View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0181-16-Insertion-8 (Length: 794)

Name: NF0181-16-Insertion-8
Description: NF0181-16
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0181-16-Insertion-8
NF0181-16-Insertion-8
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (136-794)||(34742-35401)
[»] chr7 (272 HSPs)
chr7 (136-794)||(14396-15055)
chr7 (136-794)||(9009333-9009992)
chr7 (136-794)||(15915995-15916653)
chr7 (138-794)||(14229653-14230311)
chr7 (136-794)||(39387510-39388180)
chr7 (136-794)||(15924304-15924959)
chr7 (136-783)||(35953409-35954058)
chr7 (136-794)||(23076966-23077635)
chr7 (144-794)||(15173591-15174245)
chr7 (136-794)||(18287940-18288609)
chr7 (136-794)||(16330587-16331224)
chr7 (136-794)||(16464823-16465493)
chr7 (136-794)||(18273725-18274394)
chr7 (136-789)||(14581626-14582291)
chr7 (136-794)||(16154674-16155335)
chr7 (265-794)||(15061113-15061643)
chr7 (136-794)||(16119035-16119726)
chr7 (265-794)||(15066202-15066732)
chr7 (136-794)||(544836-545507)
chr7 (136-794)||(12548010-12548683)
chr7 (136-794)||(537962-538632)
chr7 (136-789)||(16471354-16472040)
chr7 (136-794)||(27291675-27292328)
chr7 (350-794)||(826199-826643)
chr7 (350-794)||(828210-828654)
chr7 (360-794)||(4466359-4466792)
chr7 (359-794)||(19364353-19364788)
chr7 (350-794)||(821190-821630)
chr7 (359-794)||(8718448-8718882)
chr7 (359-794)||(19014344-19014780)
chr7 (359-794)||(8712944-8713378)
chr7 (359-794)||(9577808-9578244)
chr7 (359-794)||(23203743-23204180)
chr7 (359-794)||(23509870-23510307)
chr7 (359-794)||(23515652-23516089)
chr7 (359-794)||(4158377-4158813)
chr7 (384-794)||(18389640-18390049)
chr7 (136-794)||(12575540-12576189)
chr7 (255-783)||(45407511-45408054)
chr7 (350-794)||(5397662-5398118)
chr7 (359-794)||(14551621-14552058)
chr7 (136-794)||(5840384-5841060)
chr7 (359-794)||(14545381-14545818)
chr7 (350-794)||(30257288-30257743)
chr7 (311-794)||(16532579-16533074)
chr7 (311-794)||(16632588-16633083)
chr7 (350-794)||(13651918-13652374)
chr7 (350-794)||(13658441-13658897)
chr7 (136-794)||(16076520-16077198)
chr7 (350-794)||(18072154-18072610)
chr7 (359-794)||(3201383-3201830)
chr7 (350-788)||(15205773-15206223)
chr7 (351-794)||(23293397-23293853)
chr7 (136-789)||(4294308-4294984)
chr7 (136-789)||(782473-783146)
chr7 (351-786)||(37100071-37100519)
chr7 (351-783)||(21506916-21507359)
chr7 (359-794)||(18588943-18589390)
chr7 (359-794)||(18592537-18592984)
chr7 (359-794)||(18599168-18599615)
chr7 (136-789)||(12567351-12568024)
chr7 (136-377)||(15297789-15298030)
chr7 (359-794)||(15176217-15176664)
chr7 (515-794)||(33611972-33612252)
chr7 (351-789)||(34390567-34391010)
chr7 (359-782)||(13674438-13674873)
chr7 (351-783)||(48800959-48801398)
chr7 (354-789)||(24057612-24058059)
chr7 (351-791)||(12199105-12199561)
chr7 (359-794)||(14752700-14753148)
chr7 (359-782)||(13667760-13668195)
chr7 (359-794)||(18618700-18619147)
chr7 (518-794)||(648489-648766)
chr7 (351-794)||(20108954-20109408)
chr7 (359-783)||(3210434-3210874)
chr7 (250-789)||(12561774-12562327)
chr7 (351-789)||(38387855-38388304)
chr7 (530-794)||(48340305-48340571)
chr7 (385-794)||(2325541-2325953)
chr7 (136-629)||(16497498-16497982)
chr7 (515-794)||(17946826-17947105)
chr7 (359-789)||(22578573-22579014)
chr7 (515-794)||(4313323-4313603)
chr7 (469-794)||(9258331-9258653)
chr7 (469-794)||(9311600-9311922)
chr7 (136-467)||(16773992-16774323)
chr7 (515-794)||(35963929-35964207)
chr7 (515-794)||(4307959-4308239)
chr7 (515-783)||(41722807-41723075)
chr7 (515-794)||(4030120-4030398)
chr7 (351-789)||(20624541-20624989)
chr7 (541-794)||(319766-320020)
chr7 (515-783)||(13731897-13732166)
chr7 (469-790)||(16487438-16487758)
chr7 (359-602)||(9585234-9585478)
chr7 (351-782)||(20626860-20627302)
chr7 (351-782)||(20630751-20631193)
chr7 (351-782)||(20635359-20635801)
chr7 (351-782)||(20637231-20637673)
chr7 (515-794)||(9004728-9005009)
chr7 (548-794)||(9192649-9192896)
chr7 (603-794)||(9725871-9726062)
chr7 (515-794)||(10204828-10205108)
chr7 (423-781)||(39271175-39271536)
chr7 (136-467)||(11920874-11921184)
chr7 (515-789)||(48355268-48355544)
chr7 (515-781)||(3376224-3376489)
chr7 (558-790)||(8521860-8522091)
chr7 (595-794)||(12661732-12661931)
chr7 (515-794)||(13434979-13435259)
chr7 (608-794)||(16097208-16097394)
chr7 (136-289)||(18915756-18915909)
chr7 (632-788)||(11953947-11954103)
chr7 (350-575)||(13411213-13411443)
chr7 (515-789)||(15706949-15707223)
chr7 (136-342)||(15206254-15206461)
chr7 (136-342)||(30257050-30257257)
chr7 (136-342)||(13658204-13658410)
chr7 (515-789)||(14941439-14941712)
chr7 (515-789)||(15369032-15369305)
chr7 (624-794)||(16525736-16525906)
chr7 (138-342)||(13651683-13651887)
chr7 (143-342)||(13410982-13411182)
chr7 (136-342)||(13375168-13375375)
chr7 (136-320)||(4158875-4159058)
chr7 (359-611)||(4790769-4791033)
chr7 (136-342)||(825962-826168)
chr7 (136-342)||(12198853-12199060)
chr7 (136-342)||(8712699-8712904)
chr7 (136-342)||(8718203-8718408)
chr7 (136-342)||(14752456-14752660)
chr7 (634-794)||(25180869-25181029)
chr7 (136-342)||(820953-821159)
chr7 (535-789)||(48713581-48713835)
chr7 (352-647)||(368051-368354)
chr7 (136-342)||(13674194-13674398)
chr7 (136-342)||(15175973-15176177)
chr7 (136-342)||(18589430-18589635)
chr7 (136-342)||(18593024-18593229)
chr7 (136-342)||(18599655-18599860)
chr7 (136-342)||(18618455-18618660)
chr7 (136-342)||(19014820-19015024)
chr7 (136-342)||(16097578-16097785)
chr7 (136-342)||(9577563-9577768)
chr7 (136-342)||(9584989-9585194)
chr7 (136-342)||(13667516-13667720)
chr7 (136-342)||(18389374-18389579)
chr7 (423-624)||(1613991-1614195)
chr7 (143-341)||(22578324-22578523)
chr7 (423-783)||(4090719-4091082)
chr7 (515-783)||(8780154-8780422)
chr7 (168-342)||(828005-828179)
chr7 (143-341)||(20624300-20624499)
chr7 (143-341)||(20628177-20628376)
chr7 (143-342)||(21506675-21506874)
chr7 (136-310)||(3201828-3202002)
chr7 (136-341)||(20626612-20626818)
chr7 (136-341)||(20630503-20630709)
chr7 (136-265)||(16759509-16759638)
chr7 (136-342)||(41722398-41722604)
chr7 (136-342)||(48801443-48801652)
chr7 (351-598)||(11997230-11997489)
chr7 (137-342)||(23203497-23203703)
chr7 (137-342)||(23509624-23509830)
chr7 (515-783)||(8786993-8787261)
chr7 (515-783)||(9562049-9562316)
chr7 (151-335)||(48340763-48340948)
chr7 (359-471)||(9583496-9583608)
chr7 (143-342)||(20108713-20108912)
chr7 (141-283)||(9583235-9583376)
chr7 (137-342)||(23515406-23515612)
chr7 (136-316)||(12554539-12554719)
chr7 (384-630)||(16897121-16897374)
chr7 (482-598)||(39388815-39388931)
chr7 (692-794)||(10838651-10838753)
chr7 (136-325)||(20642922-20643112)
chr7 (136-341)||(38388346-38388552)
chr7 (222-342)||(24057457-24057577)
chr7 (136-262)||(16532434-16532560)
chr7 (136-262)||(16633102-16633228)
chr7 (252-342)||(18072641-18072731)
chr7 (219-341)||(20635195-20635317)
chr7 (136-341)||(20636983-20637189)
chr7 (136-283)||(12561617-12561765)
chr7 (136-291)||(12678531-12678687)
chr7 (503-622)||(4460629-4460748)
chr7 (136-262)||(5397454-5397581)
chr7 (136-227)||(14551437-14551528)
chr7 (713-783)||(3197125-3197195)
chr7 (515-783)||(9193723-9193991)
chr7 (515-600)||(21005414-21005499)
chr7 (515-622)||(4256483-4256590)
chr7 (515-622)||(6712311-6712417)
chr7 (136-262)||(11997594-11997720)
chr7 (136-227)||(14545197-14545288)
chr7 (144-342)||(37100564-37100764)
chr7 (503-639)||(46274206-46274335)
chr7 (523-598)||(33609846-33609921)
chr7 (219-340)||(13755194-13755316)
chr7 (457-622)||(38877458-38877626)
chr7 (136-268)||(3376749-3376881)
chr7 (515-614)||(9264240-9264340)
chr7 (509-600)||(4316873-4316963)
chr7 (515-622)||(11483722-11483829)
chr7 (503-622)||(17206262-17206380)
chr7 (136-262)||(19364138-19364265)
chr7 (517-647)||(6257367-6257497)
chr7 (685-789)||(23292451-23292548)
chr7 (143-262)||(34390347-34390467)
chr7 (515-622)||(17911699-17911806)
chr7 (515-598)||(19515251-19515334)
chr7 (509-600)||(25034208-25034297)
chr7 (272-342)||(4466833-4466903)
chr7 (515-622)||(4465652-4465760)
chr7 (515-630)||(1462661-1462776)
chr7 (503-622)||(4983015-4983133)
chr7 (523-622)||(15523151-15523249)
chr7 (515-622)||(30063828-30063934)
chr7 (136-254)||(41781473-41781592)
chr7 (143-260)||(4466894-4467011)
chr7 (503-622)||(679361-679479)
chr7 (136-195)||(14221536-14221595)
chr7 (136-195)||(48782406-48782465)
chr7 (272-342)||(367938-368008)
chr7 (136-190)||(18072753-18072807)
chr7 (137-262)||(18915640-18915765)
chr7 (136-198)||(38295731-38295793)
chr7 (136-258)||(4791136-4791260)
chr7 (136-185)||(11968495-11968544)
chr7 (272-341)||(34390456-34390525)
chr7 (359-424)||(48340662-48340727)
chr7 (302-342)||(11997534-11997574)
chr7 (715-783)||(33610033-33610101)
chr7 (515-622)||(4541282-4541388)
chr7 (303-342)||(15707408-15707447)
chr7 (706-789)||(19515064-19515147)
chr7 (143-262)||(367829-367949)
chr7 (301-342)||(4791072-4791113)
chr7 (725-790)||(8836890-8836955)
chr7 (351-424)||(14941798-14941871)
chr7 (351-424)||(15369391-15369464)
chr7 (351-424)||(33612338-33612411)
chr7 (350-398)||(13375089-13375137)
chr7 (147-195)||(13456335-13456383)
chr7 (302-342)||(14941897-14941937)
chr7 (136-216)||(15066107-15066187)
chr7 (302-342)||(15369490-15369530)
chr7 (143-262)||(23293944-23294063)
chr7 (302-342)||(33612437-33612477)
chr7 (302-342)||(48355753-48355793)
chr7 (136-179)||(15061018-15061061)
chr7 (514-600)||(35103977-35104062)
chr7 (137-227)||(41113130-41113220)
chr7 (351-424)||(648855-648928)
chr7 (302-339)||(648957-648994)
chr7 (136-267)||(4090400-4090531)
chr7 (136-181)||(13755334-13755379)
chr7 (351-424)||(15707309-15707382)
chr7 (351-424)||(41722650-41722723)
chr7 (351-424)||(48355654-48355727)
chr7 (706-790)||(21005224-21005308)
chr7 (309-341)||(23293895-23293927)
chr7 (730-789)||(6257225-6257284)
chr7 (220-267)||(17206660-17206707)
chr7 (312-342)||(5397601-5397631)
chr7 (549-579)||(6531412-6531442)
chr7 (553-599)||(11242618-11242664)
chr7 (143-181)||(12801827-12801865)
chr7 (312-341)||(3376684-3376713)
chr7 (359-424)||(16097484-16097549)
chr7 (137-178)||(24057394-24057435)
chr7 (359-424)||(35964290-35964354)
[»] scaffold0022 (7 HSPs)
scaffold0022 (136-794)||(33079-33741)
scaffold0022 (351-789)||(110495-110943)
scaffold0022 (359-528)||(56683-56854)
scaffold0022 (136-342)||(56894-57098)
scaffold0022 (136-262)||(78776-78903)
scaffold0022 (286-342)||(78906-78962)
scaffold0022 (143-230)||(107360-107448)
[»] chr3 (310 HSPs)
chr3 (136-794)||(6829360-6830018)
chr3 (145-794)||(5226192-5226843)
chr3 (136-794)||(3338444-3339103)
chr3 (143-789)||(43495938-43496587)
chr3 (136-794)||(11939947-11940617)
chr3 (136-794)||(14866759-14867417)
chr3 (136-794)||(13093661-13094321)
chr3 (136-794)||(30026558-30027229)
chr3 (136-794)||(13098042-13098702)
chr3 (248-794)||(6709888-6710435)
chr3 (136-794)||(13142027-13142695)
chr3 (136-794)||(13135419-13136087)
chr3 (136-794)||(15634760-15635431)
chr3 (272-794)||(2781114-2781637)
chr3 (137-794)||(4829775-4830444)
chr3 (136-794)||(13504087-13504758)
chr3 (263-794)||(10248771-10249304)
chr3 (136-794)||(32403568-32404240)
chr3 (136-794)||(11947745-11948394)
chr3 (271-794)||(20555927-20556450)
chr3 (144-794)||(9360178-9360840)
chr3 (139-794)||(15573114-15573760)
chr3 (136-794)||(24696577-24697248)
chr3 (143-783)||(12775750-12776405)
chr3 (144-794)||(9365695-9366357)
chr3 (136-794)||(15944276-15944925)
chr3 (136-763)||(5211921-5212539)
chr3 (143-794)||(53354499-53355163)
chr3 (136-794)||(15946947-15947596)
chr3 (350-794)||(4365793-4366238)
chr3 (350-794)||(4383322-4383767)
chr3 (359-794)||(4768711-4769145)
chr3 (359-794)||(22164417-22164853)
chr3 (359-794)||(41472878-41473314)
chr3 (359-794)||(6809619-6810056)
chr3 (359-794)||(6815441-6815878)
chr3 (359-794)||(15854161-15854598)
chr3 (359-794)||(12246759-12247195)
chr3 (136-789)||(10559542-10560218)
chr3 (359-794)||(15429812-15430247)
chr3 (359-788)||(22169727-22170157)
chr3 (359-794)||(16377474-16377911)
chr3 (136-794)||(50908611-50909270)
chr3 (359-794)||(10601666-10602104)
chr3 (350-794)||(13665044-13665500)
chr3 (359-794)||(10607978-10608416)
chr3 (350-794)||(1751-2205)
chr3 (350-794)||(42280878-42281334)
chr3 (350-794)||(15951846-15952302)
chr3 (351-794)||(7785670-7786125)
chr3 (250-794)||(53160235-53160804)
chr3 (479-794)||(13087597-13087912)
chr3 (359-783)||(8991361-8991797)
chr3 (469-794)||(16385152-16385477)
chr3 (350-794)||(43841761-43842206)
chr3 (350-788)||(13194649-13195098)
chr3 (423-754)||(15424905-15425237)
chr3 (359-713)||(16334019-16334375)
chr3 (136-794)||(10546153-10546813)
chr3 (350-794)||(13325754-13326210)
chr3 (350-794)||(17732940-17733397)
chr3 (351-794)||(17480406-17480863)
chr3 (350-794)||(18128659-18129115)
chr3 (351-794)||(21264776-21265234)
chr3 (136-789)||(20150228-20150894)
chr3 (350-752)||(13204277-13204691)
chr3 (403-696)||(4651306-4651601)
chr3 (384-762)||(20155754-20156144)
chr3 (359-789)||(20153983-20154425)
chr3 (351-789)||(37978010-37978458)
chr3 (350-709)||(13000673-13001044)
chr3 (359-789)||(17388421-17388865)
chr3 (361-794)||(5687627-5688073)
chr3 (359-794)||(10159374-10159816)
chr3 (359-794)||(10166035-10166477)
chr3 (359-794)||(16372755-16373197)
chr3 (359-794)||(13193249-13193691)
chr3 (469-794)||(14071412-14071736)
chr3 (359-794)||(7600937-7601384)
chr3 (359-794)||(11880188-11880635)
chr3 (359-794)||(14815572-14816019)
chr3 (359-794)||(18214036-18214483)
chr3 (359-794)||(10147583-10148025)
chr3 (359-794)||(12192681-12193123)
chr3 (515-794)||(14494521-14494802)
chr3 (359-794)||(15556127-15556574)
chr3 (359-794)||(15563978-15564425)
chr3 (136-467)||(12378619-12378950)
chr3 (359-794)||(10140977-10141419)
chr3 (351-789)||(14444949-14445398)
chr3 (351-789)||(14456996-14457445)
chr3 (350-789)||(19655800-19656246)
chr3 (359-794)||(12186267-12186709)
chr3 (359-794)||(12199322-12199764)
chr3 (359-794)||(13186618-13187060)
chr3 (359-794)||(37935115-37935563)
chr3 (359-794)||(37942960-37943408)
chr3 (359-789)||(19566697-19567141)
chr3 (359-794)||(16705564-16706010)
chr3 (384-790)||(20154938-20155348)
chr3 (503-794)||(34053308-34053600)
chr3 (351-789)||(13068727-13069176)
chr3 (515-794)||(14976005-14976286)
chr3 (535-794)||(3249820-3250080)
chr3 (515-794)||(2722049-2722327)
chr3 (515-794)||(3244773-3245053)
chr3 (384-790)||(14347781-14348190)
chr3 (574-794)||(17766537-17766757)
chr3 (574-794)||(19067857-19068077)
chr3 (252-471)||(16487567-16487786)
chr3 (503-789)||(3279938-3280223)
chr3 (515-789)||(25055132-25055406)
chr3 (384-788)||(2005922-2006338)
chr3 (136-428)||(20584441-20584733)
chr3 (515-788)||(25765537-25765811)
chr3 (515-789)||(11398994-11399268)
chr3 (136-432)||(18545638-18545933)
chr3 (351-789)||(14137454-14137878)
chr3 (525-788)||(47974949-47975213)
chr3 (578-794)||(55514936-55515152)
chr3 (515-783)||(14660517-14660769)
chr3 (359-794)||(15645583-15646012)
chr3 (523-794)||(16034198-16034467)
chr3 (359-794)||(15639007-15639436)
chr3 (136-342)||(13195129-13195335)
chr3 (136-342)||(13204722-13204928)
chr3 (515-789)||(13605155-13605427)
chr3 (136-342)||(17733428-17733634)
chr3 (605-794)||(1991024-1991213)
chr3 (584-789)||(3212640-3212845)
chr3 (136-342)||(15853916-15854121)
chr3 (136-342)||(15556614-15556819)
chr3 (136-268)||(10246459-10246591)
chr3 (136-342)||(15952333-15952540)
chr3 (139-342)||(22170197-22170399)
chr3 (136-342)||(43842237-43842444)
chr3 (136-342)||(4769185-4769390)
chr3 (136-342)||(8991115-8991321)
chr3 (136-342)||(18129146-18129352)
chr3 (141-342)||(15564465-15564665)
chr3 (136-342)||(4383084-4383290)
chr3 (136-342)||(2236-2442)
chr3 (136-342)||(15638763-15638967)
chr3 (136-342)||(15645339-15645543)
chr3 (351-598)||(1993387-1993648)
chr3 (136-342)||(4365555-4365761)
chr3 (136-342)||(10602144-10602349)
chr3 (136-342)||(12199804-12200008)
chr3 (136-342)||(13187100-13187304)
chr3 (136-342)||(37978490-37978696)
chr3 (136-342)||(41472634-41472838)
chr3 (141-342)||(16705325-16705524)
chr3 (351-598)||(1998546-1998807)
chr3 (136-342)||(12159877-12160084)
chr3 (136-342)||(10166517-10166721)
chr3 (136-342)||(10608456-10608661)
chr3 (359-583)||(11868618-11868852)
chr3 (672-794)||(14953554-14953676)
chr3 (136-342)||(16377951-16378156)
chr3 (136-342)||(37942716-37942920)
chr3 (136-342)||(5666220-5666428)
chr3 (136-342)||(7600693-7600897)
chr3 (136-342)||(12193163-12193367)
chr3 (136-342)||(12246515-12246719)
chr3 (136-342)||(13193731-13193935)
chr3 (144-342)||(13690946-13691144)
chr3 (136-342)||(14815328-14815532)
chr3 (136-342)||(18214523-18214727)
chr3 (141-342)||(6809380-6809579)
chr3 (136-320)||(12186771-12186953)
chr3 (136-342)||(16373237-16373442)
chr3 (136-342)||(10140733-10140937)
chr3 (136-342)||(10147339-10147543)
chr3 (136-342)||(10159856-10160060)
chr3 (136-342)||(11880675-11880879)
chr3 (146-342)||(11863914-11864110)
chr3 (677-794)||(15234005-15234122)
chr3 (136-300)||(18982858-18983022)
chr3 (136-342)||(7786157-7786378)
chr3 (144-342)||(13664815-13665013)
chr3 (136-341)||(14457487-14457693)
chr3 (434-628)||(27407242-27407443)
chr3 (359-578)||(5666481-5666714)
chr3 (143-342)||(20153744-20153943)
chr3 (136-299)||(6815206-6815368)
chr3 (515-647)||(36076309-36076441)
chr3 (136-341)||(13044633-13044839)
chr3 (136-341)||(13045187-13045393)
chr3 (136-341)||(13045741-13045947)
chr3 (136-341)||(13046295-13046501)
chr3 (136-341)||(13046849-13047055)
chr3 (136-341)||(13052024-13052230)
chr3 (143-342)||(1993140-1993341)
chr3 (136-342)||(17480153-17480361)
chr3 (666-789)||(36079329-36079452)
chr3 (136-262)||(18934060-18934185)
chr3 (693-783)||(4654768-4654858)
chr3 (136-341)||(10850917-10851123)
chr3 (503-623)||(11827277-11827397)
chr3 (136-341)||(13068479-13068685)
chr3 (350-467)||(13691175-13691292)
chr3 (384-599)||(13418365-13418585)
chr3 (136-341)||(3279521-3279727)
chr3 (252-342)||(13001075-13001165)
chr3 (708-794)||(16336176-16336262)
chr3 (469-598)||(10850611-10850740)
chr3 (136-267)||(15226758-15226890)
chr3 (136-263)||(14229890-14230016)
chr3 (203-342)||(14976463-14976602)
chr3 (256-342)||(13325637-13325723)
chr3 (136-341)||(14445440-14445646)
chr3 (136-262)||(37934892-37935017)
chr3 (503-600)||(17041822-17041919)
chr3 (136-342)||(19656277-19656474)
chr3 (423-647)||(20225074-20225297)
chr3 (136-262)||(11868458-11868584)
chr3 (136-262)||(42280662-42280788)
chr3 (503-647)||(42244392-42244535)
chr3 (503-618)||(17050835-17050950)
chr3 (136-286)||(46752504-46752654)
chr3 (145-268)||(47974648-47974771)
chr3 (136-238)||(7629808-7629910)
chr3 (715-788)||(13055442-13055515)
chr3 (136-261)||(20156268-20156393)
chr3 (136-236)||(16333818-16333918)
chr3 (136-271)||(16487788-16487923)
chr3 (715-794)||(51034745-51034824)
chr3 (351-513)||(13052272-13052445)
chr3 (136-230)||(17449448-17449542)
chr3 (136-249)||(19067728-19067842)
chr3 (143-276)||(53160799-53160933)
chr3 (253-342)||(22164893-22164982)
chr3 (143-262)||(4651137-4651257)
chr3 (136-236)||(14953022-14953122)
chr3 (515-647)||(22038958-22039090)
chr3 (503-622)||(11577616-11577734)
chr3 (136-249)||(17766408-17766522)
chr3 (515-600)||(8532007-8532092)
chr3 (143-338)||(14348262-14348459)
chr3 (143-262)||(2781006-2781125)
chr3 (503-647)||(17023355-17023498)
chr3 (523-622)||(8685712-8685811)
chr3 (136-262)||(20555813-20555939)
chr3 (503-600)||(11869728-11869824)
chr3 (733-794)||(17097001-17097062)
chr3 (145-260)||(16033808-16033924)
chr3 (278-342)||(42280783-42280847)
chr3 (423-618)||(7908543-7908740)
chr3 (143-262)||(14139670-14139789)
chr3 (136-195)||(19034844-19034903)
chr3 (136-258)||(27353243-27353365)
chr3 (503-622)||(27992577-27992695)
chr3 (137-262)||(14094635-14094760)
chr3 (137-262)||(15429599-15429724)
chr3 (200-269)||(21265261-21265331)
chr3 (136-229)||(13001209-13001302)
chr3 (144-260)||(13298118-13298234)
chr3 (519-600)||(17577086-17577166)
chr3 (515-598)||(6236967-6237050)
chr3 (272-342)||(15429713-15429783)
chr3 (136-182)||(18884316-18884362)
chr3 (301-342)||(16033945-16033986)
chr3 (136-217)||(17078024-17078105)
chr3 (303-342)||(1998461-1998500)
chr3 (136-258)||(12781826-12781948)
chr3 (515-622)||(41545634-41545740)
chr3 (272-342)||(14094749-14094819)
chr3 (136-249)||(16465747-16465860)
chr3 (136-182)||(17696804-17696850)
chr3 (351-424)||(3245121-3245194)
chr3 (141-182)||(13047222-13047263)
chr3 (136-260)||(13312355-13312478)
chr3 (302-343)||(14139609-14139650)
chr3 (351-424)||(14494885-14494958)
chr3 (155-267)||(17041445-17041557)
chr3 (706-783)||(17051038-17051115)
chr3 (203-267)||(7908283-7908346)
chr3 (278-330)||(11868579-11868631)
chr3 (351-427)||(13044881-13044957)
chr3 (351-427)||(13045435-13045511)
chr3 (351-427)||(13045989-13046065)
chr3 (351-427)||(13046543-13046619)
chr3 (351-427)||(13047097-13047173)
chr3 (351-419)||(14139497-14139565)
chr3 (302-342)||(14660952-14660992)
chr3 (155-267)||(42244812-42244923)
chr3 (515-586)||(13069887-13069957)
chr3 (162-260)||(13301724-13301822)
chr3 (136-179)||(16472240-16472283)
chr3 (211-299)||(2005728-2005816)
chr3 (570-783)||(17209753-17209966)
chr3 (278-320)||(37935012-37935053)
chr3 (509-622)||(12697333-12697445)
chr3 (351-424)||(16034031-16034104)
chr3 (523-576)||(16703913-16703965)
chr3 (302-335)||(20156215-20156248)
chr3 (144-260)||(40846499-40846615)
chr3 (302-342)||(3245220-3245260)
chr3 (350-398)||(12159798-12159846)
chr3 (302-342)||(14494984-14495024)
chr3 (302-341)||(3250266-3250305)
chr3 (136-179)||(14976617-14976660)
chr3 (359-467)||(3212485-3212597)
chr3 (137-227)||(3226556-3226646)
chr3 (359-467)||(3279780-3279892)
chr3 (366-424)||(47974814-47974872)
chr3 (682-711)||(13204261-13204290)
chr3 (359-424)||(14976369-14976434)
chr3 (537-622)||(17774930-17775015)
chr3 (537-622)||(19076231-19076316)
[»] chr6 (244 HSPs)
chr6 (136-794)||(12474239-12474897)
chr6 (136-794)||(16738454-16739123)
chr6 (136-794)||(19828803-19829473)
chr6 (136-794)||(18106893-18107563)
chr6 (136-794)||(17934128-17934798)
chr6 (143-794)||(11607097-11607760)
chr6 (359-794)||(19075042-19075476)
chr6 (359-794)||(15700138-15700574)
chr6 (359-794)||(4188099-4188533)
chr6 (359-794)||(22071791-22072227)
chr6 (359-794)||(22060710-22061146)
chr6 (359-794)||(27565543-27565979)
chr6 (401-794)||(22005763-22006157)
chr6 (136-794)||(27322769-27323418)
chr6 (136-794)||(12657020-12657697)
chr6 (350-788)||(18006257-18006703)
chr6 (350-794)||(23602989-23603445)
chr6 (350-794)||(25615211-25615663)
chr6 (351-783)||(14077050-14077494)
chr6 (136-794)||(18854348-18855018)
chr6 (359-794)||(12442456-12442904)
chr6 (136-794)||(29596026-29596709)
chr6 (350-788)||(209838-210283)
chr6 (359-790)||(8603452-8603888)
chr6 (351-794)||(17119432-17119892)
chr6 (359-788)||(24218672-24219110)
chr6 (143-789)||(21573581-21574247)
chr6 (136-789)||(23297117-23297793)
chr6 (351-783)||(20993475-20993921)
chr6 (350-794)||(18732280-18732735)
chr6 (136-788)||(25402159-25402831)
chr6 (351-790)||(25774973-25775426)
chr6 (351-783)||(19560611-19561056)
chr6 (351-789)||(1626093-1626538)
chr6 (359-794)||(22766307-22766749)
chr6 (359-794)||(22772990-22773432)
chr6 (359-794)||(6479140-6479587)
chr6 (359-794)||(6490561-6491008)
chr6 (359-794)||(22164734-22165181)
chr6 (359-794)||(22244395-22244842)
chr6 (351-794)||(22737773-22738229)
chr6 (359-794)||(15153626-15154072)
chr6 (359-794)||(20021981-20022428)
chr6 (484-794)||(22786886-22787198)
chr6 (351-789)||(19966350-19966799)
chr6 (359-783)||(20164118-20164549)
chr6 (359-789)||(5152329-5152770)
chr6 (359-794)||(20015816-20016262)
chr6 (359-783)||(20170815-20171246)
chr6 (359-794)||(24861091-24861537)
chr6 (515-794)||(18184099-18184380)
chr6 (359-794)||(18844418-18844839)
chr6 (359-794)||(24854432-24854878)
chr6 (479-783)||(26474028-26474331)
chr6 (469-794)||(15158204-15158530)
chr6 (351-794)||(30670978-30671434)
chr6 (136-376)||(16162712-16162952)
chr6 (515-794)||(17283747-17284026)
chr6 (351-757)||(5671809-5672229)
chr6 (536-769)||(35271295-35271530)
chr6 (503-794)||(29360418-29360704)
chr6 (359-789)||(21559813-21560250)
chr6 (351-789)||(18448719-18449162)
chr6 (503-789)||(19614895-19615181)
chr6 (515-789)||(25968676-25968949)
chr6 (518-762)||(25786093-25786336)
chr6 (595-794)||(18195273-18195472)
chr6 (515-789)||(6795054-6795327)
chr6 (515-794)||(18233531-18233794)
chr6 (515-781)||(25964029-25964294)
chr6 (515-794)||(17743616-17743878)
chr6 (515-790)||(25949435-25949709)
chr6 (640-794)||(23540666-23540820)
chr6 (517-789)||(16470090-16470362)
chr6 (136-342)||(11215299-11215505)
chr6 (136-342)||(18006019-18006226)
chr6 (615-794)||(24511780-24511959)
chr6 (136-342)||(15699893-15700098)
chr6 (136-342)||(19075516-19075721)
chr6 (136-342)||(22002145-22002351)
chr6 (136-342)||(22244150-22244355)
chr6 (136-342)||(24861577-24861781)
chr6 (136-325)||(15857250-15857439)
chr6 (136-342)||(24854918-24855122)
chr6 (616-794)||(32544764-32544942)
chr6 (136-261)||(31549154-31549279)
chr6 (469-647)||(23616210-23616390)
chr6 (136-342)||(22061186-22061390)
chr6 (136-342)||(22072267-22072471)
chr6 (136-342)||(22165221-22165426)
chr6 (136-342)||(22766789-22766993)
chr6 (136-342)||(20022468-20022672)
chr6 (136-342)||(20163874-20164078)
chr6 (351-599)||(19563730-19563989)
chr6 (137-348)||(23603471-23603682)
chr6 (663-783)||(25656168-25656288)
chr6 (136-342)||(22773472-22773677)
chr6 (136-342)||(25614974-25615180)
chr6 (136-342)||(20170571-20170775)
chr6 (686-794)||(22344244-22344352)
chr6 (136-342)||(18195690-18195897)
chr6 (136-342)||(25606636-25606842)
chr6 (136-342)||(4187854-4188059)
chr6 (225-487)||(22343513-22343788)
chr6 (612-794)||(19569871-19570053)
chr6 (423-627)||(22601214-22601421)
chr6 (141-342)||(6478900-6479100)
chr6 (141-342)||(6490321-6490521)
chr6 (146-341)||(19570192-19570388)
chr6 (136-342)||(30671479-30671686)
chr6 (136-342)||(22236797-22237001)
chr6 (469-643)||(29563360-29563540)
chr6 (143-342)||(25626028-25626226)
chr6 (136-291)||(23516924-23517079)
chr6 (136-341)||(5152820-5153025)
chr6 (136-238)||(15693225-15693327)
chr6 (136-238)||(18422585-18422687)
chr6 (155-342)||(20993947-20994136)
chr6 (136-342)||(12993482-12993690)
chr6 (136-342)||(25774721-25774928)
chr6 (143-285)||(23619867-23620009)
chr6 (143-342)||(210314-210513)
chr6 (136-330)||(21560237-21560432)
chr6 (136-298)||(10719107-10719269)
chr6 (685-790)||(5949391-5949496)
chr6 (354-467)||(11215540-11215653)
chr6 (694-783)||(19563612-19563701)
chr6 (350-467)||(25606873-25606990)
chr6 (136-334)||(22737514-22737720)
chr6 (359-467)||(25626266-25626374)
chr6 (143-341)||(1625861-1626051)
chr6 (136-341)||(2181691-2181897)
chr6 (469-598)||(20105519-20105648)
chr6 (136-335)||(18448471-18448671)
chr6 (515-647)||(20218316-20218448)
chr6 (515-647)||(22112341-22112473)
chr6 (715-794)||(17820544-17820623)
chr6 (136-290)||(18822592-18822747)
chr6 (136-262)||(22787726-22787852)
chr6 (515-600)||(25923274-25923359)
chr6 (523-627)||(5399350-5399454)
chr6 (223-342)||(5672255-5672375)
chr6 (136-271)||(35271151-35271287)
chr6 (136-262)||(18732053-18732180)
chr6 (384-590)||(18627407-18627615)
chr6 (350-467)||(22787519-22787636)
chr6 (515-598)||(4741097-4741181)
chr6 (523-639)||(14992124-14992240)
chr6 (515-789)||(26138775-26139050)
chr6 (384-467)||(12993324-12993407)
chr6 (515-622)||(13168489-13168595)
chr6 (515-646)||(25031060-25031191)
chr6 (515-789)||(25507703-25507977)
chr6 (515-789)||(26018072-26018346)
chr6 (200-330)||(12442339-12442469)
chr6 (136-262)||(15153401-15153527)
chr6 (136-310)||(25630978-25631151)
chr6 (515-639)||(29093656-29093782)
chr6 (457-620)||(32543289-32543457)
chr6 (712-777)||(12992806-12992871)
chr6 (503-627)||(18396360-18396484)
chr6 (515-599)||(25339126-25339210)
chr6 (136-236)||(27566091-27566191)
chr6 (515-789)||(26157445-26157719)
chr6 (136-262)||(24218459-24218584)
chr6 (546-628)||(30245346-30245427)
chr6 (509-622)||(17522219-17522330)
chr6 (136-296)||(18184591-18184752)
chr6 (515-600)||(23517231-23517316)
chr6 (515-648)||(26821968-26822101)
chr6 (515-647)||(28733980-28734112)
chr6 (513-588)||(9414496-9414570)
chr6 (525-600)||(17793865-17793940)
chr6 (515-598)||(19993710-19993793)
chr6 (503-622)||(20221291-20221408)
chr6 (503-622)||(20464479-20464597)
chr6 (503-622)||(22115275-22115392)
chr6 (384-598)||(24545504-24545720)
chr6 (515-613)||(13217223-13217321)
chr6 (136-260)||(16469837-16469961)
chr6 (423-602)||(19612623-19612800)
chr6 (669-789)||(20435511-20435630)
chr6 (706-789)||(4741288-4741371)
chr6 (503-622)||(29682710-29682828)
chr6 (457-584)||(20222959-20223090)
chr6 (457-584)||(22116943-22117074)
chr6 (359-432)||(10718959-10719032)
chr6 (136-260)||(17119214-17119339)
chr6 (136-245)||(19590358-19590467)
chr6 (509-622)||(21237800-21237912)
chr6 (515-600)||(23523835-23523920)
chr6 (136-259)||(19067400-19067523)
chr6 (514-622)||(23639711-23639818)
chr6 (136-230)||(12475316-12475411)
chr6 (515-598)||(29254097-29254180)
chr6 (503-600)||(12660330-12660424)
chr6 (136-284)||(19564110-19564259)
chr6 (503-600)||(24392782-24392878)
chr6 (515-588)||(32796406-32796478)
chr6 (503-599)||(18973761-18973856)
chr6 (706-790)||(20439255-20439339)
chr6 (278-342)||(22787667-22787731)
chr6 (136-227)||(17814278-17814369)
chr6 (247-342)||(19564031-19564126)
chr6 (278-341)||(19966841-19966904)
chr6 (136-182)||(23352430-23352476)
chr6 (136-185)||(11224246-11224295)
chr6 (136-217)||(18461002-18461083)
chr6 (136-217)||(22168876-22168957)
chr6 (706-783)||(24545328-24545405)
chr6 (155-267)||(18627141-18627252)
chr6 (303-342)||(18732200-18732239)
chr6 (136-282)||(19270127-19270262)
chr6 (532-599)||(31965402-31965468)
chr6 (143-236)||(14077527-14077621)
chr6 (136-249)||(16490294-16490407)
chr6 (136-182)||(20102209-20102255)
chr6 (136-182)||(23027742-23027788)
chr6 (514-600)||(34108867-34108952)
chr6 (351-428)||(2181939-2182016)
chr6 (523-648)||(3923758-3923883)
chr6 (359-424)||(18195596-18195661)
chr6 (351-424)||(19570073-19570146)
chr6 (350-398)||(22002382-22002430)
chr6 (136-180)||(35059060-35059104)
chr6 (137-227)||(1122835-1122925)
chr6 (272-342)||(19561098-19561168)
chr6 (753-794)||(5670596-5670637)
chr6 (136-181)||(23574185-23574230)
chr6 (716-789)||(29254298-29254371)
chr6 (503-599)||(12657928-12658023)
chr6 (303-335)||(15153548-15153580)
chr6 (523-599)||(16207599-16207674)
chr6 (223-267)||(25031472-25031516)
chr6 (203-262)||(25786610-25786668)
chr6 (361-424)||(18184460-18184523)
chr6 (136-178)||(5672399-5672441)
chr6 (585-647)||(5949535-5949597)
chr6 (203-265)||(20218731-20218792)
chr6 (203-265)||(22112756-22112817)
chr6 (203-257)||(22601618-22601671)
chr6 (222-267)||(25923651-25923697)
chr6 (384-467)||(25339269-25339355)
chr6 (384-467)||(25786396-25786483)
[»] scaffold0146 (3 HSPs)
scaffold0146 (136-794)||(37804-38460)
scaffold0146 (136-300)||(10103-10267)
scaffold0146 (136-180)||(17770-17814)
[»] chr5 (189 HSPs)
chr5 (138-794)||(23972907-23973564)
chr5 (136-794)||(30729575-30730233)
chr5 (136-794)||(7760812-7761470)
chr5 (136-794)||(25006015-25006685)
chr5 (136-794)||(21811957-21812616)
chr5 (137-794)||(14482115-14482773)
chr5 (136-794)||(30758870-30759542)
chr5 (137-794)||(30768975-30769646)
chr5 (136-794)||(25115010-25115680)
chr5 (136-794)||(25174102-25174772)
chr5 (136-794)||(25181082-25181740)
chr5 (136-794)||(22855902-22856552)
chr5 (350-794)||(26848218-26848662)
chr5 (145-788)||(20444051-20444708)
chr5 (136-794)||(20801868-20802517)
chr5 (359-794)||(41765484-41765919)
chr5 (136-788)||(20449533-20450198)
chr5 (359-794)||(21734314-21734750)
chr5 (359-794)||(15731898-15732332)
chr5 (359-794)||(15736117-15736551)
chr5 (359-794)||(23684807-23685241)
chr5 (359-794)||(23849570-23850004)
chr5 (136-794)||(20832167-20832838)
chr5 (359-794)||(20595027-20595463)
chr5 (136-778)||(23599858-23600513)
chr5 (350-794)||(26842762-26843206)
chr5 (359-794)||(34780266-34780700)
chr5 (359-794)||(20601313-20601749)
chr5 (359-794)||(20607604-20608040)
chr5 (359-794)||(20613941-20614377)
chr5 (359-794)||(23618173-23618608)
chr5 (359-794)||(24935425-24935862)
chr5 (359-794)||(24941117-24941554)
chr5 (359-794)||(18067187-18067622)
chr5 (359-794)||(18073482-18073917)
chr5 (359-794)||(20789920-20790357)
chr5 (359-794)||(20795701-20796138)
chr5 (350-794)||(42789532-42789977)
chr5 (359-794)||(28834605-28835041)
chr5 (136-794)||(23267401-23268084)
chr5 (350-794)||(18483397-18483853)
chr5 (359-790)||(25577353-25577786)
chr5 (248-794)||(25121991-25122537)
chr5 (350-794)||(3387962-3388418)
chr5 (350-794)||(33701430-33701886)
chr5 (350-794)||(25891052-25891508)
chr5 (350-794)||(22142945-22143401)
chr5 (136-794)||(21729577-21730225)
chr5 (350-788)||(29052726-29053175)
chr5 (359-794)||(6406226-6406658)
chr5 (136-794)||(24952380-24953061)
chr5 (350-783)||(31057422-31057858)
chr5 (350-788)||(9728603-9729053)
chr5 (350-794)||(22323304-22323760)
chr5 (351-794)||(20571145-20571600)
chr5 (350-794)||(24220312-24220763)
chr5 (354-794)||(5077903-5078362)
chr5 (387-794)||(13909985-13910404)
chr5 (350-794)||(22316697-22317153)
chr5 (350-794)||(24214689-24215140)
chr5 (350-783)||(25741623-25742066)
chr5 (497-794)||(23771018-23771315)
chr5 (403-794)||(20245543-20245949)
chr5 (384-789)||(23435292-23435711)
chr5 (384-789)||(23446659-23447078)
chr5 (351-789)||(35307348-35307792)
chr5 (359-794)||(16103941-16104388)
chr5 (359-794)||(20616271-20616718)
chr5 (543-794)||(18612985-18613236)
chr5 (359-794)||(18610888-18611330)
chr5 (359-794)||(24969045-24969493)
chr5 (359-794)||(25201841-25202289)
chr5 (359-794)||(25265996-25266444)
chr5 (359-794)||(18772052-18772499)
chr5 (515-794)||(23343245-23343526)
chr5 (515-794)||(20915652-20915932)
chr5 (484-794)||(23626542-23626857)
chr5 (423-789)||(21382296-21382665)
chr5 (503-794)||(12322436-12322725)
chr5 (351-654)||(21400809-21401125)
chr5 (359-789)||(21389622-21390057)
chr5 (359-695)||(28621767-28622115)
chr5 (503-749)||(26780650-26780898)
chr5 (515-790)||(20169174-20169448)
chr5 (515-789)||(20967852-20968126)
chr5 (136-342)||(22317184-22317390)
chr5 (136-342)||(22142709-22142915)
chr5 (136-342)||(22323791-22323997)
chr5 (573-794)||(23743358-23743579)
chr5 (359-747)||(23582732-23583134)
chr5 (136-342)||(33701193-33701399)
chr5 (553-789)||(21833078-21833314)
chr5 (136-342)||(5078397-5078604)
chr5 (136-342)||(21401157-21401364)
chr5 (136-342)||(25891539-25891745)
chr5 (136-342)||(26847982-26848187)
chr5 (384-647)||(23756723-23756999)
chr5 (384-647)||(23822179-23822455)
chr5 (136-342)||(15731653-15731858)
chr5 (136-342)||(20595503-20595708)
chr5 (136-342)||(20601789-20601994)
chr5 (136-342)||(20608080-20608285)
chr5 (136-342)||(20614417-20614622)
chr5 (136-342)||(31057889-31058096)
chr5 (136-342)||(15735872-15736077)
chr5 (136-342)||(18073238-18073442)
chr5 (136-342)||(25201597-25201801)
chr5 (136-342)||(25265752-25265956)
chr5 (136-342)||(18066943-18067147)
chr5 (136-321)||(26842532-26842717)
chr5 (136-320)||(20796200-20796382)
chr5 (136-342)||(18611370-18611574)
chr5 (515-709)||(21273761-21273954)
chr5 (136-342)||(23618648-23618852)
chr5 (136-342)||(23684563-23684767)
chr5 (136-342)||(23850044-23850248)
chr5 (136-342)||(25741386-25741592)
chr5 (136-342)||(23598527-23598731)
chr5 (136-342)||(23748389-23748593)
chr5 (137-342)||(24214453-24214658)
chr5 (136-342)||(24935180-24935385)
chr5 (136-342)||(24969533-24969737)
chr5 (136-342)||(28622155-28622359)
chr5 (136-342)||(34780022-34780226)
chr5 (136-316)||(20790423-20790601)
chr5 (136-342)||(18772539-18772743)
chr5 (136-342)||(24940872-24941077)
chr5 (136-342)||(23756437-23756645)
chr5 (136-342)||(23821893-23822101)
chr5 (136-342)||(42790008-42790214)
chr5 (136-320)||(20616027-20616209)
chr5 (136-330)||(23583121-23583316)
chr5 (136-342)||(16104428-16104632)
chr5 (136-341)||(26744789-26744995)
chr5 (156-348)||(3387744-3387936)
chr5 (681-783)||(22000192-22000294)
chr5 (136-342)||(24220084-24220281)
chr5 (515-627)||(20724710-20724822)
chr5 (143-291)||(20916180-20916327)
chr5 (136-342)||(18483884-18484090)
chr5 (137-342)||(28835081-28835286)
chr5 (384-647)||(31757959-31758231)
chr5 (523-639)||(22948692-22948808)
chr5 (136-262)||(29053265-29053392)
chr5 (143-342)||(9729084-9729263)
chr5 (523-639)||(22942482-22942598)
chr5 (515-783)||(34222839-34223095)
chr5 (515-630)||(17408591-17408706)
chr5 (359-470)||(23710198-23710309)
chr5 (515-598)||(24165366-24165449)
chr5 (136-227)||(25577879-25577970)
chr5 (515-648)||(2953376-2953509)
chr5 (137-341)||(35307834-35308039)
chr5 (136-291)||(20573792-20573947)
chr5 (515-608)||(15059721-15059814)
chr5 (515-600)||(20738467-20738552)
chr5 (479-622)||(23114339-23114478)
chr5 (351-519)||(26745037-26745216)
chr5 (515-594)||(31414732-31414811)
chr5 (225-320)||(23710371-23710465)
chr5 (515-622)||(24166377-24166483)
chr5 (515-600)||(16677190-16677275)
chr5 (278-342)||(29053206-29053270)
chr5 (532-647)||(12410655-12410770)
chr5 (732-794)||(20799520-20799581)
chr5 (515-647)||(22170898-22171030)
chr5 (503-622)||(23029435-23029552)
chr5 (272-342)||(6406127-6406197)
chr5 (137-262)||(41765998-41766123)
chr5 (136-262)||(6406011-6406138)
chr5 (706-789)||(19890046-19890129)
chr5 (739-794)||(28621725-28621780)
chr5 (143-195)||(21877427-21877479)
chr5 (359-514)||(23748633-23748788)
chr5 (272-342)||(21734779-21734849)
chr5 (534-618)||(20103799-20103884)
chr5 (351-424)||(20916019-20916092)
chr5 (351-424)||(20967696-20967769)
chr5 (137-262)||(12322050-12322176)
chr5 (352-424)||(15059323-15059395)
chr5 (509-584)||(18091821-18091896)
chr5 (302-342)||(20967630-20967670)
chr5 (136-262)||(21734838-21734965)
chr5 (351-424)||(23343612-23343685)
chr5 (384-472)||(23598796-23598885)
chr5 (223-267)||(12410307-12410351)
chr5 (203-267)||(24143470-24143533)
chr5 (754-789)||(16677431-16677466)
chr5 (136-181)||(20799441-20799486)
[»] chr4 (182 HSPs)
chr4 (136-794)||(16683092-16683751)
chr4 (136-794)||(21420297-21420966)
chr4 (136-794)||(10637335-10638004)
chr4 (143-794)||(15248045-15248709)
chr4 (136-794)||(10558623-10559293)
chr4 (137-783)||(10650727-10651384)
chr4 (136-794)||(18563163-18563833)
chr4 (136-794)||(15259316-15259986)
chr4 (136-794)||(15265938-15266608)
chr4 (137-794)||(10631089-10631758)
chr4 (136-794)||(26810853-26811514)
chr4 (136-794)||(15254686-15255336)
chr4 (136-794)||(11504681-11505373)
chr4 (350-794)||(18080652-18081098)
chr4 (136-794)||(10732496-10733147)
chr4 (136-794)||(10946265-10946916)
chr4 (359-794)||(3371573-3372009)
chr4 (359-794)||(5717342-5717778)
chr4 (143-788)||(12844630-12845292)
chr4 (359-794)||(36654053-36654490)
chr4 (359-794)||(3419013-3419447)
chr4 (350-794)||(3391888-3392334)
chr4 (350-783)||(7897229-7897666)
chr4 (350-794)||(14653183-14653637)
chr4 (359-794)||(42708926-42709363)
chr4 (359-794)||(55798290-55798727)
chr4 (350-794)||(14690532-14690986)
chr4 (350-794)||(56579750-56580206)
chr4 (349-794)||(15123936-15124393)
chr4 (350-789)||(6518313-6518757)
chr4 (350-794)||(16217527-16217981)
chr4 (351-794)||(25146180-25146636)
chr4 (350-794)||(18983943-18984404)
chr4 (469-794)||(18078745-18079070)
chr4 (350-794)||(7379-7835)
chr4 (352-794)||(18242134-18242588)
chr4 (136-794)||(3354977-3355645)
chr4 (359-794)||(9944882-9945331)
chr4 (351-783)||(17484119-17484561)
chr4 (359-794)||(2993-3440)
chr4 (359-794)||(10684586-10685033)
chr4 (359-794)||(10898226-10898673)
chr4 (359-794)||(11495799-11496246)
chr4 (359-794)||(13823496-13823943)
chr4 (515-794)||(16952006-16952286)
chr4 (359-794)||(40844799-40845246)
chr4 (351-789)||(16226978-16227427)
chr4 (361-794)||(22104893-22105331)
chr4 (359-794)||(26293176-26293623)
chr4 (351-790)||(39043190-39043643)
chr4 (136-467)||(44443600-44443931)
chr4 (400-794)||(15301991-15302397)
chr4 (515-794)||(18287096-18287377)
chr4 (359-783)||(7197165-7197603)
chr4 (351-794)||(48641619-48642066)
chr4 (351-790)||(15866073-15866523)
chr4 (532-794)||(15305363-15305627)
chr4 (548-794)||(41400627-41400874)
chr4 (515-794)||(13622404-13622682)
chr4 (351-794)||(8091599-8092053)
chr4 (351-789)||(17996072-17996522)
chr4 (252-471)||(18129587-18129806)
chr4 (505-794)||(16392774-16393064)
chr4 (359-794)||(7870802-7871232)
chr4 (515-782)||(11888693-11888959)
chr4 (515-789)||(24124933-24125207)
chr4 (582-794)||(40560293-40560506)
chr4 (515-789)||(21275366-21275640)
chr4 (403-587)||(40563741-40563927)
chr4 (136-342)||(7866-8072)
chr4 (136-342)||(18983706-18983912)
chr4 (136-342)||(56580237-56580443)
chr4 (136-342)||(13823251-13823456)
chr4 (136-342)||(18081130-18081336)
chr4 (136-388)||(15268266-15268503)
chr4 (136-342)||(22104647-22104851)
chr4 (143-342)||(14691017-14691217)
chr4 (136-342)||(10684342-10684546)
chr4 (136-342)||(10897982-10898186)
chr4 (136-342)||(14653668-14653875)
chr4 (136-342)||(11496286-11496491)
chr4 (136-342)||(40845286-40845490)
chr4 (143-342)||(40567324-40567523)
chr4 (136-342)||(7870558-7870762)
chr4 (136-342)||(42709403-42709608)
chr4 (143-342)||(8092098-8092297)
chr4 (635-794)||(11048541-11048700)
chr4 (515-789)||(43701275-43701549)
chr4 (144-342)||(7897697-7897895)
chr4 (136-320)||(26292932-26293114)
chr4 (426-627)||(16953772-16953976)
chr4 (490-639)||(9857296-9857445)
chr4 (350-593)||(21102124-21102374)
chr4 (143-342)||(16951623-16951823)
chr4 (136-342)||(18286712-18286919)
chr4 (515-789)||(20058868-20059142)
chr4 (359-783)||(39444-39881)
chr4 (136-341)||(15865825-15866031)
chr4 (136-341)||(25145932-25146138)
chr4 (136-342)||(9944622-9944829)
chr4 (136-238)||(15143553-15143655)
chr4 (136-341)||(16226730-16226936)
chr4 (366-598)||(12808074-12808320)
chr4 (515-790)||(31594000-31594274)
chr4 (151-337)||(2707670-2707857)
chr4 (136-341)||(20059343-20059549)
chr4 (143-342)||(48641372-48641573)
chr4 (515-639)||(10731252-10731376)
chr4 (515-639)||(10945021-10945145)
chr4 (515-639)||(11902475-11902599)
chr4 (144-342)||(21102405-21102603)
chr4 (136-283)||(3581-3727)
chr4 (136-298)||(18292276-18292439)
chr4 (137-342)||(20617884-20618089)
chr4 (136-269)||(39043741-39043874)
chr4 (143-341)||(17995836-17996030)
chr4 (136-269)||(14502334-14502468)
chr4 (136-298)||(11501971-11502134)
chr4 (650-782)||(15410080-15410212)
chr4 (137-227)||(5717168-5717258)
chr4 (136-271)||(18129450-18129585)
chr4 (136-236)||(36654602-36654702)
chr4 (136-236)||(55798078-55798178)
chr4 (136-270)||(3371341-3371475)
chr4 (515-789)||(3771892-3772165)
chr4 (515-622)||(12347486-12347592)
chr4 (272-342)||(3391787-3391857)
chr4 (136-206)||(15964258-15964328)
chr4 (136-261)||(18241929-18242054)
chr4 (136-260)||(17484664-17484788)
chr4 (251-342)||(3480-3571)
chr4 (515-622)||(13883336-13883442)
chr4 (503-622)||(23793478-23793596)
chr4 (136-238)||(15876485-15876587)
chr4 (272-342)||(16218012-16218082)
chr4 (143-262)||(3418805-3418925)
chr4 (515-622)||(5675581-5675688)
chr4 (136-258)||(15124486-15124609)
chr4 (136-262)||(16218071-16218197)
chr4 (136-262)||(16221391-16221517)
chr4 (272-342)||(6518212-6518282)
chr4 (509-622)||(13510688-13510800)
chr4 (281-342)||(15124423-15124484)
chr4 (136-259)||(6518097-6518220)
chr4 (136-262)||(3391672-3391798)
chr4 (136-262)||(16374890-16375017)
chr4 (503-600)||(9717651-9717747)
chr4 (515-622)||(11922310-11922417)
chr4 (503-600)||(38652259-38652356)
chr4 (509-618)||(55267689-55267797)
chr4 (754-794)||(1272364-1272404)
chr4 (302-342)||(17484603-17484643)
chr4 (302-342)||(21275114-21275154)
chr4 (302-342)||(24125389-24125429)
chr4 (515-622)||(12345823-12345929)
chr4 (302-341)||(12808380-12808419)
chr4 (351-424)||(11889040-11889113)
chr4 (136-181)||(13274050-13274095)
chr4 (359-424)||(18286948-18287013)
chr4 (351-424)||(21275180-21275253)
chr4 (302-342)||(15409913-15409953)
chr4 (514-598)||(18749651-18749734)
chr4 (137-227)||(10821719-10821809)
chr4 (136-238)||(12808467-12808569)
chr4 (513-599)||(15048147-15048232)
chr4 (513-599)||(15106192-15106277)
chr4 (362-424)||(16951855-16951917)
chr4 (136-181)||(16643105-16643150)
chr4 (550-599)||(21276772-21276821)
chr4 (509-584)||(22809401-22809475)
chr4 (353-398)||(40567245-40567290)
chr4 (286-342)||(3371477-3371533)
chr4 (272-316)||(16221358-16221402)
chr4 (515-622)||(33330866-33330970)
chr4 (303-342)||(3418945-3418984)
chr4 (303-342)||(18242075-18242114)
chr4 (533-599)||(5513530-5513595)
chr4 (143-181)||(15444606-15444644)
chr4 (514-600)||(24493056-24493141)
chr4 (143-180)||(11889372-11889409)
chr4 (351-424)||(15409995-15410068)
chr4 (550-599)||(17464989-17465038)
[»] chr2 (201 HSPs)
chr2 (136-794)||(10844-11503)
chr2 (136-794)||(27631834-27632504)
chr2 (136-794)||(27615138-27615808)
chr2 (136-794)||(117881-118551)
chr2 (136-794)||(18446447-18447117)
chr2 (136-794)||(27768023-27768693)
chr2 (136-794)||(111188-111879)
chr2 (136-794)||(19278486-19279156)
chr2 (143-794)||(23158591-23159255)
chr2 (143-794)||(23569848-23570512)
chr2 (359-794)||(25358094-25358528)
chr2 (359-794)||(20172514-20172947)
chr2 (359-794)||(21468145-21468581)
chr2 (359-794)||(35080549-35080986)
chr2 (282-794)||(23163161-23163686)
chr2 (282-794)||(23574418-23574943)
chr2 (350-794)||(21200831-21201287)
chr2 (350-794)||(23644522-23644978)
chr2 (136-789)||(25143959-25144635)
chr2 (136-794)||(42767064-42767732)
chr2 (350-794)||(39870276-39870732)
chr2 (351-794)||(23018300-23018754)
chr2 (359-794)||(23014186-23014632)
chr2 (359-794)||(40916507-40916957)
chr2 (359-794)||(22043846-22044293)
chr2 (359-794)||(22288140-22288587)
chr2 (359-794)||(22665644-22666091)
chr2 (351-789)||(33181615-33182064)
chr2 (350-794)||(45706150-45706605)
chr2 (359-794)||(24877449-24877896)
chr2 (144-432)||(20346414-20346703)
chr2 (359-794)||(16776233-16776680)
chr2 (359-794)||(16769570-16770018)
chr2 (515-794)||(5499479-5499759)
chr2 (481-794)||(25370032-25370348)
chr2 (359-794)||(27621508-27621955)
chr2 (359-794)||(27628153-27628600)
chr2 (384-789)||(29563160-29563579)
chr2 (351-789)||(11317894-11318343)
chr2 (359-794)||(24794473-24794918)
chr2 (359-794)||(24801182-24801627)
chr2 (359-794)||(17583162-17583608)
chr2 (136-423)||(27859388-27859675)
chr2 (359-794)||(17590968-17591414)
chr2 (351-789)||(24171932-24172381)
chr2 (515-794)||(19929491-19929783)
chr2 (523-781)||(20282167-20282425)
chr2 (351-783)||(32139905-32140351)
chr2 (136-467)||(17637460-17637812)
chr2 (423-794)||(20707960-20708342)
chr2 (362-789)||(24824681-24825115)
chr2 (503-794)||(25803494-25803785)
chr2 (479-783)||(18994169-18994474)
chr2 (351-789)||(20635600-20636049)
chr2 (359-789)||(24820296-24820733)
chr2 (457-789)||(24507354-24507690)
chr2 (576-789)||(23633909-23634122)
chr2 (503-783)||(36684397-36684678)
chr2 (503-794)||(23798112-23798403)
chr2 (503-789)||(23340664-23340952)
chr2 (610-794)||(25198600-25198784)
chr2 (490-742)||(28496443-28496699)
chr2 (517-794)||(32441063-32441338)
chr2 (503-747)||(27745166-27745409)
chr2 (136-299)||(20312259-20312422)
chr2 (515-789)||(16133900-16134174)
chr2 (515-794)||(23139712-23139975)
chr2 (136-342)||(23295917-23296123)
chr2 (515-794)||(23551502-23551765)
chr2 (136-342)||(24606893-24607099)
chr2 (515-789)||(25481489-25481765)
chr2 (515-789)||(25489095-25489371)
chr2 (136-342)||(21200594-21200800)
chr2 (515-794)||(11391222-11391496)
chr2 (515-794)||(11407883-11408157)
chr2 (136-342)||(25198120-25198326)
chr2 (136-353)||(22871830-22872047)
chr2 (136-348)||(23644283-23644496)
chr2 (607-794)||(17637263-17637450)
chr2 (136-342)||(25357849-25358054)
chr2 (136-298)||(41368826-41368987)
chr2 (350-528)||(23295706-23295886)
chr2 (136-342)||(16775989-16776193)
chr2 (350-585)||(25198357-25198604)
chr2 (607-794)||(23634128-23634315)
chr2 (136-342)||(16769326-16769530)
chr2 (136-342)||(17582918-17583122)
chr2 (136-342)||(22665400-22665604)
chr2 (359-595)||(25043007-25043257)
chr2 (136-342)||(25370555-25370763)
chr2 (136-342)||(22044333-22044537)
chr2 (141-342)||(27627914-27628113)
chr2 (663-794)||(25038634-25038765)
chr2 (136-342)||(22287896-22288100)
chr2 (136-341)||(24171684-24171890)
chr2 (136-342)||(24794958-24795162)
chr2 (136-342)||(24877205-24877409)
chr2 (136-342)||(27621264-27621468)
chr2 (136-335)||(5499943-5500143)
chr2 (350-536)||(24606666-24606862)
chr2 (144-342)||(25043296-25043494)
chr2 (515-783)||(539309-539577)
chr2 (143-342)||(32139658-32139860)
chr2 (359-606)||(24177561-24177814)
chr2 (423-624)||(29577212-29577419)
chr2 (351-575)||(23648610-23648851)
chr2 (143-342)||(23014682-23014883)
chr2 (143-342)||(23018796-23018997)
chr2 (469-598)||(30949148-30949277)
chr2 (136-284)||(20377521-20377669)
chr2 (136-276)||(28307541-28307680)
chr2 (136-341)||(36683978-36684184)
chr2 (143-342)||(23801015-23801215)
chr2 (136-231)||(7941398-7941493)
chr2 (136-235)||(32393090-32393189)
chr2 (137-342)||(24076916-24077100)
chr2 (136-269)||(25351754-25351887)
chr2 (503-639)||(21344333-21344469)
chr2 (137-296)||(24825184-24825344)
chr2 (143-341)||(538896-539095)
chr2 (694-794)||(23084581-23084682)
chr2 (515-783)||(23698515-23698783)
chr2 (143-341)||(20635364-20635558)
chr2 (515-630)||(23704392-23704507)
chr2 (143-342)||(40916996-40917195)
chr2 (251-342)||(45706027-45706118)
chr2 (136-262)||(20414073-20414198)
chr2 (479-622)||(24371307-24371449)
chr2 (136-227)||(20173040-20173131)
chr2 (515-622)||(24609936-24610043)
chr2 (136-262)||(33181388-33181515)
chr2 (136-227)||(35075938-35076029)
chr2 (505-639)||(21261-21395)
chr2 (136-269)||(23012603-23012737)
chr2 (725-794)||(20282429-20282498)
chr2 (136-212)||(21025715-21025791)
chr2 (136-259)||(24050718-24050842)
chr2 (136-262)||(23798673-23798800)
chr2 (136-262)||(17590745-17590870)
chr2 (144-221)||(22791709-22791786)
chr2 (151-283)||(23648356-23648489)
chr2 (517-789)||(25858289-25858561)
chr2 (136-259)||(11318437-11318561)
chr2 (136-342)||(22037471-22037657)
chr2 (509-622)||(36129967-36130079)
chr2 (515-618)||(24366176-24366279)
chr2 (384-598)||(41653504-41653717)
chr2 (136-270)||(45705890-45706025)
chr2 (515-585)||(23613996-23614066)
chr2 (515-620)||(22578195-22578298)
chr2 (515-783)||(41653319-41653587)
chr2 (523-599)||(19124220-19124295)
chr2 (503-598)||(22328592-22328688)
chr2 (136-216)||(23333041-23333121)
chr2 (138-234)||(23409781-23409877)
chr2 (509-621)||(31590383-31590493)
chr2 (515-622)||(20852241-20852347)
chr2 (635-789)||(23613844-23613998)
chr2 (250-341)||(23648477-23648568)
chr2 (509-622)||(13004595-13004707)
chr2 (257-342)||(24801667-24801751)
chr2 (546-618)||(15583981-15584053)
chr2 (136-268)||(23337914-23338046)
chr2 (515-622)||(23256885-23256990)
chr2 (136-238)||(18943300-18943401)
chr2 (351-467)||(25370390-25370510)
chr2 (515-600)||(24321911-24321995)
chr2 (515-622)||(19012880-19012986)
chr2 (136-191)||(25579207-25579262)
chr2 (136-195)||(30323176-30323235)
chr2 (137-262)||(21468669-21468794)
chr2 (302-342)||(16134359-16134399)
chr2 (754-794)||(20376966-20377006)
chr2 (514-618)||(25592993-25593096)
chr2 (272-335)||(21468617-21468680)
chr2 (302-341)||(33181534-33181573)
chr2 (359-424)||(5499842-5499907)
chr2 (278-342)||(17590865-17590928)
chr2 (515-567)||(24018503-24018554)
chr2 (302-342)||(25481260-25481300)
chr2 (302-342)||(25488866-25488906)
chr2 (716-783)||(22328806-22328873)
chr2 (301-336)||(23798619-23798654)
chr2 (291-338)||(39870767-39870814)
chr2 (136-178)||(21112645-21112687)
chr2 (136-182)||(22032546-22032592)
chr2 (350-412)||(22037378-22037440)
chr2 (351-456)||(23798460-23798568)
chr2 (359-467)||(36684237-36684349)
chr2 (351-424)||(16134260-16134333)
chr2 (550-599)||(21511826-21511875)
chr2 (351-424)||(25481326-25481399)
chr2 (351-424)||(25488932-25489005)
chr2 (351-466)||(25803828-25803947)
chr2 (136-267)||(30949503-30949634)
chr2 (512-599)||(23482615-23482701)
chr2 (301-340)||(25803994-25804033)
chr2 (312-342)||(19927278-19927308)
chr2 (752-789)||(20299646-20299683)
chr2 (225-262)||(22032617-22032654)
chr2 (423-467)||(27745071-27745116)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (136-788)||(8469-9122)
scaffold0230 (139-794)||(16019-16654)
[»] scaffold0004 (8 HSPs)
scaffold0004 (136-794)||(369208-369867)
scaffold0004 (350-627)||(24174-24463)
scaffold0004 (136-342)||(251541-251747)
scaffold0004 (136-259)||(24548-24672)
scaffold0004 (144-261)||(356306-356424)
scaffold0004 (136-182)||(253713-253759)
scaffold0004 (312-348)||(24489-24525)
scaffold0004 (350-398)||(251462-251510)
[»] scaffold0035 (5 HSPs)
scaffold0035 (136-794)||(49724-50383)
scaffold0035 (143-794)||(14276-14928)
scaffold0035 (136-342)||(55992-56198)
scaffold0035 (515-588)||(30985-31057)
scaffold0035 (515-588)||(31756-31828)
[»] chr8 (210 HSPs)
chr8 (136-794)||(22370281-22370940)
chr8 (136-794)||(11351220-11351877)
chr8 (142-794)||(27537177-27537841)
chr8 (136-794)||(21103333-21103992)
chr8 (136-794)||(21105375-21106034)
chr8 (252-790)||(20002590-20003128)
chr8 (136-794)||(21821073-21821744)
chr8 (137-794)||(22102732-22103401)
chr8 (272-793)||(19997254-19997775)
chr8 (136-794)||(18821528-18822197)
chr8 (136-794)||(20835815-20836485)
chr8 (136-794)||(21831355-21832026)
chr8 (136-794)||(22032762-22033432)
chr8 (136-794)||(22098862-22099532)
chr8 (136-794)||(22092942-22093612)
chr8 (136-794)||(40951949-40952620)
chr8 (136-794)||(22039364-22040034)
chr8 (350-794)||(25751404-25751848)
chr8 (136-788)||(17612903-17613567)
chr8 (136-788)||(17621085-17621749)
chr8 (136-788)||(21858546-21859213)
chr8 (350-794)||(21939181-21939625)
chr8 (350-794)||(20043831-20044276)
chr8 (136-794)||(25228373-25229022)
chr8 (136-788)||(21842735-21843402)
chr8 (350-794)||(21945116-21945560)
chr8 (136-794)||(21949855-21950504)
chr8 (350-794)||(20038176-20038621)
chr8 (350-794)||(29325249-29325693)
chr8 (143-794)||(19767869-19768535)
chr8 (359-794)||(1685611-1686047)
chr8 (136-667)||(11346308-11346830)
chr8 (360-794)||(35996041-35996476)
chr8 (136-619)||(24039258-24039752)
chr8 (350-794)||(33632372-33632819)
chr8 (143-638)||(1692854-1693362)
chr8 (351-794)||(26826431-26826886)
chr8 (290-794)||(21955799-21956306)
chr8 (351-794)||(45466630-45467086)
chr8 (354-788)||(20713013-20713459)
chr8 (351-794)||(38349611-38350067)
chr8 (351-783)||(18399212-18399656)
chr8 (384-794)||(19359865-19360287)
chr8 (351-783)||(18264100-18264542)
chr8 (359-794)||(23912024-23912471)
chr8 (359-794)||(23904169-23904616)
chr8 (359-794)||(21097979-21098425)
chr8 (144-547)||(23635265-23635678)
chr8 (136-476)||(23228382-23228722)
chr8 (359-794)||(18230343-18230792)
chr8 (359-779)||(20263359-20263791)
chr8 (359-779)||(21049988-21050420)
chr8 (351-794)||(24034604-24035057)
chr8 (384-794)||(23779401-23779807)
chr8 (359-783)||(23879764-23880199)
chr8 (359-794)||(21382676-21383121)
chr8 (359-794)||(8322032-8322479)
chr8 (359-794)||(8328698-8329145)
chr8 (479-794)||(22818315-22818629)
chr8 (351-789)||(14821125-14821574)
chr8 (351-789)||(37652748-37653197)
chr8 (359-794)||(8308402-8308848)
chr8 (497-794)||(16418132-16418431)
chr8 (359-794)||(8315050-8315496)
chr8 (514-794)||(14351342-14351629)
chr8 (515-794)||(18162106-18162388)
chr8 (503-794)||(22285077-22285367)
chr8 (359-789)||(17503890-17504331)
chr8 (351-794)||(39730413-39730856)
chr8 (359-794)||(43835992-43836424)
chr8 (503-794)||(42418215-42418506)
chr8 (351-789)||(1301997-1302448)
chr8 (515-789)||(14877998-14878271)
chr8 (143-601)||(22029862-22030336)
chr8 (515-794)||(15759673-15759952)
chr8 (350-600)||(22853954-22854206)
chr8 (515-783)||(22831254-22831523)
chr8 (515-794)||(17126949-17127227)
chr8 (351-683)||(18273213-18273555)
chr8 (457-794)||(9317887-9318229)
chr8 (523-794)||(25397053-25397324)
chr8 (350-751)||(17515543-17515952)
chr8 (136-344)||(19744389-19744597)
chr8 (515-794)||(23503248-23503526)
chr8 (504-695)||(6570376-6570566)
chr8 (607-794)||(21037794-21037981)
chr8 (136-342)||(20712772-20712978)
chr8 (643-794)||(22364280-22364431)
chr8 (136-342)||(33632134-33632341)
chr8 (136-293)||(23807115-23807272)
chr8 (136-342)||(8314806-8315010)
chr8 (350-563)||(13365532-13365756)
chr8 (136-342)||(8308158-8308362)
chr8 (136-342)||(21945591-21945797)
chr8 (136-342)||(21382432-21382636)
chr8 (136-342)||(35995797-35996001)
chr8 (241-374)||(23663357-23663490)
chr8 (140-342)||(13365787-13365991)
chr8 (136-342)||(20038652-20038858)
chr8 (136-342)||(8322519-8322723)
chr8 (136-342)||(8329185-8329389)
chr8 (136-341)||(14820877-14821083)
chr8 (136-342)||(21049732-21049938)
chr8 (684-794)||(21328410-21328520)
chr8 (136-342)||(23903923-23904129)
chr8 (136-342)||(23911778-23911984)
chr8 (136-342)||(20263103-20263309)
chr8 (523-789)||(6279871-6280136)
chr8 (136-298)||(20716768-20716929)
chr8 (136-341)||(25461386-25461592)
chr8 (136-342)||(20044307-20044504)
chr8 (151-342)||(22830957-22831148)
chr8 (136-338)||(26826193-26826395)
chr8 (136-238)||(16183015-16183117)
chr8 (469-611)||(29003700-29003842)
chr8 (503-639)||(23455684-23455820)
chr8 (151-342)||(24034368-24034559)
chr8 (469-592)||(5579135-5579258)
chr8 (203-342)||(20393087-20393226)
chr8 (350-463)||(20393257-20393370)
chr8 (143-342)||(19756644-19756844)
chr8 (515-647)||(26013086-26013218)
chr8 (136-342)||(18230831-18231037)
chr8 (515-783)||(1990196-1990464)
chr8 (136-342)||(21098465-21098671)
chr8 (384-783)||(21139645-21140049)
chr8 (136-341)||(6279422-6279629)
chr8 (136-342)||(18398965-18399171)
chr8 (713-794)||(27063439-27063520)
chr8 (145-342)||(27086374-27086569)
chr8 (713-794)||(27092551-27092632)
chr8 (515-789)||(23193640-23193915)
chr8 (136-267)||(23879547-23879678)
chr8 (136-269)||(22853726-22853859)
chr8 (136-238)||(45569873-45569975)
chr8 (136-287)||(21939722-21939874)
chr8 (503-647)||(14161978-14162121)
chr8 (515-647)||(21319537-21319669)
chr8 (136-262)||(45466412-45466539)
chr8 (136-275)||(17504359-17504499)
chr8 (136-271)||(20002453-20002588)
chr8 (137-236)||(1685400-1685499)
chr8 (136-267)||(9317574-9317705)
chr8 (515-622)||(24342173-24342280)
chr8 (511-599)||(26854177-26854267)
chr8 (143-262)||(37299977-37300096)
chr8 (136-262)||(23502863-23502989)
chr8 (136-262)||(25363382-25363507)
chr8 (136-260)||(23670452-23670576)
chr8 (143-291)||(38350151-38350300)
chr8 (515-599)||(18008250-18008334)
chr8 (503-598)||(24967355-24967451)
chr8 (503-648)||(19792071-19792214)
chr8 (353-511)||(25461636-25461805)
chr8 (136-217)||(22560947-22561028)
chr8 (515-600)||(31469553-31469637)
chr8 (278-338)||(6673780-6673840)
chr8 (143-262)||(18264644-18264764)
chr8 (143-262)||(18273657-18273777)
chr8 (136-262)||(17516042-17516168)
chr8 (136-262)||(19997139-19997265)
chr8 (272-342)||(17515983-17516053)
chr8 (509-622)||(15634412-15634523)
chr8 (509-622)||(15636185-15636296)
chr8 (136-201)||(23743808-23743873)
chr8 (457-622)||(24221418-24221584)
chr8 (503-622)||(22904701-22904817)
chr8 (143-262)||(37652528-37652648)
chr8 (136-262)||(39730958-39731084)
chr8 (136-258)||(5578791-5578912)
chr8 (384-467)||(17126790-17126877)
chr8 (286-342)||(25751879-25751935)
chr8 (203-262)||(25751933-25751992)
chr8 (302-345)||(43836475-43836518)
chr8 (137-262)||(29325044-29325169)
chr8 (384-467)||(6570572-6570659)
chr8 (155-267)||(14162412-14162523)
chr8 (302-342)||(14351805-14351845)
chr8 (302-341)||(9317721-9317760)
chr8 (302-341)||(23503009-23503048)
chr8 (136-320)||(42418719-42418904)
chr8 (300-342)||(5578934-5578976)
chr8 (304-342)||(18161883-18161921)
chr8 (514-622)||(18572182-18572289)
chr8 (523-600)||(23221400-23221478)
chr8 (136-185)||(21814555-21814604)
chr8 (272-341)||(37652637-37652706)
chr8 (514-620)||(24887112-24887217)
chr8 (739-794)||(6570334-6570389)
chr8 (143-182)||(16418451-16418490)
chr8 (272-338)||(18264588-18264655)
chr8 (272-338)||(18273601-18273668)
chr8 (136-195)||(22991017-22991076)
chr8 (219-262)||(43836538-43836581)
chr8 (136-198)||(1631827-1631889)
chr8 (514-618)||(25431913-25432016)
chr8 (359-420)||(19756873-19756934)
chr8 (136-262)||(22284665-22284791)
chr8 (310-342)||(22853891-22853923)
chr8 (359-419)||(27086598-27086658)
chr8 (309-341)||(45466556-45466588)
chr8 (384-427)||(14878356-14878399)
chr8 (136-179)||(17126555-17126598)
chr8 (311-342)||(29325188-29325219)
chr8 (144-260)||(14878526-14878643)
chr8 (312-342)||(38350109-38350139)
chr8 (301-343)||(39730897-39730939)
chr8 (351-424)||(14351706-14351779)
chr8 (351-424)||(18161947-18162020)
chr8 (136-181)||(43836598-43836643)
[»] chr1 (135 HSPs)
chr1 (144-794)||(13250477-13251128)
chr1 (136-794)||(3984998-3985648)
chr1 (136-794)||(3990277-3990927)
chr1 (136-794)||(16485009-16485669)
chr1 (136-794)||(27911027-27911699)
chr1 (137-794)||(20393304-20393973)
chr1 (136-794)||(20231228-20231898)
chr1 (136-794)||(20237794-20238464)
chr1 (136-794)||(23501496-23502166)
chr1 (136-794)||(41309199-41309863)
chr1 (359-794)||(38045293-38045727)
chr1 (359-794)||(27047396-27047830)
chr1 (136-794)||(19599617-19600266)
chr1 (359-794)||(27041642-27042076)
chr1 (136-794)||(28206055-28206732)
chr1 (136-794)||(2385951-2386620)
chr1 (351-794)||(18885099-18885548)
chr1 (360-794)||(49379342-49379790)
chr1 (351-794)||(36850054-36850510)
chr1 (351-783)||(8653688-8654134)
chr1 (359-794)||(2394988-2395435)
chr1 (359-794)||(20399553-20399995)
chr1 (354-794)||(41461664-41462117)
chr1 (359-794)||(22841646-22842093)
chr1 (351-783)||(4028244-4028686)
chr1 (136-423)||(22967177-22967464)
chr1 (359-794)||(17093786-17094233)
chr1 (384-780)||(46143253-46143663)
chr1 (384-783)||(8953200-8953610)
chr1 (359-794)||(17101622-17102069)
chr1 (503-794)||(17986659-17986949)
chr1 (515-794)||(44538347-44538627)
chr1 (359-794)||(21797849-21798295)
chr1 (359-794)||(21804557-21805003)
chr1 (136-346)||(20085527-20085737)
chr1 (351-789)||(18816298-18816744)
chr1 (515-794)||(26134228-26134508)
chr1 (515-783)||(8648979-8649248)
chr1 (490-794)||(19879791-19880094)
chr1 (516-794)||(17716862-17717139)
chr1 (359-719)||(22659828-22660199)
chr1 (423-794)||(25726967-25727341)
chr1 (423-794)||(25735375-25735749)
chr1 (351-794)||(19787979-19788436)
chr1 (515-783)||(39286339-39286608)
chr1 (351-789)||(21792046-21792490)
chr1 (515-783)||(16431660-16431928)
chr1 (490-794)||(19874833-19875137)
chr1 (503-790)||(19771902-19772190)
chr1 (457-788)||(21783921-21784256)
chr1 (515-789)||(41802386-41802659)
chr1 (515-789)||(28207998-28208270)
chr1 (515-766)||(48256412-48256662)
chr1 (548-794)||(12060195-12060440)
chr1 (427-695)||(16365097-16365375)
chr1 (136-342)||(2395475-2395680)
chr1 (136-342)||(23291185-23291390)
chr1 (602-794)||(41224620-41224813)
chr1 (136-342)||(22504228-22504435)
chr1 (136-342)||(17094273-17094478)
chr1 (136-342)||(17102109-17102314)
chr1 (136-342)||(21188840-21189046)
chr1 (136-301)||(17613228-17613393)
chr1 (136-342)||(21798335-21798539)
chr1 (136-342)||(21805043-21805247)
chr1 (560-788)||(19364789-19365020)
chr1 (572-789)||(22635420-22635637)
chr1 (351-598)||(22411044-22411305)
chr1 (141-342)||(22841407-22841606)
chr1 (523-790)||(20412374-20412640)
chr1 (136-342)||(20399309-20399513)
chr1 (136-342)||(22660238-22660444)
chr1 (136-342)||(22135881-22136087)
chr1 (136-342)||(41461410-41461616)
chr1 (137-342)||(8953659-8953864)
chr1 (359-639)||(52755199-52755489)
chr1 (136-342)||(8653453-8653662)
chr1 (241-342)||(22504089-22504190)
chr1 (143-342)||(52168777-52168977)
chr1 (136-269)||(22410813-22410946)
chr1 (136-342)||(49379844-49380052)
chr1 (136-291)||(18885585-18885741)
chr1 (503-788)||(28763576-28763865)
chr1 (136-262)||(25646525-25646651)
chr1 (137-342)||(38045048-38045253)
chr1 (479-573)||(52235791-52235885)
chr1 (136-227)||(27041458-27041549)
chr1 (136-227)||(27047212-27047303)
chr1 (503-598)||(52169093-52169188)
chr1 (136-341)||(21792532-21792738)
chr1 (503-647)||(13799281-13799424)
chr1 (136-262)||(4028017-4028143)
chr1 (136-196)||(22824383-22824443)
chr1 (515-598)||(12059671-12059754)
chr1 (351-427)||(25646358-25646434)
chr1 (515-622)||(16384822-16384928)
chr1 (515-622)||(21924775-21924881)
chr1 (503-598)||(26194338-26194432)
chr1 (136-260)||(18816070-18816195)
chr1 (519-600)||(24680262-24680341)
chr1 (515-600)||(25404968-25405053)
chr1 (136-262)||(19788541-19788668)
chr1 (136-238)||(22404166-22404267)
chr1 (515-640)||(15346698-15346822)
chr1 (526-647)||(16148291-16148412)
chr1 (136-259)||(23495226-23495350)
chr1 (503-599)||(30818957-30819052)
chr1 (739-794)||(52235671-52235724)
chr1 (739-794)||(16365055-16365110)
chr1 (532-590)||(16354211-16354269)
chr1 (613-695)||(52235711-52235793)
chr1 (350-415)||(22503992-22504057)
chr1 (136-185)||(52954237-52954286)
chr1 (155-267)||(13799715-13799826)
chr1 (302-342)||(19788481-19788521)
chr1 (755-794)||(41228620-41228659)
chr1 (303-342)||(44538125-44538164)
chr1 (136-182)||(19209664-19209710)
chr1 (745-794)||(1593514-1593563)
chr1 (359-466)||(19364619-19364730)
chr1 (514-586)||(15421213-15421283)
chr1 (350-398)||(21189077-21189125)
chr1 (136-179)||(18168488-18168531)
chr1 (303-342)||(18816217-18816256)
chr1 (302-341)||(22410960-22410999)
chr1 (303-342)||(25646466-25646505)
chr1 (303-342)||(26134692-26134731)
chr1 (548-618)||(2130095-2130164)
chr1 (503-600)||(20497660-20497756)
chr1 (351-424)||(26134593-26134666)
chr1 (302-342)||(4028162-4028202)
chr1 (514-618)||(16527524-16527627)
chr1 (515-622)||(23299003-23299111)
chr1 (421-467)||(19875171-19875218)
chr1 (513-599)||(17734987-17735072)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (136-794)||(2912-3572)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (136-794)||(24200-24871)
scaffold0078 (469-794)||(30614-30941)
[»] scaffold0346 (4 HSPs)
scaffold0346 (136-794)||(10473-11142)
scaffold0346 (351-794)||(2116-2571)
scaffold0346 (143-342)||(2603-2801)
scaffold0346 (136-342)||(15498-15705)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (136-794)||(2941-3612)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (136-788)||(2119-2786)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (143-794)||(2741-3407)
[»] scaffold0032 (6 HSPs)
scaffold0032 (136-794)||(117491-118163)
scaffold0032 (136-396)||(98273-98512)
scaffold0032 (136-342)||(71859-72066)
scaffold0032 (136-342)||(97398-97603)
scaffold0032 (350-467)||(97250-97367)
scaffold0032 (136-198)||(122826-122888)
[»] scaffold0071 (4 HSPs)
scaffold0071 (359-794)||(31991-32426)
scaffold0071 (423-754)||(37001-37333)
scaffold0071 (137-262)||(32514-32639)
scaffold0071 (272-342)||(32455-32525)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (136-783)||(37-677)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (359-788)||(299865-300296)
scaffold0005 (136-298)||(300347-300509)
[»] scaffold0489 (2 HSPs)
scaffold0489 (360-794)||(626-1062)
scaffold0489 (136-342)||(382-586)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (136-794)||(13861-14540)
[»] scaffold0029 (4 HSPs)
scaffold0029 (359-794)||(117708-118145)
scaffold0029 (359-794)||(123952-124389)
scaffold0029 (137-342)||(123708-123912)
scaffold0029 (136-342)||(117463-117668)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (359-794)||(2045-2482)
scaffold0301 (137-342)||(2522-2727)
[»] scaffold0009 (10 HSPs)
scaffold0009 (350-794)||(153568-154024)
scaffold0009 (351-794)||(245504-245961)
scaffold0009 (351-783)||(150566-151012)
scaffold0009 (137-310)||(66847-67020)
scaffold0009 (136-340)||(151040-151247)
scaffold0009 (136-341)||(246003-246203)
scaffold0009 (350-449)||(67074-67173)
scaffold0009 (137-262)||(154114-154240)
scaffold0009 (278-342)||(154055-154119)
scaffold0009 (136-267)||(238313-238444)
[»] scaffold0150 (4 HSPs)
scaffold0150 (136-677)||(25343-25896)
scaffold0150 (251-789)||(26029-26581)
scaffold0150 (359-789)||(19320-19752)
scaffold0150 (272-342)||(19221-19291)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (136-630)||(1-492)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (136-789)||(21368-22033)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (136-794)||(424719-425397)
scaffold0001 (351-790)||(159008-159457)
scaffold0001 (136-566)||(49265-49718)
scaffold0001 (136-341)||(158760-158966)
scaffold0001 (515-622)||(520863-520970)
scaffold0001 (515-622)||(82473-82579)
scaffold0001 (136-176)||(522300-522340)
scaffold0001 (136-173)||(182941-182978)
[»] scaffold0816 (2 HSPs)
scaffold0816 (350-794)||(1028-1483)
scaffold0816 (136-342)||(1514-1720)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (136-647)||(3048-3571)
[»] scaffold0760 (2 HSPs)
scaffold0760 (361-764)||(5949-6354)
scaffold0760 (136-262)||(6435-6560)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (359-794)||(162425-162872)
scaffold0011 (515-794)||(163616-163898)
scaffold0011 (136-342)||(164076-164281)
scaffold0011 (384-597)||(172716-172935)
scaffold0011 (253-337)||(162297-162381)
scaffold0011 (352-424)||(163984-164056)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (350-788)||(186180-186630)
scaffold0012 (136-342)||(185942-186149)
scaffold0012 (523-598)||(50003-50079)
scaffold0012 (136-181)||(101696-101741)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (136-575)||(4814-5264)
[»] scaffold0075 (4 HSPs)
scaffold0075 (350-794)||(19377-19826)
scaffold0075 (136-342)||(19148-19346)
scaffold0075 (136-177)||(36537-36578)
scaffold0075 (136-170)||(47761-47795)
[»] scaffold0381 (2 HSPs)
scaffold0381 (350-794)||(15043-15499)
scaffold0381 (136-348)||(14803-15017)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (136-788)||(22862-23537)
[»] scaffold0170 (2 HSPs)
scaffold0170 (351-794)||(6179-6635)
scaffold0170 (136-342)||(6677-6885)
[»] scaffold0142 (9 HSPs)
scaffold0142 (350-783)||(21402-21842)
scaffold0142 (350-623)||(26709-26989)
scaffold0142 (136-342)||(3373-3579)
scaffold0142 (136-342)||(27020-27226)
scaffold0142 (136-262)||(21932-22058)
scaffold0142 (350-426)||(3266-3342)
scaffold0142 (278-342)||(21873-21937)
scaffold0142 (136-190)||(12244-12298)
scaffold0142 (136-180)||(1-45)
[»] scaffold0607 (3 HSPs)
scaffold0607 (359-697)||(9463-9802)
scaffold0607 (147-262)||(9250-9364)
scaffold0607 (278-342)||(9359-9423)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (136-547)||(18434-18846)
[»] scaffold0042 (5 HSPs)
scaffold0042 (351-794)||(56382-56837)
scaffold0042 (350-654)||(72002-72318)
scaffold0042 (219-342)||(56879-57002)
scaffold0042 (136-185)||(72332-72381)
scaffold0042 (136-181)||(22091-22136)
[»] scaffold0512 (2 HSPs)
scaffold0512 (351-794)||(5665-6120)
scaffold0512 (136-342)||(5417-5624)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (359-788)||(13677-14106)
scaffold0026 (136-238)||(128889-128990)
[»] scaffold0020 (6 HSPs)
scaffold0020 (350-788)||(121493-121947)
scaffold0020 (137-262)||(111658-111784)
scaffold0020 (137-262)||(121286-121412)
scaffold0020 (350-427)||(111865-111942)
scaffold0020 (312-342)||(111804-111834)
scaffold0020 (312-342)||(121432-121462)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (136-459)||(203310-203633)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (469-794)||(5452-5779)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (351-794)||(13165-13619)
scaffold0375 (137-342)||(12917-13123)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (515-794)||(34085-34365)
[»] scaffold0278 (2 HSPs)
scaffold0278 (351-789)||(12243-12695)
scaffold0278 (201-342)||(12740-12882)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (515-794)||(17346-17625)
scaffold0211 (151-342)||(17808-17991)
[»] scaffold0112 (2 HSPs)
scaffold0112 (360-794)||(5223-5669)
scaffold0112 (136-342)||(4977-5182)
[»] scaffold0974 (2 HSPs)
scaffold0974 (483-794)||(1763-2076)
scaffold0974 (143-411)||(1448-1716)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (136-377)||(168345-168586)
[»] scaffold0291 (2 HSPs)
scaffold0291 (508-794)||(652-940)
scaffold0291 (136-467)||(938-1268)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (384-780)||(13890-14297)
scaffold0317 (136-342)||(14372-14579)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (566-794)||(42867-43095)
scaffold0125 (136-261)||(42305-42430)
[»] scaffold0916 (1 HSPs)
scaffold0916 (515-794)||(3629-3907)
[»] scaffold0506 (6 HSPs)
scaffold0506 (517-794)||(7531-7810)
scaffold0506 (350-630)||(1658-1950)
scaffold0506 (143-342)||(1981-2202)
scaffold0506 (350-521)||(9585-9766)
scaffold0506 (143-262)||(9856-9975)
scaffold0506 (278-342)||(9797-9861)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (136-467)||(54400-54726)
[»] scaffold0404 (5 HSPs)
scaffold0404 (359-794)||(3891-4338)
scaffold0404 (359-789)||(1599-2041)
scaffold0404 (136-320)||(3647-3829)
scaffold0404 (136-262)||(1376-1501)
scaffold0404 (278-320)||(1496-1537)
[»] scaffold0037 (12 HSPs)
scaffold0037 (351-789)||(83943-84392)
scaffold0037 (362-789)||(48353-48787)
scaffold0037 (136-341)||(72244-72450)
scaffold0037 (136-341)||(84434-84640)
scaffold0037 (163-262)||(44911-45011)
scaffold0037 (163-262)||(52300-52400)
scaffold0037 (272-342)||(48251-48321)
scaffold0037 (272-342)||(52389-52459)
scaffold0037 (136-190)||(57566-57620)
scaffold0037 (136-185)||(64691-64740)
scaffold0037 (359-423)||(52488-52552)
scaffold0037 (203-262)||(48203-48262)
[»] scaffold0059 (3 HSPs)
scaffold0059 (351-794)||(12986-13443)
scaffold0059 (136-342)||(12733-12941)
scaffold0059 (136-181)||(56081-56126)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (515-794)||(18632-18912)
scaffold0251 (304-342)||(19111-19149)
[»] scaffold0630 (2 HSPs)
scaffold0630 (351-790)||(5376-5826)
scaffold0630 (205-341)||(5198-5334)
[»] scaffold0861 (2 HSPs)
scaffold0861 (351-789)||(1330-1779)
scaffold0861 (136-311)||(1092-1268)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (136-789)||(27098-27762)
scaffold0138 (359-789)||(39321-39758)
scaffold0138 (251-298)||(39210-39257)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (515-794)||(48897-49177)
scaffold0064 (302-342)||(48672-48712)
scaffold0064 (354-424)||(48741-48811)
[»] scaffold0179 (2 HSPs)
scaffold0179 (136-389)||(33422-33675)
scaffold0179 (469-575)||(33715-33822)
[»] scaffold0535 (3 HSPs)
scaffold0535 (351-789)||(75-523)
scaffold0535 (136-262)||(623-750)
scaffold0535 (272-341)||(565-634)
[»] scaffold0031 (13 HSPs)
scaffold0031 (515-788)||(77943-78216)
scaffold0031 (515-783)||(23366-23634)
scaffold0031 (565-783)||(18371-18589)
scaffold0031 (136-342)||(102142-102347)
scaffold0031 (565-789)||(100569-100797)
scaffold0031 (136-296)||(8742-8902)
scaffold0031 (717-794)||(4226-4303)
scaffold0031 (515-569)||(291-345)
scaffold0031 (302-342)||(23146-23186)
scaffold0031 (302-342)||(68-108)
scaffold0031 (350-398)||(102378-102426)
scaffold0031 (351-424)||(100317-100390)
scaffold0031 (351-424)||(134-207)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (515-794)||(8550-8829)
scaffold0168 (146-251)||(578-683)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (423-794)||(12034-12416)
[»] scaffold0049 (5 HSPs)
scaffold0049 (351-789)||(14315-14767)
scaffold0049 (213-342)||(14805-14935)
scaffold0049 (143-221)||(15849-15927)
scaffold0049 (136-179)||(36408-36451)
scaffold0049 (143-181)||(31413-31451)
[»] scaffold1323 (2 HSPs)
scaffold1323 (548-794)||(396-643)
scaffold1323 (359-575)||(1818-2040)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (359-789)||(18462-18899)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (350-778)||(169067-169505)
scaffold0016 (303-342)||(169536-169575)
[»] scaffold0674 (2 HSPs)
scaffold0674 (351-789)||(1490-1940)
scaffold0674 (143-341)||(1982-2176)
[»] scaffold0486 (3 HSPs)
scaffold0486 (350-568)||(11753-11971)
scaffold0486 (136-262)||(12061-12187)
scaffold0486 (278-342)||(12002-12066)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (143-627)||(4246-4753)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (136-331)||(22072-22267)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (515-789)||(9521-9795)
scaffold0471 (302-342)||(9977-10017)
[»] scaffold0624 (1 HSPs)
scaffold0624 (469-781)||(4746-5042)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (515-790)||(6525-6800)
scaffold0447 (515-790)||(11139-11414)
scaffold0447 (302-342)||(6300-6340)
scaffold0447 (302-342)||(10914-10954)
scaffold0447 (351-424)||(6366-6439)
scaffold0447 (351-424)||(10980-11053)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (515-790)||(9134-9409)
scaffold0383 (302-342)||(8909-8949)
scaffold0383 (351-424)||(8975-9048)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (503-789)||(8528-8813)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (601-783)||(104901-105083)
scaffold0023 (136-195)||(117157-117216)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (136-575)||(6376-6839)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (515-736)||(1890-2111)
[»] scaffold0051 (4 HSPs)
scaffold0051 (136-376)||(50361-50622)
scaffold0051 (359-630)||(33801-34089)
scaffold0051 (144-294)||(34157-34308)
scaffold0051 (136-267)||(66456-66586)
[»] scaffold0072 (4 HSPs)
scaffold0072 (351-670)||(60665-60995)
scaffold0072 (138-342)||(61037-61247)
scaffold0072 (221-342)||(60491-60613)
scaffold0072 (136-179)||(60407-60450)
[»] scaffold0091 (4 HSPs)
scaffold0091 (489-694)||(17137-17344)
scaffold0091 (143-342)||(16900-17100)
scaffold0091 (707-794)||(21385-21472)
scaffold0091 (707-794)||(25582-25669)
[»] scaffold0096 (3 HSPs)
scaffold0096 (351-695)||(37742-38093)
scaffold0096 (739-789)||(37705-37755)
scaffold0096 (302-342)||(38119-38159)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (317-505)||(3487-3676)
[»] scaffold0773 (1 HSPs)
scaffold0773 (503-789)||(1219-1504)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (136-342)||(45136-45342)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (136-342)||(43616-43822)
scaffold0084 (527-595)||(49820-49888)
scaffold0084 (203-267)||(31422-31485)
scaffold0084 (717-783)||(49996-50062)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (515-789)||(18967-19242)
scaffold0165 (152-424)||(33830-34111)
[»] scaffold1092 (2 HSPs)
scaffold1092 (479-749)||(1423-1691)
scaffold1092 (423-467)||(1714-1759)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (479-749)||(2800-3068)
[»] scaffold0261 (3 HSPs)
scaffold0261 (549-789)||(4926-5167)
scaffold0261 (136-341)||(4538-4744)
scaffold0261 (351-466)||(4786-4901)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (351-695)||(61792-62142)
scaffold0058 (302-342)||(61726-61766)
scaffold0058 (739-789)||(62129-62179)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (136-342)||(34773-34981)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (574-794)||(1919-2143)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (136-357)||(2234-2434)
[»] scaffold0056 (5 HSPs)
scaffold0056 (616-783)||(70334-70501)
scaffold0056 (136-285)||(58817-58966)
scaffold0056 (143-290)||(36793-36941)
scaffold0056 (136-195)||(53704-53763)
scaffold0056 (136-181)||(42422-42467)
[»] scaffold0099 (3 HSPs)
scaffold0099 (489-789)||(6690-7013)
scaffold0099 (515-776)||(47822-48100)
scaffold0099 (211-342)||(47462-47598)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (389-593)||(3824-4040)
scaffold0452 (136-342)||(3587-3793)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (663-794)||(22473-22604)
[»] scaffold0809 (1 HSPs)
scaffold0809 (136-266)||(5659-5789)
[»] scaffold0228 (4 HSPs)
scaffold0228 (351-629)||(19612-19905)
scaffold0228 (136-260)||(17382-17507)
scaffold0228 (136-260)||(27334-27459)
scaffold0228 (301-342)||(19545-19586)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (515-789)||(44011-44268)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (136-262)||(12702-12828)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (144-432)||(12211-12510)
[»] scaffold0272 (2 HSPs)
scaffold0272 (359-508)||(1-152)
scaffold0272 (136-235)||(265-364)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (136-342)||(2228-2435)
scaffold0123 (523-600)||(14214-14291)
scaffold0123 (359-424)||(2464-2529)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (359-510)||(15442-15594)
scaffold0384 (287-342)||(15634-15689)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (136-342)||(232457-232665)
scaffold0013 (351-467)||(232292-232412)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (136-312)||(1-179)
[»] scaffold0115 (4 HSPs)
scaffold0115 (504-629)||(17741-17867)
scaffold0115 (136-262)||(18071-18198)
scaffold0115 (351-452)||(17869-17970)
scaffold0115 (305-342)||(18012-18049)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (139-246)||(39398-39504)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (143-262)||(29-148)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (136-341)||(37416-37622)
scaffold0116 (351-427)||(37298-37374)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (241-342)||(14083-14184)
scaffold0358 (350-398)||(14004-14052)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (136-342)||(2108-2315)
scaffold1208 (359-424)||(2014-2079)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (143-342)||(20039-20238)
scaffold0046 (350-438)||(20269-20357)
[»] scaffold0557 (2 HSPs)
scaffold0557 (713-794)||(1236-1317)
scaffold0557 (143-181)||(1978-2016)
[»] scaffold0441 (1 HSPs)
scaffold0441 (136-220)||(14548-14632)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (699-794)||(44963-45058)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (457-789)||(22124-22461)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (136-220)||(1-85)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (136-236)||(38532-38631)
[»] scaffold0060 (3 HSPs)
scaffold0060 (615-774)||(74174-74333)
scaffold0060 (136-262)||(73354-73481)
scaffold0060 (278-341)||(73476-73539)
[»] scaffold0582 (2 HSPs)
scaffold0582 (136-262)||(8992-9118)
scaffold0582 (278-342)||(9113-9177)
[»] scaffold0331 (2 HSPs)
scaffold0331 (136-269)||(11031-11164)
scaffold0331 (483-530)||(3776-3823)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (719-794)||(5834-5909)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (136-296)||(6-166)
[»] scaffold0371 (4 HSPs)
scaffold0371 (515-606)||(8972-9064)
scaffold0371 (663-698)||(8915-8950)
scaffold0371 (303-342)||(9258-9297)
scaffold0371 (351-424)||(9159-9232)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (515-794)||(8917-9195)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (136-275)||(61658-61798)
[»] scaffold0713 (2 HSPs)
scaffold0713 (515-789)||(6406-6680)
scaffold0713 (136-190)||(3220-3274)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (136-283)||(12544-12691)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (503-627)||(38640-38763)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (136-271)||(24069-24204)
[»] scaffold1354 (1 HSPs)
scaffold1354 (143-291)||(606-755)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (384-540)||(191098-191268)
scaffold0014 (479-622)||(168272-168414)
scaffold0014 (211-320)||(191362-191470)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (136-196)||(42796-42856)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (515-595)||(21291-21371)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (515-590)||(21436-21511)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (136-262)||(189936-190063)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (136-238)||(1083-1185)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (137-262)||(2330-2456)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (282-339)||(4835-4892)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (515-600)||(1765-1849)
[»] scaffold0374 (1 HSPs)
scaffold0374 (136-263)||(4708-4836)
[»] scaffold0855 (1 HSPs)
scaffold0855 (503-622)||(3572-3690)
[»] scaffold0847 (1 HSPs)
scaffold0847 (503-622)||(3737-3855)
[»] scaffold1202 (1 HSPs)
scaffold1202 (251-467)||(49-273)
[»] scaffold0514 (1 HSPs)
scaffold0514 (136-230)||(7707-7801)
[»] scaffold0220 (3 HSPs)
scaffold0220 (272-342)||(5303-5373)
scaffold0220 (350-424)||(5404-5478)
scaffold0220 (136-262)||(5188-5314)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (136-264)||(1056-1184)
[»] scaffold0505 (1 HSPs)
scaffold0505 (479-544)||(12513-12578)
[»] scaffold1559 (1 HSPs)
scaffold1559 (504-600)||(1506-1601)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (136-216)||(34048-34128)
scaffold0074 (503-599)||(22626-22721)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (136-196)||(54339-54399)
scaffold0073 (136-178)||(49808-49850)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (136-195)||(3442-3501)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (136-262)||(263-387)
[»] scaffold0841 (1 HSPs)
scaffold0841 (136-238)||(5275-5376)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (136-238)||(7422-7523)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (551-600)||(21748-21797)
scaffold0213 (136-177)||(8767-8808)
[»] scaffold0416 (1 HSPs)
scaffold0416 (136-196)||(15663-15723)
[»] scaffold0871 (1 HSPs)
scaffold0871 (136-195)||(4893-4952)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (203-270)||(3-70)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (136-195)||(2984-3043)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (136-195)||(58446-58505)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (136-190)||(8272-8326)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (744-794)||(1-51)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (731-789)||(2189-2247)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (136-181)||(4148-4193)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (136-217)||(778-859)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (751-794)||(2544-2587)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (136-182)||(3653-3699)
scaffold0409 (136-176)||(11908-11948)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (136-182)||(86063-86109)
[»] scaffold1004 (1 HSPs)
scaffold1004 (725-764)||(3454-3493)
[»] scaffold0594 (1 HSPs)
scaffold0594 (136-179)||(1-44)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (143-181)||(11897-11935)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (137-227)||(46867-46957)
scaffold0113 (136-181)||(550-595)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (136-198)||(84195-84257)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (302-335)||(54751-54784)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (136-182)||(10-56)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (143-181)||(19803-19841)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (509-567)||(36484-36541)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (136-181)||(5740-5785)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (765-794)||(2249-2278)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (136-169)||(162281-162314)


