View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0181-INSERTION-12 (Length: 745)
Name: NF0181-INSERTION-12
Description: NF0181
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF0181-INSERTION-12 |
 | |
|
| [»] chr2 (1 HSPs) |
| |
|
Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 726; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 726; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 745
Target Start/End: Original strand, 17924288 - 17925025
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
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| T |
17924288 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatactc |
17924387 |
T |
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| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
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| T |
17924388 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
17924487 |
T |
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| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
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| T |
17924488 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
17924587 |
T |
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| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
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| T |
17924588 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
17924687 |
T |
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| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
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| T |
17924688 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
17924787 |
T |
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| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttact |
607 |
Q |
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| T |
17924788 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtgtagtttact |
17924887 |
T |
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| Q |
608 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
707 |
Q |
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| T |
17924888 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
17924987 |
T |
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| Q |
708 |
agacttggaacttgtccaaccgaattcatgttttctga |
745 |
Q |
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| T |
17924988 |
agacttggaacttgtccaaccaaattcatgttttctga |
17925025 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 528; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 528; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12931603 - 12930872
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
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| T |
12931603 |
aatatattctaagcttgtacattcaccaatttctctaggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaatgcttcaatattttttaacataccc |
12931504 |
T |
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| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
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| T |
12931503 |
acttctcttggtaagctaccacttaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
12931404 |
T |
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| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
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| T |
12931403 |
gcttattatgagaaagatcaagagattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattctaaataata |
12931304 |
T |
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| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
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| T |
12931303 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctcctgacaacttgttttccctcaaagataatacctgcatcttttggaacttcccaaaatttgtt |
12931204 |
T |
|
| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
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| T |
12931203 |
ggaataattccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactagacgtcctaattctgcaggaatttttcctgatatcatattacccc |
12931104 |
T |
|
| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttact |
607 |
Q |
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| T |
12931103 |
ccatatatagttctggaagttcagtcgataaattgcctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaagcacgtatagtttact |
12931004 |
T |
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| Q |
608 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
707 |
Q |
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| T |
12931003 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattgttacctaaattgttaacttccaaacttaggaaggaaagatcttgtaaattccta |
12930904 |
T |
|
| Q |
708 |
agacttggaacttgtccaaccgaattcatgtt |
739 |
Q |
| |
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| T |
12930903 |
agacttggaacttgtccaaccaaattcatgtt |
12930872 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 12906514 - 12905781
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
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| T |
12906514 |
aatatattctaagcttgtacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattctgcaatattttttaacataccc |
12906415 |
T |
|
| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
