View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0190_low_5 (Length: 253)

Name: NF0190_low_5
Description: NF0190
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0190_low_5
NF0190_low_5
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (9-233)||(16282-16506)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (16-233)||(1289-1506)
scaffold0106 (16-233)||(7266-7483)
[»] chr2 (47 HSPs)
chr2 (16-233)||(20309108-20309325)
chr2 (16-233)||(38017-38235)
chr2 (28-233)||(23285865-23286069)
chr2 (17-230)||(298716-298933)
chr2 (28-233)||(22731147-22731355)
chr2 (116-233)||(23103399-23103516)
chr2 (17-233)||(23654288-23654507)
chr2 (28-233)||(22738093-22738300)
chr2 (28-233)||(23076442-23076650)
chr2 (33-233)||(23060513-23060716)
chr2 (28-233)||(22337115-22337323)
chr2 (28-233)||(23660023-23660230)
chr2 (20-147)||(40622114-40622244)
chr2 (161-229)||(7679589-7679657)
chr2 (120-230)||(22105412-22105524)
chr2 (116-217)||(7735-7838)
chr2 (161-233)||(19671830-19671902)
chr2 (161-233)||(23071998-23072070)
chr2 (157-233)||(8946657-8946732)
chr2 (161-229)||(25175854-25175922)
chr2 (161-228)||(28405981-28406048)
chr2 (180-233)||(23040257-23040310)
chr2 (160-217)||(23207293-23207350)
chr2 (120-230)||(571397-571508)
chr2 (120-230)||(18808943-18809054)
chr2 (161-232)||(22134256-22134326)
chr2 (120-230)||(23130862-23130973)
chr2 (120-230)||(23133329-23133440)
chr2 (120-230)||(23135590-23135701)
chr2 (120-230)||(23709583-23709694)
chr2 (120-230)||(23712064-23712175)
chr2 (120-230)||(26505379-26505490)
chr2 (120-230)||(26507857-26507968)
chr2 (120-230)||(34402573-34402684)
chr2 (120-230)||(39682313-39682424)
chr2 (133-230)||(6725995-6726093)
chr2 (120-232)||(32214972-32215085)
chr2 (162-217)||(20520243-20520298)
chr2 (180-230)||(28577099-28577149)
chr2 (180-230)||(38967374-38967424)
chr2 (180-230)||(45029966-45030016)
chr2 (161-206)||(18786952-18786997)
chr2 (160-217)||(22413186-22413243)
chr2 (161-206)||(23708668-23708713)
chr2 (162-206)||(23004775-23004819)
chr2 (164-216)||(32451981-32452033)
chr2 (180-228)||(43137301-43137349)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (20-233)||(21389358-21389571)
chr8 (20-233)||(21395888-21396101)
chr8 (20-233)||(21790381-21790594)
chr8 (33-233)||(21778697-21778897)
chr8 (16-233)||(16199547-16199765)
chr8 (16-233)||(31971257-31971475)
chr8 (9-233)||(45130892-45131117)
chr8 (30-233)||(21918915-21919121)
chr8 (20-233)||(18879142-18879352)
chr8 (28-233)||(20536208-20536416)
chr8 (28-232)||(28648957-28649164)
chr8 (28-233)||(22626736-22626943)
chr8 (28-233)||(18818322-18818530)
chr8 (45-233)||(16092272-16092463)
chr8 (28-233)||(7372778-7372978)
chr8 (10-233)||(22875065-22875291)
chr8 (28-233)||(21923841-21924049)
chr8 (28-236)||(6759255-6759464)
chr8 (161-233)||(5866323-5866395)
chr8 (120-233)||(17140916-17141031)
chr8 (161-233)||(21490995-21491067)
chr8 (28-233)||(23406379-23406589)
chr8 (117-233)||(6520368-6520486)
chr8 (161-233)||(38855300-38855372)
chr8 (28-232)||(23648554-23648761)
chr8 (161-233)||(23760893-23760962)
chr8 (28-97)||(25363053-25363123)
chr8 (137-226)||(13508108-13508199)
chr8 (161-233)||(17612159-17612231)
chr8 (116-217)||(20498578-20498681)
chr8 (120-230)||(14409495-14409606)
chr8 (183-233)||(21249384-21249434)
chr8 (183-233)||(21255222-21255272)
chr8 (161-206)||(983455-983500)
chr8 (116-206)||(21285624-21285716)
chr8 (161-229)||(26355747-26355815)
chr8 (120-230)||(1484402-1484513)
chr8 (120-230)||(5853343-5853454)
chr8 (120-206)||(16413367-16413454)
chr8 (120-230)||(20403227-20403338)
chr8 (120-230)||(22001753-22001864)
chr8 (162-217)||(24353036-24353091)
chr8 (162-217)||(37116363-37116418)
chr8 (164-226)||(13597669-13597731)
chr8 (133-230)||(15203295-15203393)
chr8 (160-206)||(19154935-19154981)
chr8 (114-231)||(32121734-32121853)
chr8 (162-217)||(17267044-17267099)
chr8 (120-230)||(20046246-20046357)
chr8 (180-230)||(4542485-4542535)
chr8 (180-230)||(19896265-19896315)
chr8 (179-217)||(20856491-20856529)
chr8 (180-230)||(26225359-26225409)
chr8 (179-217)||(39094991-39095029)
chr8 (180-217)||(17926773-17926810)
chr8 (162-206)||(17439557-17439601)
chr8 (180-236)||(19937118-19937174)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (9-233)||(51582-51806)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (9-233)||(27847727-27847951)
chr7 (16-231)||(40443393-40443609)
chr7 (17-233)||(16386149-16386369)
chr7 (28-233)||(12698831-12699040)
chr7 (28-233)||(9509189-9509397)
chr7 (16-233)||(10589039-10589258)
chr7 (17-233)||(26211995-26212215)
chr7 (28-230)||(18456326-18456530)
chr7 (45-233)||(38227481-38227671)
chr7 (45-230)||(3564294-3564482)
chr7 (20-135)||(12187113-12187227)
chr7 (20-135)||(17137969-17138083)
chr7 (120-233)||(13647325-13647440)
chr7 (161-233)||(16495402-16495474)
chr7 (161-233)||(28505347-28505419)
chr7 (161-233)||(34200786-34200858)
chr7 (161-233)||(67745-67817)
chr7 (161-233)||(15754936-15755008)
chr7 (116-230)||(48273392-48273508)
chr7 (161-233)||(11996076-11996148)
chr7 (114-233)||(16219717-16219835)
chr7 (116-233)||(22072913-22073033)
chr7 (116-206)||(2280121-2280213)
chr7 (161-229)||(811180-811248)
chr7 (161-229)||(18005650-18005718)
chr7 (161-229)||(44014182-44014250)
chr7 (161-233)||(47831807-47831879)
chr7 (84-230)||(16213684-16213831)
chr7 (120-230)||(17061966-17062077)
chr7 (120-230)||(456321-456432)
chr7 (137-233)||(10063841-10063939)
chr7 (120-230)||(11972496-11972607)
chr7 (120-230)||(14949173-14949284)
chr7 (120-230)||(15376764-15376875)
chr7 (120-230)||(16232520-16232631)
chr7 (120-230)||(16410059-16410170)
chr7 (120-230)||(18640272-18640383)
chr7 (120-230)||(20385174-20385285)
chr7 (120-230)||(21189646-21189757)
chr7 (120-206)||(24275195-24275282)
chr7 (120-230)||(32125491-32125602)
chr7 (120-230)||(41522917-41523028)
chr7 (120-230)||(41525379-41525490)
chr7 (120-229)||(11393338-11393448)
chr7 (116-233)||(18430709-18430827)
chr7 (120-230)||(24704688-24704796)
chr7 (161-206)||(12255842-12255887)
chr7 (157-206)||(12901350-12901399)
chr7 (162-205)||(14036282-14036325)
chr7 (162-205)||(14346312-14346355)
chr7 (116-206)||(16056355-16056446)
chr7 (120-230)||(24702238-24702349)
chr7 (120-230)||(44116509-44116620)
chr7 (115-180)||(2530139-2530205)
chr7 (180-230)||(3386333-3386383)
chr7 (180-230)||(13869346-13869396)
chr7 (180-230)||(20110556-20110606)
chr7 (160-206)||(48991207-48991253)
chr7 (180-232)||(2832509-2832561)
