View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0180_low_17 (Length: 246)

Name: NF0180_low_17
Description: NF0180
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0180_low_17
NF0180_low_17
[»] chr8 (73 HSPs)
chr8 (1-225)||(6520368-6520591)
chr8 (1-225)||(38855149-38855372)
chr8 (1-221)||(21285601-21285821)
chr8 (11-225)||(23760751-23760962)
chr8 (2-211)||(21673718-21673927)
chr8 (11-210)||(983312-983512)
chr8 (57-225)||(5866230-5866395)
chr8 (57-225)||(21490995-21491160)
chr8 (57-225)||(17140916-17141081)
chr8 (47-221)||(26355643-26355815)
chr8 (57-225)||(21249384-21249550)
chr8 (57-225)||(21255222-21255388)
chr8 (2-206)||(37116366-37116572)
chr8 (1-206)||(20498581-20498787)
chr8 (2-206)||(17266890-17267096)
chr8 (11-206)||(24353039-24353235)
chr8 (47-207)||(13508027-13508188)
chr8 (47-207)||(13597559-13597720)
chr8 (57-225)||(17612062-17612231)
chr8 (99-225)||(16092337-16092463)
chr8 (59-225)||(22626736-22626902)
chr8 (59-224)||(28648998-28649164)
chr8 (64-222)||(14409448-14409606)
chr8 (57-206)||(17439458-17439609)
chr8 (79-225)||(22875065-22875211)
chr8 (64-222)||(1484402-1484560)
chr8 (64-222)||(5853296-5853454)
chr8 (64-222)||(20403227-20403385)
chr8 (64-222)||(22001753-22001911)
chr8 (99-225)||(7372778-7372904)
chr8 (99-225)||(20536208-20536334)
chr8 (106-225)||(31971257-31971375)
chr8 (115-228)||(6759255-6759368)
chr8 (64-218)||(16413320-16413474)
chr8 (64-222)||(20046199-20046357)
chr8 (64-222)||(41598188-41598346)
chr8 (99-225)||(18818404-18818530)
chr8 (99-225)||(21918995-21919121)
chr8 (99-225)||(21923923-21924049)
chr8 (115-225)||(23406379-23406489)
chr8 (2-144)||(22364744-22364885)
chr8 (148-225)||(18879276-18879352)
chr8 (64-222)||(4483281-4483438)
chr8 (64-222)||(15203235-15203393)
chr8 (106-225)||(21395984-21396101)
chr8 (106-225)||(21790477-21790594)
chr8 (106-225)||(16199647-16199765)
chr8 (99-222)||(26219717-26219838)
chr8 (64-222)||(4542377-4542535)
chr8 (106-225)||(21389454-21389571)
chr8 (106-225)||(21778780-21778897)
chr8 (99-222)||(26225288-26225409)
chr8 (64-222)||(19896265-19896426)
chr8 (57-149)||(21383887-21383978)
chr8 (154-225)||(45131047-45131117)
chr8 (172-228)||(19937118-19937174)
chr8 (65-206)||(19801387-19801527)
chr8 (172-218)||(45290807-45290853)
chr8 (64-222)||(14823774-14823931)
chr8 (57-149)||(18862430-18862521)
chr8 (45-206)||(19154826-19154989)
chr8 (57-149)||(21387307-21387398)
chr8 (57-149)||(21411180-21411271)
chr8 (57-149)||(21805672-21805763)
chr8 (57-149)||(21827799-21827890)
chr8 (172-222)||(25484380-25484430)
chr8 (64-224)||(26223917-26224077)
chr8 (156-224)||(23648554-23648621)
chr8 (172-223)||(18678170-18678221)
chr8 (172-209)||(15070571-15070608)
chr8 (59-144)||(40492807-40492891)
chr8 (172-223)||(32121734-32121785)
chr8 (64-143)||(25484279-25484359)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-225)||(6020-6244)
[»] chr5 (70 HSPs)
chr5 (1-225)||(21329394-21329618)
chr5 (1-225)||(21502052-21502277)
chr5 (47-221)||(21565546-21565720)
chr5 (13-225)||(26011944-26012154)
chr5 (58-221)||(22959489-22959649)
chr5 (47-225)||(19668898-19669073)
chr5 (1-206)||(20026837-20027043)
chr5 (57-225)||(19660791-19660956)
chr5 (2-206)||(22178117-22178323)
chr5 (58-206)||(22144068-22144217)
chr5 (124-225)||(36314577-36314678)
chr5 (99-222)||(22412187-22412309)
chr5 (47-225)||(40725853-40726032)
chr5 (79-225)||(8286816-8286964)
chr5 (99-225)||(24493569-24493694)
chr5 (64-222)||(264772-264930)
chr5 (64-222)||(10732944-10733102)
chr5 (64-222)||(20909012-20909170)
chr5 (64-222)||(29329934-29330092)
chr5 (64-222)||(39363384-39363542)
chr5 (99-225)||(21729059-21729185)
chr5 (99-225)||(21808384-21808510)
chr5 (99-225)||(23390491-23390617)
chr5 (99-225)||(13025311-13025436)
chr5 (99-225)||(13095495-13095620)
chr5 (117-225)||(21997547-21997655)
chr5 (59-225)||(1096467-1096634)
chr5 (64-222)||(11581203-11581361)
chr5 (64-222)||(42245369-42245527)
chr5 (103-225)||(9077952-9078074)
chr5 (99-225)||(25421532-25421658)
chr5 (64-222)||(36154787-36154942)
chr5 (106-222)||(24529223-24529339)
chr5 (64-222)||(29345980-29346138)
chr5 (67-222)||(39245136-39245291)
chr5 (64-222)||(29348453-29348611)
chr5 (64-222)||(29350926-29351084)
chr5 (64-222)||(20902012-20902172)
chr5 (64-222)||(2154617-2154776)
chr5 (64-219)||(18319037-18319193)
chr5 (64-222)||(10775679-10775838)
chr5 (101-225)||(25431395-25431518)
chr5 (70-172)||(29448055-29448159)
chr5 (99-225)||(22075018-22075145)
chr5 (64-222)||(32027393-32027551)
chr5 (163-222)||(20918052-20918110)
chr5 (172-222)||(38619434-38619484)
chr5 (172-221)||(23064512-23064561)
chr5 (154-225)||(21293020-21293090)
chr5 (172-222)||(31061068-31061118)
chr5 (56-113)||(21741485-21741541)
chr5 (153-206)||(37723922-37723975)
chr5 (57-149)||(10753594-10753685)
chr5 (57-149)||(21871525-21871616)
chr5 (57-149)||(21875805-21875896)
chr5 (172-222)||(20806854-20806904)
chr5 (57-149)||(22120149-22120240)
chr5 (64-219)||(24067110-24067266)
chr5 (172-221)||(26704075-26704124)
chr5 (172-221)||(26973808-26973857)
chr5 (57-125)||(24767291-24767359)
chr5 (172-223)||(17517269-17517320)
chr5 (155-209)||(26732884-26732937)
chr5 (57-103)||(36314670-36314716)
chr5 (127-215)||(18418590-18418677)
chr5 (99-158)||(20766115-20766174)
chr5 (155-206)||(26740697-26740747)
chr5 (156-206)||(15796438-15796487)
chr5 (156-221)||(21873254-21873318)
chr5 (156-221)||(22032323-22032387)
[»] chr7 (92 HSPs)
chr7 (1-221)||(811028-811248)
chr7 (1-225)||(47831807-47832031)
chr7 (1-225)||(16219614-16219835)
chr7 (1-225)||(67745-67968)
chr7 (1-221)||(18005650-18005870)
chr7 (2-221)||(44014182-44014398)
chr7 (11-225)||(22072913-22073129)
chr7 (1-210)||(16056343-16056551)
chr7 (57-225)||(34200786-34200951)
chr7 (57-225)||(15754843-15755008)
chr7 (57-225)||(11995983-11996148)
chr7 (57-225)||(16495402-16495567)
chr7 (57-225)||(28505254-28505419)
chr7 (1-210)||(12901338-12901548)
chr7 (2-206)||(20220087-20220290)
chr7 (47-225)||(2280061-2280238)
chr7 (45-210)||(14044761-14044928)
chr7 (45-210)||(14354791-14354958)
chr7 (64-225)||(13647325-13647487)
chr7 (64-222)||(17061919-17062077)
chr7 (64-225)||(18430709-18430870)
chr7 (99-222)||(18456408-18456530)
chr7 (47-210)||(1867937-1868101)
chr7 (99-225)||(38227481-38227606)
chr7 (47-203)||(12255733-12255892)
chr7 (47-225)||(19486686-19486865)
chr7 (79-222)||(3564338-3564482)
chr7 (99-225)||(12698831-12698958)
chr7 (64-222)||(456321-456479)
chr7 (64-222)||(11972496-11972654)
chr7 (64-222)||(14949126-14949284)
chr7 (64-222)||(15376717-15376875)
chr7 (64-222)||(16232520-16232678)
chr7 (64-222)||(18640272-18640430)
chr7 (64-222)||(20385127-20385285)
chr7 (64-222)||(21189599-21189757)
chr7 (64-222)||(24702238-24702396)
chr7 (64-222)||(32125491-32125649)
chr7 (64-222)||(41522917-41523075)
chr7 (64-222)||(41525379-41525537)
chr7 (103-222)||(48273392-48273511)
chr7 (99-225)||(9509189-9509315)
chr7 (64-221)||(11393291-11393448)
chr7 (64-222)||(16410059-16410217)
chr7 (64-222)||(24704688-24704843)
chr7 (64-222)||(27216860-27217018)
chr7 (64-222)||(44116509-44116667)
chr7 (47-202)||(15008441-15008597)
chr7 (99-207)||(10063813-10063921)
chr7 (64-222)||(16213684-16213842)
chr7 (99-225)||(16386242-16386369)
chr7 (73-218)||(24275175-24275320)
chr7 (64-222)||(3386333-3386491)
chr7 (106-223)||(40443393-40443509)
chr7 (99-225)||(26211995-26212122)
chr7 (22-113)||(9389615-9389705)
chr7 (172-222)||(13869346-13869396)
chr7 (4-58)||(16324172-16324226)
chr7 (172-222)||(20110556-20110606)
chr7 (155-225)||(27847881-27847951)
chr7 (64-218)||(38898380-38898535)
chr7 (172-222)||(13831373-13831423)
chr7 (148-225)||(10589039-10589115)
chr7 (103-210)||(15144037-15144143)
chr7 (57-140)||(15113028-15113111)
chr7 (97-197)||(14036282-14036384)
chr7 (97-197)||(14346312-14346414)
chr7 (57-149)||(18426070-18426161)
chr7 (57-149)||(39267600-39267691)
chr7 (57-149)||(45169791-45169882)
chr7 (57-140)||(15116565-15116648)
chr7 (156-219)||(18154894-18154956)
chr7 (172-221)||(14932802-14932851)
chr7 (172-221)||(15356237-15356286)
chr7 (172-221)||(15360351-15360400)
chr7 (57-125)||(9751504-9751572)
chr7 (104-140)||(16324135-16324171)
chr7 (73-149)||(18425668-18425743)
chr7 (73-149)||(18425870-18425945)
chr7 (172-222)||(26356106-26356156)
chr7 (172-222)||(26358558-26358608)
chr7 (153-199)||(48991206-48991252)
chr7 (60-125)||(2832232-2832297)
chr7 (172-224)||(2832509-2832561)
chr7 (64-137)||(26355987-26356061)
chr7 (64-137)||(26358439-26358513)
chr7 (156-221)||(12187019-12187083)
chr7 (156-221)||(17138113-17138177)
chr7 (172-221)||(19649557-19649606)
chr7 (156-204)||(9177718-9177766)
chr7 (73-125)||(18302257-18302309)
chr7 (64-143)||(20110624-20110704)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-225)||(932-1155)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (1-225)||(39706186-39706409)
chr4 (1-210)||(12288106-12288316)
chr4 (1-206)||(13747-13953)
chr4 (57-225)||(15551817-15551982)
chr4 (47-221)||(8846360-8846550)
chr4 (70-221)||(12774011-12774160)
chr4 (47-210)||(43198495-43198661)
chr4 (47-210)||(52243136-52243302)
chr4 (2-206)||(53082049-53082254)
chr4 (57-187)||(16596686-16596813)
chr4 (2-206)||(46640353-46640558)
chr4 (99-225)||(7798774-7798900)
chr4 (47-222)||(44928866-44929042)
chr4 (79-222)||(16377497-16377639)
chr4 (64-222)||(18215278-18215436)
chr4 (64-222)||(44615288-44615446)
chr4 (64-222)||(12311-12469)
chr4 (106-225)||(7088877-7088996)
chr4 (99-222)||(14280316-14280438)
chr4 (64-222)||(15118356-15118514)
chr4 (64-222)||(44773091-44773249)
chr4 (64-222)||(52312510-52312668)
chr4 (99-222)||(54798749-54798872)
chr4 (59-225)||(6899891-6900057)
chr4 (99-225)||(16270231-16270356)
chr4 (64-224)||(19618176-19618336)
chr4 (100-225)||(52873363-52873488)
chr4 (79-225)||(12902757-12902904)
chr4 (64-222)||(50222343-50222501)
chr4 (57-222)||(1837506-1837671)
chr4 (22-113)||(15099461-15099551)
chr4 (22-113)||(15190428-15190518)
chr4 (99-225)||(16239965-16240090)
chr4 (64-228)||(19242693-19242857)
chr4 (67-222)||(18239426-18239581)
chr4 (64-222)||(3515007-3515165)
chr4 (99-225)||(7893703-7893829)
chr4 (99-225)||(44052829-44052955)
chr4 (59-223)||(22636437-22636602)
chr4 (148-225)||(3096293-3096369)
chr4 (64-218)||(15355328-15355483)
chr4 (153-225)||(17046487-17046559)
chr4 (64-222)||(23803269-23803427)
chr4 (64-222)||(44102214-44102372)
chr4 (64-222)||(51463872-51464030)
chr4 (99-222)||(8574864-8574985)
chr4 (103-220)||(14038653-14038770)
chr4 (64-222)||(7641196-7641344)
chr4 (99-218)||(23374354-23374473)
chr4 (163-222)||(12610950-12611008)
chr4 (64-224)||(14970711-14970871)
chr4 (108-225)||(14053306-14053422)
chr4 (57-149)||(630728-630819)
chr4 (57-149)||(3331961-3332052)
chr4 (57-149)||(13812763-13812854)
chr4 (57-149)||(14953915-14954006)
chr4 (57-149)||(25690137-25690228)
chr4 (156-206)||(6190481-6190531)
chr4 (64-223)||(22353835-22353995)
chr4 (57-149)||(10713083-10713174)
chr4 (57-149)||(10926853-10926944)
chr4 (57-149)||(12487941-12488032)
chr4 (57-149)||(15225308-15225399)
chr4 (64-225)||(15367690-15367852)
chr4 (64-225)||(15402703-15402865)
chr4 (64-143)||(15464890-15464970)
chr4 (64-206)||(21815589-21815731)
chr4 (74-149)||(15225114-15225188)
chr4 (172-225)||(15370018-15370071)
chr4 (172-225)||(15371202-15371255)
chr4 (172-225)||(15373483-15373536)
chr4 (172-225)||(16223532-16223585)
chr4 (57-149)||(15868663-15868754)
chr4 (57-125)||(20157244-20157312)
chr4 (57-125)||(22634167-22634235)
chr4 (57-149)||(32851450-32851542)
chr4 (172-224)||(20157527-20157579)
[»] chr3 (110 HSPs)
chr3 (1-225)||(14234487-14234713)
chr3 (1-225)||(15470927-15471147)
chr3 (1-221)||(16097332-16097552)
chr3 (46-221)||(12174204-12174376)
chr3 (47-221)||(16103784-16103957)
chr3 (57-225)||(13210283-13210448)
chr3 (70-211)||(32307691-32307830)
chr3 (47-222)||(27165250-27165426)
chr3 (47-206)||(52523669-52523831)
chr3 (1-206)||(37251064-37251270)
chr3 (73-221)||(9512924-9513067)
chr3 (73-221)||(9520899-9521042)
chr3 (71-221)||(49668044-49668193)
chr3 (47-222)||(53301492-53301669)
chr3 (2-206)||(22110249-22110454)
chr3 (47-225)||(24340665-24340844)
chr3 (47-207)||(23274705-23274866)
chr3 (47-225)||(37642207-37642386)
chr3 (64-206)||(43925977-43926121)
chr3 (59-225)||(14972854-14973021)
chr3 (106-225)||(18438534-18438653)
chr3 (64-222)||(29172587-29172745)
chr3 (99-225)||(12399209-12399335)
chr3 (99-222)||(24153204-24153326)
chr3 (99-222)||(36166598-36166719)
chr3 (70-211)||(1644642-1644780)
chr3 (64-222)||(9707611-9707769)
chr3 (64-222)||(17463178-17463336)
chr3 (64-222)||(34159326-34159484)
chr3 (64-222)||(45606911-45607069)
chr3 (64-222)||(55476491-55476649)
chr3 (99-225)||(13442274-13442400)
chr3 (64-225)||(43550482-43550644)
chr3 (127-225)||(11424783-11424880)
chr3 (64-220)||(16282815-16282971)
chr3 (59-207)||(42386428-42386577)
chr3 (64-223)||(13544024-13544183)
chr3 (67-222)||(28848618-28848773)
chr3 (64-222)||(6469138-6469296)
chr3 (64-222)||(7781351-7781509)
chr3 (64-222)||(8899094-8899252)
chr3 (64-218)||(12567564-12567718)
chr3 (64-222)||(16454285-16454443)
chr3 (59-225)||(17487856-17488023)
chr3 (59-225)||(17499338-17499505)
chr3 (106-225)||(20698437-20698556)
chr3 (64-222)||(38961895-38962053)
chr3 (47-225)||(22147467-22147646)
chr3 (99-225)||(23083356-23083482)
chr3 (160-222)||(28194693-28194755)
chr3 (64-222)||(13151794-13151953)
chr3 (64-222)||(13154259-13154418)
chr3 (64-222)||(10247727-10247885)
chr3 (64-222)||(17672626-17672784)
chr3 (79-225)||(25476359-25476506)
chr3 (103-222)||(40213720-40213838)
chr3 (22-113)||(1465329-1465419)
chr3 (99-222)||(21618449-21618570)
chr3 (99-225)||(26686887-26687013)
chr3 (64-220)||(41123892-41124045)
chr3 (99-211)||(14572603-14572714)
chr3 (64-222)||(17446659-17446816)
chr3 (64-222)||(50242822-50242980)
chr3 (108-222)||(55500942-55501055)
chr3 (71-206)||(606293-606428)
chr3 (47-163)||(2051141-2051260)
chr3 (103-222)||(15977515-15977633)
chr3 (64-206)||(53070657-53070799)
chr3 (163-222)||(17737236-17737294)
chr3 (99-225)||(43840932-43841058)
chr3 (172-222)||(8499518-8499568)
chr3 (172-222)||(10556985-10557035)
chr3 (172-222)||(15412429-15412479)
chr3 (172-222)||(45577950-45578000)
chr3 (47-113)||(49389573-49389639)
chr3 (103-222)||(12119768-12119887)
chr3 (59-211)||(14576787-14576939)
chr3 (172-222)||(44494809-44494859)
chr3 (109-206)||(12377940-12378039)
chr3 (57-149)||(19775998-19776089)
chr3 (57-149)||(37439421-37439512)
chr3 (57-149)||(4107182-4107273)
chr3 (57-149)||(4111034-4111125)
chr3 (57-149)||(15965202-15965293)
chr3 (57-149)||(15969126-15969217)
chr3 (57-149)||(15973050-15973141)
chr3 (57-149)||(16749779-16749870)
chr3 (57-149)||(12852318-12852413)
chr3 (74-149)||(16750390-16750464)
chr3 (172-223)||(46822267-46822318)
chr3 (57-149)||(8489250-8489341)
chr3 (172-223)||(12511059-12511110)
chr3 (74-149)||(16749994-16750068)
chr3 (57-124)||(23413204-23413271)
chr3 (156-221)||(856140-856204)
chr3 (57-149)||(14501198-14501290)
chr3 (156-221)||(23077530-23077594)
chr3 (2-67)||(43927291-43927356)
chr3 (172-224)||(14665398-14665450)
chr3 (172-224)||(14668554-14668606)
chr3 (57-125)||(4588742-4588812)
chr3 (74-149)||(16750192-16750266)
chr3 (154-204)||(13919350-13919399)
chr3 (57-118)||(14665711-14665772)
chr3 (57-118)||(14668866-14668927)
chr3 (57-118)||(14735224-14735285)
chr3 (172-221)||(15878119-15878168)
chr3 (57-149)||(45797242-45797334)
chr3 (173-221)||(26196500-26196548)
chr3 (172-224)||(30029841-30029893)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-210)||(10542-10751)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-225)||(12942-13163)
scaffold0138 (10-144)||(18143-18277)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (2-225)||(6535-6758)
scaffold0621 (1-210)||(8481-8693)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-225)||(6611-6835)
scaffold0333 (1-225)||(13991-14215)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-225)||(12766-12990)
[»] chr1 (64 HSPs)
chr1 (1-221)||(22921766-22921986)
chr1 (47-225)||(33681010-33681185)
chr1 (47-225)||(22237630-22237805)
chr1 (1-206)||(21861466-21861672)
chr1 (47-221)||(20248283-20248454)
chr1 (11-206)||(21896162-21896358)
chr1 (57-209)||(20918620-20918769)
chr1 (47-210)||(52927925-52928076)
chr1 (57-225)||(14295507-14295672)
chr1 (70-211)||(21754059-21754198)
chr1 (1-206)||(16368183-16368388)
chr1 (2-206)||(50686630-50686836)
chr1 (47-206)||(35261023-35261180)
chr1 (2-206)||(41049933-41050138)
chr1 (48-210)||(16758664-16758828)
chr1 (20-206)||(50614031-50614219)
chr1 (20-206)||(50621859-50622047)
chr1 (79-224)||(50210187-50210333)
chr1 (47-222)||(433012-433185)
chr1 (64-225)||(45574846-45575008)
chr1 (10-221)||(21161720-21161928)
chr1 (64-222)||(13988866-13989024)
chr1 (64-222)||(21923295-21923453)
chr1 (64-223)||(21840766-21840925)
chr1 (57-172)||(22130863-22130975)
chr1 (47-222)||(23593722-23593897)
chr1 (106-222)||(34509783-34509899)
chr1 (64-222)||(21475091-21475249)
chr1 (79-225)||(27250703-27250850)
chr1 (64-222)||(29298137-29298294)
chr1 (64-222)||(29776688-29776846)
chr1 (64-222)||(31612313-31612471)
chr1 (57-206)||(16093836-16093987)
chr1 (1-113)||(35981585-35981696)
chr1 (22-113)||(49261452-49261542)
chr1 (64-225)||(13212865-13213027)
chr1 (156-224)||(20454606-20454673)
chr1 (22-118)||(20636956-20637051)
chr1 (64-222)||(22123071-22123230)
chr1 (79-225)||(22532269-22532416)
chr1 (47-224)||(16361915-16362092)
chr1 (154-225)||(20847205-20847275)
chr1 (57-157)||(51130632-51130729)
chr1 (64-222)||(21346961-21347120)
chr1 (172-228)||(21342090-21342146)
chr1 (149-225)||(38801433-38801508)
chr1 (99-225)||(21026680-21026806)
chr1 (172-222)||(21707167-21707217)
chr1 (172-222)||(21711709-21711759)
chr1 (57-204)||(26064959-26065107)
chr1 (172-228)||(15860121-15860177)
chr1 (57-149)||(1924914-1925005)
chr1 (57-149)||(20923928-20924019)
chr1 (156-224)||(22468749-22468816)
chr1 (172-222)||(16275476-16275526)
chr1 (172-221)||(21714546-21714595)
chr1 (57-149)||(41387833-41387924)
chr1 (172-224)||(20135188-20135240)
chr1 (74-149)||(41388048-41388122)
chr1 (64-219)||(40389157-40389313)
chr1 (103-140)||(12271639-12271676)
chr1 (74-139)||(39243943-39244008)
chr1 (74-139)||(39247498-39247563)
chr1 (172-224)||(24783160-24783212)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-221)||(19268-19488)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-221)||(100378-100598)
scaffold0023 (11-221)||(40081-40291)
scaffold0023 (64-222)||(94411-94569)
scaffold0023 (64-222)||(44454-44613)
scaffold0023 (152-225)||(119875-119948)
scaffold0023 (64-218)||(17444-17598)
scaffold0023 (148-221)||(101503-101576)
scaffold0023 (172-221)||(38547-38596)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (1-225)||(23019408-23019630)
chr6 (47-221)||(19652199-19652371)
chr6 (57-225)||(28496427-28496592)
chr6 (57-225)||(29808838-29809003)
chr6 (57-225)||(1561303-1561468)
chr6 (1-210)||(19668386-19668596)
chr6 (47-225)||(20109140-20109319)
chr6 (124-225)||(27333238-27333339)
chr6 (124-225)||(27393978-27394079)
chr6 (57-210)||(9098466-9098620)
chr6 (59-210)||(25644335-25644488)
chr6 (2-225)||(22080637-22080846)
chr6 (33-211)||(4185752-4185928)
chr6 (64-222)||(22782227-22782385)
chr6 (47-225)||(8227453-8227632)
chr6 (79-225)||(29060540-29060687)
chr6 (64-224)||(30676714-30676874)
chr6 (110-211)||(4186381-4186482)
chr6 (64-222)||(2291184-2291342)
chr6 (64-222)||(12742317-12742475)
chr6 (64-222)||(18334596-18334754)
chr6 (64-222)||(19005046-19005204)
chr6 (64-222)||(19858923-19859081)
chr6 (64-222)||(24422547-24422705)
chr6 (64-222)||(33861794-33861952)
chr6 (64-222)||(33864278-33864436)
chr6 (99-225)||(16496244-16496370)
chr6 (99-225)||(17287791-17287917)
chr6 (59-225)||(19303495-19303661)
chr6 (103-224)||(18409826-18409947)
chr6 (119-225)||(20076700-20076805)
chr6 (64-222)||(1595549-1595707)
chr6 (64-222)||(8055029-8055187)
chr6 (79-225)||(25629329-25629476)
chr6 (64-222)||(26924644-26924802)
chr6 (59-225)||(20360914-20361081)
chr6 (79-225)||(20593773-20593920)
chr6 (64-222)||(25754809-25754967)
chr6 (64-222)||(20556898-20557054)
chr6 (2-206)||(23076749-23076955)
chr6 (117-222)||(25656629-25656733)
chr6 (10-221)||(31155305-31155514)
chr6 (64-224)||(34963371-34963531)
chr6 (67-222)||(1540918-1541073)
chr6 (106-225)||(16920634-16920751)
chr6 (106-225)||(20638285-20638404)
chr6 (106-225)||(35245586-35245703)
chr6 (33-170)||(4668142-4668277)
chr6 (33-170)||(4674989-4675124)
chr6 (64-219)||(16448530-16448686)
chr6 (163-225)||(25714417-25714478)
chr6 (64-222)||(3852021-3852179)
chr6 (2-206)||(35008167-35008373)
chr6 (64-206)||(18456735-18456877)
chr6 (157-225)||(22831503-22831571)
chr6 (103-222)||(25688502-25688620)
chr6 (99-225)||(22780222-22780348)
chr6 (57-149)||(22949375-22949466)
chr6 (57-149)||(22953331-22953422)
chr6 (57-149)||(23871819-23871910)
chr6 (57-149)||(23875775-23875866)
chr6 (57-149)||(27325388-27325479)
chr6 (2-93)||(28103796-28103887)
chr6 (70-206)||(18461895-18462031)
chr6 (47-173)||(18706356-18706483)
chr6 (162-206)||(11185524-11185568)
chr6 (57-149)||(16760525-16760616)
chr6 (45-144)||(18696569-18696667)
chr6 (172-223)||(19848063-19848114)
chr6 (1-55)||(27333182-27333236)
chr6 (1-55)||(27393922-27393976)
chr6 (57-125)||(16624583-16624651)
chr6 (57-149)||(31477595-31477686)
chr6 (127-204)||(33443068-33443146)
chr6 (163-206)||(18821904-18821946)
chr6 (172-223)||(23992429-23992480)
chr6 (74-139)||(16624371-16624436)
chr6 (57-118)||(21939488-21939549)
chr6 (184-228)||(19008799-19008843)
chr6 (172-221)||(18907111-18907160)
chr6 (172-221)||(19862978-19863027)
chr6 (172-221)||(19873120-19873169)
chr6 (156-221)||(21766695-21766759)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (1-221)||(25175854-25176074)
chr2 (59-221)||(7679589-7679750)
chr2 (1-220)||(28405981-28406201)
chr2 (11-206)||(7639-7835)
chr2 (1-210)||(18786799-18787009)
chr2 (57-225)||(23071905-23072070)
chr2 (47-225)||(23708561-23708738)
chr2 (57-225)||(19671830-19671998)
chr2 (64-222)||(22105412-22105571)
chr2 (2-206)||(23207296-23207501)
chr2 (1-206)||(23791292-23791499)
chr2 (70-224)||(22134175-22134326)
chr2 (99-222)||(298809-298933)
chr2 (2-206)||(25108906-25109112)
chr2 (99-225)||(23060513-23060639)
chr2 (64-222)||(18808943-18809101)
chr2 (57-206)||(20520145-20520295)
chr2 (64-222)||(23130862-23131020)
chr2 (64-222)||(23133329-23133487)
chr2 (64-222)||(23709536-23709694)
chr2 (64-222)||(23712017-23712175)
chr2 (64-222)||(26505379-26505537)
chr2 (64-222)||(26507857-26508015)
chr2 (64-222)||(34402526-34402684)
chr2 (64-222)||(39682313-39682471)
chr2 (67-222)||(23135590-23135745)
chr2 (64-222)||(571397-571555)
chr2 (64-222)||(6725995-6726153)
chr2 (79-225)||(22337115-22337262)
chr2 (64-222)||(24367774-24367932)
chr2 (64-222)||(28577099-28577257)
chr2 (99-225)||(23076442-23076568)
chr2 (99-225)||(23285865-23285987)
chr2 (99-225)||(23654381-23654507)
chr2 (127-225)||(38138-38235)
chr2 (64-224)||(32214925-32215085)
chr2 (64-219)||(21155064-21155219)
chr2 (47-206)||(22413078-22413240)
chr2 (64-222)||(24898199-24898358)
chr2 (64-222)||(24900682-24900841)
chr2 (64-222)||(24903159-24903318)
chr2 (64-222)||(24905636-24905795)
chr2 (64-222)||(24908111-24908270)
chr2 (106-225)||(20309108-20309225)
chr2 (64-222)||(32039502-32039660)
chr2 (99-225)||(22731229-22731355)
chr2 (79-225)||(23660023-23660169)
chr2 (103-225)||(23103396-23103516)
chr2 (64-220)||(43137301-43137457)
chr2 (64-222)||(45029858-45030016)
chr2 (47-206)||(24697548-24697709)
chr2 (148-225)||(8946657-8946733)
chr2 (161-225)||(23040247-23040310)
chr2 (99-225)||(22738175-22738300)
chr2 (172-222)||(38967374-38967424)
chr2 (163-219)||(24643054-24643109)
chr2 (59-206)||(23004767-23004916)
chr2 (172-222)||(24529641-24529691)
chr2 (57-149)||(1283657-1283748)
chr2 (57-140)||(22459514-22459598)
chr2 (57-149)||(30344776-30344867)
chr2 (156-206)||(32451981-32452031)
chr2 (154-204)||(23287384-23287433)
chr2 (172-218)||(25616192-25616238)
chr2 (155-204)||(26392403-26392451)
chr2 (64-132)||(24642860-24642929)
chr2 (64-143)||(38967452-38967533)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (47-210)||(10484-10647)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-211)||(5657-5867)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-225)||(32538-32759)
scaffold0034 (156-206)||(51936-51985)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (47-210)||(22613-22776)
scaffold0037 (64-222)||(82072-82230)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-211)||(129919-130129)
scaffold0010 (59-206)||(60669-60818)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-221)||(2542-2762)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-221)||(1086-1306)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (47-221)||(45735-45909)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (47-221)||(133-307)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (3-221)||(14596-14814)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-211)||(6826-7033)
scaffold0556 (1-143)||(8097-8239)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (47-221)||(160688-160861)
scaffold0001 (64-218)||(501088-501242)
scaffold0001 (64-222)||(85583-85742)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-207)||(62216-62419)
scaffold0028 (73-221)||(132662-132809)
scaffold0028 (64-222)||(136680-136838)
scaffold0028 (64-222)||(139149-139307)
scaffold0028 (64-222)||(144087-144245)
scaffold0028 (64-222)||(134211-134369)
scaffold0028 (64-222)||(141618-141776)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (57-222)||(15664-15826)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (57-225)||(11292-11457)
scaffold0046 (57-225)||(1997-2162)
scaffold0046 (106-225)||(28414-28533)
scaffold0046 (169-225)||(4552-4608)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (14-210)||(7983-8180)
scaffold0218 (59-178)||(29238-29354)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (86-225)||(15759-15898)
scaffold0020 (172-221)||(178898-178947)
scaffold0020 (1-36)||(15729-15764)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-206)||(12587-12792)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-221)||(2701-2923)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (57-225)||(1025-1190)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (1-206)||(53445-53651)
scaffold0075 (57-139)||(8248-8330)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-167)||(2115-2281)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (10-206)||(6188-6386)
scaffold0420 (159-206)||(13793-13840)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (2-206)||(128867-129072)
scaffold0022 (2-202)||(78345-78545)
scaffold0022 (99-222)||(116430-116551)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-206)||(136264-136471)
scaffold0021 (1-206)||(144972-145179)
scaffold0021 (153-224)||(174767-174838)
scaffold0021 (155-225)||(121766-121835)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (47-222)||(38644-38820)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (57-225)||(34123-34288)
scaffold0175 (172-225)||(273-326)
scaffold0175 (99-175)||(13141-13218)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (59-225)||(3105-3271)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (2-202)||(38339-38541)
scaffold0139 (172-221)||(19980-20029)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (119-225)||(23898-24001)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-210)||(103535-103737)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (57-210)||(25121-25275)
scaffold0123 (47-144)||(619-715)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (5-206)||(97024-97227)
scaffold0006 (5-206)||(106302-106505)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (99-206)||(1051-1158)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (47-225)||(11464-11643)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (47-225)||(17969-18148)
scaffold0247 (64-222)||(2132-2291)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (47-225)||(38198-38377)
scaffold0124 (57-149)||(21846-21937)
scaffold0124 (57-149)||(24605-24699)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (2-206)||(19782-19987)
scaffold0080 (99-225)||(39913-40038)
scaffold0080 (57-149)||(48939-49030)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (57-210)||(16052-16206)
scaffold0357 (57-206)||(13147-13298)
scaffold0357 (154-206)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (57-210)||(27701-27855)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (73-221)||(32102-32249)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (79-223)||(39479-39623)
scaffold0141 (57-149)||(13872-13963)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (79-223)||(75189-75333)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (99-222)||(44702-44825)
scaffold0122 (79-218)||(26039-26179)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (3-175)||(54-228)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (79-224)||(3160-3306)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-204)||(7955-8161)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (79-224)||(17189-17337)
scaffold0056 (64-206)||(79288-79430)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (99-225)||(25896-26021)
scaffold0026 (99-225)||(39858-39983)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-206)||(569-774)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (64-222)||(20747-20905)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (59-225)||(13211-13378)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (64-222)||(37821-37979)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (64-222)||(158454-158612)
scaffold0003 (59-222)||(339904-340065)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (99-225)||(1851-1977)
scaffold0016 (57-125)||(207473-207541)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (14-206)||(267679-267872)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (99-225)||(32942-33067)
scaffold0145 (99-225)||(38761-38886)
scaffold0145 (64-227)||(9744-9908)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (99-225)||(32952-33077)
scaffold0120 (99-225)||(45928-46053)
scaffold0120 (103-225)||(16113-16235)
scaffold0120 (163-225)||(17389-17450)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (64-223)||(10772-10931)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (67-222)||(13392-13547)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (64-222)||(4694-4852)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (106-225)||(4849-4968)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (64-222)||(13947-14105)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (64-222)||(16784-16942)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (106-225)||(1289-1406)
scaffold0106 (106-225)||(7266-7383)
scaffold0106 (156-222)||(15291-15356)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (99-225)||(3470-3596)
scaffold0292 (99-225)||(343-468)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (99-225)||(51913-52039)
scaffold0011 (79-225)||(167952-168099)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (3-206)||(1696-1900)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (99-225)||(8528-8650)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (79-225)||(1022-1169)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (99-222)||(22886-23008)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (106-225)||(51582-51699)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (106-225)||(15466-15584)