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| T |
12906414 |
acttctcttggtaaagtaccgctcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaacagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
12906315 |
T |
|
| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
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| T |
12906314 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaatactaatttaaa |
12906215 |
T |
|
| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
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| T |
12906214 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctccagacaatttgtttccatccaaagataaaagctgcatcttttggaactttccaaaagtagtt |
12906115 |
T |
|
| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
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| T |
12906114 |
ggaataattccctcaaagaagttatactccatggtcaagagaattaagccaactagatttcctaattcgtcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
12906015 |
T |
|
| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttact |
607 |
Q |
| |
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||||| ||| | ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||| | || |||||||| |
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| T |
12906014 |
ccataaataaatatttaagttcagtggaaaagttgcctatggaatttggcaaatgtcctccaaaattattagaatctattgaaagcacgtatagtttact |
12905915 |
T |
|
| Q |
608 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
707 |
Q |
| |
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| T |
12905914 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccttagttgaaatgttacctaaattgttgaatcccaaacttagaatggaaagattttgtaaattccct |
12905815 |
T |
|
| Q |
708 |
agacttggaacttgtccaaccgaattcatgtttt |
741 |
Q |
| |
|
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| T |
12905814 |
agacttggaacttgtccaaccaaattcatgtttt |
12905781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 484; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12947968 - 12947237
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
| |
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|
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| T |
12947968 |
aatatattctaagcttgtacattcaccaatttctctaggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaatgcttcaatattttttaacataccc |
12947869 |
T |
|
| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12947868 |
acttctcttggtaagctaccactcaaagagttatgtgacaagttcaatatctttgataaagaaaaaatatttaaaacttcaacaggtatggttcctctaa |
12947769 |
T |
|
| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
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| T |
12947768 |
gcttattatgagaaagataaagagattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattctaaatcaaa |
12947669 |
T |
|
| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12947668 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatacctcctgacaacttgttttccctcaaagataatacctgcatcttttggaacttcccaaaatttgtt |
12947569 |
T |
|
| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
| |
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| T |
12947568 |
ggaataattccttcaaagcagttacactccatggtcaagagaattaagccagctagacgtcctaattctgcaggaatttttcctgatatcttattacccc |
12947469 |
T |
|
| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttact |
607 |
Q |
| |
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|||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |
|
|
| T |
12947468 |
ccatatatagttctagaagttcagtggataaattgcctatggaatttggcaaacgacctcgaaaattattttaagatatcgaaagcatgtttagtttact |
12947369 |
T |
|
| Q |
608 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
707 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12947368 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaagtccatagttgaaatgttacctaaattgttaaattccaaacttaggaaggaaagatcttgtaaattccta |
12947269 |
T |
|
| Q |
708 |
agacttggaacttgtccaaccgaattcatgtt |
739 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12947268 |
agacttggaacttgtccaaccaaattcatgtt |
12947237 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 12957402 - 12956674
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12957402 |
aatatattctaagattgtacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaaatcttcaatattttttaacataccc |
12957303 |
T |
|
| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12957302 |
acttctgttggtaaggtaccgctcaaagagttatgtgacaggtctaatacta---ataatgaaaaaatatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
12957206 |
T |
|
| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
| |
|
||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | |
|
|
| T |
12957205 |
gcttattatgataaagatttagatattgtaaattttgacagtttcctatgcttggaggaatacttccttgaaacatgttatgatctaattctaatttaaa |
12957106 |
T |
|
| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12957105 |
caattgactgagattccctatgaacggtggaatatctcctgacaacttgtttttccacaaatataatacctgcatcttttggaacttcccaaaagtagtt |
12957006 |
T |
|
| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
| |
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|
|
| T |
12957005 |
ggaataattccctccaagcagttagactccatggtcaatagaattaagccaattagacgtccaaattctgcaggaatttttcctgatatttgattatccc |
12956906 |
T |
|
| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttact |
607 |
Q |
| |
