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 25443143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 35751177 - 35751365
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  35751177 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 35751275  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||  || ||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35751276 ctaattgatccatgttcctgcgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 35751365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12561708 - 12561517
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  12561708 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 12561610  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12561609 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatat 12561517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 52988125 - 52988316
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  52988125 ttcatgtatgtattgattcctctaatgcttatgttatttgtaaactccattatgagtagctaaatccatcagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 52988223  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52988224 accctaattgactcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 52988316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 47054648 - 47054836
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  47054648 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttataaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 47054746  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  47054747 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatat 47054836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15195776 - 15195585
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||||||| |  ||||    
T  15195776 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttacttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctaagatgattct-ttgta 15195678  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15195677 accctaattgaaccatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttattgctttttatat 15195585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 17141128 - 17141319
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| | ||||||| ||||||||||   ||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  17141128 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattacgttatttgtaaacaccattatgaatagctaaatccaatagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 17141226  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17141227 accttaattgaaacatgttattgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 17141319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Original strand, 18542273 - 18542463
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||     
T  18542273 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaattcaattatgagtagctaaatcttttagagattaggtttgagatgaatatgatgt-act 18542371  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttc--ctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    ||  || || | ||||  ||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18542372 ctgtttgaaccttgttaatgtgaaactctatttcatatatgaatatcaatatagttttattcaattcaattgttcttaatgatttttatata 18542463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27308448 - 27308297
Alignment:
Q  60 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatc 159  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| | |  || |||||||| | | ||||| |||||| | ||||||||||    
T  27308448 attatgtgtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgaatctgaagtaatcttgtttaaaacatgtggctatgaaaatctattgcttgtgaatatc 27308349  T
Q  160 aatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27308348 aatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacac 27308297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 31548965 - 31549119
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31548965 ccttttatcagttaatgtatgttttgattcaattattgattatgctatttgtaaactcgattataagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatg 31549064  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaat 156  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||    
T  31549065 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctatgaaactctatttattgtgaat 31549119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 47051218 - 47051406
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  47051218 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtgaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 47051316  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||| || |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  47051317 ctaattgatccatggtgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgttttttatat 47051406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 10881200 - 10881391
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |  ||||    
T  10881200 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagaagattct-ttgta 10881298  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||||||    
T  10881299 accctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattagtgttttttatat 10881391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 27298889 - 27298737
Alignment:
Q  60 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatc 159  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| | |  || |||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||    
T  27298889 attacgagtagctaaatgtcttagagattaggtctgagatgaatctgaagtaatcatgtttgaaacatgtggctgtgaaactctattgcttgtgaatatc 27298790  T
Q  160 aatctagttttattcaattcaattgttcttgatgc-tttttatatattaacac 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  27298789 aatctagttttattcaattcaattgttcttaatgcttttttatatattgacac 27298737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32367603 - 32367416
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  32367603 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattaagttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 32367505  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||||||||||   |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32367504 tccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 32367416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48064508 - 48064318
Alignment:
Q  13 tcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  |||||    
T  48064508 tcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagttaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgtaa 48064410  T
Q  113 ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| |   |||||| ||||||||||||||   |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48064409 ccctaattgacttatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 48064318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 55035262 - 55035143
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  55035262 gattaggtctgagatgaatttgatgtaatcctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttgttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 55035163  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  55035162 gttcttaatgctttttatat 55035143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 11784485 - 11784676
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| |  ||||    
T  11784485 ttcatgtatgtattaattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattctgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagacgattct-ttgta 11784583  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11784584 accctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11784676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 27309005 - 27308887
Alignment:
Q  60 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatc 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| | |  || |||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27309005 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgaatctgaagtaatcttgtttgaaacatttggttgtgaaactctattgcttgtgaatatc 27308906  T
Q  160 aatctagttttattcaatt 178  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  27308905 aatctatttttattcaatt 27308887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 9392529 - 9392645
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9392529 gattaggtctgagatgattctg---taaccctaattgaagcatattgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 9392625  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  9392626 gttcttaatgctttttatat 9392645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3293418 - 3293244
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||              ||||||||| || |||||||    
T  3293418 atgtatgttttaattctttcattgattatgctatttgtaaactcaattatgattagctaaatgtct--------------gagatgattctg-tgtaacc 3293334  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3293333 ctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaaatgttcttaatgctttttatat 3293244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8461889 - 8461770
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaac-atgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaat 182  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||    
T  8461889 gattaggtctgagatgattttg-tgtaaccctaaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaat 8461791  T
Q  183 tgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  8461790 tgtgcttaatgctttttatat 8461770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6435179 - 6435061
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  6435179 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattaattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 6435081  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6435080 gttcttaatgctttttatat 6435061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 28265673 - 28265791
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  28265673 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgattcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 28265771  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  28265772 gttcttaatgctttttatat 28265791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 85 - 198
Target Start/End: Original strand, 10884651 - 10884764
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||||    
T  10884651 gattaggtctgagatgatttct-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaatt 10884749  T
Q  184 gttcttgatgctttt 198  Q
    |||||| ||||||||    
T  10884750 gttcttaatgctttt 10884764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 52199731 - 52199824
Alignment:
Q  111 aaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52199731 aaccttaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 52199824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10106978 - 10106882
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10106978 tgtaaccctaattgaaccatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 10106882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 35412308 - 35412426
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  35412308 gattaggtctgagatgattctt-tgtaaccttaattgatctatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 35412406  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  35412407 gttcttaatgctttttatat 35412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 53815621 - 53815739
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  53815621 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgattcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 53815719  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  53815720 gttcttaatgctttttatat 53815739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Original strand, 538666 - 538737
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  538666 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 538737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16185062 - 16184971
Alignment:
Q  113 ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  16185062 ccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttgttaatgttttttatat 16184971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 204
Target Start/End: Original strand, 38386818 - 38386898
