View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0180_high_4 (Length: 261)

Name: NF0180_high_4
Description: NF0180
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0180_high_4
NF0180_high_4
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (1-241)||(12902757-12902997)
chr4 (1-241)||(7088877-7089117)
chr4 (2-241)||(44052829-44053068)
chr4 (1-239)||(22636437-22636674)
chr4 (1-234)||(23374240-23374473)
chr4 (6-241)||(7893703-7893935)
chr4 (29-241)||(16270145-16270356)
chr4 (57-241)||(7798774-7798958)
chr4 (1-241)||(16239851-16240090)
chr4 (1-236)||(14038653-14038888)
chr4 (1-238)||(16377404-16377639)
chr4 (1-241)||(14053183-14053422)
chr4 (1-241)||(17046487-17046724)
chr4 (69-241)||(6899891-6900062)
chr4 (116-241)||(52873363-52873488)
chr4 (26-238)||(44928829-44929042)
chr4 (75-238)||(18215274-18215436)
chr4 (26-238)||(54798669-54798872)
chr4 (75-238)||(12307-12469)
chr4 (75-238)||(15118352-15118514)
chr4 (75-238)||(23803265-23803427)
chr4 (75-238)||(52312510-52312672)
chr4 (69-238)||(1837503-1837671)
chr4 (75-244)||(19242693-19242861)
chr4 (75-238)||(3515007-3515169)
chr4 (115-238)||(14280316-14280438)
chr4 (75-238)||(44615288-44615450)
chr4 (75-238)||(44773087-44773249)
chr4 (75-238)||(50222339-50222501)
chr4 (75-238)||(51463868-51464030)
chr4 (92-238)||(18239436-18239581)
chr4 (1-118)||(17047953-17048070)
chr4 (75-240)||(19618172-19618336)
chr4 (155-241)||(3096293-3096379)
chr4 (12-126)||(3096759-3096872)
chr4 (75-234)||(15355324-15355483)
chr4 (75-238)||(44102214-44102376)
chr4 (26-241)||(15367690-15367905)
chr4 (26-241)||(15402703-15402918)
chr4 (107-241)||(15370018-15370152)
chr4 (75-238)||(12610950-12611105)
chr4 (135-241)||(15371202-15371307)
chr4 (135-241)||(15373483-15373588)
chr4 (75-240)||(14970707-14970871)
chr4 (26-226)||(52243099-52243302)
chr4 (107-241)||(16223532-16223666)
chr4 (63-222)||(13794-13953)
chr4 (115-238)||(8574864-8574985)
chr4 (75-239)||(22353835-22353999)
chr4 (66-192)||(43256106-43256230)
chr4 (92-222)||(21815602-21815731)
chr4 (75-238)||(7641192-7641344)
chr4 (75-235)||(20149832-20149992)
chr4 (170-241)||(15551817-15551889)
chr4 (118-241)||(39706286-39706409)
chr4 (165-237)||(12774011-12774084)
chr4 (63-226)||(43198496-43198661)
chr4 (123-226)||(12288211-12288316)
chr4 (140-222)||(6190481-6190564)
chr4 (63-237)||(15093775-15093949)
chr4 (165-237)||(8846360-8846433)
chr4 (64-237)||(15121747-15121917)
chr4 (171-220)||(17333298-17333347)
chr4 (26-81)||(14280462-14280518)
chr4 (139-237)||(16348682-16348780)
chr4 (139-237)||(16356970-16357068)
chr4 (1-44)||(15091093-15091136)
chr4 (164-222)||(46640499-46640558)
chr4 (178-215)||(11250619-11250656)
chr4 (26-77)||(8574784-8574836)
chr4 (178-214)||(15353365-15353401)
chr4 (171-222)||(53082202-53082254)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-241)||(13211-13450)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (1-241)||(27250610-27250850)
chr1 (1-241)||(21026680-21026920)
chr1 (1-241)||(22532269-22532509)
chr1 (1-240)||(50210094-50210333)
chr1 (1-238)||(34509783-34510020)
chr1 (1-164)||(22354453-22354616)
chr1 (27-240)||(22468604-22468816)
chr1 (8-240)||(20135188-20135420)
chr1 (1-241)||(38801272-38801508)
chr1 (2-130)||(22356056-22356185)
chr1 (2-130)||(22357742-22357871)
chr1 (75-238)||(13988866-13989028)
chr1 (75-238)||(21923291-21923453)
chr1 (75-238)||(23593735-23593897)
chr1 (75-241)||(45574842-45575008)
chr1 (75-238)||(21475087-21475249)
chr1 (75-238)||(31612313-31612475)
chr1 (75-239)||(21840766-21840929)
chr1 (26-238)||(433012-433222)
chr1 (75-238)||(29298137-29298298)
chr1 (75-238)||(29776688-29776850)
chr1 (20-118)||(48603637-48603735)
chr1 (75-238)||(16275363-16275526)
chr1 (141-241)||(20847175-20847275)
chr1 (75-240)||(16361915-16362079)
chr1 (66-192)||(33797570-33797694)
chr1 (75-241)||(13212861-13213027)
chr1 (119-244)||(15860052-15860177)
chr1 (135-244)||(21342090-21342198)
chr1 (75-238)||(21346961-21347124)
chr1 (107-238)||(21707167-21707297)
chr1 (107-238)||(21711709-21711839)
chr1 (57-237)||(21787979-21788159)
chr1 (75-235)||(40389157-40389317)
chr1 (63-222)||(21861513-21861672)
chr1 (63-222)||(21896199-21896358)
chr1 (75-238)||(22123067-22123230)
chr1 (173-240)||(20454606-20454673)
chr1 (26-226)||(16758664-16758866)
chr1 (115-237)||(22921864-22921986)
chr1 (115-237)||(33681011-33681133)
chr1 (32-222)||(35260992-35261180)
chr1 (152-237)||(21714546-21714631)
chr1 (134-234)||(21754052-21754152)
chr1 (143-241)||(14295574-14295672)
chr1 (115-237)||(22237631-22237753)
chr1 (1-63)||(20847100-20847163)
chr1 (143-225)||(20918620-20918702)
chr1 (165-237)||(20248283-20248356)
chr1 (165-226)||(52928014-52928076)
chr1 (122-222)||(50614117-50614219)
chr1 (122-222)||(50621945-50622047)
chr1 (122-222)||(41050036-41050138)
chr1 (164-222)||(16368329-16368388)
chr1 (178-240)||(24783150-24783212)
chr1 (152-237)||(42865245-42865330)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (5-241)||(13442274-13442510)
chr3 (2-241)||(17487856-17488095)
chr3 (2-241)||(17499338-17499577)
chr3 (6-241)||(20698322-20698556)
chr3 (1-241)||(12399209-12399449)
chr3 (11-241)||(26686887-26687117)
chr3 (1-241)||(23083242-23083482)
chr3 (11-241)||(43840932-43841162)
chr3 (1-241)||(14972854-14973094)
chr3 (1-237)||(14576714-14576949)
chr3 (26-238)||(24153115-24153326)
chr3 (1-241)||(18438534-18438774)
chr3 (1-228)||(14572602-14572828)
chr3 (1-241)||(25476266-25476506)
chr3 (1-241)||(11424644-11424880)
chr3 (25-223)||(42386428-42386627)
chr3 (1-238)||(40213602-40213838)
chr3 (1-226)||(30029855-30030079)
chr3 (75-238)||(29172583-29172745)
chr3 (75-238)||(7781347-7781509)
chr3 (75-238)||(9707607-9707769)
chr3 (75-238)||(17463178-17463340)
chr3 (75-238)||(17672626-17672788)
chr3 (75-238)||(34159326-34159488)
chr3 (75-238)||(45606907-45607069)
chr3 (75-238)||(55476491-55476653)
chr3 (92-238)||(28848628-28848773)
chr3 (1-118)||(16796670-16796787)
chr3 (75-238)||(8899094-8899256)
chr3 (75-238)||(16454281-16454443)
chr3 (75-238)||(17446655-17446816)
chr3 (75-238)||(38961891-38962053)
chr3 (75-238)||(13151790-13151953)
chr3 (75-238)||(13154255-13154418)
chr3 (75-239)||(13544024-13544187)
chr3 (75-238)||(6469134-6469296)
chr3 (75-238)||(10247723-10247885)
chr3 (75-234)||(12567564-12567722)
chr3 (73-239)||(46822267-46822434)
chr3 (75-238)||(50242822-50242984)
chr3 (20-118)||(14179555-14179653)
chr3 (124-238)||(55500942-55501055)
chr3 (75-236)||(16282811-16282971)
chr3 (115-238)||(36166598-36166719)
chr3 (94-241)||(43550497-43550644)
chr3 (62-239)||(12511059-12511237)
chr3 (75-236)||(41123892-41124049)
chr3 (135-238)||(12119785-12119887)
chr3 (135-238)||(15412429-15412531)
chr3 (107-238)||(15977515-15977645)
chr3 (75-222)||(53070653-53070799)
chr3 (26-241)||(24340628-24340844)
chr3 (135-238)||(8499518-8499620)
chr3 (141-238)||(44494809-44494905)
chr3 (118-241)||(14234487-14234610)
chr3 (115-227)||(21618460-21618570)
chr3 (135-238)||(10556985-10557087)
chr3 (107-238)||(27165250-27165381)
chr3 (141-238)||(17737236-17737335)
chr3 (115-241)||(13210325-13210448)
chr3 (26-222)||(52523633-52523831)
chr3 (122-237)||(15470928-15471043)
chr3 (97-238)||(53301527-53301669)
chr3 (165-237)||(12174303-12174376)
chr3 (96-223)||(23274705-23274832)
chr3 (115-237)||(16097332-16097454)
chr3 (115-237)||(16103784-16103905)
chr3 (165-234)||(32307684-32307754)
chr3 (165-237)||(49668120-49668193)
chr3 (177-238)||(28194693-28194755)
chr3 (165-237)||(9512924-9512997)
chr3 (165-237)||(9520899-9520972)
chr3 (26-241)||(37642170-37642386)
chr3 (185-238)||(45577947-45578000)
chr3 (17-118)||(12339890-12339986)
chr3 (70-237)||(856140-856304)
chr3 (165-234)||(1644718-1644787)
chr3 (152-237)||(23408428-23408513)
chr3 (173-237)||(23077530-23077594)
chr3 (122-222)||(37251168-37251270)
chr3 (122-222)||(43925977-43926079)
chr3 (178-240)||(14665398-14665460)
chr3 (92-237)||(11298500-11298644)
chr3 (171-220)||(13919350-13919399)
chr3 (152-237)||(15878083-15878168)
chr3 (63-159)||(2051142-2051238)
chr3 (173-237)||(14878569-14878633)
chr3 (171-222)||(22110402-22110454)
chr3 (118-222)||(12377940-12378046)
chr3 (178-240)||(14668554-14668616)
chr3 (178-215)||(3389994-3390031)
chr3 (172-237)||(15060284-15060349)
chr3 (172-236)||(15051509-15051573)
chr3 (26-81)||(21618594-21618650)
chr3 (26-77)||(36166747-36166799)
[»] chr7 (77 HSPs)
chr7 (2-241)||(9509189-9509428)
chr7 (1-241)||(12698831-12699072)
chr7 (1-241)||(26211995-26212236)
chr7 (1-241)||(10589039-10589278)
chr7 (5-241)||(16386132-16386369)
chr7 (26-238)||(18456319-18456530)
chr7 (1-241)||(38227481-38227720)
chr7 (1-239)||(40443393-40443629)
chr7 (1-238)||(3564245-3564482)
chr7 (1-241)||(27847714-27847951)
chr7 (75-241)||(13647325-13647491)
chr7 (69-238)||(16213684-16213852)
chr7 (122-238)||(48273392-48273508)
chr7 (75-238)||(456321-456483)
chr7 (75-238)||(11972496-11972658)
chr7 (75-238)||(14949122-14949284)
chr7 (75-238)||(15376713-15376875)
chr7 (75-238)||(16232520-16232682)
chr7 (75-238)||(18640272-18640434)
chr7 (75-238)||(20385123-20385285)
chr7 (75-238)||(21189595-21189757)
chr7 (75-238)||(32125491-32125653)
chr7 (75-238)||(41522917-41523079)
chr7 (75-238)||(41525379-41525541)
chr7 (75-237)||(11393287-11393448)
chr7 (75-241)||(18430709-18430874)
chr7 (92-234)||(24275175-24275316)
chr7 (95-238)||(16410059-16410201)
chr7 (75-238)||(24702238-24702400)
chr7 (75-238)||(27216860-27217022)
chr7 (72-237)||(14932685-14932851)
chr7 (72-237)||(15356120-15356286)
chr7 (72-237)||(15360234-15360400)
chr7 (35-241)||(2280033-2280238)
chr7 (75-238)||(44116509-44116671)
chr7 (75-238)||(3386333-3386495)
chr7 (110-238)||(13869346-13869474)
chr7 (75-238)||(24704688-24704847)
chr7 (8-226)||(15143925-15144143)
chr7 (26-238)||(17061866-17062077)
chr7 (122-241)||(22072913-22073033)
chr7 (75-234)||(38898376-38898535)
chr7 (112-238)||(13831373-13831498)
chr7 (75-238)||(20110556-20110708)
chr7 (122-241)||(67745-67864)
chr7 (143-241)||(28505321-28505419)
chr7 (143-241)||(34200786-34200884)
chr7 (65-218)||(15211480-15211633)
chr7 (118-237)||(811129-811248)
chr7 (118-237)||(16219715-16219834)
chr7 (118-241)||(47831807-47831930)
chr7 (143-241)||(16495402-16495500)
chr7 (115-237)||(18005650-18005772)
chr7 (75-238)||(26355983-26356156)
chr7 (75-238)||(26358435-26358608)
chr7 (108-192)||(2530126-2530208)
chr7 (188-241)||(15754955-15755008)
chr7 (165-237)||(44014182-44014255)
chr7 (75-222)||(12756671-12756817)
chr7 (152-235)||(18154873-18154956)
chr7 (144-241)||(11996051-11996148)
chr7 (63-237)||(17138006-17138177)
chr7 (26-241)||(19486649-19486865)
chr7 (26-226)||(1867901-1868101)
chr7 (143-241)||(10063841-10063939)
chr7 (64-237)||(12187019-12187189)
chr7 (63-219)||(12255734-12255892)
chr7 (122-226)||(16056343-16056446)
chr7 (26-81)||(48273538-48273594)
chr7 (164-226)||(12901338-12901401)
chr7 (26-214)||(15008404-15008593)
chr7 (171-226)||(14044761-14044817)
chr7 (171-226)||(14354791-14354847)
chr7 (178-240)||(2832499-2832561)
chr7 (152-237)||(19649521-19649606)
chr7 (178-215)||(20569654-20569691)
chr7 (178-214)||(9446216-9446252)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (1-241)||(20536208-20536448)
chr8 (1-241)||(18818290-18818530)
chr8 (6-241)||(21918886-21919121)
chr8 (1-241)||(21923809-21924049)
chr8 (2-241)||(18879119-18879352)
chr8 (1-241)||(31971257-31971495)
chr8 (10-241)||(7372778-7373001)
chr8 (11-241)||(23406379-23406611)
chr8 (1-241)||(22626736-22626975)
chr8 (1-241)||(45130879-45131117)
chr8 (1-240)||(23648554-23648793)
chr8 (1-240)||(28648925-28649164)
chr8 (1-241)||(16199527-16199765)
chr8 (1-244)||(6759255-6759496)
chr8 (10-241)||(16092231-16092463)
chr8 (25-241)||(22875065-22875281)
chr8 (20-241)||(21395883-21396101)
chr8 (20-241)||(21790376-21790594)
chr8 (25-241)||(21389358-21389571)
chr8 (38-241)||(21778697-21778897)
chr8 (75-238)||(14409444-14409606)
chr8 (1-118)||(25363021-25363138)
chr8 (75-238)||(1484402-1484564)
chr8 (75-238)||(5853292-5853454)
chr8 (75-234)||(16413316-16413474)
chr8 (75-238)||(20403227-20403389)
chr8 (75-238)||(22001753-22001915)
chr8 (73-239)||(18678054-18678221)
chr8 (75-238)||(41598188-41598350)
chr8 (75-238)||(4483281-4483442)
chr8 (75-238)||(4542373-4542535)
chr8 (75-238)||(15203231-15203393)
chr8 (75-238)||(20046195-20046357)
chr8 (73-239)||(32121734-32121901)
chr8 (75-238)||(19896265-19896430)
chr8 (135-244)||(19937066-19937174)
chr8 (141-234)||(45290761-45290853)
chr8 (118-241)||(6520368-6520491)
chr8 (75-238)||(14823774-14823935)
chr8 (115-238)||(26219717-26219838)
chr8 (115-241)||(38855246-38855372)
chr8 (135-225)||(15070571-15070660)
chr8 (75-238)||(25484275-25484430)
chr8 (75-240)||(26223917-26224081)
chr8 (63-234)||(13508028-13508199)
chr8 (126-241)||(17140916-17141031)
chr8 (115-238)||(26225288-26225409)
chr8 (144-241)||(21490995-21491092)
chr8 (63-234)||(13597560-13597731)
chr8 (143-241)||(5866297-5866395)
chr8 (92-222)||(19801399-19801527)
chr8 (69-241)||(17612059-17612231)
chr8 (57-237)||(23776772-23776952)
chr8 (63-222)||(20498581-20498740)
chr8 (122-237)||(21285601-21285716)
chr8 (123-226)||(983407-983512)
chr8 (170-237)||(23760893-23760961)
chr8 (165-237)||(26355742-26355815)
chr8 (191-241)||(21249384-21249434)
chr8 (191-241)||(21255222-21255272)
chr8 (115-229)||(21673716-21673830)
chr8 (122-222)||(37116366-37116468)
chr8 (171-222)||(24353039-24353091)
chr8 (26-77)||(26222987-26223039)
chr8 (164-214)||(19154930-19154981)
chr8 (64-214)||(20465982-20466132)
chr8 (178-217)||(20533467-20533506)
chr8 (152-237)||(17353975-17354060)
chr8 (173-222)||(20502154-20502203)
chr8 (171-220)||(22525579-22525628)
chr8 (92-228)||(16410226-16410361)
chr8 (171-222)||(17267044-17267096)
chr8 (122-214)||(17439507-17439601)
chr8 (173-237)||(17926758-17926822)
chr8 (26-81)||(26219862-26219918)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (1-241)||(20360841-20361081)
chr6 (5-241)||(20638168-20638404)
chr6 (9-241)||(22780116-22780348)
chr6 (1-241)||(17287677-17287917)
chr6 (1-241)||(29060540-29060780)
chr6 (1-241)||(25629236-25629476)
chr6 (74-241)||(16496244-16496411)
chr6 (1-240)||(18409708-18409947)
chr6 (1-241)||(19303422-19303661)
chr6 (1-241)||(20593773-20594013)
chr6 (74-241)||(20076700-20076863)
chr6 (1-241)||(16920514-16920751)
chr6 (66-241)||(35245586-35245758)
chr6 (1-241)||(22831503-22831742)
chr6 (94-238)||(1595549-1595692)
chr6 (75-238)||(12742317-12742479)
chr6 (75-238)||(18334592-18334754)
chr6 (75-238)||(19005046-19005208)
chr6 (75-238)||(19858919-19859081)
chr6 (75-238)||(22782227-22782389)
chr6 (75-238)||(24422547-24422709)
chr6 (75-238)||(25754809-25754971)
chr6 (75-238)||(33861794-33861956)
chr6 (75-238)||(33864278-33864440)
chr6 (75-240)||(30676710-30676874)
chr6 (75-238)||(2291180-2291342)
chr6 (75-238)||(8055029-8055191)
chr6 (135-238)||(25656629-25656731)
chr6 (75-238)||(26924640-26924802)
chr6 (75-240)||(34963371-34963535)
chr6 (95-238)||(25688502-25688644)
chr6 (92-238)||(1540928-1541073)
chr6 (26-226)||(25644335-25644537)
chr6 (1-218)||(25603266-25603482)
chr6 (75-235)||(16448526-16448686)
chr6 (26-222)||(18456735-18456930)
chr6 (75-238)||(3852017-3852179)
chr6 (92-222)||(18461895-18462024)
chr6 (114-239)||(19847989-19848114)
chr6 (73-239)||(23992429-23992593)
chr6 (1-222)||(11185524-11185742)
chr6 (126-238)||(20556943-20557054)
chr6 (94-241)||(20109140-20109285)
chr6 (1-218)||(25611604-25611820)
chr6 (66-192)||(27415887-27416011)
chr6 (34-214)||(15041465-15041644)
chr6 (165-241)||(27333262-27333339)
chr6 (165-241)||(27394002-27394079)
chr6 (141-222)||(18821866-18821946)
chr6 (180-241)||(25714417-25714478)
chr6 (143-241)||(28496494-28496592)
chr6 (143-241)||(29808905-29809003)
chr6 (188-241)||(1561303-1561356)
chr6 (26-241)||(8227416-8227632)
chr6 (165-237)||(19652199-19652272)
chr6 (164-226)||(9098557-9098620)
chr6 (122-241)||(23019408-23019525)
chr6 (126-229)||(4185827-4185930)
chr6 (164-220)||(33443068-33443124)
chr6 (123-226)||(19668386-19668491)
chr6 (152-237)||(19873120-19873205)
chr6 (92-237)||(21766695-21766839)
chr6 (194-241)||(22080799-22080846)
chr6 (92-214)||(18907134-18907255)
chr6 (152-237)||(19862978-19863063)
chr6 (188-237)||(31155465-31155514)
chr6 (126-229)||(4186379-4186482)
chr6 (178-215)||(19790837-19790874)
chr6 (171-222)||(23076749-23076801)
chr6 (171-222)||(35008167-35008219)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (1-241)||(22731115-22731355)
chr2 (1-241)||(23285865-23286101)
chr2 (1-241)||(22738061-22738300)
chr2 (1-241)||(23654267-23654507)
chr2 (11-241)||(23060513-23060742)
chr2 (25-241)||(23076442-23076658)
chr2 (1-238)||(298695-298933)
chr2 (1-241)||(37997-38235)
chr2 (1-241)||(22337115-22337355)
chr2 (1-241)||(23660023-23660262)
chr2 (1-241)||(20309108-20309345)
chr2 (75-238)||(22105412-22105575)
chr2 (75-235)||(21155060-21155219)
chr2 (75-238)||(18808943-18809105)
chr2 (75-238)||(23130862-23131024)
chr2 (75-238)||(23133329-23133491)
chr2 (75-238)||(23709532-23709694)
chr2 (75-238)||(23712013-23712175)
chr2 (75-238)||(26505379-26505541)
chr2 (75-238)||(26507857-26508019)
chr2 (75-238)||(34402522-34402684)
chr2 (75-238)||(39682313-39682475)
chr2 (92-238)||(23135590-23135735)
chr2 (26-241)||(23708524-23708738)
chr2 (75-240)||(32214921-32215085)
chr2 (75-238)||(571397-571559)
chr2 (75-238)||(6725995-6726157)
chr2 (75-238)||(24367774-24367936)
chr2 (75-238)||(24898195-24898358)
chr2 (75-238)||(24900678-24900841)
chr2 (75-238)||(24903155-24903318)
chr2 (75-238)||(24905632-24905795)
chr2 (75-238)||(24908107-24908270)
chr2 (75-238)||(32039498-32039660)
chr2 (122-241)||(23103399-23103516)
chr2 (90-234)||(25616192-25616336)
chr2 (75-238)||(28577099-28577261)
chr2 (92-238)||(45029871-45030016)
chr2 (75-236)||(43137301-43137461)
chr2 (135-238)||(24529589-24529691)
chr2 (164-241)||(8946657-8946734)
chr2 (2-86)||(27753730-27753814)
chr2 (75-238)||(38967374-38967537)
chr2 (115-236)||(28405981-28406103)
chr2 (69-241)||(19671830-19672001)
chr2 (118-237)||(7679589-7679707)
chr2 (63-237)||(22799069-22799243)
chr2 (178-241)||(23040247-23040310)
chr2 (94-222)||(7707-7835)
chr2 (63-237)||(23019649-23019823)
chr2 (115-237)||(25175854-25175976)
chr2 (159-235)||(24643034-24643109)
chr2 (165-240)||(22134251-22134326)
chr2 (143-241)||(23071972-23072070)
chr2 (140-222)||(32451948-32452031)
chr2 (34-237)||(40622123-40622327)
chr2 (165-226)||(18786947-18787009)
chr2 (171-220)||(23287384-23287433)
chr2 (152-220)||(23038048-23038116)
chr2 (122-222)||(23207296-23207398)
chr2 (172-220)||(26392403-26392451)
chr2 (26-222)||(20520098-20520295)
chr2 (92-237)||(25963688-25963832)
chr2 (178-215)||(25961592-25961629)
chr2 (178-214)||(24655396-24655432)
chr2 (178-214)||(24869903-24869939)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (6-241)||(1851-2086)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (6-241)||(23390382-23390617)
chr5 (1-241)||(8286723-8286964)
chr5 (1-241)||(22075018-22075259)
chr5 (1-241)||(25421532-25421772)
chr5 (1-241)||(25431395-25431634)
chr5 (1-241)||(24493569-24493808)
chr5 (1-241)||(9077952-9078192)
chr5 (1-241)||(13025311-13025550)
chr5 (1-241)||(13095495-13095734)
chr5 (74-241)||(21808343-21808510)
chr5 (12-238)||(24529223-24529449)
chr5 (1-241)||(21292851-21293090)
chr5 (74-241)||(21729018-21729185)
chr5 (1-241)||(1096467-1096707)
chr5 (26-227)||(18418594-18418793)
chr5 (135-241)||(21997549-21997655)
chr5 (26-238)||(22412187-22412388)
chr5 (75-238)||(264768-264930)
chr5 (75-238)||(39363384-39363546)
chr5 (92-238)||(10732957-10733102)
chr5 (75-238)||(20909012-20909174)
chr5 (1-104)||(22107254-22107357)
chr5 (75-238)||(29329934-29330096)
chr5 (75-238)||(42245365-42245527)
chr5 (75-238)||(29345980-29346142)
chr5 (92-238)||(39245136-39245281)
chr5 (75-238)||(36154783-36154942)
chr5 (73-239)||(17517153-17517320)
chr5 (66-192)||(18356364-18356488)
chr5 (75-238)||(29348453-29348615)
chr5 (75-238)||(29350926-29351088)
chr5 (75-235)||(18319033-18319193)
chr5 (126-238)||(20902060-20902172)
chr5 (126-238)||(2154665-2154776)
chr5 (94-238)||(11581218-11581361)
chr5 (34-234)||(37723910-37724108)
chr5 (75-238)||(32027393-32027555)
chr5 (75-238)||(10775675-10775838)
chr5 (66-192)||(20910745-20910869)
chr5 (135-238)||(31061068-31061170)
chr5 (135-238)||(38619434-38619536)
chr5 (144-238)||(20918017-20918110)
chr5 (37-222)||(22144068-22144254)
chr5 (135-237)||(23064512-23064613)
chr5 (34-237)||(21873254-21873453)
chr5 (165-241)||(19660879-19660956)
chr5 (165-241)||(21329541-21329618)
chr5 (118-241)||(21502154-21502277)
chr5 (123-222)||(20026942-20027043)
chr5 (115-237)||(21565546-21565668)
chr5 (165-237)||(22959576-22959649)
chr5 (75-235)||(24067110-24067270)
chr5 (143-241)||(36314577-36314675)
chr5 (1-103)||(21986028-21986130)
chr5 (152-237)||(26704075-26704160)
chr5 (152-237)||(26973808-26973893)
chr5 (63-237)||(22032323-22032492)
chr5 (165-241)||(26012079-26012154)
chr5 (165-241)||(19668898-19668975)
chr5 (63-237)||(18769947-18770118)
chr5 (64-237)||(23572084-23572254)
chr5 (184-238)||(20806850-20806904)
chr5 (172-225)||(26732884-26732937)
chr5 (26-241)||(40725853-40726069)
chr5 (115-175)||(20766115-20766174)
chr5 (172-222)||(26740697-26740747)
chr5 (26-77)||(20766035-20766087)
chr5 (173-237)||(20805552-20805616)
chr5 (174-237)||(20766974-20767037)
chr5 (173-222)||(23469822-23469871)
chr5 (122-192)||(29448052-29448123)
chr5 (122-222)||(22178221-22178323)
chr5 (173-237)||(23512098-23512162)
chr5 (178-214)||(26680605-26680641)
chr5 (178-214)||(26952212-26952248)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-241)||(930-1169)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-241)||(3470-3710)
scaffold0292 (1-241)||(343-582)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-241)||(167860-168099)
scaffold0011 (1-241)||(51913-52153)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (2-241)||(6003-6245)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (2-241)||(4849-5088)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (6-223)||(24187-24406)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-241)||(38761-39000)
scaffold0145 (29-241)||(32942-33153)
scaffold0145 (126-243)||(9744-9860)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-241)||(8424-8650)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-238)||(22886-23122)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-241)||(32067-32304)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-241)||(15346-15584)
scaffold0114 (64-237)||(7295-7465)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-241)||(20910-21151)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (1-241)||(4712-4951)
scaffold0358 (1-176)||(1-175)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-241)||(8479-8715)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-241)||(3032-3271)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-241)||(1952-2192)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-241)||(13497-13735)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-241)||(25896-26135)
scaffold0026 (1-241)||(39858-40097)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-239)||(39479-39716)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-239)||(75096-75333)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-241)||(39913-40152)
scaffold0080 (122-222)||(19885-19987)
scaffold0080 (139-214)||(18674-18749)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (1-234)||(25946-26179)
scaffold0122 (115-238)||(44702-44825)
scaffold0122 (1-88)||(33376-33463)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-241)||(10307-10544)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (11-189)||(13144-13322)
scaffold0175 (166-241)||(34123-34199)
scaffold0175 (185-241)||(273-329)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-241)||(4508-4747)
scaffold0228 (1-241)||(12090-12329)
scaffold0228 (1-241)||(22042-22281)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-240)||(17096-17337)
scaffold0056 (92-222)||(79301-79430)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (37-240)||(3103-3306)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-241)||(16481-16721)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-241)||(16282-16519)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (2-151)||(124675-124824)
scaffold0021 (63-240)||(174767-174943)
scaffold0021 (172-241)||(121766-121835)
scaffold0021 (123-222)||(136370-136471)
scaffold0021 (123-222)||(145078-145179)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-241)||(933-1170)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (12-241)||(32851-33077)
scaffold0120 (12-241)||(45928-46154)
scaffold0120 (30-241)||(16113-16323)
scaffold0120 (180-241)||(17389-17450)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (1-238)||(339831-340065)
scaffold0003 (75-238)||(158450-158612)
scaffold0003 (66-192)||(71350-71474)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-241)||(1289-1526)
scaffold0106 (1-241)||(7266-7503)
scaffold0106 (173-238)||(15291-15356)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (103-241)||(28414-28552)
scaffold0046 (143-241)||(11292-11390)
scaffold0046 (143-241)||(1997-2095)
scaffold0046 (188-241)||(4552-4605)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (31-241)||(46995-47202)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-182)||(6669-6850)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-241)||(51582-51819)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-220)||(4545-4763)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-238)||(5012-5246)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-118)||(1037-1154)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (75-238)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (75-238)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (75-238)||(94411-94573)
scaffold0023 (75-234)||(17440-17598)
scaffold0023 (92-238)||(44454-44600)
scaffold0023 (114-237)||(100378-100501)
scaffold0023 (34-237)||(38394-38596)
scaffold0023 (170-241)||(119875-119947)
scaffold0023 (115-237)||(40169-40291)
scaffold0023 (165-237)||(101503-101576)
scaffold0023 (34-149)||(23581-23695)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (92-238)||(13392-13537)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (119-241)||(11442-11564)
