View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0175-Insertion-5 (Length: 589)

Name: NF0175-Insertion-5
Description: NF0175
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0175-Insertion-5
NF0175-Insertion-5
[»] chr1 (122 HSPs)
chr1 (159-589)||(39462386-39462816)
chr1 (161-589)||(14097953-14098380)
chr1 (159-586)||(51749907-51750333)
chr1 (159-586)||(10399815-10400241)
chr1 (159-589)||(41646788-41647217)
chr1 (159-581)||(13214949-13215375)
chr1 (159-589)||(15823414-15823843)
chr1 (159-589)||(38925465-38925891)
chr1 (159-589)||(28207052-28207479)
chr1 (160-586)||(13761706-13762130)
chr1 (159-586)||(20302327-20302752)
chr1 (159-586)||(28840546-28840973)
chr1 (159-584)||(6822883-6823306)
chr1 (216-589)||(17324620-17324994)
chr1 (159-586)||(28842361-28842788)
chr1 (159-586)||(51752233-51752657)
chr1 (236-584)||(2617460-2617808)
chr1 (216-589)||(28998237-28998611)
chr1 (216-589)||(29003953-29004327)
chr1 (236-589)||(50078804-50079158)
chr1 (159-589)||(3579601-3580031)
chr1 (212-589)||(47906183-47906567)
chr1 (236-589)||(11457459-11457812)
chr1 (234-589)||(12302489-12302849)
chr1 (216-589)||(6995684-6996058)
chr1 (236-589)||(50307529-50307884)
chr1 (212-586)||(2510312-2510690)
chr1 (236-589)||(50076656-50077009)
chr1 (242-589)||(18307059-18307406)
chr1 (159-569)||(47451516-47451919)
chr1 (209-589)||(16428569-16428951)
chr1 (212-586)||(31735508-31735887)
chr1 (241-589)||(25251258-25251607)
chr1 (241-586)||(15294821-15295180)
chr1 (236-589)||(18839531-18839885)
chr1 (212-583)||(24325575-24325954)
chr1 (216-589)||(2949216-2949589)
chr1 (236-589)||(31489859-31490209)
chr1 (234-589)||(9241069-9241425)
chr1 (210-586)||(16226085-16226461)
chr1 (241-586)||(39932020-39932368)
chr1 (243-589)||(17186111-17186458)
chr1 (212-589)||(27336924-27337304)
chr1 (236-589)||(50248554-50248909)
chr1 (242-589)||(6756477-6756825)
chr1 (212-589)||(27339115-27339496)
chr1 (257-589)||(31424999-31425335)
chr1 (235-586)||(20291400-20291750)
chr1 (159-490)||(6823752-6824090)
chr1 (241-535)||(21948226-21948523)
chr1 (212-586)||(9459404-9459785)
chr1 (212-586)||(9463231-9463612)
chr1 (290-586)||(46431693-46431990)
chr1 (276-589)||(25127856-25128170)
chr1 (262-588)||(4131360-4131692)
chr1 (212-512)||(48665090-48665398)
chr1 (241-589)||(17318842-17319184)
chr1 (191-582)||(31422851-31423256)
chr1 (210-586)||(47179627-47180006)
chr1 (290-588)||(40133942-40134241)
chr1 (243-589)||(17324016-17324359)
chr1 (210-586)||(47177276-47177655)
chr1 (210-574)||(42922151-42922514)
chr1 (236-589)||(14183574-14183923)
chr1 (191-547)||(8347298-8347652)
chr1 (291-589)||(16432404-16432693)
chr1 (359-584)||(25248540-25248766)
chr1 (377-589)||(16429042-16429255)
chr1 (233-577)||(49495206-49495539)
chr1 (316-589)||(15669376-15669648)
chr1 (233-542)||(18800603-18800909)
chr1 (372-589)||(6115086-6115304)
chr1 (8-155)||(39451443-39451590)
chr1 (8-155)||(39460830-39460977)
chr1 (243-589)||(8349035-8349379)
chr1 (359-586)||(16231630-16231856)
chr1 (389-574)||(23785936-23786121)
chr1 (384-586)||(51757623-51757824)
chr1 (159-506)||(30790468-30790807)
chr1 (433-589)||(23816027-23816183)
chr1 (237-536)||(13125494-13125792)
chr1 (210-574)||(30738625-30738989)
chr1 (8-129)||(39472309-39472430)
chr1 (216-481)||(26520205-26520475)
chr1 (210-547)||(27916415-27916752)
chr1 (374-589)||(26613223-26613440)
chr1 (371-547)||(16561545-16561723)
chr1 (374-535)||(155788-155950)
chr1 (315-506)||(28279292-28279480)
chr1 (208-332)||(16231517-16231641)
chr1 (497-586)||(13358778-13358867)
chr1 (159-248)||(49687408-49687496)
chr1 (464-574)||(15916562-15916674)
chr1 (8-72)||(24060620-24060684)
chr1 (246-331)||(25248756-25248841)
chr1 (378-530)||(43104245-43104400)
chr1 (237-416)||(26332719-26332890)
chr1 (374-547)||(14353047-14353220)
chr1 (374-577)||(21353342-21353545)
chr1 (374-449)||(26332613-26332688)
chr1 (374-451)||(4144804-4144882)
chr1 (237-416)||(13127790-13127964)
chr1 (212-284)||(46432017-46432090)
chr1 (374-451)||(2232580-2232658)
chr1 (374-547)||(2401246-2401420)
chr1 (388-451)||(14997039-14997101)
chr1 (374-451)||(9526449-9526527)
chr1 (374-451)||(25134054-25134132)
chr1 (374-484)||(49959129-49959241)
chr1 (233-272)||(43104100-43104139)
chr1 (545-586)||(13447260-13447301)
chr1 (374-549)||(46783126-46783305)
chr1 (374-451)||(9521698-9521776)
chr1 (479-542)||(13127718-13127782)
chr1 (374-450)||(2393404-2393481)
chr1 (398-449)||(3091229-3091279)
chr1 (235-265)||(13449856-13449886)
chr1 (208-274)||(23783467-23783533)
chr1 (210-266)||(2401492-2401549)
chr1 (209-285)||(16431017-16431094)
chr1 (210-307)||(26613503-26613603)
chr1 (519-571)||(13598402-13598454)
[»] chr4 (147 HSPs)
chr4 (159-589)||(48486241-48486670)
chr4 (159-589)||(22800844-22801272)
chr4 (159-589)||(24878911-24879341)
chr4 (159-589)||(24880373-24880803)
chr4 (159-586)||(22802719-22803144)
chr4 (159-586)||(47274649-47275073)
chr4 (159-589)||(24888718-24889147)
chr4 (162-589)||(40091397-40091823)
chr4 (159-586)||(5198342-5198768)
chr4 (159-589)||(36919566-36919998)
chr4 (159-586)||(37089357-37089785)
chr4 (159-589)||(36921475-36921906)
chr4 (159-586)||(11434877-11435302)
chr4 (234-589)||(40637070-40637425)
chr4 (159-586)||(51015168-51015593)
chr4 (159-586)||(22044376-22044800)
chr4 (159-586)||(22046671-22047095)
chr4 (175-586)||(9148190-9148600)
chr4 (234-586)||(14633316-14633666)
chr4 (159-589)||(619430-619858)
chr4 (159-586)||(38409121-38409552)
chr4 (159-586)||(7941241-7941671)
chr4 (159-586)||(31849584-31850010)
chr4 (236-589)||(38928159-38928513)
chr4 (159-586)||(11006222-11006652)
chr4 (234-586)||(8631404-8631760)
chr4 (236-589)||(19095880-19096234)
chr4 (234-584)||(47868397-47868747)
chr4 (241-589)||(33415470-33415817)
chr4 (208-586)||(18847123-18847500)
chr4 (212-586)||(24348187-24348566)
chr4 (159-512)||(5637524-5637879)
chr4 (234-586)||(6764835-6765192)
chr4 (234-589)||(36378288-36378644)
chr4 (236-589)||(12395827-12396180)
chr4 (159-586)||(9174131-9174557)
chr4 (236-589)||(12400789-12401142)
chr4 (159-512)||(3824629-3824984)
chr4 (234-586)||(2484858-2485210)
chr4 (216-577)||(14787423-14787789)
chr4 (242-589)||(16453313-16453661)
chr4 (212-589)||(17662227-17662598)
chr4 (241-589)||(37313047-37313396)
chr4 (159-490)||(52942540-52942858)
chr4 (212-586)||(44599823-44600198)
chr4 (208-586)||(16934128-16934506)
chr4 (208-586)||(11008553-11008933)
chr4 (208-584)||(9176461-9176837)
chr4 (208-586)||(16931774-16932152)
chr4 (242-589)||(19322701-19323046)
chr4 (217-567)||(56030422-56030770)
chr4 (241-551)||(13543957-13544272)
chr4 (212-574)||(22132389-22132759)
chr4 (304-586)||(26085962-26086243)
chr4 (212-586)||(18709149-18709531)
chr4 (241-574)||(41997495-41997828)
chr4 (212-586)||(53405100-53405481)
chr4 (236-574)||(18409344-18409681)
chr4 (315-589)||(36380426-36380701)
chr4 (167-542)||(8756280-8756653)
chr4 (276-586)||(22780358-22780668)
chr4 (276-586)||(22782723-22783033)
chr4 (213-537)||(18537508-18537829)
chr4 (212-561)||(47210762-47211106)
chr4 (212-574)||(22134615-22134990)
chr4 (351-589)||(16455354-16455591)
chr4 (389-589)||(13547305-13547505)
chr4 (380-589)||(2891433-2891643)
chr4 (321-589)||(27499128-27499393)
chr4 (236-466)||(3937314-3937543)
chr4 (244-542)||(18534861-18535156)
chr4 (236-456)||(6132871-6133090)
chr4 (318-574)||(38890221-38890476)
chr4 (415-588)||(4215483-4215656)
chr4 (326-589)||(30136640-30136901)
chr4 (184-547)||(15032572-15032923)
chr4 (433-586)||(5635461-5635614)
chr4 (236-399)||(38270158-38270321)
chr4 (210-530)||(40998990-40999308)
chr4 (373-574)||(12102221-12102425)
chr4 (216-374)||(5100974-5101133)
chr4 (241-574)||(28453690-28454020)
chr4 (432-586)||(11437557-11437710)
chr4 (441-589)||(5101132-5101279)
chr4 (237-574)||(9863707-9864049)
chr4 (236-399)||(24446756-24446914)
chr4 (374-574)||(16185831-16186035)
chr4 (373-534)||(31983564-31983727)
chr4 (377-547)||(3982200-3982374)
chr4 (374-589)||(25357772-25357994)
chr4 (236-355)||(2891314-2891434)
chr4 (292-589)||(47150875-47151167)
chr4 (486-589)||(47563009-47563112)
chr4 (292-537)||(9022362-9022605)
chr4 (243-542)||(10112876-10113174)
chr4 (388-587)||(5336764-5336965)
chr4 (460-578)||(49088791-49088911)
chr4 (458-589)||(24446636-24446754)
chr4 (374-547)||(7050282-7050456)
chr4 (506-577)||(14789422-14789495)
chr4 (374-451)||(25699732-25699810)
chr4 (506-589)||(6133105-6133188)
chr4 (374-541)||(4570077-4570245)
chr4 (532-589)||(52942470-52942527)
chr4 (285-431)||(10114380-10114520)
chr4 (374-451)||(11853532-11853610)
chr4 (374-451)||(16489332-16489410)
chr4 (392-451)||(4556180-4556238)
chr4 (159-218)||(9176849-9176907)
chr4 (159-230)||(11008933-11009003)
chr4 (184-284)||(25357583-25357683)
chr4 (374-502)||(54906722-54906852)
chr4 (389-451)||(29609591-29609653)
chr4 (375-479)||(22295294-22295399)
chr4 (529-589)||(3937256-3937316)
chr4 (183-266)||(4569899-4569980)
chr4 (374-451)||(8529250-8529328)
chr4 (374-451)||(15831124-15831202)
chr4 (233-308)||(16186099-16186175)
chr4 (374-451)||(18586949-18587027)
chr4 (476-574)||(26557823-26557922)
chr4 (374-451)||(31300407-31300485)
chr4 (374-427)||(55822248-55822303)
chr4 (392-451)||(4558314-4558372)
chr4 (392-451)||(15316961-15317019)
chr4 (210-284)||(52043716-52043791)
chr4 (388-437)||(16638826-16638875)
chr4 (374-427)||(4884857-4884912)
chr4 (374-451)||(16689061-16689139)
chr4 (234-286)||(36380370-36380422)
chr4 (374-430)||(4874620-4874678)
chr4 (191-285)||(12102043-12102137)
chr4 (159-218)||(18847053-18847111)
chr4 (392-451)||(47566496-47566554)
chr4 (423-461)||(38270120-38270158)
chr4 (551-588)||(3824593-3824630)
chr4 (518-571)||(5269231-5269284)
chr4 (374-449)||(5516367-5516444)
chr4 (518-571)||(10047383-10047436)
chr4 (522-571)||(38152483-38152532)
chr4 (518-571)||(39245998-39246051)
chr4 (395-450)||(3760105-3760161)
chr4 (208-264)||(22780688-22780744)
chr4 (208-264)||(22783053-22783109)
chr4 (374-427)||(36769462-36769517)
chr4 (374-427)||(36771379-36771434)
chr4 (343-430)||(38208825-38208911)
[»] chr5 (117 HSPs)
chr5 (159-589)||(21947898-21948323)
chr5 (159-586)||(25921458-25921884)
chr5 (175-589)||(2818317-2818731)
chr5 (159-586)||(4236498-4236922)
chr5 (159-589)||(36402310-36402738)
chr5 (159-586)||(38881973-38882399)
chr5 (159-589)||(6756362-6756789)
chr5 (159-586)||(2174787-2175212)
chr5 (159-587)||(16776025-16776452)
chr5 (243-589)||(18511194-18511542)
chr5 (234-579)||(10529091-10529436)
chr5 (234-589)||(39854426-39854780)
chr5 (236-589)||(25904047-25904400)
chr5 (234-589)||(40221464-40221820)
chr5 (241-589)||(18509300-18509649)
chr5 (216-585)||(18596570-18596939)
chr5 (159-586)||(21684437-21684872)
chr5 (241-589)||(10474305-10474653)
chr5 (159-589)||(12555905-12556334)
chr5 (236-589)||(17072827-17073181)
chr5 (216-589)||(26097656-26098028)
chr5 (236-589)||(24126800-24127153)
chr5 (208-586)||(31544996-31545374)
chr5 (244-589)||(2954368-2954713)
chr5 (212-586)||(18466599-18466978)
chr5 (212-586)||(27912449-27912830)
chr5 (158-589)||(31465971-31466390)
chr5 (241-589)||(16092181-16092534)
chr5 (208-586)||(31542651-31543028)
chr5 (236-589)||(31472594-31472948)
chr5 (212-586)||(25803935-25804318)
chr5 (236-589)||(1189589-1189949)
chr5 (234-588)||(6745003-6745364)
chr5 (243-588)||(17818475-17818817)
chr5 (212-586)||(27910364-27910744)
chr5 (236-589)||(695833-696175)
chr5 (212-586)||(18468926-18469303)
chr5 (208-574)||(31179368-31179734)
chr5 (234-588)||(6747246-6747600)
chr5 (315-589)||(658338-658609)
chr5 (242-577)||(37705774-37706109)
chr5 (236-589)||(39397975-39398327)
chr5 (276-586)||(34477038-34477349)
chr5 (276-586)||(34479403-34479714)
chr5 (212-586)||(15552154-15552539)
chr5 (236-524)||(34530712-34531001)
chr5 (243-589)||(21288715-21289058)
chr5 (212-586)||(10586758-10587126)
chr5 (370-589)||(20505825-20506042)
chr5 (359-589)||(41585726-41585956)
chr5 (237-574)||(6661181-6661516)
chr5 (354-589)||(2723964-2724190)
chr5 (371-586)||(39798126-39798341)
chr5 (236-450)||(20042994-20043208)
chr5 (236-454)||(20044954-20045172)
chr5 (359-586)||(4410090-4410316)
chr5 (233-433)||(26098389-26098589)
chr5 (159-374)||(20507659-20507873)
chr5 (389-578)||(10749797-10749986)
chr5 (236-581)||(36208524-36208865)
chr5 (316-589)||(9020246-9020517)
chr5 (290-589)||(20053845-20054134)
chr5 (389-586)||(15354560-15354756)
chr5 (389-586)||(23665141-23665337)
chr5 (389-586)||(23793250-23793446)
chr5 (389-586)||(3373122-3373319)
chr5 (389-578)||(10757274-10757462)
chr5 (389-586)||(15356836-15357032)
chr5 (389-586)||(38960117-38960313)
chr5 (318-539)||(17413198-17413416)
chr5 (395-586)||(23741844-23742034)
chr5 (159-274)||(39797956-39798070)
chr5 (374-547)||(15143547-15143722)
chr5 (392-585)||(4897828-4898023)
chr5 (418-507)||(42770936-42771025)
chr5 (190-460)||(42770671-42770934)
chr5 (388-574)||(15445263-15445454)
chr5 (480-589)||(26098270-26098380)
chr5 (234-332)||(4409999-4410101)
chr5 (292-534)||(2144599-2144840)
chr5 (211-446)||(29748260-29748502)
chr5 (292-451)||(4754159-4754312)
chr5 (233-331)||(41585946-41586044)
chr5 (524-589)||(20043222-20043287)
chr5 (374-506)||(34033632-34033768)
chr5 (374-451)||(35385573-35385651)
chr5 (389-575)||(23667416-23667601)
chr5 (212-280)||(3373332-3373401)
chr5 (374-451)||(1170794-1170872)
chr5 (374-451)||(31782578-31782656)
chr5 (374-586)||(35430259-35430476)
chr5 (374-436)||(10627347-10627411)
chr5 (374-450)||(16093413-16093489)
chr5 (186-284)||(2144878-2144978)
chr5 (374-427)||(2298145-2298200)
chr5 (374-451)||(25452478-25452556)
chr5 (374-451)||(26406594-26406672)
chr5 (374-547)||(17841274-17841448)
chr5 (208-279)||(23665054-23665125)
chr5 (208-279)||(23667329-23667400)
chr5 (208-279)||(23793462-23793533)
chr5 (374-437)||(28786387-28786452)
chr5 (236-285)||(2723911-2723960)
chr5 (394-451)||(25445501-25445557)
chr5 (374-451)||(1240411-1240489)
chr5 (208-276)||(15354777-15354845)
chr5 (208-276)||(15357053-15357121)
chr5 (343-451)||(15224889-15224997)
chr5 (389-451)||(32520534-32520597)
chr5 (208-279)||(38960334-38960405)
chr5 (159-188)||(659819-659848)
chr5 (208-273)||(10757180-10757245)
chr5 (462-522)||(20045210-20045271)
chr5 (208-265)||(34477378-34477435)
chr5 (374-427)||(22672817-22672872)
chr5 (235-279)||(23742057-23742101)
chr5 (162-218)||(31542573-31542628)
[»] chr6 (99 HSPs)
chr6 (159-589)||(9019830-9020258)
chr6 (159-589)||(15541122-15541551)
chr6 (159-589)||(11983011-11983440)
chr6 (166-579)||(15532674-15533085)
chr6 (159-586)||(14507161-14507586)
chr6 (159-589)||(32279900-32280329)
chr6 (159-589)||(30728806-30729239)
chr6 (236-589)||(13057173-13057527)
chr6 (234-586)||(1230234-1230586)
chr6 (234-586)||(28241306-28241658)
chr6 (236-589)||(13039733-13040087)
chr6 (243-586)||(14458752-14459093)
chr6 (233-589)||(3390355-3390712)
chr6 (159-528)||(15530166-15530533)
chr6 (236-589)||(3629847-3630199)
chr6 (208-586)||(4816216-4816608)
chr6 (241-589)||(3631921-3632268)
chr6 (212-586)||(30967152-30967530)
chr6 (236-589)||(25477253-25477614)
chr6 (237-586)||(19704552-19704909)
chr6 (212-586)||(2628871-2629250)
chr6 (212-586)||(12195500-12195875)
chr6 (212-584)||(30034590-30034967)
chr6 (236-589)||(3233707-3234065)
chr6 (159-465)||(19227514-19227820)
chr6 (208-576)||(20915351-20915721)
chr6 (234-588)||(26064958-26065312)
chr6 (234-588)||(26084927-26085281)
chr6 (236-589)||(24338430-24338783)
chr6 (212-586)||(26932546-26932930)
chr6 (236-589)||(12161540-12161889)
chr6 (319-574)||(15719708-15719961)
chr6 (233-536)||(3027888-3028188)
chr6 (236-589)||(14466312-14466656)
chr6 (159-381)||(1072067-1072288)
chr6 (244-506)||(22490626-22490889)
chr6 (377-589)||(1069700-1069913)
chr6 (356-574)||(5273213-5273431)
chr6 (199-547)||(16455449-16455796)
chr6 (159-356)||(8995383-8995578)
chr6 (323-589)||(15367101-15367363)
chr6 (373-589)||(12186053-12186271)
chr6 (389-586)||(26066109-26066306)
chr6 (237-504)||(17012024-17012287)
chr6 (389-586)||(29754694-29754891)
chr6 (389-586)||(33308989-33309185)
chr6 (389-586)||(26068380-26068577)
chr6 (389-586)||(33311258-33311454)
chr6 (210-574)||(19696394-19696759)
chr6 (372-574)||(26945258-26945463)
chr6 (236-384)||(32447502-32447651)
chr6 (432-574)||(15346522-15346664)
chr6 (216-365)||(17852500-17852650)
chr6 (243-385)||(13870608-13870749)
chr6 (318-547)||(22857977-22858203)
chr6 (352-532)||(20526902-20527081)
chr6 (374-589)||(25078540-25078755)
chr6 (375-507)||(28037794-28037927)
chr6 (495-589)||(10584233-10584328)
chr6 (452-589)||(25465573-25465710)
chr6 (233-402)||(15346367-15346524)
chr6 (236-348)||(10584105-10584212)
chr6 (374-449)||(11138423-11138499)
chr6 (388-542)||(12911475-12911630)
chr6 (456-561)||(30445723-30445830)
chr6 (388-535)||(12937229-12937377)
chr6 (389-502)||(7542452-7542566)
chr6 (159-236)||(24192630-24192706)
chr6 (374-451)||(13878710-13878788)
chr6 (374-451)||(13883458-13883536)
chr6 (374-451)||(16785902-16785980)
chr6 (208-280)||(26068590-26068662)
chr6 (374-451)||(26887345-26887423)
chr6 (374-451)||(31248835-31248913)
chr6 (374-451)||(35201447-35201525)
chr6 (165-236)||(24191533-24191603)
chr6 (374-437)||(3577648-3577713)
chr6 (397-451)||(5165936-5165989)
chr6 (210-280)||(26066319-26066389)
chr6 (374-451)||(17036038-17036116)
chr6 (374-451)||(17694972-17695050)
chr6 (216-279)||(18317984-18318048)
chr6 (456-551)||(28078215-28078310)
chr6 (518-571)||(31979517-31979570)
chr6 (374-427)||(13467607-13467662)
chr6 (374-427)||(19702006-19702061)
chr6 (208-284)||(29754983-29755059)
chr6 (374-451)||(33215810-33215888)
chr6 (396-451)||(12166267-12166321)
chr6 (392-427)||(22351996-22352031)
chr6 (233-308)||(25466433-25466508)
chr6 (395-437)||(25941650-25941692)
chr6 (462-506)||(3833481-3833526)
chr6 (210-308)||(12186330-12186431)
chr6 (392-472)||(26643179-26643259)
chr6 (392-472)||(26749145-26749225)
chr6 (159-227)||(4816612-4816678)
chr6 (208-264)||(33308905-33308961)
chr6 (208-264)||(33311174-33311230)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (159-586)||(3874-4298)
[»] chr8 (91 HSPs)
chr8 (159-589)||(15072634-15073064)
chr8 (159-589)||(14807676-14808114)
chr8 (159-585)||(15067905-15068330)
chr8 (163-589)||(28251549-28251973)
chr8 (159-586)||(27829221-27829646)
chr8 (159-586)||(4423942-4424368)
chr8 (159-586)||(27826910-27827335)
chr8 (212-586)||(32339280-32339659)
chr8 (184-589)||(14419172-14419578)
chr8 (236-589)||(30480485-30480838)
chr8 (212-586)||(15809190-15809568)
chr8 (212-586)||(3873981-3874360)
chr8 (236-589)||(27106879-27107232)
chr8 (234-589)||(1225164-1225520)
chr8 (233-587)||(13858469-13858822)
chr8 (234-586)||(22684638-22685003)
chr8 (233-589)||(27911012-27911366)
chr8 (233-589)||(27957431-27957785)
chr8 (216-589)||(41384724-41385097)
chr8 (208-586)||(18810680-18811057)
chr8 (216-589)||(41382652-41383015)
chr8 (212-579)||(608702-609077)
chr8 (208-586)||(44720815-44721193)
chr8 (212-586)||(28283206-28283585)
chr8 (241-586)||(36865542-36865887)
chr8 (236-589)||(25952521-25952874)
chr8 (236-586)||(5372161-5372512)
chr8 (208-586)||(18812865-18813231)
chr8 (233-589)||(15185696-15186048)
chr8 (290-586)||(43079656-43079952)
chr8 (236-589)||(33541392-33541723)
chr8 (212-574)||(24873178-24873547)
chr8 (212-586)||(43530099-43530465)
chr8 (276-586)||(43082013-43082323)
chr8 (236-482)||(14477276-14477522)
chr8 (236-574)||(21482322-21482649)
chr8 (326-589)||(15956051-15956311)
chr8 (319-554)||(21480589-21480821)
chr8 (233-574)||(31162210-31162551)
chr8 (267-577)||(3005624-3005931)
chr8 (213-432)||(5622877-5623096)
chr8 (234-413)||(26775199-26775378)
chr8 (163-336)||(3886153-3886328)
chr8 (159-347)||(12517248-12517437)
chr8 (359-536)||(181622-181799)
chr8 (159-416)||(2468261-2468509)
chr8 (236-399)||(35872555-35872713)
chr8 (371-543)||(31035252-31035425)
chr8 (442-574)||(2468126-2468259)
chr8 (374-547)||(31578301-31578476)
chr8 (324-454)||(37214317-37214438)
chr8 (318-503)||(31573794-31573975)
chr8 (199-408)||(31035031-31035238)
chr8 (374-589)||(6376124-6376342)
chr8 (216-331)||(181516-181632)
chr8 (374-537)||(3895957-3896124)
chr8 (458-589)||(35872435-35872553)
chr8 (374-547)||(17847661-17847830)
chr8 (374-530)||(13985121-13985278)
chr8 (521-589)||(37214246-37214314)
chr8 (209-266)||(17847501-17847558)
chr8 (374-547)||(28327891-28328064)
chr8 (374-451)||(9021228-9021306)
chr8 (374-451)||(16752643-16752721)
chr8 (374-451)||(16757388-16757466)
chr8 (374-451)||(28895485-28895563)
chr8 (374-451)||(30423195-30423274)
chr8 (159-230)||(44720746-44720815)
chr8 (233-279)||(6375986-6376032)
chr8 (374-450)||(13985933-13986011)
chr8 (505-586)||(14477519-14477601)
chr8 (374-451)||(590777-590855)
chr8 (374-451)||(4812608-4812686)
chr8 (456-547)||(16833769-16833861)
chr8 (374-427)||(17799568-17799623)
chr8 (374-451)||(28332614-28332692)
chr8 (374-451)||(33032637-33032715)
chr8 (374-437)||(29554919-29554984)
chr8 (374-547)||(33838946-33839120)
chr8 (374-451)||(25684626-25684704)
chr8 (267-323)||(37214458-37214514)
chr8 (388-451)||(2267144-2267206)
chr8 (392-451)||(3276347-3276405)
chr8 (242-284)||(14419784-14419826)
chr8 (388-430)||(15949533-15949575)
chr8 (374-425)||(21033853-21033906)
chr8 (374-426)||(11701102-11701155)
chr8 (208-265)||(43081930-43081987)
chr8 (557-589)||(181800-181832)
chr8 (374-427)||(23179705-23179760)
chr8 (208-264)||(43079558-43079614)
[»] chr3 (169 HSPs)
chr3 (159-589)||(24979555-24979985)
chr3 (162-589)||(18162515-18162940)
chr3 (159-589)||(45882787-45883217)
chr3 (159-586)||(11170252-11170678)
chr3 (159-588)||(18099151-18099579)
chr3 (159-586)||(10956010-10956436)
chr3 (234-589)||(4308261-4308616)
chr3 (159-586)||(10958306-10958732)
chr3 (159-586)||(22114288-22114714)
chr3 (175-589)||(18096880-18097294)
chr3 (159-589)||(48361651-48362079)
chr3 (159-586)||(3859376-3859801)
chr3 (159-586)||(5191501-5191925)
chr3 (159-589)||(32264018-32264452)
chr3 (159-586)||(10084372-10084802)
chr3 (159-589)||(32218943-32219362)
chr3 (233-589)||(53917644-53918000)
chr3 (216-589)||(1313313-1313686)
chr3 (236-589)||(1626663-1627016)
chr3 (159-586)||(26720396-26720821)
chr3 (216-589)||(53915476-53915850)
chr3 (241-589)||(43421395-43421743)
chr3 (234-586)||(51726990-51727341)
chr3 (234-589)||(43228213-43228568)
chr3 (234-589)||(27101161-27101520)
chr3 (236-589)||(43423443-43423796)
chr3 (208-586)||(38889935-38890314)
chr3 (236-589)||(3314608-3314962)
chr3 (206-589)||(12267955-12268329)
chr3 (212-586)||(25533333-25533716)
chr3 (159-586)||(5522610-5523024)
chr3 (236-589)||(28101982-28102335)
chr3 (234-589)||(43226008-43226360)
chr3 (236-589)||(880431-880785)
chr3 (212-586)||(4103879-4104257)
chr3 (159-574)||(10191305-10191722)
chr3 (233-589)||(51943292-51943647)
chr3 (276-589)||(42990268-42990581)
chr3 (233-589)||(28761407-28761764)
chr3 (236-588)||(5926746-5927097)
chr3 (234-589)||(9604587-9604947)
chr3 (236-589)||(47148875-47149233)
chr3 (276-589)||(30005805-30006118)
chr3 (236-589)||(36011751-36012104)
chr3 (197-589)||(15780745-15781156)
chr3 (199-586)||(6065779-6066167)
chr3 (212-586)||(746650-747031)
chr3 (208-586)||(6063429-6063809)
chr3 (241-589)||(51674746-51675083)
chr3 (242-589)||(39715400-39715742)
chr3 (236-589)||(53468433-53468788)
chr3 (208-586)||(50493895-50494273)
chr3 (237-528)||(6561735-6562028)
chr3 (212-586)||(458179-458558)
chr3 (159-477)||(35777270-35777587)
chr3 (212-586)||(455802-456181)
chr3 (316-586)||(1321483-1321753)
chr3 (208-586)||(25388794-25389179)
chr3 (236-589)||(54691554-54691906)
chr3 (212-586)||(10621513-10621900)
chr3 (325-589)||(6484372-6484637)
chr3 (236-561)||(889781-890104)
chr3 (234-541)||(35917971-35918284)
chr3 (209-586)||(38210265-38210644)
chr3 (302-586)||(28413014-28413299)
chr3 (276-533)||(29956650-29956907)
chr3 (334-586)||(7606571-7606822)
chr3 (236-571)||(53591119-53591442)
chr3 (363-589)||(25688140-25688367)
chr3 (217-589)||(42992186-42992547)
chr3 (233-589)||(23633381-23633730)
chr3 (236-467)||(28100143-28100374)
chr3 (236-589)||(31151271-31151622)
chr3 (159-380)||(11162998-11163218)
chr3 (373-588)||(5886261-5886474)
chr3 (333-589)||(4666535-4666791)
chr3 (360-589)||(6231849-6232077)
chr3 (236-472)||(28180948-28181182)
chr3 (233-547)||(53597162-53597472)
chr3 (373-588)||(5899734-5899947)
chr3 (376-586)||(11168165-11168375)
chr3 (241-589)||(27635638-27635955)
chr3 (319-589)||(17795269-17795536)
chr3 (319-589)||(19103709-19103976)
chr3 (243-489)||(23636958-23637200)
chr3 (244-506)||(54884089-54884348)
chr3 (233-532)||(13420222-13420508)
chr3 (319-535)||(25635391-25635605)
chr3 (319-547)||(561797-562024)
chr3 (236-460)||(28137415-28137628)
chr3 (159-416)||(24177127-24177380)
chr3 (390-589)||(3306839-3307037)
chr3 (290-547)||(36871323-36871577)
chr3 (441-588)||(47701652-47701799)
chr3 (233-500)||(1673896-1674160)
chr3 (212-404)||(41849041-41849244)
chr3 (159-309)||(1321289-1321438)
chr3 (233-506)||(4560355-4560601)
chr3 (236-366)||(47701798-47701928)
chr3 (496-589)||(41849243-41849336)
chr3 (374-547)||(1620483-1620657)
chr3 (418-547)||(24181486-24181616)
chr3 (241-365)||(6231378-6231502)
chr3 (455-589)||(25634030-25634164)
chr3 (241-355)||(3306728-3306842)
chr3 (374-507)||(14634504-14634638)
chr3 (505-586)||(35919098-35919179)
chr3 (518-586)||(53894040-53894108)
chr3 (291-541)||(13419864-13420110)
chr3 (374-451)||(7768632-7768709)
chr3 (208-285)||(53896480-53896557)
chr3 (208-284)||(6719396-6719472)
chr3 (319-416)||(25633930-25634024)
chr3 (159-230)||(6719472-6719542)
chr3 (401-547)||(11007545-11007683)
chr3 (374-451)||(11066652-11066731)
chr3 (159-218)||(38889865-38889923)
chr3 (388-586)||(16996874-16997074)
chr3 (374-451)||(10094195-10094273)
chr3 (374-451)||(10201075-10201153)
chr3 (374-451)||(16462186-16462264)
chr3 (374-451)||(22626105-22626183)
chr3 (374-547)||(29913980-29914152)
chr3 (374-451)||(47883003-47883081)
chr3 (186-264)||(13893269-13893345)
chr3 (392-451)||(27762107-27762165)
chr3 (374-437)||(6303293-6303358)
chr3 (374-437)||(10100225-10100290)
chr3 (374-577)||(47878165-47878370)
chr3 (212-284)||(42990181-42990254)
chr3 (374-451)||(10208121-10208199)
chr3 (234-274)||(25690651-25690691)
chr3 (186-266)||(26762839-26762919)
chr3 (374-427)||(27544256-27544311)
chr3 (352-414)||(31021300-31021361)
chr3 (374-451)||(54193209-54193287)
chr3 (388-451)||(4535613-4535675)
chr3 (207-266)||(46966938-46966997)
chr3 (388-547)||(11079516-11079674)
chr3 (374-437)||(20031452-20031517)
chr3 (234-284)||(29956586-29956636)
chr3 (234-284)||(30005741-30005791)
chr3 (388-437)||(7418063-7418112)
chr3 (356-401)||(7606828-7606873)
chr3 (234-267)||(27101562-27101595)
chr3 (405-586)||(46966633-46966816)
chr3 (374-547)||(5858529-5858701)
chr3 (374-451)||(10896988-10897066)
chr3 (533-589)||(42992607-42992663)
chr3 (374-451)||(54188492-54188570)
chr3 (208-267)||(5886181-5886240)
chr3 (208-267)||(5899656-5899715)
chr3 (233-279)||(1618948-1618994)
chr3 (242-300)||(6484315-6484373)
chr3 (393-427)||(10949404-10949438)
chr3 (374-437)||(38002852-38002917)
chr3 (374-407)||(1618824-1618857)
chr3 (518-571)||(1736335-1736388)
chr3 (518-571)||(18552913-18552966)
chr3 (518-571)||(26298992-26299045)
chr3 (374-451)||(26763021-26763101)
chr3 (518-571)||(30709820-30709873)
chr3 (236-272)||(4663843-4663879)
chr3 (374-451)||(11073007-11073084)
chr3 (397-437)||(13893470-13893510)
chr3 (184-266)||(20031611-20031692)
chr3 (509-561)||(28181185-28181236)
chr3 (527-571)||(39153361-39153405)
chr3 (527-571)||(51398938-51398982)
[»] chr2 (110 HSPs)
chr2 (163-589)||(40032035-40032465)
chr2 (159-589)||(21520675-21521106)
chr2 (162-589)||(6258799-6259223)
chr2 (159-586)||(13910030-13910455)
chr2 (159-589)||(22287318-22287747)
chr2 (159-589)||(6264130-6264556)
chr2 (159-586)||(42064359-42064785)
chr2 (159-586)||(19504331-19504756)
chr2 (159-586)||(27104643-27105067)
chr2 (159-589)||(43623562-43623978)
chr2 (159-586)||(19501996-19502422)
chr2 (216-589)||(42923491-42923867)
chr2 (234-586)||(45279969-45280322)
chr2 (236-588)||(19007560-19007912)
chr2 (159-586)||(24162208-24162623)
chr2 (212-586)||(23452222-23452601)
chr2 (236-589)||(11739541-11739895)
chr2 (212-586)||(42452678-42453050)
chr2 (236-589)||(28196557-28196908)
chr2 (236-589)||(17849037-17849390)
chr2 (236-589)||(17848365-17848713)
chr2 (236-589)||(14837193-14837541)
chr2 (241-589)||(3022088-3022445)
chr2 (244-589)||(34979559-34979906)
chr2 (236-589)||(44289049-44289403)
chr2 (236-548)||(45239000-45239316)
chr2 (212-586)||(35215571-35215956)
chr2 (241-490)||(15539556-15539805)
chr2 (236-575)||(31732772-31733100)
chr2 (159-589)||(18800295-18800712)
chr2 (159-387)||(22407593-22407820)
chr2 (276-586)||(35217948-35218258)
chr2 (366-589)||(5375328-5375550)
chr2 (191-542)||(11578137-11578485)
chr2 (242-589)||(22874068-22874404)
chr2 (326-589)||(28459172-28459435)
chr2 (241-547)||(20146632-20146937)
chr2 (233-535)||(17897281-17897580)
chr2 (429-589)||(22407436-22407596)
chr2 (389-586)||(36558849-36559046)
chr2 (389-586)||(36561126-36561323)
chr2 (236-413)||(22163106-22163282)
chr2 (389-586)||(45332166-45332363)
chr2 (452-589)||(22707733-22707872)
chr2 (207-589)||(35107191-35107569)
chr2 (372-547)||(40699429-40699606)
chr2 (276-473)||(38020162-38020349)
chr2 (326-501)||(27136195-27136368)
chr2 (233-574)||(37962938-37963265)
chr2 (234-371)||(5377629-5377770)
chr2 (388-506)||(20589762-20589881)
chr2 (482-589)||(22163004-22163111)
chr2 (451-589)||(23870951-23871089)
chr2 (442-568)||(7462950-7463077)
chr2 (359-458)||(38414194-38414291)
chr2 (373-506)||(15693958-15694094)
chr2 (292-506)||(43139356-43139564)
chr2 (210-536)||(35028473-35028796)
chr2 (375-431)||(27583479-27583535)
chr2 (374-451)||(17921754-17921833)
chr2 (241-330)||(38020068-38020157)
chr2 (374-547)||(17943520-17943692)
chr2 (374-451)||(28458949-28459028)
chr2 (373-449)||(26345661-26345738)
chr2 (388-451)||(2736204-2736266)
chr2 (388-451)||(2740940-2741002)
chr2 (374-577)||(27517633-27517838)
chr2 (199-307)||(12342673-12342782)
chr2 (412-547)||(13828366-13828503)
chr2 (374-547)||(39686966-39687139)
chr2 (374-451)||(17462419-17462497)
chr2 (374-451)||(20054886-20054964)
chr2 (374-451)||(22712637-22712715)
chr2 (374-451)||(22717346-22717424)
chr2 (206-266)||(28462591-28462651)
chr2 (374-451)||(45567392-45567470)
chr2 (374-451)||(34575230-34575308)
chr2 (374-500)||(30720684-30720811)
chr2 (374-449)||(38190980-38191056)
chr2 (374-449)||(7502975-7503052)
chr2 (389-449)||(10942634-10942695)
chr2 (389-449)||(10948503-10948564)
chr2 (184-284)||(40699178-40699278)
chr2 (374-451)||(17932617-17932695)
chr2 (374-451)||(30478977-30479055)
chr2 (374-537)||(33603977-33604143)
chr2 (392-451)||(12781342-12781400)
chr2 (199-331)||(20146987-20147121)
chr2 (547-589)||(15539511-15539553)
chr2 (388-449)||(45158307-45158369)
chr2 (159-266)||(37171049-37171154)
chr2 (374-427)||(20050166-20050221)
chr2 (212-279)||(35218269-35218337)
chr2 (374-427)||(39680028-39680083)
chr2 (208-279)||(36559067-36559138)
chr2 (208-279)||(36561344-36561415)
chr2 (392-451)||(37170873-37170931)
chr2 (395-449)||(41303155-41303210)
chr2 (398-451)||(27248021-27248075)
chr2 (374-425)||(33674551-33674604)
chr2 (522-571)||(8040064-8040113)
chr2 (518-571)||(14699047-14699100)
chr2 (522-571)||(34682378-34682427)
chr2 (211-264)||(45156946-45156999)
chr2 (527-571)||(17057369-17057413)
chr2 (527-571)||(17085352-17085396)
chr2 (236-284)||(20589581-20589629)
chr2 (527-571)||(36773686-36773730)
chr2 (527-571)||(38312364-38312408)
chr2 (235-279)||(45332384-45332428)
[»] chr7 (124 HSPs)
chr7 (159-589)||(27306214-27306640)
chr7 (158-589)||(31435028-31435459)
chr7 (159-586)||(3878450-3878881)
chr7 (159-586)||(35507-35933)
chr7 (159-586)||(44442-44868)
chr7 (159-584)||(1049283-1049706)
chr7 (159-586)||(40836728-40837154)
chr7 (216-589)||(13099456-13099832)
chr7 (216-589)||(42330979-42331355)
chr7 (236-589)||(44724533-44724886)
chr7 (212-586)||(38393911-38394290)
chr7 (159-584)||(25542408-25542830)
chr7 (234-586)||(48457601-48457957)
chr7 (236-589)||(4295916-4296271)
chr7 (236-589)||(20137091-20137444)
chr7 (216-589)||(21990084-21990457)
chr7 (243-589)||(24748555-24748902)
chr7 (236-589)||(11355212-11355565)
chr7 (216-589)||(443528-443903)
chr7 (243-589)||(20625995-20626345)
chr7 (243-589)||(20629886-20630236)
chr7 (243-589)||(20642305-20642655)
chr7 (241-586)||(7470007-7470356)
chr7 (212-586)||(20299383-20299764)
chr7 (212-586)||(7471965-7472344)
chr7 (257-589)||(21592125-21592457)
chr7 (236-589)||(9680768-9681127)
chr7 (212-586)||(18345466-18345845)
chr7 (236-589)||(21679981-21680337)
chr7 (212-584)||(28485491-28485867)
chr7 (212-585)||(3035646-3036027)
chr7 (236-589)||(39145968-39146322)
chr7 (276-586)||(1849975-1850285)
chr7 (234-586)||(40946276-40946632)
chr7 (212-586)||(20297287-20297666)
chr7 (236-589)||(21678020-21678371)
chr7 (212-586)||(28487478-28487857)
chr7 (241-589)||(9679013-9679366)
chr7 (159-475)||(26804452-26804765)
chr7 (216-587)||(37412109-37412484)
chr7 (236-589)||(42223110-42223465)
chr7 (212-586)||(43253502-43253884)
chr7 (212-586)||(31155896-31156271)
chr7 (276-584)||(1046912-1047219)
chr7 (237-589)||(24258418-24258775)
chr7 (212-586)||(7351637-7352018)
chr7 (212-512)||(11757153-11757460)
chr7 (212-586)||(7349262-7349639)
chr7 (236-557)||(27832646-27832969)
chr7 (236-589)||(25276095-25276437)
chr7 (233-531)||(22828672-22828971)
chr7 (352-586)||(7092198-7092431)
chr7 (184-574)||(7188445-7188833)
chr7 (352-586)||(7094445-7094678)
chr7 (158-400)||(18567490-18567731)
chr7 (243-565)||(24817358-24817677)
chr7 (220-506)||(22251611-22251893)
chr7 (233-538)||(20091580-20091879)
chr7 (318-589)||(24813480-24813748)
chr7 (360-586)||(38396713-38396938)
chr7 (389-574)||(2935375-2935560)
chr7 (163-429)||(22392355-22392608)
chr7 (389-586)||(22137185-22137381)
chr7 (389-586)||(40552212-40552408)
chr7 (241-542)||(24465507-24465797)
chr7 (389-586)||(22108174-22108370)
chr7 (389-586)||(40549934-40550130)
chr7 (389-574)||(1606487-1606671)
chr7 (415-577)||(26295580-26295743)
chr7 (389-574)||(9027191-9027375)
chr7 (436-589)||(22393876-22394030)
chr7 (292-589)||(11081522-11081817)
chr7 (374-547)||(16297046-16297222)
chr7 (233-574)||(6332177-6332514)
chr7 (412-506)||(6348912-6349006)
chr7 (292-506)||(6048885-6049094)
chr7 (398-586)||(6067183-6067373)
chr7 (519-586)||(11759364-11759431)
chr7 (237-367)||(6348773-6348903)
chr7 (374-437)||(21369625-21369690)
chr7 (212-284)||(1606399-1606472)
chr7 (373-451)||(2120881-2120960)
chr7 (374-451)||(11084467-11084544)
chr7 (319-574)||(13290470-13290723)
chr7 (352-430)||(12310157-12310234)
chr7 (374-547)||(25351336-25351508)
chr7 (377-480)||(40281468-40281572)
chr7 (430-547)||(6046641-6046759)
chr7 (374-547)||(25410113-25410287)
chr7 (374-451)||(26210631-26210710)
chr7 (241-331)||(7092414-7092509)
chr7 (290-343)||(38396324-38396377)
chr7 (181-262)||(45366446-45366526)
chr7 (374-451)||(3320171-3320249)
chr7 (374-451)||(3324919-3324997)
chr7 (374-451)||(7069763-7069841)
chr7 (374-451)||(7074770-7074848)
chr7 (374-451)||(25357030-25357108)
chr7 (374-451)||(25405376-25405454)
chr7 (374-451)||(42006646-42006724)
chr7 (243-331)||(7094662-7094754)
chr7 (534-589)||(26804762-26804817)
chr7 (374-437)||(15541129-15541194)
chr7 (212-284)||(1849894-1849967)
chr7 (212-284)||(38396215-38396288)
chr7 (374-451)||(8378625-8378703)
chr7 (374-451)||(30246953-30247031)
chr7 (233-359)||(30906264-30906388)
chr7 (374-439)||(44143998-44144065)
chr7 (374-451)||(44512646-44512724)
chr7 (241-304)||(3677239-3677301)
chr7 (208-279)||(22108087-22108158)
chr7 (208-279)||(22137098-22137169)
chr7 (208-279)||(40549847-40549918)
chr7 (208-279)||(40552125-40552196)
chr7 (466-530)||(22280379-22280444)
chr7 (392-437)||(34546997-34547042)
chr7 (376-430)||(8260570-8260625)
chr7 (208-279)||(9027396-9027467)
chr7 (208-278)||(2935279-2935349)
chr7 (522-571)||(9190052-9190101)
chr7 (518-571)||(20284093-20284146)
chr7 (208-264)||(1047239-1047295)
chr7 (527-571)||(8153466-8153510)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (161-586)||(69277-69703)
scaffold0025 (159-391)||(73203-73437)
scaffold0025 (348-398)||(73160-73210)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (162-589)||(14899-15323)
scaffold0131 (248-589)||(14366-14707)
scaffold0131 (374-416)||(31124-31168)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (234-586)||(183626-183976)
scaffold0005 (216-577)||(51941-52307)
scaffold0005 (506-577)||(50235-50308)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (159-586)||(2757-3182)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (234-586)||(41468-41820)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (216-589)||(79117-79491)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (216-589)||(11455-11829)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (159-586)||(29038-29473)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (236-589)||(79812-80165)
scaffold0004 (374-451)||(188363-188441)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (208-586)||(6124-6502)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (236-589)||(85184-85537)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (276-586)||(34-344)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (216-535)||(1968-2293)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (210-574)||(15817-16180)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (350-586)||(1438-1673)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (243-574)||(16646-16975)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (245-547)||(1666-1958)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (236-463)||(35593-35819)
scaffold0011 (506-589)||(35817-35900)
[»] scaffold0458 (2 HSPs)
scaffold0458 (8-155)||(12072-12219)
scaffold0458 (8-129)||(1927-2048)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (389-586)||(22222-22418)
scaffold0140 (389-586)||(24497-24693)
scaffold0140 (208-279)||(22135-22206)
scaffold0140 (208-279)||(24410-24481)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (237-547)||(4768-5076)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (234-404)||(993-1168)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (388-547)||(57452-57614)
[»] scaffold0891 (1 HSPs)
scaffold0891 (518-584)||(4666-4732)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (374-451)||(224802-224880)
scaffold0006 (519-571)||(5687-5739)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (374-547)||(16308-16482)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (537-583)||(1439-1485)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (392-426)||(17131-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 351; Significance: 0; HSPs: 122)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 39462386 - 39462816
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462386 tggcacgatggtgcgcttgcagtgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 39462485  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462486 gtatcagagtaaactttgagatagagaaggctgaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 39462585  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39462586 actaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 39462685  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  39462686 attattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 39462785  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39462786 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39462816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 161 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14098380 - 14097953
Alignment:
Q  161 gcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098380 gcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatt-gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgt 14098283  T
Q  261 atcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 360  Q
    |||| | |||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14098282 atcaaactaaactttgagatagaggggactgaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacac 14098183  T
Q  361 tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagact 460  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14098182 tagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagact 14098083  T
Q  461 tattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaa 559  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  14098082 tattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccacaaactaggtcaatttggaccgaa 14097983  T
Q  560 cttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14097982 ctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14097953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 51749907 - 51750333
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  51749907 tggcacgatagtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 51750005  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51750006 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 51750105  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51750106 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 51750205  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51750206 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 51750305  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51750306 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 51750333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10400241 - 10399815
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||||||    
T  10400241 tggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaactttttctataaatatagacctt 10400143  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10400142 gtatcagagcaaactgggagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 10400043  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10400042 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggaga 10399943  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  10399942 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 10399843  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10399842 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 10399815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 41646788 - 41647217
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41646788 tggcacgatggtgcactggcagcgaataacagaaacatattttt-ggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 41646886  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41646887 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 41646986  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  41646987 acttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggaga 41647086  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  41647087 cttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccatcagactatgtcaatttggaccga 41647186  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41647187 actgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 41647217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 159 - 581
Target Start/End: Original strand, 13214949 - 13215375
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  13214949 tggcacgatggtgtgttggcagcaaataacaaaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 13215047  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215048 gtatcagagtaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 13215147  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13215148 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 13215247  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgata----tctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgg 553  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13215248 cttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 13215347  T
Q  554 actgaacttggtcaacaaattcttttgt 581  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||    
T  13215348 accgaactgcgtcaacaaattcttttgt 13215375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 15823414 - 15823843
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15823414 tggcacgatggtgcgctagcagcaaataacagaaacatattttt-ggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 15823512  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15823513 gtatcaaagtaaacttagagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 15823612  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15823613 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 15823712  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  15823713 cttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccga 15823812  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15823813 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15823843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 38925891 - 38925465
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38925891 tggcacgatggggcgttggcagcgaacaacagaagtgtattttt-gggtgcagatttattccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 38925793  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38925792 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 38925693  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  38925692 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggaga 38925593  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  38925592 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 38925496  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  38925495 actgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 38925465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28207479 - 28207052
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28207479 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgt-ttttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 28207381  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28207380 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaac 28207281  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  28207280 actagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggaga 28207181  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28207180 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 28207083  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28207082 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28207052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 160 - 586
Target Start/End: Original strand, 13761706 - 13762130
Alignment:
Q  160 ggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttg 259  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||    
T  13761706 ggcacgatggtgtgctggcggcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttg 13761804  T
Q  260 tatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 359  Q
    |||||||| |||||| |||||||||  |  |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13761805 tatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 13761904  T
Q  360 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagac 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13761905 ctagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagac 13762004  T
Q  460 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaa 559  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13762005 ttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctctctcccccagactaggtcaatttggactgaa 13762103  T
Q  560 cttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  13762104 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 13762130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 20302327 - 20302752
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||    
T  20302327 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttt-tgggtgcatatttgttccaaattttaagtgaaacttttattataaatatagacctt 20302425  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20302426 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 20302525  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20302526 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggaga 20302625  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||| |||||| | | |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20302626 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcagatagtggatcggaggactactctctcccccagactaggtcaatttggaccga 20302724  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302725 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 20302752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 28840546 - 28840973
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28840546 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 28840644  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||||| |||||||||||  || ||| |  ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28840645 gtatcagagcaaactttgagagatacagggggatgaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 28840744  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28840745 acactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggga 28840844  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28840845 gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 28840943  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28840944 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28840973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 159 - 584
Target Start/End: Original strand, 6822883 - 6823306
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||    
T  6822883 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataatagaaatgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacctt 6822981  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6822982 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa- 6823080  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6823081 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggaga 6823180  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6823181 cttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 6823280  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6823281 actgggtcaacaaattcttttgtgtt 6823306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17324994 - 17324620
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||| ||| |  | |||||||||||||||| | |||     
T  17324994 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaaccagagtaaacctgaagatacagggggctaaaacaagggtttagaatggcaac 17324895  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17324894 aacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17324795  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17324794 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 17324695  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17324694 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17324620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 28842361 - 28842788
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  28842361 tggcacgatggtgtcctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaacctt 28842459  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28842460 gtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 28842559  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  28842560 acactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggga 28842659  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  28842660 gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctaatctctcccccagactaggtcaatttggaca 28842758  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28842759 gaactaggtcaacaaattctattgtgttct 28842788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 51752233 - 51752657
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  51752233 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 51752331  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||  || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51752332 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 51752431  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  51752432 actaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta-gattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 51752530  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  51752531 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 51752629  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51752630 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 51752657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 236 - 584
Target Start/End: Original strand, 2617460 - 2617808
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2617460 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 2617559  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  2617560 gagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggac 2617659  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||     
T  2617660 tttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccct 2617759  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  2617760 cagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttgtgtt 2617808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28998611 - 28998237
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  28998611 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaac 28998512  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28998511 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 28998412  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  28998411 gttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaa 28998312  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28998311 actgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28998237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 29004327 - 29003953
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  29004327 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatgacaac 29004228  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29004227 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 29004128  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  29004127 gttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcatcatatggtgaa 29004028  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29004027 actgagggttgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 29003953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 50079158 - 50078804
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||    
T  50079158 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcata 50079059  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50079058 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggac 50078959  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50078958 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctctctccc 50078859  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50078858 ccagactaggtcaatttggaccgaatttggtaaacaaattcttttgtgttctctc 50078804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3580031 - 3579601
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3580031 tggcacgatggtgcgctggcggcgaatatcataaacgtatttta-gagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactttaaatatagacctt 3579933  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagat--tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |    ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3579932 gtatcagcgtaaaatttgagatagagggggggctgaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaa 3579833  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  3579832 acactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcggga 3579733  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  3579732 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat-tagtgaaacggatgattgctctctcccctagactaggtcaatttggacc 3579634  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3579633 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3579601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 212 - 589
Target Start/End: Original strand, 47906183 - 47906567
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  47906183 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 47906282  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47906283 gaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 47906382  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  47906383 gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 47906482  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47906483 atatagtgaatcggagggctgctctctcccccagacttggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 47906567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11457812 - 11457459
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11457812 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 11457713  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  11457712 gagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattggggg 11457613  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  11457612 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctctctcccc 11457513  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11457512 cagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11457459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12302849 - 12302489
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggt 328  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  12302849 tacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggt 12302750  T
Q  329 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 428  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302749 ttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 12302650  T
Q  429 ttgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12302649 ttgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 12302550  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12302549 tctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 12302489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6996058 - 6995684
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||     
T  6996058 gttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagaccttgaatcagagtaaatcttgagatagagggggccgaaacaacggtttagaaaggcaac 6995959  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6995958 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 6995859  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6995858 gttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgttactcatcatatagtgaa 6995759  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6995758 acggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6995684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 50307884 - 50307529
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||| | | |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50307884 cttttactataaatataagctttgtatcaaagtaaaccttgagatatatggggctgaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtata 50307785  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50307784 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggg 50307685  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50307684 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 50307585  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc-ttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50307584 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttttgtgttctctc 50307529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2510690 - 2510312
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  ||||||||||||||| |    
T  2510690 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttata 2510591  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2510590 aaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattga 2510491  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  2510490 gtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcat 2510392  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2510391 atagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 2510312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 50077009 - 50076656
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50077009 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaagggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 50076910  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50076909 aagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaa 50076810  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||| ||    
T  50076809 tttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctct-cc 50076711  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50076710 ccagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50076656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 18307059 - 18307406
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18307059 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagttt 18307158  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18307159 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttggg 18307258  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  18307259 tagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctct-ccccagac 18307357  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  18307358 taggtcaatttggaccgaacggagtcaacaaattcttttgtgttctctc 18307406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 159 - 569
Target Start/End: Original strand, 47451516 - 47451919
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  47451516 tggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttttgg-tgcagatttgttccaaatattaagcgatacttttactataaatatagacctt 47451614  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47451615 gtatcagagtaaactttgagatagagggggcttaaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 47451714  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |    
T  47451715 actagggtttgagggttgattcacattag------tgtttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaa 47451808  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  47451809 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaatgactgctctctcccccatactaggtcaatttggaccga 47451908  T
Q  559 acttggtcaac 569  Q
    ||| |||||||    
T  47451909 actgggtcaac 47451919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 209 - 589
Target Start/End: Original strand, 16428569 - 16428951
Alignment:
Q  209 cagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || ||| ||||  ||||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||  | ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  16428569 cagatttgttcgaattttataagggatacttttactataaatataggttttatatcagagcaaaccattagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 16428668  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 407  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16428669 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 16428768  T
Q  408 tctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-t 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16428769 tctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatt 16428868  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16428869 ttagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 16428951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31735887 - 31735508
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttga----gatagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    |||||||| |  | |||||||||||||||    
T  31735887 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgaatgagatagagggggctaaaacaagggtttaga 31735788  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  31735787 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttga 31735688  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  31735687 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 31735588  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31735587 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31735508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25251607 - 25251258
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  25251607 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtt 25251508  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  25251507 tgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgg 25251408  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  25251407 gtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctctctccccaata 25251308  T
Q  540 ctatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25251307 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25251258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 241 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15295180 - 15294821
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-----gagat---------tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagg 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     |||||         |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15295180 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagagagatagagagggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg 15295081  T
Q  327 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295080 gtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 15294981  T
Q  427 gattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgc 526  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15294980 ggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgc 15294881  T
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15294880 tctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15294821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 18839531 - 18839885
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  18839531 cttttactataaatatagacattgtattattgtaaaccatgagatagagggggctgaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtata 18839630  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  18839631 gagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagac 18839730  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18839731 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctttccc 18839830  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18839831 ccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttcgtgttctctc 18839885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 212 - 583
Target Start/End: Original strand, 24325575 - 24325954
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--------tagaggagattgaaacaagggtt 302  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||        |||||| |  |||||||||||||    
T  24325575 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 24325674  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24325675 -agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagga 24325773  T
Q  403 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  24325774 ttgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactca 24325873  T
Q  503 tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 583  Q
    |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24325874 tcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccccagactaagtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 24325954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 2949589 - 2949216
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| || |||||||||||  ||| ||| ||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  2949589 gttccaaatttatgagttatacttttacaataaatatagatattgaatccgagaaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaac 2949490  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2949489 aacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 2949390  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
     ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  2949389 tttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 2949290  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2949289 acagagggctgctctctccccc-gactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2949216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 31489859 - 31490209
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  31489859 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 31489958  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  31489959 g--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagac 31490056  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  31490057 tttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctctc-cccc 31490155  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31490156 cagactaggtcaatttggactgaactagatcaacaaattcttttgtgttctctc 31490209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9241425 - 9241069
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| |   |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9241425 tacttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagaggggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 9241327  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9241326 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 9241227  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9241226 ggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctct 9241127  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||| |||||||||    
T  9241126 cccccatactaggtcaatttggaccgaactggggaaacaaattcttttttgttctctc 9241069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 210 - 586
Target Start/End: Original strand, 16226085 - 16226461
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaag 309  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||     
T  16226085 agatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggtctaaaacaagggtttagaaaa 16226184  T
Q  310 acaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagt 408  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16226185 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagt 16226284  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatat 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||||    
T  16226285 ctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatat 16226383  T
Q  509 agtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  16226384 agtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 16226461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 241 - 586
Target Start/End: Original strand, 39932020 - 39932368
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39932020 actataaatatagaccttgtatgagacaaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 39932119  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  39932120 tttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagacttt 39932219  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctc-tccccca 537  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  39932220 gggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctctcttccccca 39932319  T
Q  538 gactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39932320 tactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 39932368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17186458 - 17186111
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17186458 tataaatatagattttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 17186359  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  17186358 tctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggt 17186259  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17186258 agaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctctctcccccagact 17186159  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  17186158 aggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 17186111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 212 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27337304 - 27336924
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  27337304 atttgttccaaatttatgcgttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 27337205  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  27337204 aaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 27337106  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  27337105 gtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 27337007  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27337006 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27336924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 50248909 - 50248554
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||    