chr7 (162-206)||(14044773-14044817)
chr7 (162-206)||(14354803-14354847)
chr7 (181-217)||(20569665-20569701)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (9-233)||(17046487-17046711)
chr4 (16-233)||(14053203-14053422)
chr4 (17-233)||(12902757-12902976)
chr4 (17-233)||(7088877-7089096)
chr4 (17-226)||(23374261-23374473)
chr4 (28-231)||(22636437-22636642)
chr4 (28-233)||(44052829-44053037)
chr4 (28-233)||(16270149-16270356)
chr4 (28-230)||(16377436-16377639)
chr4 (52-233)||(7798774-7798958)
chr4 (28-233)||(16239883-16240090)
chr4 (28-228)||(14038653-14038856)
chr4 (20-147)||(15121709-15121834)
chr4 (161-233)||(15551817-15551889)
chr4 (114-233)||(52873367-52873488)
chr4 (28-233)||(7893703-7893908)
chr4 (157-233)||(3096293-3096368)
chr4 (64-233)||(6899891-6900062)
chr4 (116-217)||(13853-13956)
chr4 (161-229)||(12774011-12774079)
chr4 (161-233)||(39706337-39706409)
chr4 (16-107)||(3096772-3096863)
chr4 (117-206)||(12288211-12288304)
chr4 (116-230)||(54798756-54798872)
chr4 (161-206)||(52243245-52243290)
chr4 (116-230)||(14280316-14280431)
chr4 (120-230)||(18215325-18215436)
chr4 (116-230)||(44928926-44929042)
chr4 (32-97)||(17047989-17048055)
chr4 (180-233)||(15367690-15367743)
chr4 (180-233)||(15370018-15370071)
chr4 (180-233)||(15371202-15371255)
chr4 (180-233)||(15373483-15373536)
chr4 (180-233)||(15402703-15402756)
chr4 (180-233)||(16223532-16223585)
chr4 (161-229)||(8846360-8846428)
chr4 (120-230)||(12358-12469)
chr4 (120-230)||(15118403-15118514)
chr4 (180-231)||(22353835-22353886)
chr4 (120-230)||(23803316-23803427)
chr4 (120-230)||(44615288-44615399)
chr4 (120-230)||(44773138-44773249)
chr4 (120-230)||(51463919-51464030)
chr4 (120-230)||(52312510-52312621)
chr4 (120-205)||(14970758-14970844)
chr4 (168-206)||(43198611-43198649)
chr4 (115-180)||(43256161-43256227)
chr4 (120-236)||(19242693-19242810)
chr4 (120-232)||(19618223-19618336)
chr4 (160-217)||(46640504-46640561)
chr4 (164-216)||(6190479-6190531)
chr4 (120-230)||(1837560-1837671)
chr4 (120-230)||(3515007-3515118)
chr4 (120-230)||(18239470-18239581)
chr4 (120-230)||(50222390-50222501)
chr4 (162-217)||(53082202-53082257)
chr4 (180-230)||(7641294-7641344)
chr4 (180-230)||(12610950-12611000)
chr4 (180-230)||(44102214-44102264)
chr4 (180-217)||(16348731-16348768)
chr4 (180-217)||(16357019-16357056)
chr4 (181-217)||(11250630-11250666)
chr4 (181-217)||(25555492-25555528)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (16-233)||(953-1170)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (16-233)||(16920534-16920751)
chr6 (9-221)||(11185517-11185729)
chr6 (16-233)||(22831503-22831722)
chr6 (61-233)||(35245586-35245758)
chr6 (16-233)||(20360861-20361081)
chr6 (28-233)||(20638196-20638404)
chr6 (28-233)||(29060540-29060748)
chr6 (82-233)||(16496244-16496397)
chr6 (28-233)||(19303454-19303661)
chr6 (28-233)||(20593773-20593981)
chr6 (28-233)||(25629268-25629476)
chr6 (28-233)||(22780140-22780348)
chr6 (28-232)||(18409740-18409947)
chr6 (114-233)||(20076700-20076817)
chr6 (32-233)||(17287713-17287917)
chr6 (161-233)||(1561303-1561375)
chr6 (161-233)||(27333267-27333339)
chr6 (161-233)||(27394007-27394079)
chr6 (161-233)||(28496520-28496592)
chr6 (161-233)||(29808931-29809003)
chr6 (120-230)||(1595549-1595660)
chr6 (84-230)||(22782227-22782374)
chr6 (133-230)||(25656629-25656727)
chr6 (116-206)||(25644347-25644440)
chr6 (161-206)||(9098563-9098608)
chr6 (116-206)||(20109165-20109257)
chr6 (161-229)||(19652199-19652267)
chr6 (120-230)||(12742317-12742428)
chr6 (120-230)||(18334643-18334754)
chr6 (120-230)||(19005046-19005157)
chr6 (120-230)||(19858970-19859081)
chr6 (120-230)||(24422547-24422658)
chr6 (120-230)||(25754809-25754920)
chr6 (120-230)||(33861794-33861905)
chr6 (120-230)||(33864278-33864389)
chr6 (115-180)||(27415942-27416008)
chr6 (120-206)||(4185827-4185915)
chr6 (116-233)||(23019408-23019525)
chr6 (180-233)||(25714417-25714470)
chr6 (120-232)||(30676761-30676874)
chr6 (135-206)||(25688526-25688598)
chr6 (120-230)||(1540962-1541073)
chr6 (120-230)||(2291231-2291342)
chr6 (120-230)||(8055029-8055140)
chr6 (186-233)||(22080799-22080846)
chr6 (120-230)||(26924691-26924802)
chr6 (120-217)||(18456732-18456830)
chr6 (120-217)||(18461892-18461990)
chr6 (168-206)||(19668398-19668436)
chr6 (180-217)||(18821912-18821949)
chr6 (180-217)||(19790847-19790884)
chr6 (180-217)||(21766707-21766744)
chr6 (162-215)||(23076748-23076801)
chr6 (162-215)||(35008166-35008219)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-230)||(5017-5246)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (9-233)||(38801285-38801508)
chr1 (17-233)||(27250631-27250850)
chr1 (17-233)||(21026680-21026899)
chr1 (28-232)||(50210126-50210333)
chr1 (28-230)||(34509783-34509988)
chr1 (32-233)||(22532269-22532473)
chr1 (28-158)||(22354485-22354616)
chr1 (133-233)||(20847173-20847275)
chr1 (120-233)||(45574893-45575008)
chr1 (161-233)||(14295600-14295672)
chr1 (28-232)||(20135188-20135395)
chr1 (116-217)||(21896258-21896361)
chr1 (116-217)||(21861572-21861675)
chr1 (161-229)||(22921918-22921986)
chr1 (28-232)||(22468610-22468816)
chr1 (161-233)||(33681010-33681079)
chr1 (28-97)||(48603652-48603722)
chr1 (133-217)||(35261097-35261183)
chr1 (116-233)||(22237630-22237746)
chr1 (161-206)||(16758676-16758721)
chr1 (161-206)||(20918631-20918676)
chr1 (161-206)||(21754072-21754117)
chr1 (120-230)||(13988866-13988977)
chr1 (120-230)||(21923342-21923453)
chr1 (120-230)||(23593786-23593897)
chr1 (116-230)||(31612313-31612428)
chr1 (162-217)||(50614167-50614222)
chr1 (162-217)||(50621995-50622050)
chr1 (28-124)||(22356087-22356185)
chr1 (28-124)||(22357773-22357871)
chr1 (161-233)||(52928019-52928088)
chr1 (180-233)||(13212974-13213027)
chr1 (164-217)||(16368338-16368391)
chr1 (161-229)||(20248283-20248351)
chr1 (164-232)||(20454606-20454673)
chr1 (180-236)||(21342090-21342146)
chr1 (120-231)||(21840766-21840878)
chr1 (116-230)||(433012-433125)
chr1 (180-230)||(21346961-21347011)
chr1 (180-230)||(21707167-21707217)
chr1 (180-230)||(21711709-21711759)
chr1 (133-206)||(22123131-22123206)
chr1 (180-230)||(29298137-29298187)
chr1 (180-230)||(29776688-29776738)
chr1 (115-180)||(33797573-33797639)
chr1 (160-217)||(41050084-41050141)
chr1 (180-236)||(15860121-15860177)
