View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0180_low_5 (Length: 276)

Name: NF0180_low_5
Description: NF0180
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0180_low_5
NF0180_low_5
[»] chr5 (69 HSPs)
chr5 (3-256)||(9077952-9078205)
chr5 (1-253)||(24529223-24529475)
chr5 (1-256)||(25421532-25421787)
chr5 (2-256)||(1096467-1096721)
chr5 (1-256)||(24493569-24493823)
chr5 (1-256)||(25431395-25431649)
chr5 (1-256)||(23390362-23390617)
chr5 (1-256)||(8286708-8286964)
chr5 (1-256)||(13025311-13025565)
chr5 (1-256)||(13095495-13095749)
chr5 (7-256)||(22075018-22075268)
chr5 (41-253)||(22412187-22412388)
chr5 (1-256)||(21292836-21293090)
chr5 (89-256)||(21808343-21808510)
chr5 (1-152)||(21986013-21986164)
chr5 (148-256)||(21997547-21997655)
chr5 (90-253)||(264768-264930)
chr5 (89-256)||(21729018-21729185)
chr5 (90-253)||(29329934-29330096)
chr5 (90-253)||(29345980-29346142)
chr5 (90-253)||(39363384-39363546)
chr5 (91-253)||(10732941-10733102)
chr5 (90-253)||(20909012-20909174)
chr5 (90-253)||(29348453-29348615)
chr5 (90-253)||(29350926-29351088)
chr5 (90-253)||(42245365-42245527)
chr5 (41-253)||(11581151-11581361)
chr5 (90-253)||(32027393-32027555)
chr5 (90-253)||(36154783-36154942)
chr5 (90-253)||(39245136-39245298)
chr5 (130-253)||(20902049-20902172)
chr5 (130-253)||(2154654-2154776)
chr5 (90-250)||(18319033-18319193)
chr5 (5-118)||(22107243-22107356)
chr5 (90-253)||(10775675-10775838)
chr5 (90-253)||(31061068-31061231)
chr5 (130-253)||(38619434-38619557)
chr5 (74-252)||(21565546-21565723)
chr5 (49-249)||(37723910-37724108)
chr5 (41-242)||(18418594-18418793)
chr5 (130-252)||(23064512-23064634)
chr5 (35-237)||(22144068-22144271)
chr5 (90-253)||(20917952-20918110)
chr5 (138-256)||(21329500-21329618)
chr5 (41-190)||(20766035-20766174)
chr5 (90-250)||(24067110-24067270)
chr5 (141-252)||(22959538-22959649)
chr5 (138-237)||(20026942-20027043)
chr5 (185-256)||(19660884-19660956)
chr5 (158-256)||(36314577-36314675)
chr5 (41-256)||(40725853-40726069)
chr5 (137-256)||(21502158-21502277)
chr5 (134-256)||(26012034-26012154)
chr5 (108-254)||(17517174-17517320)
chr5 (141-256)||(19668898-19669013)
chr5 (81-207)||(18356364-18356488)
chr5 (49-252)||(21873254-21873453)
chr5 (134-207)||(29448052-29448126)
chr5 (188-252)||(26704075-26704139)
chr5 (188-252)||(26973808-26973872)
chr5 (137-207)||(20910801-20910869)
chr5 (134-237)||(22178218-22178323)
chr5 (199-253)||(20806850-20806904)
chr5 (187-240)||(26732884-26732937)
chr5 (188-252)||(22032323-22032387)
chr5 (187-237)||(26740697-26740747)
chr5 (167-252)||(23201360-23201445)
chr5 (183-252)||(23501403-23501472)
chr5 (188-252)||(18770054-18770118)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (1-255)||(28648910-28649164)
chr8 (1-259)||(6759255-6759511)
chr8 (1-256)||(16092207-16092463)
chr8 (1-256)||(22875065-22875320)
chr8 (1-256)||(22626736-22626990)
chr8 (1-256)||(18818275-18818530)
chr8 (1-256)||(21923794-21924049)
chr8 (3-256)||(20536208-20536461)
chr8 (1-256)||(7372778-7373025)
chr8 (1-256)||(23406379-23406636)
chr8 (1-256)||(18879103-18879352)
chr8 (1-256)||(21918866-21919121)
chr8 (1-255)||(23648554-23648808)
chr8 (5-256)||(31971257-31971506)
chr8 (1-256)||(45130864-45131117)
chr8 (1-256)||(16199512-16199765)
chr8 (90-253)||(14409444-14409606)
chr8 (90-253)||(1484402-1484564)
chr8 (90-253)||(5853292-5853454)
chr8 (90-249)||(16413316-16413474)
chr8 (90-253)||(20403227-20403389)
chr8 (90-253)||(22001753-22001915)
chr8 (41-253)||(41598188-41598399)
chr8 (90-253)||(15203231-15203393)
chr8 (90-253)||(20046195-20046357)
chr8 (90-253)||(4483281-4483442)
chr8 (1-119)||(25363006-25363124)
chr8 (41-253)||(26219717-26219918)
chr8 (35-256)||(21389353-21389571)
chr8 (90-253)||(4542373-4542535)
chr8 (40-256)||(21395888-21396101)
chr8 (40-256)||(21790381-21790594)
chr8 (90-253)||(19896265-19896430)
chr8 (110-253)||(26225268-26225409)
chr8 (53-256)||(21778697-21778897)
chr8 (130-255)||(26223917-26224041)
chr8 (134-256)||(38855250-38855372)
chr8 (138-256)||(6520368-6520486)
chr8 (90-253)||(14823774-14823935)
chr8 (41-237)||(19801333-19801527)
chr8 (131-259)||(19937046-19937174)
chr8 (74-249)||(13508024-13508199)
chr8 (130-240)||(15070571-15070681)
chr8 (90-253)||(25484275-25484430)
chr8 (141-256)||(5866280-5866395)
chr8 (74-249)||(13597556-13597731)
chr8 (153-256)||(17140916-17141019)
chr8 (141-256)||(21490995-21491110)
chr8 (130-249)||(45290734-45290853)
chr8 (134-252)||(21285601-21285719)
chr8 (41-256)||(17612018-17612231)
chr8 (108-254)||(18678075-18678221)
chr8 (108-254)||(32121734-32121880)
chr8 (134-252)||(23760843-23760961)
chr8 (135-252)||(26355699-26355815)
chr8 (138-241)||(983407-983512)
chr8 (74-237)||(20498581-20498744)
chr8 (134-244)||(21673716-21673826)
chr8 (141-256)||(21249384-21249500)
chr8 (141-256)||(21255222-21255338)
chr8 (72-252)||(23776772-23776952)
chr8 (134-237)||(37116366-37116471)
chr8 (40-252)||(17353843-17354060)
chr8 (134-230)||(17439504-17439602)
chr8 (41-92)||(26222987-26223039)
chr8 (134-237)||(17266991-17267096)
chr8 (134-237)||(24353039-24353143)
chr8 (134-175)||(40492850-40492891)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-255)||(50210079-50210333)
chr1 (3-253)||(34509783-34510033)
chr1 (1-256)||(22532269-22532524)
chr1 (1-256)||(27250595-27250850)
chr1 (7-256)||(21026680-21026929)
chr1 (1-255)||(20135188-20135442)
chr1 (14-255)||(22468576-22468816)
chr1 (4-179)||(22354441-22354616)
chr1 (41-253)||(433012-433222)
chr1 (74-253)||(23593719-23593897)
chr1 (90-254)||(21840766-21840929)
chr1 (90-253)||(13988866-13989028)
chr1 (90-253)||(21923291-21923453)
chr1 (90-256)||(45574842-45575008)
chr1 (90-253)||(21475087-21475249)
chr1 (90-253)||(29776688-29776850)
chr1 (90-253)||(31612313-31612475)
chr1 (1-118)||(22356040-22356158)
chr1 (1-118)||(22357726-22357844)
chr1 (74-255)||(16361915-16362095)
chr1 (90-253)||(29298137-29298298)
chr1 (2-256)||(38801258-38801508)
chr1 (50-256)||(13212821-13213027)
chr1 (90-253)||(16275363-16275526)
chr1 (53-253)||(21346961-21347161)
chr1 (53-259)||(21342090-21342296)
chr1 (90-253)||(21707167-21707329)
chr1 (90-253)||(21711709-21711871)
chr1 (40-119)||(48603651-48603730)
chr1 (145-259)||(15860064-15860177)
chr1 (154-256)||(20847173-20847275)
chr1 (130-249)||(21754052-21754170)
chr1 (90-253)||(22123067-22123230)
chr1 (74-252)||(33681011-33681188)
chr1 (134-252)||(22921868-22921986)
chr1 (74-237)||(21896195-21896358)
chr1 (75-237)||(21861510-21861672)
chr1 (1-241)||(16758664-16758906)
chr1 (90-250)||(40389157-40389317)
chr1 (141-256)||(14295557-14295672)
chr1 (72-252)||(21787979-21788159)
chr1 (109-252)||(22237631-22237773)
chr1 (188-255)||(20454606-20454673)
chr1 (47-237)||(35260992-35261180)
chr1 (74-240)||(20918620-20918782)
chr1 (141-252)||(20248283-20248394)
chr1 (49-252)||(21714546-21714754)
chr1 (134-237)||(50614114-50614219)
chr1 (134-237)||(50621942-50622047)
chr1 (134-237)||(41050033-41050138)
chr1 (74-207)||(22130850-22130978)
chr1 (81-207)||(33797570-33797694)
chr1 (158-241)||(52927993-52928076)
chr1 (134-237)||(16368284-16368388)
chr1 (188-252)||(42865266-42865330)
chr1 (7-76)||(20847091-20847161)
chr1 (195-252)||(21161720-21161778)
chr1 (41-118)||(21477654-21477732)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-256)||(3017-3271)
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (1-256)||(25629221-25629476)
chr6 (5-256)||(29060540-29060791)
chr6 (3-256)||(20593773-20594026)
chr6 (1-255)||(18409693-18409947)
chr6 (1-256)||(19303407-19303661)
chr6 (4-256)||(20360829-20361081)
chr6 (1-256)||(17287662-17287917)
chr6 (1-256)||(20638149-20638404)
chr6 (1-256)||(22780093-22780348)
chr6 (90-253)||(22782227-22782389)
chr6 (89-256)||(20076700-20076863)
chr6 (90-253)||(2291180-2291342)
chr6 (90-253)||(12742317-12742479)
chr6 (89-256)||(16496244-16496411)
chr6 (90-253)||(18334592-18334754)
chr6 (90-253)||(19005046-19005208)
chr6 (90-253)||(19858919-19859081)
chr6 (90-253)||(24422547-24422709)
chr6 (90-253)||(33861794-33861956)
chr6 (90-253)||(33864278-33864440)
chr6 (90-255)||(30676710-30676874)
chr6 (90-253)||(1540911-1541073)
chr6 (90-253)||(8055029-8055191)
chr6 (90-253)||(25754809-25754971)
chr6 (90-253)||(26924640-26924802)
chr6 (90-255)||(34963371-34963535)
chr6 (90-253)||(1595549-1595711)
chr6 (90-253)||(25656629-25656791)
chr6 (130-253)||(25688502-25688624)
chr6 (1-256)||(16920499-16920751)
chr6 (41-237)||(18456735-18456930)
chr6 (90-253)||(20556894-20557054)
chr6 (35-241)||(25644335-25644543)
chr6 (90-253)||(3852017-3852179)
chr6 (90-250)||(16448526-16448686)
chr6 (1-256)||(22831503-22831757)
chr6 (14-229)||(15041430-15041644)
chr6 (103-237)||(18461895-18462028)
chr6 (1-218)||(25603251-25603467)
chr6 (74-256)||(20109140-20109322)
chr6 (81-256)||(35245586-35245758)
chr6 (1-256)||(8227376-8227632)
chr6 (1-218)||(25611589-25611805)
chr6 (141-256)||(28496477-28496592)
chr6 (141-256)||(29808888-29809003)
chr6 (72-237)||(18821782-18821946)
chr6 (134-252)||(19652199-19652316)
chr6 (158-256)||(27333241-27333339)
chr6 (158-256)||(27393981-27394079)
chr6 (134-256)||(23019408-23019528)
chr6 (5-74)||(5834367-5834436)
chr6 (5-74)||(20177096-20177165)
chr6 (5-74)||(22158826-22158895)
chr6 (195-256)||(25714417-25714478)
chr6 (141-256)||(1561303-1561418)
chr6 (141-241)||(9098518-9098620)
chr6 (138-241)||(19668386-19668491)
chr6 (14-237)||(11185524-11185744)
chr6 (137-254)||(19847997-19848114)
chr6 (141-244)||(4185827-4185930)
chr6 (108-254)||(23992429-23992572)
chr6 (137-207)||(27415943-27416011)
chr6 (184-235)||(33443068-33443119)
chr6 (14-94)||(31164727-31164807)
chr6 (209-256)||(22080799-22080846)
chr6 (188-229)||(21766718-21766759)
chr6 (203-252)||(31155465-31155514)
chr6 (14-86)||(16924759-16924830)
chr6 (188-252)||(19873120-19873184)
chr6 (72-147)||(25642120-25642196)
[»] chr3 (90 HSPs)
chr3 (1-256)||(14972854-14973109)
chr3 (3-256)||(18438534-18438787)
chr3 (1-253)||(40213587-40213838)
chr3 (1-256)||(25476251-25476506)
chr3 (1-256)||(26686887-26687142)
chr3 (1-256)||(17487856-17488111)
chr3 (1-256)||(23083227-23083482)
chr3 (1-256)||(11424629-11424880)
chr3 (1-256)||(13442274-13442529)
chr3 (1-252)||(14576699-14576949)
chr3 (1-256)||(17499338-17499593)
chr3 (1-238)||(42386428-42386666)
chr3 (11-256)||(43840932-43841177)
chr3 (1-256)||(20698302-20698556)
chr3 (9-256)||(12399209-12399456)
chr3 (1-243)||(14572602-14572843)
chr3 (41-253)||(24153115-24153326)
chr3 (74-253)||(29172567-29172745)
chr3 (90-254)||(13544024-13544187)
chr3 (90-253)||(9707607-9707769)
chr3 (90-253)||(10247723-10247885)
chr3 (90-249)||(12567564-12567722)
chr3 (90-253)||(17463178-17463340)
chr3 (90-253)||(34159326-34159488)
chr3 (110-253)||(36166598-36166739)
chr3 (90-253)||(45606907-45607069)
chr3 (90-253)||(55476491-55476653)
chr3 (90-253)||(7781347-7781509)
chr3 (90-253)||(8899094-8899256)
chr3 (90-253)||(16454281-16454443)
chr3 (90-253)||(17672626-17672788)
chr3 (90-253)||(28848611-28848773)
chr3 (90-253)||(38961891-38962053)
chr3 (90-253)||(13151790-13151953)
chr3 (90-253)||(13154255-13154418)
chr3 (90-253)||(6469134-6469296)
chr3 (90-253)||(17446655-17446816)
chr3 (90-253)||(50242822-50242984)
chr3 (41-242)||(21618460-21618650)
chr3 (90-256)||(43550478-43550644)
chr3 (90-251)||(16282811-16282971)
chr3 (130-253)||(15977515-15977637)
chr3 (90-237)||(53070653-53070799)
chr3 (139-253)||(55500942-55501055)
chr3 (1-241)||(30029855-30030094)
chr3 (90-251)||(41123892-41124049)
chr3 (50-253)||(12119684-12119887)
chr3 (41-256)||(24340628-24340844)
chr3 (130-253)||(15412429-15412552)
chr3 (1-119)||(16796684-16796802)
chr3 (145-253)||(8499518-8499625)
chr3 (40-119)||(14179569-14179648)
chr3 (74-252)||(16103784-16103960)
chr3 (141-256)||(13210333-13210448)
chr3 (130-249)||(32307684-32307802)
chr3 (153-253)||(44494809-44494908)
chr3 (134-252)||(15470928-15471046)
chr3 (74-252)||(16097332-16097509)
chr3 (41-237)||(52523633-52523831)
chr3 (134-253)||(10556985-10557104)
chr3 (74-253)||(27165250-27165429)
chr3 (146-253)||(53301562-53301669)
chr3 (138-256)||(14234487-14234605)
chr3 (77-252)||(12174205-12174376)
chr3 (41-256)||(37642170-37642386)
chr3 (41-238)||(23274705-23274903)
chr3 (108-254)||(46822267-46822413)
chr3 (130-252)||(49668071-49668193)
chr3 (108-254)||(12511059-12511205)
chr3 (154-253)||(17737236-17737337)
chr3 (150-252)||(9512924-9513026)
chr3 (150-252)||(9520899-9521001)
chr3 (134-237)||(37251165-37251270)
chr3 (134-237)||(43925977-43926082)
chr3 (192-253)||(28194693-28194755)
chr3 (74-175)||(2051138-2051239)
chr3 (200-253)||(45577947-45578000)
chr3 (130-249)||(1644670-1644787)
chr3 (140-237)||(12377940-12378039)
chr3 (134-237)||(22110349-22110454)
chr3 (41-256)||(22147431-22147646)
chr3 (188-252)||(856140-856204)
chr3 (188-252)||(23077530-23077594)
chr3 (193-255)||(14665398-14665460)
chr3 (41-92)||(36166747-36166799)
chr3 (193-255)||(14668554-14668616)
chr3 (186-235)||(13919350-13919399)
chr3 (188-252)||(14878569-14878633)
chr3 (188-252)||(15878104-15878168)
chr3 (188-252)||(17525211-17525275)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (1-253)||(16377389-16377639)
chr4 (1-251)||(14038653-14038903)
chr4 (1-256)||(16239836-16240090)
chr4 (1-256)||(44052829-44053084)
chr4 (1-256)||(12902757-12903012)
chr4 (1-256)||(7893703-7893955)
chr4 (4-254)||(22636437-22636686)
chr4 (1-256)||(7088877-7089132)
chr4 (39-256)||(16270140-16270356)
chr4 (7-249)||(23374231-23374473)
chr4 (72-256)||(7798774-7798958)
chr4 (41-253)||(54798669-54798872)
chr4 (41-253)||(14280316-14280518)
chr4 (41-253)||(44928829-44929042)
chr4 (84-256)||(6899891-6900062)
chr4 (90-255)||(19618172-19618336)
chr4 (90-253)||(18215274-18215436)
chr4 (137-256)||(52873369-52873488)
chr4 (90-253)||(12307-12469)
chr4 (74-253)||(1837494-1837671)
chr4 (90-253)||(15118352-15118514)
chr4 (90-253)||(44773087-44773249)
chr4 (90-253)||(52312510-52312672)
chr4 (1-256)||(14053168-14053422)
chr4 (90-259)||(19242693-19242861)
chr4 (90-253)||(3515007-3515169)
chr4 (16-256)||(17046487-17046724)
chr4 (90-253)||(44615288-44615450)
chr4 (90-253)||(50222339-50222501)
chr4 (90-253)||(18239419-18239581)
chr4 (90-253)||(23803265-23803427)
chr4 (90-253)||(51463868-51464030)
chr4 (41-253)||(44102214-44102425)
chr4 (90-249)||(15355324-15355483)
chr4 (110-253)||(8574844-8574985)
chr4 (1-119)||(17047938-17048056)
chr4 (90-255)||(14970707-14970871)
chr4 (90-253)||(12610950-12611105)
chr4 (41-256)||(15367690-15367905)
chr4 (41-256)||(15402703-15402918)
chr4 (41-241)||(52243099-52243302)
chr4 (170-256)||(3096293-3096379)
chr4 (90-253)||(7641192-7641344)
chr4 (41-256)||(15371202-15371417)
chr4 (41-256)||(15373483-15373698)
chr4 (74-237)||(13790-13953)
chr4 (130-252)||(12774011-12774132)
chr4 (130-256)||(15370018-15370144)
chr4 (1-118)||(3096782-3096898)
chr4 (1-256)||(16223532-16223787)
chr4 (92-237)||(21815587-21815731)
chr4 (146-256)||(39706299-39706409)
chr4 (141-256)||(15551817-15551932)
chr4 (74-241)||(43198492-43198661)
chr4 (1-59)||(15091093-15091151)
chr4 (90-254)||(22353835-22353999)
chr4 (1-237)||(6190481-6190717)
chr4 (138-241)||(12288211-12288316)
chr4 (152-252)||(8846360-8846460)
chr4 (90-250)||(20149832-20149992)
chr4 (81-207)||(43256106-43256230)
chr4 (134-237)||(46640453-46640558)
chr4 (41-92)||(8574784-8574836)
chr4 (72-252)||(15093775-15093955)
chr4 (1-174)||(15464796-15464970)
chr4 (153-218)||(16596686-16596751)
[»] chr7 (76 HSPs)
chr7 (1-253)||(3564230-3564482)
chr7 (2-256)||(12698831-12699086)
chr7 (1-256)||(9509189-9509444)
chr7 (1-256)||(38227481-38227735)
chr7 (41-253)||(18456319-18456530)
chr7 (7-256)||(26211995-26212245)
chr7 (1-256)||(10589039-10589293)
chr7 (1-241)||(15143903-15144143)
chr7 (1-256)||(16386113-16386369)
chr7 (41-253)||(48273392-48273594)
chr7 (90-256)||(13647325-13647491)
chr7 (90-256)||(18430709-18430874)
chr7 (5-254)||(40443393-40443640)
chr7 (90-253)||(456321-456483)
chr7 (90-253)||(11972496-11972658)
chr7 (90-253)||(14949122-14949284)
chr7 (90-253)||(15376713-15376875)
chr7 (74-253)||(16213684-16213861)
chr7 (90-253)||(16232520-16232682)
chr7 (90-253)||(18640272-18640434)
chr7 (90-253)||(20385123-20385285)
chr7 (90-253)||(21189595-21189757)
chr7 (90-253)||(24702238-24702400)
chr7 (90-253)||(32125491-32125653)
chr7 (90-253)||(41522917-41523079)
chr7 (90-253)||(41525379-41525541)
chr7 (90-252)||(11393287-11393448)
chr7 (90-253)||(27216860-27217022)
chr7 (90-253)||(44116509-44116671)
chr7 (1-256)||(2279984-2280238)
chr7 (103-249)||(24275175-24275320)
chr7 (1-256)||(27847699-27847951)
chr7 (92-253)||(16410059-16410219)
chr7 (90-253)||(3386333-3386495)
chr7 (90-253)||(24704688-24704847)
chr7 (41-253)||(17061866-17062077)
chr7 (133-256)||(67745-67868)
chr7 (130-253)||(13869346-13869469)
chr7 (130-253)||(13831373-13831495)
chr7 (90-249)||(38898376-38898535)
chr7 (73-253)||(20110556-20110724)
chr7 (141-256)||(34200786-34200901)
chr7 (134-252)||(18005650-18005768)
chr7 (134-256)||(22072913-22073036)
chr7 (158-256)||(28505321-28505419)
chr7 (41-217)||(12756622-12756797)
chr7 (141-256)||(16495402-16495517)
chr7 (146-252)||(811142-811248)
chr7 (138-256)||(47831807-47831925)
chr7 (143-252)||(44014182-44014291)
chr7 (41-256)||(19486649-19486865)
chr7 (137-252)||(16219719-16219834)
chr7 (90-190)||(26355983-26356083)
chr7 (90-190)||(26358435-26358535)
chr7 (141-256)||(11996033-11996148)
chr7 (141-256)||(15754893-15755008)
chr7 (35-241)||(1867895-1868101)
chr7 (134-241)||(16056343-16056449)
chr7 (80-229)||(15211484-15211633)
chr7 (35-230)||(15008398-15008594)
chr7 (134-256)||(10063817-10063939)
chr7 (74-229)||(12255730-12255887)
chr7 (87-252)||(14932685-14932851)
chr7 (87-252)||(15356120-15356286)
chr7 (87-252)||(15360234-15360400)
chr7 (188-250)||(18154894-18154956)
chr7 (137-207)||(2530140-2530208)
chr7 (73-168)||(15113031-15113125)
chr7 (143-237)||(20220194-20220290)
chr7 (150-241)||(12901338-12901431)
chr7 (188-252)||(12187019-12187083)
chr7 (188-252)||(17138113-17138177)
chr7 (186-237)||(18203831-18203882)
chr7 (193-255)||(2832499-2832561)
chr7 (186-241)||(14044761-14044817)
chr7 (186-241)||(14354791-14354847)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-256)||(16466-16721)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (1-256)||(4508-4762)
scaffold0228 (1-256)||(12090-12344)
scaffold0228 (1-256)||(22042-22296)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (3-254)||(39479-39729)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (3-254)||(75083-75333)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-255)||(17081-17337)
scaffold0056 (41-237)||(79235-79430)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (5-249)||(25935-26179)
scaffold0122 (110-253)||(44682-44825)
scaffold0122 (1-131)||(33361-33491)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (1-256)||(22337115-22337370)
chr2 (1-256)||(23660023-23660277)
chr2 (4-256)||(23060513-23060764)
chr2 (1-256)||(23076442-23076697)
chr2 (4-256)||(22731102-22731355)
chr2 (1-256)||(23285865-23286116)
chr2 (4-256)||(22738049-22738300)
chr2 (1-256)||(23654252-23654507)
chr2 (1-256)||(37982-38235)
chr2 (7-253)||(298686-298933)
chr2 (90-253)||(22105412-22105575)
chr2 (1-256)||(20309108-20309360)
chr2 (90-253)||(18808943-18809105)
chr2 (90-253)||(23130862-23131024)
chr2 (90-253)||(23133329-23133491)
chr2 (90-253)||(23709532-23709694)
chr2 (90-253)||(23712013-23712175)
chr2 (90-253)||(26505379-26505541)
chr2 (90-253)||(26507857-26508019)
chr2 (90-253)||(34402522-34402684)
chr2 (90-253)||(39682313-39682475)
chr2 (90-255)||(32214921-32215085)
chr2 (90-253)||(571397-571559)
chr2 (90-253)||(6725995-6726157)
chr2 (90-253)||(23135590-23135752)
chr2 (90-253)||(24367774-24367936)
chr2 (90-250)||(21155060-21155219)
chr2 (90-253)||(24898195-24898358)
chr2 (90-253)||(24900678-24900841)
chr2 (90-253)||(24903155-24903318)
chr2 (90-253)||(24905632-24905795)
chr2 (90-253)||(24908107-24908270)
chr2 (90-253)||(32039498-32039660)
chr2 (90-251)||(43137301-43137461)
chr2 (90-253)||(28577099-28577261)
chr2 (90-253)||(45029854-45030016)
chr2 (87-256)||(23103348-23103516)
chr2 (2-256)||(23708485-23708738)
chr2 (1-101)||(27753730-27753830)
chr2 (41-256)||(19671830-19672043)
chr2 (130-253)||(24529569-24529691)
chr2 (134-251)||(28405981-28406099)
chr2 (90-253)||(38967374-38967537)
chr2 (134-252)||(25175854-25175972)
chr2 (183-256)||(8946657-8946730)
chr2 (72-252)||(22799063-22799243)
chr2 (72-252)||(23019643-23019823)
chr2 (193-256)||(23040247-23040310)
chr2 (5-237)||(32451799-32452031)
chr2 (130-255)||(22134203-22134326)
chr2 (138-252)||(7679589-7679702)
chr2 (158-256)||(23071972-23072070)
chr2 (108-249)||(25616192-25616333)
chr2 (89-226)||(7687-7824)
chr2 (134-237)||(23207296-23207401)
chr2 (195-250)||(24643054-24643109)
chr2 (90-167)||(24642856-24642933)
chr2 (35-237)||(20520092-20520295)
chr2 (141-241)||(18786907-18787009)
chr2 (35-237)||(22413035-22413240)
chr2 (134-230)||(23004774-23004872)
chr2 (186-235)||(23287384-23287433)
chr2 (187-235)||(26392403-26392451)
chr2 (73-160)||(22459500-22459587)
chr2 (134-237)||(23791292-23791397)
chr2 (72-144)||(22758652-22758725)
chr2 (134-175)||(24697604-24697645)
chr2 (72-147)||(22740897-22740973)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-256)||(51913-52168)
scaffold0011 (1-256)||(167845-168099)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (3-253)||(339818-340065)
scaffold0003 (90-253)||(158450-158612)
scaffold0003 (137-207)||(71350-71418)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-256)||(38761-39015)
scaffold0145 (39-256)||(32942-33158)
scaffold0145 (130-258)||(9744-9871)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-256)||(25896-26150)
scaffold0026 (1-256)||(39858-40111)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-253)||(22886-23137)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (2-256)||(13211-13465)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (1-256)||(39913-40167)
scaffold0080 (135-237)||(19883-19987)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-256)||(1851-2106)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (4-256)||(3470-3722)
scaffold0292 (1-256)||(343-597)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (52-255)||(3103-3306)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-256)||(8398-8650)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (1-174)||(27912-28085)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-256)||(8479-8730)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-256)||(5987-6245)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-256)||(915-1169)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (25-256)||(4849-5080)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-204)||(13144-13347)
scaffold0175 (141-256)||(34123-34238)
scaffold0175 (200-256)||(273-329)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (45-256)||(16113-16323)
scaffold0120 (1-256)||(32825-33077)
scaffold0120 (1-256)||(45928-46180)
scaffold0120 (195-256)||(17389-17450)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (30-193)||(3424-3588)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-238)||(24167-24406)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (1-256)||(20910-21166)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-256)||(32067-32319)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-256)||(1952-2207)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-256)||(13497-13750)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (1-197)||(829-1021)
scaffold0395 (190-256)||(4888-4954)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (2-256)||(4712-4965)
scaffold0358 (2-191)||(1-189)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-256)||(10292-10544)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (14-256)||(15344-15584)
scaffold0114 (188-252)||(7295-7359)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-256)||(16282-16534)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (1-118)||(124723-124840)
scaffold0021 (78-255)||(174767-174943)
scaffold0021 (187-256)||(121766-121835)
scaffold0021 (138-237)||(136370-136471)
scaffold0021 (138-237)||(145078-145179)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (1-256)||(1289-1541)
scaffold0106 (1-256)||(7266-7518)
scaffold0106 (188-253)||(15291-15356)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (90-254)||(10772-10935)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (90-253)||(4694-4856)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (90-253)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (90-253)||(37821-37983)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (137-256)||(28414-28533)
scaffold0046 (141-256)||(11292-11407)
scaffold0046 (141-256)||(1997-2112)
scaffold0046 (203-256)||(4552-4605)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (90-253)||(94411-94573)
scaffold0023 (90-249)||(17440-17598)
scaffold0023 (93-253)||(44454-44614)
scaffold0023 (134-252)||(100378-100496)
scaffold0023 (134-252)||(40173-40291)
scaffold0023 (185-256)||(119875-119947)
scaffold0023 (49-252)||(38394-38596)
scaffold0023 (185-252)||(101503-101571)
scaffold0023 (49-148)||(23581-23679)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (41-253)||(16784-16995)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-235)||(4545-4778)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (90-253)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (90-253)||(13947-14109)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (1-96)||(10323-10418)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (90-253)||(136680-136842)
scaffold0028 (90-253)||(139149-139311)
scaffold0028 (90-253)||(144087-144249)
scaffold0028 (90-253)||(134211-134373)
scaffold0028 (90-253)||(141618-141780)
scaffold0028 (134-254)||(62200-62317)
scaffold0028 (130-252)||(132662-132784)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (90-249)||(501088-501246)
scaffold0001 (50-253)||(85539-85742)
scaffold0001 (74-252)||(160688-160864)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-256)||(918-1170)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (90-254)||(9241-9404)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-197)||(6669-6865)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (90-253)||(82072-82234)
scaffold0037 (74-241)||(22610-22776)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (110-253)||(116430-116571)
scaffold0022 (134-237)||(128968-129072)
scaffold0022 (134-230)||(78348-78445)
scaffold0022 (41-92)||(116579-116631)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (38-237)||(20328-20524)
scaffold0031 (89-256)||(128751-128917)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (90-255)||(11286-11450)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (90-253)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (90-253)||(40400-40562)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (1-119)||(1051-1169)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (90-255)||(12249-12413)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (14-256)||(51582-51821)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (50-253)||(161049-161252)
scaffold0007 (50-173)||(164550-164674)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (90-250)||(4300-4459)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-253)||(4997-5246)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (90-253)||(12064-12220)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (1-97)||(3640-3736)
scaffold0165 (1-97)||(7704-7800)
scaffold0165 (50-241)||(27663-27855)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (134-256)||(6535-6657)
scaffold0621 (74-241)||(8481-8650)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (50-253)||(2088-2291)
scaffold0247 (41-256)||(17932-18148)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (46-256)||(46995-47202)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (90-253)||(4214-4377)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (74-256)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (74-256)||(38195-38377)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (134-252)||(19268-19386)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (139-256)||(11447-11564)
scaffold0235 (1-72)||(11379-11450)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (90-239)||(29946-30094)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (74-241)||(10481-10647)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (134-252)||(2805-2923)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (74-252)||(45732-45909)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (74-244)||(129917-130086)
scaffold0010 (35-230)||(60614-60811)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (50-241)||(16014-16206)
scaffold0357 (50-237)||(13147-13336)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (4-77)||(17856-17929)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (141-253)||(15664-15776)
scaffold0261 (167-252)||(1339-1424)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (90-250)||(1280-1440)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (74-253)||(38641-38820)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (74-252)||(133-310)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (146-256)||(6134-6244)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-237)||(51750-51985)
scaffold0034 (134-256)||(32538-32657)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (134-252)||(14696-14814)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (134-244)||(5655-5765)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (74-226)||(53488-53640)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (141-256)||(1075-1190)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (146-256)||(15788-15898)
scaffold0020 (189-252)||(178898-178961)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (148-256)||(6611-6719)
scaffold0333 (148-256)||(13991-14099)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (138-256)||(1037-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (138-256)||(12766-12884)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (134-252)||(2644-2762)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (49-252)||(23843-24048)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (49-229)||(16264-16442)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (134-237)||(1051-1154)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (134-237)||(12587-12690)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (134-241)||(10542-10649)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (134-252)||(1086-1204)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (150-252)||(23898-24000)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (141-244)||(6824-6927)
scaffold0556 (134-181)||(8090-8137)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (1-64)||(20595-20658)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (138-241)||(8075-8180)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (138-252)||(12943-13057)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-199)||(225465-225662)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (185-252)||(28818-28887)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (74-235)||(7998-8161)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (134-230)||(38342-38440)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (72-252)||(4741-4921)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (134-237)||(6281-6386)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (134-241)||(25121-25229)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (81-207)||(15362-15486)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (80-229)||(192920-193070)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (134-199)||(2217-2281)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (186-235)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (188-252)||(10575-10639)
scaffold0297 (192-252)||(15736-15796)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (189-252)||(36454-36517)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (38-144)||(32544-32650)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (134-237)||(97024-97129)
scaffold0006 (134-237)||(106302-106407)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (195-237)||(11982-12024)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (130-168)||(13092-13130)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (77-165)||(1169-1257)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (188-252)||(1881-1945)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (188-252)||(21856-21920)
scaffold0210 (188-252)||(29748-29812)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (188-252)||(14664-14728)
scaffold0081 (188-252)||(23679-23743)
scaffold0081 (188-252)||(39103-39167)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (138-237)||(569-669)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (138-241)||(103632-103737)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (134-237)||(267679-267784)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (49-252)||(26828-27027)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (150-252)||(29558-29660)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (134-175)||(1795-1836)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (188-252)||(6095-6159)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (188-252)||(69794-69858)
scaffold0004 (49-144)||(69905-70000)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 69)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9078205 - 9077952
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078205 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 9078106  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9078105 tatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctg 9078006  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9078005 ttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24529475 - 24529223
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24529475 gagttgaaccttggggtagtattgaaacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataat 24529376  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  24529375 gttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgt 24529276  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24529275 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25421787 - 25421532
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421787 gagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 25421688  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  25421687 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgt 25421588  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25421587 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1096721 - 1096467
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096721 agttggaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatg 1096622  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgct 201  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||| |||||||    
T  1096621 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgct 1096522  T
Q  202 gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1096521 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24493823 - 24493569
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493823 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataat 24493724  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||| ||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24493723 gttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 24493625  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24493624 tattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25431649 - 25431395
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431649 gagttgaaccttgaggtagcattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 25431550  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25431549 gttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgc 25431450  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  25431449 tgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 23390362 - 23390617
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390362 gagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 23390461  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  23390462 gttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgc 23390561  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23390562 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8286708 - 8286964