T  50248909 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatata 50248810  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  50248809 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagac 50248710  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctg--ctctctcc 533  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||||    
T  50248709 tttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagatggttgttctctctcc 50248610  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  50248609 cctagactaggtcaatttggtccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 50248554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 6756477 - 6756825
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6756477 ctataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgaaatagaggggactgaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttt 6756576  T
Q  342 gtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||     
T  6756577 gtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgg 6756674  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct-cccccag 538  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||    
T  6756675 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctctctccccccag 6756774  T
Q  539 actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  6756775 actaggtcagtttggaccgaactggatcaacaaattcttttctgttctctc 6756825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 212 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27339496 - 27339115
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  27339496 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggcttaga 27339397  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27339396 aaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattga 27339297  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||    
T  27339296 gtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcat 27339198  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27339197 atagtggatcggagggctgatctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27339115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 257 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31425335 - 31424999
Alignment:
Q  257 ttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aaca 355  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31425335 ttgtatcaatgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaaca 31425236  T
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt---ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggc 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31425235 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggc 31425136  T
Q  453 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaattt 551  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  31425135 gggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctctct-ccccatactaggtcaattt 31425037  T
Q  552 ggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31425036 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31424999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 235 - 586
Target Start/End: Original strand, 20291400 - 20291750
Alignment:
Q  235 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg-agattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20291400 acttttactataaatatagaccttgtattagagcaaattttgagatagagggagat-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 20291498  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  20291499 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactagg 20291598  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | | |||||||||||||| | | ||||| || |||||||    
T  20291599 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgattctcatcatatagtggatcggagggttgttctctcc 20291697  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20291698 cccacactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttct 20291750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 159 - 490
Target Start/End: Original strand, 6823752 - 6824090
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||    
T  6823752 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactatttatatagacctt 6823850  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6823851 gtatcagagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa 6823950  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt-------ggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag 450  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||       |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6823951 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 6824050  T
Q  451 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6824051 gcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 6824090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 241 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 21948523 - 21948226
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21948523 actataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 21948424  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  21948423 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggact 21948325  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21948324 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 21948226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9459785 - 9459404
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  9459785 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 9459686  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9459685 gaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 9459586  T
Q  405 g-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||    
T  9459585 gaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 9459487  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9459486 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9459404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9463612 - 9463231
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  9463612 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 9463513  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9463512 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 9463413  T
Q  405 g-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||    
T  9463412 gaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcat 9463314  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9463313 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9463231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 46431990 - 46431693
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  46431990 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 46431891  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  46431890 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttt 46431792  T
Q  490 gaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct--cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46431791 gtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 46431693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 276 - 589
Target Start/End: Original strand, 25127856 - 25128170
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  25127856 gagatagaggggcctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 25127955  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  25127956 gattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattca 25128055  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  25128056 ttgatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctctctctcccatactaggtcaattaggaccgaactgggtcaacaaatt 25128155  T
Q  575 cttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||    
T  25128156 cttttgtgttctctc 25128170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 262 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 4131692 - 4131360
Alignment:
Q  262 tcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 359  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |  |||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131692 tcagagtaaaccttgagagatagagggggctgaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaaca 4131593  T
Q  360 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagac 459  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||| || ||    
T  4131592 ctagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaac 4131494  T
Q  460 ttattcttgtaacccattgata----tctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4131493 ttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 4131394  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4131393 ctgaactatgtcaacaaattcttttgtgttctct 4131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 212 - 512
Target Start/End: Original strand, 48665090 - 48665398
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggaga------ttgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |       ||||||||||||||||    
T  48665090 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggagggggttgaaacaagggttta 48665189  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48665190 gaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 48665289  T
Q  405 gagtctcttggtta-cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  48665290 gagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 48665389  T
Q  504 catatagtg 512  Q
    |||||||||    
T  48665390 catatagtg 48665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Original strand, 17318842 - 17319184
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  17318842 actataaatataggttttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtt 17318941  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  17318942 tgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgg 17319035  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||| |||    
T  17319036 gtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctct-ccctaga 17319134  T
Q  540 ctatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17319135 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17319184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 191 - 582
Target Start/End: Complemental strand, 31423256 - 31422851
Alignment:
Q  191 aaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagta-atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat 289  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||   | | ||||||| ||||||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||| |      
T  31423256 aaacatattttttgggt-cagatttgttccaattttatgggagatacttttactataaatataagcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggc 31423158  T
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac-aaacactagggtttgagggttgattcaccttgga 388  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||||||||     
T  31423157 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttggg 31423058  T
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31423057 aaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttt 31422958  T
Q  489 tgaaaagttactcatca-tata------------gtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    || || ||||||||||| ||||            |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  31422957 tgtaaggttactcatcattatagtgaaagagagggtgaaacagagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgagctgggtgaacaaattc 31422858  T
Q  576 ttttgtg 582  Q
    |||||||    
T  31422857 ttttgtg 31422851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 210 - 586
Target Start/End: Original strand, 47179627 - 47180006
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |  ||||||||||||||||    
T  47179627 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47179726  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt- 404  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  47179727 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 47179826  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||    
T  47179827 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 47179925  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  47179926 atatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47180006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 290 - 588
Target Start/End: Original strand, 40133942 - 40134241
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40133942 tgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 40134041  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40134042 aatactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctttt 40134141  T
Q  490 gaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40134142 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccggactaggtaaacaaattcttttgtgttctct 40134241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 17324016 - 17324359
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |  | ||||||||||| |||||| | | |||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17324016 tataaatatagactttgtattagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttg 17324113  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||    
T  17324114 tctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggt 17324213  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||    
T  17324214 aaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaacggaaggctggtctctccccatgact 17324313  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  17324314 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 17324359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 210 - 586
Target Start/End: Original strand, 47177276 - 47177655
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    |||||| |  ||||||||||||||||    
T  47177276 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 47177375  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat-t 404  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  47177376 aaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgg 47177475  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||    
T  47177476 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 47177574  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||  ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  47177575 atatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcagattggatcgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 47177655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 210 - 574
Target Start/End: Original strand, 42922151 - 42922514
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaa 308  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||||     
T  42922151 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 42922249  T
Q  309 gacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 408  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  42922250 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 42922346  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-ta 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  42922347 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 42922446  T
Q  508 tagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  42922447 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 42922514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14183923 - 14183574
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||| |   || ||||| ||||||||||||||    
T  14183923 cttttactataaatatagaccatgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaatgc--aacacaaa-ctagggtttgtata 14183827  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  14183826 gaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaat 14183730  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  14183729 tttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctccc 14183630  T
Q  535 ccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  14183629 ccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatttttttgtggtctctc 14183574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 8347652 - 8347298
Alignment:
Q  191 aaacgtattttt-tgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggag 287  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8347652 aaacgtatttttatgggt-cagatttgttccaattttatgaggggtacttttactataaa-atagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggg 8347555  T
Q  288 attgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 387  Q
     ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | ||||  |||||||||||||||| |    
T  8347554 gttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttag 8347459  T
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8347458 gaaacactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 8347359  T
Q  488 ttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  8347358 ttgtaaagttactcattattatagtggaacggagggatgctctttcccctagactaggtca 8347298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 291 - 589
Target Start/End: Original strand, 16432404 - 16432693
Alignment:
Q  291 gaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16432404 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 16432492  T
Q  391 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432493 acattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttg 16432592  T
Q  491 aaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccc-agactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
     || ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16432593 taatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctctctcccccaagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 16432692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 359 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248540
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctccctcccctagactaggtcaatttggaccg 25248567  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248566 aactgggtcaacaaattcttttgtgtt 25248540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 377 - 589
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429255
Alignment:
Q  377 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 476  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  477 tgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattc 16429241  T
Q  576 ttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||    
T  16429242 ttttgtgttctctc 16429255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 233 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 49495539 - 49495206
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||          |||||||||||||     
T  49495539 atacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaatc--------aaactagggtttgc 49495448  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  49495447 atatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattgg 49495352  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  49495351 ggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggcttatctct 49495252  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||    
T  49495251 ccccaagactatgtcaatttagaccgaactaggtaaagaaattctt 49495206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 316 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669376
Alignment:
Q  316 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 415  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  416 ttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaa 514  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| ||||||| |    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || || ||||||||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||  || |||||||| | ||||||||||||    
T  15669451 acggatggctgctctctccccgagactaggtcagttttagactgaactgtgtaaacaaattttgttgtgttctctc 15669376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18800909 - 18800603
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |  |||||||| ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  18800909 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatacaaggggctgaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgt 18800811  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  18800810 atagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttg 18800714  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
     |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||    
T  18800713 aactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaagcggagaactgctctct 18800614  T
Q  532 cccccagacta 542  Q
    |||||| ||||    
T  18800613 cccccaaacta 18800603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 372 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115086
Alignment:
Q  372 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaaca 570  Q
    || |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaaca 6115105  T
Q  571 aattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  6115104 aattattttgtgttctctc 6115086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 39451443 - 39451590
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39451443 gattggattcctcaaactggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 39451542  T
Q  108 tatttatataaacgtgttttctgtccacacctagagcattttcgtgta 155  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  39451543 tatttatataaacgtgttttctcttcacacctagagcatttttgtgta 39451590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 39460830 - 39460977
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39460830 gattggattcctcaaactggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 39460929  T
Q  108 tatttatataaacgtgttttctgtccacacctagagcattttcgtgta 155  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  39460930 tatttatataaacgtgttttctcttcacacctagagcatttttgtgta 39460977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 8349379 - 8349035
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||| | ||| || |||| || ||||||||||||||||    
T  8349379 tataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagttt 8349281  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    | ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||  |    
T  8349280 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttagg 8349184  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||| || ||||||||| ||||    
T  8349183 tagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattatagtggaatagagggttgttctctccccaagac 8349084  T
Q  541 tatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  8349083 tatgtcagttttagaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 8349035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 359 - 586
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231856
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccg 16231828  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  16231829 aac-tggtcaacaaatatctttgtgttct 16231856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 574
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786121
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 23786034  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 23786121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 384 - 586
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757824
Alignment:
Q  384 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatc 483  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  484 tcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 583  Q
    || |||| || | |||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgt 51757821  T
Q  584 tct 586  Q
    |||    
T  51757822 tct 51757824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 159 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30790807 - 30790468
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  30790807 tggcacgatggtgcgctggaggggaaaaacataaacgtatttttcag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacatt 30790709  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagagg-agattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||| |||||||||  |||| |  ||||||||||||   ||||| || |||||  |    | |    
T  30790708 gtatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaaacaagagtttagaaa--caaacaataaactagggttt---tagagatt-tctctaagagggaga 30790615  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcg-gga 456  Q
    ||||||||||    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   |||    
T  30790614 cactagggttgt--ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttgga 30790518  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30790517 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 30790468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 433 - 589
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816183
Alignment:
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| || | | ||||| |||||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctctctc 23816126  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23816127 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 23816183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 13125792 - 13125494
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg-tata 335  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| | ||| |  ||||||||||||| |||| | ||| ||  ||||||||||||| ||||    
T  13125792 tttctctataaatagaaaccttgtatcagagtaaaacttgagagaaagggggctgaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtata 13125694  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||| ||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  13125693 gagtttg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gagg-ttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggac 13125597  T
Q  436 tttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  13125596 tttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctctcccc 13125497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 210 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 30738989 - 30738625
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaa 308  Q
    |||||| |||||| |||| ||  || |||| |||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  30738989 agatttattccaatttttgaggcattcttttactataaacatagtccttgtatcagatgaaaccttgagatacaggtgactgaaaacaagggtttagaaa 30738890  T
Q  309 gacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 408  Q
     | ||||||||| |||||||||  | |||| || |||||  |    | ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30738889 caaaaaaacaaa-ctagggttt--agagagatt-tctctaagcgggagacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 30738796  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-- 505  Q
    |||||||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  30738795 ctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcata 30738696  T
Q  506 -tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| |||| | ||||||  |||||||| ||||||||    
T  30738695 ttatagtgaaacggagggatgctctctcacccatactaggtcagtattggaccaaacttggtaaacaaatt 30738625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 39472309 - 39472430
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39472309 gattggattcctcaaactggtgttccatactctagtagattgatatagtcaaattcaaacacctagagtaagaatttgttgaattttatatattttcttc 39472408  T
Q  108 tatttatataaacgtgttttct 129  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  39472409 tttttatataaacgtgttttct 39472430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 216 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 26520475 - 26520205
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggaga--ttgaaacaagggtttagaaagaca 312  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   |  |||||| ||||||||| | ||    
T  26520475 gttccaaatttataagttata-tttctctataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggggctgaaaacaacggtttagaa-gtca 26520378  T
Q  313 aaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 412  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26520377 acaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gagg-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctct 26520281  T
Q  413 tg------gttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgata 481  Q
    ||      || |||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26520280 tggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 210 - 547
Target Start/End: Original strand, 27916415 - 27916752
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagag-gagattgaaa-caagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||| |||  ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| | || |||   |||| ||||||||||||    
T  27916415 agatttgttccaattttggagggatacttttactataaatatagacattgtatcaaatgtaaactgtgagaaacagagagccagaaaacaagggtttaga 27916514  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    | | ||  || ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27916515 a-gccagcaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattga 27916608  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--cattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||| ||  |||||||||| ||||||| || ||||||||   | ||||| |||||| |||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27916609 gtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctc-tttgtaaagttactcat 27916707  T
Q  504 c-atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27916708 cgttatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 27916752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613223
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaaca 570  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | || ||| ||||| ||| ||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagattaggtcagtatttgaccgaactgggtaaaca 26613241  T
Q  571 aattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| || |||||||||||    
T  26613240 aatt-ttgtgtgttctctc 26613223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 371 - 547
Target Start/End: Original strand, 16561545 - 16561723
Alignment:
Q  371 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgt 469  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||| ||||||| |||||| ||||   | ||||||||||||||    
T  16561545 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgt 16561644  T
Q  470 aacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||  |||||| ||||    
T  16561645 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacaaagggttgctctctcccatagactaggtca 16561723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 374 - 535
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155950
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||   | ||| | |||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaac 155887  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |  ||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  155888 cttttgttatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccc 155950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 315 - 506
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279480
Alignment:
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctctt 413  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  414 ggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcat 28279480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 208 - 332
Target Start/End: Original strand, 16231517 - 16231641
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  16231517 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtctagaa 16231616  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    |  ||| || |||||||||||||||    
T  16231617 aagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 497 - 586
Target Start/End: Original strand, 13358778 - 13358867
Alignment:
Q  497 tactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13358778 tactcttcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13358867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Original strand, 49687408 - 49687496
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaa 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  49687408 tggcacgatggtgcgctgacagcgaataacataaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaa 49687496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 464 - 574
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916674
Alignment:
Q  464 tcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaa-tttggactgaact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttggaccgaact 15916661  T
Q  562 tggtcaacaaatt 574  Q
     ||| ||||||||    
T  15916662 gggtaaacaaatt 15916674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 24060684 - 24060620
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacaccta 72  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24060684 gattggattcctcaaactggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacaccta 24060620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25248841 - 25248756
Alignment:
Q  246 aaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25248841 aaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 530
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104400
Alignment:
Q  378 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccca 475  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||| ||||  |||||| |||||||||||   | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctctc 43104400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 26332890 - 26332719
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |   ||||||||||||||||   | || |||||| |||||||||||      
T  26332890 tttctctataaatacagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagaggataa--aaacaagggtttagaag--ccaacacaaaaatagggtttgta-- 26332797  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  26332796 gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggt 26332719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353220
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||   || || |||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaa 14353145  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||| |||| |  ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||  || ||  |||||||||||| | |||||||    
T  14353146 ccctttgaaa--tcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacgaagagccactctctcccccaaagtatgtca 14353220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353342
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaac--actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 21353447  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaa 568  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||| ||    
T  21353446 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcatctttagaccgaactgggtaaa 21353351  T
Q  569 caaattctt 577  Q
    |||||||||    
T  21353350 caaattctt 21353342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta 449  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144804
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 13127964 - 13127790
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||| |||||    
T  13127964 tttctctataaatataaaccttgtatcggagtaaacctttagagagagg-ggttgaaacaagggtttag-aagccaacaagaaaagtagggtttatatag 13127867  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    |||||  || || | ||||||||||||||||   || | |||||||||||| ||||| | || | ||| |||||||||||    
T  13127866 agttt-ccttttggcaacaaacactagggtt--gggatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggt 13127790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 46432090 - 46432017
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  46432090 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagag 46432017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232658
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401246
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 2401322  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2401321 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagcttctctctcccccagactaggtca 2401246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 451
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997101
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526527
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 484
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| | |||||||  || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  472 cccattgatatct 484  Q
    ||| |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 272
Target Start/End: Original strand, 43104100 - 43104139
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104100 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 43104139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 545 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13447301 - 13447260
Alignment:
Q  545 tcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13447301 tcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 13447260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 549
Target Start/End: Original strand, 46783126 - 46783305
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga-ctttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgt 469  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||  |||||||||  || ||||| |||||||||||   || |||| ||||||||    
T  46783126 ttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 46783225  T
Q  470 aacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat 549  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  46783226 aaccctttgatatct-ttttgtaaagaaactcatcattatagtggaacagagagctgttatctcctccagagtaagtcaat 46783305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521776
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 479 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 13127782 - 13127718
Alignment:
Q  479 atatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  13127782 atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcctccagacta 13127718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393404
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag 450  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 398 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 3091279 - 3091229
Alignment:
Q  398 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  3091279 taggattgagtctcttggtaacaggaagagattgagac-ttgagtagaatta 3091229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 235 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13449886 - 13449856
Alignment:
Q  235 actttcactataaatatagaccttgtatcag 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13449886 actttcactataaatatagaccttgtatcag 13449856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 274
Target Start/End: Original strand, 23783467 - 23783533
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 274  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23783467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactt 23783533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2401549 - 2401492
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttc-actataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  2401549 agatttgttccatattttaagggatactttccactataaatataagccttgtatcaga 2401492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Original strand, 16431017 - 16431094
Alignment:
Q  209 cagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg 285  Q
    |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16431017 cagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataggttttgtatcagagcaaaccttgagatagagg 16431094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 26613603 - 26613503
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt--gagatagaggagattg-aaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  26613603 agatttgttccaatttttgagggattcttttgctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagatagagggggctgaaaacaagggtttaga 26613504  T
Q  307 a 307  Q
    |    
T  26613503 a 26613503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 13598454 - 13598402
Alignment:
Q  519 agggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  13598454 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 13598402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 331; Significance: 0; HSPs: 147)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 48486241 - 48486670
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486241 tggcacaatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 48486339  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48486340 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaac 48486439  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48486440 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 48486539  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48486540 cttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactga 48486639  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  48486640 actgggtcaacaaattattttgtgttttctc 48486670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22801272 - 22800844
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22801272 tggcacgatggtgcgccggcagcaaataacagaaacgtatttt--gagtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 22801175  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22801174 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 22801075  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22801074 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 22800975  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  22800974 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 22800875  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22800874 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22800844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 24878911 - 24879341
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24878911 tggcacgatggtacgctggcatcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 24879009  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879010 gtatccgagtaaacttggagatagagggggctgaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 24879109  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24879110 accagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 24879209  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24879210 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 24879309  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24879310 aactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 24879341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 24880373 - 24880803
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24880373 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttt-ggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 24880471  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| |    |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880472 gtatcggagtaaacttggagatagagggggcgtaaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 24880571  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24880572 actagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 24880671  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24880672 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 24880771  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24880772 aactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 24880803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22803144 - 22802719
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22803144 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttt--gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 22803047  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22803046 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 22802947  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22802946 attagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 22802847  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| || ||    
T  22802846 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtggaacggagggtttctctctcccccagactaggtcaatttgaaccga 22802747  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22802746 actaggtcaacaaattcttttgtgttct 22802719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 47274649 - 47275073
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47274649 tggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 47274747  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47274748 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaac 47274846  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47274847 actagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggaga 47274946  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  47274947 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 47275045  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  47275046 accgggtcaacaaattcttttgtgttct 47275073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 24888718 - 24889147
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24888718 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 24888816  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888817 gtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaac 24888916  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24888917 actaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggaga 24889016  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24889017 cttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 24889116  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24889117 actgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 24889147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 162 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40091823 - 40091397
Alignment:
Q  162 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgta 261  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40091823 cacgatggtgcactgacagcgaataacgtaaacgtatttttcag-tgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 40091725  T
Q  262 tcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40091724 tcaaagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacact 40091625  T
Q  362 agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactt 461  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40091624 atggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 40091525  T
Q  462 attcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  40091524 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaact 40091425  T
Q  562 tggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  40091424 gggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40091397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 5198342 - 5198768
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5198342 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 5198440  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198441 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 5198540  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5198541 actaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggaga 5198640  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5198641 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 5198740  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5198741 actgtgtcaacaaattcttttgtgttct 5198768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 36919998 - 36919566
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36919998 tggcacgatggtgcgctggcagcgaatagtagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 36919900  T
Q  259 gtatcagagtaaactttga--gatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aaca 355  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  36919899 gtatcagagtaaactttgatagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaaca 36919800  T
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||    
T  36919799 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcggg 36919700  T
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggac 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  36919699 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctctctcccctagactaggtcaatttggac 36919600  T
Q  556 tgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36919599 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36919566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37089785 - 37089357
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  37089785 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagacctt 37089687  T
Q  259 gtatcagagtaaacttt---gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 355  Q
    |||||||  |||||||    |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37089686 gtatcaggctaaacttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaaca 37089587  T
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  37089586 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 37089487  T
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggac 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37089486 agacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac 37089388  T
Q  556 tgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37089387 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 37089357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 36921906 - 36921475
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||    
T  36921906 tggcacgatggtgcattggcagcgaataacagaaacgtattttt-ggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagacctt 36921808  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aaca 355  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| | | |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  36921807 gtatcagagtaaactttgagagatagagggggt-gaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaaca 36921709  T
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 455  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  36921708 aacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggg 36921609  T
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggac 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  36921608 agacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcccccagactagttaaatttggac 36921509  T
Q  556 tgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36921508 cgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36921475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 11434877 - 11435302
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  11434877 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 11434975  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11434976 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 11435075  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11435076 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggaga 11435175  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  11435176 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 11435274  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11435275 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 11435302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 40637070 - 40637425
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40637070 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 40637169  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40637170 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgag 40637269  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  40637270 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 40637369  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40637370 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 40637425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 51015168 - 51015593
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  51015168 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttttcag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacttt 51015266  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51015267 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaac 51015366  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51015367 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 51015466  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  51015467 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 51015565  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51015566 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 51015593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22044800 - 22044376
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22044800 tggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag--tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggcctt 22044703  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22044702 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 22044603  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22044602 actagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 22044503  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  22044502 cttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 22044404  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22044403 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 22044376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22047095 - 22046671
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22047095 tggcacgatggtgtgctggcagggaaaaacagaaacatatttttag--tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggcctt 22046998  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22046997 gtatcggagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaac 22046898  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22046897 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 22046798  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  22046797 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccga 22046699  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22046698 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 22046671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 175 - 586
Target Start/End: Original strand, 9148190 - 9148600
Alignment:
Q  175 tggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9148190 tggcagcaaataacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggccttgtatcagagcaaactt 9148287  T
Q  275 tgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 372  Q
    |||||  |||||| |  |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148288 tgagagatagagggggctgaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagg 9148387  T
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 472  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148388 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 9148487  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaa 572  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  9148488 ccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaa 9148586  T
Q  573 ttcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||    
T  9148587 ttcttttgtgttct 9148600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 14633316 - 14633666
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  14633316 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaagggct-gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 14633414  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14633415 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 14633513  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633514 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 14633613  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14633614 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14633666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 619858 - 619430
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  619858 tggcacaatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttt-gggtagagattttttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagacctt 619760  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  619759 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaac 619660  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |    
T  619659 actagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaa 619560  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||    
T  619559 attattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccccta-actaggtcaatttggaccga 619461  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  619460 actgggtcaacaaattattttgtgttctctc 619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 38409121 - 38409552
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38409121 tggcacgatggtgcgttggcggcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 38409219  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgga 352  Q
    ||||||||| |||||||||||      |||||| |  |||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38409220 gtatcagagcaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgga 38409319  T
Q  353 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggc 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  38409320 acaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 38409419  T
Q  453 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttg 552  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  38409420 tggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttg 38409518  T
Q  553 gactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38409519 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgagttct 38409552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 7941241 - 7941671
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||    
T  7941241 tggcacgatggtgcgctggtgacgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacgtt 7941339  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||||| ||||   ||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  7941340 gtatcagagcaaaccgggagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaa 7941439  T
Q  357 a--cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    |  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  7941440 atgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg 7941539  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7941540 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 7941639  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7941640 ccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7941671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31850010 - 31849584
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||  |||    
T  31850010 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactagaaatataggtctt 31849912  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31849911 gtatcagagcaaactaggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 31849812  T
Q  359 act-agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  31849811 actaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggag 31849712  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |    
T  31849711 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgaaccg 31849613  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31849612 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 31849584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 38928513 - 38928159
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38928513 cttttactataaatataggctttgtattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 38928414  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38928413 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattgggg 38928314  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38928313 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctctctccc 38928214  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38928213 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 38928159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11006652 - 11006222
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11006652 tggcacgatggtgcgctggcagcaaaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacctt 11006554  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgga 352  Q
    |||||||| ||   |||||||      |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11006553 gtatcagactat--tttgagagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgga 11006456  T
Q  353 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  11006455 acaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 11006356  T
Q  452 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaattt 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11006355 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 11006257  T
Q  552 ggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11006256 ggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttct 11006222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 8631760 - 8631404
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8631760 tactttcactataaatatagactttgtatcaaagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 8631661  T
Q  330 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8631660 tgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 8631561  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  8631560 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8631460 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 8631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 19095880 - 19096234
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19095880 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtata 19095979  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  19095980 gagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagag 19096079  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19096080 ctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctctctccc 19096179  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19096180 ccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 19096234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 234 - 584
Target Start/End: Original strand, 47868397 - 47868747
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47868397 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 47868496  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |    
T  47868497 tagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgag 47868596  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  47868597 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 47868696  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47868697 cccatactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgtt 47868747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 33415817 - 33415470
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33415817 actacaaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 33415718  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  33415717 tgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgg 33415619  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  33415618 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccctcaggc 33415519  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33415518 taggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 33415470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 18847123 - 18847500
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  18847123 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaaacaaactttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaa 18847222  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  18847223 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattgga 18847322  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||    
T  18847323 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 18847421  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18847422 atagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18847500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 24348187 - 24348566
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  24348187 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 24348286  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24348287 aaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 24348386  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  24348387 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 24348486  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24348487 atagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 24348566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 159 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 5637879 - 5637524
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5637879 tggcatgatggtgagctggcagcgaaaaacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 5637782  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    |||| |||| |||||||||||    |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637781 gtataagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 5637682  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |    
T  5637681 aaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcag 5637582  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5637581 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 6764835 - 6765192
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6764835 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 6764934  T
Q  334 tagagtttgtctcttt-----ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 428  Q
    ||||||||||||||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6764935 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagagg 6765034  T
Q  429 ttgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  6765035 ctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctc 6765134  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6765135 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 6765192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 36378288 - 36378644
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36378288 tacttttactataaatatagactttgtatcagaataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 36378387  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36378388 tagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattggg 36378487  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36378488 actttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctc 36378587  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36378588 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattattttgtgttctctc 36378644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12396180 - 12395827
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12396180 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12396081  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12396080 gagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12395981  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12395980 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12395881  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12395880 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12395827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9174557 - 9174131
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  9174557 tggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttacagtttttaagcaagacttttactataaatatagacctt 9174459  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  9174458 gtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaac 9174359  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  9174358 actagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggag 9174259  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  9174258 acttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgttctctgccccagactaggtcaatttggaccg 9174160  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  9174159 aactgggtcaacaaatttctttgtgttct 9174131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12401142 - 12400789
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12401142 cttttactataaatatagacattgtataaatgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 12401043  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12401042 gagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 12400943  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12400942 tttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccc 12400843  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12400842 cagactaggtcaatttggaccgaacagggtcaacaaactcttttgtgttctctc 12400789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 159 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 3824984 - 3824629
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3824984 tggcacgatggtgcgttggcgacgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 3824886  T
Q  259 gtatcagagtaaa-ctttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaa 353  Q
    |||||||||||   ||||||||    |||||| |  |||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824885 gtatcagagtatttctttgagagagatagagggggctgaaaca--ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaa 3824788  T
Q  354 caaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcg 453  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  3824787 ctaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcg 3824688  T
Q  454 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3824687 ggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 3824629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2485210 - 2484858
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga-ggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2485210 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagctagaagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 2485111  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2485110 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 2485011  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  2485010 gactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 2484912  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  2484911 ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgttct 2484858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 216 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14787789 - 14787423
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagaca 312  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  14787789 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggca 14787690  T
Q  313 aaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787689 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 14787590  T
Q  413 tggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14787589 tggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 14787490  T
Q  513 aaacagagggctgctc--tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  14787489 aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 14787423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 16453313 - 16453661
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||| | |||||    
T  16453313 ctataaatataggctttgtatcagagcaaaccgagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagttt 16453412  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  16453413 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttggg 16453512  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16453513 tagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggttgctctctcccccagac 16453612  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16453613 taggtcaatttggaccgaactgcgccaaaaaattcttttgtgttctctc 16453661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 212 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17662598 - 17662227
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  17662598 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 17662499  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||           ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17662498 aaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 17662410  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  17662409 gtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 17662310  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17662309 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17662227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 37313396 - 37313047