Alignment Details
Target: scaffold0111 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 35401 - 34742
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35401 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 35302  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35301 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 35202  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35201 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattca 35102  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35101 ataagtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 35002  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35001 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 34902  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34901 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 34802  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34801 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 34742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 568; Significance: 0; HSPs: 272)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 568; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15055 - 14396
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15055 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 14956  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14955 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 14856  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14855 caatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttagaatgca 14756  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  14755 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagt 14656  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 14556  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14555 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 14456  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14455 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 14396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 517; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 9009333 - 9009992
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  9009333 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 9009431  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9009432 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 9009531  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9009532 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatac 9009631  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9009632 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgttag 9009731  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9009732 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 9009831  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9009832 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 9009931  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9009932 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 9009992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15916653 - 15915995
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||  |||||||    
T  15916653 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaac-tatgtct 15916555  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916554 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15916455  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15916454 tctatttttagcccgaatgtaactgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgc 15916355  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916354 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttatttttatgctttctttcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 15916255  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916254 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 15916155  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15916154 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 15916055  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15916054 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 15915995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 492; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14230311 - 14229653
Alignment:
Q  138 ggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcc 237  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||||    
T  14230311 ggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcc 14230213  T
Q  238 cacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14230212 cctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 14230113  T
Q  337 tatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaa 436  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14230112 tatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaaagaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatacaa 14230013  T
Q  437 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  14230012 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagt 14229913  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14229912 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 14229813  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14229812 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 14229713  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14229712 cataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14229653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 39387510 - 39388180
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39387510 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 39387609  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39387610 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 39387709  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39387710 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 39387809  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  39387810 ataagtgataattgtttttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 39387909  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  39387910 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 39388009  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| || |||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  39388010 cctaatttcttatctgaagtcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 39388109  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  39388110 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 39388180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15924959 - 15924304
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  15924959 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 15924861  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15924860 cccctaaagttagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15924761  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagctt-agattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||  ||| |    ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15924760 tctatttttagcccaaatgtaactcctccagagt----gtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatg 15924665  T
Q  434 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15924664 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttatttttatgctttctttcttcttctccttgtctacgatgaacattag 15924565  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15924564 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 15924465  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15924464 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 15924365  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15924364 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 15924304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 783
Target Start/End: Original strand, 35953409 - 35954058
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  35953409 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 35953507  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35953508 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 35953607  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35953608 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 35953707  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35953708 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtgtacgatgaacattagt 35953807  T
Q  535 gagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcc 632  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  35953808 gagtatacttcttcttctcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttc 35953907  T
Q  633 ttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaa 732  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35953908 ttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaa 35954007  T
Q  733 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35954008 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 35954058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 454; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23077635 - 23076966
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23077635 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 23077537  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23077536 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 23077437  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23077436 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 23077337  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  23077336 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 23077238  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23077237 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 23077138  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  23077137 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattc 23077038  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23077037 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 23076966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15174245 - 15173591
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||     
T  15174245 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcccctaaa 15174147  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15174146 gtcagaagcttggcacgtcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactatatttt 15174047  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15174046 tagcccgaatgtaattgcttagattttaagtaaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcataaatattcatcttttcttggaatgcaaaatgtg 15173947  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15173946 acaattgtctttctaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgttagtgagtag 15173847  T
Q  541 acttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15173846 acttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaaattcttatct 15173747  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15173746 aaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcata 15173647  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15173646 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15173591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 18287940 - 18288609
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18287940 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 18288038  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18288039 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcctaggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18288138  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18288139 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttacttggaattc 18288238  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||          ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||    
T  18288239 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgttttctctcttctctcccatgtctacgat 18288337  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18288338 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 18288437  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18288438 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 18288537  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18288538 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18288609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16331224 - 16330587
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  16331224 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 16331126  T
Q  236 cccaca-agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  | ||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16331125 cccctatagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 16331047  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16331046 tctatttttaacccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatac 16330947  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16330946 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 16330847  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||     
T  16330846 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctcta 16330747  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  16330746 atctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaatt 16330647  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16330646 cataaaatgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 16330587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16465493 - 16464823
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16465493 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16465394  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16465393 cccccaagtcagaagcctggcacggcccgtgcttaccttggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagcaact 16465294  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16465293 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 16465194  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  16465193 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 16465095  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16465094 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 16464995  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  16464994 ccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 16464895  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16464894 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16464823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 18273725 - 18274394
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18273725 caggaaagaatattggatggattgagtcttagagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 18273823  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273824 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcctaggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18273923  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  18273924 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatgttcatcttttacttggaattc 18274023  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||          ||||||||||| ||||||||||||   || ||||||||||    
T  18274024 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgttttctctcttctctcccatgtctacgat 18274122  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18274123 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 18274222  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18274223 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 18274322  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18274323 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18274394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Original strand, 14581626 - 14582291
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14581626 caggaatgaatattggatggattgggtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 14581725  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14581726 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccatcctccagagtgtcttttgctgcttttgctttgattttaagctact 14581825  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14581826 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 14581925  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||    
T  14581926 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctccccgatgtctacgat 14582024  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14582025 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 14582124  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  14582125 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 14582224  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14582225 caaataacaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 14582291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16155335 - 16154674
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16155335 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16155236  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||         ||||||||||||||||    
T  16155235 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgct---------tagattttaagctact 16155145  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16155144 ctatttttatcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 16155045  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||          |||||  | | ||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  16155044 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttttcattcacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 16154945  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16154944 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 16154845  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  16154844 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcattcc 16154745  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16154744 aaatatcaattcataaaacgaaagttgagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16154674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 265 - 794
Target Start/End: Original strand, 15061113 - 15061643
Alignment:
Q  265 tgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttag 364  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061113 tgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttag 15061212  T
Q  365 attttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag 464  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061213 attttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag 15061312  T
Q  465 ttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtt 563  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061313 ttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtt 15061412  T
Q  564 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatca 663  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15061413 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatca 15061512  T
Q  664 accattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061513 accattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 15061612  T
Q  764 gaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15061613 gaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 15061643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16119726 - 16119035
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119726 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16119627  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc---------------------gtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||                     |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16119626 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctt 16119527  T
Q  315 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16119526 ttgcttagattttaagctactctatttttatcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaata 16119427  T
Q  415 ttcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc 504  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | ||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16119426 ttcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaattagagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctc 16119327  T
Q  505 ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16119326 ttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctc 16119227  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119226 taagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 16119127  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16119126 taattgttcatccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16119035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 265 - 794
Target Start/End: Original strand, 15066202 - 15066732
Alignment:
Q  265 tgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttag 364  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066202 tgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttag 15066301  T
Q  365 attttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag 464  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066302 attttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag 15066401  T
Q  465 ttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtt 563  Q
    ||||||| |||||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066402 ttcattttactttcttgctatttacttttatgttatctctcttcttcttcttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtt 15066501  T
Q  564 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatca 663  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15066502 ggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatca 15066601  T
Q  664 accattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15066602 accattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 15066701  T
Q  764 gaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  15066702 gaacaagtgaatttaggtaaagattgcaaag 15066732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 545507 - 544836
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  545507 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatct 545409  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  545408 ccctcaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 545309  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  545308 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 545209  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  545208 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttttctcttcttctccttgtctac 545109  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  545108 aatgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 545009  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  545008 accctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 544909  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  544908 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 544836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12548683 - 12548010
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||  ||||||  || |||||| ||| |||    
T  12548683 caggaacgaatatttgatggattgagttttgaagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagatttggaaacaaaa-tatatct 12548585  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcac---ggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagc 331  Q
    ||| ||| |||||||||||||||    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548584 cccccaaagtcagaagcttggcatcatggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagc 12548485  T
Q  332 tactctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcat 419  Q
    |||| | ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  12548484 tactatgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcat 12548385  T
Q  420 cttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtct 519  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548384 cttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtct 12548285  T
Q  520 acgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548284 acgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatg 12548185  T
Q  620 taaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 719  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12548184 taaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 12548085  T
Q  720 tctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548084 tctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 12548010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 538632 - 537962
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||  |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  538632 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaatttggagttgattcggtacaaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatct 538534  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538533 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggtcgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 538434  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  538433 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 538334  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  538333 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctaca 538234  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538233 atgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 538134  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  538133 ccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatct 538034  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538033 caaaaatcaattcataaaacgaaagtgaagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 537962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 16472040 - 16471354
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16472040 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgtatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16471941  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgt---------------------gctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||                     |||  |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16471940 ccgccaagtcagaagcttggcacggcccgtgcttaccttggcacggcccgtgcttaccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctt 16471841  T
Q  315 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaata 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16471840 ttgcttagattttaagcaactctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaata 16471741  T
Q  415 ttcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctct 503  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||    
T  16471740 ttcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctct 16471642  T
Q  504 cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct 601  Q
    ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16471641 cttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccatgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct 16471542  T
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16471541 ctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 16471442  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16471441 ataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattg 16471354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 27291675 - 27292328
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291675 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 27291774  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||                     ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27291775 ccccacagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccatctagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 27291853  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27291854 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 27291953  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc--------------atttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||              ||||| |||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  27291954 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttatttattttcttgtcatttacttttatgccttctctcttctcccccatgtctac 27292053  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatg 619  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27292054 gatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatg 27292153  T
Q  620 taaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 719  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27292154 taaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggcttgataattgtttatccatta 27292253  T
Q  720 tctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27292254 ttccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27292328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 826199 - 826643
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826199 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagataggcatcacaaatattaatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 826298  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826299 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 826398  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  826399 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgc 826498  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  826499 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 826598  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  826599 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 826643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 828210 - 828654
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828210 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagataggcatcacaaatattaatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 828309  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828310 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 828409  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  828410 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgc 828509  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  828510 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 828609  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  828610 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 828654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 360 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4466792 - 4466359
Alignment:
Q  360 cttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4466792 cttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattgt-tttctaat 4466694  T
Q  460 aaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggat 559  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4466693 aaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggat 4466594  T
Q  560 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatgg 659  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4466593 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatgg 4466494  T
Q  660 atcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgat 759  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4466493 atcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgat 4466394  T
Q  760 attcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4466393 attcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 4466359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 19364353 - 19364788
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364353 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 19364452  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19364453 taaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtaagtagacttctcttgtcttggga 19364552  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19364553 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 19364652  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364653 gatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggtgggtttgataattatttatccatcgtctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 19364752  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19364753 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 19364788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 821190 - 821630
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821190 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattaatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 821289  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  821290 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctct----ttctccttgtctacgatgaacattagtgaatagacttctctt 821385  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  821386 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgc 821485  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  821486 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 821585  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  821586 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 821630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 8718448 - 8718882
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8718448 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatattttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 8718546  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8718547 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 8718646  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8718647 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 8718746  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8718747 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 8718846  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8718847 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 8718882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19014780 - 19014344
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19014780 gcttagattttaagtcaattatgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 19014681  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19014680 taaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 19014581  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19014580 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 19014481  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19014480 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 19014381  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19014380 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 19014344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 8712944 - 8713378
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8712944 gcttagattttaagtcaactgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatattttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 8713042  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8713043 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 8713142  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8713143 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 8713242  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8713243 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 8713342  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8713343 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 8713378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 9577808 - 9578244
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9577808 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 9577907  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9577908 taaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 9578007  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9578008 attattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 9578107  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9578108 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 9578207  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9578208 atatttgaacaagtgaatttagacagagattgtaaag 9578244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23203743 - 23204180
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23203743 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgataattgtctttctaa 23203842  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23203843 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 23203942  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23203943 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 23204042  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204043 tggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 23204142  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23204143 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23204180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23509870 - 23510307
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23509870 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgataattgtctttctaa 23509969  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23509970 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 23510069  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23510070 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 23510169  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23510170 tggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 23510269  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23510270 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23510307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23515652 - 23516089
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  23515652 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgataattgtctttctaa 23515751  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23515752 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 23515851  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  23515852 gattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 23515951  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23515952 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 23516051  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23516052 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23516089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4158813 - 4158377
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4158813 gcttagatttgaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 4158714  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  4158713 taaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 4158614  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  4158613 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 4158514  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4158513 ggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 4158414  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4158413 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 4158377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 384 - 794
Target Start/End: Original strand, 18389640 - 18390049
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgtta 483  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  18389640 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaataaaagttcatttactttattgtta 18389738  T
Q  484 tttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataa 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389739 tttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataa 18389838  T
Q  584 tcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaa 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389839 tcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaa 18389938  T
Q  684 acgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389939 acgaaagtggagggtttgataattttttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 18390038  T
Q  784 agattgtaaag 794  Q
     ||||| ||||    
T  18390039 ggattgcaaag 18390049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 12575540 - 12576189
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  12575540 caggaatgaatattggatggatcgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 12575639  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575640 cccccaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagcgtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 12575718  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  12575719 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 12575818  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||          | ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  12575819 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttattttcctgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 12575918  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12575919 aacatgactgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaac 12576018  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||  |    
T  12576019 cctaatttcttatctaaattcactgttttaacatggaacaaccattatcaaactgtagaaacgaaagttgtgggattgataattgtttatccattattcc 12576118  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12576119 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 12576189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 255 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 45408054 - 45407511
Alignment:
Q  255 gcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt-------tagcc 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       | |      
T  45408054 gcacggcccgtgctaggcttggcatggccgtgccaccctccagaaccacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttttagtttacttgtg 45407955  T
Q  348 caa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
     || ||    || || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45407954 gaacattctagtgattgcttaaattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtg 45407855  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45407854 acaattgtctttctaataaaagttctttttactttcttgttatttatttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 45407755  T
Q  542 cttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45407754 cttcttcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatcta 45407655  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45407654 aattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 45407555  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45407554 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 45407511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 5397662 - 5398118
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5397662 aatgtaattgcttagattttaagttgaatgtatgctataaatagagtagatagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 5397761  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5397762 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagta 5397861  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5397862 gacttctcttgtcttgggattgttggatgagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatc 5397961  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  5397962 taaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcat 5398061  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5398062 aaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagccaaagattgtaaag 5398118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 14551621 - 14552058
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14551621 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctga 14551720  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551721 taaaagttcacctttactttcttgttatttacttttgtgcattctctcttcttccccttgtatacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 14551820  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  14551821 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatctcatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 14551920  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14551921 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 14552020  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14552021 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 14552058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 5840384 - 5841060
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |   ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  5840384 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtatgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatc 5840483  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5840484 tccctcaagtcataaacttggcacggcccgtgctaggcttagcacggccgtgccacactctagaactactttttctgcttttgcttagattttaagctac 5840583  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || ||||||||||||||| || || |  |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  5840584 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagttgaatgtaaactataaatagcgtagctagccatcacaaatattcatatt 5840683  T
Q  423 ttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttg 516  Q
    || ||   ||||   |||| ||||||| ||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5840684 ttgttctcggaaat-aataagtgacaactgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctctatg 5840782  T
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    ||||| ||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5840783 tctacaatgcacgttattgagtagatttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatctt 5840882  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
    |||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840883 atgtaaccctaatctctaatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 5840982  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840983 tcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 5841060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 14545381 - 14545818
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  14545381 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatctttccttggaatacaatatgtgacaattgtctttctga 14545480  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14545481 taaaagttcacctttactttcttgttatttacttttgtgcattctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgt 14545580  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  14545581 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatctcatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 14545680  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14545681 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 14545780  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14545781 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 14545818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 30257288 - 30257743
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  30257288 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaataaagtagctatccatcacaaatattcatctttt-ttggaattcaataagtgacaattg 30257386  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  30257387 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 30257486  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30257487 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 30257586  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30257587 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcat 30257686  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30257687 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 30257743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 311 - 794
Target Start/End: Original strand, 16532579 - 16533074
Alignment:
Q  311 gcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcaca 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16532579 gcttttgcttagattttaaactactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatcctataaatagagtagtcatccatcaca 16532678  T
Q  411 aatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgcttt 499  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16532679 aatattcatctttacttggaagtcaataagggacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgcttt 16532777  T
Q  500 ctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaacca 597  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16532778 ctctcttctcccccatgtctatgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagcca 16532877  T
Q  598 agctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 697  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16532878 agctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggaggg 16532977  T
Q  698 tttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16532978 tttgataattgtttatccatgattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16533074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 311 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16633083 - 16632588
Alignment:
Q  311 gcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcaca 410  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  16633083 gcttttgcttagattttaaactactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatcctataaatagagtagtcatccatcaca 16632984  T
Q  411 aatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgcttt 499  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||    
T  16632983 aatattcatctttacttggaagtcaataagggacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgcttt 16632885  T
Q  500 ctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaacca 597  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  16632884 ctctcttctcccccatgtctatgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagcca 16632785  T
Q  598 agctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 697  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16632784 agctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggaggg 16632685  T
Q  698 tttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16632684 tttgataattgtttatccatgattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16632588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 13651918 - 13652374
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13651918 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcagaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13652017  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  13652018 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 13652116  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13652117 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 13652216  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13652217 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 13652316  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13652317 taaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13652374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 13658441 - 13658897
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13658441 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccgtcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13658540  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  13658541 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 13658639  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13658640 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 13658739  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13658740 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 13658839  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13658840 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13658897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16077198 - 16076520
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  16077198 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 16077099  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16077098 tccatcaagtcagaaacttggcacggcccgtgcaaggcttggcacagccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 16076999  T
Q  335 tctatttt----------tagcccaaat--gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||          | |  ||     || || ||||||||||||||| ||   ||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16076998 tctgttttagtttacttgtgggacattctagtgattgcttagattttaagttgaaacaaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 16076899  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  16076898 ttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttcttcat 16076801  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| || ||| |||||||    
T  16076800 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaagccaaactctaagccttaat 16076701  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16076700 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 16076601  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16076600 ccattatctcaaatattaattcataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16076520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18072610 - 18072154
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18072610 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccataaaaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 18072511  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  18072510 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttattctttcactcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 18072412  T
Q  539 agacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18072411 agacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttattat 18072312  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18072311 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 18072212  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18072211 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18072154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3201830 - 3201383
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||    
T  3201830 gcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaaatcaataagtgacaattgcttttctaa 3201731  T
Q  459 taaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    | ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  3201730 ttaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctaccgtgaacatgagtgagtagacttctc 3201632  T
Q  548 -ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3201631 cttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 3201532  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3201531 ccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaa 3201432  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3201431 agtggagctttgatatacgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3201383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 15206223 - 15205773
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15206223 aatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtatgctataaatatagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 15206124  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15206123 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 15206024  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15206023 gacttctatttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 15205924  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  15205923 taaattcactgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccatcatctcaaatatcaagtcat 15205824  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15205823 aaaacgaaagtggagttttgatactcgaacaagtgaatttagacaaggatt 15205773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23293853 - 23293397
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  23293853 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtatctagtcatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 23293754  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattta-----cttttct-----gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||      |||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  23293753 tctttctaataaaagttcttttcttttccttttctttcttgttatttacttttatgatttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 23293654  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  23293653 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatc 23293554  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23293553 taaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggatatgaaagtggagggtttgatgattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat 23293454  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293453 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23293397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Original strand, 4294308 - 4294984
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  4294308 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatgggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 4294407  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4294408 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 4294507  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  4294508 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaaatataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 4294607  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4294608 ttcttgaaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttctc 4294707  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
      |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||     
T  4294708 gatgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaaccttag 4294807  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    | |||| |||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4294808 tattatataaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaa 4294907  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4294908 tccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 4294984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 783146 - 782473
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  783146 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 783047  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  783046 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgttgcttttgcttagattttaagctac 782947  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||| ||||||||||||| || |  ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  782946 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttggattttaagtcgaatgtaaactatatatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 782847  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  782846 ttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctctat 782749  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  782748 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaat 782649  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  782648 cttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttggtaatcgttaat 782549  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  782548 ccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 782473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 351 - 786
Target Start/End: Complemental strand, 37100519 - 37100071
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  37100519 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatcacaaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 37100420  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||          | ||||||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37100419 tgtctttcttaataaaagtttttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgcttttccttttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 37100320  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  37100319 gtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaat 37100221  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37100220 ctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaggtggagggtttgataatcgttaatccatcatctcaaatatcaattca 37100121  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaga 786  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37100120 taaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaga 37100071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Original strand, 21506916 - 21507359
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21506916 atgtaattgcttaaattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatattttcttggaattcaataagtgacaattgt 21507015  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctct-tcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  21507016 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccctcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 21507114  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  21507115 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaggttattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatct 21507214  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21507215 aaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 21507314  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21507315 aaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaa 21507359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18589390 - 18588943
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18589390 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 18589291  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18589290 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18589191  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18589190 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18589091  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18589090 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttcaaatatcaattcataaaacgaaa 18588991  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18588990 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18588943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18592984 - 18592537
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18592984 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 18592885  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18592884 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18592785  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18592784 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18592685  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18592684 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttcaaatatcaattcataaaacgaaa 18592585  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18592584 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18592537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18599615 - 18599168
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18599615 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 18599516  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18599515 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18599416  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18599415 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18599316  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18599315 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattatttcaaatatcaattcataaaacgaaa 18599216  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18599215 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18599168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Original strand, 12567351 - 12568024
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  12567351 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 12567450  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12567451 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaacttttgctgcttttacttagattttaagctac 12567550  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  12567551 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 12567650  T
Q  423 tt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttg 516  Q
    ||   |||  ||   |||||||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||    
T  12567651 ttgttcttttaaat-aatatgtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatcctttctctcttcttctctatg 12567749  T
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||     
T  12567750 tctacaatgaacgttagtgggtagacttatcttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttcaaccttaata 12567849  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  12567850 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgagaatcgttaatc 12567949  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12567950 cattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtgtagcattaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 12568024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 136 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15298030 - 15297789
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15298030 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttagagccgattggatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgact 15297931  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15297930 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 15297831  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgat 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15297830 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgat 15297789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15176217 - 15176664
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  15176217 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 15176316  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15176317 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 15176416  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15176417 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 15176516  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15176517 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 15176616  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15176617 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15176664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 33612252 - 33611972
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612252 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 33612153  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33612152 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 33612053  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612052 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 33611972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 34390567 - 34391010
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  34390567 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattt 34390666  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgt----tatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc 545  Q
    |||||  ||||||||||| |||  ||| || |    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34390667 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttatttacttttatgctttctatcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttc 34390766  T
Q  546 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||    
T  34390767 ttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattca 34390866  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||||     
T  34390867 ccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgat 34390966  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  34390967 agtggagttttaatatttgatcaagtgaatttagacaaggattg 34391010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 782
Target Start/End: Original strand, 13674438 - 13674873
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  13674438 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 13674537  T
Q  459 taaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||          | |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13674538 ataaagttattttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 13674637  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13674638 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 13674737  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  13674738 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 13674837  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13674838 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagaca 13674873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 48801398 - 48800959
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  48801398 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 48801299  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttctgttatttactt-ttatg--ctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||  ||| || ||| ||||   |||| | | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  48801298 tgtctttcttaataaaagtt-attttcttttcctttactttcttgttatttacttt-tatgttcttctccacgtctacgatgaacatgagtgagtggact 48801201  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||    
T  48801200 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaa 48801101  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    ||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48801100 ttcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattggtaatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 48801001  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48801000 cgaaagtggatctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 48800959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 354 - 789
Target Start/End: Original strand, 24057612 - 24058059
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctt 453  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||    
T  24057612 taattgcttagattttaagtcgaatgtatgctatagatagagtagctagccatcacaaatattaatcttttcttagaatccaataagggacaattgtctt 24057711  T
Q  454 tctaataaaagttc----------atttacttttctgttatttacttttatgctttctct-cttcttctccttgtcta-cgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    ||||||||||||||          |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24057712 tctaataaaagttcttttcttttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctcttcttcttctccgtgtctaacgatgaacatgagtgagtaga 24057811  T
Q  542 cttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||    
T  24057812 cttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaaccttaatctaatgtaaccctagtttctcttcta 24057911  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  24057912 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagtggagggtttgataatcgttagtccattatcccaaatatcaattcataa 24058011  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24058012 aacgaaagtggagttttgata--cgatcaagtgaatttagacaaggattg 24058059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 351 - 791
Target Start/End: Original strand, 12199105 - 12199561
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||| ||||| |||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  12199105 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacagatatttatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 12199204  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttc--tct-cttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||   ||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  12199205 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttattttactttatgcttttcttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgag 12199304  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12199305 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatttct 12199403  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
     ||||||||||||   ||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12199404 aatctaaattcactgttttaacatgaattaactattattaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaat 12199503  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgta 791  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12199504 tcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacacggattgta 12199561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 14752700 - 14753148
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  14752700 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 14752799  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  14752800 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 14752899  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14752900 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattca 14752999  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  14753000 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 14753099  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14753100 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 14753148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 782
Target Start/End: Original strand, 13667760 - 13668195
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  13667760 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 13667859  T
Q  459 taaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||          | |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13667860 ataaagttattttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 13667959  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13667960 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagtcttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 13668059  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  13668060 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 13668159  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13668160 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagaca 13668195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 18618700 - 18619147
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18618700 gcttagattttaagtcaattttgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 18618799  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18618800 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18618899  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18618900 ttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaaccttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18618999  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18619000 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 18619099  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18619100 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18619147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 518 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 648766 - 648489
Alignment:
Q  518 ctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  648766 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatttt 648667  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  648666 atgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcatactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcca 648567  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  648566 tcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacatgtgaatttagataaagattgtaaag 648489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 20108954 - 20109408
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  20108954 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcaatcacaaatattcatcttttattggaattcaataagtgacaattgt 20109053  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  20109054 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttcttcatgtctacgatgaacatgagtgagta 20109152  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||| |  ||| || |||||||||||  ||||  || ||||    
T  20109153 gacttctcttgtcttaggattgttggataagtcttaataaaataatcctaatcaacccaagctattgaccctagtcttatgtaactataatctctaatct 20109252  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||     ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20109253 aaattcgttgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 20109352  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20109353 aaacgaaagaggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20109408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3210874 - 3210434
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3210874 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 3210775  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  3210774 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctccatgtctactatgaacatgagtgagtagactt 3210675  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  || ||||||||    
T  3210674 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctattaaccctcaatcttatgtaacactaatctctaatctaaat 3210575  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    | |||  ||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  3210574 taaccgttttaacatgaattaaccattatcaaatcgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatcatcgcaaatatcaattcataaaac 3210475  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3210474 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 3210434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 250 - 789
Target Start/End: Original strand, 12561774 - 12562327
Alignment:
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt------- 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||           
T  12561774 gcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccataactacttttgctgcttttgcttagattttatgctactctgttttagtttac 12561873  T
Q  343 ---tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgca 435  Q
       | |  || | || || |||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||    | |||  |    
T  12561874 ttgtggagcata-gtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactagaaatagagtagctagccatcataaatattcatcttttgttctctgaaat--a 12561970  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatta 532  Q
    ||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  12561971 ataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttactttaatgttttatctcttcttctccatgtctacgatgaacatga 12562070  T
Q  533 gtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcc 632  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |    
T  12562071 gtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataatattatgtaaccctagtttc 12562170  T
Q  633 ttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaa 732  Q
    |  |||||||| |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||    
T  12562171 tcttctaaatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaa 12562270  T
Q  733 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12562271 ttcataaaacgaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 12562327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 38388304 - 38387855
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  38388304 atgtaattgcttagattttaagttgaatgttacctataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 38388205  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  38388204 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatttctacgatgaccatgagtgagta 38388105  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||  ||||    
T  38388104 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccatagtttctcttcta 38388005  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||   ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  38388004 aattcacagttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 38387905  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38387904 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 38387855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 530 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 48340571 - 48340305
Alignment:
Q  530 ttagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  48340571 ttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgtaaccctc 48340472  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||  || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  48340471 atctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaat 48340372  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48340371 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 48340305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 385 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2325953 - 2325541
Alignment:
Q  385 tataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt----tacttt 476  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||    
T  2325953 tataaatagagtagctagccatcacaataaatcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaaattctttcttttacttt 2325854  T
Q  477 tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaat 576  Q
      ||||||||  ||| |||  |||| ||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2325853 cttgttattttattt-atg--ttct-tcttcttctctatgtctacgatgagcatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaac 2325758  T
Q  577 gacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaac 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||     
T  2325757 gacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaat 2325659  T
Q  677 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2325658 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggggtcttgatattcgaacaagtgaatt 2325559  T
Q  777 tagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  2325558 tagacaaggattgcaaag 2325541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 629
Target Start/End: Original strand, 16497498 - 16497982
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  16497498 caggaatgcatattggatggaatgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 16497597  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||                    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16497598 cccccaagccagaagcttggcacggcccgt--------------------gccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 16497677  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||| || ||    
T  16497678 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaataaagtagccatccatcaacaatatccatctttacttgg-attca 16497776  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  16497777 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 16497875  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16497876 gaacatgagtgagtagatttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 16497975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 17946826 - 17947105
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17946826 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatt 17946925  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17946926 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatc 17947025  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17947026 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 17947105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 22578573 - 22579014
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  22578573 gcttagattttaagtcaaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatttggaattcaataagtgacaattgtcttttga 22578672  T
Q  458 ataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||||||| |||          |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22578673 ataaaagttcttttcttttactttactttattgttatttaattttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 22578772  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  22578773 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaagccaagtcttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcacc 22578872  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
      ||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| | |||||||||||| ||||    
T  22578873 gttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcattaatccatcattccaaatgttaattcataaaacaaaag 22578972  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22578973 tggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 22579014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 4313323 - 4313603
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4313323 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagcttttaaccctaat 4313422  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4313423 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 4313522  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4313523 ccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 4313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9258653 - 9258331
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9258653 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggata 9258554  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   | | |||||||||||  ||||| ||| || || |||    
T  9258553 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttaggtaaccctaatctataagctaaattcaccgttttaacatgaattaatcat 9258455  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9258454 tatcaaactatggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatc--ctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctgtgatattcgaaca 9258357  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9258356 agtgaatttagacaagggttgtaaag 9258331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Original strand, 9311600 - 9311922
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9311600 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggata 9311699  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||   | | |||||||||||  ||||| ||| || || |||    
T  9311700 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatcttaggtaaccctaatctataagctaaattcaccgttttaacatgaattaatcat 9311798  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9311799 tatcaaactatggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatc--ctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctgtgatattcgaaca 9311896  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||    
T  9311897 agtgaatttagacaagggttgtaaag 9311922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16774323 - 16773992
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  16774323 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggaacaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 16774224  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16774223 cccccaagtcagaagcttggcacggcccatgccatcattggcacgaccgtgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 16774124  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  16774123 ctatttttagtccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttgaaattca 16774024  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||| |||||||||   |||||||| |||||||    
T  16774023 ataagtgacaattccttttctaattaaagttc 16773992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 35964207 - 35963929
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  35964207 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaaaccaagctttaactct-aatc 35964109  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||  || |||| |||||||   ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35964108 ttatgtaaccctaatctctaatctgaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 35964009  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35964008 catcatcacaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 35963929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 4307959 - 4308239
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||||  |||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  4307959 tgtctacaatgaacgtcggtgagtagactcttcttttctggggattattggataagtataaatgacataatcctaatcaaaccaaacttttaaccctaat 4308058  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4308059 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 4308158  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308159 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 4308239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 41722807 - 41723075
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| |||||    
T  41722807 tgtctacaatgaacgttggtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagttattaaccataatc 41722906  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||| ||  || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41722907 ttatgtaaccctgatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 41723006  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41723007 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 41723075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 4030120 - 4030398
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  4030120 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccct-aatc 4030218  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4030219 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttcatc 4030318  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4030319 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 4030398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 20624541 - 20624989
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| |||    
T  20624541 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccgtcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagcgacagttg 20624640  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  20624641 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatactttctctcttcttctgcatgtctacgatgaccatgagtgagta 20624740  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  20624741 gacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaacctt-aaatcttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 20624839  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  | ||| | |||||||||    
T  20624840 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccgtcattccaaatgttaattcataa 20624939  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20624940 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 20624989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 541 - 794
Target Start/End: Original strand, 319766 - 320020
Alignment:
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  319766 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctg 319865  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||    
T  319866 aattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataa 319965  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  319966 aacgaaagtggagctttaatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 320020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 13731897 - 13732166
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  13731897 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttttcttggatttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccataat 13731996  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||| |  ||||| ||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13731997 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgttttaaaatgaattaaccatgatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 13732096  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13732097 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 13732166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 469 - 790
Target Start/End: Original strand, 16487438 - 16487758
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16487438 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacagtgaacatgagtgagtagaattctcttgtcttgggattgtgggata 16487537  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||| || || ||||||||| |||  ||| | ||| || ||||||    
T  16487538 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaaccctaatcttacataaccctagtttctaatctaaatttaccgtttttacatgaattaaccat 16487637  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  16487638 tatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccat-atctcaaatatcaattcataaaacaaaagtggagttttgatattctaaca 16487736  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  16487737 agtgaatttagacaaggattgt 16487758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 359 - 602
Target Start/End: Original strand, 9585234 - 9585478
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9585234 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 9585333  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9585334 taaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 9585433  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9585434 attattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 9585478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 782
Target Start/End: Original strand, 20626860 - 20627302
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20626860 atgtaattgctttgattttaagtcgaatgttacctatgaatagagaagctatccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacagttg 20626959  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20626960 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttctttttcatgtctatgatgaccatgagtgagta 20627059  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  20627060 gacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttattttcta 20627159  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||    
T  20627160 aattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataa 20627259  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20627260 aacgaaagtggagctttaattttcgatcaagtgaatttagaca 20627302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 782
Target Start/End: Original strand, 20630751 - 20631193
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20630751 atgtaattgctttgattttaagtcgaatgttacctatgaatagagaagctatccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacagttg 20630850  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20630851 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttctttttcatgtctatgatgaccatgagtgagta 20630950  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  20630951 gacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttattttcta 20631050  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||    
T  20631051 aattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataa 20631150  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20631151 aacgaaagtggagctttaattttcgatcaagtgaatttagaca 20631193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 782
Target Start/End: Original strand, 20635359 - 20635801
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20635359 atgtaattgctttgattttaagtcgaatgttacctatgaatagagaagctatccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacagttg 20635458  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20635459 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttctttttcatgtctatgatgaccatgagtgagta 20635558  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  20635559 gacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttattttcta 20635658  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||    
T  20635659 aattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataa 20635758  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20635759 aacgaaagtggagctttaattttcgatcaagtgaatttagaca 20635801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 782
Target Start/End: Original strand, 20637231 - 20637673
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||    |||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  20637231 atgtaattgctttgattttaagtcgaatgttacctatgaatagagaagctatccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacagttg 20637330  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||| ||| ||||||||    
T  20637331 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttctttttcatgtctatgatgaccatgagtgagta 20637430  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  || ||||    
T  20637431 gacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttattttcta 20637530  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||    
T  20637531 aattcaccgttttaacttggattaaatattatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataa 20637630  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  20637631 aacgaaagtggagctttaattttcgatcaagtgaatttagaca 20637673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 9004728 - 9005009
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  9004728 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaat 9004827  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9004828 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcagacagtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 9004927  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcat-aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9004928 ccatcatctcaattatcaattcataaaaacgaaagtgggtttttgacattcgaacaagtgaatttagacaagggttgtaaag 9005009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 548 - 794
Target Start/End: Original strand, 9192649 - 9192896
Alignment:
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||     
T  9192649 ttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttacgtaaccctaatttctaatctaaattcat 9192748  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9192749 cgttttaacatgaattgaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataactgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 9192848  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9192849 gttgagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 9192896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 603 - 794
Target Start/End: Original strand, 9725871 - 9726062
Alignment:
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9725871 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 9725970  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9725971 taattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatttagacagagattgtaaag 9726062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 10204828 - 10205108
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagact--tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  10204828 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaccct-aa 10204926  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10204927 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgatttaacatgaattaaccattatcaaactataaaaacgaaagtggaaggtttgataattgttaa 10205026  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  10205027 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagttttgatattcgaacaagtgaattttgacaaggattgcaaag 10205108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 423 - 781
Target Start/End: Original strand, 39271175 - 39271536
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt----tacttttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttg 516  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||    ||||||  ||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||   ||    
T  39271175 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttcttttactttcttgttattttattt-atgttcttct-tcttcttctttatg 39271272  T
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  39271273 tctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaatctt 39271372  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || || ||| || ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  39271373 atgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgtttcaacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattca 39271471  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 781  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39271472 tcatctcaaatatcaattcataaatcgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagac 39271536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 11921184 - 11920874
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11921184 caggaacgaatattggatggattgagtattggagcaaaagaaagggactttgagctgattgaatgcaaaaatacaaagattgagagacaaaaatatgtct 11921085  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||   |||||||||||||||||                     |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11921084 cctcaaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctctatagtgtctttggctgcttttgcttagattttaagctact 11921006  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11921005 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 11920906  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  11920905 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc 11920874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 48355544 - 48355268
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  48355544 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaactttaaaccttaa 48355445  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    ||||||||||||||| || ||  |||||||||||   ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  48355444 tcttatgtaaccctattttctcttctaaattcactgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaa 48355345  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  48355344 tccattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaaataaatttagacaaggattg 48355268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 515 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 3376489 - 3376224
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  3376489 tgtctacaatgaacgttagtgagtaaactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatt 3376390  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  3376389 ttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 3376291  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 781  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3376290 catcatctcaaatatcaattcataaagcgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaagttagac 3376224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 558 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 8522091 - 8521860
Alignment:
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||    
T  8522091 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aattttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacat 8521993  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  8521992 gaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtgcagttttg 8521893  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  8521892 atattcgagcaagtgaatttagacaaggattgt 8521860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 595 - 794
Target Start/End: Original strand, 12661732 - 12661931
Alignment:
Q  595 ccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 694  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661732 ccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttcacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 12661831  T
Q  695 gggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12661832 gggtttgataattgtttatccattatttcaaatatcaattcataaaattaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 12661931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 13434979 - 13435259
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagact--tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  13434979 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgagattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaccct-aa 13435077  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  13435078 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccactatcaaactatagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaa 13435177  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||||| ||| ||||| ||||    
T  13435178 tcaatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagtcttgatactcgaacaatggaatttagtcaaggattgcaaag 13435259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 608 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16097394 - 16097208
Alignment:
Q  608 cttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatt 707  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097394 cttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataatt 16097295  T
Q  708 gtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097294 gttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 16097208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 18915909 - 18915756
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  18915909 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagaaataaaaatatgtct 18915810  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgcca 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18915809 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgcca 18915756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 632 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 11954103 - 11953947
Alignment:
Q  632 cttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatca 731  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11954103 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 11954004  T
Q  732 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11954003 attcataaaacgaaagtcgagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 11953947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 350 - 575
Target Start/End: Original strand, 13411213 - 13411443
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13411213 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13411312  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||     |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  13411313 tctttctaataaaagttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaccataaatgagtagactt 13411412  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  13411413 cttatgtcttgggattgttggataagtctaa 13411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 15707223 - 15706949
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||     
T  15707223 tgtctacaatgaaagttagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcttaatcaagccaagtcttaaaccctaatt 15707124  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  15707123 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaagtgaagggtttgataatcgttaatc 15707024  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||  | ||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15707023 cattattccaaatgttaattcataaaacaaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaatgattg 15706949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15206461 - 15206254
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15206461 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgatttagtgcgataatacgaagatttagagacaaaaatatgtct 15206362  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206361 cccccaaagtcagaatcttggcacggcccgtgctagcattggcacggtcgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15206262  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  15206261 tctatttt 15206254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 30257050 - 30257257
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  30257050 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 30257149  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30257150 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacagccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttacttagattttaagctac 30257249  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  30257250 tctatttt 30257257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 13658204 - 13658410
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13658204 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctaatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 13658303  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13658304 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccttccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 13658403  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13658404 ctatttt 13658410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14941712 - 14941439
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||      
T  14941712 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatctaaatcaagccaagccttaaaccctaact 14941613  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||| ||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||    
T  14941612 ttatgtaaccctagtttctcttctaa-ttcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgctaatc 14941514  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  14941513 cattatcccaaatattaatacataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaagtgagtttagacaaggattg 14941439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 15369305 - 15369032
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||| ||||||| |||      
T  15369305 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcaaaatcaagccaagccttaaaccctaact 15369206  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||| ||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||    
T  15369205 ttatgtaaccctagtttctcttctaa-ttcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgctaatc 15369107  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  15369106 cattatcccaaatattaatacataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaagtgagtttagacaaggattg 15369032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 624 - 794
Target Start/End: Original strand, 16525736 - 16525906
Alignment:
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  16525736 cctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatgtatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcattcc 16525835  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16525836 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16525906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Original strand, 13651683 - 13651887
Alignment:
Q  138 ggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcc 237  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13651683 ggaatgaatattggatggattgagtcttagagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtctcc 13651782  T
Q  238 cacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 337  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13651783 ccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 13651882  T
Q  338 atttt 342  Q
    |||||    
T  13651883 atttt 13651887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 13410982 - 13411182
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  13410982 gaatattggatggattgaatcttagagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctcctccaa 13411081  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13411082 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttctgcttagattttaagctactctattt 13411181  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  13411182 t 13411182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13375375 - 13375168
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  13375375 caggaacgaatattggatggatttagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 13375276  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13375275 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacgaccgtgccaccctccaaagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 13375176  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  13375175 tctatttt 13375168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4159058 - 4158875
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  4159058 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 4158960  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  4158959 tccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgctt 4158875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 359 - 611
Target Start/End: Complemental strand, 4791033 - 4790769
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  4791033 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtttttctaa 4790934  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    | ||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  4790933 tgaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttt-tctccttcttctccatgtctacgataaacatgagtgagtagacttctt 4790835  T
Q  548 tt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790834 tttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 4790769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 825962 - 826168
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||     
T  825962 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtca 826060  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  826061 cccctaaagtcagaaacttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 826160  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  826161 tctatttt 826168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 12198853 - 12199060
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12198853 caggaatgaatatttgatggattgaatcttgaagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 12198952  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12198953 ctcccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggaacaccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 12199052  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  12199053 tctatttt 12199060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8712699 - 8712904
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  8712699 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8712797  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8712798 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 8712897  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8712898 ctatttt 8712904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8718203 - 8718408
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  8718203 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8718301  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8718302 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 8718401  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8718402 ctatttt 8718408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 14752456 - 14752660
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  14752456 caggaaggaatatttgatggatagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 14752554  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  14752555 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 14752653  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  14752654 ctatttt 14752660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 634 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25181029 - 25180869
Alignment:
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25181029 tatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaat 25180930  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||    
T  25180929 tcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaactagtgaatttaaacaagaattgtaaag 25180869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 820953 - 821159
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  820953 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagctgatttggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 821051  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  821052 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccatgctagcattggcacgaccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 821151  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  821152 tctatttt 821159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 535 - 789
Target Start/End: Original strand, 48713581 - 48713835
Alignment:
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||     
T  48713581 gagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttcta 48713680  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||||||||||  ||| | ||| || ||| |||| || |||   ||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  48713681 atctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccacactcatgaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaatt 48713779  T
Q  735 cataaaacgaaagtgg-agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  48713780 catcaagcgaaagtggaagttttgatattggaacaagtgaattgagacaaggattg 48713835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 352 - 647
Target Start/End: Original strand, 368051 - 368354
Alignment:
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaatt 448  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| |||||||||    
T  368051 tgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttgttcttggaatacaataagtgacaatt 368150  T
Q  449 gtctttc-taataaaagttcatttacttttctgttatttactt-----ttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||||||  |||||| |||     ||||| |||   ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  368151 gtctttcattataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgttatttatgattttcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagac 368249  T
Q  543 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||||  |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||  |||||||    
T  368250 ttcttatgtcttggaattgttgaataagtataatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccctaattttatgtaaccctagtttctcttctaaat 368349  T
Q  643 tcacc 647  Q
    |||||    
T  368350 tcacc 368354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 13674194 - 13674398
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  13674194 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 13674292  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  13674293 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 13674391  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13674392 ctatttt 13674398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15175973 - 15176177
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  15175973 cagggaagaatattggatggattaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 15176071  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  15176072 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 15176170  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15176171 ctatttt 15176177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18589635 - 18589430
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18589635 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18589537  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18589536 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18589437  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18589436 ctatttt 18589430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18593229 - 18593024
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18593229 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18593131  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18593130 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18593031  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18593030 ctatttt 18593024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18599860 - 18599655
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18599860 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18599762  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18599761 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18599662  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18599661 ctatttt 18599655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18618455 - 18618660
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18618455 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18618553  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18618554 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18618653  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18618654 ctatttt 18618660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19015024 - 19014820
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  19015024 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 19014926  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  19014925 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 19014827  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  19014826 ctatttt 19014820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16097785 - 16097578
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  16097785 caggaacgaatatttgatggattgagttttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatatc 16097686  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097685 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggctgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 16097586  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||| ||||    
T  16097585 tctgtttt 16097578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 9577563 - 9577768
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  9577563 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 9577661  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  9577662 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgtcaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 9577761  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  9577762 ctatttt 9577768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 9584989 - 9585194
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  9584989 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 9585087  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  9585088 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgtcaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 9585187  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  9585188 ctatttt 9585194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 13667516 - 13667720
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  13667516 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 13667614  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  13667615 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgttccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 13667713  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13667714 ctatttt 13667720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18389374 - 18389579
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18389374 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18389472  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18389473 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagatcttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18389572  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18389573 ctatttt 18389579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 423 - 624
Target Start/End: Original strand, 1613991 - 1614195
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || || | ||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||  ||||    
T  1613991 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttctttgttatttacttt-atgtttttcttcttcttttctatgtc 1614089  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1614090 tacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttat 1614189  T
Q  619 gtaacc 624  Q
    ||||||    
T  1614190 gtaacc 1614195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 22578324 - 22578523
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  22578324 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagcggttttggagctgatttgatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccccca 22578423  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22578424 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggtcgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 22578523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 423 - 783
Target Start/End: Original strand, 4090719 - 4091082
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || || |   ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||    
T  4090719 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttcttgtttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatgtc 4090817  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || | ||||    
T  4090818 tacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagttttat 4090917  T
Q  619 gtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccat 717  Q
     |||   || ||  | |||||| ||||||  ||| || ||| |||| | ||||  |||||   ||| |||| |  ||||||||  |||||||| || |||    
T  4090918 ataaatgtactttataatctaatttcaccgtttttataatgaatcagcaattactaaact-aagaagcgaacgcagagggtttagtaattgttaattcat 4091016  T
Q  718 catctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4091017 catctcaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaccaagtgaaattagacaa 4091082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8780422 - 8780154
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  8780422 tgtctacaatgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 8780323  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca-ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| |||||||  ||||  ||| || ||| |||| ||||||   ||| |||| | |||||||||  |||||||| ||    
T  8780322 ttatataaatctactttctaatctaatttcaccatatttataatgaattaacaattaccaaact-aagaagcgaacgcggagggtttagtaattgttaat 8780224  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  8780223 tcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaccaagtgaaattagacaa 8780154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 168 - 342
Target Start/End: Original strand, 828005 - 828179
Alignment:
Q  168 agcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtg 266  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||    
T  828005 agcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtcacccctaaagtcagaaacttggcacggcccgtg 828103  T
Q  267 ctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  828104 ctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 828179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 20624300 - 20624499
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20624300 gaatatttgatagattgagtattggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgcagattcagagacaaaaatatatctccctca 20624399  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20624400 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 20624499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 20628177 - 20628376
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  20628177 gaatatttgatagattgagtattggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgcagattcagagacaaaaatatatctccctca 20628276  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20628277 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 20628376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 21506675 - 21506874
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |   || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  21506675 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaagagtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctccctcaa 21506774  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||| |||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21506775 gttagaagcttggcacggcccatgctaacattggaacggtcgtgccacctcccatagcaccttttgctacttttgcttagattttaagctactctatttt 21506874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3202002 - 3201828
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||| |||||||   ||||||||||| ||||    
T  3202002 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatacgaaaatacgaagattcgaagacaaaaatacgtct 3201903  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgct 310  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| | | || | | ||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  3201902 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgccatcattagcaaggccgtgccaccctctagagtcgcttttgct 3201828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 20626612 - 20626818
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||||||| ||    
T  20626612 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagaaaaagaaaggggttttcgagctgattcggtacgaaaatacgcagattcggagacaaaaatatatc 20626711  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20626712 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaagattggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgcttagattctaagctac 20626811  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  20626812 tctattt 20626818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 20630503 - 20630709
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||||||| ||    
T  20630503 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagaaaaagaaaggggttttcgagctgattcggtacgaaaatacgcagattcggagacaaaaatatatc 20630602  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20630603 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaagattggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgcttagattctaagctac 20630702  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  20630703 tctattt 20630709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16759638 - 16759509
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  16759638 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 16759539  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgt 265  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16759538 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgt 16759509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 41722398 - 41722604
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| ||  |||| ||| ||||   |||||||||| |||||||  ||||||||||||| |     
T  41722398 caggaatgaatatttgatggattgactctttgaacaaaagaaaagggttttggagctgattc--tgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatt 41722495  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41722496 ttcctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccagaacagccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 41722595  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  41722596 ctctatttt 41722604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48801652 - 48801443
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaag-aaagggactttgagccgatt-ggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgt 233  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||   |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  48801652 caggaacgaatatttgatggattgagccttggagcaaaagaaaagggttttggagctgattcggagcaaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgt 48801553  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagct 332  Q
    |||||  |||||||||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48801552 ctccccaaagtcagaagataggcacggcccatgctaacattggtacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttacttagattttaagct 48801453  T
Q  333 actctatttt 342  Q
    ||||||||||    
T  48801452 actctatttt 48801443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 351 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 11997489 - 11997230
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||  | | ||||||||||| ||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  11997489 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatacagtagctagc-atcacaaatatccatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 11997391  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11997390 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttt-tcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 11997292  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11997291 gtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaataatttattcctaatcaaaccaa 11997230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 23203497 - 23203703
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  23203497 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 23203596  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23203597 cccaaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggattggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23203696  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23203697 ctatttt 23203703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 23509624 - 23509830
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  23509624 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 23509723  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23509724 cccaaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggattggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23509823  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23509824 ctatttt 23509830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8787261 - 8786993
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  8787261 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 8787162  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| ||| ||  ||| || ||| || ||| |||| ||||||   ||| |||| ||||| |||||  |||||||| ||    
T  8787161 ttatataaatctactttctaatctaatttctccgtttttataatgaattaacaattaccaaact-aagaagcgaatgtggacggtttagtaattgttaat 8787063  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| ||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8787062 tcatcatctcaaatataaatttataaagcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 8786993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 9562049 - 9562316
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  9562049 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgtgattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 9562148  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||  ||  ||| || || |||||| ||||||| ||| || ||| || ||| |||| ||||||   ||| |||| | |||||||||  |||||||| ||    
T  9562149 ttat-aaaatctactttctaatctaatttcaccatttttataatgaattaacaattaccaaact-aagaagcgaacgcggagggtttagtaattgttaat 9562246  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9562247 tcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaacgcggaactttgatattggaacaagtgaaattagacaa 9562316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 151 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 48340948 - 48340763
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  48340948 gatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcggagacagaaatatatctccctcaagtcagaa 48340849  T
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48340848 acttggcacggcccgtgttaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 48340763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 359 - 471
Target Start/End: Original strand, 9583496 - 9583608
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9583496 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 9583595  T
Q  459 taaaagttcattt 471  Q
    |||||||||||||    
T  9583596 taaaagttcattt 9583608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 20108713 - 20108912
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| |  | ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  20108713 gaatatttgatgaattgagtcttggagcaaaagaaaagggtttggagctgattcggagaaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctcccccaa 20108812  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  20108813 gtcagaagcttcgcacttcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccagagcaccttttgttgcctttgcttatattttaatctactctatttt 20108912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 283
Target Start/End: Original strand, 9583235 - 9583376
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  9583235 aagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 9583333  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc 283  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9583334 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggcc 9583376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 23515406 - 23515612
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  23515406 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 23515505  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23515506 cccaaaagtcagaagcttcgcacggcccgtgctaggattggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23515605  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23515606 ctatttt 23515612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 12554719 - 12554539
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | |||||| || ||||  ||||||||| ||| |||    
T  12554719 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacgatgatttggagacaaaa-tatatct 12554621  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttt 316  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||    
T  12554620 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgctttt 12554539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 16897374 - 16897121
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctt-tctaataaaagttcatt----tactt 475  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||    |||||    
T  16897374 ctataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtcttctttaataaaagttctttcttttactt 16897276  T
Q  476 ttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcta 574  Q
    |  ||||||||  ||| ||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16897275 tcttgttattttattt-atgttcttct-tcttcttctctatgtctacgatgaacttgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtcta 16897178  T
Q  575 atgacataatcctaatc-aaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16897177 atgacgtaatcctaatcaaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatt 16897121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 482 - 598
Target Start/End: Original strand, 39388815 - 39388931
Alignment:
Q  482 tatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacat 581  Q
    |||||||||||||| |||   |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39388815 tatttacttttatgtttttcttcttattctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgt 39388914  T
Q  582 aatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||||||||||||    
T  39388915 aatcctaatcaaaccaa 39388931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 692 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10838753 - 10838651
Alignment:
Q  692 ggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgta 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  10838753 ggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgca 10838654  T
Q  792 aag 794  Q
    |||    
T  10838653 aag 10838651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 325
Target Start/End: Original strand, 20642922 - 20643112
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||||||| ||    
T  20642922 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagaaaaagaaaggggttttcgagctgattcggtacgaaaatacgcagattcggagacaaaaatatatc 20643021  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagatt 325  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  20643022 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaagattggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgcttagatt 20643112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 38388552 - 38388346
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  38388552 caggaatgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgattcgttacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 38388453  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||  ||||     |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38388452 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggctgtgccacctcccaggacaacttttgttgcttttgcttagattctaagctac 38388353  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  38388352 tctattt 38388346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 222 - 342
Target Start/End: Original strand, 24057457 - 24057577
Alignment:
Q  222 acaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctta 321  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||    
T  24057457 acaaaaatacgtctcccccaagtcagaagcttggcacgacccgtgctaggcttggcacggccgtgccacctcccagaaccacttttgctgcttttgctta 24057556  T
Q  322 gattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  24057557 gattttaagctaatctatttt 24057577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 16532434 - 16532560
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || | |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||    
T  16532434 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgattgaatacgaaaatacgaagattcggagaaaaaaatacgtct 16532533  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16532534 cccccaagtcagaagcttggcacggcc 16532560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16633228 - 16633102
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| || | |||||| |||||||  |||| ||||||| ||||    
T  16633228 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgattgaatacgaaaatacgaagattcggagaaaaaaatacgtct 16633129  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16633128 cccccaagtcagaagcttggcacggcc 16633102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 252 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18072731 - 18072641
Alignment:
Q  252 ttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18072731 ttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtaacttttgctacttttgcttagattttaagctactctatttt 18072641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 341
Target Start/End: Original strand, 20635195 - 20635317
Alignment:
Q  219 gagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgc 318  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||    
T  20635195 gagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaagattggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgc 20635294  T
Q  319 ttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  20635295 ttagattctaagctactctattt 20635317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 20636983 - 20637189
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||| ||||   | | |||||| | |||||  ||||||||||||| ||    
T  20636983 caggaatgaatatttgatgaattgagtcttggagcgaaagaaaggggttttggagctgattcagtacgaaaatacgcagattcggagacaaaaatatatc 20637082  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| || ||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20637083 tccctcaggtcagaaacttggcaccgcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgcttagattctaagctac 20637182  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  20637183 tctattt 20637189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Original strand, 12561617 - 12561765
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  12561617 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 12561716  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12561717 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggcc 12561765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Original strand, 12678531 - 12678687
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  |||||||||  | ||||  ||||||||||||||||    
T  12678531 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacaatgattcggagacaaaaatatgtc 12678630  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12678631 tcccgcaagtcagaatcttggcaccgcccgtgctaacattgggacggccgtgccacc 12678687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 4460748 - 4460629
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  4460748 tcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttgcatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcct 4460649  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  4460648 cgaaccttaattttatgtaa 4460629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 5397454 - 5397581
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  5397454 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 5397553  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5397554 cccccaaagtcagaagcttggcacggcc 5397581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 14551437 - 14551528
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14551437 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 14551528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 713 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3197195 - 3197125
Alignment:
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3197195 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 3197125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 9193991 - 9193723
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  9193991 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaactctaatt 9193892  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||   || || || |||||| |||| |  ||| || ||| || ||| |||| ||||||   ||| |||| | |||||||||  |||||||| ||    
T  9193891 ttatataaatatactttctaatctaatttcatcgtttttataatgaattaacaattaccaaact-aagaagcgaacgcggagggtttagtaattgttaat 9193793  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||  |||   ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9193792 tcatcatctcaaatatcaattcataaagagaacacggaactttgatattggaacaagtgaaattagacaa 9193723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 21005499 - 21005414
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21005499 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 21005414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 4256590 - 4256483
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||     
T  4256590 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttggatgagtctaataacctaatcctaatcaaaccaagcctcaaaccctaatt 4256491  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  4256490 ttatgtaa 4256483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 6712417 - 6712311
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||     
T  6712417 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaatt 6712319  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  6712318 ttatgtaa 6712311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11997720 - 11997594
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagcc-gattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | || |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11997720 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggg-tttgaggctgcttcggagcaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtc 11997622  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11997621 tcccccaagtcagaagtttggcacggcc 11997594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 14545197 - 14545288
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  14545197 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacatgaaaatatgaagattgagagacaaaa 14545288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37100764 - 37100564
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaa-tatgtctcccacaa 242  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  || |||  |||| |  ||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  37100764 aatatttgatggattgaatcttggagtaaaagaaagaggtttggagttgattcggagcaaaaatacgaagattcagagataaaaaatatgtctcccctaa 37100665  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||||||||||| | || ||||| | |||| ||||| ||||||||  ||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37100664 gtcagaagcttggcacagtccatgctaacattggcacggctgtgccacctcccaggacaaccttttactgcttttgcttagattttaagttactttattt 37100565  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  37100564 t 37100564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 639
Target Start/End: Original strand, 46274206 - 46274335
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaagct 601  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||     
T  46274206 tcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtc--------taatcctaatcaaaaccaagcc 46274297  T
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  46274298 ttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatcta 46274335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 523 - 598
Target Start/End: Original strand, 33609846 - 33609921
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33609846 atgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 33609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13755316 - 13755194
Alignment:
Q  219 gagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttg 317  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||| |||||||||  ||| ||   ||||||| ||||||||    
T  13755316 gagacaaaaatatgtctcccccaagtcagaagcttggcacggctcgtgctaacattggcacggtcgtgccacctcccaggacaaccttttgttgcttttg 13755217  T
Q  318 cttagattttaagctactctatt 340  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  13755216 cttatattttaagccactctatt 13755194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 457 - 622
Target Start/End: Original strand, 38877458 - 38877626
Alignment:
Q  457 aataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatg--ctttctct-cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtc 552  Q
    |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38877458 aataaaagttctctttactttcttgttatttacttttatcttctttttcttcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtc 38877556  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |  |||| |||||||||||||    
T  38877557 ttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagactcgaaccctaatcttatgtaa 38877626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3376881 - 3376749
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| |   | |||||| ||||| |  || ||||||||||||||    
T  3376881 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaagggtttggagctgattcggaacgaaaatacgaagaattggatacaaaaatatgtct 3376782  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgct 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3376781 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgct 3376749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 9264340 - 9264240
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||    
T  9264340 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttatcttaggattgttggataagtctaatgacataatccacatcaaaccaagctattaaccctaat 9264241  T
Q  614 c 614  Q
    |    
T  9264240 c 9264240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 509 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 4316963 - 4316873
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  4316963 tctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactttgtttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagc 4316873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11483829 - 11483722
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     
T  11483829 tgtctacgattaacatgagtgagtagactcttcttattttaggattgttggataagtataatgacataatcttaatcaaaccaagcctcgaaccttaatt 11483730  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  11483729 ttatgtaa 11483722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17206380 - 17206262
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  17206380 tcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaagcct 17206282  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||| ||||||||    
T  17206281 cgaaccctaattttatgtaa 17206262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 19364138 - 19364265
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  19364138 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 19364237  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19364238 tccctcaagtcagaaacttggcacggcc 19364265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 517 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 6257497 - 6257367
Alignment:
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||    
T  6257497 tctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgaaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatttt 6257398  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    || |||  ||| || || |||||| ||||||    
T  6257397 atataaatctactttctaatctaatttcacc 6257367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 685 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23292548 - 23292451
Alignment:
Q  685 cgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaa 784  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||       || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23292548 cgaaagtggagggtttgatgattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat-------aattggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaag 23292456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 34390347 - 34390467
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  34390347 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatttccctca 34390446  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34390447 agtcagaagcttggcacggcc 34390467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 17911699 - 17911806
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||| ||||     
T  17911699 tgtctacaacgaacatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcttcgaaccctaatt 17911798  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  17911799 ttatgtaa 17911806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 19515334 - 19515251
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19515334 tgtcgacgatgaacatgagttagtagactcttcttctcttgggattcttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 19515251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 509 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25034297 - 25034208
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25034297 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtaggcttct-ttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagc 25034208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4466903 - 4466833
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4466903 cttggcacggacgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 4466833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 4465760 - 4465652
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||    
T  4465760 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 4465661  T
Q  614 cttatgtaa 622  Q
     ||||||||    
T  4465660 tttatgtaa 4465652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 630
Target Start/End: Original strand, 1462661 - 1462776
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||  |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  1462661 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagaatcttcttgtctttagattgttgaataattttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaatt 1462760  T
Q  615 ttatgtaaccctaatt 630  Q
    |||||| | |||||||    
T  1462761 ttatgtcaacctaatt 1462776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 4983133 - 4983015
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  4983133 tcttcttctctatgtcttcaatgaacgtgagtgagtagacttat-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcct 4983035  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||| ||||||||    
T  4983034 cgaaccctaattttatgtaa 4983015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 622
Target Start/End: Original strand, 15523151 - 15523249
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  15523151 atgaacatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgcgtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaaccgtaatcttatgtaa 15523249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 30063934 - 30063828
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |  |||| |||||    
T  30063934 tgtctacaatgaacatgagtgagttgacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatccctatcaagccaagcctcgaaccctaatc 30063836  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  30063835 ttatgtaa 30063828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #219
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 254
Target Start/End: Original strand, 41781473 - 41781592
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  41781473 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 41781572  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttg 254  Q
    |||| |||||||||| ||||    
T  41781573 tccctcaagtcagaaacttg 41781592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #220
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4467011 - 4466894
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac-a 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | | | ||||||  ||||||   |||| |||||||||||||| | |    
T  4467011 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacctggagctgattcggtacgaaaatacaaagatttgaagac-aaaatatgtctcccccaa 4466913  T
Q  242 agtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4466912 agtcagaagcttggcacgg 4466894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #221
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 679479 - 679361
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| | |    
T  679479 tcttcttctctatgtctgcaatgaacatgagtgagtagacaact-ttgtcttggaattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaaacct 679381  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  679380 agaaccctaatcttatgtaa 679361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #222
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14221595 - 14221536
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14221595 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 14221536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #223
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 48782465 - 48782406
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  48782465 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 48782406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #224
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 367938 - 368008
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  367938 cttggcacggccgtgccacctcccaggatgacttttgctgcttttgcttagattttaagctattctatttt 368008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #225
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18072807 - 18072753
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagc 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18072807 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagc 18072753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #226
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 18915640 - 18915765
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  18915640 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 18915739  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18915740 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 18915765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #227
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Original strand, 38295731 - 38295793
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattgga 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  38295731 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattgga 38295793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #228
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4791260 - 4791136
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt--gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgt 233  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| |||||  || ||| |||  |||| |||| | |||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  4791260 caggaacgaatatttgatggactgagtcttggaacaaaaagaaaggagttttggagctgattcgctgcaaaaatacgaagattcggatacaaaaatatgt 4791161  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcac 258  Q
    | ||| |||||||||||||||||||    
T  4791160 ccccctcaagtcagaagcttggcac 4791136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #229
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11968544 - 11968495
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11968544 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactt 11968495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #230
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 34390456 - 34390525
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34390456 cttggcacggccgtgccacctcccagacaaccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 34390525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #231
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 48340727 - 48340662
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48340727 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatcacaaatattcatctttt 48340662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #232
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11997574 - 11997534
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11997574 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 11997534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #233
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 715 - 783
Target Start/End: Original strand, 33610033 - 33610101
Alignment:
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33610033 catcatctcaaatatcaattcataaagtgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 33610101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #234
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 4541282 - 4541388
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| || |||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  4541282 tgtctacaataaacatgtgtgagtagacttct-ttgttttgggattgttggatgagactaatgacctaatccctatcaaaccaagcatcgaaccctaatt 4541380  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  4541381 ttatgtaa 4541388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #235
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15707447 - 15707408
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15707447 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 15707408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #236
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 706 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19515147 - 19515064
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  19515147 ttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattaaacaaggattg 19515064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #237
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 367829 - 367949
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac-- 240  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  | | |||| |||| || ||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| |      
T  367829 gaatatttgatggattgagtcttggaccaaaagaaaggagcctggagctgattcgaagcaaaaatacgaagattcggag-caaaaatatatctcccccca 367927  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  367928 aagccagaagcttggcacggcc 367949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #238
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4791113 - 4791072
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4791113 gccttttgctgcttttgcttagattttaaactactctatttt 4791072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #239
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 725 - 790
Target Start/End: Original strand, 8836890 - 8836955
Alignment:
Q  725 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    |||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8836890 aatatcaattcataaagcgagagcagagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattgt 8836955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #240
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14941871 - 14941798
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  14941871 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 14941798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #241
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15369464 - 15369391
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15369464 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 15369391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #242
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 33612411 - 33612338
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  33612411 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 33612338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #243
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 13375137 - 13375089
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13375137 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 13375089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #244
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 195
Target Start/End: Original strand, 13456335 - 13456383
Alignment:
Q  147 attggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13456335 attggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 13456383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #245
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14941937 - 14941897
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14941937 ccttttgctgcttttgcttagattttaaactactctatttt 14941897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #246
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Original strand, 15066107 - 15066187
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||    
T  15066107 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagatt 15066187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #247
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15369530 - 15369490
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15369530 ccttttgctgcttttgcttagattttaaactactctatttt 15369490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #248
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23294063 - 23293944
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| |||||||   |||||||||||  ||   | ||    
T  23294063 gaatatttgatggattgggtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcgaagacaaaaatacatc-atctca 23293965  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23293964 agtcagaagcttggcacggcc 23293944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #249
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33612477 - 33612437
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612477 ccttttgctgtttttgcttagattttaagctactctatttt 33612437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #250
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48355793 - 48355753
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355793 ccttttgcagcttttgcttagattttaagctactctatttt 48355753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #251
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Original strand, 15061018 - 15061061
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15061018 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaag 15061061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #252
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 35104062 - 35103977
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |  |  ||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  35104062 ttgtctacaatgaacataagtgagtagaccttccaagtctttggattgttggatgagtctaatgactaaatcct-atcaaaccaagc 35103977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #253
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41113220 - 41113130
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  41113220 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 41113130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #254
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 648928 - 648855
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  648928 atgtaattgcttagattcaaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 648855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #255
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 648994 - 648957
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  648994 ccttttgctgcttttgcttagattttaagttactctat 648957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #256
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 4090400 - 4090531
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgatt--ggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatg 232  Q
    |||||| |||| || ||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||  || ||  |||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  4090400 caggaacgaatgtttgatagattgagtcttggagcaaaagaaagagaatttggagctgattcaggttg--aaaatacgaagattga-agacaaaaatata 4090496  T
Q  233 -tctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4090497 atctccc-caagtcagaagattggcacggcccgtgc 4090531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #257
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13755379 - 13755334
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13755379 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 13755334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #258
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 15707382 - 15707309
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15707382 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataattagagtaggtagccatcacaaatattcatctttt 15707309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #259
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 41722650 - 41722723
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  41722650 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactgtaaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 41722723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #260
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 48355727 - 48355654
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  48355727 atgtaattgcttatattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 48355654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #261
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 706 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 21005308 - 21005224
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||| |   ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21005308 ttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaagcgacaacagagttttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattgt 21005224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #262
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23293927 - 23293895
Alignment:
Q  309 ctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23293927 ctgcttttgcttagattttaagctactctattt 23293895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #263
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 6257284 - 6257225
Alignment:
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||    
T  6257284 caattcataaagcgaacgcggagctttgatattagaacaagtgaaattaaacaaggattg 6257225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #264
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17206707 - 17206660
Alignment:
Q  220 agacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17206707 agacaaaaatatgattcccccaagtcagaagcttggcatggcccgtgc 17206660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #265
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 342
Target Start/End: Original strand, 5397601 - 5397631
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5397601 cttttgcttagattttaagctactctatttt 5397631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #266
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 549 - 579
Target Start/End: Original strand, 6531412 - 6531442
Alignment:
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgac 579  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6531412 tgtcttgggattgttggataagtctaatgac 6531442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #267
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 553 - 599
Target Start/End: Original strand, 11242618 - 11242664
Alignment:
Q  553 ttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11242618 ttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 11242664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #268
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 12801827 - 12801865
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12801827 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 12801865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #269
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3376713 - 3376684
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3376713 cttttgcttagattttaagctactctattt 3376684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #270
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16097549 - 16097484
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||| ||||||    
T  16097549 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcaaaaatattcgtctttt 16097484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #271
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 178
Target Start/End: Original strand, 24057394 - 24057435
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaa 178  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24057394 aggaacgaatattggatggattgagtcttgcagcaaaagaaa 24057435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #272
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 35964354 - 35964290
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||| ||||||||||||  | | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35964354 gcttaggttttaagtcgatata-tactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 35964290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 565; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 565; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 33741 - 33079
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33741 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 33642  T
Q  236 ccc--acaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33641 cccccacaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctg 33542  T
Q  334 ctctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatg 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33541 ctctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatg 33442  T
Q  434 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt--acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatt 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33441 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtt 33342  T
Q  532 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 33242  T
Q  632 cttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatca 731  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33241 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatca 33142  T
Q  732 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33141 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 33079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 110495 - 110943
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| ||| | || || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  110495 atgtaattgcttagattctaaatagaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 110594  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt---------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||| |||         |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  110595 ctttctaataaaagttcttttcttttccttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctcattcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 110693  T
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || |||||    
T  110694 acttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatcta 110793  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||   |||| ||| |  || |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||    
T  110794 aattcaccgtattaacatgaaaaaaacattatcaaactatgaaaacaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcacaaatataaattcataa 110893  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  110894 aacgaaagtggaaatttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 110943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 359 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 56854 - 56683
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56854 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 56755  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaac 528  Q
    ||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56754 taaaagttcatttttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaac 56683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 57098 - 56894
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  57098 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 57000  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  56999 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 56901  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  56900 ctatttt 56894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 78776 - 78903
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  78776 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 78875  T
Q  236 c-ccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    | ||  ||||||||||||||||||||||    
T  78876 ctcccaaagtcagaagcttggcacggcc 78903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 78906 - 78962
Alignment:
Q  286 gccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78906 gccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattataagctactctatttt 78962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 230
Target Start/End: Original strand, 107360 - 107448
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaata 230  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||   |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  107360 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcagtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaata 107448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 563; Significance: 0; HSPs: 310)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 6830018 - 6829360
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6830018 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttgaagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 6829919  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6829918 ccccacagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggtcgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgtttagattttaagctact 6829819  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6829818 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 6829719  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6829718 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 6829619  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6829618 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacacaatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccctaatttctta 6829519  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6829518 tctaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatagtttatccatcatctcaaatatcaattc 6829419  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6829418 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 6829360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5226843 - 5226192
Alignment:
Q  145 atattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagt 244  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5226843 atattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaaagt 5226744  T
Q  245 cagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttta 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226743 cagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctcaagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttta 5226644  T
Q  345 gcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgac 444  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5226643 gcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttttttggaatgcaatatgtgac 5226544  T
Q  445 aattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5226543 aattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatactttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgttagtgagtagact 5226444  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5226443 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaattccttatctaaat 5226344  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5226343 tcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggcaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 5226244  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5226243 aaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 5226192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3339103 - 3338444
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  3339103 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 3339005  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3339004 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 3338905  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3338904 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatac 3338805  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3338804 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 3338705  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3338704 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 3338605  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3338604 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 3338505  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3338504 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3338444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 789
Target Start/End: Original strand, 43495938 - 43496587
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43495938 gaatattggatggattgagttttggagcaaaagaaatggacttggagctgaatgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaaa 43496037  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43496038 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttacttttgctgcttctgcttagattttaagctactctatttt 43496137  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43496138 tagcccaaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 43496237  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| || ||    
T  43496238 acaattgtctttctaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtaagcag 43496337  T
Q  541 acttc-tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43496338 acttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaatttcttatcta 43496437  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43496438 aattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 43496537  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43496538 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 43496587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 11939947 - 11940617
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11939947 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 11940046  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11940047 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaatctact 11940146  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11940147 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 11940246  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  11940247 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 11940345  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11940346 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 11940445  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  11940446 acctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgttgaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 11940545  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11940546 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 11940617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14867417 - 14866759
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||    ||| |||||||||||    
T  14867417 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcgatgac-aaaatatgtct 14867319  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||  |   |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14867318 cccccaaagtcaaaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgctaccttccaatgcctcttttgttgcttttgcttagattttaagctac 14867219  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14867218 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatac 14867119  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14867118 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 14867019  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14867018 gagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 14866919  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14866918 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 14866819  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14866818 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14866759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13094321 - 13093661
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  13094321 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatc 13094222  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13094221 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccataactactcttgctgcttttgcttagattttaagctac 13094122  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  13094121 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttctgggaatac 13094022  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    
T  13094021 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtgtacgatgaacgtcag 13093922  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13093921 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 13093822  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13093821 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 13093722  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13093721 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 13093661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 30027229 - 30026558
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30027229 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 30027130  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30027129 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 30027030  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  30027029 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 30026930  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  30026929 ataagtgacaattgtttttctaattaaagttc-ttttcttttccctttattttcttgtcatttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacga 30026831  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  30026830 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 30026731  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  30026730 accctaatctcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 30026631  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  30026630 ccaaatatctattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 30026558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 13098042 - 13098702
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  13098042 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 13098141  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13098142 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccataactactgttgctgcttttgcttagattttaagctac 13098241  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13098242 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatac 13098341  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13098342 aatatgtgacaattatctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcag 13098441  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13098442 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaacctaattcct 13098541  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13098542 tatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 13098641  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13098642 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 13098702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 248 - 794
Target Start/End: Original strand, 6709888 - 6710435
Alignment:
Q  248 aagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6709888 aagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcc 6709987  T
Q  348 caaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6709988 caaatgtaatagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaat 6710087  T
Q  448 tgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct 546  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  6710088 tgtctttctaataaaagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttct 6710187  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6710188 cttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 6710287  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6710288 cgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 6710387  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6710388 gtggagctttgatattcgaaaaagtgaatttagacaaggattgcaaag 6710435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13142695 - 13142027
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13142695 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 13142597  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13142596 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 13142497  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13142496 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 13142397  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||          |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  13142396 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 13142298  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  13142297 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaac 13142198  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  13142197 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 13142098  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13142097 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13142027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13136087 - 13135419
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13136087 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 13135989  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13135988 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 13135889  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13135888 ctatttttagctcaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 13135789  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||          |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  13135788 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 13135690  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  13135689 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaac 13135590  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  13135589 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 13135490  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13135489 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13135419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15635431 - 15634760
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaa-tatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635431 caggaaaaaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 15635332  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635331 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccacccactagggtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15635232  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |    
T  15635231 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttactgggaatac 15635132  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  15635131 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 15635032  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  15635031 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcattaatcttatgtaa 15634932  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||      
T  15634931 ccctaacttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgcagggtttgataattgtttatccattattc 15634832  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15634831 caaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15634760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 272 - 794
Target Start/End: Original strand, 2781114 - 2781637
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaa 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2781114 cttggcacggccgtgccaccctctagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaa 2781213  T
Q  372 gtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt 471  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781214 gtcgaaagaatgctataaatagagtagccatccaccacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt 2781313  T
Q  472 -acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataag 570  Q
     |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781314 tactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataag 2781413  T
Q  571 tctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatta 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2781414 tctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccatta 2781513  T
Q  671 tcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaag 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2781514 tcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaag 2781613  T
Q  771 tgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    
T  2781614 tgaatttagacaaagattgcaaag 2781637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Original strand, 4829775 - 4830444
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  4829775 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctc 4829873  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4829874 cccaaagtcagaagcttggcacagcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccataactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 4829973  T
Q  337 tatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    | ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4829974 tgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactttaaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttt 4830073  T
Q  425 cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830074 cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 4830173  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830174 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 4830273  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830274 cctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 4830373  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830374 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 4830444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13504758 - 13504087
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504758 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 13504659  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13504658 cccccaagtcagaagcttggcacggccggtgctagccttggcacagccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 13504559  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  13504558 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttgaaataca 13504459  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| ||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||    
T  13504458 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttccctttattttcttgtcatttactttcatgctttctctcttctctcccatgtctacga 13504360  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  13504359 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcagaccaagctctaagccttaatcttatgta 13504260  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||     
T  13504259 accctaatttcttatccgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttggtaattgtttatccattatt 13504160  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13504159 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13504087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 263 - 794
Target Start/End: Original strand, 10248771 - 10249304
Alignment:
Q  263 cgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagctt 362  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10248771 cgtgctagccttggcacggccgtgccatcctctagagtgccttttgttgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagctt 10248870  T
Q  363 agattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaa 462  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10248871 agattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtggcaattgtctttctaataaa 10248970  T
Q  463 agttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattg 561  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10248971 agttcattttagtttattgttatttacttttatgctttctctcctcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttatcttgtcttgggattg 10249070  T
Q  562 ttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatgga 660  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10249071 ttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccataatttcttatctaaattcaccgctttaacatgga 10249170  T
Q  661 tcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgata 760  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249171 ccaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgata 10249270  T
Q  761 ttcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10249271 ttcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 32404240 - 32403568
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32404240 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 32404141  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32404140 ccccacagtcataagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttttgcttagattttaagctac 32404041  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32404040 tctatttttagcccaaatgtaattgcttagattttaagtcaagtgtatgctataaatagagtagccacccatcacaaatattcatctttacttggaatac 32403941  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaa-taaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| ||||||           ||| |||||| |||||| |||||||||||| |  | ||||||||    
T  32403940 aataagtgacaattgcttttctaattaaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgttttctctcttctccctcatgtctacg 32403842  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32403841 atgaacatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgt 32403742  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32403741 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtcgagggtttgataattgtttatccattat 32403642  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
      | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32403641 tccaaatatcaattcgtaaaacgaaagtgaagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 32403568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 11947745 - 11948394
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11947745 caggaaagaatattggatgaattgaatctttgagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtca 11947844  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  11947845 cccacaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcatagattttaagctaca 11947923  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11947924 ttatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 11948023  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  11948024 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 11948122  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  11948123 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 11948222  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  11948223 ccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 11948322  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11948323 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 11948394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 271 - 794
Target Start/End: Original strand, 20555927 - 20556450
Alignment:
Q  271 ccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagatttta 370  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20555927 ccttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagatttta 20556026  T
Q  371 agtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatt 470  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556027 agtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtaacaattgtctttctaataaaagttcatt 20556126  T
Q  471 t-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
    | |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20556127 ttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagact-ctcttgtcttgggattattggataa 20556225  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20556226 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcctatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccatt 20556325  T
Q  670 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556326 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 20556425  T
Q  770 gtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  20556426 gtgaatttagacaaggattgcaaag 20556450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9360840 - 9360178
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  9360840 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatatgaagattcggaagacaaaa-tatgtctcccccaa 9360742  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9360741 gtcagaacattggcacggcccgtgctaggcttggcacgaccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 9360642  T
Q  343 ---tagcccaaatg--------taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaa 431  Q
       |  || |||||        |  | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360641 agtttaccgaaatgcccttttatggttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaa 9360542  T
Q  432 tgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacat 530  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9360541 tacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctatatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgt 9360442  T
Q  531 tagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9360441 cagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgtaaccctaatt 9360342  T
Q  631 ccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatc 730  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9360341 ccttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatc 9360242  T
Q  731 aattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360241 aattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 9360178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 397; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15573760 - 15573114
Alignment:
Q  139 gaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15573760 gaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggtacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 15573661  T
Q  239 acaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    |||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15573660 acaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagggtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 15573582  T
Q  339 tttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaata 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15573581 tttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaatacaata 15573482  T
Q  439 tgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaac 528  Q
     |||||| |||  |||||||| ||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  15573481 agtgacagttgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaac 15573382  T
Q  529 attagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 626  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15573381 atgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccct 15573282  T
Q  627 aattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaa 726  Q
    || | ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||    
T  15573281 aacttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaa 15573182  T
Q  727 tatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15573181 tatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15573114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 24696577 - 24697248
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  24696577 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatct 24696675  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696676 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccagactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 24696775  T
Q  335 tctatttt----------tagcccaaat--gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||          | |  ||  |  || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  24696776 tctgttttagtttacttgtggaacattttagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 24696875  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696876 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttccttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 24696975  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24696976 aatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 24697075  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24697076 accctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatc 24697175  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697176 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 24697248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 12776405 - 12775750
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  12776405 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 12776306  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12776305 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 12776206  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12776205 tagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttgg 12776106  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12776105 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttctgctccttgtctacgatgaaca 12776006  T
Q  530 ttagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12776005 ttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacccta 12775906  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12775905 atttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat 12775806  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12775805 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 12775750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9366357 - 9365695
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||  || ||||||| ||||||| || |||    
T  9366357 aatattggatggattgagtcttggaccaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagacaaaa-tatgtcttccccaa 9366259  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9366258 gtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactatgtttt 9366159  T
Q  343 ----ta-------gcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaa 431  Q
        ||       ||||   | |  | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9366158 agtttaccggaatgcccttttatggttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaa 9366059  T
Q  432 tgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacat 530  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9366058 tacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgt 9365959  T
Q  531 tagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9365958 cagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 9365859  T
Q  631 ccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatc 730  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9365858 ccttatctaaattcaccgccttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatt 9365759  T
Q  731 aattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9365758 aattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 9365695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 15944276 - 15944925
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15944276 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaaaaaagggacttggagccgattggatacaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15944375  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||                     | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15944376 ccccacagtcagaagcttggca---------------------ccgccgtgccataatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 15944454  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15944455 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgagtgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 15944554  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  15944555 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 15944653  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15944654 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 15944753  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15944754 ccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatcc 15944853  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15944854 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15944925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 5212539 - 5211921
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212539 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagaaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 5212440  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||| ||||||                     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212439 ccccaaagtcagaaccttggc---------------------acggccgtgccaccatccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 5212361  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5212360 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 5212261  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  5212260 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 5212162  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5212161 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 5212062  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5212061 ccctaatttcttatatgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 5211962  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 763  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5211961 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattc 5211921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 53355163 - 53354499
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| ||||   | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  53355163 gaatatttgatggattgagttttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcagtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 53355064  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53355063 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 53354964  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  53354963 tagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactatgaatagagtagctagccatcacaaatattcatcctttcttgg 53354864  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  53354863 aatgcaatatgtgacaattatctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacg 53354764  T
Q  530 ttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53354763 ttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 53354664  T
Q  630 tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatat 729  Q
    | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53354663 ttcttatctaaaatcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatat 53354564  T
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53354563 caattcattagacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 53354499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 15946947 - 15947596
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15946947 caggaatgaatactggatggattgagtcttggagcaaaaaaaagggacttggagccgattggatacaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15947046  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||                     | |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15947047 ccccacagtcagaagcttggca---------------------ccgccgtgccataatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 15947125  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15947126 ttatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgagtgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 15947225  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  15947226 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 15947324  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15947325 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 15947424  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  15947425 ccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatcc 15947524  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  15947525 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagataaggattgcaaag 15947596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 4365793 - 4366238
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365793 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 4365892  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  4365893 tctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctct 4365992  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4365993 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattcgttatctaaattcaccg 4366092  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4366093 ctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagt 4366192  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4366193 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 4366238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 4383322 - 4383767
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4383322 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 4383421  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  4383422 tctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctct 4383521  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  4383522 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattcgttatctaaattcaccg 4383621  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4383622 ctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagt 4383721  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4383722 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 4383767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4769145 - 4768711
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4769145 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 4769047  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769046 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttggga 4768947  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4768946 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4768847  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4768846 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 4768747  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4768746 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 4768711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22164853 - 22164417
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | |   |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164853 gcttagattttaagtcaaatatgtgctataaatagagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 22164754  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22164753 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 22164654  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22164653 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 22164554  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22164553 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacaaaagtggagctttg 22164454  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22164453 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22164417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 41472878 - 41473314
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41472878 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtacctagccatcacaaataatcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 41472977  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  41472978 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 41473077  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41473078 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 41473177  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41473178 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 41473277  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41473278 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 41473314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 6809619 - 6810056
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6809619 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 6809718  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6809719 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 6809818  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6809819 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 6809918  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6809919 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 6810018  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6810019 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 6810056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 6815441 - 6815878
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6815441 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 6815540  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  6815541 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 6815640  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  6815641 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 6815740  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6815741 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 6815840  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6815841 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 6815878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15854161 - 15854598
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15854161 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 15854260  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15854261 taaaagttcattttactttctttgttgtttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 15854360  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  15854361 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 15854460  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854461 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 15854560  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15854561 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 15854598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 12246759 - 12247195
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12246759 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 12246858  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12246859 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctctggtcttggg 12246958  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12246959 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 12247058  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12247059 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccataatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttg 12247158  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12247159 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 12247195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 10560218 - 10559542
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  10560218 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaataggaagatttggagacaaaa-tatgtct 10560120  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10560119 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgccagcattggcacggccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 10560020  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    || ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  10560019 ctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacgaatattcatcttt 10559920  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcc 513  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10559919 tcttggaattcaataagtgacaattgcttttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttcccc 10559820  T
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  10559819 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 10559720  T
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10559719 atcttatgtaaccctaattgcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttt 10559620  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10559619 atccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaggtttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 10559542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15429812 - 15430247
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15429812 gcttagattttaagtcgaaggtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 15429911  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15429912 taaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 15430011  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||    
T  15430012 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatg 15430111  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15430112 gattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttga 15430211  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15430212 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 15430247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 22170157 - 22169727
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22170157 gcttagattttaagtcaaatgtgtgttataaatagagtagctagtcatcacaattattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 22170058  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170057 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 22169958  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22169957 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 22169858  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22169857 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaattggagctttg 22169758  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22169757 atattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 22169727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16377911 - 16377474
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16377911 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 16377812  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377811 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 16377712  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  16377711 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 16377612  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377611 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 16377512  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16377511 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16377474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 50909270 - 50908611
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| || | | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  50909270 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgaatcggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatc 50909171  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||| |     |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50909170 tccctcaagttagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacagccgtgccacactccataactatttttgctgcttt-gcttagattttaagctac 50909072  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  50909071 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 50908972  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||            |||||||||||||||||| ||||||||    
T  50908971 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttctttt-cttttccttta------------ctttctctcttcttctccatgtctacg 50908885  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50908884 atgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgt 50908785  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50908784 aactctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 50908685  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50908684 ctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 50908611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10602104 - 10601666
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10602104 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 10602005  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10602004 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 10601905  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc-taattccttatctaaattcaccactttaat 655  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||     
T  10601904 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaac 10601805  T
Q  656 atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctt 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10601804 atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctt 10601705  T
Q  756 tgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10601704 tgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10601666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 13665044 - 13665500
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13665044 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13665143  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||          || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13665144 tctttctaataaaagttcttttctttttctttaatttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 13665243  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13665244 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 13665343  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13665344 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataaatgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 13665443  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13665444 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13665500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10608416 - 10607978
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10608416 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 10608317  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10608316 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 10608217  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc-taattccttatctaaattcaccactttaat 655  Q
    |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||   ||||     
T  10608216 attgttggataagtctaaataaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaac 10608117  T
Q  656 atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctt 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10608116 atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctt 10608017  T
Q  756 tgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10608016 tgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10607978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2205 - 1751
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2205 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 2106  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||     |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2105 tctttctaataaaagttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 2006  T
Q  545 ctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2005 ctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaat 1906  T
Q  643 t---caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  1905 tattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcgtaa 1806  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1805 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 42280878 - 42281334
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42280878 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 42280977  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
      |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  42280978 cttttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 42281077  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  42281078 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttgtc 42281177  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42281178 taaattcaccgctctaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 42281277  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42281278 aaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 42281334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15952302 - 15951846
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  15952302 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 15952203  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  15952202 attttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacatttatgatttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 15952104  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15952103 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 15952004  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15952003 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtctgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 15951904  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15951903 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15951846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7786125 - 7785670
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  7786125 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccagcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgc 7786026  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
     |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  7786025 ttttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 7785926  T
Q  541 acttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7785925 acttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatct 7785826  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7785825 aaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcata 7785726  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7785725 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 7785670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 250 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 53160804 - 53160235
Alignment:
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt------- 342  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||           
T  53160804 gcttggcacgacccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctctagaactacttttgctgcttttgtttagattttaagctactctgttttagtttac 53160705  T
Q  343 tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaa 436  Q
    | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  53160704 ttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaataaagtagttagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaa 53160605  T
Q  437 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatga 526  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  53160604 taagtgacaattgtctttctaaaaaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttcttcatgtctacgatga 53160505  T
Q  527 acattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacc 624  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  53160504 acatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacc 53160405  T
Q  625 ctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcg 724  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53160404 ctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctca 53160305  T
Q  725 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53160304 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 53160235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 479 - 794
Target Start/End: Original strand, 13087597 - 13087912
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13087597 tgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 13087696  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13087697 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatccaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactg 13087796  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13087797 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 13087896  T
Q  779 gacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||    
T  13087897 gacaaagattgtaaag 13087912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Original strand, 8991361 - 8991797
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  8991361 gcttagattttaattcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgcttttctaa 8991460  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  8991461 taaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 8991560  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8991561 ttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaatcctaatttcttatctaaattcac 8991660  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8991661 cgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 8991760  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8991761 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 8991797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16385477 - 16385152
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385477 tttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 16385378  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  16385377 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccat 16385278  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385277 tatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 16385178  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16385177 agtgaatttagacaaagattgcaaag 16385152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 43842206 - 43841761
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    ||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||   ||||   |||| |||||||    
T  43842206 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctata----gagtagctagccatcacaaatattcattttttgttctcggaaat-aataagtgacaa 43842112  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842111 ttgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttcttcatgtctacgatgaacattagtgagtagact 43842012  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  43842011 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatt 43841912  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    ||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43841911 caccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacg 43841812  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841811 aaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 43841761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 13195098 - 13194649
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13195098 aatgtaatcacttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtgacaattg 13194999  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
     ||||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  13194998 -ctttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctgttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 13194901  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13194900 agacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcgaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 13194801  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13194800 ctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 13194701  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13194700 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 13194649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 423 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 15425237 - 15424905
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgt-tatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15425237 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttctttctatttacttttatgttttctctcttcctctccttgtctac 15425138  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
     |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425137 aatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 15425038  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15425037 accctaattccttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 15424938  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15424937 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 15424905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 359 - 713
Target Start/End: Original strand, 16334019 - 16334375
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334019 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 16334118  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16334119 taaaagttcattttactttctttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 16334218  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  16334219 gattgttggataagtctaatgacataaccctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 16334318  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16334319 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 16334375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10546813 - 10546153
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  10546813 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaataggaagatttggagacaaaa-tatgtct 10546715  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10546714 ccccaaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttggttagattttaagctact 10546636  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    || ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  10546635 ctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacgaatattcatcttt 10546536  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcc 513  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  10546535 tcttggaattcaataagtgacaattgcttttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttattctttctcttttcttcccc 10546436  T
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| ||| | |||    
T  10546435 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagctaagctctaagcgtta 10546336  T
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10546335 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatagttt 10546236  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10546235 atccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaggtttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10546153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 13325754 - 13326210
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13325754 aatgtaattgtttagattttaattcgaatgtctgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13325853  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  13325854 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttacttttttgttatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 13325953  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||  || |||    
T  13325954 gatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaagcaagttttataccttaatcctatgtaaccataatctctaatc 13326053  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  13326054 taaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcat 13326153  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13326154 aaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13326210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17733397 - 17732940
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatatt-catcttttcttggaatgcaatatgtgacaatt 448  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17733397 aatgtaatcgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatctttcatctttgcttggaattcaataagtgacaatt 17733298  T
Q  449 gtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgag 537  Q
    |  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||    
T  17733297 gcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgag 17733199  T
Q  538 tagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17733198 tagacttctccttgtcttgggattgttggataattctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttctta 17733099  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||    
T  17733098 tctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattc 17732999  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17732998 ataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 17732940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 17480406 - 17480863
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  17480406 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaaaattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 17480505  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17480506 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttattatttacttttatgcttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 17480605  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  17480606 gtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatcttatgtaaccctaatttctaat 17480705  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  17480706 ctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttaaaaattgttaatcaatcatctcaaatatcaattca 17480805  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17480806 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 17480863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18129115 - 18128659
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18129115 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatatagtatctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 18129016  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
      |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  18129015 attttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgccttctctcttcttctccatgtctatgatgaacatgagtgagta 18128916  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  |||||    
T  18128915 gatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatataaccctaatttattatc 18128816  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18128815 taaatttaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggggttgacaattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 18128716  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  18128715 aaaacgaaagtggagatttgatattcgaacaactgaatttagacaaggattgcaaag 18128659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21265234 - 21264776
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||   |   ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  21265234 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtaactagaaatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 21265135  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  21265134 tgtctttcttaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 21265035  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  21265034 gtagacttcttttgtcttggaattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaa 21264935  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21264934 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattattaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattc 21264835  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21264834 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21264776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Original strand, 20150228 - 20150894
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||  || |||| |||| | ||| |||||| ||||||| || ||||||||   ||||    
T  20150228 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggaacaaaagaaaggggtttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagatttgaaagacaaaa---tgtc 20150324  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20150325 tccccgaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacctcccaaagccacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 20150424  T
Q  335 tctattttt-----------agcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    ||| ||||            |||||   |||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  ||||| ||| ||  ||||||    
T  20150425 tctgttttagtttaccataaagcccttttgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcataaaaatggatcttt 20150524  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt---------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct 514  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||         |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20150525 tattggaattcaatatgtgacaattttctttctaataaaagttcttttttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctcca 20150624  T
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20150625 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttatcttgggatcgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccttaaaccttaat 20150724  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||      ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  20150725 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtgg------aagtggagggtttgataatcgttaat 20150818  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20150819 ccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 20150894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 350 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 13204691 - 13204277
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13204691 aatgtaatcgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatatttatctttacttggaattcaataagtgacaattg 13204592  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  13204591 cttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctgttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 13204493  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13204492 agacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccttaatttcttat 13204393  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  13204392 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatcttaaatatcaattca 13204293  T
Q  737 taaaacgaaagtggag 752  Q
    ||||||||||||||||    
T  13204292 taaaacgaaagtggag 13204277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 403 - 696
Target Start/End: Original strand, 4651306 - 4651601
Alignment:
Q  403 ccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctc 502  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  4651306 ccatcagaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttttttacttttatgctttctc 4651405  T
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4651406 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagc 4651505  T
Q  601 tttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagg 696  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4651506 tctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatctaactgtggaaacgaaagtggagg 4651601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 384 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 20156144 - 20155754
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc----- 478  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||         
T  20156144 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctgataaaagttctttt-cttttccttta 20156046  T
Q  479 ------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagt 571  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  20156045 cttgcttgttatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgagatttttggataagt 20155946  T
Q  572 ctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatta 670  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20155945 ctaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaaaatggatcaaccatta 20155846  T
Q  671 tcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 762  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20155845 tcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 20155754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 20153983 - 20154425
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  20153983 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtggctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 20154082  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttattt-----------acttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    | ||||||| ||| ||||||  ||||||           ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20154083 ttaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctc 20154181  T
Q  548 -ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20154182 cttgtcttgggattgtcggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattca 20154281  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  20154282 ccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacggaagtggagggtttgataattgtttatccatcattccaaatatcaattcataaaacgaa 20154381  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20154382 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattg 20154425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 37978458 - 37978010
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  37978458 atgtaattgcttaggttttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatccaataagtgacagttgt 37978359  T
Q  451 ctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  37978358 ctttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 37978259  T
Q  541 acttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||    
T  37978258 acttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaaccttaatctcatgtaaccctagtttctcttct 37978159  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||| |||||    
T  37978158 aaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatcaaatcata 37978059  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||  ||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37978058 aaacgaaagtgga--tttaaaatacgatcaagtgaatttagacaaggattg 37978010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 350 - 709
Target Start/End: Complemental strand, 13001044 - 13000673
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13001044 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 13000945  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  13000944 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 13000846  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13000845 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 13000746  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 709  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13000745 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 13000673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 17388421 - 17388865
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17388421 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 17388520  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17388521 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagact 17388619  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  17388620 tctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatt 17388719  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    ||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17388720 caccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacg 17388819  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17388820 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 17388865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 361 - 794
Target Start/End: Original strand, 5687627 - 5688073
Alignment:
Q  361 ttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct- 456  Q
    ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||     
T  5687627 ttagattgtaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttctt 5687726  T
Q  457 aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct 546  Q
    ||||||||||  |||          |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5687727 aataaaagttgttttcttttcccttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctccatgcctacgatgaacatgagtgagtagacttct 5687826  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5687827 cttgtcttgggattattggataattctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaagccc-aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcac 5687925  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  5687926 cgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaatctaaa 5688025  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5688026 gtggagctttgatattcgaactagtgaagttagacaaagattgtaaag 5688073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10159816 - 10159374
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  10159816 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 10159717  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10159716 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 10159617  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  10159616 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 10159517  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10159516 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 10159417  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10159416 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10159374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 10166477 - 10166035
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  10166477 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 10166378  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10166377 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 10166278  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  10166277 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 10166178  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10166177 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 10166078  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10166077 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10166035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16373197 - 16372755
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  16373197 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 16373098  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct-----gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||  |     ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16373097 ataaagttcttttcctttattttattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 16372998  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  16372997 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 16372898  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16372897 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 16372798  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16372797 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16372755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13193691 - 13193249
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  13193691 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 13193592  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13193591 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 13193492  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  13193491 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 13193392  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13193391 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 13193292  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13193291 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13193249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14071736 - 14071412
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14071736 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcctctttttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 14071637  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||    
T  14071636 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccct-aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccat 14071538  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14071537 tatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatattaattcatgaaacgaaagtggagctttgatattagaaca 14071438  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14071437 agtgaatttagacaaggattgtaaag 14071412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 7600937 - 7601384
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  7600937 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 7601036  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  7601037 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 7601136  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7601137 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 7601236  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7601237 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 7601336  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  7601337 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 7601384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11880635 - 11880188
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  11880635 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 11880536  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11880535 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 11880436  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11880435 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 11880336  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11880335 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 11880236  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11880235 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 11880188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 14815572 - 14816019
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  14815572 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 14815671  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  14815672 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 14815771  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  14815772 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 14815871  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  14815872 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 14815971  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14815972 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 14816019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18214483 - 18214036
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18214483 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 18214384  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18214383 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18214284  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18214283 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18214184  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18214183 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 18214084  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18214083 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18214036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 10147583 - 10148025
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  10147583 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 10147682  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  10147683 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtc 10147782  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  10147783 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 10147882  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10147883 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 10147982  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10147983 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10148025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12193123 - 12192681
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  12193123 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 12193024  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12193023 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 12192924  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  12192923 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgaaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 12192824  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12192823 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 12192724  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12192723 gctttgatattcgaataagtgaattcagacaaggattgcaaag 12192681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14494802 - 14494521
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14494802 tgtctacaatgaacgttagtgactagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 14494703  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14494702 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaa 14494603  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14494602 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14494521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15556574 - 15556127
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  15556574 gcttagattttaagtcaattttgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 15556475  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15556474 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttc 15556375  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15556374 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 15556275  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15556274 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 15556175  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15556174 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15556127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15564425 - 15563978
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||  |||||||    
T  15564425 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttacttggaatacaataagtgacaactgcttttctaa 15564326  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15564325 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 15564226  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15564225 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 15564126  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15564125 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 15564026  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15564025 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15563978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Original strand, 12378619 - 12378950
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12378619 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagttgattgaatgcgataatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 12378718  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12378719 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttacttttgctgcttttgctttgattttaagctact 12378818  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  12378819 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatctttacttggaattca 12378918  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  12378919 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc 12378950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 10140977 - 10141419
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  10140977 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 10141076  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  10141077 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtc 10141176  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  10141177 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 10141276  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  10141277 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 10141376  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10141377 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10141419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14445398 - 14444949
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14445398 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 14445299  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  14445298 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaccatgagtgagta 14445199  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  14445198 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 14445099  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  14445098 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 14444999  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| |||||    
T  14444998 aacgaaagtggagctttaatattcgataaaatgaatttagacaaggattg 14444949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14457445 - 14456996
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14457445 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctacccatcacaaatattcatcttttccttggaattcaataagtgacaattg 14457346  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  14457345 tcttttgaataaaagttcttttcttttccttgactttcttgttatttacttatatgctttctctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagta 14457246  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||  ||||    
T  14457245 aacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccttagtttctcttcta 14457146  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  14457145 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 14457046  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14457045 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 14456996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 350 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19656246 - 19655800
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   ||||   |||| |||||||    
T  19656246 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaat-aataagtgacaa 19656148  T
Q  447 ttgtctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    ||||  ||  ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19656147 ttgttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactt 19656048  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||    
T  19656047 ttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagtttctcttctaaat 19655948  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    |||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||    
T  19655947 tcaccattttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaac 19655848  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaa-tttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  19655847 gaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaattttagacaaggattg 19655800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12186709 - 12186267
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  ||||| |    
T  12186709 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctga 12186610  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12186609 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctctcccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 12186510  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  12186509 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgaaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 12186410  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12186409 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 12186310  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12186309 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 12186267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12199764 - 12199322
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  12199764 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttactaggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 12199665  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  12199664 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagagttcttcttgtc 12199565  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  12199564 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 12199465  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12199464 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 12199365  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  12199364 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 12199322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 13187060 - 13186618
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | || ||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  13187060 gcttagattttaagtcaattgtgtactgtaaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 13186961  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  13186960 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgttttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 13186861  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  13186860 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 13186761  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13186760 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 13186661  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13186660 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13186618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 37935115 - 37935563
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  37935115 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaagattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 37935214  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37935215 aataaagttcttttcctttcctttattttcatgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 37935314  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  37935315 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 37935414  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  37935415 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 37935514  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  37935515 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 37935563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 37942960 - 37943408
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  37942960 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaagattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 37943059  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  37943060 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 37943159  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  37943160 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 37943259  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  37943260 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 37943359  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  37943360 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 37943408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19567141 - 19566697
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||  | | |||| ||  |||||||||||   |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19567141 gcttagattttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttattcttgaaattcaataagtgacaattgtctttc 19567042  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctct-cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19567041 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctgcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgggtagact 19566943  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19566942 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaatt 19566843  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    ||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19566842 caccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtagagggtttgataattgttaatccatcatctcaaataacaattcataaaacg 19566743  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19566742 aaagtggagttttgatattcgaacaagtgaaattagacaaggattg 19566697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 16705564 - 16706010
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  16705564 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 16705662  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16705663 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 16705762  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16705763 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 16705862  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16705863 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 16705962  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16705963 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16706010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 384 - 790
Target Start/End: Original strand, 20154938 - 20155348
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------ac 473  Q
    ||||||||| |||||  | |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||          ||    
T  20154938 ctataaataaagtagctagccatcacaaatatggatcttttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttac 20155037  T
Q  474 ttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct 573  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20155038 tttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggatcgttggataagtct 20155137  T
Q  574 -aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatc 672  Q
     ||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||    
T  20155138 aaatgacataatcctattcaaacc-------aaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaagatggattaaatattatc 20155230  T
Q  673 aaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtg 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||     
T  20155231 aaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagta 20155330  T
Q  773 aatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  20155331 aatttagacaaggattgt 20155348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 34053600 - 34053308
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct- 601  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34053600 tcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagcta 34053501  T
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34053500 ttaaccctaaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcagactgtggaaacgaaagtggagggtttg 34053401  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34053400 atacttgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaagggttgtaaag 34053308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 13068727 - 13069176
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  13068727 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgaaaattg 13068826  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  13068827 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaccatgagtgagta 13068926  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  13068927 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacatagtcctaatcaagtcaacccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 13069026  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||| ||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||  | |||||||||    
T  13069027 aattccccgttttaacatggattaaatattatcaaagtgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaaagttaattcataa 13069126  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  13069127 aacgaaagtggagctttaatattcaatcaagtgaatttagacaaggattg 13069176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14976286 - 14976005
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14976286 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 14976187  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    | |||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  14976186 tattatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgctttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttaataattgttaa 14976087  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14976086 tccatcatctcaaatattaattcataaaacgaaagtggagatttgataatcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14976005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 535 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3250080 - 3249820
Alignment:
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  3250080 gagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttct 3249981  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
     ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  3249980 aatctaaattcaccgctttaacgtggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccaccatctcaaatatcaat 3249881  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3249880 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3249820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 2722049 - 2722327
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  2722049 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccct-aatc 2722147  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2722148 ttatgcaaccttaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggggggtttgataattgttaatc 2722247  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2722248 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 2722327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3245053 - 3244773
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3245053 tgtctacaatgaacgttagtaagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtgtaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaat 3244954  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  3244953 cttatgtaaccctaatttctaatataaattcaccgctttaacgtggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaaaggtttgataattgttaat 3244854  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3244853 tcaccatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattctaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3244773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 384 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 14348190 - 14347781
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatttacttttct 479  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||||   |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||    
T  14348190 ctataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttattcttgaaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttt--ctttact 14348093  T
Q  480 g--ttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatg 577  Q
       ||||||   ||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348092 tctttattttactttatgcttttcttcttctactccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatg 14347993  T
Q  578 acataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaact 677  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||  || ||| |||||||||||    
T  14347992 acataatcctaatcaaatcaagtcttaaaccctaattttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaaaataaattaacaattatcaaact 14347893  T
Q  678 gtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattt 777  Q
    || ||| ||||||||||||||| | |||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14347892 gtagaatcgaaagtggagggttag-taattggtaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaattt 14347794  T
Q  778 agacaaagattgt 790  Q
    |||||| ||||||    
T  14347793 agacaaggattgt 14347781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 574 - 794
Target Start/End: Original strand, 17766537 - 17766757
Alignment:
Q  574 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  17766537 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattcatcactttaatatggattaaccattatca 17766636  T
Q  674 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtga 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17766637 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtga 17766736  T
Q  774 atttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  17766737 atttacacaaagattgtaaag 17766757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 574 - 794
Target Start/End: Original strand, 19067857 - 19068077
Alignment:
Q  574 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatca 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19067857 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattcatcactttaatatggattaaccattatca 19067956  T
Q  674 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtga 773  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19067957 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtga 19068056  T
Q  774 atttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  19068057 atttaaacaaagattgtaaag 19068077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 471
Target Start/End: Complemental strand, 16487786 - 16487567
Alignment:
Q  252 ttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaa 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16487786 ttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaa 16487687  T
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16487686 tgtaattgcttagattttaagtcgaaagaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 16487587  T
Q  452 tttctaataaaagttcattt 471  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16487586 tttctaataaaagttcattt 16487567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Original strand, 3279938 - 3280223
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3279938 tcttcttctctatgtttacgatgaacatgagtgcgtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 3280037  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||| |||||||    
T  3280038 taaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaactcaccattttaacatgaattaaccattatcaaaatgtataagcgaaagtggaaggtttga 3280136  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3280137 taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaaatggagatttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 3280223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 25055132 - 25055406
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25055132 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatc 25055231  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||| ||| || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25055232 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtataagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 25055331  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25055332 aatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 25055406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 384 - 788
Target Start/End: Original strand, 2005922 - 2006338
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt---tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatttacttttct 479  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||    
T  2005922 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttcattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttctttttct 2006021  T
Q  480 gttatttactt----------ttatgctt-tctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
     ||| || |||          ||||| |  ||| ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2006022 -ttactttcttgttattttatttatgttcatct-tcttcttctctatgtttacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 2006119  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || || ||||||||||   |||| ||  || ||||||    
T  2006120 agtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccct-aatctcatgtaaccctagtttctaatataaattcaccgtcttaacataaattaaccat 2006218  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  2006219 tatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatttcaaatatcaattcataaaacgagagtggagtcttgatattcgaaca 2006318  T
Q  769 agtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  2006319 agtgaatttagacaaggatt 2006338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 170; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 136 - 428
Target Start/End: Original strand, 20584441 - 20584733
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||  || ||||||| ||||||    
T  20584441 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagacaaaa-tatgtc 20584539  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20584540 tcccccaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 20584639  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20584640 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttg 20584733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 515 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 25765811 - 25765537
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagact--tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25765811 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aa 25765713  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||| || || |  |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  25765712 tcttatgtaaccgtagtttcgaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaa 25765613  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25765612 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagaggaaaattgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 25765537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 11398994 - 11399268
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11398994 tgtctacaatgaatgttagtgagtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatc 11399093  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| |||  ||||| ||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||     
T  11399094 ttatgtaaccctagtttctaatctaaatttaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatagaagcgaaagtggagggcttgataatagttaatt 11399193  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11399194 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattg 11399268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 136 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 18545933 - 18545638
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | || | ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18545933 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgtagaaatacgaagattcagaagacaaaa-tatgtc 18545835  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18545834 tcccccaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 18545735  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaat 432  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18545734 tctatttt-agcccaaatgtaatagcttagattttaagtcaaataaatgttataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaat 18545638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14137878 - 14137454
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||| ||||    
T  14137878 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcaatcacaaatattcatcttttgttcttggaattcaataagtgtcaat 14137779  T
Q  448 tgtctttctaat-aaaagtt----catttacttttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    ||||||||| || |||||||    | ||||||||  ||||||||  ||| ||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14137778 tgtctttctcattaaaagttatttcttttactttcttgttatttgattt-atgttcttct-tcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtaga 14137681  T
Q  542 cttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| || || || ||||    
T  14137680 cttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaat-ttatgtaaccctagtttctaatttaaa 14137582  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    ||||||| ||||| ||| ||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14137581 ttcaccattttaacatgaat--------------------taacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 14137502  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14137501 cgaatgtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 14137454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 525 - 788
Target Start/End: Original strand, 47974949 - 47975213
Alignment:
Q  525 gaacattagtgagtagact--tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47974949 gaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccataatcttatgtaa 47975047  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    ||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  47975048 ccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccataatgt 47975147  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47975148 caaatatcaattcataaaacgagagtggagtcttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 47975213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 578 - 794
Target Start/End: Original strand, 55514936 - 55515152
Alignment:
Q  578 acataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaact 677  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  55514936 acataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttacgtatacctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgtatcaaccattatcaaact 55515035  T
Q  678 gtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattt 777  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55515036 gtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatctcaactatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattt 55515135  T
Q  778 agacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||| ||||| ||||    
T  55515136 agacaaggattgcaaag 55515152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 14660769 - 14660517
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  14660769 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatc 14660670  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |                || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14660669 t----------------ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 14660586  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660585 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggatctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 14660517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15645583 - 15646012
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  15645583 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 15645681  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15645682 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 15645781  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15645782 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 15645881  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   ||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15645882 cgtcttaa-----------------caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 15645964  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15645965 gtggagctttgatattcgagcaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15646012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 523 - 794
Target Start/End: Original strand, 16034198 - 16034467
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||||    
T  16034198 atgaacgtttgtgagtggacttctcctgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaaattttaaccct-aatcttatgtaa 16034296  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| || ||| |||||||||  ||||| | | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16034297 ccctaatttctaatc-aaattcaccgttttaacaagaattaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtgaatccatcatct 16034395  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16034396 caaatatcaattcataaaacgaaaatggagttttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16034467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15639007 - 15639436
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  15639007 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 15639105  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  15639106 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttacttacatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 15639205  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  15639206 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 15639305  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   ||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15639306 cgtcttaa-----------------caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 15639388  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15639389 gtggagctttgatattcgagcaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15639436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13195335 - 13195129
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13195335 caggaaagaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 13195236  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13195235 ccccaaagtcagaagcttggcatggcccgtactagcattggcacggccgtgccaccctccagagttacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 13195136  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13195135 ctatttt 13195129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13204928 - 13204722
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13204928 caggaaagaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagagacttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 13204829  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13204828 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttacttttggtgcttttgcttagattttaagctact 13204729  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13204728 ctatttt 13204722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 13605155 - 13605427
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  13605155 tgtctacaatgaacgttagcgagtagactctccttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacc-taatt 13605253  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  13605254 ttatgtaaccctaatttctaatcgaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaacagtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 13605352  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13605353 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggatttttgatattggaacaagtgaatttagacaaggattg 13605427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17733634 - 17733428
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17733634 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 17733535  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17733534 ccccaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctagcattggcacggccgtgcctccctcgagagttacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 17733435  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  17733434 ctatttt 17733428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 605 - 794
Target Start/End: Original strand, 1991024 - 1991213
Alignment:
Q  605 aaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgata 704  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1991024 aaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgata 1991123  T
Q  705 attgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1991124 attgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaggttgtaaag 1991213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 584 - 789
Target Start/End: Original strand, 3212640 - 3212845
Alignment:
Q  584 tcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaa 683  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| |||    
T  3212640 tcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttttgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaa 3212739  T
Q  684 acgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3212740 gcgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaaaagtgaatttagacaa 3212839  T
Q  784 agattg 789  Q
     |||||    
T  3212840 ggattg 3212845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15853916 - 15854121
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  15853916 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa-tacgtct 15854014  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  15854015 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 15854114  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15854115 ctatttt 15854121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15556819 - 15556614
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  15556819 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcgaattggacacaaaaatataaagattgagagacaaat-tatgtct 15556721  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  15556720 cccataagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctaagctatt 15556621  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15556620 ctatttt 15556614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Original strand, 10246459 - 10246591
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10246459 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 10246558  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10246559 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgct 10246591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15952540 - 15952333
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  15952540 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 15952441  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15952440 cccccaaagtcaaaagcttggcacggcctgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15952341  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  15952340 tctatttt 15952333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22170399 - 22170197
Alignment:
Q  139 gaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 238  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22170399 gaaagaataatggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttgtagccgattagacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa-tacgtctccc 22170301  T
Q  239 acaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  22170300 acaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattcta 22170201  T
Q  339 tttt 342  Q
    ||||    
T  22170200 tttt 22170197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43842444 - 43842237
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  43842444 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagagactttgagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 43842345  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842344 accccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggctgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 43842245  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  43842244 tctatttt 43842237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4769390 - 4769185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4769390 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttagagcagattggacacgaaaatataaagattgagagacaaaa-tatgtct 4769292  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  4769291 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaatactttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 4769192  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  4769191 ctatttt 4769185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8991115 - 8991321
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8991115 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagagacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 8991214  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8991215 ccccaaagtcagaagcttggcacggctcgtgctagcattggcacgaccatgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 8991314  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8991315 ctatttt 8991321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18129352 - 18129146
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  18129352 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagaggcaaaaatatgtct 18129253  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18129252 ccccaaagtaagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcatggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18129153  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18129152 ctatttt 18129146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15564665 - 15564465
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||     
T  15564665 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcgaattggacacaaaaatataaagattgagagacaaat-tatgtctcccat 15564567  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  15564566 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagcctttgcacggccgtgccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctaagctattctatt 15564467  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  15564466 tt 15564465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 4383084 - 4383290
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  4383084 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 4383182  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4383183 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 4383282  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  4383283 tctatttt 4383290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2442 - 2236
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  2442 caggaacgaatattggatggattgagtcttggacaaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 2343  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2342 ccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccacgctctggagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 2243  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  2242 ctatttt 2236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15638763 - 15638967
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  15638763 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 15638861  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  15638862 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 15638960  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15638961 ctatttt 15638967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15645339 - 15645543
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  15645339 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 15645437  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  15645438 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 15645536  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15645537 ctatttt 15645543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 351 - 598
Target Start/End: Original strand, 1993387 - 1993648
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  1993387 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaattataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaat 1993486  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1993487 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 1993586  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1993587 gtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1993648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 4365555 - 4365761
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  4365555 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 4365653  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4365654 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 4365753  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  4365754 tctatttt 4365761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10602349 - 10602144
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||  | ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  10602349 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagtaaattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatgtct 10602251  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  10602250 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 10602151  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10602150 ctatttt 10602144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12200008 - 12199804
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  12200008 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 12199910  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  12199909 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 12199811  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  12199810 ctatttt 12199804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13187304 - 13187100
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  13187304 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 13187206  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  13187205 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 13187107  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13187106 ctatttt 13187100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 37978696 - 37978490
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || |||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  37978696 caggaacgaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagaggtttggagctgattcgatacaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 37978597  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37978596 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacctcccagaaccacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 37978497  T
Q  336 ctatttt 342  Q
     ||||||    
T  37978496 atatttt 37978490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 41472634 - 41472838
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||| |||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  41472634 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatacgaagattgggaagcaaaa-tatatct 41472732  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  41472733 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 41472831  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  41472832 ctatttt 41472838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 16705325 - 16705524
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  16705325 aagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 16705423  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  16705424 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctattctatt 16705522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 351 - 598
Target Start/End: Original strand, 1998546 - 1998807
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  1998546 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaattataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaat 1998645  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1998646 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 1998745  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1998746 gtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12160084 - 12159877
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  12160084 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttattgctaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 12159985  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12159984 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagtattggcacggccgtgtcaccctctatagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 12159885  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  12159884 tctatttt 12159877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10166721 - 10166517
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  10166721 caggaaagaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 10166623  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10166622 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 10166524  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10166523 ctatttt 10166517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10608661 - 10608456
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||  | ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  10608661 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagtaaattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatgtct 10608563  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  10608562 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 10608463  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10608462 ctatttt 10608456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 359 - 583
Target Start/End: Original strand, 11868618 - 11868852
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  |||||||    
T  11868618 gcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcagaaatattcatcttttcttggaatttaataagtgacaattgcttttctaa 11868717  T
Q  459 taaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    | ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11868718 ttaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttc-c 11868815  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataa 583  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11868816 ttgtcttgggattgtttgataagtctaaatgacataa 11868852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 672 - 794
Target Start/End: Original strand, 14953554 - 14953676
Alignment:
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14953554 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcattaaacgaaagaggagctttgatattcgaacaagt 14953653  T
Q  772 gaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14953654 gaatttagacaaagattgtaaag 14953676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16378156 - 16377951
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||   ||||||  | ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  16378156 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagtaaattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatgtct 16378058  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  16378057 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 16377958  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  16377957 ctatttt 16377951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 37942716 - 37942920
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  37942716 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 37942814  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  37942815 cccacaagtcagaagtttggcacggcccgtgctggccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 37942913  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  37942914 ctatttt 37942920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 5666220 - 5666428
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  5666220 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 5666319  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |  ||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5666320 tcccccaagtcagaagcttggcacagcccgtgctagcattggcacggccgtgccaactcccaggattgtcttttgctacttttgcttagattttaagcta 5666419  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  5666420 ctctatttt 5666428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 7600693 - 7600897
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  7600693 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 7600791  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  7600792 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 7600890  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  7600891 ctatttt 7600897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12193367 - 12193163
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  12193367 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 12193269  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  12193268 cccacaagtcagaagcctggcacgacccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 12193170  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  12193169 ctatttt 12193163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 12246515 - 12246719
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  12246515 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 12246613  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  12246614 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 12246712  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  12246713 ctatttt 12246719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13193935 - 13193731
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  13193935 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 13193837  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  13193836 cccacaagttagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccata-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 13193738  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13193737 ctatttt 13193731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Original strand, 13690946 - 13691144
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |   | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||    
T  13690946 aatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttagagctgatttggaacgaaaatatgaagatttggagacaaaaatatatctccctaaag 13691045  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13691046 tcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagactttaagctactctatttt 13691144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 14815328 - 14815532
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  14815328 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 14815426  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  14815427 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 14815525  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  14815526 ctatttt 14815532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18214727 - 18214523
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  18214727 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18214629  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18214628 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 18214530  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18214529 ctatttt 18214523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 6809380 - 6809579
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  6809380 aagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 6809478  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  6809479 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatt 6809577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 12186953 - 12186771
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  12186953 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 12186855  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12186854 cccacaagtcagaagcctggcacgacccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctt 12186771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16373442 - 16373237
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  16373442 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 16373344  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttg-ctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |  ||||||     
T  16373343 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttggctgcttttgctttgactccaagctat 16373245  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  16373244 tctatttt 16373237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 10140733 - 10140937
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  10140733 caggaaggaatatttgatggaaagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 10140831  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10140832 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 10140930  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10140931 ctatttt 10140937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 10147339 - 10147543
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  10147339 caggaaggaatatttgatggaaagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 10147437  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10147438 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 10147536  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10147537 ctatttt 10147543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10160060 - 10159856
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  10160060 cagggaagaatatttgatggagagagtcttgcagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 10159962  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10159961 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 10159863  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10159862 ctatttt 10159856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11880879 - 11880675
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  11880879 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 11880781  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  11880780 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 11880682  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  11880681 ctatttt 11880675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 342
Target Start/End: Original strand, 11863914 - 11864110
Alignment:
Q  146 tattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa-gt 244  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| ||| | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  11863914 tatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaagggtttggagctgattcgatacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtctcccccaaagt 11864012  T
Q  245 cagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11864013 cagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcatggccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 11864110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 677 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15234122 - 15234005
Alignment:
Q  677 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 776  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15234122 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatt 15234023  T
Q  777 tagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  15234022 tagacaaggattgcaaag 15234005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18983022 - 18982858
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18983022 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 18982923  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagt 300  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18982922 ccccaaagtcagaagcttggcacgggccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagt 18982858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7786378 - 7786157
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  7786378 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaatgaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaataagaagattcggagacaaaaatatgtcc 7786279  T
Q  236 cccac---------------aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||| |               ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7786278 cccccccccccccccccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgctt 7786179  T
Q  321 agattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7786178 agattttaagctactctatttt 7786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Original strand, 13664815 - 13665013
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |   | ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||    
T  13664815 aatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggaacgaaaatatgaagattcggagacgaaaatatatctccctaaag 13664914  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664915 tcagaagcttggcacggcccgtgcgaaggttggcacggccgtgccaccctccatagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 13665013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14457693 - 14457487
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  14457693 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 14457594  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14457593 tccctcaagtcagaagcttggcaaggcccgtgctaaggttggcacggctgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 14457494  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  14457493 tctattt 14457487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 434 - 628
Target Start/End: Original strand, 27407242 - 27407443
Alignment:
Q  434 caatatgtgacaattgtctttctaataaaag----ttcatttacttttctgttatttacttttatgct-ttct--ctcttcttctccttgtctacgatga 526  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||    ||| ||||||||  ||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||  ||||||||||||    
T  27407242 caataagtgacaattgtcttcttaataaaagttatttcttttactttcttgttatttacttttatgttcttcttcttcttcttctctatgtctacgatga 27407341  T
Q  527 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccct 626  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27407342 acatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccct 27407441  T
Q  627 aa 628  Q
    ||    
T  27407442 aa 27407443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 359 - 578
Target Start/End: Original strand, 5666481 - 5666714
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5666481 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatattttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 5666580  T
Q  456 t-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  5666581 ttaataaaagttgttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgataaacatgagtgactagactt 5666680  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5666681 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 5666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 20153744 - 20153943
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||    
T  20153744 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcgga-acaaaaatacgtctccctcaa 20153842  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgcc-ttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  20153843 gtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacacctttttgctgcttttgcttggattctgagctattctattt 20153942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Original strand, 6815206 - 6815368
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  6815206 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 6815304  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagag 299  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6815305 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag 6815368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Original strand, 36076309 - 36076441
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  36076309 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatt 36076408  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  36076409 ttatgtagccctagtttctaatctaaattcacc 36076441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13044633 - 13044839
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13044633 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgtagacaaaaatatatc 13044732  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13044733 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13044832  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13044833 tctattt 13044839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13045187 - 13045393
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13045187 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatatc 13045286  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13045287 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13045386  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13045387 tctattt 13045393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13045741 - 13045947
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13045741 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatatc 13045840  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13045841 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13045940  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13045941 tctattt 13045947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13046295 - 13046501
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13046295 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatatc 13046394  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13046395 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13046494  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13046495 tctattt 13046501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13046849 - 13047055
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13046849 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatatc 13046948  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13046949 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13047048  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13047049 tctattt 13047055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13052024 - 13052230
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||   |||||||||||| ||    
T  13052024 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatatc 13052123  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13052124 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctctcagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 13052223  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  13052224 tctattt 13052230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 1993140 - 1993341
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaa-tatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||| ||||| || ||| ||| ||    
T  1993140 gaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagaaaaaaaatacgtcaccccca 1993239  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1993240 aatcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggaacaccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 1993339  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  1993340 tt 1993341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 17480153 - 17480361
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||  ||| |  |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  17480153 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaggaaaggggttttggagcttattcggagcaaaaatactaagattcggagacaaaaatatgtc 17480252  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| || |||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17480253 tcctccaagtcagaagcttggcacagcccgtgctaacattggcacagccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 17480352  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  17480353 ctctatttt 17480361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 666 - 789
Target Start/End: Original strand, 36079329 - 36079452
Alignment:
Q  666 cattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcga 765  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36079329 cattatcaaactggagaagcgaaagtggatggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcga 36079428  T
Q  766 acaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  36079429 acaagtgaatttagacaaggattg 36079452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 18934060 - 18934185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18934060 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgagagac-aaaatatgtct 18934158  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||    
T  18934159 cccacaagtcagaagtctggcacggcc 18934185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 693 - 783
Target Start/End: Original strand, 4654768 - 4654858
Alignment:
Q  693 gagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4654768 gagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttatacaa 4654858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 10851123 - 10850917
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |   |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  10851123 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctaattcggaacaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 10851024  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |  ||| || |||||| ||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10851023 cccccaagtcagaagcttggcacggcctgtgatcccactggcacagccgtgtcacctcccagaacttccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 10850924  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  10850923 tctattt 10850917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 503 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 11827397 - 11827277
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11827397 tcttcttctctacgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctt 11827298  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    |||||| |||| |||||||||    
T  11827297 taaaccctaattttatgtaac 11827277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 13068479 - 13068685
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  13068479 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 13068578  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    || | |||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  13068579 tctctcaagtcagaaacttggcacggcctgtgctaaagttggcacgaccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcatagattctaagctac 13068678  T
Q  335 tctattt 341  Q
    | |||||    
T  13068679 tatattt 13068685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Original strand, 13691175 - 13691292
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  13691175 aatgtaattgcttagactttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttagaattcaataagtgacaattg 13691274  T
Q  450 tctttctaataaaagttc 467  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13691275 tctttctaataaaagttc 13691292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 384 - 599
Target Start/End: Original strand, 13418365 - 13418585
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcat---ttacttt 476  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||    
T  13418365 ctataaatagagtagttagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttcttcttttacttt 13418463  T
Q  477 tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct 573  Q
      ||||||||  ||| |||  |||| |||||||||| |   ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13418464 catgttattttattt-atg--ttct-tcttcttctcttctatgtctgcgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatgagtct 13418559  T
Q  574 aatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  13418560 aatgacctaatcctaatcaaaccaag 13418585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 3279521 - 3279727
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |   | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  3279521 caggaatgaataattgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 3279620  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||| || | ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  3279621 tccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctcccgctggcacggccgtgccaccttctaggatctcctttttctgcttttgcttagattttaagatac 3279720  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  3279721 tctattt 3279727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13001165 - 13001075
Alignment:
Q  252 ttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13001165 ttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 13001075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 708 - 794
Target Start/End: Original strand, 16336176 - 16336262
Alignment:
Q  708 gtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16336176 gtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16336262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 469 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 10850740 - 10850611
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  ||||   | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10850740 tttactttcttgttatttacttttacacttttcttattcttctccatgtatacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggata 10850641  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10850640 attctaatgacataatcctaatcaaaccaa 10850611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15226890 - 15226758
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15226890 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 15226791  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15226790 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 15226758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 14230016 - 14229890
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  14230016 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaac-aaaatatatct 14229918  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggccc 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14229917 cccacaagtcagaagcttggcacggccc 14229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14976602 - 14976463
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgc 302  Q
    |||||| |||||||   |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||        
T  14976602 aaaatacgaagattcgaagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggccggtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacta 14976503  T
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14976502 gttttgttgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 14976463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 256 - 342
Target Start/End: Original strand, 13325637 - 13325723
Alignment:
Q  256 cacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13325637 cacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 13325723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14445646 - 14445440
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||| ||||||  ||||||  |||| |||||||| ||    
T  14445646 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtgcgaaaatacaaagattcggagaaaaaaatatatc 14445547  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||   |||| ||||| || |||||  ||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14445546 tccctcaagtcagaagcttggcaaggcctgtgctaaggttggcacggctgttccacctcccaggcatccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 14445447  T
Q  335 tctattt 341  Q
    | |||||    
T  14445446 tatattt 14445440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 37934892 - 37935017
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  37934892 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaac-aaaatatatct 37934990  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  37934991 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 37935017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Original strand, 17041822 - 17041919
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041822 tcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 17041919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19656474 - 19656277
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  19656474 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaaaaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 19656376  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| |          ||||||||||||||||||||||||    
T  19656375 cccccaaagtcagaatcttggcacgacccgtgctagcattgacacggtcgtgccaccctccagaat---------cgcttttgcttagattttaagctac 19656285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 423 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 20225297 - 20225074
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcat---ttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||  ||||||||  ||| |||  |||| |||||||||   ||||    
T  20225297 ttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttcttcttttactttcttgttattttattt-atg--ttct-tcttcttctttatgtc 20225203  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||  |||    
T  20225202 tacgatgaacatgaatgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattctat 20225103  T
Q  619 gtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||  ||| || || |||||||||||||    
T  20225102 gtaaatctattttctaatctaaattcacc 20225074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 11868458 - 11868584
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  11868458 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggtcttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 11868557  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  11868558 cccccaagttagaactttggcacggcc 11868584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 42280662 - 42280788
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42280662 caggaacgaatattagatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 42280761  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||    
T  42280762 ccccaaagtcagaagtttggcacggcc 42280788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 503 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 42244535 - 42244392
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  42244535 tcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcct 42244437  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
      |||| |||| ||||||||   ||||| || |||||| ||||||    
T  42244436 cgaaccctaattttatgtaaatttaatttctaatctaatttcacc 42244392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 503 - 618
Target Start/End: Original strand, 17050835 - 17050950
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17050835 tcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagactctttttgttttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaaaccaagcca 17050934  T
Q  603 taaaccttaatcttat 618  Q
    ||||||||||| ||||    
T  17050935 taaaccttaattttat 17050950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46752654 - 46752504
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   | || ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  46752654 caggaatgaatatttgatgtattgagtcttggagcaaaagaaaggcgttatggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 46752555  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtg 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  46752554 tccctcaagtcagaagcttggcac-gcccgtgctagacttggtacggccgtg 46752504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 145 - 268
Target Start/End: Original strand, 47974648 - 47974771
Alignment:
Q  145 atattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagt 244  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  47974648 atatttgatggattgagtctttgagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctcccccaagt 47974747  T
Q  245 cagaagcttggcacggcccgtgct 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  47974748 cagaagcttgacacggcccgtgct 47974771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 7629808 - 7629910
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  7629808 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 7629907  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  7629908 ccc 7629910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 715 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 13055515 - 13055442
Alignment:
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13055515 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacatgtgaatttagacaaggatt 13055442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20156393 - 20156268
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20156393 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 20156294  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||    
T  20156293 ccgcccagtcagaagcttggcacggc 20156268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 16333818 - 16333918
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16333818 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtct 16333917  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  16333918 c 16333918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16487923 - 16487788
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  16487923 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaggaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 16487825  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 271  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16487824 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 16487788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 715 - 794
Target Start/End: Original strand, 51034745 - 51034824
Alignment:
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  51034745 catcatctcaaatatcaattcataaaacgatagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 51034824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 513
Target Start/End: Original strand, 13052272 - 13052445
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  13052272 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 13052371  T
Q  450 tctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcc 513  Q
    |||||  ||||||||          ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13052372 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttctactcc 13052445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 17449448 - 17449542
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaata 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  17449448 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattaaatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaata 17449542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Original strand, 19067728 - 19067842
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||    
T  19067728 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacatc 19067827  T
Q  235 tcccacaagtcagaa 249  Q
    |||| ||||||||||    
T  19067828 tccctcaagtcagaa 19067842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 53160933 - 53160799
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  53160933 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaataaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctca 53160834  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttgg 276  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  53160833 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttgg 53160799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22164982 - 22164893
Alignment:
Q  253 tggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  22164982 tggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattctatttt 22164893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 4651137 - 4651257
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  4651137 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 4651236  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4651237 agtcagaagcttggcacggcc 4651257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 14953022 - 14953122
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14953022 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 14953121  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  14953122 c 14953122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Original strand, 22038958 - 22039090
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  22038958 tgtctacaatgaacgtgggtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 22039057  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||  ||| || || |||||| ||||||    
T  22039058 ttatgtaaatctattttctaatctaatttcacc 22039090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11577734 - 11577616
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||| |    
T  11577734 tcttcttcttcttgtctacaatgaacatgtgtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatccctatcaaaccaagcct 11577636  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
     ||||| |||| ||||||||    
T  11577635 caaaccctaattttatgtaa 11577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Original strand, 17766408 - 17766522
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||    
T  17766408 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacatc 17766507  T
Q  235 tcccacaagtcagaa 249  Q
    |||| ||||||||||    
T  17766508 tccctcaagtcagaa 17766522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Original strand, 8532007 - 8532092
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8532007 tgtctacaatgaacatgagtgaaaagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatccaaatcaaaccaagc 8532092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 14348459 - 14348262
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaa-tatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |  || |||| |||| |   | |||||| |||||||  |||||||||| |||||||| |  |    
T  14348459 gaatatttgatggattgagtcttagagcaaaagaaagaggtttggagctgattcggaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaaatatgtctctccta 14348360  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||  |  ||| ||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14348359 agtcagaggcttggcacaacccgtgctcccactggcacggccgtgccacctcccaagatctccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 14348262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 2781006 - 2781125
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct-cccaca 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| ||||||||||| |||  |    
T  2781006 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtctcccctaa 2781104  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2781105 agtcagaagcttggcacggcc 2781125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 647
Target Start/End: Original strand, 17023355 - 17023498
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||  |||||  | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  17023355 tcttcttctctatgtctataatgaatgtgagtgtgtagatttct-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcct 17023453  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
      |||| |||| ||||||||  ||| || || |||||| ||||||    
T  17023454 cgaaccctaattttatgtaaatctattttctaatctaatttcacc 17023498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 523 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 8685811 - 8685712
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  8685811 atgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaa 8685712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 20555813 - 20555939
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  20555813 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagac-aaaatatgtc 20555911  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20555912 tcccccaagtcagaaccttggcacggcc 20555939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 11869824 - 11869728
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11869824 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgcgtgagtatacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 11869728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 794
Target Start/End: Original strand, 17097001 - 17097062
Alignment:
Q  733 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17097001 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 17097062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 16033808 - 16033924
Alignment:
Q  145 atattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||| ||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16033808 atatttgatggattgagtcttggagcgaaagaaagaggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcagatacaaaaatatgtctcccccaag 16033907  T
Q  244 tcagaagcttggcacgg 260  Q
    ||||| |||||||||||    
T  16033908 tcagatgcttggcacgg 16033924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 42280783 - 42280847
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42280783 acggccgtgccaccctccatagtcacttttgctgcttttgcttagattttaatctactctatttt 42280847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 423 - 618
Target Start/End: Original strand, 7908543 - 7908740
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagtt---catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct---t 515  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||  ||||||||  ||| |||  |||| |||||||||| |   |    
T  7908543 ttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagtttttcatttactttcttgttattttattt-atg--ttct-tcttcttctcttctat 7908637  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatct 615  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  7908638 gtctatgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgcgataattggatgagtctaatggcctattcctaatcaaaccaagcctcaaaccctaattt 7908737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 14139789 - 14139670
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||  |||  |  |||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| || |||    
T  14139789 gaatatttgattgattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagttgatccggagcaaaaatacaaagatttggagacaaaaatacgtcttccccaa 14139690  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14139689 gtcagaagcttggcacggcc 14139670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19034903 - 19034844
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19034903 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 19034844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 27353365 - 27353243
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  27353365 caggaatgaatattagatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 27353267  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcac 258  Q
     |||  ||||||||||||||||||    
T  27353266 cccctaaagtcagaagcttggcac 27353243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 27992695 - 27992577
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |    
T  27992695 tcttcttctctatgtctacgatgagcatgagtgagtagatttct-ttgtattgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcct 27992597  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||| ||||||||    
T  27992596 agaaccctaattttatgtaa 27992577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 14094635 - 14094760
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  14094635 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 14094734  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14094735 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 14094760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 15429599 - 15429724
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||| |||| ||     
T  15429599 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacggagatttggagacaaaatatatctcc 15429698  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15429699 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 15429724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 200 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21265331 - 21265261
Alignment:
Q  200 gcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct-cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21265331 gcaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtctccccccaagtcagaagcttggcacgacccgtgcta 21265261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13001302 - 13001209
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaat 229  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | |  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13001302 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgtaaatacgaagattaagagacaaaaat 13001209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 13298118 - 13298234
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac-aa 242  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| | ||    
T  13298118 aatatttgatggattaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtctcccccaaa 13298216  T
Q  243 gtcagaagcttggcacgg 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13298217 gtcagaagcttggcacgg 13298234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #258
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 519 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17577166 - 17577086
Alignment:
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  17577166 tacgatgaacatgagtgagtaaatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 17577086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #259
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Original strand, 6236967 - 6237050
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6236967 tgtctacaacgaacgttagtgagtaggctctccttgtcttgggattgttggataagtctaataacgtaaacctaatcaaaccaa 6237050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #260
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 15429713 - 15429783
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15429713 cttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 15429783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #261
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18884362 - 18884316
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18884362 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 18884316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #262
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 16033945 - 16033986
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16033945 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 16033986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #263
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Original strand, 17078024 - 17078105
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| ||||||||    
T  17078024 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattg 17078105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #264
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 1998461 - 1998500
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998461 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 1998500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #265
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12781948 - 12781826
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtc 234  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||    
T  12781948 caggaacggatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctc 12781849  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcac 258  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  12781848 cccca-aagtcagaagcttggcac 12781826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #266
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 41545740 - 41545634
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| || | ||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  41545740 tgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttcagattgttgaatgaatctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 41545642  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  41545641 ttatgtaa 41545634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #267
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 14094749 - 14094819
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14094749 cttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttggattttaagctactctgtttt 14094819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #268
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16465860 - 16465747
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || || | |||| | |||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  16465860 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggacctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagac-aaaatatgtc 16465762  T
Q  235 tcccacaagtcagaa 249  Q
    |||| ||||||||||    
T  16465761 tcccccaagtcagaa 16465747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #269
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 17696850 - 17696804
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17696850 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 17696804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #270
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 3245194 - 3245121
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3245194 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatgacaaatattcatctttt 3245121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #271
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13047263 - 13047222
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13047263 aagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 13047222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #272
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 13312355 - 13312478
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  13312355 caggaacgaatatttgatg-attaagtcttggagcaaaagagagggatttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtct 13312452  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  13312453 cccccaaagtcagaagcttggcacgg 13312478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #273
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14139650 - 14139609
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttt 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139650 cctttttctgcttttgcttagattttaagctactctattttt 14139609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #274
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14494958 - 14494885
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  14494958 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 14494885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #275
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 17041445 - 17041557
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagctt 253  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |   | |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  17041445 gattgagtcttggagcaaaagaaagaggatttggagctgattcgtgcctaaaatacgaatattga-agacaaaaatatgtctccctcaagtcagagactt 17041543  T
Q  254 ggcacggcccgtgc 267  Q
    ||||||||| ||||    
T  17041544 ggcacggcctgtgc 17041557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #276
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 706 - 783
Target Start/End: Original strand, 17051038 - 17051115
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  17051038 ttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataatgcgacagcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 17051115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #277
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 7908283 - 7908346
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  7908283 aaaatacgaagattgaga-acaaaaatacgtctcccccaagtcagagacttggcacggcccgtgc 7908346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #278
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 330
Target Start/End: Original strand, 11868579 - 11868631
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaag 330  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  11868579 acggccgtgccaccctccagagtcgctttcgcagcttttgcttagattttaag 11868631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #279
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Original strand, 13044881 - 13044957
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  13044881 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctt 13044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #280
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Original strand, 13045435 - 13045511
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  13045435 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctt 13045511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #281
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Original strand, 13045989 - 13046065
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  13045989 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctt 13046065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #282
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Original strand, 13046543 - 13046619
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  13046543 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctt 13046619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #283
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Original strand, 13047097 - 13047173
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  13047097 atgtaattgcttagattttatgtcgaatgttacctataaatagagtagctaaccatcacaaatattcatcttttctt 13047173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #284
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 351 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 14139565 - 14139497
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcat 419  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14139565 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcat 14139497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #285
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14660992 - 14660952
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14660992 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctagtctatttt 14660952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #286
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 42244923 - 42244812
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttg 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |     |||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42244923 gattgagtcttggagcaaaagaaagggatttgaagctgattcgggttgaaaatacgaagattca-atacaaaaatatgactcccccaagtcagaagcttg 42244825  T
Q  255 gcacggcccgtgc 267  Q
    |||||||| ||||    
T  42244824 gcacggcctgtgc 42244812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #287
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 515 - 586
Target Start/End: Original strand, 13069887 - 13069957
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcc 586  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13069887 tgtctacaatgaatgtgagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcc 13069957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #288
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 260
Target Start/End: Original strand, 13301724 - 13301822
Alignment:
Q  162 tcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac-aagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13301724 tcttggagcaaaagagagggatttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtctcccccaaagtcagaagcttggcacgg 13301822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #289
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Original strand, 16472240 - 16472283
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16472240 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaag 16472283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #290
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 299
Target Start/End: Original strand, 2005728 - 2005816
Alignment:
Q  211 aagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtg---ctagccttggtacggccgtgccaccctccagag 299  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||   ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2005728 aagattga-agacaaaaatacatctccctcaagtcagaagcttggcacggccagtgtcactag--ttggcacggccgtgccaccccccagag 2005816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #291
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 570 - 783
Target Start/End: Original strand, 17209753 - 17209966
Alignment:
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata-tggatcaaccat 668  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| |||  ||| || || |||||| ||||||  ||| ||| || || ||| |     
T  17209753 gtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaaa 17209852  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    || ||||||    || |||| | |||||||| | || ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||  ||| | |||||||| ||||| |||||    
T  17209853 taccaaactcataaagcgaatgcggagggttag-tatttgttaattcatcatctcaaatatcaattcaaaaagtgaacgcggagctttaatattggaaca 17209951  T
Q  769 agtgaatttagacaa 783  Q
    |||||| ||||||||    
T  17209952 agtgaaattagacaa 17209966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #292
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 37935012 - 37935053
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37935012 acggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctt 37935053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #293
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 12697445 - 12697333
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||| ||||| |  ||||    
T  12697445 tctctttgtctacaatgaacatgaatgagtagatttgt-ttgtcttgggattgttggttgagtctaatgacctaattcctatcaaatcaagcatataacc 12697347  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  12697346 ctaattttatgtaa 12697333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #294
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 16034031 - 16034104
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||    
T  16034031 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatatccatctttt 16034104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #295
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 576
Target Start/End: Original strand, 16703913 - 16703965
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaat 576  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16703913 atgaacatgagtgagtatacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaat 16703965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #296
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20156248 - 20156215
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20156248 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20156215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #297
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Original strand, 40846499 - 40846615
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgatt--ggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||| ||||  |||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || |    
T  40846499 aatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaagaggattaggagctgattcgggatg--aaaatacgaagattga-agacaaaaatatgttttcccc 40846595  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  40846596 aagtcagaagtttggcacgg 40846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #298
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3245260 - 3245220
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3245260 ccttttgttgcttttccttagattttaagctactctatttt 3245220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #299
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 12159846 - 12159798
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12159846 aatgtaattccttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 12159798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #300
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14495024 - 14494984
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  14495024 ccttttgctgcttttgcttagattctaagttactctatttt 14494984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #301
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 3250305 - 3250266
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3250305 ccttttgctgcttttgcatagattttaagcaactctattt 3250266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #302
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 14976660 - 14976617
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14976660 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaag 14976617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #303
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Original strand, 3212485 - 3212597
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  3212485 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataacattcatcttttattcttggaattcactaagtgacaattgtctttc 3212584  T
Q  456 t-aataaaagttc 467  Q
    | |||||||||||    
T  3212585 tgaataaaagttc 3212597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #304
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 3226556 - 3226646
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  3226556 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 3226646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #305
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Original strand, 3279780 - 3279892
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||  | |||||||||  | | |||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  3279780 gcttaggttttaagtcgattgtaaactataaatagagtagctagccatcacaataaattatcttttattcttggaattcaataagtggcaattgtctttc 3279879  T
Q  456 -taataaaagttc 467  Q
     | ||||||||||    
T  3279880 ttcataaaagttc 3279892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #306
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 366 - 424
Target Start/End: Original strand, 47974814 - 47974872
Alignment:
Q  366 ttttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  47974814 ttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 47974872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #307
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 682 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 13204290 - 13204261
Alignment:
Q  682 aaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13204290 aaacgaaagtggagggtttgataattgttt 13204261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #308
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14976434 - 14976369
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||| ||||||| || |  ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  14976434 gcttagatttaaagtcgaatgtaaactataaatatagtagctagccatcacaaatattcatctttt 14976369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #309
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 622
Target Start/End: Original strand, 17774930 - 17775015
Alignment:
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||| ||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  17774930 gtagactcttcttgtcttgggatcgttggatgaatctaatgacctaatccccatcaaagcaagcctcgaaccctaattttatgtaa 17775015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #310
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 537 - 622
Target Start/End: Original strand, 19076231 - 19076316
Alignment:
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||  |||||| ||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  19076231 gtagactcttcttgtcttgggatcgttggatgaatctaatgacctaatccccatcaaagcaagcctcgaaccctaattttatgtaa 19076316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 555; Significance: 0; HSPs: 244)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 555; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12474897 - 12474239
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474897 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 12474798  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12474797 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgcgttttgctgtttttgcttagattttaagctact 12474698  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474697 ctatttttagcccaaatgtaatttcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccgtccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 12474598  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474597 atatgtgacaattgtctttataataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 12474498  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12474497 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaaccctaattcctta 12474398  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12474397 tctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattc 12474298  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12474297 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 12474239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 16738454 - 16739123
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16738454 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16738553  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16738554 cccacaagtcagaagcttggcacggcctgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 16738653  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16738654 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 16738753  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  16738754 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcgtttacttttatgctttctctcttc-tccccatgtctacgatg 16738852  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16738853 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 16738952  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  16738953 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 16739052  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16739053 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16739123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19829473 - 19828803
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19829473 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagtcgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 19829374  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19829373 ccccacagtcagaagcttggcagggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 19829274  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19829273 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 19829174  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19829173 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 19829075  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19829074 gaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 19828975  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19828974 ccctaatttcgtatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 19828875  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  19828874 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 19828803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 18106893 - 18107563
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106893 caggaatgaatattggatggattgagtgttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 18106992  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106993 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccaccctccagagtaccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18107092  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18107093 ctatttttagcccaaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 18107192  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||    
T  18107193 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcgcccatgtctacgat 18107291  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18107292 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaagccaagctataagccttaatcttatgtaa 18107391  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18107392 ccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 18107491  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18107492 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18107563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 17934128 - 17934798
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17934128 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 17934227  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17934228 ccccacagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgcgttttgctgttttttgttagattttaagctact 17934327  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17934328 ctatttttagctcgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 17934427  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| ||          || |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  17934428 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcgtttcctttattttctcgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 17934527  T
Q  526 aacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  17934528 aacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaac 17934627  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  17934628 cctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 17934727  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17934728 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatctagacaaggattgcaaag 17934798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Original strand, 11607097 - 11607760
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  11607097 gaatattggatggattgagtctgggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccccat 11607196  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11607197 gccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 11607296  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  11607297 tagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtg 11607396  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatt 531  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  11607397 acaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatg 11607495  T
Q  532 agtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11607496 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 11607595  T
Q  630 tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatat 729  Q
    | ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  11607596 ttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatat 11607695  T
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11607696 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 11607760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19075476 - 19075042
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19075476 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 19075378  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19075377 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 19075278  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19075277 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 19075178  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19075177 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 19075078  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19075077 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 19075042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15700138 - 15700574
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15700138 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 15700237  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15700238 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 15700337  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15700338 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 15700437  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15700438 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 15700537  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15700538 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15700574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 4188099 - 4188533
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4188099 gcttagattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatgatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 4188197  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4188198 taaaagttcgtttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 4188297  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4188298 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4188397  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4188398 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttga 4188497  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4188498 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 4188533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22072227 - 22071791
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22072227 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 22072128  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22072127 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttagg 22072028  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22072027 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 22071928  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22071927 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 22071828  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22071827 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22071791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22061146 - 22060710
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22061146 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 22061047  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    || |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22061046 tacaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttagg 22060947  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22060946 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 22060847  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22060846 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 22060747  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22060746 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22060710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 27565979 - 27565543
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27565979 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 27565880  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27565879 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgactagacttctcttgtcttggg 27565780  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27565779 attgttggataattctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 27565680  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27565679 ggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 27565580  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27565579 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27565543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 401 - 794
Target Start/End: Original strand, 22005763 - 22006157
Alignment:
Q  401 atccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgcttt 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||    
T  22005763 atccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgtttt 22005862  T
Q  500 ctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22005863 ctctcttcttctccttgtctacaatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 22005962  T
Q  600 ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtt 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22005963 ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaaatcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtt 22006062  T
Q  700 tgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006063 tgataagtgtttatccatcatctcaaatatgaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 22006157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 27323418 - 27322769
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  27323418 caggaatgaatattggatggattgagtcttagagcaaaagaaagggacttggagctgattgagtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 27323319  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||| |||||||                     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27323318 ccctcaagtcagaaacttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagagtttaagctact 27323240  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27323239 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaataaagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 27323140  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||    
T  27323139 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatactttctctcttctcccccatgtctacgat 27323041  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27323040 gaacatgagtgagtagacttctccatgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 27322941  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  27322940 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatctatcattc 27322841  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27322840 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27322769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12657697 - 12657020
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  12657697 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaattttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 12657598  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12657597 tccctcaagtcagaaacttggcatgacccgtgctaggcttggcacggccgtgccatcctctagaattacttttgctacttttgcttagattttaagctac 12657498  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  12657497 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 12657398  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657397 ttcttggaattcaatatgtgaaaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 12657298  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12657297 catgtctatgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttaggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaa 12657198  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    ||||||||||      
T  12657197 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaacagtggaaacgaaagtggagg----gataattgttcg 12657102  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657101 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 12657020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Original strand, 18006257 - 18006703
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18006257 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 18006356  T
Q  450 tctttctaataaaagtt------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||||||||||||||||      | ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18006357 tctttctaataaaagttattttccttttactttcttgtcatttacttttatgctttttctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagact 18006456  T
Q  544 tctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18006457 tctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaa 18006556  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18006557 ttcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcatgaaa 18006656  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18006657 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 18006703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23603445 - 23602989
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23603445 aatgtaattgcttagattttaagtcgattgtatgttataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttcgaattcaatatgtgacaattg 23603346  T
Q  450 tctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  23603345 tctttctaataaaagttattttcttttcctttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgatcattagtgagta 23603246  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23603245 gacttctcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatc 23603146  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  23603145 taaatttaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcat 23603046  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23603045 aaaacgaaagtggtgttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23602989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 25615211 - 25615663
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25615211 aatgtaattgcttagatttgaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 25615310  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25615311 tctttctaataaaagttctttt-cttttcctttacttgtcatttacttttatgctttctctcttactctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagac 25615409  T
Q  543 ttctcttg-tcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaa 640  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |    
T  25615410 ttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccatgctctaagccttaatcttatgtaactctaatttcttatatga 25615509  T
Q  641 attcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaa 740  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25615510 attcaccgctttaagatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 25615609  T
Q  741 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25615610 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25615663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 14077494 - 14077050
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14077494 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattgatcttttcttggaattcaatatgtgacaattgt 14077395  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14077394 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacgtttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 14077295  T
Q  541 acttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  14077294 acttctctttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagcttaaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatct 14077195  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14077194 aaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 14077095  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14077094 aaacaaaagtggacctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 14077050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 18854348 - 18855018
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | |        |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18854348 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtac--------gaagattcggagacaaaaatatatc 18854439  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18854440 tctctcaagtcaaaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactctagaactacttttgctgtttttgcttagattttaagctac 18854539  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgta-------------atagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatct 421  Q
    ||| |||| ||   | ||||              || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  18854540 tctgtttt-agtttacatgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccgtcacaaatattcatct 18854638  T
Q  422 tttcttggaatgcaatat---gtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    ||| ||    || |||||   ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18854639 tttgttctc-tgaaatattaagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccat 18854737  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854738 gtctacaatgaacgttggtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 18854837  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18854838 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 18854937  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854938 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18855018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 12442456 - 12442904
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12442456 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttgaattcaataagtgaaaattgtctttctaa 12442555  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  12442556 taaaagttcttttcatttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatcagtgagtagacttcttc 12442655  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12442656 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaaactcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattca 12442755  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    || |||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12442756 ccgctttgacatgaattaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaa 12442855  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12442856 agtggagctttgatatccgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 12442904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 29596026 - 29596709
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| || || ||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  29596026 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttgaagcgaaaatatgaagattcggagacaaaaatacatct 29596125  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgc-cttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| |||||    ||| | |||||||| |||  ||||| | | | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29596126 ccctaaagtcagaagcttggcacggcccatgctaagggtggcatggccgtgctacctcccagaattcacgtttgctgcttttgcttagattctaagctac 29596225  T
Q  335 tctatttt----tagcccaaa-----tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc 425  Q
    ||||||||    || |  |||     |||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  29596226 tctattttagtttaccagaaagcccttgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttc 29596325  T
Q  426 ttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||||||||          | ||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||    
T  29596326 ttggaattcaacaagtgacaattgt--ttctaataaaagttattttcttttcttttactttcttgtcatttactttcatgtcttctctcttcttcccctt 29596423  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaa 612  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29596424 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttatctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattaaaccttaa 29596523  T
Q  613 tct---tatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 709  Q
    |||   ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  29596524 tctaattatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggaggatttgataattgt 29596623  T
Q  710 ttatccatcatctcgaatatcaattcat-aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
       ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29596624 ccgtccatcatctcaaatatcaatttataaaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 29596709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 210283 - 209838
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||  ||||||    
T  210283 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aatgagtgaca 210186  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  210185 attgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 210086  T
Q  543 ttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaa 640  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  210085 ttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaatgaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaa 209986  T
Q  641 attcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaa 740  Q
     |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  209985 gttcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtgaggggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 209886  T
Q  741 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  209885 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 209838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 359 - 790
Target Start/End: Original strand, 8603452 - 8603888
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8603452 gcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagtcatctatcataacaattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 8603551  T
Q  456 taataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtc 552  Q
    |||||||||||| ||   || || | ||||||||||||| ||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8603552 taataaaagttctttctttatttctttgttatttacttt-atgtttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttttc 8603650  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||||||||||  |||    
T  8603651 ttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgtttt 8603750  T
Q  653 aatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag 752  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603751 aacatgaattaaccattatcaaactgttgaagcgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggag 8603850  T
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8603851 ttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgt 8603888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 17119432 - 17119892
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17119432 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtaactagtcatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 17119531  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt---------------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    |||||||||||||||||| |||               |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17119532 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagt 17119631  T
Q  535 gagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcc 632  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |    
T  17119632 gagaagacttcttcgtgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaatcttaatcttatgtaaccttaatctc 17119731  T
Q  633 ttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaa 732  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17119732 taatctaaattcaccgctttaacatgcattaaccat-atcaaacagtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaa 17119830  T
Q  733 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17119831 ttcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 17119892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 359 - 788
Target Start/End: Original strand, 24218672 - 24219110
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtcttt 454  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||||||| | |    
T  24218672 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaataaagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttct 24218769  T
Q  455 ct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttg 550  Q
     | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24218770 ttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttg 24218869  T
Q  551 tcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat--tcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||    
T  24218870 tcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatatatatattcacc 24218969  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24218970 gctttaacatggatcaaccattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaag 24219069  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24219070 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 24219110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 143 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 21574247 - 21573581
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||| ||    
T  21574247 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatgggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaa-tatatctccctca 21574149  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  21574148 agtcagaaacttggcatagcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagagctacttttgctgcttttgcttaaattt-aagctactctgttt 21574050  T
Q  342 t---------tagcccaaat--gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgga 430  Q
    |         | |  ||     || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21574049 tagtttactttggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagtcatcataaatattcatcttttcttgga 21573950  T
Q  431 atgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtcta 520  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21573949 attcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtcta 21573850  T
Q  521 cgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||| | || | |    
T  21573849 cgatgaccattagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgaccaagtcaagccttaaaccttagtattgtat 21573750  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    ||||||| || ||  |||||||||| |  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21573749 aaccctagtttctcttctaaattcatcgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcat 21573650  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
      | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21573649 tccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 21573581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23297793 - 23297117
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |  |||| ||| | || | |   |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  23297793 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaatggttttggagctgtttcggtatgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 23297694  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    || | |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23297693 tctctcaagtcagaaacttggcacggcccgtcttaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgttgcttttgcttagattttaagctac 23297594  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       |||   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23297593 tctgttttagtatactagtagaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 23297494  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297493 ttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaataaaatttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 23297394  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||     
T  23297393 catgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaagtcaagccttaaaccttag 23297294  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    | || | ||| |||| || ||  | ||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |    
T  23297293 tattgtataaacctagtttctcttataaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggattgataatcgttaa 23297194  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  23297193 tccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtaaatttagacaatgattg 23297117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 20993921 - 20993475
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||   |||||||||| ||||| |||||||     
T  20993921 atgtaattgcttagattccaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaacaatcatcttgtattcttggaattcaataagtgacaac 20993822  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagtt---------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgag 537  Q
    ||||||||| ||||||||||         | ||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20993821 tgtctttcttaataaaagttttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttatccttcttttccatgtctacgatgaacatgagtgag 20993722  T
Q  538 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  20993721 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaatcttatgtaaccctaatctctaat 20993622  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20993621 ctaaattcacctttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattca 20993522  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20993521 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 20993475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 18732280 - 18732735
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18732280 aatgtaattgcttagattctaattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccattacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 18732379  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||           |||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18732380 tctttctaataaaagttcttttttttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttccccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagt 18732479  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |  ||| |||||||||||||| |||||  || |||    
T  18732480 ag-cttctcttgtctttggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaatcaagatattgaccctaatcttatgtaactctaatctctaatc 18732578  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18732579 taaattcaccgttttataatgaatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat 18732678  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18732679 aaaacaaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18732735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 25402831 - 25402159
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25402831 caggaacgaatatttgatggattgagtctttgagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 25402732  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25402731 tccctcaagtcagaaacttgtcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactatttttgctgcttttgcttagattttaagctac 25402632  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||||||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||    
T  25402631 tctattttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtaactagccatcataaatattcatctt 25402532  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  25402531 ttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttactttaatgttttatctcttcttctccat 25402434  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  25402433 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaat 25402334  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     ||||||||||||| || ||  |||||||| |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25402333 attatgtaaccctagtttctcttctaaatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaat 25402234  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  25402233 ccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttaggcaaggatt 25402159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 351 - 790
Target Start/End: Original strand, 25774973 - 25775426
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  25774973 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaat 25775072  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||          |||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  25775073 tgtctttcttaataaaagttcttttctttttctttattttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 25775172  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||| |||||||| || || ||    
T  25775173 gtagacttcttttgtcttgggattgttagataagtctaattacataatcctaatcaaagcaacccttaaatcctaatcttatttaaccctagtttctaat 25775272  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  25775273 ctaaattcaccgttttaacatgatttaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaaaatcaattca 25775372  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25775373 taaaacgaaagtggagttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgt 25775426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 19561056 - 19560611
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19561056 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcattaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 19560957  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct--tgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  | |||||||||||||||||||   ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||    
T  19560956 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttattatttacttttatgcttttcttcttcttcttctcatgtctacgatgaacatgagtgagt 19560857  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  19560856 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttattgaccgtaatcttatgtaaccctaatctctaatc 19560757  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||| |  ||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  19560756 taaattcatcgttttaacatgaattaaccattatcaaactctggaaacgaaaattgagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat 19560657  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19560656 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 19560611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 1626093 - 1626538
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg-gaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  1626093 atgtaattgtttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttagaattcaataagtgacaattg 1626192  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||     |||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1626193 tctttctaataaaagttcttttcttttactttcttgttatttacttttatactttctttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 1626292  T
Q  545 ctcttgt-cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||    
T  1626293 ctttttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctagtttctattctaaatt 1626392  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    ||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  1626393 caccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaagcgaaagcggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatatcaattcataaaacg 1626492  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1626493 aaagtgtagttttgatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 1626538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22766749 - 22766307
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  22766749 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 22766650  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22766649 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 22766550  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  22766549 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 22766450  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22766449 taacatggattaaccattatcaaactgtgggaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 22766350  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22766349 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22766307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22773432 - 22772990
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  22773432 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 22773333  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22773332 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 22773233  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  22773232 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 22773133  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22773132 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 22773033  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22773032 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22772990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 6479140 - 6479587
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  6479140 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 6479239  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6479240 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 6479339  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6479340 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 6479439  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6479440 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 6479539  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  6479540 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 6479587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 6490561 - 6491008
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  6490561 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 6490660  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  6490661 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 6490760  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  6490761 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 6490860  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6490861 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 6490960  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  6490961 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 6491008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22165181 - 22164734
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22165181 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22165082  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22165081 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22164982  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22164981 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22164882  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22164881 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22164782  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22164781 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22164734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 22244395 - 22244842
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22244395 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22244494  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22244495 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22244594  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22244595 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22244694  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22244695 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22244794  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22244795 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22244842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 22737773 - 22738229
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| | || |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  22737773 atgtaattgcttagattctaagtcaaatgtaaattataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 22737872  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  22737873 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttattttactttatgcttttcttcttcttctccatgtctacaatgaacatgagtga 22737972  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| || ||    
T  22737973 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaataacataatcctaatcaaaccaagcttgaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaat 22738072  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22738073 ctaaattcaccgttttaacaggaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg-ttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattca 22738171  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22738172 taaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgagtttagacaaggattgtaaag 22738229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15153626 - 15154072
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15153626 gcttagattctaagtcgaatgtaacctataaatagagtagttagccatcacaaatattcatattttcttggaattcaataagtgacaattgcctttctaa 15153725  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15153726 taaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctc 15153824  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15153825 ttgtcttgggatagttggaaaagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 15153924  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15153925 cgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaatgaaattggatgttttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 15154024  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15154025 gtggaactttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattttaaag 15154072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20022428 - 20021981
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  20022428 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 20022329  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20022328 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 20022229  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20022228 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 20022129  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20022128 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 20022029  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20022028 gtggagctttgattttcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20021981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 484 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22787198 - 22786886
Alignment:
Q  484 tttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacat 581  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22787198 tttactttaatgctttctctcttcttccccatgtctacgataaacatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacat 22787099  T
Q  582 aatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtgg 681  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22787098 aatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgg 22786999  T
Q  682 aaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 781  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22786998 aaacgaaagtgaaggatttgataattttttatccattatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 22786899  T
Q  782 aaagattgtaaag 794  Q
    || ||||| ||||    
T  22786898 aaggattgcaaag 22786886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19966799 - 19966350
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  19966799 atgtaattgcttagattttaagtcgaatataacatataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcattggaattcaataagtgacaattg 19966700  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||  ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  19966699 tcttttgaataaaagttcttttctttttctttactttgttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 19966600  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  19966599 gacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataatattatgtaaccctagtttctcttcta 19966500  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||| |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| | |||||||||    
T  19966499 aatttaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatttcaaatgttaattcataa 19966400  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19966399 aacgaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 19966350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Original strand, 20164118 - 20164549
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  20164118 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 20164217  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||  ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20164218 ataaagttattttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 20164317  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  20164318 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 20164417  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20164418 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 20164517  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20164518 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaa 20164549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 5152770 - 5152329
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg-gaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  5152770 gcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttagaattcaataagtgacaattgtcttttga 5152671  T
Q  458 ataaaagttcatt----------tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||||||| ||          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  5152670 ataaaagttctttccttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 5152571  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  5152570 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatgattctaatcaagccaaggcttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcacc 5152471  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
      ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||||||||||    
T  5152470 gttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaag 5152371  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  5152370 tggagttttaatattcgatcaagtaaatttagacaaggattg 5152329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20016262 - 20015816
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  20016262 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 20016163  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttat----------gctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| || |||||| | | |||          |||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20016162 ataaagttcttttcctttcct-ttattttcctgtattttactttcagctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 20016064  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20016063 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 20015964  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20015963 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 20015864  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20015863 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20015816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Original strand, 20170815 - 20171246
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||   |||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  20170815 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttaaatggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 20170914  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20170915 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 20171014  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  20171015 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 20171114  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20171115 taacatggattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 20171214  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20171215 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaa 20171246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24861537 - 24861091
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  24861537 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 24861439  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24861438 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 24861339  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  24861338 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 24861239  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24861238 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 24861139  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24861138 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24861091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18184380 - 18184099
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18184380 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgcgattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccataa 18184281  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  18184280 tcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaa 18184181  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18184180 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18184099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 18844418 - 18844839
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtcttt 454  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||||||| | |    
T  18844418 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttct 18844515  T
Q  455 ct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-g 550  Q
     | ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||                     ||||||||||| |    
T  18844516 ttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgt---------------------agacttctctttg 18844594  T
Q  551 tcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||      
T  18844595 tcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgt 18844694  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18844695 tttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 18844794  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18844795 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18844839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24854878 - 24854432
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  24854878 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 24854780  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24854779 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgttttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 24854680  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  24854679 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 24854580  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24854579 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 24854480  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24854479 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24854432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 479 - 783
Target Start/End: Original strand, 26474028 - 26474331
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26474028 tgttatttacttttatgtttttcttctttttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 26474127  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||     
T  26474128 tataatcctaatcaaacaaagctt-aaaccctaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaacta 26474226  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26474227 tagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcgtaaaacgaaagtggaggtttgatattcgaacaagtgaattta 26474326  T
Q  779 gacaa 783  Q
    |||||    
T  26474327 gacaa 26474331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Original strand, 15158204 - 15158530
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  15158204 tttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggaa 15158302  T
Q  568 aagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacc 666  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||    
T  15158303 aagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacc 15158402  T
Q  667 attatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaa 766  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  15158403 attatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatatttgaa 15158502  T
Q  767 caagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15158503 caagtgaatttagacaaggattttaaag 15158530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 30671434 - 30670978
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc---ttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| ||||||||    
T  30671434 atgtaattgcttagatttcaagtcgactgtaaactataaatagagtagctagc-atcacaaatattcatcttttaattttggaattcaataagtgacaat 30671336  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttctgttatttactt-----------ttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||           ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30671335 tgtctttcttaataaaagttctttt-cgtttcttttattttcttgttattttactttatgattttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtg 30671237  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  30671236 agtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatccaaatcaaaccaagatttaaaccttaattttatgtaatcctaatttctaa 30671137  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30671136 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtgaagagtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattc 30671037  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30671036 ataaaacggaagtggatttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 30670978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 136 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 16162952 - 16162712
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16162952 caggaatgaatattagacggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttagagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16162853  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16162852 ccaaaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccatctagagtgccctttgctgcttttgcttagattttaagctact 16162753  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcga 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16162752 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcga 16162712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17284026 - 17283747
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  17284026 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaatcctaatt 17283927  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17283926 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattataaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 17283827  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17283826 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttcatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 17283747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 351 - 757
Target Start/End: Complemental strand, 5672229 - 5671809
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  5672229 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctacccatcacaaatagtcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 5672130  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||  ||||||          ||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  5672129 tgtctttcttaataaaagttcttttctttttcttttctttcttgttatttacttttatacttt-tctccttcttctcat-gtctacgatgaacatgagtg 5672032  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  ||| |||||||||||||| |||||  ||     
T  5672031 agtagacttctcttgtattaggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagatattgaccctaatcttatgtaactctaatctcta 5671932  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5671931 atctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatt 5671832  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5671831 cataaaacgaaagtggagctttg 5671809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 536 - 769
Target Start/End: Original strand, 35271295 - 35271530
Alignment:
Q  536 agtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  35271295 agtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctcaatcttatgtaaccctaatttct 35271394  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35271395 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaaatgtggaaacgaaagtcgagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 35271494  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35271495 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 35271530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Original strand, 29360418 - 29360704
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29360418 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttggggttgttggataagtctaatgtcataatcctaatcaaaccaagctt 29360517  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||    
T  29360518 t-aaccctaatcttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacga----ggaaggtttga 29360612  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  29360613 taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagataaggattgcaaag 29360704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 21560250 - 21559813
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | | ||   |||||||    
T  21560250 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatcggtcaaattt---tttctaa 21560154  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||      
T  21560153 taaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttctccacgtctacgatgaccatgagtgagtagacttctta 21560054  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| | |||| |||||||| || ||  |||||||||| |     
T  21560053 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagtattatataaccctagtttctcttctaaattcatcg 21559954  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
     ||||| |||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||  | ||| | ||||||||||||||||||    
T  21559953 ttttaacatggattaaatattattaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaagt 21559854  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21559853 ggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 21559813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 18448719 - 18449162
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| |||||||    
T  18448719 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgtaat--aataagtgacaa 18448816  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448817 ttgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttctttcccatgtctacgatgaacattagtgagtagact 18448916  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||||||    
T  18448917 tcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaatccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttataaatt 18449016  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    | ||  | ||| |||||| ||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||||||    
T  18449017 ctccgttataacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaattggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacg 18449116  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| |||||  || ||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  18449117 aaaatggagtcttaatatttgatcaagtgaatttagacaaggattg 18449162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 19615181 - 19614895
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19615181 tcttcttctctatgtctacaatgaatatgagtgcgtagacttctcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcct 19615082  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19615081 taaaccttaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaacggtagaagcgaaagtggagggtttga 19614982  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  19614981 taattgttaatccatcatctaaaacatcaattcataaaacgaaagttgagttttgatattcgaacaaatgaatttagacaaggattg 19614895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 25968676 - 25968949
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  25968676 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataatt 25968775  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  25968776 ttatgtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 25968874  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25968875 catcatctcaaatattaattcatgaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 25968949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 518 - 762
Target Start/End: Complemental strand, 25786336 - 25786093
Alignment:
Q  518 ctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctta 617  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25786336 ctacgatgaacatgagtatgtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-ccttattctta 25786238  T
Q  618 tgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccat 717  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25786237 tgtaaccctagtttctaatctaaattcacctttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccat 25786138  T
Q  718 catctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 762  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||    
T  25786137 catctcaaatatcaattcataaaatgagagtggagtattgatatt 25786093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 595 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18195472 - 18195273
Alignment:
Q  595 ccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 694  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18195472 ccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 18195373  T
Q  695 gggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18195372 gggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgagtttagacaaagattgtaaag 18195273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 6795054 - 6795327
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  6795054 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatt 6795153  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  6795154 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 6795252  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  6795253 catcatatcaaatatcaattcgtaaaacgaaagtggagttttggtattcgcacaagtgaatttagacaaggattg 6795327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18233794 - 18233531
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||    
T  18233794 tgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctattaaccctaatc 18233695  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |                || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18233694 t----------------ctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatccaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 18233611  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18233610 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttatacaagggttgtaaag 18233531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 515 - 781
Target Start/End: Original strand, 25964029 - 25964294
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  25964029 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataatt 25964128  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  25964129 ttatgtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 25964227  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 781  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25964228 catcatctcaaatattaattcattaatcgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagac 25964294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 17743616 - 17743878
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  17743616 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa--------- 17743706  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
            |||||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  17743707 --------ccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgtaagtagagggtttgataattgttaatc 17743798  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17743799 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtgaagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 17743878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Original strand, 25949435 - 25949709
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||     
T  25949435 tgtctacaatgaacgttagtgagtagattcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaagcaagccttaaaccctaatt 25949534  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| ||  || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  25949535 ttatgtaaccctaatttctactctaaattcaccgttttaacatcaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 25949633  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25949634 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatatttgaaaaagtgaatttagacaaggattgt 25949709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 640 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23540820 - 23540666
Alignment:
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23540820 aattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataa 23540721  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23540720 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23540666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 517 - 789
Target Start/End: Original strand, 16470090 - 16470362
Alignment:
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16470090 tctacgatgaacatgagtgagtagaatcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagccttaaaccttaatttt 16470189  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
     ||||||||||||| || |||||||||||||  ||| | ||| || ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  16470190 gtgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattca 16470288  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg-agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16470289 tcatctcaaatatcaattcatcaagcgaaagtggaagttttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattg 16470362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 11215299 - 11215505
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11215299 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagctgattcagtgcgaaaatacgaagatttagagacaaaaatatgtct 11215398  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11215399 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccatccagagtcacttttgctgcttttgcttatattttaagctact 11215498  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  11215499 ctatttt 11215505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18006019 - 18006226
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  18006019 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaatgtacttggagctgattcggtaccaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 18006118  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18006119 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 18006218  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  18006219 tctatttt 18006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 615 - 794
Target Start/End: Original strand, 24511780 - 24511959
Alignment:
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24511780 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatt 24511879  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24511880 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 24511959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15699893 - 15700098
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  15699893 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatgtct 15699991  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || | ||||||| |    
T  15699992 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactctaagctatt 15700091  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15700092 ctatttt 15700098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19075721 - 19075516
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  19075721 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagactaaa-tacgtct 19075623  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  |||| | ||||| |    
T  19075622 cctacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgctaggattctgagctatt 19075523  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  19075522 ctatttt 19075516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22002145 - 22002351
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  22002145 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacaaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 22002243  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002244 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22002343  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  22002344 tctatttt 22002351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22244150 - 22244355
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22244150 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22244248  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || | ||||||| |    
T  22244249 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactctaagctatt 22244348  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22244349 ctatttt 22244355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24861781 - 24861577
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  24861781 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24861683  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |    
T  24861682 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactctaagctatt 24861584  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24861583 ctatttt 24861577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15857439 - 15857250
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatctt-ggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15857439 caggaaagaatattggatggattgagtcttaggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa-tacgtc 15857341  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagatt 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| ||||    
T  15857340 tcccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctctagatcaccttttgctgcttttgcttggatt 15857250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24855122 - 24854918
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  24855122 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24855024  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24855023 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 24854925  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24854924 ctatttt 24854918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 616 - 794
Target Start/End: Original strand, 32544764 - 32544942
Alignment:
Q  616 tatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 715  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  || || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32544764 tatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatcc 32544863  T
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32544864 atcacctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 32544942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 31549279 - 31549154
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31549279 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 31549180  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  31549179 cccacaagtcagaagcttggcacggc 31549154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 469 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 23616390 - 23616210
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23616390 tttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctctatcttgggattgttggat 23616291  T
Q  568 aagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23616290 aagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcacc 23616210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22061390 - 22061186
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22061390 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22061292  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22061291 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 22061193  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22061192 ctatttt 22061186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22072471 - 22072267
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22072471 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22072373  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22072372 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 22072274  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22072273 ctatttt 22072267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22165426 - 22165221
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22165426 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22165328  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22165327 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 22165228  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22165227 ctatttt 22165221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22766993 - 22766789
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22766993 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22766895  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22766894 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 22766796  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22766795 ctatttt 22766789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20022672 - 20022468
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  20022672 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20022574  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  20022573 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 20022475  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20022474 ctatttt 20022468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 20163874 - 20164078
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20163874 caggaaagaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20163972  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  20163973 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 20164071  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20164072 ctatttt 20164078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 351 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 19563989 - 19563730
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| || || |  |||||||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||    
T  19563989 atgtaattgtttagattctaagttgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcataaatattcatcttttctctgaattcaataagtgacaattgt 19563890  T
Q  451 ctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19563889 ctttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccacgtctacgatgaacatgagtgagta 19563791  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19563790 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaag 19563730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23603682 - 23603471
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  23603682 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaatttgaagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtctc 23603584  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23603583 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttacttagattttaagctact 23603484  T
Q  336 ctatttttagccc 348  Q
    |||||||||||||    
T  23603483 ctatttttagccc 23603471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 663 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 25656288 - 25656168
Alignment:
Q  663 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656288 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 25656189  T
Q  763 cgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25656188 cgaacaagtgaatttagacaa 25656168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22773677 - 22773472
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || || ||||||| |||    
T  22773677 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaac-aaaatatatct 22773579  T
Q  236 cccacaagtcagaagctt-ggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||     
T  22773578 cccacaagtcagaagcttgggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctat 22773480  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  22773479 tctatttt 22773472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25614974 - 25615180
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||   | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  25614974 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcagtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtct 25615072  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25615073 cccccaaagtgagaagcttggcacggcccgtgctagctttggcacggccgttccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 25615172  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  25615173 tctatttt 25615180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 20170571 - 20170775
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20170571 caggaaagaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20170669  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| || |  |||||| |    
T  20170670 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgctttttctttgactccaagctatt 20170768  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20170769 ctatttt 20170775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 686 - 794
Target Start/End: Original strand, 22344244 - 22344352
Alignment:
Q  686 gaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaag 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22344244 gaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaag 22344343  T
Q  786 attgtaaag 794  Q
    |||||||||    
T  22344344 attgtaaag 22344352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18195897 - 18195690
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18195897 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 18195798  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18195797 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 18195698  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||| ||||    
T  18195697 tctgtttt 18195690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25606636 - 25606842
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  ||||   | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  25606636 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattctgtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtct 25606734  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25606735 cccccaaagtgagaagcttggcacggcccgtgctagctttggcacggccgttccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 25606834  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  25606835 tctatttt 25606842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 4187854 - 4188059
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  4187854 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttgagctgattcggtacaaaaatatgaagattc-gagacaaaaatacgtct 4187952  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  4187953 ccctcaagtcataatgctggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 4188052  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  4188053 ctatttt 4188059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 225 - 487
Target Start/End: Original strand, 22343513 - 22343788
Alignment:
Q  225 aaaatatgtctcccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttaga 323  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||| |    
T  22343513 aaaatatatctcccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgttaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttata 22343612  T
Q  324 ttttaagctactctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaa 411  Q
    |||| ||||||||| ||||       | |   || ||    || || |||| ||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||    
T  22343613 tttttagctactctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgctttgattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaa 22343712  T
Q  412 atattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttattta 487  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22343713 atattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttattta 22343788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 612 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19570053 - 19569871
Alignment:
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||| |||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  19570053 atcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgtta 19569954  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19569953 atccatcatcttaaatatcaattcatataacaagagtggagtcttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 19569871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 423 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 22601421 - 22601214
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || || | ||||||||| ||| |||||||   ||||||||||| ||||    
T  22601421 ttcttgggattcaaaaagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttctttgttatttaattt-atgcttttcttcttcttctccatgtc 22601323  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  22601322 tacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaaactttaaaccctaattttat 22601223  T
Q  619 gtaacccta 627  Q
    |||||||||    
T  22601222 gtaacccta 22601214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 6478900 - 6479100
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  6478900 aagaatgttggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacatgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 6478998  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  6478999 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatt 6479098  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  6479099 tt 6479100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 6490321 - 6490521
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||    |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  6490321 aagaatgttggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacatgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 6490419  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  6490420 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatt 6490519  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  6490520 tt 6490521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19570388 - 19570192
Alignment:
Q  146 tattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtc 245  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  19570388 tatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctccctcaagtc 19570289  T
Q  246 agaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    | || ||||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570288 aaaaacttggcacggcctatgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggattcccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 19570192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30671686 - 30671479
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  30671686 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 30671587  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||| ||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30671586 cccccaagtcagaagcttggcacgacacttgctaacattggcacggccgtggcacctcccaggatctccttttgctgcttttgcttagattttcagctac 30671487  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  30671486 tctatttt 30671479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22236797 - 22237001
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |      
T  22236797 caggaaggaatatttgatggaaagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatattc 22236895  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22236896 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 22236994  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22236995 ctatttt 22237001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 469 - 643
Target Start/End: Original strand, 29563360 - 29563540
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||| ||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  29563360 tttactttcttgtcatttactttcatgtcttctctcttcttccccttgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgttttgggattgttggat 29563459  T
Q  568 aagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatc---ttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||  || |||||||||    
T  29563460 aagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaaccttaatctaattatgtaaccctaatctctaatctaaatt 29563540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 25626028 - 25626226
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||  ||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||| |||    
T  25626028 gaatatttgatgaattgagccttggagcaaaagaaaggga-tttgagctaattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtctcccccaa 25626125  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25626126 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagctttggcacggccgtacctccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagaatttaagctactctattt 25626225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23517079 - 23516924
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23517079 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatacgtct 23516980  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23516979 ccctcaagtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacc 23516924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 5153025 - 5152820
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| ||||   ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  5153025 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaataaaggggttttggagctgattcagtgcgaaaatacgaagattc-gagacaaaaatatatc 5152927  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5152926 tcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgcaaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattttaaactac 5152827  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  5152826 tctattt 5152820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 15693225 - 15693327
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693225 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15693324  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  15693325 ccc 15693327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 18422585 - 18422687
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422585 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 18422684  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  18422685 ccc 18422687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20994136 - 20993947
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagctt 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20994136 gattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggagcaaaaatacgaagattcgaagacaaaaatatgtctcacccaagtcagaagctt 20994037  T
Q  254 ggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20994036 ggcacggcccgtgctaaatttggcacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 20993947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12993690 - 12993482
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||    
T  12993690 caggaatgaatatttgatagattgagtctttgagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtc 12993591  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12993590 tcccttaactcagaagcttggcacggcccgtgctaagcttggcacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttagatttcaagcta 12993491  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    || ||||||    
T  12993490 ctttatttt 12993482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25774721 - 25774928
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||  ||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  25774721 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaatgggtttggagcttattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 25774820  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |  ||| ||| ||||||||||  ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25774821 cccccaagtcagaagcttagcacggcccgttctcccactggcacgaccgtgccacctcccaggactgccttttgctgattttgcttagatttcaagctac 25774920  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  25774921 tctatttt 25774928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 143 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23620009 - 23619867
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  23620009 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctccccaaa 23619910  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgt 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23619909 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgt 23619867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 210513 - 210314
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |||| |||    
T  210513 gaatattggatggattgagtcttggatcaaaagaaagggatttggagctgattcggtatgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtttcccccaa 210415  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  210414 agtcagaagctaagcacggcccgtgctagcattggcacgaccgtgccaccctccataatcgcttttgctgcttttgtttagattttaagctactctattt 210315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 21560432 - 21560237
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttga-gccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| | || |||| | | | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  21560432 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggggcaaaagaaaagggttttaatgctgatttggtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatatc 21560333  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaag 330  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21560332 tcccttaagtcagaaacttggcacgacccgtgctaggcttggcacgaccgtgccaccctccagagctacttttgctgcttttgcttagattttaag 21560237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 10719269 - 10719107
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| || |    
T  10719269 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaatgggtttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatacgttt 10719170  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10719169 ccctcaagtcagaatgttggcacggcctgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccaga 10719107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 685 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 5949496 - 5949391
Alignment:
Q  685 cgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaa 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  5949496 cgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatatttgaacaagtaaatttagacaag 5949397  T
Q  785 gattgt 790  Q
    ||||||    
T  5949396 gattgt 5949391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 354 - 467
Target Start/End: Original strand, 11215540 - 11215653
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctt 453  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  11215540 taattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtttt 11215639  T
Q  454 tctaataaaagttc 467  Q
    ||||||||||||||    
T  11215640 tctaataaaagttc 11215653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 694 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 19563701 - 19563612
Alignment:
Q  694 agggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19563701 agggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 19563612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Original strand, 25606873 - 25606990
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25606873 aatgtaattgcttagatttgaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 25606972  T
Q  450 tctttctaataaaagttc 467  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25606973 tctttctaataaaagttc 25606990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 334
Target Start/End: Original strand, 22737514 - 22737720
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  22737514 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcagagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 22737613  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttg-------gtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagatttt 327  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||       | ||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  22737614 tccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggagcacggccgtgccacctcccaggaacaccttttgctgcttttgcttagatttt 22737713  T
Q  328 aagctac 334  Q
    |||||||    
T  22737714 aagctac 22737720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Original strand, 25626266 - 25626374
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25626266 gcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaa 25626365  T
Q  459 taaaagttc 467  Q
    |||||||||    
T  25626366 taaaagttc 25626374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 1625861 - 1626051
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  1625861 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttgatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatctccctca 1625960  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||         || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1625961 agtcagaagcttgccatggcccgtgctaggcttggcacggtcgtgccacctcccaga---------gccgcttttgcttagattttaagctactctattt 1626051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 2181691 - 2181897
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2181691 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcagagaaaaaaatatatc 2181790  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||  ||||     ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  2181791 tccctcaagtcagaaacttggcacggcctgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccaggacaacttttgctgcttttgcttatattctaagctac 2181890  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  2181891 tctattt 2181897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 469 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 20105648 - 20105519
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||   |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20105648 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcttctttttctcgatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggata 20105549  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105548 agtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 20105519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 18448471 - 18448671
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18448471 caggaacgaatatttgatggattgagtctaggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 18448570  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    | ||  |||||| |||||| |||| ||||||||||   |||| |||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18448571 ttccctaagtcaaaagcttcgcaccgcccgtgctaaggttggcacggtcgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 18448670  T
Q  335 t 335  Q
    |    
T  18448671 t 18448671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 20218448 - 20218316
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||     
T  20218448 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaatt 20218349  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| ||||||    
T  20218348 ttatataaatctactttctaatctaatttcacc 20218316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22112473 - 22112341
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||     
T  22112473 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaatt 22112374  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| ||||||    
T  22112373 ttatataaatctactttctaatctaatttcacc 22112341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 715 - 794
Target Start/End: Original strand, 17820544 - 17820623
Alignment:
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17820544 catcatctcaaatatcaatgcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 17820623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 290
Target Start/End: Original strand, 18822592 - 18822747
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18822592 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 18822691  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccac 290  Q
    || | ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18822692 tctctcaagtcataaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccac 18822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22787852 - 22787726
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22787852 caggaacgaatattggatcgattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 22787753  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  22787752 ccccaaagtcagaagcttggcacggcc 22787726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25923359 - 25923274
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25923359 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacatattcctaatcaaaccaagc 25923274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 627
Target Start/End: Original strand, 5399350 - 5399454
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  5399350 atgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaa 5399449  T
Q  623 cccta 627  Q
     ||||    
T  5399450 accta 5399454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 223 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5672375 - 5672255
Alignment:
Q  223 caaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagt-gccttttgctgcttttgctta 321  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||||| |  ||||||| |||||||| |||    
T  5672375 caaaaatatgtctcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcatggccgtgccacctcccagaataaccttttgttgcttttgttta 5672276  T
Q  322 gattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5672275 gattttaagctactctatttt 5672255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 35271151 - 35271287
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc- 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||   | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  35271151 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagttgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 35271250  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 271  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35271251 tccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 35271287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 18732053 - 18732180
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  18732053 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggattttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 18732152  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18732153 tccctcaagtcagaagcttggcacggcc 18732180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 384 - 590
Target Start/End: Original strand, 18627407 - 18627615
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctt-tctaataaaagttcatttacttttct 479  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  ||||||||||| ||   ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |    
T  18627407 ctataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttgttattggaattcaata-gtgacaattgtcttctttaataaaagttcttttactttctt 18627505  T
Q  480 gttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    |||||||  ||| ||| | |||| ||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18627506 gttattttattt-atgttcttct-tcttctcttctttgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatga 18627603  T
Q  579 cataatcctaat 590  Q
    | ||||||||||    
T  18627604 cctaatcctaat 18627615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22787636 - 22787519
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||    
T  22787636 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctactcatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatcagggacaattg 22787537  T
Q  450 tctttctaataaaagttc 467  Q
      ||||||||||||||||    
T  22787536 cttttctaataaaagttc 22787519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Original strand, 4741097 - 4741181
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4741097 tgtctacgatgaacattagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 4741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 523 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 14992240 - 14992124
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  14992240 atgaacgtgagtgagtagacacttcttgtcttgggaatgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatataa 14992141  T
Q  623 ccctaattccttatcta 639  Q
     ||||||| || |||||    
T  14992140 acctaatttctaatcta 14992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 26138775 - 26139050
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  26138775 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 26138874  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  | | || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||| | | || ||||| ||    
T  26138875 ttatataaatccactttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaat 26138973  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaa-cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26138974 tcatcatcacaaatatcaattcataaaagcgaacacggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 26139050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 384 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 12993407 - 12993324
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12993407 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttc 12993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 13168489 - 13168595
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||     
T  13168489 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaatt 13168587  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  13168588 ttatgtaa 13168595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 25031191 - 25031060
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||     
T  25031191 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcataatcaaatcaagcctcgaaccttaatt 25031092  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||| |||  |||||| || |||||| |||||    
T  25031091 ttatataaatctaatttctaatctaatttcac 25031060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 25507703 - 25507977
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  || ||| ||||     
T  25507703 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccatacaccctaatt 25507802  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  | | || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||||| | || ||||| ||    
T  25507803 ttatataaatccactttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggttag-tatttgttaat 25507901  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25507902 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacgcgaagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 25507977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 26018072 - 26018346
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  26018072 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 26018171  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  | | || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||| | | || ||||| ||    
T  26018172 ttatataaatccactttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaat 26018270  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  26018271 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaatgattg 26018346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 330
Target Start/End: Original strand, 12442339 - 12442469
Alignment:
Q  200 gcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagag 299  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||  |||||     
T  12442339 gcaaaaatacgaagattcgaagacaaaaatatatctcccccaagtcggaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggtcgtgccacctcccagac 12442438  T
Q  300 tgccttttgctgcttttgcttagattttaag 330  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12442439 tcacttttgctgcttttgcttagattttaag 12442469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 15153401 - 15153527
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15153401 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttagagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 15153500  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15153501 cccccaagtcagaaacttggcacggcc 15153527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 25631151 - 25630978
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  || | || |||| |  ||||||||| || ||||  |||||||||| || |||    
T  25631151 caggaacgaatatttgatggattaagtcttggagcaaaagaaaggggtttggggctgatttggagcaaaaataagacgattcggagacaaaaacatttct 25631052  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgct 310  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||    
T  25631051 ccc-caagtcagaagcttggcacggcccgtgctacgattggaacggccgtgccacctcccagagcaccttttgct 25630978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 639
Target Start/End: Original strand, 29093656 - 29093782
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaag-ctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  29093656 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaattacgtaatcctaatcaaaaccaagcctttaaaccctaa 29093755  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    | |||||||||||||||| || |||||    
T  29093756 ttttatgtaaccctaatttctaatcta 29093782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 457 - 620
Target Start/End: Original strand, 32543289 - 32543457
Alignment:
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgct-ttctc--tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||  |||||   |||||| | ||||||||||||  ||||||    
T  32543289 aataaaagttcacctttattttattgttatttacttttatgttcttcttcttcttcttctctatgtctttaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgt 32543388  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  32543389 cttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaactctaattttatgt 32543457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 712 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 12992871 - 12992806
Alignment:
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattt 777  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12992871 atccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattt 12992806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 18396484 - 18396360
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  18396484 tcttcttctctatctctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgatttaatcctaatcaaaccaagcct 18396385  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    | | || |||| |||||||| ||||    
T  18396384 tgatccctaattttatgtaaaccta 18396360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 25339210 - 25339126
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25339210 tgtctacggtgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaag 25339126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27566191 - 27566091
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27566191 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtct 27566092  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  27566091 c 27566091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 26157445 - 26157719
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  26157445 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 26157544  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  | | || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||| | | || || || ||    
T  26157545 ttatataaatccactttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttattaat 26157643  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26157644 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacacggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaagattg 26157719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 24218459 - 24218584
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  24218459 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgttt 24218557  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  24218558 ccccaaagtcagaagcttggcacggcc 24218584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 546 - 628
Target Start/End: Original strand, 30245346 - 30245427
Alignment:
Q  546 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaa 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  30245346 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcatagtcaaaccaag-ttttaaccctaatcttatgtaaccctaa 30245427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 17522330 - 17522219
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  17522330 tctctttgtctacgatgaacatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaacc 17522233  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  17522232 ctaattttatgtaa 17522219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18184752 - 18184591
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18184752 caggaacgaatatttgatggatcgagtcttggagcaaaagaaagggattttggagctaatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 18184653  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca 296  Q
    |||| |||||||||| | ||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  18184652 tccctcaagtcagaaacctggcaccacccgtgctaggcttggcacggccatgccacactcca 18184591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23517316 - 23517231
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23517316 tgtctacgatgaacatgagtgagtagattcttcttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 23517231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 515 - 648
Target Start/End: Original strand, 26821968 - 26822101
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |  |||| ||||     
T  26821968 tgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttatcttgggattgttgtatgagtctaatgacctaatcctaatcaaatcaagcctcgaaccctaatt 26822067  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    ||||||||  ||| || || |||||| |||||||    
T  26822068 ttatgtaaatctattttctaatctaatttcacca 26822101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 28734112 - 28733980
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  |||||||||     
T  28734112 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaatcaagcctcgaaccttaatt 28734013  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||  ||| || || |||||| ||||||    
T  28734012 ttatgtaaatctactttctaatctaatttcacc 28733980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 513 - 588
Target Start/End: Original strand, 9414496 - 9414570
Alignment:
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccta 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9414496 cttgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccta 9414570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 525 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 17793940 - 17793865
Alignment:
Q  525 gaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17793940 gaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccctatcaaaccaagc 17793865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Original strand, 19993710 - 19993793
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19993710 tgtctactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgaactaatcctaatcaaaccaa 19993793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 20221291 - 20221408
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  20221291 tcttcttctctatgtctactatgaacatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcct 20221388  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  20221389 cgaaccctaatcttatgtaa 20221408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 20464479 - 20464597
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  20464479 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacatct-ttctcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcgt 20464577  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  20464578 taaaccctaattttatgtaa 20464597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 22115275 - 22115392
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22115275 tcttcttctctatgtctactatgaacatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcct 22115372  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  22115373 cgaaccctaatcttatgtaa 22115392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 24545720 - 24545504
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaag----ttcatttactt 475  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    ||| |||||||    
T  24545720 ctataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttctttcttttactt 24545622  T
Q  476 ttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    |  ||||||||  | || | |||  ||||||||      |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24545621 tcttgttattttatgttcttcttcttctcttct-----atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtattgagattgttggataagtctaa 24545527  T
Q  576 tgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    | || ||||||||||||||||||    
T  24545526 taacgtaatcctaatcaaaccaa 24545504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 515 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 13217321 - 13217223
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  13217321 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtttcgggattgttggataagtcgaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcaaaccctaat 13217223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16469961 - 16469837
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| | |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  16469961 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcgatacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 16469863  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
     |||  ||||||||||||||||||||    
T  16469862 cccctaaagtcagaagcttggcacgg 16469837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 423 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 19612800 - 19612623
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctt-tctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||  ||||||||| || ||| |||  |||  ||||||   |||| ||    
T  19612800 ttcttgaaattcaata-gtgacaattgttttctttaataaaagttcttttattttcttgttatttatttatattcttcttcttctcttcta--tgtcaac 19612704  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||    
T  19612703 gatgaacataagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatcctagtcaagccaagctt 19612623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 669 - 789
Target Start/End: Original strand, 20435511 - 20435630
Alignment:
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||| | ||| |||| | |||||||| | || ||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20435511 tatcaaactcttgaagcgaaggaggagggttag-tatttgttaatccatcatcacaaatatcaattcataaagcgaaagtggagttttgatattggaaca 20435609  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  20435610 agtgaaattagacaaggattg 20435630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 706 - 789
Target Start/End: Original strand, 4741288 - 4741371
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  4741288 ttgttaatccatcatcttaaatatcaattcataaaacgaaagcggagttttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 4741371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 29682710 - 29682828
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  29682710 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacctct-ttgtcatgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcat 29682808  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  29682809 cgaaccctaatcttatgtaa 29682828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 584
Target Start/End: Original strand, 20222959 - 20223090
Alignment:
Q  457 aataaaagttcat--ttacttttctgttatttacttttatg--ctttctct-cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    |||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20222959 aataaaagttcatctttattttcttgttatttacttttatgttcttcgtcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgt 20223057  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataat 584  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  20223058 cttgggattgttggattagtcaaatgacgtaat 20223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 457 - 584
Target Start/End: Original strand, 22116943 - 22117074
Alignment:
Q  457 aataaaagttcat--ttacttttctgttatttacttttatg--ctttctct-cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    |||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22116943 aataaaagttcatctttattttcttgttatttacttttatgttcttcgtcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgt 22117041  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataat 584  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  22117042 cttgggattgttggattagtcaaatgacgtaat 22117074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 359 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 10719032 - 10718959
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaat 432  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10719032 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaat 10718959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 17119214 - 17119339
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| | | |||| | ||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  17119214 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatgggttttggaactgattcggtgcaaaaatacaaagatttggagacaaaaatatatc 17119313  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||    
T  17119314 tccctcaagtcagaagtttggcacgg 17119339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19590467 - 19590358
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||    
T  19590467 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggatcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaaaatgtct 19590368  T
Q  236 cccacaagtc 245  Q
    ||| ||||||    
T  19590367 cccccaagtc 19590358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 21237912 - 21237800
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |  ||||||| |||| |  ||||    
T  21237912 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtcttatgacctaattcctatcaaactaagcatagaacc 21237814  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
    ||||| ||||||||    
T  21237813 ttaattttatgtaa 21237800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23523920 - 23523835
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||| ||||||||| | ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23523920 tgtctatgatgaacatgaatgactagactcttcttgttttgggattgttggatgagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagc 23523835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 19067400 - 19067523
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||| ||||||    
T  19067400 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaacatgtct 19067498  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacg 259  Q
     |||  |||||||||||||||||||    
T  19067499 cccctaaagtcagaagcttggcacg 19067523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #193
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 514 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 23639818 - 23639711
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  |||| ||||    
T  23639818 ttgtctacgatgaacatgagtaagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaat 23639720  T
Q  614 cttatgtaa 622  Q
     ||||||||    
T  23639719 tttatgtaa 23639711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #194
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 12475316 - 12475411
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaata 230  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12475316 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctaattcgatgcaaaaatatgaagattccgagacaaaaata 12475411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #195
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Original strand, 29254097 - 29254180
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29254097 tgtcgacgatgaacatgggtgagtagactcttcatgtcttgagattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 29254180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #196
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 12660424 - 12660330
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  12660424 tcttcttctc--tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatctaatccctatcaaaccaagc 12660330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #197
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 19564259 - 19564110
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||| ||| || ||||  ||||||||||||  ||    
T  19564259 caggaatgaatatttgaaggattaagtcttggagcaaaagaaaggggttttagagctgatttggtgcaaatatacgatgattcggagacaaaaatacatc 19564160  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccg 284  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |  ||||| |||||||    
T  19564159 tccctcaagttagaagcttggcacggccggtgcgaagcttggcacggccg 19564110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #198
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 24392878 - 24392782
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24392878 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctttt-tcataggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 24392782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #199
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 32796478 - 32796406
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccta 588  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32796478 tgtctacgatgaacatgaattagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccta 32796406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #200
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 599
Target Start/End: Original strand, 18973761 - 18973856
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  18973761 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttttcttaggattgttggatgagtttaatgacctaatccctatcaaaccaag 18973856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #201
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 706 - 790
Target Start/End: Original strand, 20439255 - 20439339
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20439255 ttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaagcgatagtggagttttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattgt 20439339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #202
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22787731 - 22787667
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22787731 acggccgtgccatcctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttgagctactttatttt 22787667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #203
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 17814278 - 17814369
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  17814278 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 17814369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #204
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19564126 - 19564031
Alignment:
Q  247 gaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||||||||  ||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19564126 gaagcttggcacggccggtgcgaagcttggcacggccgtgccacctcccataacaacttttgctgtttttgcttagattttaagctactctatttt 19564031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #205
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19966904 - 19966841
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19966904 acggccgtgccacctcccagacagccttttgttgcttttgcttagattttaagctactctattt 19966841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #206
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 23352430 - 23352476
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23352430 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 23352476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #207
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11224295 - 11224246
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11224295 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactt 11224246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #208
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Original strand, 18461002 - 18461083
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| ||||||||    
T  18461002 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattg 18461083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #209
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22168957 - 22168876
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattg 217  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  22168957 caggaaagaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattg 22168876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #210
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 706 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 24545405 - 24545328
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24545405 ttgttaattcatcatctcaaatatcaattcataacgcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 24545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #211
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Original strand, 18627141 - 18627252
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttg 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |     |||||| ||||||| | | |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  18627141 gattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagctaattcgggctgaaaatacgaagattaa-atacaaaaatatatgtcccccaagtcagaagcttg 18627239  T
Q  255 gcacggcccgtgc 267  Q
    |||||||||||||    
T  18627240 gcacggcccgtgc 18627252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #212
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 18732200 - 18732239
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18732200 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 18732239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #213
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19270262 - 19270127
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||   |||| ||||||         
T  19270262 caggaaagaatatttgacggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaataggaagattcgaagac-aaaata----- 19270169  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggc 282  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19270168 -----aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggc 19270127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #214
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 532 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 31965468 - 31965402
Alignment:
Q  532 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  31965468 agtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatctctatcaaaccaag 31965402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #215
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14077621 - 14077527
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| |||||||  ||| |||||||| |||||    
T  14077621 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagtcaaaaatacgtctc 14077527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #216
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 249
Target Start/End: Original strand, 16490294 - 16490407
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  || |||| |||| | |||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  16490294 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaatgaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagac-aaaatatgtc 16490392  T
Q  235 tcccacaagtcagaa 249  Q
    |||| ||||||||||    
T  16490393 tcccccaagtcagaa 16490407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #217
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 20102209 - 20102255
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20102209 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 20102255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #218
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 23027742 - 23027788
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23027742 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 23027788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #219
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 34108952 - 34108867
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  34108952 ttgtctacaatgaacatgagtgaatagatctct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 34108867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #220
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 428
Target Start/End: Original strand, 2181939 - 2182016
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg 428  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  2181939 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagtcatcacaaatattcatcttttcttg 2182016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #221
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 523 - 648
Target Start/End: Original strand, 3923758 - 3923883
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||| |  |||| |||| |||| |||    
T  3923758 atgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttagaattgttggatgagtctaatggcctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataa 3923857  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
      ||| || || ||||||||||||||    
T  3923858 atctattttctaatctaaattcacca 3923883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #222
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18195661 - 18195596
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18195661 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 18195596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #223
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19570146 - 19570073
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  19570146 atgtaattgcttagattttaagtcgaatttaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 19570073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #224
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Original strand, 22002382 - 22002430
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22002382 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 22002430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #225
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 35059060 - 35059104
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35059060 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagg 35059104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #226
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 1122835 - 1122925
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  1122835 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 1122925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #227
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19561168 - 19561098
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19561168 cttggcacggccgtgccacctcccagaacaacttttgctacttttgcttatattttaagctactctatttt 19561098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #228
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 753 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5670637 - 5670596
Alignment:
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5670637 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 5670596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #229
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 23574230 - 23574185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23574230 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 23574185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #230
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 716 - 789
Target Start/End: Original strand, 29254298 - 29254371
Alignment:
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  29254298 atcatcacaaatatcaattcataaagcgaacacggaggtttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 29254371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #231
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 503 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 12658023 - 12657928
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||   |||||||||||    
T  12658023 tcttcttctctatgtcttcaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtcctgggattgttggaagagtctaattacctaatcactatcaaaccaag 12657928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #232
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 335
Target Start/End: Original strand, 15153548 - 15153580
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15153548 cttttgctgcttttgcttagattttaagctact 15153580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #233
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 523 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 16207674 - 16207599
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||| || |||||||||| | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  16207674 atgaacatgagcgagtagacttat-ttgtcttgagattgttggttgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 16207599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #234
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25031516 - 25031472
Alignment:
Q  223 caaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25031516 caaaaatatgaatcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 25031472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #235
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25786668 - 25786610
Alignment:
Q  203 aaaatatgaa-gattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25786668 aaaatatgaaagattga-agacaaaaatatgtttccc-caagtcagaagcttggcacggcc 25786610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #236
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 18184523 - 18184460
Alignment:
Q  361 ttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||| ||||| || |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  18184523 ttagattttatgtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatcacaaatattcttctttt 18184460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5672441 - 5672399
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaa 178  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5672441 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaa 5672399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 585 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 5949597 - 5949535
Alignment:
Q  585 cctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| |||||||| || || |||||||||||||    
T  5949597 cctaatcaaatcaagccttaaaccctaatattatataaccctagtttctaatctaaattcacc 5949535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20218792 - 20218731
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgt 265  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  20218792 aaaatatgaagattggga-acaaaattatgtttcccccaagtcagagacttggcacggcccgt 20218731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22112817 - 22112756
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgt 265  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  22112817 aaaatatgaagattggga-acaaaattatgtttcccccaagtcagagacttggcacggcccgt 22112756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22601671 - 22601618
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggca 257  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||||||||||||||    
T  22601671 aaaatatgaagattga-agacaaaaatatgatttccccaagtcagaagcttggca 22601618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 25923697 - 25923651
Alignment:
Q  222 acaaaaatatgtc-tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25923697 acaaaaatatgacatcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 25923651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25339355 - 25339269
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25339355 ctataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25339269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #244
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 384 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25786483 - 25786396
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||||||||  | |||| | |||||||||| ||   |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25786483 ctataaatagagtagctagccataaaaaatattcatattttattcttggaatccaataagtgacaattctctttcttaataaaagttc 25786396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 554; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 554; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 37804 - 38460
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37804 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 37903  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37904 cccccaagttagaagcttggcacggcctgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 38003  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38004 ctatttttagccca---gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 38100  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38101 atatgtgacaattgtcattctaataaaagttcattttactttcttgttatttatttttatgttttgtctcttcttctccttgtctacgatgaacattact 38200  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38201 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 38300  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38301 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgcaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 38400  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38401 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 38460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 300
Target Start/End: Original strand, 10103 - 10267
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  10103 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggatctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 10201  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagt 300  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10202 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagt 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Original strand, 17770 - 17814
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17770 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagg 17814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 546; Significance: 0; HSPs: 189)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 546; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 138 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23973564 - 23972907
Alignment:
Q  138 ggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23973564 ggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatatgtctcc 23973465  T
Q  238 cacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23973464 cccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttacttagattttaagctactct 23973365  T
Q  338 atttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaat 437  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23973364 atttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaat 23973265  T
Q  438 atgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  23973264 atgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtga 23973165  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23973164 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 23973065  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23973064 ctatattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 23972965  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23972964 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23972907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 30729575 - 30730233
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaa-tatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30729575 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagagacttggagccgattggacacaaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtc 30729673  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729674 tcccacaagtcagaagcctagcacggcccatgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 30729773  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30729774 tctatttttggcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttagaatgc 30729873  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30729874 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgataaacattagt 30729973  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30729974 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 30730073  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30730074 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatcttaaatatcaatt 30730173  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  30730174 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 30730233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 497; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7761470 - 7760812
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  7761470 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaa-gggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 7761373  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761372 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 7761273  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7761272 tatatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatac 7761173  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  7761172 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 7761073  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7761072 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 7760973  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7760972 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 7760873  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760872 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 7760812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25006685 - 25006015
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25006685 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 25006586  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25006585 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttatattttaagctact 25006486  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25006485 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 25006386  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25006385 ataagtgacaattgtttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 25006287  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25006286 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 25006187  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  25006186 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 25006087  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25006086 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 25006015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21812616 - 21811957
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  || |||| |||| | |||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||    
T  21812616 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaatgaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagac-aaaatatgtc 21812518  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812517 tcccccaagtcagaaccttcgcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 21812418  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  21812417 tctatttttagcccaaatgtagtagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttctgggaatac 21812318  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  21812317 aatatgtgacaattgtctttctaacaaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 21812218  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812217 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 21812118  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21812117 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 21812018  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812017 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21811957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Original strand, 14482115 - 14482773
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||  || ||||||| |||||||    
T  14482115 aggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatacgaagattcggaagacaaaa-tatgtct 14482213  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14482214 cccccaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttacttagattttaagctact 14482313  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14482314 ctatttttagcccaattgtaatagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccacccatcacaaataatcatcttttcttggaatgca 14482413  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482414 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcaatttactttcttgttatttacttttatgctttctctctccttctccttgtctacgatgaacattagt 14482513  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14482514 gagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttgtgtaaccctaattcctt 14482613  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  14482614 atctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaatt 14482713  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14482714 cataaaacaaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14482773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 30759542 - 30758870
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759542 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 30759443  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30759442 ccccacagtcagaagcttggcacggcctgtgctagccttggcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgctttttgcttagattttaagctac 30759343  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatg 433  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  30759342 tctatttttagcccaaatgtaattgcttagattttaagtcaagtgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttacttggaatt 30759243  T
Q  434 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  30759242 caataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacg 30759144  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30759143 atgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgt 30759044  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30759043 aaccctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattat 30758944  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30758943 tccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 30758870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 30769646 - 30768975
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30769646 aggaatgaatattggatggattgagtcttcgagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 30769547  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  30769546 cccacagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgctttttgcttagattttaaactact 30769447  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  30769446 ctatttttagcccaaatgtaattgcttagattttaagtcaagtgtatgctataaatcgagtagccatccatcacaaatattcatcttttacttggaattc 30769347  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  30769346 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 30769248  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  30769247 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaatctctaagccttaatcttatgta 30769148  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  30769147 accctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 30769048  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30769047 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 30768975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25115680 - 25115010
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115680 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatttgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 25115581  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25115580 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 25115481  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25115480 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 25115381  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25115380 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcatgtcatttatctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 25115282  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25115281 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 25115182  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  25115181 ccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccattattc 25115082  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25115081 caaatatcaattcatcaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25115010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25174772 - 25174102
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174772 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatttgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 25174673  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25174672 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 25174573  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25174572 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 25174473  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25174472 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcatgtcatttatctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 25174374  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25174373 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 25174274  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||      
T  25174273 ccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattttttatccattattc 25174174  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25174173 caaatatcaattcatcaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25174102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25181740 - 25181082
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181740 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 25181641  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181640 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 25181541  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25181540 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagaggagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 25181441  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           | | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25181440 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttatcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 25181342  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            || ||||||||||||||||    
T  25181341 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatc------------aagccttaatcttatgtaa 25181254  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  25181253 ccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatacattattc 25181154  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25181153 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25181082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 389; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 22855902 - 22856552
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22855902 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 22856001  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22856002 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtg--------------------ccaccctccagagttacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 22856081  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22856082 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattca 22856181  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  22856182 ataagtgacaattgtttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 22856280  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22856281 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 22856380  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22856381 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 22856480  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22856481 caaatatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22856552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 26848218 - 26848662
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848218 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcaaaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 26848317  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848318 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 26848417  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  26848418 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaatcctaattccttatcttaattcaccgc 26848517  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26848518 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 26848617  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26848618 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 26848662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 20444708 - 20444051
Alignment:
Q  145 atattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa-g 243  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  20444708 atatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctcccccaaag 20444610  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt- 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20444609 tcagaagcttggcacgacccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttta 20444510  T
Q  343 ------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaa 431  Q
          | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20444509 gtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagccagccatcacaaatattcatcttttcttggaa 20444410  T
Q  432 tgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatt 531  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20444409 tacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctatgatgaacatt 20444310  T
Q  532 agtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20444309 aatgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 20444210  T
Q  630 tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatat 729  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20444209 ttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgtttattcatcatctcaaatat 20444110  T
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20444109 caattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 20444051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 20801868 - 20802517
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801868 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20801967  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||| |||||||                     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801968 cccccaagtcagaagcctggcacg---------------------gccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20802046  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20802047 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatcctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 20802146  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  20802147 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 20802246  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20802247 aacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaacgaagctctaagccttaatcttatgtaac 20802346  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20802347 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 20802446  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20802447 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20802517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 41765919 - 41765484
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41765919 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatatagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaacgcaatatgtgacaattgtctttctaa 41765820  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765819 taaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 41765720  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    
T  41765719 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctagattcaccgctttaacatg 41765620  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41765619 gatcaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagatttga 41765520  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41765519 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 41765484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 20450198 - 20449533
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  20450198 caggaacggatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatct 20450100  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20450099 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacagccgtgccacactccagaactactttt-ctgcttttgcttagattttaagctac 20450001  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    | | ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20450000 tttgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagccagccatcacaaatattcatctt 20449901  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20449900 ttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 20449801  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  20449800 atgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacgaagctctaagccttaatcttatgt 20449701  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20449700 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 20449601  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20449600 ctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 20449533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21734750 - 21734314
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21734750 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaa 21734651  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21734650 taaaagttccttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 21734551  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  21734550 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacat 21734451  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21734450 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 21734351  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21734350 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21734314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15731898 - 15732332
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15731898 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 15731996  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15731997 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 15732096  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15732097 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15732196  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15732197 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 15732296  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15732297 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15732332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 15736117 - 15736551
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15736117 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 15736215  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15736216 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 15736315  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  15736316 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15736415  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15736416 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 15736515  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15736516 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15736551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23684807 - 23685241
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23684807 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 23684905  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23684906 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 23685005  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23685006 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23685105  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23685106 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 23685205  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23685206 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23685241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23850004 - 23849570
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23850004 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 23849906  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23849905 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 23849806  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23849805 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23849706  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23849705 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 23849606  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23849605 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23849570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20832838 - 20832167
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  20832838 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagtaaaagaaagggatttggagctgattcggtatgaaaataggaagatttggagacaaaa-tatgttt 20832740  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832739 ccccaaagtcaaaagcttggcaccgcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20832640  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
     | ||||       | |   || ||    || || ||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  20832639 atgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagttgaatgtaaactataaatagagtagctagcaatcacaaatattcatcttt 20832540  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
T  20832539 tcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaa 20832440  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20832439 tgaacgttagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 20832340  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg--ataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20832339 cctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgatataattgtttatccatcatc 20832240  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20832239 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20832167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20595463 - 20595027
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20595463 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20595364  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  20595363 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 20595264  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20595263 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 20595164  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595163 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 20595064  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20595063 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20595027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 23600513 - 23599858
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  23600513 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 23600414  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23600413 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgttgcttttgcttagattttaagctac 23600314  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  23600313 tctatttatagcccgaatataattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcaaaaatattcatctttacttggaatac 23600214  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||          |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  23600213 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 23600114  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  23600113 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaa 23600014  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  23600013 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcattc 23599914  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23599913 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 23599858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 26842762 - 26843206
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26842762 aatgtaattgtttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagtcatcacaaatattcatcttttcatggaatgcaatatgtgacaattg 26842861  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26842862 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcatctccttgtctacgatgaacattagtaagtagacttctctt 26842961  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  26842962 gtctttgaattgttggataagtataatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaatcttaatcttatgtaatcctaattccttatcttaattcaccgc 26843061  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26843062 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 26843161  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26843162 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 26843206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 34780266 - 34780700
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34780266 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 34780364  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34780365 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 34780464  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  34780465 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 34780564  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34780565 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttga 34780664  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34780665 tatttgaacaagtgaatttagacagagattgcaaag 34780700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20601749 - 20601313
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20601749 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20601650  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  20601649 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgag 20601550  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20601549 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 20601450  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20601449 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 20601350  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20601349 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20601313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20608040 - 20607604
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20608040 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20607941  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  20607940 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgag 20607841  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20607840 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 20607741  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20607740 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 20607641  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20607640 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20607604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20614377 - 20613941
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20614377 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20614278  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  20614277 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgag 20614178  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20614177 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 20614078  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20614077 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 20613978  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20613977 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20613941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23618608 - 23618173
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23618608 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagtcatcactaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttcta 23618510  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  23618509 ataaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 23618410  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23618409 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 23618310  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23618309 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 23618210  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23618209 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23618173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 24935425 - 24935862
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24935425 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 24935524  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  24935525 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtaaacttctcttgtcttgg 24935624  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24935625 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaata 24935724  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24935725 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 24935824  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24935825 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 24935862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 24941117 - 24941554
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24941117 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 24941216  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  24941217 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 24941316  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24941317 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaatcttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaata 24941416  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24941417 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 24941516  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24941517 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 24941554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 18067187 - 18067622
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18067187 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaagaatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttcta 18067285  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18067286 ataaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 18067385  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18067386 attattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 18067485  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18067486 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttg 18067585  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18067586 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 18067622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 18073482 - 18073917
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18073482 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaagaatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttcta 18073580  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18073581 ataaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctctttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 18073680  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18073681 attattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 18073780  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18073781 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttg 18073880  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18073881 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 18073917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20790357 - 20789920
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20790357 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagaatagctagccatcactaatattcatctcttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20790258  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20790257 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 20790158  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20790157 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 20790058  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20790057 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 20789958  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20789957 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20789920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20796138 - 20795701
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20796138 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagaatagctagccatcactaatattcatctcttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 20796039  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20796038 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 20795939  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  20795938 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 20795839  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20795838 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 20795739  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20795738 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20795701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 42789977 - 42789532
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42789977 aatgtaattgcttagattttatgtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 42789878  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42789877 tctttctaataaaagttccttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 42789778  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||     
T  42789777 tgtcttgggattgctggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttgatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccg 42789678  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  42789677 ctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcgtaaaacgaaagt 42789578  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42789577 ggagttttgatattcgaacaagtgaacttagacaaagattgtaaag 42789532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28835041 - 28834605
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28835041 gcttagattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttt-cttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 28834943  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28834942 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 28834843  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  28834842 gattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcgctttaaca 28834743  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28834742 tggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagtttt 28834643  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28834642 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 28834605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 23267401 - 23268084
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  23267401 caggaacgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatatc 23267500  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  23267501 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtactaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgttgtttttgcttagattttaagctac 23267600  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||    
T  23267601 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaatatttatctt 23267700  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||          | ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23267701 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatactttctctcttcttctc 23267800  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctt 610  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23267801 catgtctacgataaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctt 23267900  T
Q  611 aatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtt 710  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23267901 aatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgacaattgtt 23268000  T
Q  711 tatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23268001 tatacatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23268084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18483853 - 18483397
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18483853 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctatagatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 18483754  T
Q  450 tctttctaataaaagttc----------atttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||||          |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18483753 tctttctaataaaagttcttttcttttcatttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagta 18483654  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  18483653 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatc 18483554  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  18483553 taaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatagttgttaattcatcatctcaaatatcaattcat 18483454  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483453 aaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18483397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 359 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 25577786 - 25577353
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25577786 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttctttgaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 25577687  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25577686 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcctgtcttggg 25577587  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  25577586 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaaca 25577487  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25577486 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagtttt 25577387  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25577386 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgt 25577353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 248 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25122537 - 25121991
Alignment:
Q  248 aagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcc 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25122537 aagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcc 25122438  T
Q  348 caaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  25122437 cgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagaggagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtgacaat 25122338  T
Q  448 tgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           | | |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  25122337 tgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttatcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtga 25122239  T
Q  537 gtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||            || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25122238 gtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatc------------aagccttaatcttatgtaaccctaatttctt 25122151  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||    
T  25122150 atctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatacattattccaaatatcaatt 25122051  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25122050 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25121991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 3387962 - 3388418
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3387962 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 3388061  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3388062 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctcgcttcttctccatgtctacgatgaacatcagtgagta 3388161  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||     
T  3388162 gaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaata 3388261  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  3388262 taaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcat 3388361  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3388362 aaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 3388418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 33701430 - 33701886
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  33701430 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 33701529  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||| ||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  33701530 tctttctaataaaaattcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 33701629  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33701630 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcgttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 33701729  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33701730 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcat 33701829  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33701830 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 33701886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25891508 - 25891052
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25891508 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 25891409  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  25891408 cttttctaataaaagttc-tttccttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 25891310  T
Q  539 agacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25891309 agacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 25891210  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25891209 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 25891110  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25891109 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25891052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 22142945 - 22143401
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22142945 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 22143044  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||    
T  22143045 cttttctaataaaagttc-tttccttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgagcatgagtgagt 22143143  T
Q  539 agacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22143144 agacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 22143243  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22143244 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 22143343  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22143344 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22143401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 21729577 - 21730225
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21729577 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcaaattggacacaaaaatataaagattgagagacaaat-tatgtct 21729675  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  21729676 cccataagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctaagctatt 21729775  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||                     |||| |||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||| || ||||| ||    
T  21729776 cta---------------------cttaaattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttactgggaataca 21729854  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttt----------tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||          |||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21729855 ataagtgacaattgcttttctaaataaagttcttttcctttcctttatttttctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 21729954  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  21729955 aacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaac 21730054  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |    
T  21730055 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattcc 21730154  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21730155 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21730225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 29053175 - 29052726
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29053175 aatgtaattgcttagattttaagttgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 29053076  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  29053075 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 29052976  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29052975 gacttctctttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagtcaagctctaagccttaatcatatgtaaccctaatttcttatc 29052876  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29052875 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttt-ataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 29052777  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29052776 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 29052726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 6406226 - 6406658
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6406226 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaa 6406325  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttggg 557  Q
    ||||||||| ||| ||||||     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  6406326 taaaagttctttt-cttttcc----tttactttgatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttggg 6406420  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||| |    
T  6406421 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaaatcttaatcttatgtaatcctaatctctaatctaaattcaccgctttaaca 6406520  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6406521 tggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 6406620  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6406621 gatatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 6406658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24953061 - 24952380
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||   ||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  24953061 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacataaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24952963  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24952962 cccacaagtcagaagcttggcatggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 24952864  T
Q  336 ctattttta-gcccaa-----------atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatctt 422  Q
    |||||||   || |||           || || | |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  24952863 ctattttggcgcacaatctaccgaggaatatacttgcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctt 24952764  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttt----------tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||  ||||||| ||| ||||          |||||  |||||||| |||||||||||||||| | |    
T  24952763 tacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaaataaagttcttttcctttcctttatttttctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccc 24952664  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctt 610  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  24952663 catgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctt 24952564  T
Q  611 aatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtt 710  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24952563 aatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtt 24952464  T
Q  711 tatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
      ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24952463 cgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgaagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24952380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 350 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 31057858 - 31057422
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||  || |||  |||| |||||||||     
T  31057858 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgctgaaat--aataagtgacaattt 31057761  T
Q  450 tctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct 546  Q
    | | | | ||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  31057760 tttctttgaataaaagttcacctttactttcttattatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct 31057661  T
Q  547 ctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31057660 ctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattc 31057561  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacga 744  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31057560 accgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacga 31057461  T
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057460 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 31057422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 9729053 - 9728603
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9729053 aatgtaattgcttaaaatttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagttagccatcacaaatattgatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 9728954  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  9728953 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacatgagtgagta 9728854  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
     ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9728853 aacttctctttgtattgagattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 9728754  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9728753 taaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaagatttaataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 9728654  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9728653 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 9728603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22323760 - 22323304
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  22323760 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaattcaagaagtgacaattg 22323661  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||| | ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  22323660 cttttctagttaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 22323562  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22323561 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 22323462  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22323461 ctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcatccatcatctcaaatatcaattca 22323362  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22323361 taaaacgaaagtggagctttgacattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22323304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20571600 - 20571145
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| || |  ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  20571600 atgtaattgtttagattctaagtcgaatgtaaactatatatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttcgaattcaattagtgacaattgt 20571501  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20571500 ctttctaataaaagttcttttcttttactttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 20571401  T
Q  541 acttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20571400 acttcttcttgtcttgggatggttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatct 20571301  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20571300 aaattcaccgttttaacatgaatgaacgattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 20571201  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20571200 aaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 20571145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 24220312 - 24220763
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||| ||   ||||   |||| |||||||    
T  24220312 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagtcatcacaaatatttatcttttgttctcggaaat-aataagtgacaa 24220410  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  24220411 ttgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagact 24220510  T
Q  544 tct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||    
T  24220511 tcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcatatgtaaccctaatttccaatctaaa 24220610  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24220611 ttcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaa 24220710  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24220711 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtggatttagacaaagattgtaaag 24220763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 354 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5078362 - 5077903
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg-------gaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||| |||||||    
T  5078362 taattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccagccatcacaaatattcatcttttcttgaaatttggaattcaataagtgacaa 5078263  T
Q  447 ttgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    |||||||||||||||||           ||| ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  5078262 ttgtctttctaataaaaaatcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtga 5078163  T
Q  537 gtagacttctcttg-tcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  5078162 gtagacttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttctt 5078063  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5078062 atctaagttcaccgctttaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaatt 5077963  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5077962 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 5077903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 387 - 794
Target Start/End: Original strand, 13909985 - 13910404
Alignment:
Q  387 taaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttattt 486  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  13909985 taaatagagtagctatccataacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgcttttctaataaaagttc-tttccttttcttttattt 13910083  T
Q  487 -----------acttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtcta 574  Q
               |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13910084 tcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtcta 13910183  T
Q  575 a-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatca 673  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13910184 aatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattgaccgctttaacatggatcaaccattatca 13910283  T
Q  674 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtga 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13910284 aactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcataaaacaaaaatggagctttgatattcgaacaagtga 13910383  T
Q  774 atttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||| ||||    
T  13910384 atttagacaaggattgcaaag 13910404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22317153 - 22316697
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  22317153 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaattcaagaagtgacaattg 22317054  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  22317053 cttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 22316955  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22316954 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 22316855  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||    
T  22316854 ctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaaatggagggtttgataatttttcatccatcatctcaaatatcaattca 22316755  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22316754 taaaatgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22316697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 24214689 - 24215140
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| ||   ||||   |||| |||||||    
T  24214689 aatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagctagccatcataaatatttatcttttgttctcggaaat-aataagtgacaa 24214787  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24214788 ttgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccacgtctacgatgaacgttagtgagtagact 24214887  T
Q  544 tct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||    
T  24214888 tcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatcatatgtaaccctaatctccaatctaaa 24214987  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24214988 ttcatcactttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaa 24215087  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24215088 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 24215140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 350 - 783
Target Start/End: Original strand, 25741623 - 25742066
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25741623 aatgtaattgcttagatttgaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 25741722  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||          || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  25741723 tctttctaataaaagttcttttctttttctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 25741822  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  25741823 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 25741922  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||| ||    
T  25741923 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcagaa 25742022  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  25742023 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaa 25742066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 497 - 794
Target Start/End: Original strand, 23771018 - 23771315
Alignment:
Q  497 tttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc 596  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23771018 tttctctctttttctccttgtctacaatgaacgtcaatgagaagacttttcttgtctggggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc 23771117  T
Q  597 aagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagg 696  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23771118 aagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagg 23771217  T
Q  697 gtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23771218 gtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23771315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 403 - 794
Target Start/End: Original strand, 20245543 - 20245949
Alignment:
Q  403 ccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatttacttttc-----------tgttattta 487  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||           |||||||||    
T  20245543 ccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaaatt-attttcttttcctttacgttcttgttattta 20245641  T
Q  488 cttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcc 586  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20245642 cttttatgcttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcc 20245741  T
Q  587 taatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacg 686  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||     
T  20245742 taatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaattcgtaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtggaaaca 20245841  T
Q  687 aaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaga 786  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20245842 aaagtggagggttggataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaattggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaaga 20245941  T
Q  787 ttgtaaag 794  Q
    ||||||||    
T  20245942 ttgtaaag 20245949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 384 - 789
Target Start/End: Original strand, 23435292 - 23435711
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  23435292 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctcttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttcttttcct 23435391  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23435392 ttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataa 23435491  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||    
T  23435492 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatt 23435591  T
Q  670 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23435592 atcaaactatggaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagttttgatattcgaacaa 23435691  T
Q  770 gtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  23435692 gtgaatttggacaaggattg 23435711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 384 - 789
Target Start/End: Original strand, 23446659 - 23447078
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  23446659 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctcttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttcttttcct 23446758  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23446759 ttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataa 23446858  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||    
T  23446859 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatt 23446958  T
Q  670 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23446959 atcaaactatggaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagttttgatattcgaacaa 23447058  T
Q  770 gtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  23447059 gtgaatttggacaaggattg 23447078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 35307792 - 35307348
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  35307792 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 35307693  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct-----gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||  ||||||||||| ||| |||| ||     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  35307692 tcttttgaataaaagttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaccatgagtgagtagactt 35307593  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
    |   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||    
T  35307592 cctgtgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattc 35307493  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacga 744  Q
    |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || ||| | ||||||||||||||    
T  35307492 accgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatttcaaatgttaattcataaaacga 35307393  T
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35307392 aagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 35307348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16104388 - 16103941
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  16104388 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 16104289  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| |||          | ||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16104288 ataaagttcttttcttttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttttctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 16104189  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  16104188 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 16104089  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16104088 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 16103989  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16103988 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16103941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 20616271 - 20616718
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  20616271 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 20616370  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20616371 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 20616470  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20616471 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 20616570  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||    
T  20616571 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaaggaaa 20616670  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20616671 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20616718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 543 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18613236 - 18612985
Alignment:
Q  543 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18613236 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcctatctaaat 18613137  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18613136 tcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 18613037  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18613036 gaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18612985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18611330 - 18610888
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  18611330 gcttagattttaagtcagttgtgtactataaatagagtagctagccatcagtaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 18611231  T
Q  459 taaaagttcatttacttt---tc--tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||   ||  |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  18611230 ataaagttcttttcctttatttcattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 18611131  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  18611130 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagtcctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 18611031  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18611030 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 18610931  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18610930 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18610888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24969493 - 24969045
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  24969493 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 24969394  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  24969393 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 24969294  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24969293 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 24969194  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  24969193 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 24969094  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24969093 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24969045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 25201841 - 25202289
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  25201841 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 25201940  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  25201941 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 25202040  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  25202041 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 25202140  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  25202141 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 25202240  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25202241 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 25202289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 25265996 - 25266444
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  25265996 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 25266095  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  25266096 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 25266195  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  25266196 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 25266295  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  25266296 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 25266395  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25266396 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 25266444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18772499 - 18772052
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||  |||||||    
T  18772499 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaagacaataagtgacaattgcttttctaa 18772400  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18772399 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 18772300  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18772299 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 18772200  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18772199 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 18772100  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18772099 gtggagctttgatatacgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18772052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23343526 - 23343245
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23343526 tgtctacaatgaacgttagtgagtagaattcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaa 23343427  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  23343426 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgctttaacatgaattaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataattattaa 23343327  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23343326 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23343245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20915932 - 20915652
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20915932 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 20915833  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     |||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  20915832 tttatgtaaccctaatttctaatgtaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaaa 20915733  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20915732 ccatcatctcaaatatcaattcataaaaagaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20915652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 484 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23626857 - 23626542
Alignment:
Q  484 tttacttttatgctttct-ctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaa--tgac 579  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  23626857 tttacttttatgctttcttctcttctcccccatgtctacgatgaacaagagagagtagacttctccctgtcttgggaatgttggataagtctaaaatgac 23626758  T
Q  580 ataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctta-tgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23626757 ataatcctaatcaaaccaagctttaagccctaatcttaatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactg 23626658  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23626657 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 23626558  T
Q  779 gacaaagattgtaaag 794  Q
    || || ||||| ||||    
T  23626557 gaaaaggattgaaaag 23626542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 423 - 789
Target Start/End: Original strand, 21382296 - 21382665
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || || | ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||    
T  21382296 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttctttgttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatgtc 21382394  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  21382395 tacgatgaacatgagtgagtagacttctcttatcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagccttaaaccgtaatcttat 21382494  T
Q  619 gtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc 718  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| || ||  ||||| || || ||||    
T  21382495 gtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcaaaagtggaagggttagtaattattaattcatc 21382594  T
Q  719 atctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21382595 atctcaaatatcaattcataaaacgaaagttgagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 21382665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Original strand, 12322436 - 12322725
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12322436 tcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgaatagacttcttttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctt 12322535  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| ||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  12322536 taaccct-aatcttatgtaacc-tagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggatttga 12322633  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12322634 taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 12322725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 21401125 - 21400809
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  21401125 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatatagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgc 21401026  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattta-----------cttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||            ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21401025 ctttctaataaaagttcttttcttttgtcagagctttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacattagtgagta 21400926  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21400925 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 21400826  T
Q  638 taaattcaccactttaa 654  Q
    |||||||||| ||||||    
T  21400825 taaattcaccgctttaa 21400809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 21389622 - 21390057
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   ||| |||| |||||  |||||||||||||||    
T  21389622 gcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcattaaaattcatcttttattctttgaattcaataactgacaattgtctttc 21389721  T
Q  456 t-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    | ||||||||||  ||   || || | ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21389722 ttaataaaagttatttctttatttctttgttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatgcctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgt 21389820  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |  || || ||||||||||  ||    
T  21389821 cttgagattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagccttaaatcctaatcttatgtaaccctagtatctaatataaattcacccttt 21389920  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  21389921 taacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaattggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaataaaagtgga 21390019  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21390020 gttttgatattcgaactagtgaatttagacaaggattg 21390057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 359 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 28622115 - 28621767
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  28622115 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 28622016  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
      ||||||| |||| ||| ||          ||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  28622015 ataaagttcttttattttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 28621916  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  28621915 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 28621816  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
    |   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28621815 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 28621767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 503 - 749
Target Start/End: Original strand, 26780650 - 26780898
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  26780650 tcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttggtattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagt 26780749  T
Q  601 tttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttt 700  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26780750 tctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacattgatcaaccattatcaaattgttgaaacgaaagtggagggttt 26780849  T
Q  701 gataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  26780850 gataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtg 26780898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 20169448 - 20169174
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  20169448 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactattcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatt 20169349  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||| ||| ||| ||| |||||| || ||||| | |||||||| ||     
T  20169348 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattataaaattgtagaagcgaaagcggggggttag-taattgttaatt 20169250  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20169249 catcatctcaaatatcaattcagaaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttaggcaaggattgt 20169174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 20967852 - 20968126
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||     
T  20967852 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatccttatcaagccaagccttaaaccttaata 20967951  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||    
T  20967952 ttatgtaaccctagtttctcttataaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataatcgttaatc 20968051  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| || || ||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  20968052 cattatttcaaatgttaattcataaaacgaaagtggagttttaatattcgatcaagtgagtttagacaaggattg 20968126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22317390 - 22317184
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22317390 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcaatgcaaaaatacaaagattgagagacaaaaatatgtct 22317291  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22317290 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagagtcactttcactgcttttgcttagattttaagctact 22317191  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22317190 ctatttt 22317184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22142709 - 22142915
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  22142709 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 22142808  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22142809 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 22142908  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22142909 ctatttt 22142915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22323997 - 22323791
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||   ||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  22323997 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagagacttggagctgattcagtgcgaaaatacaaagattgagagacaaaaatatatct 22323898  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323897 ccccaaagtcagaagctttgcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 22323798  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22323797 ctatttt 22323791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 573 - 794
Target Start/End: Original strand, 23743358 - 23743579
Alignment:
Q  573 taatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa-tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
T  23743358 taataacataatcctaatcaaaccagacttt-aaccttaatttttatgtaaccctaattccttatctaaattccccgctttaacagggatcaaccattat 23743456  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23743457 caaactggggaaagaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatccataaaacgaaaggggagctttgatattcgaacaagt 23743556  T
Q  772 gaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||| ||||| ||||    
T  23743557 gattttagacaaggattgcaaag 23743579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 359 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 23583134 - 23582732
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  |||||||    
T  23583134 gcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtatttatccatcaaaaatattcatctttacttggaatacaataagagacaattgcttttctaa 23583035  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    | ||||||| |||          |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23583034 ttaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 23582935  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgaca-taatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct-aaattc 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||   |||| |||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  23582934 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacattattcctaatcaaaccaagctctaagcccctatctaatgtaaccctaacttcttatctgaaattc 23582835  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc-atctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
     ||   |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||| |||||||||| |    
T  23582834 cccgtcttaacatgtatcaaccattatcatactgtgaaaacaaatatggagggtttgataactgttaatccatctatc-ctaatatccattcataaaatg 23582736  T
Q  744 aaag 747  Q
    ||||    
T  23582735 aaag 23582732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 33701193 - 33701399
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  33701193 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 33701292  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33701293 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggcagtgccaccctccagagtcacttttgctgtttttgcttagattttaagctact 33701392  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  33701393 ctatttt 33701399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 553 - 789
Target Start/End: Original strand, 21833078 - 21833314
Alignment:
Q  553 ttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttt 652  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| |||   ||    
T  21833078 ttgggattgttggataagtctaatgacatattcctaataaaatcaagccttaaaccccaatcttatgtaaccctagtttctaatctgaatttaccgtctt 21833177  T
Q  653 aatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag 752  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833178 tacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaaatgaacggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggag 21833277  T
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21833278 ttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 21833314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5078604 - 5078397
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||   ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5078604 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagctgatttagtgtgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 5078505  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5078504 cccccaaagtcataagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 5078405  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  5078404 tctatttt 5078397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21401364 - 21401157
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  21401364 caggaacgaatatttgatggattgaatcttggagaaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 21401265  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21401264 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 21401165  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  21401164 tctatttt 21401157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25891745 - 25891539
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25891745 caggaacgaatattggatggattgagtcttgtagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 25891646  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25891645 ccccaaagtcagaagcttggcacgacacgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 25891546  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  25891545 ctatttt 25891539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 26847982 - 26848187
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || | ||||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26847982 caggaaagaatattggatggattgaat-ttggagcaaaagaaaggggcttggacctgattccgtgcgaaaatacaaagattgagagacaaaaatatgtct 26848080  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26848081 ccccaaagtcagaagattggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctaat 26848180  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  26848181 ctatttt 26848187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 384 - 647
Target Start/End: Original strand, 23756723 - 23756999
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  23756723 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttcttttcct 23756822  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23756823 ttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataa 23756922  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23756923 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-tcataaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcacc 23756999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 384 - 647
Target Start/End: Original strand, 23822179 - 23822455
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  23822179 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttcttttcct 23822278  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23822279 ttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataa 23822378  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  23822379 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-tcataaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcacc 23822455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15731653 - 15731858
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15731653 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 15731751  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  15731752 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 15731851  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15731852 ctatttt 15731858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20595708 - 20595503
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20595708 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 20595610  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  20595609 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 20595510  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20595509 ctatttt 20595503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20601994 - 20601789
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20601994 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 20601896  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  20601895 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 20601796  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20601795 ctatttt 20601789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20608285 - 20608080
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20608285 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 20608187  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  20608186 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 20608087  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20608086 ctatttt 20608080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20614622 - 20614417
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20614622 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 20614524  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  20614523 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 20614424  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20614423 ctatttt 20614417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31058096 - 31057889
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  31058096 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 31057997  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057996 cccccaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctagcattggcacggccgtgccaccttctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 31057897  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  31057896 tctatttt 31057889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 15735872 - 15736077
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15735872 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 15735970  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| |    
T  15735971 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgggccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctatt 15736070  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  15736071 ctatttt 15736077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18073238 - 18073442
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  18073238 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18073336  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18073337 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 18073435  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18073436 ctatttt 18073442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25201597 - 25201801
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  25201597 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 25201695  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  25201696 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 25201794  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  25201795 ctatttt 25201801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25265752 - 25265956
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  25265752 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 25265850  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  25265851 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 25265949  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  25265950 ctatttt 25265956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18066943 - 18067147
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  18066943 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18067041  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18067042 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 18067140  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18067141 ctatttt 18067147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 321
Target Start/End: Original strand, 26842532 - 26842717
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26842532 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaagggcttggtgctgattccgtgcgaaaatacaaagattgagagacaaaaatatgtct 26842631  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctta 321  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26842632 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctacagagtcacttttgctgcttttgctta 26842717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20796382 - 20796200
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20796382 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20796284  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20796283 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctt 20796200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18611574 - 18611370
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  18611574 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18611476  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18611475 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 18611377  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18611376 ctatttt 18611370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 515 - 709
Target Start/End: Original strand, 21273761 - 21273954
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21273761 tgtctacaatgaacgttagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctagcgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccctaatc 21273859  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 709  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21273860 ttatataaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcaaaagtggagtgtttgataattgt 21273954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23618852 - 23618648
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||  ||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  23618852 cagggaagaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 23618754  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23618753 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 23618655  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23618654 ctatttt 23618648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23684563 - 23684767
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  23684563 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 23684661  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23684662 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23684760  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23684761 ctatttt 23684767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23850248 - 23850044
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  23850248 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 23850150  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23850149 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23850051  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23850050 ctatttt 23850044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25741386 - 25741592
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  25741386 caggaacgaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtct 25741484  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25741485 cccccaaagtcagaagcttggcacggtccgtggtagcattggcacggccgtgccaccctctagagtccattttgctgcttttgcttagattttaagctac 25741584  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  25741585 tctatttt 25741592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23598527 - 23598731
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  23598527 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 23598625  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23598626 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctcaagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23598724  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23598725 ctatttt 23598731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23748389 - 23748593
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  23748389 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcatattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 23748487  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  23748488 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-taccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 23748586  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23748587 ctatttt 23748593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 24214453 - 24214658
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||    
T  24214453 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtttc 24214551  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24214552 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctatcattggcacggccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 24214651  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24214652 ctatttt 24214658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 24935180 - 24935385
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  24935180 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24935278  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24935279 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 24935378  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24935379 ctatttt 24935385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24969737 - 24969533
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| || |||  |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  24969737 cagggaagaatattggatggagaaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagtagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24969639  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24969638 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 24969540  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24969539 ctatttt 24969533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28622359 - 28622155
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  28622359 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 28622261  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  28622260 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgctaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 28622162  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  28622161 ctatttt 28622155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 34780022 - 34780226
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||  ||||||| || |||||| ||| |||    
T  34780022 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacaaagattgggaaacaaaa-tatatct 34780120  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  34780121 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 34780219  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  34780220 ctatttt 34780226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 20790601 - 20790423
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20790601 cagggaagaatattggatggagagtgtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20790503  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttt 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20790502 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgctttt 20790423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18772743 - 18772539
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  18772743 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 18772645  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  18772644 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccatgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 18772546  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18772545 ctatttt 18772539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 24940872 - 24941077
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  24940872 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24940970  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24940971 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaaaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 24941070  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24941071 ctatttt 24941077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23756437 - 23756645
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  23756437 caggaatgaatatttgatggattgaatcttatagaaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcgggagacaaaaatatgtc 23756536  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23756537 tcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggactgccttttgctgcctttgctttgattttaagcta 23756636  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  23756637 ctctatttt 23756645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23821893 - 23822101
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt-gagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  23821893 caggaatgaatatttgatggattgaatcttatagaaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcgggagacaaaaatatgtc 23821992  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23821993 tcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggactgccttttgctgcctttgctttgattttaagcta 23822092  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  23822093 ctctatttt 23822101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42790214 - 42790008
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||| ||| | |    
T  42790214 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatatgaagatttggagacaaaa-tatcttt 42790116  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42790115 tccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacgactgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgctttgattttaagctac 42790016  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  42790015 tctatttt 42790008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Original strand, 20616027 - 20616209
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  20616027 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaatggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20616125  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  20616126 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccatcctccagag-accttttgctgcttttgctt 20616209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 23583316 - 23583121
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  23583316 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 23583217  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaag 330  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23583216 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaag 23583121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16104632 - 16104428
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| | | |||    
T  16104632 cagggaagaatattggatggattaagtcttggagcaaaacaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tgtatct 16104534  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  16104533 cccacaagtcagaagcctggcacggcctgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 16104435  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  16104434 ctatttt 16104428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 26744789 - 26744995
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  ||| |||| |||| | ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  26744789 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggttttcgagctgattcggtgcgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatc 26744888  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26744889 tccctcaagtcagaaacttggcacagcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgctttttcttagattctaagctac 26744988  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  26744989 tctattt 26744995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 156 - 348
Target Start/End: Original strand, 3387744 - 3387936
Alignment:
Q  156 attgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa-gtcagaagcttg 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||| | |||||||  ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3387744 attgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaaaacgaagatttggagacaaaa-tatgtctcccccaaagtcagaagcttg 3387842  T
Q  255 gcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagccc 348  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3387843 gcacggcccgtgctagaattggcacggccgtgccaccctttagagtcacttttgctgcttttgcttagatattaagctactctatttttagccc 3387936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 681 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 22000294 - 22000192
Alignment:
Q  681 gaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttaga 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22000294 gaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaataagtgaatttaga 22000195  T
Q  781 caa 783  Q
    |||    
T  22000194 caa 22000192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 24220084 - 24220281
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  24220084 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggcgctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgttt 24220182  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |         |||||||||||||||||||||||||    
T  24220183 cccccaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctagaattggcacggccgtgccaccctccagaat---------tgcttttgcttagattttaagctac 24220273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 515 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 20724822 - 20724710
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  20724822 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgtgattgttggataagtctaatgacattatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaatt 20724723  T
Q  615 ttatgtaacccta 627  Q
    |||||||||||||    
T  20724722 ttatgtaacccta 20724710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20916327 - 20916180
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| || | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20916327 gaatatttgatgggttgaatcttggagcaaaagaaaggggtttgaagctgattcga-gaaaaaatacgaagattgggagacaaaaatatgtctcccccaa 20916229  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||    
T  20916228 gtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcatggccgtgccacc 20916180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18484090 - 18483884
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  18484090 caggaacgaatatttgatggattgggtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggagcaaaaatatgaagatttggagacaaaaatacatct 18483991  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||   ||| | |   ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18483990 ccccaaagtcagaagcttggcacggtccgtgctaagggtggcacggccgtgccacatcccacacttgtttttgctgcttttacttagattttaaactact 18483891  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18483890 ctatttt 18483884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28835286 - 28835081
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||  |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  28835286 aggaacgaatatttgattgattgagtctttgagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtatgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctc 28835188  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  28835187 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggattggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 28835088  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  28835087 ctatttt 28835081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 384 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 31758231 - 31757959
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaa-gttcatt---tactt 475  Q
    |||||||||||||||| | | | |||||  |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||   || ||    
T  31758231 ctataaatagagtagttagctagcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaaagttctttctttattt 31758133  T
Q  476 ttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagt 571  Q
    |  ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31758132 tcttgttatttacttt-atgttcttct-tcttcttctcttctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagt 31758035  T
Q  572 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||  ||| || || |||||| ||||||    
T  31758034 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcacc 31757959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 523 - 639
Target Start/End: Original strand, 22948692 - 22948808
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  22948692 atgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaacccaaattttatgtaa 22948791  T
Q  623 ccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||| || |||||    
T  22948792 ccctaatttctaatcta 22948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29053392 - 29053265
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  29053392 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 29053293  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29053292 cccccaaagtcagaagcttggcacggcc 29053265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9729263 - 9729084
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac-a 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  9729263 gaatattggatggattgagtcttggagtaaaagaaagggactttgagctgatttagtacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctccctcaa 9729164  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9729163 agtcagaagcttggcacg---------------------gccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 9729085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 523 - 639
Target Start/End: Original strand, 22942482 - 22942598
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||    
T  22942482 atgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccaaactttaaaccctaattttatgcaa 22942581  T
Q  623 ccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||| || |||||    
T  22942582 ccctaatttctaatcta 22942598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 34223095 - 34222839
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  34223095 tgtctacgatgaacatgagtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 34222996  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||            |||||| |||||   ||| || ||| || ||  |||| ||||||   ||| |||| | |||||||||  |||||||| ||    
T  34222995 ttatataa------------atctaatttcactgtttttataatgaattaataattaacaaact-aagaagcgaacgcggagggtttagtaattgttaat 34222909  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34222908 tcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 34222839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 515 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 17408706 - 17408591
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  17408706 tgtctccgatgaacgttagtgagttgactcttcttgtcttgaatttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacccagctttaaaccctaatt 17408607  T
Q  615 ttatgtaaccctaatt 630  Q
    |||||||||| |||||    
T  17408606 ttatgtaaccttaatt 17408591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 359 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23710309 - 23710198
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23710309 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccctcccaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 23710210  T
Q  459 taaaagttcatt 470  Q
     |||||| ||||    
T  23710209 aaaaagtccatt 23710198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Original strand, 24165366 - 24165449
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24165366 tgtctacgatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 24165449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25577970 - 25577879
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25577970 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 25577879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 515 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 2953509 - 2953376
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  2953509 tgtctacgatgaacatgagtcagtagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaatt 2953410  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| |||||||    
T  2953409 ttatataaatctactttctaatctaatttcacca 2953376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35308039 - 35307834
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||   |||||||||||| |||    
T  35308039 aggaatgaatatttgatggattgagtcttagagcaaaagaaagtggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcgaagacaaaaatatatct 35307940  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||| || |||||| || |||||||||   |||| |||| |||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35307939 ccctcaagtcataaacttggcccgacccgtgctaaggttggcacggtcgtgccaccacccaaacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctact 35307840  T
Q  336 ctattt 341  Q
    ||||||    
T  35307839 ctattt 35307834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 20573947 - 20573792
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  20573947 caggaatgaatattg-atggattgagtcttggagaaaaagaaaggggttttagagctgatttggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 20573849  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  20573848 tccccaaagtcaaaagcttggcacggcccgtgctaagcttggtaaggccgtgccacc 20573792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 608
Target Start/End: Original strand, 15059721 - 15059814
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  15059721 tgtctacaatgaaagttggtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaacc 15059814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Original strand, 20738467 - 20738552
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20738467 tgtctacgatgaacataagtgagtagattcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 20738552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 479 - 622
Target Start/End: Original strand, 23114339 - 23114478
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23114339 tgttatttactttcatg--ttct-tcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgttttgggattgttggatgagtctaatga 23114434  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    | ||||||  |||||||||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  23114435 cctaatccctatcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 23114478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 351 - 519
Target Start/End: Original strand, 26745037 - 26745216
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  26745037 atgtaattacttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 26745136  T
Q  450 tctttctaataaaagttc----------atttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtct 519  Q
    |||||  |||||||||||           ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  26745137 tcttttgaataaaagttcttttctttttctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtct 26745216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 515 - 594
Target Start/End: Original strand, 31414732 - 31414811
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaa 594  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31414732 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaa 31414811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 225 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23710465 - 23710371
Alignment:
Q  225 aaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  23710465 aaaatatatctcccacaagtcagaagcctggcacggcccgggttagccttggcacggccgggccaccctccagag-acctttggctgcttttgctt 23710371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 24166377 - 24166483
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| |||||    
T  24166377 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttaggattgttggatgagtcgaatgacctaatccctatcaaaccaagcctggaaccctaatc 24166475  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  24166476 ttatgtaa 24166483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Original strand, 16677190 - 16677275
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  16677190 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatataatccctatcaaaccaagc 16677275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29053270 - 29053206
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29053270 acggccgtgccaccctccaaagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 29053206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 532 - 647
Target Start/End: Original strand, 12410655 - 12410770
Alignment:
Q  532 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 631  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||  ||| ||     
T  12410655 agtgagtagactcttcttgtcatgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctacttt 12410754  T
Q  632 cttatctaaattcacc 647  Q
    || |||||| ||||||    
T  12410755 ctaatctaatttcacc 12410770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 732 - 794
Target Start/End: Original strand, 20799520 - 20799581
Alignment:
Q  732 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799520 attcataaaacgaaagtggag-tttggtattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 20799581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Original strand, 22170898 - 22171030
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  22170898 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaatttttggatgagtctaatgaattaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 22170997  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||  ||| || || |||||||||||||    
T  22170998 ttatgtaaatctattttctaatctaaattcacc 22171030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 23029552 - 23029435
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||||||| |    
T  23029552 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagt-gacttct-ttgtcttgggattgttggatgactctaatgacctaatccctattaaaccaagcct 23029455  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  23029454 agaaccctaatcttatgtaa 23029435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 6406127 - 6406197
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6406127 cttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 6406197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41766123 - 41765998
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||     
T  41766123 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctcc 41766024  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  41766023 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 41765998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 6406011 - 6406138
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttga-gccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||  ||||| || |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  6406011 caggaacgaatatttgatggattgagtctttgaggaaaagaaaagggttttgaagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 6406110  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  6406111 tccctcaagtcagaaacttggcacggcc 6406138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 706 - 789
Target Start/End: Original strand, 19890046 - 19890129
Alignment:
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  19890046 ttgttaattcatcatctcaaatatcaatttataaagcgaaagtggagtttttatattggaacaagagaaattagacaaagattg 19890129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 739 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28621780 - 28621725
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  28621780 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 28621725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21877479 - 21877427
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21877479 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 21877427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 359 - 514
Target Start/End: Original strand, 23748633 - 23748788
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaat-gcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| || | || | ||||| |||||| |||| |||  ||| || | ||||||    
T  23748633 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaaaatccttttttcctggaatagcaaaatggaacattttt-tttcta 23748731  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct 514  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  23748732 ataaaagttcatttactttactgtgatgtacacttatgcgttctctcttctcctcct 23748788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21734849 - 21734779
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21734849 cttggcacggccatgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 21734779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 534 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 20103884 - 20103799
Alignment:
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    ||||||||||  |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  20103884 tgagtagactcttcttgtattgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaaccctaattttat 20103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 20916092 - 20916019
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20916092 atgtaattgcttagattttaattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 20916019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 20967696 - 20967769
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  20967696 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 20967769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 12322050 - 12322176
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgatt-ggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgt- 233  Q
    ||||| |||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| |  |||| |||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  12322050 aggaacgaatgtttgatagattgagtcttggagcaaaaaaaagaggattaggagctgattcggatgaaaaaatacgaagattga-agacaaaaatatatt 12322148  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12322149 ctccc-caagtcagaagcttggcacggcc 12322176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 424
Target Start/End: Original strand, 15059323 - 15059395
Alignment:
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  15059323 tgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 15059395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 18091896 - 18091821
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtctt-gggattgttggataagtctaatgacataat 584  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18091896 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgccttggggattgttggatgagtctaatgacctaat 18091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 20967630 - 20967670
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20967630 ccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctatttt 20967670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21734965 - 21734838
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagg-gactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgt 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  || || | |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| |    
T  21734965 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggaactgatttggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatct 21734866  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21734865 ccccca-aagtcagaagcttggcacggcc 21734838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23343685 - 23343612
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  23343685 atgtaattgtttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 23343612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 384 - 472
Target Start/End: Original strand, 23598796 - 23598885
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcat-cttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattta 472  Q
    |||||||||||||||    || |||||||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  23598796 ctataaatagagtagcttgccttcacaaatattccttcttttcttgggatacaataggggacaattgtctttctaaaaaaagctcattta 23598885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 267
Target Start/End: Original strand, 12410307 - 12410351
Alignment:
Q  223 caaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12410307 caaaaatatgattcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 12410351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 24143533 - 24143470
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24143533 aaaatacgaagattgaga-acaaaaatatgtcgccctcaagttagagacttggcacggcccgtgc 24143470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 754 - 789
Target Start/End: Original strand, 16677431 - 16677466
Alignment:
Q  754 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16677431 tttgatattggaacaagtgaatttagacaaagattg 16677466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 20799441 - 20799486
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20799441 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggg 20799486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 182)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 16683092 - 16683751
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16683092 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 16683191  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16683192 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 16683291  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16683292 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaataca 16683391  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16683392 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 16683491  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16683492 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 16683591  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||    
T  16683592 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaatt 16683691  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16683692 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16683751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 21420297 - 21420966
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21420297 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 21420396  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21420397 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21420496  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  21420497 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttgtaattca 21420596  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttattt----------acttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||| ||||  |||||  ||||||          |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21420597 ataagtgacaattgcttttctaattaaagtt-attttattttcctttattttcttgtcatcacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 21420695  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  21420696 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 21420795  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  21420796 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 21420895  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21420896 aattatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21420966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 10637335 - 10638004
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  10637335 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaa-tatgtct 10637433  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10637434 ccccacagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgattttgcttagattttaagctact 10637533  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10637534 atatttttggcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 10637633  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10637634 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgat 10637732  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10637733 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 10637832  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       
T  10637833 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattactc 10637932  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10637933 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10638004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Original strand, 15248045 - 15248709
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15248045 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaagaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 15248144  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15248145 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacgaccgttccaccctcgagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 15248244  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||    
T  15248245 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtg 15248344  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacat 530  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            | | |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  15248345 acaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttccctttattttcttatcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacat 15248443  T
Q  531 tagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaa 628  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15248444 gagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaa 15248543  T
Q  629 ttccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaata 728  Q
    || ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||    
T  15248544 tttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaata 15248643  T
Q  729 tcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15248644 tcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15248709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 10558623 - 10559293
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10558623 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 10558722  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10558723 cccccatgccagaagcttggcacgacccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 10558822  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10558823 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 10558922  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  10558923 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttccttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 10559021  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10559022 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctataagccttaatcttatgtaa 10559121  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  10559122 ccctaatttcttatctaaattcactgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 10559221  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10559222 caaatgtcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10559293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 783
Target Start/End: Original strand, 10650727 - 10651384
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10650727 aggaatgaatgttggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggattaaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtctc 10650825  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    ||   ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10650826 cccacagttagaaacttggcacggcccgtgctagccttagcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 10650925  T
Q  337 tatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaa 436  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10650926 tatttttggcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaacgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaa 10651025  T
Q  437 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    || ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  10651026 taagtgacaattgcttttctaatcaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 10651124  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10651125 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 10651224  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |    
T  10651225 cctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattactcc 10651324  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10651325 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 10651384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 18563163 - 18563833
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18563163 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagcagattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 18563262  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18563263 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18563362  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18563363 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 18563462  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| ||          || |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18563463 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttttttttcctttattttctcgtcatttacatttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 18563562  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18563563 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 18563662  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  18563663 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 18563762  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18563763 aaatatcaattcataaaacgaaagtggatctttgatattcgaataagtgaattcagacaaggattgcaaag 18563833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15259986 - 15259316
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15259986 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15259887  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15259886 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcaccgccgtgccaccctccagagtcacttttgctacttttgcttagattttaagctact 15259787  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15259786 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatctttacttggaattca 15259687  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| ||          || |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  15259686 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttattttctcgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 15259587  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15259586 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 15259487  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  15259486 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgcggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 15259387  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15259386 aaatataaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15259316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15266608 - 15265938
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15266608 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15266509  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15266508 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcaccgccgtgccaccctccagagtcacttttgctacttttgcttagattttaagctact 15266409  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  15266408 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatctttacttggaattca 15266309  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| ||          || |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  15266308 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttattttctcgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 15266209  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15266208 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 15266109  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  15266108 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattattcc 15266009  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15266008 aaatatcaattcataaaacgaacgtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15265938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Original strand, 10631089 - 10631758
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  10631089 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctc 10631187  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631188 ccccaaagtcagaagcttggcacagcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 10631287  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    || ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  10631288 ctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttt 10631387  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10631388 tcttgaaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctatga 10631487  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10631488 tgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaac 10631587  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10631588 cctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 10631687  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10631688 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10631758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 26810853 - 26811514
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  26810853 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatacgaagattcggagacaaaa-tatatct 26810951  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |          || |||||||||||||||||||||||    
T  26810952 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccataa---------ctacttttgcttagattttaagctac 26811042  T
Q  335 tctatttt----ta-------gcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    ||| ||||    ||       ||||   | |  | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26811043 tctgttttagtttaccggaatgcccttttatggttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacagatattcatcttt 26811142  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26811143 tcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacg 26811242  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26811243 atgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 26811342  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26811343 ccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 26811442  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26811443 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 26811514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 15254686 - 15255336
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15254686 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaagaatatgaagattgagagacaaaaataggtct 15254785  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15254786 cccacaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 15254864  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15254865 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 15254964  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgtt------------atttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||  |||||| ||| ||||||  ||            |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  15254965 ataagtgacaattgcttttctaattgaagttctttt-cttttccctttattttcttatcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 15255063  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15255064 tgaccatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 15255163  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  15255164 accctaatttcttatctgaattcaccatcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 15255263  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  15255264 ccaaatatcaattcataaaacgtaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcatacaaggattgcaaag 15255336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11505373 - 11504681
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11505373 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 11505274  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc----------------ct-----tggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||                ||     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11505273 cccctaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcagtggcacggcccgtgctagcagtggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttactgctt 11505174  T
Q  315 tt-gcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaat 413  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11505173 tttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaaagaatgctataaatagagtagccatccatcacaaat 11505074  T
Q  414 attcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctct 503  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||| ||| ||          || |||||| |||||| |||||||    
T  11505073 attcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttattttcctttattttcttgtcatttacctttatgttttctct 11504974  T
Q  504 cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct 601  Q
    ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11504973 cttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacatctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagct 11504874  T
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11504873 ctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatcgatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttg 11504774  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11504773 ataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 11504681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18081098 - 18080652
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081098 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 18080999  T
Q  450 tctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  18080998 tctttctaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctc 18080899  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18080898 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatcttatgtaaccctaattcgttatctaaattcacc 18080799  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18080798 gctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaag 18080699  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18080698 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18080652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 10732496 - 10733147
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10732496 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 10732595  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10732596 ccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtg--------------------ccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttaaattttaagccact 10732675  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaa-tattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  10732676 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatggtataaatagagtagccatccatcacaaaatattcatctttacttggaattc 10732775  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  10732776 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 10732874  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10732875 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgta 10732974  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10732975 accctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatt 10733074  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10733075 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10733147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 10946265 - 10946916
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10946265 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 10946364  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||                    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10946365 ccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtg--------------------ccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttaaattttaagccact 10946444  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaa-tattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  10946445 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatggtataaatagagtagccatccatcacaaaatattcatctttacttggaattc 10946544  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  10946545 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 10946643  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10946644 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgta 10946743  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  10946744 accctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatt 10946843  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10946844 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10946916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 3371573 - 3372009
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3371573 gcttatattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 3371672  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3371673 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 3371772  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  3371773 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 3371872  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3371873 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtgaagctttg 3371972  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3371973 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3372009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 5717342 - 5717778
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717342 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 5717441  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  5717442 taaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 5717541  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5717542 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 5717641  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717642 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 5717741  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5717742 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 5717778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 788
Target Start/End: Original strand, 12844630 - 12845292
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaa-gggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||| |||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |    
T  12844630 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcagagacaaaaatatatctccctaa 12844729  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  || ||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12844730 agttagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctccctgaacaacttttgctacttttgcttagattttaagctactctgttt 12844829  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12844830 tagtttcgttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcggatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttgg 12844929  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaa 527  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  12844930 aatacaatatgtgacaattgtctttctaattaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaa 12845029  T
Q  528 cattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc 625  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12845030 tgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccc 12845129  T
Q  626 taattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcga 725  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12845130 taatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaa 12845229  T
Q  726 atatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12845230 atatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 12845292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 36654490 - 36654053
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36654490 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 36654391  T
Q  459 taaaagttcattt-acttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36654390 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 36654291  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  36654290 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccatgctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaaca 36654191  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36654190 tggatcaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 36654091  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  36654090 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 36654053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 3419013 - 3419447
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3419013 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcat--ttacttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaa 3419110  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3419111 taaaagttctttttactttcttgttatttacttttatgctttctctattcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 3419210  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  3419211 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacat 3419310  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  3419311 agatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatcccaaatatcaattcataaaacgaaagtggaattttg 3419410  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3419411 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 3419447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 3391888 - 3392334
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3391888 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaagattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 3391987  T
Q  450 tctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  3391988 tctttctaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctc 3392087  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  3392088 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcacc 3392187  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
     |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3392188 gctttaacatggattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaag 3392287  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3392288 tggaattttgatattcgaacaagtgaatttagccaaagattgtaaag 3392334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 7897666 - 7897229
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7897666 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 7897567  T
Q  450 tctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  7897566 tctttctaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgatttctctcttcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctt 7897467  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7897466 cttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 7897367  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7897366 ccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaa 7897267  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7897266 actggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 7897229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14653637 - 14653183
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14653637 aatgtaattgcttagattttaagtcaaatatatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttgaattcaatatgtgacaattg 14653538  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14653537 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacactagtgagta 14653438  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  14653437 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatcta 14653338  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14653337 aattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataa 14653238  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14653237 aacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14653183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 42709363 - 42708926
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42709363 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 42709264  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709263 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 42709164  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  42709163 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaggcaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 42709064  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42709063 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 42708964  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  42708963 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 42708926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 55798290 - 55798727
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55798290 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtttttctaa 55798389  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55798390 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 55798489  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  55798490 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 55798589  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55798590 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 55798689  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  55798690 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 55798727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14690986 - 14690532
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14690986 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttgaattcaatatgtgacaattg 14690887  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  14690886 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacactagtgagta 14690787  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||    
T  14690786 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttttgtaaccctgatctctaatcta 14690687  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  14690686 aattcaccgctttaacatggactaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataactgttcgtccatcatcttaaatatcaattcataa 14690587  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14690586 aacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 14690532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 56580206 - 56579750
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  56580206 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 56580107  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  56580106 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccgtgtctacgatgaacatgagtgagt 56580008  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  56580007 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 56579908  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  56579907 ctaaattcaccgctttaacatggatcaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 56579808  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  56579807 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 56579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 349 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 15124393 - 15123936
Alignment:
Q  349 aaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaatt 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  15124393 aaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgaaaatt 15124294  T
Q  449 gtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgag 537  Q
    |  |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  15124293 gcttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgag 15124195  T
Q  538 tagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15124194 tagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttctta 15124095  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15124094 tctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtgtaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattc 15123995  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15123994 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15123936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 350 - 789
Target Start/End: Original strand, 6518313 - 6518757
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  |  ||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||    
T  6518313 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaataaagtagctaggcatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgaca 6518410  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6518411 attgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 6518510  T
Q  543 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  6518511 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctcatataaccctaatttcttatctaaat 6518610  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6518611 tcacccctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 6518710  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6518711 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 6518757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16217981 - 16217527
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16217981 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 16217882  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt--------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    |||||||||||||||||| |||        |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16217881 tctttctaataaaagttctttttttcctttactttcttgtcatttaattttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtaga 16217782  T
Q  542 cttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  16217781 cttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatcta 16217682  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16217681 aattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataa 16217582  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16217581 aacgaaagtggagctttgatattttaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16217527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 25146180 - 25146636
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  25146180 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 25146279  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25146280 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttcctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 25146379  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  25146380 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatc 25146479  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |    
T  25146480 taaattcaccgctttaacatgaataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattattaatccatcatctcaaatatcaattctt 25146579  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25146580 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 25146636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 18983943 - 18984404
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  18983943 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatgagtgacaattg 18984042  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt-----gtctacgatgaacattag 533  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |     ||||||||||||||| ||    
T  18984043 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccgtcccgtgtctacgatgaacatgag 18984141  T
Q  534 tgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattc 631  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18984142 tgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaattt 18984241  T
Q  632 cttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatca 731  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18984242 cttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatca 18984341  T
Q  732 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18984342 attcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18984404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Original strand, 18078745 - 18079070
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078745 tttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 18078844  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  18078845 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatctaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccat 18078944  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078945 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 18079044  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18079045 agtgaatttagacaaagattgcaaag 18079070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7379
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  7835 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcattttttcttggaattcaataagtgacaattg 7736  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| ||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  7735 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttatttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 7637  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  7636 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagctctaagccttaatcttatgcaaccctaatttcttat 7537  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7536 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattca 7437  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7436 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 7379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 352 - 794
Target Start/End: Original strand, 18242134 - 18242588
Alignment:
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 451  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||    
T  18242134 tgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttgaaattcaataagtgacaattatc 18242233  T
Q  452 tttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    |||||||||||||||          | ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18242234 tttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttatcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtaga 18242333  T
Q  542 cttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||    
T  18242334 cttctctttgccttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatcta 18242433  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18242434 aattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttttataattgttcgtccatcatctaaaatatcaattcataa 18242533  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18242534 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18242588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 3354977 - 3355645
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttga-gccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  3354977 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggattttgaagctaattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 3355076  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3355077 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgatgcttttgcttagattttaaactac 3355176  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  3355177 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 3355276  T
Q  423 ttct--tggaatgcaatatgtgacaattgtct-ttctaataaaagttcatttacttttctgttatttactt-ttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    || |  |  ||   |||| ||||||||||| | ||  |||||||||||    || ||| | |||| | ||| || | |||  ||||||||      ||||    
T  3355277 ttgttctataaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc----acctttattttatgttcttcttcttcttcttctcttct-----atgtc 3355367  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3355368 tacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 3355467  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3355468 atgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcca 3355567  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3355568 tcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 3355645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 9944882 - 9945331
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  9944882 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattttcattc 9944981  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9944982 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 9945081  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  9945082 ctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattc 9945181  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacga 744  Q
    |||  || || ||| || || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9945182 accgtttcaacatgaattaatcattatcaaaccgtggaaatgaaagtggaggatttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacga 9945281  T
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9945282 aattggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 9945331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 17484561 - 17484119
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  17484561 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcatttcttg-aattcaataagtgacaattgt 17484463  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||    
T  17484462 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtttacgatgaacatgagtgagta 17484364  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  ||  |||    
T  17484363 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctattct 17484264  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  17484263 aaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttgatccatcatcccaaatatcaattcata 17484164  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17484163 aaacgaaaatggagctttgatattcgaacaattgaatttagacaa 17484119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3440 - 2993
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  3440 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 3341  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3340 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 3241  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3240 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 3141  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  3140 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 3041  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  3040 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 10684586 - 10685033
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  10684586 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 10684685  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10684686 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 10684785  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10684786 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 10684885  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10684886 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 10684985  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10684986 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10685033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 10898226 - 10898673
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  10898226 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 10898325  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  10898326 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 10898425  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10898426 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 10898525  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10898526 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 10898625  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  10898626 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 10898673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11496246 - 11495799
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  11496246 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 11496147  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  11496146 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 11496047  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11496046 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 11495947  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11495946 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 11495847  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  11495846 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 11495799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 13823496 - 13823943
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  13823496 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 13823595  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  13823596 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 13823695  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13823696 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 13823795  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  13823796 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 13823895  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13823896 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 13823943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 16952006 - 16952286
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16952006 tgtctacaataaacgttagtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 16952105  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16952106 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 16952205  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16952206 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 16952286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 40845246 - 40844799
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  40845246 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 40845147  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  40845146 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 40845047  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40845046 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 40844947  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  40844946 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 40844847  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  40844846 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 40844799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 16226978 - 16227427
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||     
T  16226978 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagcaagccatcacaaatattcatcttttttttggaattcaataagtgacaattt 16227077  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  16227078 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttatttttatgctttctctcttcttctccatatctacgatgaacatgagtgagta 16227177  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  16227178 gacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaattttatgtaaccctagtttctcttcta 16227277  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||   ||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  16227278 aattcactgttttaacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattatcccaaatattaattcataa 16227377  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16227378 aacgaaagtggagtttttatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 16227427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 361 - 794
Target Start/End: Original strand, 22104893 - 22105331
Alignment:
Q  361 ttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||    
T  22104893 ttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-aat 22104991  T
Q  460 aaaagt---tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttg 555  Q
    |||  |   || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22104992 aaagttctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttg 22105091  T
Q  556 ggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaa 654  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||   ||||    
T  22105092 ggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaa 22105191  T
Q  655 tatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 754  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105192 catggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 22105291  T
Q  755 ttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22105292 ttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22105331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 26293176 - 26293623
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  26293176 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 26293275  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26293276 ataaagttcttttcctttcctttatttttccgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 26293375  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  26293376 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 26293475  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  26293476 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 26293575  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26293576 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 26293623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 351 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 39043643 - 39043190
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  39043643 atgtaattgcttaaattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacatatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 39043544  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||| | |||   ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  39043543 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttacgtttttcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtga 39043444  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||  | ||    
T  39043443 gtagacttctcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttacgtaaccctagtttataat 39043344  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39043343 ctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggattgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattca 39043244  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  39043243 taaaacgaaagtggagtcttgatattcgaacaaatgaatttagacaaggattgt 39043190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 44443931 - 44443600
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44443931 caggaatgaatattagatggattgagtttttgagcaaaagaaagggacttggagctgattgtatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 44443832  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44443831 ccccaaagtcagaagcttggcacggtccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgttgcttttgcttagattttaagctact 44443732  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  44443731 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatatatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 44443632  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  44443631 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc 44443600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 400 - 794
Target Start/End: Original strand, 15301991 - 15302397
Alignment:
Q  400 catccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttac 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||    
T  15301991 catccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttac 15302089  T
Q  489 ttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcc 586  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15302090 ttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcc 15302189  T
Q  587 taatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacg 686  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15302190 taatcaagccaagctctaagccttaatcttatataaccctaatttcttatctgaattcaccgttctaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacg 15302289  T
Q  687 aaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaga 786  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  15302290 aaagtggagagtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacaaaagtggagctttgatattcgaacatgtgaattcagacaagga 15302389  T
Q  787 ttgtaaag 794  Q
    ||| ||||    
T  15302390 ttgcaaag 15302397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 18287096 - 18287377
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287096 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 18287195  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    |||||||||||| ||||  || || |||||||||| |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18287196 tcttatgtaaccataatctctaatttaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatctaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaa 18287295  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18287296 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18287377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Original strand, 7197165 - 7197603
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7197165 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 7197264  T
Q  456 t-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||          | ||||||||  ||||||||   ||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7197265 ttaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttattttactttatgcttttcttcttcttgtccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactc 7197364  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7197365 ttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacttaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattc 7197464  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacga 744  Q
    |||  || || ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7197465 accgtttgaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacga 7197564  T
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7197565 aagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 7197603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 48641619 - 48642066
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt----cttggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||||||    
T  48641619 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatgttttatttcttggaattcaataagtgacaa 48641718  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    |||||||||| ||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  48641719 ttgtctttcttaataaaagtttttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgattttcctcttcttttccatgtctacgatgaacatgagtg 48641818  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  48641819 agtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatatttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcta 48641918  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||||||||||  ||||| ||  || ||||||||||||| |            | ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  48641919 atctaaattcaccgttttaacataaattaaccattatcaaatt------------ggggagggtttgataattgtaaatccatcatctcaaatatcaatt 48642006  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48642007 cataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 48642066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 351 - 790
Target Start/End: Original strand, 15866073 - 15866523
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15866073 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaataaagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 15866172  T
Q  450 tctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||| ||          | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15866173 tcttttgaataaaatttattttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 15866272  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  15866273 gacttattatgtcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaagcttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 15866372  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  15866373 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaattggagggtttgataatcgtttatccattattccaaatgttaattcataa 15866472  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  15866473 aacgaaaatggagctttaatattcgatcaagtgaattttggcaaggattgt 15866523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 532 - 794
Target Start/End: Original strand, 15305363 - 15305627
Alignment:
Q  532 agtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15305363 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 15305462  T
Q  630 tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatat 729  Q
    | ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  15305463 ttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatat 15305562  T
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15305563 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 15305627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 548 - 794
Target Start/End: Original strand, 41400627 - 41400874
Alignment:
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41400627 ttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagctaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcac 41400726  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41400727 cgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaaatggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 41400826  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41400827 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 41400874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 13622404 - 13622682
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13622404 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagccttaa-ccttaatc 13622502  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |      
T  13622503 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaacgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgaaggtttgataattgttaaat 13622602  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13622603 catcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13622682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8092053 - 8091599
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  8092053 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 8091954  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttctgttatttactt----------ttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||| || |||          ||||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  8091953 tgtctttcttaataaaagttctttt-cttttcctttactttcttgttattttatttatgttcttct-tcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtg 8091856  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || |    
T  8091855 agtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagc-ttaaacc-taatcttatataaccctagtttctaa 8091758  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |    ||||||| |||||||||||    
T  8091757 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagaggatggtttgataattgttaagttttcatctcaaatatcaattc 8091658  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8091657 ataaaacgagagtggagtcttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 8091599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 17996072 - 17996522
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  17996072 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttgtctttggaattcaataagtgacaattg 17996171  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17996172 tcttttgaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacataagtgagta 17996271  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||  |||    
T  17996272 gacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaaccttagtttctcttct 17996371  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||| | ||||||||    
T  17996372 aaattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaaatgttaattcata 17996471  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17996472 aaatgaatgtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 17996522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 252 - 471
Target Start/End: Original strand, 18129587 - 18129806
Alignment:
Q  252 ttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaa 351  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18129587 ttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaa 18129686  T
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 451  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18129687 tgtaattgcttagattttaagtcgaaagaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 18129786  T
Q  452 tttctaataaaagttcattt 471  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18129787 tttctaataaaagttcattt 18129806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 505 - 794
Target Start/End: Original strand, 16392774 - 16393064
Alignment:
Q  505 ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagcttt 603  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  16392774 ttcttctccatgtctatgatgaacatgagtgagtagacttcttttctcttgggattgttggataagttttaatgacataatcctaatcaaatcaagttat 16392873  T
Q  604 aaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgat 703  Q
     |||| || |||||||||||||||||  || |||||| ||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16392874 taaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatctaatttcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgat 16392973  T
Q  704 aattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16392974 aattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16393064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 7870802 - 7871232
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  7870802 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaatacgtgacatttg-ctttctaa 7870900  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
      ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  7870901 ataaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtc 7871000  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  7871001 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 7871100  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| |    
T  7871101 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaac-----------gtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgaa 7871189  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  7871190 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 7871232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 515 - 782
Target Start/End: Complemental strand, 11888959 - 11888693
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |  ||    
T  11888959 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagcctttaaccctgttc 11888860  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||    
T  11888859 ttatgtaatcctaatttctaatctaa-ttcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgacaatggagggtttgataattgttaatc 11888761  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11888760 catcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagtcttgatattcgaacaagtgaatttagaca 11888693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 24125207 - 24124933
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  24125207 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaatt 24125108  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  24125107 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgaagaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatc 24125008  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24125007 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 24124933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 582 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 40560506 - 40560293
Alignment:
Q  582 aatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtg 680  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||    
T  40560506 aatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatataaccctaatttttaatctaaattcaccgctttaacatgaagtaaccattatcaaactgtg 40560407  T
Q  681 gaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttaga 780  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40560406 gaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttaga 40560307  T
Q  781 caaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||    
T  40560306 caaagattgtaaag 40560293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 21275366 - 21275640
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  21275366 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtttgttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaatt 21275465  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||| || || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  21275466 ttatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatc 21275565  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21275566 cattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 21275640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 403 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 40563927 - 40563741
Alignment:
Q  403 ccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttct 501  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40563927 ccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttctttttactttcttgttatttacttttatactttct 40563828  T
Q  502 ctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcct 587  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40563827 ctcttcttctccatgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcct 40563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8072 - 7866
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8072 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 7973  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7972 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcatggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 7873  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  7872 ctatttt 7866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18983706 - 18983912
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  18983706 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaaaattcagagacaaaaatatgtct 18983805  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18983806 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18983905  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18983906 ctatttt 18983912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 56580443 - 56580237
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  56580443 caggaacgaatattcgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatatgaagattcagagacaaaaatacgtct 56580344  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56580343 ccccaaagtcagaagcttcgcacggcccgtgctagcattggcatggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 56580244  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  56580243 ctatttt 56580237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 13823251 - 13823456
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  13823251 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 13823349  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || | ||||||| |    
T  13823350 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactctaagctatt 13823449  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13823450 ctatttt 13823456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18081336 - 18081130
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  18081336 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 18081238  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18081237 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 18081138  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  18081137 tctatttt 18081130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 388
Target Start/End: Original strand, 15268266 - 15268503
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15268266 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15268365  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaag-ctac 334  Q
    |||  |||||||||||||||||||                     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  15268366 ccccaaagtcagaagcttggcacg---------------------gccgtgccatcatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagtcgaa 15268444  T
Q  335 t-----ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctata 388  Q
    |     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15268445 tgaatgctatatttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctata 15268503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22104647 - 22104851
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  22104647 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22104745  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22104746 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 22104844  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22104845 ctatttt 22104851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14691217 - 14691017
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||| |||  |||||||||||||||||||| |||    
T  14691217 gaatattggatagattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaatattcggagacaaaaatatgtctcccccaa 14691118  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691117 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacgaccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 14691018  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  14691017 t 14691017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 10684342 - 10684546
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  10684342 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggattttgagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 10684440  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10684441 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 10684539  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10684540 ctatttt 10684546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 10897982 - 10898186
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  10897982 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggattttgagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 10898080  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10898081 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 10898179  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  10898180 ctatttt 10898186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14653875 - 14653668
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||   | | ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  14653875 caggaacgaatattggatgaattgagacttggaacaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacaaagattcggagacaaaaatatgtct 14653776  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14653775 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacgaccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 14653676  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  14653675 tctatttt 14653668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11496491 - 11496286
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | ||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  11496491 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 11496393  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  11496392 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 11496293  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  11496292 ctatttt 11496286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40845490 - 40845286
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  40845490 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 40845392  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  40845391 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-gccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 40845293  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  40845292 ctatttt 40845286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40567523 - 40567324
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  40567523 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattttgtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctcccccaa 40567424  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||| | | |||  |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40567423 agtcagaagcttggcacggcccgtgcaa-cattgacacggccgtgccaccttccagagtcacttttgctgcttttgcttaaattttaagctactctattt 40567325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 7870558 - 7870762
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  7870558 caggaaggaatatttgatggaaagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 7870656  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  7870657 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 7870755  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  7870756 ctatttt 7870762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42709608 - 42709403
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  42709608 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 42709510  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  42709509 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 42709410  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  42709409 ctatttt 42709403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8092297 - 8092098
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  || |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  8092297 gaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggt-ttggagctgattcggagccaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctcccccaa 8092199  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092198 gtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattagcacggccgtgccacctcccaggactgacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 8092099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 635 - 794
Target Start/End: Original strand, 11048541 - 11048700
Alignment:
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  11048541 atctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatt 11048640  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11048641 gataaaacgaaagtgaagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 11048700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 43701549 - 43701275
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || | || ||||    
T  43701549 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgagccctaat 43701450  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     |||| |||  ||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  43701449 tttatataaatctactttctaatctaaattcaccgttttaacatgtattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaat 43701351  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
      |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  43701350 ttatcatctcaaatattaattcataaagcaaaagtggagttttgatattggaacaaatgaatttagacaaggattg 43701275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7897895 - 7897697
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||  |||    
T  7897895 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaattatgtttacccaaag 7897796  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||  |  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7897795 tcagaagcttggcacggcccgtgctatcattgacattgccgtgccaccctccagagtcacttttgctacttttgcttagattttaagctactctatttt 7897697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Original strand, 26292932 - 26293114
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  26292932 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 26293030  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26293031 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtactagccttggcacggccatgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctt 26293114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 426 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 16953976 - 16953772
Alignment:
Q  426 ttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || || | ||||||||||||| |||||||   ||||||| ||| |||||||    
T  16953976 ttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttctttgttatttacttt-atgcttttcttcttcttatccatgtctac 16953878  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  16953877 gatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggatagttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccctaattttatgta 16953778  T
Q  622 acccta 627  Q
    | ||||    
T  16953777 atccta 16953772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 490 - 639
Target Start/End: Original strand, 9857296 - 9857445
Alignment:
Q  490 tttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaa 589  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857296 tttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaa 9857395  T
Q  590 tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  9857396 tcaaaccaaactttaaaccctaattttacgtaaccctaatttctaatcta 9857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 350 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21102374 - 21102124
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg----aatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||      |||  |||| ||||||    
T  21102374 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcttaaat--aataagtgaca 21102277  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||| | | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  21102276 attatttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaatcttagtgagtagac 21102177  T
Q  543 ttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaa 593  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21102176 ttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 21102124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 16951623 - 16951823
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  16951623 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctca 16951722  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16951723 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactactttcgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 16951822  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  16951823 t 16951823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18286712 - 18286919
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18286712 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 18286811  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  18286812 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggtcgtgccaccctccagaactacttttgcagcttttgctttgattttaagctac 18286911  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||| ||||    
T  18286912 tctgtttt 18286919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 20059142 - 20058868
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| | |||| |||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||  |||    
T  20059142 tgtctacaatgaacgtgagtgggtagactcttctagtcttgggattgttgggtaaatctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaacccaaat 20059043  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     |||| |||  ||| || || ||||||||||| |  ||| | ||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  20059042 tttatataaatctactttctaatctaaattcatcgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaat 20058944  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  20058943 tcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaaagtggagttttgatattggaacaaatgaatttagacaaggattg 20058868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 39881 - 39444
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||  | | ||||  || |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39881 gcttagattttaagtcgacataagactataaatagagtagctaactatcattaacattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 39782  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||     
T  39781 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgattttcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactc 39682  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |  |||||| |||| |||| |||  ||| || || |||||| |||    
T  39681 ttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgacgtaatcctaatcaaacgaaaccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttc 39582  T
Q  645 accact-ttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    |||| | |||  ||| || ||| ||||  || ||   ||| | || | |||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39581 accagtcttataatgaattaacaattacgaagct-aagaagcaaacgcggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaagcg 39484  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    || | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  39483 aacgcggagctttgatattggaacaagttaaattagacaa 39444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 15865825 - 15866031
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  15865825 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttagagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 15865924  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||  ||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  15865925 tccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccttgccacctcccaaaaagccttttcctgcttttgcttagattctaagttac 15866024  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  15866025 tctattt 15866031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 25145932 - 25146138
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  25145932 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 25146031  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  25146032 tccctcaagtcagaagcttggcacgggccgtgctagacttggcacggccgtgccacctcccagaactgcttttgctgcttttgcttagattttaagttaa 25146131  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  25146132 tctattt 25146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 9944622 - 9944829
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  |||||||||  || |||   ||||||||||||||||    
T  9944622 caggaacgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacaaaaattcgaagacaaaaatatgtct 9944721  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||| ||||||||||||||  |||| | | | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9944722 cccccaagtcagaagcttggcatgacccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccagaacttctttttactgcttttgcttagattttaagctac 9944821  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  9944822 tctatttt 9944829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15143655 - 15143553
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143655 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 15143556  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  15143555 ccc 15143553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 16226730 - 16226936
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||| | |||||||||| |||||||  ||||| ||||||   |    
T  16226730 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagttgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagaccaaaatacacc 16226829  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226830 tccctcatgtcagaagcttggcacggcccatgctaggcttgaaacggccgtgccacctcccagagccacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 16226929  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  16226930 tctattt 16226936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 366 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 12808320 - 12808074
Alignment:
Q  366 ttttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataa 461  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||  | |||||||||   |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  12808320 ttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctaaccatcacaacaaatcatcttttgttcttggaattcaataagtgagaattgtctttctcaataa 12808221  T
Q  462 aagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    |||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  12808220 aagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtatactcttcttgt 12808121  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12808120 cttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 12808074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Original strand, 31594000 - 31594274
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||  |||    
T  31594000 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagattcttcttgtcttgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaatcaagccttgaaccccaat 31594099  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     |||| |||  | | || || || ||||||||||  ||| | ||| || ||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  31594100 tttatataaatc-attttctaatataaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtaaaagcgaaagtggagggttag-taattgttaat 31594197  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  31594198 tcatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgt 31594274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2707857 - 2707670
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  2707857 gatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttttgagctgattcggtacgaaaatatgaagattcagagacaaaaatatatcttcctaaagtcagaa 2707758  T
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 337  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2707757 gcttggcacggcccgtgctaaaattggcacggccgtgccacctcccagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 2707670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20059549 - 20059343
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |   | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20059549 caggaatgaatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcgtaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 20059450  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20059449 cccccaagtcagaagcttggcacggcccatgctcccactggcacggccgtgccacctcccagaacttccttttgctgcttttacttagattttaagctac 20059350  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  20059349 tctattt 20059343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 48641372 - 48641573
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||| |  ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  48641372 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaagggggttttggagttgattcggagcaaaaatacgaagattcgaagacaaaaatatgtctccccca 48641471  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||  | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48641472 aatcagaagcttggcacgtcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctccgaggacagccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 48641571  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  48641572 tt 48641573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 515 - 639
Target Start/End: Original strand, 10731252 - 10731376
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  10731252 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaatt 10731351  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  10731352 ttatgtaaccctaatttctaatcta 10731376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 515 - 639
Target Start/End: Original strand, 10945021 - 10945145
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  10945021 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaatt 10945120  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  10945121 ttatgtaaccctaatttctaatcta 10945145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 515 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 11902599 - 11902475
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  11902599 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgccttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatt 11902500  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  11902499 ttatgtaaccctaatttctaatcta 11902475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21102603 - 21102405
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa- 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||| |||| | ||| |||| |||     
T  21102603 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagataaaa-tgtgtttcccccaaa 21102505  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21102504 gtcagaagtttggcacggcccgtgctagcattgacacagccgtgccacccttcaggatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 21102405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3727 - 3581
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  3727 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 3629  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc 283  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3628 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggcc 3581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 18292276 - 18292439
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  18292276 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatatc 18292375  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18292376 tccctcaagttagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccaga 18292439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 20617884 - 20618089
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  20617884 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctc 20617982  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  20617983 ctccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggattggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 20618082  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20618083 ctatttt 20618089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 39043874 - 39043741
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  39043874 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 39043775  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39043774 ccctcaagtcagaagcttggcatggcccgtgcta 39043741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 17995836 - 17996030
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  17995836 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccccca 17995935  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||     ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17995936 agtcaga-----ggcacggtccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagcctattgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 17996030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14502468 - 14502334
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  14502468 caggaacgaatactggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 14502369  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14502368 accccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 14502334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11502134 - 11501971
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| | | |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  11502134 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggaactgatttggtactaaaatacgaagattctgagacaaaaatatatc 11502035  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11502034 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccaga 11501971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 650 - 782
Target Start/End: Original strand, 15410080 - 15410212
Alignment:
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  15410080 tttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaatgaaagtgaagggtttgataatctttaatccattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtg 15410179  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagaca 782  Q
    ||| ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  15410180 gagttttgatatttgatcaagtgaattaagaca 15410212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 5717168 - 5717258
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  5717168 aggaaaaaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 5717258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 18129450 - 18129585
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  18129450 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 18129548  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 271  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18129549 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 18129585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 36654702 - 36654602
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36654702 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtct 36654603  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  36654602 c 36654602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Original strand, 55798078 - 55798178
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  55798078 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtct 55798177  T
Q  236 c 236  Q
    |    
T  55798178 c 55798178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 270
Target Start/End: Original strand, 3371341 - 3371475
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  3371341 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggtacaaaaatatgaagatt-cgagacaaaaatacgtct 3371439  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctag 270  Q
    ||| | |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  3371440 ccctcaaagtcagaatgctggcacggcccgtgctag 3371475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 3772165 - 3771892
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |||||||| ||     
T  3772165 tgtctacaatgaacgttagtgagtagtttcttcttgtcttggaattgttggataagtcttatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaacctt-att 3772067  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | |||||||||    || |||| | |||||||| | || ||||| ||    
T  3772066 ttatataaatctattttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaaatatcaaactcataaagcgaacgcggagggttag-tatttgttaat 3771968  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  3771967 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacgcgaagctttgatattggaacaagtgaaattagaaaaggattg 3771892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 12347486 - 12347592
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||     
T  12347486 tgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaatt 12347584  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  12347585 ttatgtaa 12347592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 3391787 - 3391857
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3391787 cttggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 3391857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15964328 - 15964258
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaa 206  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15964328 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaa 15964258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Original strand, 18241929 - 18242054
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||  |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  18241929 caggaacgaatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagttgatttggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatct 18242028  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18242029 cccccaagtcagaagcttggcacggc 18242054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17484788 - 17484664
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||  |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  17484788 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggtttggagttgatttggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 17484689  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||  ||||||||||||||||||||    
T  17484688 cccctaagtcagaagcttggcacgg 17484664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 251 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3571 - 3480
Alignment:
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  3571 cttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatttt 3480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 13883442 - 13883336
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  |||| ||||     
T  13883442 tgtctaagatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctagaaccctaatt 13883344  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  13883343 ttatgtaa 13883336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 23793596 - 23793478
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||| |    
T  23793596 tcttcttctctatatctacgatgaatatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaatccaagcct 23793498  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||||||||||||    
T  23793497 cgaaccctaatcttatgtaa 23793478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 15876485 - 15876587
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  15876485 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 15876584  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  15876585 ccc 15876587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16218082 - 16218012
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16218082 cttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactttatttt 16218012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 3418805 - 3418925
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  3418805 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatataaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 3418904  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  3418905 agtcagaagcttggcacggcc 3418925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 5675581 - 5675688
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  5675581 tgtctacaatgaacatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 5675680  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  5675681 ttatgtaa 5675688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15124609 - 15124486
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||    
T  15124609 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggtcttggagctgatttagtgcgaaaatacaaagattcggagacaaaaatacgtct 15124510  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcac 258  Q
    ||| | |||||||||| |||||||    
T  15124509 cccccaaagtcagaagattggcac 15124486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16218197 - 16218071
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  16218197 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagatgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtct 16218099  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16218098 cccccaaagtcagaagcttggcacggcc 16218071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16221517 - 16221391
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  16221517 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagatgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtct 16221419  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16221418 cccccaaagtcagaagcttggcacggcc 16221391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 6518212 - 6518282
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6518212 cttggcacgaccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 6518282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 13510800 - 13510688
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||  |||||||||||| |  ||||    
T  13510800 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgaatctgatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaacc 13510702  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  13510701 ctaattttatgtaa 13510688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15124484 - 15124423
Alignment:
Q  281 gccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15124484 gccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctattgcttagattttaagctactctatttt 15124423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Original strand, 6518097 - 6518220
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatg-tc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||| |     
T  6518097 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 6518195  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacg 259  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  6518196 tccccaaagtcagaagcttggcacg 6518220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 3391672 - 3391798
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  3391672 caggaatgaatattgaatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctaattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 3391770  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  3391771 cccctaaagtcagaagcttggcacggcc 3391798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 16375017 - 16374890
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  16375017 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggagatgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 16374918  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16374917 tccctcaagtcagaaacttggcacggcc 16374890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 9717747 - 9717651
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||    
T  9717747 tcttcttctctatgtatacgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttggtattgttggatgagtctaatgatctaatccctatcaaaccaagc 9717651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 11922417 - 11922310
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||  |||| | ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  11922417 tgtctacaatgaacatgagtgggtagactcttcttattttgggatagatggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 11922318  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  11922317 ttatgtaa 11922310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Original strand, 38652259 - 38652356
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  38652259 tcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgattagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctgatgacctaatcataatcaaactaagc 38652356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 618
Target Start/End: Original strand, 55267689 - 55267797
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||| ||||| |  ||||    
T  55267689 tctctttgtctacgatgaatatgagtgagtagatttc-cttgttttgggattgttggatgagtctaatgacttaattcctatcaaatcaagcctagaacc 55267787  T
Q  609 ttaatcttat 618  Q
     |||||||||    
T  55267788 ctaatcttat 55267797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 754 - 794
Target Start/End: Original strand, 1272364 - 1272404
Alignment:
Q  754 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1272364 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 1272404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17484643 - 17484603
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484643 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 17484603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 21275114 - 21275154
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275114 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 21275154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24125429 - 24125389
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24125429 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 24125389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 12345929 - 12345823
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||   || ||||||||| |  |||| ||||     
T  12345929 tgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctttt-tcttgggattgttagatgagtctaatgacctaatcgctattaaaccaagcctcgaaccctaatt 12345831  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  12345830 ttatgtaa 12345823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 12808419 - 12808380
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12808419 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 12808380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11889113 - 11889040
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  11889113 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 11889040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 13274050 - 13274095
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13274050 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 13274095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Original strand, 18286948 - 18287013
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  18286948 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 18287013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 21275180 - 21275253
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21275180 atgtaattgcttagattataagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 21275253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 15409913 - 15409953
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409913 ccttttgttgcttttgcttagattttaagctactctatttt 15409953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 598
Target Start/End: Original strand, 18749651 - 18749734
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  18749651 ttgtctacgatgaacatgagtgagtagatctct-ttgtcttggaattgttgaatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaa 18749734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Original strand, 10821719 - 10821809
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  10821719 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 10821809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12808569 - 12808467
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  || |||| |||| |   | ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  12808569 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggtgcaaaagaaaggggtttggagctgatttggaacgaaaatacaaagatttggagacaaaaatatgtct 12808470  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  12808469 ccc 12808467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 513 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 15048232 - 15048147
Alignment:
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||| || | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15048232 cttgtctacaatcatcatgagtgagtatactt-tctagtcttgggattgttggaatagtctaatgactaaatcctattcaaaccaag 15048147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 513 - 599
Target Start/End: Original strand, 15106192 - 15106277
Alignment:
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||| || | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15106192 cttgtctacaatcatcatgagtgagtatactt-tctagtcttgggattgttggaatagtctaatgactaaatcctattcaaaccaag 15106277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 424
Target Start/End: Original strand, 16951855 - 16951917
Alignment:
Q  362 tagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16951855 tagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 16951917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16643150 - 16643105
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16643150 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 16643105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 599
Target Start/End: Original strand, 21276772 - 21276821
Alignment:
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21276772 gtcttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 21276821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 509 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 22809475 - 22809401
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataat 584  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  22809475 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtaga--tctctatgttttgggattgttggatgagtctattgacttaat 22809401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 353 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 40567290 - 40567245
Alignment:
Q  353 gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  40567290 gtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 40567245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Original strand, 3371477 - 3371533
Alignment:
Q  286 gccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  3371477 gccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattctatttt 3371533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 16221402 - 16221358
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttt 316  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16221402 cttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctttt 16221358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 33330970 - 33330866
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||| ||||||  ||| ||  ||||||||||||||  |||| ||||     
T  33330970 tgtctacaatgaacatgagtgagtagact--tcttatcttgggattgttgaatgagtttaatgaactaa-ccccatcaaaccaagcttcgaaccctaatt 33330874  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  33330873 ttatgtaa 33330866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 3418945 - 3418984
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3418945 cttttgctgtttttgcttagattttaagctactctgtttt 3418984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 18242075 - 18242114
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18242075 cttttgctgcttttgcttagattctaagctactctgtttt 18242114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 533 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 5513595 - 5513530
Alignment:
Q  533 gtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  5513595 gtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttatatgagtctaatgagctaatccctatcaaaccaag 5513530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15444644 - 15444606
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15444644 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 15444606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 514 - 600
Target Start/End: Original strand, 24493056 - 24493141
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  24493056 ttgtctatgatgaacatgagtgtgtagatctct-ttgtcttcggattgttagatgagtctaatgacttaattcctatcaaaccaagc 24493141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11889409 - 11889372
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagg 180  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11889409 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagg 11889372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 15409995 - 15410068
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | | ||||||||||||||| ||||    
T  15409995 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcgatcacaaatattcatgtttt 15410068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 550 - 599
Target Start/End: Original strand, 17464989 - 17465038
Alignment:
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  17464989 gtcttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcttattcaaaccaag 17465038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 540; Significance: 0; HSPs: 201)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 540; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11503 - 10844
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11503 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatatgtct 11404  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11403 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctcccgagtcgcttttgctgcttttggttagattttaagctact 11304  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  11303 ctatttttagcccagatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttctgggaataca 11204  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  11203 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagt 11104  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11103 gagtagacttctcttgtcttgcgattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 11004  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11003 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 10904  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10903 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaaaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 27631834 - 27632504
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631834 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggaacaaaagaaaaggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 27631933  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27631934 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaaagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 27632033  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27632034 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 27632133  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  27632134 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 27632233  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27632234 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 27632333  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27632334 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 27632433  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27632434 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 27632504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 27615138 - 27615808
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615138 caggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagttgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 27615237  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27615238 cccacaagttagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctctagagtgccttttactgcttttgcttagattttaagctact 27615337  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27615338 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 27615437  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  27615438 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 27615537  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  27615538 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 27615637  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  27615638 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 27615737  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27615738 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 27615808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 456; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 117881 - 118551
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  117881 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttgaagccgattggatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 117980  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117981 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagtcttggcacggtcgtgccaccctccaaagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 118080  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  118081 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccacccatcacaaatattcatctttacttggaataca 118180  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| | || |||||| ||||    
T  118181 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttatctcttctcccccatgtctatgatg 118280  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  118281 aacatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttacgtaac 118380  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       
T  118381 cctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattca 118480  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  118481 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 118551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 442; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18447117 - 18446447
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18447117 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgagtggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 18447018  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18447017 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18446918  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18446917 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 18446818  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  18446817 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 18446719  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  18446718 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 18446619  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  18446618 ccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 18446519  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18446518 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 18446447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 27768693 - 27768023
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768693 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 27768594  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27768593 cccccatgtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 27768494  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  27768493 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttatttggaattca 27768394  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||| ||    
T  27768393 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacaat 27768295  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27768294 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaccaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 27768195  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  27768194 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 27768095  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  27768094 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcatacaaggattgcaaag 27768023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 111188 - 111879
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  111188 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttgaagccgattggatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 111287  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc---------------------gtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||                     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111288 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 111387  T
Q  315 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaata 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  111388 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccacccatcacaaata 111487  T
Q  415 ttcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc 504  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  111488 ttcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctc 111587  T
Q  505 ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    |||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  111588 ttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctc 111687  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111688 taagccttaatcttacgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 111787  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111788 taattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 111879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19279156 - 19278486
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||  |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  19279156 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttcgagctgattgaatgtgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 19279057  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19279056 cccccaagtcataagcttggcacggcctgtgccatcattggcacggctgtgccaccctccagagtcgtttttgctgcttttgcttagattttaagctact 19278957  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19278956 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattca 19278857  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  19278856 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttccccatgtctacgat 19278758  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  19278757 gaacatgagtgagtagatttctccttctcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaattttatgtaa 19278658  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19278657 ccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 19278558  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19278557 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 19278486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23159255 - 23158591
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||    
T  23159255 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcccctaa 23159157  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23159156 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 23159057  T
Q  342 ttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgt 441  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23159056 ttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagt 23158957  T
Q  442 gacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| ||||||||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  23158956 gacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccctttattttcttgtcatttactttcatgttatctctcttctcccccatgtctacgatgaaca 23158858  T
Q  530 ttagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23158857 tgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagccttaatcttatgtaacccta 23158758  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||    
T  23158757 atttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaat 23158658  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23158657 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaagattgcaaag 23158591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23570512 - 23569848
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||    
T  23570512 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcccctaa 23570414  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23570413 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 23570314  T
Q  342 ttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgt 441  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  23570313 ttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagt 23570214  T
Q  442 gacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| ||||||||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  23570213 gacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccctttattttcttgtcatttactttcatgttatctctcttctcccccatgtctacgatgaaca 23570115  T
Q  530 ttagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23570114 tgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagccttaatcttatgtaacccta 23570015  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||    
T  23570014 atttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaat 23569915  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23569914 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaagattgcaaag 23569848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 25358094 - 25358528
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25358094 gcttagattttaagtcaaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 25358192  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25358193 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 25358292  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  25358293 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 25358392  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25358393 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 25358492  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25358493 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 25358528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20172947 - 20172514
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20172947 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 20172849  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20172848 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 20172749  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20172748 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20172649  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20172648 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaat-tcaattcataaaacgaaagtggagctttga 20172550  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20172549 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 20172514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21468581 - 21468145
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21468581 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgataattgtctttctaa 21468482  T
Q  459 taaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21468481 taaaagttccgtttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 21468382  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||    
T  21468381 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacat 21468282  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21468281 ggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttg 21468182  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21468181 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21468145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 35080549 - 35080986
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35080549 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 35080648  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  35080649 taaaagttcacctttactttcatgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgg 35080748  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  35080749 gattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 35080848  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35080849 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 35080948  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35080949 gatattcgaacaagtgaatttagacagagattgtaaag 35080986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 282 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23163686 - 23163161
Alignment:
Q  282 ccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaa 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |    
T  23163686 ccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgta 23163587  T
Q  382 tgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc--- 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||       
T  23163586 tgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccct 23163488  T
Q  479 ---------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggata 568  Q
             ||| ||||||||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23163487 ttattttcttgtcatttactttcatgttatctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggata 23163388  T
Q  569 agtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacca 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  23163387 agtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaacca 23163288  T
Q  668 ttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaac 767  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23163287 ttatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaac 23163188  T
Q  768 aagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23163187 aagtgaattcagacaaggattgcaaag 23163161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 282 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23574943 - 23574418
Alignment:
Q  282 ccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaa 381  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |    
T  23574943 ccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgta 23574844  T
Q  382 tgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc--- 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||       
T  23574843 tgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccct 23574745  T
Q  479 ---------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggata 568  Q
             ||| ||||||||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23574744 ttattttcttgtcatttactttcatgttatctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggata 23574645  T
Q  569 agtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacca 667  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||    
T  23574644 agtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaacca 23574545  T
Q  668 ttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaac 767  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23574544 ttatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaac 23574445  T
Q  768 aagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23574444 aagtgaattcagacaaggattgcaaag 23574418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 21200831 - 21201287
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  21200831 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 21200930  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
      |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  21200931 cttttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 21201030  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  21201031 gacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttagtcttatgtaaccctaatttcttatc 21201130  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21201131 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcat 21201230  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21201231 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 21201287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 23644522 - 23644978
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23644522 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 23644621  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  23644622 cttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 23644720  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23644721 agacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 23644820  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||    
T  23644821 ctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattca 23644920  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23644921 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 23644978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 25144635 - 25143959
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25144635 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 25144536  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25144535 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 25144436  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  25144435 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 25144336  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25144335 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctc 25144236  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    | |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25144235 catgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaa 25144136  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    | ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  25144135 tattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaa 25144036  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||  | ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25144035 tccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaggtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 25143959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 42767732 - 42767064
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  42767732 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 42767633  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||          || |||||||||||||||||||||||    
T  42767632 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcaaggccgtgccaccctccagaa---------ctacttttgcttagattttaagctac 42767542  T
Q  335 tctattt---tta---gcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    ||| |||   |||   |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  42767541 tctgtttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttt 42767442  T
Q  424 tctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttg 516  Q
    | ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42767441 tgttatctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatg 42767344  T
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42767343 tctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatc 42767244  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42767243 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 42767144  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42767143 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 42767064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 39870732 - 39870276
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  39870732 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttctgggaattcaataagtgacaattg 39870633  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
      |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  39870632 cttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagt 39870534  T
Q  539 agacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39870533 aaacttctccttgtcttgggattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttat 39870434  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39870433 ctaaattcaccgttttaacatgaataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattca 39870334  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39870333 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 39870276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23018754 - 23018300
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  23018754 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataactgacaattgt 23018655  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||| |||||||||||| |||          |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  23018654 ctttgtaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttaattacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgtgtgagta 23018556  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || ||||    
T  23018555 gacttctcttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatct 23018456  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||    
T  23018455 aaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatagtaattcata 23018356  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23018355 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgaaaag 23018300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23014632 - 23014186
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||    
T  23014632 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataactgacaattgtctttgtaa 23014533  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23014532 taaaagttcttttcttttcctttactttcttgttaattacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgtgtgagtagacttctc 23014434  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  23014433 ttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 23014334  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    || ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  23014333 cattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatagtaattcataaaacgaaa 23014234  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23014233 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23014186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 40916957 - 40916507
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg----gaatgcaatatgtgacaattgtcttt 454  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||     |||| ||||| ||||||||| | |||    
T  40916957 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatttatgtgaattcaataagtgacaattcttttt 40916858  T
Q  455 ct-aataaaagttcattt---------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    || ||||| ||||| |||         |||||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40916857 cttaataagagttcttttcttttctttactttcttgttatttacttttatacttttcctcttcttcttcatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 40916758  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
     | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40916757 tttttgtctcgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaatt 40916658  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    || |  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40916657 catcgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacg 40916558  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40916557 aaagtggagctttgatatccgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 40916507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22044293 - 22043846
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22044293 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22044194  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22044193 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22044094  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22044093 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22043994  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22043993 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22043894  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22043893 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22043846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 22288140 - 22288587
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22288140 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22288239  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22288240 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22288339  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22288340 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22288439  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22288440 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22288539  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22288540 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22288587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 22665644 - 22666091
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22665644 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22665743  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22665744 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22665843  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22665844 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22665943  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22665944 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22666043  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22666044 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22666091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 33181615 - 33182064
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  33181615 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 33181714  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||| ||| |||| ||| ||          |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33181715 tctttaaaataaaaattcttttattttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 33181814  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  33181815 gacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagacaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 33181914  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  33181915 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatccattataacaaatattaattcataa 33182014  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  33182015 aacgaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 33182064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 45706150 - 45706605
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| | |||    |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  45706150 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaagctataaatatactag----ccatcacaaataataatcttttcttggaattcaataagtgataattg 45706245  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||          || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45706246 tctttctaataaaagttcttttattttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 45706345  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatc-ctaatcaaaccaagctt---taaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||| ||     |||   ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45706346 gacttctctttgtcttgggattgttggataagactaaatgacataatttcttatctaaattt-cttatctaagccttaatcttatgtaaccctaatttct 45706444  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45706445 tatctaaattcaccgttttaacatggaccaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 45706544  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  45706545 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 45706605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 24877449 - 24877896
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  24877449 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 24877548  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24877549 ataaagttcttttcctttcctttattttcttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 24877648  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  24877649 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 24877748  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  24877749 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 24877848  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24877849 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24877896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 144 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 20346703 - 20346414
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20346703 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatattaagattgagagacaaaaatatatctcccccaag 20346604  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346603 tcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctttttgcttagattttaagctactctatttt 20346504  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaat 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20346503 tagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaacaaatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaat 20346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 16776233 - 16776680
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  16776233 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 16776332  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |  |||||         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16776333 aataaagtcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 16776432  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  16776433 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 16776532  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16776533 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 16776632  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16776633 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16776680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 16769570 - 16770018
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||    
T  16769570 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttcta 16769669  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    |  ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  16769670 aataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 16769769  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  16769770 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattca 16769869  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  16769870 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 16769969  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  16769970 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 16770018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5499759 - 5499479
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5499759 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 5499660  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  5499659 cttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaat 5499560  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5499559 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 5499479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 481 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25370348 - 25370032
Alignment:
Q  481 ttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgaca 580  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370348 ttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgaatatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgaca 25370249  T
Q  581 taatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaa----ccattatcaaac 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||    ||||||||| ||    
T  25370248 taatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaattaaccattatcagac 25370150  T
Q  677 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 776  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25370149 tctggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 25370050  T
Q  777 tagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25370049 tagacaaagattgtaaag 25370032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 27621508 - 27621955
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  27621508 gcttagattttaagacaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 27621607  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27621608 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 27621707  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27621708 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagctttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 27621807  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27621808 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 27621907  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27621908 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 27621955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 27628153 - 27628600
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  27628153 gcttagattttaagacaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttactttgaatacaataagtgacaattgcttttctaa 27628252  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  27628253 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 27628352  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  27628353 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 27628452  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  27628453 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 27628552  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27628553 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 27628600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 384 - 789
Target Start/End: Original strand, 29563160 - 29563579
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt---tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  29563160 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttcattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttcttttcct 29563259  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29563260 ttactttcttgttatttacttttattttttc-ctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 29563358  T
Q  570 gtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccat 668  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| | ||| ||| || ||||||    
T  29563359 gtctaaatgacacaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagtttttaatctaaatttaccattgtaacatgaattaaccat 29563458  T
Q  669 tatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaaca 768  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29563459 tatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagttttgatattcgaaca 29563558  T
Q  769 agtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  29563559 agtgaatttagaaaaggattg 29563579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 11318343 - 11317894
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  11318343 atgtaattgcttagattttaagtagaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 11318244  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  11318243 tcttttgaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 11318144  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    || ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  11318143 gatttcttatgtcttgggattgttggataggtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctattttctcttcta 11318044  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  11318043 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 11317944  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11317943 aacgaaagtggaactttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 11317894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24794918 - 24794473
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||    
T  24794918 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-aa 24794820  T
Q  459 taaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ct 548  Q
    ||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24794819 taaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttct 24794720  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24794719 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcacc 24794620  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
       |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24794619 gtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaag 24794520  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24794519 tggagttttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24794473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 24801627 - 24801182
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||    
T  24801627 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-aa 24801529  T
Q  459 taaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ct 548  Q
    ||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  24801528 taaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttct 24801429  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  24801428 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcacc 24801329  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
       |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  24801328 gtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaag 24801229  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24801228 tggagttttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 24801182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 17583162 - 17583608
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  17583162 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 17583260  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17583261 ataaa-gttcttttcctttcctttattttcttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 17583359  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17583360 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattca 17583459  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  17583460 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 17583559  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17583560 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 17583608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 27859675 - 27859388
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27859675 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 27859576  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27859575 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctcgagagttacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 27859476  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27859475 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttt 27859388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 17590968 - 17591414
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  17590968 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaataaagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 17591066  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct- 546  Q
    ||||| |||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  17591067 ataaa-gttcttttcctttcctttattttcttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctt 17591165  T
Q  547 cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17591166 cttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattca 17591265  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  17591266 ccgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaa 17591365  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17591366 agtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 17591414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 24171932 - 24172381
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  24171932 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacagttg 24172031  T
Q  450 tctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  24172032 tcttttgaataaaagttatttttttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctcacttcttctccatgtctactatgaacatgagtgagta 24172131  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  24172132 gacttcttatgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 24172231  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  | ||| | |||||||||    
T  24172232 aattcaccgttttaacatggattaaatgttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaattcattattccaaatgttaattcataa 24172331  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24172332 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 24172381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 19929491 - 19929783
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929491 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 19929590  T
Q  614 cttatgtaaccctaat------------tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
    ||||||||||||||||            |||| |||||||||||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929591 cttatgtaaccctaatatgtaaccttaatcctaatctaaattcaccattttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 19929690  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929691 ataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 19929783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 523 - 781
Target Start/End: Original strand, 20282167 - 20282425
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  20282167 atgaacgttagtgagtagacttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaa 20282266  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||  || |||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20282267 ccctaatctctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatct 20282366  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 781  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20282367 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac 20282425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Original strand, 32139905 - 32140351
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  32139905 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 32140004  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  | |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  32140005 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttattatttacttttatgcttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtga 32140104  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||| || || ||    
T  32140105 atagacttcttttgtcatgggattgttggagaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaatccgaatcttatgtaaccctagtttctaat 32140204  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  32140205 ctaaattcaccgttttaacatgaattaatcattatcaaactatagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatccatcatctaaaatatcaattca 32140304  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32140305 taaaatgaaagtggatttttgatatttgaacaagtgaatttagacaa 32140351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17637812 - 17637460
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17637812 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggaaccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 17637713  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctag---------------------ccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    ||| || | |||||||||||||||||||||||||                      |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  17637712 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccatagtcacttttgctgctt 17637613  T
Q  315 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaata 414  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17637612 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaata 17637513  T
Q  415 ttcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  17637512 ttcatctttacttggaattcaataagtgacaattgcttttctaattaaagttc 17637460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 423 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20708342 - 20707960
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttct 511  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||          |||||||   ||||||||||   |||||||||    
T  20708342 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttattttcctttactttcttgttattttactttatgcttttcttcttcttct 20708243  T
Q  512 ccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20708242 ccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaacccta 20708143  T
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20708142 atcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcacttttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtta 20708043  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20708042 attcatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 20707960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 362 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 24825115 - 24824681
Alignment:
Q  362 tagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct- 456  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| | ||||||||| | | |     
T  24825115 tagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagggacaattgtttctttg 24825018  T
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtctt 554  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24825017 aataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctcaatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtctt 24824918  T
Q  555 gggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttt 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||   |||    
T  24824917 gggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcactgtttt 24824818  T
Q  653 aatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag 752  Q
    || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | ||| | ||||| ||||| ||||||||||    
T  24824817 aacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccattattccaaatgttaattcgtaaaatgaaagtggag 24824718  T
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24824717 ctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 24824681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25803785 - 25803494
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25803785 tcttcttctctatgtctacgataaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctt 25803686  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    | ||||  |||||||||||| |||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25803685 ttaaccccaatcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttga 25803586  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25803585 taattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtggagtcttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25803494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 479 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18994474 - 18994169
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aat 576  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18994474 tgttatttacttttatacttt-tctccttcttctccatgtcgacgatgaacacgggtgagtagagttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaat 18994376  T
Q  577 gacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaac 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |  ||||| ||| || ||| ||||||||||    
T  18994375 gacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaacactaatctctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaactattatcaaac 18994276  T
Q  677 tgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 776  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18994275 tgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatt 18994176  T
Q  777 tagacaa 783  Q
    |||||||    
T  18994175 tagacaa 18994169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 20635600 - 20636049
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||    
T  20635600 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttgacttggaattcaataagtgacaattgt 20635699  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  20635700 cttttgaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacataagtgagtag 20635799  T
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||  ||||    
T  20635800 acttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaaccttagtttctcttcta 20635899  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  20635900 aattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaaatgttaattcataa 20635999  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    || ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20636000 aatgaatgtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 20636049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 24820733 - 24820296
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||   |||| | ||||||||| | |     
T  24820733 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttctttgaaat-aataagggacaattgtttctt 24820635  T
Q  456 t-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtc 552  Q
    | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24820634 tgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacgtttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtc 24820535  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccact 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |    
T  24820534 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctcaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgtt 24820435  T
Q  651 ttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg 750  Q
    || | |||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  24820434 ttcacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaaatggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtgg 24820335  T
Q  751 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24820334 agctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 24820296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 457 - 789
Target Start/End: Original strand, 24507354 - 24507690
Alignment:
Q  457 aataaaagttcat--ttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    |||||||||||||  ||| |||  |||||||| |||||||| | | | |||||||||| |   ||||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||    
T  24507354 aataaaagttcatctttattttattgttatttccttttatgttctttttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttaatgagtagactcttcttgt 24507453  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||  ||    
T  24507454 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatccaaattcaccgttt 24507552  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  24507553 taacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagagtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagagtgga 24507652  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24507653 gttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 24507690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 576 - 789
Target Start/End: Original strand, 23633909 - 23634122
Alignment:
Q  576 tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaa 675  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23633909 tgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctaaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacttcttttatatggatcaaccattatcaaa 23634008  T
Q  676 ctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaat 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23634009 ctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaat 23634108  T
Q  776 ttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| |||||    
T  23634109 ttagacaaggattg 23634122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 503 - 783
Target Start/End: Original strand, 36684397 - 36684678
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36684397 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-tt 36684495  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc-accactttaatatg-gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttt 700  Q
    | |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||| |||  ||||| |||  || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36684496 ttaaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaaccgttttaacatgaaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttt 36684595  T
Q  701 gataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36684596 gataattgttaattcatcatctcaaatatcaatttataaaacgagaatggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 36684678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23798403 - 23798112
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct 601  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23798403 tcttcttctctatgtctatgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtctggagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct 23798304  T
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23798303 ttaaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcacagttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttg 23798205  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  23798204 ataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgagggtggagtcttgatattcgaacaagtaaatttagacaaggattgcaaag 23798112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Original strand, 23340664 - 23340952
Alignment:
Q  503 tcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23340664 tcttcttctcctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 23340763  T
Q  600 ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtt 699  Q
    | ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||    
T  23340764 ccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaattgtataatcgaaagtggagggtt 23340863  T
Q  700 tgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23340864 ag-taattattaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 23340952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 610 - 794
Target Start/End: Original strand, 25198600 - 25198784
Alignment:
Q  610 taatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 709  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25198600 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt 25198699  T
Q  710 ttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25198700 ttatccattatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25198784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 490 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 28496699 - 28496443
Alignment:
Q  490 tttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatt----agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatc 585  Q
    ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496699 tttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatc 28496600  T
Q  586 ctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaac 685  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |    
T  28496599 ctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagc 28496500  T
Q  686 gaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28496499 gaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 28496443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 517 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 32441338 - 32441063
Alignment:
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    ||||| |||||| ||| |||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  32441338 tctacaatgaacgttactgagtaaattcttcttgtcttaggattgtcggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaacc--taatctt 32441241  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcca 716  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||    ||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  32441240 atgtaaccctagtttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattct 32441141  T
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32441140 tcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 32441063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 503 - 747
Target Start/End: Original strand, 27745166 - 27745409
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27745166 tctttttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtttttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttt 27745265  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| | | || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27745266 taaccct-aatcttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaacaagaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttga 27745364  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  27745365 taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacaaaag 27745409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 136 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 20312422 - 20312259
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20312422 caggaaagaatattggatggattgagttttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20312323  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagag 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20312322 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagctttggcacggccgtgccaccctccagag 20312259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 16134174 - 16133900
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||      
T  16134174 tgtctacaatgaacgttagtgagtatacttcttttgtcttgtgattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaact 16134075  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  16134074 ttatgtaactctagtttctcttctaaattcaccattttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatc 16133975  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16133974 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagcggagttttgatattcgatcaagtgagtttagacaaggattg 16133900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23139975 - 23139712
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  23139975 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaacc------ 23139882  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
              |||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23139881 ----------ctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 23139792  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23139791 catcatcttaaatatcaattcataaaacaaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23139712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23296123 - 23295917
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  23296123 caggaatgaatattagatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 23296024  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296023 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctcaagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 23295924  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23295923 ctatttt 23295917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23551765 - 23551502
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||          
T  23551765 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaacc------ 23551672  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
              |||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23551671 ----------ctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 23551582  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23551581 catcatcttaaatatcaattcataaaacaaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 23551502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24607099 - 24606893
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||   | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24607099 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagccaaagaaagggacttggagctgatttagtacaaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 24607000  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24606999 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 24606900  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24606899 ctatttt 24606893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 25481489 - 25481765
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||     
T  25481489 tgtctacaatgaacaatagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaata 25481588  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  25481589 ttatgtaaccctagtttttcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatctttaatc 25481688  T
Q  715 catcatctcgaa---tatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  25481689 cattatcccaaatattattaattcataaaacgaaagtggagttttgatatt-gatcaagtgaatttagacaaggattg 25481765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 25489095 - 25489371
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||     
T  25489095 tgtctacaatgaacaatagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaata 25489194  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  25489195 ttatgtaaccctagtttttcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatctttaatc 25489294  T
Q  715 catcatctcgaa---tatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  25489295 cattatcccaaatattattaattcataaaacgaaagtggagttttgatatt-gatcaagtgaatttagacaaggattg 25489371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 21200594 - 21200800
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21200594 caggaacgaatattggatggattgaatcttggaacaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 21200693  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21200694 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21200793  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21200794 ctatttt 21200800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 11391222 - 11391496
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||     
T  11391222 tgtctacaatgaacgttagcgagcagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaatt 11391321  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||     || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  11391322 ttatgtaaccctt----ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaataattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 11391416  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  11391417 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatatagacaaggattgcaaag 11391496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 11407883 - 11408157
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||     
T  11407883 tgtctacaatgaacgttagcgagcagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaatt 11407982  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||     || |||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  11407983 ttatgtaaccctt----ctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaataattatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 11408077  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  11408078 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatatagacaaggattgcaaag 11408157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25198120 - 25198326
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25198120 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 25198219  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25198220 ccccaaagtcagaagctttgcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgtttagattttaagctact 25198319  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  25198320 ctatttt 25198326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 353
Target Start/End: Original strand, 22871830 - 22872047
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  22871830 caggaatgaatattggatggattgattcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 22871929  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |  ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22871930 ctcccaagtcagaagcttggcacggcccgtgccatcattggcatagccttgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 22872029  T
Q  336 ctatttttagcccaaatg 353  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  22872030 ctatttttagcccgaatg 22872047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 136 - 348
Target Start/End: Original strand, 23644283 - 23644496
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||    
T  23644283 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggaactgattgaatgcaaaaatacgaagattcggagaaaaaaatacgtct 23644382  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23644383 cccccaaagtcagaagtttggcacagcccgtgccagcattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 23644482  T
Q  335 tctatttttagccc 348  Q
    ||||||||||||||    
T  23644483 tctatttttagccc 23644496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 607 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17637450 - 17637263
Alignment:
Q  607 ccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 706  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17637450 cctttatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcgtaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataat 17637351  T
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  17637350 tgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 17637263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 25357849 - 25358054
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25357849 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagacaaaa-tatgtct 25357947  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  25357948 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 25358047  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  25358048 ctatttt 25358054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 41368826 - 41368987
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41368826 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagac-aaaatacgtct 41368924  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41368925 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga 41368987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 350 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 23295886 - 23295706
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23295886 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatggagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 23295787  T
Q  450 tctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaac 528  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  23295786 tctttctaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaac 23295706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 16775989 - 16776193
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  16775989 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 16776087  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  16776088 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 16776186  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  16776187 ctatttt 16776193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 350 - 585
Target Start/End: Original strand, 25198357 - 25198604
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25198357 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctatcaatagtgtagctatccatcacatatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 25198456  T
Q  450 tctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||    
T  25198457 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgggta 25198556  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatc 585  Q
    || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25198557 gatttctctttctcttgggattgttggataagtctaaatgacataatc 25198604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 607 - 794
Target Start/End: Original strand, 23634128 - 23634315
Alignment:
Q  607 ccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 706  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||  |||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23634128 ccttaatcttatgtaacactaatctctaatctaaattcactgctttaacatgaattaactattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataat 23634227  T
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23634228 tgttaatccatcatctcaaataccaattcataaaagaaaagcggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 23634315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 16769326 - 16769530
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  16769326 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 16769424  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  16769425 cccacaagtcagaagcttggcacggcacgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 16769523  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  16769524 ctatttt 16769530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 17582918 - 17583122
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  17582918 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattgggcacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 17583016  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  17583017 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 17583115  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  17583116 ctatttt 17583122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22665400 - 22665604
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  22665400 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22665498  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22665499 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 22665597  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22665598 ctatttt 22665604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 359 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 25043257 - 25043007
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25043257 gcttagattctaagtcgaatgtaaactacaaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttattcttggaatttaataagtgacaattgtctttc 25043158  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25043157 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagact 25043059  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25043058 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 25043007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25370763 - 25370555
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25370763 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtc 25370664  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25370663 tcccccaagtcagaagcttggcatggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttacttagattttaagcta 25370564  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  25370563 ctctatttt 25370555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22044537 - 22044333
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  22044537 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22044439  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22044438 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 22044340  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22044339 ctatttt 22044333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 27627914 - 27628113
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  27627914 aagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 27628012  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  27628013 aagtcagaagcatggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatt 27628111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 663 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25038765 - 25038634
Alignment:
Q  663 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25038765 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaaccaaagtggatctttgatatt 25038666  T
Q  763 cgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25038665 cgaacaagtgaatttagacaagggttgtaaag 25038634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22287896 - 22288100
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  22287896 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 22287994  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  22287995 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 22288093  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22288094 ctatttt 22288100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 24171684 - 24171890
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  24171684 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaataaaggggttttagagctgattgggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 24171783  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24171784 tcccccaagtcacaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 24171883  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  24171884 tctattt 24171890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24795162 - 24794958
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  24795162 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24795064  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24795063 cccacaaatcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 24794965  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24794964 ctatttt 24794958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 24877205 - 24877409
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  24877205 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 24877303  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  24877304 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 24877402  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  24877403 ctatttt 24877409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 27621264 - 27621468
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  27621264 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 27621362  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  27621363 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 27621461  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  27621462 ctatttt 27621468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5500143 - 5499943
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||| |||| | | |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  5500143 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggagctgattcggtacaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 5500044  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5500043 tccctcaagtcagaaacttggcatggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgttgcttttgcttagattttaagctac 5499944  T
Q  335 t 335  Q
    |    
T  5499943 t 5499943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 350 - 536
Target Start/End: Complemental strand, 24606862 - 24606666
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24606862 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 24606763  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
      |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  24606762 cttttctaataaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtga 24606666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 144 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25043494 - 25043296
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | ||    
T  25043494 aatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctcccccgag 25043395  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||| |||||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25043394 tcagaagcttggcacagcacgtgctaacattggcacggccgtgccacttcccagaacaccttttgctgcttttgcttagcttttaagctactctatttt 25043296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 539309 - 539577
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  || |||| ||||    
T  539309 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtttaaatgacataaccctaatcaaaccaagtcttgaaccctaat 539408  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
     |||| |||  ||| || || ||||||||||||   ||| | ||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||| | | |||||||| ||    
T  539409 tttatataaatctactttctaatctaaattcactgttttcacatgaattaacaattaccaaactgtagaagcgaaagtggagggctag-taattgttaat 539507  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  539508 tcatcatctcaaacatcaattcataaagcgaaagtggagttttgatatttgaccaagtgaatttagacaa 539577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 32139658 - 32139860
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgca--aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  |||  ||||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  32139658 gaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcagaaaaatacaaagattcggagacaaaaatatgtctccccc 32139757  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctat 339  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  ||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32139758 aagtcagaagctcggcacggcccatgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggactgctttttgctgcttttccttagattttaagctactctat 32139857  T
Q  340 ttt 342  Q
    |||    
T  32139858 ttt 32139860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 359 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 24177814 - 24177561
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||  | | |||| ||   ||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24177814 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcataacatttcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 24177715  T
Q  456 t-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    | ||||||||||| ||   || || | ||| ||||||||| |||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  24177714 ttaataaaagttctttctttatttctttgtaatttacttt-atgcttttcttcttcctctccatgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttgt 24177616  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaa 606  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24177615 cttgggattgatggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaggtttaaa 24177561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 423 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 29577419 - 29577212
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct---t 515  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||   || || | ||||||||||||| |||||||   ||||||||| ||   |    
T  29577419 ttcttggaattcaatcagtgacaattgtctttcttaataaaagttatttctttatttctttgttatttacttt-atgcttttcttcttcttcttctcaat 29577321  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatct 615  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  29577320 gtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaatccctaattt 29577221  T
Q  616 tatgtaacc 624  Q
    |||||||||    
T  29577220 tatgtaacc 29577212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 351 - 575
Target Start/End: Original strand, 23648610 - 23648851
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||| |  |  |||| ||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  23648610 atgtaattgattatattttaagtcgaatttaacctattaatagagtagataaccatcacaaataatcatcttttctttggaattcaataagtgacaatta 23648709  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt---------------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    |||||||||||||||||| |||               |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  23648710 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagt 23648809  T
Q  535 gagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648810 gagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaa 23648851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23014883 - 23014682
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  23014883 gaatatttgatggatttagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattctgagacaaaaatacatctccctca 23014784  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23014783 agtcagaagcttatcacggcccgtgctaagcttggcacggccgtgccacctcccaggacagacttttgctgcttttgcttagatttcaagctactctatt 23014684  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  23014683 tt 23014682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23018997 - 23018796
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  23018997 gaatatttgatggatttagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattctgagacaaaaatacatctccctca 23018898  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23018897 agtcagaagcttatcacggcccgtgctaagcttggcacggccgtgccacctcccaggacagacttttgctgcttttgcttagatttcaagctactctatt 23018798  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  23018797 tt 23018796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 469 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 30949277 - 30949148
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||    
T  30949277 tttactttcttgttatttacttttatgctttttttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattattggata 30949178  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30949177 agtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 30949148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20377669 - 20377521
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20377669 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaatattcagagacaaaaatatgtct 20377570  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccg 284  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20377569 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccg 20377521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Original strand, 28307541 - 28307680
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||    
T  28307541 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcaaattggacacaaaaatataaagattgagagac-aaattatgtct 28307639  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttgg 276  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28307640 cccataagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttgg 28307680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 36683978 - 36684184
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||  || |||| |||| |   | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  36683978 caggaatgaatattcgatggattgagttttggagcaaaagaaaagggtttggagctgatttggaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 36684077  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||  |  ||| ||||||||||||||  ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36684078 cccctaagtcagaagcttggcacagcccgtgctcccactggcacggccgtgccacctcccatgattcccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 36684177  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  36684178 tctattt 36684184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23801215 - 23801015
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  23801215 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggtttttggagctgattcggtacgaaaatataaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 23801116  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| || |||||||||||  | |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23801115 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacagccgtgccacctcctagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 23801016  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  23801015 t 23801015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 7941398 - 7941493
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatat 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7941398 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatat 7941493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32393189 - 32393090
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32393189 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatacgtct 32393090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24077100 - 24076916
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  24077100 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagatttagagacaaaaatatgtctc 24077001  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    ||  |||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24077000 cccaaagtcagaagcttggcacg---------------------gccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 24076922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Original strand, 25351754 - 25351887
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25351754 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 25351853  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25351854 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 25351887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 503 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 21344469 - 21344333
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  21344469 tcttcttctctatgtctacgatgaacataagcgagtagactcttcctgtcttgagattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagcct 21344370  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||| || |||||    
T  21344369 taaaccctaattttaggtaaccctaatttctaatcta 21344333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24825344 - 24825184
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagcc-gattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  || |||| ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  24825344 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggacctgattcgatacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatct 24825245  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca 296  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  24825244 ccctcaagtcagaaacatggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctcca 24825184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 538896 - 539095
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  || |||| ||||     | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||  |||    
T  538896 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatgggtttggagctgattcagaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctccgccaa 538995  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc-ctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    || |||||||||||||||||||||||  |  ||| |||||||||||||| | | | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  538996 gttagaagcttggcacggcccgtgctcccactggcacggccgtgccacctcccaaaacttccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 539095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 694 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23084682 - 23084581
Alignment:
Q  694 agggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga-gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaa 792  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  23084682 agggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggaggctttgatattcgatcaagtaaatttagacaaagattgtaa 23084583  T
Q  793 ag 794  Q
    ||    
T  23084582 ag 23084581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 23698783 - 23698515
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||     
T  23698783 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaactataaaccctaatt 23698684  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| || || |||||| ||||    ||| || ||| || ||| | || ||||||    || ||||   |||||||| | || ||||| ||    
T  23698683 ttatataaatctattttctaatctaatttcattgtttttataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacacggagggttag-tatttgttaat 23698585  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| | ||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23698584 tcatcatctcaaatatcaattcataaagctaacacggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 23698515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Original strand, 20635364 - 20635558
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  20635364 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccccca 20635463  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||     ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20635464 agtcaga-----ggcacggtccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagcctattgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 20635558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 515 - 630
Target Start/End: Original strand, 23704392 - 23704507
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  23704392 tgtctacaatgaacgctagtgagtagcctcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctctaaaccctaatt 23704491  T
Q  615 ttatgtaaccctaatt 630  Q
    ||||||||||||||||    
T  23704492 ttatgtaaccctaatt 23704507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 40917195 - 40916996
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||| ||  || |||| ||||    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  40917195 gaatatttgatggattgagtctttgagcaaaacaaatgggtttggagctgattcagagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctccctcaa 40917096  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||  | |||    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40917095 gtcaaaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggtcgtgcctcctcctagaacatcttttgctgcttttgcttagattttaaactactatatttt 40916996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 251 - 342
Target Start/End: Original strand, 45706027 - 45706118
Alignment:
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45706027 cttggcacagcccgtgctagtcttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 45706118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 20414198 - 20414073
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  20414198 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaac-aaaatatatct 20414100  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20414099 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 20414073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 479 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 24371449 - 24371307
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatg 577  Q
    ||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24371449 tgttaattacttttatgttgttct-tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatg 24371352  T
Q  578 acataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    || ||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24371351 acgtaatccctatcaaaccaagcctagaaccttaatcttatgtaa 24371307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20173131 - 20173040
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  20173131 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 20173040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 24610043 - 24609936
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||     
T  24610043 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacctaatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaatt 24609944  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  24609943 ttatgtaa 24609936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 33181388 - 33181515
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  33181388 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatatc 33181487  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33181488 tccctcaagtcagaagcttggcacggcc 33181515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 35075938 - 35076029
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  35075938 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 35076029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 505 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 21395 - 21261
Alignment:
Q  505 ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttta 604  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||    
T  21395 ttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgaatagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaataacgtaatgctaatcaaaccaagcctta 21296  T
Q  605 aaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||| || |||||    
T  21295 aaccctaattttatgtaaccttaatttctaatcta 21261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Original strand, 23012603 - 23012737
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||  |||| ||||||| |||    
T  23012603 caggaatgaatatttgatggatttagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcgatgcaaaaatacgaagattcggagaaaaaaataggtc 23012702  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23012703 tccctcaagtcagaagcttggcacggcccatgcta 23012737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 725 - 794
Target Start/End: Original strand, 20282429 - 20282498
Alignment:
Q  725 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20282429 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaggttgtaaag 20282498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 212
Target Start/End: Original strand, 21025715 - 21025791
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaa 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21025715 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaa 21025791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24050842 - 24050718
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  24050842 caggaacgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 24050743  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacg 259  Q
     |||  |||||||||||||||||||    
T  24050742 accccaaagtcagaagcttggcacg 24050718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23798800 - 23798673
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23798800 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 23798701  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  23798700 tccctctagtcagaagcttggcacggcc 23798673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 17590745 - 17590870
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||   ||||||||||||||||| || || ||||||| |||    
T  17590745 cagggaagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattgggcacaaaaatatgaagattgggaaac-aaaatatatct 17590843  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17590844 cccacaagtcagaagcttagcacggcc 17590870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 144 - 221
Target Start/End: Original strand, 22791709 - 22791786
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagag 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22791709 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaatggacttggagccgattggatgcaaaagtatgaagattgagag 22791786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 283
Target Start/End: Original strand, 23648356 - 23648489
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  23648356 gatggattgagtcttggagcaatagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatccccctcaagtcagaa 23648455  T
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc 283  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23648456 gcttggcacagcccgtgctaggcttggcacggcc 23648489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 517 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 25858561 - 25858289
Alignment:
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatctt 616  Q
    ||||| |||||| | |||||| || ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||| |||| ||    
T  25858561 tctacaatgaacgtgagtgagaaggctcttcttgtcttgggattgttcgataagtctaatgacgtaatcctaatcaaatcaaaccataaaccctaatatt 25858462  T
Q  617 atgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata-tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 715  Q
    || |||  ||| || || |||||| ||||||  ||| ||| |  || ||| | || ||||||    || |||| |||||||||| | || ||||| || |    
T  25858461 atataaatctactttctaatctaatttcaccgtttttataataaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgtggagggttag-tatttgttaattc 25858363  T
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  25858362 atcatcacaaatatcaattcataaagcgaaagcggacctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 25858289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11318561 - 11318437
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  11318561 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttagagctgattaggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 11318462  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacg 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  11318461 tcccccaagtcagaagcttggcacg 11318437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22037657 - 22037471
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  22037657 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaaaaacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 22037558  T
Q  236 cccacaag-tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||  ||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22037557 cccccaaaatcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22037479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 36130079 - 36129967
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  ||||||||||||   |||||    
T  36130079 tctccttgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagccaaaaacc 36129981  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  36129980 ctaattttatgtaa 36129967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 24366279 - 24366176
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  24366279 tgtctacaatgaacgtgagtggatagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccttaatt 24366180  T
Q  615 ttat 618  Q
    ||||    
T  24366179 ttat 24366176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 384 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 41653717 - 41653504
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttcatttacttttct 479  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||      
T  41653717 ctataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttc--tttcttttac 41653621  T
Q  480 gttatt-tacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||| || |  |||||||  |||| ||||||  ||  |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41653620 gttcttgttattttatg--ttct-tcttctcttctatgtctacgatgaacatgagtgagtagattcttcttatcttgggattgttggataagtctaatga 41653524  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaa 598  Q
      ||||||||||||||||||    
T  41653523 tgtaatcctaatcaaaccaa 41653504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 270
Target Start/End: Original strand, 45705890 - 45706025
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttga-gccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||| || |||| | | | |||||| |||||||  || |||||||||| ||    
T  45705890 caggaacgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttgaagcagattcggtacgaaaatacgaagattcggaaacaaaaatatatc 45705989  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctag 270  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45705990 tcccccaagtcagaaacttggcacggcccgtgctag 45706025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 515 - 585
Target Start/End: Complemental strand, 23614066 - 23613996
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatc 585  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23614066 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatcacataatc 23613996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 22578298 - 22578195
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||     
T  22578298 tgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctaaaaccctaatt 22578201  T
Q  615 ttatgt 620  Q
    ||||||    
T  22578200 ttatgt 22578195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 41653587 - 41653319
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  41653587 tgtctacgatgaacatgagtgagtagattcttcttatcttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 41653488  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata-tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| ||  | |||||| ||||||  ||| ||| || || ||  | ||  |||||    || |||    |||||||| | || ||||| ||    
T  41653487 ttatataaatctactttgtaatctaatttcaccgtttttataatgaattaataaatacaaaactcataaagcgagcacggagggttag-tatttgttaat 41653389  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41653388 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacgcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 41653319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 523 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 19124295 - 19124220
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19124295 atgaacgttagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 19124220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 503 - 598
Target Start/End: Original strand, 22328592 - 22328688
Alignment:
Q  503 tcttcttctcct-tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22328592 tcttcttcttctatgtctacaatgaatgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgttatcctaatcaaaccaa 22328688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 23333121 - 23333041
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |||||||    
T  23333121 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagatt 23333041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 23409781 - 23409877
Alignment:
Q  138 ggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  23409781 ggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 23409877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 509 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 31590493 - 31590383
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  31590493 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagcagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaacc 31590396  T
Q  609 ttaatcttatgta 621  Q
     |||| |||||||    
T  31590395 ctaattttatgta 31590383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 20852241 - 20852347
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  20852241 tgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 20852339  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  20852340 ttatgtaa 20852347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 635 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23613998 - 23613844
Alignment:
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    |||||||||||||  ||| | ||| || ||| |||| ||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  23613998 atctaaattcaccgttttcacatgaattaacaattaccaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaatt 23613900  T
Q  735 cataaaacgaaagtgga-gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| || |||||||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23613899 catcaagcgaaagtgaaagttttgatattggaacaagtgaatttagacaaggattg 23613844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 250 - 341
Target Start/End: Original strand, 23648477 - 23648568
Alignment:
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648477 gcttggcacggcccgtgctaggcttggcacgtccgtgccacctcccagaactgcttatgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 23648568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Original strand, 13004595 - 13004707
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  ||||    
T  13004595 tctctttgtccacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaacc 13004693  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  13004694 ctaattttatgtaa 13004707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24801751 - 24801667
Alignment:
Q  257 acggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  24801751 acggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatttt 24801667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 546 - 618
Target Start/End: Original strand, 15583981 - 15584053
Alignment:
Q  546 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  15583981 tcttgtcttgagattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttat 15584053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 268
Target Start/End: Original strand, 23337914 - 23338046
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||   || |||| |||| |     |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23337914 caggaatgaatttttgatggattgagtcttggagcaagagaaaggtgtttggagctgattcggaatgaaaatacgaagatttagagacaaaaatatgtct 23338013  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgct 268  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23338014 cccccaattcagaagcttggcacggccggtgct 23338046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 23256990 - 23256885
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |  |||| ||||     
T  23256990 tgtctacaatgaatatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaacccaagcctcgaaccctaatt 23256893  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  23256892 ttatgtaa 23256885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18943401 - 18943300
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  18943401 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 18943303  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  18943302 ccc 18943300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25370510 - 25370390
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  25370510 atgtaattgcttagactctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttgaaattcaataagtgacaat 25370411  T
Q  448 tgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  25370410 tgtctttcttaataaaagttc 25370390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Original strand, 24321911 - 24321995
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  24321911 tgtctacaatgaacatgagtgtgtagacttctttt-tcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccatatcaaaccaagc 24321995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 19012986 - 19012880
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  19012986 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtctcgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 19012888  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  19012887 ttatgtaa 19012880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 191
Target Start/End: Original strand, 25579207 - 25579262
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagcc 191  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25579207 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagcc 25579262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30323235 - 30323176
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30323235 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 30323176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21468794 - 21468669
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||| |||| ||     
T  21468794 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttgaagctgattcggtacgaaaatacggagatttggagacaaaatatatctcc 21468695  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21468694 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 21468669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16134399 - 16134359
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16134399 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 16134359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 754 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20377006 - 20376966
Alignment:
Q  754 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20377006 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 20376966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 514 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25593096 - 25592993
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| | |||||  |||    
T  25593096 ttgtctacgatgaacatgagtgagtagatctct-ttgtcttgatattgttggatgagtctaatgacttaattcctatcaaaccaagcctaaaaccgcaat 25592998  T
Q  614 cttat 618  Q
    |||||    
T  25592997 cttat 25592993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21468680 - 21468617
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21468680 cttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21468617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Original strand, 33181534 - 33181573
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33181534 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 33181573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 5499907 - 5499842
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  5499907 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 5499842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 17590865 - 17590928
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  17590865 acggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctattctatttt 17590928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 24018554 - 24018503
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat 567  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24018554 tgtctatgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggat 24018503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 25481260 - 25481300
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25481260 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactccatttt 25481300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 25488866 - 25488906
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25488866 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactccatttt 25488906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 716 - 783
Target Start/End: Original strand, 22328806 - 22328873
Alignment:
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||| | |||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22328806 atcatcacaaatatcaattcataatgcgacagcggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 22328873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23798654 - 23798619
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23798654 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 23798619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39870814 - 39870767
Alignment:
Q  291 cctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39870814 cctccagagtcatttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 39870767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 178
Target Start/End: Original strand, 21112645 - 21112687
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaa 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21112645 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaa 21112687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 22032546 - 22032592
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22032546 cagggaagaatattggatggattaagtcttggagcaaaagaaaggga 22032592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 350 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 22037440 - 22037378
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaa 412  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  22037440 aatgaaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaa 22037378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23798568 - 23798460
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||  |||||||    
T  23798568 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaataaagtatctagccatcacaaatattcatctttcattcttggaattcaataaatgacaat 23798469  T
Q  448 tgtctttct 456  Q
    | |||||||    
T  23798468 tttctttct 23798460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 359 - 467
Target Start/End: Original strand, 36684237 - 36684349
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| |||||| |||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||  | ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36684237 gcttaggttttaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttcttcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 36684336  T
Q  456 -taataaaagttc 467  Q
     ||||||||||||    
T  36684337 ttaataaaagttc 36684349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 16134333 - 16134260
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |   ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  16134333 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaattataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 16134260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 550 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 21511875 - 21511826
Alignment:
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21511875 gtcttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 21511826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 25481326 - 25481399
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  25481326 atgtaattgcttagattctaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 25481399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 25488932 - 25489005
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  25488932 atgtaattgcttagattctaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 25489005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25803947 - 25803828
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt---tcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||| || |  |||||| ||||||||  |  ||||||||||||||||||||   |||||||||  |||| ||||||||    
T  25803947 atgtaattgtttagattctaaatcgaatgtaaactataagtagagtagctagtcatcacaaatattcatctttcattcttggaatttaataagtgacaat 25803848  T
Q  448 tgtctttc-taataaaagtt 466  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  25803847 tgtctttcttaataaaagtt 25803828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 30949634 - 30949503
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgatt-ggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgt 233  Q
    |||||| ||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||| || || ||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  30949634 caggaacgaatatgtgatagattgagtcttggagcaaaagaaagaggattaggagctgattcgggtg-aaaaatacgaagattga-agacaaaaatatat 30949537  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    |  |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30949536 cctcaccaagtcagaagcttggcacggccagtgc 30949503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 599
Target Start/End: Original strand, 23482615 - 23482701
Alignment:
Q  512 ccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||  ||| ||| ||||||||||    
T  23482615 ccttgtctacaatgaacatgtgtgagtagactt-tctactcttgggattgtgggaatagtctaatgactaaattctattcaaaccaag 23482701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 301 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25804033 - 25803994
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25804033 gccttttgctgcttttgcttagattttaagttactttatt 25803994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 342
Target Start/End: Original strand, 19927278 - 19927308
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19927278 cttttgcttagattttaagctactctatttt 19927308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 752 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 20299683 - 20299646
Alignment:
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20299683 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattg 20299646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #200
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 262
Target Start/End: Original strand, 22032617 - 22032654
Alignment:
Q  225 aaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22032617 aaaatatatctcccacaagtcagaagcctggcacggcc 22032654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #201
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 467
Target Start/End: Original strand, 27745071 - 27745116
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27745071 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 27745116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 534; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Original strand, 8469 - 9122
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8469 caggaaagaatattgaatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatatgtct 8568  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8569 ccccctagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 8668  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8669 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 8768  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||    
T  8769 atatgtgacaattgtctttctaatataagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagt 8868  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8869 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 8968  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8969 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 9068  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9069 cataaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggatt 9122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 139 - 794
Target Start/End: Original strand, 16019 - 16654
Alignment:
Q  139 gaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 238  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16019 gaaagaatattcgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatatgtctccc 16118  T
Q  239 acaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
     | ||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16119 cctagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 16197  T
Q  339 tttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaata 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16198 tttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcaaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttctttgaatgcaata 16297  T
Q  439 tgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgag 537  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  16298 tgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgag 16397  T
Q  538 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16398 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 16497  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16498 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcat 16597  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16598 aaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 369867 - 369208
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   | | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  369867 caggaatgaatattgaatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttgaagctgatttagtacgaaaatacaaagattcagagacaaaaatatgtct 369768  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369767 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 369668  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369667 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 369568  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  369567 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagt 369468  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369467 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 369368  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  369367 atctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 369268  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  369267 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 369208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 350 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 24463 - 24174
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24463 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 24364  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  24363 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttaattttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 24264  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24263 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaacccta 24174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 251747 - 251541
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||     
T  251747 caggaacgaatattggatggaatgagtcttggagcaaaagaaagtgacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtcc 251648  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |  ||||||| |  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251647 ccccaaaatcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcatgtctttgccaccttttagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 251548  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  251547 ctatttt 251541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24672 - 24548
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  24672 caggaacgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 24573  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacg 259  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||    
T  24572 cccccaaaggcagaagcttggcacg 24548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 356424 - 356306
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||    
T  356424 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaa 356325  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggc 261  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  356324 gtcagaaacttggcacggc 356306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 253713 - 253759
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  253713 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 253759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24525 - 24489
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttttagccc 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24525 cttttgcttagattttaagctactctatttttagccc 24489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 251510 - 251462
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  251510 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 251462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 50383 - 49724
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  50383 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 50285  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50284 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 50185  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50184 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 50085  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  50084 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 49985  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49984 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 49885  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49884 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 49785  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  49784 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 49724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14928 - 14276
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||    
T  14928 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcccctaa 14830  T
Q  243 -gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14829 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtttcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 14730  T
Q  342 ttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgt 441  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14729 ttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgt 14630  T
Q  442 gacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  14629 gacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcagtgagtag 14530  T
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaa 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14529 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaa 14430  T
Q  641 attcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaa 740  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14429 attcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 14330  T
Q  741 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14329 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 14276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 56198 - 55992
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | |  |||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  56198 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacggaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 56100  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56099 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggctgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 56000  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  55999 tctatttt 55992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 515 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31057 - 30985
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccta 588  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31057 tgtctacgattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacctaatccta 30985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 31828 - 31756
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccta 588  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31828 tgtctacaattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtcaaatgacctaatccta 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 501; Significance: 0; HSPs: 210)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 501; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 22370281 - 22370940
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  22370281 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 22370379  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370380 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22370479  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22370480 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatac 22370579  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22370580 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 22370679  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22370680 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 22370779  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22370780 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 22370879  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22370880 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22370940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11351877 - 11351220
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||| ||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  11351877 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaa-tacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 11351780  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351779 cccctaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctaaagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 11351680  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351679 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 11351580  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11351579 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttatttttatgttttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagt 11351480  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351479 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 11351380  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaatt 734  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11351379 atcaaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaatt 11351280  T
Q  735 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11351279 cataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 11351220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 142 - 794
Target Start/End: Original strand, 27537177 - 27537841
Alignment:
Q  142 agaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537177 agaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 27537276  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27537277 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccatgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 27537376  T
Q  342 ttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgt 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  27537377 ttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagtcacccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagt 27537476  T
Q  442 gacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatt 531  Q
    ||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||     
T  27537477 gacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatg 27537576  T
Q  532 agtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27537577 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 27537676  T
Q  630 tccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatat 729  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||    
T  27537677 ttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatat 27537776  T
Q  730 caattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27537777 caattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27537841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21103992 - 21103333
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| |||||||||||||    ||| |||||||||||    
T  21103992 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatatgaagattcgatgac-aaaatatgtct 21103894  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21103893 cccccaaagtcagaacctcggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctacttttgtttagattttaagctac 21103794  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21103793 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgc 21103694  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  21103693 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 21103594  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21103593 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 21103494  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21103493 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 21103394  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21103393 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 21103333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21106034 - 21105375
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||  ||| |||| | |||| |||||||||||||    ||| |||||||||||    
T  21106034 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattgaagctgattcggtgcagaaatatgaagattcgatgac-aaaatatgtct 21105936  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| | |||| |||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21105935 cccccaaagttagaacctcgccacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccagtgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 21105836  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21105835 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatcttttcttggaatgc 21105736  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  21105735 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 21105636  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21105635 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 21105536  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21105535 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 21105436  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21105435 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 21105375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 252 - 790
Target Start/End: Original strand, 20002590 - 20003128
Alignment:
Q  252 ttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaa 351  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20002590 ttggcacggcctgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttaaattttaagctactctatttttagcccgaa 20002689  T
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 451  Q
    |||||  |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002690 tgtaactgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtc 20002789  T
Q  452 tttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002790 tttctagtaaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 20002889  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20002890 cttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcgctt 20002989  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20002990 taacatagatcaaccattatcgaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 20003089  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20003090 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 20003128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 21821073 - 21821744
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21821073 caggaatgaatattggatgggttgagtcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 21821172  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21821173 ccccacagtcagaagcttcgcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccatcatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21821272  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21821273 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgagtgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttacttggaattc 21821372  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  21821373 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcatgtcatttacctttatgttttctctcttctcccccatgtctacga 21821471  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21821472 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 21821571  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21821572 accctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 21821671  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21821672 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 21821744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Original strand, 22102732 - 22103401
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22102732 aggaaagaatattcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 22102831  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    || || | |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22102832 ccccatgccagaagcttggcacggcctgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 22102931  T
Q  337 tatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaa 436  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22102932 tatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattcaa 22103031  T
Q  437 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    || ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  22103032 taagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 22103130  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22103131 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 22103230  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
     |||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |    
T  22103231 tctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatcattgtttatccattattcc 22103330  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22103331 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22103401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 430; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 272 - 793
Target Start/End: Original strand, 19997254 - 19997775
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaa 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  19997254 cttggcacggccgtgccaccctctagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaactgcttagattttaa 19997353  T
Q  372 gtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt 471  Q
    ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19997354 gtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt 19997453  T
Q  472 acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagt 571  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19997454 actttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagt 19997553  T
Q  572 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19997554 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattat 19997653  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19997654 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatacttgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagt 19997753  T
Q  772 gaatttagacaaagattgtaaa 793  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  19997754 gaatttagacaaagattgtaaa 19997775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18822197 - 18821528
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18822197 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 18822098  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18822097 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgcgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 18821998  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18821997 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 18821898  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||          |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  18821897 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 18821799  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18821798 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagccttaatcttatgtaac 18821699  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  18821698 cctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 18821599  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18821598 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 18821528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 20835815 - 20836485
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20835815 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagagacttggagccatttggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20835914  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20835915 cccccaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccatgccaccctccagagtcacttttgctgctttttgcttagattttaagctac 20836014  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || |    
T  20836015 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttgg-attc 20836113  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| |||||||||||| |||||| | || |||||||||    
T  20836114 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctttcttctcccccatgtctacga 20836212  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20836213 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 20836312  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  20836313 accctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 20836412  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20836413 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20836485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 21831355 - 21832026
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21831355 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatatct 21831454  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21831455 ccccacagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccatcatccagagtaccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21831554  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |    
T  21831555 ctatttttagcccgaatgtaatagcttggattttaagtcgagtgaatgctataaatagagtagccatccatcataaatattcatcttttacttggaattc 21831654  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  21831655 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcatgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 21831753  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  21831754 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttacgta 21831853  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  21831854 accctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 21831953  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21831954 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaattttgacaaggattgcaaag 21832026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22033432 - 22032762
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033432 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttagagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 22033333  T
Q  236 cc-cacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22033332 cctcaca-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22033234  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22033233 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgattgctataaatagagtagccattcatcacaaatattcatctttacttggaatac 22033134  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  22033133 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 22033035  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  22033034 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctcagccttaatcttatgta 22032935  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  22032934 accctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgtttatccattatt 22032835  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22032834 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagatttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22032762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22099532 - 22098862
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099532 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 22099433  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22099432 cccccatgtcagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcatagattttaagctact 22099333  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22099332 ctatttttagcctgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 22099233  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| | ||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  22099232 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctctatgctttctctcttcttacccatgtctacgat 22099134  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22099133 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 22099034  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  22099033 ccctaatttcttatctaaattcaccgttttatcatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 22098934  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22098933 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22098862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 22092942 - 22093612
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22092942 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagaaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 22093041  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22093042 cccccatgccagaagcttgggacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagtgtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 22093141  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22093142 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagttgccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 22093241  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |          ||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||||    
T  22093242 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcctttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctctgctcccccatgtctacgatg 22093341  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22093342 aacatgagtgagtagaattctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatagtcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 22093441  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  22093442 cctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 22093541  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22093542 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22093612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 40952620 - 40951949
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40952620 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 40952521  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
     ||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40952520 tccctatgtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacagttgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaaggtact 40952421  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||    
T  40952420 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttgaaataca 40952321  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||            ||| ||||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  40952320 ataagtgacaattgcttttctaattaaaattc-ttttcttttccctttattttcttgtcatttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacga 40952222  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  40952221 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 40952122  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  40952121 accctaatttcttatctaaattcgtcgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 40952022  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  40952021 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 40951949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22040034 - 22039364
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22040034 caggaatgaatattggatggatcaagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 22039935  T
Q  236 cc-cacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    || |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22039934 cctcaca-gtcaaaagcttggcacggcccatgctagccttggcacggctgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgcctagattttaagctac 22039836  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  22039835 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgatttctataaatagagtagccattcatcacaaatattcatctttacttggaatac 22039736  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  22039735 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 22039637  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22039636 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgta 22039537  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  22039536 accctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatt 22039437  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  22039436 ccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtaaatttagacaaggattgcaaag 22039364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 25751848 - 25751404
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751848 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 25751749  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751748 tctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 25751649  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25751648 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgc 25751549  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25751548 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 25751449  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751448 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 25751404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Original strand, 17612903 - 17613567
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  17612903 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcgttacgaaaataggaagattcggagacaaaa-tatgtct 17613001  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613002 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacagccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 17613101  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    || ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17613102 ctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagccaaccatcacaaatattcatcttt 17613201  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17613202 tcttggaatgcaatatgtgacaattgcctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacga 17613301  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  17613302 tgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtttaaatgacataatcctaattgaaccaaactctaagccttaatcttatgtaa 17613401  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613402 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 17613501  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  17613502 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggatt 17613567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Original strand, 17621085 - 17621749
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  17621085 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtatgaaaataggaagattcggagacaaaa-tatgtct 17621183  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17621184 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggctgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 17621283  T
Q  336 ctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    || ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17621284 ctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagccaaccatcacaaatattcatcttt 17621383  T
Q  424 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17621384 tcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctcattgtctacga 17621483  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||||||    
T  17621484 tgaacgttagtgagtagacttatcttgtcttgggattgctggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaatctaagctttaatcttatgtaa 17621583  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17621584 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 17621683  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17621684 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 17621749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 21859213 - 21858546
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  21859213 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 21859114  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21859113 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttgacacggccgtgccacactccataactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 21859014  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  21859013 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 21858914  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21858913 ttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacg 21858814  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21858813 atgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 21858714  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21858713 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataactgtttatccatcat 21858614  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21858613 ctcaaatatcaattcctaaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 21858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21939625 - 21939181
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21939625 aatgtaattgcttagattttaaatcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaatta 21939526  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939525 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 21939426  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21939425 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgc 21939326  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21939325 tttaacatggataaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 21939226  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21939225 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21939181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20044276 - 20043831
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20044276 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatatttatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 20044177  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20044176 tctttctagtaaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct 20044077  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20044076 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccg 20043977  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20043976 ctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagt 20043877  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043876 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 20043831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 25228373 - 25229022
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  25228373 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 25228472  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25228473 cccccaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 25228551  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  25228552 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 25228651  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  25228652 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 25228750  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25228751 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 25228850  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  25228851 ccctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 25228950  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  25228951 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 25229022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 21843402 - 21842735
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |   | || ||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  21843402 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggaacgaatatacgaagattcggagacaaaaatatatc 21843303  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21843302 tccctcaagttagaaacttggcacggcccttgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 21843203  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  21843202 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 21843103  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21843102 ttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacg 21843003  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21843002 atgaacattagtgagtagacttctacttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 21842903  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21842902 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 21842803  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21842802 ctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 21842735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21945560 - 21945116
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21945560 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctgggaatgcaatatgtgacaattg 21945461  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21945460 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 21945361  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21945360 gtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaactaggctttcaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgc 21945261  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21945260 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattgataaaacgaaagtg 21945161  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21945160 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 21945116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 21949855 - 21950504
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21949855 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaa-tatgaagattgagagacaaaaatatgtct 21949953  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21949954 cccccaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21950032  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21950033 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 21950132  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||    
T  21950133 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccctttattttcatgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctatga 21950231  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21950232 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgta 21950331  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||     
T  21950332 acccaaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattatt 21950431  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21950432 ccaaatatcaattcataaaaggaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21950504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 20038621 - 20038176
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20038621 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatatttatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 20038522  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  20038521 tctttctagtaaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct 20038422  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20038421 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcg 20038322  T
Q  649 ctttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagt 748  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20038321 ctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagt 20038222  T
Q  749 ggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20038221 ggagctttaatattcgaataagtgaatttagacaaagattgtaaag 20038176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 29325249 - 29325693
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29325249 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacagtatgtgacaattg 29325348  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29325349 tctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt 29325448  T
Q  550 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |    
T  29325449 gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgacttcaccgc 29325548  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29325549 tttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtg 29325648  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29325649 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 29325693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Original strand, 19767869 - 19768535
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||   | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |    
T  19767869 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattccgtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatcttcctaa 19767968  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||  ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19767969 agtcagaagcttggcacggcccgtgcgaaggttggcacggccgtgccacctcccataacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 19768068  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    ||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||     
T  19768069 tagtttacttgtggaacattctagtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttga 19768168  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768169 aatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttactttcttgttatttatttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 19768268  T
Q  530 ttagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19768269 ttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaaagacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaacccta 19768368  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  19768369 atttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgatagtagagggtttgataattatttatccatcatctcaaat 19768468  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19768469 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgaaaag 19768535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 1685611 - 1686047
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1685611 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 1685710  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1685711 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 1685810  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1685811 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 1685910  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1685911 ggataaacaattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttg 1686010  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1686011 atattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 1686047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 11346830 - 11346308
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  11346830 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 11346732  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||         |||||||||||||||    
T  11346731 cccctaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctctagagtgtcttttgct---------tagattttaagctac 11346641  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346640 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 11346541  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagt 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11346540 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttatttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagt 11346441  T
Q  535 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 634  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11346440 gagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctt 11346341  T
Q  635 atctaaattcaccactttaatatggatcaacca 667  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  11346340 atctaaattcactgctttaacatggatcaacca 11346308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 360 - 794
Target Start/End: Original strand, 35996041 - 35996476
Alignment:
Q  360 cttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35996041 cttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaat 35996140  T
Q  460 aaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  35996141 aaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 35996240  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  35996241 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 35996340  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35996341 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 35996440  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35996441 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 35996476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 24039752 - 24039258
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24039752 caggaaagaatagtcgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 24039653  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24039652 cccacaagtcagaagcttcgcacggcccgtgctagccttggcacggctgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 24039553  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  24039552 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgatcgaatgctataaatagagtagccatccaacacaaatattcatctttacttggaattca 24039453  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttat----------ttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||||||  ||||          |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  24039452 ataagtgacaattgctgttctaattaaacttc-ttttcttttcctttattttcttgtcattacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 24039354  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatg 619  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24039353 aacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatg 24039258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 33632372 - 33632819
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33632372 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 33632471  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33632472 tctttctaataaaagttctttttactttcttgttatttacttttatgatttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctct 33632571  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  33632572 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatataaccctaatttctaatctaaattcac 33632671  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    | |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33632672 cgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 33632771  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33632772 gtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 33632819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 143 - 638
Target Start/End: Original strand, 1692854 - 1693362
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  1692854 gaatattggaaggattgagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaca 1692953  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692954 gtcagaagcttggcatggcccgtgctagccttggcacagccgtgccaccatccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 1693053  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    || ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||    
T  1693054 taacccgaatgtactagcttagattttaagtcgaatgattgctataaataaagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaatataataagtg 1693153  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc------------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacat 530  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||            ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  1693154 acaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttccctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacat 1693252  T
Q  531 tagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaa 628  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  1693253 gagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaa 1693352  T
Q  629 ttccttatct 638  Q
    || |||||||    
T  1693353 tttcttatct 1693362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 26826431 - 26826886
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26826431 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatacgtgacaattgt 26826530  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26826531 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtag 26826630  T
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26826631 acttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttctaatct 26826730  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  26826731 aaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaattggagggtttgatgattgttaattcatcatctcaaatatcaattcata 26826830  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26826831 aaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 26826886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 290 - 794
Target Start/End: Original strand, 21955799 - 21956306
Alignment:
Q  290 ccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataa 389  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  21955799 ccctccagagtaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataa 21955898  T
Q  390 atagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc----------- 478  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||               
T  21955899 atagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttagaatacaataagtgacaattgcttttctaattaaagttctttt-cttttccctttattttc 21955997  T
Q  479 -tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa- 575  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||| | |          |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  21955998 ttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccc----------atgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaa 21956087  T
Q  576 tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaa 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21956088 tgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaa 21956187  T
Q  676 ctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaat 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21956188 ctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaaggaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaat 21956287  T
Q  776 ttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||| ||||| ||||    
T  21956288 tcagacaaggattgcaaag 21956306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 45466630 - 45467086
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  45466630 atgtaattgcttagattctaagtcgagtgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 45466729  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45466730 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttactattatgctttccctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 45466829  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  45466830 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatc 45466929  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  45466930 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaacagtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat 45467029  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45467030 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 45467086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 354 - 788
Target Start/End: Original strand, 20713013 - 20713459
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctt 453  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  20713013 taattgcttagattttatgtcgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttcttgtaattcaataagtgacaattgcttt 20713112  T
Q  454 tctaataaaagttcatt----------tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||||||||||||| ||          ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20713113 tctaataaaagttctttccttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtatact 20713212  T
Q  544 tctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20713213 tatctttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaa 20713312  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20713313 ttcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 20713412  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20713413 tgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 20713459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 38350067 - 38349611
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||| ||||||    
T  38350067 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaatattcatattttctttggaattcaataagtggcaattg 38349968  T
Q  450 tctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  38349967 tctttctaataaaagttattttcttttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 38349868  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  38349867 gacttcttcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaattttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatc 38349768  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  38349767 taaattcaccgctttaacatgaattaatcattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatttat 38349668  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38349667 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 38349611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Original strand, 18399212 - 18399656
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18399212 atgtaattgcttagattttaagtcgaaggtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 18399311  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  18399312 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttactttaatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 18399411  T
Q  541 acttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  18399412 acttctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccttaatcttatgtaactctaatctctaatct 18399511  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  18399512 aaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaataccaattcata 18399611  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18399612 aaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 18399656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 384 - 794
Target Start/End: Original strand, 19359865 - 19360287
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc----- 478  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||         
T  19359865 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcctttcttggaattcaataagtgacaattgcttttctattaaaagttctttt-cttttccttta 19359963  T
Q  479 ------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagt 571  Q
          ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19359964 ttttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagt 19360063  T
Q  572 ctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatta 670  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  19360064 ctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagccttaattttatgcaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccatta 19360163  T
Q  671 tcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaag 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19360164 tcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaag 19360263  T
Q  771 tgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  19360264 tgaatttagacaaggattgcaaag 19360287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18264542 - 18264100
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18264542 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 18264443  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttt-tctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    ||||||||||||||||| |||          ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  18264442 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttctct-ttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacttgagtgagc 18264345  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18264344 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatct 18264245  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18264244 aaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttcgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 18264145  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18264144 aaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 18264100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23912024 - 23912471
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  23912024 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 23912123  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
    | ||||||| |||          |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23912124 ttaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 23912223  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23912224 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 23912323  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  23912324 cgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaa 23912423  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23912424 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 23912471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 23904169 - 23904616
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  23904169 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 23904268  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
    | ||||||| |||          |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  23904269 ttaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 23904368  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  23904369 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttgtgtaaccctaatttcttatctgaattcac 23904468  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  23904469 cgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaa 23904568  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23904569 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 23904616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21098425 - 21097979
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  21098425 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 21098326  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
    | ||||||| |||          |||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  21098325 ttaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcc-ccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 21098227  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21098226 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaatcttgtgtaaccctaatttcttatctgaattcac 21098127  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21098126 cgttttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttgtccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaa 21098027  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21098026 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21097979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 144 - 547
Target Start/End: Complemental strand, 23635678 - 23635265
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaag 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23635678 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaaag 23635579  T
Q  244 tcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttt 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635578 tcataagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttt 23635479  T
Q  344 agcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtga 443  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23635478 agcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtga 23635379  T
Q  444 caattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacatta 532  Q
    |||||   |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |    
T  23635378 caatttcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatga 23635280  T
Q  533 gtgagtagacttctc 547  Q
    ||||| | |||||||    
T  23635279 gtgaggaaacttctc 23635265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 136 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23228722 - 23228382
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  23228722 caggaatgaatattggatggattgagtcttgtagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 23228624  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228623 cccctaaagtcagaagcttggcgcggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 23228524  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228523 tctatttttagccaaaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 23228424  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttt 476  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23228423 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttt 23228382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18230792 - 18230343
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18230792 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattataggaattcaataagtgacaattgtctttc 18230693  T
Q  456 taataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  18230692 taataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtatacgataaacatgagtgagtagactt 18230594  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaatt 643  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  18230593 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaataaaaccaagttattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatt 18230494  T
Q  644 caccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacg 743  Q
    || |  ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18230493 catcgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcatgaaacg 18230394  T
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18230393 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 18230343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 359 - 779
Target Start/End: Original strand, 20263359 - 20263791
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  20263359 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagattagctagccatcacaaatattcatcttttcttgaaattcagtaagtgacaattgtctttctaa 20263458  T
Q  459 taaaag-----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||            ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||    ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20263459 taaaaagctcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcaccttgttcttcatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctc 20263558  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  20263559 ttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttac 20263658  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20263659 cgttttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 20263758  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttag 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20263759 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttag 20263791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 359 - 779
Target Start/End: Original strand, 21049988 - 21050420
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||    
T  21049988 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagattagctagccatcacaaatattcatcttttcttgaaattcagtaagtgacaattgtctttctaa 21050087  T
Q  459 taaaag-----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||            ||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||    ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21050088 taaaaagctcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcaccttgttcttcatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctc 21050187  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||| ||    
T  21050188 ttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttac 21050287  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21050288 cgttttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaaagaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 21050387  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttag 779  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21050388 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttag 21050420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 24034604 - 24035057
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||    
T  24034604 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaatctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattctttgaattcaataagtgacaat 24034703  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||| ||| |||   ||| ||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  24034704 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttccttcactttcttgttatttactttcatgtttt---tctccttctccatgtctatgataaacatgagtga 24034800  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  24034801 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatctctaat 24034899  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  24034900 ctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaatgca 24034999  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24035000 taaaacgaaagtggagctttgatattggaacaagtgaatttagaccaaggttgtaaag 24035057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 384 - 794
Target Start/End: Original strand, 23779401 - 23779807
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------ac 473  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          ||    
T  23779401 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttac 23779500  T
Q  474 ttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtc 572  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23779501 tttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtc 23779600  T
Q  573 taa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  23779601 taaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgccttaacatggattaaccattat 23779700  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23779701 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgt------------tcg----tcaattcataaaaggaaagtggagctttgatatttgaacaagt 23779784  T
Q  772 gaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||| ||||| ||||    
T  23779785 gaatttagacaaggattgcaaag 23779807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 783
Target Start/End: Original strand, 23879764 - 23880199
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |   |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23879764 gcttagattctaagtcgaatgtaacttatagatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaa 23879863  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23879864 taaaagttcttttcatttcctttactttcttgttatttactttcatgtttt-tctccttcttctccatgtctacgttgaacatgagtgagtagacttctc 23879962  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  23879963 ttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacattatcctaattaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcat 23880062  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
       ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23880063 tgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaa 23880162  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23880163 gtggagctttgaaattcgaacaagtgaatttagacaa 23880199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 21382676 - 21383121
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||    
T  21382676 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-aa 21382774  T
Q  459 taaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ct 548  Q
    ||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  21382775 taaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttct 21382874  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  21382875 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcacc 21382974  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
       |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  21382975 gtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaag 21383074  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21383075 tggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21383121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8322479 - 8322032
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  8322479 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 8322380  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8322379 ataaagttcttttcctttcctttattttattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 8322280  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8322279 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 8322180  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8322179 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 8322080  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8322079 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaatgattgcaaag 8322032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8329145 - 8328698
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  8329145 gcttagattttaagtcaattgtgtactataagtagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 8329046  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8329045 ataaagttcttttcctttcctttattttattgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 8328946  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8328945 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 8328846  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8328845 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 8328746  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8328745 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 8328698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 479 - 794
Target Start/End: Original strand, 22818315 - 22818629
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22818315 tgttatttacttttatgcttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgtgtagacttctcttgtcttgggattgttggataaatctaatga 22818414  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    ||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  22818415 cataatcataatcaaaccaagctttaaccct-aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaacaattatcaaactg 22818513  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22818514 tgaaaacgaaagtggagggtttaataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattca 22818613  T
Q  779 gacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||    
T  22818614 gacaaggattgtaaag 22818629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 14821125 - 14821574
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14821125 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 14821224  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||| ||| ||          ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||    
T  14821225 tcttttgaataaaagttcttttattttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctatgatgaacatgagtgagta 14821324  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  14821325 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 14821424  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  14821425 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgacaatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 14821524  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14821525 aacgaaagtggggctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 14821574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 37652748 - 37653197
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  37652748 atgtaatttcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 37652847  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37652848 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 37652947  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||    
T  37652948 gacttcttatgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcattaaaccttaatattatgtaaccctaatttctctttta 37653047  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| ||  | ||| | |||||||||    
T  37653048 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaaaccattattccaaatgttaattcataa 37653147  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  37653148 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 37653197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 8308402 - 8308848
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  8308402 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 8308500  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  || ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8308501 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtctttcactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 8308600  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8308601 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 8308700  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8308701 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 8308800  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8308801 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 8308848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 497 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16418431 - 16418132
Alignment:
Q  497 tttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaa 594  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||     
T  16418431 tttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaag 16418332  T
Q  595 ccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgga 694  Q
    |||| || ||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16418331 ccaatctctaagccttaattttatgtaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtgga 16418232  T
Q  695 gggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16418231 ggatttgataattgtttatccatgatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 16418132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 8315050 - 8315496
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  8315050 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 8315148  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  || ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  8315149 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtctttcactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 8315248  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  8315249 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 8315348  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8315349 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgatgattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 8315448  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8315449 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 8315496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 514 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14351629 - 14351342
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14351629 ttgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 14351530  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaa-------ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 706  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||       |||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14351529 cttatgtaaccctaatctctaatctaaaatctaaattcactgatttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 14351430  T
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14351429 tgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagataaaaattgtaaag 14351342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 18162106 - 18162388
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162106 tgtctacaatgaacgttagtaagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 18162205  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttta--atatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| || |  ||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18162206 cttatgtaaccctaatttctaatctaaatttacgatattcctatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtta 18162305  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162306 atccatcttctcaaatctcaactcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 18162388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Original strand, 22285077 - 22285367
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22285077 tcttcttctccatgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 22285176  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  22285177 taaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttga 22285276  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22285277 taattgttaatccatcatct-taatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattataaag 22285367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 17504331 - 17503890
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    ||||||||||||||| || ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  |    
T  17504331 gcttagattttaagttgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattgtcttttga 17504232  T
Q  458 ataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc 547  Q
    |||||||||| |||  ||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  17504231 ataaaagttcttttctttttctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaccatgagtgagtagacttctt 17504132  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||    
T  17504131 atgtcttgggattgttggacaagtctaattgcataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcacc 17504032  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
      ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||    
T  17504031 gttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaag 17503932  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17503931 tggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 17503890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 39730856 - 39730413
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||| | |||    
T  39730856 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttccttagaattcaataagtgatatttg 39730757  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    | |||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  39730756 tttttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtgatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgatcatgagtgagt 39730658  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || |||    
T  39730657 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatc 39730558  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            ||||||||| |||||||||||||    
T  39730557 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttga------------catcatctcaaatatcaattcat 39730470  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  39730469 aaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 39730413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 43836424 - 43835992
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  43836424 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttattattggaattcaataagtgacaattgtctttc 43836325  T
Q  456 t-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    | ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43836324 ttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgattttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 43836225  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattc 644  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 | | |||| || ||||||||||    
T  43836224 cttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaa-----------------ctccaatttctaatctaaattc 43836142  T
Q  645 accactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacga 744  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43836141 accgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattaataaaacga 43836042  T
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43836041 aagtgtatctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 43835992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 42418506 - 42418215
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42418506 tcttcttctccatgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttgtcttggggttgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttt 42418407  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42418406 taaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttga 42418307  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  42418306 taattgtttatccattattccaaatatcaattcatcaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 42418215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 1302448 - 1301997
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1302448 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 1302349  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||| ||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1302348 tcttttgaataaaaattcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 1302249  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  1302248 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 1302149  T
Q  640 aattcaccacttta--atatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaata-tcaattca 736  Q
    |||||||   || |  || ||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || || |||| | ||||||    
T  1302148 aattcactgtttcaacatttggattaaatatcatcaaaatgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattat-tctaatattaaattca 1302050  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1302049 taaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 1301997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14878271 - 14877998
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14878271 tgtctacaatgaacgttggtgagtggacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatc 14878173  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14878172 ttatgtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttaataattgttaatc 14878073  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14878072 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 14877998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 143 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 22030336 - 22029862
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | || |||||||||||  ||||||||||||| | ||||  |    
T  22030336 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaatatatgaagattcggagacaaaaatatatatccctaa 22030237  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||||| |  ||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22030236 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttcgcacggccgtgccatctcccaaaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 22030137  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || ||||| ||||||||| || || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22030136 tagtttacttgtggaacattctagtgattgcttaaattttaagttgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttgg 22030037  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcc-ttgtctacgatgaac 528  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22030036 aatacaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcttttagtttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttcccctttgtctacgatgaac 22029937  T
Q  529 attagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagct 601  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22029936 attagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct 22029862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 15759673 - 15759952
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  15759673 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggctaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatt 15759772  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  15759773 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattatcgaactgtagaagcgaaaatggagggtttgataattgttaatc 15759872  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15759873 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaattggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15759952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 350 - 600
Target Start/End: Original strand, 22853954 - 22854206
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22853954 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgcatgctataaatagagtaactagccatcacaattattcatcttttcttggaattcaatatgtgacaattg 22854053  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22854054 tctttctaataaaagttctttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctct 22854153  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22854154 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagc 22854206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 22831254 - 22831523
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||    
T  22831254 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaat 22831353  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  22831354 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaaccgtggaaacgaatatggagggtttgataattgttaat 22831453  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831454 ccatcatctcaattatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 22831523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 17126949 - 17127227
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  17126949 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaccataatc 17127047  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||  || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  17127048 ttatgtaaccctggtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgttgaagcgaaagtggatggtttgataattgttaatc 17127147  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17127148 catcatctcaaatatcaattcataaaatgattgtgtatttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 17127227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 351 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 18273555 - 18273213
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18273555 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagatagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 18273456  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttt-tctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    ||||||||||||||||| |||          ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
T  18273455 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttctct-ttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacttgagtgagc 18273358  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  18273357 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatct 18273258  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaa 683  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18273257 aaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaa 18273213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 457 - 794
Target Start/End: Original strand, 9317887 - 9318229
Alignment:
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttg 550  Q
    ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |   ||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||     
T  9317887 aataaaagttcacctttattttattgttatttacttttatgttcttct-tcttcttctcttccatgtctacaatgaatgttagtgagtagactcttctta 9317985  T
Q  551 tcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccact 650  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |    
T  9317986 tattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttaacccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgtt 9318085  T
Q  651 ttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg 750  Q
    |||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  9318086 ttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaataacaattcataaaacgagagtgg 9318185  T
Q  751 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  9318186 agttttgatatttgaacaagtgaacttagacaaggattgcaaag 9318229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 523 - 794
Target Start/End: Original strand, 25397053 - 25397324
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||| |||    
T  25397053 atgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgagatttttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaacgaagttttaaaccctaattttatctaa 25397152  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25397153 ccctaatttctaatctaaattcaccattttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatct 25397252  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25397253 caaatatcaattcataaaacgaaaatggatttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25397324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 350 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 17515952 - 17515543
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||    | |||  |||| ||||||    
T  17515952 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatattttgttataagaaat--aataagtgaca 17515855  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  17515854 attgtttctttgaataaaagttcacctttactttctcgttattttcttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 17515755  T
Q  543 ttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||    
T  17515754 ttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaacctaaccttaaaccttaatcttatgtagccctagtttctcttcta 17515655  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  17515654 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtgaaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 17515555  T
Q  740 aacgaaagtgga 751  Q
    ||||||||||||    
T  17515554 aacgaaagtgga 17515543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 136 - 344
Target Start/End: Original strand, 19744389 - 19744597
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19744389 caggaaagaatattggatggattgagtctcggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatataaagattgagagacaaaaatatgtct 19744488  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19744489 cccccaagtcagaagaatggaacaacccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 19744588  T
Q  336 ctattttta 344  Q
    |||||||||    
T  19744589 ctattttta 19744597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 23503248 - 23503526
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  23503248 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccttaatt 23503347  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||    ||||| ||| || || |||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||     
T  23503348 ttatttaaccctaatttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaa-cattatcaaactgtagaagcgaaaatggaaggtttgataattgttaatt 23503446  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23503447 catcatctcagatatcaaatcataaaacgagagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacagagattgcaaag 23503526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 504 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 6570566 - 6570376
Alignment:
Q  504 cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt 603  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570566 cttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttt 6570467  T
Q  604 aaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
     |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6570466 -aaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 6570376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 607 - 794
Target Start/End: Original strand, 21037794 - 21037981
Alignment:
Q  607 ccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 706  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21037794 ccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataat 21037893  T
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21037894 tgtttatccattattccaaatataaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21037981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 20712772 - 20712978
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20712772 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagatgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 20712871  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20712872 cctcaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20712971  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20712972 ctatttt 20712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 643 - 794
Target Start/End: Original strand, 22364280 - 22364431
Alignment:
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22364280 tcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggatggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 22364379  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22364380 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22364431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 33632134 - 33632341
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | ||||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  33632134 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacaaagattcggagacaaaaatatgtct 33632233  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33632234 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 33632333  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  33632334 tctatttt 33632341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 136 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23807272 - 23807115
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23807272 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaagtttgagagacaaaaatatgtct 23807173  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccct 293  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23807172 cccccatgtcagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccct 23807115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8314806 - 8315010
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8314806 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8314904  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8314905 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 8315003  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8315004 ctatttt 8315010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 350 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 13365756 - 13365532
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  13365756 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctgggaattcaataagtgacaattg 13365657  T
Q  450 tctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||          ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  13365656 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgggtgagta 13365557  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgtt 563  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  13365556 gacttctctttgtcttgggattgtt 13365532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8308158 - 8308362
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8308158 cagggaagaatattggatggagaaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8308256  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8308257 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 8308355  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8308356 ctatttt 8308362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21945797 - 21945591
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||  || ||||  |||||||| |||||||    
T  21945797 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacaaaaatacaaatattggaagacaaaa-tatgtct 21945699  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21945698 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtactagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctacttttgcttagattttaagctac 21945599  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  21945598 tctatttt 21945591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 21382432 - 21382636
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  21382432 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 21382530  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  21382531 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 21382629  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21382630 ctatttt 21382636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 35995797 - 35996001
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  35995797 caggaaagaatattggatggattaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 35995895  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  35995896 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 35995994  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  35995995 ctatttt 35996001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 241 - 374
Target Start/End: Original strand, 23663357 - 23663490
Alignment:
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23663357 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcatttgcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 23663456  T
Q  341 tttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtc 374  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23663457 tttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtc 23663490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 140 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13365991 - 13365787
Alignment:
Q  140 aaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 238  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13365991 aaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatctccc 13365892  T
Q  239 acaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttt-gcttagattttaagctactct 337  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13365891 taaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttggcttagattttaagctactct 13365792  T
Q  338 atttt 342  Q
    |||||    
T  13365791 atttt 13365787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20038858 - 20038652
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  20038858 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 20038760  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20038759 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagaatttgcacggccgtgccaccctccagagttgtttttgctgcttttgcttagattttaagctac 20038660  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  20038659 tctatttt 20038652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8322723 - 8322519
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8322723 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaaaatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8322625  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8322624 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 8322526  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8322525 ctatttt 8322519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8329389 - 8329185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||  || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  8329389 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 8329291  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  8329290 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 8329192  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  8329191 ctatttt 8329185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 14820877 - 14821083
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||| | ||||||||||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  14820877 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggaggtgattcggtgcaaaaatacaaagattcggagacaaaaatatatc 14820976  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14820977 tccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 14821076  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  14821077 tctattt 14821083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 21049732 - 21049938
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  21049732 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 21049831  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | || || |||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21049832 cccccaagtcagaagtttggcacggcccgtgctaacataggcacagccgtgccacctcccataacaccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21049931  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21049932 ctatttt 21049938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 684 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21328520 - 21328410
Alignment:
Q  684 acgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21328520 acgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 21328421  T
Q  784 agattgtaaag 794  Q
    |||||||||||    
T  21328420 agattgtaaag 21328410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23903923 - 23904129
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23903923 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatacgtct 23904022  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |    
T  23904023 ccctcaagtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgcagcttttgcttggattctgaactatt 23904122  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23904123 ctatttt 23904129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 23911778 - 23911984
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  23911778 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatacgtct 23911877  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||| | | ||| |    
T  23911878 ccctcaagtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgcagcttttgcttggattctgaactatt 23911977  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23911978 ctatttt 23911984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 20263103 - 20263309
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  20263103 caggaacgaatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 20263202  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | | || || |||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20263203 cccccaagtcagaagtttggcacggcccgtgctaacataggcacagccgtgccacctcccataacaccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20263302  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20263303 ctatttt 20263309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 523 - 789
Target Start/End: Original strand, 6279871 - 6280136
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    |||||| | ||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||    
T  6279871 atgaacgtgagtgagtagactcttct-gccttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctaattttatata 6279969  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |   || || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| |||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  6279970 aatttactttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattaccaaactatagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatc 6280068  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  6280069 tcaaatatcaatttataaagcgaaagtggagttttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattg 6280136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Original strand, 20716768 - 20716929
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |||||| ||| |||    
T  20716768 cagggaagaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 20716866  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20716867 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga 20716929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 25461386 - 25461592
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  25461386 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 25461485  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||   |||| ||||| ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  25461486 tcccccaagtcagaagcttggcacgacccgtgctaaggttggcacggctgtgccacctcccagatagccttttgctgcttttgcttagattctaagctat 25461585  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  25461586 tctattt 25461592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20044504 - 20044307
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  20044504 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 20044406  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  20044405 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagaattggcacggccgtgccaccctccagagt---------tgcttttgcttagattttaagctac 20044315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 151 - 342
Target Start/End: Original strand, 22830957 - 22831148
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaag 250  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22830957 gatggattgagtgttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcgcagacaaaaatatgtctcccccaagtcagaag 22831056  T
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  22831057 cttggcacggcccatgctaacattggcacggccgtgccacctcccagaacaccttttgctgcttttgcttagattttaagataccctatttt 22831148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 338
Target Start/End: Original strand, 26826193 - 26826395
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| |||| | | | |||||| ||| |||  ||||||||| |||||||    
T  26826193 caggaacgaatatttaatggattgagtctttgagcaaaagaaagggattttgagctgattcggtacgaaaatacgaatatttggagacaaaa-tatgtct 26826291  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26826292 cccccaaagtcagaagcttggcacggtccgtgctatcattggcacggccgtgccaccctctagagtcacttttgctacttttgcttagattttaagctac 26826391  T
Q  335 tcta 338  Q
    ||||    
T  26826392 tcta 26826395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 16183015 - 16183117
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16183015 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 16183114  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  16183115 ccc 16183117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 469 - 611
Target Start/End: Original strand, 29003700 - 29003842
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  29003700 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggata 29003799  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  29003800 agtctaatgacataatcctaatcaaaccaaaccataaacctta 29003842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 503 - 639
Target Start/End: Original strand, 23455684 - 23455820
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  23455684 tcttattctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccgagctt 23455783  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  23455784 taaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatcta 23455820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 342
Target Start/End: Original strand, 24034368 - 24034559
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaag 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24034368 gatggattgaatctcggagcaaaagaaaggggtttagagctgattcgg-gcaaaaatacgaagattcggacacaaaaatatgtctcccccaagtcataag 24034466  T
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |  | | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24034467 cttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccatctcctaggactgccgtttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 24034559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 469 - 592
Target Start/End: Original strand, 5579135 - 5579258
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 568  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  5579135 tttactttcttgttatttacttttatgcttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcatgtcttaggattgttggata 5579234  T
Q  569 agtctaatgacataatcctaatca 592  Q
    | ||||||||||||||||||||||    
T  5579235 aatctaatgacataatcctaatca 5579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 203 - 342
Target Start/End: Original strand, 20393087 - 20393226
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgc 302  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  20393087 aaaatacgaagattcggagacaaaaatatatcttccccaagtcagaaacttggaacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagagtca 20393186  T
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20393187 ctttcgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 20393226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 350 - 463
Target Start/End: Original strand, 20393257 - 20393370
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20393257 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 20393356  T
Q  450 tctttctaataaaa 463  Q
    ||||||||||||||    
T  20393357 tctttctaataaaa 20393370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 19756644 - 19756844
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | ||| ||||||||||||  |||||||||| || ||||||  |    
T  19756644 gaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacaacaatatgaagattcggagacaaaaaaatatctccctaa 19756743  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19756744 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 19756843  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  19756844 t 19756844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Original strand, 26013086 - 26013218
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||     
T  26013086 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatgaagtcttaaaccctaatt 26013185  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26013186 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcacc 26013218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18231037 - 18230831
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||| || |||| ||||    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18231037 caggaacgaatatttgatggatcgagtcttggagtaaaagaaagggatttggagctgattcagagcaaaaatacgaagatttagagataaaaatatgtct 18230938  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
     ||  |||||| |||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |  |||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18230937 tcccaaagtcaaaagcttggcatggcccgtgctaacattggcacggccgtgccatctcccagaacaccttttgctgcttttgcttatattttaagctacc 18230838  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  18230837 ctatttt 18230831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 1990464 - 1990196
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||     
T  1990464 tgtctacaatggacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccttaatt 1990365  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||   || || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| |||| ||||||   ||| ||||   |||||||||  |||||||| ||    
T  1990364 ttatataaatatactttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaattaccaaact-aagaagcgaacacggagggtttagtaattgttaat 1990266  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1990265 tcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaacgcagagctttgatattggaacaagtgaaattagacaa 1990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21098671 - 21098465
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| |||||||||||||    ||| |||||||||||    
T  21098671 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgattcggtgcagaaatatgaagattcgatgac-aaaatatgtct 21098573  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||| | | |||     
T  21098572 cccccaaagtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgcagcttttgcttggattctgaactat 21098473  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  21098472 tctatttt 21098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 384 - 783
Target Start/End: Original strand, 21139645 - 21140049
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttt 476  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||   || ||     
T  21139645 ctataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgtctttcttaataaaagttatttctttatttc 21139743  T
Q  477 tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct 573  Q
    | ||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21139744 tttgttattta-ttttatg--ttct-tcttcttctcttctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagatttttggataagtct 21139839  T
Q  574 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatc 672  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |  |||||| |||| |||| |||  ||| || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| |||| |    
T  21139840 aatgacgtaatcctaatcaaactaaaccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttttataatgaattaacaattacc 21139939  T
Q  673 aaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtg 772  Q
    |||||    || |||| | |||||||| | |||||||| || ||||||||  |||||||||| ||||| |||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  21139940 aaactcataaagcgaatgcggagggttag-taattgttaattcatcatctaaaatatcaatttataaagcgaacgcggggctttgatattggaacaagtg 21140038  T
Q  773 aatttagacaa 783  Q
    || ||||||||    
T  21140039 aaattagacaa 21140049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 6279422 - 6279629
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||| |||| |   | |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  6279422 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggggtttggagctgattcggaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtc 6279521  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |  ||| |||| |||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6279522 tcccccaagccagaagcttggcacgacccgtgctcccactggcacggtcgtgccacctcccaggatctccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 6279621  T
Q  334 ctctattt 341  Q
    ||||||||    
T  6279622 ctctattt 6279629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 18398965 - 18399171
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||  ||  | | |||| |  ||||||||| |||||||  ||| ||||||||| |||    
T  18398965 caggaatgaatatttgatggattgagtgttggagcaaaacaaaggggtttgaaactgatttggagcaaaaatacgaagattcggaggcaaaaatatatct 18399064  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18399065 cccccaagtcagaagcttgacacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacacacttttgctgcttttgcttagattctaagctact 18399164  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    || ||||    
T  18399165 ctgtttt 18399171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 713 - 794
Target Start/End: Original strand, 27063439 - 27063520
Alignment:
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27063439 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 27063520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 145 - 342
Target Start/End: Original strand, 27086374 - 27086569
Alignment:
Q  145 atattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagt 244  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |  |||| ||||    
T  27086374 atatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatctggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatcttcccca-aagt 27086471  T
Q  245 cagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  27086472 cagaagtttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgattagattttaagctactctgtttt 27086569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 713 - 794
Target Start/End: Original strand, 27092551 - 27092632
Alignment:
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27092551 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 27092632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 23193915 - 23193640
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| || |||||||||    
T  23193915 tgtctacaataaacgtgagtgagtagactcttcttgtctcgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccttaatcaaatcaagccttgaaccttaat 23193816  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata-tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
     |||| |||  ||| || || |||||| ||||||  | | ||| || || ||| | |||||||||   ||| ||||||||||||||| | || ||||| |    
T  23193815 tttatataaatctactttctaatctaatttcaccgttgttataatgaattaacaaatatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-tatttgttaa 23193717  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23193716 ttcatcatctcaaatgtcaattcataaagcgaaagtagagttttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 23193640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 23879547 - 23879678
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  23879547 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 23879646  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23879647 cccccaagtcaaaagcttggcacggcccgtgc 23879678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Original strand, 22853726 - 22853859
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||  |||    
T  22853726 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggagcaaaaatatgaagatttggagacaaaaatacatct 22853825  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22853826 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 22853859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 45569873 - 45569975
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45569873 caggaatgaaaattagatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 45569972  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  45569973 ccc 45569975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 21939874 - 21939722
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattgg-atggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |   ||||||||  |||||||  |||||||| ||||||    
T  21939874 caggaatgaatattgggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttggcacaaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtc 21939776  T
Q  235 tcccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgc 287  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21939775 tcccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgc 21939722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 503 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 14162121 - 14161978
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  14162121 tcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcat 14162023  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
      |||| |||| ||||||||  |||||| || |||||| ||||||    
T  14162022 cgaaccctaattttatgtaaatctaatttctaatctaatttcacc 14161978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Original strand, 21319537 - 21319669
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  21319537 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattcttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 21319636  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||  ||| || ||  ||||||||||||    
T  21319637 ttatgtaaatctattttctactctaaattcacc 21319669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 45466412 - 45466539
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||    
T  45466412 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatacatc 45466511  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  45466512 tccctcaagtcagaagctcggcacggcc 45466539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17504499 - 17504359
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  17504499 caggaatgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 17504400  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttg 275  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17504399 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttg 17504359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Original strand, 20002453 - 20002588
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  20002453 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 20002551  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 271  Q
     |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20002552 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 20002588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Original strand, 1685400 - 1685499
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1685400 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtctc 1685499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 9317574 - 9317705
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  || |||  |||| |  || |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  9317574 caggaatgaatattcgatggatcgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagttgattcgtagctaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 9317673  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9317674 cccgcaagtcagaagcttggcaccgcccgtgc 9317705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 24342173 - 24342280
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||     
T  24342173 tgtctacgattaacataagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtttaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 24342272  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  24342273 ttatgtaa 24342280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 511 - 599
Target Start/End: Original strand, 26854177 - 26854267
Alignment:
Q  511 tccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt--cttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26854177 tccttgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 26854267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 37300096 - 37299977
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  37300096 gaatatttgatgaattgaatctttgagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctcccccaa 37299997  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcc 262  Q
     |||||||||||||||||||    
T  37299996 atcagaagcttggcacggcc 37299977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 23502863 - 23502989
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||  ||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  23502863 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagtaaaagaaaggggtttggagctaattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 23502962  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  23502963 cccccaagtccgaagtttggcacggcc 23502989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 25363382 - 25363507
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| || |  ||||||| |||    
T  25363382 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattggga-agcaaaatatatct 25363480  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25363481 cccacaagtcagaagcctggcacggcc 25363507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 23670452 - 23670576
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||| |||| |||||||||||    
T  23670452 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattgaaagac-aaaatatgtct 23670550  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
     |||  ||||||||||||||||||||    
T  23670551 cccctaaagtcagaagcttggcacgg 23670576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 38350300 - 38350151
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || | ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||  |||||| ||    
T  38350300 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttgggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatctccctca 38350201  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| || |||||||    
T  38350200 agtcagaagcttggcatggcccgtgcgaggcttggcacgtccatgccacc 38350151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 599
Target Start/End: Original strand, 18008250 - 18008334
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18008250 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 18008334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 598
Target Start/End: Original strand, 24967355 - 24967451
Alignment:
Q  503 tcttcttctcct-tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24967355 tcttcttcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacgcaatcctaatcaaaccaa 24967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 503 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 19792214 - 19792071
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  |||| || |||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  19792214 tcttcttctctatgtcgacaatgaacgtgagtgagtagacttct--tgtcttgggattgttggatgaatctaatgacctaatcctaatcaaactaagcat 19792117  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacca 648  Q
    | |||| |||| ||||||||  ||| || || |||||| |||||||    
T  19792116 tgaaccctaattttatgtaaaactactttctaatctaatttcacca 19792071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 353 - 511
Target Start/End: Original strand, 25461636 - 25461805
Alignment:
Q  353 gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttc-ttggaatgcaatatgtgacaattgtc 451  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||| ||||    
T  25461636 gtaattgcttagattttaagtcaaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtaacaactgtc 25461735  T
Q  452 tttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttct 511  Q
    |||  ||||||||          ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25461736 ttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttct 25461805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22561028 - 22560947
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattg 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||||||    
T  22561028 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggattttgagcagattggacacgaaaatatgaagattg 22560947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 31469637 - 31469553
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31469637 tgtctacgatgaacatgggtgactagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagc 31469553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6673840 - 6673780
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6673840 acggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 6673780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18264764 - 18264644
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||  |||| |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18264764 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaagggttttggagttgatttggagcaaaaagacgaagattcggagacaaaaatatgtctccccca 18264665  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18264664 agtcagaagcttggcacggcc 18264644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18273777 - 18273657
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||| ||  |||| |  ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18273777 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaagggttttggagttgatttggagcaaaaagacgaagattcggagacaaaaatatgtctccccca 18273678  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18273677 agtcagaagcttggcacggcc 18273657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17516168 - 17516042
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  17516168 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 17516070  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  17516069 cccctaaagtcagaagcttggcacggcc 17516042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 19997139 - 19997265
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  19997139 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaacaaagggacttggagctgattcggtacgaaaataaaaagattggaagac-aaaatatgtct 19997237  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19997238 cccctaaagtcagaagcttggcacggcc 19997265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17516053 - 17515983
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516053 cttggcacggccgtgccacccttcagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 17515983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Original strand, 15634412 - 15634523
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  15634412 tctctttgtctacgataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattatttgatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaacc 15634509  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  15634510 ctaattttatgtaa 15634523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 509 - 622
Target Start/End: Original strand, 15636185 - 15636296
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacc 608  Q
    |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||    
T  15636185 tctctttgtctatgataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaacc 15636282  T
Q  609 ttaatcttatgtaa 622  Q
     |||| ||||||||    
T  15636283 ctaattttatgtaa 15636296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 23743873 - 23743808
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgc 201  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23743873 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgc 23743808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 457 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 24221584 - 24221418
Alignment:
Q  457 aataaaagttcat--ttacttttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtct 553  Q
    |||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |    
T  24221584 aataaaagttcatatttattttcttgttatttactttcatgttattct-tcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgctt 24221487  T
Q  554 tgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||| |  |||| ||||||| |||||    
T  24221486 tgggattgttggatgattctaatgacctaatccctgtcaaaccaagcctagaaccctaatcttgtgtaa 24221418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 22904701 - 22904817
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  22904701 tcttcttctctatgtctacgatgaatatgagtaagtggacttct-ttgt--tgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcct 22904797  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    | |||| |||||||||||||    
T  22904798 tgaaccctaatcttatgtaa 22904817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 37652528 - 37652648
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  37652528 gaatatttaatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacaaagattcggagacaaaaatatatctccctga 37652627  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  37652628 agtcagaagcttggcacggcc 37652648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 39731084 - 39730958
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  39731084 caggaatgaatatttgatgaattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagttgattcggtgcaaaaatacgaagattg-gagacaaaaatacatc 39730986  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||    
T  39730985 tgcctcaagtcagaagcttgacacggcc 39730958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 258
Target Start/End: Original strand, 5578791 - 5578912
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| ||||    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  5578791 caggaatgaatgtttgatggattgaattttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcagagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 5578890  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcac 258  Q
     || ||||||||||| |||||||    
T  5578891 tcc-caagtcagaagattggcac 5578912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 384 - 467
Target Start/End: Original strand, 17126790 - 17126877
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17126790 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 17126877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25751935 - 25751879
Alignment:
Q  286 gccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25751935 gccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactttatttt 25751879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25751992 - 25751933
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25751992 aaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctccccaaagtcagaagcttggcacggcc 25751933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43836518 - 43836475
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttag 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43836518 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttttag 43836475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 29325044 - 29325169
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct- 235  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |     
T  29325044 aggaacgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtttc 29325142  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||    
T  29325143 ccctaaagtcataagcttggcacggcc 29325169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6570659 - 6570572
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6570659 ctataaatagaggagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 6570572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14162523 - 14162412
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttg 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| |     ||||||  |||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14162523 gattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcgggttgaaaatacaaagattca-atacaaaaatatgactcccccaagtcagaagcttg 14162425  T
Q  255 gcacggcccgtgc 267  Q
    |||||||||||||    
T  14162424 gcacggcccgtgc 14162412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14351845 - 14351805
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14351845 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 14351805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Original strand, 9317721 - 9317760
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9317721 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 9317760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Original strand, 23503009 - 23503048
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23503009 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 23503048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42418904 - 42418719
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaa-gattgagagacaaaaatatgt 233  Q
    |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||| |     |||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42418904 caggaatgaatacttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattaggagctgattcgggttgaaaatacgaaagattga-agacaaaaatatgt 42418806  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcc-ttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
     |||| |||||||||||||||||| |||| |||| | |  |||| ||||||||||||||| || |||   ||||||||||||||||||    
T  42418805 ttccc-caagtcagaagcttggcatggccagtgccaccagttggcacggccgtgccacccccctgagcctcttttgctgcttttgctt 42418719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 342
Target Start/End: Original strand, 5578934 - 5578976
Alignment:
Q  300 tgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5578934 tgccttttgctgcttttggttagattttaagctactctatttt 5578976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 18161883 - 18161921
Alignment:
Q  304 ttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161883 ttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 18161921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 514 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 18572289 - 18572182
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||  |||||||||||| |  |||| |||    
T  18572289 ttgtctacgatgaatatgagtgagtaga--tctctatgtcttgggattgtttgatgagcctaatgacctaatccctatcaaaccaagcatagaaccctaa 18572192  T
Q  613 tcttatgtaa 622  Q
    |||| |||||    
T  18572191 tcttgtgtaa 18572182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 523 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 23221478 - 23221400
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||| | ||||| ||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23221478 atgaacgtgagtgaatagactcttcttgtcttgggattgctgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagc 23221400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Original strand, 21814555 - 21814604
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21814555 caggaatgaatattggatgggttgagtcttggagcaaaagaaagggactt 21814604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Original strand, 37652637 - 37652706
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||| ||||||  ||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37652637 cttggcacggccaggccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 37652706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 620
Target Start/End: Original strand, 24887112 - 24887217
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  |||||||||||| |  |||| |||    
T  24887112 ttgtctatgatgaacatgagtgattaga--tctctatgtcttgggattgttggatgagtataatgacttaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaa 24887209  T
Q  613 tcttatgt 620  Q
    ||||||||    
T  24887210 tcttatgt 24887217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 739 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 6570389 - 6570334
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||    
T  6570389 aaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaaattagttaaggattgtaaag 6570334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 16418490 - 16418451
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16418490 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 16418451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18264655 - 18264588
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18264655 cttggcacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttaaattttaagctactcta 18264588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18273668 - 18273601
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactcta 338  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18273668 cttggcacggccgtgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttaaattttaagctactcta 18273601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 22991017 - 22991076
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  22991017 caggaacgaatattggatagattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgatt 22991076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 43836581 - 43836538
Alignment:
Q  219 gagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  43836581 gagacaaaaatatgtctaccccaagtcagaagcttggcacggcc 43836538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1631889 - 1631827
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattgga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  1631889 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattgga 1631827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 514 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 25432016 - 25431913
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||| |  |||| |||    
T  25432016 ttgtctatgatgaacatgactgattaga--tctctatgtcttgggattgttggatgagtctaatgacttaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaa 25431919  T
Q  613 tcttat 618  Q
    ||||||    
T  25431918 tcttat 25431913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 420
Target Start/End: Original strand, 19756873 - 19756934
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatc 420  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  19756873 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatc 19756934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 22284665 - 22284791
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgattggatgcaaaaatatg-aagattgagagacaaaaatatgt 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||| |     |||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  22284665 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattaggagctgattcgggttgaaaatacgaaagattga-agaccaaaatatgt 22284763  T
Q  234 ctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22284764 ttccc-caagtcagaagcttggcacggcc 22284791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 342
Target Start/End: Original strand, 22853891 - 22853923
Alignment:
Q  310 tgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22853891 tgcttttgcttagattttaagctactctatttt 22853923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 419
Target Start/End: Original strand, 27086598 - 27086658
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcat 419  Q
    |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  27086598 gcttagattttaagtcgaataaaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcat 27086658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 309 - 341
Target Start/End: Original strand, 45466556 - 45466588
Alignment:
Q  309 ctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45466556 ctgcttttgcttagattttaagctactctattt 45466588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #202
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 384 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 14878399 - 14878356
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  14878399 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctt 14878356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #203
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Original strand, 17126555 - 17126598
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17126555 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaag 17126598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 342
Target Start/End: Original strand, 29325188 - 29325219
Alignment:
Q  311 gcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29325188 gcttttgcttagattttaagctactctatttt 29325219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 14878643 - 14878526
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag-ggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaa-gattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |  |||| |||| |     |||||| ||| |||||| |||||||||||||| | || ||    
T  14878643 aatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattaggagctgattcgggttgaaaatacgaaagattga-agacaaaaatatgttttcccca 14878545  T
Q  242 agtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14878544 agtcagaagcttggcacgg 14878526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38350139 - 38350109
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38350139 cttttgcttagattttaagctactctatttt 38350109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 39730939 - 39730897
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattttt 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  39730939 gccttttgctgtttttgcttagatttcaagctactttattttt 39730897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 14351779 - 14351706
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  14351779 atgtaattgtttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacagatattcatctttt 14351706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 18161947 - 18162020
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |   |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||    
T  18161947 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaattataaatagagtatctacccatcacaaatattcatctttt 18162020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 43836643 - 43836598
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43836643 caggaatgaatatttgatggattgagtcttagagcaaaagaaaggg 43836598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 489; Significance: 0; HSPs: 135)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 489; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 794
Target Start/End: Original strand, 13250477 - 13251128
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa- 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||  ||     
T  13250477 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtctcccctaaa 13250575  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250576 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagaatgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 13250675  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 442  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250676 tagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtg 13250775  T
Q  443 acaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 541  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250776 acaattgtctttctagtaaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtaga 13250875  T
Q  542 cttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||    
T  13250876 cttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccgtaatctctaatctaaa 13250975  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13250976 ttcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaa 13251075  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13251076 cgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 13251128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 3984998 - 3985648
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  3984998 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 3985096  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  3985097 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagt---------tgcttttgcttagattttaagctac 3985187  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3985188 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataataatcttttcttggaatgc 3985287  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3985288 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 3985387  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3985388 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 3985487  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3985488 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 3985587  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3985588 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 3985648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 3990277 - 3990927
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  3990277 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 3990375  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||    
T  3990376 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagt---------tgcttttgcttagattttaagctac 3990466  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3990467 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataataatcttttcttggaatgc 3990566  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  3990567 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 3990666  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3990667 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 3990766  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3990767 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 3990866  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3990867 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 3990927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 16485009 - 16485669
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | | |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  16485009 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggaactgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 16485108  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16485109 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactatttttgctgcttttgcttagattttaagctac 16485208  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16485209 tatatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatatgcatcttttcttggaatac 16485308  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  16485309 aataggtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcag 16485408  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16485409 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 16485508  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16485509 tatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaat 16485608  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16485609 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 16485669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 434; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 27911699 - 27911027
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  27911699 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 27911600  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911599 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 27911500  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||||||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27911499 tctattttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 27911400  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911399 ttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 27911300  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911299 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 27911200  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911199 accctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 27911100  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27911099 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 27911027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 137 - 794
Target Start/End: Original strand, 20393304 - 20393973
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20393304 aggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagcggattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 20393403  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20393404 ccccaagtcagaagcctgacacggcccgtgctagccttggcacggtcgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 20393503  T
Q  337 tatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaa 436  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20393504 tatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaatacaa 20393603  T
Q  437 tatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    || ||| ||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||    
T  20393604 taagtgccaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacttttatgcttcctctcttctcccccatgtctacgatg 20393702  T
Q  526 aacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20393703 aacatgagtgcgtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgagataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 20393802  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20393803 cctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 20393902  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  20393903 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattttgacaaggattgcaaag 20393973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 20231228 - 20231898
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20231228 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20231327  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20231328 cacccaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20231427  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  20231428 atatttttagcccgaatgtaatagcttagattttgagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattaatctttacttggaataca 20231527  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  20231528 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 20231627  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20231628 aacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 20231727  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20231728 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 20231827  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20231828 aaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20231898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 20237794 - 20238464
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20237794 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttagagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20237893  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20237894 cccccaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacgaccgtgccaccctccagagtcactttttctgcttttgcttagattttaagctact 20237993  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  20237994 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaataca 20238093  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||          ||| ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  20238094 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttcttttcctttactttcttatcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatg 20238193  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  20238194 aacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctatgccttaatcttatgtaac 20238293  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20238294 cctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattcc 20238393  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20238394 aaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20238464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 23502166 - 23501496
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23502166 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 23502067  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23502066 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 23501967  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23501966 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagttgaacaaatgctataaatagagtagccttccatcacaaatattcatctttacttggaattca 23501867  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  23501866 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 23501768  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23501767 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 23501668  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    | |||||| ||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  23501667 ctctaatttcttatctgaattcactgtcttaacatggatcaaccattatcaagctgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 23501568  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  23501567 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 23501496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 41309863 - 41309199
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41309863 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 41309764  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  41309763 cccccaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagacttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgctttttgcttagatttcaagctac 41309664  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  41309663 tctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgaatgctataaatagagtagccatccatcaaaaatattcatctttacttggaatac 41309564  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttc----------atttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| |||||||           |||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||    
T  41309563 aataagtgacaattgcttttctaattaaagttcttttctctttctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttttcccccatgtctacgat 41309464  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||    
T  41309463 gaacatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagct-------ctaatcttatgtaa 41309371  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    || ||||| ||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |      
T  41309370 ccttaatttcttatctgaattcaccgcttaaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatttttc 41309271  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  41309270 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 41309199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 38045293 - 38045727
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38045293 gcttagattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 38045391  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38045392 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 38045491  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38045492 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 38045591  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38045592 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 38045691  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  38045692 tatttgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 38045727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 27047396 - 27047830
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27047396 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 27047494  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27047495 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 27047594  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27047595 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27047694  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27047695 gatcaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 27047794  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27047795 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27047830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19600266 - 19599617
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19600266 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcagagacaataatacgtct 19600167  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19600166 ccctcaagtcagaagcttggca---------------------cggccgtgccaccctccagaatcacttttgctgtttttgcttagattttaagctact 19600088  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19600087 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 19599988  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  19599987 ataagtgacgattgcttttctaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 19599889  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  19599888 gaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcaaagctctaagccttaatcttatgtaa 19599789  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  19599788 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattc 19599689  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  19599688 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 19599617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 27041642 - 27042076
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||| || |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27041642 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatggaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt-tttctaa 27041740  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27041741 taaaagttcatttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggga 27041840  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  27041841 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27041940  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041941 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 27042040  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27042041 tattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 27042076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 28206732 - 28206055
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  28206732 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 28206633  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206632 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttgtcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 28206533  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  28206532 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 28206433  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||| ||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28206432 ttgttctcagaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaaattcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctcca- 28206336  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206335 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 28206236  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28206235 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccactttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 28206136  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28206135 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 28206055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 2385951 - 2386620
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  2385951 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatatc 2386050  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||||      |||||||||| ||||| |||    |||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2386051 tccctcaagtcagaaacttg------cccgtgctaggcttggcacg----tgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 2386140  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2386141 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 2386240  T
Q  423 ttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcct-- 514  Q
    || ||   ||||   |||| ||||||||||| | | | |||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2386241 ttgttctcggaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtttacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctcc 2386339  T
Q  515 -tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2386340 atgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaat 2386439  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2386440 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgt 2386539  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2386540 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaattggagttttgatattcgaacaagtgaatttagaaaaagattgtaaag 2386620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18885548 - 18885099
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||    
T  18885548 atgtaattacttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgaaaattg 18885449  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18885448 tctttctaataaaagttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 18885349  T
Q  545 ctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||    
T  18885348 ct--tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaaccttaatcctatgtaaccctaatctataatctaaat 18885251  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    ||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18885250 tcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 18885151  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18885150 gaaagtggatctttgatattcgaacatgtgaatttagataaagattgtaaag 18885099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 360 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 49379790 - 49379342
Alignment:
Q  360 cttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct 456  Q
    |||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49379790 cttagattctaagtcgaatgtagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttct 49379691  T
Q  457 -aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc 545  Q
     ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49379690 taataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctccatgtctacgatgaacaagagtgagtagacttc 49379591  T
Q  546 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 645  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  49379590 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaccctaatcttatgtaatcctaatctctaatctaaattca 49379491  T
Q  646 ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaa 745  Q
    ||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  49379490 ccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaa 49379391  T
Q  746 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49379390 agtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 49379342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 36850510 - 36850054
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  36850510 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtcaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 36850411  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||| |||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  36850410 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttaattttatgcttttcttcttcttctcaatgtctacgatgaacatgagtga 36850311  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||    
T  36850310 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaat 36850212  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||| | ||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36850211 ctaaattcactattttaacatgaattaaccattattaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattca 36850112  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36850111 taaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 36850054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Original strand, 8653688 - 8654134
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||| | ||||||||    
T  8653688 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttaaccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaacaagtgacaat 8653787  T
Q  448 tgtctttctaataaaagttcatttacttttctgt----------tatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| |          |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  8653788 tgtctttctaataaaagttcttttctttttctttactttcttattatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagcga 8653886  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  8653887 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaa 8653986  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  8653987 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcttaaatatcaattc 8654086  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8654087 ataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 8654134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2395435 - 2394988
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  2395435 gcttagattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 2395336  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc- 547  Q
    | ||||||| |||| ||| ||          ||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  2395335 ttaaagttcttttattttcctttactttcttgtcttttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcc 2395236  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  2395235 ttgtcttgggattgttggacaagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctggattcac 2395136  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2395135 cgtcttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 2395036  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||    
T  2395035 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcaaacaaggattgcaaag 2394988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 20399553 - 20399995
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| |||  |||||||    
T  20399553 gcttagattctaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaatattcatctttacttggaatacaataagtgacatttgcttttctaa 20399652  T
Q  459 taaaagttcatttacttt-----tctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtc 552  Q
    | ||||||| ||| ||||     | |||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20399653 ttaaagttcttttcctttatttctttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtc 20399752  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactt 651  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |    
T  20399753 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtct 20399852  T
Q  652 taatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgga 751  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  20399853 taacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtgga 20399952  T
Q  752 gctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  20399953 gctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 20399995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 354 - 794
Target Start/End: Original strand, 41461664 - 41462117
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    |||| ||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||    
T  41461664 taattgcttagaatctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgt 41461763  T
Q  451 ctttct-aataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||| ||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  41461764 ctttcttaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgttttttcccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 41461863  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || |||||    
T  41461864 tacttctcttgtcttgggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccct-aatcttatgtaacccgaatttctaatcta 41461962  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||| | |||||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41461963 aattcactattttaacttgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaagttgaaggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataa 41462062  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41462063 aacgaaagtgaagctttgatattcgaacaaatgaatttagacaaggattgtaaag 41462117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 22841646 - 22842093
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  22841646 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 22841745  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  22841746 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 22841845  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  22841846 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 22841945  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  22841946 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 22842045  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  22842046 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 22842093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Original strand, 4028244 - 4028686
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||| || ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4028244 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatataggagctagccatcactaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 4028343  T
Q  451 ctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||          |||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| || |||||    
T  4028344 ctttctaataaaagttcttttattttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttcttcatgtctacgatgaacatgagcgagta 4028442  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || ||||    
T  4028443 gacttctcttgtcttgggattgctggataagtcttaatgacataatcctaatcaaactaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatct 4028542  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4028543 aaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaa-ctgtgtaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 4028641  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4028642 aaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 4028686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 136 - 423
Target Start/End: Original strand, 22967177 - 22967464
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22967177 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgggagacaaaaatatgtct 22967276  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22967277 tccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggctgtgccaccctccagagtcacttttgctgcctttgcttagattttaagctact 22967376  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22967377 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcataaatattcatcttt 22967464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17094233 - 17093786
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  17094233 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 17094134  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17094133 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 17094034  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17094033 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgtaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 17093934  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17093933 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 17093834  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  17093833 gtggagctttgatattcgaacaagtaaattcagacaaggattgcaaag 17093786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 384 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 46143663 - 46143253
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcattt-------- 471  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||            
T  46143663 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcattttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttctcaataaaagttcttttcttttcct 46143564  T
Q  472 --acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
      |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46143563 ttactttcttgttatttacttttatgtttttcctcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtatacttcttttgtcttgggattgttggataa 46143464  T
Q  570 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccatt 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||    
T  46143463 gtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttacaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccatt 46143364  T
Q  670 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46143363 atcaaactttagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaataa 46143264  T
Q  770 gtgaatttaga 780  Q
    |||||||||||    
T  46143263 gtgaatttaga 46143253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 384 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 8953610 - 8953200
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagtt----------catttac 473  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||          | |||||    
T  8953610 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattatctttctaataaaagttattttcttttcctttac 8953511  T
Q  474 ttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtc 572  Q
    |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8953510 tttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtc 8953412  T
Q  573 t-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||| |||||  || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||    
T  8953411 ttaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaactctaatctctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattat 8953312  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8953311 caaactgtggaaaagaaaatggaaggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagatttgatattcgaacaagt 8953212  T
Q  772 gaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||    
T  8953211 gaatttagacaa 8953200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17102069 - 17101622
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  17102069 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 17101970  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  17101969 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 17101870  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17101869 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgtaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcac 17101770  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  17101769 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgacagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 17101670  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  17101669 gtggagctttgatattcgaacaagtaaattcagacaaggattgcaaag 17101622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 503 - 794
Target Start/End: Original strand, 17986659 - 17986949
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  17986659 tcttcttctctatgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagttt 17986758  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986759 taaccct-aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 17986857  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17986858 taattgttaatccatcatctcaaatatcaaatcataaaaagaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 17986949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 44538347 - 44538627
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44538347 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatacgagtaaatgacataattctaatcaaaccaaactttaaaccttaat 44538446  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44538447 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 44538546  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44538547 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 44538627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21798295 - 21797849
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  21798295 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 21798197  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21798196 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 21798097  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21798096 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 21797997  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21797996 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 21797897  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21797896 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21797849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 21805003 - 21804557
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcac-aaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttcta 457  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||| |    
T  21805003 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcactaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttc-a 21804905  T
Q  458 ataaaagt---------tcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
    |||||  |         || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  21804904 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 21804805  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  21804804 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 21804705  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21804704 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 21804605  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  21804604 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 21804557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 136 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 20085737 - 20085527
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20085737 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 20085638  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20085637 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 20085538  T
Q  336 ctatttttagc 346  Q
    |||||||||||    
T  20085537 ctatttttagc 20085527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 18816298 - 18816744
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||   || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  18816298 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaa---ttgatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 18816394  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18816395 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 18816494  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  18816495 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagacttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 18816594  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||    
T  18816595 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataa 18816694  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18816695 aacgaaagtagagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 18816744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 26134508 - 26134228
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  26134508 tgtctacaatgaatgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagttttaaaccttaat 26134409  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26134408 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaactattatcaaactgtggaaacgaaagtggggggtttgataattgttaat 26134309  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26134308 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaggtgaatttagacaaagattgtaaag 26134228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 8648979 - 8649248
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  8648979 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 8649078  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || || ||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8649079 cttatgtaaccctaatctctaatataaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 8649178  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8649179 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 8649248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 490 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19880094 - 19879791
Alignment:
Q  490 tttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaa 589  Q
    ||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19880094 tttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcc-aa 19879996  T
Q  590 tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaa 689  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||  | ||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19879995 tcaaaccaagccttaaaccctaatcttacgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttgtaacatgaattaaccattatcaaactgtagaaacgaaa 19879896  T
Q  690 gtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19879895 gtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 19879796  T
Q  790 taaag 794  Q
     ||||    
T  19879795 caaag 19879791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 516 - 794
Target Start/End: Original strand, 17716862 - 17717139
Alignment:
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatct 615  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17716862 gtctacaatgaacgttagtgagtatgcttctcttgtcttgggatggttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatct 17716960  T
Q  616 tatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 715  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17716961 tatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatcc 17717060  T
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17717061 atcatctaaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 17717139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 359 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 22660199 - 22659828
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  22660199 gcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaa 22660100  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct 548  Q
    ||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  22660099 taaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacataagtgagtagacttccct 22660000  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  22659999 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcacc 22659900  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 719  Q
      ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22659899 gttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaatgaaagtggagggtttgataattgttaatcaatca 22659828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 423 - 794
Target Start/End: Original strand, 25726967 - 25727341
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || ||   ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  25726967 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttccttgttattttactttatgcttttcttcttcttctccatgtc 25727066  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  25727067 tactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaattttat 25727166  T
Q  619 gtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc 718  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  25727167 gtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggg-ttaataattgttaattcatc 25727265  T
Q  719 atctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  25727266 atctcaaatatcaattcgtaaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatatagacaaggattgcaaag 25727341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 423 - 794
Target Start/End: Original strand, 25735375 - 25735749
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||   || ||   ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  25735375 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttctttctttatttccttgttattttactttatgcttttcttcttcttctccatgtc 25735474  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  25735475 tactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaattttat 25735574  T
Q  619 gtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatc 718  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| || ||||    
T  25735575 gtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggaggg-ttaataattgttaattcatc 25735673  T
Q  719 atctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  25735674 atctcaaatatcaattcgtaaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatatagacaaggattgcaaag 25735749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19788436 - 19787979
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  ||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  19788436 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaataatcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 19788337  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcatttacttttctgttatttactt-----------ttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||| || |||           ||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| | ||    
T  19788336 tgtctttcttaataaaagttc-tttacttttcctttactttcttgttgttttactttatgattttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgactg 19788238  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||  | |    
T  19788237 agtagactcttcttgtcttgggattgttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaattttatataaccctaatttgtaa 19788138  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    |||||||||||   || || ||| || ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||     
T  19788137 tctaaattcactgtttcaacatgaattaaccattatcaaactatagaagcgaaagtatagggtttgataattgctaatccataatctcaaatatcaattt 19788038  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19788037 ataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 19787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 39286608 - 39286339
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagct-ttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||    
T  39286608 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaat 39286509  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  39286508 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaaaatgaattaaccattattaaactgtgaaaacgaaagcgaagggtttgataattgttaat 39286409  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39286408 tcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 39286339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 21792490 - 21792046
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||| ||    | |||  |||| |||||||    
T  21792490 atgtaattgtttagattttaagtcgaatgtac-ctataaatagagtagctagccatgacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaa 21792394  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  21792393 ttgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagagagtagact 21792294  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||    
T  21792293 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaa 21792194  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaa 741  Q
    |||| |  ||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||||    
T  21792193 ttcaacgttttaacatggattaaatattatcaaattgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaa 21792094  T
Q  742 cgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21792093 cgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 21792046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 16431660 - 16431928
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  16431660 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttggaatcgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaatt 16431759  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||    
T  16431760 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaaatggagggtttaataattgttaatc 16431859  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16431860 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 16431928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 490 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19875137 - 19874833
Alignment:
Q  490 tttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaa 589  Q
    ||||||||||   ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19875137 tttatgcttttcttcttcttctctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaa 19875038  T
Q  590 tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaa 689  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||||| ||||  ||  ||||    
T  19875037 tcaaaccaagacttaaaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaacctgtaaaagtgaaa 19874938  T
Q  690 gtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19874937 gtggagggtttgataattgttaattcatcatatcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 19874838  T
Q  790 taaag 794  Q
     ||||    
T  19874837 caaag 19874833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 503 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 19772190 - 19771902
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19772190 tcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcgtataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaagctt 19772091  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacc-attatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  || || ||| || |||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  19772090 taaaccctaatcttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaattaaccaattatcaacctgtagaagcgaaagtggagggtatg 19771991  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19771990 ataattgttaatccatcatctcaaatatcaattaataaaaccaaagtggagtgttgatattcgaacaagtgaattcagacaaagattgt 19771902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 457 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 21784256 - 21783921
Alignment:
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtctt 554  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  21784256 aataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttttctatgtctacaatgaacgttaatgagtagacttttcttgtctt 21784157  T
Q  555 gggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttt 652  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||    
T  21784156 gggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaactttaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgtttt 21784057  T
Q  653 aatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag 752  Q
    || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21784056 aacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggag 21783957  T
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  21783956 ctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggatt 21783921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 41802386 - 41802659
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  41802386 tgtctacaatgaacgttactgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacactaatc 41802485  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||    ||||| ||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41802486 ttatgtaaccttagtttctaatctaaattcattgttttaacatgaattaaccattatcaaagtgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 41802585  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41802586 catcatctcaaatatcaattcataaaacg-aggtggggttttgatattcgaacaagtgaatttagacaatgattg 41802659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 28207998 - 28208270
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28207998 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttcggattcttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatc 28208097  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||   ||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  28208098 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaacaattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggttag-taattgttaatt 28208196  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  28208197 catcatctcaaata-caattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttcgacaaggattg 28208270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 515 - 766
Target Start/End: Original strand, 48256412 - 48256662
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  48256412 tgtctacaatgaacgttagtgagtagattcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacct-aatt 48256510  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||  ||||| || || |||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48256511 ttatgtaacattaatttctaatataaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 48256610  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaa 766  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48256611 tatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaa 48256662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 548 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12060440 - 12060195
Alignment:
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  12060440 ttgttttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatccaaccaagctttaactct-aatattatgtaaccctagtttctaatctaaattcacc 12060342  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
      ||||| ||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  12060341 gttttaacatgaattaaccgttatcaaactgtagaaacgaaagtggagggtttgataattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgagag 12060242  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12060241 tggagttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 12060195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 427 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 16365375 - 16365097
Alignment:
Q  427 tggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctcctt 515  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |    
T  16365375 tggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgattt-tctccttcttctccat 16365277  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatct 615  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  16365276 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatct 16365177  T
Q  616 tatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16365176 tatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacgattatcaaaccgtggaaacgaaagtggag 16365097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2395680 - 2395475
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2395680 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagaagattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 2395582  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||| | ||||| |    
T  2395581 cccacaattcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagaacgccttttcctgcttttgcttggattctgagctatt 2395482  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  2395481 ctatttt 2395475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23291390 - 23291185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23291390 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagtaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 23291292  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  23291291 cccacaagtccgaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 23291192  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  23291191 ctatttt 23291185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 602 - 794
Target Start/End: Original strand, 41224620 - 41224813
Alignment:
Q  602 ttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttg 701  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  41224620 ttaaaccttaatcttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaaagaaaatggaaggtttg 41224719  T
Q  702 ataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat-aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41224720 ataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaaacgaaagtggagctttgatattcgattaagtgaatttagacaaagattgtaaag 41224813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22504435 - 22504228
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22504435 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagacacaaaaatatgtct 22504336  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22504335 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22504236  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  22504235 tctatttt 22504228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17094478 - 17094273
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  17094478 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcaaattggacacaaaaatataaagattgagagacaaat-tatgtct 17094380  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  17094379 cccataagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctaagctatt 17094280  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  17094279 ctatttt 17094273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17102314 - 17102109
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  17102314 cagggaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagcaaattggacacaaaaatataaagattgagagacaaat-tatgtct 17102216  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  17102215 cccataagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccatgccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctaagctatt 17102116  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  17102115 ctatttt 17102109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 21188840 - 21189046
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  21188840 caggaacgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 21188939  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21188940 ccccgaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggctcggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 21189039  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21189040 ctatttt 21189046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 136 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 17613393 - 17613228
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17613393 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaaaaaatagacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 17613294  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtg 301  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17613293 ccccttagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtg 17613228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21798539 - 21798335
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  21798539 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 21798441  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  21798440 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 21798342  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21798341 ctatttt 21798335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21805247 - 21805043
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||    
T  21805247 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaatatgaagattgggaaacaaaa-tatatct 21805149  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  21805148 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgccttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 21805050  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  21805049 ctatttt 21805043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 560 - 788
Target Start/End: Original strand, 19364789 - 19365020
Alignment:
Q  560 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatgg 659  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || || |||||||||||||  ||||| |||     
T  19364789 tgttggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttgtgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatga 19364888  T
Q  660 atcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag---cttt 756  Q
    || ||||||||||||||| |  ||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||    
T  19364889 attaaccattatcaaactttttaattgaaattggatggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttttt 19364988  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
     ||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  19364989 tatatttgaataagtgaatttagacaaggatt 19365020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 572 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22635637 - 22635420
Alignment:
Q  572 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||    
T  22635637 ctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaactctaattttatgtaaccctaatttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattat 22635538  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22635537 caaactatggaaacgaaagtggagggtttgatggtcgttaatccattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaagt 22635438  T
Q  772 gaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||| |||||    
T  22635437 gaatttagacaaggattg 22635420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 351 - 598
Target Start/End: Original strand, 22411044 - 22411305
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| | ||||||    
T  22411044 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttcttggaattcaataagagacaat 22411143  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22411144 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtga 22411243  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22411244 gtagactcttcttgtcttggaattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 22411305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 141 - 342
Target Start/End: Original strand, 22841407 - 22841606
Alignment:
Q  141 aagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccac 240  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| ||||||||    
T  22841407 aagaatattggatggagtgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatctcccac 22841505  T
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| ||||||    
T  22841506 aagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctattctatt 22841604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 523 - 790
Target Start/End: Original strand, 20412374 - 20412640
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| | ||| ||||||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  20412374 atgaacgtgagtaagtagactcttcttgtcttgagattgcgggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaccct-aattttatgtaa 20412472  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaata-tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||||||| || |||||||||||||  ||| ||| || || ||| | || ||||||   ||| ||||||||||||||| | |||||||| || |||||||    
T  20412473 ccctaatttctaatctaaattcaccgttttcataatgaattaacaaataccaaactcatgaagcgaaagtggagggttag-taattgttaattcatcatc 20412571  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  20412572 tcaaatatcaattcatgaagcgaaagtggagttttgatattggaacaagtgaatttagacaaggattgt 20412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 20399309 - 20399513
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  20399309 caggaaggaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 20399407  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  20399408 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccaga-tgtcttttgctgcttttgctttgactccaagctatt 20399506  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  20399507 ctatttt 20399513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22660444 - 22660238
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22660444 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 22660345  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22660344 cccttaagtcagaagcttgacacggcccgtgctaacattgccacggccgtgccacctcccagaacactttttgctgcttttgcttagattttaagctacc 22660245  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  22660244 ctatttt 22660238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 22135881 - 22136087
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||| |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  22135881 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggatttggagctgattcgttatgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgttt 22135979  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135980 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacgaccgtgccaccctccatattctcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 22136079  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  22136080 tctatttt 22136087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 41461410 - 41461616
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  41461410 caggaacgaatatttgattgattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatatgaatattcggagacaaaaatatgtct 41461509  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||  |||||   ||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  41461510 cctccaagtcagaagcttggcacggcccgtgttaacattggcacggccgtgccacctaccagaacaccttttgttgtttttgcttagattttaagttact 41461609  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  41461610 ctatttt 41461616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8953864 - 8953659
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  |||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||    
T  8953864 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttagagctgattcggagcaacaatacgaagattcggagacaaaattatgtctc 8953765  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||   |||| |||| |||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8953764 ccccaagtcagaagcttggcacggcacgtgctaagattggcacggtcgtgccacctcccagaacaccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 8953665  T
Q  337 tatttt 342  Q
    ||||||    
T  8953664 tatttt 8953659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 52755489 - 52755199
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| |||||||||||   ||  |||||||||||||||  | | |||| ||| |||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  52755489 gcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataaacattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttt 52755390  T
Q  456 --taataaaagttcatt---tacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag---acttctc 547  Q
      ||||||| |||| ||   || || | ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||   |||  ||    
T  52755389 cttaataaaggttctttctttatttctttgttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagtagactcttc 52755291  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||| || |||||    
T  52755290 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaacccctaactttatgtaaccctaatttctaatcta 52755199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 8653453 - 8653662
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8653453 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggggtttggagctgattcagagcaaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtc 8653552  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgc-ttttgcttagattttaagct 332  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8653553 tcctccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattgacacggccgtgccacctcccaggacaaccttttgctgctttttgcttagattttaagct 8653652  T
Q  333 actctatttt 342  Q
    ||| ||||||    
T  8653653 actttatttt 8653662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 241 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22504190 - 22504089
Alignment:
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22504190 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 22504091  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  22504090 tt 22504089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 52168777 - 52168977
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  || |||| ||||     | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  52168777 gaatatttgatggattgagtattggagcaaaagaaaggggtttggagctgattccgaacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtctcccccaa 52168876  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52168877 gtcagaagtttggcacggcccgtgctcccactggcacggccgtgccacctcccagaacttccttttgttgcttttgcttagattttaagctactctattt 52168976  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  52168977 t 52168977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Original strand, 22410813 - 22410946
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  22410813 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 22410912  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22410913 ccctcaagtcagaagcttggcatggcccgtgcta 22410946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49380052 - 49379844
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| ||| ||||    || || ||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  49380052 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaatgagttttggagctgattcagagcgaagatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 49379953  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| |  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49379952 tcccccaagttagaagcttggcatggcccgtgctaacattggcacggccgtgccatctcccaggacaaccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 49379853  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  49379852 ctctatttt 49379844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 18885741 - 18885585
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  18885741 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcgaagacaaaaatatatc 18885642  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  18885641 tccttcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttgtcacggtcgtgccacc 18885585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 503 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 28763865 - 28763576
Alignment:
Q  503 tcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28763865 tcttcttctcctctatgtttacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtagggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaa 28763766  T
Q  599 gctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 697  Q
    || || |||| |||| |||| |||   || || || |||||| |||||   | | || ||| || ||| | |||||||||    || |||||||||||||    
T  28763765 gccttgaaccctaattttatataaatatactttctaatctaatttcactgttatcataatgaattaacaaatatcaaactcataaagcgaaagtggaggg 28763666  T
Q  698 tttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
      | ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28763665 -ctaatatttgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaagcgaaagtggagtttcgatattggaacaagtgaaattagacaaggatt 28763576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 25646651 - 25646525
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  || |||| |||| ||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  25646651 caggaacgaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagaaagaggtttagagctgattcgatacaaaaatacgaagatttggagacaaaaatatgtct 25646552  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25646551 cccccaagtcagaagcttggcacggcc 25646525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 38045048 - 38045253
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  38045048 aggaacgaatatttgattgattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatctc 38045146  T
Q  237 ccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  38045147 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgttaggattggcacggccgtgccaccctccaagacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 38045246  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  38045247 ctatttt 38045253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 479 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 52235885 - 52235791
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct 573  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52235885 tgttatttacttttatgcttttcctcttcttctcaatgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtct 52235791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 27041458 - 27041549
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  27041458 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 27041549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 227
Target Start/End: Original strand, 27047212 - 27047303
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  27047212 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa 27047303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 598
Target Start/End: Original strand, 52169093 - 52169188
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52169093 tcttcttctccatgtctacgatgaacatgattgagtaaactcttcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 52169188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21792738 - 21792532
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  21792738 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 21792639  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    | || ||||||| || |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||     ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||    
T  21792638 ttcctcaagtcaaaaacttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccaggacaactttttctgcttttatttagattctaagctac 21792539  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  21792538 tctattt 21792532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 503 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 13799424 - 13799281
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  13799424 tcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcat 13799326  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
      |||| |||| ||||||||  |||||| || |||||| ||||||    
T  13799325 cgaaccctaattttatgtaaatctaatttctaatctaatttcacc 13799281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 4028017 - 4028143
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  4028017 caggaacgaatatttaatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttagagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 4028116  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  4028117 cctccaagtcagaagcttggcacggcc 4028143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Original strand, 22824383 - 22824443
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22824383 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattg 22824443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 598
Target Start/End: Complemental strand, 12059754 - 12059671
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12059754 tgtctacaatgaacattagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctgatcataatcaaaccaa 12059671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 25646434 - 25646358
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  25646434 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctt 25646358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 16384928 - 16384822
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||| ||||     
T  16384928 tgtctacaatgaacatgagtgagcagacttct-ttctcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaatt 16384830  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  16384829 ttatgtaa 16384822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 21924775 - 21924881
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||| ||||     
T  21924775 tgtctatgatgaacatgagtgagtagtctttt-ttgtcttgggattgttagatgagtctaatgacttaatcctattcaaaccaagcctaaaaccctaatt 21924873  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  21924874 ttatgtaa 21924881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 503 - 598
Target Start/End: Original strand, 26194338 - 26194432
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  26194338 tcttcttctctatgtctacaattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaa 26194432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 18816070 - 18816195
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | | |||||||| |||| ||  ||||||||||||| |     
T  18816070 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacaaaaatacgaaggttcggagacaaaaatatata 18816169  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  18816170 tccctcaagtcagaaacttggcacgg 18816195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 519 - 600
Target Start/End: Original strand, 24680262 - 24680341
Alignment:
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24680262 tacgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataat-cttatcaaaccaagc 24680341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Complemental strand, 25405053 - 25404968
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25405053 tgtctacaatgaacatgagtgagtaaactctttttgtcttgggattgatgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagc 25404968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 19788668 - 19788541
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |  |||| ||  ||||     |||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  19788668 caggaatgaatatttgatggattgattcttggagcaaaagaaaaagggtttggagttgattcagaccaaaaataagaagatttggagacaaaaatatgtc 19788569  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19788568 tcccccaagtcagaagcttggcacggcc 19788541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 22404166 - 22404267
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  22404166 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 22404264  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  22404265 ccc 22404267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 15346822 - 15346698
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| | ||||  ||||     
T  15346822 tgtctacaatgaacatgagtaagtagacttct-ttatcttgggattgttagatgagtctaatgacctaatcttattcaaagcaagcctaaaactctaatt 15346724  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaa 640  Q
    ||||||||||||| || || ||||||    
T  15346723 ttatgtaaccctattttctaatctaa 15346698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 526 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 16148412 - 16148291
Alignment:
Q  526 aacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc 625  Q
    ||||| |||||||| |||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||  |    
T  16148412 aacatgagtgagtaaactcttcttgtctttgaattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatc 16148313  T
Q  626 taattccttatctaaattcacc 647  Q
    || || || |||||| ||||||    
T  16148312 tactttctaatctaatttcacc 16148291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23495350 - 23495226
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  23495350 caggaacgaatatttgatggattgagtcttgtagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 23495251  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacg 259  Q
    |||| ||||||| || |||||||||    
T  23495250 tccctcaagtcaaaaacttggcacg 23495226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 30819052 - 30818957
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| || |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  30819052 tctttttctccatgtctacaatggacgtgggtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 30818957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 739 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 52235724 - 52235671
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52235724 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagac--agattgtaaag 52235671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 739 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 16365110 - 16365055
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16365110 aaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaagggttgtaaag 16365055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 532 - 590
Target Start/End: Original strand, 16354211 - 16354269
Alignment:
Q  532 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaat 590  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16354211 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcttaat 16354269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 613 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 52235793 - 52235711
Alignment:
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  52235793 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaagttgtggaaacgaaagtggag 52235711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 22504057 - 22503992
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatat 415  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  22504057 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatat 22503992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 52954286 - 52954237
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52954286 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactt 52954237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 155 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13799826 - 13799715
Alignment:
Q  155 gattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttg 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| |     ||||||  |||||| | | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13799826 gattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcgggttgaaaatacaaagattca-atacaaaaatatgactcccccaagtcagaagcttg 13799728  T
Q  255 gcacggcccgtgc 267  Q
    |||||||||||||    
T  13799727 gcacggcccgtgc 13799715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19788521 - 19788481
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788521 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 19788481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 755 - 794
Target Start/End: Original strand, 41228620 - 41228659
Alignment:
Q  755 ttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41228620 ttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 41228659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 44538125 - 44538164
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44538125 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 44538164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 19209664 - 19209710
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19209664 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 19209710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 745 - 794
Target Start/End: Original strand, 1593514 - 1593563
Alignment:
Q  745 aagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1593514 aagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaaattgcaaag 1593563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 466
Target Start/End: Original strand, 19364619 - 19364730
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||| | | ||||  || |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19364619 gcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagttagctatcaataacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttc 19364718  T
Q  456 -taataaaagtt 466  Q
     |||||||||||    
T  19364719 ttaataaaagtt 19364730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 514 - 586
Target Start/End: Original strand, 15421213 - 15421283
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcc 586  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15421213 ttgtctacgatga-catgtgtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcc 15421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Original strand, 21189077 - 21189125
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21189077 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 21189125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18168531 - 18168488
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18168531 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaag 18168488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 18816217 - 18816256
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18816217 cttttgctgcttttgcttagattctaagctactctatttt 18816256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 302 - 341
Target Start/End: Original strand, 22410960 - 22410999
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22410960 ccttttgctgtttttgcttagattttaagctactctattt 22410999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25646505 - 25646466
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25646505 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactttatttt 25646466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26134731 - 26134692
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26134731 cttttgttgcttttgcttagattttaagctactctatttt 26134692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 548 - 618
Target Start/End: Original strand, 2130095 - 2130164
Alignment:
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||    
T  2130095 ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaatcttat 2130164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 503 - 600
Target Start/End: Original strand, 20497660 - 20497756
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  20497660 tcttcttctctatgtctacaacgaacatgagtgactagacttct-ttattttgggattaatggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 20497756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 26134666 - 26134593
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  26134666 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaatctataaatagagtagttagtcatctcaaatattcatctttt 26134593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 4028162 - 4028202
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4028162 ccttttgctgattttgtttagattttaagctactctatttt 4028202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 514 - 618
Target Start/End: Complemental strand, 16527627 - 16527524
Alignment:
Q  514 ttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| |  |||||| ||||| |  |||| ||||    
T  16527627 ttgtctacgatgaacatgagtgaatagatctct-ttgtctttggattgttggatgagtctaataacttaattcatatcaaatcaagcctagaaccctaat 16527529  T
Q  614 cttat 618  Q
    |||||    
T  16527528 cttat 16527524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 23299003 - 23299111
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||| |  |||| ||||    
T  23299003 tgtctacaatgaacatgagtgattcgactcttctttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctaccaaaccaagcctggaaccctaat 23299102  T
Q  614 cttatgtaa 622  Q
     ||||||||    
T  23299103 tttatgtaa 23299111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 421 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 19875218 - 19875171
Alignment:
Q  421 ttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19875218 ttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 19875171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 513 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 17735072 - 17734987
Alignment:
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| |  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  17735072 cttgtctacaatgaacatgtgtgagtagacgt-tctagtcttaggattgttgaaatagtctaatgactaaatcctattcaaaccaag 17734987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 486; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3572 - 2912
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3572 caggaatgaatattggatggattaagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 3473  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3472 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 3373  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3372 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 3273  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||    
T  3272 atatgtgacaattgtctttctaataaaaattcatctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttag 3173  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  3172 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtatccctaatctct 3073  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
     |||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  3072 aatctaaattcaccgttttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaat 2973  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2972 tcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaatgattataaag 2912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 24200 - 24871
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24200 caggaatgagtattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaacattgagagacaaaaatatgtct 24299  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctttt-gcttagattttaagctac 334  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24300 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacagccgtgccaccctcgagagtgctttttgctgctttttgcttagattttaagctac 24399  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24400 tctatttttagcctgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgaatgctataaacagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaatgc 24499  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    |||| ||||||||||  || ||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  24500 aataagtgacaattgctttactaattaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacga 24598  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24599 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgta 24698  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24699 accctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatt 24798  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24799 ccaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 24871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Original strand, 30614 - 30941
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggat 567  Q
    |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30614 tttatttttttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggat 30713  T
Q  568 aagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacc 666  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  30714 aagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctcaattcaccgctttaacatggatcaacc 30813  T
Q  667 attatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaa 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814 attatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaa 30913  T
Q  767 caagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30914 caagtgaatttagacaaggattgcaaag 30941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 403; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10473
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||    
T  11142 caggaatgaattttgtatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactttgagctgattgaatgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgcct 11043  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11042 ccctcaagtaagaagcttggcacggcccgtgccatcgttggcacggccgtgacaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 10943  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10942 ctatttttagccctaatttaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaattca 10843  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatg 525  Q
    ||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||| ||          || ||||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||    
T  10842 ataagtgacaattgt--ttctaataaaagttcttttcctttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctcttttctcccctatgtctacgatg 10745  T
Q  526 aacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10744 aacatgactgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 10645  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644 ccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatgaatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 10545  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  10544 caaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 10473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2571 - 2116
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||     
T  2571 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgataattgc 2472  T
Q  451 ctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
     |||||||||||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  2471 ttttctaataaaagttctttt-cttttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctatgataaacatgagtgagta 2373  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2372 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 2273  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  2272 taaattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactacgaaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcaacgcaaatatcaattcat 2173  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  2172 aaaacgaaagtggagctttgttattcgaacaagtgaattgagacaatgattgcaaag 2116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2801 - 2603
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2801 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtctcccacaa 2703  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2702 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 2603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15705 - 15498
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  15705 caggaacgaatatttaatggattgaatcttggggcaaaagaaagggacttggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 15606  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605 cccccaaagtcagaagcttggcacggctgatgctagcattggcacgaccatgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 15506  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  15505 tctatttt 15498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 401; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 2941 - 3612
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga-ctttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || | |||| | | | |||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  2941 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtcttggaactgatttggtacgaaaatacgaagattgggagacaaaaatatatc 3040  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3041 tccctcaagtcagaaacttggcacagcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacccaccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 3140  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    ||||| ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  3141 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtaattgcttatattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaacattcatctt 3240  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3241 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacg 3340  T
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3341 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaaactttaaaacttaatcttatgtaa 3440  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatct 722  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3441 ccctaatttcttatctaaattcactgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccaccatct 3540  T
Q  723 cgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3541 caaatatcaattcagaaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 3612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 386; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 2786 - 2119
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| |||    
T  2786 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatatct 2688  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2687 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagagctacttttgctgcttttgtttagattttaagctac 2588  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2587 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 2488  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2487 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttccttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctac 2388  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2387 gatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatg 2288  T
Q  620 taaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatca 719  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2287 taaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggatttgataattgtttatccatca 2188  T
Q  720 tctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2187 tctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 2119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 380; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 143 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 2741
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| |||| | | | ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||  |    
T  3407 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagtaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatttgaagattcggagacaaaaatatatctccctaa 3308  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  | |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3307 agtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctccaagaacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctactatgttt 3208  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || |||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3207 tagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagtttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttgg 3108  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3107 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaaca 3008  T
Q  530 ttagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3007 ttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaacccta 2908  T
Q  628 attccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaat 727  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||| |||    
T  2907 atttcttatctaaattcaccactttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataactgtttacgcaccatctcaaat 2808  T
Q  728 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2807 atcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 362; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Original strand, 117491 - 118163
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| | | |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  117491 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggagttttggaactgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 117590  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117591 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctagacttggtacggtcgtgccacactccataactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 117690  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  117691 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcggatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaacattcatctt 117790  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  117791 ttcttggaattcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttccttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctat 117890  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  117891 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatata 117990  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  117991 accctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggcttgataattgttcgtccatcatc 118090  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118091 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 118163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 136 - 396
Target Start/End: Original strand, 98273 - 98512
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98273 caggaatgaatattggatggattgagtcttggtgcaaaagaaagggacttagagccgattggatgcaagaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 98372  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||                     ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98373 cccacaagtcagaagcttggca---------------------cggccatgccaccctccagagtcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 98451  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagt 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  98452 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagt 98512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 71859 - 72066
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    || |||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  71859 caggaatgaatattgaatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggcttggagctgatttagggcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 71958  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  71959 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagatcttaagctac 72058  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  72059 tctatttt 72066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 97603 - 97398
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   ||| ||||||  ||||||  |||||||||||| ||||    
T  97603 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggtcttggagctgatttagtgcgaaaatacaaagattcggagacaaaaatacgtct 97504  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  97503 cccccaagtcagaagcttggcacgtcccatgccagcattggcacggccgtgctaccctccagagtcacttttgctacttttgcttaga-tttaagctact 97405  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  97404 ctatttt 97398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 350 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 97367 - 97250
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  97367 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctatctatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 97268  T
Q  450 tctttctaataaaagttc 467  Q
      ||||||||||||||||    
T  97267 cttttctaataaaagttc 97250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Original strand, 122826 - 122888
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattgga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  122826 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattgga 122888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 32426 - 31991
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32426 gcttagattttaagtcgaaggtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 32327  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 558  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32326 taaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggga 32227  T
Q  559 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||    
T  32226 ttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatg 32127  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32126 gattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttga 32027  T
Q  759 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32026 tattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 31991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 423 - 754
Target Start/End: Original strand, 37001 - 37333
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgt-tatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37001 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttctttctatttacttttatgttttctctcttcctctccttgtctac 37100  T
Q  522 gatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 621  Q
     |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37101 aatgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgta 37200  T
Q  622 accctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatc 721  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||    
T  37201 accctaattccttatctaaattcaccgctttaacatagatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtagaaggtttgataataatttatccatcatc 37300  T
Q  722 tcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 754  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37301 tcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagct 37333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 32639 - 32514
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| | |||||  ||||||||| |||| ||     
T  32639 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacggagatttggagacaaaatatatctcc 32540  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32539 ccca-aagtcagaagcttggcacggcc 32514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32525 - 32455
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32525 cttggcacggccgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 32455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 783
Target Start/End: Original strand, 37 - 677
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaa-gattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcgaaaatatgaaagattgagagacaaaaatatgtc 136  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||||| |||||||                     ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  137 tcccccaagtcagaagcctggcacg---------------------gccgtgccaccctccagagtcacttttgctacttttgcttagattttaagctac 215  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  216 tctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagttgaacaaatgctataaatagagtagccttccatcacaaatattcatctttacttggaatac 315  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    || | ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           |||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||    
T  316 aacaagtgacaattgcttttctaatcaaagttctttt-cttttcctttattttcttgttttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacga 414  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaa-accaagctttaaaccttaatcttatgt 620  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  415 tgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcatgaccaagctctaagccttaatcttatgt 514  T
Q  621 aaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcat 720  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  515 aaccctaatttcttatctaaattcacctctttaccatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtgaagggtttgataattgtttatccattat 614  T
Q  721 ctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  615 tccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtaaatttagacaa 677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 300296 - 299865
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  300296 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagacatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 300197  T
Q  459 taaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttggg 557  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  300196 taaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtttacgatgaacattagtgagtagacttctctttgtcttggg 300097  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  300096 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaaca 299997  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299996 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 299897  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  299896 gatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 299865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 136 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 300509 - 300347
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |   |||||| | |||||  ||||||||| ||| |||    
T  300509 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtatgaaaatacggagatttggagacaaaa-tatatct 300411  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||    
T  300410 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcaaggctgtgccacactccaga 300347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 360 - 794
Target Start/End: Original strand, 626 - 1062
Alignment:
Q  360 cttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  626 cttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaat 725  T
Q  460 aaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatg-ctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  726 aaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgtctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttggg 825  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  826 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 925  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 757  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  926 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttg 1025  T
Q  758 atattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1026 atattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 1062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 382 - 586
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  382 caggaaagaatattggatggattaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 480  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  481 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgcttggactccaagctatt 579  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  580 ctatttt 586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 14540 - 13861
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  14540 caggaacgaatatttgatgcattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 14441  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14440 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttggattttaagctac 14341  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14340 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 14241  T
Q  423 ttcttggaa-tgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagtt-----catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttg 516  Q
    ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||     | ||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |     
T  14240 ttctttgaaattcaataagtgacaattgtctttcaaataaaagttattttcttttactttcttgtcatttactttaatgttttctctcttcttctccatt 14141  T
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  14140 tctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatc 14041  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaattgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 13941  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13940 catcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 13861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 117708 - 118145
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  117708 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctga 117807  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117808 taaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgcattctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 117907  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |    
T  117908 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccatcttaaca 118007  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  118008 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 118107  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  118108 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 118145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 123952 - 124389
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  123952 gcttagattttaagtcaaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaattattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctga 124051  T
Q  459 taaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 556  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124052 taaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgcattctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgg 124151  T
Q  557 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||| |    
T  124152 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccatcttaaca 124251  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124252 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 124351  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  124352 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 124389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 123708 - 123912
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  123708 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagccgattggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa-tacgtctc 123806  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||    
T  123807 ccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattc 123906  T
Q  337 tatttt 342  Q
    ||||||    
T  123907 tatttt 123912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 117463 - 117668
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||  |||    
T  117463 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggatttggagccgactggacacgaaaatatgaagattgagagacaaaa-tacatct 117561  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  117562 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagaacactttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 117661  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  117662 ctatttt 117668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2482 - 2045
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2482 gcttagattttaagtcgaatgtgtgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaataccatatgtgacaattgtctttctaa 2383  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2382 taaaagttcattttactttattgttatttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 2283  T
Q  558 attgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaata 656  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   |||| |    
T  2282 attgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaaca 2183  T
Q  657 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 756  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2182 tggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagcttt 2083  T
Q  757 gatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  2082 gatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2727 - 2522
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  2727 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacaaaaatatgaagatttggagacaaaaatacgtctc 2628  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactc 336  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||    
T  2627 cctcaagtcagaatgttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattc 2528  T
Q  337 tatttt 342  Q
    ||||||    
T  2527 tatttt 2522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 10)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 154024 - 153568
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  154024 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 153925  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  153924 tctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 153825  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  153824 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 153725  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  153724 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatctcaaatatcaattcat 153625  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  153624 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 153568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 245961 - 245504
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  245961 atgtaattgcttagattataagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 245862  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctg-----ttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||| ||      | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  245861 tctttctaataaaagttcttttcttttacttccttctcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagactt 245762  T
Q  545 ct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||    
T  245761 cttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaacaagcttttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaa 245662  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga---taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat- 737  Q
    |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  245661 ttcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcata 245562  T
Q  738 -aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  245561 aaaaaaaaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 245504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 351 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 151012 - 150566
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||   ||||| ||||| ||||||||    
T  151012 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaaaattcatcttttattaatggaattcaataagtgacaat 150913  T
Q  448 tgtctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    |||||||||||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  150912 tgtctttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgaagaacatgagtga 150814  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||  || |    
T  150813 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaatctctaa 150714  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  150713 tctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattc 150614  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  150613 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 150566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 310
Target Start/End: Original strand, 66847 - 67020
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||   ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  66847 aggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggaattggagctgatttagtgcgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctc 66946  T
Q  237 ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgct 310  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  66947 cctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgct 67020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 151247 - 151040
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  151247 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 151148  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcc--agagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagct 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||   ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  151147 tcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccacactcccaggacagccttttgctgcttttgcttagattttacgct 151048  T
Q  333 actctatt 340  Q
    ||||||||    
T  151047 actctatt 151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 246203 - 246003
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttga-gccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||  |    |||| ||    
T  246203 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttgaagctgattcgatgcaaaaatacgaagattcggaagcttttatatttc 246104  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  246103 ------aagtcagaagcttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgacacctcccagagccacttttgctgcttttgcttagtttttaagctac 246010  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  246009 tctattt 246003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 350 - 449
Target Start/End: Original strand, 67074 - 67173
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  67074 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctttccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 67173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 154240 - 154114
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |   |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  154240 aggaacgaatattagatggattgagtcttagagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtatgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctc 154141  T
Q  237 ccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  154140 ccccaaagtcagaagcttggcacggcc 154114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 154119 - 154055
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  154119 acggccgtgccaccctctagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 154055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 238313 - 238444
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa-atatgtc 234  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||| ||    
T  238313 caggaacggatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaatatatctc 238412  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  238413 cccca-aagtcagaagcttggcacggcccgtgc 238444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 309; Significance: 1e-174; HSPs: 4)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 136 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 25896 - 25343
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896 caggaatgaatattggatggattgagtcttgaagcaaaagcaagggacttggagccgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 25797  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25796 cccccaagtcagaagcctggcacggcccttgctagacttggcacggccgtgcaaccctccagagtcacttttgctgcttttgtttagattttaagctact 25697  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  25696 ctatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccttccatcacaaataatcatctttacttggaataca 25597  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| ||||||||| ||||||| ||||||||   || ||||||||||    
T  25596 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttactttcatgctttatctcttctctcccatgtctacgat 25498  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25497 gaacatgagtgagtagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaa 25398  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaact 677  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25397 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatcaaccattatcaaact 25343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 251 - 789
Target Start/End: Original strand, 26029 - 26581
Alignment:
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt-------- 342  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||            
T  26029 cttggcacggcccgtgctaatcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactatgttttagtttact 26128  T
Q  343 tagcccaaat----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaata 438  Q
    |     ||||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||  ||||    
T  26129 tgtggaaaattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagacatcacaa-tattcatctttt-ttggaatttaata 26226  T
Q  439 tgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  26227 -gtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttatctcttcttctccatgtctacgatgaccatgag 26325  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcct 633  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||    
T  26326 tgagtagactttttatgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatataaccctagttact 26425  T
Q  634 tatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaat 733  Q
      | ||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||    
T  26426 cttttaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaat 26525  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  26526 tcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgagttcagacaaggattg 26581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 19320 - 19752
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  |  |||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19320 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagacatcacaa-tattcatctttt-ttggaatttaata-gtgacaattgtctttctaa 19416  T
Q  459 taaaagttcattt-----acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtct 553  Q
    ||||||||| |||     |||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||    
T  19417 taaaagttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttatctcttcttctccatgtctacgatgaccatgagtgagtagactttttatgtct 19516  T
Q  554 tgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttta 653  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||  | ||||||||||  ||||    
T  19517 tgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatataaccctagttactcttttaaattcaccgtttta 19616  T
Q  654 atatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagc 753  Q
    | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  19617 acatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagc 19716  T
Q  754 tttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  19717 tttaatattcgatcaagtgagttcagacaaggattg 19752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 19221 - 19291
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19221 cttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 19291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 136 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 492 - 1
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||   |||||||| |||||||    
T  492 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagtaaaagaaagaggattggagctgattcgttgcagaaatacgaagattcgaagacaaaa-tatgtct 394  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
     || ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  393 accccaaagtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttaaattttaagctac 294  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  293 t----ttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttttttggaattc 198  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctttgtctacgatgaacattag 98  T
Q  534 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  97 tgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22033 - 21368
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  22033 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggatttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattcggagacaaaaatatatc 21934  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21933 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaacttggcacggccgtgccacctcccagacaaccttttgctgcttttgcttagattctaagctac 21834  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatg 433  Q
    |||||||   |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  21833 tctatttggtgcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgttacccataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaatt 21734  T
Q  434 caatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacga 523  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21733 caataagtgacaattgtcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtccacga 21634  T
Q  524 tgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21633 tgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaac 21534  T
Q  624 cctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctc 723  Q
    |||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |    
T  21533 cctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccatcattcc 21434  T
Q  724 gaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21433 aaatgttaattcataaaacgaaagtgaagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 21368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 136 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 425397 - 424719
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  425397 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 425298  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  425297 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctctagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 425198  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  425197 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 425098  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  425097 ttgttccctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccat 425000  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  424999 gtctacaatgaacgttagtgagtagactccttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaat 424900  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||| |||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  424899 cttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatggttaat 424800  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  424799 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtaaatttagacaaagattgtaaag 424719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 351 - 790
Target Start/End: Original strand, 159008 - 159457
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  159008 atgtaattgcttagatttta-gtcgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcgataagtgacaattg 159106  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  159107 tcttttgaataaaagttcttttctttccctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttttccatgtctacgatgaacatgagtgagta 159206  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||| ||| || |   ||||    
T  159207 gacttcttatgtcctgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtaaagccttaaaccttaatattatgtaactctagtttcacttcta 159306  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||||||   ||||| |||| | ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  159307 aattcactgttttaacatgggttaaatattatcagattgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 159406  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  159407 aacgaaagtgaagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattgt 159457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 136 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 49718 - 49265
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  49718 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 49619  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49618 tccctcaactcagaaatttggcacggtccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagagctacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 49519  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    | ||||||       | |   || ||    ||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  49518 tttattttagtttacttgtggaacattctagtaattgcttagattttaagtcgaatgtagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 49419  T
Q  423 ttc-ttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttct 511  Q
    ||| ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||          ||| ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49418 ttctttggaattcaata-gtgacaattttctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcttct 49320  T
Q  512 ccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgga 566  Q
    || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  49319 ccatgtctatgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttgga 49265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 158760 - 158966
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  158760 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaacaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 158859  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||  |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  158860 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaagattggcacgaccgtgccacctcccagacagccttttgctacttttgcttagattataagctac 158959  T
Q  335 tctattt 341  Q
    | |||||    
T  158960 tatattt 158966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Original strand, 520863 - 520970
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||| |  |||||||||     
T  520863 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttaggaatgttggatgagtctaatgactaaatcttaatcataccaagcctcgaaccttaatt 520962  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  520963 ttatgtaa 520970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 622
Target Start/End: Complemental strand, 82579 - 82473
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||| |||| ||||     
T  82579 tgtctacaatgaacatgtgtgagtagacttct-ttgtcttgggattgatggatgagtttaatgacctaatccctatacaaccaagctttgaaccctaatt 82481  T
Q  615 ttatgtaa 622  Q
    ||||||||    
T  82480 ttatgtaa 82473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 522300 - 522340
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaaga 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  522300 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaaga 522340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 182978 - 182941
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaa 173  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  182978 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaa 182941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 2)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 1483 - 1028
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaa-tgcaatatgtgacaatt 448  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1483 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagaatagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaaattcaatatgtgacaatt 1384  T
Q  449 gtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgag 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1383 gtctttctaataaaagttctttt-cttttccttttatttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccacgtctacgatgaacattagtgag 1285  T
Q  538 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  1284 tatacatctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatc 1185  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  1184 taaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataattgttcgtccatcatctcaaatatcaattcat 1085  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1084 aaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttatacaacgattgtaaag 1028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1720 - 1514
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  1720 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaatggacttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtct 1622  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1621 ccctcaaagtcagaagcttgccacggcccgtgctggcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 1522  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  1521 tctatttt 1514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 299; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 136 - 647
Target Start/End: Original strand, 3048 - 3571
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3048 caggaatgaatattggatgaattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 3147  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3148 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcgttggcacggccgtgccaccctccagagtgtattttgctgcttttgcttagattttaagctact 3247  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  3248 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcaaatatatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatctttacttggaattca 3347  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||| | |  | ||||||||||    
T  3348 ataagtgacaattgcttttctaattaaatttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttatcccacatgtctacgat 3446  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  3447 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaa 3546  T
Q  623 ccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  3547 ccctaatttcttatctaaattcacc 3571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0760
Description:

Target: scaffold0760; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 361 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 6354 - 5949
Alignment:
Q  361 ttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaata 460  Q
    |||||||||||||| | || |  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6354 ttagattttaagtccaatgtaaactataaatagagtagccagccatcacaaataatcatcttttcctggaatacaatatgtgacaattgtctttctaata 6255  T
Q  461 aaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggat 559  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6254 aaagttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctttttgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggat 6155  T
Q  560 tgttggataagtcta-atgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatg 658  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  6154 tgttggataagtctagatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgcaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 6055  T
Q  659 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttga 758  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6054 gatcaaccattatcaaactgtggaaacgaatgtggagggtttgataattgtttatccattatttcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttga 5955  T
Q  759 tattcg 764  Q
    ||||||    
T  5954 tattcg 5949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 6560 - 6435
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||   | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  6560 caggaaagaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttgaagctgattcagtacgaaaataggaagattcggagac-aaaatatgtct 6462  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||    
T  6461 ccccaaagtcagaaccttggcacggcc 6435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 162425 - 162872
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    ||||||||| |||||| | || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  162425 gcttagattctaagtcaaatgtaacctataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttcttgaaattcaataagtgacaattgtctttctaa 162524  T
Q  459 taaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
     |||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  162525 caaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 162624  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  162625 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctgatttctaatctaaattcac 162724  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  162725 cgttttaacatgggttaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaaccaaa 162824  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  162825 gtggagctttgatattcgaacaaatgaatttagacaaagattgtaaag 162872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 163898 - 163616
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagcttt-aaacctta 611  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  163898 tgtctacaatgaacgttagtgagttgacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaacctta 163799  T
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  163798 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggttttgataattgtta 163699  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  163698 atccatcatctcaaatatcaattcataaaacaaaagtggagctttgatattcaaacaagtcaatttagacaaagattgtaaag 163616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 164281 - 164076
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  164281 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatct 164182  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  164181 ccc-caagttagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagactcacttttgctgcttttgctttgattctaagttact 164083  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    || ||||    
T  164082 ctgtttt 164076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 384 - 597
Target Start/End: Original strand, 172716 - 172935
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctt-tct-aataaaagttcatttacttttc 478  Q
    |||||||||||||||  | | |||||||  |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||      
T  172716 ctataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaata-gtgacaattgttttctcttaataaaagttc-tttactttct 172813  T
Q  479 tgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcta 574  Q
    ||||||||  ||||||| | ||||| ||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  172814 tgttattttattttatgttattctc-cttcttctcttctatgtctacgatgaacatgagtgagtagactgttcttgtattgggaatgttggatgagtcta 172912  T
Q  575 atgacataatcctaatcaaacca 597  Q
    ||||| |||| ||||||||||||    
T  172913 atgacctaattctaatcaaacca 172935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 337
Target Start/End: Original strand, 162297 - 162381
Alignment:
Q  253 tggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactct 337  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| | ||||||||||  || ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  162297 tggcacggcccgtgctcccactggcatggccgtgccaagcttcagagtctcttttgttgcttttgcttagattttaagctactct 162381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 352 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 164056 - 163984
Alignment:
Q  352 tgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||    
T  164056 tgtaattgcttagagtttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctaaccatcacatatattcatctttt 163984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Original strand, 186180 - 186630
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  186180 aatgtaattgcttagatttaaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatatttttttggaattcaataagtgacaattg 186279  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    | |||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  186280 tatttctaataaaagttcttttctttccttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 186379  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  186380 gacttctctttgtcatgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 186479  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  186480 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccataatctcaaatatcaattcat 186579  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  186580 aaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 186630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 185942 - 186149
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  185942 caggaatgaatattggatagattgagtcttggagcaaaagaaagggaattggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 186041  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186042 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgttgcaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 186141  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  186142 tctatttt 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 523 - 598
Target Start/End: Original strand, 50003 - 50079
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat-aagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 598  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50003 atgaacgttagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggataaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 50079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 101696 - 101741
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101696 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 101741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 274; Significance: 1e-153; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 136 - 575
Target Start/End: Original strand, 4814 - 5264
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4814 caggaatgaatattagatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 4913  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4914 ccccacagtcagaagcttggcacgacccgtgctagccttgtcacggccgtgccatcatcgagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 5013  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5014 atatttttagcccgaatgtaatagcttagattttaagtcgagtgaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 5113  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttc-----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgat 524  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||           ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  5114 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc-ttttcttttcctttattttcttgtcatttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgat 5212  T
Q  525 gaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5213 gaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaa 5264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 272; Significance: 1e-151; HSPs: 4)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 19377 - 19826
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   ||||   |||| |||||||    
T  19377 aatgtaatttcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaat-aataagtgacaa 19475  T
Q  447 ttg--tctttctaataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    |||  |||||  || |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||     
T  19476 ttggttctttg-aacaaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttcttcatgtctacgatgaacattagtgagtagat 19574  T
Q  543 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaat 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  19575 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttatgtaaccctaatatctaatctaaat 19674  T
Q  643 tcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaac 742  Q
    | ||| |||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19675 taaccgctttaacattgattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaac 19774  T
Q  743 gaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19775 gaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagaaaaagattgtaaag 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 19148 - 19346
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || | |||||| |||||||  || ||||||||||||||    
T  19148 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttaatacgaaaatacgaagattcggaaacaaaaatatgtct 19247  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||  ||||         |||||||||||||||||||    
T  19248 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccaaagtcacttt---------tgcttagattttaagctac 19338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36578 - 36537
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaa 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36578 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaa 36537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47795 - 47761
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagc 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47795 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagc 47761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 350 - 794
Target Start/End: Original strand, 15043 - 15499
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15043 aatgtaattgcttagattttaagttgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaattcaataagtgacaattg 15142  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
      |||||||| ||||||| |||  ||| ||          || |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||    
T  15143 cttttctaattaaagttcttttcgtttcctttattttcttgtcatttacttttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 15242  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15243 gacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 15342  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||    
T  15343 taaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcat 15442  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15443 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 15499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 348
Target Start/End: Original strand, 14803 - 15017
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgc-aaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | || || | |||| | | | ||||||| |||||||  ||||||||| ||||||    
T  14803 caggaacggatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggaatttggatctgatttggtacgaaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtc 14901  T
Q  235 tcccacaa--gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagct 332  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14902 tcccccaaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagaattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagct 15001  T
Q  333 actctatttttagccc 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  15002 actctatttttagccc 15017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 262; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 136 - 788
Target Start/End: Original strand, 22862 - 23537
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  22862 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaaaaaatgggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 22961  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22962 tccctcaagtcagaaacttggcaccgcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 23061  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23062 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt 23161  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23162 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctc 23261  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 612  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||     
T  23262 catgtctacgatgaccatgagtgagtaggcttcttatgtcttggggttgttggataagtctaatgacataatcctaattaagtcaagccttaaaccttag 23361  T
Q  613 tcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttta 712  Q
    | |||| |||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23362 tattatataaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaa 23461  T
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||  | ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  23462 tccatcattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttaggcaaggatt 23537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 2)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 6635 - 6179
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  6635 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 6536  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattta-----cttttct-----gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||      |||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  6535 tctttctaataaaagttcttttcttttccttttctttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctactatgaacatgagtgagta 6436  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||    
T  6435 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaacctttatcttatgtaaccctaatctctaatc 6336  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  6335 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactctggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcat 6236  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6235 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 6179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6885 - 6677
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||| | || |||||||  ||||||  ||||||||||||  ||    
T  6885 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcgaaagaaaggggttttggagctgattcggtggaaaaatacaaagattcggagacaaaaatacatc 6786  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6785 tccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaagcttggcacggccgtggcacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 6686  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
     | ||||||    
T  6685 ttttatttt 6677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 9)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 350 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 21842 - 21402
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||    
T  21842 aatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtatctacccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgaca 21745  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21744 attgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacatttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 21645  T
Q  543 ttctctt-gtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaa 640  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21644 ttctctttgtcttgggattgttggataattctgaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaa 21545  T
Q  641 attcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaa 740  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21544 agtcaccggtttaacatggatcaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaa 21445  T
Q  741 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21444 acgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 21402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 350 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 26989 - 26709
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgaca 445  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||    
T  26989 aatgtaattgcttagattttaattcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat--aataagtgaca 26892  T
Q  446 attgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagac 542  Q
    ||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  26891 attgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttgtcatttacatttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 26792  T
Q  543 ttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaac 623  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  26791 ttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaac 26709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 3579 - 3373
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3579 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaacttggagctgattcagtgcgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 3480  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3479 ccccaaagtcagaagcttggcacagcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccttccagagtcacttttgctgcttttgcttatattttaagctact 3380  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  3379 ctatttt 3373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27226 - 27020
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||||| |    
T  27226 caggaacgaatattagatggattgagtcttggagcaaaagaaaggtatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgttt 27128  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27127 cccccaaagtcagaagtttggcacggcccgtgctaacattggcacggccgtgccaccctccagaattgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 27028  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  27027 tctatttt 27020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 22058 - 21932
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  22058 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagaaaaagaaagggattttgagctgattcgatacaaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 21960  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21959 cccccaaagtcagaagcttggcacggcc 21932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 350 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 3342 - 3266
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttct 426  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3342 aatgtaattgcttagattttaagccgaatgtatgctataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttct 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #7
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21937 - 21873
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21937 acggccgtgccaccctccagaatcgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 21873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12298 - 12244
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12298 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagc 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 136 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45 - 1
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagg 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 3)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 359 - 697
Target Start/End: Original strand, 9463 - 9802
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9463 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttcttggaatacaatatgtaacaattgtctttctaa 9562  T
Q  459 taaaagttcattt-acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttggg 557  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  9563 taaaagttcattttactttcttgttatttatctttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacgtcggtgagtagacttctcttgtcttggg 9662  T
Q  558 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatat 657  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  9663 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 9762  T
Q  658 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 697  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763 ggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaggg 9802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 262
Target Start/End: Original strand, 9250 - 9364
Alignment:
Q  147 attggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtca 246  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9250 attggatggattaagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagattgggagac-aaaatatgtctcccacaagtca 9348  T
Q  247 gaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||| ||||||||||    
T  9349 gaagcctggcacggcc 9364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 9359 - 9423
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||||    
T  9359 acggccgtgccaccctccagaagaccttttgctgcttttgcttgggctctaagctattctatttt 9423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 136 - 547
Target Start/End: Original strand, 18434 - 18846
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  18434 caggaatgaatattggatggattgagtcttggtgcaaaagaaattgacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 18532  T
Q  236 cccacaagt-cagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||  || | |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18533 cccctaaattcagatgcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctac 18632  T
Q  335 tctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 434  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18633 tctatttttagctcgaatgtaatagcttagattttaagtcgaataaatgctataaatagagtagccatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgc 18732  T
Q  435 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattag 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  18733 aatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctcttcttctccttgtctacaatgaacgtcag 18832  T
Q  534 tgagtagacttctc 547  Q
    ||||||||||||||    
T  18833 tgagtagacttctc 18846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 5)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 56837 - 56382
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  56837 atgtaattgcttagaatctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagatagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattat 56738  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||| |||          |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  56737 ctttctaataaaagttcttttcttttcctttacttttttgttatttacttttatgtttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 56639  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||    
T  56638 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatataaacctaatttctaatc 56539  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||    
T  56538 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatatcaaatgtcaattcat 56439  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56438 aaaacgaaaatggagctttaatattcgaacaagtgaatttggacaaagattgtaaag 56382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 350 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 72318 - 72002
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  72318 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccgtccatcacaaatattcatcttttcttgggattcaataagtgacaattg 72219  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||    
T  72218 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgatgaacatgagtgagta 72119  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  72118 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatc 72019  T
Q  638 taaattcaccactttaa 654  Q
    |||||||||| ||||||    
T  72018 taaattcaccgctttaa 72002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 57002 - 56879
Alignment:
Q  219 gagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgc 318  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  || |     |||| |||||||||||    
T  57002 gagacaaaaatacatctccctcaagtctgaagcttggaacggcccgtgctaagcttggcacggccgtgccacctcccgggacaactttcgctgcttttgc 56903  T
Q  319 ttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  56902 ttagattttaagctactctatttt 56879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 72381 - 72332
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  72381 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactt 72332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22136 - 22091
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22136 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 22091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 2)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 5665 - 6120
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5665 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 5764  T
Q  451 ctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
     ||||||||| |||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5765 ttttctaatacaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 5863  T
Q  540 gacttct-cttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |    
T  5864 gacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaactctaatttctaacc 5963  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcat 737  Q
    ||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  5964 taaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtgaaaacgaaaggggagggtttgataattgttaatccattatctcaaatatcaattcat 6063  T
Q  738 aaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6064 aaaacgaaagtggaactttgatattcgaacaagtgaatttagaaaaagattgtaaag 6120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 5417 - 5624
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  5417 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaataaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 5516  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||  ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5517 tccctcaagtcagaagcttggcacagcccgtgctaagcttggcacggcagtgccacctcccaggacaacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 5616  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||||||||    
T  5617 tctatttt 5624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 359 - 788
Target Start/End: Original strand, 13677 - 14106
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   ||||   || | ||||||||||| | |     
T  13677 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaataaaaa-gtgacaattgtttatt 13775  T
Q  456 t-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gt 551  Q
    | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13776 tgaataaaagttcaactttactttcttgttatttactttt-------ctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgt 13868  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccact 650  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  13869 cttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgct 13968  T
Q  651 ttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg 750  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13969 ttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtgg 14068  T
Q  751 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14069 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 14106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 128889 - 128990
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  128889 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 128987  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  128988 ccc 128990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 6)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 350 - 788
Target Start/End: Original strand, 121493 - 121947
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  121493 aatgtaattgattagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagaagctaaccatcacaaatattaatattttcttggaattcaataagtgacaattg 121592  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattta----------cttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||| |||||||| ||||          ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||    
T  121593 tctttctaacaaaagttcttttattttcttttactttcttgtcatttacttttatgctctctctcttcttctccatgtctacgatgaatatgagtcagta 121692  T
Q  540 gacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatc 637  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  121693 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagtcaagctctaagccttaattttatgtaaccctaatttcttatc 121792  T
Q  638 taaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcga----atatcaat 733  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||    
T  121793 taaattcaccgatttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatatatcaat 121892  T
Q  734 tcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  121893 tcataaaacgaaagtggagctttgatattctaacaagtgaatttagacaaggatt 121947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 111658 - 111784
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  111658 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattaagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctc 111757  T
Q  237 ccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  111758 ccacaaagtcagaagcttggcacggcc 111784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Original strand, 121286 - 121412
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctc 236  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  121286 aggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattaagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtctc 121385  T
Q  237 ccac-aagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  121386 ccacaaagtcagaagcttggcacggcc 121412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 350 - 427
Target Start/End: Original strand, 111865 - 111942
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  111865 aatgtaattgattagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctt 111942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 342
Target Start/End: Original strand, 111804 - 111834
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  111804 cttttgcttagattttaagctactctatttt 111834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 342
Target Start/End: Original strand, 121432 - 121462
Alignment:
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121432 cttttgcttagattttaagctactctatttt 121462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 136 - 459
Target Start/End: Original strand, 203310 - 203633
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203310 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttgtagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 203409  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  203410 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccatggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 203509  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  203510 ctatttttaacccgaatgtaatagcttagattttaagtcgaacaaatgctataaatagagtagccatccatcacaaataatcatctttacttggaataca 203609  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||    
T  203610 ataagtgacaattgcttttctaat 203633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 469 - 794
Target Start/End: Original strand, 5452 - 5779
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5452 tttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggat 5551  T
Q  568 aagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacc 666  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| || ||||    
T  5552 aagtttaaattacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccattttaacatgaattaacc 5651  T
Q  667 attatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaa 766  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5652 attatcaaactgtggaaacgaaagttgagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataagacgaaagtggaactttgatattcaaa 5751  T
Q  767 caagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5752 caagtgaacttagacaaagattgtaaag 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 13165 - 13619
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13165 atgtaattgcttagattataattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcgtttcttggaattcaataagtgacaattgt 13264  T
Q  451 ctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||||  |||||||||||||||||||||    ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||    
T  13265 ctttctaataaaagttattttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttaaacttcttcaccatgtctacgatgaatatgagtgagtag 13364  T
Q  541 acttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||| || |||||||||||||||||  || |||||    
T  13365 acttctcttgtcttgggattgttggataactcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctagtcttatgtaaccctaatctctaatcta 13464  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||   |||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13465 aattcaccgtcttaacatgaattaacctttatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataa 13564  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13565 aacgaaagtgaagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgcaaag 13619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 342
Target Start/End: Original strand, 12917 - 13123
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||| |||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||    
T  12917 aggaatgaatatttgatggattgacttttggagcaaaagaaaggggttttcgagctgattcggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacgtct 13016  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||| ||| |||||  |||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13017 ccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgcgaagcttggcacgggcgttccacctcccagaacaactttttctgcttttgcttagattttaagctact 13116  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  13117 ctatttt 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 34085 - 34365
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34085 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 34184  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34185 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 34284  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34285 ccatcatctcaaatatcaaatcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 34365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 12695 - 12243
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  12695 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtgaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatttttttttcttggaattcaataagtgacaat 12596  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  12595 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgc 12496  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || ||    
T  12495 gtagatttctcttgtcatggcattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgtaaccctagtttctaat 12396  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    |||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |    
T  12395 ctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaatctgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattta 12296  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12295 taaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 201 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12882 - 12740
Alignment:
Q  201 caaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gag 299  Q
    |||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||  ||| ||     
T  12882 caaaaatacgatgattcggagacaaaaatatgtctcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggaatggccgtgccacctcccaggaa 12783  T
Q  300 tgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12782 caccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 12740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 17625 - 17346
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17625 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatc 17526  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  17525 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtc 17426  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17425 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 17346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 151 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17991 - 17808
Alignment:
Q  151 gatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaa 249  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17991 gatgtattgagtcttccagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatatctccctcaagtcagaa 17892  T
Q  250 gcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
     |||||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |||          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17891 acttggcacagctcgtgctaggcttagcacggccgtgccacactctaga---------actgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 17808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 360 - 794
Target Start/End: Original strand, 5223 - 5669
Alignment:
Q  360 cttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaat 459  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||     
T  5223 cttagattttaagtcgaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaaa 5322  T
Q  460 aaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ct 548  Q
     ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5323 taaagttcttttcctttcctttattttcttgtcttttactttcatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttct 5422  T
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcacc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5423 tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcacc 5522  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
       |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5523 gtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaag 5622  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  5623 tggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 5669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 4977 - 5182
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4977 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacaaaaaaatatgaagattgagagacaaaa-tatgtct 5075  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||| |||| | ||||| |    
T  5076 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacagccgtgccaccctctagaacaccttttgctgcttttgcttggattctgagctatt 5175  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  5176 ctatttt 5182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 2)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 483 - 794
Target Start/End: Original strand, 1763 - 2076
Alignment:
Q  483 atttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgaca 580  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1763 atttacctttatgctttctctcttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagcagacttctccttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgaca 1862  T
Q  581 taatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtg 680  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1863 taatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtg 1962  T
Q  681 gaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttaga 780  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1963 gaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattattccaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttaga 2062  T
Q  781 caaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||| ||||    
T  2063 caaggattgcaaag 2076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 143 - 411
Target Start/End: Original strand, 1448 - 1716
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1448 gaatattggatggattgagtcttggagcaaacgaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaaa 1547  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1548 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcactgccgtgccaccctccaaagtgtcttttgctgcttttgcttagatttaaagctactctatttt 1647  T
Q  343 tagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaa 411  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1648 tagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccatccatcacaa 1716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 136 - 377
Target Start/End: Original strand, 168345 - 168586
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  168345 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatacgaagattgagagacaaaaatatgtct 168444  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168445 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctcaagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 168544  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgat 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168545 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgat 168586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 508 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 940 - 652
Alignment:
Q  508 ttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaa 605  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  940 ttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaa 841  T
Q  606 accttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataa 705  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  840 gccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataa 741  T
Q  706 ttgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  740 ttgtttatgcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1268 - 938
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  1268 caggaacgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 1169  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||              |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttg--------------ccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 1083  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaaat-----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   ||       || || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||    
T  1082 tctgttttagtttacttgtggaacgttctagtgattgcttatattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatgtt 983  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  982 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaacgttc 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 384 - 780
Target Start/End: Complemental strand, 14297 - 13890
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------ac 473  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          ||    
T  14297 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttgaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttac 14198  T
Q  474 ttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtc 572  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14197 tttcttgtgatttacttttatgcttt-tctccttcctctccaagtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtc 14099  T
Q  573 taa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattat 671  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||  || |||||||||||| | ||||| ||| || |||||||||    
T  14098 taaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatcttatgtaaccataatctctaatctaaattcactattttaacatgaattaaccattat 13999  T
Q  672 caaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagt 771  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13998 caagttgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcagttcataaaacgaaaatggagctttgatattcgaacaagt 13899  T
Q  772 gaatttaga 780  Q
    |||||||||    
T  13898 gaatttaga 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14579 - 14372
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14579 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatatgaagattcgaagacaaaaatatgtc 14480  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccag-agtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14479 cccc-caagtcagaagcttggcacggcccgtgctaacattggcacggccttgccacctcccaggacagccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 14381  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    | |||||||    
T  14380 cactatttt 14372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 566 - 794
Target Start/End: Original strand, 42867 - 43095
Alignment:
Q  566 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaac 665  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42867 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatcaac 42966  T
Q  666 cattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcga 765  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42967 cattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcga 43066  T
Q  766 acaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43067 acaagtgaatttagacaaagattgtaaag 43095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 261
Target Start/End: Original strand, 42305 - 42430
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||   |   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  42305 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaaggacttggagctgatttagtatgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 42404  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    |||  |||||||||||||||||||||    
T  42405 ccccaaagtcagaagcttggcacggc 42430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3907
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3629 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccct-aatc 3727  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3728 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 3827  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3828 catcatctctaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttaggcaaagattgtaaag 3907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 6)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 517 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 7810 - 7531
Alignment:
Q  517 tctacgatgaacattagtgagtagacttctctt-gtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  7810 tctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatc 7711  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7710 ttatgtaaccctgatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 7611  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7610 cattatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 7531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 350 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 1950 - 1658
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1950 aatgttattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagccgtccatcaaaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattg 1851  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||||||||||||||| |||          |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||    
T  1850 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctacgttgaacatgagtgagta 1751  T
Q  540 gacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1750 gacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagcgctaagccttaatcttatgtaaccctaatt 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2202 - 1981
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  2202 gaatattggatggattgagtcttcgagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctccccaaa 2103  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacgg----------------------ccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||                      |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2102 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggcccgtgctagcattggcacggcccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgctt 2003  T
Q  321 agattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  2002 agattttaagctactctatttt 1981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 350 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 9766 - 9585
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  9766 aatgttattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagagtagccgtccatcacaaatattcatcttttcttagaattcaataagtgacaattg 9667  T
Q  450 tctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctac 521  Q
    |||||||||||||||          ||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  9666 tctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttccccatgtctac 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9975 - 9856
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  9975 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtctccccaaa 9876  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9875 gtcagaagcttggcacggcc 9856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9861 - 9797
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9861 acggccgtgccaccctccagggtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 9797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 136 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 54726 - 54400
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54726 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 54627  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54626 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccacgctccatagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctact 54527  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgca 435  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  54526 ctatttttagcccgaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctata-----agtagccatccatcacaaatattcatctttacttggaattca 54432  T
Q  436 atatgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
    ||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  54431 ataagtgacaattgcttttctaattaaagttc 54400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 5)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 794
Target Start/End: Original strand, 3891 - 4338
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  3891 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 3990  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3991 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctcccttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 4090  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  4091 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 4190  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  4191 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 4290  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  4291 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattgcaaag 4338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 1599 - 2041
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  1599 gcttagattttaagtcaattgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttacttggaatacaataagtgacaattgcttttctaa 1698  T
Q  459 taaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-c 547  Q
      ||||||| ||| |||| ||          ||  |||||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1699 ataaagttcttttcctttcctttattttcctgtcttttactttcatgctttctcccttctcccccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttc 1798  T
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||    
T  1799 ttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagccttaatcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcac 1898  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |   |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  1899 cgtcttaacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttcgtccattattccaaatatcaattcataaaacgaaa 1998  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1999 gtggagctttgatattcgaacaagtgaattcagacaaggattg 2041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 320
Target Start/End: Original strand, 3647 - 3829
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || |||||| ||| |||    
T  3647 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaacaaaa-tatatct 3745  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3746 cccacaagtcagaagcctggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctt 3829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 1376 - 1501
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  | |||||| |||||||| || || ||||||| |||    
T  1376 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcaaattggacacgaaaatacgaagattgggaaac-aaaatatatct 1474  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1475 cccacaagtcagaagcctggcacggcc 1501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 278 - 320
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1537
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgctt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1496 acggccgtgccaccctccagag-accttttgctgcttttgctt 1537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 12)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 84392 - 83943
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  84392 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 84293  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  84292 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 84193  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| || ||  | ||    
T  84192 gacttcttttatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaacgttaatattatgtaaccctactttctcttata 84093  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    |||| |||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||| |    
T  84092 aattaaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcatga 83993  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  83992 aacaaaagtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 83943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 362 - 789
Target Start/End: Original strand, 48353 - 48787
Alignment:
Q  362 tagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct- 456  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| ||||||||||| | | |     
T  48353 tagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttccctgaaat--aataagtgacaattgtttctttg 48450  T
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtctt 554  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48451 aataaaagttcacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctattcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtctt 48550  T
Q  555 gggattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccacttt 652  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||    
T  48551 gggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaagcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgtttt 48650  T
Q  653 aatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggag 752  Q
    || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||| ||  |  || | ||||||||||||||||||||||    
T  48651 aacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtgtaggctttgataatcgttaatccattattccagatgttaattcataaaacgaaagtggag 48750  T
Q  753 ctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  48751 ctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 48787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 72450 - 72244
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  72450 caggaatgaatattttatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 72351  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  72350 tccctcaagtcaaaagcttggcacggcctgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacaaccttttgctacttttgcttagattctaagctac 72251  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  72250 tctattt 72244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 84640 - 84434
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  84640 caggaatgaatattttatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 84541  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  84540 tccctcaagtcaaaagcttggcacggcctgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacaaccttttgctacttttgcttagattctaagctac 84441  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  84440 tctattt 84434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 44911 - 45011
Alignment:
Q  163 cttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  44911 cttggagcaaaagaaagggaatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggc 45010  T
Q  262 c 262  Q
    |    
T  45011 c 45011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 163 - 262
Target Start/End: Original strand, 52300 - 52400
Alignment:
Q  163 cttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggc 261  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||    
T  52300 cttggagcaaaagaaagggaatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggc 52399  T
Q  262 c 262  Q
    |    
T  52400 c 52400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 48251 - 48321
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48251 cttggcacggccgtgccaccctccagaactacttttgctacttttgcttagattttaagctactctgtttt 48321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 52389 - 52459
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52389 cttggcacggccgtgccaccctccataactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgtttt 52459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 57566 - 57620
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagc 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  57566 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagc 57620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 185
Target Start/End: Original strand, 64691 - 64740
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactt 185  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  64691 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggactt 64740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 359 - 423
Target Start/End: Original strand, 52488 - 52552
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttt 423  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  52488 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttt 52552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 203 - 262
Target Start/End: Original strand, 48203 - 48262
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48203 aaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggcc 48262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 210; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 351 - 794
Target Start/End: Original strand, 12986 - 13443
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||   |   |||||||| |||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  12986 atgtaattacttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtaactagaaatcacaaaaattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 13085  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||| ||| ||| |||| |||| |||| |||||||||||||||| || |    
T  13086 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttactttcatgtttt-tctccttctactccatgtctacgatgaacatgagcg 13184  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattcctta 635  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  || |    
T  13185 agtagacttctcttgtcttgggattatttgataagtctaatgaaataatcctaaccaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatctctaa 13284  T
Q  636 tctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattc 735  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13285 tctaaattcaccgttttaacatgaataaaacattatcaaactatggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattc 13384  T
Q  736 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13385 ataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaggttgtaaag 13443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 12733 - 12941
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  12733 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcacaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 12832  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12833 tcccccaagtcagaagcttggcatggcctgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggacacccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 12932  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
     ||||||||    
T  12933 ttctatttt 12941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 56081 - 56126
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  56081 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 56126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 18912 - 18632
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18912 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcgaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 18813  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18812 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaattaaccattatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaat 18713  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18712 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaacattgtaaag 18632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19149 - 19111
Alignment:
Q  304 ttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19149 ttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 19111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 351 - 790
Target Start/End: Original strand, 5376 - 5826
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |     ||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  5376 atgtaattgcttagattttaagttgaatattacctagaaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 5475  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5476 tcttttgaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 5575  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  5576 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 5675  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||    
T  5676 aattcaccgttttaacatggattaaatattttcaaactgtggaaacgaaagtggaaggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataa 5775  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  5776 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattgt 5826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 341
Target Start/End: Original strand, 5198 - 5334
Alignment:
Q  205 aatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgcct 304  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  | ||    
T  5198 aatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaagtcataagcttggcagggcccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagtct 5297  T
Q  305 tttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5298 tttcctgctttttcttagattctaagctactctattt 5334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Original strand, 1330 - 1779
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1330 atgtaattgcttagattttaagtcaaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttctttggaattcaataagtgacaattg 1429  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1430 tcttttgaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcattctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 1529  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  1530 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 1629  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||| | ||| |||||    
T  1630 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaaatgttaatccataa 1729  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1730 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 1779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 136 - 311
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1268
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  1092 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 1191  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctg 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||| |||||||||  | |||  |||||||||||    
T  1192 tccctcaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaaggttggcacggtcgtgccacctccgagacagccttttgctg 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 136 - 789
Target Start/End: Original strand, 27098 - 27762
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |     
T  27098 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaaatatatt 27197  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||          || |||||||||||||||||||||||    
T  27198 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaa---------ctacttttgcttagattttaagctac 27288  T
Q  335 tctatttt--------tagcccaaat----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||        ||    | ||    || || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||    
T  27289 tctgttttagtttacttatggaacattctagtgattgcttacattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctt 27388  T
Q  423 ttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctcctt 515  Q
    || ||    | |||  |||| ||||||||||| | | | ||||||||||||  ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  27389 ttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttactttcttttcatttacttttatgctttctctctttttctctat 27486  T
Q  516 gtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  27487 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaat 27586  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||||||||||||| || |   ||||||||||||  ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27587 cttatgtaaccctagtttcccttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaat 27686  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27687 ccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggaggtttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 27762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Original strand, 39321 - 39758
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaattgtcttt 454  Q
    ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||| ||    | |||  |||| ||||||||||| | |    
T  39321 gcttacattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttct 39418  T
Q  455 ct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgt 551  Q
     | ||||||||||||  ||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39419 ttgaataaaagttcacctttactttcttttcatttacttttatgctttctctctttttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgt 39518  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac 649  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||      
T  39519 cttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagtttcccttctaaattcaccgt 39618  T
Q  650 tttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||    
T  39619 tttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtg 39718  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  39719 gagatttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 39758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 251 - 298
Target Start/End: Original strand, 39210 - 39257
Alignment:
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccaga 298  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39210 cttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccaga 39257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Original strand, 48897 - 49177
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48897 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgccttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaaccttaat 48996  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  48997 cttatgtaatcctaatttctaatctaaattcaccggtttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtatgataattgttaat 49096  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49097 ccatcatctcaaatatcaattcataaaaagaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 49177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 48672 - 48712
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  48672 ccttttgctgcttttgtttagattttaagctactcaatttt 48712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 354 - 424
Target Start/End: Original strand, 48741 - 48811
Alignment:
Q  354 taatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |  |  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  48741 taattgcttagattctaagtcgaatataaactataaatagagtacttagccatcacaaatattcatctttt 48811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 136 - 389
Target Start/End: Original strand, 33422 - 33675
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  33422 caggaaataatattggatggatcgaatcttggagcaaaagaaatggacttggagccgattggaaacaaaaatatgaagattgagagacgaaaatatgttt 33521  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33522 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctaaccttggcacggccgtgccaccctccagagtaacttttactgattttgcttagattttaagctact 33621  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataa 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33622 ctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataa 33675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 469 - 575
Target Start/End: Original strand, 33715 - 33822
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-cttgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33715 tttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttctcccccttgtatacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggat 33814  T
Q  568 aagtctaa 575  Q
    ||||||||    
T  33815 aagtctaa 33822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 195; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 75
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttg-gaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  523 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgttgtctataaatagagtagctagccatcacaaattttcatcttttcttttgaattcaataagtgacaattg 424  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttc----------tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| ||| ||||||          | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  423 tcttttgaataaaagttctttt-cttttcctttacttcttattatttacttttatgctttgtctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagta 325  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatcta 639  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||  ||||    
T  324 gacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataataaagtcaagccttcaatcttaatattatgtaaccctagtttctcttcta 225  T
Q  640 aattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataa 739  Q
    ||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  224 aattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactctggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatattaattcataa 125  T
Q  740 aacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  124 aacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 750 - 623
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttt-gagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||  |||| | ||| ||||||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  750 caggaatgtatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagatgattcggtgcgaaaatactaagattcggagacaaaaatatatc 651  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  650 tccctcaagtcagaaacttgggacggcc 623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 634 - 565
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  634 cttgggacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagactctaagctactctattt 565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 13)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 515 - 788
Target Start/End: Original strand, 77943 - 78216
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  77943 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaatt 78042  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  78043 ttatgtaaccctaatttctaatctgaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaagtggagggtttgataattgttaatc 78142  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagatt 788  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  78143 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggatt 78216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 515 - 783
Target Start/End: Original strand, 23366 - 23634
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||    
T  23366 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgaaataatcctaatcaaaccaagctattagccctaatc 23465  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23466 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatc 23565  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23566 catcatcgcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 23634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 565 - 783
Target Start/End: Original strand, 18371 - 18589
Alignment:
Q  565 gataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaa 664  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| |  ||    
T  18371 gataagtataatgaaataatcctaatcaaaccaagatattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaactaa 18470  T
Q  665 ccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcg 764  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18471 ccattatcaaactgtgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatcgcaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcg 18570  T
Q  765 aacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18571 aacaagtgaatttagacaa 18589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 102142 - 102347
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  102142 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagagatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa-tatgtct 102240  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  102241 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccatgccacccttcagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 102340  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  102341 ctatttt 102347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 565 - 789
Target Start/End: Original strand, 100569 - 100797
Alignment:
Q  565 gataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccac--tttaatatgga 660  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| || ||  |||||||||||     ||||| |||||    
T  100569 gataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaaccttaatattatgtaactctagtttctcttctaaattcacatagttttaacatgga 100668  T
Q  661 tcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgata 760  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  100669 ttaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttgatccattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgata 100768  T
Q  761 ttcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  100769 ttcgatcaagtaaatttagacaaggattg 100797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Original strand, 8742 - 8902
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||||||| |||||||    
T  8742 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagtgacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagacaaaa-tatgtct 8840  T
Q  236 cc-cacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca 296  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8841 cctctaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctcca 8902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 717 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 4303 - 4226
Alignment:
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4303 tcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaaggttataaag 4226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 515 - 569
Target Start/End: Original strand, 291 - 345
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 569  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  291 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #9
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 23146 - 23186
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23146 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 23186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 68 - 108
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68 ccttttgctgcttttgcttagattttaaactactctatttt 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Original strand, 102378 - 102426
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  102378 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 102426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 100317 - 100390
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  100317 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccctcacaaataatcatctttt 100390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #13
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 134 - 207
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||    
T  134 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagttgctgaccatcacaaatattcatctttt 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 8829 - 8550
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctc-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 613  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  8829 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccct-aat 8731  T
Q  614 cttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8730 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccaatttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattggtaat 8631  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8630 ccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagcggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 8550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 578
Alignment:
Q  146 tattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtc 245  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  683 tatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccccaaagtc 584  T
Q  246 agaagc 251  Q
    ||||||    
T  583 agaagc 578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 423 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 12416 - 12034
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttct-aataaaagttcatttacttttct----------gttatttacttttatgctttctctcttcttct 511  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||          |||||||   ||||||||||   |||||||||    
T  12416 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttcttttattttcctttactttcttgttattttactttatgcttttcttcttcttct 12317  T
Q  512 ccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 611  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12316 ccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaacccta 12217  T
Q  612 atcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttt 711  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||||||||   ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12216 atcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcacttttttaacatgaattaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtta 12117  T
Q  712 atccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12116 attcatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgtaaag 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 14767 - 14315
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||   |   ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||    
T  14767 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtatctagttatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 14668  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtga 536  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  14667 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttttcctctgcttctctgtgtctacgatgaacatgagtga 14568  T
Q  537 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttat 636  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| || || || ||    
T  14567 gtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatattcctaataaaaccaagccttaaaccccaatcttatgtaaccttagtttctaat 14468  T
Q  637 ctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattca 736  Q
    || ||||||||   || | ||| || ||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14467 ctgaattcaccgtctttacatgaattaaccattatcaaactgtagaagcgaaaatgtacggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattca 14368  T
Q  737 taaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  14367 taaaacgaaagtggagttttgatatttgaacaagtgaatttagacaaggattg 14315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 213 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14935 - 14805
Alignment:
Q  213 gattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctg 311  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||| || |||||||||||  ||| || ||||||||||||    
T  14935 gattcagagacaaatatatgtctcccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgcttccactggcacagccgtgccacctcccaggactgccttttgctg 14836  T
Q  312 cttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14835 cttttgcttagattttaagctactctatttt 14805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15927 - 15849
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagag 221  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||||||| ||||||| ||||    
T  15927 gaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcagag 15849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Original strand, 36408 - 36451
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36408 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaag 36451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 31451 - 31413
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31451 gaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 31413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323 (Bit Score: 184; Significance: 4e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold1323
Description:

Target: scaffold1323; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 548 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 643 - 396
Alignment:
Q  548 ttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcac 646  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  643 ttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 544  T
Q  647 cactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaa 746  Q
    |  ||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  543 cgttttaacatgaagtaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatttcaattcataaaacgaaa 444  T
Q  747 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443 gtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 359 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2040 - 1818
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt---ggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    ||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||   ||||   |||| ||||||||||| | |     
T  2040 gcttagattttaagtggaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaat-aataagtgacaattgtttctt 1942  T
Q  456 t-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc-tcttgt 551  Q
    | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1941 tgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgt 1842  T
Q  552 cttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1841 cttgggattgttggataagtctaa 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 182; Significance: 6e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 359 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 18899 - 18462
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc 455  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||   ||| |||   |||| | ||||||||| | |     
T  18899 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttctttgaaat-aataagggacaattgtttctt 18801  T
Q  456 t-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtc 552  Q
    | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18800 tgaataaaagttcacctttactttcttgttatttacgtttatgttttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtc 18701  T
Q  553 ttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccact 650  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |    
T  18700 ttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctcaatattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgtt 18601  T
Q  651 ttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg 750  Q
    || | |||||| ||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  18600 ttcacatggattaaatattatcaaaccgtggaaacgaaaatggagggtttgataatcgttaatccattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtgg 18501  T
Q  751 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  18500 agctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 18462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 350 - 778
Target Start/End: Complemental strand, 169505 - 169067
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt-cttggaatgcaatatgtgacaatt 448  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  169505 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttttcttggaattcaataagtgacaatt 169406  T
Q  449 gtctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagt 538  Q
    ||||||||||||||||||| |||          |||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||    
T  169405 gtctttctaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgttttctctcttcctctccatgtctacgatgaccgtgagtgagt 169306  T
Q  539 agacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| | | || |||||||| || ||  |||    
T  169305 agacttcttatgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagtataatataaccctagtttctcttct 169206  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||  | ||| | ||||||||    
T  169205 aaattcaccgttttaacatggattaa-atttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtatgataatcgttgatccatcattccaaatgttaattcata 169107  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattta 778  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||    
T  169106 aaacgaaagtggagctttatttttcgatcaagtgatttta 169067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 169575 - 169536
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169575 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 169536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 180; Significance: 9e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 351 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 1940 - 1490
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt-ggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  1940 atgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttgtctttggaattcaataagtgacaattg 1841  T
Q  450 tctttctaataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    |||||  ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  1840 tcttttgaataaaagttcttttcttttcttttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacataagtgagta 1741  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-ctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||  |||    
T  1740 gacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaatattatgtaaccttagtttctcttct 1641  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcata 738  Q
    |||||||||  ||||| |||||| ||  || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||| | ||||||||    
T  1640 aaattcaccgttttaacatggattaaatatcatcaaaccgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcattaatccattattccaaatgttaattcata 1541  T
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  1540 aaatgaatgtggagttttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 1490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 143 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2176 - 1982
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  2176 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccccca 2077  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||     ||||||| ||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2076 agtcaga-----ggcacggtccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagcctattgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 1982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 3)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 350 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 11971 - 11753
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattg 449  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11971 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatacagtagctatccatcacaaataagcatcttttcttggattgcaatatgtgacaattg 11872  T
Q  450 tctttctaataaaagttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11871 tctttctaataaaagttcatttactttcttgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctt 11772  T
Q  550 gtcttgggattgttggata 568  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11771 gtcttgggattgttggata 11753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 12187 - 12061
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  12187 caggaaagaatattggatggattaagtcttagagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtgcgaaaatacaaagattcagagacaaaaatatgtct 12088  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  12087 ccccaaagtcagaagcttggcacggcc 12061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12066 - 12002
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12066 acggccgtgccaccatccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttatgctactttatttt 12002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 143 - 627
Target Start/End: Original strand, 4246 - 4753
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| ||||||| ||| | ||||| |   ||||| ||    
T  4246 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcagaaaaaaaaaaaaaactccctca 4345  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcatggcacagccgtgccaccctccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 4445  T
Q  342 t-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttgg 429  Q
    |       | |   || ||    || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4446 tagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagatagccatcacaaatattcatcttttcttgg 4545  T
Q  430 aatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcatttacttttctgtt-----------atttacttttatgctttctctcttcttctccttgtc 518  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||           ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  4546 aattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagtt-attttcttttcttttactttcttttcatttacttttatgttttctctgttcttctccatgtc 4644  T
Q  519 tacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttat 618  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||| | ||||    
T  4645 tacgatgaccatgagtgagtagacttcttttgacttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaagtcaagccttaaaccttagtattat 4744  T
Q  619 gtaacccta 627  Q
     ||||||||    
T  4745 ataacccta 4753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 136 - 331
Target Start/End: Original strand, 22072 - 22267
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattgaatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 22171  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagc 331  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22172 cccccaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagc 22267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 9795 - 9521
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  9795 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaatt 9696  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  9695 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgaagaaacgaaagtagagggtttgataatcgttaatc 9596  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9595 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 9521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10017 - 9977
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10017 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 9977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0624 (Bit Score: 161; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0624
Description:

Target: scaffold0624; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 469 - 781
Target Start/End: Original strand, 4746 - 5042
Alignment:
Q  469 tttacttttctgttatttacttttatgctttctctctt-cttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat 567  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4746 tttactttcttgttatttacttttatgtttt-tctcctacttctccatgtctacgatgaacatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat 4844  T
Q  568 aagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaacca 667  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||                || ||||||||||||   ||||| ||| || |||||    
T  4845 aagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatct----------------ctaatctaaattcactgttttaacatgaattaacca 4928  T
Q  668 ttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaac 767  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4929 ttatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaac 5028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Original strand, 6525 - 6800
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  6525 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaatt 6624  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6625 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatc 6724  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  6725 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgataaagtgaatttagacaaggattgt 6800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Original strand, 11139 - 11414
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  11139 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaatt 11238  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  11239 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatc 11338  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  11339 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgataaagtgaatttagacaaggattgt 11414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 6300 - 6340
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6300 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 10914 - 10954
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 10954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 6366 - 6439
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  6366 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 6439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 10980 - 11053
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  10980 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 11053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 160; Significance: 8e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 515 - 790
Target Start/End: Original strand, 9134 - 9409
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||     
T  9134 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaatt 9233  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9234 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactttggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatc 9333  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgt 790  Q
    ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  9334 cattatcccaaatattaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgataaagtgaatttagacaaggattgt 9409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 8909 - 8949
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8909 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 8949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Original strand, 8975 - 9048
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  8975 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 9048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 8813 - 8528
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  8813 tcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtct 8714  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    |||||| |||| |||||||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| |     
T  8713 taaaccctaattttatgtaaccatagtttctaatctaaattcaccattttaacatgaattaacaattatcaaactgtaaaagcgaaagtggagggttag- 8615  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8614 taattgttaattcatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaattggatttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 8528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 601 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 105083 - 104901
Alignment:
Q  601 tttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggttt 700  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  105083 tttaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccactttaacatggatcaatcagtatcaaactgtggaaacgaaagtggatggttt 104984  T
Q  701 gataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  104983 gataattgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 104901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 117157 - 117216
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  117157 caggaaataatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagcagatt 117216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 575
Target Start/End: Original strand, 6376 - 6839
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||   |||||||||||| ||    
T  6376 caggaacgaatatttgatggattgagtcttgaagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagatttgaagacaaaaatatatc 6475  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6476 tccctcaagtcagaaacttggcgcggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccacactccagaactccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 6575  T
Q  335 tctatttt-------tagcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt 422  Q
    ||| ||||       | |   || ||    || || ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | || |||||||||||||||||    
T  6576 tctgttttagtttacttgtggaacattctagtgattgcttagattataagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccctcacaaatattcatctt 6675  T
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaag----------ttcatttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctc 512  Q
    |||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||          ||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6676 ttcttggaattcaataagtgacagttttctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctc 6775  T
Q  513 cttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtctaa 575  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6776 catgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctttttgtcttgggattgttggataagtctaa 6839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 515 - 736
Target Start/End: Original strand, 1890 - 2111
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1890 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactttttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttcaaccttaatc 1989  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  1990 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctataacatggattaaccattatcaaactgtggaaacgaaaatcgagggtttgataattgttcgtc 2089  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattca 736  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  2090 catcatctcaaatatcaattca 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 4)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 136 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 50622 - 50361
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagac-aaaaatatgtc 234  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  50622 caggaaagaatatttgatgtattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagtcgattggatgcaaaaatacgaagattgaaagacaaaaaatatgtc 50523  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgct--------------------agccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgctt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50522 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttgacacggccgtgccagccttggcacgaccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgctt 50423  T
Q  315 ttgcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcga 376  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50422 ttgcttagattttaagctactatatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcga 50361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 359 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 34089 - 33801
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||||| || |  | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||    
T  34089 gcttagattttaagtcgaatgtaaacgataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgcttttctaa 33990  T
Q  459 taaaagttcattt---------------acttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    ||||||||| |||               |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33989 taaaagttcttttcttttcttttcttttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagact 33890  T
Q  544 tct-cttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatt 630  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33889 tctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatt 33801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 144 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34308 - 34157
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| | | | |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  34308 aatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagcttattcggttctaaaatacgaagattcagagacaaaaatatatctccctcaa 34209  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctc 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  34208 gtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacagccgtgccaccctc 34157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Original strand, 66456 - 66586
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||    
T  66456 caggaaggaatatttgatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattgggaagcaaaa-tatatct 66554  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66555 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 66586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 4)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 351 - 670
Target Start/End: Complemental strand, 60995 - 60665
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  60995 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttcttggaatttaataagtgacaattgt 60896  T
Q  451 ctttctaataaaagtt----------catttacttttctgttatttacttttatgctttctctc-ttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagta 539  Q
    ||||||||||||||||          | ||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  60895 ctttctaataaaagtttttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgtttt-tctccttcttctccatgtctacgttgaacatgagtgagta 60797  T
Q  540 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatct 638  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||  || ||||    
T  60796 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctatttaccttattcttatgtaaccctaatctctaatct 60697  T
Q  639 aaattcaccactttaatatggatcaaccatta 670  Q
    |||||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  60696 aaattcaccgttttaacatgaattaaccatta 60665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 61247 - 61037
Alignment:
Q  138 ggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaa-----tat 231  Q
    |||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||| | |||||||  ||||||||||     ||     
T  61247 ggaatgaatatttgatagattgagtcttagagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcaaaaaaacgaagattcggagacaaaaaaaaaatac 61148  T
Q  232 gtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagc 331  Q
     |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61147 atctccttcaaatcagaagcttgccacggcccgtgctaagcttggcacggccgtgccacctcccaggaaaaattttgctgcttttgcttagattttaagc 61048  T
Q  332 tactctatttt 342  Q
    |||||||||||    
T  61047 tactctatttt 61037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 221 - 342
Target Start/End: Original strand, 60491 - 60613
Alignment:
Q  221 gacaaaaatatgtctc-ccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgct 319  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||    |||||||||| |||||  |  ||| ||||||||||||  || ||||||  |||||| ||||||||||    
T  60491 gacaaaaatatgtcactccccaagtcagagaggtggcacggcctgtgctcccactggcacggccgtgccaagcttcagagtctcttttgttgcttttgct 60590  T
Q  320 tagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  60591 tagattttaagctactctgtttt 60613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Original strand, 60407 - 60450
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60407 caggaatgaatatttgatggattgaatcttgaagcaaaagaaag 60450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 4)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 489 - 694
Target Start/End: Original strand, 17137 - 17344
Alignment:
Q  489 ttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctct-tgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcc 586  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17137 ttttatgttttctctcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctatgtcttaggattgttgaataagtctaaatgacataatcc 17236  T
Q  587 taatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacg 686  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17237 taatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatcaaaattcaccgctttaacatggatcaaccattatcaaactgtggaaacg 17336  T
Q  687 aaagtgga 694  Q
    ||||||||    
T  17337 aaagtgga 17344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 16900 - 17100
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  16900 gaatattggatggattgagtcttggagaaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattcggagacaaaaatatatctccctca 16999  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17000 agtcagaaacttggcatggcccgtggtaggcttggtacggccgtgccaccctccaaaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttt 17099  T
Q  342 t 342  Q
    |    
T  17100 t 17100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 707 - 794
Target Start/End: Original strand, 21385 - 21472
Alignment:
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21385 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 21472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 707 - 794
Target Start/End: Original strand, 25582 - 25669
Alignment:
Q  707 tgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25582 tgtttatccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcaaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 25669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 351 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 38093 - 37742
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||    | |||  |||| |||||||    
T  38093 atgtaattgcttagattctaagtcgattgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgtaat--aataagtgacaa 37996  T
Q  447 ttgtctttctaat-aaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | |||  |||||||||  ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  37995 ttgtttctttaaacaaaagttcacctttactttcttgtcattttcttttatgctttctctcttcttctccatgtctacaatgaacgttagtgagtagact 37896  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  37895 tctcttgttttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaacattaaaccttaatcttatgtaaccctagtttctcttctaaa 37796  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
    |||||   ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37795 ttcacagttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 37742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 739 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 37755 - 37705
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  37755 aaacgaaagtggagctttaatattcaatcaagtgaatttagacaaggattg 37705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38159 - 38119
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38159 ccttttgttgcttttgcttagattctaagctactctatttt 38119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 317 - 505
Target Start/End: Original strand, 3487 - 3676
Alignment:
Q  317 gcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatatt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  3487 gcttagattttaagctactctatttttagcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgaataaatactataaatagagtagacatccatcacaaataat 3586  T
Q  417 catcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctct 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||    
T  3587 catcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagctcattttactttcttgctatttacttttatgttttctctct 3676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 503 - 789
Target Start/End: Original strand, 1219 - 1504
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1219 tcttcttctctacgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcct 1318  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttga 702  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||| || ||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||| |     
T  1319 taaaccttaatattatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccattttcacatgaattaacaattatcaaactcatgaagcgaaagtggagggttag- 1417  T
Q  703 taattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtgg-agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1418 taattgttaattcatcatctcaaat-tcaattcatcaagtgaaagtggaagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 45136 - 45342
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  45136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 45235  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45236 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggtcgtgccaccctctagagtgacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 45335  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  45336 ctatttt 45342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 43616 - 43822
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  43616 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaagggcttggagctgattccgtgcgaaaatacaaagattgagagacaaaaatatgtct 43715  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43716 ccccaaagtcagaagcttggcacggcctgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagctact 43815  T
Q  336 ctatttt 342  Q
    |||||||    
T  43816 ctatttt 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 527 - 595
Target Start/End: Original strand, 49820 - 49888
Alignment:
Q  527 acattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 595  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49820 acataagtgagtagacctttcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaac 49888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 267
Target Start/End: Original strand, 31422 - 31485
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgc 267  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31422 aaaatacgaagattga-agacaaaaatatgatttccgcaagttagaagcttggcacggcccgtgc 31485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 717 - 783
Target Start/End: Original strand, 49996 - 50062
Alignment:
Q  717 tcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  49996 tcatctcaaatatcaattcataatgcgaacgcagagctttgatattggaacatgtgaaattagacaa 50062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 136; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Original strand, 18967 - 19242
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||     
T  18967 tgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaata 19066  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattca-ccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    ||||||||||||| || ||  |||||||||| |   ||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  19067 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcatcgtttttaacatggattaaatattatctaactgtggaaacgaaagtggagagtttgataatcgttaat 19166  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||    ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19167 ccatcattctaaatgttaattcataaaacgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 19242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 424
Target Start/End: Original strand, 33830 - 34111
Alignment:
Q  152 atggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaag 250  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||  || |||||| ||||||||||     
T  33830 atggattgagtcatggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaataatatctccctcaagtcagaaa 33929  T
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt-------t 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  33930 cttggcacggcccgtgctaggcttggcacggacgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctactctgttttagtttact 34029  T
Q  344 agcccaaat-gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
     |   || | || || |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34030 tgtggaactagtgattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 34111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 479 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 1691 - 1423
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1691 tgttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatatctacgatgaacatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatga 1593  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    | ||| ||| || ||| || |||||||||    
T  1592 cataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttataacatgaattaacaataatcaaactg 1493  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    | ||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  1492 tagaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattaataaaacgaaagtg 1423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 423 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1759 - 1714
Alignment:
Q  423 ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1759 ttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 479 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 3068 - 2800
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 578  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3068 tgttatttacttt-atgcttttcttcttcttctccatatctacgatgaacatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatga 2970  T
Q  579 cataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactg 678  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||    | ||| ||| || ||| || |||||||||    
T  2969 cataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttataacatgaattaacaataatcaaactg 2870  T
Q  679 tggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    | ||| ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2869 tagaagcgaaaatggagggttag-taattgttaattcatcatctcaaatatcaattaataaaacgaaagtg 2800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 130; Significance: 6e-67; HSPs: 3)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 549 - 789
Target Start/End: Original strand, 4926 - 5167
Alignment:
Q  549 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccc-taattccttatctaaattcacc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||| || || ||  ||||||||||||    
T  4926 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcctcaaaccttaatattatgtaacccctagtttctcttctaaattcacc 5025  T
Q  648 actttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaag 747  Q
      ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||||| |||||||||||| ||||    
T  5026 gttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataatcgttaatccataattccaaatattaattcataaaacaaaag 5125  T
Q  748 tggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5126 tggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 5167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 4538 - 4744
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | |  ||| | ||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| ||    
T  4538 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggaactcattcggtgcgaaaatacgaatattcggagacaaaaatatatc 4637  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||   |||   |||||||| ||||  | |||  | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4638 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaaggttgtctcggccgtggcacctccaagacaggcttttactgcttttgcttagattctaagctac 4737  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  4738 tctattt 4744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 351 - 466
Target Start/End: Original strand, 4786 - 4901
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  4786 atgtaattgcttagattttaagttgaatgttacctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttagaattcaataagtgacaattgt 4885  T
Q  451 ctttctaataaaagtt 466  Q
    ||||  ||||||||||    
T  4886 cttttgaataaaagtt 4901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 351 - 695
Target Start/End: Original strand, 61792 - 62142
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt----ggaatgcaatatgtgacaa 446  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    | |||  |||| |||||||    
T  61792 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttctctgaaat--aataagtgacaa 61889  T
Q  447 ttgtctttct-aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagact 543  Q
    |||| | | | ||||||| || |  ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  61890 ttgtttctttgaataaaaattgacctttactttcttgtcatttacttttatgctttctctcttcttctctatgtctacaatgaacgtcagtgagtagact 61989  T
Q  544 tctcttgtcttgggattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaa 641  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||    
T  61990 tctctt-tcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaattgaaccaaaccttaaaccttaatcttatgtaaccctagtttctcttctaaa 62088  T
Q  642 ttcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggag 695  Q
    ||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62089 ttcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacgaaactggag 62142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 342
Target Start/End: Original strand, 61726 - 61766
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61726 ccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctatttt 61766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 739 - 789
Target Start/End: Original strand, 62129 - 62179
Alignment:
Q  739 aaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  62129 aaacgaaactggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 62179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34981 - 34773
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  34981 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 34882  T
Q  235 tcccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34881 tcccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattgccacggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagattttaagcta 34782  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
    |||||||||    
T  34781 ctctatttt 34773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 120; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 574 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2143 - 1919
Alignment:
Q  574 aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaa----ccatt 669  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||| || ||||||||||| |  ||||| ||| || ||    |||||    
T  2143 aatgacataatcctaatcgaaccaagttttaaaccctaattttatgtaactctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaattaattaaccatt 2044  T
Q  670 atcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaa 769  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  2043 aacaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatccattatttcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcaaacaa 1944  T
Q  770 gtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||    
T  1943 gtgaatttagacaatgattgcaaag 1919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 357
Target Start/End: Original strand, 2234 - 2434
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2234 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattggatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 2333  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    |||  |||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2334 ccccaaagtcagaagcttggcacg---------------------gccgtgccaccctccagagtgtcttttgttgcttttgcttagattttaagctact 2412  T
Q  336 ctatttttagcccaaatgtaat 357  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  2413 ctatttttagcccgaatgtaat 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 113; Significance: 8e-57; HSPs: 5)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 616 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 70501 - 70334
Alignment:
Q  616 tatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatcc 715  Q
    ||| ||||||||||  || |||||||||||||  ||||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  70501 tatntaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaattaaccattatcaaactatgaaaacgaaagtggagggtttgataattgttaatcc 70402  T
Q  716 atcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 783  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70401 atcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaa 70334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 285
Target Start/End: Original strand, 58817 - 58966
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  58817 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatatgtct 58916  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgt 285  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  58917 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgt 58966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 143 - 290
Target Start/End: Original strand, 36793 - 36941
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  36793 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctca 36892  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccac 290  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36893 agtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccac 36941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 53704 - 53763
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  53704 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 53763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 42422 - 42467
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42422 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 42467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 112; Significance: 3e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 489 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 7013 - 6690
Alignment:
Q  489 ttttatgctttct-ctcttcttctccttgtct-acgatgaacattagtgagtagactt-ctcttgtctt-gggattgttggataagtctaa-tgacataa 583  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7013 ttttatgttttcttctcttcttctccttgtcttacaatgaacgtcagtgagtagactttctcttgtctttgggattgttggataagtctaaatgacataa 6914  T
Q  584 tcctaatcaaaccaag-ctttaaa-ccttaatcttatgtaa-ccctaattccttatct-aaattcaccacttt-aatatggatcaaccattatcaaact- 677  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||     
T  6913 tcctaatcaaaccaagactttaaacccttaatcttatgtaacccctaattccttatctaaaattcaccgctttaaatatggatcaaccattatcaaacta 6814  T
Q  678 gtggaaac-gaaagtggaggg-tttgat-aattg-tttatccatcatctcgaat-atcaatt-cat-aaaacg-aaagtgga-gctttgata-ttcgaac 767  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  6813 gtggaaacggaaagtggagggttttgataaattgttttatccatcatctcaaataatcaattacataaaaacgaaaagtggaggctttgatatttcgaac 6714  T
Q  768 aa-gtgaa-tttagacaaagattg 789  Q
    || ||||| ||||||||| |||||    
T  6713 aacgtgaattttagacaaggattg 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 515 - 776
Target Start/End: Original strand, 47822 - 48100
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttc--tcttg-tcttggg-attgttggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaacc-aagctttaaac 607  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  ||| |    
T  47822 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctttcttgttcttgggtattgttggataagtctaaattgacataatcctaatcaaaccaaagccctaagc 47921  T
Q  608 cttaatcttatg-taaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatgga-tcaacca-ttatc-aaactgtggaaacgaaagtgg-agggtttga 702  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||   |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47922 cttaatcttatgttaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatttaaccatttatcaaaactgtggaaacgaaagtggtagggtttga 48021  T
Q  703 taattgtttatcc-atca-tctcgaatatcaattcat-aaaacg-aaagtggagc-tttgatattcgaacaagtgaatt 776  Q
    ||||||||  ||| || | ||   ||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48022 taattgttcgtcctattattccaaaatatcaattcataaaaacgaaaagtgaagcttttgatattcgaacaagtgaatt 48100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 211 - 342
Target Start/End: Original strand, 47462 - 47598
Alignment:
Q  211 aagattgagagacaaaaata-tgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcc-ttggtacgg-ccgtgccaccct-ccagagtgcc-tt 305  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| |||| ||    
T  47462 aagattgggaaacaaaaataatatctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcctttggcacggcccgtgccaccctcccagattgccttt 47561  T
Q  306 ttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||| ||||||||    
T  47562 ttgctgcttttgctttgactccaagctattctatttt 47598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 110; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 389 - 593
Target Start/End: Original strand, 3824 - 4040
Alignment:
Q  389 aatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaataaaagttcattt----------acttttc 478  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||          |||||      
T  3824 aatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgtctttctaataaaagttcttttcttttcctttactttct 3923  T
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttc-tcttgtcttgggattgttggataagtct-aat 576  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3924 tgtcatttacttttatgctttctctcttcttctccatgtttacgttgaacatgagtgagtagacttctttttgtcttgggattgttggataagtctaaat 4023  T
Q  577 gacataatcctaatcaa 593  Q
    |||||||||||||||||    
T  4024 gacataatcctaatcaa 4040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 3587 - 3793
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  3587 caggaacgaattttggatggattga-tcttgtagcaaaaaaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 3685  T
Q  236 cccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3686 ccctcaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattgggacggccgttccaccctccagagtcacttttgctgcttttgcttagactttaagctac 3785  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    | ||||||    
T  3786 tatatttt 3793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 108; Significance: 8e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 663 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 22604 - 22473
Alignment:
Q  663 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatatt 762  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22604 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccattatcccaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatatt 22505  T
Q  763 cgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22504 cgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 22473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0809 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0809
Description:

Target: scaffold0809; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 266
Target Start/End: Original strand, 5659 - 5789
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5659 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 5758  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtg 266  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  5759 cccccatgccagaagcttggcacggcccgtg 5789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 106; Significance: 1e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 351 - 629
Target Start/End: Original strand, 19612 - 19905
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt---cttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||   |||||||| | ||| ||||||||    
T  19612 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcataaatattcatcttttattcttggaattcgataagtgacaat 19711  T
Q  448 tgtctttct-aataaaagttcattt----------acttttctgttatttacttttatgctttctctct-tcttctccttgtctacgatgaacattagtg 535  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||          |||||  ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  19712 tgtctttcttaataaaagttcttttcttttcctttactttcttgttatttacttttatgcttt-tctccgtcttctccatgtatacgatgaacatgagtg 19810  T
Q  536 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  19811 agtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaaccctaat 19905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 17382 - 17507
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  17382 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagaaaaagaaaggagttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 17481  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  17482 tcccccaagtcagaagcttggcacgg 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 260
Target Start/End: Original strand, 27334 - 27459
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||   |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  27334 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagaaaaagaaaggagttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 27433  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacgg 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  27434 tcccccaagtcagaagcttggcacgg 27459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 342
Target Start/End: Original strand, 19545 - 19586
Alignment:
Q  301 gccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19545 gccttttactacttttgcttagattttaagatactctatttt 19586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 44268 - 44011
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||             ||    
T  44268 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaatcaag-------------tc 44182  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    |||   ||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||| || ||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||| || ||     
T  44181 tta---aaccctaatttttaatctaaattcaccgttttaacatgaattaacaaatatcaaattgtagaagcgaaagtggagggttag-taattattaatt 44086  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44085 catcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagttttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattg 44011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 103; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 12702 - 12828
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12702 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 12801  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||    
T  12802 cccccatgccagaagcttggcacggcc 12828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 432
Target Start/End: Original strand, 12211 - 12510
Alignment:
Q  144 aatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga-gacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || |||| |||| | |||| ||||| |||||||  || ||||||| |||||||||| |||    
T  12211 aatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagaggattggagctgatttggtgcagaaatacgaagattcggaagacaaaa-tatgtctcccccaa 12309  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt-- 340  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12310 gtcagaaccttggcacggcccgtgctaggcttggcacggccgtgccaccttccaatgcctcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 12409  T
Q  341 --ttta-------gcccaaatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaa 431  Q
      ||||       ||||   | |  | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12410 agtttaccggaatgcccttttatggttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaa 12509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 359 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 152 - 1
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  152 gcttagattttaagtcaattgtttactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattgtctttctaa 53  T
Q  459 taaaagttca-tttacttt-tctgttatttacttttatgctttctctcttct 508  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52 taaaagttcattttactttctttgttatttacttttatgttttctctcttct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 364 - 265
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  364 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgatttggtataaaaatatgaagattcggagacaaaaatatgtct 265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Original strand, 2228 - 2435
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||| ||| ||    
T  2228 caggaaagaatatttgatagattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaagtatatc 2327  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2328 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttggcacggtcgtgccacactccagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 2427  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||| ||||    
T  2428 tctgtttt 2435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 523 - 600
Target Start/End: Original strand, 14214 - 14291
Alignment:
Q  523 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||    
T  14214 atgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacctaatccctatcgaaccaagc 14291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Original strand, 2464 - 2529
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||||||||||| || || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2464 gcttagattttaagtggaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 2529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 359 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15594 - 15442
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttctaa 458  Q
    |||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15594 gcttagattttaagtcaaatgtgtactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaatacaatatgtgacaattttctttctaa 15495  T
Q  459 taaaagttca-tttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttc 510  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15494 taaaagttcattttactttcttgttatttacttttatgttttctctcttcttc 15442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15689 - 15634
Alignment:
Q  287 ccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||    
T  15689 ccaccctccagagcaccttttgctgcttttgcttggattctgagctattctatttt 15634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 232665 - 232457
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||| |||| |  ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  232665 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcacaagaaaggggttttggagctgattcggagcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 232566  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca-gagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 333  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||||||  ||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  232565 tcccccaagtcagaagcttggcatggcctgtgctaacattggcacggccgtgccacctcccaggacacccttttgctgcttttgcttagattttaagcta 232466  T
Q  334 ctctatttt 342  Q
     ||||||||    
T  232465 ttctatttt 232457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 351 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 232412 - 232292
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaat 447  Q
    |||||||  |||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||    
T  232412 atgtaattacttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaat 232313  T
Q  448 tgtctttc-taataaaagttc 467  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  232312 tgtctttcttaataaaagttc 232292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 136 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 179 - 1
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  179 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtc 80  T
Q  235 tcccacaa-gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgc 312  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  79 tcccccaacgtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcatggccgtgccaccctccagagtcacttttgctgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 504 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 17867 - 17741
Alignment:
Q  504 cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  17867 cttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagcta 17768  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaaccctaat 629  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||    
T  17767 ttgaccctaatcttatgtaacactaat 17741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18198 - 18071
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||    
T  18198 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtgcaaaaatacgaagattcggagacaaaaatacatc 18099  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18098 tccctcaagtcagaagcttggcacggcc 18071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 351 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 17970 - 17869
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaatatgtgacaattgt 450  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17970 atgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaataagtgacaattgt 17871  T
Q  451 ct 452  Q
    ||    
T  17870 ct 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18049 - 18012
Alignment:
Q  305 tttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049 tttgctacttttgcttagattttaagctactctatttt 18012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 139 - 246
Target Start/End: Original strand, 39398 - 39504
Alignment:
Q  139 gaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctccc 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39398 gaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatacaaaaatatgaagattgagagac-aaaatatgtctccc 39496  T
Q  239 acaagtca 246  Q
    ||||||||    
T  39497 acaagtca 39504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 143 - 262
Target Start/End: Original strand, 29 - 148
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  29 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttagagctgattgaatgcgaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcctcaaa 128  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  129 gtcagaagcttggcacggcc 148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 37622 - 37416
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  37622 caggaatgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 37523  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| |||||||||| ||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  37522 tccctcaagtcagaaacttggcaagacccgtgctaaggttggcacggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttacttagattctaagctac 37423  T
Q  335 tctattt 341  Q
    |||||||    
T  37422 tctattt 37416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 351 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 37374 - 37298
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttctt 427  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||    |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  37374 atgtaattgcttagattttaagtagaatgttacctataaatagagcagctagccatcacaaatattcatcttttctt 37298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 241 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14184 - 14083
Alignment:
Q  241 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 340  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14184 aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagcattggcacggccgtgccaccctccagagttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatt 14085  T
Q  341 tt 342  Q
    ||    
T  14084 tt 14083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 14052 - 14004
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtag 398  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14052 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtag 14004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 136 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 2315 - 2108
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  2315 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaataaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 2216  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctac 334  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2215 tccctcaagtcataaacttggcacggcccgtgctaggcttagcacggccatgccacactctagaactacttttgctgcttttgcttagattttaagctac 2116  T
Q  335 tctatttt 342  Q
    ||| ||||    
T  2115 tctgtttt 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 359 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2079 - 2014
Alignment:
Q  359 gcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  2079 gcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 2014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 342
Target Start/End: Original strand, 20039 - 20238
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaa 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |  ||||| |||||||||||  | ||||||||||  ||||||  ||    
T  20039 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggtttggagctgatttggagcaaatatatgaagatttggtgacaaaaatacatctccccaaa 20138  T
Q  243 gtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    ||| |||||||||||||   ||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139 gtcagaagcttggcacggcccatgctaagggtggcacggccgtgccacatcccacacttgcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 20238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 350 - 438
Target Start/End: Original strand, 20269 - 20357
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaata 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20269 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttggaattcaata 20357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0557
Description:

Target: scaffold0557; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 713 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 1317 - 1236
Alignment:
Q  713 tccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1317 tccatcatctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 1236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0557; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1978
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2016 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 1978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Original strand, 14548 - 14632
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga 220  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14548 caggaaagaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga 14632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 699 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 45058 - 44963
Alignment:
Q  699 ttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45058 ttgataattgttaatccatcatctcaaatatcaattcataaaatgaaagtggagctttcatatttgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 44963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 457 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 22461 - 22124
Alignment:
Q  457 aataaaagttca--tttacttttctgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctcct---tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttg 550  Q
    ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |   ||||||| |||||| | |||||||||||   |||||    
T  22461 aataaaagttcacctttattttattgttatttacttttatgttattct-tcttcttctcttctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagacacttcttg 22363  T
Q  551 tcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccact 650  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||| |||| |||  ||| || || |||||| ||||||  |    
T  22362 tcttgggattgatggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtt 22263  T
Q  651 ttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtg 749  Q
    || || ||| || ||| | || ||||||    || ||| ||||||||||| | || ||||| || ||||||| | |||||||||||||||| ||| || |    
T  22262 tttataatgaattaacaaataccaaactcataaaccgacagtggagggttag-tatttgttaattcatcatcacaaatatcaattcataaagcgacagcg 22164  T
Q  750 gagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22163 gagttttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 22124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 85 - 1
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgaga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  85 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattagatgcaaaaatacgaagattgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 38631 - 38532
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38631 caggaaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaataaagggacttggagccgattggacacaaaaatatgaagattgagagac-aaaatatgtct 38533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 615 - 774
Target Start/End: Original strand, 74174 - 74333
Alignment:
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaatatggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttatc 714  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  74174 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggattaaatattatcaaactgtggaaacaaaagtggagggtttgataatcgttaatc 74273  T
Q  715 catcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaa 774  Q
    ||| ||  | ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  74274 cattattccaaatgttaattcataaaacgaaagtggggctttaatattcgatcaagtgaa 74333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 73354 - 73481
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  73354 caggaacgaatatttgatggattgagttttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcgctacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 73453  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  73454 tccctcaagtcagaagcttggcacggcc 73481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 341
Target Start/End: Original strand, 73476 - 73539
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctattt 341  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  73476 acggccgtgccacctcccagacagccttttgctgcttttgcttagattctaagctactctattt 73539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 8992 - 9118
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  8992 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattccgagacaaaaatatgtct 9091  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  9092 ccccaaagtcagaagcttggcacggcc 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 342
Target Start/End: Original strand, 9113 - 9177
Alignment:
Q  278 acggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9113 acggccgtgccactcttcagagtcacttttgctacttttgcttagattttaaactactctatttt 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11031
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11164 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggaacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaatacgtct 11065  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 269  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11064 ccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgcta 11031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 483 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 3823 - 3776
Alignment:
Q  483 atttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacat 530  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3823 atttacttttatgctttctctcttcttccccttgtctacgatgaacat 3776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 719 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5834
Alignment:
Q  719 atctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5909 atctcaaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaattttgacaaagattgtaaag 5834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 66; Significance: 9e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 166 - 6
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |    
T  166 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagctgattcggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgttt 68  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctcca 296  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  | ||||||||||||||||    
T  67 cccccaaagtcagaagcttggcacgacccgtgctatcattggcgcagccgtgccaccctcca 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 9064 - 8972
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaa 606  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9064 tgtctacaatgaacgttagtaagtagaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaaa 8972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 663 - 698
Target Start/End: Complemental strand, 8950 - 8915
Alignment:
Q  663 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggt 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8950 aaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggt 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9297 - 9258
Alignment:
Q  303 cttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9297 cttttgctgcttttgcttagatttttagctactctgtttt 9258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 351 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9232 - 9159
Alignment:
Q  351 atgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    ||||||| | ||||||| ||| |||| || |  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  9232 atgtaattgtttagattctaattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 9159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 515 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 9195 - 8917
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  9195 tgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaactctaatt 9096  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  ||| || || ||||||||||||   ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||||| | || || || ||    
T  9095 ttatataaatctactttctaatctaaattcactgtttttataatgaattaacaaataccaaact-caaaagcgaacgcggagggttag-tattttttaat 8998  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8997 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacacggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattgcaaag 8917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 275
Target Start/End: Original strand, 61658 - 61798
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | ||||||||||||||  ||||||||||||| |     
T  61658 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatatgaagattcggagacaaaaatatatt 61757  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttg 275  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  61758 tccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctaggcttg 61798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 515 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 6680 - 6406
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 614  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||     
T  6680 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctaatt 6581  T
Q  615 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccactttaat-atggatcaaccattatcaaactgtggaaacgaaagtggagggtttgataattgtttat 713  Q
    |||| |||  | | || || |||||| ||||||  ||| || ||| || ||| | || ||||||    || |||| | |||||| | | || ||||| ||    
T  6580 ttatataaatccactttctaatctaatttcaccgttttgataatgaattaacaaataccaaactcataaagcgaacgcggagggatag-tatttgttaat 6482  T
Q  714 ccatcatctcgaatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6481 tcatcatcacaaatatcaattcataaagcgaacacggagctttgatattggaacaagtgaaattagacaaggattg 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 3220 - 3274
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagc 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3220 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagc 3274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 283
Target Start/End: Original strand, 12544 - 12691
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || | |||| | | | |||||| |||||||  ||||| |||||||||||    
T  12544 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggatctgatttggtacgaaaatacgaagatttggagac-aaaatatgtct 12642  T
Q  236 cccac-aagtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggcc 283  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  12643 cccccaaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagaattggcacggcc 12691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 503 - 627
Target Start/End: Original strand, 38640 - 38763
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |    
T  38640 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcatattcaaaccaagcct 38738  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaacccta 627  Q
      |||| |||| |||||||||||||    
T  38739 agaaccctaattttatgtaacccta 38763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 61; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 136 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24204 - 24069
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  24204 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 24106  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc 271  Q
     |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24105 cccctaaagtcagaagcttggcacggtccgtgctagc 24069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1354 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1354
Description:

Target: scaffold1354; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 755 - 606
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccaca 241  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| | ||| |||||| |||||||  ||||||||||||| | |||| ||    
T  755 gaatatttgatggattgagtcttcgagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtgcgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatatccctca 656  T
Q  242 agtcagaagcttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccacc 291  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  655 agtcagaagtttggcaaggcccgtgctaagattggcacggccgtgccacc 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 384 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 191268 - 191098
Alignment:
Q  384 ctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctt---ttcttggaatgcaatatgtgacaattgtctttc-taataaaag----------ttcat 469  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||          ||| |    
T  191268 ctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttattttcttttcct 191169  T
Q  470 ttacttttctgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtag 540  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  191168 ttactttcttgttatttacttttatgattttcttcttcttctccatgtctacgatgaacatgagtgagtag 191098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 479 - 622
Target Start/End: Original strand, 168272 - 168414
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgct-ttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatg 577  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  168272 tgttatttacttttatgttcttct-tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgtgattgttggatgagtctaatg 168369  T
Q  578 acataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 622  Q
    || |||||   |||||||||| | |  |||| |||||||||||||    
T  168370 acctaatctctatcaaaccaaacctagaaccctaatcttatgtaa 168414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 191470 - 191362
Alignment:
Q  211 aagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctagc-cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgc 309  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||| | |  |||| ||||||||||||||| | ||||   |||||||    
T  191470 aagattga-agacaaaaatatgtttccc-caagtcagaagcttggcacggcgaatgccaccagttggcacggccgtgccaccccctagagcctcttttgc 191373  T
Q  310 tgcttttgctt 320  Q
    |||||||||||    
T  191372 tgcttttgctt 191362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Original strand, 42796 - 42856
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42796 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattg 42856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 595
Target Start/End: Original strand, 21291 - 21371
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 595  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21291 tgtctacaataaacgttagtgagtagactcttcttgttttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 21371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 515 - 590
Target Start/End: Original strand, 21436 - 21511
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaat 590  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21436 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgatgtaatcctaat 21511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 56; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 189936 - 190063
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||| |||| ||| | |||||| |||||||  ||||||||||||| |     
T  189936 caggaatgaatatttgatggattgagtcttagagcaaaagaaaggggttttggagctgattcgatacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatg 190035  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  190036 tccctcaagtcagaagcttggcacggcc 190063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1185
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||    
T  1083 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcagtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatgtct 1182  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  1183 ccc 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 55; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 137 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 2456 - 2330
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  2456 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggggttttggagctgattcggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatct 2357  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2356 ccctcaagtcagaaacttggcacggcc 2330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 282 - 339
Target Start/End: Original strand, 4835 - 4892
Alignment:
Q  282 ccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctat 339  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4835 ccgtgccaccctccagagtgtcttttgctgcttttgcttagattttaagctactctat 4892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 600
Target Start/End: Original strand, 1765 - 1849
Alignment:
Q  515 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  1765 tgtctatgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagc 1849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0374 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0374
Description:

Target: scaffold0374; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 263
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4836
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttg-agccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtc 234  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||| ||| |||| | | | |||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  4708 caggaacgaatatttgatggattgagtattggagcaaaagaaaggggttttggagctgatttggtacgaaaatacgaagattcggagacaaaaatatatc 4807  T
Q  235 tcccacaagtcagaagcttggcacggccc 263  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||    
T  4808 tccctcaagtcagaaacttggcacggccc 4836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0855
Description:

Target: scaffold0855; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 3572 - 3690
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  3572 tcttcttctctatgtttacaataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcct 3670  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||| ||||||||    
T  3671 cgaaccctaattttatgtaa 3690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0847
Description:

Target: scaffold0847; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 503 - 622
Target Start/End: Original strand, 3737 - 3855
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctt 602  Q
    ||||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  3737 tcttcttctctatgtttacaataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcct 3835  T
Q  603 taaaccttaatcttatgtaa 622  Q
      |||| |||| ||||||||    
T  3836 cgaaccctaattttatgtaa 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1202 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1202
Description:

Target: scaffold1202; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 273 - 49
Alignment:
Q  251 cttggcacggcccgtgctagccttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt-------t 343  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||       |    
T  273 cttggcacgacccgtgctaagcttggcacggtcgtgccaccctccagaactacttttgctgtttttgcttagattttaagctactctgttttagtttact 174  T
Q  344 agcccaa-at----gtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatcttttcttggaatgcaata 438  Q
     |   || ||    || || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  173 tgtggaacattctagtgattgcttaaattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatat--atctttt-ttggaattcaata 77  T
Q  439 tgtgacaattgtctttctaataaaagttc 467  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  76 -gtgacaattgtctttctaataaaagttc 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0514 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0514
Description:

Target: scaffold0514; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 136 - 230
Target Start/End: Original strand, 7707 - 7801
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaata 230  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||   | | |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7707 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatttagtacgaaaatacgaagattcagagacaaaaata 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 342
Target Start/End: Original strand, 5303 - 5373
Alignment:
Q  272 cttggtacggccgtgccaccctccagagtgccttttgctgcttttgcttagattttaagctactctatttt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5303 cttggcacggccgtgccaccctccagagttgtttttggtgcttttgcttagattttaagctactctatttt 5373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 350 - 424
Target Start/End: Original strand, 5404 - 5478
Alignment:
Q  350 aatgtaatagcttagattttaagtcgattgaatgctataaatagagtagtcatccatcacaaatattcatctttt 424  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  5404 aatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttt 5478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Original strand, 5188 - 5314
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  5188 caggaatgaatgttggatggattgagtcttggagcaaaagaaggggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 5286  T
Q  236 cc-cacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||    
T  5287 ccgctaaagtcagaagcttggcacggcc 5314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 264
Target Start/End: Original strand, 1056 - 1184
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  1056 caggaatgaatattggatggattgggtcttggaacaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 1154  T
Q  236 -cccacaagtcagaagcttggcacggcccg 264  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1155 cccctaaagtcagaagcttggcacggcccg 1184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 479 - 544
Target Start/End: Original strand, 12513 - 12578
Alignment:
Q  479 tgttatttacttttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagactt 544  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12513 tgttatttatctttatgctttctctcttcttctccttgtctacgatgaacgtcagtgagtagactt 12578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 504 - 600
Target Start/End: Original strand, 1506 - 1601
Alignment:
Q  504 cttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  1506 cttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagc 1601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34048
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagatt 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  | ||||||||||||||    
T  34128 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacgaaaatatgaagatt 34048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 503 - 599
Target Start/End: Complemental strand, 22721 - 22626
Alignment:
Q  503 tcttcttctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 599  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||| | || ||| ||  |||||||||||    
T  22721 tcttcttctctatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttttcttaggattgttggatgagtctattaacctaacccctatcaaaccaag 22626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Original strand, 54339 - 54399
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54339 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgattg 54399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 178
Target Start/End: Original strand, 49808 - 49850
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaa 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49808 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaa 49850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 3442 - 3501
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3442 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagccgatt 3501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 48; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 387 - 263
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||  ||| |  ||||||||| ||||| |  |||||||||  ||||||    
T  387 caggaatgaatatttgatggattgaatcttggagcaaaagaaaggagtttggagctcattcggagcaaaaatacgaagaatcggagacaaaa--atgtct 290  T
Q  236 cccacaagtcagaagcttggcacggcc 262  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  289 cccccaagtcagaagcttggcaaggcc 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0841 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0841
Description:

Target: scaffold0841; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Original strand, 5275 - 5376
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  5275 caggaatgaatattggatggattgagtattggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacaaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 5373  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  5374 ccc 5376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7523 - 7422
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtct 235  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| | | | ||||||  |||||||  |||| |||||||||||    
T  7523 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattcggtacgaaaatacaaagattggaagac-aaaatatgtct 7425  T
Q  236 ccc 238  Q
    |||    
T  7424 ccc 7422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 46; Significance: 8e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 551 - 600
Target Start/End: Original strand, 21748 - 21797
Alignment:
Q  551 tcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 600  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21748 tcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaaaccaagc 21797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 177
Target Start/End: Original strand, 8767 - 8808
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaa 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8767 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaa 8808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0416 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0416
Description:

Target: scaffold0416; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Original strand, 15663 - 15723
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattg 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15663 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgattg 15723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0871 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0871
Description:

Target: scaffold0871; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4952
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4893 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 4952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 203 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 70 - 3
Alignment:
Q  203 aaaatatgaagattgagagacaaaaatatgtctcccacaagtcagaagcttggcacggcccgtgctag 270  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  70 aaaatacgaagattcggagacaaaaatatatctccctcaagtcagaaacttggcacggcccgtgctag 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Original strand, 2984 - 3043
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2984 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 3043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 58505 - 58446
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgatt 195  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  58505 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagctgatt 58446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 190
Target Start/End: Original strand, 8272 - 8326
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagc 190  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8272 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaagggacttggagc 8326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 744 - 794
Target Start/End: Original strand, 1 - 51
Alignment:
Q  744 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1 aaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaggattgcaaag 51  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 731 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 2247 - 2189
Alignment:
Q  731 aattcataaaacgaaagtggagctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattg 789  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2247 aattcataaaatgaaagtggagctttaatattcgatcaagtgaatttagacaaggattg 2189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 4193 - 4148
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4193 caggaacgaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 4148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 859 - 778
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattg 217  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  |||||| ||||||||||    
T  859 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattggacacaaaaacatgaagattg 778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2587 - 2544
Alignment:
Q  751 agctttgatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2587 agcttggatattcgaacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 2544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Original strand, 3653 - 3699
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3653 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 3699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 136 - 176
Target Start/End: Original strand, 11908 - 11948
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaaga 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11908 cagggaagaatattggatggattgagtcttggagcaaaaga 11948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 86109 - 86063
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  86109 caggaacgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggga 86063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1004
Description:

Target: scaffold1004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 725 - 764
Target Start/End: Complemental strand, 3493 - 3454
Alignment:
Q  725 aatatcaattcataaaacgaaagtggagctttgatattcg 764  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3493 aatatcaattcataaaatgaaagtggagctttgatattcg 3454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0594 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0594
Description:

Target: scaffold0594; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44 - 1
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaag 179  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44 caggaatgaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaag 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 11935 - 11897
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11935 gaatattggatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 11897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46957 - 46867
Alignment:
Q  137 aggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattggatgcaaaaatatgaagattgagagacaaaa 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  |||| | | | |||||| |||||||  |||||||||    
T  46957 aggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaagggatttggagttgattcggtacgaaaatacgaagatttggagacaaaa 46867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 550 - 595
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  550 caggaacgaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 84257 - 84195
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaagggactttgagccgattgga 198  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  84257 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaagggatttggagcagattgga 84195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 335
Target Start/End: Original strand, 54751 - 54784
Alignment:
Q  302 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54751 ccttttgctgcttttgcttagattttaagctact 54784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 10
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggga 182  Q
    |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  56 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaaggga 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 19803 - 19841
Alignment:
Q  143 gaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19803 gaatatttgatggattgagtcttggagcaaaagaaaggg 19841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 509 - 567
Target Start/End: Original strand, 36484 - 36541
Alignment:
Q  509 tctccttgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggat 567  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||    
T  36484 tctctttgtctacgatgaacatgagtgagtagacctct-aggtcttgggattgttggat 36541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 181
Target Start/End: Original strand, 5740 - 5785
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggagcaaaagaaaggg 181  Q
    |||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5740 cagggaagaatattggatggagagagtcttggagcaaaagaaaggg 5785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 765 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 2278 - 2249
Alignment:
Q  765 aacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 794  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2278 aacaagtgaatttagacaaagattgtaaag 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 169
Target Start/End: Original strand, 162281 - 162314
Alignment:
Q  136 caggaaagaatattggatggattgaatcttggag 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  162281 caggaaagaatattggatggattgagtcttggag 162314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 588 times since January 2019
Visitors: 2233