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286708 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattatattatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 8286807  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||||  |||||||||||   ||| |||  || || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  8286808 gttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttg 8286907  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8286908 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13025565 - 13025311
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13025565 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataat 13025466  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||   ||||| ||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13025465 gttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 13025367  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13025366 tattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13095749 - 13095495
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13095749 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataat 13095650  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||   ||||| ||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13095649 gttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 13095551  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13095550 tattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22075268 - 22075018
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttata 106  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22075268 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 22075169  T
Q  107 agcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgt 206  Q
     ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22075168 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgt 22075069  T
Q  207 tatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag-atgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22075068 tatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22412388 - 22412187
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  22412388 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgagat 22412299  T
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  241 atgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21292836 - 21293090
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21292836 gagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataat 21292935  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg-acttgcat-ttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| || |||||||||||   || ||||||||  | |||||||| || | ||| || ||||||||||||||||||  |||||  || |||||||||||||    
T  21292936 gtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgtt 21293032  T
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  21293033 gctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 21808343 - 21808510
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21808343 atgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21808442  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21808443 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 21986013 - 21986164
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  21986013 gagttgaaccttggggtagtattcagacttgatgatgatgttaactataatttgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgaatatgaggtgataaaat 21986112  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 152  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||    
T  21986113 gttatatgcattacttgagatatgaatttataatgaagatgttgttgacttg 21986164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997655
Alignment:
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  248 tgatgatgt 256  Q
    |||||||||    
T  21997647 tgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 264768 - 264930
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  264768 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 264867  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  264868 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Original strand, 21729018 - 21729185
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  21729018 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 21729117  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21729118 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29330096 - 29329934
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29330096 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 29329997  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29329996 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29346142 - 29345980
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29346142 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29346043  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29346042 g-ttgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39363546 - 39363384
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39363546 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39363447  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39363446 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 253
Target Start/End: Original strand, 10732941 - 10733102
Alignment:
Q  91 gtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 190  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10732941 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 10733040  T
Q  191 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10733041 -ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20909174 - 20909012
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909174 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20909075  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20909074 g-ttgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29348615 - 29348453
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29348615 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29348516  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29348515 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29351088 - 29350926
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29351088 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29350989  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29350988 g-ttgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 42245365 - 42245527
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  42245365 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 42245464  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  42245465 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 11581151 - 11581361
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  11581151 ttaatgataatctgtgaagttgatttatgatga-ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgaga 11581248  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11581249 cgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11581347  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  11581348 gattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32027555 - 32027393
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32027555 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32027456  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32027455 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 36154783 - 36154942
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36154783 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 36154882  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||   || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36154883 gc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39245298 - 39245136
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39245298 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39245199  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39245198 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Original strand, 20902049 - 20902172
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20902049 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 20902147  T
Q  230 gatctaagttg-atgaagatgatga 253  Q
    | ||||||||| || ||||||||||    
T  20902148 ggtctaagttgaattaagatgatga 20902172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Original strand, 2154654 - 2154776
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2154654 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 2154752  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  2154753 ggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Original strand, 18319033 - 18319193
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  18319033 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 18319132  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18319133 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Original strand, 22107243 - 22107356
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 104  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |      
T  22107243 tgaacctttgagtagtattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatat 22107342  T
Q  105 taagcattacttga 118  Q
    || |||||||||||    
T  22107343 tatgcattacttga 22107356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 10775675 - 10775838
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||    
T  10775675 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatac 10775774  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10775775 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31061231 - 31061068
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| || | ||||   || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31061231 tgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 31061132  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | | | | |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31061131 tac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38619557 - 38619434
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38619557 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 38619459  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  38619458 cggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565546
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21565624 gatgatttgg-atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 37724108 - 37723910
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgtt 146  Q
    |||||||||||||||||  ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |    
T  37724108 aatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgat 37724011  T
Q  147 gacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaa 245  Q
    || ||  ||||||||| || |||||||| ||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||| || ||||    
T  37724010 gaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaa 37723914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 41 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18418793 - 18418594
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  | | |||| || ||| |||    
T  18418793 ttaattataacctgtgaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataatgttgtgtacattacttgaagttttattgaat-attaaga 18418695  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || | |||||  |||||||    
T  18418694 tgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagt 18418598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23064634 - 23064512
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | | ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23064634 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagt 23064536  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  23064535 cggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22144271 - 22144068
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| ||||| || | |||||||| |||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  22144271 atgatattaatgatgacctgtgaagttgttataagatgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 22144172  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22144171 ttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22144073  T
Q  233 ctaag 237  Q
    |||||    
T  22144072 ctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 20917952 - 20918110
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgat-tgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||||||||||    || |||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20917952 tgtgatataattatatatgctttacttgaatta-gatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatac 20918046  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20918047 tgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21329598  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  21329599 gttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 20766035 - 20766174
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  20766035 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcgtac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 20766124  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactg 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20766125 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24067270 - 24067110
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  24067270 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatac 24067171  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||    
T  24067170 tg-ttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaagatga 24067110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 252
Target Start/End: Original strand, 22959538 - 22959649
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22959538 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22959636  T
Q  240 gatgaagatgatg 252  Q
    ||||| |||||||    
T  22959637 gatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027043
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgtttt-ggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20027040  T
Q  235 aag 237  Q
    |||    
T  20027041 aag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314577
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40726069 - 40725853
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  40726069 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 40725970  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  40725969 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  40725870 cgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 21502158 - 21502277
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||| ||||| || |||   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  21502158 agatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 21502256  T
Q  236 agttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  21502257 agttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012154
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  26012133 ctaagttga--aagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Original strand, 17517174 - 17517320
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  17517174 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 17517273  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||| ||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  17517274 attaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 17517320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19669013 - 19668898
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  19669013 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagtt 19668915  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||| |||||||||||    
T  19668914 gatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18356488 - 18356364
Alignment:
Q  81 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18356488 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T
Q  181 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
      |||| ||||||||||||||||||||    
T  18356388 --gtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21873453 - 21873254
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| ||  || ||||||||   |    
T  21873453 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatggttaagatgttg---a 21873358  T
Q  149 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagat 248  Q
      ||   |||||||||| | |||||| || | | |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||  |||||    
T  21873357 aatgagattgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagat 21873258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29448126 - 29448052
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29448126 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26704139 - 26704075
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26704139 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 26973872 - 26973808
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  26973872 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 20910801 - 20910869
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  20910801 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatgctgtctatgttgctgttgtt 20910869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 22178218 - 22178323
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  22178218 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 22178316  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  22178317 gtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 253
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20806904
Alignment:
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032323
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22032387 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 237
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740747
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23201445 - 23201360
Alignment:
Q  167 atgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||| ||||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||  |||||||||    
T  23201445 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 183 - 252
Target Start/End: Original strand, 23501403 - 23501472
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| |||||| || |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  23501403 gtattctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 18770054 - 18770118
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  18770054 ctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 28648910 - 28649164
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28648910 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 28649009  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28649010 gttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgc 28649109  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28649110 ttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6759511 - 6759255
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759511 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 6759412  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  6759411 tgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttg---acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttg 6759315  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgtcca 259  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759314 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16092207 - 16092463
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092207 gagttgaaccttggggtaatattgagacttaaggatgatgttaattataatatgcgaagttgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 16092306  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  16092307 tgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttg 16092406  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16092407 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22875320 - 22875065
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22875320 gagttgaaccttggggtagtattgagatgtaatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 22875221  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  22875220 tgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctgtgttg 22875122  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22875121 ctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22626990 - 22626736
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  22626990 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataat 22626891  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||  ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22626890 gttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgc 22626792  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22626791 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18818275 - 18818530
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18818275 gagttgaaatttagggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataat 18818374  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18818375 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 18818474  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18818475 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21923794 - 21924049
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||     
T  21923794 gagttgaaccttgaggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataag 21923893  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  21923894 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgc 21923993  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21923994 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20536461 - 20536208
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20536461 gttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgt 20536362  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  20536361 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg 20536262  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20536261 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7373025 - 7372778
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  7373025 gagttgaactttggggtggtagtgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa- 7372927  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
           |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7372926 -------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 7372834  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7372833 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23406636 - 23406379
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23406636 gagttgaactttgggataatattgggacttaatgaggatgttaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataat 23406537  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgtt--gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23406536 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgtt 23406437  T
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23406436 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18879103 - 18879352
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18879103 gagttgaaccttgggatagcatcaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgat-aagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataat 18879201  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||| ||||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||     |||||| ||||||||||||||||||    
T  18879202 gttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgc 18879296  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18879297 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21918866 - 21919121
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||  ||| |||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21918866 gagttgaacccttgggtaagattaagacttaacgatgaggttaattacgatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataat 21918965  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgatt-gtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||| || |||||||||||   || ||| | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  21918966 gtt-tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 21919064  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  21919065 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23648808 - 23648554
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648808 gagttgaaccttggggtagtattaagacctaatgatgatgttaattataatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 23648709  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||| | |||  |||||||||||||    
T  23648708 gttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgc 23648609  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | |||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  23648608 tattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31971506 - 31971257
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 104  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  31971506 tgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt- 31971408  T
Q  105 taagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt 204  Q
    || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31971407 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgtt 31971309  T
Q  205 gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  31971308 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 45130864 - 45131117
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  45130864 gagttggacccttgggtaggattaagacttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataat 45130963  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg-acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||| || |||||||||||   || ||||||||  | |||||||| || | ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||    
T  45130964 gtt-tatgcattacttgaagaataattgtatacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttg 45131060  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  45131061 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16199512 - 16199765
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16199512 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataat 16199611  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||||    
T  16199612 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgc 16199708  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  16199709 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 14409444 - 14409606
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14409444 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14409543  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14409544 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1484564 - 1484402
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1484564 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 1484465  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1484464 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 5853292 - 5853454
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5853292 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 5853391  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  5853392 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 16413316 - 16413474
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16413316 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16413415  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16413416 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20403389 - 20403227
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20403389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20403290  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20403289 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22001915 - 22001753
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22001915 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22001816  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22001815 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41598399 - 41598188
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||| ||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  41598399 ttaatgatgatctgtgaaactgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 41598301  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  41598300 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41598202  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  41598201 gattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 15203231 - 15203393
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15203231 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15203330  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15203331 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 20046195 - 20046357
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20046195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 20046294  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20046295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4483442 - 4483281
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4483442 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 4483343  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4483342 g-ttgtgttgctgttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 25363006 - 25363124
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25363006 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataat 25363105  T
Q  101 gttataagcattacttgag 119  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  25363106 gttttatgcattacttgag 25363124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26219918 - 26219717
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  26219918 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 26219829  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26219828 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26219731  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| | ||||||||    
T  26219730 gattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 35 - 256
Target Start/End: Original strand, 21389353 - 21389571
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataat 134  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||      
T  21389353 atgaagttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtataca 21389451  T
Q  135 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatc 233  Q
    | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21389452 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21389548  T
Q  234 taagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  21389549 taagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 4542373 - 4542535
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  4542373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtat-ct 4542471  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4542472 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  40 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21395986  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  21395987 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21396083  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||||||||    
T  21396084 tgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 256
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  40 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 21790479  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  21790480 tgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 21790576  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||||||||    
T  21790577 tgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19896430 - 19896265
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat---gtcatgatgttttcgtat 186  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||    
T  19896430 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtat 19896331  T
Q  187 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19896330 accgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225409
Alignment:
Q  110 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattg-ttgtgtcgctgttgttat 26225365  T
Q  210 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26225366 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 256
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  53 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttg 152  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| |||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 21778795  T
Q  153 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||    
T  21778796 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T
Q  252 gatgt 256  Q
    |||||    
T  21778893 gatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26224041 - 26223917
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| || || | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||    
T  26224041 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattg-ctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtc 26223943  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||    
T  26223942 gatctaagttgattaagatgttgatg 26223917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855372
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  38855349 ctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 6520388  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  6520387 gttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14823935 - 14823774
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14823935 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14823836  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  14823835 g-ttgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatga 14823774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 19801333 - 19801527
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  19801333 ttaatgatgatctgtgaagctgatttacgatgacttgatgttg-ttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 19801431  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19801432 cgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 131 - 259
Target Start/End: Original strand, 19937046 - 19937174
Alignment:
Q  131 taattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19937046 taattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19937144  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatgatgtcca 259  Q
    | || |||||||| |||||||||| |||||    
T  19937145 ggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 249
Target Start/End: Original strand, 13508024 - 13508199
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13508024 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13508123  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    |||||| | | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  13508124 gatgttgt-gcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15070681 - 15070571
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15070681 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15070583  T
Q  229 cgatctaagttg 240  Q
    || |||||||||    
T  15070582 cggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 25484275 - 25484430
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  25484275 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac- 25484373  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
           | ||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  25484374 -------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866395
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 249
Target Start/End: Original strand, 13597556 - 13597731
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  13597556 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcat 13597655  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    |||||||| | || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||    
T  13597656 gatgtttt-gcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17141019 - 17140916
Alignment:
Q  153 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17141019 cattcgatattattatgtcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T
Q  252 gatgt 256  Q