scaffold0235 (1-57)||(11394-11450)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (15-178)||(3424-3588)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (75-238)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (75-238)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (75-238)||(82072-82234)
scaffold0037 (115-226)||(22665-22776)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (75-238)||(136680-136842)
scaffold0028 (75-238)||(139149-139311)
scaffold0028 (75-238)||(144087-144249)
scaffold0028 (75-238)||(134211-134373)
scaffold0028 (75-238)||(141618-141780)
scaffold0028 (143-239)||(62200-62296)
scaffold0028 (155-237)||(132662-132745)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (75-240)||(11286-11450)
scaffold0029 (64-237)||(12763-12933)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (75-235)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (75-239)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (75-238)||(16784-16946)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-160)||(27911-28070)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (74-241)||(128751-128917)
scaffold0031 (75-222)||(20379-20524)
scaffold0031 (152-213)||(65830-65891)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (75-234)||(501088-501246)
scaffold0001 (35-238)||(85539-85742)
scaffold0001 (134-237)||(160688-160791)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (75-238)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (75-238)||(40400-40562)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (94-226)||(8481-8613)
scaffold0621 (115-241)||(6535-6661)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (75-240)||(12249-12413)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-82)||(3640-3721)
scaffold0165 (1-82)||(7704-7785)
scaffold0165 (35-226)||(27663-27855)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (75-239)||(9241-9404)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (66-192)||(15362-15486)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-182)||(844-1021)
scaffold0395 (175-241)||(4888-4954)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (76-237)||(29558-29720)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (75-238)||(4214-4377)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (115-238)||(116430-116551)
scaffold0022 (122-222)||(128971-129072)
scaffold0022 (122-234)||(78328-78442)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (26-241)||(17932-18148)
scaffold0247 (135-238)||(2189-2291)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (75-224)||(29946-30094)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (75-238)||(12064-12220)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (63-222)||(53492-53651)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (75-238)||(161089-161252)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (35-222)||(13147-13336)
scaffold0357 (35-226)||(16014-16206)
scaffold0357 (171-222)||(2680-2732)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (75-235)||(1280-1440)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (34-214)||(26851-27027)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (115-237)||(19268-19390)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (97-238)||(38679-38820)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (115-222)||(1051-1158)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (143-238)||(15664-15759)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (118-241)||(6121-6244)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (115-237)||(2801-2923)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (63-241)||(11464-11642)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (63-241)||(38199-38377)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (115-229)||(129917-130031)
scaffold0010 (26-214)||(60620-60810)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (115-237)||(14692-14814)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (72-214)||(29117-29262)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (165-241)||(6611-6688)
scaffold0333 (165-241)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (165-241)||(15821-15898)
scaffold0020 (174-237)||(178898-178961)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (115-226)||(10536-10647)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-81)||(10323-10403)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (116-222)||(12587-12693)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (115-229)||(5655-5769)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (143-241)||(1092-1190)
scaffold0184 (178-215)||(4284-4321)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (34-215)||(16264-16443)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (63-237)||(4747-4921)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (63-220)||(8002-8161)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (152-237)||(23843-23928)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (134-241)||(32538-32643)
scaffold0034 (140-222)||(51903-51985)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (170-241)||(1083-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (118-241)||(12766-12889)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (1-61)||(17868-17928)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (170-237)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (118-237)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (122-237)||(45794-45909)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (115-237)||(133-255)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (165-237)||(28813-28887)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (65-218)||(192920-193074)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (34-237)||(21721-21920)
scaffold0210 (34-237)||(29613-29812)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (165-237)||(1086-1159)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (70-237)||(1881-2045)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (165-237)||(23927-24000)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (165-226)||(8118-8180)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (165-229)||(6824-6889)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (122-226)||(10542-10646)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (143-237)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (174-237)||(36454-36517)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (164-226)||(25121-25184)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (180-222)||(11982-12024)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (63-184)||(225465-225584)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (152-237)||(69794-69879)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (122-214)||(38343-38437)
scaffold0139 (152-237)||(19980-20065)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (2-49)||(20595-20642)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (171-214)||(206575-206618)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (139-237)||(44081-44179)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (92-237)||(897-1041)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (92-237)||(1830-1974)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (63-150)||(1170-1257)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (173-237)||(6095-6159)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (122-222)||(6284-6386)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (173-237)||(10575-10639)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (164-222)||(569-628)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (176-215)||(4999-5038)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (178-215)||(7328-7365)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (134-222)||(2694-2784)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (173-237)||(14664-14728)
scaffold0081 (173-237)||(23679-23743)
scaffold0081 (173-237)||(39103-39167)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (139-215)||(46745-46821)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (122-222)||(97024-97126)
scaffold0006 (122-222)||(106302-106404)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12902997 - 12902757
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902997 gtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 12902898  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902897 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12902798  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12902797 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7089117 - 7088877
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7089117 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 7089018  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089017 tgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 7088918  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7088917 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 44053068 - 44052829
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  44053068 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 44052969  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  44052968 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactg 44052869  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  44052868 agctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22636674 - 22636437
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22636674 gtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 22636576  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22636575 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaact 22636476  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22636475 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 23374240 - 23374473
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23374240 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23374339  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23374340 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23374439  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23374440 aagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7893935 - 7893703
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 105  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  7893935 attaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaag 7893839  T
Q  106 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
     ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893838 tataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagct 7893739  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7893738 gcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Original strand, 16270145 - 16270356
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16270145 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 16270244  T
Q  129 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 228  Q
    | | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16270245 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 16270343  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  16270344 aagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 57 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc 156  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  157 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16239851 - 16240090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  16239851 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattact 16239950  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  16239951 taaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaatt 16240049  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  16240050 aagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14038888 - 14038653
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14038888 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 14038789  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14038788 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaact 14038689  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038688 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 16377404 - 16377639
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16377404 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 16377503  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377504 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 16377601  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  16377602 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 14053183 - 14053422
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14053183 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 14053281  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaag-atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaa 198  Q
    ||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || |||||||||||    
T  14053282 tgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaa 14053379  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  14053380 ctaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatg-tttatacattact 17046626  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 116 - 241
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  116 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 52873462  T
Q  216 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  52873463 gtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||  ||||| ||||  |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||       ||    ||||||||||  ||   || |||||| |||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac------tt----attacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12407 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Original strand, 1837503 - 1837671
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1837503 ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttg 1837602  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1837603 tatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 gt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 gc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14280340  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  14280339 ggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 18239436 - 18239581
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  18239436 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgctgctgttgt 18239534  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18239535 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 17047953 - 17048070
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17047953 gtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 17048052  T
Q  101 tgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||  | |||||||||||    
T  17048053 tgagaattatttgaatat 17048070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||  |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  155 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3096872 - 3096759
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3096872 acttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatg-tttatgcattacttgaagaatatt 3096774  T
Q  112 tgaatatttaagatg 126  Q
    |||||||||| ||||    
T  3096773 tgaatatttatgatg 3096759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15355424 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44102376 - 44102214
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102376 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44102277  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44102276 ac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | ||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  125 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | ||| ||| |||||  |||| |||||| || |||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  125 tgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
     |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15370152 - 15370018
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15370152 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 15370054  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370053 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15371307 - 15371202
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15371307 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15371209  T
Q  235 atgatgt 241  Q
     ||||||    
T  15371208 ttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15373588 - 15373483
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15373588 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15373490  T
Q  235 atgatgt 241  Q
     ||||||    
T  15373489 ttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||| |  |||| ||||| ||| |||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    ||||| |||||| || |||||||| |||| |||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  222 gttga 226  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 107 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16223666 - 16223532
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16223666 atatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagct 16223568  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223567 gcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 13794 - 13953
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  13794 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 13893  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13894 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     ||||||||| || ||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  |  |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 43256202  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256203 ttggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 21815602 - 21815731
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||    
T  21815602 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-ttgtgttgctgtcgt 21815700  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21815701 tatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||         
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgt----- 7641286  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7641287 ------gttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 39706286 - 39706409
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  39706286 tttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12774084 - 12774011
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12774084 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 43198496 - 43198661
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||  |||| |||||       
T  43198496 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaat 43198595  T
Q  163 t-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    | ||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43198596 tgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  220 aagttga 226  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6190564 - 6190481
Alignment:
Q  140 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6190564 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15093949 - 15093775
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||  ||||||  |||| ||||||  ||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  15093949 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtcatgctg 15093850  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || ||||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||||    
T  15093849 ttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 8846433 - 8846360
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||    
T  8846433 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Original strand, 15121747 - 15121917
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 162  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |     
T  15121747 gttgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattgatataatta--tcatgatta 15121842  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || |||||  ||||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  15121843 ttgttgtaatctgcctatgctgatattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 15121917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280462
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 14280462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 16348682 - 16348780
Alignment:
Q  139 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16348682 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16348780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Original strand, 16356970 - 16357068
Alignment:
Q  139 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  16356970 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 16357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 15091136 - 15091093
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaag 44  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15091136 gtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 46640499 - 46640558
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  46640499 ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250656
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 11250656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13450 - 13211
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13450 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 13351  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13350 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 13251  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27250610 - 27250850
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27250610 gtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 27250709  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27250710 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 27250809  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27250810 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21026920 - 21026680
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21026920 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21026821  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21026820 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaact 21026721  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026720 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22532509 - 22532269
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22532509 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22532410  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532409 tgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22532310  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22532309 aaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 50210094 - 50210333
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  50210094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 50210193  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210194 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 50210293  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50210294 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34510020 - 34509783
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  34510020 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattact 34509921  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509920 tgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 34509821  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34509820 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 164
Target Start/End: Original strand, 22354453 - 22354616
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  22354453 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattact 22354552  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354553 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 27 - 240
Target Start/End: Original strand, 22468604 - 22468816
Alignment:
Q  27 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||| ||||||||    
T  22468604 taattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatg 22468702  T
Q  127 ttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22468703 ttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 22468802  T
Q  227 tgaagatgatgatg 240  Q
    | |||||| |||||    
T  22468803 ttaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20135420 - 20135188
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa 107  Q
    |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||      
T  20135420 taagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagtt 20135321  T
Q  108 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgc 207  Q
    |  ||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||    
T  20135320 ttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgc 20135221  T
Q  208 atgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20135220 atgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 38801272 - 38801508
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  38801272 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatg-tttatgcattact 38801370  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38801371 tgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctg---ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaac 38801467  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  38801468 taagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 22356056 - 22356185
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22356056 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22356155  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttga 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22356156 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 130
Target Start/End: Original strand, 22357742 - 22357871
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttg-ttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22357742 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22357841  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttga 130  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22357842 tgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 23593735 - 23593897