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||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12956905 |
ccatatacagttgaataagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatggcctccaaaattattataagatatcgaaagcttgtgtagtttact |
12956806 |
T |
|
| Q |
608 |
gcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccct |
707 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
12956805 |
gcaattagtcaaatattttagaaattctaaatccatagttgaaatgttacctaaattgtttgattgcaaatttagattggaaaggtcttgtaaattccct |
12956706 |
T |
|
| Q |
708 |
agacttggaacttgtccaaccgaattcatgtt |
739 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12956705 |
agacttggaacttgtccaaccaaattcatgtt |
12956674 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 12898894 - 12898155
Alignment:
| Q |
8 |
aatatattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacataccc |
107 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12898894 |
aatatattctatgcttgtacattcaccaatttctatcggaatatcaccagatagatgattcccagagacatctaatcctttaatattttttaacataccc |
12898795 |
T |
|
| Q |
108 |
acttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaa |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
12898794 |
acttctcttggtaaagtaccgctcaaagagttatgtgacaagttcaataacattgataaagaaaaaagatttaaaacctctgcaggtatggttcctctaa |
12898695 |
T |
|
| Q |
208 |
gcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcata |
307 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | | |
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| T |
12898694 |
gcttattatgagaaagatctagatattgtaaatgtagacagtttccaatgcttggaggaatacttccttgaaacatattatgatttaattgtaatttaaa |
12898595 |
T |
|
| Q |
308 |
caattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagtt |
407 |
Q |
| |
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|
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| T |
12898594 |
caactgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgtttttcctcaaacgtaatagctgcatcttttggaacttcccaaaagtagtt |
12898495 |
T |
|
| Q |
408 |
ggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
507 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12898494 |
ggaataattccttcaaagtagttagactccatggtcaagagaattaagccaactagatatcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccc |
12898395 |
T |
|
| Q |
508 |
ccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctcc-aaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttac |
606 |
Q |
| |
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||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| || |||||||| | | ||||||| |
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| T |
12898394 |
ccataaatagttgttgaagttcagtggaaaaattgcctatggaatttggcagttgaccaccaaaaattatttccagctatcgaaagcacatttagtttac |
12898295 |
T |
|
| Q |
607 |
tgcaatttgtcaaatattttaaaaactct-aaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattcc |
705 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |
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|
| T |
12898294 |
tgcaatttgtcaaatattttaaaaaatctaaaatccatagttgaaatgttacctaaattgttgaatcccaaacttagaatggaaagattttgtaaattcc |
12898195 |
T |
|
| Q |
706 |
ctagacttggaacttgtccaaccgaattcatgttttctga |
745 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12898194 |
ctagacttggaacttgtccaaccaaattcatgttttctga |
12898155 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 10564348 - 10563635
Alignment:
| Q |
11 |
atattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccact |
110 |
Q |
| |
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|
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| T |
10564348 |
atattctaagcttatacattcgccaatttctgtaggaatatcaccagataaatgattcttagagacatctaatatttcaagattttttaagacacccagt |
10564249 |
T |
|
| Q |
111 |
tctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagct |
210 |
Q |
| |
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| T |
10564248 |
tctcttggtaagctaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagtttgttaaagaagaaagactaaaaacctctagaggtatggatccattaaatt |
10564149 |
T |
|
| Q |
211 |
tattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaa |
310 |
Q |
| |
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| T |
10564148 |
tattataagaaagatctagtacttgtaaattttgacaatttcctatgctaggaggaatatttccttcaaacatattatgagctaattctaaatcatacaa |
10564049 |
T |
|
| Q |
311 |
ttgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttgga |
410 |
Q |
| |
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| T |
10564048 |
ctgactgagattacctataaaaggtggcatatcacctgacaacttgtttccacccaaatataatatctgcatcttttcgaacttcccaaaagtagttgga |
10563949 |
T |
|
| Q |
411 |
atagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccccca |
510 |
Q |
| |
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| T |
10563948 |
ataactcctacaaagaggttagactccatggtcaagagaattaagccaactagatttcctatttccacgggaatttttcctgatatcatatttcccccaa |
10563849 |
T |
|
| Q |
511 |
tatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgca |
610 |
Q |
| |
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| T |
10563848 |
gatatagttgtgtaagttggatagataaattgccaatgaaatttggcaaatgacctccaaaattattagaagctatcgaaagcatttctagtttactaca |
10563749 |
T |
|
| Q |
611 |
atttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccctaga |
710 |
Q |
| |