    |||||    
T  17140920 gatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21491110 - 21490995
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21491110 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21491012  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  21491011 gttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Original strand, 45290734 - 45290853
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45290734 ataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 45290832  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    || ||||||||||| ||||||    
T  45290833 cggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285601
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagatg 21285601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 17612018 - 17612231
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||   ||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  17612018 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt---tataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 17612114  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  17612115 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  17612214 cgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Original strand, 18678075 - 18678221
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  18678075 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 18678174  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  18678175 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 18678221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32121880 - 32121734
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  32121880 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 32121781  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  32121780 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 23760843 - 23760961
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23760843 ttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttac-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 23760941  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  23760942 ctaagttgaagatgatgatg 23760961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 252
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355815
Alignment:
Q  135 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| || ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  26355699 tgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtc 26355796  T
Q  234 taagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  26355797 taagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 983407 - 983512
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt-ttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  983407 gatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 983506  T
Q  236 agttga 241  Q
    ||||||    
T  983507 agttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20498744 - 20498581
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20498744 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    | | ||||   |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  20498644 gctatttt-acatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 21673826 - 21673716
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||| | || |||||||| |    
T  21673826 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggt 21673728  T
Q  233 ctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||||    
T  21673727 ctaagttgatga 21673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21249500 - 21249384
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21249500 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21249402  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||||||||    
T  21249401 tgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21255338 - 21255222
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt--atttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| ||||||||| || ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21255338 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaatt-gcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21255240  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||||||||    
T  21255239 tgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 23776772 - 23776952
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  23776772 tgttgatgttgaatatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtc 23776871  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||| || | | ||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  23776872 atgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 23776952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 37116471 - 37116366
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  37116471 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 37116373  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  37116372 gtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 252
Target Start/End: Original strand, 17353843 - 17354060
Alignment:
Q  40 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataag-cattacttgagttatgattgtataattgag 138  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||| || |||||  |   |||||||||| |||||| || || ||||||    
T  17353843 gttaattgtaatctgtgaagctgtt-atgaaatgtttatgttgaatatgatgtgagatgatgtttgatttcattacttgaattatgaatgaatgattgag 17353941  T
Q  139 atgttgttgacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatc 233  Q
    ||| || |  |||| |||||||||     ||| ||||||| ||||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||||||     
T  17353942 atgatgcttgcttgtatttgatatcgttatatgatgtcataatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgata 17354041  T
Q  234 taagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  17354042 taagatgatcaagatgatg 17354060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Original strand, 17439504 - 17439602
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17439504 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17439602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Original strand, 26222987 - 26223039
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 92  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26222987 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 26223039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 17266991 - 17267096
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||   |||||  | |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  17266991 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 17267089  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  17267090 gtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24353143 - 24353039
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  24353143 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 24353046  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  24353045 gtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 175
Target Start/End: Original strand, 40492850 - 40492891
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  40492850 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 40492891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 50210079 - 50210333
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210079 gagttgaacctttgggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 50210178  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50210179 gttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgc 50210278  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50210279 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34510033 - 34509783
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34510033 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 34509934  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34509933 tataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 34509834  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34509833 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22532524 - 22532269
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532524 gagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgatgatgttatttatgaactgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 22532425  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| || ||| || |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22532424 gttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 22532325  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22532324 tgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27250595 - 27250850
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27250595 gagttgaacctttgggtagcattgatacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 27250694  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27250695 gttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 27250794  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27250795 tattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21026929 - 21026680
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttata 106  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21026929 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgtttta 21026830  T
Q  107 agcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgt 206  Q
     ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21026829 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgt 21026730  T
Q  207 tatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  21026729 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 20135442 - 20135188
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20135442 gagttgaaccttagggtagtagtaagacctaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataat 20135343  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||  | | |||| ||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||    
T  20135342 gttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgc 20135243  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | ||||| |||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  20135242 tattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 255
Target Start/End: Original strand, 22468576 - 22468816
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcatta 113  Q
    ||||||||||||||| |  ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22468576 gggtagtattgagaccttttgaagttggtaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcatta 22468674  T
Q  114 cttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 213  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||| | |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  22468675 cttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaa 22468774  T
Q  214 ctaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| |||||    
T  22468775 ctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 179
Target Start/End: Original strand, 22354441 - 22354616
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354441 ttgaacctttaggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 22354540  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 179  Q
    |||  ||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  22354541 atatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 433222 - 433012
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || |||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  433222 ttaatgatgatctgtaaagctgatttatgatgatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 433123  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  433122 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 433026  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  433025 gattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Original strand, 23593719 - 23593897
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593719 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 23593818  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23593819 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21840929 - 21840766
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21840929 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 21840830  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  21840829 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13989028 - 13988866
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13989028 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13988929  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13988928 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 21923291 - 21923453
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21923291 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21923390  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21923391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Original strand, 45574842 - 45575008
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  45574842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatact 45574941  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  45574942 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 21475087 - 21475249
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21475087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21475186  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  21475187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29776850 - 29776688
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  29776850 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatact 29776751  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29776750 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 31612475 - 31612313
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31612475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 31612376  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31612375 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 22356040 - 22356158
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22356040 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataa 22356139  T
Q  100 tgttataagcattacttga 118  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  22356140 tgttatgtgcattacttga 22356158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Original strand, 22357726 - 22357844
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatg-ttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22357726 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataa 22357825  T
Q  100 tgttataagcattacttga 118  Q
    ||||||  |||||||||||    
T  22357826 tgttatgtgcattacttga 22357844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 16362095 - 16361915
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362095 ttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 16361996  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | ||||||  |||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  16361995 gttgtttttatatactg-ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 29298298 - 29298137
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  29298298 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatact 29298200  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29298199 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 38801258 - 38801508
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    ||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  38801258 agttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatg 38801357  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgct 201  Q
    || || |||||||||||   || ||||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   | | |||||||||||||||    
T  38801358 tt-tatgcattacttgaagaataattgtatatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgtt---gcacactgcctatgttgct 38801453  T
Q  202 gtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  38801454 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 13212821 - 13213027
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    |||||||||| || |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  13212821 atctgtgaagttgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattg 13212919  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |  || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13212920 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 13213018  T
Q  248 tgatgatgt 256  Q
    |||||||||    
T  13213019 tgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 16275363 - 16275526
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||| || |   || |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16275363 tgtgatataatggtatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16275462  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16275463 tgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21347161 - 21346961
Alignment:
Q  53 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgact 150  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21347161 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21347063  T
Q  151 tgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21347062 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21346964  T
Q  251 tga 253  Q
    |||    
T  21346963 tga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21342296 - 21342090
Alignment:
Q  53 tgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgact 150  Q
    |||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||| ||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| ||||||    
T  21342296 tgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgact 21342198  T
Q  151 tgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21342197 tgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21342099  T
Q  251 tgatgtcca 259  Q
    ||| |||||    
T  21342098 tgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707167
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21707329 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21707230  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21707229 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21711871 - 21711709
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||    
T  21711871 tgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatact 21711772  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21711771 -attgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48603730 - 48603651
Alignment:
Q  40 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  48603730 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 48603651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860177
Alignment:
Q  145 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  245 agatgatgatgtcca 259  Q
    ||||||||| |||||    
T  15860163 agatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  154 atttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  254 tgt 256  Q
    |||    
T  20847273 tgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754052
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  21754072 cggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 22123067 - 22123230
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  22123067 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 22123166  T
Q  190 gcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  22123167 g-ttgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681011
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 33681011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22921986
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  22921967 ctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 21896195 - 21896358
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||| ||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21896195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  21896295 gctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 237
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  75 tgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 174  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  175 atgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     |||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  21861610 ctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16758906 - 16758664
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16758906 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataatatgatttgttgttgtttataatgtgatataa 16758807  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgt 197  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||    
T  16758806 ttgtatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgt 16758709  T
Q  198 tgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  16758708 tgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40389317 - 40389157
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  40389317 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 40389218  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||  | ||| |||||||||||||||| ||| || |||||||  |||| |||||| |||||||    
T  40389217 tg-atgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaagatga 40389157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 14295557 - 14295672
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||  |    
T  14295557 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaat 14295655  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  14295656 gttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 21787979 - 21788159
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||  | |||    
T  21787979 tgttgatgttgattatgatgttatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtc 21788078  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||| |||| | ||   ||||||||| |||| | |||||||||||||| || ||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  21788079 atgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 21788159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 109 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22237773 - 22237631
Alignment:
Q  109 cattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gtt 207  Q
    |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||| |||||| |||    
T  22237773 cattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcgctgtttgtt 22237676  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  22237675 atttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgaagatgatgatg 22237631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 237
Target Start/End: Original strand, 35260992 - 35261180
Alignment:
Q  47 ataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgt 145  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||| | || ||||||| ||||  |||| ||||||||||| |||||  || ||  ||||||   |||    
T  35260992 ataatatgtgaagttgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgt 35261088  T
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35261089 tgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||| | ||| |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 240  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20918686 gatggttt-gcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20248394 - 20248283
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  20248394 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagtt 20248296  T
Q  240 gatgaagatgatg 252  Q
    ||||| |||||||    
T  20248295 gatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21714754 - 21714546
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgtt 146  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||| || || |||||||||||| |    
T  21714754 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtt-taattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgct 21714657  T
Q  147 gacttgcatttgatat-----tattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
       ||  |||||||||     ||| |||||||  |||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  21714656 tgtttttatttgatatcgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttga 21714557  T
Q  242 tgaagatgatg 252  Q
    | |||||||||    
T  21714556 tcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 50614114 - 50614219
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  50614114 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50614212  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  50614213 gtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 50621942 - 50622047
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  50621942 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50622040  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  50622041 gtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 41050033 - 41050138
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||  ||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||| ||||||||     
T  41050033 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcgg 41050132  T
Q  232 tctaag 237  Q
    ||||||    
T  41050133 tctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 207
Target Start/End: Original strand, 22130850 - 22130978
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  |||| ||||||| ||| ||| | ||| |||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||    
T  22130850 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 22130945  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22130946 gatggtttgg-atactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 33797694 - 33797570
Alignment:
Q  81 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33797694 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt 33797595  T
Q  181 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
      |||| |||| |||||||||||||||    
T  33797594 --gtatgctgcatatgttgctgttgtt 33797570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 241
Target Start/End: Original strand, 52927993 - 52928076
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  52927993 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 16368284 - 16368388
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  16368284 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 16368381  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  16368382 gtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 42865266 - 42865330
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  42865266 ctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 76
Target Start/End: Original strand, 20847091 - 20847161
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttg 76  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20847091 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaaccataatctatgaagctgtttaaagatgtgttg 20847161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 21161778 - 21161720
Alignment:
Q  195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  21161778 tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 21477732 - 21477654
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttga 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  21477732 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttga 21477654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 3017 - 3271
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3017 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 3116  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3117 gttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgc 3215  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3216 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 25629221 - 25629476
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629221 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgttgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 25629320  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| |    
T  25629321 gttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcc 25629420  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25629421 tgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29060791 - 29060540
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29060791 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgtta 29060692  T
Q  105 taagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt 204  Q
    |  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29060691 tgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 29060592  T
Q  205 gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29060591 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20594026 - 20593773
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20594026 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgataatgataattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgt 20593927  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20593926 tatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctg 20593827  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20593826 tttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 18409693 - 18409947
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409693 gagttgaaccttagggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 18409792  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| | |||| |||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18409793 gttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgc 18409892  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18409893 tgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 19303407 - 19303661
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303407 gagttgaaccttggggtagcactgagaattaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 19303506  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||   ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||     
T  19303507 gttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatacttcctgtgttgt 19303605  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19303606 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 20360829 - 20361081
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20360829 ttgaacctttgggtagtattaagacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtt 20360928  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt 203  Q
    ||| |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20360929 atatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgt 20361028  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20361029 tgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 17287662 - 17287917
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||    
T  17287662 gagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataat 17287761  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  17287762 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgc 17287861  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  17287862 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20638149 - 20638404
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20638149 gagttgaaccttgggataacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataac 20638248  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| ||| ||| |  |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  20638249 gttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgataaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgt 20638348  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20638349 tgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22780093 - 22780348
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22780093 gagttgaaccttggggtagtataaagacttaatgatgatgttaatcataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataat 22780192  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||    |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||      
T  22780193 gttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttt 22780292  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22780293 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22782389 - 22782227
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22782389 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22782290  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22782289 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20076863 - 20076700
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||  || |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  20076863 atgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttac 20076768  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20076767 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 2291180 - 2291342
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  2291180 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 2291279  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2291280 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12742479 - 12742317
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12742479 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12742380  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12742379 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16496411 - 16496244
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  16496411 atgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatac 16496312  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16496311 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 18334592 - 18334754
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18334592 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18334691  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18334692 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19005208 - 19005046
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19005208 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19005109  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19005108 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 19858919 - 19859081
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19858919 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19859018  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19859019 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24422709 - 24422547
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24422709 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24422610  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24422609 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33861956 - 33861794
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33861956 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33861857  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33861856 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 33864440 - 33864278
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  33864440 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 33864341  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33864340 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 30676710 - 30676874
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  30676710 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 30676809  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  30676810 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 1540911 - 1541073
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  1540911 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatact 1541010  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1541011 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8055191 - 8055029
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8055191 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8055092  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  8055091 -tttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25754971 - 25754809
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25754971 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25754872  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25754871 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 26924640 - 26924802
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26924640 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26924739  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26924740 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34963535 - 34963371