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593735 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23593834  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23593835 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433012
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T
Q  225 gatgaagatgatga 238  Q
    ||| ||||||||||    
T  433025 gattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 48603735 - 48603637
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  48603735 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 48603637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||| | | ||||||| |||||   ||| |||||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tg-ctatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847275
Alignment:
Q  141 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 20847274  T
Q  241 t 241  Q
    |    
T  20847275 t 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16362079 - 16361915
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16362079 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatact 16361980  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  16361979 gt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-- 33797598  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33797597 tttgtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Original strand, 13212861 - 13213027
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13212861 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 13212960  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||  |  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13212961 tgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 244
Target Start/End: Original strand, 15860052 - 15860177
Alignment:
Q  119 ttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 217  Q
    |||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15860052 ttaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15860150  T
Q  218 ctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    | |||||||| |||||||||| |||||    
T  15860151 ccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21342198 - 21342090
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  21342198 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 21342100  T
Q  235 atgatgtcca 244  Q
    |||| |||||    
T  21342099 atgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21347124 - 21346961
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21347124 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 21347025  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| | |||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21347024 tgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21707297 - 21707167
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 206  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21707297 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21707199  T
Q  207 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21707198 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21711839 - 21711709
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 206  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711839 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat-tgtgttgttgttgttatttaactaagctg 21711741  T
Q  207 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21711740 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788159
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt 155  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagt 21788077  T
Q  156 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21788078 catgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 21861513 - 21861672
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  21861513 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21861612  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21861613 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 21896199 - 21896358
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||| ||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  21896199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 21896298  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21896299 -ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || |||  ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  175 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 240
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16758866 - 16758664
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||   ||    
T  16758866 ttaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgt-ga 16758768  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    ||||| || |||| | |||||||| |||| |||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  16758767 tgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa 16758669  T
Q  222 gttga 226  Q
    |||||    
T  16758668 gttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 22921864 - 22921986
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22921864 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22921962  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  22921963 cggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 33681133 - 33681011
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| ||||||||| || ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33681133 atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 33681035  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  33681034 cggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 222
Target Start/End: Original strand, 35260992 - 35261180
Alignment:
Q  32 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 130  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||| ||||| | || ||||||| ||||  | | |||||||||||||  || | ||||| ||| |||||||||    
T  35260992 ataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttga 35261091  T
Q  131 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |   ||||| |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35261092 t---ttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21714631 - 21714546
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21714631 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21754152 - 21754052
Alignment:
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  21754152 attgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatga 21754054  T
Q  233 tg 234  Q
    ||    
T  21754053 tg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 14295574 - 14295672
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||    
T  14295574 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22237753 - 22237631
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22237753 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagt 22237655  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | ||||||||||| || |||||||    
T  22237654 cggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 20847100 - 20847163
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgtt 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20847100 gtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaagatgtgttgtt 20847163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20918702 - 20918620
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20918702 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20248356 - 20248283
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20248356 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 52928014 - 52928076
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52928014 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 50614117 - 50614219
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50614117 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50614215  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  50614216 taag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 50621945 - 50622047
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  50621945 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 50622043  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  50622044 taag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 41050036 - 41050138
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  41050036 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtct 41050135  T
Q  220 aag 222  Q
    |||    
T  41050136 aag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Original strand, 16368329 - 16368388
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16368329 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865330
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| ||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  42865245 atgtcatactgttgttgcaatctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13442510 - 13442274
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaa 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442510 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 13442411  T
Q  105 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442410 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagc 13442311  T
Q  205 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13442310 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17488095 - 17487856
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17488095 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 17487996  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17487995 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17487896  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17487895 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17499577 - 17499338
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17499577 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattactt 17499478  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17499477 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaacta 17499378  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17499377 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 20698322 - 20698556
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 105  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20698322 attaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaag 20698420  T
Q  106 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698421 aatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 20698520  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20698521 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12399449 - 12399209
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  12399449 gtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattact 12399350  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399349 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 12399250  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  12399249 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26687117 - 26686887
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  26687117 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 26687018  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26687017 tggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 26686918  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26686917 agtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23083242 - 23083482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083242 gtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 23083341  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
     |||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083342 agaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 23083441  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23083442 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 43841162 - 43840932
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  43841162 gacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 43841063  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43841062 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatg 43840963  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  43840962 agtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14973094 - 14972854
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14973094 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14972995  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14972994 tgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 14972895  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14972894 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 14576714 - 14576949
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14576714 gtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 14576813  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14576814 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14576912  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  14576913 aagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18438774 - 18438534
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18438774 gtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattact 18438675  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||   || |||   ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18438674 tgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18438575  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18438574 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14572828 - 14572602
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  14572828 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataatgtttttttcattatt 14572729  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14572728 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaact 14572630  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatg 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  14572629 aagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 25476266 - 25476506
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25476266 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattact 25476365  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  25476366 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaact 25476465  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25476466 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 11424644 - 11424880
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  11424644 gtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattact 11424743  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || ||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424744 tgaattatgaatgcataattgagatgttgat---ttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 11424839  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424840 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 42386627 - 42386428
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||   ||||||||| ||    
T  42386627 gttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgag 42386528  T
Q  124 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42386527 atgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 40213602 - 40213838
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  40213602 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 40213701  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    || |  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  40213702 tggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgttgttatttaact 40213800  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40213801 aagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30030079 - 30029855
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  30030079 gtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattact 30029980  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||  |  |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  30029979 tgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaact 30029881  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30029880 aagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 29172583 - 29172745
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172583 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29172682  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29172683 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 gc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 28848628 - 28848773
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  28848628 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 28848726  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28848727 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 16796787 - 16796670
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16796787 gtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 16796688  T
Q  101 tgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||  | |||||||||||    
T  16796687 tgagaattatttgaatat 16796670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| ||| || || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12567622 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 46822434 - 46822267
Alignment:
Q  73 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||  ||||     
T  46822434 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaa 46822335  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46822334 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  50242884 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14179653 - 14179555
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  14179653 aagaagttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatat 14179555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  124 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  224 tgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16282911 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Original strand, 43550497 - 43550644
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  43550497 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcatta 43550596  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  43550597 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 12511237 - 12511059
Alignment:
Q  62 ttgttgattatgatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 160  Q
    ||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||     
T  12511237 ttgttgaataagatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgt 12511138  T
Q  161 tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Original strand, 12119785 - 12119887
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12119785 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12119883  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  12119884 atga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15412531 - 15412429
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15412531 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15412433  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  15412432 atga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15977645 - 15977515
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 206  Q
    |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15977645 atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  207 catgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8499620 - 8499518
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  8499620 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 8499522  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  8499521 atga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494809
Alignment:
Q  141 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14234610 - 14234487
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14234610 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcag 14234512  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  14234511 tctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618460
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  215 agtctaagttgat 227  Q
     ||||||||||||    
T  21618472 ggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10557087 - 10556985
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10557087 ttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  10556988 atga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 107 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27165381 - 27165250
Alignment:
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagct 205  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||| |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27165381 atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagct 27165283  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27165282 gcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737236
Alignment:
Q  141 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 17737237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 13210325 - 13210448
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    ||||||||| |||||||   ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13210325 atatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 13210420  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||    
T  13210421 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||| |||| |||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470928
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15470945  T
Q  221 agttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||| || |||||||    
T  15470944 agttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301669
Alignment:
Q  97 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga-tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttat 194  Q
    ||||||||  |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  195 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 12174303 - 12174376
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12174303 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274705
Alignment:
Q  96 ttacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttat 194  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  195 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16097454 - 16097332
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| | ||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16097454 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16097356  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16097355 cggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16103905 - 16103784
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16103905 atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagt 16103808  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  16103807 cggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32307754 - 32307684
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32307754 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 49668120 - 49668193
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  49668120 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  177 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9512997 - 9512924
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9512997 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 9520972 - 9520899
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  9520972 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  185 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 12339986 - 12339890
Alignment:
Q  17 atgaagaggttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaa 115  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  | ||||||||    
T  12339986 atgaagaggctaattataatatgtgaagctgttttaagatgtgttgttgt------tgatgtgatataatgttttatgcatcacttgagaattatttgaa 12339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 856304 - 856140
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttg 168  Q
    ||||||||  ||||||||||  || |||||||||||| || ||| |||  |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||    
T  856304 tatgatgtattataatgttta-tgtattacttgaagattaattgtatacataagatgttgttgaattg-aattggtataattat--catgattgttgttg 856209  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  856208 taatctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 234
Target Start/End: Original strand, 1644718 - 1644787
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||    
T  1644718 tttgcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23408513 - 23408428
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23408513 atgtcacgctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataagatgatcaagatgatg 23408428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 37251168 - 37251270
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||    
T  37251168 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtc 37251266  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  37251267 taag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43926079 - 43925977
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  43926079 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 43925981  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  43925980 taag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 11298500 - 11298644
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  11298500 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 11298598  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  11298599 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 11298644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 15878083 - 15878168
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  15878083 atgtcatattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 159
Target Start/End: Original strand, 2051142 - 2051238
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg 159  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||    
T  2051142 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110454
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12378046 - 12377940