scaffold0114 (156-221)||(7295-7359)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (106-225)||(32067-32184)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (64-206)||(20383-20524)
scaffold0031 (59-225)||(128751-128917)
scaffold0031 (57-149)||(35871-35962)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (99-225)||(6116-6245)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (108-225)||(16282-16397)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (64-223)||(9241-9400)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (141-221)||(28806-28887)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (64-222)||(161093-161252)
scaffold0007 (64-142)||(164594-164674)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (79-225)||(1952-2099)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (153-225)||(10472-10544)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (79-225)||(16574-16721)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (64-222)||(40400-40558)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (33-170)||(9133-9268)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (106-225)||(13497-13615)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (99-207)||(24297-24406)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (64-222)||(12064-12216)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (64-224)||(11286-11446)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (64-222)||(4214-4373)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (64-219)||(4300-4455)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (106-222)||(5132-5246)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (148-225)||(4712-4788)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (64-222)||(106-264)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (106-225)||(8479-8598)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (106-225)||(1053-1170)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (79-225)||(4508-4654)
scaffold0228 (79-225)||(12090-12236)
scaffold0228 (79-225)||(22042-22188)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (64-224)||(12253-12413)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (155-225)||(46995-47065)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (57-156)||(2398-2494)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (158-225)||(4888-4954)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (119-206)||(2694-2783)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (47-167)||(225465-225585)
scaffold0012 (57-149)||(189162-189253)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (106-225)||(20910-21030)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (172-219)||(1393-1440)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (57-139)||(6-88)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (108-225)||(11447-11564)
scaffold0235 (57-149)||(13638-13730)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (172-221)||(23843-23892)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (64-222)||(29931-30090)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (172-221)||(36454-36503)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (57-149)||(627-718)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (57-149)||(11286-11377)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (57-149)||(32445-32536)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (57-125)||(12762-12830)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (57-125)||(9788-9856)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (163-206)||(11982-12024)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (149-204)||(4545-4599)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (172-221)||(29558-29607)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (59-143)||(27912-27997)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (171-221)||(289-339)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (154-204)||(206575-206624)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (156-221)||(1881-1945)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (172-221)||(159-208)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (156-221)||(10575-10639)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (172-221)||(21871-21920)
scaffold0210 (172-221)||(29763-29812)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (172-221)||(69794-69843)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (73-149)||(9932-10007)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 73)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6520591 - 6520368
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6520591 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt-gat 6520493  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520492 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6520393  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6520392 tctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 38855149 - 38855372
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  38855149 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 38855247  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855248 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 38855347  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38855348 tctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21285821 - 21285601
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21285821 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgat 21285722  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21285721 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcgg 21285622  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  21285621 tctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Original strand, 23760751 - 23760962
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23760751 tgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagat 23760849  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760850 gttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23760949  T
Q  210 attaagatgatgatgt 225  Q
       |||||||||||||    
T  23760950 ---aagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21673927 - 21673718
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||    
T  21673927 ttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattaaataaattatatt-gat 21673829  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  21673828 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcgg 21673729  T
Q  201 tctaagttgat 211  Q
    |||||||||||    
T  21673728 tctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 210
Target Start/End: Original strand, 983312 - 983512
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  983312 tgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgatg 983410  T
Q  111 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 208  Q
    ||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983411 ttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 983510  T
Q  209 ga 210  Q
    ||    
T  983511 ga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 5866230 - 5866395
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  5866230 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 5866326  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  5866327 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21491160 - 21490995
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21491160 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 21491064  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21491063 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17141081 - 17140916
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  17141081 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatac 17140985  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17140984 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 26355643 - 26355815
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355643 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaatatgtt-gatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatg 26355740  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26355741 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249384
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21249454  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21249453 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255222
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatac 21255292  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgtt-atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21255291 tgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37116572 - 37116366
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  37116572 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 37116473  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  37116472 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 37116373  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  37116372 gtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20498787 - 20498581
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  20498787 tttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaa 20498688  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  20498687 tgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 20498588  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  20498587 gtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 17266890 - 17267096
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||| | ||||     
T  17266890 ttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatg 17266989  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||   | |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  17266990 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17267089  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  17267090 gtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24353235 - 24353039
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| | |  ||| |||||||||    
T  24353235 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatg 24353136  T
Q  111 ttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353135 ttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508188
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    | | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597720
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13597658  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    | ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597659 gttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612231
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 155  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgcata 17612161  T
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  17612162 ctgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 16092337 - 16092463
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16092337 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16092435  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  16092436 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22626902 - 22626736
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  22626902 atgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatact 22626803  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 28648998 - 28649164
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||  || ||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||    
T  28648998 atgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatac 28649097  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28649098 tgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 14409448 - 14409606
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14409448 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 14409546  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409547 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439609
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |    
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgt 17439557  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439558 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22875211 - 22875065
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 177  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||| | | ||    
T  22875211 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gcta 22875113  T
Q  178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22875112 tttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1484560 - 1484402
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  1484560 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 1484462  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484461 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 5853296 - 5853454
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  5853296 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 5853394  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853395 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20403385 - 20403227
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20403385 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20403287  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403286 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22001911 - 22001753
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  22001911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 22001813  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001812 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7372904 - 7372778
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7372904 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 7372806  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7372805 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20536334 - 20536208
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20536334 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 20536236  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20536235 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31971375 - 31971257
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6759368 - 6759255
Alignment:
Q  115 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 213  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6759368 tgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 6759270  T
Q  214 agatgatgatgtcca 228  Q
    |||||||||||||||    
T  6759269 agatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 16413320 - 16413474
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16413320 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 16413418  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413419 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 20046199 - 20046357
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20046199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 20046297  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046298 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41598346 - 41598188
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  41598346 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 41598248  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598247 gtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 18818404 - 18818530
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18818404 atatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 18818502  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18818503 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 21918995 - 21919121
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21918995 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21919093  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21919094 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 21923923 - 21924049
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| | || ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21923923 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21924021  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21924022 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23406489 - 23406379
Alignment:
Q  115 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 213  Q
    ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  214 agatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||    
T  23406390 agatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22364885 - 22364744
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  22364885 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22364786  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    |||||||||||| ||| || | || ||||||||||||||||||    
T  22364785 tttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcatga 22364744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879352
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4483438 - 4483281
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  4483438 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 4483340  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483339 gtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 15203235 - 15203393
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15203235 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15203333  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15203334 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396101
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21396081  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  21396082 gatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790594
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21790574  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  21790575 gatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 16199647 - 16199765
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||| ||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16199745  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  16199746 gatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26219838 - 26219717
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  |  |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26219838 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26219741  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  26219740 ggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 4542377 - 4542535
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||  ||  |    
T  4542377 atataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-t 4542475  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542476 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389571
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21389551  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  21389552 gatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21778897
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21778877  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  21778878 gatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 26225288 - 26225409
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||  || |||| ||| ||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26225288 atatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttttgtatattgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 26225385  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26225386 ggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19896426 - 19896265
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttata---tcatgatgattt-gcatactg 158  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    ||||| || ||| | |||| |    
T  19896426 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccg 19896327  T
Q  159 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
      | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896326 t-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383887
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21383887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131117
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 206
Target Start/End: Original strand, 19801387 - 19801527
Alignment:
Q  65 tataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctat 163  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | |    
T  19801387 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgt 19801485  T
Q  164 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801486 gttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290853
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14823931 - 14823774
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||||  |    
T  14823931 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-tt 14823833  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14823832 gtgttgttg-ttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862521
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18862521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 45 - 206
Target Start/End: Original strand, 19154826 - 19154989
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||  |||||||| |  ||| ||| || ||||| ||| | ||| | |||||| |||||||  ||    
T  19154826 taatgttgatactaatgtaatatatttgtatatgcattatctgaattatttaagatgtttaagttgttgttgattagcacttgatattattatatctgga 19154925  T
Q  145 t--gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |  | |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154926 tatgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387307
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21387307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411180
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21411180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805672
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21805672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827890
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21827890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26224077 - 26223917
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||  | |||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||| ||| |    
T  26224077 atataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt 26223978  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26223977 -tattgctgtt-gttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648554
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678221
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 144
Target Start/End: Original strand, 40492807 - 40492891
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    |||| ||||| |||||||| || | |||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  40492807 atgtaatatatttgtatatgcaat-catgaattatttatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32121785 - 32121734
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32121785 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Original strand, 25484279 - 25484359
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||    
T  25484279 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatg 25484359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 6020 - 6244
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6020 tttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 6119  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6120 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6219  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6220 tctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 70)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21329394 - 21329618
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329394 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 21329493  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329494 gtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 21329593  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21329594 tctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 21502052 - 21502277
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502052 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 21502151  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21502152 tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 21502251  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21502252 gtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21565720 - 21565546
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565720 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 21565621  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21565620 atttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 26011944 - 26012154
Alignment:
Q  13 ttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgtt 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26011944 ttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgtt 26012043  T
Q  113 gatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatt 212  Q
    | ||| |  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26012044 gttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-- 26012141  T
Q  213 aagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||    
T  26012142 aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 58 - 221
Target Start/End: Original strand, 22959489 - 22959649
Alignment:
Q  58 aatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959489 aatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatact 22959585  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22959586 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19669073 - 19668898
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19669073 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcacgatg 19668977  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19668976 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 20026837 - 20027043
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026837 tttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat 20026936  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026937 -gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 20027035  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  20027036 ggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 19660791 - 19660956
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   ||  |||||||||  |||||||| |||| |||||||||    
T  19660791 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatac 19660887  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19660888 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 22178117 - 22178323
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  22178117 ttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 22178216  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  22178217 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 22178316  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  22178317 gtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 58 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22144068
Alignment:
Q  58 aatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatac 22144118  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144117 tacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314577
Alignment:
Q  124 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  224 gt 225  Q
    ||    
T  36314578 gt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22412309 - 22412187
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  22412309 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtc 22412211  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22412210 ggtctaagttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725853
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 8286816 - 8286964
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcctatgttgctgtttgt 175  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||| ||    
T  8286816 cattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gt 8286914  T
Q  176 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8286915 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24493694 - 24493569
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  24493694 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtc 24493596  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493595 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 264772 - 264930
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  264772 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 264870  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264871 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 10732944 - 10733102
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10732944 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10733042  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733043 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20909170 - 20909012
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20909170 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20909072  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909071 gtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29330092 - 29329934
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29330092 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 29329994  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329993 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39363542 - 39363384
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  39363542 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39363444  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363443 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 21729059 - 21729185
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21729059 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21729157  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21729158 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 21808384 - 21808510
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21808384 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21808482  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21808483 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 23390491 - 23390617
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23390491 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23390589  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390590 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13025436 - 13025311
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  13025436 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtc 13025338  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025337 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13095620 - 13095495
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||   ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  13095620 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtc 13095522  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095521 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  117 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 215  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21997645  T