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    |||||||||||||   |||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  37313396 actataaatataggttttgtatcaaagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtt 37313297  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||     
T  37313296 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgg 37313197  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  37313196 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctttcccccaga 37313097  T
Q  540 ctatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||| |||||||    
T  37313096 ctatgtcaatttggaccaaattggatcaacaaattcttttgttttctctc 37313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 159 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 52942858 - 52942540
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942858 tggcacgatgatgcgctggcagcgaataacataaacatattttttgg-tgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 52942760  T
Q  259 gtat--cagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52942759 gtatatcagactaaactttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaa 52942661  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||| ||||||||||||||||    
T  52942660 acactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcggga 52942574  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942573 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 52942540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 44600198 - 44599823
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaaga 310  Q
    ||||||| ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||      
T  44600198 atttgtttcaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaag 44600099  T
Q  311 caaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44600098 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 44599999  T
Q  410 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatata 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |  ||||||||||||    
T  44599998 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatata 44599900  T
Q  510 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  44599899 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 44599823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16934506 - 16934128
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  16934506 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16934407  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  16934406 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16934307  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||    
T  16934306 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 16934208  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16934207 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16934128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11008933 - 11008553
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggt 301  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||   |||||||      |||||| |  ||||||||||||    
T  11008933 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctat--tttgagagagagatagagggggctgaaacaagggt 11008836  T
Q  302 ttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 401  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11008835 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 11008736  T
Q  402 att-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| || | ||||    
T  11008735 attggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttgtaatggtact 11008639  T
Q  501 catcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11008638 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 11008553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 208 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 9176837 - 9176461
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  9176837 gcagatttgttacagtttttaagcaagacatttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 9176738  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  9176737 aagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 9176638  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||    
T  9176637 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 9176539  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||  ||||||||    
T  9176538 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacagagtcaacaaatttctttgtgtt 9176461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16932152 - 16931774
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  16932152 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgatacaagggtttagaa 16932053  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  16932052 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgga 16931953  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||    
T  16931952 gtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 16931854  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  16931853 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 16931774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 19322701 - 19323046
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  19322701 ctataaatatagatcttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt 19322799  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19322800 g-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 19322896  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19322897 tagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctctctcccccagac 19322996  T
Q  541 tatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||  ||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  19322997 taggtcagttttggaccgaactggataaacaaattctttagtgttctctc 19323046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 217 - 567
Target Start/End: Original strand, 56030422 - 56030770
Alignment:
Q  217 ttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaa 315  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||| |    
T  56030422 ttccaaatttatgagttatatttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaatgacaaca 56030521  T
Q  316 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 415  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  56030522 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttgg 56030621  T
Q  416 ttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaa 515  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||| || |||| ||||||||   |||||    
T  56030622 ttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgttattcatcata---tgaaa 56030718  T
Q  516 cagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtca 567  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  56030719 cggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtca 56030770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 241 - 551
Target Start/End: Original strand, 13543957 - 13544272
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||| |  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13543957 actataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 13544056  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13544057 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattggga 13544155  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |    
T  13544156 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttc 13544255  T
Q  535 ccagactatgtcaattt 551  Q
    |||||||| ||||||||    
T  13544256 ccagactaggtcaattt 13544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 212 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 22132759 - 22132389
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-gagat--------tgaaacaagggt 301  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||        ||||||||||||    
T  22132759 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggctgaaacaagggt 22132660  T
Q  302 ttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 401  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22132659 ttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 22132561  T
Q  402 attgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactc 501  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||    
T  22132560 attgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactc 22132462  T
Q  502 atcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22132461 atcatatagtggattggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22132389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 304 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26085962
Alignment:
Q  304 agaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 403  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  404 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |||||||    
T  26086143 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcat 26086045  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| | | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26086044 catatagtggatcggaaggctgctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaattcttttgtgttct 26085962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 18709531 - 18709149
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--------tagaggagattgaaacaagggtt 302  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||        |||||| |  |||||||||||||    
T  18709531 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtattaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 18709432  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18709431 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggg 18709332  T
Q  403 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||    
T  18709331 ttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactca 18709233  T
Q  503 tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| |   |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  18709232 tcatatagtggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 18709149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 241 - 574
Target Start/End: Original strand, 41997495 - 41997828
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||| ||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41997495 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 41997594  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||     
T  41997595 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgg 41997694  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  41997695 gtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctctct-ccccaga 41997793  T
Q  540 ctatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| || ||||||||| ||||| | | ||||||||    
T  41997794 ctaggttaatttggaccgaactggataaacaaatt 41997828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 53405100 - 53405481
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| | | ||||||||||||||||    
T  53405100 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggct-gaaacaagggtttaga 53405198  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  53405199 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattga 53405297  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    ||||||||||||||| |||||  || ||||||  ||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  53405298 gtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaaacgatact 53405397  T
Q  501 catcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  53405398 catcatatagtggaacagagagctg--ctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttttgttct 53405481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 236 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 18409681 - 18409344
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||  |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18409681 cttttactataaatatagaatttgtatcagtgtaaacaatgagatagag-aggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 18409583  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  18409582 gagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagac 18409483  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18409482 ttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg-taagttacccatcattatagtgaaacagagagttgctctctccc 18409384  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  18409383 tcagactaggtcaatttggattgaactgggtaaacaaatt 18409344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 315 - 589
Target Start/End: Original strand, 36380426 - 36380701
Alignment:
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36380426 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttg 36380525  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtga 513  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  36380526 gttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 36380625  T
Q  514 aacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  36380626 aactgagtgctgctctctcccccagactaggtcaatttggagcgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 36380701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 167 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 8756653 - 8756280
Alignment:
Q  167 tggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8756653 tggtgcgctggaggcgaataacagaaacatatttctcgg-tgcagatttgttccaaattataaacgatacttttactataaatatagaccttgtatcaga 8756555  T
Q  267 gtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 365  Q
    |||||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| | ||| || |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  8756554 gtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg 8756457  T
Q  366 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt-ggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatt 464  Q
    || |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8756456 ttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttatt 8756359  T
Q  465 cttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||| || || |||||||||| ||||||||    
T  8756358 cttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctctctcctccagacta 8756280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22780668 - 22780358
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22780668 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22780569  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 474  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780568 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22780469  T
Q  475 attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||     
T  22780468 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 22780370  T
Q  575 cttttgtgttct 586  Q
      ||||||||||    
T  22780369 tctttgtgttct 22780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22783033 - 22782723
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  22783033 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 22782934  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 474  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782933 gattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 22782834  T
Q  475 attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||     
T  22782833 attgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaaata 22782735  T
Q  575 cttttgtgttct 586  Q
      ||||||||||    
T  22782734 tctttgtgttct 22782723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 213 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 18537829 - 18537508
Alignment:
Q  213 tttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagac 311  Q
    |||||||||| || | ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  |    
T  18537829 tttgttccaatttatgagtgatgcttttactataaatatagatcttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa--c 18537732  T
Q  312 aaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 411  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18537731 aaacaacaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctc 18537635  T
Q  412 ttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatag 510  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  18537634 ttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatag 18537535  T
Q  511 tgaaacagagggctgctctctccccca 537  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||    
T  18537534 tggaacggagggctgctctctccccca 18537508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 212 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 47211106 - 47210762
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  47211106 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagggagatagagggggctgaaacaagggttta 47211007  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |            |||| ||||||||||||||||    
T  47211006 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactattaggatt 47210919  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  47210918 gagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatc 47210819  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  47210818 atatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaact 47210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 212 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 22134990 - 22134615
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-------gagat--------tgaaac 295  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||       |||||        ||||||    
T  22134990 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaagctaaactttgagagagagagagagagagatagaggggctgaaac 22134891  T
Q  296 aagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 395  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22134890 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 22134792  T
Q  396 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaag 495  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  22134791 attaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacg 22134693  T
Q  496 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22134692 gtactcatcatatagtggattggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatt 22134615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 351 - 589
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455591
Alignment:
Q  351 gaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag 450  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  451 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat 549  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctctctcccccagactaggtcaat 16455553  T
Q  550 ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16455554 ttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 16455591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 389 - 589
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547505
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  489 tgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctct 13547504  T
Q  589 c 589  Q
    |    
T  13547505 c 13547505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 380 - 589
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891643
Alignment:
Q  380 caccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 479  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  480 tatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttt 578  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatgactgctctctcccccagactagtacaacttggaccgaactgggtcaacaaattcttt 2891632  T
Q  579 tgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||    
T  2891633 tgtgttctctc 2891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 321 - 589
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499393
Alignment:
Q  321 actagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacg 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  421 ggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacaga 519  Q
      ||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  |    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaa 27499324  T
Q  520 gggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27499325 gggctgctct-ttccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27499393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 236 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 3937543 - 3937314
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||    
T  3937543 cttttactataaatatagacttt-tatcagagtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtata 3937445  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  3937444 gagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggc 3937345  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattct 466  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937344 tttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 244 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 18535156 - 18534861
Alignment:
Q  244 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||| |  || ||||||| ||||  ||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18535156 ataaatatagacctcgattcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagtgttt--aaaaacaaacaacaaactagggtttgtatagagtttg 18535059  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
     ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||    
T  18535058 -ctcttggcaacaaacactagggtt--ggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgggt 18534962  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18534961 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggtgctctcccccccagact 18534862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 236 - 456
Target Start/End: Original strand, 6132871 - 6133090
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  6132871 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaacattgagatagaggaggctgaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtata 6132969  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6132970 gagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 6133069  T
Q  436 tttgagtagaattaggcggga 456  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  6133070 tttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 318 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890221
Alignment:
Q  318 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaac 516  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 38890280  T
Q  517 agagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  38890279 agagggctgctctctccccaagattaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 38890221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 415 - 588
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215656
Alignment:
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4215583 acggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 4215656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 326 - 589
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136901
Alignment:
Q  326 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  426 agattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggct 524  Q
    | |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  525 gctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||    
T  30136837 gctctctcctcaatactaggtcaatttggaccgaattggataaacaaattcttttgtgttctctc 30136901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 184 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 15032923 - 15032572
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatag 282  Q
    ||||||||| || |||||| || || ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||     
T  15032923 ataacagaatcgaatttttgggctg-agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagacttggtaccagagtaaaccttgagataa 15032825  T
Q  283 aggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 382  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||          ||||| ||||||||     
T  15032824 agggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgagg-ttgattcat 15032738  T
Q  383 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 482  Q
     || | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15032737 atttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatat 15032638  T
Q  483 ctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||| |||  || |||||||||||||||| |||| ||||    
T  15032637 ctcttttgtaaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctctctcccccaaactaggtca 15032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 433 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635461
Alignment:
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 5635515  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5635514 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 5635461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 38270321 - 38270158
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  38270321 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaagaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgta 38270222  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 399  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270221 gagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 210 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 40999308 - 40998990
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaa 308  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||      
T  40999308 agatttgttccaaattttaagggttatttttactataaatataaaccttatatcagagtaaaccttgaggtagag-agtctgaaaacaagggtttagac- 40999211  T
Q  309 gacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 408  Q
    | ||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40999210 gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcacctaggaaaacattattaggattgagt 40999114  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc-at 506  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  40999113 ctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgtt 40999014  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  40999013 atagtggaacagagggatgctctc 40998990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 373 - 574
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102425
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaac 569  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| ||||| ||| |||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtcagttttggaccgaactaggtaaac 12102420  T
Q  570 aaatt 574  Q
    |||||    
T  12102421 aaatt 12102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 216 - 374
Target Start/End: Original strand, 5100974 - 5101133
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||     
T  5100974 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagggtaaaccttgagatagaggggactgaaacaaaggtttagaatgacaac 5101073  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5101074 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 241 - 574
Target Start/End: Original strand, 28453690 - 28454020
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||| |||  || |||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||   ||||    
T  28453690 actataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtaga-gagtctgaaaacaagggtttag-aagccaacactaaaactagggtttg--cagag 28453785  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    |||| ||||| | || |||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  28453786 tttg-ctcttggcaagaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggacctt 28453882  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccca 537  Q
    | |||||||||||  | ||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||  || ||||||||||||    
T  28453883 gggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactactctctccccca 28453982  T
Q  538 gactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||| || | | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  28453983 gactaggttagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 28454020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 432 - 586
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437710
Alignment:
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt-gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctct 11437655  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11437656 cccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11437710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 441 - 589
Target Start/End: Original strand, 5101132 - 5101279
Alignment:
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  5101132 gtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgctatct-ccccagac 5101230  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5101231 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 5101279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 237 - 574
Target Start/End: Original strand, 9863707 - 9864049
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaa--caagggtttagaaagacaaaaacaaaa-ctagggtttgt 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  9863707 tttctctataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagatagtagagagctgaaaaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtttgt 9863805  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |  |||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  9863806 a--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattga 9863900  T
Q  433 gactttgagtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca----tatagtgaaacagagggctgct 527  Q
    ||||||| |||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    ||||||| ||| ||| ||||||    
T  9863901 gactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgct 9863999  T
Q  528 ctct--cccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||  ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  9864000 ctctcccccccagactaagtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 9864049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24446914 - 24446756
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  24446914 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca-----acaactagggtttgtata 24446820  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 399  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24446819 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 374 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185831
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||   | ||||||||||||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaa 568  Q
    |||| ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  16185935 accctttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctctctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaa 16185837  T
Q  569 caaatt 574  Q
    ||||||    
T  16185836 caaatt 16185831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 373 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983564
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 31983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 377 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982200
Alignment:
Q  377 attcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacc 473  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   || |||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctcatactaggtca 3982200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357994
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagta----gaattaggcggga-gacttattcttg 468  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||    |||||| |   || ||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  469 taacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtc 566  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||  |||||||||||||| |||||| |||| | ||||||  |||| |||     
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctctctcccctagactaggtcagtattggacctaactgggta 25357971  T
Q  567 aacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| || |||||||||||    
T  25357972 aacaaatttttgtgtgttctctc 25357994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 236 - 355
Target Start/End: Original strand, 2891314 - 2891434
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgta-tcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2891314 cttttactataaatatagacattgtaatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat 2891413  T
Q  335 agagtttgtctctttggaaca 355  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2891414 agagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 47151167 - 47150875
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 391  Q
    ||||||||||||||||   | || ||||||||| |||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||  |   |||||||||||||| |||    
T  47151167 aaacaagggtttagaag--ccaacacaaaactaaggttt--atagagtttg-ctcttggtaaccaacactagggttgaaa--ttgattcaccttgggaaa 47151075  T
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| || |||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  47151074 cactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttc 47150975  T
Q  491 aaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
     |||||| ||||||| ||||||| ||||||  | || | ||||||| |||||| |||||| |||||| ||| | ||| ||| |||| | |||||||||||    
T  47150974 taaagttgctcatcattatagtggaacagatagatgttatctcccctagactaggtcaatattggaccgaattgggtaaactaatt-tcttgtgttctct 47150876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 486 - 589
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563112
Alignment:
Q  486 ttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 585  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccttgactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 47563108  T
Q  586 tctc 589  Q
    ||||    
T  47563109 tctc 47563112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 537
Target Start/End: Original strand, 9022362 - 9022605
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aa 390  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||||||||| ||    
T  9022362 aaacaagggtttagaa-gtcaacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaa 9022455  T
Q  391 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ccattgatatctctt 487  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||   | ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |    
T  9022456 acagtattaggatagaatttcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctc-t 9022554  T
Q  488 ttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccca 537  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9022555 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacaaagggctgctctctccccca 9022605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 243 - 542
Target Start/End: Original strand, 10112876 - 10113174
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||| |||||   |||||| ||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||  |||||    
T  10112876 tataaatatagacattgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtttgta--gagtt 10112972  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttac-gggaagagattgggactttg 439  Q
    || ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  10112973 tg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttg 10113069  T
Q  440 agtagaattag-gcgggagacttattcttgtaacc-cattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
     ||||||||||    | ||||| ||||||||||||   |||||||||| |||| || |||||| |||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||||     
T  10113070 ggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctc-tttgtaatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctctctcccca 10113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336764
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  | ||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctcttatatctct 5336867  T
Q  487 tttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||  |||||  | |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| | | || |||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  5336866 ttgtaaaagaaattcatcattatagtggaacggagagctgctctctcccctatagtaggtcaatattggactgaactgattaaacaaattcttttgtgtt 5336767  T
Q  585 ctc 587  Q
    |||    
T  5336766 ctc 5336764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 460 - 578
Target Start/End: Original strand, 49088791 - 49088911
Alignment:
Q  460 ttattcttgtaacccattgatatct-cttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc-cagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  49088791 ttattcttgtaactcattgacatcttcttttgtaatgttagtcatcatatagtgaaacagagaactactctctccccccagactaggtcaatttgggccg 49088890  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttt 578  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  49088891 aactgggtcaacaaattcttt 49088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 458 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446636
Alignment:
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             |||||||| |    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 24446668  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24446667 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24446636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050282
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 7050358  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7050357 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 7050282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 14789495 - 14789422
Alignment:
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctc--ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14789495 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 14789422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggactttg-gtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 589
Target Start/End: Original strand, 6133105 - 6133188
Alignment:
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| ||| || | |||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6133105 tatagtggaacggatgactgctctctcacccagactaggtcaatttggatcgaattgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6133188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 541
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570245
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 4570175  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4570176 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagact 4570245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 532 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 52942527 - 52942470
Alignment:
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52942527 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 52942470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 431
Target Start/End: Original strand, 10114380 - 10114520
Alignment:
Q  285 gagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacct 384  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | || ||  ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| |    
T  10114380 gagatggaaacaaggttttagaa-gccataacaaaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactt 10114473  T
Q  385 tggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  10114474 taggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853610
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489410
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9176907 - 9176849
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9176907 tggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgtt 9176849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11009003 - 11008933
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 230  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11009003 tggcacgatggtgcactggcagcaaaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgttacagattttaag 11008933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 25357583 - 25357683
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaatttta--agtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagata 281  Q
    ||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||||  ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  25357583 ataacagaatcgtatttttgggct-cagatttgttccaa-ttttacgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagaga 25357680  T
Q  282 gag 284  Q
    |||    
T  25357681 gag 25357683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 502
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906852
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||   ||||||  |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    || | |||||||||| |||| |||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctc-tttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 389 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 29609653 - 29609591
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29609653 aaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 375 - 479
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295399
Alignment:
Q  375 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| ||||| ||  | |||||||||| |||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagggttgaagacttattcctgtaacc 22295393  T
Q  474 cattga 479  Q
    | ||||    
T  22295394 ctttga 22295399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 529 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3937316 - 3937256
Alignment:
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3937316 tctccctcagactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcatttgtgttctctc 3937256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 266
Target Start/End: Original strand, 4569899 - 4569980
Alignment:
Q  183 aataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    |||||||||||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4569899 aataacagaaacgtattttcag--tgaagatttgttccatattttaagggttactttcactataaatataagccttgtatcaga 4569980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529328
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831202
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16186175 - 16186099
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga-ggagattgaaacaagggtttagaaa 308  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || | |  |||||||||||||||||    
T  16186175 atacttttactataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagagagagggggctaaaaacaagggtttagaaa 16186099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587027
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 476 - 574
Target Start/End: Original strand, 26557823 - 26557922
Alignment:
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaat 573  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| |||||||    
T  26557823 ttgatatctcttt-gtaaagttactcatcgttatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaagtcagtattggaccgaactaggtaaacaaat 26557921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300485
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822303
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 52043791 - 52043716
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||| |||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  52043791 agatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagag 52043716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 437
Target Start/End: Original strand, 16638826 - 16638875
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16638826 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactt 16638875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884912
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 4884912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689061
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 234 - 286
Target Start/End: Original strand, 36380370 - 36380422
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagga 286  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  36380370 tacttttactataaatatggactttgtatcagagtaaaccttgagataaagga 36380422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 4874678 - 4874620
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgg--aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4874678 ttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 285
Target Start/End: Original strand, 12102043 - 12102137
Alignment:
Q  191 aaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaata-ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg 285  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||  ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  12102043 aaacgtattttctgcgtg-agatttgttccaattttttagggatttcttttactataaatatagatcttgtatcagataaaaccttgagatagagg 12102137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 18847053 - 18847111
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18847053 tggcacgatggtgcgctcgcggggaaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgtt 18847111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||| |||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 423 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  423 aagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactt 461  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 3824630 - 3824593
Alignment:
Q  551 tggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3824630 tggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 3824593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Original strand, 5269231 - 5269284
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  5269231 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaa 5269284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 10047436 - 10047383
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  10047436 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 10047383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 571
Target Start/End: Original strand, 38152483 - 38152532
Alignment:
Q  522 gctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  38152483 gctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 38152532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39246051 - 39245998
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  39246051 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 39245998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 395 - 450
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  395 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgagtagaattag 450  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||| ||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22780744 - 22780688
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22780744 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatca 22780688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22783109 - 22783053
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22783109 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatca 22783053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 36769462 - 36769517
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  36769462 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagag 36769517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771434
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagag 36771434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 117)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 21947898 - 21948323
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21947898 tggcacgatggtg---tggcagcgaataacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 21947993  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21947994 gtatcagagtaaattttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 21948092  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||    
T  21948093 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggaga 21948192  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21948193 cttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactga 21948292  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21948293 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21948323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 25921884 - 25921458
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25921884 tggcacgatggtgcgctgacagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 25921786  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921785 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 25921686  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||    
T  25921685 actagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaaga 25921586  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  25921585 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 25921486  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25921485 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 25921458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 175 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 2818731 - 2818317
Alignment:
Q  175 tggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 274  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818731 tggcagcgaataacaaaaacgtattttc-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 2818633  T
Q  275 tgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 374  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2818632 tgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggt 2818533  T
Q  375 t-gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  2818532 ttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaact 2818433  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaat 573  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2818432 cattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaat 2818333  T
Q  574 tcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  2818332 tcttttgtgttctctc 2818317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 4236498 - 4236922
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4236498 tggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacagaaacgtatttt--gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 4236595  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236596 gtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 4236695  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4236696 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4236795  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  4236796 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 4236895  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||    
T  4236896 ac-tggtcaataaattcttttgtgttct 4236922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 36402738 - 36402310
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  36402738 tggcacgatggtgcgttggcaacgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttc-aaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 36402641  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402640 atatcagagtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 36402541  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||    
T  36402540 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggaga 36402441  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||    
T  36402440 cttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctctctcccccagactaggtcaatttagatcga 36402341  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36402340 actaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 36402310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 38881973 - 38882399
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38881973 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 38882071  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38882072 gtatcagagcaaacttggagatagaggggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa 38882171  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38882172 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag 38882271  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  38882272 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccg 38882370  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38882371 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38882399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 6756362 - 6756789
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    
T  6756362 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgg-tgcagatttattccaaattttaagttatacttttactattaatatagatctt 6756460  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756461 gtatcatattaaactttgagatagagggagctgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 6756560  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6756561 actagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 6756660  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  6756661 cttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggttacacatcattatagtgaaac-gagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccg 6756757  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  6756758 aactgagtcaacaaaatcttttgtgttctctc 6756789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 2174787 - 2175212
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| || ||||    
T  2174787 tggcacgatggtgcactggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatacaggcctt 2174885  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2174886 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 2174985  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2174986 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 2175085  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2175086 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 2175184  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2175185 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 2175212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 159 - 587
Target Start/End: Original strand, 16776025 - 16776452
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaa-tatagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||    
T  16776025 tggcacgatggtgcgctggcatcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgaagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaaatatagacct 16776123  T
Q  258 tgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16776124 tgtatctgagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaa 16776223  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16776224 cactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 16776323  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16776324 acttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactatgccaatttggaccg 16776422  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctc 587  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16776423 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctc 16776452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18511542 - 18511194
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18511542 tataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 18511443  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18511442 tgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgg 18511343  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18511342 atagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccctagac 18511243  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18511242 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18511194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 234 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 10529436 - 10529091
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||    
T  10529436 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggattttta 10529337  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529336 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 10529237  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10529236 gctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctctctcc 10529137  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctttt 579  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10529136 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 10529091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 39854426 - 39854780
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39854426 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 39854524  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  39854525 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactgga 39854624  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  39854625 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 39854724  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39854725 cccagactagatcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39854780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 25904047 - 25904400
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25904047 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtata 25904146  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  25904147 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggc 25904246  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  25904247 tttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctctctcccc 25904346  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25904347 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattattttgtgttctctc 25904400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 40221464 - 40221820
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  40221464 tacttttactataaatatagacattgactcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgta 40221563  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40221564 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggg 40221663  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||    
T  40221664 acttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctc 40221763  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40221764 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgctctctc 40221820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18509649 - 18509300
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18509649 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagatagaggggct-gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagag 18509551  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18509550 tttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggacttt 18509451  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 538  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||    
T  18509450 gggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctctctcccctag 18509351  T
Q  539 actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18509350 actaggtcaatttgaaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 18509300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 216 - 585
Target Start/End: Original strand, 18596570 - 18596939
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||| ||  |||||||     
T  18596570 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgggatagagggggctgaaacaagggtata--aagacaac 18596667  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18596668 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttg 18596767  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  18596768 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgg 18596867  T
Q  514 aacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 585  Q
    ||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18596868 aacggatggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacagattcttttgtgttc 18596939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 21684872 - 21684437
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21684872 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagacctt 21684774  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagag-gagat---------tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 348  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21684773 gtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 21684674  T
Q  349 tggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatt 448  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21684673 cggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaatt 21684574  T
Q  449 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaa 548  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21684573 aggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 21684475  T
Q  549 tttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21684474 tttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 21684437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 10474653 - 10474305
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10474653 actataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgaaatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtt 10474554  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10474553 tgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttga 10474454  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  10474453 gtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccatac 10474354  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10474353 taggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 10474305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12556334 - 12555905
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12556334 tggcacgatgatgcgctggcagcgaataacagaaatgtattttt-gtgtacagatttgtttcaaaatttaagcgatacttttactataaatatagacctt 12556236  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12556235 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 12556136  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |  ||||    
T  12556135 actaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagaga 12556037  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||| || || ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12556036 ctttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgctatctcccccatactagttcaatttggactg 12555937  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12555936 aactgggtcaataaattcttttgtgttctctc 12555905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 17072827 - 17073181
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17072827 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17072926  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17072927 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggc 17073026  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17073027 tttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctctctccc 17073126  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  17073127 ccagactcggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgctttctctc 17073181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 26097656 - 26098028
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||| || ||||||||| | |||     
T  26097656 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaatggcaac 26097755  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  26097756 aacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactattaggaatgagtctcttg 26097854  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    |||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  26097855 gttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 26097954  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26097955 acaga-ggctgctctctcctccagactaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26098028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 24126800 - 24127153
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24126800 cttttactataaatatagacattatatcagtgtaaaccttgagatagatggggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 24126899  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||   |||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24126900 gagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 24126999  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24127000 tttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccc 24127099  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24127100 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24127153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 31544996 - 31545374
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  31544996 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaa 31545095  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31545096 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaga 31545195  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||    
T  31545196 gtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacag-tactcatcat 31545294  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31545295 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31545374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 244 - 589
Target Start/End: Original strand, 2954368 - 2954713
Alignment:
Q  244 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 343  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || | |||||    
T  2954368 ataaatataggctttgtatcagtgtaaactttgagatagaggagtatgaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgt 2954467  T
Q  344 ctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  2954468 ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggt 2954567  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2954568 agaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctctctcccccaaacta 2954666  T
Q  543 tgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2954667 ggtcaattttgaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2954713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 18466599 - 18466978
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  18466599 atttgttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18466698  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18466699 aaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18466798  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  18466799 gtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 18466898  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18466899 ataatggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttct 18466978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 27912449 - 27912830
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||||||    |||||||||||||||    
T  27912449 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggtgctgaaacaagggttta 27912548  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27912549 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 27912648  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  27912649 gagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatc 27912748  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27912749 atatagtggaacagagaactgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27912830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 158 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31466390 - 31465971
Alignment:
Q  158 ttggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacct 257  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  31466390 ttggcacgatggtgcactggcagggaataccataaatgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgacacttttactataaatatagacct 31466292  T
Q  258 tgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | | |  |||||||| |||||| |||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31466291 tgtatcagactaaactttgagataaaaggggctgaaacaaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaa 31466192  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31466191 caccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggag 31466092  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||          |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| |    
T  31466091 ac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatat----------agggctgctctcacccccagactagttcaatttggaccg 31466003  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  31466002 aactaggtcaacaaattcttttgtattctctc 31465971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 16092534 - 16092181
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaacttt---gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16092534 actagaaatatagactttgtatcagatgtaaacttgtgagagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 16092435  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16092434 agtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagact 16092335  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  16092334 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctcctc 16092235  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16092234 tagactaggtcaatttagactgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 16092181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 31542651 - 31543028
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31542651 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 31542750  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31542751 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31542850  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  || || ||||||||||    
T  31542851 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaacag-tactcatcat 31542948  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31542949 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31543028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31472948 - 31472594
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| || |||||| |||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31472948 cttttactataaatatggacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 31472849  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31472848 gagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac 31472749  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||  ||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  31472748 ttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctctctccc 31472649  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31472648 ccatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31472594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 25803935 - 25804318
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-gagattga---------aacaaggg 300  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||| ||         ||||||||    
T  25803935 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaa-tttgagagagagagagatagagggggctcaaacaaggg 25804033  T
Q  301 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 400  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25804034 tttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 25804133  T
Q  401 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  25804134 gattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 25804233  T
Q  501 catcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25804234 catcatatagtggaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 25804318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1189949 - 1189589
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  1189949 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggttt 1189850  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1189849 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacaggaagagatt 1189750  T
Q  431 gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  1189749 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T
Q  530 ctcc-cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1189649 ctcctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1189589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 234 - 588
Target Start/End: Original strand, 6745003 - 6745364
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat---------tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaacta 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||| |||| ||||         ||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  6745003 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagagagagagag-agataaagggggctgaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaacta 6745101  T