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgt--gaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38386818 catgttgttgtgaaactctatttcatatatgaatatcaattcagttttattcaattcaattgtt-ttaatgctttttatata 38386898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Original strand, 31857650 - 31857727
Alignment:
Q  127 tgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31857650 tgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 31857727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17529111 - 17529040
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  17529111 tgtgaaactctatttattgtgaatgtcaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatat 17529040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18645106 - 18645025
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagt 167  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||    
T  18645106 gattaggtctgagatgattttg-tgtaaccctaattgaaccaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagt 18645025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 6922561 - 6922657
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||  | |||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  6922561 tgtaaccctaattgatctatgttgatgtgaaactctatttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcgattgtgcttaatgctttttatat 6922657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7270640 - 7270842
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7270640 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 7270739  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttt-tattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7270740 attct-ttgtaactctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctattcaattcaattgttcttaatgcttttt 7270838  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  7270839 atat 7270842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 34831387 - 34831585
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34831387 ccttctatcaattcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 34831486  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34831487 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 34831585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 33551745 - 33551947
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33551745 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 33551844  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33551845 attct-ttgtaactctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 33551943  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  33551944 atat 33551947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41307025 - 41306823
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41307025 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 41306926  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41306925 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 41306827  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  41306826 atat 41306823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18239994 - 18239792
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18239994 ccttctatcagttcctgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagttaaatctcttagagattaggtttgagatg 18239895  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatcta-gttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  |||||||   ||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18239894 attctg-tgtaaccctaattaaaacatgttattgtgaaactctatctattgtgaatgaaaatctactttttattaaattcaattgttcttcatgcttttt 18239796  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  18239795 atat 18239792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26753200 - 26752998
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26753200 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgatatttgtaaattcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 26753101  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26753100 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 26753002  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  26753001 atat 26752998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 30065966 - 30066168
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  30065966 ccttctatcagttcatgtaagttttgattccattaatgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgaaatg 30066065  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30066066 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaatgcttttt 30066164  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  30066165 atat 30066168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41877263 - 41877061
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41877263 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 41877164  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41877163 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgcttttt 41877065  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  41877064 atat 41877061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4100020 - 4099813
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4100020 ccttctatcagttcatgtatgttttgatttcattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagataaatctcttagagattaggtctgagatg 4099921  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt------attcaattcaattgttcttgatgc 194  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||    
T  4099920 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattcaattgttcttaatgc 4099822  T
Q  195 tttttatat 203  Q
    |||||||||    
T  4099821 tttttatat 4099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18952317 - 18952519
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18952317 ccttttatcagttcatgcatgttttgattcctatattgattatgttattggtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 18952416  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18952417 attct-ttgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgcttttt 18952515  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  18952516 atat 18952519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 17664181 - 17664378
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||| || ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  17664181 tatcagtttatgtatgttttaattctttcattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct 17664280  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
      ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17664281 -ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 17664378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26896102 - 26895900
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26896102 ccttctaccaattcatgtatcttttgatttcactattgattatgttatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 26896003  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttt-tattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  26896002 attct-ttgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttctatttaattcagttgttcttaatgcttttt 26895904  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  26895903 atat 26895900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 204
Target Start/End: Original strand, 31575055 - 31575244
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||  || ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31575055 atgtatgttttaattattccattgattatgttatttgtaatttcaattatgagttgttaaatctcttaaagagtaggtctgagatgaatctgatgtaacc 31575154  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31575155 ctatttgaaccatgttgttgtgaaactctatttcatgtgaatatcaatctagttttatttaattcaattgttcataatgctttttatata 31575244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26907942 - 26907751
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  26907942 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgattagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 26907844  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26907843 actctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttaattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 26907751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 40582884 - 40583075
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  40582884 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 40582982  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40582983 accctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 40583075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 7624740 - 7624928
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  7624740 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 7624838  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7624839 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 7624928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 22129923 - 22130090
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |  ||| ||| ||    
T  22129923 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaaccctaattgatccatattgctg 22130021  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22130022 tgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttatcaattcaattgttcttaatgctttttatat 22130090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34133470 - 34133279
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  34133470 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 34133372  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34133371 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 34133279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 34143701 - 34143510
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  34143701 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 34143603  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34143602 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 34143510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14016623 - 14016435
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  14016623 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 14016525  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14016524 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 14016435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 12087593 - 12087784
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  || ||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  12087593 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattggaggttaggtctgagatgattct-ttgta 12087691  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12087692 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactttattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 12087784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 17748075 - 17748266
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  17748075 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 17748173  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17748174 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 17748266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 23043800 - 23043990
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  23043800 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 23043898  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23043899 accctaattgaaccatgttgttatgaaa-tctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 23043990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 26292426 - 26292617
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| | | |||    
T  26292426 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttttaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattctta-gta 26292524  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  26292525 accctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactatttatat 26292617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 18032082 - 18032227
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  18032082 ccttctatcagttgatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcgattatgaatagctaaatctcttagagattaggtctgaaatg 18032181  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctattt 147  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||    
T  18032182 attct-ctgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctattt 18032227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 20055412 - 20055600