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||     
T  12378046 tttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcg 12377947  T
Q  216 gtctaag 222  Q
    |||||||    
T  12377946 gtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390031
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 3390031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15060349 - 15060284
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  15060349 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgatg 15060284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15051573 - 15051509
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  ||||||||    
T  15051573 actgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcattgtaagatgaataagatgat 15051509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 21618594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 77)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9509428 - 9509189
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9509428 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattactt 9509329  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9509328 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaacta 9509229  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9509228 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12699072 - 12698831
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12699072 gtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 12698973  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698972 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 12698873  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12698872 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26212236 - 26211995
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26212236 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattact 26212137  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26212136 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26212037  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag-atgatgatgt 241  Q
    ||| || ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212036 aagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10589278 - 10589039
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  10589278 gtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgttta-tgcattgct 10589180  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10589179 tgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaact 10589080  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||    
T  10589079 aagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 16386132 - 16386369
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  16386132 cattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgag 16386231  T
Q  105 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 203  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  16386232 aattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaag 16386331  T
Q  204 ctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16386332 ctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 38227720 - 38227481
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||| |    
T  38227720 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaat 38227621  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38227620 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 38227522  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  38227521 aagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 40443629 - 40443393
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  40443629 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 40443531  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40443530 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaac 40443433  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  40443432 taagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 3564245 - 3564482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||    
T  3564245 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattact 3564344  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564345 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3564444  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3564445 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27847714 - 27847951
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  27847714 gtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatg-tttatgcattact 27847812  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||| || |||||||||    
T  27847813 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactg---ttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaac 27847909  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  27847910 taagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16213852 - 16213684
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    ||||| |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16213852 ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttg 16213753  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16213752 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 48273409  T
Q  222 gttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| ||||||||||    
T  48273408 gttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  456383 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  11393387 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24275316 - 24275175
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24275316 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgt 24275218  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24275217 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16410201 - 16410059
Alignment:
Q  95 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 194  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||    
T  16410201 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttat 16410103  T
Q  195 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16410102 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgta 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Original strand, 2280033 - 2280238
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| || | || |||| |||||  |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  2280033 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttga 2280132  T
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  2280133 tttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 2280229  T
Q  233 tgatgatgt 241  Q
    |||||||||    
T  2280230 tgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 gc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | || ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13869474 - 13869346
Alignment:
Q  110 tttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    |||||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13869474 tttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgca 13869376  T
Q  209 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13869375 tgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 8 - 226
Target Start/End: Original strand, 15143925 - 15144143
Alignment:
Q  8 taagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga 106  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| ||      
T  15143925 taagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatgatgttatacgcattacttaaatt 15144024  T
Q  107 atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctg 206  Q
    ||   || ||| || |||||||| ||  ||||| |||||||||| || || ||||||| ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144025 atgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagctg 15144123  T
Q  207 catgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15144124 catgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || |||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  224 tgatgaagatgatga 238  Q
    |||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  221 agttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  38898476 tgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 112 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13831498 - 13831373
Alignment:
Q  112 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 211  Q
    |||||| || ||| |||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831498 tgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  212 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20110708 - 20110556
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20110708 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata-- 20110611  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
             ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20110610 ---------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 67864 - 67745
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  67864 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 67766  T
Q  221 agttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  67765 agttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34200884 - 34200786
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34200884 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211480
Alignment:
Q  65 ttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| ||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  165 tttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 15211480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 811129 - 811248
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  811129 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Original strand, 16219715 - 16219834
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  16219715 tttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  16219814 tctaagttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47831930 - 47831807
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | | | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  47831930 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16495500 - 16495402
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16495500 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18005772 - 18005650
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18005772 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 18005674  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  18005673 cggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356156
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  175 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26356083 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358608
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  175 g----------cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |            | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26358535 gttgtgtttatgttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 2530126 - 2530208
Alignment:
Q  108 tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||    
T  2530126 tatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755008
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44014255 - 44014182
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 12756671 - 12756817
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12756671 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 12756770  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  12756771 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 152 - 235
Target Start/End: Original strand, 18154873 - 18154956
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18154873 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Original strand, 11996051 - 11996148
Alignment:
Q  144 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11996051 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 17138006 - 17138177
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct- 161  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  |||| |     
T  17138006 tgttgaatatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataattat--catgatt 17138101  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17138102 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486865
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19486848 cgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 1867901 - 1868101
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 125  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||| ||||| | || |||||||||| |  | | |||||||| ||||  |||| ||| | ||| ||||    
T  1867901 ttaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagat 1867999  T
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||| | | ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  1868000 gttgttcatttgca-ttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1868097  T
Q  223 ttga 226  Q
    ||||    
T  1868098 ttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12187189 - 12187019
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 162  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  12187189 gttgaatatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12187094  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |  |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12187093 taattgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 63 - 219
Target Start/End: Original strand, 12255734 - 12255892
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | || ||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| || |||||||| |||| |||||       
T  12255734 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaat 12255833  T
Q  163 tt-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    |  |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255834 tgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056343
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtcta 16056349  T
Q  221 agttga 226  Q
    ||||||    
T  16056348 agttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273538
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcata 48273538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12901401 - 12901338
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12901401 ttttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 15008404 - 15008593
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| | || |||||||||| |  | | |||||||||||||  |||| || || ||| ||     
T  15008404 ttaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagg 15008502  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||  ||| |||| |||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15008503 tgttgttgatttgc-attgatattgttatatcatgaactg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 15008593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 240
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 19649521 - 19649606
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||  |||| |||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19649521 atgtcatattgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569691
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 20569691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20536448 - 20536208
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20536448 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 20536349  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20536348 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaact 20536249  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20536248 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18818290 - 18818530
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  18818290 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 18818389  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818390 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 18818489  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18818490 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 21918886 - 21919121
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  21918886 attaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgttta-tgcattacttgaag 21918984  T
Q  106 aat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918985 aattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 21919084  T
Q  205 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21919085 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21923809 - 21924049
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||| |||||||||||    
T  21923809 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattact 21923908  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923909 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaact 21924008  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21924009 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 18879119 - 18879352
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18879119 tagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattactt 18879217  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879218 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 18879312  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18879313 agctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 31971495 - 31971257
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31971495 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 31971397  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971396 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 31971298  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  31971297 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7373001 - 7372778
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaata 109  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        ||||||||||||| |||    
T  7373001 agacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa--------gcattacttgaagtata 7372910  T
Q  110 tttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 209  Q
     |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372909 attgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcat 7372810  T
Q  210 gagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7372809 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23406611 - 23406379
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  23406611 gacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23406512  T
Q  111 ttgaatatttaagatgtt--gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    |||||||||||||||| |  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406511 ttgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 23406412  T
Q  209 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23406411 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22626975 - 22626736
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |   |||||||    
T  22626975 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattact 22626876  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626875 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 22626777  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22626776 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 45130879 - 45131117
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  45130879 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 45130977  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45130978 tgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaac 45131075  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  45131076 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23648793 - 23648554
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23648793 gtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattact 23648694  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||  |  ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23648693 tgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaact 23648594  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23648593 aagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 28648925 - 28649164
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  28648925 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 28649024  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28649025 tgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaact 28649124  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28649125 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16199527 - 16199765
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16199527 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatg-tttatgcattact 16199625  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16199626 tgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaac 16199723  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16199724 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6759496 - 6759255
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 99  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||     
T  6759496 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaa 6759397  T
Q  100 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||||  ||   || ||| || |||||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6759396 ttgaattatgagtgtataattgagatgttgac---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaac 6759300  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 244  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759299 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 241
Target Start/End: Original strand, 16092231 - 16092463
Alignment:
Q  10 agacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat 108  Q
    |||||||| || || |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||  ||    
T  16092231 agacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattat 16092330  T
Q  109 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
       || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092331 gaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgca 16092430  T
Q  209 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16092431 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22875281 - 22875065
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaag 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   || |||||| ||    
T  22875281 gttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgag 22875182  T
Q  124 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22875181 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaat 22875083  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22875082 tgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 21395883 - 21396101
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatt 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||      
T  21395883 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtataca 21395981  T
Q  120 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21395982 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21396078  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21396079 taagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 241
Target Start/End: Original strand, 21790376 - 21790594
Alignment:
Q  20 aagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatt 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||      
T  21790376 aagaagttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtataca 21790474  T
Q  120 taagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21790475 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21790571  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21790572 taagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21389456  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21389457 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21389553  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||||||||||||||    
T  21389554 tgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 241
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  38 tgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 137  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  138 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
     | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  237 gatgt 241  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 25363021 - 25363138
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25363021 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattact 25363120  T
Q  101 tgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||  | |||||||||||    
T  25363121 tgagaattatttgaatat 25363138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Original strand, 18678054 - 18678221
Alignment:
Q  73 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||     
T  18678054 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaa 18678153  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18678154 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 41598350 - 41598188
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598350 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41598251  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
      || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41598250 -actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatctt 4542472  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4542473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32121901 - 32121734
Alignment:
Q  73 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||     
T  32121901 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaa 32121802  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121801 tctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattat---gtcatgctgtttttgtat 171  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 244
Target Start/End: Original strand, 19937066 - 19937174
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  19937066 ttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatg 19937164  T
Q  235 atgatgtcca 244  Q
    |||| |||||    
T  19937165 atgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 141 - 234
Target Start/End: Original strand, 45290761 - 45290853