chr1 (181-217)||(18394034-18394070)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (28-233)||(46995-47200)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (9-233)||(10320-10544)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (16-233)||(32067-32284)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (16-233)||(13497-13715)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (9-233)||(15359-15584)
scaffold0114 (59-147)||(7378-7465)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (16-233)||(4712-4931)
scaffold0358 (16-158)||(13-155)
[»] chr5 (54 HSPs)
chr5 (9-233)||(21292864-21293090)
chr5 (33-233)||(8286760-8286964)
chr5 (20-226)||(37723910-37724117)
chr5 (28-233)||(23390409-23390617)
chr5 (9-233)||(24493569-24493795)
chr5 (28-233)||(9077952-9078160)
chr5 (17-233)||(22075018-22075238)
chr5 (20-230)||(24529223-24529436)
chr5 (82-233)||(21729032-21729185)
chr5 (82-233)||(21808357-21808510)
chr5 (28-233)||(25421532-25421740)
chr5 (28-233)||(13025311-13025518)
chr5 (28-233)||(13095495-13095702)
chr5 (20-135)||(18769910-18770024)
chr5 (20-135)||(22032415-22032529)
chr5 (28-206)||(25431421-25431602)
chr5 (35-233)||(1096467-1096668)
chr5 (161-233)||(19660884-19660956)
chr5 (59-135)||(23572178-23572254)
chr5 (161-233)||(36314577-36314649)
chr5 (133-233)||(21997553-21997655)
chr5 (117-233)||(21329500-21329618)
chr5 (117-217)||(20026942-20027046)
chr5 (161-229)||(22959581-22959649)
chr5 (114-233)||(21502156-21502277)
chr5 (118-229)||(21565546-21565659)
chr5 (116-230)||(22412187-22412302)
chr5 (17-98)||(22107275-22107357)
chr5 (120-230)||(264819-264930)
chr5 (120-230)||(10732991-10733102)
chr5 (120-230)||(20909012-20909123)
chr5 (120-230)||(39363384-39363495)
chr5 (114-214)||(18418599-18418699)
chr5 (115-180)||(20910800-20910866)
chr5 (133-230)||(31061068-31061166)
chr5 (133-230)||(39245136-39245234)
chr5 (161-206)||(26012084-26012129)
chr5 (161-233)||(19668898-19668970)
chr5 (135-206)||(20902075-20902147)
chr5 (161-217)||(22144065-22144121)
chr5 (181-220)||(17919220-17919259)
chr5 (120-230)||(29329934-29330045)
chr5 (180-230)||(2154726-2154776)
chr5 (180-230)||(11581311-11581361)
chr5 (180-230)||(20918060-20918110)
chr5 (155-217)||(21873266-21873327)
chr5 (180-230)||(36154892-36154942)
chr5 (180-230)||(38619434-38619484)
chr5 (180-217)||(20766986-20767023)
chr5 (180-217)||(20805564-20805601)
chr5 (160-217)||(22178269-22178326)
chr5 (180-229)||(23064512-23064561)
chr5 (182-230)||(10775790-10775838)
chr5 (181-217)||(12028634-12028670)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (28-233)||(13211-13419)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (17-233)||(12399209-12399428)
chr3 (28-233)||(20698349-20698556)
chr3 (28-233)||(17487856-17488064)
chr3 (28-233)||(13442274-13442482)
chr3 (28-233)||(17499338-17499546)
chr3 (28-233)||(14972854-14973062)
chr3 (20-233)||(18438534-18438750)
chr3 (1-206)||(14576719-14576926)
chr3 (28-233)||(26686887-26687095)
chr3 (29-233)||(23083275-23083482)
chr3 (28-230)||(24153122-24153326)
chr3 (28-233)||(11424676-11424880)
chr3 (28-233)||(43840932-43841140)
chr3 (29-233)||(25476299-25476506)
chr3 (28-206)||(42386437-42386619)
chr3 (161-233)||(13210376-13210448)
chr3 (20-229)||(856140-856348)
chr3 (28-230)||(40213634-40213838)
chr3 (161-229)||(49668125-49668193)
chr3 (117-233)||(14234487-14234605)
chr3 (116-233)||(15470927-15471043)
chr3 (161-229)||(9512924-9512992)
chr3 (161-229)||(9520899-9520967)
chr3 (161-229)||(12174308-12174376)
chr3 (137-233)||(24340746-24340844)
chr3 (28-97)||(14179570-14179640)
chr3 (135-206)||(14572616-14572688)
chr3 (120-233)||(43550529-43550644)
chr3 (161-230)||(27165250-27165319)
chr3 (161-206)||(32307704-32307749)
chr3 (116-230)||(36166598-36166712)
chr3 (161-217)||(52523778-52523834)
chr3 (120-230)||(9707658-9707769)
chr3 (120-230)||(17672626-17672737)
chr3 (120-230)||(29172634-29172745)
chr3 (168-230)||(28194693-28194755)
chr3 (118-230)||(55500942-55501055)
chr3 (165-229)||(16097332-16097396)
chr3 (161-229)||(16103784-16103852)
chr3 (120-230)||(6469185-6469296)
chr3 (120-230)||(7781398-7781509)
chr3 (120-230)||(17463178-17463289)
chr3 (162-217)||(22110402-22110457)
chr3 (120-230)||(28848662-28848773)
chr3 (120-230)||(34159326-34159437)
chr3 (162-217)||(43925974-43926029)
chr3 (120-230)||(45606958-45607069)
chr3 (120-230)||(55476491-55476602)
chr3 (160-229)||(37251216-37251283)
chr3 (161-214)||(23274706-23274759)
chr3 (161-230)||(53301600-53301669)
chr3 (180-231)||(12511059-12511110)
chr3 (164-206)||(606378-606420)
chr3 (180-230)||(8499518-8499568)
chr3 (180-230)||(10556985-10557035)
chr3 (179-217)||(12496269-12496307)
chr3 (180-230)||(15412429-15412479)
chr3 (180-230)||(15977515-15977565)
chr3 (28-97)||(16796685-16796755)
chr3 (180-230)||(17737236-17737286)
chr3 (180-230)||(44494809-44494859)
chr3 (180-230)||(45577950-45578000)
chr3 (120-217)||(53070704-53070802)
chr3 (180-217)||(3390004-3390041)
chr3 (180-217)||(3403024-3403061)
chr3 (180-217)||(11298595-11298632)
chr3 (180-217)||(19725978-19726015)
chr3 (181-217)||(11595208-11595244)
chr3 (160-216)||(12377938-12377994)
chr3 (180-232)||(14665398-14665450)
chr3 (180-232)||(14668554-14668606)
chr3 (180-228)||(16282923-16282971)
chr3 (180-228)||(41123892-41123940)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (19-233)||(4849-5066)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (17-233)||(951-1169)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (17-233)||(167881-168099)
scaffold0011 (28-233)||(51913-52121)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (20-232)||(174767-174980)
scaffold0021 (28-141)||(124679-124793)
scaffold0021 (163-233)||(121766-121835)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (28-233)||(1952-2160)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (28-233)||(3470-3678)
scaffold0292 (35-233)||(343-543)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (28-233)||(1851-2059)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (33-233)||(6039-6245)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (32-233)||(3068-3271)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (28-206)||(24214-24397)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (32-232)||(3103-3306)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (9-231)||(39479-39703)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (9-231)||(75109-75333)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (28-233)||(32942-33149)
scaffold0145 (28-233)||(38761-38968)