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||    
T  20055412 atgtatgttttaattctttcattgattattctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttttaacc 20055510  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |   |||||| |||||||||||||||   ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20055511 ctaattgatttatgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatcaagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 20055600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12058979 - 12058788
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  12058979 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 12058881  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12058880 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 12058788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Original strand, 21914818 - 21914946
Alignment:
Q  73 aaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttat 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  21914818 aaatctcttagagattaggtctgagatgattctgatgtaaccctaattgaaccatgttgctatgaaactcta-ttattgtgaaaatcaatctagttttat 21914916  T
Q  173 tcaattcaattgttcttgatgctttttata 202  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  21914917 tcaattcaattgttcttaatgatttttata 21914946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21333099 - 21332978
Alignment:
Q  82 agagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattca 180  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  21333099 agagattaagtctgagatgattctg-tgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattca 21333001  T
Q  181 attgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  21333000 attgctcttaatgctttttatat 21332978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 31863407 - 31863526
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  31863407 gattaggtctgagatgattttg-tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 31863505  T
Q  184 gttctt-gatgctttttatat 203  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  31863506 gttcttaaatgctttttatat 31863526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21336115 - 21335994
Alignment:
Q  82 agagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattca 180  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  21336115 agagattaagtctgagatgattctg-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatatagttttaattcaattca 21336017  T
Q  181 attgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  21336016 attgctcttaatgctttttatat 21335994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22937352 - 22937234
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  22937352 gattaggtctgagatgattttg-tgtaatcctaattgaaccaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 22937254  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  22937253 gttcttaatgcattttatat 22937234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 42062629 - 42062747
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  42062629 gattaggtgtgagatgattttg-tgtaaccttaattgaaccaagttgcagtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 42062727  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  42062728 gttcttaatgctttttatat 42062747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 563686 - 563518
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatg-agatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgtt 133  Q
    |||||||||| |||||||||  |  |||||||||| ||||||| || ||||||||||| || ||| |||| |||||||  | |  || |||||||| |||    
T  563686 attgattatgttatttgtaattttcattatgagtatctaaatcact-agagattaggtttggagacgattctgatgtagac-tgtttgaaacatgtggtt 563589  T
Q  134 gtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  563588 gtgaaactctattgcatgtgaatattaatatagttttattcaatttaattgttcttaatactttttatata 563518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 18766044 - 18765929
Alignment:
Q  96 agatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgct 195  Q
    |||||| | ||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18766044 agatgaatctgaggtaatcctatttgaaacatgtggctgtgaaactttattgcttgtgcatattaatctagttttattcaattcaattgtttttaatgct 18765945  T
Q  196 ttttatatattaacac 211  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18765944 ttttatatattgacac 18765929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28441549 - 28441431
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  28441549 gattaggtctgagatgactctg-tataactctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 28441451  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| ||  |||||||||    
T  28441450 gttcttaatattttttatat 28441431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 203
Target Start/End: Original strand, 43491491 - 43491581
Alignment:
Q  114 cctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  43491491 cctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttattaatgctttttatat 43491581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28787710 - 28787619
Alignment:
Q  113 ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28787710 ccctaattgaatcatgttgctgtgaaagtctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 28787619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 2836998 - 2837063
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatga 66  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2836998 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaacttgactatga 2837063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11959546 - 11959466
Alignment:
Q  124 acatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| ||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11959546 acatgttgctgttaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 11959466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14376202 - 14376104
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtga--aactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14376202 tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgagaaactttatttattgcgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttgttatat 14376104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 32837725 - 32837844
Alignment:
Q  82 agagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattca 180  Q
    |||||||| || | |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||| |||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  32837725 agagattaagtctaagatgattctg-tgtaacactaattgaaccattttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattca 32837823  T
Q  181 attgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||   |||||||||||||    
T  32837824 attgttc--aatgctttttatat 32837844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Original strand, 2837075 - 2837129
Alignment:
Q  150 tgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2837075 tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 2837129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Original strand, 39192118 - 39192154
Alignment:
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39192118 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 39192154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 51)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 5105332 - 5105534
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5105332 ccttctatcaattcatgtatgttttgattccagtattgattatgctatttgtaaactcaaatatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 5105431  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5105432 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 5105530  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  5105531 atat 5105534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 40781078 - 40781280
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40781078 ccttctatcaattcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 40781177  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40781178 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 40781276  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  40781277 atat 40781280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 43723307 - 43723509
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43723307 ccttctatcagtacatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaattcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 43723406  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43723407 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 43723505  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  43723506 atat 43723509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 6 - 203
Target Start/End: Original strand, 30926158 - 30926355
Alignment:
Q  6 tatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatttt 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  30926158 tatcagttcatgtatgttttaattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtggctaaatctcttagagactaggtctgagatgattct 30926257  T
Q  106 gatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30926258 g-tgtaaccataattgaaacatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 30926355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9185923 - 9185722
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9185923 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 9185824  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    || ||  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9185823 atctt--tgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 9185726  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  9185725 atat 9185722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6826378 - 6826580
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  6826378 ccttctatcaattcatgtatgttttgatttcattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcgtagagattaagtctgagatg 6826477  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6826478 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 6826576  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  6826577 atat 6826580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42369210 - 42369008
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42369210 ccttctatcaatttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaacaccattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 42369111  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42369110 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 42369012  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  42369011 atat 42369008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9189152 - 9188950
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9189152 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 9189053  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9189052 attct-ttgtaacccttattgaaccatgatgttgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 9188954  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  9188953 atat 9188950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25960188 - 25959986
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25960188 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 25960089  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25960088 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 25959990  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  25959989 atat 25959986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 22020674 - 22020890
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22020674 ccttctatcagttcatgtatgttttaattccattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 22020773  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||  |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22020774 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactcta-ttattgtgaatgacaatctagtttttattcaactcaattgttcttaatgcttttt 22020871  T
Q  200 atatattaacaccaaataa 218  Q
    ||||||| |||||| ||||    
T  22020872 atatattgacaccatataa 22020890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11348395 - 11348193