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34963535 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34963436  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  34963435 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1595711 - 1595549
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1595711 tgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1595612  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1595611 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25656791 - 25656629
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   || |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25656791 tgtgatataattatatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25656692  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  25656691 g-ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25688624 - 25688502
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688624 ataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 25688526  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  25688525 gatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16920499 - 16920751
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16920499 gagttgaacccttgggtagaattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataat 16920598  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| | | |||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||| |||    
T  16920599 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgctgc 16920694  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||    
T  16920695 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18456930 - 18456735
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  18456930 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 18456832  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18456831 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 20556894 - 20557054
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  20556894 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattata--tgtgaaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatact 20556991  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  20556992 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25644543 - 25644335
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| | || ||||  ||||||||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  25644543 atgatattaatgatgatctgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgt 25644444  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25644443 ttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 25644344  T
Q  233 ctaagttga 241  Q
    |||||||||    
T  25644343 ctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 3852017 - 3852179
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3852017 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3852116  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3852117 -attgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Original strand, 16448526 - 16448686
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16448526 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 16448625  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16448626 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22831757 - 22831503
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22831757 gagttgaacccttgggtagaattaagacttgagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataat 22831658  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtata-at-tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| || |||||||||||   ||| ||||||| || | |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||  |||   | | | ||||||||||    
T  22831657 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacatctaagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgtt---gaacagtgcctatgtt 22831562  T
Q  199 gctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||   || |||||||||||||||    
T  22831561 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15041430 - 15041644
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcatta 113  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| || | ||||| |||  ||||||    
T  15041430 gggtagtaatgagacctaatgatgatgttagatacaatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgataattaagatttggtttaatg-tatgtgcatta 15041528  T
Q  114 cttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 213  Q
    |||||| | | |||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | ||   ||||||||| | || |||||||||||    
T  15041529 cttgagattttattgaatacttaagatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaa 15041628  T
Q  214 ctaagctgtatgagtc 229  Q
    ||||| || |||||||    
T  15041629 ctaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-attgtgttgctg 18461930  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25603251 - 25603467
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||    
T  25603251 gagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgacgatgtttaatagaatctgtgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgat 25603350  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| ||  ||||||||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||    
T  25603351 gttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgc 25603449  T
Q  201 tgttgttatttaactaag 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  25603450 tgttgttaattaactaag 25603467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109140
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  20109222 atgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  81 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 180  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||     
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt- 35245661  T
Q  181 tcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
      ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  35245660 --gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8227376 - 8227632
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||| |||||||  |||   ||||| || || ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  8227376 gagttgaaccttagggtagttatgaatattaattataatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 8227475  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8227476 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctacgttg 8227574  T
Q  200 ctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||| |  |||  ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  8227575 ctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 25611589 - 25611805
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| |||||| |  | ||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||| ||    
T  25611589 gagttgaacctttgggtagctttaggacttaatgacgatgtttaacagaatctatgaagctgtttaagatgtttagtcattgattatgatgtgatatgat 25611688  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| ||  ||||||||||  | | |||| ||||||||||||| | ||| ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||    
T  25611689 gttgtatacattacttgaagttttattgaataattgagatgtag-tgaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgc 25611787  T
Q  201 tgttgttatttaactaag 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  25611788 tgttgttaattaactaag 25611805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 28496477 - 28496592
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28496477 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
      |||||||||||||||    
T  28496576 tttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 29808888 - 29809003
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29808888 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
      |||||||||||||||    
T  29808987 tttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 237
Target Start/End: Original strand, 18821782 - 18821946
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatg 169  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||  | | | || |||||||||||| |||||| ||||| || |||||| |||||    
T  18821782 tgttaatgttgatttatgatgtgatataatgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatg 18821879  T
Q  170 tcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     |||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18821880 gcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19652316 - 19652199
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  19652316 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 19652219  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19652218 ctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 256
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333339
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 256
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394079
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019408
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||| || ||||| |    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 5834367 - 5834436
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5834367 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 5834436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20177165 - 20177096
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20177165 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 20177096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 22158826 - 22158895
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgt 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22158826 tgaaccttggggtagtattgggacttaatggtgatgctaattataatatgtaaagctgtttaagatgtgt 22158895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  195 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1561418 - 1561303
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  1561418 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1561320  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  1561319 gttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 9098518 - 9098620
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9098518 gttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-gcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 9098616  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  9098617 ttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19668491 - 19668386
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  19668491 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtct 19668393  T
Q  235 aagttga 241  Q
    |||||||    
T  19668392 aagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 11185744 - 11185524
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcatta 113  Q
    |||||| ||| |||||||||  ||| |||||   |||||||||||| ||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||    
T  11185744 gggtaggattaagacttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtt-tatgcatta 11185646  T
Q  114 cttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttattta 212  Q
    |||||   ||| |||||||    ||||| || ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  11185645 cttgaagaatgtttgtatacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---gtacactgcacatgttgttgtttgttattta 11185549  T
Q  213 actaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11185548 actaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 254
Target Start/End: Original strand, 19847997 - 19848114
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||  || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||    
T  19847997 agatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 19848096  T
Q  237 gttgatgaagatgatgat 254  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  19848097 gttgattaagatgttgat 19848114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 244
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185930
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| || |||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  240 gatga 244  Q
    |||||    
T  4185926 gatga 4185930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23992572 - 23992429
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||   | ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  23992572 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttg---aattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 23992476  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||| ||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  23992475 atttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 23992429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 27415943 - 27416011
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27415943 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 27416011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33443119 - 33443068
Alignment:
Q  184 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  33443119 tatactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 94
Target Start/End: Original strand, 31164727 - 31164807
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtga 94  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||   ||||| ||| |||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||    
T  31164727 gggtagtagtgagacctaatgttgatgttagagataatttgtaaagctgtttaagatgttttgatgctaattaggatgtga 31164807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 256
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  209 tttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 203 - 252
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155514
Alignment:
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 16924759 - 16924830
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatta 86  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  16924759 gggtagtaatgagacctaaggatgatgttaaatacaatctgt-tagctgtttaagacatgttgatgtttatta 16924830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19873184 - 19873120
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  19873184 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 25642120 - 25642196
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||    
T  25642120 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 90)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14973109 - 14972854
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973109 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 14973010  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  14973009 gttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgc 14972910  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14972909 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18438787 - 18438534
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438787 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgt 18438688  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438687 tatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 18438588  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18438587 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 40213587 - 40213838
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213587 gagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 40213686  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||     
T  40213687 gttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttga 40213785  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40213786 tgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 25476251 - 25476506
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25476251 gagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatgaggatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataat 25476350  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||    
T  25476351 gttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgc 25476450  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25476451 tgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26687142 - 26686887
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26687142 gagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataat 26687043  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| || | ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  26687042 gttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgt 26686943  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  26686942 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17488111 - 17487856
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488111 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 17488012  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  17488011 gttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgc 17487912  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17487911 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 23083227 - 23083482
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23083227 gagttgaaccttgaggtagtattaagacttagtgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataat 23083326  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||| ||  ||  |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  23083327 gttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgc 23083426  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23083427 tattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 11424629 - 11424880
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11424629 gagttgaactttggggtagtattgagacttaatgttgatgttaattttaatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataat 11424728  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11424729 gttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 11424824  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11424825 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13442529 - 13442274
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442529 gagttgaaccttgggatgacattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 13442430  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13442429 gttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgc 13442330  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13442329 cgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 14576699 - 14576949
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14576699 gagttgaaccttggggtagtattaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 14576798  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| |||||||||    
T  14576799 gttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgt-ttatactgtctatgttgc 14576897  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  14576898 tgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgatgttgatgatg 14576949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17499593 - 17499338
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17499593 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataat 17499494  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  17499493 gttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgc 17499394  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17499393 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 42386666 - 42386428
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42386666 gagttgaaccttggggtagtattgggacttgtttatgatgttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataa 42386567  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42386566 tgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttg 42386467  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  42386466 ctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43841177 - 43840932
Alignment:
Q  11 ttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagca 110  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||    
T  43841177 ttggggtagtattgggacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgca 43841078  T
Q  111 ttacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatt 210  Q
    ||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43841077 ttacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatt 43840978  T
Q  211 taactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  43840977 taactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 20698302 - 20698556
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20698302 gagttgaacctttggatagaattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataat 20698401  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  ||| |||  | |||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20698402 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 20698500  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20698501 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12399456 - 12399209
Alignment:
Q  9 ccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataag 108  Q
    |||| |||||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |    
T  12399456 cctttgggtagcattaagacataatgaagaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatg 12399357  T
Q  109 cattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtta 208  Q
    |||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12399356 cattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgtta 12399257  T
Q  209 tttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12399256 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14572843 - 14572602
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14572843 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatttgtttatgttgtttatgatgtgatataat 14572744  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| |   ||||| ||||  ||| |||| ||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  14572743 gtttttttcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgc 14572645  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatg 243  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14572644 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 14572602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 24153115 - 24153326
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  24153115 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagat 24153214  T
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  241 atgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Original strand, 29172567 - 29172745
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    |||||||||||  |  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172567 ttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 29172666  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29172667 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13544187 - 13544024
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  13544187 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 13544088  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  13544087 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 9707607 - 9707769
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  9707607 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 9707706  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  9707707 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 10247723 - 10247885
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10247723 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 10247822  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10247823 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12567722 - 12567564
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  12567722 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatatt 12567623  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12567622 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17463340 - 17463178
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17463340 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17463241  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17463240 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 34159488 - 34159326
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34159488 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34159389  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34159388 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166598
Alignment:
Q  110 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ctgtgtcgctgttgttat 36166642  T
Q  210 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36166641 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 45606907 - 45607069
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45606907 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 45607006  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45607007 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55476653 - 55476491
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  55476653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 55476554  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  55476553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 7781347 - 7781509
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7781347 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7781446  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7781447 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8899256 - 8899094
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8899256 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 8899157  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  8899156 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 16454281 - 16454443
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16454281 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16454380  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454381 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17672788 - 17672626
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17672788 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17672689  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17672688 g-ctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 28848611 - 28848773
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  28848611 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 28848710  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28848711 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 38961891 - 38962053
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  38961891 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 38961990  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  38961991 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 13151790 - 13151953
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13151790 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13151889  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13151890 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 13154255 - 13154418
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13154255 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13154354  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13154355 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 6469134 - 6469296
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6469134 tgtgatataattgtatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6469233  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6469234 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 17446655 - 17446816
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17446655 tgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17446754  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17446755 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 50242984 - 50242822
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50242984 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50242885  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  50242884 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21618650 - 21618460
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  21618650 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 21618561  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21618560 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21618463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Original strand, 43550478 - 43550644
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  43550478 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatact 43550577  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  43550578 gcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Original strand, 16282811 - 16282971
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16282811 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16282910  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16282911 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15977637 - 15977515
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15977637 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 15977539  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  15977538 ggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 237
Target Start/End: Original strand, 53070653 - 53070799
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  53070653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatact 53070752  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  53070753 g-ttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 139 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  139 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  239 tgatgaagatgatga 253  Q
    |||| ||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 30030094 - 30029855
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  30030094 gagttgaacctttgggtagctttaagacttaatgatgatgtttaatataatatgtgaagctgtttaagatgttttgacattgattatgatgtgatataat 30029995  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| |   ||||||||||  | | |||| ||| || ||| |||| ||| |||||  ||||||| |||||||||| |||| | |||  ||| ||||| |||    
T  30029994 gttgtgtacattacttgaagttttattgaatatttaagacgttg-tgaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgc 30029896  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    | |||||||| ||||||| || |||||||  ||||||||||    
T  30029895 tattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41124049 - 41123892
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41124049 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41123950  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
    |    |  || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41123949 g----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 12119684 - 12119887
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| ||   ||||   || |||||||||| |||| |||    
T  12119684 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattg 12119782  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  12119783 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 12119881  T
Q  248 tgatga 253  Q
    ||||||    
T  12119882 tgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 24340628 - 24340844
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  24340628 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 24340727  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  24340728 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  24340827 cgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15412552 - 15412429
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15412552 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15412454  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  15412453 cggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16796802 - 16796684
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16796802 gagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggctaattataatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataat 16796703  T
Q  101 gttataagcattacttgag 119  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  16796702 gttttatgcattacttgag 16796684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 145 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499518
Alignment:
Q  145 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  245 agatgatga 253  Q
    |||||||||    
T  8499526 agatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14179648 - 14179569
Alignment:
Q  40 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgag 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14179648 gttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgag 14179569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103784
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| |||||  |||||  ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210448
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307684
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  32307704 cggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 153 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494809
Alignment:
Q  153 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470928
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| || |||||||    
T  15470947 ctaagttgaagatgatgatg 15470928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097332
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 52523633 - 52523831
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||    
T  52523633 ttaatgatgatctgagaagctgttataagatga-ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgaga 52523731  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52523732 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52523830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 134 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 10557104 - 10556985
Alignment:
Q  134 ttgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  10557104 ttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 10557006  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  10557005 ctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27165429 - 27165250
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||| ||||| | ||||   || ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  27165429 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcat 27165330  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27165329 gttgtttt-gcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 253
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301669
Alignment:
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  245 agatgatga 253  Q
    |||||||||    
T  53301661 agatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaa 14234507  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  14234506 gttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 77 - 252
Target Start/End: Original strand, 12174205 - 12174376
Alignment:
Q  77 atgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 176  Q
    |||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||    
T  12174205 atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttg-atatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgat 12174300  T
Q  177 gttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12174301 gattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 37642170 - 37642386
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  37642170 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 37642269  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  37642270 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  37642369 cgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23274903 - 23274705
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgt-ttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || |||||||||||||  ||| ||||  ||||||||| |||| ||||||| ||||  ||||  | |||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  23274903 ttaatgatgatctgtgaagctgaattatgatgatttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgaga 23274804  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  |||||||    
T  23274803 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46822413 - 46822267
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  46822413 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 46822314  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  46822313 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgat 46822267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Original strand, 49668071 - 49668193
Alignment:
Q  130 ataattgagatgtt-gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgag 227  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  49668071 ataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 49668168  T
Q  228 tcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||    
T  49668169 tcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12511205 - 12511059
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| |  |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| |||||    
T  12511205 gcattacttgagatattattgaatattgaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtt 12511106  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| ||||    
T  12511105 atttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737236
Alignment:
Q  154 atttgatattattatgtcatgatgttttcgta---tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||   || ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17737239  T
Q  251 tga 253  Q
    |||    
T  17737238 tga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512924
Alignment:
Q  150 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagat 248  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9512928  T
Q  249 gatg 252  Q
    ||||    
T  9512927 gatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520899
Alignment:
Q  150 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagat 248  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgat 9520903  T
Q  249 gatg 252  Q
    ||||    
T  9520902 gatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251270
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcg 37251263  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  37251264 gtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 43926082 - 43925977
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  43926082 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 43925984  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  43925983 gtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  192 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 175
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051239
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  174 ga 175  Q
    ||    
T  2051238 ga 2051239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 253
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578000
Alignment:
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 249
Target Start/End: Original strand, 1644670 - 1644787
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||     
T  1644670 ataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagcaacataagtt 1644767  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatg 249  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  1644768 ggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12377940
Alignment:
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  | |||  |||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 22110349 - 22110454
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  22110349 ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 22110447  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  22110448 gtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 22147431 - 22147646
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||    
T  22147431 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattt-atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgaga 22147529  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| ||||||| |  |||  ||||||||||| |||| ||| || ||||    
T  22147530 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagt 22147628  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  22147629 cgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 856140
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077594
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  193 tatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 36166799 - 36166747
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 92  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  36166799 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 36166747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  193 tatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878633
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 14878633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 15878104 - 15878168
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  15878104 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 17525211 - 17525275
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  17525211 ctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-113; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 16377389 - 16377639
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377389 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 16377488  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  16377489 gttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgc 16377586  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16377587 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14038903 - 14038653
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038903 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatattaattataatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 14038804  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  14038803 gttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgc 14038704  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14038703 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16239836 - 16240090
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16239836 gagttgaactttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataat 16239935  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  ||||||||| |  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  16239936 gttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctattttgc 16240034  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||| |||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16240035 tattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44053084 - 44052829
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44053084 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataat 44052985  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||| ||||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  44052984 gttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttga 44052885  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44052884 tgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12903012 - 12902757
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12903012 gagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 12902913  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  12902912 gttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 12902813  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12902812 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7893955 - 7893703
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||    
T  7893955 gagttgaaccttggggtaatattaagacttaacgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataat 7893859  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    | |||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7893858 ggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 7893759  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7893758 tattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22636686 - 22636437
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22636686 ttgaaccttggggtagtattaagacttaacgaggatgttaattataatctgtgaagctgtt-aagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgtt 22636588  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt 203  Q
    ||| |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||| |||    
T  22636587 atatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgt 22636488  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22636487 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7089132 - 7088877
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  7089132 gagttgaacctttgagtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataat 7089033  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||  ||| |||  | |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  7089032 gttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 7088933  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7088932 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 16270140 - 16270356
Alignment:
Q  39 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||    
T  16270140 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 16270239  T
Q  139 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  16270240 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 16270338  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16270339 tgatgaagatgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 249
Target Start/End: Original strand, 23374231 - 23374473
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttata 106  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23374231 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttta 23374330  T
Q  107 agcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgt 206  Q
     ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23374331 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgt 23374430  T
Q  207 tatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23374431 tatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 54798669 - 54798872
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  54798669 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtatatttgaga 54798758  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  54798759 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14280518 - 14280316
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| | |||| ||||||    
T  14280518 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatctatatttgaga 14280429  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14280428 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 44928829 - 44929042
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  || |||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  44928829 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgattttatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44928928  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44928929 tgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44929028  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  44929029 gattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 84 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  84 ttatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-g 6899964  T
Q  184 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6899963 tatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 19618172 - 19618336
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19618172 tgtgatataattatatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 19618271  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  19618272 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 18215274 - 18215436
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18215274 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18215373  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18215374 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873488
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  52873469 gttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 12307 - 12469
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12307 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12406  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12407 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Original strand, 1837494 - 1837671
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1837494 ttgatgttg-ttataatgtgatataatcgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcat 1837592  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1837593 gctgtttttgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 15118352 - 15118514
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15118352 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15118451  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15118452 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 44773087 - 44773249
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44773087 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44773186  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44773187 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 52312672 - 52312510
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52312672 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 52312573  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52312572 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 14053168 - 14053422
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14053168 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataat 14053267  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgag-atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||| || |||||||||||   ||  ||||||   | || |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||    
T  14053268 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatgcataagaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgtctatgctg 14053364  T
Q  200 ctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
     || |||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14053365 ttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19242861 - 19242693
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19242861 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 19242762  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgtcca 259  Q
    |  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19242761 g-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3515169 - 3515007
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  3515169 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatact 3515070  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3515069 g-ctgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17046724 - 17046487
Alignment:
Q  16 gtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattact 115  Q
    |||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||||    
T  17046724 gtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtt-tatacattact 17046626  T
Q  116 tgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaac 214  Q
    |||   ||| |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17046625 tgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgtt---ctatactacctatgttgctgtttgttatttaac 17046529  T
Q  215 taagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  17046528 taagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44615450 - 44615288
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  44615450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 44615351  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44615350 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 50222339 - 50222501
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  50222339 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataat 50222438  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  50222439 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 18239419 - 18239581
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18239419 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18239518  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18239519 g-ttgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 23803265 - 23803427
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23803265 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23803364  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23803365 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 51463868 - 51464030
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  51463868 tgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 51463967  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  51463968 -actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44102425 - 44102214
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  44102425 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 44102327  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44102326 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-actgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44102228  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  44102227 gattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 15355324 - 15355483
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15355324 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 15355423  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    || || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15355424 tg-ctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574985
Alignment:
Q  110 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 8574941  T
Q  210 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  8574942 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttaattaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 17047938 - 17048056
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17047938 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagagactaattacaacctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 17048037  T
Q  101 gttataagcattacttgag 119  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  17048038 gttttatgcattacttgag 17048056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 14970707 - 14970871
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  14970707 tgtgatataattatatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatatt 14970806  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||| |||||    
T  14970807 g-ctgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatg 14970871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12611105 - 12610950
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||         
T  12611105 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt----- 12611011  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12611010 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15367905 - 15367690
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15367905 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15367807  T
Q  140 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15367806 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15367707 cgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15402918 - 15402703
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15402918 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15402820  T
Q  140 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15402819 cgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15402720 cgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 241
Target Start/End: Original strand, 52243099 - 52243302
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||   || ||  ||||||    
T  52243099 ttaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgaga 52243198  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  52243199 tgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52243297  T
Q  237 gttga 241  Q
    |||||    
T  52243298 gttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096293
Alignment:
Q  170 tcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 7641192 - 7641344
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||            
T  7641192 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-------- 7641283  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7641284 ---tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15371417 - 15371202
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15371417 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15371319  T
Q  140 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15371318 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15371219 cgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15373698 - 15373483
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| || ||| |||| ||||   || ||||||||||    
T  15373698 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgaga 15373600  T
Q  140 tgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  15373599 cattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  15373500 cgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Original strand, 13790 - 13953
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13790 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 13889  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13890 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12774011
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    || ||||||||||||| |||||||    
T  12774034 cggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15370144 - 15370018
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15370144 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 15370046  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  15370045 cagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 3096898 - 3096782
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||    
T  3096898 gagttgaacctttgggtaggataaatacttaatgatgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaat 3096799  T
Q  101 gttataagcattacttga 118  Q
    ||| || |||||||||||    
T  3096798 gtt-tatgcattacttga 3096782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16223787 - 16223532
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   ||| | | ||| ||||| || ||||||||||||| |||| ||||   |||||||| ||||  ||||||||||    
T  16223787 gagttgaaccttggggtagttatgaatattatttacgatattaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatgtgatgttg-ttatattgtgatataa 16223689  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    |  |||| |  ||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||     
T  16223688 ttgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtc 16223590  T
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  16223589 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 237
Target Start/End: Original strand, 21815587 - 21815731
Alignment:
Q  92 tgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 191  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |     
T  21815587 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacag- 21815685  T
Q  192 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  21815686 ttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 256
Target Start/End: Original strand, 39706299 - 39706409
Alignment:
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  39706299 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39706397  T
Q  245 agatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||    
T  39706398 agatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15551932 - 15551817
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || | || ||||||||||| ||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15551932 gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15551834  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  15551833 gttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  174 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    ||  |||||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  43198592 gaattgtttt-gcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 15091151 - 15091093
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaag 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15091151 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaag 15091093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22353999 - 22353835
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||||| ||||     |  ||    
T  22353999 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatct 22353900  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  22353899 gcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 6190717 - 6190481
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgat-tatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| |||  ||||||||||| | ||  |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  6190717 gagttgaaccttggcgtagcattaagacttgaatatgatattaattacaattcgtgaagctgtt-atgagatgttaatgttgatgtatgatgtgatctaa 6190619  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| ||| |||||||||||  | | | || |||||||||||| |||||  ||| |||| |||||| |||||||||| | |||| | || |||||||||||    
T  6190618 tgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttacatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgtt 6190521  T
Q  199 gctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |||| ||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6190520 gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288316
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 12288309  T
Q  235 aagttga 241  Q
    |||||||    
T  12288310 aagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8846460 - 8846360
Alignment:
Q  152 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||    
T  8846460 gcattcgatattgttatctcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatga 8846362  T
Q  251 tg 252  Q
    ||    
T  8846361 tg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20149992 - 20149832
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20149992 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 20149893  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||  | ||| ||||||||||||| |  ||| || |||||||  ||||||||||| |||||||    
T  20149892 tg-atgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatga 20149832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 43256106 - 43256230
Alignment:
Q  81 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 180  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||  |    
T  43256106 tgattataatgtgatataatattatatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttg--t 43256203  T
Q  181 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||    
T  43256204 tggtatgctgcctatgttgctgttgtt 43256230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 46640453 - 46640558
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  46640453 ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 46640551  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  46640552 gtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Original strand, 8574784 - 8574836
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaag-atgtgttgatgttgattatgatgt 92  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8574784 ttaatgataatctatgaagctgttttaggatgtgttgatgttgattatgatgt 8574836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 15093955 - 15093775
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||| |||| || ||| | ||||||| ||  || | |||||||||| | |||    
T  15093955 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaatatattattgaatgattaatatgttgtagaaatgaaattgatattatgaagtc 15093856  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||| |||| | ||   ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||  ||| |||| |||||||||    
T  15093855 atgctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtcaatacaagatgattaagatgatg 15093775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 15464796 - 15464970
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||    ||||| ||||| || || |||||||||| | || ||||  ||||||| | |||  || ||||||||    
T  15464796 gagttgaaccttggagtagtaatgagaattgtatatgatattaatgatgatttgtgaagctgatatatgatgatttgatgtcgtttaaaatttgatataa 15464895  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 174  Q
    |  |||| ||| ||||||| ||||   || ||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  15464896 ttgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 15464970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16596751 - 16596686
Alignment:
Q  153 catttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16596751 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 76)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 3564230 - 3564482
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3564230 gagtttaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaat 3564329  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3564330 gttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgc 3564429  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3564430 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12699086 - 12698831
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12699086 agttgaaccttggggtagtattaagagttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 12698987  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12698986 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 12698887  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12698886 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 9509444 - 9509189
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9509444 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagt 9509345  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |    
T  9509344 gttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttac 9509245  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9509244 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38227735 - 38227481
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38227735 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaagatatttaagatatgttgatgttgattaagatgtgatataat 38227636  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    | |||   ||||| ||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38227635 gatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 38227537  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38227536 tattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 18456319 - 18456530
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagat 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||    
T  18456319 ttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagat 18456418  T
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  241 atgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 7 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26212245 - 26211995
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttata 106  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26212245 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgtttta 26212146  T
Q  107 agcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgt 206  Q
     ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26212145 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgt 26212046  T
Q  207 tatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag-atgatgatgt 256  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  26212045 tatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10589293 - 10589039
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10589293 gagttggacctttgggtaggattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataat 10589194  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||| |||||   ||  ||| | | |  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  10589193 gtt-tatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgc 10589095  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10589094 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 15143903 - 15144143
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |    
T  15143903 gagttgaacctcggggtagtactaagacttaatgatgatgtttaatataatctgtcaagctgttttaagatgttttgacattgattatgatgtgatatga 15144002  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||| | | ||||||   ||||||    
T  15144003 tgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactg-agatgttg 15144101  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15144102 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16386113 - 16386369
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16386113 gagttgaacctttgggtaacattaagacttaatgaagaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataat 16386212  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||||   || ||| ||| || |||||||| |||  | || |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |     
T  16386213 gttttatgcattacttgagaattgtttgaatatttaagatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgt 16386312  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  16386313 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 48273594 - 48273392
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||      ||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  48273594 ttaatgataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtcatac----ttat------tacttgaattatgaatgtata-ttgaga 48273506  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  48273505 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13647491 - 13647325
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  13647491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 13647392  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  13647391 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 90 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18430874 - 18430709
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  18430874 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 18430775  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18430774 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40443640 - 40443393
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 104  Q
    |||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||     
T  40443640 tgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtt- 40443542  T
Q  105 taagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-t 203  Q
    || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| |    
T  40443541 tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtt 40443444  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  40443443 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 456483 - 456321
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  456483 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 456384  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  456383 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 11972658 - 11972496
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11972658 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11972559  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11972558 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 14949122 - 14949284
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14949122 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14949221  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14949222 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 15376713 - 15376875
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15376713 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 15376812  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15376813 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16213861 - 16213684
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16213861 ttgatgttg-ttatgttgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcat 16213763  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16213762 gttgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16232682 - 16232520
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  16232682 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16232583  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16232582 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18640434 - 18640272
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18640434 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18640335  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18640334 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 20385123 - 20385285
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20385123 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20385222  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20385223 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 21189595 - 21189757