scaffold0145 (180-235)||(9744-9799)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (20-147)||(26911-27036)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (28-232)||(17128-17337)
scaffold0056 (180-217)||(79396-79433)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (28-226)||(25978-26179)
scaffold0122 (116-230)||(44709-44825)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (28-233)||(8446-8650)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (32-233)||(20910-21115)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (28-230)||(339863-340065)
scaffold0003 (120-230)||(158501-158612)
scaffold0003 (115-180)||(71353-71419)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (28-230)||(22886-23090)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (31-233)||(16516-16721)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (58-233)||(32901-33077)
scaffold0120 (58-233)||(45928-46104)
scaffold0120 (51-233)||(16113-16298)
scaffold0120 (180-233)||(17397-17450)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (20-135)||(12857-12971)
scaffold0029 (120-206)||(11312-11399)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (28-171)||(6671-6818)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (28-233)||(25896-26103)
scaffold0026 (28-233)||(39858-40065)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (20-135)||(1975-2089)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (28-233)||(4508-4715)
scaffold0228 (28-233)||(12090-12297)
scaffold0228 (28-233)||(22042-22249)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (20-135)||(21712-21826)
scaffold0210 (20-135)||(29604-29718)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (104-233)||(28414-28545)
scaffold0046 (161-233)||(11292-11364)
scaffold0046 (161-233)||(1997-2069)
scaffold0046 (177-233)||(4552-4608)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (161-233)||(1118-1190)
scaffold0184 (181-217)||(4295-4331)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (161-233)||(119875-119947)
scaffold0023 (116-229)||(100378-100493)
scaffold0023 (162-229)||(40224-40291)
scaffold0023 (116-230)||(44454-44570)
scaffold0023 (120-230)||(94411-94522)
scaffold0023 (161-229)||(101503-101571)
scaffold0023 (180-229)||(38547-38596)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (156-233)||(34123-34200)
scaffold0175 (28-183)||(13141-13300)
scaffold0175 (180-233)||(273-326)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (28-233)||(39913-40120)
scaffold0080 (116-217)||(19885-19990)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (116-217)||(1048-1151)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (118-233)||(11447-11564)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (116-206)||(8493-8585)
scaffold0621 (161-233)||(6535-6607)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (116-229)||(2808-2923)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (29-233)||(8479-8682)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (157-230)||(15664-15737)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (161-233)||(11464-11536)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (116-217)||(12584-12687)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (161-233)||(6611-6683)
scaffold0333 (161-233)||(13991-14063)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (161-233)||(6172-6244)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (161-229)||(45841-45909)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (161-233)||(38305-38377)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (161-229)||(19268-19336)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (116-217)||(53551-53654)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (161-233)||(15826-15898)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (32-154)||(27911-28034)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (116-233)||(10543-10659)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (45-158)||(3460-3574)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (161-233)||(23932-24001)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (117-233)||(12942-13057)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (161-217)||(6828-6884)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (161-233)||(1083-1155)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (116-217)||(13144-13247)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (161-229)||(2694-2762)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (161-229)||(160688-160756)
scaffold0001 (180-230)||(85692-85742)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (137-233)||(18050-18148)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (162-229)||(14747-14814)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (28-97)||(1052-1122)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (116-233)||(22672-22788)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (161-206)||(1109-1154)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (161-206)||(5670-5715)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (157-206)||(8119-8168)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (116-230)||(38704-38820)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (51-206)||(4551-4709)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (161-206)||(62225-62270)
scaffold0028 (173-229)||(132662-132718)
scaffold0028 (120-230)||(136680-136791)
scaffold0028 (120-230)||(139149-139260)
scaffold0028 (120-230)||(144087-144198)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (116-230)||(116430-116544)
scaffold0022 (162-217)||(129021-129075)
scaffold0022 (164-206)||(78349-78391)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (157-206)||(60761-60810)
scaffold0010 (116-206)||(129932-130024)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (117-233)||(12766-12884)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (120-230)||(13392-13503)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (33-171)||(881-1019)