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11348395 ccttctatcggttcgtgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 11348296  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11348295 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 11348197  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  11348196 atat 11348193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37280176 - 37279974
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  37280176 ccttctatcagttcgtgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattcggtctgagatg 37280077  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37280076 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgccgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 37279978  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  37279977 atat 37279974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43208389 - 43208187
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43208389 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaaatatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 43208290  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  43208289 attct-ttgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatacttttt 43208191  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  43208190 atat 43208187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 8888242 - 8888444
Alignment:
Q  2 cttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatga 101  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8888242 cttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga 8888341  T
Q  102 ttttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttctt-gatgcttttt 199  Q
    || |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8888342 ttct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaaatgcttttt 8888440  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  8888441 atat 8888444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24234701 - 24234903
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  24234701 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactctattatgagtagctaaatctcttagagattaagtctgagatg 24234800  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24234801 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgcttttt 24234899  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24234900 atat 24234903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24237973 - 24238175
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24237973 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactctattatgagtagctaaatcttttagagattaggtctgagatg 24238072  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24238073 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgcttttt 24238171  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  24238172 atat 24238175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27266394 - 27266596
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27266394 ccttctatcagttcatgcatgttttgattccgttattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 27266493  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  27266494 attct-ttgtaaccctaattgatccatgttgatgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgtttttt 27266592  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  27266593 atat 27266596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13972393 - 13972191
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13972393 ccttctattagttcatgtatgttttgattcaattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 13972294  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtt-ttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  ||||| |  |||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  13972293 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgattgacaatatagttattattcaattcaactgttcttaatgtttttt 13972195  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  13972194 atat 13972191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 12219412 - 12219603
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  12219412 ttcatgtatgtgttgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 12219510  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12219511 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 12219603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16791247 - 16791056
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  16791247 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagttaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 16791149  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16791148 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 16791056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17876499 - 17876308
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  17876499 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 17876401  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||   ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17876400 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttatcgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 17876308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 45453494 - 45453682
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  45453494 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 45453592  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45453593 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 45453682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 45456781 - 45456969
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  45456781 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 45456879  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45456880 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatccaattcaattgttcttaatgctttttatat 45456969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 22630459 - 22630649
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | |||||    
T  22630459 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatctattagaggttaggtctgagatgattct-atgta 22630557  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  22630558 a-cctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgctttttatat 22630649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 38015158 - 38015326
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  38015158 attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaaccctaattgatccatgttgctg 38015256  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38015257 tgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 38015326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1386910 - 1386719
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  1386910 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 1386812  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1386811 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 1386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 16178744 - 16178935
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||| |  ||||    
T  16178744 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttatgtctgagatgattct-ttgta 16178842  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16178843 accctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 16178935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40259630 - 40259436
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||||| |  |    
T  40259630 caattcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccatcatgagtagctaaatccatcagaggttaggtctgagatgattct-tt 40259532  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40259531 gtaaccctaattgactcatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 40259436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31428027 - 31427839
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  31428027 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 31427929  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31427928 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 31427839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 33310306 - 33310474
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| ||    
T  33310306 attgattatgttatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaaccctaattgatccatgttgctg 33310404  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33310405 tgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 33310474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35521850 - 35521661
Alignment:
Q  16 tgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggt-atgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||     
T  35521850 tgtatgtttttatgcttaaattgattatgctatttgtaatttcaattatgagtagctaaatctattaaagattaggttatgagatgaatctgatgtaact 35521751  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
     |  || || |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  35521750 ttgtttgaaccatgttgttgtgaaactctatttcatgtgggtatcaatctagttttactcaattcaattgttcttaatgtattttatata 35521661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37937703 - 37937516
Alignment:
Q  16 tgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccc 115  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| |||| | |||||||||| |  ||||||||    
T  37937703 tgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaattcattagagtttagctctgagatgattct-ttgtaaccc 37937605  T
Q  116 taatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37937604 taattgacacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattgaattcaattgttcttaatgctttttatat 37937516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 3874906 - 3875094
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  3874906 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaattcattagaggttaggtatgagatgattct-ttgta 3875004  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||   |||||||||||| | |||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3875005 accctaattgaaaca---tgttgtgaaactgtgtttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 3875094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 30189942 - 30190033
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggt 92  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30189942 ccttctatcagttcatgtatgttttgatttctaaattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggt 30190033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25821259 - 25821143
Alignment:
Q  87 ttaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgt 185  Q
    |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  25821259 ttaggtttgagatgattctt-tgtaaccctaattgaaacatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgt 25821161  T
Q  186 tcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| |||||||||||||    
T  25821160 tcttaatgctttttatat 25821143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31586334 - 31586238
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31586334 tgtaacccttattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttgattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 31586238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25139348 - 25139229
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| || ||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  25139348 gattaggtctgtgatgattctggtgtgaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaatt 25139249  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  25139248 gttcctaatgctttttatat 25139229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36808857 - 36808739
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||| | |||||||||||||||||    
T  36808857 gattagatttgagatgattttg-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctaatttttattcaattcaatt 36808759  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  36808758 gttcttaatgttttttatat 36808739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 203
Target Start/End: Original strand, 26365647 - 26365741
Alignment:
Q  110 taaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26365647 taaccctaattaaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 26365741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9966769 - 9966701
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatt 103  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9966769 attgattatgttatatgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgatt 9966701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 203