Q  216 atgatgatgt 225  Q
    ||||||||||    
T  21997646 atgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1096634 - 1096467
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| | ||| || ||| ||||||    
T  1096634 atgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatac 1096535  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1096534 tacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 11581203 - 11581361
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||| || |||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11581203 atataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 11581301  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581302 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 42245369 - 42245527
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  42245369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 42245467  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245468 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077952
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagt 9077976  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  9077975 ctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25421658 - 25421532
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25421658 atatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 25421560  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25421559 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 36154787 - 36154942
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  36154787 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 36154885  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154886 gtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529223
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24529241  T
Q  205 agttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  24529240 agttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29346138 - 29345980
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29346138 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29346040  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346039 gtgatgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39245291 - 39245136
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || ||| || |||  ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  39245291 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 39245193  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245192 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29348611 - 29348453
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29348611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29348513  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348512 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29351084 - 29350926
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29351084 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29350986  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350985 gtgatgctgttc-ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 20902012 - 20902172
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  20902012 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 20902110  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatga 222  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20902111 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 2154617 - 2154776
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  2154617 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 2154715  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154716 tgtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 18319037 - 18319193
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  18319037 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 18319135  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18319136 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 10775679 - 10775838
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||||     
T  10775679 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc- 10775777  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775778 tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 101 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25431518 - 25431395
Alignment:
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25431518 atttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcg 25431420  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||| || || |||||||||||||    
T  25431419 gtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448055
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttg 167  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaattacgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttg 29448060  T
Q  168 ctgtt 172  Q
    |||||    
T  29448059 ctgtt 29448055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22075145 - 22075018
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22075145 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagt 22075047  T
Q  198 cggtctaagttgattaag-atgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  22075046 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32027551 - 32027393
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  32027551 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32027453  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027452 gtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293090
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 113
Target Start/End: Original strand, 21741485 - 21741541
Alignment:
Q  56 ctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21741485 ctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 153 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723922
Alignment:
Q  153 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753594
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10753594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871616
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21871616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875896
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaattatgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21875896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120240
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22120240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24067266 - 24067110
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| | |||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  24067266 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 24067168  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    | ||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24067167 tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 24767291 - 24767359
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  24767291 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 24767359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 17517269 - 17517320
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314670
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgatatt 36314670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 18418677 - 18418590
Alignment:
Q  127 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 215  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418677 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatgtt-gttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 158
Target Start/End: Original strand, 20766115 - 20766174
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 158  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||    
T  20766115 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 206
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15796487 - 15796438
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15796487 ctgcctatgttgctgtttattattgat-taagctgcatgagtcggtctaag 15796438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21873318 - 21873254
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21873318 ctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21873254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032323
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032387 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 92)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 811028 - 811248
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811028 tttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 811127  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811128 gtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 811227  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  811228 tctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47832031 - 47831807
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47832031 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgat 47831932  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831931 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 47831832  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  47831831 tctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 16219614 - 16219835
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219614 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 16219713  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16219714 gtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcgg 16219813  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  16219814 tctaagttg---aagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 67968 - 67745
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  67968 tttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 67870  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67869 tatt-gagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 67771  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  67770 gtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18005870 - 18005650
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18005870 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 18005772  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005771 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 18005672  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  18005671 gtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44014398 - 44014182
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44014398 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gat 44014300  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014299 atttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 44014203  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  44014202 tctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22073129 - 22072913
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  22073129 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagat 22073030  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 208  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22073029 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagtt 22072930  T
Q  209 gattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  22072929 gattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16056551 - 16056343
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056551 tttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 16056452  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16056451 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcgg 16056353  T
Q  201 tctaagttga 210  Q
    ||||||||||    
T  16056352 tctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34200951 - 34200786
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  34200951 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 34200855  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34200854 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 15754843 - 15755008
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15754843 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 15754939  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  15754940 tacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 11995983 - 11996148
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||   || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11995983 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgat---ttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatac 11996079  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11996080 tgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495402
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 28505254 - 28505419
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||   ||  || ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28505254 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatac 28505350  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  28505351 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12901548 - 12901338
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12901548 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat 12901449  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||| ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12901448 -gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 12901350  T
Q  199 ggtctaagttga 210  Q
    ||| ||||||||    
T  12901349 ggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 20220087 - 20220290
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  20220087 ttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatg 20220186  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  20220187 tttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcg 20220283  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  20220284 gtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 2280061 - 2280238
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||  ||||  |||||||| | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| |    
T  2280061 atgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct 2280160  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2280161 gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044761
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcagg 14044830  T
Q  144 a--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    |  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044829 agctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354791
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| |    
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcagg 14354860  T
Q  144 a--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    |  || |||   |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354859 agctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13647487 - 13647325
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  13647487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 13647388  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  13647387 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062077
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 162  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||||||  |    
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctga 17062018  T
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17062019 -gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18430870 - 18430709
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  18430870 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 18430772  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430771 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 18456408 - 18456530
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  18456408 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtc 18456506  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18456507 ggtctaagttgattaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868101
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagc 1868035  T
Q  145 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    || |||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868036 tgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38227606 - 38227481
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  38227606 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtc 38227508  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38227507 ggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 203
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255892
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||  || || |||| ||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatgaa 12255832  T
Q  145 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 203  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255833 ttgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486865
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 222
Target Start/End: Original strand, 3564338 - 3564482
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  3564338 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 3564436  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3564437 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12698958 - 12698831
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 196  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12698958 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 12698860  T
Q  197 tcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12698859 tcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 456479 - 456321
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  456479 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 456381  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456380 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 11972654 - 11972496
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11972654 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11972556  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972555 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 14949126 - 14949284
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14949126 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14949224  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949225 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 15376717 - 15376875
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15376717 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15376815  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376816 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16232678 - 16232520
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16232678 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16232580  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232579 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18640430 - 18640272
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18640430 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18640332  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640331 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 20385127 - 20385285
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20385127 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20385225  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385226 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 21189599 - 21189757
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21189599 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21189697  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189698 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24702396 - 24702238
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24702396 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 24702298  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702297 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 32125649 - 32125491
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  32125649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32125551  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125550 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41523075 - 41522917
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  41523075 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41522977  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522976 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 41525537 - 41525379
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  41525537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41525439  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525438 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273392
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9509315 - 9509189
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509315 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 9509217  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9509216 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 221
Target Start/End: Original strand, 11393291 - 11393448
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  11393291 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 11393389  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393390 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16410217 - 16410059
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16410217 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16410119  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410118 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24704843 - 24704688
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 162  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || || |  |||| ||||||  |     
T  24704843 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt--tttgtatactgt-tg 24704747  T
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27217018 - 27216860
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  27217018 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 27216920  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27216919 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44116667 - 44116509
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  44116667 atataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-t 44116569  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116568 gtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  145 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 202  Q
    || |||  ||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063921
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtc 10063912  T
Q  199 ggtctaagt 207  Q
     ||||||||    
T  10063913 agtctaagt 10063921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16213842 - 16213684
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || || ||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16213842 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-t 16213744  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213743 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 16386242 - 16386369
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||||||||||  | || | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386242 atatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 16386341  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16386342 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctg 170  Q
    ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg 24275222  T
Q  171 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275221 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3386491 - 3386333
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| | || ||||| || ||| | |||||   |    
T  3386491 atataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3386393  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386392 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40443509 - 40443393
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaa 40443411  T
Q  206 gttgattaagatgatgat 223  Q
    | || | |||||||||||    
T  40443410 gatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26212122 - 26211995
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26212122 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagt 26212024  T
Q  198 cggtctaagttgattaag-atgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  26212023 cggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 9389615 - 9389705
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  9389615 cagtaagcctggattgtatattctaatattgatgataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatg-ttgatatatgagatgttg 9389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16324226 - 16324172
Alignment:
Q  4 atctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 58  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324226 atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgcta 16324172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847951
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 38898380 - 38898535
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||||     
T  38898380 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc- 38898478  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38898479 tgtgtcgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589039
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 210
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144143
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgat-ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| || || | ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15144134  T
Q  202 ctaagttga 210  Q
    |||||||||    
T  15144135 ctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15113111 - 15113028
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15113111 taatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14036384 - 14036282
Alignment:
Q  97 tgatatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 193  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14036384 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 14036286  T
Q  194 gagt 197  Q
    ||||    
T  14036285 gagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14346414 - 14346312
Alignment:
Q  97 tgatatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 193  Q
    |||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14346414 tgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 14346316  T
Q  194 gagt 197  Q
    ||||    
T  14346315 gagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18426161 - 18426070
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18426161 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18426070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 39267600 - 39267691
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||| ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  39267600 taattttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 39267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 45169791 - 45169882
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45169791 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45169882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 15116648 - 15116565
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| | |||   ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15116648 taatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 219
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154956
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 9751504 - 9751572
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9751504 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9751572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 104 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  104 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18425743 - 18425668
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425743 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 18425945 - 18425870
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  18425945 tatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 18425870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 26356106 - 26356156
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26356106 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 26358558 - 26358608
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26358558 ttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatga 26358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  153 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Original strand, 2832232 - 2832297
Alignment:
Q  60 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  2832232 tgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacatgcatt 2832297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Original strand, 26355987 - 26356061
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26355987 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26356061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 137
Target Start/End: Original strand, 26358439 - 26358513
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttat 137  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  26358439 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 26358513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138177
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138113 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 19649557 - 19649606
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649557 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 18302309 - 18302257
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  18302309 tatatatattgcatgaattatgtttgatgaatgagatgttgatgacgtgcatt 18302257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 20110704 - 20110624
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||  ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  20110704 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 932 - 1155
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  932 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta-aatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 1030  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1031 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1130  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1131 tctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 39706186 - 39706409
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39706186 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt-gat 39706284  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706285 gtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 39706384  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39706385 tctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 12288106 - 12288316
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288106 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat 12288205  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288206 -gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12288304  T
Q  199 ggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||    
T  12288305 ggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 13747 - 13953