Q  325 gggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745102 gggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 6745200  T
Q  425 gagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggct 524  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||    
T  6745201 gaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggct 6745300  T
Q  525 gctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6745301 gctctctcccccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6745364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 243 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 17818817 - 17818475
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| | | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  17818817 tataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagaaagaggggct-gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcg 17818719  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  17818718 tctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggt 17818619  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17818618 agaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatacagtggaacagagggct--tctctcccccaaacta 17818521  T
Q  543 tgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17818520 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 17818475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 27910364 - 27910744
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag------gagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||      | |  |||||||||| ||||    
T  27910364 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggttaaactttgagagagagatagcgggggctgaaacaagg-ttta 27910462  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27910463 aaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 27910562  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    || ||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||    
T  27910563 gaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatc 27910662  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27910663 atataatggaacggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 27910744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 695833 - 696175
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  695833 cttttactatgaatatagacattgtatgagtgtaaaccttgagataaagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat- 695931  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  695932 ----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 696020  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  696021 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 696120  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  696121 ccagacaaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 696175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 18468926 - 18469303
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  18468926 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgataaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 18469025  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18469026 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18469125  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  18469126 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 18469225  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     ||||| |||  || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||    
T  18469226 ctagtggaacgaagagctgctctct--cccagactaggtcaatttggaccgaactggattaacaaattcttttgcgttct 18469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 208 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 31179734 - 31179368
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  31179734 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagacattgtatcaaagcaaactttgagatagagggagctgaaacaagggtttagaa 31179635  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31179634 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 31179535  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || |  |||||||||    
T  31179534 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 31179436  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  31179435 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 31179368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 234 - 588
Target Start/End: Original strand, 6747246 - 6747600
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt--gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||      |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||    
T  6747246 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaagagaaagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttg 6747345  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6747346 tataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactg 6747444  T
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||    
T  6747445 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctct 6747543  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    | | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6747544 ctctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 6747600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 315 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 658609 - 658338
Alignment:
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  658609 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttg 658510  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  658509 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 658410  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || || |||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  658409 acggatggctgctct---ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 658338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 242 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 37706109 - 37705774
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| |||    
T  37706109 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagacttt 37706010  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||      
T  37706009 gtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttgga 37705910  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||||||||||||||    
T  37705909 tagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacgaatggctattctctcccccagact 37705810  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  37705809 aggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattctt 37705774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 39398327 - 39397975
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| | | |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39398327 cttttactataaatataaacattgtaccggtgtaaaccttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 39398229  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  39398228 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaa 39398130  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  || ||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  39398129 ctttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctctctccc 39398030  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39398029 acagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaaaacattcttttgtgttctctc 39397975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34477349 - 34477038
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34477349 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34477250  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34477249 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34477150  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaat 573  Q
    ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34477149 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34477051  T
Q  574 tcttttgtgttct 586  Q
    ||| |||||||||    
T  34477050 tctcttgtgttct 34477038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 34479714 - 34479403
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34479714 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 34479615  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  34479614 gattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 34479515  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaat 573  Q
    ||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34479514 cattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaat 34479416  T
Q  574 tcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||||    
T  34479415 tcttttgtgttct 34479403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 15552154 - 15552539
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----------tagaggagattgaaacaaggg 300  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||          |||||| || |||||||||||    
T  15552154 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagaggggactgaaacaaggg 15552253  T
Q  301 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 400  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15552254 tttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 15552353  T
Q  401 gatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttac 499  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||    
T  15552354 gattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaac 15552452  T
Q  500 tcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  15552453 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 15552539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 34531001 - 34530712
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  34531001 cttttactgtaaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 34530902  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  34530901 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggac 34530802  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggct 524  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||    
T  34530801 tttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaagagagggct 34530712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 21288715 - 21289058
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  21288715 tataaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggttgaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttg 21288814  T
Q  343 tctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21288815 tctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacctt-gaaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggact 21288913  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
    |||  |||||||| |||||||| || |||||||||| ||        ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21288914 ttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca--------tcttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctctctccccc 21289005  T
Q  537 agactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21289006 agactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 21289058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 10586758 - 10587126
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| | | ||||||||||||||||    
T  10586758 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaggggct-gaaacaagggtttaga 10586856  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg 405  Q
    | | ||| |||||||||||           ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10586857 atggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc 10586945  T
Q  406 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca 505  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| || |||||||||||    
T  10586946 agtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatca 10587044  T
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctct-cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10587045 tatagtggatcggagggctgctctctccccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 10587126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 370 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505825
Alignment:
Q  370 agggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgt 469  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  470 aacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaac 569  Q
    ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgc--tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaac 20505845  T
Q  570 aaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20505844 aaattcttttgtgttctctc 20505825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 359 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585726
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 41585757  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41585756 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41585726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 237 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 6661516 - 6661181
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||| |||||||    
T  6661516 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatag 6661418  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |    
T  6661417 agtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagatt 6661321  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||| || | ||||||||||||     
T  6661320 ttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctctctccct 6661221  T
Q  536 cagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||| | | ||||||||    
T  6661220 cagactaggtcagatttggaccgaactggataaacaaatt 6661181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 354 - 589
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724190
Alignment:
Q  354 caaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcg 453  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg---------tagaattaggcg 2724054  T
Q  454 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgg 553  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgg 2724154  T
Q  554 actgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2724155 accgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 2724190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 371 - 586
Target Start/End: Original strand, 39798126 - 39798341
Alignment:
Q  371 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798126 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 39798225  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaaca 570  Q
    |||||||||| ||||||||  || | |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||    
T  39798226 acccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggatcgaactgggtcaaca 39798325  T
Q  571 aattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||||    
T  39798326 aattcttttgtgttct 39798341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 450
Target Start/End: Original strand, 20042994 - 20043208
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20042994 cttttactataaatataggctttgtatcatagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 20043093  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20043094 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 20043193  T
Q  436 tttgagtagaattag 450  Q
    ||||  |||||||||    
T  20043194 tttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 454
Target Start/End: Original strand, 20044954 - 20045172
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  20044954 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagacagagggggctgaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 20045053  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20045054 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggac 20045153  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgg 454  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  20045154 tttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 359 - 586
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410316
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccga 4410288  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4410289 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4410316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 26098589 - 26098389
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||| |||||||||||| | ||| || || ||||||||||||    
T  26098589 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgt 26098490  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26098489 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattgg 26098390  T
Q  433 g 433  Q
    |    
T  26098389 g 26098389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 159 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20507873 - 20507659
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  20507873 tggcacgaaggtgcgctagcagcgaataacagaaacatattttt-gggagcagatttgttccaagatttaagcgatacttttactataaatatagatctt 20507775  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20507774 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 20507675  T
Q  359 actagggtttgagggt 374  Q
    || ||||||| |||||    
T  20507674 acaagggtttaagggt 20507659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 389 - 578
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749986
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 10749895  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttt 578  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttt 10749986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 236 - 581
Target Start/End: Original strand, 36208524 - 36208865
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||||||| ||     
T  36208524 cttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaa--caaacaacaaactagggttt-tag 36208620  T
Q  335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||| || |||||  |    | | |||||||||   |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  36208621 agagatt-tctctaagcgggagaaactagggttgttg--ttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgaga 36208717  T
Q  435 ctttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||| |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |     
T  36208718 ctttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct-tt 36208816  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgt 581  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  36208817 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgt 36208865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 316 - 589
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020517
Alignment:
Q  316 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 415  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  416 ttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaa 514  Q
    | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtc-aatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     | || ||||||||||||| ||| | || |||   ||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||    
T  9020442 tcggatggctgctctctcctccaaattaggtctgttttggaccgaactggataaaccaattcttttgtgttctctc 9020517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 290 - 589
Target Start/End: Original strand, 20053845 - 20054134
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  20053845 tgaaacaagggtttagaagg-caacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttggga 20053940  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |     ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  20053941 aacactattaggattgagtctcttggtttgg-----agattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctctttt 20054032  T
Q  490 gaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctc 587  Q
    | |||||||||||||| ||||||  ||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  20054033 gtaaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctctctcctccatactaggtcagttttggaccgaactgcgtaaacaaattcttttgtgttctc 20054132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354560
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15354658  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15354657 t-gtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15354560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665337
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23665238  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23665337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793250
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23793348  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23793347 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23793250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373122
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattga-gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 3373221  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || |  ||||||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 3373122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 578
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757462
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-t 10757371  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttt 578  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattagaccgaactgggtcaacaaattcttt 10757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356836
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15356935  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctctctcccccggactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 15356836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960117
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 38960215  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  38960214 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccaaactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 38960117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 318 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17413416 - 17413198
Alignment:
Q  318 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17413416 aaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtc 17413322  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaa 515  Q
    | |||||||||||| ||||||  |||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  17413321 aagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 17413222  T
Q  516 cagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  17413221 cagagggatgctctctcccccaga 17413198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 395 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741844
Alignment:
Q  395 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaa 493  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctcttt-gtaa 23741937  T
Q  494 agttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23741936 cgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctcttccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 23741844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 274
Target Start/End: Original strand, 39797956 - 39798070
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39797956 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcaaaacttttactataaatatagacctt 39798054  T
Q  259 gtatcagagtaaactt 274  Q
    |||| |||||||||||    
T  39798055 gtattagagtaaactt 39798070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143722
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgctttctcccctagactaggtca 15143722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 392 - 585
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4898023
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  491 aaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 585  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||| | || ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgctttctcccccatactaggtcagtattcgactgaactgggtaaacaaatt-ttttgtgttc 4898023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 418 - 507
Target Start/End: Original strand, 42770936 - 42771025
Alignment:
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcata 507  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42770936 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 460
Target Start/End: Original strand, 42770671 - 42770934
Alignment:
Q  190 gaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggaga 288  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||| ||| | ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  42770671 gaaacgtatttttatgggccagatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatataaactttgtatc-gagtaaaccttgagatagagggga 42770769  T
Q  289 ttg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 387  Q
     || |||||||||||| ||| |   || |||||| || ||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||| ||||||| |||    
T  42770770 ctgaaaacaagggtttggaagg--caacacaaaatta-ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgg 42770863  T
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagact 460  Q
     ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||    
T  42770864 gaa--actattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 15445454 - 15445263
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggtt---acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatc 483  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||     ||  |||||||||| |||||||||||||||||||   || || | ||||||||||||| ||||||||    
T  15445454 aaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatc 15445355  T
Q  484 tcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  15445354 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctctct-tcccagactaggtcagtattggactgaactgggtaaacaaatt 15445263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 480 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 26098380 - 26098270
Alignment:
Q  480 tatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc-ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttt 578  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  26098380 tatctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctctctccccccatactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttt 26098281  T
Q  579 tgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||    
T  26098280 tatgttctctc 26098270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 332
Target Start/End: Original strand, 4409999 - 4410101
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  4409999 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 4410098  T
Q  330 tgt 332  Q
    |||    
T  4410099 tgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144599
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa-acactagggtttgagggttgattcaccttgga-a 389  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| |    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggaga 2144747  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-cattgatatctct 486  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| || ||||||||   | ||||| ||||||||||||   || |||||||     
T  2144746 aacactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctc- 2144648  T
Q  487 tttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2144647 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 2144599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 446
Target Start/End: Original strand, 29748260 - 29748502
Alignment:
Q  211 gatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattg----------aaacaagg 299  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| || |           ||||||||    
T  29748260 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaacttttagagagaggcgagtagagagccagaaaacaagg 29748359  T
Q  300 gtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactatt 398  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| |||||||  ||| |||||||  |||||| |||||||| |    
T  29748360 gtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaaacactaat 29748453  T
Q  399 aggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaa 446  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  29748454 aggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 451
Target Start/End: Original strand, 4754159 - 4754312
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 391  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  4754159 aaacaagggttta-aaagccaacacaaacactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgaaaaa 4754252  T
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  4754253 cactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 41586044 - 41585946
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  41586044 atacttttactataaatataggttttgtatcagagtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaataacaagaacaaaactagggtttg 41585946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 589
Target Start/End: Original strand, 20043222 - 20043287
Alignment:
Q  524 tgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20043222 tgctctctcccacagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 20043287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 34033768 - 34033632
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatt-aggcgggagacttattcttgta 470  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||   | |||||| || | |||    
T  34033768 ttgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggtagaattaagtttgaagacttgttatggta 34033669  T
Q  471 acccatt-gatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34033668 accccttcgatatctcttttgtaaagttactcatcat 34033632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385573
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 575
Target Start/End: Original strand, 23667416 - 23667601
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||||   |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||| ||||||    
T  23667416 aaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaact-atgcttgcaacccattgatttctctt 23667514  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    | | || || |||||||| ||| || | | |||||||||||||| |||||||||| | ||  |||||| ||||| || ||||||||||    
T  23667515 t-gtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctctcttccccagactaggacagattggaccgaactgggccaacaaattc 23667601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3373401 - 3373332
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat 280  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3373401 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 3373332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170872
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782578
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 586
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430476
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  471 a-cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtca 567  Q
    |  |  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||| || |||||   ||| || |||| | |||||||||||| | | |    
T  35430359 attcttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaaagctcctatctcctttagagtaggtcagtattggactgaactggataa 35430457  T
Q  568 acaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  35430458 acaaattctcttgtgttct 35430476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 436
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627411
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 10627411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093413
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag 450  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| | ||||||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggacttag-gtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2144978 - 2144878
Alignment:
Q  186 aacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaat-tttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagataga 283  Q
    |||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  2144978 aacataaacgtattttctgggccgagatttgttccaattatttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagaga 2144879  T
Q  284 g 284  Q
    |    
T  2144878 g 2144878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298145
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452556
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406594
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841274
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| |||| | |||||||||||   || |||| |||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaacttgg-gtagaattaggtttgaagactgattcttgta 17841350  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcat--cat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   |||||||||| | ||||  ||||||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17841349 actca---atatctcttt-gtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 17841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 23665054 - 23665125
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23665054 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23665125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 23667329 - 23667400
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23667329 gcagatttgttatagattttaagcatgactttaactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23667400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23793533 - 23793462
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23793533 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 23793462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786452
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 28786452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 236 - 285
Target Start/End: Original strand, 2723911 - 2723960
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg 285  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2723911 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg 2723960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 394 - 451
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  394 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240489
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15354845 - 15354777
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttg 276  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15354845 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15354777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15357121 - 15357053
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttg 276  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15357121 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttg 15357053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 343 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 15224997 - 15224889
Alignment:
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttga 440  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | | ||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||     
T  15224997 tctcttggcaacaaacactagggtt--atgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgg 15224900  T
Q  441 gtagaattagg 451  Q
    ||| |||||||    
T  15224899 gtaaaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 451
Target Start/End: Original strand, 32520534 - 32520597
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||    
T  32520534 aaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 38960405 - 38960334
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  38960405 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 38960334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 188
Target Start/End: Original strand, 659819 - 659848
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  659819 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataac 659848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 273
Target Start/End: Original strand, 10757180 - 10757245
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaact 273  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10757180 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaact 10757245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 522
Target Start/End: Original strand, 20045210 - 20045271
Alignment:
Q  462 attcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagaggg 522  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  20045210 attcttttaacccattgatatcttttttgtaaagttacttatcattatagagaaacggaggg 20045271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 34477435 - 34477378
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcag 265  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  34477435 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaaaatagaccttgtatcag 34477378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22672872
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 22672872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23742101 - 23742057
Alignment:
Q  235 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  23742101 acttttactataaatatagaccttgtgtcaaagcaaactttgaga 23742057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 218
Target Start/End: Original strand, 31542573 - 31542628
Alignment:
Q  162 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||| |  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31542573 cacgatggtgcgctggcggataaaaacagaaacata-tttttgggtgcagatttgtt 31542628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 99)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 9019830 - 9020258
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  9019830 tggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatctt 9019927  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9019928 gtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatc 9020027  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9020028 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 9020127  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  9020128 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 9020227  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9020228 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 9020258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15541551 - 15541122
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  15541551 tggcacgatggtacgctggcagcgaatagcagaaacatatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagttacacttttactataaatatagacctt 15541453  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15541452 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaac 15541353  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15541352 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggaga 15541253  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  15541252 cgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctctctcctccagactaggttaatttggactga 15541153  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15541152 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15541122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11983440 - 11983011
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||    
T  11983440 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgtttcaaattttaaacgaaacttttactataaatatagacctt 11983342  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983341 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 11983242  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11983241 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 11983142  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  11983141 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 11983042  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11983041 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11983011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 166 - 579
Target Start/End: Complemental strand, 15533085 - 15532674
Alignment:
Q  166 atggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcag 265  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15533085 atggtgcgctggtagcaaataagagaaacatatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagttatacttttactataaatatagaccttgtatcag 15532987  T
Q  266 agtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 365  Q
    | |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15532986 actaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaataggg 15532887  T
Q  366 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattc 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  15532886 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattc 15532787  T
Q  466 ttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggt 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  15532786 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctat-ccctagactaggtcaattttgactgaactaggt 15532688  T
Q  566 caacaaattctttt 579  Q
    ||||||||||||||    
T  15532687 caacaaattctttt 15532674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14507586 - 14507161
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14507586 tggcacgatggtgcgctgccagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgtagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 14507488  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14507487 gtattagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 14507388  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14507387 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaaga 14507288  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14507287 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 14507189  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14507188 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 14507161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 32279900 - 32280329
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||||||||||    
T  32279900 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacataaatgtattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttcctatatatatagacctt 32279998  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32279999 gtatcatagtaaacttggagatagaggggct-gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaac 32280097  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  32280098 acttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggaga 32280197  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc-atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32280198 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 32280297  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  32280298 aacttggtcaaaaaattctcttgtgttctctc 32280329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 30729239 - 30728806
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| |||    
T  30729239 tggcacgatagtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcggtacttttactataaatatagatctt 30729141  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729140 gtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 30729041  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30729040 actaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggaga 30728941  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgata----tctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    |||||| ||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30728940 cttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctctctcccgcagactaggtcaatttgga 30728841  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30728840 ccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 30728806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 13057173 - 13057527
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  13057173 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtata 13057272  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13057273 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggac 13057372  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13057373 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactctctccc 13057472  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13057473 ccaaactaggtcaatttggaccgaactcggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13057527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1230586 - 1230234
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1230586 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaactttgagatagagagggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1230487  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||    
T  1230486 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttggttattggaagaggctggg 1230387  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  1230386 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 1230287  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1230286 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1230234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28241658 - 28241306
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  28241658 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 28241559  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  28241558 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 28241459  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28241458 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 28241359  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28241358 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28241306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 13039733 - 13040087
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13039733 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtata 13039832  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13039833 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagac 13039932  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13039933 tttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 13040032  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13040033 ctagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13040087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 243 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 14459093 - 14458752
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459093 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttg 14458994  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||    
T  14458993 tctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggt 14458896  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14458895 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagacta 14458796  T
Q  543 tgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14458795 ggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 14458752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 3390355 - 3390712
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3390355 atacttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagacggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 3390454  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3390455 atagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgg 3390554  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  3390555 ggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctctct 3390654  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390655 cccccatactaggtcaatttggaccaaattgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 3390712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 159 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 15530533 - 15530166
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15530533 tggcacgatggtgtgctggcagtgaattatagaaacatattttt-gggtgcaggtttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 15530435  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |  |||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15530434 gtatcagagtaaactgggagatagagggggctgaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 15530335  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  15530334 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggaga 15530235  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15530234 cttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3630199 - 3629847
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||| |  |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3630199 cttttactataaatatagacattgtatcaatgtaaaacttgagatagagggggctgaaacatcggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 3630100  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3630099 gagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggc 3630000  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  3629999 tttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactaataatatagtgaaactgagggctgctctct-ccc 3629901  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3629900 catactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3629847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4816608 - 4816216
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-----gagat---------tgaa 293  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     |||||         ||||    
T  4816608 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagagatagagggggctgaa 4816509  T
Q  294 acaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaaca 393  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4816508 acaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 4816409  T
Q  394 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaa 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4816408 ctattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 4816309  T
Q  494 agttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4816308 cggtactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4816216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3632268 - 3631921
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3632268 actataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 3632169  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  3632168 tgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgg 3632069  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccaga 539  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||    
T  3632068 gtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctgt--cccaga 3631971  T
Q  540 ctatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3631970 ctaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 3631921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 30967152 - 30967530
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    |||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  30967152 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtat-aggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 30967250  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30967251 aagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 30967350  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  30967351 gtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 30967450  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30967451 atagtggatcggagagctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 30967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 25477253 - 25477614
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  25477253 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatata 25477352  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |    
T  25477353 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggc 25477452  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaa-------agttactcatca-tatagtgaaacagagggctgct 527  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25477453 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcgttactcatcattatagtgaaacagagggctgct 25477552  T
Q  528 ctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25477553 ctctcccccatactaggtcaatttggaccgaaatgggtcaacaaattcttttgtattctctc 25477614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 237 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19704909 - 19704552
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag------gagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||      | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19704909 tttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 19704810  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19704809 gtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagat 19704710  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct-tttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||||||||||||||| |   |||||||||||    
T  19704709 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctc 19704610  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  19704609 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 19704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 2629250 - 2628871
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-----gagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||     | |  ||||||||||||||||    
T  2629250 atttgttccaaatttattagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgttaaactttgagagagagatagaggggctgaaacaagggtttag 2629151  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg 405  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2629150 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 2629051  T
Q  406 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||    
T  2629050 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatca 2628952  T
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2628951 tatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattcttttgtgttct 2628871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 12195875 - 12195500
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaaga 310  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||      
T  12195875 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaag 12195776  T
Q  311 caaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  12195775 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 12195676  T
Q  410 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatata 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||||||    
T  12195675 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatata 12195577  T
Q  510 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||    
T  12195576 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaagtttctttgtgttct 12195500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 212 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 30034967 - 30034590
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    ||||||||||    | |||||||||||||||    
T  30034967 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttaagagagatagagggagctaaaacaagggtttaga 30034868  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30034867 aaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 30034768  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||  ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  30034767 gtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 30034668  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30034667 atagcggatcggagggctgctctctcccccagactgggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 30034590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 3234065 - 3233707
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3234065 cttttactataaatatagac-ttgtatcagtgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtata 3233967  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3233966 tagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 3233867  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3233866 ctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctctctccc 3233767  T
Q  535 ccagactatgtcaattt-----ggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| ||||||||     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3233766 ccacactaggtcaattttgaccgaactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3233707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 159 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19227820 - 19227514
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||    
T  19227820 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacatattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagatctt 19227721  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19227720 gtatcagagcaaactttgagataaagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaac 19227621  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19227620 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 19227521  T
Q  459 cttattc 465  Q
    |||||||    
T  19227520 cttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 208 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 20915721 - 20915351
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||  |||||| |  ||||||||||||||||    
T  20915721 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattgagagagatagagggggctgaaacaagggtttag 20915622  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt- 404  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20915621 aaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 20915522  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||    
T  20915521 gagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatc 20915423  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattct 576  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20915422 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattct 20915351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 234 - 588
Target Start/End: Original strand, 26064958 - 26065312
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttg-----agatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||     ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  26064958 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26065057  T
Q  329 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26065058 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26065154  T
Q  429 ttgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||| | |||||||| | | |||||||||||    
T  26065155 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26065253  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26065254 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26065312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 234 - 588
Target Start/End: Original strand, 26084927 - 26085281
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttg-----agatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||     ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  26084927 tactttcactataaatatagaccttgtatcacagtatttcttggagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagt 26085026  T
Q  329 ttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26085027 ttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagg 26085123  T
Q  429 ttgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| || ||||||| | |||||||| | | |||||||||||    
T  26085124 ctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctc 26085222  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26085223 tct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattattttgtgttctct 26085281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24338783 - 24338430
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  24338783 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcata 24338684  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactaggg-tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
     ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||  ||    
T  24338683 aagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaaga 24338584  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    ||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  24338583 ctttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctg--ctctcc 24338486  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||| ||||    
T  24338485 cccagactatgtcaatttggaccgaactaggtaaacaaatatttttgtgttatctc 24338430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26932930 - 26932546
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--------tagaggagattgaaacaagggtt 302  Q
    ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||        |||||| | |||||||||||| |    
T  26932930 atttgttccaaatttatgggttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagagagatagagggggttgaaacaagggct 26932831  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26932830 tagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattagga 26932731  T
Q  403 tt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactc 501  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||    
T  26932730 ttggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactc 26932632  T
Q  502 atcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26932631 atcatatagtggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttcttttgtgttct 26932546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12161889 - 12161540
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  12161889 cttttactttaaatatagacattgtatcattgtaaaccttgagataaaggggct-gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtata 12161791  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  12161790 gagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagac 12161693  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||  ||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||| |||    
T  12161692 tttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtaaaatggatggctgttctct-ccc 12161594  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     | |||| || ||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||    
T  12161593 taaactaggttaatttggaccgaactgaatcaacaaattattttgtgttctctc 12161540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 319 - 574
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719961
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 15719903  T
Q  518 gagggctgctctct-cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| | |||||| | |||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  15719904 gagagttgctctttccccccatactaggtcaatttggaccgaacttggtaaacaaatt 15719961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 3028188 - 3027888
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | | |  ||||| ||||||||| ||| |   || ||||||||||||||||    
T  3028188 atacttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccatgagataaaaggggctgaaaacaagggtttggaaggc--aacacaaaactagggtttg 3028091  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  3028090 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattg 3027994  T
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||     
T  3027993 agactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctt 3027894  T
Q  531 tccccc 536  Q
    ||||||    
T  3027893 tccccc 3027888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 14466312 - 14466656
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||              
T  14466312 cttttactatagatatagactttgtattagaataaaccttgagatagagagggttgaaacaagagtttagaaagacaacagcaaaactag---------- 14466401  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
     ||||||||| || | ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14466402 -agtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggga 14466500  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| | || | ||||| | |||    
T  14466501 gtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattatagtgaaccggatgactgctgtttcc 14466600  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14466601 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcagcaaattctcttgtgttctctc 14466656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 159 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 1072288 - 1072067
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1072288 tggcacgatggtacgtaggcagcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacatt 1072190  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatag-aggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1072189 gtatcagagtaaactttgagatagaaggag-ctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 1072091  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattca 381  Q
    |||||||||||| | |||||||||    
T  1072090 cactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 244 - 506
Target Start/End: Original strand, 22490626 - 22490889
Alignment:
Q  244 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggttta-gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    |||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22490626 ataaatatagacattgaattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg 22490725  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22490726 cctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggt 22490825  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  22490826 agaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 377 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069700
Alignment:
Q  377 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 476  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  477 tgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctctcttccccatactaggtcaatttggaccgaactgaatcaacaaattc 1069714  T
Q  576 ttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||    
T  1069713 ttttatgttctctc 1069700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 356 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273213
Alignment:
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 5273233  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  5273232 ccgaactgggtcaacaaatt 5273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 199 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16455796 - 16455449
Alignment:
Q  199 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaa-c 295  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| ||  |||| || |||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||  ||||| |    
T  16455796 tttttgggctcagatttgttccaatttttcagggatacctttactataaatatataccttgtatcggtgtaaaccttgagaggtagag-agtctgaaaac 16455698  T
Q  296 aagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 395  Q
    |||||||||||| | ||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||    
T  16455697 aagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacact 16455602  T
Q  396 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaag 495  Q
     |||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  16455601 gttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaa 16455502  T
Q  496 ttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16455501 ttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccatactaggtca 16455449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 159 - 356
Target Start/End: Original strand, 8995383 - 8995578
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  8995383 tggcacgatggtgcgctgacagcaaataacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatctt 8995480  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8995481 gtatcagagtaaactgagagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 323 - 589
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367363
Alignment:
Q  323 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 422  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  423 aagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagaggg 522  Q
    |||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaagg 15367296  T
Q  523 ctgctctctc-ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  15367297 ctgctctctctccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 15367363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 373 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186053
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaaca 570  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || | ||||| ||||||||| || ||||| ||| ||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctgcctcggactaggtcaatttgaaccgaactgggtaaaca 12186072  T
Q  571 aattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  12186071 aattattttgtgttctctc 12186053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066109
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26066208  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || |||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26066109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 237 - 504
Target Start/End: Original strand, 17012024 - 17012287
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaa-acaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  |||| | |||||||||| |||  || ||| |||||||||||||||||    
T  17012024 tttctctataaatatagaccttgtatcggagtaaaccttgagatagaggggtctgaataaaagggtttag-aagtaaacaac-aaactagggtttgtata 17012121  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||   |    
T  17012122 aagtttg-ctcttggcaacaaacactaggg-ttga-ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgatgc 17012218  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17012219 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754694
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 29754793  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 29754694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309185
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33309086  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33309185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068380
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26068479  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 26068380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311454
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33311355  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctttctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 33311454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 574
Target Start/End: Original strand, 19696394 - 19696759
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagga---gattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||| |||| |   || |||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| |||||| |||||    | |  |||||||||||||||    
T  19696394 agatttgttccaatttttgaaggattcttttactataaatatagaccttgtatatgatgaaaccttgagagagagggagggctgaaaacaagggtttaga 19696493  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||  |||| |  ||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||  |   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19696494 aa--caaacaacaaattagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattga 19696588  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca 505  Q
    ||||||| || || | ||||||||| |||||||  ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19696589 gtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatca 19696688  T
Q  506 -tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     ||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  19696689 ttatagtggaacagatagctgctctctctcccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 19696759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 372 - 574
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945463
Alignment:
Q  372 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaa 568  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||  ||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctctcccccccagattatgtcaggtttggaccgaactgggtaaa 26945457  T
Q  569 caaatt 574  Q
    ||||||    
T  26945458 caaatt 26945463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 236 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32447651 - 32447502
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32447651 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 32447552  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactag-ggtttgagggttgattcacct 384  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32447551 gagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 432 - 574
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346664