Target Start/End: Original strand, 17876791 - 17876914
Alignment:
Q  80 ttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaatt 178  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17876791 ttagaggttaggtctgagatgattctt-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaatt 17876889  T
Q  179 caattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  17876890 caattgttcttaattctttttatat 17876914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 25870496 - 25870592
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25870496 tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttatttaattcaattgttcttaatgctttttatat 25870592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 25873887 - 25873983
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25873887 tgtaaccctaattgaaccatgttggtgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 25873983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 31430175 - 31430104
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagaga 86  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31430175 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagaga 31430104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 29440213 - 29440331
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  29440213 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaatttaatt 29440311  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  29440312 gttcttaatgctttttatat 29440331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Original strand, 10600676 - 10600754
Alignment:
Q  126 atgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10600676 atgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagattttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 10600754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 31586405 - 31586347
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcg 59  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  31586405 ccttctatcagttcatgtatgttttgatttcactattgattatgctatttgtaaactcg 31586347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Original strand, 5666255 - 5666326
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5666255 tgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 5666326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45493571 - 45493453
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||   ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  45493571 gattaggtctgagatgaatttg-tgtaatcctaattgactcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaatt 45493473  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  45493472 gttcttaatgctttttatat 45493453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45501313 - 45501195
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||  |||||||   ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  45501313 gattaggtctgagatgaatttg-tgtaatcctaattgactcatgttgctgtaaaactctatttattgtgaatgataatttagtttttattcagttcaatt 45501215  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  45501214 gttcttaatgctttttatat 45501195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30275120 - 30275066
Alignment:
Q  150 tgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30275120 tgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 30275066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18563036 - 18562835
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18563036 ccttttatcagttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattataagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 18562937  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgcttttta 200  Q
    ||| |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||| ||  | | | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18562936 attctgatgtaaccctaattgaaccatgctgttgtaaaactcta-ttattataattatctatctagttttattcaattcagttgttcttaatgcttttta 18562838  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  18562837 tat 18562835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 4695135 - 4695337
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4695135 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatcttttagagattaggtctgagatg 4695234  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4695235 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttattaatgcttttt 4695333  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  4695334 atat 4695337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23225409 - 23225207
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23225409 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatg 23225310  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23225309 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 23225211  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  23225210 atat 23225207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4596512 - 4596310
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4596512 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgtgtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 4596413  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4596412 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctctgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 4596314  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  4596313 atat 4596310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Original strand, 7227144 - 7227340
Alignment:
Q  7 atcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttg 106  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  7227144 atcatttcatgtatgttttaattcctccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctaagatgattctg 7227243  T
Q  107 atgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
     ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7227244 -tgtaaccctaattgaaacatgttgctatgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 7227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13810005 - 13809814
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  13810005 ttcatgtatgttttaattcttatattgattatgctatttgtaacctcgattgtgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatgattctg-tgta 13809907  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13809906 accctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatctattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 13809814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9865230 - 9865028
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9865230 ccttctatcagttcatgtatgtcttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 9865131  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  9865130 attct-ttgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatgtagtttttattcaattcaattgttcttattgcttttt 9865032  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  9865031 atat 9865028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 17730426 - 17730627
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17730426 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattg-ttatgttatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 17730524  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||| ||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17730525 attct-ttgtaaccctgattgaaccatgttgctgtgaaactctacttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgattttt 17730623  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  17730624 atat 17730627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3068469 - 3068278
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||| |  ||||    
T  3068469 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggtttggtctgagatgattct-ttgta 3068371  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3068370 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaataacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 3068278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14683933 - 14683745
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  | |||||    
T  14683933 atgtatgttttaattcttttattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtccgagatgattct-ttctaacc 14683835  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| || ||||||  ||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14683834 ctaattgaaccatgtttctgtgaaactttatttactgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 14683745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 10468766 - 10468957
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  10468766 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 10468864  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  10468865 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatat 10468957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26136620 - 26136429
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  26136620 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 26136522  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26136521 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 26136429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26145000 - 26144809
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  26145000 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 26144902  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26144901 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 26144809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 6603083 - 6603271
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  6603083 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 6603181  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6603182 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 6603271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20081210 - 20081019
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  20081210 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 20081112  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatct-agttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20081111 accctaattgaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgataatctaatttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 20081019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9273623 - 9273421
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||    
T  9273623 ccttctatcggttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagttgctaaatcccttagagattaggtcggagatg 9273524  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  || ||||||||| ||  ||||||| ||||||||| |||||  |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  9273523 attct-ttgaaaccctaatctatccatgttgctgtgaaactatatttattgtgaatgactatctagtttttattcaattcaattgttcttaatatttttt 9273425  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  9273424 atat 9273421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37166642 - 37166448
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  |    
T  37166642 caattcatgtatgtattgattcctctaatgattatgatatttgtaaacatcattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tt 37166544  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37166543 gtaaccctaattgagccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 37166448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9133251 - 9133061
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  | ||  ||||    
T  9133251 ttcatgtatgtattgattcctccaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagagattaggtctgagatattctt--tgta 9133154  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9133153 accctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttctatat 9133061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 13842265 - 13842453
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |  |||||||    
T  13842265 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgcgtagctaaatctattagagattaggtctgagatgaatct-ttgtaacc 13842363  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13842364 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 13842453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 9405868 - 9405969