scaffold0395 (166-233)||(4888-4954)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (120-230)||(20747-20858)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (120-230)||(37821-37932)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (160-206)||(38343-38389)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (160-206)||(25133-25179)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (115-180)||(15417-15483)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (164-217)||(566-619)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (160-217)||(6332-6389)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (116-206)||(10554-10646)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (161-206)||(32563-32608)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (161-229)||(133-201)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (120-231)||(10772-10884)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (177-229)||(32102-32154)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (120-217)||(20430-20527)
scaffold0031 (88-158)||(128827-128897)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (120-206)||(4718-4805)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (120-230)||(16784-16895)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (114-202)||(8059-8151)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (179-217)||(15277-15315)
scaffold0017 (179-217)||(19799-19837)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (180-217)||(11979-12016)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (161-229)||(28818-28887)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (28-69)||(3648-3689)
scaffold0165 (28-69)||(7712-7753)
scaffold0165 (116-206)||(27751-27843)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (180-217)||(1842-1879)
scaffold0104 (180-217)||(9525-9562)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (160-217)||(2691-2748)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (180-217)||(44093-44130)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (181-217)||(8572-8608)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (181-217)||(2180-2216)


Alignment Details
Target: scaffold0351 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16506 - 16282
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16506 ttaataatgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 16407  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  16406 atacataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcgg 16307  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16306 tctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1506 - 1289
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1506 tgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 1407  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1406 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 1307  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1306 tgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7483 - 7266
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7483 tgaggttaactataatctatgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 7384  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7383 agatgttgatgaattgaatttgatataattatttcatgttgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 7284  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7283 tgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 47)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20309325 - 20309108
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20309325 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 20309226  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaga 20309126  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20309125 tgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 38017 - 38235
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38017 tgaggttaattataatctctgaagctgtataagacatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 38116  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    ||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  38117 agatgatgatgaatcgaaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 38215  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  38216 gttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23286069 - 23285865
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||  |||||||||||||    
T  23286069 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatg 23285970  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatg 226  Q
    ||||| | ||||||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  23285969 aattgcaattgatattattatgtc-tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 23285872  T
Q  227 atgatgt 233  Q
    |||||||    
T  23285871 atgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 298716 - 298933
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  298716 gaggttaactataatatgtgaagctgtataagatgtgttgttattaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 298815  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  298916 agttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22731147 - 22731355
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||    
T  22731147 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatg 22731246  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  || |||||    
T  22731247 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaag 22731345  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  22731346 atgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 23103399 - 23103516
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  23103399 agatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23103498 atgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 23654288 - 23654507
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||  ||    
T  23654288 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatattta 23654387  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||   ||||| ||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 23654486  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23654487 agttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22738093 - 22738300
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  22738093 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22738192  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||    
T  22738193 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgccta-tttaatg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaag 22738290  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  22738291 atgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23076650 - 23076442
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||| ||| ||    
T  23076650 taatctgtgaagctgtttaagctgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttg 23076551  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||    