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| T |
10563748 |
atttgtcaaatagtttaaaaactctaaatctataattgaattgttacctaaattgttgtatccaaaacttagccagtaaagatcttgtaacttctctaga |
10563649 |
T |
|
| Q |
711 |
cttggaacttgtcc |
724 |
Q |
| |
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| T |
10563648 |
cttggaacttgtcc |
10563635 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 667
Target Start/End: Original strand, 10741588 - 10742243
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10741588 |
tattctaaggttgtgcattcaccaattgttctaggaatatcaccagatagacgattctcagatagatctagcatgtcaatattttttaacatacccactt |
10741687 |
T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagctt |
211 |
Q |
| |
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| T |
10741688 |
ctcttggtatgctaccactcaaagtgttatgtgacaagtccaataagtttgataaagaagaaagactaaaaacctctagaggtatggatccattaaattt |
10741787 |
T |
|
| Q |
212 |
attatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaat |
311 |
Q |
| |
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| T |
10741788 |
attataagaaagatctagtacttgtaaattttgacaatttcctatggtaggaggaatattcccttgaaacatattaaaatttaattccaaatcaaacaat |
10741887 |
T |
|
| Q |
312 |
tgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttc-ctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttgga |
410 |
Q |
| |
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| T |
10741888 |
tgactaagatttcctataaagggtggtatatctcctgacaacttgtttccactcaaaat-taacacctgcatcttttggaacttcccaaaagtagttgga |
10741986 |
T |
|
| Q |
411 |
atagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccccca |
510 |
Q |
| |
|
||| |||||||||| |||| | | ||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
10741987 |
ataattccttcaaaatggttaaaattcatggccaagagaattaagccaactagatgtcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattttccccta |
10742086 |
T |
|
| Q |
511 |
tatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgca |
610 |
Q |
| |
|
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| T |
10742087 |
tatatagttgtttaagttcagctgataaattgcctatggaatttggaaaattacctccgaaattattaccagctatcgaaaacaattttaatttagtaca |
10742186 |
T |
|
| Q |
611 |
atttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgtt |
667 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10742187 |
atttgtcaaatatcttaaaaacattaaatctatggctgaattgttacctaaattgtt |
10742243 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 45 - 721
Target Start/End: Original strand, 10747937 - 10748613
Alignment:
| Q |
45 |
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144 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10747937 |
ggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctagccaatcaatattttttagtaaacccacttctcttggtaagctaccactcaaaaagttatgtg |
10748036 |
T |
|
| Q |
145 |
acaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttg |
244 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
10748037 |
ataagttcaataagtttgataaagaaaaaatatgaaaaatctctgaaggtatggttccactaagcttattatgagaaagatctaggtattgtaacttttg |
10748136 |
T |
|
| Q |
245 |
acagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatatct |
344 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| ||| || || | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |
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|
| T |
10748137 |
acaattttctatgcttggaggaatatttccttggaacatattacgatataaatccaatttaaacaattgactgagattgcctatgaagggtggtatatat |
10748236 |
T |
|
| Q |
345 |
cctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtca |
444 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10748237 |
cctgacaacttgtttccactcaaagctaaatattgcatcttttggaacttcccaaaagaagttggaattattccttcaaagtggttaaaatcgatggcca |
10748336 |
T |
|
| Q |
445 |
agagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattaccccccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccc |
544 |
Q |
| |
|
|||| ||||| |||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| || || | | |||||| | |||||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
10748337 |
agagtattaactcaactagatttcctatttccacgggaatttttcctgatatcaaatttccaccaagacatagttctgtaagttgggtggataaactgcc |
10748436 |
T |
|
| Q |
545 |
tatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccata |
644 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10748437 |
aatggaatttggcaaactacctccaaacttattattacatatagaaaccacttctagtttactacaatttgtcaaatactttaaaaactctaaatcgata |
10748536 |
T |
|
| Q |
645 |
gttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccctagacttggaacttg |
721 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
10748537 |
gttgaattgttaccgaaatagttgtcttccaaatttagccagtaaagatcttgtaacttctctagacttggaacttg |
10748613 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 89 - 733
Target Start/End: Original strand, 10717864 - 10718508
Alignment:
| Q |
89 |
aatattttttaacatacccacttctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctct |
188 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
10717864 |
aatattttttaacatactcacttctcttggtaagctaccactcaaagagttatgtgacaagtccaatatttttgataaataaaaaagattaaaaacctct |
10717963 |
T |
|
| Q |
189 |
acaggtatggttcctctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattat |
288 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10717964 |