Alignment:
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctctct 15346621  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15346622 cccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 15346664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 216 - 365
Target Start/End: Original strand, 17852500 - 17852650
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  17852500 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaac 17852599  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 365  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17852600 aacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 243 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 13870749 - 13870608
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13870749 tataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagaggggct-gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttg 13870651  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 385  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13870650 tctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22857977
Alignment:
Q  318 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtc 22858109  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc-attgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaa 514  Q
    ||  |||||||||| ||||||  ||||| |||||   | ||||| |||||||||||||  ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  22858108 acaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 22858010  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  22858009 acggatggctgctctctcccccagactaggtca 22857977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 352 - 532
Target Start/End: Original strand, 20526902 - 20527081
Alignment:
Q  352 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  20526902 aacaaacactagggtt-gaga-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattagg 20526999  T
Q  452 -cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
       | ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  20527000 tttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctctctc 20527081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078540
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaaca 570  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||| |||  ||||| ||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgctttct-tcccagtctaggtcagtattggaccgaactgggtaaaca 25078558  T
Q  571 aattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| || |||||||||||    
T  25078557 aatt-ttgtgtgttctctc 25078540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 375 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  375 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 473  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||| || |||||| ||||||| |||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatcata 507  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 495 - 589
Target Start/End: Original strand, 10584233 - 10584328
Alignment:
Q  495 gttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10584233 gttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagactaggtcaatttggaccgaactgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 10584328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 452 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465573
Alignment:
Q  452 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat- 549  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||| |||| ||||||||| |     
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctctctctcccatactatgtcagta 25465612  T
Q  550 ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25465611 ttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25465573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 233 - 402
Target Start/End: Original strand, 15346367 - 15346524
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||        ||   ||||||||||||||    
T  15346367 atacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaccaagggtttag--------aattcaaactagggtttgt 15346458  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15346459 ataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 348
Target Start/End: Original strand, 10584105 - 10584212
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||     ||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  10584105 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagg-----gaaacaaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtata 10584199  T
Q  336 gagtttgtctctt 348  Q
    |||||||||||||    
T  10584200 gagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 388 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 12911630 - 12911475
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||  || |||||| ||||||  ||||| |||||   || | || ||||||||||||  || ||||||||    
T  12911630 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  487 tttgaaaagttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    || | ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12911530 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagacta 12911475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 456 - 561
Target Start/End: Original strand, 30445723 - 30445830
Alignment:
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttgg 553  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||| ||| |||| |||| | ||||    
T  30445723 agactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctccaccatactaggtcagtattgg 30445822  T
Q  554 actgaact 561  Q
    ||||||||    
T  30445823 actgaact 30445830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 388 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 12937377 - 12937229
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| ||||||  |||||  |||||||||||   || | || ||||||||||||  || ||||||||    
T  12937377 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  487 tttgaaaagttactcatcat-atagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    || | ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12937277 tt-gtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccc 12937229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 389 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 7542566 - 7542452
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||   | ||||| ||| ||||||||| ||||||||||     
T  7542566 aaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctc- 7542468  T
Q  487 tttgaaaagttactca 502  Q
    |||| |||||||||||    
T  7542467 tttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24192706 - 24192630
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatac 236  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24192706 tggcatgatggggcgctggcagcgaataacagaaacata-tttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcaatac 24192630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878788
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883536
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785980
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 208 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26068662 - 26068590
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat 280  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26068662 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26068590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887345
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201447
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24191603 - 24191533
Alignment:
Q  165 gatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatac 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24191603 gatggggcgctggcagcgaataacagaaacata-tttttcagtgcaaatttgttccaaattttaagcaatac 24191533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577648
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 3577648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 397 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  397 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 26066389 - 26066319
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat 280  Q
    ||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  26066389 agatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagat 26066319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694972
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Original strand, 18317984 - 18318048
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  18317984 gttccaaatttatgagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgaga 18318048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078215
Alignment:
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaattt 551  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |  | | | |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggattataagactgctctctccctcatactaggtcaattt 28078215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 31979570 - 31979517
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  31979570 gagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 31979517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467607
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 13467607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19702006
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 19702006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29755059 - 29754983
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||    
T  29755059 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgagagagag 29754983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33215888
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| || ||||||||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggacttgga-tagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 396 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  396 attaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351996
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 22351996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 25466508 - 25466433
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaa 308  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||  | |  |||||||||||||||||    
T  25466508 atacttttactataaatatagatcttttgtcagagtaaaccttgaggtagagaggctgaaaacaagggtttagaaa 25466433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 395 - 437
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941692
Alignment:
Q  395 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 25941692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 506
Target Start/End: Original strand, 3833481 - 3833526
Alignment:
Q  462 attcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagtt-actcatcat 506  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  3833481 attcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttaactcatcat 3833526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12186431 - 12186330
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaat-actttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatag-aggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||| |||| ||  || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||| | |  |||||||||||||||    
T  12186431 agatttgttccaattttttagcgattacttttactataaatataaaccttgtatcacatgtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttaga 12186332  T
Q  307 aa 308  Q
    ||    
T  12186331 aa 12186330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 472
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| ||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 472
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||| ||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4816678 - 4816612
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaatttt 227  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  4816678 tggcacgatggtgtgctggtagcaaa-aacagaaacatattttttgg-tgcagatttgttacagatttt 4816612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Original strand, 33308905 - 33308961
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33308905 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 33308961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Original strand, 33311174 - 33311230
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33311174 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 33311230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 3874 - 4298
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3874 tggcacgatggtgcgatggcagcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgtttcaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 3972  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  3973 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaac 4071  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4072 actagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4171  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  4172 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 4270  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  4271 accgggtcaacaaattcttttgtgttct 4298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 91)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 15072634 - 15073064
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15072634 tggcatgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 15072732  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15072733 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 15072832  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga-gattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15072833 actagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggag 15072932  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  15072933 atttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttagaccg 15073032  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  15073033 aactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 15073064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 14807676 - 14808114
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  14807676 tggcacggtggtgcgctggcagcgaaaaacataaacgtatttt--gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 14807773  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807774 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 14807873  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14807874 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 14807973  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctg----------ctctctcccccagactatgtcaa 548  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||          ||||||||||||||||| |||||    
T  14807974 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctctctcccccagactaggtcaa 14808073  T
Q  549 tttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14808074 tttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 14808114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 159 - 585
Target Start/End: Original strand, 15067905 - 15068330
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  15067905 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacaaaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataaacctt 15068003  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15068004 gtatcaacctaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 15068103  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15068104 actagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggaga 15068203  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15068204 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatataatggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggactga 15068303  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttc 585  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||    
T  15068304 actgggccaacaaattcttttgtgttc 15068330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 163 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28251973 - 28251549
Alignment:
Q  163 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtat 262  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28251973 acgatggtgcgttggcagcgaaaaacagaaacgtatttt--gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 28251876  T
Q  263 cagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 362  Q
    || |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251875 catagtaaactttgagatagagtgggttgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 28251776  T
Q  363 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactta 462  Q
    || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28251775 ggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagactta 28251676  T
Q  463 ttcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaactt 562  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||     
T  28251675 ttcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactg 28251576  T
Q  563 ggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28251575 ggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28251549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 27829221 - 27829646
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27829221 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggcctt 27829319  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829320 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 27829419  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27829420 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggaga 27829519  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27829520 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 27829618  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27829619 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 27829646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 4423942 - 4424368
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||    
T  4423942 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaatagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatacagacctt 4424040  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  4424041 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaac 4424140  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||    
T  4424141 actagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggaga 4424240  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4424241 cttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattactcatcatatagtggatcagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 4424340  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4424341 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 4424368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 27826910 - 27827335
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27826910 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacaaaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatataggcctt 27827008  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827009 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 27827108  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27827109 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggaga 27827208  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27827209 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccga 27827307  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27827308 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 27827335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 32339280 - 32339659
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  32339280 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 32339379  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32339380 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattga 32339479  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  32339480 gtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgatactcatcat 32339579  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32339580 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggttaacaaattcttttgtgttct 32339659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 184 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14419578 - 14419172
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagattt-gttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatag 282  Q
    ||||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||| || | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  14419578 ataacagaaacatatttttgggctg-agattttgttccaatttatgagtgatacttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatag 14419480  T
Q  283 aggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 382  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14419479 agggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcac 14419380  T
Q  383 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 482  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14419379 cttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatat 14419280  T
Q  483 ctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgt 581  Q
     ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14419279 gtcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgt 14419180  T
Q  582 gttctctc 589  Q
    ||||||||    
T  14419179 gttctctc 14419172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 30480838 - 30480485
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||    
T  30480838 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtata 30480739  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  30480738 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggc 30480639  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  30480638 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcccc 30480539  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30480538 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 30480485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 15809190 - 15809568
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----ggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    || |  |||||||||||||||||    
T  15809190 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagataaagggggctgaaacaagggtttaga 15809289  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809290 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 15809388  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  15809389 gtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 15809488  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15809489 atagtggatcagagggctgctctcttccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 15809568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 3873981 - 3874360
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----ggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||    || |  |||||||||||||||||    
T  3873981 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcaggctaaactttgagagagatagcgggggctgaaacaagggtttaga 3874080  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3874081 aagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattta 3874180  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  3874181 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 3874280  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3874281 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3874360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27107232 - 27106879
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27107232 cttttactataaatatagacattgtatcagtataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 27107133  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27107132 gagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgac 27107033  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  27107032 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctatctcctc 27106933  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27106932 cagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttttctc 27106879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 1225164 - 1225520
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1225164 tacttttactataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgta 1225263  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225264 aagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 1225363  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  1225364 gctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctctctc 1225463  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || || |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1225464 cctcatactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1225520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 233 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 13858822 - 13858469
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13858822 atacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggatgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 13858723  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13858722 atagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattgg 13858623  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13858622 ggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctctct 13858524  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctc 587  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  13858523 cccccagactaggtcaatttggacagaactgggtaaacaaattc-tttgtgttctc 13858469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22685003 - 22684638
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----------tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaact 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||          ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22685003 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagagagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaact 22684904  T
Q  324 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 423  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684903 agggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 22684804  T
Q  424 agagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagag 520  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||| |||    
T  22684803 agaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcatatagtggaacggag 22684704  T
Q  521 ggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22684703 ggctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 22684638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 27911012 - 27911366
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  27911012 atacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgt 27911110  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911111 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 27911210  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  27911211 gactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct- 27911309  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27911310 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27911366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 27957431 - 27957785
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| || |||||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  27957431 atacttttacaataaatattgacattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgt 27957529  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27957530 atagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 27957629  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  27957630 gactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctct- 27957728  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27957729 ccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaaaaaattcttttgtgctctctc 27957785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 41384724 - 41385097
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||     
T  41384724 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaaattgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaatgacaac 41384822  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41384823 aacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttg 41384922  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41384923 gttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 41385022  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41385023 acagagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttctgttctctc 41385097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 18810680 - 18811057
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  18810680 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 18810779  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 407  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18810780 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18810879  T
Q  408 tctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcata 507  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||    
T  18810880 tctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcata 18810978  T
Q  508 tagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18810979 tagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcaatttgaaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 18811057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 41382652 - 41383015
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |  | |||||||||||||||| |||||     
T  41382652 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagatggggctaaaacaagggtttagaatgacaac 41382751  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||| ||||||||||||||    
T  41382752 aacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct-----------attatgattgagtctcttg 41382840  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41382841 gttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 41382940  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41382941 acagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41383015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 212 - 579
Target Start/End: Original strand, 608702 - 609077
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--------tagaggagattgaaacaagggtt 302  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||        |||||| |  |||||||||||||    
T  608702 atttgttccaaatttatgagttata-tttcactgtaaatatagaccttatatcatagcaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 608800  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  608801 tagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattagga 608900  T
Q  403 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  608901 ttgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 609000  T
Q  503 tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctttt 579  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  609001 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaagtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctttt 609077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 44720815 - 44721193
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  44720815 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttatatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 44720914  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt-ggaaaacactattaggattga 406  Q
    || ||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44720915 aggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattga 44721014  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||    
T  44721015 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcat 44721113  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  44721114 atagtggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 44721193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28283585 - 28283206
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  28283585 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 28283486  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28283485 gaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt 28283386  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||    
T  28283385 gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatc 28283287  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28283286 atatagtggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 28283206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 241 - 586
Target Start/End: Original strand, 36865542 - 36865887
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagt 339  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36865542 actataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagt 36865641  T
Q  340 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 439  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||    
T  36865642 ttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttg 36865738  T
Q  440 agtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccc-a 537  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |    
T  36865739 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctctctcccccaa 36865838  T
Q  538 gactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  36865839 gactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaattctcttgtgttct 36865887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 25952521 - 25952874
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||||    
T  25952521 cttttactataaatataagctttgtatcagaggaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtata 25952619  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||    
T  25952620 tagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagac 25952719  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
     ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  25952720 attgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccc 25952819  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25952820 ccagactaggtaaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 25952874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 236 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5372512 - 5372161
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  5372512 cttttactataattatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatata 5372414  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5372413 gagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggac 5372314  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct-cc 533  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  5372313 tttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggttactctctccc 5372214  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||| ||||||    
T  5372213 cccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaataaattattttctgttct 5372161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 18812865 - 18813231
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18812865 gcagatttgttacaaattttaagggaaacttttactataaatatagatcttgtatcagagcaaacttggagatagaggaggctgaaacaagggtttagaa 18812964  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 407  Q
    || ||| |||||||||||           |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18812965 aggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 18813053  T
Q  408 tctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcata 507  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||    
T  18813054 tctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcata 18813152  T
Q  508 tagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18813153 tagtggattggagggctgctctctcccccatattaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 18813231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15186048 - 15185696
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |    
T  15186048 atacttttactataaatataaactttgtatcagagtaaaccttgagataaaggtgactgaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttat 15185949  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt--ctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||      
T  15185948 ataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-- 15185851  T
Q  431 gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
         |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||    
T  15185850 -----tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattatagtgaaacggaggactgttct 15185756  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15185755 ctcccctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttttgttctctc 15185696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 290 - 586
Target Start/End: Original strand, 43079656 - 43079952
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  43079656 tgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggga 43079755  T
Q  390 aacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 488  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  43079756 aacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 43079854  T
Q  489 tgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || || |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  43079855 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 43079952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 33541723 - 33541392
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  33541723 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 33541624  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541623 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggac 33541524  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||  |||||||||||                      ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33541523 ttttggtagaattagg----------------------cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctctctcccc 33541446  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  33541445 cagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaaaaatttcttttgtgttctctc 33541392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 212 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 24873547 - 24873178
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  24873547 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 24873448  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24873447 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggatt 24873348  T
Q  405 -gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| || |  ||||||    
T  24873347 ggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 24873249  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||| |  |||||||||||    
T  24873248 catatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaattgagtcaacaaatt 24873178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 43530099 - 43530465
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  43530099 atttattccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 43530198  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||  ||| |||             || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43530199 aaagcaacaac-------------gtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 43530285  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  43530286 gtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcat 43530385  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43530386 atagtggatcggagggctgctgtctctcccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 43530465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Original strand, 43082013 - 43082323
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  43082013 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 43082112  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 474  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43082113 gattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaaccc 43082212  T
Q  475 attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  43082213 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 43082311  T
Q  575 cttttgtgttct 586  Q
      ||||||||||    
T  43082312 tctttgtgttct 43082323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 236 - 482
Target Start/End: Original strand, 14477276 - 14477522
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14477276 cttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 14477375  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14477376 aagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 14477475  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 482  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14477476 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 236 - 574
Target Start/End: Original strand, 21482322 - 21482649
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||    
T  21482322 cttttactataaatatagaatttgtatcagagtaaactttgagatagagtggactgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtata 21482413  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21482414 aagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaagagattggggc 21482509  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21482510 tttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggctgctctctccc 21482609  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  21482610 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 21482649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 326 - 589
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956311
Alignment:
Q  326 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  426 agattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggct 524  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggtt 15956246  T
Q  525 gctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  15956247 tctctctccctcagattaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 15956311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 319 - 554
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480821
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
    |||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaaca 21480784  T
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21480785 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgga 21480821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 233 - 574
Target Start/End: Original strand, 31162210 - 31162551
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  | ||| ||| ||||||||||  |||  |  ||| ||| |||||    
T  31162210 atacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaaa--caagcaacaaattagtgtttg 31162307  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    |||| |||||| ||||| | |||||||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31162308 tataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaagagattg 31162404  T
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31162405 ggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctgctctc 31162504  T
Q  531 t--cccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |  ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  31162505 tcccccccagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 31162551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 267 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 3005931 - 3005624
Alignment:
Q  267 gtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggg 365  Q
    |||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||||||  |||| |  ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||    
T  3005931 gtaaaccttgagatagagggggctggaaacaagggtttagaaa--caaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaataggg 3005835  T
Q  366 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattc 465  Q
    || ||   ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3005834 ttgga---ttgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 3005738  T
Q  466 ttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttg 563  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||||| |    
T  3005737 ttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctctctcccccagaccaggtcagttttggaccgaactgg 3005638  T
Q  564 gtcaacaaattctt 577  Q
    || |||||||||||    
T  3005637 gtaaacaaattctt 3005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 213 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 5623096 - 5622877
Alignment:
Q  213 tttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagaca 312  Q
    |||||||||| || | ||| || |||| |||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  5623096 tttgttccaatttatgagtgattcttttactataaatataggttttgtatcagaataaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca 5622997  T
Q  313 aaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  5622996 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctct 5622897  T
Q  413 tggttacgggaagagattgg 432  Q
    || |||||||||||||||||    
T  5622896 tgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 234 - 413
Target Start/End: Original strand, 26775199 - 26775378
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  26775199 tacttttactataaatataggctttgtatcagagcaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgta 26775298  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 413  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26775299 tatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 163 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3886328 - 3886153
Alignment:
Q  163 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtatttttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgt 260  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3886328 acgatggtgtgctggcagcgaataacagaaacatattttttttgggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagactttgt 3886229  T
Q  261 atcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3886228 atcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12517437 - 12517248
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||||    
T  12517437 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactatatatatatacctt 12517339  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 347  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517338 gtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 359 - 536
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181799
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt-aggattgagtctcttggttacg--ggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 455  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatgactgctctctccccc 181799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 159 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 2468509 - 2468261
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2468509 tggcacgatggtgcgctggatgcgaataacagaaacgtattttttag-tgcagatttgttccaaatgttaagcgatacttttactataaatatagacctt 2468411  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg----tatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||        |||  |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| | |||    
T  2468410 gtatcaaagtaaactttgagatagagggagctgaaacaaggatttag--------aaatcaaactacggtttgtatatatagagtttg-ctcttggcaac 2468320  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468319 aaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 35872713 - 35872555
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||     | ||||||||||||||||    
T  35872713 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggca-----acaactagggtttgtata 35872619  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 399  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35872618 gagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 371 - 543
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035425
Alignment:
Q  371 gggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgt 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||   | ||||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  470 aacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactat 543  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactat 31035425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 442 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468126
Alignment:
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctctctctcccagat 2468160  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    || |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  2468159 taggtcaatttggacagaactaggtaaacaaatt 2468126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578301
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| ||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctctctcccctagactaggtca 31578301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 324 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  324 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  424 agagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 318 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573794
Alignment:
Q  318 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtc 31573881  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31573880 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 199 - 408
Target Start/End: Original strand, 31035031 - 31035238
Alignment:
Q  199 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga--tagaggagattgaaa- 294  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||| || | || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||  |||||     
T  31035031 tttttgggctcagatttgttccaattttttagga-tatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaactttgagaggtagag-agtctgaaaa 31035128  T
Q  295 caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacac 394  Q
    ||| ||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||    
T  31035129 caatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacac 31035224  T
Q  395 tattaggattgagt 408  Q
     |||||||||||||    
T  31035225 cattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 589
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376342
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaa 568  Q
    |||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||| |||||| || ||    
T  6376224 accttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctctctccctcagactaggtcagtattggaccgaacttagtaaa 6376322  T
Q  569 caaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| || |||||||||||    
T  6376323 caaatt-ttgtgtgttctctc 6376342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 331
Target Start/End: Original strand, 181516 - 181632
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| | |||     
T  181516 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggcttagaatggcaac 181615  T
Q  315 aacaaaactagggtttg 331  Q
    || ||||||||||||||    
T  181616 aataaaactagggtttg 181632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896124
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactt-attcttgtaa 471  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   || | || ||||||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaa 3896056  T
Q  472 cccat-tgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccca 537  Q
    | | | |||||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||| || |||||||||||||||||    
T  3896057 ctcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcattaaagtagaacggatggctgctctctccccca 3896124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 458 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872435
Alignment:
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             |||||||| |    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc-------------atttggaccg 35872467  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35872466 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 35872435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847830
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    | || ||||||||||||||| ||    | ||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17847761 a-cctttgatatctcttttgtaa----aatcat--tatagtggaatggagggctgctctctcccccagactaggtca 17847830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 374 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985121
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 471  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  472 cccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    ||| |||  ||||||| |  |||||||| | ||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  13985178 ccctttggaatctcttat--aaagttacccctcattatagtggaacagagagttgctctc 13985121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 521 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 37214314 - 37214246
Alignment:
Q  521 ggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37214314 ggctgctctctaccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttttctc 37214246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 266
Target Start/End: Original strand, 17847501 - 17847558
Alignment:
Q  209 cagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17847501 cagatttgttccaaattttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcaga 17847558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28328064
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 28327989  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactca-tca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || |||   |||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  28327990 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 28328064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021228
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752643
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757388
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895563
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423274
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Original strand, 44720746 - 44720815
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  44720746 tggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacagaaacatatttt-tgggtgcagatttgttacagattttaag 44720815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Original strand, 6375986 - 6376032
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6375986 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacattgaga 6376032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattag 450  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 505 - 586
Target Start/End: Original strand, 14477519 - 14477601
Alignment:
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact-tggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||| || |||| |||| | |||||||||| |||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14477519 atatagtgaaacggatggctactctttaccccagactaggtcaatttggatcgaactgcggtcaacaaattcttttgtgttct 14477601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590855
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812608
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 456 - 547
Target Start/End: Original strand, 16833769 - 16833861
Alignment:
Q  456 agacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16833769 agacttactcttgtaatcatttgatatctcttttgtaaagttactcaacattatagtggaacgaaaggctgctctctcccacagactaagtca 16833861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799568
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332692
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032715
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554919
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 29554919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33838946
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   ||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt--caggaagagattcaagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 33839023  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca--tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |||| |||  |  ||||||| ||||||||| |  |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||| | |||||||    
T  33839022 accctttggaa--tcttttgtaaagttacttaaaagttatagtggaacggagaactgctctctcccccataatatgtca 33838946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25684626 - 25684704
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  25684626 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37214514 - 37214458
Alignment:
Q  267 gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaact 323  Q
    |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37214514 gtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaact 37214458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 2267206 - 2267144
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  2267206 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 14419826 - 14419784
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||    
T  14419826 ctataaatatagacattgtatcagggtaaaccttgagatagag 14419784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 430
Target Start/End: Original strand, 15949533 - 15949575
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  15949533 aaaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagatt 15949575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 425
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033906
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 426  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 265
Target Start/End: Original strand, 43081930 - 43081987
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcag 265  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43081930 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcag 43081987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 557 - 589
Target Start/End: Original strand, 181800 - 181832
Alignment:
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  181800 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 181832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179705
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagag 23179705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Original strand, 43079558 - 43079614
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43079558 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatca 43079614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 169)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 24979555 - 24979985
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24979555 tggcacgatggtacgctggtagcgaataacataaacatattttttgg-tgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatatacctt 24979653  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24979654 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 24979753  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24979754 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggaga 24979853  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |    
T  24979854 cttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggatcg 24979953  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24979954 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 24979985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 162 - 589
Target Start/End: Original strand, 18162515 - 18162940
Alignment:
Q  162 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgta 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18162515 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 18162613  T
Q  262 tca-gagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacac 360  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18162614 tcatgagtaaacttggagatagagg-gat-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacac 18162711  T
Q  361 tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagact 460  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18162712 tagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagact 18162811  T
Q  461 tattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaa 559  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18162812 tattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggac-gaa 18162910  T
Q  560 cttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18162911 ctgtgtcaacaaatttttttgtgttctctc 18162940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 45882787 - 45883217
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45882787 tggcacgatggtgcgctgacaacgaataacagaaacctatttt-tgggtgcagatttgttgaaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 45882885  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45882886 gtatcatagtaaactatgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaac 45882985  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45882986 aataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggaga 45883085  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc-agactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  45883086 cttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccccctagactaggtcaatttggaccg 45883185  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45883186 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 45883217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 11170252 - 11170678
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  11170252 tggctcgattgtgcgctggcggcgaataacagaaacatatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 11170350  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170351 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 11170450  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11170451 actagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggaga 11170550  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  11170551 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttgggccga 11170650  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  11170651 actgggtcaacaaattcttttgttttct 11170678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 159 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 18099579 - 18099151
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18099579 tggcacgatggtgcgctggcggcgaacaatagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgagacttttactataa-tatagacctt 18099482  T
Q  259 gtatcagagtaaacttt-gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099481 gtatcagagtaaacttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 18099382  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18099381 cactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 18099282  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |    
T  18099281 acttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatatggaccg 18099182  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18099181 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctct 18099151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10956436 - 10956010
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10956436 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagacctt 10956338  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10956337 gtatcagagtaaacatgaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 10956238  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10956237 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 10956138  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  10956137 cttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctccaccagactaggtcaatttggaccga 10956038  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10956037 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 10956010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 4308616 - 4308261
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4308616 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 4308517  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4308516 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4308417  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4308416 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 4308317  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4308316 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 4308261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10958732 - 10958306
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||    
T  10958732 tggcacgatggtgcgctggcagccaataacagaaacgtatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagcaatttttttactataaatatagacctt 10958634  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10958633 gtatcagagtaaacataaagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaac 10958534  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  10958533 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggaga 10958434  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  10958433 cttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 10958334  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10958333 actgggtcaacaaattcttttatgttct 10958306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 22114714 - 22114288
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22114714 tggcacgatggtgcgatggcggcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 22114616  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| | |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22114615 gtatcagagcaaacttggagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 22114516  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  22114515 actaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggaga 22114416  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||| || | || ||||||||| ||    
T  22114415 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatgaatcggagggatgatctctcccccaaacaaagtaaatttggaccga 22114316  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22114315 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 22114288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 175 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18097294 - 18096880
Alignment:
Q  175 tggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 274  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18097294 tggcggcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgtttcaaattttaagcgagacttttactataaatatagaccttgtatcatagtaaactt 18097196  T
Q  275 t-gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 373  Q
      |||||||||| |  | |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097195 gagagatagagggggctcaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgaggg 18097096  T
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097095 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 18096996  T
Q  474 cattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaat 573  Q
     |||||| || |||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18096995 tattgatttcccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacgaat 18096896  T
Q  574 tcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||    
T  18096895 tcttttgtgttctctc 18096880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 48362079 - 48361651
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  48362079 tggcatgatggtgcgctggcagcgaatagcagaaacgtattttt-ggatgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 48361981  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  48361980 gtatcatagtaaactttgagatacagggggctgaaacaagg-tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaa 48361882  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  48361881 actagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaaga 48361782  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  48361781 ctttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgttactcataatatagtaaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcga 48361682  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48361681 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 48361651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 3859376 - 3859801
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  3859376 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataatataaacgtatttt-tgggtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 3859474  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3859475 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 3859574  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3859575 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 3859674  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3859675 cttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 3859773  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3859774 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 3859801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 5191501 - 5191925
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5191501 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacctt 5191599  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||  || |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5191600 gtatctaagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 5191699  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5191700 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 5191799  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||    
T  5191800 ctcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcagagggctgttctct-ccccagactaggtcaatttggaccga 5191897  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5191898 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 5191925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32264452 - 32264018
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32264452 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatattttt-gggtgcagatttgtttcaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 32264354  T
Q  259 gtatcagagtaaa----ctttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    |||||||||||||    |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32264353 gtatcagagtaaattaactttgagatagagggggctcaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaac 32264254  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  32264253 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgg 32264154  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttg 552  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32264153 gagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtctatttg 32264054  T
Q  553 gactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||  |||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  32264053 gaccaaactggatcaac-aattcttttgtgttctctc 32264018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10084802 - 10084372
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||    
T  10084802 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatgcttttactataaatatagacctt 10084704  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    ||||| ||| |||||||||||    |||||| |  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10084703 gtatcggagcaaactttgagagagatagagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 10084604  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  10084603 aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagg 10084504  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10084503 gagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccccaagactaggtcaatttgga 10084404  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  10084403 ccgaactgggtcaacaaattattttgtgttct 10084372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Original strand, 32218943 - 32219362
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32218943 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataagagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcagtataaatatagacctt 32219041  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||           |||||||||||||| |||||||    
T  32219042 gtatctgactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactag-----------agtttgtctctttgtaacaaac 32219130  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  32219131 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattgggactttgggcagaattaggcggaaga 32219230  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |    