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  13747 tttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaa 13846  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  13847 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 13946  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  13947 gtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551817
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatac 15551886  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  15551885 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8846550 - 8846360
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt-------------- 132  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  8846550 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgata 8846451  T
Q  133 --gttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
      ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||    
T  8846450 ttgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 70 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12774160 - 12774011
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774160 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 12774063  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12774062 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 43198495 - 43198661
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 144  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  43198495 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaa 43198594  T
Q  145 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
     || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198595 ttgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243302
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaa 52243235  T
Q  145 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243236 ctgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 53082049 - 53082254
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  53082049 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 53082148  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||  || |||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  53082149 tttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 53082247  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  53082248 gtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16596813 - 16596686
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16596813 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16596717  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaag 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596716 tacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 46640353 - 46640558
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| || | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  46640353 ttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 46640452  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    || ||||||||  ||| || |||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46640453 tt-gagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 46640551  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  46640552 gtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7798900 - 7798774
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7798900 atatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 7798802  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7798801 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929042
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||  ||||||||||| || ||| |||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  146 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 222
Target Start/End: Original strand, 16377497 - 16377639
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 177  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16377497 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gtta 16377594  T
Q  178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16377595 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 18215278 - 18215436
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  18215278 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 18215376  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215377 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44615446 - 44615288
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  44615446 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 44615348  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615347 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 12311 - 12469
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  12311 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12409  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12410 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088877
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14280438 - 14280316
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280438 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14280341  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14280340 cggtctaagttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 15118356 - 15118514
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  15118356 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 15118454  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118455 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 44773091 - 44773249
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  44773091 atataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 44773189  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773190 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 52312668 - 52312510
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  52312668 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 52312570  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312569 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 54798749 - 54798872
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  54798749 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagt 54798847  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  54798848 cggtctaagttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6900057 - 6899891
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||   ||| || |||| |||||    
T  6900057 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatact 6899958  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 16270231 - 16270356
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  16270231 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtc 16270329  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16270330 ggtctaacttgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 19618176 - 19618336
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||   ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| |    
T  19618176 atataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-t 19618274  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19618275 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 225
Target Start/End: Original strand, 52873363 - 52873488
Alignment:
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52873363 tatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 52873461  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  52873462 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12902904 - 12902757
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  12902904 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 12902806  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12902805 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 50222343 - 50222501
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  50222343 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-t 50222441  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222442 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Original strand, 1837506 - 1837671
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcat 154  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| | ||    
T  1837506 taatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtat 1837605  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837606 actgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15099551 - 15099461
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15099551 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 15190518 - 15190428
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15190518 cagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 16239965 - 16240090
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||     
T  16239965 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagtt 16240063  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16240064 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19242857 - 19242693
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19242857 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19242759  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 228  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19242758 gtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 18239426 - 18239581
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  18239426 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 18239524  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239525 ctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 3515165 - 3515007
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||| |    
T  3515165 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-t 3515067  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515066 gtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7893829 - 7893703
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  7893829 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaat 7893731  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  7893730 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44052955 - 44052829
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  44052955 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagt 44052857  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  44052856 cggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22636602 - 22636437
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||    
T  22636602 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaac 22636503  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22636502 tgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096293
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 15355328 - 15355483
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  15355328 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 15355426  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355427 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046487
Alignment:
Q  153 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 23803269 - 23803427
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || || ||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  23803269 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 23803367  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803368 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44102372 - 44102214
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  44102372 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 44102274  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102273 gtgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 51463872 - 51464030
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  51463872 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 51463970  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463971 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 8574864 - 8574985
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8574864 atatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 8574961  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  8574962 ggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038653
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 14038672  T
Q  202 ctaagttgattaagatgat 220  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  14038671 ctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 7641196 - 7641344
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 162  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||          |     
T  7641196 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tg 7641285  T
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 218
Target Start/End: Original strand, 23374354 - 23374473
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23374354 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23374452  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatg 218  Q
    || ||||||||| | ||||||    
T  23374453 cgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 14970711 - 14970871
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| |||||  ||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  14970711 atataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-t 14970809  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  14970810 gttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 14053306 - 14053422
Alignment:
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  14053306 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaaga 14053404  T
Q  208 tgattaagatgatgatgt 225  Q
    || | |||||||||||||    
T  14053405 tgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630819
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 630819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331961
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 3331961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812854
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13812854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14954006
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14954006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690137
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 25690137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22353995 - 22353835
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||| | | ||||||||||| ||||| || |  | ||  ||||||    
T  22353995 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcct 22353896  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||    
T  22353895 atgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10713174 - 10713083
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10713174 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10713083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10926944 - 10926853
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10926944 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 10926853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12488032 - 12487941
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  12488032 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 12487941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15225399 - 15225308
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15225399 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15225308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15367852 - 15367690
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  15367852 atataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 15367754  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15367753 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15402865 - 15402703
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| | |||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  15402865 atataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 15402767  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15402766 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Original strand, 15464890 - 15464970
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15464890 atataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 21815589 - 21815731
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| |||||||||||  ||||| |||| ||||| ||  |||| |||| |  |    
T  21815589 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag-tt 21815687  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815688 gtgttgctg-tcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15225188 - 15225114
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15225188 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15225114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 15868663 - 15868754
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| | | |  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15868663 taatgttatataattggatatttattgcatgaattatggtcgctgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15868754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 20157244 - 20157312
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| | | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  20157244 taatgttatataattagatatatactgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 20157312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 22634167 - 22634235
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  22634167 taatgttatataattagatatatattgcataaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 22634235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32851542 - 32851450
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||  || |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32851542 taatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32851450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 20157527 - 20157579
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||    
T  20157527 ttgttatttaactaatttgcatgagtctatataagttgattaagacgatgatg 20157579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 110)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14234713 - 14234487
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg 98  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14234713 tttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg 14234614  T
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14234613 atgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatc 14234514  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  14234513 agtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15471147 - 15470927
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471147 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 15471049  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471048 gtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcgg 15470949  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  15470948 tctaagttg---aagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16097552 - 16097332
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097552 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 16097453  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097452 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 16097353  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||| | |||||||    
T  16097352 tctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 46 - 221
Target Start/End: Original strand, 12174204 - 12174376
Alignment:
Q  46 aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12174204 aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgat 12174300  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12174301 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16103957 - 16103784
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103957 atgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatg 16103859  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16103858 atttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 13210283 - 13210448
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13210283 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 13210379  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  13210380 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 32307830 - 32307691
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307830 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 32307733  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307732 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27165426 - 27165250
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||  || ||| | |||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |    
T  27165426 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgtt 27165327  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165326 gttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  145 -tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 37251064 - 37251270
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  37251064 tttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgat 37251163  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  37251164 -gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactc 37251262  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  37251263 ggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9513067 - 9512924
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 172  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9513067 tatatacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 9512973  T
Q  173 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9512972 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9521042 - 9520899
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 172  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9521042 tatatacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgat----tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt 9520948  T
Q  173 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  9520947 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 221
Target Start/End: Original strand, 49668044 - 49668193
Alignment:
Q  71 tgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgtt-gatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||  ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49668044 tgtatatactttaaatggattatgtt-gataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 49668141  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  49668142 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 53301492 - 53301669
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||   | ||| |||||||| | ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  53301492 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgtaatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgt 53301591  T
Q  145 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301592 tgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 22110249 - 22110454
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| | | ||||     
T  22110249 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgat- 22110347  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
     |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22110348 gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 22110447  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  22110448 gtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340844
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | | |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 47 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 23274866 - 23274705
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| | |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23274866 atgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 23274767  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274766 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642386
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925977
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcct 161  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcct 43926022  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926021 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14973021 - 14972854
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||  || |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||    
T  14973021 atgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 14972922  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14972921 tgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438534
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtcta 18438555  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  18438554 agttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172745
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 29172685  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172686 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399209
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 12399237  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  12399236 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 24153204 - 24153326
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  24153204 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtc 24153302  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24153303 ggtctaagttgattaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 36166719 - 36166598
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36166719 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 36166622  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  36166621 ggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Original strand, 1644642 - 1644780
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1644642 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 1644739  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 211  Q
    | |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  1644740 g-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgat 1644780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 9707611 - 9707769
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  9707611 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 9707709  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707710 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17463336 - 17463178
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  17463336 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17463238  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463237 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34159484 - 34159326
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34159484 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34159386  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159385 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 45606911 - 45607069
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  45606911 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 45607009  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607010 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55476649 - 55476491
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  55476649 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 55476551  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476550 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13442400 - 13442274
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13442400 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 13442302  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  13442301 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550644
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| ||||||||| |    
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcat 43550581  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  43550582 atgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 127 - 225
Target Start/End: Original strand, 11424783 - 11424880
Alignment:
Q  127 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11424783 gatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Original strand, 16282815 - 16282971
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16282815 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16282913  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 220  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282914 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42386577 - 42386428
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||| | |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||| ||||    
T  42386577 atgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatac 42386478  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386477 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 13544183 - 13544024
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| |    
T  13544183 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-t 13544085  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13544084 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 28848618 - 28848773
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  28848618 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 28848716  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848717 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 6469138 - 6469296
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6469138 atataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6469236  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469237 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 7781351 - 7781509
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  7781351 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 7781449  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781450 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8899252 - 8899094
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  8899252 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 8899154  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8899153 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 12567718 - 12567564
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||| |    
T  12567718 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-t 12567620  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567619 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 16454285 - 16454443
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  16454285 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 16454383  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454384 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17488023 - 17487856
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||    
T  17488023 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 17487924  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17487923 tgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17499505 - 17499338
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||    
T  17499505 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 17499406  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17499405 tgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698556