acaggtatggttccactaaacctattatgagaaagatctagatattgtaaattttgacagtttcctatacttggaggaatattcccttgaaacatattaa |
10718063 |
T |
|
| Q |
289 |
gatctaattctaaatcatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttt |
388 |
Q |
| |
|
| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
10718064 |
gttctaatcgtaaatcaaacaattgactgagatttcctataaagggtggcatatctcctgacaacttgtttccacccaaaagtaatttctgcatcttttg |
10718163 |
T |
|
| Q |
389 |
taacttcccaaatgtagttggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaattttt |
488 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
10718164 |
gaagttcccaaaagtagttggaataattccttcaaagtggttaaatcccatggacaagacagttaagccaactaagtatcctaattctgccggaattttt |
10718263 |
T |
|
| Q |
489 |
cctgatatctgattaccccccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcg |
588 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10718264 |
cctgatatatgatttaccccaagatctagtacactaaattgagtggataaatttcccaaggaatttggaaaattacctccaaaactattattatatatag |
10718363 |
T |
|
| Q |
589 |
aaaacttgtggagtttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatgga |
688 |
Q |
| |
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||| | | |||||| | || |||| ||| | ||||||||| | || || | ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| |
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|
| T |
10718364 |
aaatcaattctagtttagtacagtttgccaacgaatttaaaaacaccaattctttggttgagttttcacctaaattgtttgattgcaaatttagaaatcg |
10718463 |
T |
|
| Q |
689 |
aaggtcttgtaaattccctagacttggaacttgtccaaccgaatt |
733 |
Q |
| |
|
||| | |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10718464 |
aagattttgtaactcccctatacttggaacttgtccaaccaaatt |
10718508 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 12 - 728
Target Start/End: Original strand, 10764022 - 10764737
Alignment:
| Q |
12 |
tattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10764022 |
tattctaaggttgtgcattcaccaattgttttaggaatatcaccagatagatgattctcagatagatccagcatgtcaatattttttaacatacccactt |
10764121 |
T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaag-atttaaaacctctacaggtatggttcctctaagct |
210 |
Q |
| |
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| T |
10764122 |
ctcttggtaagctaccactca--gttttatgtgacaagttcaatacaattgataaataaaaaaatatgaaaaacctctacaggtatggttccgctaagct |
10764219 |
T |
|
| Q |
211 |
tattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaa |
310 |
Q |
| |
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| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||| | || | |||| |
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| T |
10764220 |
tgttatcagaaagatcgagatattgtaacttttgacagtttcctatgctaggaggaatatttccgtgaaacatattaccagttaaagccaatgtaaacaa |
10764319 |
T |
|
| Q |
311 |
ttgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttgga |
410 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | || || | || ||||||| | |||| ||| |||| |||| |
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|
| T |
10764320 |
ttgactgagattgcctatgaagggtggtatatatcctgacaacttgtttttgcttagatccaaaatttgtatattttggatgttcctaaaagtagatgga |
10764419 |
T |
|
| Q |
411 |
atagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccccca |
510 |
Q |
| |
|
| | |||| ||||| |||| ||||| ||| | | ||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| | | | |
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|
| T |
10764420 |
acaattccatcaaattggttaagtggcatggacaaaacagttaagccgactagacgtcctaattctactggaatttttccagatatctgattactctcaa |
10764519 |
T |
|
| Q |
511 |
tatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgca |
610 |
Q |
| |
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| T |
10764520 |
ggtatagtttttcaagtttagtggagaaatttcctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattaacagctatggaaagcgcatgttgtttgctgca |
10764619 |
T |
|
| Q |
611 |
atttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccctaga |
710 |
Q |
| |
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| T |
10764620 |
atttgtcaaatattttaaaaactctaaatccattgtggaattgtcacctaaattgttttcttccaaatttagcaagccaagatgttgtaaattccctaga |
10764719 |
T |
|
| Q |
711 |
cttggaacttgtccaacc |
728 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10764720 |
cttggaacttgtccaacc |
10764737 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 10611030 - 10610309
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
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| T |
10611030 |
tattctaaacttatacattcaccaactgttctaggaagataagaagatagttgattctcagatacatctagcatattaatattttttagcatacccactt |
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T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagctt |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
10610930 |
ctcttggtaagctaccactcaaagagttatgcgacaagttcaataaatttgataaataaaaaagattaaaaatctctaaaggtatggatccactaagttt |
10610831 |
T |
|
| Q |
212 |
attatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaat |
311 |
Q |
| |
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| T |
10610830 |
attatgagaaagatctaggtattgtaacttttgacaatttcctatgcttggaggaatatttccttgaaacatgttactgtgtacagccaacctaaacaat |
10610731 |
T |
|
| Q |
312 |
tgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttggaa |
411 |
Q |
| |
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| T |
10610730 |