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21189595 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21189694  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21189695 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24702400 - 24702238
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24702400 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 24702301  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24702300 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32125653 - 32125491
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32125653 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32125554  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32125553 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41523079 - 41522917
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41523079 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41522980  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41522979 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 41525541 - 41525379
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41525541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 41525442  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41525441 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 252
Target Start/End: Original strand, 11393287 - 11393448
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11393287 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11393386  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11393387 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27217022 - 27216860
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27217022 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27216923  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  27216922 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44116671 - 44116509
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44116671 tgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 44116572  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44116571 g-ctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 2279984 - 2280238
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||   ||| | ||||| | ||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  2279984 gagttgaaccttggggtcgtaatgaagattatttatgatatcaatgatgatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 2280083  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    | ||||| | |||| |||| ||||   || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  2280084 ttttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttg 2280182  T
Q  200 ctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
     || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  2280183 ttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275175
Alignment:
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 24275222  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24275221 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 27847699 - 27847951
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27847699 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataat 27847798  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||   ||| ||||||||||||||    
T  27847799 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgc 27847894  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || || |||||||||||||||| |||| ||| |||||| || |||||||||||||||    
T  27847895 tgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16410219 - 16410059
Alignment:
Q  92 tgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 191  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  16410219 tgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 16410121  T
Q  192 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16410120 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 3386495 - 3386333
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3386495 tgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 3386396  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  3386395 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24704847 - 24704688
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||||||    
T  24704847 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatact 24704751  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24704750 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Original strand, 17061866 - 17062077
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  ||||||||||    
T  17061866 ttaataatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgaga 17061964  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17061965 cgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttt-gtatactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 17062062  T
Q  239 tgatgaagatgatga 253  Q
    |||| ||||||||||    
T  17062063 tgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67745
Alignment:
Q  133 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  232 tctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13869469 - 13869346
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13869469 ataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||| ||||||||||    
T  13869370 cggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13831495 - 13831373
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13831495 ataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactacc-gtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 13831397  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||    
T  13831396 ggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 38898376 - 38898535
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  38898376 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatac 38898475  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    || || ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  38898476 tg-ctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 73 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20110724 - 20110556
Alignment:
Q  73 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 172  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110724 gttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtca 20110626  T
Q  173 tgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || |||||| |||||           ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20110625 tgctgtttttgtata-----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200786
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005650
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  18005669 ctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072913
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 256
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505419
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Original strand, 12756622 - 12756797
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| || |   || ||||||||||    
T  12756622 ttaatgatgatctgtgatgctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgaga 12756720  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa 217  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  12756721 cgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattg-ttgtgttgctgttgttatttaactaa 12756797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16495517 - 16495402
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16495517 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16495419  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  16495418 gttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 252
Target Start/End: Original strand, 811142 - 811248
Alignment:
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  811142 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 811240  T
Q  245 agatgatg 252  Q
     |||||||    
T  811241 tgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47831925 - 47831807
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| | | | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  47831925 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatat-gcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 47831827  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  47831826 gttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 44014291 - 44014182
Alignment:
Q  143 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44014291 tgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 44014193  T
Q  242 tgaagatgatg 252  Q
    ||| |||||||    
T  44014192 tgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 19486649 - 19486865
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||   ||  || ||||||    
T  19486649 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgaga 19486748  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||| | |  ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||| |||||||| || ||||    
T  19486749 tgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19486848 cgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 137 - 252
Target Start/End: Original strand, 16219719 - 16219834
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  16219719 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtcta 16219817  T
Q  236 agttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||| || |||||||    
T  16219818 agttgaagatgatgatg 16219834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 190
Target Start/End: Original strand, 26355983 - 26356083
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26355983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26356082  T
Q  190 g 190  Q
    |    
T  26356083 g 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 90 - 190
Target Start/End: Original strand, 26358435 - 26358535
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  26358435 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatact 26358534  T
Q  190 g 190  Q
    |    
T  26358535 g 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 11996033 - 11996148
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11996033 gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagtt 11996131  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  11996132 gttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 15754893 - 15755008
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  15754893 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 15754991  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  15754992 gttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 241
Target Start/End: Original strand, 1867895 - 1868101
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataat 134  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||| ||| ||||   || ||  |    
T  1867895 atgatattaatgatgatctgtgaagctttttaagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtt 1867993  T
Q  135 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 231  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| ||||||||     
T  1867994 tgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcgg 1868091  T
Q  232 tctaagttga 241  Q
    ||||||||||    
T  1868092 tctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056343
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  233 ctaagttga 241  Q
    |||||||||    
T  16056351 ctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15211633 - 15211484
Alignment:
Q  80 ttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||||  | | |||| |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||||||||||||    
T  15211633 ttgattatgatgtgatataatgttgtatacatcgcttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgtt 15211535  T
Q  180 ttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
     | || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  15211534 gttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 15008398 - 15008594
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| |||| ||   ||      
T  15008398 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattat-atatgatgt 15008496  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15008497 ttgaggtgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 15008594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Original strand, 10063817 - 10063939
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||  |    
T  10063817 ttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagt 10063915  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| | ||||| || ||||||    
T  10063916 ctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255887
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||| ||||   || ||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  174 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    ||  || ||| | |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  12255830 gaattgattt-gcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12255887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 14932685 - 14932851
Alignment:
Q  87 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 185  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  14932685 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 14932784  T
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  14932785 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 15356120 - 15356286
Alignment:
Q  87 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 185  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15356120 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15356219  T
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15356220 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 252
Target Start/End: Original strand, 15360234 - 15360400
Alignment:
Q  87 tgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgac-ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgta 185  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  | | |||| ||| || |  |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||    
T  15360234 tgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaaagtgttgttgaaattgcaattgatattattatgtcatgctattgttgta 15360333  T
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
      || |||||| | || ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  15360334 atctacctatgctactattgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 250
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154956
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Original strand, 2530140 - 2530208
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  2530140 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtatgttgcctatgttgctgttgtt 2530208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 15113125 - 15113031
Alignment:
Q  73 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 168  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||   ||||||||||||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113125 gttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 237
Target Start/End: Original strand, 20220194 - 20220290
Alignment:
Q  143 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20220194 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12901431 - 12901338
Alignment:
Q  150 ttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  12901431 ttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga 12901338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12187019
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  12187083 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138177
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  17138113 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  193 tatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044761
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354791
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16466 - 16721
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16466 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattatagtctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataat 16565  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16566 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgc 16665  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16666 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4762 - 4508
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4762 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 4663  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||    
T  4662 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgc 4563  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  4562 tgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12344 - 12090
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12344 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 12245  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||    
T  12244 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgc 12145  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  12144 tgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22296 - 22042
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22296 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 22197  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | ||||||    
T  22196 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgc 22097  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  22096 tgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39729 - 39479
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39729 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 39630  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  39629 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttg 39531  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  39530 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 254
Target Start/End: Original strand, 75083 - 75333
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75083 gttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 75182  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  75183 tatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgttg 75281  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  75282 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 17081 - 17337
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17081 gagttaaaccttggggtagtattgagacttaatcatgatgttaattataatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 17180  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg--ttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    |||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||    
T  17181 gttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgtt 17280  T
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17281 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 237
Target Start/End: Original strand, 79235 - 79430
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||    
T  79235 ttaatgatgatcagtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 79333  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  79334 cgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtc-gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 249
Target Start/End: Original strand, 25935 - 26179
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25935 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtta 26034  T
Q  105 taagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt 204  Q
     | ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26035 aacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 26134  T
Q  205 gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26135 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44825
Alignment:
Q  110 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  210 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 33361 - 33491
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctatgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 33460  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtat 131  Q
    |||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  33461 gttaaacgcattacttgaattatgaatgtat 33491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22337370 - 22337115
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337370 gagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataat 22337271  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||| ||||||    
T  22337270 gttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgc 22337171  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22337170 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23660277 - 23660023
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660277 gagttgaaccttggggtagtattgagacttattgatgatgttaattataatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 23660178  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  23660177 gttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgc 23660079  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23660078 tgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23060764 - 23060513
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060764 ttgaactttggggtagtattgggacttaatgatgatgttaattataat-tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 23060666  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt 203  Q
    ||  |||||||||||  ||| |||  ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  23060665 atgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgt 23060566  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23060565 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23076697 - 23076442
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076697 gagttgaactttggggtagtattgggattttatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 23076598  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23076597 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 23076498  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23076497 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 22731102 - 22731355
Alignment:
Q  4 ttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731102 ttgaaccttgggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 22731201  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    |||  |||||||||||   ||  ||| ||| || | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22731202 tatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg 22731301  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22731302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23286116 - 23285865
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23286116 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 23286017  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   |   ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||    
T  23286016 gttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgc 23285921  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23285920 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 22738049 - 22738300
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738049 ttgaaccttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 22738148  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt 203  Q
    ||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||  |||    
T  22738149 atgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgt 22738247  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22738248 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 23654252 - 23654507
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23654252 gagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataat 23654351  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||||| ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||     
T  23654352 gttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgt 23654451  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23654452 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 37982 - 38235
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37982 gagttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataat 38081  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | ||||| || ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38082 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 38179  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38180 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 253
Target Start/End: Original strand, 298686 - 298933
Alignment:
Q  7 aaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttata 106  Q
    |||||| |||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||    
T  298686 aacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgtttta 298785  T
Q  107 agcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttg 205  Q
     ||||||||||||   |  ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  298786 tgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttg 298885  T
Q  206 ttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  298886 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22105575 - 22105412
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  22105575 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatact 22105476  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22105475 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20309360 - 20309108
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20309360 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataat 20309261  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  20309260 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgc 20309165  T
Q  201 t-gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  20309164 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18809105 - 18808943
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18809105 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 18809006  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  18809005 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23131024 - 23130862
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23131024 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23130925  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23130924 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23133491 - 23133329
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23133491 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23133392  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23133391 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 23709532 - 23709694
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23709532 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23709631  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23709632 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 23712013 - 23712175
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23712013 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23712112  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23712113 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26505541 - 26505379
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26505541 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26505442  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26505441 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26508019 - 26507857
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  26508019 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatact 26507920  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26507919 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 34402522 - 34402684
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  34402522 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 34402621  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34402622 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 39682475 - 39682313
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39682475 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 39682376  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39682375 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 32214921 - 32215085
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32214921 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32215020  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  32215021 g-ctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 571559 - 571397
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  571559 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 571460  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  571459 gt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6726157 - 6725995
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6726157 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 6726058  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  6726057 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23135752 - 23135590
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23135752 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23135653  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  23135652 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24367936 - 24367774
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24367936 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24367837  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  24367836 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Original strand, 21155060 - 21155219
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  21155060 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 21155159  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21155160 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 24898195 - 24898358
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24898195 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24898294  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24898295 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 24900678 - 24900841
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24900678 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24900777  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24900778 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 24903155 - 24903318
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24903155 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24903254  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24903255 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 24905632 - 24905795
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24905632 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24905731  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24905732 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 24908107 - 24908270
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  24908107 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 24908206  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaact-aagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  24908207 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 32039498 - 32039660
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32039498 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 32039597  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  32039598 g-ttgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 43137461 - 43137301
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  43137461 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 43137362  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  43137361 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 28577261 - 28577099
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  28577261 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 28577162  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28577161 g-ttgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 45029854 - 45030016
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    ||||||||||   |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  45029854 tgtgatataaatgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 45029953  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45029954 g-ttgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 256
Target Start/End: Original strand, 23103348 - 23103516
Alignment:
Q  87 tgatgtgatataatgttataa--gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgt 184  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||| ||||||||| || |||||||| |||||  ||    
T  23103348 tgatgtgatataatgtt-taattgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gt 23103444  T
Q  185 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  23103445 atactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 23708485 - 23708738
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||| ||| |||   ||  | ||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23708485 agttgaaccttggggtcgtaatgaagattgtttatgatattaatgatgatctgtgaagctgttataagatgaattgatgttgtttataatgtgatataat 23708584  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
      |||| ||||||||||| ||||  ||| ||  ||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  23708585 tgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgc 23708683  T
Q  201 tgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | | ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  23708684 tatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27753830 - 27753730
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753830 gagttgaagcttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatatgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 27753731  T
Q  101 g 101  Q
    |    
T  27753730 g 27753730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19672043 - 19671830
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  19672043 ttaatgataatctgtgaagctgatctatgatga-ttgatgttg-ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgaga 19671947  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  19671946 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  19671847 cgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 253
Target Start/End: Original strand, 24529569 - 24529691
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24529569 ataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-atgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtc 24529667  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | ||||||||||| ||||||||||    
T  24529668 ggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405981
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgat 251  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  28405999 ctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 38967537 - 38967374
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||     
T  38967537 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatat 38967438  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||  | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  38967437 tgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175854
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25175873 ctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8946730 - 8946657
Alignment:
Q  183 gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8946730 gtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 22799063 - 22799243
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  22799063 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgccttacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 22799162  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||| | ||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||  |||||||||    
T  22799163 atgatgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatg 22799243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 23019643 - 23019823
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  23019643 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 23019742  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||| |||| | ||   ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23019743 atgttgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23019823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  193 tatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 237