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9405868 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 9405967  T
Q  101 at 102  Q
    ||    
T  9405968 at 9405969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22612102 - 22611908
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| |||||| |  |    
T  22612102 caattcatgcatgtattgaatcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaagttaggtctgatatgattct-tt 22612004  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
     ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22612003 ttaaccctaattgaaacatgttgttgcgaaactctatttattgtgaatgataatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 22611908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Original strand, 16165396 - 16165561
Alignment:
Q  38 gattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtga 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |   ||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  16165396 gattatgctatttgtaaactcaattatgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaaccctaattgatccatgttgctgtga 16165494  T
Q  138 aactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16165495 aactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 16165561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23234562 - 23234460
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23234562 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatg 23234463  T
Q  101 att 103  Q
    |||    
T  23234462 att 23234460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20593889 - 20594076
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20593889 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagaagctaaatctcttagaaattaggtctgagatg 20593988  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtt-ttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||               |||||||||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20593989 attct-ttgtaaccctaat---------------tgaaactctatttattgtgaatgacattctagttcttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 20594072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 48645099 - 48645287
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   |||||||    
T  48645099 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatatgtaaactcaattatgcgtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccttgtaacc 48645197  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48645198 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaaatcaattgttcttaatgctttttatat 48645287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 10344836 - 10345027
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  10344836 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaacattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 10344934  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||  |||||||   ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10344935 accctaattgaaacatgttgctttgaaactctacttattgtgaatgataatctagtttttattccattcaattgttcttaatgttttttatat 10345027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11398515 - 11398327
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||   |||||||    
T  11398515 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagat-aattccttgtaacc 11398417  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  11398416 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttgttcagttcaattgttctgaatgttttttatat 11398327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 9080796 - 9080970
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  |    
T  9080796 caattcatgtatgtattgattcctctaataattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tt 9080894  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  9080895 gtaaccctaattgaaagatgttgccgtgaaactctatttattgtcaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 9080970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5242574 - 5242454
Alignment:
Q  83 gagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaa 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  5242574 gagattaggtctgagatgattttg-tgtaaccataattaaaagatgttgttgtgaaactctatctattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaa 5242476  T
Q  182 ttgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  5242475 ttgttcttaatgctttttatat 5242454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 203
Target Start/End: Original strand, 5796226 - 5796364
Alignment:
Q  63 atgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaat 162  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| || ||||||| |||||||||| || |  | |||||| ||||    
T  5796226 atgagtagctaaatttatttgagattaggtatgagatgattctaa-gtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactc-atctattatgaataacaat 5796323  T
Q  163 ctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  5796324 ctagttttattcaattcaattattcttaatgttttttatat 5796364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 26557192 - 26557308
Alignment:
Q  82 agagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattca 180  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  26557192 agagattaagtctgagatgattctg-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttaatgtgaatgacaatctagtttttattcaattca 26557290  T
Q  181 attgttcttgatgctttt 198  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  26557291 attgttcttaatgctttt 26557308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Original strand, 4546563 - 4546682
Alignment:
Q  84 agattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaat 182  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  4546563 agattaggtctgagatgattctt-tgtaaacctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaattacaatctagttttcattcaattcaat 4546661  T
Q  183 tgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  4546662 tgttcttaatgctttttatat 4546682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 81 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13450199 - 13450077
Alignment:
Q  81 tagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| |||||||||    
T  13450199 tagagattaggtctgagatgattctt-tgtaaccctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattc 13450101  T
Q  180 aattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  13450100 aattgttcttaatgctttttatat 13450077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 8276702 - 8276798
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8276702 tgtaaccctgattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 8276798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 24917938 - 24918009
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24917938 tgtgaaactctattgcatgtgaatattaatttagttttattcaatccaattgttcttaatgctttttatata 24918009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45287488 - 45287370
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  45287488 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgattcatgttgctgtgaaactttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 45287390  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  45287389 gttcttaatgctttttatat 45287370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45290751 - 45290715
Alignment:
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45290751 ttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 45290715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 204
Target Start/End: Original strand, 2090376 - 2090420
Alignment:
Q  160 aatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  2090376 aatctagtcttattcaattcaattgttcttaattttttttatata 2090420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2441616 - 2441580
Alignment:
Q  167 ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2441616 ttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 2441580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16953397 - 16953599
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16953397 ccttctatcagttcacgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 16953496  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16953497 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 16953595  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  16953596 atat 16953599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38248887 - 38248680
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagaga-ttaggtatgagatgattttgatgt 110  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||    
T  38248887 ttcatgtatgttttaattccattattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagatttaggtctgagatgattct-ttgt 38248789  T
Q  111 aaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaac 209  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  38248788 aaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgac 38248689  T
Q  210 accaaataa 218  Q
    |||| ||||    
T  38248688 accatataa 38248680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5980811 - 5980609
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  5980811 ccttctatcaattcgtgtatgttttgattctactattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagggattaggtctgagatg 5980712  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    | || | ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5980711 a-ttcggtgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaaatctatttattgtgaatgtcaatctagtttttattcaattaaattgttcttaatgcttttt 5980613  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  5980612 atat 5980609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21280255 - 21280065
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  ||||    
T  21280255 ttcatgtatgtattgattcctatattgattatgttatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttag-gattaggtctgagatgattct-ttgta 21280158  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  ||| |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21280157 accctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattgttaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 21280065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 12582640 - 12582831
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||    
T  12582640 ttcatgtatgtattgatcccattattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgta 12582738  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    || |||||| ||  |||||| |||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12582739 actctaattgaactatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 12582831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Original strand, 30784585 - 30784752
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  30784585 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagaggttaggt-caagatgaatttg-tgtaaccctaattgaaacatgttgatg 30784682  T
Q  135 tgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30784683 tgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 30784752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5614220 - 5614025
Alignment:
Q  7 atcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttg 106  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |     
T  5614220 atcagttcatgtatgttttaattcttccattgattatgccatttgtaaactcaattataagtagctaaatctcttagagattaggtctgatatgattct- 5614122  T
Q  107 atgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttata 202  Q
     ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5614121 ttgtaaccctaattgaaacatgttgatgtgaaactctatttattgtggatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttata 5614025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 8911279 - 8911470
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  8911279 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 8911377  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  8911378 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgctttttatat 8911470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 205
Target Start/End: Original strand, 31284299 - 31284495
Alignment:
Q  9 caattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgat 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  |    
T  31284299 caattcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tt 31284397  T
Q  109 gtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatat 205  Q