tgactgagattgcctatgaagggtggtatatatcctgacaacttgttttcgcttagatccaaaatttgcatattttggaacttccctaaagtagacggaa |
10610631 |
T |
|
| Q |
412 |
tagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattaccccccat |
511 |
Q |
| |
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| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||| | | |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| || | |
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| T |
10610630 |
caattccatcaaattggttaagttccatggacaagagagttaagccaaccaaatttcctatttccatgggaatttttcctgttatcatattacctccaag |
10610531 |
T |
|
| Q |
512 |
atatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgcaa |
611 |
Q |
| |
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| T |
10610530 |
atatagctgtctaagatgggtggataaattgccaatgaaatttggcaaactacctccaaacttattattagatatagaaagcttttctagtttactacag |
10610431 |
T |
|
| Q |
612 |
tttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccctagac |
711 |
Q |
| |
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| T |
10610430 |
tttgtcaaatattttaaaaactctaaatctatagttgaattgttaccgaaatagttgtattccaaactcagccagtaaagatctggtaacttctctagac |
10610331 |
T |
|
| Q |
712 |
ttggaacttgtccaaccgaatt |
733 |
Q |
| |
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| T |
10610330 |
ttggaacttgtccaaccaaatt |
10610309 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 7192325 - 7191669
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
7192325 |
tattctaagcgtatgcattcgccaatggctctaggaatgtcaccagatagaagattctccgagacatctagcttgttgatactttttagcatacccactt |
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T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagctt |
211 |
Q |
| |
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| T |
7192225 |
ctcttggtaggctaccactcaatgagtttcttgacaagttcagtaagtttgataacgaagaaagactgaaaacttctaagggtatggttcctctaagatt |
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T |
|
| Q |
212 |
attatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatcta-attctaaatcatacaa |
310 |
Q |
| |
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| T |
7192125 |
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T |
|
| Q |
311 |
ttgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttgga |
410 |
Q |
| |
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| T |
7192026 |
ttgactgaggttgcctatgatgggtggtatctctccggaaaacttatttccctgcaaaaccaatagttgcattttctcaaacttcccaaaagtagtagga |
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T |
|
| Q |
411 |
atagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccccca |
510 |
Q |
| |
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| T |
7191926 |
ataattccttcaaagttgttaagttccatgctcaacagagttaagccaattagatttcctaattcttcaggaatttttcctgatatcatattacatccaa |
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T |
|
| Q |
511 |
tatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgca |
610 |
Q |
| |
|
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|
| T |
7191826 |
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T |
|
| Q |
611 |
atttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttt |
668 |
Q |
| |
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|
| T |
7191726 |
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7191669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 45 - 682
Target Start/End: Original strand, 10217668 - 10218305
Alignment:
| Q |
45 |
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144 |
Q |
| |
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| T |
10217668 |
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T |
|
| Q |
145 |
acaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttg |
244 |
Q |
| |
|
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| T |
10217768 |
acaactccaataaaattgataaggaaaaaagattaaaaatctctaagggtatgattcctctaagcttattttgagctagatttagatattgtagatgttg |
10217867 |
T |
|
| Q |
245 |
acagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatatct |
344 |
Q |
| |
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| T |
10217868 |
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T |
|
| Q |
345 |
cctgacaacttgttttcctccaaatgt--aatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttggaatagttccttcaaagcagttagactccatggt |
442 |
Q |
| |
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|
| T |
10217968 |
cctaacaacttgtttctattc-aatgttaaatct-tgcatcttttggaacttttcaaaagcagctgggataattccttcaaagtggttttgttccattcc |
10218065 |
T |
|
| Q |
443 |
caagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattaccccccatatatagttgtttaagttcagtggataaattc |
542 |
Q |
| |
|
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| T |
10218066 |
caatagagttaagccaattaaattgcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattatacccaacatatagctcaataagttcagtggataaattg |
10218165 |
T |
|
| Q |
543 |
cctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatcca |
642 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
10218166 |
cctatgaaatttggcaagttgcctccaaaattgttattgtttatagaaagcacttgcaacttagtacaatttgtcaaagattttaaaaactccaaatcct |
10218265 |
T |
|
| Q |
643 |
tagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttag |
682 |
Q |
| |
|
| |||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||| |
|
|
| T |
10218266 |