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| |||  ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20698535  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20698536 agttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 38961895 - 38962053
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  38961895 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 38961993  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38961994 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147646
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||| ||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 23083356 - 23083482
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23083356 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagt 23083454  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23083455 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  160 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 13151794 - 13151953
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13151794 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13151892  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151893 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 13154259 - 13154418
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13154259 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13154357  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154358 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 10247727 - 10247885
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  10247727 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 10247825  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247826 gtgctgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17672784 - 17672626
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17672784 atataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 17672686  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672685 atgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 25476359 - 25476506
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||| |||||||||| |||    
T  25476359 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gtt 25476457  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25476458 ttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40213838
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggt 40213817  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40213818 ctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Original strand, 1465329 - 1465419
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1465329 cagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21618570 - 21618449
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21618570 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 21618473  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  21618472 ggtctaagttgattgagaagatga 21618449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26687013 - 26686887
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26687013 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 26686915  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||    
T  26686914 cggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 41124045 - 41123892
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  41124045 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 41123947  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 220  Q
     |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123946 gtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 99 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14572714 - 14572603
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| |||||  || | |||||| |||| ||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14572714 atatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T
Q  199 ggtctaagttgat 211  Q
    |||||||||||||    
T  14572615 ggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 17446659 - 17446816
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  17446659 atataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 17446757  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17446758 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 50242980 - 50242822
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  50242980 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-t 50242882  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50242881 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  207 ttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 71 - 206
Target Start/End: Original strand, 606293 - 606428
Alignment:
Q  71 tgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgc 168  Q
    |||||| |||||||||||||| | | |||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||||||    
T  606293 tgtatacacattacatgaattctatatgatgtt-gagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatgtgctgcctatgttgc 606390  T
Q  169 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606391 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  145 -tgatttgcatactgcctat 163  Q
     || ||||||||||||||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977515
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 15977536  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15977535 ctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 53070657 - 53070799
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| || || || ||| | ||||||  |    
T  53070657 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-t 53070755  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070756 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 163 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43841058 - 43840932
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43841058 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 43840960  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  43840959 cggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 113
Target Start/End: Original strand, 49389573 - 49389639
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49389573 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Original strand, 12119768 - 12119887
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12119768 ttgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaacaaagctgcatgagtcgg 12119865  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12119866 tctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 59 - 211
Target Start/End: Original strand, 14576787 - 14576939
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || | |  |||||    
T  14576787 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatact 14576886  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 211  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  109 tgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19775998
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 19775998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439512
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 37439512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 4107182 - 4107273
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  4107182 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 4107273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 4111034 - 4111125
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  4111034 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 4111125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15965293 - 15965202
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15965293 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15965202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15969217 - 15969126
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15969217 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15969126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 15973141 - 15973050
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  15973141 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 15973050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 16749779 - 16749870
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16749779 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16749870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 12852318 - 12852413
Alignment:
Q  57 taatgttatataattg----tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  12852318 taatgttatataattggatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 12852413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Original strand, 16750390 - 16750464
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750390 atatacattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822267
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 8489250 - 8489341
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| |||||||||    
T  8489250 taatgttatatatttagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgtatttgtaattgttatat-atgatgatt 8489341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12511059
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Original strand, 16749994 - 16750068
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16749994 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 124
Target Start/End: Original strand, 23413204 - 23413271
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcat 124  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  23413204 taatgttatatagatggatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcat 23413271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctatt-gttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 14501290 - 14501198
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  14501290 taatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 14501198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43927356 - 43927291
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatat 67  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| ||||    
T  43927356 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 4588742 - 4588812
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacat--tacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  4588742 taatgttatataattatatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 4588812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Original strand, 16750192 - 16750266
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16750192 atatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16750266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14665772 - 14665711
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 118  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14665772 taatgtcatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 14665711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14668927 - 14668866
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 118  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14668927 taatgtcatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 14668866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14735285 - 14735224
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 118  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  14735285 taatgtcatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 14735224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 15878119 - 15878168
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878119 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 45797334 - 45797242
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||  || |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  45797334 taatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 45797242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 221
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  173 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30029893 - 30029841
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  30029893 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatg 30029841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10751 - 10542
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10751 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgat 10652  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10651 gtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcgg 10552  T
Q  201 tctaagttga 210  Q
    ||||||||||    
T  10551 tctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13163 - 12942
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13163 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgat 13064  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  13063 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcgg 12964  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||   |||||||||||||    
T  12963 tctaagttg---aagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 144
Target Start/End: Original strand, 18143 - 18277
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||  | | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  18143 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 18242  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  18243 gttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 18277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6758 - 6535
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  6758 ttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gat 6660  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6659 atttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6560  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| | |||||||||||    
T  6559 tctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8693 - 8481
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat--tgtatatacattacatgaattatgtttg 98  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||  | ||| |  | ||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||    
T  8693 tttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatg 8594  T
Q  99 a-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8593 aatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 8494  T
Q  198 cggtctaagttga 210  Q
    |||||||||||||    
T  8493 cggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6835 - 6611
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6835 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 6736  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6735 gtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 6636  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6635 tctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14215 - 13991
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14215 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 14116  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14115 gtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 14016  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14015 tctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12990 - 12766
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12990 tttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 12891  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12890 gtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcgg 12791  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||    
T  12790 tctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 64)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 22921766 - 22921986
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  22921766 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttgtt-ga 22921864  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921865 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 22921964  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||| |||| | |||||||    
T  22921965 gtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33681185 - 33681010
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33681185 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 33681086  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  33681085 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22237805 - 22237630
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22237805 atgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 22237706  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22237705 atttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 21861466 - 21861672
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  21861466 tttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaa 21861565  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  21861566 tgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcg 21861665  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  21861666 gtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20248454 - 20248283
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248454 atgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatg 20248358  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20248357 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 21896162 - 21896358
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||    
T  21896162 tgttgttgtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagat 21896261  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896262 gttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20918769 - 20918620
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20918769 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 20918673  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918672 tgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 52927925 - 52928076
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||    
T  52927925 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgatg 52928012  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928013 atttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295672
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 70 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 21754198 - 21754059
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21754198 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgtt 21754101  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754100 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 16368183 - 16368388
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    |||    
T  16368183 tttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat 16368282  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
     || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16368283 gtt-gagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 16368380  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  16368381 ggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 50686836 - 50686630
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  50686836 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 50686737  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  |  |||    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  50686736 tttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaactattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcg 50686637  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  50686636 gtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgct 35261119  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261120 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 41049933 - 41050138
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||||     
T  41049933 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgat- 41050031  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  41050032 gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcg 41050131  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  41050132 gtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758664
Alignment:
Q  48 tgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--t 145  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||   ||| ||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaact 16758729  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758728 ggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 50614031 - 50614219
Alignment:
Q  20 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||| |    
T  50614031 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatt 50614130  T
Q  120 tgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614131 tgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 206
Target Start/End: Original strand, 50621859 - 50622047
Alignment:
Q  20 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgact 119  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | |||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| |||||||||||| ||| |    
T  50621859 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatt 50621958  T
Q  120 tgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621959 tgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 50210187 - 50210333
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  50210187 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 50210285  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50210286 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 433185 - 433012
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||||    
T  433185 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgat 433086  T
Q  146 g-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |  |||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433085 gtttttgtatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45575008
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgt-ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 45574945  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||    
T  45574946 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21161928 - 21161720
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgag 107  Q
    |||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||  ||||||    |    
T  21161928 ctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatgatttatgttgatgatat----g 21161833  T
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  21161832 aagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactg-ttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagt 21161734  T
Q  208 tgattaagatgatg 221  Q
    |||| | |||||||    
T  21161733 tgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13989024 - 13988866
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  13989024 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 13988926  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988925 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 21923295 - 21923453
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21923295 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21923393  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923394 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21840925 - 21840766
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| |    
T  21840925 atataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-t 21840827  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21840826 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 172
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130975
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttggatac 22130959  T
Q  157 tgcctatgttgctgtt 172  Q
    ||||||||||||||||    
T  22130960 tgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 23593722 - 23593897
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  23593722 atgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23593821  T
Q  146 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| | ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593822 gtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509783
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 34509801  T
Q  205 agttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  34509800 agttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 21475091 - 21475249
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21475091 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21475189  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21475190 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 27250703 - 27250850
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||    
T  27250703 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gtt 27250801  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27250802 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29298294 - 29298137
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  29298294 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-t 29298197  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298196 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29776846 - 29776688
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||  |    
T  29776846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-t 29776748  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776747 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31612471 - 31612313
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  31612471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 31612373  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612372 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093987
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgca 153  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttcta 16093934  T
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093935 tactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 113
Target Start/End: Original strand, 35981585 - 35981696
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  35981585 tttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatg-ttgat 35981683  T
Q  101 atttgagatgttg 113  Q
    |||||||||||||    
T  35981684 atttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 49261542 - 49261452
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  49261542 cagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatataaattatg-ttgatatttgagatgttg 49261452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 13212865 - 13213027
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  13212865 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 13212963  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212964 tgcgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20637051 - 20636956
Alignment:
Q  22 cagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 118  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20637051 cagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 22123071 - 22123230
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||  | ||| || ||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||  |    
T  22123071 atataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-t 22123169  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22123170 gtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22532416 - 22532269
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  22532416 cattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 22532318  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22532317 atttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16362092 - 16361915
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |    
T  16362092 atgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 16361993  T
Q  146 gatttgc-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    | |||   ||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16361992 gtttttatatactgt-tgtgttgctgtc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 225
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847275
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130632
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21347120 - 21346961
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  21347120 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc- 21347022  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | |||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347021 tgtgtctttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801508
Alignment:
Q  149 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21026806 - 21026680
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||  ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21026806 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 21026708  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | | |||||||||||    
T  21026707 cggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064959
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 154  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||  |  |||   |    
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaattatatatgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcatgaattattttatgt 26065009  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065008 actgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1925005
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 1925005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924019
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 20924019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 224
Target Start/End: Original strand, 22468749 - 22468816
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22468749 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275526
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 41387833 - 41387924
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  41387833 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 41387924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20135240 - 20135188
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20135240 ttgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 149
Target Start/End: Original strand, 41388048 - 41388122
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  41388048 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 41388122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40389313 - 40389157
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| | |||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  40389313 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga- 40389215  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    | ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40389214 tgtgtcgctgtt-gttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12271676 - 12271639
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12271676 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 39243943 - 39244008
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 139  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39243943 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39244008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Original strand, 39247498 - 39247563
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 139  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  39247498 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 39247563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 224
Target Start/End: Original strand, 24783160 - 24783212
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||||    