T  32219231 cttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctctcccagactatgccaatttggaccg 32219330  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32219331 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 32219362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 53918000 - 53917644
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||| |  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53918000 atacttttactataaatatagaccttgaatcagattaaaccttgagatggagggggctgaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgt 53917901  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917900 atagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 53917801  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53917800 gattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctc 53917701  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53917700 ccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53917644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 1313313 - 1313686
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||| || | |||     
T  1313313 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagg-tttacaatggcaac 1313411  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  1313412 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctta 1313511  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1313512 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaa 1313611  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1313612 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1313686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 1627016 - 1626663
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1627016 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 1626917  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1626916 gagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggac 1626817  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1626816 tttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcgcc 1626717  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1626716 cagactaggtcgatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 1626663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 26720396 - 26720821
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720396 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 26720494  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26720495 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaac 26720594  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26720595 actagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 26720693  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||    
T  26720694 cttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctctctcccctagattaggtcaatttggaccga 26720793  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26720794 actgggtcaccaaattcttttgtgttct 26720821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 53915850 - 53915476
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||     
T  53915850 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaccttaagatagagggggctgaaacaagggtttaggatgacaac 53915751  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  53915750 aacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttg 53915651  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  53915650 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttagtgaa 53915551  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53915550 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaattttgactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53915476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 43421743 - 43421395
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  43421743 actataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaaggggttgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtt 43421644  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||     
T  43421643 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgg 43421544  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43421543 gtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctctctcccccagac 43421444  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43421443 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43421395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 51727341 - 51726990
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  51727341 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgta 51727242  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |    
T  51727241 tagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgag 51727143  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  51727142 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctctctcc 51727043  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51727042 cccagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttct 51726990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 43228213 - 43228568
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  43228213 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgta 43228312  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43228313 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43228412  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  43228413 actttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43228512  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43228513 cccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 43228568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27101520 - 27101161
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaact----ttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  27101520 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaattgagatagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27101421  T
Q  330 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  27101420 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaa 27101321  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  27101320 tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  27101220 ctcccccagaataggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 27101161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 43423796 - 43423443
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43423796 cttttactataaatatagacattgtatcactgtaaaccttgagaaagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 43423697  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43423696 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 43423597  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  43423596 tttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctctctccct 43423497  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43423496 gagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43423443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 38889935 - 38890314
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggttt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||    |||||| |  ||||||||||||||    
T  38889935 gcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttgtat---agcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggttt 38890031  T
Q  304 agaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 403  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38890032 agaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggat 38890131  T
Q  404 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  38890132 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 38890231  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38890232 catatagtggatcggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38890314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 3314608 - 3314962
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3314608 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtata 3314707  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3314708 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggc 3314807  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3314808 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctctctccc 3314907  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3314908 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3314962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 206 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 12268329 - 12267955
Alignment:
Q  206 gtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||    
T  12268329 gtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaacttgtatcagagtaaactttgagatagagggagctgaaacaagagtttag 12268230  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 403  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12268229 aaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggat 12268130  T
Q  404 tgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| || |||||||||    
T  12268129 tgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgttactcat 12268041  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12268040 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccaaactagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 12267955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 25533333 - 25533716
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--------tagaggagattgaaacaagggtt 302  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||        |||||| |  |||||||||||||    
T  25533333 atttgttctaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagatagagggggctgaaacaagggtt 25533432  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25533433 tagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 25533532  T
Q  403 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  25533533 ttgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactca 25533632  T
Q  503 tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25533633 tcatatagtggatcggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 25533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5523024 - 5522610
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5523024 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 5522926  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||           ||||| |||||||||    
T  5522925 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaac 5522837  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5522836 actcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 5522737  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  5522736 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccga 5522638  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5522637 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 5522610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28102335 - 28101982
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||| ||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28102335 cttttactataaatataagcgttgtattagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28102236  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28102235 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggc 28102136  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  28102135 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctctctcccc 28102036  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |  ||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28102035 aaagctaggtcaatttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28101982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Original strand, 43226008 - 43226360
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||    
T  43226008 tactttcactataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgta 43226106  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  43226107 tagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 43226206  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  43226207 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcc 43226306  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  43226307 cctagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 43226360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 880785 - 880431
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  880785 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggtctgaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtata 880686  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  880685 gagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattgggg 880586  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  880585 ctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctctctccc 880486  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  880485 ctagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 880431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 4104257 - 4103879
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  4104257 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 4104158  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4104157 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 4104058  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||    
T  4104057 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcat 4103959  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4103958 atagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 4103879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 159 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 10191722 - 10191305
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10191722 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcaaatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 10191624  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagataga----ggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||    || |  || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10191623 gtatcggagcaaactttgagagagataaagggggctggaacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaac 10191524  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgg 454  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||| ||    
T  10191523 aaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagg 10191425  T
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgga 554  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  10191424 gagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctccctaagactaggtcaatttgga 10191325  T
Q  555 ctgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    | ||||| ||||||||||||    
T  10191324 ccgaactgggtcaacaaatt 10191305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 51943292 - 51943647
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51943292 atacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggtgctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 51943391  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51943392 atagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 51943491  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  51943492 ggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctc 51943590  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  51943591 ccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctcttgtgttctctc 51943647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 276 - 589
Target Start/End: Original strand, 42990268 - 42990581
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42990268 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 42990367  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42990368 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 42990467  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  42990468 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 42990567  T
Q  576 ttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||    
T  42990568 ttttgtgttctctc 42990581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28761764 - 28761407
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28761764 atacttttactataaatatagactttgcatcagagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgt 28761665  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  28761664 atatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattga 28761566  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  28761565 gactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctctct 28761466  T
Q  532 cccccagactatgtcaa-tttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28761465 cccccagactaggtcaattttggatcgaactgggtaaacaaattcttttgttttctctc 28761407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 236 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 5927097 - 5926746
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||    
T  5927097 cttttactataaatatagacattgtatcggtgtaaaccttgagatagagagggctgaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtata 5926998  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926997 gagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 5926898  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||     
T  5926897 ttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctctctcccg 5926798  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5926797 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc-tttgtgttctct 5926746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 234 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 9604947 - 9604587
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactaggg 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||      |||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||     
T  9604947 tactttcactataaatatagaccttgtattagagaaaactctgagagagagatagagggggctgaaacaagg-tttagaaaggcaacaacaaaactagga 9604849  T
Q  328 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9604848 tttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagag 9604749  T
Q  428 attgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 527  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  9604748 gttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgct 9604649  T
Q  528 ctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9604648 ctctcccccagactaggtcaatttagaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 9604587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 47149233 - 47148875
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgag----atagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||    ||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47149233 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaggccttgagggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 47149134  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttggaa-caaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47149133 gtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaa-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagat 47149035  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47149034 tgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctct 47148935  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  47148934 ctcccccagactatgtcaatttggcccgaactaggtcaacaaattattctgtgttctctc 47148875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 276 - 589
Target Start/End: Original strand, 30005805 - 30006118
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30005805 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 30005904  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30005905 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 30006004  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30006005 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagattagatcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 30006104  T
Q  576 ttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||    
T  30006105 ttttgtgttctctc 30006118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 36011751 - 36012104
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  36011751 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtata 36011850  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  36011851 gagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgac 36011950  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |      
T  36011951 tttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctctcttctt 36012050  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36012051 cagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 36012104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 197 - 589
Target Start/End: Original strand, 15780745 - 15781156
Alignment:
Q  197 attttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||    
T  15780745 attttttgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttggagatagagggggctgaaaca 15780844  T
Q  297 agggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 385  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780845 agggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctt 15780944  T
Q  386 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata---- 481  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        
T  15780945 gggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatt 15781044  T
Q  482 tctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagaggg---ctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||  ||||   ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15781045 tctcttttgtaaagttatttatcattatagtggaacgaagggcgcctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattctt 15781144  T
Q  578 ttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||    
T  15781145 ttgttttctctc 15781156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 199 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6066167 - 6065779
Alignment:
Q  199 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaa 297  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |   ||||||||    
T  6066167 tttttgggagcagatttgttacagattttaagcagaacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagaggggggctgaaacaa 6066068  T
Q  298 gggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 397  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6066067 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 6065968  T
Q  398 taggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagt 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  6065967 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacga 6065869  T
Q  497 tactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     ||||||||||||||| |   || ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  6065868 aactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccctagactaggtcagattggacagaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 6065779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 746650 - 747031
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  746650 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 746749  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  746750 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 746849  T
Q  405 -gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||    
T  746850 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcat 746948  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  746949 catatagtggatcggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 747031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6063809 - 6063429
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttag 305  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||    
T  6063809 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttag 6063710  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt- 404  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6063709 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 6063610  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||    
T  6063609 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatc 6063511  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||    
T  6063510 atatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaaatttctttgtgttct 6063429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 51675083 - 51674746
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||            
T  51675083 actataaatatagacgttgtatcaatgtaaacgttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgt-------- 51674992  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  51674991 ---ccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttgg 51674895  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  51674894 atagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctctctcccccatac 51674795  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674794 caggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 51674746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 39715400 - 39715742
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||| ||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39715400 ctataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggggct-gaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagttt 39715498  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39715499 gtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggg 39715598  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| || ||  |||||||||| |||    
T  39715599 tagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtgaaacagatggttg--ctctcccccatact 39715694  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |  ||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39715695 agatcattttggaccaaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39715742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 53468788 - 53468433
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||| |  |||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  53468788 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctttagataaagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtata 53468690  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53468689 gagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggac 53468590  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  53468589 tttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctacccc 53468490  T
Q  535 ccag--actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||  |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53468489 ccagacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 53468433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 50493895 - 50494273
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  50493895 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 50493994  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-ga 406  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  50493995 aagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgga 50494094  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||||||||    
T  50494095 gtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcat 50494193  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  50494194 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 50494273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 237 - 528
Target Start/End: Original strand, 6561735 - 6562028
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  6561735 tttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 6561834  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561835 agtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 6561934  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||| | | |||||||||||    
T  6561935 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 458179 - 458558
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  458179 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 458278  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-g 405  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  458279 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 458378  T
Q  406 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||    
T  458379 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca 458477  T
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  458478 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 458558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 159 - 477
Target Start/End: Original strand, 35777270 - 35777587
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||    
T  35777270 tggcacgatggtgcgctggcagcaaa-aacataaacatatttt-tgggtgcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagacatt 35777367  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35777368 gtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 35777467  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35777468 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 35777567  T
Q  458 acttattcttgtaacccatt 477  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  35777568 acttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 455802 - 456181
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  455802 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 455901  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-g 405  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  455902 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgg 456001  T
Q  406 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||    
T  456002 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatca 456100  T
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  456101 tatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcgggttggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 456181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 316 - 586
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321753
Alignment:
Q  316 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  416 ttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaa 515  Q
    |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |     
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T
Q  516 cagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1321683 cggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1321753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 25388794 - 25389179
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag---------gagat-tgaaacaa 297  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||| ||||         ||||  ||||||||    
T  25388794 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcaggctat--tttgagagagagagagagagagagagctgaaacaa 25388891  T
Q  298 gggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 397  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25388892 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactat 25388990  T
Q  398 taggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagt 496  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||    
T  25388991 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgt 25389089  T
Q  497 tactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25389090 tactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 25389179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 54691906 - 54691554
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||| | |  |||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  54691906 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggta-aaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtata 54691808  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| || |    
T  54691807 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggc 54691708  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  54691707 tttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctctctcccc 54691608  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||    
T  54691607 tagactatgtcaatttgaactgaactaggtcgacaaattcttttatgttttctc 54691554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 10621900 - 10621513
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag---gagat---------tgaaacaag 298  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||   |||||         |||||||||    
T  10621900 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagagatagagggtgctgaaacaag 10621801  T
Q  299 ggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 398  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621800 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 10621701  T
Q  399 aggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagtt 497  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |    
T  10621700 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 10621602  T
Q  498 actcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  10621601 actcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 10621513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 325 - 589
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484637
Alignment:
Q  325 gggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggga 423  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  424 agagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggc 523  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggc 6484571  T
Q  524 tgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6484572 tgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6484637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 236 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 890104 - 889781
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||| | ||| ||  || ||||||||||||||    
T  890104 cttttactataaatatagatattgtatcagtgtaaaccttgagatagaggaagctgaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtata 890007  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  890006 gagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttgggg 889908  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  889907 ctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgatttctccc 889808  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
     ||||||| |||||||||||| |||||    
T  889807 gcagactaggtcaatttggaccgaact 889781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 234 - 541
Target Start/End: Complemental strand, 35918284 - 35917971
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  35918284 tactttcactataaatatagaccttgtatcatagcaaattttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 35918185  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacac------tagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  35918184 tagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagag 35918085  T
Q  428 attgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 527  Q
    | ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  35918084 actgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgct 35917985  T
Q  528 ctctcccccagact 541  Q
    ||||||| ||||||    
T  35917984 ctctccctcagact 35917971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 209 - 586
Target Start/End: Original strand, 38210265 - 38210644
Alignment:
Q  209 cagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    |||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||   |||||||    |||||| |  |||||||||||||||    
T  38210265 cagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatataggccttgtatcaggctat--tttgagagagatagagggggctgaaacaagggttta 38210362  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38210363 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 38210462  T
Q  405 -gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |  ||||||    
T  38210463 ggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 38210561  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |   ||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  38210562 catatagtggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 38210644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 302 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413014
Alignment:
Q  302 ttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 401  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  402 attg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  501 catcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaa-ttcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaattaggtcaacaaatttcttttgtgttct 28413014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 276 - 533
Target Start/End: Original strand, 29956650 - 29956907
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29956650 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggtt 29956749  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29956750 gattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactca 29956849  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  29956850 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcc 29956907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 334 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606571
Alignment:
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||||| |||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctctctcc 7606624  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7606623 cccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7606571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 571
Target Start/End: Original strand, 53591119 - 53591442
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||         
T  53591119 cttttactataaatatagacattgtataagtgtaaaccttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggttt----- 53591213  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
          |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  53591214 ------gtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggat 53591307  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||    
T  53591308 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctctct-ccc 53591406  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||    
T  53591407 cagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaacaa 53591442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 363 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688140
Alignment:
Q  363 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  463 ttcttgtaacccattgatatctcttttg-aaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaact 25688168  T
Q  562 tggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||| || |||||||||||||||||    
T  25688167 gggtcaaaaagttcttttgtgttctctc 25688140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 217 - 589
Target Start/End: Original strand, 42992186 - 42992547
Alignment:
Q  217 ttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagac 311  Q
    |||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||||    |||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |    
T  42992186 ttccaaatttatgagttatacttttactataaatatataccttgtatcatgctaaactttaagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggc 42992285  T
Q  312 aaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42992286 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 42992385  T
Q  412 ttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagt 511  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||               ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  42992386 ttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagt 42992469  T
Q  512 gaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42992470 gaatcggggggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaatttttttgtgttctctc 42992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 233 - 589
Target Start/End: Original strand, 23633381 - 23633730
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |  | |||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  23633381 atacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatagagagggctaaaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgt 23633479  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  23633480 atagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 23633574  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  23633575 gactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctctct 23633673  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||||||| |||||||| ||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  23633674 -ccccagactaggtcaatttagaccgaaatgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 23633730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 236 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 28100374 - 28100143
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  28100374 cttttactataaatataagcgttgtatcagagtaacccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtata 28100275  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  28100274 gagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggc 28100175  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattctt 467  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28100174 tttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 31151271 - 31151622
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||| |  ||||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  31151271 cttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgta 31151369  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  31151370 tagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattggg 31151466  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca-tcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31151467 actttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctctctc 31151564  T
Q  533 ccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  31151565 ccccagactaggtcagttttgggctgaactgggtaaacaaattctcatgtgttctctc 31151622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 158; E-Value: 9e-84
Query Start/End: Original strand, 159 - 380
Target Start/End: Original strand, 11162998 - 11163218
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||    
T  11162998 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttacgataaatatagacctt 11163096  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163097 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 11163196  T
Q  359 actagggtttgagggttgattc 380  Q
    ||||||||||| || |||||||    
T  11163197 actagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 373 - 588
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886474
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaa 572  Q
    |||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5886458  T
Q  573 ttcttttgtgttctct 588  Q
    ||||||||||||||||    
T  5886459 ttcttttgtgttctct 5886474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 333 - 589
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666791
Alignment:
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
       |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4666735 ---ccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttctctc 4666791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 360 - 589
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232077
Alignment:
Q  360 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagac 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  460 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagtg-aacggagggctgctgtctccccccgattaggtcaatttggaccga 6232046  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6232047 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6232077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 472
Target Start/End: Original strand, 28180948 - 28181182
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28180948 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaata--ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 28181045  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28181046 gagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattggttacgggaagagattgggac 28181145  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 472  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181146 tttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 547
Target Start/End: Original strand, 53597162 - 53597472
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| || | ||| || |||||||||| ||||    
T  53597162 atacttttactataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggat-gaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgt 53597259  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||     
T  53597260 atagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattga 53597356  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||    
T  53597357 gattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctctct 53597456  T
Q  532 cccccagactatgtca 547  Q
    ||| || |||| ||||    
T  53597457 cccacaaactaggtca 53597472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 373 - 588
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899947
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaa 572  Q
    |||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaa 5899931  T
Q  573 ttcttttgtgttctct 588  Q
    ||||||||||||||||    
T  5899932 ttcttttgtgttctct 5899947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 376 - 586
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168375
Alignment:
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaacttggtcaacaaattc 11168364  T
Q  576 ttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||    
T  11168365 ttttgtgttct 11168375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27635955 - 27635638
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27635955 actacaaatatagaccttgaattagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 27635856  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| |||||||||||||||||                   || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||            |||||     
T  27635855 tgtctcttgggaacaaacactagggt-------------------gggaaacaatattaagattgagtctcttggttacggg------------ctttgg 27635787  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27635786 gtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagac 27635687  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27635686 taggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 27635638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 319 - 589
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795536
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
    ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||     
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 17795464  T
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17795465 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 17795536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 319 - 589
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103976
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
    ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||     
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacg 19103904  T
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19103905 gaaggctgctctctcccctagactaggtcaatttgaaccgaattaggtaaacaaattctcttgtgttctctc 19103976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 243 - 489
Target Start/End: Original strand, 23636958 - 23637200
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| ||    
T  23636958 tataaatatatactttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctaaaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg 23637056  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
     ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||| ||    
T  23637057 -ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggt 23637153  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23637154 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 244 - 506
Target Start/End: Original strand, 54884089 - 54884348
Alignment:
Q  244 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg-agattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||| || ||| ||||  |||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||||||    
T  54884089 ataaatataaacattggatcattgtaaaccttgagatagagggagctcgaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttg 54884185  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| |    
T  54884186 tttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaat 54884285  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54884286 agaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 54884348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 13420508 - 13420222
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| |||||||||||||   |||||||| || |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||          ||  ||||||||||||||    
T  13420508 atacttttactataaatataggttttgtatcaaagcaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggttta----------aatcaaactagggtttgt 13420419  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  13420418 atagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 13420323  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| || ||| ||| ||||||||||    
T  13420322 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagctgctctct 13420223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 319 - 535
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635605
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattatggtgaaaca 25635587  T
Q  518 gagggctgctctctcccc 535  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  25635588 gagggttgctctctcccc 25635605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 319 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561797
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtta 418  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  419 cgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaaca 517  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||     
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacg 561828  T
Q  518 gagggctgctctctccc-ccagactatgtca 547  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  561827 aagggctgctctctccctccagactaggtca 561797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 28137628 - 28137415
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||              
T  28137628 cttttactataaatatatgcgttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactag---------- 28137539  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28137538 -agtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggggc 28137440  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagact 460  Q
    |||| |||||||||||||| |||||    
T  28137439 tttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 416
Target Start/End: Original strand, 24177127 - 24177380
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||    
T  24177127 tggcacgatggtgcgttggaggcgaaaaacataaacgtatttttaag-tgcagatttgttccaaattttaagggatacttttattataaatatagacctt 24177225  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||| |  || ||||||| |||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  24177226 gtatcatagtaaacattgagctagagggggctgaaaacaagagtttag-atgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaa 24177323  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177324 cactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 390 - 589
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3307037
Alignment:
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  490 gaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||  || || ||||||||  || |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattatagtgaaaaggatggttgctctct--cctagactaggtcaatttggaccgaactaggttaacaaattcttttgtgttctct 3307036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 290 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 36871577 - 36871323
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    ||||||||||||||| || | ||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  36871577 tgaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaa 36871482  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 488  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||    
T  36871481 aacactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tt 36871383  T
Q  489 tgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36871382 tgtaaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtca 36871323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 441 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 47701799 - 47701652
Alignment:
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  47701799 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccagat 47701700  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    || |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  47701699 taggtcaatttggatcgaactggatcaacaaattcttttgcgttctct 47701652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 500
Target Start/End: Original strand, 1673896 - 1674160
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaac-aagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||  ||||| ||  |||||  |||||||||||| |  || || |||||||| ||||    
T  1673896 atacttttactataaatatagaacttgtatcaaaagtaaaccttgatgtagag-agtctgaaaataagggtttagaa-gttaacaagaaaactagtgttt 1673993  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1673994 gtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagatt 1674090  T
Q  431 gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  1674091 gggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 212 - 404
Target Start/End: Original strand, 41849041 - 41849244
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----------tagaggagattgaaacaaggg 300  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||          |||||| |  |||||||||||    
T  41849041 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagacattgtatcaggctaaactttgagagagagatagatagagggggctgaaacaaggg 41849140  T
Q  301 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 400  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41849141 tttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattag 41849240  T
Q  401 gatt 404  Q
    ||||    
T  41849241 gatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 309
Target Start/End: Original strand, 1321289 - 1321438
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  1321289 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacttt 1321387  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1321388 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaag 1321438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 4560601 - 4560355
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||  || |||||||||||           
T  4560601 atactttcactataagtatagactatgtatcatagtaaacattgagatagagggggctgaaacaatggtttataaaggtaacaacaaaactag------- 4560509  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
        |||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  4560508 ----agtttgtctct--------aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattgg 4560421  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
      ||||| |||||||||||| |    |||    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  4560420 agctttgggtagaattaggcag----ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 236 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47701928 - 47701798
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  47701928 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagataaagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 47701829  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggt 366  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47701828 gagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 496 - 589
Target Start/End: Original strand, 41849243 - 41849336
Alignment:
Q  496 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41849243 ttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 41849336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620483
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||   | || ||  ||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaac 1620558  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || |||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1620557 cctttgatatctc-tttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtca 1620483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 418 - 547
Target Start/End: Original strand, 24181486 - 24181616
Alignment:
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaac 516  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  24181486 acgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac 24181585  T
Q  517 agagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
     || | ||||||||||| ||| |||| ||||    
T  24181586 ggatgactgctctctcctccaaactaggtca 24181616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 241 - 365
Target Start/End: Original strand, 6231378 - 6231502
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||  |  |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6231378 actataaatatagacattgtatcagtgtaaatcttgagatagagcgggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt 6231477  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactaggg 365  Q
    |||||||| | ||||||||||||||    
T  6231478 tgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 455 - 589
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634164
Alignment:
Q  455 gagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttgg 553  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||| | |||||||     
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctctctccaccagactaggacaatttgc 25634129  T
Q  554 actgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  25634130 accgaactaggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 25634164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 355
Target Start/End: Original strand, 3306728 - 3306842
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  3306728 actataaatatagacattgtatcagtgtaaacctagagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtt 3306827  T
Q  341 tgtctctttggaaca 355  Q
    |||||||||||||||    
T  3306828 tgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 472  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||   | ||||| ||||||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  473 ccattgatatctcttttgaaaagttactcatcata 507  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 505 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35919179 - 35919098
Alignment:
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35919179 atatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 35919098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 518 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 53894108 - 53894040
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53894108 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 53894040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 541
Target Start/End: Original strand, 13419864 - 13420110
Alignment:
Q  291 gaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 390  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||    
T  13419864 gaaacaaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaa 13419957  T
Q  391 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac-ccattgatatctcttt 488  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||   | |||| |||||||| ||  || ||| | ||| |||||||    |||||||||| ||    
T  13419958 acactattaggatcaagtctcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatttggttggaagaataatttttgtaacatttttgatatctc-tt 13420056  T
Q  489 tgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    || |||||||||||||| ||||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  13420057 tgtaaagttactcatcattatagtggaatagtggactcctctctcccccagact 13420110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768709
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||||| ||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 53896557 - 53896480
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagagg 285  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  53896557 gcagatttgttacagattttaagcaggactttcactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagg 53896480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 6719472 - 6719396
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6719472 gcagatttgttacagattttaagcaagacttttactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagag 6719396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 416
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6719542 - 6719472
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaag 230  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  6719542 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacata-tttttgggtgcagatttgatacagattttaag 6719472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007545
Alignment:
Q  401 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||         | |||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg---------ttttcttgtaactctttgacatctcttttgtaaagttact 11007593  T
Q  501 catca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||||| ||||||| ||  | ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11007592 catcattatagtggaatggggggctcctctctcccctagactaggtca 11007545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 38889865 - 38889923
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38889865 tggcacgatggtgcgctggcggcgaataacagaaacata-tttttgggtgcagatttgtt 38889923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 586
Target Start/End: Original strand, 16996874 - 16997074
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||||||   | ||||| |||||| |||  |  | ||||||||    
T  16996874 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattaggtttgaagactaattcttataattctctaatatctct 16996972  T
Q  487 tttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||  |||||  || ||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||||||||||| || | | | |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  16996973 ttgtaaaagaaacacatcattatagtggaacggagaactgctcactcccccagactaggtaagtatgggactgaactgggtaaacaaattctcttgtgtt 16997072  T
Q  585 ct 586  Q
    ||    
T  16997073 ct 16997074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094195
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201075
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626105
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29913980
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 29914054  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| | |  || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29914053 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctctctcccccagactaggtca 29913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Original strand, 13893269 - 13893345
Alignment:
Q  186 aacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  13893269 aacagaaacgtattttcag--tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatatagacattgtatca 13893345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303358
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100225
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 10100225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878165
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 47878272  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtc 566  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| | || ||| ||||| |||     
T  47878271 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcctccagactaggtcattattagaccgaactgggta 47878176  T
Q  567 aacaaattctt 577  Q
    |||||||||||    
T  47878175 aacaaattctt 47878165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 42990181 - 42990254
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  42990181 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatgctaaactttgagagagag 42990254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208121
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 234 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25690691 - 25690651
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25690691 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactt 25690651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Original strand, 26762839 - 26762919
Alignment:
Q  186 aacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26762839 aacataaacgtattttttgggcttagatttgttccaattttttagggatgcttttactataaatataaaccttgtatcaga 26762919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544311
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 352 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  352 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193287
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 451
Target Start/End: Original strand, 4535613 - 4535675
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  4535613 aaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46966997 - 46966938
Alignment:
Q  207 tgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  46966997 tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaacattgtatcaga 46966938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 547
Target Start/End: Original strand, 11079516 - 11079674
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   |||||||     
T  11079516 aaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggacttag-gtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctc- 11079610  T
Q  487 tttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  11079611 tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 11079674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031452
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 20031452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 29956586 - 29956636
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  29956586 tactttcactataaatatagactttgtattagagcaaactttgagagagag 29956636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 284
Target Start/End: Original strand, 30005741 - 30005791
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  30005741 tactttcactataaatatagactttgtattagagcaaactttgagagagag 30005791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 388 - 437
Target Start/End: Original strand, 7418063 - 7418112
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7418063 aaaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  356 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg 401  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 234 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27101595 - 27101562
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagag 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101595 tactttcactataaatatagaccttgtatcagag 27101562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 405 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 46966816 - 46966633
Alignment:
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    |||||||||| | |||| || ||||| ||||||||| |||||||||||   || |||| ||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||  |||||    
T  46966816 gagtctcttgctcacggaaaaagattcgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattattgtaaccatttgatatctc-tttgtaaagaaactca 46966718  T
Q  503 tca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||| | | | |||||||| ||||| |||||    
T  46966717 tcattatagtggaacagagagctgccctct-ccccagagtaggtcaatattggactgaattggataaacaaattattttgcgttct 46966633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858701
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 5858625  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5858626 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 5858701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897066
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 533 - 589
Target Start/End: Original strand, 42992607 - 42992663
Alignment:
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||| |||||||    
T  42992607 ccccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaaaaaattcttttgtattctctc 42992663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188570
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 5886181 - 5886240
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagag 267  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5886181 gcagatttgttacagattttaagcgaaacttttactataaatatagaccttttatcagag 5886240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Original strand, 5899656 - 5899715
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagag 267  Q
    ||||||||||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5899656 gcagatttgttacagattttaagcgagacttttactataaatatagaccttttatcagag 5899715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 1618994 - 1618948
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  1618994 atactttgactataaatatagaccttgtaccatagtaaaccttgaga 1618948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 300
Target Start/End: Original strand, 6484315 - 6484373
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaaggg 300  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  6484315 ctataaatataggcattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaggg 6484373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949404
Alignment:
Q  393 actattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002917
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38002917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1618857 - 1618824
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1618857 ttgattcaccttggaaaacactattatgattgag 1618824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Original strand, 1736335 - 1736388
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  1736335 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 1736388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Original strand, 18552913 - 18552966
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  18552913 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 18552966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 26299045 - 26298992
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||| |||||||||    
T  26299045 gagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaa 26298992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 26763021 - 26763101
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||| | |||||||||||    
T  26763021 ttgattcaccttggacaaaacattattaggataaagtctcttggttatgggaagaaattcgagacttcgggtagaattagg 26763101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Original strand, 30709820 - 30709873
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  30709820 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 30709873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 272
Target Start/End: Original strand, 4663843 - 4663879
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaac 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4663843 cttttactataaatatagacattgtatcagagtaaac 4663879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 437
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893510
Alignment:
Q  397 ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 13893510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20031692 - 20031611
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttc-actataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    ||||||||||||||||||  |  || |||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  20031692 ataacagaaacgtattttccg--tgaagatttgttccatattttaaggattactttcgactataaatataagtcttgtatcaga 20031611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 509 - 561
Target Start/End: Original strand, 28181185 - 28181236
Alignment:
Q  509 agtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  28181185 agtgaaacggaaggctgctctctccct-agactaggtcaatttggactgaact 28181236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153361