ttgttgaattgtcacctaaatagttgtattccaaacttag |
10218305 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 724
Target Start/End: Original strand, 10653088 - 10653800
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||| ||| || |||| |||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
10653088 |
tattctaagactatgcattcaccaatggttctaggaatctcacctgatagataattatcggagatatctaactcattgatatttcttagcatacccactt |
10653187 |
T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagctt |
211 |
Q |
| |
|
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| T |
10653188 |
ctctcggtaagctaccactcaatgtgttatttgacaaattcagtatgtttgttagggaggaaagacttaaaacctctatgggtatggttcctcggagaat |
10653287 |
T |
|
| Q |
212 |
attatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaat |
311 |
Q |
| |
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| T |
10653288 |
gttttgtgaaaggtctaggtattgtagcttttggcaatatccaatgcttgaaggaatgtttccttccaacatattatctcctacactaaaaaaaaataaa |
10653387 |
T |
|
| Q |
312 |
tgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttggaa |
411 |
Q |
| |
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| T |
10653388 |
tgagtgaggttgcctatgatgggtggtatcattcctgacaacctatttccattcagtactaatctttgcatcctctcaaacttcccaaaagtagtaggaa |
10653487 |
T |
|
| Q |
412 |
tagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattaccccccat |
511 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||| |||| | |||| | | ||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| | |
|
|
| T |
10653488 |
taattccttcaaagtggttatattccaagcttaagtgaattaaaccaattagatttcctaattctgcaggaattttttcagacatctgattacccccaac |
10653587 |
T |
|
| Q |
512 |
atatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgcaa |
611 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10653588 |
atatagctgactaagttgagtggataaattgcctacaaaatttggcaagttacctccaaaattattataagctatagaaatcacggttagtttactacag |
10653687 |
T |
|
| Q |
612 |
tttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaattccctagac |
711 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||| ||| | |||||| ||| || ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10653688 |
tttgtcaaggtttttaaaaattctaaatccttagttgtattgtctcctaaattgttaaattctagatttagccgttgaagatcatgtaaattccccagac |
10653787 |
T |
|
| Q |
712 |
ttggaacttgtcc |
724 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
10653788 |
ttggaacttgtcc |
10653800 |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 668
Target Start/End: Original strand, 10661065 - 10661630
Alignment:
| Q |
103 |
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202 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | || |||| | ||||||||||| |
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|
| T |
10661065 |
tacccacttctattggtaggctaccactcaatgagttttttgacaagttcagtaagtttgttaaagaggaaagactaaagacctttttgggtatggttcc |
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T |
|
| Q |
203 |
tctaagcttattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattct-aa |
301 |
Q |
| |
|
|||||| | || || || || ||||| |||||| ||||| || | ||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| || || || |
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| T |
10661165 |
tctaagaatgttttgtgaaaggtctagggattgtagcttttggcaatgtcctatgcttgaaggaatatttcctcctaacatattatc-tcttatactcaa |
10661263 |
T |
|
| Q |
302 |
atcatacaattgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaat |
401 |
Q |
| |
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| ||| ||||||||||| |||||||| | || ||| | |||||||||||||| ||| | | ||| ||||| ||||| | | ||||||||||| |
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| T |
10661264 |
aagatataattgactgaggttgcctataatggatggtacctctcctgacaacttatttccattcaatagtaattgttgcattctctcaaacttcccaaaa |
10661363 |
T |
|
| Q |
402 |
gtagttggaatagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgat |
501 |
Q |
| |
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||| | |||||| ||||||||||| | || |||||| ||||| |||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
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| T |
10661364 |
gtattaggaataattccttcaaagttgctattgtccatgctcaagtgaattaggccaattagatttcctaattctgcaggaatttttcctgatattggat |
10661463 |
T |
|
| Q |
502 |
taccccccatatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggag |
601 |
Q |
| |
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| T |
10661464 |
tacccccaacatatagctgactaagttgagtggataaattgcctacaaaatttggcaagttacccccaaaatgattactggatatagaaatcactcttag |
10661563 |
T |
|
| Q |
602 |
tttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttt |
668 |
Q |
| |
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| T |
10661564 |
tttagtgaagtttgtcaaggttttcaaaaactccaaatccttagttgaattgtcacctaatttgttt |
10661630 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 580
Target Start/End: Original strand, 19606753 - 19607322
Alignment:
| Q |
11 |
atattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccact |
110 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19606753 |
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T |
|
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111 |
tctcttggtaaggtaccactcaaagagttatgtgacaagttcaataagattgataaagaaaaaagatttaaaacctctacaggtatggttcctctaagct |
210 |
Q |
| |