    |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31284398 gtaaccctaattgactcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatat 31284495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 17930616 - 17930804
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| | |  |||||||    
T  17930616 atgtatgttttaattctttcattgattatgctatttgtaaactcaactatgagtagttaaatctcttagagattagttctaagatgagtct-ttgtaacc 17930714  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17930715 ctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 17930804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18824879 - 18824691
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  18824879 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 18824781  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18824780 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 18824691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10498701 - 10498510
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |  ||||    
T  10498701 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtatgagatgattct-ttgta 10498603  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10498602 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaagtcaattgttcttaatgctttttatat 10498510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 45155690 - 45155551
Alignment:
Q  80 ttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaatt 178  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  45155690 ttagagattaggtctgagatgattctgatgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatt 45155591  T
Q  179 caattgttcttgatgctttttatatattaacaccaaataa 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45155590 caattgttcttaatgctttttatatattgacaccatataa 45155551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18826372 - 18826184
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||||    
T  18826372 atgtatgttttaatttttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-ttccttgtaacc 18826274  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||  |||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18826273 ctaattgatccatgttactgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 18826184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22174408 - 22174220
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   ||||||     
T  22174408 atgtatgttttaattcttctattgattatgctattcgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatga-atccctgtaact 22174310  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22174309 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgaccatctagtttttattcaattcaattattcttaatgctttttatat 22174220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 33419291 - 33419479
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||    
T  33419291 atgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttataaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatg-tttttttgtaacc 33419389  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||    
T  33419390 ctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaatttaattgttcttaaagctctttatat 33419479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 13196480 - 13196680
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattat---------gagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13196480 ttcatgtatgtttggattcctatattgattatgctatttgtaaactcaattatctcaattttgagtagctaaatctcttagagattatgtctgagatgat 13196579  T
Q  103 tttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttat 201  Q
    | |  ||| ||||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||  ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13196580 tct-ttgtgaccctaatggatccatgttgctgtgaaactatatttattgtgaacgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttat 13196678  T
Q  202 at 203  Q
    ||    
T  13196679 at 13196680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 23613245 - 23613363
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  23613245 gattaggtctgagatgatttt-atgtaaccctgattgaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 23613343  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  23613344 gttcttaatgctttttatat 23613363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36711140 - 36710933
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatt--ttg------ 106  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||          
T  36711140 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattccttgtaaccc 36711041  T
Q  107 ----------atgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgct 195  Q
               ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  | | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36711040 taatgattccttgtaaccctaattgatccatgttgttgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgct 36710941  T
Q  196 ttttatat 203  Q
    ||||||||    
T  36710940 ttttatat 36710933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 103
Target Start/End: Original strand, 2560221 - 2560312
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgatt 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2560221 ttcatgtatgtattgattcctttattgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatctcttagaggttaggtctgagatgatt 2560312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 14421449 - 14421567
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  14421449 gattaggtctgagatgattctg-tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctattaattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 14421547  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14421548 gttcttaatgctttttatat 14421567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18721696 - 18721577
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  18721696 gattaggtctgagatgattct-atgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 18721598  T
Q  184 gttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  18721597 gttcttaatgctttttatata 18721577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25595072 - 25594954
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25595072 gattaggtctgagattattctg-tgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatt 25594974  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  25594973 gttcttaatgctttttatat 25594954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 23620794 - 23620687
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  23620794 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 23620696  T
Q  112 accctaatt 120  Q
    |||||||||    
T  23620695 accctaatt 23620687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5539180 - 5539069
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||| | |||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5539180 gattagatctgagatgaattggatgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatt---------tatgaatctagtttttattcaattcaatt 5539090  T
Q  184 gttcttgatgctttttatata 204  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  5539089 gttcttaatgctttttatata 5539069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 203
Target Start/End: Original strand, 23643499 - 23643642
Alignment:
Q  60 attatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatc 159  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||||    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||  | |||||  |    
T  23643499 attatgagtaggtaaatatattagagattagatctgagatgattcct-tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactgtatttattctgaatgac 23643597  T
Q  160 aatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23643598 aatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctgtttatat 23643642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25591871 - 25591775
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  25591871 tgtaacccttattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcacttgttcttaatgttttttatat 25591775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Original strand, 10663604 - 10663722
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | |||||  |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10663604 gattaggtctgagatgaatctg-tgtaaccctaattgactcatgttgctgtgaaactctatttattctgaatgacaatttagtttttattcaattcaatt 10663702  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| ||| |||||||||    
T  10663703 gttcttaatgatttttatat 10663722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23619731 - 23619660
Alignment:
Q  133 tgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||   |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23619731 tgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 23619660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43682246 - 43682167
Alignment:
Q  125 catgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43682246 catgttgttgtgaaattttatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 43682167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 25230836 - 25230905
Alignment:
Q  137 aaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatatat 205  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25230836 aaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatactttttatatat 25230905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 201
Target Start/End: Original strand, 4868039 - 4868075
Alignment:
Q  165 agttttattcaattcaattgttcttgatgctttttat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4868039 agttttattcaattcaattgttcttaatgctttttat 4868075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19019 - 19221
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19019 ccttctatcagtttatgtatgttttaattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtttgagatg 19118  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19119 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 19217  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  19218 atat 19221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4287 - 4085
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  4287 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgggatg 4188  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4187 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgaaaatctagtttttattcaattcaactgttcttaatgcttttt 4089  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  4088 atat 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4478 - 4276
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4478 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattttgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 4379  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    ||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  4378 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattattcttaaagcttttt 4280  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  4279 atat 4276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8654 - 8515
Alignment:
Q  64 tgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatc 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||  |||||||  |||||    
T  8654 tgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgatgtgaaacactatttattgtgaatgacaatc 8556  T
Q  164 tag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8555 tagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatat 8515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 4976 - 5178
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4976 ccttctatgagttcatgtatgttttgattccattattgattatgctatttgttaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 5075  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
     |||   |||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  5076 -tttctttgtaactctaatagaaccatgttgttgtgaaactctatttattgtgaatgacaatatagtttttattcaattcaactgtttttaatgcttttt 5174  T
Q  200 atat 203  Q
    ||||    
T  5175 atat 5178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 48887 - 48689
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||     
T  48887 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaattacaattatgagtggctaaatctcttagagattaggtttgagatgaatctgatgttact 48788  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatatattaacacca 213  Q