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 39153361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Original strand, 51398938 - 51398982
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  51398938 tctctcccccagattaggtcaagttggaccgaacttggtcaacaa 51398982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 110)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 163 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 40032465 - 40032035
Alignment:
Q  163 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtat 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40032465 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaagttttaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 40032367  T
Q  263 cagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40032366 cagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 40032267  T
Q  363 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactta 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40032266 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagactta 40032167  T
Q  463 ttcttgtaacccattgata----tctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  40032166 ttcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctctctccctcagactaggtcaatttggaccg 40032067  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  40032066 aactgggtcaacaaattcttttgtattctctc 40032035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21521106 - 21520675
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  21521106 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaaatttaagcgatacttttactataaatataaacctt 21521008  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||| | |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21521007 gtatcagactaaactttgagagatagatggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaa 21520908  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21520907 acactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcggga 21520808  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21520807 gactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 21520708  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21520707 gaactttgtcaacaaattcttttgtgttctctc 21520675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 162 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6259223 - 6258799
Alignment:
Q  162 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgta 261  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6259223 cacgatggtgcgctggcggtgaataacagaaacatattttt-gggtgcagacttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 6259125  T
Q  262 tcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 361  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6259124 ttagactaaactttgagatagaggaggatgaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacact 6259025  T
Q  362 agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactt 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6259024 agggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagactt 6258927  T
Q  462 attcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaac 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  6258926 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctctct-ccccatactaggtcaatttggaccgaac 6258828  T
Q  561 ttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6258827 tgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6258799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 13910455 - 13910030
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  13910455 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacctt 13910357  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13910356 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 13910257  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13910256 actagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggaga 13910157  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  13910156 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 13910058  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13910057 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 13910030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22287747 - 22287318
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22287747 tggcaccatggtgcgctggcagcgaataacaaaaatgtatgttt-gggtgcatatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 22287649  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22287648 gtattaaagtaaactttgagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaac 22287549  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||| |||||||||    
T  22287548 attagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggaga 22287449  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  22287448 cttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccga 22287349  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22287348 actgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22287318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 6264556 - 6264130
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6264556 tggcacgatggtgcattagcggcgaataacagaaacatattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatatttttactataaatatagacctt 6264458  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6264457 gtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaac 6264362  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||  ||||||||| |||||||    
T  6264361 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggaga 6264262  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  6264261 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccg 6264162  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6264161 aactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 6264130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 42064359 - 42064785
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42064359 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttag-tgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 42064457  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42064458 gtatcagagcaaacttggagatagagggagctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 42064557  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||||||||    
T  42064558 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggaga 42064657  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtc-aatttggactg 557  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  42064658 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaaatttggaccg 42064756  T
Q  558 aacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42064757 aactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19504756 - 19504331
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  19504756 tggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacacatttttagg-tgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacctt 19504658  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19504657 gtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 19504558  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    || ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19504557 acaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 19504459  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19504458 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctatctcccccagactaggtcaatttggaccga 19504359  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19504358 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 19504331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 27104643 - 27105067
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  27104643 tggcacgatggtgcgctggcagggaaaaacataaacatattttt-gagtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 27104741  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  27104742 gtatcagagaaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa- 27104840  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27104841 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 27104940  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27104941 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacattactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 27105039  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27105040 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 27105067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 43623978 - 43623562
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  43623978 tggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcaatacttttactataaaaatagacctt 43623881  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                
T  43623880 gtatcagagtaaactgggagatagaggggggtgaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------ 43623793  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43623792 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 43623693  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  43623692 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttggaccga 43623593  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43623592 actaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 43623562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 19502422 - 19501996
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||  | | ||| ||||||||||||||||||    
T  19502422 tggcacgatggtgcgctggcgacgaataacagaaacatattttt-ggttgcagatttgatccaaattttaagggaaaattttactataaatatagacctt 19502324  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  19502323 gtatcagagcaaacttggagataaagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaac 19502224  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19502223 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 19502124  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19502123 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 19502024  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19502023 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 19501996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 42923867 - 42923491
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagaca 312  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| | ||    
T  42923867 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcatagtaaaccttgagagatagaggaggctgaaacaagggtttagaatggca 42923768  T
Q  313 aaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 412  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923767 acaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 42923668  T
Q  413 tggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  42923667 tggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcatatagtg 42923568  T
Q  513 aaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42923567 aaacggagggctgctctctcccctatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42923491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45280322 - 45279969
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaaga-caaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  45280322 tactttcactataaatatataccttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 45280223  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  45280222 atagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 45280123  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  45280122 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctc 45280023  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45280022 ccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 45279969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 588
Target Start/End: Original strand, 19007560 - 19007912
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||    
T  19007560 cttttactataaatataggctttgtatcatagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtata 19007659  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  19007660 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggc 19007759  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19007760 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctctctcccc 19007859  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctct 588  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19007860 cagactaggtcaatttggaccgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctct 19007912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 24162623 - 24162208
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  24162623 tggcacgattgtgcgctggctgcgaatattagaaacgtattttt-gggtgcagatttgtttcaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 24162525  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24162524 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 24162425  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |          |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24162424 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggaga 24162335  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24162334 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgctactcatcatatagtggattggatggctgctctctcccccggactaggtcaatttggaccga 24162236  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24162235 attgggtcaacaaattcttttgtgttct 24162208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 23452601 - 23452222
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----ggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    || |  |||||||||||||||||    
T  23452601 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagacagagggggctgaaacaagggtttaga 23452502  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  23452501 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattga 23452402  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  23452401 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 23452302  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23452301 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 23452222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11739895 - 11739541
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  11739895 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctggaacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatg 11739796  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  11739795 gagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttataggaagagattgggac 11739696  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  11739695 tttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 11739596  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11739595 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11739541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 42452678 - 42453050
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaaga 310  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  42452678 atttgttccaaatttatgagttatacttttattataaatatagacattgtatcagagcaaacttggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 42452777  T
Q  311 caaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 410  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42452778 caacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 42452875  T
Q  411 cttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatag 510  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  42452876 cttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 42452975  T
Q  511 tgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || | | |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42452976 tggatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 42453050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 28196557 - 28196908
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28196557 cttttactataaatatatgctttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 28196656  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  28196657 gagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggc 28196756  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  28196757 tttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctctctcccc 28196856  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28196857 cagactaggtcaatt--gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 28196908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 17849037 - 17849390
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||    
T  17849037 cttttactataaatataaacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtata 17849136  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17849137 gagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagac 17849236  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17849237 tttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaac-gggggctgctctctccc 17849335  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     || |||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17849336 acatactaggtcaatttggacaagactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17849390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 17848365 - 17848713
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||  ||| | |||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17848365 cttttactataaatataggctttgtatcag--taatccttgagatagagggggctcaaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 17848462  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17848463 gagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagg 17848562  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  17848563 ctttgggtagaa---ggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctctctccc 17848658  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17848659 ccatactaggtcaatttggactgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 17848713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 14837193 - 14837541
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14837193 cttttactgtaaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatagagggagctgaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtaca 14837292  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||    
T  14837293 tagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt------gggaagagattgagac 14837386  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  14837387 tttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctctctccc 14837486  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14837487 ccagactaggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 14837541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Original strand, 3022088 - 3022445
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3022088 actataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatataggaggctgaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtt 3022187  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||      
T  3022188 tgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttag 3022287  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca----------tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||          |||| ||||||||| ||||||||||    
T  3022288 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagttactcatcattatcatcgttataatgaaacagatggctgctctc 3022386  T
Q  531 tcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3022387 tcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 3022445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 244 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 34979906 - 34979559
Alignment:
Q  244 ataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 343  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||    
T  34979906 ataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgt 34979807  T
Q  344 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagta 443  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||    
T  34979806 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggta 34979707  T
Q  444 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct-ctcccccagact 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||| |||  |||||| |||| | |||||| |||    
T  34979706 gaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactctccccccccaaact 34979607  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34979606 aggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 34979559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 44289403 - 44289049
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| || |||| |||| ||||||| || | |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  44289403 cttttactataaatataggttttgtatcatagcaaaccttgatatagaggggactaaaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 44289304  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44289303 gagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggac 44289204  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    || | ||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  44289203 ttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattatagtgaaacagatggttgctctttccc 44289104  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44289103 ccaaactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44289049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 236 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45239316 - 45239000
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||| |||||| ||    |||||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239316 cttttactataaatatagaccattcatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggctgaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 45239217  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239216 gtatagactt--tctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 45239119  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    ||||  |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45239118 tggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 45239019  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaa 548  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  45239018 ctcccccagactaggtcaa 45239000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35215956 - 35215571
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-gagat---------tgaaacaaggg 300  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||         |||||||||||    
T  35215956 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaaggg 35215857  T
Q  301 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 400  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35215856 tttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattag 35215757  T
Q  401 gatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttac 499  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |  ||    
T  35215756 gattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaaac 35215658  T
Q  500 tcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  35215657 tcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 35215571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 241 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 15539805 - 15539556
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtt 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15539805 actataaatatagacattgtatcagtgtaaaccttgagatatagggggttgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtt 15539706  T
Q  341 tgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttga 440  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15539705 tgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgg 15539606  T
Q  441 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15539605 gtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttg 15539556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31733100 - 31732772
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  31733100 cttttactataaatatagactttgtaacagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 31733001  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||            |||||||    
T  31733000 gagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggac 31732913  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  31732912 tttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctctctccc 31732813  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    |||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  31732812 ccagactaggtcaatttggaccgagctgggtaaacaaattc 31732772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 18800712 - 18800295
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18800712 tggcacgatggtgcgctagaggcgaa-aacagaaacatatttttaag-tgcagatttgttccaaattttaaacgatacttttactataaatatagacctt 18800615  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||| |  |||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||    
T  18800614 gtatcagggtaaacatggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aagctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaac 18800524  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18800523 actagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattggggctttgggtagaattaggagggaga 18800427  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggact 556  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||||  |||||||     
T  18800426 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggctactctct-ccccagaccaggtcagttttggacc 18800328  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18800327 aaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 18800295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 159 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22407820 - 22407593
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22407820 tggcacgatggtgcgttggcagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttcaaaattttaagcaatacttttactataaatatagacctt 22407722  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407721 gtatcagagtaaactgtgagatatagggtgctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 22407622  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttgg 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407621 actagggtttgagggttgattcaccttgg 22407593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 35218258 - 35217948
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  35218258 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggtt 35218159  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 474  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35218158 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 35218059  T
Q  475 attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     ||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||     
T  35218058 gttgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaata 35217960  T
Q  575 cttttgtgttct 586  Q
      ||||||||||    
T  35217959 tctttgtgttct 35217948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 366 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375328
Alignment:
Q  366 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattc 465  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgg-agacttattc 5375452  T
Q  466 ttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggt 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggt 5375352  T
Q  566 caacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5375351 caacaaattcttttgtgttctctc 5375328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 160; E-Value: 6e-85
Query Start/End: Original strand, 191 - 542
Target Start/End: Complemental strand, 11578485 - 11578137
Alignment:
Q  191 aaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaata-ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat 289  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||||||| |||| ||  ||  |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||  |      
T  11578485 aaacgtatttttaggggcctgatttgttccaatttttgagggattgcttttactataaatatagaccttatatcagggtaaatcttgagatagagtgggc 11578386  T
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 389  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| || |    
T  11578385 tgaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcggga 11578291  T
Q  390 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11578290 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 11578191  T
Q  490 gaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    | || ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11578190 gtaaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctctttcccccagacta 11578137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 242 - 589
Target Start/End: Original strand, 22874068 - 22874404
Alignment:
Q  242 ctataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| |||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||    
T  22874068 ctataaatacaggctttgtatcagagcaaacctggagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagagttt 22874159  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    | ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||  |    
T  22874160 g-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaagagattgaggctttcgg 22874255  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||    
T  22874256 tagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagctgctctctccctcatac 22874355  T
Q  541 tatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || |||||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22874356 taggtcaatttggaccgaattgggtaaacaaattctcttgtgttctctc 22874404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 326 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459172
Alignment:
Q  326 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  426 agattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggct 524  Q
    || ||||| |||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggct 28459236  T
Q  525 gctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||||  || |||||| |||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  28459235 tctctct-acctagactaggtcaatttggatcgaactagataaacaaattcttttgtgttctctc 28459172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 241 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 20146937 - 20146632
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt--gagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtataga 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  20146937 actataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttaagaggtaga-gagtttgaaaacaagggtttag-aagtcaacaagaaaactagggtttgtataga 20146840  T
Q  338 gtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||| | ||| | ||||||||||| ||||   || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  20146839 gtttg-cccttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattt 20146743  T
Q  438 tgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  20146742 tgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctccctc 20146643  T
Q  537 agactatgtca 547  Q
    |||||| ||||    
T  20146642 agactaagtca 20146632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 233 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 17897580 - 17897281
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattga-aacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||    
T  17897580 atacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagag-agtctgagaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggttt 17897483  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||    
T  17897482 gtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagatt 17897387  T
Q  431 gggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||    
T  17897386 gagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatggctgctct 17897287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 429 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407436
Alignment:
Q  429 ttgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc 528  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  529 tctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407496 tctcccccagactaggtcaatttggaccgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22407436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558849
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36558948  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36558849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561126
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36561225  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 36561126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 236 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 22163282 - 22163106
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  22163282 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtata 22163183  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 413  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22163182 gagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332166
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-t 45332265  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatatctttgtgttct 45332166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 452 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707733
Alignment:
Q  452 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctc--tctcccccagactatgtcaat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctctcctccagactaggtcaat 22707773  T
Q  550 ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22707772 ttggactgaactaggtcaacaaattcttttgtgttctctc 22707733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 207 - 589
Target Start/End: Original strand, 35107191 - 35107569
Alignment:
Q  207 tgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaac-aagggtttag 305  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| ||  | |||| ||| ||||||    
T  35107191 tgcagatttgttccaaattttaagggatacttttactataaatatagacattgtatcatagtaaaccttgaggtagag-agtctaaaaccaagagtttag 35107289  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg 405  Q
    || | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  35107290 aa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg 35107382  T
Q  406 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||     | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||    
T  35107383 agtctcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcat 35107481  T
Q  504 ca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||| ||| || || || |||||  ||||||||| |||| | |||||| ||| | ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  35107482 cattatagtggaacggatggttgttctctttcccagactaggtcagtattggaccgaaataggtaaacaaatatttttgtgttctctc 35107569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 372 - 547
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699606
Alignment:
Q  372 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctctttcccccagactaggtca 40699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 276 - 473
Target Start/End: Original strand, 38020162 - 38020349
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38020162 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggtt 38020261  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga-ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 473  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||           ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020262 gattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttggt-----------attgggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 326 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  326 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  426 agattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactc 501  Q
    | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 37963265 - 37962938
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||          ||||||||||||||    
T  37963265 atacttttactataaatatagactttgtataagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgt 37963174  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
     || |||||| |||||   ||||||||| | ||||   | |||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||     
T  37963173 gtatagtttg-ctcttgacaacaaacaccatggtt---gtgttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattga 37963078  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    | ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| || ||| |||||    
T  37963077 ggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat---ttttttgtaaagttattcatcattatagtgaaacagtggactgatctct 37962981  T
Q  532 cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    | |||| |||| || ||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  37962980 ctcccacactaggttaatttggaccgaactgggtaaacaaatt 37962938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 234 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5377770 - 5377629
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  5377770 tactttcactataaatatagaccttgtttcagagcaaactttgagagagatagaggggactgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtt 5377671  T
Q  330 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgag 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5377670 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 388 - 506
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589881
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 486  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  487 tttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||  ||||||||||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163004
Alignment:
Q  482 tctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgt 581  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgt 22163012  T
Q  582 gttctctc 589  Q
    ||||||||    
T  22163011 gttctctc 22163004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 451 - 589
Target Start/End: Original strand, 23870951 - 23871089
Alignment:
Q  451 gcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatt 550  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| || |||||||    
T  23870951 gcggcagacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctctctcccttagattaggtcaatt 23871050  T
Q  551 tggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  23871051 tggatcaaactaggtcaacaaattcttttgagttctctc 23871089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 442 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462950
Alignment:
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctctctcccccagact 7462978  T
Q  542 atgtcaa-tttggactgaacttggtcaa 568  Q
    | ||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7462977 aggtcaattttggaccgaactgggtcaa 7462950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 359 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 373 - 506
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgt 469  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||   || |||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  470 aacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 506
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 391  Q
    |||||||||||||||| | ||| |  |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| |||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcatcttgggaaa 43139449  T
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 490  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||    
T  43139450 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttg 43139548  T
Q  491 aaaagttactcatcat 506  Q
     |||||||||||||||    
T  43139549 taaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 536
Target Start/End: Original strand, 35028473 - 35028796
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaaca-agggtttagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||  ||||| ||   |||| | |||||||||||    
T  35028473 agatttgttccaattttttagggatacttttactataaatatagacattgtatcagatgtaaaccttgaattagag-agccggaaaaacagggtttagaa 35028571  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgag 407  Q
       ||| || |||| | |||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  35028572 tc-caacaataaaatttgggtttgta--gagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcgcattggaaaacactattatgattgag 35028665  T
Q  408 tctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca- 505  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |   | | ||| ||||||||||||  || |||||||||||  ||| ||||||||||     
T  35028666 tctcttgatcacgagaagagattgacactttgggtagaattatgtttgaatactaattcttgtaaccttttaatatctcttttctaaaattactcatcat 35028765  T
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
    |  |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  35028766 tgcagtggaacggagagctgctctctccccc 35028796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 375 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  375 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 330
Target Start/End: Original strand, 38020068 - 38020157
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||| | |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  38020068 actataaatatagacattgtatcggtgtaaacctggagatagagggggttggaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943692
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17943618  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17943619 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctctctcccccagactaggtca 17943692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 449
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 451
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736266
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg-gtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 388 - 451
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2741002
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 577
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517633
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 27517740  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtc 566  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   || ||| |||||||||     
T  27517739 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtcatcattagaccgaacttggta 27517644  T
Q  567 aacaaattctt 577  Q
    |||||||||||    
T  27517643 aacaaattctt 27517633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 12342782 - 12342673
Alignment:
Q  199 tttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaac-aa 297  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||     ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||    
T  12342782 tttttggggtcagatttgttccaatttttttaggatacttttactataaatatacacattgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaaa 12342683  T
Q  298 gggtttagaa 307  Q
    ||||||||||    
T  12342682 gggtttagaa 12342673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 412 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828366
Alignment:
Q  412 ttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tata 509  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||| |   || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T
Q  510 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||| |||||   ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  13828403 gtggaacagttagctactctctcccctagactaggtca 13828366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687139
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgaa 39687064  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactca-tca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || |||   |||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39687065 actcat---tatctc-tttgtaaagaaactcattcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 39687139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462497
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054886
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28462651 - 28462591
Alignment:
Q  206 gtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcaga 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28462651 gtgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtatcaga 28462591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720684
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 30720712  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttact 500  Q
    |||| |||| |  ||||||| |||||||||    
T  30720711 accctttgaaa--tcttttgtaaagttact 30720684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191056
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgagtagaatta 38191056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 374 - 449
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaga-ttgggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10942695 - 10942634
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10942695 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 389 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 10948564 - 10948503
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10948564 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 284
Target Start/End: Original strand, 40699178 - 40699278
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatag 282  Q
    ||||||||| | ||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  40699178 ataacagaatcatatttttgggctg-agatttgttccaattttctgagggatacttttactataaatatagaccttgcatcagagtaaaccttgagagag 40699276  T
Q  283 ag 284  Q
    ||    
T  40699277 ag 40699278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932695
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479055
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 537
Target Start/End: Original strand, 33603977 - 33604143
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||  | |||||||||   | ||||| |||||| ||    
T  33603977 ttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttcta 33604076  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccccca 537  Q
    |||  ||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||    
T  33604077 accttttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccccca 33604143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20147121 - 20146987
Alignment:
Q  199 tttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-gagattg-aaac 295  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||| | || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| ||| ||||    
T  20147121 tttttgggctcaaatttgttccaattttatgaggaatatttttactataaatatagaccttgtatcaaagtaaaccttgagagatagagagtttgaaaac 20147022  T
Q  296 aagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| || ||| ||| || ||||||||||||||    
T  20147021 aagggttaag-aagtcaacaagaaaactagggtttg 20146987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15539553 - 15539511
Alignment:
Q  547 aatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15539553 aatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 15539511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 449
Target Start/End: Original strand, 45158307 - 45158369
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  45158307 aaaacactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 45158369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 159 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37171154 - 37171049
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttc-actataaatatagacct 257  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||| |||||||||||  |  || |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||| ||||    
T  37171154 tggcacgatggtgcgctga-aggaaataacaaaaacgtattttcag--tgaagatttgttccatattttaagggttactttccactataaatataaacct 37171058  T
Q  258 tgtatcaga 266  Q
    |||||||||    
T  37171057 tgtatcaga 37171049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050166
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 35218337 - 35218269
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  35218337 atttgctccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtataaggctaaactttgaga 35218269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 427
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680083
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag 427  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36559138 - 36559067
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  36559138 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36559067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36561415 - 36561344
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  36561415 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 36561344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 41303210 - 41303155
Alignment:
Q  395 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaatta 449  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  41303210 tattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 398 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  398 taggattgagtctcttggttacgggaagagat-tgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 374 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 33674604 - 33674551
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaag 425  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33674604 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 8040113 - 8040064
Alignment:
Q  522 gctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||| |||||||||    
T  8040113 gctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaa 8040064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Original strand, 14699047 - 14699100
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  14699047 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 14699100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 571
Target Start/End: Original strand, 34682378 - 34682427
Alignment:
Q  522 gctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  34682378 gctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaa 34682427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 211 - 264
Target Start/End: Original strand, 45156946 - 45156999
Alignment:
Q  211 gatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    ||||||||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45156946 gatttgttccaaattttgagggatgcttttactataaatatagaccttatatca 45156999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 17057413 - 17057369
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  17057413 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17057369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 17085396 - 17085352
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  17085396 tctctcccccagactaggtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 17085352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 284
Target Start/End: Original strand, 20589581 - 20589629
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  20589581 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgaaaccttgagagagag 20589629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Original strand, 36773686 - 36773730
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  36773686 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 36773730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Original strand, 38312364 - 38312408
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  38312364 tctctcccccagattatgtcaagttggaccgaactgggtcaacaa 38312408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 235 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45332428 - 45332384
Alignment:
Q  235 actttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  45332428 acttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 45332384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 124)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 159 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 27306640 - 27306214
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27306640 tggcacgatggtgcgctagcagcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 27306542  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  27306541 gtatcagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaa 27306443  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27306442 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggaga 27306343  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |    
T  27306342 cttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggtcaatttggaccaa 27306243  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  27306242 actgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 27306214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 158 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 31435459 - 31435028
Alignment:
Q  158 ttggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    
T  31435459 ttggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatct 31435361  T
Q  258 tgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435360 tgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 31435261  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggag 457  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| || ||    
T  31435260 cgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaag 31435161  T
Q  458 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||     
T  31435160 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctctctcccccaaactaggtcaatttgtacc 31435061  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31435060 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 31435028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 3878450 - 3878881
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaat----ataga 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    |||||    
T  3878450 tggcacgatggtacgctggcagcgaataacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaattaatataga 3878547  T
Q  255 ccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgga 352  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878548 ccttgtatcagagcaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgga 3878647  T
Q  353 acaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggc 452  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||    
T  3878648 acaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggc 3878747  T
Q  453 gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttg 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3878748 gggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactatgttaatttg 3878847  T
Q  553 gactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3878848 gaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 3878881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 35507 - 35933
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  35507 tggcccgatcgtgcgctggcagcaaatagcagaaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 35605  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35606 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaac 35705  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35706 actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 35805  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  35806 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctttctcccctagactaggtcaatttggaccga 35905  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  35906 actggatcaacaaatttttttgtgttct 35933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 44442 - 44868
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  44442 tggcacgatggtgcgctggcagcaaataacataaacatatttt-tgggtgcagatttgtaccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 44540  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44541 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaac 44640  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  44641 actaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggaga 44740  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  44741 cttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggatagctgctttctcccccagactaggtcaatttggaccga 44840  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44841 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 44868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 159 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 1049706 - 1049283
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  1049706 tggcacgaaggtgcgctggcggcgaataacagaaacgtattttt-gggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 1049608  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1049607 gtattagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaac 1049508  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1049507 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 1049408  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1049407 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 1049309  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1049308 actgggtcaacaaattcttttgtgtt 1049283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 40837154 - 40836728
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  40837154 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaatagaaacatattttttgagtgcagatttgttccaaattttaagggaaacttttactataaatatagacctt 40837055  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||| |  ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40837054 gtatcagagcaaatttggagattgagggggctgaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 40836955  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40836954 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggaga 40836855  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  40836854 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccga 40836756  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40836755 actgggtcaacaaattcttttgtgttct 40836728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 13099832 - 13099456
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||     
T  13099832 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcaaagtaaaccttgagatagagggggttgaaacaagggtttagaatggcaac 13099733  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13099732 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttg 13099633  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatca-tatagtg 512  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13099632 gttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattatagtg 13099533  T
Q  513 aaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099532 aaacggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 13099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 42331355 - 42330979
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||     
T  42331355 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgtatcagactaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaac 42331256  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42331255 aacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 42331156  T
Q  415 gtt--acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  42331155 gttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattatatagtg 42331056  T
Q  513 aaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42331055 aaacggagggctattctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 42330979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 44724533 - 44724886
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44724533 cttttactataaatatagacattgtatcagtgtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 44724632  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  44724633 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggac 44724732  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  44724733 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccc 44724832  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44724833 cagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 44724886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 38393911 - 38394290
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  38393911 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 38394010  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38394011 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 38394110  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  38394111 gtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 38394210  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38394211 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 38394290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 159 - 584
Target Start/End: Original strand, 25542408 - 25542830
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||    
T  25542408 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttttgagtgtagatttattccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagacctt 25542507  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25542508 gtatcagagcaaactttgagatagagg-ggctgaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaac 25542606  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25542607 actagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggaga 25542705  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||    
T  25542706 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccctagactaggttaatttggaccga 25542804  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25542805 actgggtcaacaaattcttttgtgtt 25542830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 48457601 - 48457957
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  48457601 tactttcactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 48457700  T
Q  330 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  48457701 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 48457800  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  48457801 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48457901 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 48457957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 4296271 - 4295916
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagacctt-gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4296271 cttttactataaatatagacatttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtat 4296172  T
Q  335 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4296171 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 4296072  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4296071 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctatctcc 4295972  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4295971 cccatactaggtcaatttggaccgaactgggtgaacaaattcttttgtgttctctc 4295916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20137444 - 20137091
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  20137444 cttttactataaatattggctttgtatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtata 20137345  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20137344 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggac 20137245  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20137244 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctct-cc 20137146  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20137145 ccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20137091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 21990084 - 21990457
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||     
T  21990084 gttccaaatttatgagttataattttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagaggggct-gaaacaagggtttagaatgacaac 21990182  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  21990183 aacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttg 21990282  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  21990283 gttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 21990382  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21990383 acagagggctgctctctccccaagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21990457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 24748555 - 24748902
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttg 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24748555 tataaatatagacattgtatcagtgtaaactttgacttagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttg 24748654  T
Q  343 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagt 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24748655 tctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggt 24748754  T
Q  443 agaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagact 541  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |    
T  24748755 agaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctctctcctccagatt 24748854  T
Q  542 atgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  24748855 aggtcaatttggaccgaactgagtcaacaaattcttttgtgttctctc 24748902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 11355212 - 11355565
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11355212 cttttactataaatataggctttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 11355311  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11355312 gagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagac 11355411  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11355412 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctctctcccc 11355511  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11355512 tagactatgtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttatgttctctc 11355565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 443528 - 443903
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    | |||||| ||||||||| | |||     
T  443528 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagactttgaatcagagtaaaccttgagatagagggagctaaaacaatggtttagaatggcaac 443627  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  443628 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 443727  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  443728 attacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgttactcatcatatagtgaa 443827  T
Q  515 acagagggctgctctct-cccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  443828 acgaagggctgctctctcccccccgactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 443903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 20625995 - 20626345
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20625995 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20626094  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20626095 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20626194  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 538  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20626195 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20626294  T
Q  539 actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20626295 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20626345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 20629886 - 20630236
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20629886 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20629985  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20629986 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20630085  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 538  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20630086 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20630185  T
Q  539 actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20630186 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20630236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 243 - 589
Target Start/End: Original strand, 20642305 - 20642655
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagag 338  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20642305 tataaatatagaccttctatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagag 20642404  T
Q  339 tttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20642405 tttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttt 20642504  T
Q  439 gagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 538  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  20642505 gggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccag 20642604  T
Q  539 actatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20642605 actaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 20642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 241 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7470356 - 7470007
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  7470356 actataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 7470257  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  7470256 agattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagact 7470157  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccccc 536  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||    
T  7470156 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctccctccccc 7470057  T
Q  537 agactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7470056 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7470007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 20299383 - 20299764
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaaggg-tttag 305  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  20299383 atttgttccatatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttag 20299482  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20299483 aatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 20299582  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  20299583 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 20299682  T
Q  505 atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20299683 atatagtggatcggagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 20299764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7472344 - 7471965
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  7472344 atttgttccaaatttatgagttatatgtttactataaatatagaccttgtatcagactaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 7472245  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7472244 aaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 7472145  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  7472144 gtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 7472045  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7472044 atagtggatcggatggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7471965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 257 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 21592457 - 21592125
Alignment:
Q  257 ttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21592457 ttgtatcagtgtaaactttgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaa 21592358  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21592357 acactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtggga 21592258  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  21592257 gacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggacc 21592158  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21592157 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 21592125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 9680768 - 9681127
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggttt 330  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    |||||| | ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  9680768 cttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagagagatagagggggttgaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggttt 9680867  T
Q  331 gtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9680868 gtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 9680967  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  9680968 tgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9681068 ctcccccagactaggtcaatttggatcgaactaggtcaataaatttttttgtgttctctc 9681127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 18345466 - 18345845