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| T |
19606853 |
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19606952 |
T |
|
| Q |
211 |
tattatgagacagatctagatattgtaaattttgacagtttcctaagcttggaggaataattccttgaaacatattatgatctaattctaaatcatacaa |
310 |
Q |
| |
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| T |
19606953 |
tattttgaaaaaggactatggattgtaacttttgacagtttcctatgcttgaaggaatatttccttgtagcatattttcacctaaacctaggtaatacaa |
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T |
|
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311 |
ttgactgagattgcctatgaagggtggaatatctcctgacaacttgttttcctccaaatgtaatctctgcatattttttaacttcccaaatgtagttgga |
410 |
Q |
| |
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19607053 |
ttgactgaggttgcctaaggtggttggtataactccggacagtttgtttcgactcaaatccaacaattgcatgttttgaaacttcccaaaagaagatgga |
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|
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atagttccttcaaagcagttagactccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattacccccca |
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Q |
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| T |
19607153 |
ataattccatcaagttggttaagttctatggtcaagagagttaagccaactagatttcctatttccataggaatctttcctgatatgatattacctccaa |
19607252 |
T |
|
| Q |
511 |
tatatagttgtttaagttcagtggataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattata |
580 |
Q |
| |
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| T |
19607253 |
gatatagttgactaagttgggtggataaattaccaatggaatttggcaaactacctccaaaattattata |
19607322 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10604072 - 10603951
Alignment:
| Q |
12 |
tattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccactt |
111 |
Q |
| |
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| T |
10604072 |
tattctaagcttatgcattcaccaatagttccaggaatctccccacacaaatgattttcagagacatctaaccaatcaatattttttagcatacccactt |
10603973 |
T |
|
| Q |
112 |
ctcttggtaaggtaccactcaa |
133 |
Q |
| |
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| T |
10603972 |
cttttggtaagctaccactcaa |
10603951 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 603 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 10603482 - 10603358
Alignment:
| Q |
603 |
ttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactctaaatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttagaatggaaaggtcttgtaaat |
702 |
Q |
| |
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| T |
10603482 |
ttactacagtttgtcaatgattttaaaaactccaaatcaattgttgagttgtcacctaaaatgttcatttccaaatttagcaaataaagatcttttagct |
10603383 |
T |
|
| Q |
703 |
tccctagacttggaacttgtccaac |
727 |
Q |
| |
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| T |
10603382 |
tccctagacttggaacttgtccaac |
10603358 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 537 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 10549588 - 10549443
Alignment:
| Q |
537 |
aaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaattattataagatatcgaaaacttgtggagtttactgcaatttgtcaaatattttaaaaactcta |
636 |
Q |
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| T |
10549588 |
aaattacctatgaaacttggcaaactacctccaaaattattatgggatatagaaaatgcttgcaaattactacaatttgtcaatggttttaaaaattcta |
10549489 |
T |
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| Q |
637 |
aatccatagttgaattatcacctaaattgttttcttccaaatttag |
682 |
Q |
| |
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| T |
10549488 |
aatccttagttgaattgtcaccaagattatttatttccaaatttag |
10549443 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Original strand, 9837217 - 9837317
Alignment:
| Q |
12 |
tattctaagcttatacattcaccaatttctctcggaatatcaccagatagatgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccactt |
111 |
Q |
| |
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| T |
9837217 |
tattctaaacttatgcattcaccaattgttattggaatgtcacccgacagatgattttcagagacatctagcttatgaatattttttagcaaacccactt |
9837316 |
T |
|
| Q |
112 |
c |
112 |
Q |
| |
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| |
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| T |
9837317 |
c |
9837317 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 574
Target Start/End: Original strand, 10589739 - 10589878
Alignment:
| Q |
435 |
tccatggtcaagagaattaagccaactacacttcctaattctgcaggaatttttcctgatatctgattaccccccatatatagttgtttaagttcagtgg |
534 |
Q |
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| T |
10589739 |
tccatggttaagagaatcaagctagttagatttcctaattctataggaattttaccatatatttgattacccccaatatataattcacttagtccagggg |
10589838 |
T |
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| Q |
535 |
ataaattccctatggaatttggcaaatgacctccaaaatt |
574 |
Q |
| |
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| T |
10589839 |
ataagttacctatcaaatttggcaaactacctccaaaatt |
10589878 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 10601125 - 10601054
Alignment:
| Q |
62 |
atgattctcagagacatctaattcttcaatattttttaacatacccacttctcttggtaaggtaccactcaa |
133 |
Q |
| |
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| T |
10601125 |
atgattctcagagacatctagccaatcaatattttttagcatacccacttcttttgttaagctacctctcaa |
10601054 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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