    ||  || | |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  48787 ctggttgagacatgttaatgtgcaactctatttcatgtgaatatcaatctagttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatatattgacacca 48689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 84864 - 85009
Alignment:
Q  1 ccttctatcaattcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  84864 ccttctatcagttcatgtatgttttgattccactattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatg 84963  T
Q  101 attttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctattt 147  Q
    ||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  84964 attct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgttgtgaaactctattt 85009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 58077 - 57886
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||    
T  58077 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatattatttgtaaacccgattatgagtagctaaatatcttagatattaggtctgagatgattct-ttgta 57979  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||  || ||||||  |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  57978 accctaatcgaaccatgttactgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgtttttaatgttttttatat 57886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 59170 - 58979
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||| |  ||||    
T  59170 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccgttagaggttaggtctgagattattct-ttgta 59072  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  59071 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 58979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3498 - 3308
Alignment:
Q  13 tcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||| |  |||||    
T  3498 tcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagatgttaggtatgagataattct-ttgtaa 3400  T
Q  113 ccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3399 ccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 89407 - 89595
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  89407 atgtatgttttaattcttcaattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 89505  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  89506 ctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 89595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 118911 - 118742
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatt-taaacatgttgtt 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  ||| |||||||||||||  |||||||||| |    
T  118911 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtccaagatgaaattg-tgtaaccctaattgcaaacatgttgct 118813  T
Q  134 gtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  118812 gtgaaactctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 118742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 1381 - 1572
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| |||||| || ||||||| |  ||||    
T  1381 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaattcattagaggttaggtctgggatgattct-ttgta 1479  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1480 accctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgtatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 1572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 18930 - 19121
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  18930 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 19028  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19029 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 19121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 29000 - 29191
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  29000 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 29098  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29099 accctaattgattcatgttgctgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 29191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 24456 - 24647
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| || |||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  24456 ttcatgtatgtatttattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 24554  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24555 accttaattgaaccatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 24647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 68012 - 67821
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||| |  | ||    
T  68012 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattttgagtagccaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-tttta 67914  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  67913 accctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattatgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 67821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Original strand, 30729 - 30920
Alignment:
Q  12 ttcatgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgta 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||    
T  30729 ttcatgtatgtattgattcctctaatgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaaatccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgta 30827  T
Q  112 accctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||| |||||    ||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30828 accttaattgtttcatgttgttgtgaaactctattatttgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaatttttcttaatgctttttatat 30920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2535 - 2373
Alignment:
Q  37 tgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtg 136  Q
    |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  2535 tgattatgttatttgtaaacaccattatgagtagctaagtccattagaggttaggtctgagatgattct-ttgtaaccctaattgaaccatgttgctgtg 2437  T
Q  137 aaactctatttcctgtgaatatcaatctagt-tttattcaattcaattgttcttgatgcttttt 199  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2436 aaactctatttattgtgaatgacaatctaatgtttattcaattcaattgttcttaatgcttttt 2373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 185
Target Start/End: Original strand, 31395 - 31517
Alignment:
Q  63 atgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaat 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| | |  || |||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||||    
T  31395 atgagtagttaaatctcttagagattaggtctgagatgaatctgatgtaatcatgtttgaaacatgtggttgtgaaactatattgcttatgaatatcaat 31494  T
Q  163 ctagttttattcaattcaattgt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  31495 ctagttttattcaattcaattgt 31517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1684 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1684
Description:

Target: scaffold1684; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 125 - 1
Alignment:
Q  15 atgtatgttttgattcctatattgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaacc 114  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||    
T  125 atgtatgttttaattcttccattgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagagattaggtctgagatgattcct-tgtaacc 27  T
Q  115 ctaatttaaacatgttgttgtgaaac 140  Q
    |||||| |  ||||||| ||||||||    
T  26 ctaattgatccatgttgctgtgaaac 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3696 - 3579
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaatt 183  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3696 gattaggtctgagatgattttg-tgtaaccctaattgaaacaagttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaa-ctagtttttattcaattcaatt 3599  T
Q  184 gttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  3598 gttcttaatgctttttatat 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 139 - 28
Alignment:
Q  35 attgattatgctatttgtaaactcgattatgagtagctaaatctcttagagattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |   ||||||||||||| |   |||||| ||    
T  139 attgattatgctatttgtaaactcaattatgagtagctaaatctcttagaaattaggtatcagatga-atccttgtaaccctaattgatctatgttgctg 41  T
Q  135 tgaaactctattt 147  Q
    |||||||||||||    
T  40 tgaaactctattt 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 62250 - 62343
Alignment:
Q  111 aaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  62250 aaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 62343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Original strand, 63598 - 63686
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgct 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  63598 tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgct 63686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 292753 - 292849
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  292753 tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaattctatttattgtgaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 292849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 19085 - 19182
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag--ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  19085 tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagttttttattcaattcaattgttcataatgcttgttatat 19182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Original strand, 197855 - 197973
Alignment:
Q  84 agattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaat 182  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||  | |||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  197855 agattagatatgagatgattctgatggaaccctaattaaaacatgtttatgtgaaactc--tttattatgaatgacaatttagtttttattcaattcaat 197952  T
Q  183 tgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  197953 tgttcttaatgctttttatat 197973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 195
Target Start/End: Original strand, 988 - 1076
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgct 195  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  988 tgtaaccctaattgaaacatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacattctagtttttattcaattcaattgttcttaatgct 1076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Original strand, 26896 - 27000
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaatt 183  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||| |||| || |||||||||    
T  26896 gattaggtctgagatgattctg-tgtaaccctaattgaaccatgttgctgtgaaactctatttattgtgaatgacaatctagtttttgtttaattcaatt 26994  T
Q  184 gttctt 189  Q
    ||||||    
T  26995 gttctt 27000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5814 - 5695
Alignment:
Q  85 gattaggtatgagatgattttgatgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctagtttt--attcaattcaat 182  Q
    |||||||| |||||||||| |  ||||||| | ||| || ||||||| |||||||| ||||||  ||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5814 gattaggtctgagatgattctt-tgtaacctttattgaaccatgttgctgtgaaaccctatttattgtaaatgacaatctagttttttattcaattcaat 5716  T
Q  183 tgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  5715 tgttcttaatgctttttatat 5695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3816 - 3734
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttctt 189  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3816 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctt 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10946 - 10864
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttctt 189  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||  | | |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10946 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactctatttattattaatgacaatttagtttttattcaattcaattgttctt 10864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 456 - 360
Alignment:
Q  108 tgtaaccctaatttaaacatgttgttgtgaaactctatttcctgtgaatatcaatctag-ttttattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||  | | |||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  456 tgtaaccctaattgatccatgttgctgtgaaactatatttattattaattacaatttagtttttattcaattcaattgttcttattgctctttatat 360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 203
Target Start/End: Original strand, 1 - 34
Alignment:
Q  170 tattcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1 tattcaattcaattgttcttaatgctttttatat 34  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 10190 - 10235
Alignment:
Q  159 caatctagtttt-attcaattcaattgttcttgatgctttttatat 203  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10190 caatctagtttttattcaattcaattgttcttaatgttttttatat 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1053 times since January 2019
Visitors: 1522