Alignment:
Q  141 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45290761 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6520491 - 6520368
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6520491 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||| | ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Original strand, 38855246 - 38855372
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38855246 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 38855344  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  38855345 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15070660 - 15070571
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070660 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
           | ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26224081 - 26223917
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | ||||||| || ||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  26224081 tgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatatt 26223982  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  26223981 g-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Original strand, 13508028 - 13508199
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  13508028 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13508127  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    || | | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13508128 ttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    |||||||| || || | ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17140933  T
Q  225 gatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||||||    
T  17140932 gttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21491092 - 21490995
Alignment:
Q  144 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21491092 atattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 234
Target Start/End: Original strand, 13597560 - 13597731
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||||  ||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| ||    
T  13597560 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg 13597659  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||| | || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13597660 tttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 5866297 - 5866395
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  5866297 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 19801399 - 19801527
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| ||||    
T  19801399 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg-ttgtgttgctattgt 19801496  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19801497 tatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612231
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-g 17612157  T
Q  169 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 237
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776952
Alignment:
Q  57 tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt 155  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagt 23776870  T
Q  156 catgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| | ||||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23776871 catgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20498740 - 20498581
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||     
T  20498740 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct- 20498642  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     ||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20498641 attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285601
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtcta 21285618  T
Q  221 agttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  21285617 agttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt-tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  221 agttga 226  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760961
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 26355742 - 26355815
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  26355742 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  191 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  191 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21673830 - 21673716
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21673830 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagt 21673732  T
Q  214 cagtctaagttgatga 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  21673731 cggtctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37116468 - 37116366
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37116468 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 37116370  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  37116369 taag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 214
Target Start/End: Original strand, 19154930 - 19154981
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19154930 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 19154981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 20465982 - 20466132
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | || ||| ||    
T  20465982 gttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgttg 20466080  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466081 ttgttgtgatctgcctatactgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20466132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 217
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533506
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 217  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagt 20533506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Original strand, 17353975 - 17354060
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  17353975 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 228
Target Start/End: Original strand, 16410226 - 16410361
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || ||||| |||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  16410226 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 16410324  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 228  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||    
T  16410325 tatttcactaagttgcatgagtcattataagatgatg 16410361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267096
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Original strand, 17439507 - 17439601
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  17439507 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17439601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 17926758 - 17926822
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  17926758 ctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 17926822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219862
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcata 26219862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 20360841 - 20361081
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20360841 gtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 20360940  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20360941 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaact 20361040  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  20361041 aagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 241
Target Start/End: Original strand, 20638168 - 20638404
Alignment:
Q  5 cattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaa 104  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  20638168 cattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaa 20638267  T
Q  105 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagc 204  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20638268 gaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagc 20638367  T
Q  205 tgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  20638368 tgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Original strand, 22780116 - 22780348
Alignment:
Q  9 aagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat 108  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  22780116 aagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtat 22780215  T
Q  109 atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgca 208  Q
    | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22780216 aattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgca 22780315  T
Q  209 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780316 tgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 17287677 - 17287917
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  17287677 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattact 17287776  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17287777 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaact 17287876  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17287877 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 29060780 - 29060540
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  29060780 gtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattact 29060681  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060680 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 29060581  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060580 aagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 25629236 - 25629476
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  25629236 gtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 25629335  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  25629336 tgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaact 25629435  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25629436 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 18409708 - 18409947
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||| |    
T  18409708 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatt 18409807  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||  || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18409808 tgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaact 18409907  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18409908 gagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 19303422 - 19303661
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||| | ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  19303422 gtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattact 19303521  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19303522 tgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaact 19303620  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303621 aagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20594013 - 20593773
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||    
T  20594013 gtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattact 20593914  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  20593913 tgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaact 20593814  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20593813 gagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16920514 - 16920751
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16920514 gtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatg-tttatgcattact 16920612  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16920613 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaac 16920709  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  16920710 taagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 66 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 165  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgatta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtca---tgttg 35245663  T
Q  166 ttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  35245662 ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22831742 - 22831503
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  22831742 gtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattact 22831644  T
Q  101 tgaagaatatttgaat--atttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttattta 197  Q
    |||||||| |||| ||  || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||   |||  ||| | | |||||||||||||| ||||||||||    
T  22831643 tgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtca---tgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttattta 22831547  T
Q  198 actaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||    
T  22831546 actaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1595692 - 1595549
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1595692 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgtta 1595594  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1595593 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  || | |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 tt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25656731 - 25656629
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25656731 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 25656633  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  25656632 atga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 95 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25688644 - 25688502
Alignment:
Q  95 attacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat 194  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25688644 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttat 25688546  T
Q  195 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  25688545 ttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 1540928 - 1541073
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  1540928 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 1541026  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1541027 tatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25644537 - 25644335
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||| ||||| || ||||||||||||||  | |  ||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  25644537 ttaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 25644438  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||||||| || || |||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25644437 tgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 25644338  T
Q  224 tga 226  Q
    |||    
T  25644337 tga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25603266 - 25603482
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||    
T  25603266 gtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25603365  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25603366 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25603464  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||  |||||||||||||    
T  25603465 aagtcgcatgagtcagtc 25603482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  16448626 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || |||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 at-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18462024 - 18461895
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  18462024 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgt 18461926  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18461925 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 239
Target Start/End: Original strand, 19847989 - 19848114
Alignment:
Q  114 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19847989 aatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 19848088  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  19848089 cagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 23992593 - 23992429
Alignment:
Q  73 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||     
T  23992593 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttga---attgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaa 23992497  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
     ||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23992496 tctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11185742 - 11185524
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||   ||||||||   |||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||    
T  11185742 gtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagttta-tgcattact 11185644  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||   |||||| |||||||||| | ||||||| |||||||||   |||| ||||| |||||  |||||| || ||||||||||||    
T  11185643 tgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtca---tgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaac 11185547  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||| |||||||    
T  11185546 taagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Original strand, 20556943 - 20557054
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20556943 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 20557041  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  20557042 attaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20109285 - 20109140
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 192  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20109285 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 20109187  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  20109186 tattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25611604 - 25611820
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||| | | |||||||    
T  25611604 gtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgatgttgtatacattact 25611703  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||  |  ||||||| || |||||| | ||||||  || ||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25611704 tgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaact 25611802  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||  |||||||||||||    
T  25611803 aagtcgcatgagtcagtc 25611820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 27415887 - 27416011
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||      
T  27415887 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 27415983  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27415984 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Original strand, 15041465 - 15041644
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat-ttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||| ||| || | |||||| | ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||  ||    
T  15041465 aatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatgtat-gtgcattacttga-gattttattgaatacttaagatgttattg 15041562  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041563 aattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 27333262 - 27333339
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27333262 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 27394002 - 27394079
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27394002 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 222
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  141 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 28496494 - 28496592
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  28496494 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 29808905 - 29809003
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  29808905 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561303
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 8227416 - 8227632
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  8227416 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 8227515  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8227516 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 8227614  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||||||| ||||||    
T  8227615 tgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19652272 - 19652199
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19652272 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 9098557 - 9098620
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9098557 ttttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtcta 23019427  T
Q  221 agttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||  |||||||||||||    
T  23019426 agatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  225 gatga 229  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 33443124 - 33443068
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  33443124 ttttatatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  220 aagttga 226  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19873205 - 19873120
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19873205 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766695
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18907255 - 18907134
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| | || |||||||| ||||   |||  |||| |||| ||||    
T  18907255 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattatgctgctattgt 18907157  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  18907156 tatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19863063 - 19862978
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  19863063 atgtcatactgttgttgtaatcttcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186379
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  || | |||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  225 gatga 229  Q
    |||||    
T  4186383 gatga 4186379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790874
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 19790874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22731115 - 22731355
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22731115 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22731214  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731215 tgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaact 22731314  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22731315 aagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23286101 - 23285865
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23286101 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23286002  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286001 tgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt----ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 23285906  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23285905 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22738061 - 22738300
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22738061 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 22738160  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  22738161 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaact 22738259  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22738260 aagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23654267 - 23654507
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23654267 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 23654366  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  23654367 tgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaact 23654466  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23654467 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23060742 - 23060513
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  23060742 gacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 23060644  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060643 tttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 23060544  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060543 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23076658 - 23076442
Alignment:
Q  25 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  23076658 gttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaaga 23076559  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23076558 tattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtg 23076459  T
Q  225 gatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||    
T  23076458 gatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 298695 - 298933
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  298695 gtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattact 298794  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  298795 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 298894  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  298895 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 37997 - 38235
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37997 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 38095  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38096 tgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 38194  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  38195 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22337355 - 22337115
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22337355 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22337256  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22337255 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaact 22337156  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337155 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23660262 - 23660023
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  23660262 gtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 23660163  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660162 tgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaact 23660064  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23660063 aagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20309345 - 20309108
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  20309345 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattact 20309247  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  20309246 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaac 20309150  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  20309149 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23135735 - 23135590