T  24783160 ttgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19488 - 19268
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19488 tttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 19390  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19389 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 19290  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  19289 gtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 100598 - 100378
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  100598 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtta-a 100500  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100499 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 100400  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  100399 gtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 40081 - 40291
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40081 tgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagat 40179  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40180 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 40279  T
Q  210 attaagatgatg 221  Q
    || | |||||||    
T  40280 atgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 94569 - 94411
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  94569 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 94471  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94470 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 44613 - 44454
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt--gcatactgcc 160  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||  | ||||||      
T  44613 atataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt- 44515  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119875
Alignment:
Q  152 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Original strand, 17444 - 17598
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  17444 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 17542  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
     ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17543 gtgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101503
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 38547 - 38596
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  38547 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23019630 - 23019408
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23019630 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 23019531  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  23019530 gtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcgg 23019431  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||| |||  |||||||||||||    
T  23019430 tctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652199
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652371 atgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggattatgtt-gatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatg 19652274  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19652273 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 28496427 - 28496592
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  28496427 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 28496523  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  28496524 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 29808838 - 29809003
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29808838 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 29808934  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  29808935 tgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1561468 - 1561303
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1561468 taatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgat---ttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1561372  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  1561371 tacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19668596 - 19668386
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  19668596 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgat 19668497  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668496 -gttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 19668398  T
Q  199 ggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||    
T  19668397 ggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20109319 - 20109140
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataat--tgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    ||||||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20109319 atgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatg 20109220  T
Q  144 atgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20109219 ttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333339
Alignment:
Q  124 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  224 gt 225  Q
    ||    
T  27333338 gt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 124 - 225
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394079
Alignment:
Q  124 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  224 gt 225  Q
    ||    
T  27394078 gt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098620
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 154  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||  || |||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcat 9098564  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098565 actgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25644488 - 25644335
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||    
T  25644488 atgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatac 25644389  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644388 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 225
Target Start/End: Original strand, 22080637 - 22080846
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||   |||    
T  22080637 ttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatg-acgat 22080735  T
Q  101 atttgagatgttgatgact-tgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
     |||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||    
T  22080736 gtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatg-------------tttaactaagctgcatgagtcg 22080820  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22080821 gtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Original strand, 4185752 - 4185928
Alignment:
Q  33 aattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 130  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||    
T  4185752 aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgata 4185847  T
Q  131 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 211  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185848 ttgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782227
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 22782287  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782286 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227632
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 29060687 - 29060540
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  29060687 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 29060589  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29060588 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 30676714 - 30676874
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||| |    
T  30676714 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-t 30676812  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676813 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4186482 - 4186381
Alignment:
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4186482 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttg 4186383  T
Q  210 at 211  Q
    ||    
T  4186382 at 4186381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 2291184 - 2291342
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  2291184 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 2291282  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291283 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12742475 - 12742317
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  12742475 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 12742377  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742376 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 18334596 - 18334754
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18334596 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18334694  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334695 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 19005204 - 19005046
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19005204 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19005106  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005105 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 19858923 - 19859081
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  19858923 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 19859021  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859022 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24422705 - 24422547
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24422705 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24422607  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422606 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33861952 - 33861794
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  33861952 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33861854  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861853 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33864436 - 33864278
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  33864436 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 33864338  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864337 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16496370 - 16496244
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16496370 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 16496272  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16496271 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 17287791 - 17287917
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| ||  |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17287791 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 17287889  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287890 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 19303495 - 19303661
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||| |||| ||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  19303495 atgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatact 19303594  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
     ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 103 - 224
Target Start/End: Original strand, 18409826 - 18409947
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409826 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20076805 - 20076700
Alignment:
Q  119 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20076805 ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 20076707  T
Q  219 atgatgt 225  Q
    |||||||    
T  20076706 atgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 1595707 - 1595549
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  1595707 atataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-t 1595609  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595608 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8055187 - 8055029
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  8055187 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-t 8055089  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055088 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 25629329 - 25629476
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||| ||||| ||     
T  25629329 cattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gta 25629427  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629428 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 26924644 - 26924802
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  26924644 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 26924742  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924743 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 20360914 - 20361081
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | || |    
T  20360914 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgc 20361013  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  20361014 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20593920 - 20593773
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||||||||| ||    
T  20593920 cattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-tt 20593822  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20593821 atttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25754967 - 25754809
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  25754967 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 25754869  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754868 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 20556898 - 20557054
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgccta 162  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| |||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||| | ||||||  |     
T  20556898 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaaatt-gagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tg 20556995  T
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20556996 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23076955 - 23076749
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  23076955 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatg 23076856  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    ||| || ||||| ||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23076855 tttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23076756  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  23076755 gtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25656733 - 25656629
Alignment:
Q  117 acttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 215  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656733 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 25656636  T
Q  216 atgatga 222  Q
    |||||||    
T  25656635 atgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 221
Target Start/End: Original strand, 31155305 - 31155514
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgag 107  Q
    |||||| |||| |||| || || |||| | |||||  ||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||    |    
T  31155305 ctgttgatgttccagtgagtctaaattttttaatccgatgatgttgttgatgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----g 31155400  T
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || |||    
T  31155401 aagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgttta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaag 31155499  T
Q  207 ttgattaagatgatg 221  Q
    ||||| | |||||||    
T  31155500 ttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34963531 - 34963371
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34963531 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34963433  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34963432 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Original strand, 1540918 - 1541073
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||  | ||    
T  1540918 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtg 1541016  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1541017 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 16920634 - 16920751
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaa 16920731  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  16920732 gatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 20638285 - 20638404
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||| | ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20638285 agatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtcta 20638383  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  20638384 agttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35245703 - 35245586
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35245703 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 35245606  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  35245605 gatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 170
Target Start/End: Original strand, 4668142 - 4668277
Alignment:
Q  33 aattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 130  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||    
T  4668142 aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgata 4668237  T
Q  131 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4668238 ttgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 170
Target Start/End: Original strand, 4674989 - 4675124
Alignment:
Q  33 aattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 130  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||    
T  4674989 aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgata 4675084  T
Q  131 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4675085 ttgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 16448530 - 16448686
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  16448530 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 16448628  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16448629 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 3852021 - 3852179
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||||||||  ||||| | || ||||| || ||| | |||||   |    
T  3852021 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-t 3852119  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852120 gtgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35008373 - 35008167
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  35008373 ttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatgaattatatatgatg 35008274  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat--gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    ||| || ||||  ||| |  || | |||||| |||||||  |||  | |||   |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  35008273 tttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 35008174  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  35008173 gtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18456877 - 18456735
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  18456877 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-t 18456779  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456778 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688502
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgat 25688523  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  25688522 ctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 22780222 - 22780348
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||| | || ||| | ||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22780222 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22780320  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  22780321 cagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949375
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22949375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953331
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 22953331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871819
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 23871819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875775
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 23875775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325479
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 27325479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 93
Target Start/End: Original strand, 28103796 - 28103887
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattat 93  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||||    
T  28103796 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattat 28103887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 167  Q
    |||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   | |||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttg 18461933  T
Q  168 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461932 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706356
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaac 18706385  T
Q  145 tgatttgcatactgcctatgttgctgttt 173  Q
    || |||  ||| |||||||||||||||||    
T  18706384 tgttttatatattgcctatgttgctgttt 18706356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185524
Alignment:
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16760616 - 16760525
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  16760616 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 16760525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696569
Alignment:
Q  45 taatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 18696569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848114
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27333182 - 27333236
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 55  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27333182 tttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27333236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 27393922 - 27393976
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 55  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27393922 tttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttg 27393976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 16624651 - 16624583
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||    
T  16624651 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattaagatgttgatgacgtgcatt 16624583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 31477595 - 31477686
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  31477595 taatgttatataattagatatatattgcataaattttgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 31477686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33443146 - 33443068
Alignment:
Q  127 gatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||||| |||  || |||  ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443146 gatattgttatatcttgagatgttttatatactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 23992480 - 23992429
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  23992480 ttgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16624436 - 16624371
Alignment:
Q  74 atatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 139  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  16624436 atatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 16624371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21939549 - 21939488
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgac 118  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21939549 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgac 21939488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008799
Alignment:
Q  184 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcca 228  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19008799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18907160 - 18907111
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907160 ttgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19863027 - 19862978
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863027 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19873169 - 19873120
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873169 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766695
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 154; Significance: 8e-82; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25176074 - 25175854
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  25176074 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgtt-ga 25175976  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25175975 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatct 25175876  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  25175875 gtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 158  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  159 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28406201 - 28405981
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||    
T  28406201 tttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaagtt-ga 28406103  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28406102 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtc 28406003  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgat 220  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  28406002 ggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 206
Target Start/End: Original strand, 7639 - 7835
Alignment:
Q  11 tgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||||    
T  7639 tgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagat 7738  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7739 gttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 18786799 - 18787009
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786799 tttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat 18786898  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
      ||| || |||| ||| ||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18786899 -gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtc 18786997  T
Q  199 ggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||    
T  18786998 ggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072070
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||   ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 23072001  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||    
T  23072002 tgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708738
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||| |    
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgtt 23708660  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23708661 gttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671830
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||   ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgcatac 19671899  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  19671898 tgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22105571 - 22105412
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||    
T  22105571 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcct 22105472  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105471 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23207501 - 23207296
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||     
T  23207501 ttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatg 23207402  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    || ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23207401 tt-gagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  23207302 gtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23791499 - 23791292
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  23791499 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataat 23791400  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
     |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||    
T  23791399 gtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtc 23791300  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  23791299 ggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Original strand, 22134175 - 22134326
Alignment:
Q  70 ttgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgct 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134175 ttgtatatacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgct 22134272  T
Q  170 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||    
T  22134273 g-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 298809 - 298933
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298809 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 298908  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  298909 cggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25109112 - 25108906
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  25109112 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 25109013  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||| ||| ||| ||   || ||||||||||||||||||  |  |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  25109012 tttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcatgaactattttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcg 25108913  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  25108912 gtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23060639 - 23060513
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23060639 atatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23060541  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23060540 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18809101 - 18808943
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  18809101 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 18809003  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809002 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520295
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 154  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |    
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgt 20520243  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520244 actgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23131020 - 23130862
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23131020 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23130922  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130921 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23133487 - 23133329
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23133487 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23133389  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133388 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 23709536 - 23709694
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23709536 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23709634  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709635 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 23712017 - 23712175
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  23712017 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 23712115  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712116 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26505537 - 26505379
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  26505537 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-t 26505439  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505438 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 26508015 - 26507857