Target Start/End: Original strand, 32451799 - 32452031
Alignment:
Q  5 tgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataatgtt 103  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | |   |||| ||||||||| |||||||||||| ||||     
T  32451799 tgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgggatgttaatgttgatttatgatgtgatattatgt- 32451896  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||| |||||||||||  | | | || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||| | |||| | || |||||||||||||||    
T  32451897 atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctg 32451995  T
Q  203 -ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
     ||| | |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  32451996 tttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 130 - 255
Target Start/End: Original strand, 22134203 - 22134326
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||| |||| | |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22134203 ataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtc 22134300  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | |||| | |||||| ||||||||||    
T  22134301 ggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7679702 - 7679589
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  7679702 gatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 7679605  T
Q  237 gttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||| |||||||||    
T  7679604 gttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 158 - 256
Target Start/End: Original strand, 23071972 - 23072070
Alignment:
Q  158 gatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  23071972 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25616333 - 25616192
Alignment:
Q  108 gcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||   |||  ||||||||| |||| ||||     
T  25616333 gcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgta 25616234  T
Q  208 atttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    ||||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  25616233 atttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 25616192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 226
Target Start/End: Original strand, 7687 - 7824
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||    
T  7687 atgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatac 7785  T
Q  189 tgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatga 226  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  7786 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207296
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  23207302 gtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  195 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Original strand, 24642856 - 24642933
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattatta 167  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24642856 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 20520092 - 20520295
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||| | | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  20520092 atgatattaatgataatctgtgaagttgttataagatgatttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgt 20520190  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  20520191 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 20520288  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  20520289 gtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 18786907 - 18787009
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  || ||| | ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18786907 gttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggttt-gcatactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18787005  T
Q  238 ttga 241  Q
    ||||    
T  18787006 ttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 237
Target Start/End: Original strand, 22413035 - 22413240
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | || |||||||||||   |||| ||||||| ||| ||||  || |        
T  22413035 atgatattaatgttaatctgtgaagctgttataagatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat--ttatgatg 22413132  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatat--tattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||||||  ||||||  |||||||||||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||    
T  22413133 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagt 22413231  T
Q  229 cgatctaag 237  Q
    || ||||||    
T  22413232 cggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23004872 - 23004774
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  | |||  | |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  23004872 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23004774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 160
Target Start/End: Original strand, 22459500 - 22459587
Alignment:
Q  73 gttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgat 160  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22459500 gttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23791397 - 23791292
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||| || ||| |  |||||||||||  ||||||||    
T  23791397 ttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcg 23791299  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  23791298 gtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 72 - 144
Target Start/End: Original strand, 22758652 - 22758725
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg 144  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  22758652 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 22758725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 175
Target Start/End: Original strand, 24697604 - 24697645
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  24697604 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatga 24697645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 72 - 147
Target Start/End: Original strand, 22740897 - 22740973
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 147  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||| |||||||||||    
T  22740897 tgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 52168 - 51913
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  52168 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataat 52069  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  52068 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgc 51969  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51968 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 167845 - 168099
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  167845 gagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataat 167944  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||     
T  167945 gtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgt 168043  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  168044 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 253
Target Start/End: Original strand, 339818 - 340065
Alignment:
Q  3 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339818 gttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgacgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgt 339917  T
Q  103 tataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||    
T  339918 tatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgttg 340015  T
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
     |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  340016 -tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Original strand, 158450 - 158612
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  158450 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 158549  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  158550 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 71418 - 71350
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
    |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  71418 agatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgttt--gtatgctgcctatgttgctgttgtt 71350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39015 - 38761
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39015 gagttgaaccttggggtagtattaagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 38916  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38915 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgc 38817  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38816 tattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 33158 - 32942
Alignment:
Q  39 tgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgag 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||    
T  33158 tgttgattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaag 33059  T
Q  139 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  33058 atgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaact 32960  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  32959 tgatgaagatgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 130 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9871 - 9744
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9871 ataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 9773  T
Q  230 gatctaagttgatgaagatgatgatgtcc 258  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9772 ggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26150 - 25896
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26150 gagttgaaccttggggtagcattgagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 26051  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||| | |||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26050 gttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgc 25952  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25951 tattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40111 - 39858
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40111 gagttgaaccttggg-tagcattgagacttaatgaggatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataat 40013  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||| | |||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  40012 gttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatatttt-gtatactgcctatgttgc 39914  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39913 tattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23137 - 22886
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23137 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttatttataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataat 23038  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||    
T  23037 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgc 22939  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22938 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13465 - 13211
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13465 agttgaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 13366  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgct 201  Q
    ||||| |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13365 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 13266  T
Q  202 gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13265 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40167 - 39913
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40167 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 40068  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| ||   ||| || ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40067 gttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgc 39969  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  39968 tattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Original strand, 19883 - 19987
Alignment:
Q  135 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcga 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||     
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  232 tctaag 237  Q
    ||||||    
T  19982 tctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2106 - 1851
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2106 gagttgaaccttgggatagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 2007  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  2006 gttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgc 1907  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1906 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3722 - 3470
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 103  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3722 ttgaactttggggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgtt 3623  T
Q  104 ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgt 203  Q
    ||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3622 atttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgcttt 3523  T
Q  204 tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
     ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3522 agttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 597 - 343
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgaggatgttaattataatatatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 498  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| || | ||| || ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||      
T  497 gttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctatttt-gtatactgcctatgttat 399  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  398 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 255
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  52 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgactt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  152 gcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgat 251  Q
     |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3302  T
Q  252 gatg 255  Q
    ||||    
T  3303 gatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 8398 - 8650
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttgggg-tagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8398 gagttgaacgttgggggtagtattgggacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa 8497  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  8498 tgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttg 8596  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8597 c---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28085 - 27912
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataacctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataat 27986  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 174  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27985 gttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 8730 - 8479
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  8730 gagttgaaccttggagtagtattaagacttaatgatgatgttaattacaatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taat 8635  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||   ||| ||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  8634 gttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgc 8535  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8534 tattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 5987 - 6245
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5987 gagtggaaccttgggatagcattaagacttaatgatgatgttaattataaaatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 6086  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgccta---tgt 197  Q
    |||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||   |||    
T  6087 gttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgt 6186  T
Q  198 tgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6187 tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 915 - 1169
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  915 gagttgaacctttgggtagcattaagacttaatgaagaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataat 1014  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||     
T  1015 gtt-tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgt 1113  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1114 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5080 - 4849
Alignment:
Q  25 agacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatg 124  Q
    ||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   |     
T  5080 agacttaatgaaggggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaatta 4981  T
Q  125 attgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtat 224  Q
     ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4980 tttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcat 4881  T
Q  225 gagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4880 gagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13347 - 13144
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13347 gagttgaactttggggtagtattgggacttaatgaagatgttaattataatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataat 13248  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||  |||||||||||  ||| |||| ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13247 gttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgc 13148  T
Q  201 tgtt 204  Q
    ||||    
T  13147 tgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34238 - 34123
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34238 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagtt 34140  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  34139 gttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 273
Alignment:
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 45 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16323 - 16113
Alignment:
Q  45 ttataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgtt 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |    
T  16323 ttataatctgtgaagctgttttaagatgt--tgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgat 16226  T
Q  144 gttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatg 243  Q
    |||| ||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16225 gttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 16126  T
Q  244 aagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||    
T  16125 aagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 32825 - 33077
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||    
T  32825 gagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataa 32922  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||| || | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  32923 tgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttg 33020  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33021 ctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 46180 - 45928
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatg-tgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| |  || || |||||||||| |||||||| |||||    
T  46180 gagttgaaccttggggtagtattgaaacttattgaaggtgttagttataatctgtgaagctatttta--tgatgctgatgttgatcatgatgtgttataa 46083  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||| || | ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  46082 tgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctgtgttg 45985  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45984 ctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  195 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 3424 - 3588
Alignment:
Q  30 taatgatgatgttaattataatctgtgaagctgttt-aagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattg 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  3424 taatgatgatgttaattataatctatgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtg 3523  T
Q  129 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcct 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3524 tataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 24167 - 24406
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttg-attatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24167 gagttgaactttgggatagtattaagacttattgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataa 24266  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt-tttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||||||  |||||||||||   ||  ||| ||| || |||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  24267 tgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgtt 24366  T
Q  199 gctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24367 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21166 - 20910
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21166 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagatgttaattataacctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataat 21067  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||    |   ||| |||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||    
T  21066 gttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgc 20967  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||    
T  20966 tgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32319 - 32067
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  32319 gagttgaacccttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataat 32220  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||    
T  32219 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgc 32123  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32122 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2207 - 1952
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||| ||| ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  2207 gagttgaacctttgggtaggattaagacttaatgataaggttattaataatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataat 2108  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||    
T  2107 gttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgc 2008  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  2007 tgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13750 - 13497
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  13750 gagttgaacctttcggtaggattaagacttaacaatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataat 13651  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| | | | |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13650 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgc 13553  T
Q  201 tgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  13552 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 829 - 1021
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  829 gagttgaaccttgaggtagtattgagacttaatggtgatgctatttatgatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataat 928  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgt 197  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||    
T  929 gttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt---gtatactgcctatgt 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 256
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4712
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4965 agttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 4866  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgct 201  Q
    || || || ||||||||   ||  |||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  4865 tt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 4767  T
Q  202 gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4766 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 1
Alignment:
Q  2 agttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg 101  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  189 agttgaacctttgggtaggattaagacttaacaatgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatg 90  T
Q  102 ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgc 191  Q
    || || || ||||||||   ||  |||||||  | |||| ||| ||| ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  89 tt-tatgccttacttgaagaatatttgtatacataagattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 10292 - 10544
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  10292 gagttgaacccttgggtagaattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataat 10391  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    | | || |||||||||||   ||  ||||||| || |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  10392 gat-tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgc 10487  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10488 tgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 15344 - 15584
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcatta 113  Q
    |||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  15344 gggtaggattaagacttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatt-tatgcatta 15442  T
Q  114 cttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaa 213  Q
    |||||   ||  || ||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15443 cttgaagaatatttttatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaa 15541  T
Q  214 ctaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  15542 ctaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7295
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  7359 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16534 - 16282
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||  | |||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16534 gagttgaacgcttgggtaggattaagacttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataat 16435  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  16434 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgc 16339  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || || |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  16338 tgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 124840 - 124723
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124840 gagttgaaccttgggatagcattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 124741  T
Q  101 gttataagcattacttga 118  Q
    |||||| |||||||||||    
T  124740 gttatatgcattacttga 124723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 174943 - 174767
Alignment:
Q  78 tgttgattatgatgtgatataatgtt-ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgat 176  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||| |    
T  174943 tgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgct 174844  T
Q  177 gttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  174843 gtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 187 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 136370 - 136471
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||    
T  136370 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 136468  T
Q  235 aag 237  Q
    |||    
T  136469 aag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Original strand, 145078 - 145179
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||||| || |||||||| |||    
T  145078 gatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-gtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtct 145176  T
Q  235 aag 237  Q
    |||    
T  145177 aag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1541 - 1289
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  1541 gagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataat 1442  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  1441 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgc 1346  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  1345 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7518 - 7266
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||| ||| | |||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  7518 gagttggacccttgggtaggattaagacttaagaatgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataat 7419  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||     
T  7418 gtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgtt---gtatactgcctatgttgt 7323  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  7322 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 253
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10935 - 10772
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10935 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatact 10836  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  10835 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4856 - 4694
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4856 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4757  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  4756 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20909 - 20747
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20909 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20810  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20809 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 37983 - 37821
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  37983 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 37884  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37883 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28414
Alignment:
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28433 gttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11292
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2112 - 1997
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2112 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2014  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  2013 gttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4552
Alignment:
Q  203 ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 94573 - 94411
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  94573 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 94474  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  94473 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Original strand, 17440 - 17598
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17440 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17539  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17540 g-ctgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44454
Alignment:
Q  93 gatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgc 191  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactg- 44516  T
Q  192 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44515 ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 100496 - 100378
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  100496 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 100398  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  100397 ctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40291
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  40272 ctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Original strand, 38394 - 38596
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  38394 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 38492  T
Q  149 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagat 248  Q
      || | |||||||||  | |||||| |||| | ||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| |||||    
T  38493 aatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagat 38592  T
Q  249 gatg 252  Q
    ||||    
T  38593 gatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Original strand, 23581 - 23679
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  23581 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16995 - 16784
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  |||||| || ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |  ||||||||||    
T  16995 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgatg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgaga 16897  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16896 cgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact-actgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4778 - 4545
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4778 gagttgaaccttgaggtagtattgagacttattgaagatgttaattataatttgtgaggctgttttaaga--tgttgatgttgatcatgatgtgatataa 4681  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    |||  || |||||||||||  ||| | || ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| || || || || | | | |||||||||||| ||    
T  4680 tgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctg 4581  T
Q  200 ctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
     |||||||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  4580 ttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 13554 - 13392
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13554 tgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13455  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  13454 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 14109 - 13947
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14109 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14010  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14009 g-ttgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 10418 - 10323
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10418 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaataatgatgttaataataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgata 10323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 136842 - 136680
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  136842 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 136743  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  136742 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 139311 - 139149
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  139311 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 139212  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  139211 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 144249 - 144087
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  144249 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 144150  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  144149 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 134373 - 134211
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  134373 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 134274  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  134273 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 141780 - 141618
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  141780 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatact 141681  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  141680 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 62317 - 62200
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||||||||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |    
T  62317 ttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 62222  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
     ||||| || || |||||||||    
T  62221 ttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132662
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagt 228  Q
    |||||||||| |||| ||| || |||| |||||| || | |||||||| ||| | ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  229 cgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    || |||||| |||||| |||||||    
T  132685 cggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 90 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 501246 - 501088
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  501246 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatatt 501147  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  501146 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 85539 - 85742
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||| ||| |||| |||    
T  85539 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattg 85637  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||    
T  85638 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaaga 85736  T
Q  248 tgatga 253  Q
    ||||||    
T  85737 tgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160688
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||   ||||| ||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttg-atatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 918 - 1170