T  23076550 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaag 23076452  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  23076451 atgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23060716 - 23060513
Alignment:
Q  33 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||  |||  |||||||||| ||| |||    
T  23060716 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttg 23060617  T
Q  132 aatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  23060616 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23060518  T
Q  229 gatgt 233  Q
    |||||    
T  23060517 gatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22337323 - 22337115
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  22337323 taatttgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22337224  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
      ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  22337223 tcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22337125  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  22337124 atgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23660230 - 23660023
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   ||| ||| |||  |||||||||| ||    
T  23660230 taatttgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttg 23660131  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | ||||||||  |||||| || ||||||    
T  23660130 atttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaaga 23660032  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  23660031 tgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 40622114 - 40622244
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtt-----tgtatacat 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||    
T  40622114 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtactgtatacat 40622212  T
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattat 147  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40622213 aagatgttgatgaattgaa-ttgatataattat 40622244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7679657 - 7679589
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  7679657 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22105524 - 22105412
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  22105524 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22105426  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  22105425 gattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 7735 - 7838
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7735 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaa 7834  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  7835 gatg 7838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19671902 - 19671830
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  19671902 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 23071998 - 23072070
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  23071998 atactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8946732 - 8946657
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  8946732 ttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25175922 - 25175854
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||| |||||||    
T  25175922 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28406048 - 28405981
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||| ||||||    
T  28406048 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040310
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23207350 - 23207293
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23207350 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 23207293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 571508 - 571397
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  571508 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 571411  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  571410 gattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18809054 - 18808943
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18809054 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18808957  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  18808956 gattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 232
Target Start/End: Original strand, 22134256 - 22134326
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||    
T  22134256 atactgcctatgttgctgtt-gatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23130973 - 23130862
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23130973 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23130876  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23130875 gattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23133440 - 23133329
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23133440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23133343  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23133342 gattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23135701 - 23135590
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23135701 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23135604  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23135603 gattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 23709583 - 23709694
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23709583 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23709680  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23709681 gattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 23712064 - 23712175
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23712064 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23712161  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23712162 gattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26505490 - 26505379
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  26505490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26505393  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  26505392 gattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26507968 - 26507857
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  26507968 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26507871  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  26507870 gattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 34402573 - 34402684