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||| |    
T  26508015 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-t 26507917  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507916 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 34402526 - 34402684
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  34402526 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 34402624  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402625 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 39682471 - 39682313
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  39682471 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 39682373  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682372 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23135745 - 23135590
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  23135745 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 23135647  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135646 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 571555 - 571397
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  571555 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 571457  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571456 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 6726153 - 6725995
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  6726153 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 6726055  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726054 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22337262 - 22337115
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||| |||| |||||||||| |||    
T  22337262 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gtt 22337164  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22337163 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24367932 - 24367774
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24367932 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24367834  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24367833 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 28577257 - 28577099
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||| || ||| | ||||||  |    
T  28577257 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-t 28577159  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577158 gcgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23076568 - 23076442
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076568 atatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23076470  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  23076469 cggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23285987 - 23285865
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| || || |  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23285987 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc-tgtt--tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 23285892  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23285891 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 23654381 - 23654507
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23654381 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 23654479  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||    
T  23654480 cggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 225
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38235
Alignment:
Q  127 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||| |||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 32214925 - 32215085
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  32214925 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 32215023  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32215024 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 21155064 - 21155219
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  21155064 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 21155162  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155163 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatat--tgttatatcatga 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  145 --tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
      || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 24898199 - 24898358
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24898199 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24898297  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898298 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 24900682 - 24900841
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24900682 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24900780  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900781 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 24903159 - 24903318
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24903159 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24903257  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903258 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 24905636 - 24905795
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24905636 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24905734  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905735 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 24908111 - 24908270
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  24908111 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 24908209  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908210 gtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20309108
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20309128  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  20309127 gatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 32039502 - 32039660
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  32039502 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 32039600  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32039601 gtgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 22731229 - 22731355
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22731229 atatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22731327  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22731328 cggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23660169 - 23660023
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 177  Q
    |||||| ||| ||||| |||| ||||| |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||  || || | |||||||||||||||||||| |||     
T  23660169 cattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttg 23660071  T
Q  178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23660070 tttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103516
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 202  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | || ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  203 taagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| || | |||||||||||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43137457 - 43137301
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||  | |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| | | |    
T  43137457 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-t 43137359  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 220  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137358 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 45029858 - 45030016
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||  |    
T  45029858 atataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-t 45029956  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029957 gtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 206
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697709
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga-- 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| | | |||  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||      
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaac 24697647  T
Q  145 tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    || ||    ||||||||| |||| ||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697648 tgtttgatgtactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946657
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 225
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 22738175 - 22738300
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22738175 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22738272  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  22738273 cggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23004916 - 23004767
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatac 156  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||  || ||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||  |  |||   |||    
T  23004916 atgttaaatatttgtatatgcattatgtggattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtac 23004817  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004816 tacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 172 - 222
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529691
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283657
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 1283657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 140
Target Start/End: Original strand, 22459514 - 22459598
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 140  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22459514 taatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344867
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 30344867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 172 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 25616238 - 25616192
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25616238 ttgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 132
Target Start/End: Original strand, 24642860 - 24642929
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatatt 132  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  24642860 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatatt 24642929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 38967533 - 38967452
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  38967533 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatg 38967452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 10484 - 10647
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10484 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 10583  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10584 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5867 - 5657
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5867 tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 5769  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5768 tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcg 5669  T
Q  200 gtctaagttgat 211  Q
    ||||||||||||    
T  5668 gtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32759 - 32538
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32759 tttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat 32660  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32659 gtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 32561  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  32560 tctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 206
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 210
Target Start/End: Original strand, 22613 - 22776
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22613 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 22712  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22713 atttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 82230 - 82072
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  82230 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-t 82132  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82131 gtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 130129 - 129919
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130129 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 130030  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  130029 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcgg 129930  T
Q  201 tctaagttgat 211  Q
    |||||||||||    
T  129929 tctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 206
Target Start/End: Original strand, 60669 - 60818
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcata 155  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||  || |||| |||    
T  60669 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtata 60767  T
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60768 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2542 - 2762
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2542 tttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 2640  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2641 tatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 2740  T
Q  200 gtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| | |||||||    
T  2741 gtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1086
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1306 tttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgat 1207  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
     ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1206 gtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1107  T
Q  201 tctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1106 tctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Original strand, 45735 - 45909
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45735 atgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatg 45834  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45835 atttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 307 - 133
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  307 atgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatg 208  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  207 atttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 221
Target Start/End: Original strand, 14596 - 14814
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14596 tatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatgaattatgtt-gata 14694  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14695 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||| | |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7033 - 6826
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7033 tttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgat 6934  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||| |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6933 atttgagttgttgat---ttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcgg 6837  T
Q  201 tctaagttgat 211  Q
    |||||| ||||    
T  6836 tctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8239 - 8097
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8239 tttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 8140  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8139 gtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 160861 - 160688
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg 146  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  160861 atgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatg 160763  T
Q  147 atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  160762 atttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 64 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 501242 - 501088
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  501242 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-t 501144  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501143 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 85583 - 85742
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || || ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  85583 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt- 85681  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  85682 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 62419 - 62216
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgt-ataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  62419 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-ga 62321  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  62320 tatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcg 62224  T
Q  200 gtctaagt 207  Q
    || |||||    
T  62223 gtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 132809 - 132662
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgt 171  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  132809 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgt 132712  T
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  132711 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 136838 - 136680
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  136838 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 136740  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136739 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 139307 - 139149
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  139307 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 139209  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139208 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 144245 - 144087
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  144245 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 144147  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144146 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 134369 - 134211
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  134369 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 134271  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134270 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 141776 - 141618
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |    
T  141776 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-t 141678  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141677 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 15826 - 15664
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  15826 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatac 15730  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15729 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11292
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11457 taatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 11361  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11360 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 1997
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2066  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  2065 tgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 28435  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  28434 agttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  169 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 7983 - 8180
Alignment:
Q  14 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||    
T  7983 tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttg 8081  T
Q  114 atgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
     ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8082 ttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 178
Target Start/End: Original strand, 29238 - 29354
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||   || ||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||     
T  29238 atgttatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgagttgctgat---ttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatacta 29334  T
Q  159 cctatgttgctgtttgttat 178  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29335 cctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 86 - 225
Target Start/End: Original strand, 15759 - 15898
Alignment:
Q  86 tgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaacta 185  Q
    ||||||||||||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15759 tgaattatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacta 15858  T
Q  186 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15859 agctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 15729 - 15764
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 36  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15729 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12792 - 12587
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | | |     
T  12792 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataag 12694  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  12693 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcg 12594  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  12593 gtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 2701 - 2923
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatata----cattacatgaattatgt 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||    ||||  |||||||| |     
T  2701 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--attgtatatatatacattttatgaattaagc 2798  T
Q  96 ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 195  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2799 t-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatga 2897  T
Q  196 gtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||    
T  2898 gtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1190
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 107; Significance: 9e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 53445 - 53651
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||     
T  53445 tttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaa 53544  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  53545 tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatca 53644  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  53645 gtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Original strand, 8248 - 8330
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 139  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  8248 taatgttatataattaaatatatattgtatgaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 8330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 2115 - 2281
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  2115 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgct-ga 2213  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 167  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2214 tatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Original strand, 6188 - 6386
Alignment:
Q  10 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  6188 ctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagat 6287  T
Q  110 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6288 gttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 206
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  159 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 128867 - 129072
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  128867 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatg 128966  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  128967 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 129065  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  129066 gtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 78545 - 78345
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    |||     
T  78545 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat- 78447  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  78446 gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 78348  T
Q  200 gtc 202  Q
    |||    
T  78347 gtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 116551 - 116430
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| ||||| || |||| ||||||  | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  116551 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 116454  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  116453 ggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 136264 - 136471
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  136264 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacga 136363  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  136364 t-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagt 136462  T
Q  198 cggtctaag 206  Q
    |||||||||    
T  136463 cggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 144972 - 145179
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatct-aatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  144972 tttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacga 145071  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |   || ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  145072 t-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagt 145170  T
Q  198 cggtctaag 206  Q
    |||||||||    
T  145171 cggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174767
Alignment:
Q  153 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 222
Target Start/End: Original strand, 38644 - 38820
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  || ||| |||||||||||||  || ||| |||||||| | | | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  38644 atgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgtt 38743  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38744 gttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34288 - 34123
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||    
T  34288 taatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatac 34192  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  34191 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13218 - 13141
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgt 175  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13218 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Original strand, 3105 - 3271
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  3105 atgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatact 3204  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38541 - 38339
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||| | ||||     
T  38541 ttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatg 38442  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  38441 tttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcg 38342  T
Q  200 gtc 202  Q
    |||    
T  38341 gtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 225
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24001
Alignment:
Q  119 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatg 23994  T
Q  219 atgatgt 225  Q
    |||||||    
T  23995 atgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 103535 - 103737
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |       
T  103535 tttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgtat--- 103631  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
          ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||    
T  103632 ------gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtc 103725  T
Q  199 ggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||    
T  103726 ggtctaagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25121
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcat 154  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || |||  ||    
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttatat 25177  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176 actgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 619
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga 144  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatga 619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 97227 - 97024
Alignment:
Q  5 tctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatattt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  97227 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 97128  T
Q  105 gagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 202  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  97127 gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 97028  T
Q  203 taag 206  Q
    ||||    
T  97027 taag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 106505 - 106302
Alignment:
Q  5 tctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatattt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  106505 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgttt 106406  T
Q  105 gagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 202  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||   |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  106405 gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtc 106306  T
Q  203 taag 206  Q
    ||||    
T  106305 taag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1051
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1059  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  1058 ggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11464
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18148
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | | |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 2132 - 2291
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| ||| || |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||      
T  2132 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt- 2230  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2231 tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38377
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||| | |||| | | ||||||| ||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 21846 - 21937
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  21846 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgtagatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 21937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24699
Alignment:
Q  57 taatgttatataattg--tatatacattacatgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 24699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 206
Target Start/End: Original strand, 19782 - 19987
Alignment:
Q  2 ttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||| ||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| | ||||     
T  19782 ttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgatg 19881  T
Q  102 tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 199  Q
     | ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19882 ct-gagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcg 19980  T
Q  200 gtctaag 206  Q
    |||||||    
T  19981 gtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40038 - 39913
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||  |||| |||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||     
T  40038 atatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtt 39940  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39939 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49030