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| || |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  918 gagttgaacccttgggtaggattaagtcttaagaatgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataat 1017  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||     
T  1018 gtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttga 1113  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || || ||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  1114 tgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9404 - 9241
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  9404 tgtgatataattatatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatact 9305  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgat 254  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  9304 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6865 - 6669
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  6865 gagttgaacctttgggtaggattaagatttaatgataaggttatttataatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataac 6766  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgt 197  Q
    ||| || ||||||||||| | ||| ||| ||| || |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  6765 gttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgt 6669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 82234 - 82072
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  82234 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 82135  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  82134 -actgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||| ||| | |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 110 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116430
Alignment:
Q  110 attacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttat 209  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactg-ttgtgtcgctgttgttat 116474  T
Q  210 ttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  116473 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 128968 - 129072
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  128968 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcg 129065  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  129066 gtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 78445 - 78348
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  78445 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 78348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 116631 - 116579
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgt 92  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  116631 ttaatgataatctgtgaagctgttttaggatatgttaatgttgattatgatgt 116579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 237
Target Start/End: Original strand, 20328 - 20524
Alignment:
Q  38 atgttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattg 136  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||  |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||    
T  20328 atgttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgtt--ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 20425  T
Q  137 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20426 agacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactg-atgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 128917 - 128751
Alignment:
Q  89 atgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||  ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |      
T  128917 atgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-tttttt 128819  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |   | ||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||||| ||||| |||||||||||||    
T  128818 tttttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11286
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| | ||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11450 tgtgatataattatatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 11351  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  11350 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 268 - 106
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  268 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 169  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  168 -attgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 40562 - 40400
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| || |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  40562 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatact 40463  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40462 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1051
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1169 gagttgaacttttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataat 1070  T
Q  101 gttataagcattacttgag 119  Q
    ||| || ||||||||||||    
T  1069 gttttatgcattacttgag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 255
Target Start/End: Original strand, 12249 - 12413
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  12249 tgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattct 12348  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatg 255  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  12349 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51821 - 51582
Alignment:
Q  14 gggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcatta 113  Q
    |||||| ||| ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||     
T  51821 gggtaggattaagacttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtt-tatgcattt 51723  T
Q  114 cttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttattta 212  Q
    |||||   ||  |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51722 cttgaaggatatttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgctgtttgttattta 51626  T
Q  213 actaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  51625 actaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 161049 - 161252
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||    
T  161049 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatattg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 161147  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||    
T  161148 acttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactg-ctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaaga 161246  T
Q  248 tgatga 253  Q
    ||||||    
T  161247 tgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 173
Target Start/End: Original strand, 164550 - 164674
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || ||||||||||||||| |||    
T  164550 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattg 164648  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  164649 acttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4459 - 4300
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4459 tgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 4360  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  4359 ac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 4997 - 5246
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataat 100  Q
    |||||||||| | |||||| ||| ||| ||||| || | |||||||||||| |||||| |||  ||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  4997 gagttgaacccttgggtaggattaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataat 5096  T
Q  101 gttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgc 200  Q
    ||| ||  ||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||     
T  5097 gtt-tatacattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgtt---gtataatacctatgttga 5192  T
Q  201 tg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  5193 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12220 - 12064
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  12220 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatact 12121  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | || ||||||||      ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12120 g-ctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3736 - 3640
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3736 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 3640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7800 - 7704
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatat 97  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7800 gagttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaagaggctaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatat 7704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 241
Target Start/End: Original strand, 27663 - 27855
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||| || ||||   || ||  |||||||||||||||    
T  27663 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttga 27762  T
Q  149 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  27763 tttacatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6535
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgtt--ataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  8550 atgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Original strand, 2088 - 2291
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttg 147  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||  |||    
T  2088 atctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattg 2186  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaaga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |    
T  2187 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactg-ttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaa 2285  T
Q  248 tgatga 253  Q
    ||||||    
T  2286 tgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 256
Target Start/End: Original strand, 17932 - 18148
Alignment:
Q  41 ttaattataatctgtgaagctg-tttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgaga 139  Q
    ||||| || ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||| ||||||    
T  17932 ttaatgatgatctgtgaagctgatttatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgaga 18031  T
Q  140 tgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||    
T  18032 tgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgt-gcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
     | |||||||| ||||||    
T  18131 cgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 46 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 47202 - 46995
Alignment:
Q  46 tataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgt 145  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||    ||  |||||||  | ||||||||     
T  47202 tataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtt-tatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttga 47104  T
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||||||| || |   ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||| || |||    
T  47103 tgaattgaaattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttga 47007  T
Q  245 agatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||    
T  47006 agatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 90 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4214
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  4377 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatac 4278  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    ||| | ||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4277 tgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11646 - 11464
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  11646 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 11547  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  11546 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 256
Target Start/End: Original strand, 38195 - 38377
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||  || ||||||||||||| |||| | |  ||||||||||| ||||    
T  38195 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcat 38294  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||| ||||||    
T  38295 gatgtttt-gcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19268
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  19287 ctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 139 - 256
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  139 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagt 238  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 11546  T
Q  239 tgatgaagatgatgatgt 256  Q
    || ||||||||| |||||    
T  11547 tgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 11379 - 11450
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgt 72  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11379 gagttgaacctttgggtagaattaagacttaatgatgaggttaattataatctgtgaagctgattaacatgt 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30094 - 29946
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatact 189  Q
    |||||||||||  |||| | |||| |||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  30094 tgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 29995  T
Q  190 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29994 g-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 241
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2923
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||| |||||| |||||||    
T  2904 ctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45909
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||  ||||  ||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttg-ataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 130086 - 129917
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  130086 ttgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 129988  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  129987 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatga 129917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 230
Target Start/End: Original strand, 60614 - 60811
Alignment:
Q  35 atgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataa 133  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || |||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || ||      
T  60614 atgatattaatgataatctgtgaagctgttataaaatgatttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgt 60713  T
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  60714 ttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgtttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 60811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 241
Target Start/End: Original strand, 16014 - 16206
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||    | ||  |||||||||||||||    
T  16014 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttga 16113  T
Q  149 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttga 241  Q
     || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16114 tttacatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 13336 - 13147
Alignment:
Q  50 atctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattg-agatgttgttg 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||  |||||||||||    
T  13336 atctgtgaagctgttataagatgatttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttg 13237  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    | |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  13236 atttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 17856 - 17929
Alignment:
Q  4 ttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 77  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17856 ttgaacctttgggtagtattaagacttaatgaggatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttga 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15664
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  240 gatgaagatgatga 253  Q
    ||| ||||||||||    
T  15677 gattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 167 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1339
Alignment:
Q  167 atgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||| ||||| | |||  |||||||||||||| |||||| ||||  ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  1424 atgtcataatgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 90 - 250
Target Start/End: Original strand, 1280 - 1440
Alignment:
Q  90 tgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatac 188  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||| ||||   || |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1280 tgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 1379  T
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatga 250  Q
    | | | ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1380 t-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 74 - 253
Target Start/End: Original strand, 38641 - 38820
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||  |||| ||| ||||||| ||||   |  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38641 ttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcat 38740  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatga 253  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  38741 gttgtttt-gcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 310 - 133
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||  ||||  |||||| ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||    
T  310 ttgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 212  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  211 gatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 256
Target Start/End: Original strand, 6134 - 6244
Alignment:
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  6134 tgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 6232  T
Q  245 agatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||    
T  6233 agatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Original strand, 51750 - 51985
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgatt-atgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |  ||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||  | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  51750 gagttgaaccttggggtagcattaagacttgaatatgatattaattacaatttgtgaagctgtt-atgagatattaatgttgatttatgatgtgatataa 51848  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgtt 198  Q
    ||| ||| |||||||||||  | | | || |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| | || ||||||||||     
T  51849 tgt-atacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt- 51945  T
Q  199 gctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    |||||| | | ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51946 gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32538
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||||||  |||||||||||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14814
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  14795 ctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5655
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatg-ttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcga 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||     
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc--atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcgg 5668  T
Q  232 tctaagttgatga 244  Q
    |||||||||||||    
T  5667 tctaagttgatga 5655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 53488 - 53640
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53488 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 53587  T
Q  174 gatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatga 226  Q
    | |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  53588 gttgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 1075 - 1190
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  1075 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 1173  T
Q  240 gatgaagatgatgatgt 256  Q
    | |||||||||||||||    
T  1174 gttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 256
Target Start/End: Original strand, 15788 - 15898
Alignment:
Q  146 tgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatga 244  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  15788 tgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15886  T
Q  245 agatgatgatgt 256  Q
    ||||||||||||    
T  15887 agatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178898
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6719 - 6611
Alignment:
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 246  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  6719 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 6621  T
Q  247 atgatgatgt 256  Q
    ||||||||||    
T  6620 atgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14099 - 13991
Alignment:
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 246  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  14099 acttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 14001  T
Q  247 atgatgatgt 256  Q
    ||||||||||    
T  14000 atgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1155
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||||| | | | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1037 gatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1135  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  1136 gttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaa 12786  T
Q  237 gttgatgaagatgatgatgt 256  Q
    ||||||||  ||||||||||    
T  12785 gttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 2644 - 2762
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||  ||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  2644 ttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttac-atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2742  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  2743 ctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24048 - 23843
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||  ||||| || || |||||||||||| ||     
T  24048 aatctgtgaagctgtt-aagagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgttaatttcattacttgaactatgaatgaatgattgagatgttgctgt 23950  T
Q  149 cttgcatttgatattattat-----gtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatg 243  Q
     ||  |||||||||| ||||     |||||  |||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||     
T  23949 ttt--atttgatattgttatatgatgtcatactgttgttgtaatctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatc 23852  T
Q  244 aagatgatg 252  Q
    |||||||||    
T  23851 aagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Original strand, 16264 - 16442
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttga 148  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  16264 aatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttga 16362  T
Q  149 cttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
      |  | |||||||||| | ||||||||||| | || ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  16363 aat-taattgatattatgaagtcatgatgttgttgtgata-tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1051
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1154 ttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1056  T
Q  233 ctaag 237  Q
    |||||    
T  1055 ctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12690 - 12587
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  |||||||| |    
T  12690 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggt 12592  T
Q  233 ctaag 237  Q
    |||||    
T  12591 ctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10542
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  233 ctaagttga 241  Q
    |||||||||    
T  10550 ctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1086
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgat 232  Q
    |||| |||||| |||| || ||| |||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1204 ttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 1106  T
Q  233 ctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||| |||| ||||    
T  1105 ctaagttgattaagaagatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Original strand, 23898 - 24000
Alignment:
Q  150 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagat 248  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || |||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgaagatgat 23996  T
Q  249 gatg 252  Q
    ||||    
T  23997 gatg 24000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6927 - 6824
Alignment:
Q  141 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagtt 239  Q
    |||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |    
T  6927 gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagat 6829  T
Q  240 gatga 244  Q
    |||||    
T  6828 gatga 6824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8090
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttt 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 20658 - 20595
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt 64  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20658 gagttgaaccttggaatagcattaagacttaatgatgatgttaactataatctgtgaagctgtt 20595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 8075 - 8180
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||  || ||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  8075 gatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggttt-gtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtct 8173  T
Q  235 aagttga 241  Q
    |||||||    
T  8174 aagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12943
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatctaa 236  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa 12959  T
Q  237 gttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||| || |||||||    
T  12958 gttgaagatgatgatg 12943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 225662 - 225465
Alignment:
Q  1 gagttgaaccttggggtagtattgagacttaatgatgatgttaattataatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||  |||   |||   ||||| ||||| || | ||||||||||| | || ||||  ||||||||| |||| |||||||||||    
T  225662 gagttgaaccttggggtagttatgaagattatatatgatattaataatgaactgtgaagctgatatatgatgatttgatgttgtttataatgtgatataa 225563  T
Q  100 tgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    |  |||| ||||||||||| ||||   || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| | |||||| ||||||||    
T  225562 ttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgtttt-gcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 252
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 74 - 235
Target Start/End: Original strand, 7998 - 8161
Alignment:
Q  74 ttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 173  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||   || ||  || |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  7998 ttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcat 8097  T
Q  174 ga--tgttttcgtatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||  || ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||    
T  8098 gagctgattt-gcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38440 - 38342
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  38440 ttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcg 38342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 4741 - 4921
Alignment:
Q  72 tgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 171  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||    ||||||| || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | |||||||||| | |||    
T  4741 tgttaatgttgaatatgatgtgatataacgttatgtatattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtc 4840  T
Q  172 atgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    | | |||| | ||   ||||||||| |||| || ||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  4841 aagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 4921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 6281 - 6386
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  6281 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttt-atatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcg 6379  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  6380 gtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25229 - 25121
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||    
T  25229 ttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgtttta-tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 25132  T
Q  231 atctaagttga 241  Q
     ||||||||||    
T  25131 gtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Original strand, 15362 - 15486
Alignment:
Q  81 tgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttt 180  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||   |  ||| ||| |  |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15362 tgattataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaattatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt 15461  T
Q  181 tcgtatactgcctatgttgctgttgtt 207  Q
      |||| |||||||||||| |||||||    
T  15462 --gtatgctgcctatgttgatgttgtt 15486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 192920 - 193070
Alignment:
Q  80 ttgattatgatgtgatataatgttataag-cattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgt 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||  | | |||| |||||||||||||||| || ||  |  ||||||| ||||||||||||||    
T  192920 ttgattatggtgtgatataatgttgtaatacatcacttgaagttttattgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgt 193018  T
Q  179 tttcgt-atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtc 229  Q
    | | || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  193019 tgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 199
Target Start/End: Original strand, 2217 - 2281
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  2217 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatcta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10639
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Original strand, 15736 - 15796
Alignment:
Q  192 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 15796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36454
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||| | || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32650 - 32544
Alignment:
Q  38 atgttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattg 136  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||| || || ||||    
T  32650 atgttaattgcaatctgtgaagctgtt-atgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgattg 32552  T
Q  137 agatgttg 144  Q
    ||||||||    
T  32551 agatgttg 32544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 97129 - 97024
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| |    
T  97129 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgg 97031  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  97030 gtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 106407 - 106302
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||| |    
T  106407 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgg 106309  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  106308 gtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  195 tgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13130 - 13092
Alignment:
Q  130 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattat 168  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13130 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 165
Target Start/End: Original strand, 1169 - 1257
Alignment:
Q  77 atgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattat 165  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || || ||| |||| || ||| ||||||||||||  || | ||||||||||    
T  1169 atgttgaatatgatgtgatataatgttatgtgcattatttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattat 1257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 21856 - 21920
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21856 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29812
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  29748 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14728 - 14664
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  14728 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 14664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 23743 - 23679
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  23743 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 23679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 39167 - 39103
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  39167 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtcaatataagatgattaagatgatg 39103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 669 - 569
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||| |||    
T  669 gatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgtttta-tatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 572  T
Q  235 aag 237  Q
    |||    
T  571 aag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 241
Target Start/End: Original strand, 103632 - 103737
Alignment:
Q  138 gatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcgatct 234  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||| |||||||||||| || ||  |||||||||||| || ||||| |||    
T  103632 gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgtttt-ttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtct 103730  T
Q  235 aagttga 241  Q
    |||||||    
T  103731 aagttga 103737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 267784 - 267679
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga--tgttttcgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgtatgagtcg 230  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  |||||||| ||||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||    
T  267784 ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgtttt-atatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcg 267686  T
Q  231 atctaag 237  Q
     ||||||    
T  267685 gtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 27027 - 26828
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtt-taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttgttg 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||   ||  |||||||  | |||||||| ||    
T  27027 aatctgtgaagctgttatgagatgt-ttg-tgttgattatgatgtattataatgtt-tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatg 26931  T
Q  148 acttgcatttgatattattatgtcatgat-gttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaag 246  Q
    | ||| ||| ||||| |||||  |||||| ||| | |||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||||| |||| |||| ||     
T  26930 aattgaatt-gatataattat--catgattgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaa 26834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 29660 - 29558
Alignment:
Q  150 ttgcatttgatattattatgtcatgatgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatg 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | || | |||  || |||||| | || ||||||||||||||||    |||||||  ||||||||||| ||||||    
T  29660 ttgcaattgatattattatgtcatgctattattgtaatctacctatgctactattgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatg 29561  T
Q  250 atg 252  Q
    |||    
T  29560 atg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 175
Target Start/End: Original strand, 1795 - 1836
Alignment:
Q  134 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatga 175  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  1795 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 1836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || ||||||| || |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 69858 - 69794
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcgatctaagttgatgaagatgatg 252  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  69858 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 70000 - 69905
Alignment:
Q  49 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatg-ttataagcattacttgagttatgattgtataattgagatgttg 144  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||  |||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  70000 aatctgtgaagctgtt-atgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttg 69905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 909 times since January 2019
Visitors: 1516