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgag----atagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18345466 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctgaactttgagggagatagagggggttgaaacaagggtttaga 18345565  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18345566 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 18345665  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  18345666 gtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 18345765  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  18345766 atagtggatcggagggctgttctctcccccagactaggtcaatttggaccgagctgggtcaacaaattcttttgtgttct 18345845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 21679981 - 21680337
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21679981 cttttactataaatatagacattgtattagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 21680080  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21680081 gagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggac 21680180  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21680181 tttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctctctcccc 21680280  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaa---cttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| || ||||||||| |||   || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  21680281 cagactaggtgaatttggaccgaactgctgggtcaacaaatacttttttgttctctc 21680337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 212 - 584
Target Start/End: Original strand, 28485491 - 28485867
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||| | | ||||||||||||||||||    
T  28485491 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagaaggggttgaaacaagggtttaga 28485590  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28485591 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattga 28485690  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  28485691 gtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28485790  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28485791 ataatgaatcagagggttgctctct-cctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgtt 28485867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 212 - 585
Target Start/End: Original strand, 3035646 - 3036027
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  3035646 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 3035745  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3035746 aaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 3035845  T
Q  407 gtctcttggttacgggaaga---gattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
    ||||||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  3035846 gtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacgatactcat 3035945  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttc 585  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035946 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttc 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 39146322 - 39145968
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39146322 cttttactataaatatagacactgtatcagtgtaaaccttgagatggagggggctgaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtata 39146223  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39146222 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaac 39146123  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||    
T  39146122 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctcttttcc 39146023  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | | |||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39146022 ctaaactaggtcaatttgtaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 39145968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Original strand, 1849975 - 1850285
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1849975 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggtt 1850074  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850075 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1850174  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1850175 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccatactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1850274  T
Q  576 ttttgtgttct 586  Q
    |||||||||||    
T  1850275 ttttgtgttct 1850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Original strand, 40946276 - 40946632
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagat----agaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtt 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||     ||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40946276 tactttcactataaatataaaccttgtttcatagcaaactttgagagggacagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40946375  T
Q  330 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  40946376 tgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggc 40946475  T
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  40946476 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40946576 ctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 40946632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 20297287 - 20297666
Alignment:
Q  212 atttgttccaaatttta-agtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  20297287 atttgttccaaatttacgagttatacttttactaaaaatatggaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 20297386  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    | | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20297387 atggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 20297486  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  20297487 gtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcat 20297586  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  20297587 atagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 20297666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 21678020 - 21678371
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  21678020 cttttactataaatatagatattgtatcaatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtata 21678119  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21678120 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggac 21678219  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21678220 tttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctctctcccc 21678319  T
Q  536 cagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     |||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  21678320 tagactaggttaatttggaccgaactgggacaacaaattc--ttgtgttctctc 21678371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Original strand, 28487478 - 28487857
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttaga 306  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||    
T  28487478 atttgttctaaatttatgagttatacttttcctataaatatagaccatgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttaga 28487577  T
Q  307 aagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattga 406  Q
    |||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28487578 aaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattga 28487677  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  28487678 gtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28487777  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28487778 atagtgaatcagagggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcttttgtgttct 28487857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 241 - 589
Target Start/End: Original strand, 9679013 - 9679366
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    |||||| |  |||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9679013 actataaatatagatcttgtatcagatgtaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtata 9679112  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9679113 gagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattggga 9679211  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |    
T  9679212 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctctctttc 9679311  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9679312 ccagactaggtcaatttggaccagactgggtcaacaaattcttttgtgttatctc 9679366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 159 - 475
Target Start/End: Original strand, 26804452 - 26804765
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26804452 tggcacgatggtgcgctggcagcaaataacagaaacgtatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagacctt 26804549  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804550 gt----gagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 26804645  T
Q  359 actag---ggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggg 455  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    
T  26804646 actagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcggg 26804745  T
Q  456 agacttattcttgtaaccca 475  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26804746 agacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 216 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 37412484 - 37412109
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| |  |||||||||||||||||| | |||     
T  37412484 gttccaaatttatgagttatatttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatatagggggctgaaacaagggtttagaatggcaac 37412385  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 413  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37412384 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt 37412285  T
Q  414 ggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatca-tatagt 511  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  37412284 ggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattatagt 37412185  T
Q  512 gaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctc 587  Q
    | ||| || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  37412184 ggaacggatggctgctctctcccctagactgggtcaatttggaccgaactggatcaataaattcttttgtgttctc 37412109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 42223110 - 42223465
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| | |   |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  42223110 cttttactataaatataggctttgtatcagagtaaaccttgagatagatgtgggatgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtat 42223209  T
Q  335 agagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42223210 agagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgga 42223309  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
     |||||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  42223310 gctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctctctcc 42223409  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||| |||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  42223410 cccatactaggtcaattttgatcgaactgggtcaacaaattcttttgttttctctc 42223465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 43253884 - 43253502
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag-gagat-------tgaaacaagggtt 302  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||        |||||||||| ||    
T  43253884 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagagagaaagagggctgaaacaaggttt 43253785  T
Q  303 tagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagga 402  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43253784 tagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattagga 43253686  T
Q  403 ttgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactca 502  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  43253685 ttgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactca 43253586  T
Q  503 tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  43253585 tcatatagtggatcagagggctgctctctccctcagactaggtcaatttagaccgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 43253502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 31156271 - 31155896
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaaga 310  Q
    ||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||     
T  31156271 atttgttccaaatttatgagctatacttttactataaatatagagcttgtatcaaggcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagg 31156172  T
Q  311 caaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 409  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  31156171 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtc 31156072  T
Q  410 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatata 509  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||| ||||    
T  31156071 tcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggtactcatcctata 31155973  T
Q  510 gtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  31155972 gtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 31155896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 276 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 1047219 - 1046912
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  1047219 gagatagagggggctgaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt 1047120  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047119 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1047020  T
Q  476 ttgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattc 575  Q
    ||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1047019 ttgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccacactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattc 1046921  T
Q  576 ttttgtgtt 584  Q
    |||||||||    
T  1046920 ttttgtgtt 1046912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 237 - 589
Target Start/End: Original strand, 24258418 - 24258775
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatag 336  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24258418 tttctctataaatataggttttgtatcagagtaaacattgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatag 24258517  T
Q  337 agtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggact 436  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  24258518 agtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagact 24258617  T
Q  437 ttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca----tatagtgaaacagagggctgctctctc 532  Q
    |||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24258618 ttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctctctc 24258717  T
Q  533 ccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaac-aaattcttttgtgttctctc 589  Q
       ||||||| |||||||||||| ||| | | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24258718 tttcagactaggtcaatttggaccgaattagatgaacaaaattcttttgtgttctctc 24258775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7352018 - 7351637
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  |||||||||||||||    
T  7352018 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatataaaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaagggttta 7351919  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7351918 gaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 7351819  T
Q  405 -gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||    
T  7351818 ggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 7351720  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  7351719 catatagtggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatttctttgtgttct 7351637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 212 - 512
Target Start/End: Original strand, 11757153 - 11757460
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaaggg-tttag 305  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||| |  ||||||||||| |||||    
T  11757153 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagatagagggggctgaaacaaggggtttag 11757252  T
Q  306 aaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttt-gagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11757253 aatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 11757352  T
Q  405 gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  11757353 gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 11757452  T
Q  505 atatagtg 512  Q
    ||||||||    
T  11757453 atatagtg 11757460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 212 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7349639 - 7349262
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      |||||| |  ||||||| |||||||    
T  7349639 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaactttgagagagagatagagggggctgaaacaggggttta 7349540  T
Q  305 gaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7349539 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 7349440  T
Q  405 -gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcat 503  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||    
T  7349439 ggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcat 7349341  T
Q  504 catatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||    |||||||||||  ||||||||||    
T  7349340 catatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaa----gtcaacaaatttctttgtgttct 7349262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 236 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 27832969 - 27832646
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagat-tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||| |||| ||| |||||||  ||  ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  27832969 cttttactataaatataggttgtgtatcagagcaaaccttgtgatagagtggagctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtat 27832870  T
Q  335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27832869 agagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaga 27832770  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  27832769 ctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctctctcc 27832670  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactg 557  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||    
T  27832669 cccagactaggtcaatttgaactg 27832646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 25276095 - 25276437
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  25276095 cttttactataaatatatgctttgtatcagagcaaactttgagatagagggggctaaaacaataatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 25276194  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25276195 gagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagac 25276294  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    ||||        ||    
T  25276295 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaac----ggct--------cc 25276382  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  25276383 ccagactaagtcaatatggaccgaactggttaaacaaattcttttgtgttctctc 25276437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 233 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22828971 - 22828672
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgt 332  Q
    ||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  22828971 atacttttactataaatataggctttgtatccgagtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgt 22828872  T
Q  333 atagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgg 432  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22828871 atagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattga 22828772  T
Q  433 gactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22828771 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctctct 22828672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 352 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092198
Alignment:
Q  352 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  452 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaattt 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctct-ccccagactaggtcaattt 7092233  T
Q  552 ggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7092232 ggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 7092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 184 - 574
Target Start/End: Original strand, 7188445 - 7188833
Alignment:
Q  184 ataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatag 282  Q
    |||||| |||||||||||| || || ||||||||||||| ||| | ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7188445 ataacataaacgtatttttgggctg-agatttgttccaattttatgagggatacttttactataaatatagactttgtatcagagtaaaccttgagatag 7188543  T
Q  283 aggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcac 382  Q
    ||| |  |||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7188544 agggggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcac 7188639  T
Q  383 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7188640 cttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatat 7188739  T
Q  483 ctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     ||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7188740 ttcttttgtaaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctctcttccccagtctatgtcagttttggactgaactaggtaaacaaatt 7188833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 352 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094445
Alignment:
Q  352 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  452 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaattt 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaattt 7094480  T
Q  552 ggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7094479 ggactgaactgggtcaataaattcttttgtgttct 7094445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 158 - 400
Target Start/End: Original strand, 18567490 - 18567731
Alignment:
Q  158 ttggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacct 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||    
T  18567490 ttggcacgatggtgcgctggcaacgaataacagaaacgtatttttttggtgcaaatt-gttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagatct 18567588  T
Q  258 tgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 357  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18567589 tgtatcagagtaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaa 18567688  T
Q  358 cactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 400  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18567689 cgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 243 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 24817677 - 24817358
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| | ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  24817677 tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagaggggct-gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagttt 24817580  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  24817579 g-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttggg 24817484  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  24817483 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctctctcccccatac 24817384  T
Q  541 tatgtca-atttggactgaacttggt 565  Q
    || ||||  ||||||| |||||||||    
T  24817383 taggtcagttttggaccgaacttggt 24817358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 220 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 22251893 - 22251611
Alignment:
Q  220 caaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaa 319  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  22251893 caaattttaagcgacacttttactataaatataaaccttgaatcagagtaaactttgagatagaggaggctgaaacaagagtttagaaaggcaacaacaa 22251794  T
Q  320 aactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttac 419  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||    
T  22251793 aactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttggttac 22251702  T
Q  420 gggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgata----tctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  22251701 gggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcat 22251611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 233 - 538
Target Start/End: Complemental strand, 20091879 - 20091580
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||| | | |   || ||||||||||||||||    
T  20091879 atacttttactataaatatagactttttatcagagtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcggaggc--aacacaaaactagggtttg 20091782  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
    ||||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  20091781 tatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttggtcacgggaagagattg 20091685  T
Q  432 ggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctct 531  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||    
T  20091684 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaacggagggctgctctct 20091587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 318 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 24813748 - 24813480
Alignment:
Q  318 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||     
T  24813748 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtg 24813653  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaac 516  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |    
T  24813652 acgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattatagtggagc 24813553  T
Q  517 agagggctgctctctcccccagactatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
     || ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||    
T  24813552 ggatggctgctttctcccccagactaggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttctctc 24813480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 5e-70
Query Start/End: Original strand, 360 - 586
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396938
Alignment:
Q  360 ctagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagac 459  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  460 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaa 559  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctctctccctcagactaggtcaatttggaccgaa 38396911  T
Q  560 cttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  38396912 ctgggtcaacaaattcttttgtgttct 38396938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 574
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935560
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 2935473  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 2935560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 163 - 429
Target Start/End: Original strand, 22392355 - 22392608
Alignment:
Q  163 acgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtat 262  Q
    |||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22392355 acgatggtgcgctggaggcaaaaaacagaaatgtatttttcag-tgcagatttgttccaaattgtaagcgatacttttactataaatatagaccttgtat 22392453  T
Q  263 cagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacta 362  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||        | |||  ||||||||||||||||||| |||| || || | |||||||||||    
T  22392454 cagagtaaactttgagatagagggggctgaaacaagggttt--------ataaatcaaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacacta 22392544  T
Q  363 gggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 429  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22392545 gggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137381
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22137283  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22137284 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22137381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552408
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40552310  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40552311 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40552408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 241 - 542
Target Start/End: Original strand, 24465507 - 24465797
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagt 339  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||| ||    
T  24465507 actatagatatagactttgtatcagatgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaatc--------aaactagggtttgtatagcgt 24465598  T
Q  340 ttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 439  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||||  |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24465599 ttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaa---ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttg 24465694  T
Q  440 agtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccag 538  Q
     ||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| |  | ||||||||||||||||    
T  24465695 ggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatgaaacgggtgactgctctctcccccag 24465793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108370
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22108272  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22108273 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22108370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550130
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40550032  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  40550033 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 40550130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 389 - 574
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606671
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 1606584  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactagatcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 1606671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 415 - 577
Target Start/End: Original strand, 26295580 - 26295743
Alignment:
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtga 513  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  26295580 gttacaggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtga 26295679  T
Q  514 aacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    |||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  26295680 aacagatgactgctctctcctccagactaggtcaatttggactgaactggataaacaaattctt 26295743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 389 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027191
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 9027278  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||| || ||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 9027191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 436 - 589
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22394030
Alignment:
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgttctctccc 22393975  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    | |||||| ||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22393976 ctagactaggtcaatttggaccaaactgggtaaacaaattcttttgtgttctctc 22394030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 292 - 589
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081817
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 391  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gaga-ttgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccc--attgatatctcttt 488  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||   | ||||| |||||||||||||   ||||||||||||     
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttg 11081715  T
Q  489 tgaaaagttactcatc-atatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    || |||||||||||||  || | || ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||    
T  11081716 tgtaaagttactcatctttaaaatggaacggatggttgctctctcccccagactaggtcaatattggaccgaactgggtaaacaaatt-ttgtgtgttct 11081814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297046
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattag-gcgggagacttattcttgtaac 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    | ||| | |||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaac 16297123  T
Q  473 cc-attgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||  || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16297122 ccttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctctctcccctagactatgtca 16297046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 574
Target Start/End: Original strand, 6332177 - 6332514
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||| |  || ||||||||||||| ||| | | ||   | ||||||||||     
T  6332177 atacttttactataaatataaaacttgtatcagagtaacctt-gagagagagggggctggaaacaagggtttataaacatacaac--agactagggttt- 6332272  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattg 431  Q
     |||||||||  ||||| | ||||||||||||| || |||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  6332273 -atagagttta-ctcttggcaacaaacactaggatt-gaga-ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattg 6332368  T
Q  432 ggactttgagtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctct 529  Q
     ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| || | ||| |||    
T  6332369 agactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaagactgttct 6332468  T
Q  530 ctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  6332469 ctcccctagactaggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 6332514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 412 - 506
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349006
Alignment:
Q  412 ttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 506
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049094
Alignment:
Q  292 aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aa 390  Q
    |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  391 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 489  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||   | |||| ||||||| |||||| |||||||| | |||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatc-ccttt 6049077  T
Q  490 gaaaagttactcatcat 506  Q
    | |||||||||||||||    
T  6049078 gtaaagttactcatcat 6049094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 398 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067183
Alignment:
Q  398 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagt 496  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||  |||||     
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttga-tagaattaggtttgaagactaattcttgtaatcctctgatatctctttgtaaaagg 6067275  T
Q  497 tactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
     |||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| | |||||| | ||| ||| |||||||||| | |||||||    
T  6067274 aactcgtcattatagtgaaacggagagctgctctctcccccatactaggtcagtattggaccggactgggtaaacaaattctctcgtgttct 6067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 519 - 586
Target Start/End: Original strand, 11759364 - 11759431
Alignment:
Q  519 agggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11759364 agggttgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 11759431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 237 - 367
Target Start/End: Original strand, 6348773 - 6348903
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtat 334  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||  || ||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||    
T  6348773 tttctctataaatataaaccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagta-aaaaagaaaactagggtttgtat 6348871  T
Q  335 agagtttgtctctttggaacaaacactagggtt 367  Q
     ||||||| ||||| | |||||||| |||||||    
T  6348872 cgagtttg-ctcttggcaacaaacattagggtt 6348903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369690
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactt 21369690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 1606399 - 1606472
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1606399 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagag 1606472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 373 - 451
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  373 gttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 13290723 - 13290470
Alignment:
Q  319 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggtt 417  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||| || |  |  ||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||     
T  13290723 aaactagggtttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtc 13290629  T
Q  418 acgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaa 515  Q
    || |||||| ||| | ||| || |||||||||||   || || | ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||    
T  13290628 acaggaagatattagaactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagcggaa 13290530  T
Q  516 cagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    ||||| ||| | ||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  13290529 cagagagctacactctccctcagacttggtcagtattggaccgaactgggtaaacaaatt 13290470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 352 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310157
Alignment:
Q  352 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351508
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25351434  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  25351435 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgttctctcccccagactaggtca 25351508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 377 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281468
Alignment:
Q  377 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgtaaccca 475  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  || ||||||||   | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  476 ttgat 480  Q
    |||||    
T  40281472 ttgat 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 430 - 547
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046759
Alignment:
Q  430 tgggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgct 527  Q
    |||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||   || ||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgct 6046739  T
Q  528 ctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6046740 ctctcccccagactaggtca 6046759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410287
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 25410211  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25410212 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacggagagctgctctctcccccagactaggtca 25410287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 241 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7092509 - 7092414
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagataga----ggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaa-actagggtttg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  7092509 actataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatggagggggctgaaacaagggtttagaatgacaacaacaaacactagggtttg 7092414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 343
Target Start/End: Original strand, 38396324 - 38396377
Alignment:
Q  290 tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396324 tgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 262
Target Start/End: Original strand, 45366446 - 45366526
Alignment:
Q  181 cgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtat 262  Q
    |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  45366446 cgaaaaacagaaacgtatttttcag-tgcagatttgttccaaattttaagggttacttttactataaatataaaccttgtat 45366526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320171
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324919
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069841
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074848
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357108
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405454
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006724
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 7094754 - 7094662
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaacttt----gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||    
T  7094754 tataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggcaacaacaaacatagggtttg 7094662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 589
Target Start/End: Original strand, 26804762 - 26804817
Alignment:
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26804762 cccagactaggtcaatttggatcgaactgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 26804817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 374 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541129
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 15541129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 1849894 - 1849967
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  1849894 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagagag 1849967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 284
Target Start/End: Original strand, 38396215 - 38396288
Alignment:
Q  212 atttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagag 284  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  38396215 atttgttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcaggctaaattttgagagagag 38396288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378625
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247031
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30906388 - 30906264
Alignment:
Q  233 atactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattg-aaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttg 331  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  || |||||||  |||||||  ||||| |  ||||||| |||||    
T  30906388 atacttttgctataaatatagaccttgtataagagtaaatcttgagatagagggggctgaaaacaagaatttagaa--acaaataacaaactagagtttg 30906291  T
Q  332 tatagagtttgtctctttggaacaaaca 359  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  30906290 tatagagtttg-ctcttagcaacaaaca 30906264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143998
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttg 439  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttg 44143998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512646
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 241 - 304
Target Start/End: Original strand, 3677239 - 3677301
Alignment:
Q  241 actataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggttta 304  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||    
T  3677239 actataaatatagatcttgaatcagagtaaacttggagatagagg-ggctgaaacaagggttta 3677301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 22108087 - 22108158
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22108087 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22108158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 22137098 - 22137169
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22137098 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 22137169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 40549847 - 40549918
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40549847 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40549918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 40552125 - 40552196
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40552125 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgaga 40552196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 466 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22280444 - 22280379
Alignment:
Q  466 ttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctc 530  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  22280444 ttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttattgatcattatagtgaaacagaaagctgctctc 22280379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546997
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactt 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 34546997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 430
Target Start/End: Original strand, 8260570 - 8260625
Alignment:
Q  376 gattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt 430  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  8260570 gattcaccttgtataaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9027467 - 9027396
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  9027467 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 9027396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 278
Target Start/End: Original strand, 2935279 - 2935349
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgag 278  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  2935279 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactctgag 2935349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 522 - 571
Target Start/End: Original strand, 9190052 - 9190101
Alignment:
Q  522 gctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  9190052 gctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 9190101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 20284146 - 20284093
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  20284146 gagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 20284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 208 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1047295 - 1047239
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatca 264  Q
    ||||||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1047295 gcagatttgttacagattttaagcaggacttttactataaatataaaccttgtatca 1047239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 571
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153510
Alignment:
Q  527 tctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaa 8153510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 161 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 69703 - 69277
Alignment:
Q  161 gcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgt 260  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |    
T  69703 gcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttacaataaatatagaccttat 69606  T
Q  261 atcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 356  Q
    ||||||| |||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  69605 atcagagcaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 69506  T
Q  357 acactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcggga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  69505 acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcggga 69406  T
Q  457 gacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggact 556  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  69405 gacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggacc 69307  T
Q  557 gaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  69306 gaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 69277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 159 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 73437 - 73203
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  73437 tggcacgatggtgtgctggcagcgaaaaacagaaacatatttt--gggtgcagatttgttccaaattttaagagatacttttactataaatatagaccgt 73340  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgaga----tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 354  Q
    |||||| || |||||||||||    |||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73339 gtatcaaaggaaactttgagagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaac 73240  T
Q  355 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73239 aaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 348 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 73210 - 73160
Alignment:
Q  348 ttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 398  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  73210 ttggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 162 - 589
Target Start/End: Original strand, 14899 - 15323
Alignment:
Q  162 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgta 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14899 cacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacatatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgatacttttactataaatatagaccttgta 14997  T
Q  262 tcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacact 361  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14998 tcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacact 15097  T
Q  362 agggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagactt 461  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15098 agagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagactt 15197  T
Q  462 attcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  15198 attcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgctgtctcccccatgctaggtcaatttggaccgaact 15297  T
Q  562 tggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
       |||||||||||  ||||||||||||    
T  15298 gactcaacaaattc--ttgtgttctctc 15323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 248 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 14707 - 14366
Alignment:
Q  248 atatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 345  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||||| |  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14707 atatagaccttgttttagagcaaactttgagagatagagggggatgaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct 14608  T
Q  346 ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtaga 445  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  14607 ctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtaga 14508  T
Q  446 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgt 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14507 attaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctctctcccctagactaggt 14408  T
Q  546 caatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  14407 caatttggaccgaactgggtcaacaaattc--ttgtgttctctc 14366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 416
Target Start/End: Original strand, 31124 - 31168
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggt 416  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 183976 - 183626
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  183976 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaagggct-gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgta 183878  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  183877 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg-aagagattggg 183779  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  183778 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctcc 183679  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  183678 ctcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 183626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 216 - 577
Target Start/End: Original strand, 51941 - 52307
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga--tagaggagattgaaacaagggtttagaaagaca 312  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  51941 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgtatcatactaaactttgagagatagagggggctgaaacaagggtttagaatggca 52040  T
Q  313 aaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctct 412  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52041 acaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 52140  T
Q  413 tggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtg 512  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  52141 tggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 52240  T
Q  513 aaacagagggctg--ctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  52241 aaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattctt 52307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 506 - 577
Target Start/End: Original strand, 50235 - 50308
Alignment:
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctct--ctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattctt 577  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  50235 tatagtgaaacggagggctgctctctctcccccagactaggtcaatttggacctaactgggtcaacaaattctt 50308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 2757 - 3182
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||| |||    
T  2757 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacataaacgtatttt-tgggtgcagatttgttccaaattttaagcgaaacttttactataaatatagaactt 2855  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaac 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2856 gtatcagagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaac 2955  T
Q  359 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggaga 458  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  2956 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggaga 3055  T
Q  459 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactga 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  3056 cttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctatctccccgagactaggtcaatttggaccga 3154  T
Q  559 acttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||  ||||||||| | |||||||||||    
T  3155 actgagtcaacaaaatattttgtgttct 3182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 234 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 41820 - 41468
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41820 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaacttagagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 41721  T
Q  334 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  41720 tagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 41621  T
Q  434 actttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41620 actttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctctctcc 41521  T
Q  534 cccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41520 cccagactaggtgaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 41468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Original strand, 79117 - 79491
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |  | |||||||||||||||||| |||     
T  79117 gttccaaatttatgagttatacctttactataaatatagaccttgaatcagagtaaaacttgagatagagggggctaaaacaagggtttagaaaggcaac 79216  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  79217 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 79316  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    |||||||||||||  || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  79317 gttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 79416  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  79417 acggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccaaactgggtcaacaaattattttgtgttctctc 79491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 216 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 11829 - 11455
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaa 314  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |  ||||||| || ||||||| |||||     
T  11829 gttccaaatttatgagttatacttttactataaatatagaccttgaatcagagtaaacctggagatagagggggctgaaacagggatttagaatgacaac 11730  T
Q  315 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11729 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 11630  T
Q  415 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaa 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |    
T  11629 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 11530  T
Q  515 acagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11529 ttggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaaccgggtcaacaaattcttttgtgttctctc 11455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 159 - 586
Target Start/End: Original strand, 29038 - 29473
Alignment:
Q  159 tggcacgatggtgcgctggcagcgaataacagaaacgtattttttgggtgcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagacctt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  29038 tggcacgatggtgcgctggcagcgaaaaacagaaacatattttt-gagtgcagatttgttacaaattttaagcaaaacttttactataaatatagacctt 29136  T
Q  259 gtatcagagtaaactttgagatagag-gagat---------tgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 348  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| |||||         ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29137 gtatcaggctaaactttgagagagagagagatagagggggctgaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 29236  T
Q  349 tggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatt 448  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29237 cggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaatt 29336  T
Q  449 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaa 548  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29337 aggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaa 29435  T
Q  549 tttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29436 tttggaccgaactgggtcaacaaattcgtttgtgttct 29473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 79812 - 80165
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||| |||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  79812 cttttactataaatatagtttttgtatcagtgtaaaccttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtata 79911  T
Q  336 gagtttgtctctttgg-aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggga 434  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  79912 gagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggg 80011  T
Q  435 ctttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  80012 ctttgggtaga-ttaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctctctccc 80110  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  80111 ccagactaggtcaatttggattgaactgggtcaacaaattcttttgtgatctctc 80165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 208 - 586
Target Start/End: Original strand, 6124 - 6502
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaa 307  Q
    ||||||||||| ||  ||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6124 gcagatttgttacagtttttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaactttgagatagagggggctgaaacaagggtttagaa 6223  T
Q  308 agacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-a 406  Q
    |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  6224 aagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa 6323  T
Q  407 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcat 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||     
T  6324 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcaa 6422  T
Q  507 atagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||    
T  6423 atagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgagtcaacaaatttctttgtgttct 6502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 236 - 589
Target Start/End: Original strand, 85184 - 85537
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| |||   ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  85184 cttttactataaatataggctttgtatcaaagtaaaccttgagatagaagagga-gaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtata 85282  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  85283 gagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgac 85382  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctccc 534  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| || | ||||||||||||    
T  85383 tttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctctctccc 85482  T
Q  535 ccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  85483 ccagactaggtcaatttgaactgaaccaggtaaacaaattcttttgtgttctctc 85537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 180; Significance: 6e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 276 - 586
Target Start/End: Original strand, 34 - 344
Alignment:
Q  276 gagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtt 375  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  34 gagatagagggggctgaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggtt 133  T
Q  376 gattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 474  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134 gattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaaccc 233  T
Q  475 attgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
    |||||| |||| |||| || |  ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  234 attgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaatt 332  T
Q  575 cttttgtgttct 586  Q
      ||||||||||    
T  333 tctttgtgttct 344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 176; Significance: 2e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 216 - 535
Target Start/End: Original strand, 1968 - 2293
Alignment:
Q  216 gttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga------tagaggagattgaaacaagggtttagaaa 308  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||      || ||| |  |||||||||||||||||||    
T  1968 gttccaaatttataagttatactttcactataaatatagaccttgtttcatagcaaactttgagagaaagatatagggggctgaaacaagggtttagaaa 2067  T
Q  309 gacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 408  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2068 ggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagt 2166  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatat 508  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||| ||||||||||    
T  2167 ctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttcctcatcatat 2266  T
Q  509 agtgaaacagagggctgctctctcccc 535  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  2267 agtgaatcggagggctactctctcccc 2293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 172; Significance: 4e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 210 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 15817
Alignment:
Q  210 agatttgttccaaattt-taagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaa 308  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| ||||||||||||     
T  16180 agatttgttccaaatttatgagggatacttttactataaatatagattttgtatcagagtaaaccttaagatagagggggttgaaataagggtttagaa- 16082  T
Q  309 gacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 408  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  16081 gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gagg-ttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagt 15985  T
Q  409 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-ta 507  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  15984 ctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15885  T
Q  508 tagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat-ttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     |||| ||| |||| ||||||||| |||| ||||| |||| | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15884 gagtggaacggaggactgctctctgcccccgactaggtcagtgttggaccgaactgggtaaacaaatt 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 350 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1438
Alignment:
Q  350 ggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaatta 449  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  450 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcaat 1475  T
Q  550 ttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1474 ttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgttct 1438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 243 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 16975 - 16646
Alignment:
Q  243 tataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaa-caagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagttt 341  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16975 tataaatataaaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagttt 16878  T
Q  342 gtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgag 441  Q
    | ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  16877 g-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttggg 16781  T
Q  442 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagac 540  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  16780 tagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgggacaaagggtttatctctcccccagac 16681  T
Q  541 tatgtca-atttggactgaacttggtcaacaaatt 574  Q
     | ||||  ||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  16680 caggtcagttttggaccgaactgggtaaacaaatt 16646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 245 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 1958 - 1666
Alignment:
Q  245 taaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 343  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||      
T  1958 taaatatagaccttgtatcagatgtaaacctagagatagaggtggctgaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttc- 1861  T
Q  344 ctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagta 443  Q
            ||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  1860 --------aacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggta 1771  T
Q  444 gaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagacta 542  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  1770 gaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctctctcccccatacta 1671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 236 - 463
Target Start/End: Original strand, 35593 - 35819
Alignment:
Q  236 ctttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||   | |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35593 cttttactataaatatagacattgtatcagtacaaaccgggtgatagaggcgct-gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata 35691  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35692 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggac 35791  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttat 463  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35792 tttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 506 - 589
Target Start/End: Original strand, 35817 - 35900
Alignment:
Q  506 tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttctctc 589  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  35817 tatagtggaacggagggctgctctcttccttagactaggtcaatttggaccgaattgggtcaacaaattattttgtgttctctc 35900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0458
Description:

Target: scaffold0458; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12219 - 12072
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12219 gattggattcctcaaactggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 12120  T
Q  108 tatttatataaacgtgttttctgtccacacctagagcattttcgtgta 155  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  12119 tatttatataaacgtgttttctcttcacacctagagcatttttgtgta 12072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0458; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2048 - 1927
Alignment:
Q  8 gattggattcctcaaaccggtgttccatactccagtggattgatatagtcaaattcaaacacctagagtatgaagttgttcaattttatatattttcttc 107  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  2048 gattggattcctcaaactggtgttccatactctagtagattgatatagtcaaattcaaacacctagagtaagaatttgttgaattttatatattttcttc 1949  T
Q  108 tatttatataaacgtgttttct 129  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  1948 tttttatataaacgtgttttct 1927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22418
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 22320  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22321 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 22418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 586
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24693
Alignment:
Q  389 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 487  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 24595  T
Q  488 ttgaaaagttactcatcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgttct 586  Q
    | | || ||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  24596 t-gtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaaattcctttgtgttct 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 22135 - 22206
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  22135 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 22206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 279
Target Start/End: Original strand, 24410 - 24481
Alignment:
Q  208 gcagatttgttccaaattttaagtaatactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgaga 279  Q
    |||||||||||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  24410 gcagatttgttatagattttaagcaggacttttactataaatatagaccttgtatcaaagcaaacttggaga 24481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 547
Target Start/End: Original strand, 4768 - 5076
Alignment:
Q  237 tttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaaggg-tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtata 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| || || |||||||  | |  |||||| ||||||||| ||||    
T  4768 tttctctataaatatagaccttgtatcagagtaaaccttgagatagaggggtctgaaaaaaaggatttagaagta-agcaacaaa-ctagggtttatata 4865  T
Q  336 gagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggac 435  Q
    | |||| |||||  | |||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||   |    
T  4866 gcgttt-tctctcagcaacaaacactagagtt-gagt-ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagc 4962  T
Q  436 tttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctc-ttttgaaaagttactcatca-tatagtgaaacagagggctgctctctcc 533  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||| |    
T  4963 ttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaacatagaactgctctctgc 5062  T
Q  534 cccagactatgtca 547  Q
    ||||||||| ||||    
T  5063 cccagactaggtca 5076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 96; Significance: 9e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 9e-47
Query Start/End: Original strand, 234 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 993
Alignment:
Q  234 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagtaaactttgagatagaggagattgaaacaagggtttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgta 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  1168 tactttcactataaatatagaccttgtatcagagcaaactttgagatagaaggggctgaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgta 1069  T
Q  334 tagagtttgtctc-----tttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt 404  Q
    |||||||||||||     |||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||  ||| ||| ||||||||    
T  1068 tagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaatacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 388 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57452
Alignment:
Q  388 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt-gggactttgagtagaattaggcggga-gacttattcttgtaacccattgatatctc 485  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||| ||||||||| || ||||||||   || ||  |||||||||||||| |||||||||     
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  486 ttttgaaaagttactca-tcatatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 57452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 4732 - 4666
Alignment:
Q  518 gagggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgtt 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  4732 gagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactggatcaacaaattcctttgtgtt 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 374 - 451
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224880
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg 451  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 519 - 571
Target Start/End: Complemental strand, 5739 - 5687
Alignment:
Q  519 agggctgctctctcccccagactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaa 571  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||| |||||||||    
T  5739 agggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaa 5687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 374 - 547
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16482
Alignment:
Q  374 ttgattcaccttggaaaa--cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattagg-cgggagacttattcttgta 470  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||||||||||   | ||||| ||||||| |    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgga 16406  T
Q  471 acccattgatatctcttttgaaaagttactc--atca-tatagtgaaacagagggctgctctctcccccagactatgtca 547  Q
    || ||   ||||||| |||| ||||  ||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16407 actca---atatctc-tttgtaaagaaactcatatcattatagtggaacagagagctgctctctcccccagactaggtca 16482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 537 - 583
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1439
Alignment:
Q  537 agactatgtcaatttggactgaacttggtcaacaaattcttttgtgt 583  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1485 agactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaaattcttttgtgt 1439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17131
Alignment:
Q  392 cactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 17131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 544 times since January 2019
Visitors: 2229