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  23135735 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 23135637  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23135636 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 23708524 - 23708738
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||||||||| ||| |||    
T  23708524 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgaga 23708623  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  23708624 tgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagt 23708722  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||  |||||||||||||    
T  23708723 tga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 122 - 241
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23103496  T
Q  222 gttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23103497 gatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25616336 - 25616192
Alignment:
Q  90 tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| ||    
T  25616336 tgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt 25616237  T
Q  190 gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25616236 gtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 gt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 45029871 - 45030016
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  | ||||| ||||||    
T  45029871 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgttgt 45029969  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  45029970 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||| | || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Original strand, 24529589 - 24529691
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24529589 ttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24529687  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  24529688 atga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 164 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946657
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27753814 - 27753730
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatg 86  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27753814 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28406103 - 28405981
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  28406103 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagt 28406004  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  28406003 cggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  69 ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||||| | ||||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||||| |    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattga-gatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-g 19671904  T
Q  169 tatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
     |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  19671903 catactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7679707 - 7679589
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7679707 tttatgatgttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcag 7679610  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  7679609 tctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 22799069 - 22799243
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |    
T  22799069 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgat 22799167  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  22799168 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 178 - 241
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7835
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 192  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  7707 cattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 7805  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7806 tattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 23019649 - 23019823
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 161  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||||| |    
T  23019649 tgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcatgtt 23019747  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23019748 gttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 25175976 - 25175854
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  25175976 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaat 25175878  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  25175877 ctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643109
Alignment:
Q  159 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 240
Target Start/End: Original strand, 22134251 - 22134326
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  22134251 tttgcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Original strand, 32451948 - 32452031
Alignment:
Q  140 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32451948 attgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 40622123 - 40622327
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt-----tgaatatttaagatgt 127  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||     || |||  ||||||||    
T  40622123 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtactgtatacataagatgt 40622219  T
Q  128 tgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||    
T  40622220 tgatgaattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatga 40622316  T
Q  227 tgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||    
T  40622317 ttaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 18786947 - 18787009
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18786947 tttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 152 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23038116 - 23038048
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038116 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23207398 - 23207296
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  23207398 agatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 23207300  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  23207299 taag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 222
Target Start/End: Original strand, 20520098 - 20520295
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||| ||| | | || |||||||||| |  | | |||||||||||||  |||| ||| | ||| |||    
T  20520098 ttaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgaga 20520196  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 221  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20520197 tgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 20520294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 25963688 - 25963832
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  25963688 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 25963786  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  25963787 tattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 25963832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961629
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtca 25961629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2086 - 1851
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2086 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 1987  T
Q  106 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1986 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 1887  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1886 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 241
Target Start/End: Original strand, 23390382 - 23390617
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaag 105  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23390382 attaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaag 23390481  T
Q  106 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagct 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390482 aatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagct 23390581  T
Q  206 gcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23390582 gcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 8286723 - 8286964
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8286723 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 8286822  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286823 tgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 8286922  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8286923 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22075259 - 22075018
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22075259 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 22075160  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22075159 tgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaact 22075060  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag-atgatgatgt 241  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075059 aagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25421772 - 25421532
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25421772 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25421673  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421672 tgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 25421573  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25421572 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25431634 - 25431395
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25431634 gtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 25431535  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431534 tgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 25431435  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  25431434 aagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24493808 - 24493569
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24493808 gtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcact 24493709  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  24493708 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaacc 24493610  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24493609 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 9078192 - 9077952
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  9078192 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 9078093  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||   ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078092 tgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 9077993  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077992 aagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13025550 - 13025311
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  13025550 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13025451  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025450 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13025352  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13025351 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13095734 - 13095495
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  13095734 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatt 13095635  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095634 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 13095536  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13095535 atgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24529449 - 24529223
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatt 111  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||   ||       
T  24529449 acttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaa 24529350  T
Q  112 tgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 211  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529349 tgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 24529250  T
Q  212 gtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24529249 gtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 21292851 - 21293090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21292851 gtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatg-tttatgcattact 21292949  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgca--attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 198  Q
    ||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21292950 tgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaa 21293047  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||    
T  21293048 ctaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1096707 - 1096467
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1096707 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 1096608  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||| | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1096607 tgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaact 1096508  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1096507 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||   |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |  ||||||| ||||||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaata-ttaaga 18418695  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 241
Target Start/End: Original strand, 21997549 - 21997655
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21997549 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 21997648  T
Q  235 atgatgt 241  Q
    |||||||    
T  21997649 atgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||       ||    ||||||||||  ||   || |||||| ||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac------tt----attacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  264868 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 10732957 - 10733102
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10732957 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 10733055  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10733056 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 22107254 - 22107357
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  22107254 gtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattact 22107353  T
Q  101 tgaa 104  Q
    ||||    
T  22107354 tgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 39245281 - 39245136
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| ||  || |||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  39245281 tgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 39245183  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39245182 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 73 - 239
Target Start/End: Original strand, 17517153 - 17517320
Alignment:
Q  73 gatgtgatataatgttt-tgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 171  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||  ||||     
T  17517153 gatgtgatacattgtttatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaa 17517252  T
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
     ||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17517253 tctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt 165  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--t 18356391  T
Q  166 ttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18356390 ttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  18319133 tgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Original strand, 20902060 - 20902172
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20902060 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T
Q  226 -atgaagatgatga 238  Q
     || ||||||||||    
T  20902159 aattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 238
Target Start/End: Original strand, 2154665 - 2154776
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2154665 gttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2154763  T
Q  226 atgaagatgatga 238  Q
    || ||||||||||    
T  2154764 attaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 11581218 - 11581361
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtta 193  Q
    |||||||||||  |||  |||||| || ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11581218 cattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 11581316  T
Q  194 tttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11581317 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723910
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||||||    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatg 37724010  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  37724009 aatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaag 37723913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 20910745 - 20910869
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  20910745 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatgttcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 20910841  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910842 tttgtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 31061170 - 31061068
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31061170 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 31061072  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  31061071 atga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 38619536 - 38619434
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38619536 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 38619438  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  38619437 atga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 20918017 - 20918110
Alignment:
Q  144 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20918017 atattattttgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22144254 - 22144068
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaat 135  Q
    |||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||  ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||| |    
T  22144254 ctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatt 22144155  T
Q  136 tgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22144154 tgcaattgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23064613 - 23064512
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23064613 ttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 23064515  T
Q  235 atg 237  Q
    |||    
T  23064514 atg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873254
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||||      
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatggttaagatgttga-- 21873358  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
     | ||  ||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  ||||    
T  21873357 -aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataaga 21873259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 19660879 - 19660956
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19660879 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 21329541 - 21329618
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  21329541 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 21502154 - 21502277
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |    
T  21502154 tttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 21502252  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21502253 tctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  220 aag 222  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 21565668 - 21565546
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21565668 atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagt 21565570  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  21565569 cggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 22959576 - 22959649
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22959576 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 21986028 - 21986130
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| |||||| |||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||||    
T  21986028 gtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaatgttatatgcattact 21986127  T
Q  101 tga 103  Q
    |||    
T  21986128 tga 21986130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26704160 - 26704075
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26704160 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26973893 - 26973808
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  26973893 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22032492 - 22032323
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||| |     
T  22032492 tgttgaatatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgat- 22032398  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | ||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  22032397 tgtttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 26012079 - 26012154
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  26012079 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19668975 - 19668898
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19668975 tttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 18769947 - 18770118
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ct 161  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |    
T  18769947 tgttgaatatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgatt 18770042  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  18770043 gttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572084
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 162  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 23572159  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || ||||   ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  23572158 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtccatataagatgattaagatgatg 23572084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  184 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 175
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 175  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766087
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgttgttgattatgatgt 77  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 20766087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805552
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20805552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766974
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 20766974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 173 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 29448123 - 29448052
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448123 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 22178221 - 22178323
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  22178221 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtc 22178319  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  22178320 taag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23512162 - 23512098
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23512162 ctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 23512098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 930 - 1169
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  930 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 1028  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1029 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 1128  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  1129 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3710 - 3470
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3710 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattact 3611  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3610 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaact 3511  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3510 aagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 343
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  582 gtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 483  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  482 tgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatactgcctatgttattgttgttatttaact 384  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  383 aagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 167860 - 168099
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  167860 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 167958  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  167959 tgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 168058  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  168059 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 52153 - 51913
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  52153 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattact 52054  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52053 tgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaact 51954  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51953 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6245
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6003 tagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactt 6102  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgccta---tgttgctgttgttatttaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||    
T  6103 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaa 6202  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6203 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5088 - 4849
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5088 tagcaataagacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattactt 4989  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 201  Q
    ||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4988 gagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaacta 4889  T
Q  202 agctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 atctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 223
Target Start/End: Original strand, 24187 - 24406
Alignment:
Q  6 attaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttga-ttatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaa 104  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24187 attaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaa 24286  T