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 49030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 16052 - 16206
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 155  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |  || | |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  16052 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcata 16151  T
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16152 ctacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 13298 - 13147
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgata--tttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcat 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  13298 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcat 13199  T
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13198 actgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 210
Target Start/End: Original strand, 27701 - 27855
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcata 155  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| | ||| | |||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27701 taatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcata 27800  T
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 210  Q
    || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801 ctacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 73 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32249 - 32102
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgt 171  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||    
T  32249 tatatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgt 32152  T
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  32151 ttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39623 - 39479
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 177  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  39623 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 39525  T
Q  178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39524 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 13872 - 13963
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13872 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgaagtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 223
Target Start/End: Original strand, 75189 - 75333
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgtta 177  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  75189 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtta 75287  T
Q  178 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  75288 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Original strand, 44702 - 44825
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44702 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 44800  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  44801 cagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 218
Target Start/End: Original strand, 26039 - 26179
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| |||||| |||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  26039 cattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 26137  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26138 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 228 - 54
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatat 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||  || || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| |    
T  228 tatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgt 129  T
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgt 175  Q
    ||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||  || |||   ||||||||||||||||||||||    
T  128 ttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgt 54  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3306
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  3160 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 3258  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3259 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7955 - 8161
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga- 99  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||| || ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||     
T  7955 tttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaa 8054  T
Q  100 tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  8055 tgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgt 8154  T
Q  198 cggtcta 204  Q
    |||||||    
T  8155 cggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 224
Target Start/End: Original strand, 17189 - 17337
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt---gcatactgcctatgttgctgtttg 174  Q
    |||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   | |||||||||||||||||||| |    
T  17189 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-g 17287  T
Q  175 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17288 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 79288 - 79430
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcct 161  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||| || |||   |||||| |     
T  79288 atatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg 79387  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79388 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26021 - 25896
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  26021 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtc 25923  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  25922 ggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39983 - 39858
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||| |||||||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||     
T  39983 atatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtt 39885  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  39884 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 774 - 569
Alignment:
Q  1 tttatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgat 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || || |   |||| | |||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  774 tttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgtatatgcattacatgaattatatatgat 675  T
Q  101 atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
     || | ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  674 gttgg-gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 577  T
Q  199 ggtctaag 206  Q
    ||||||||    
T  576 ggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 20905 - 20747
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  20905 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 20807  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20806 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13378 - 13211
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatac 156  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| ||||  || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||    
T  13378 atgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 13279  T
Q  157 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13278 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37979 - 37821
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  37979 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 37881  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37880 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 158454 - 158612
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  158454 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 158552  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158553 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 339904 - 340065
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  |||| ||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||| || |||| |||||    
T  339904 atgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatact 340002  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1977 - 1851
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1977 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 1879  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  1878 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 207473 - 207541
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  207473 taatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 207541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 267872 - 267679
Alignment:
Q  14 tgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttg 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||| ||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||| || ||||| |||    
T  267872 tgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtt-gagatattg 267774  T
Q  114 atgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267773 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33067 - 32942
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  33067 atatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtc 32969  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32968 ggtctaacttgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38886 - 38761
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||    
T  38886 atatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactc 38788  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38787 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9908 - 9744
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatat--ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| ||  |||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||      
T  9908 atataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt- 9810  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgtcc 227  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9809 tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 32952 - 33077
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32952 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 33050  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33051 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46053 - 45928
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46053 atatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtc 45955  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45954 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 103 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 16113
Alignment:
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 201  Q
    |||||||| || || |||||||| |||||| | ||||| || || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 16137  T
Q  202 ctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  16136 ctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10931 - 10772
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| |    
T  10931 atataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-t 10833  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10832 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13547 - 13392
Alignment:
Q  67 taattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatg 164  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | ||    
T  13547 taattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtg 13449  T
Q  165 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13448 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4852 - 4694
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  4852 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-t 4754  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4753 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4849
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtcta 4870  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||| | |||||||||||||    
T  4869 agttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14105 - 13947
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  14105 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 14007  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14006 gtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 16942 - 16784
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | | | || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  16942 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-t 16844  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16843 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1289
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1309  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  1308 gatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7383 - 7266
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttg--ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7286  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  7285 gatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 222
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3470
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  3596 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagt 3498  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3497 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 468 - 343
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||  ||||| |  |||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  468 atatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 370  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  369 ggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 52039 - 51913
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52039 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 51941  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  51940 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 167952 - 168099
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  167952 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 168050  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  168051 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 206
Target Start/End: Original strand, 1696 - 1900
Alignment:
Q  3 tatctttctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatat 102  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| | ||||      
T  1696 tatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgat-g 1794  T
Q  103 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |  |||  ||||| ||||||||  |||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactacctatgttaatgttagtttaataactaagctgcatgagtcgg 1894  T
Q  201 tctaag 206  Q
    ||||||    
T  1895 tctaag 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 8528 - 8650
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 198  Q
    |||||| ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || |||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||    
T  8528 atatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtc 8623  T
Q  199 ggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8624 ggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1169
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| |||    
T  1022 cattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt-gtt 1120  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1121 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 23008 - 22886
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 197  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23008 atatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 22911  T
Q  198 cggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22910 cggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 51699 - 51582
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| | |||  |||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51699 agatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51602  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | || ||||||||||    
T  51601 gatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 15466 - 15584
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15466 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 15564  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  15565 gttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32184 - 32067
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 32087  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| | |||||||||||||    
T  32086 gttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 206
Target Start/End: Original strand, 20383 - 20524
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgccta 162  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||| ||||||  |     
T  20383 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tg 20481  T
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20482 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 157  Q
    |||| |||||||  ||| |||||||| |||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |  |    
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttttttt 128818  T
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
       | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  128817 ttttttgttgct-tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 35871 - 35962
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  35871 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 35962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 225
Target Start/End: Original strand, 6116 - 6245
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatga 195  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| | || ||||| || ||| | ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6116 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 6215  T
Q  196 gtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6216 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16397 - 16282
Alignment:
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 207  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16397 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 16300  T
Q  208 tgattaagatgatgatgt 225  Q
    || | |||||||||||||    
T  16299 tgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9400 - 9241
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgc-atactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||   ||||||  |    
T  9400 atataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-t 9302  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 223  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9301 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28887
Alignment:
Q  141 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Original strand, 161093 - 161252
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | |||||||     
T  161093 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc- 161191  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  161192 tgtgtcgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 142
Target Start/End: Original strand, 164594 - 164674
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttga-tgacttgcattcgatattgttatatcat 142  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  164594 atataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2099 - 1952
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| | |||||  |||| ||||| |||||| | ||||||||||||| |||||| |||    
T  2099 cattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gtt 2001  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2000 aattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 10472 - 10544
Alignment:
Q  153 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10472 atactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Original strand, 16574 - 16721
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||| |||||||| || |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||    
T  16574 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gtt 16672  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16673 atttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 40558 - 40400
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| | | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||  || ||| | ||||||  |    
T  40558 atataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-t 40460  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40459 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9268 - 9133
Alignment:
Q  33 aattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtt--tgatatttgagatgttgatgacttgcattcgata 130  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||    || |||||||| ||||||||||||    
T  9268 aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgatat----gaagttgatgaattgcattcgata 9173  T
Q  131 ttgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctg 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9172 ttgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13615 - 13497
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| | | | | |||||| | || ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| | ||| |||||||||    
T  13516 gttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 207
Target Start/End: Original strand, 24297 - 24406
Alignment:
Q  99 atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga--tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 196  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||| ||   |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24297 atatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgag 24395  T
Q  197 tcggtctaagt 207  Q
    |||||||||||    
T  24396 tcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12216 - 12064
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  12216 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-t 12118  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12117 gtgttgctgttt-------aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 11446 - 11286
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| || | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  11446 atataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 11348  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  11347 gtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 4373 - 4214
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgat-gacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcc 160  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||||     
T  4373 atataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc- 4275  T
Q  161 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
    | ||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4274 tgtgtcgctgtc-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4455 - 4300
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgat-atttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | |||| | |||||| |||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| | |    
T  4455 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-t 4357  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4356 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 222
Target Start/End: Original strand, 5132 - 5246
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5132 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 5229  T
Q  206 gttgattaagatgatga 222  Q
    | || | ||||||||||    
T  5230 gatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4712
Alignment:
Q  148 tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 264 - 106
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | |||||   |    
T  264 atataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-t 166  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  165 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 8598 - 8479
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||| |||| ||||  || ||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8598 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtcta 8500  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  8499 agttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 1053 - 1170
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 205  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1150  T
Q  206 gttgattaagatgatgatgt 225  Q
    | || | |||||||||||||    
T  1151 gatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4654 - 4508
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||    
T  4654 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgtt 4556  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  4555 atttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12236 - 12090
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||    
T  12236 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgtt 12138  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12137 atttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 79 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22188 - 22042
Alignment:
Q  79 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 176  Q
    |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||  |||  ||||||| | |||||||| |||||    
T  22188 cattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgtt 22090  T
Q  177 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22089 atttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12413
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||  | ||| || |||||| |||| ||||||||||| |||||| || | ||||| || ||| | || |||| |    
T  12253 atataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-t 12351  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatg 224  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12352 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46995
Alignment:
Q  155 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 156
Target Start/End: Original strand, 2398 - 2494
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2398 taatgttatataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 225
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  158 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2783 - 2694
Alignment:
Q  119 ttgcattcgatattgttatatcatga--tgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  || |||  |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2783 ttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  47 atgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat 145  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | |    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgct 225487  T
Q  146 gatttgcatactgcctatgttg 167  Q
    | ||||||||||| ||||||||    
T  225486 gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 189162 - 189253
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  189162 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 189253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20910
Alignment:
Q  106 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  205 agttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||| | | |||||| ||||||    
T  20930 agtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 219
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 219  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatat 139  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 225
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  108 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||| ||| | | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  207 ttgattaagatgatgatgt 225  Q
    ||| | ||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13730 - 13638
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaa-ttatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||| ||| |||||  || |||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  13730 taatgttatatagttggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 13638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 30090 - 29931
Alignment:
Q  64 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 161  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||  |    
T  30090 atataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-t 29992  T
Q  162 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatga 222  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29991 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatga 29931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 718 - 627
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  718 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11377
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  11286 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 11377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 149
Target Start/End: Original strand, 32445 - 32536
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  32445 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttaatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 32536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 12762 - 12830
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  12762 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 125
Target Start/End: Original strand, 9788 - 9856
Alignment:
Q  57 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcatt 125  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  9788 taatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgatgacgtgcatt 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  163 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 206  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4599 - 4545
Alignment:
Q  149 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4599 ttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 27997 - 27912
Alignment:
Q  59 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatg 143  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27997 atgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 339 - 289
Alignment:
Q  171 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  339 tttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 204
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  154 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 204  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctatt-gttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 208 - 159
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  208 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 221
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  156 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 21871 - 21920
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21871 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Original strand, 29763 - 29812
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29763 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 172 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 69843 - 69794
Alignment:
Q  172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 221  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69843 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 10007 - 9932
Alignment:
Q  73 tatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 149  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||| |||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  10007 tatatatattgcatgaattatgtttgatgagtgagatgttggtgacgtgcatttgtaattgttatat-atgatgatt 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 985 times since January 2019
Visitors: 1519