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  34402573 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34402670  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  34402671 gattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39682424 - 39682313
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  39682424 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39682327  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  39682326 gattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6726093 - 6725995
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  6726093 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 6725996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215085
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  217 gttgaagatgatgatg 232  Q
    | | |||||| |||||    
T  32215070 gattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520298
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20520298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 18786952 - 18786997
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18786952 atactacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtc 18786997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 22413186 - 22413243
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  22413186 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22413243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 23708668 - 23708713
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtc 23708713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004775
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 23004775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452033
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaagat 32452033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21389358 - 21389571
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389358 gttaattgtaatatgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21389457  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgtt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21389557  T
Q  220 gaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||    
T  21389558 gaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21395888 - 21396101
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395888 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21395987  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgtt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21396087  T
Q  220 gaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||    
T  21396088 gaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 21790381 - 21790594
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790381 gttaattgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttattgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 21790480  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgtt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgtt 21790580  T
Q  220 gaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||    
T  21790581 gaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 21778697 - 21778897
Alignment:
Q  33 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778697 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattga 21778796  T
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21778797 atttgatataattatgtcatgctgttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21778896  T
Q  233 t 233  Q
    |    
T  21778897 t 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 16199547 - 16199765
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16199547 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgttgattatgatgtaatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataccta 16199646  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16199647 agatgtagatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16199747 atgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31971475 - 31971257
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31971475 tgaggttaattataatctgtgaagatgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 31971376  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  31971375 agatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 31971277  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  31971276 gttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 45130892 - 45131117
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  45130892 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatttgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgt 45130991  T
Q  109 atacataagatgttgatgaa-ttgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45130992 atacctaagatgttgatgaatttgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 45131090  T
Q  207 attctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
      |||||||||||||||||||||||||    
T  45131091 ggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Original strand, 21918915 - 21919121
Alignment:
Q  30 atctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaa-tgtttgtatacataagatgttgatgaa 128  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| ||||    
T  21918915 atctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaa 21919014  T
Q  129 ttgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagat 225  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  21919015 ttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 21919113  T
Q  226 gatgatgt 233  Q
    ||||||||    
T  21919114 gatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Original strand, 18879142 - 18879352
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  18879142 gttaactataatctgtgaagctga-taagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaaga 18879240  T
Q  119 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgt 218  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||     
T  18879241 tgttgatgaattgcaattgatattattatgt--tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18879337  T
Q  219 tgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||    
T  18879338 tgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20536416 - 20536208