Q  105 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287 gaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaag 24386  T
Q  204 ctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  24387 ctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 39000 - 38761
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39000 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 38901  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  38900 tgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 38802  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801 aagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 29 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33153 - 32942
Alignment:
Q  29 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  33153 attataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgtt 33054  T
Q  129 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 228  Q
    | | | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  33053 gttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatg 32955  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  32954 aagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 9860 - 9744
Alignment:
Q  126 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 225  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9860 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9762  T
Q  226 atgaagatgatgatgtcc 243  Q
    || |||||||||| ||||    
T  9761 attaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 8424 - 8650
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  8424 gacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 8523  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  8524 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatg 8619  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8620 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23122 - 22886
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23122 gtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 23023  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  23022 tgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctgttgttatttaact 22924  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22923 aagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32304 - 32067
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32304 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 32206  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32205 tgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaact 32108  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  32107 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15346 - 15584
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  15346 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatattta-tgcattact 15444  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||  |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15445 tgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaact 15543  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15544 aagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7295
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 162  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||  ||| ||||  |||||  ||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aatttgtataatta--tcatgattg 7370  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || |||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  7369 ttgttgtaatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21151 - 20910
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21151 gtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 21052  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    || |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  21051 tgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaac 20952  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||  ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  20951 taagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4951 - 4712
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  4951 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgccttact 4853  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4852 tgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 4753  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4752 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 1
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  175 gtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg-tttatgccttact 77  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 176  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  76 tgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8715 - 8479
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||| |||||||||||    
T  8715 gtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattact 8620  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| | | |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  8619 tgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaacc 8520  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8519 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 3032 - 3271
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3032 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 3131  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3132 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 3230  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3231 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2192 - 1952
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||| | ||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2192 gtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattact 2093  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2092 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaact 1993  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1992 aagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13735 - 13497
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13735 gtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgttta-tgcattact 13637  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13636 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 13538  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  13537 aagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26135 - 25896
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  26135 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 26036  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26035 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 25937  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  25936 aagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40097 - 39858
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  40097 gtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattact 39998  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39997 tgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatactgcctatgttgctattgttatttaact 39899  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39898 aagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39716 - 39479
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39716 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 39617  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39616 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 39518  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39517 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 75096 - 75333
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75096 gtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 75195  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  75196 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaact 75294  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  75295 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 40152 - 39913
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40152 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattact 40053  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||| ||| |  |||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  40052 tgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaatt 39954  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  39953 aagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19987
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtc 19983  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  19984 taag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 214
Target Start/End: Original strand, 18674 - 18749
Alignment:
Q  139 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||||||| | || || ||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18674 aattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25946 - 26179
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  25946 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 26045  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26046 tgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 26145  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26146 aagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 44801  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||    
T  44802 agtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 33376 - 33463
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 88  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33376 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 33463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10544
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  10307 gtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgatta-tgcattact 10405  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10406 tgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaac 10502  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10503 tatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 13322 - 13144
Alignment:
Q  11 gacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||     
T  13322 gacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataa 13223  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 189  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13222 ttgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 34199 - 34123
Alignment:
Q  166 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34199 ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  185 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4747 - 4508
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4747 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 4648  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  4647 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 4548  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4547 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12090
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  12329 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 12230  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  12229 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 12130  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12129 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22281 - 22042
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  22281 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattact 22182  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22181 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 22082  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22081 aagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 17096 - 17337
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||    
T  17096 gtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattact 17195  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt--tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 198  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17196 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 17295  T
Q  199 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17296 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 222
Target Start/End: Original strand, 79301 - 79430
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||    
T  79301 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgt 79399  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  79400 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 37 - 240
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  37 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaatt 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||   || ||| || |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  137 gcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 236  Q
     || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  237 gatg 240  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16481 - 16721
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  16481 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattact 16580  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || ||||| || ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16581 tgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaact 16680  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16681 aagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16519 - 16282
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  16519 gtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattact 16421  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  16420 tgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaac 16324  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  16323 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 124824 - 124675
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattactt 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  124824 tagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattactt 124725  T
Q  102 gaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  124724 gaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgt-gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 161  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||  ||   |||||  || |||||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 172 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  172 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  220 aag 222  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 222
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  123 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  ||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  220 aag 222  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 933 - 1170
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||| |||||  | |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  933 gtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatg-tttatgcattact 1031  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| || || ||| |||||    
T  1032 tgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaac 1128  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1129 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 32851 - 33077
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||     
T  32851 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 32948  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32949 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 33046  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33047 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 46154 - 45928
Alignment:
Q  12 acttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatat 110  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||| ||| |  || || || ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||     
T  46154 acttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa 46057  T
Q  111 ttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 210  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46056 t-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatg 45959  T
Q  211 agtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45958 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  30 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgtt 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||   ||   || ||| || ||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  129 gatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatg 228  Q
    | ||  ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  229 aagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 241
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 339831 - 340065
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |   |||||||    
T  339831 gtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattact 339930  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaact 200  Q
    ||||  ||   || ||| || |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  339931 tgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttg-tgttatttaact 340027  T
Q  201 aagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  340028 aagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  158550 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 71474 - 71350
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaat-atttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||      
T  71474 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacct-aagaattatttgaatactcaagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctg-- 71378  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  71377 tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1526 - 1289
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  1526 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattact 1428  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1427 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaac 1331  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1330 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7503 - 7266
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||    
T  7503 gtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattact 7405  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7404 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttca---tgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaac 7308  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  7307 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 238
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 28552 - 28414
Alignment:
Q  103 aagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 202  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28552 aagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaa 28453  T
Q  203 gctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28452 gctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11390 - 11292
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11390 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2095 - 1997
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2095 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  188 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  31 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttga 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||    
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgttta-tgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  131 tgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  230 agatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 6850 - 6669
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  6850 gtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattact 6751  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 182  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6750 tgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 51819 - 51582
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||| |||||| ||    
T  51819 gtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatg-tttatgcatttct 51721  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    ||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51720 tgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaac 51624  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||    
T  51623 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4763 - 4545
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattac 99  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  4763 gtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattac 4666  T
Q  100 ttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaac 199  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||| || || ||||| | ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4665 ttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaac 4566  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||| |||||||||| |||||    
T  4565 taagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 5012 - 5246
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||||||    
T  5012 gtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgttta-tacattact 5110  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 199  Q
    |||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||| | ||||||||| || ||||||||||||    
T  5111 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg---ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaac 5207  T
Q  200 taagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  5208 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1037
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1154 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattact 1055  T
Q  101 tgaagaatatttgaatat 118  Q
    |||  | |||||||||||    
T  1054 tgagaattatttgaatat 1037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20809 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37883 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  94473 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 44600 - 44454
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttt-gtatactgcctatgttgctgttg 190  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||    
T  44600 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgttg 44502  T
Q  191 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44501 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 100501 - 100378
Alignment:
Q  114 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 212  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  100501 aatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 100403  T
Q  213 tcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || |||||||||||||| |||||||    
T  100402 tcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38596
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 38491  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
    || || |||||||||||  | |||||| |||| ||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| ||||    
T  38492 aaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaaga 38591  T
Q  233 tgatg 237  Q
    |||||    
T  38592 tgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 40169 - 40291
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40169 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagt 40267  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  40268 cagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 149
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23695
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 23678  T
Q  133 aattgcaattgatatta 149  Q
    || || |||||||||||    
T  23679 aaatgaaattgatatta 23695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13537 - 13392
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  13537 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgt 13439  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  13438 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 119 - 241
Target Start/End: Original strand, 11442 - 11564
Alignment:
Q  119 ttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11442 ttaacatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtt 11541  T
Q  219 taagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  11542 taagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 11394 - 11450
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 57  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11394 gtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  15 taatgaagaggttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttg 113  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||   ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  114 aatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 178  Q
     ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4756 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
      || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 22665 - 22776
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22665 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22763  T
Q  214 cagtctaagttga 226  Q
    | |||||||||||    
T  22764 cggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  136742 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  139211 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  144149 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  134273 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  141680 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 143 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62200
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 132745 - 132662
Alignment:
Q  155 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  132745 tcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12933 - 12763
Alignment:
Q  64 gttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctg 162  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  ||    
T  12933 gttgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattg 12838  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    || ||||   ||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  12837 ttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 12763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| || || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16946 - 16784
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16946 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 16847  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16846 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28070 - 27911
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28070 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattact 27971  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgc 160  Q
    ||||  ||   || |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27970 tgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  74 atgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttt-ttttt 128819  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Original strand, 20379 - 20524
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20379 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 20477  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20478 ga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 152 - 213
Target Start/End: Original strand, 65830 - 65891
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  65830 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  501146 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 238
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-g 132  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| ||||  |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || ||| |||||| |    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  233 tgatga 238  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 160791 - 160688
Alignment:
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  160791 attgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatga 160693  T
Q  233 tgatg 237  Q
    |||||    
T  160692 tgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
       | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  168 at-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||   ||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40462 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8613 - 8481
Alignment:
Q  94 cattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgtt 192  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  8613 cattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtt 8515  T
Q  193 atttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8514 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6661 - 6535
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6661 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 6563  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  6562 cggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 240
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 240  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3721 - 3640
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3721 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7785 - 7704
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7785 gtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||| |||  |||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
     || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||| ||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgat 239  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 192
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  66 tgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaa-tatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtt 164  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattactt-aagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-- 15458  T
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgttgtt 192  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15459 tttgtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 182
Target Start/End: Original strand, 844 - 1021
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattact 100  Q
    |||| ||| ||||||||||  || | || |||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  844 gtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattact 943  T
Q  101 tgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgt 182  Q
    ||||  ||  |||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  944 tgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctg---ttgtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 241
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 29720 - 29558
Alignment:
Q  76 gtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaa-ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||    
T  29720 gtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtcttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatct 29621  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
     |||||| | || ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29620 acctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  215 agtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 128971 - 129072
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtct 219  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  128971 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtct 129069  T
Q  220 aag 222  Q
    |||    
T  129070 aag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78442 - 78328
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  78442 agatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T
Q  219 taagttg-atgaagatg 234  Q
     ||| || |||||||||    
T  78344 caagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 241
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||||||| |||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 223  Q
    ||||| | | ||||  | ||||||||||| ||||| |||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  224 tgatgaagatgatgatgt 241  Q
     | |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 238
Target Start/End: Original strand, 2189 - 2291
Alignment:
Q  135 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatg 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||    
T  2189 ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatg 2287  T
Q  235 atga 238  Q
    ||||    
T  2288 atga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | || |||| |||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 224  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 174  Q
    |||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  175 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 222
Target Start/End: Original strand, 53492 - 53651
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | | |||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||    
T  53492 tgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg 53591  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
     ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53592 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Original strand, 161089 - 161252
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  || | |||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  161089 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatac 161188  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  161189 tgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaata-tttaagatgttgatg 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||| ||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 226
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  35 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatga 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  ||||  |||| ||| |||||||| |||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
     || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 75 - 235
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  75 tgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 173  Q
    |||||||||||  | | ||||||| |||||  |||| |||||| || ||| | |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatga 235  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26851
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 26931  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||  |||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26930 aattg-aattgatataatta--tcatgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtc 26851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19390 - 19268
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19390 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 19292  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  19291 cggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 97 - 238
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38820
Alignment:
Q  97 tacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatt 195  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  38679 tacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatt 38777  T
Q  196 taactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  38778 taactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 1060  T
Q  214 cagtctaag 222  Q
    | |||||||    
T  1059 cggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15664
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatga 238  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15759 gatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Original strand, 6121 - 6244
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| |||||| |||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  6121 tttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 2801 - 2923
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2801 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 2899  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | ||||||| |||||| |||||||    
T  2900 cggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11642 - 11464
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||    
T  11642 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 11543  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  11542 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 38199 - 38377
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||| | | || |    ||||||||||| ||||| ||    
T  38199 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 38298  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  38299 tttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 130031 - 129917
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  130031 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagt 129933  T
Q  214 cagtctaagttgatga 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  129932 cggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 214
Target Start/End: Original strand, 60620 - 60810
Alignment:
Q  26 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| | || |||||||||| |  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||    
T  60620 ttaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 60719  T
Q  125 tgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  60720 tgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Original strand, 14692 - 14814
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||||| || |||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14692 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagt 14790  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  14791 cggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 29262 - 29117
Alignment:
Q  72 tgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttga--atatttaagatgttgat-gaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 168  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |  ||||  ||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  29262 tgatgtgatataatgttgtgtgtattacttgaagttttattgaatatatttaaggtgttgttaaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttg 29163  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||  || |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29162 taatctacctatgctactattgttatttaactaagatgcatgagtc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 6688 - 6611
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6688 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14068 - 13991
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14068 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 15821 - 15898
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15821 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 226
Target Start/End: Original strand, 10536 - 10647
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  10536 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagt 10634  T
Q  214 cagtctaagttga 226  Q
    | |||||||||||    
T  10635 cggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 10403 - 10323
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgata 81  Q
    |||| ||| ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10403 gtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12693 - 12587
Alignment:
Q  116 tatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtc 12595  T
Q  215 agtctaag 222  Q
     |||||||    
T  12594 ggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5769 - 5655
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  5769 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagt 5671  T
Q  214 cagtctaagttgatga 229  Q
    | ||||||||||||||    
T  5670 cggtctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 241
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1190
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  1092 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4321
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 215
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16443
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| ||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttg 16361  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    || |  |||||||||||| | |||||| |||| |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16362 aaat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtca 16443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 4747 - 4921
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgct 161  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||| |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||| | |||| |||    
T  4747 tgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattactt-aagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagct 4845  T
Q  162 gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||| ||||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  4846 gttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 220
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8161
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcat--gc 160  Q
    ||||| |||| |||||||||||| || | | |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||  ||    
T  8002 tgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagc 8101  T
Q  161 tgtttttgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    ||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  8102 tg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23928 - 23843
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23928 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32643 - 32538
Alignment:
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 232  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  32643 attgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aaga 32547  T
Q  233 tgatgatgt 241  Q
    |||||||||    
T  32546 tgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 222
Target Start/End: Original strand, 51903 - 51985
Alignment:
Q  140 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51903 attgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 241
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12889 - 12766
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |    
T  12889 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatgatgt 241  Q
    |||||||||||||  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 17868 - 17928
Alignment:
Q  1 gtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 61  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17868 gtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttg 17928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  170 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13062 - 12943
Alignment:
Q  118 tttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcag 216  Q
    |||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  13062 tttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  217 tctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  12963 tctaagttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 237
Target Start/End: Original strand, 45794 - 45909
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45794 agatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 45892  T
Q  221 agttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||||||    
T  45893 agttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 133
Alignment:
Q  115 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 213  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  255 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaat 157  T
Q  214 cagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  156 cggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 28813 - 28887
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 218
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193074
Alignment:
Q  65 ttgattatgatgtgatataatgttttg-tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgt 163  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||||||  |  ||||||| || |||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttg-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  164 ttttgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    | |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtc 193074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 21721 - 21920
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||    
T  21721 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 21817  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||    
T  21818 aattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 21914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 237
Target Start/End: Original strand, 29613 - 29812
Alignment:
Q  34 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 132  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||| || ||| |||  |||||||||||||    
T  29613 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttgt-gttgattaagatgtattataatgttta-tgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatg 29709  T
Q  133 aattgcaattgatattattatgtcatgct-gtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 231  Q
    ||||| ||||| ||| |||||  |||| | ||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||    
T  29710 aattg-aattggtataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaag 29806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1159 - 1086
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1159 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 70 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 2045 - 1881
Alignment:
Q  70 tatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg-ctgtttttg 168  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||||  |||| |||    
T  2045 tatgatgtattataatgttta-tgcattacttgaagaataattgtatacataagatgttgatgaattg-aattggtataatta--tcatgattgttgttg 1950  T
Q  169 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  1949 taatctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 165 - 237
Target Start/End: Original strand, 23927 - 24000
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  23927 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6889 - 6824
Alignment:
Q  165 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatga 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6889 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10542
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 220  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtcta 10548  T
Q  221 agttga 226  Q
    ||||||    
T  10547 agttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 32197 - 32102
Alignment:
Q  143 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  32197 gatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  174 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25184 - 25121
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttga 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25184 ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  180 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 225584 - 225465
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 162  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  | | |||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  225584 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttg-attgcatttgatattattatatcacgctg 225486  T
Q  163 tttttgtatactgcctatgttg 184  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  225485 -ttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 69879 - 69794
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  69879 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 122 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 38437 - 38343
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  38437 agatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 152 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20065 - 19980
Alignment:
Q  152 atgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||| ||||| |||||  ||||||||| | || |||||||||||  |||||||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  20065 atgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 20642 - 20595
Alignment:
Q  2 tagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtt 49  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  20642 tagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206618
Alignment:
Q  171 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 214  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 206618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 139 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 44179 - 44081
Alignment:
Q  139 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  44179 aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1041 - 897
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||| ||||    
T  1041 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctattgt 943  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  942 tattgaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1974 - 1830
Alignment:
Q  92 tgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgt 191  Q
    |||||||||||||  ||  ||||||  | ||||||||| |||| || |||||||||||| |  | |||||||| ||||   ||||||||| |||  ||||    
T  1974 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatg-aattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgt 1876  T
Q  192 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  1875 tatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 1830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 1170 - 1257
Alignment:
Q  63 tgttgattatgatgtgatataatgttttgtgcattacttgaaga-atatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattat 150  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||  ||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  1170 tgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcatta-tttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Original strand, 6284 - 6386
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| | || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  6284 agatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtc 6382  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  6383 taag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 628 - 569
Alignment:
Q  164 ttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  628 ttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 176 - 215
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5038
Alignment:
Q  176 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtca 5038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 215
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7365
Alignment:
Q  178 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtca 7365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 2784 - 2694
Alignment:
Q  134 attgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 222  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||| |||||||    
T  2784 attgcatttgatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  173 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatg 237  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 139 - 215
Target Start/End: Original strand, 46745 - 46821
Alignment:
Q  139 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtca 215  Q
    |||||||||||| | || ||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  46745 aattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctatgctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtca 46821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 97126 - 97024
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||  |||    
T  97126 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  97027 taag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 106404 - 106302
Alignment:
Q  122 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcagtc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||||||  | |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||  |||    
T  106404 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T
Q  219 taag 222  Q
    ||||    
T  106305 taag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 944 times since January 2019
Visitors: 1518