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||| ||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  20536416 taatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 20536317  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  20536316 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 20536218  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  20536217 atgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 28648957 - 28649164
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||  |||||||||| ||    
T  28648957 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttg 28649056  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  28649057 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 28649155  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    |||||||||    
T  28649156 atgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22626943 - 22626736
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  22626943 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22626844  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  22626843 atttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 22626745  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  22626744 tgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 18818322 - 18818530
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  18818322 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 18818421  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||  | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  18818422 acttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18818520  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  18818521 atgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Original strand, 16092272 - 16092463
Alignment:
Q  45 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||| ||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  16092272 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatta 16092371  T
Q  144 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  16092372 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7372978 - 7372778
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||       ||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || |||    
T  7372978 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataa-------gcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttga 7372886  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
     ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  7372885 cttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 7372787  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  7372786 tgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22875291 - 22875065
Alignment:
Q  10 taatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 107  Q
    |||| |||| ||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||    
T  22875291 taatggtgatgttaattataatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatg 22875192  T
Q  108 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| | |||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  22875191 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagt 22875093  T
Q  206 cattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |  |||||  || |||||||||||||||    
T  22875092 cggtctaaattgatgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 21923841 - 21924049
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |    |||| ||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  21923841 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgcaaaataaggttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 21923940  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| || |||||||| ||||   ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  21923941 acttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 21924039  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  21924040 atgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6759464 - 6759255
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 125  Q
    |||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||| |||||  |||  ||||||  | |||||||||     
T  6759464 taatctgtgaagctgttttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgagatgttgac 6759365  T
Q  126 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaa 222  Q
       ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  6759364 ---ttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 6759269  T
Q  223 gatgatgatgtcca 236  Q
    ||||||||||||||    
T  6759268 gatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 5866323 - 5866395
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5866323 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17141031 - 17140916
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  17141031 gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T
Q  218 ttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  17140931 ttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21491067 - 21490995
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21491067 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23406589 - 23406379
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgtt--ga 124  Q
    |||| ||||||| ||  |||||| ||||| |||||| ||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| |  |     
T  23406589 taatatgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgactatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgt 23406490  T
Q  125 tgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttga 221  Q
    ||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  23406489 tgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 23406391  T
Q  222 agatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||    
T  23406390 agatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6520486 - 6520368
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6520486 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6520387  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     || | |||||||||||||    
T  6520386 ttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 38855300 - 38855372
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  38855300 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23648761 - 23648554
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||  |  ||| |||  |||||||||| ||    
T  23648761 taatctgttaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttattgaatatttaagatgttgttg 23648662  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
     |||| |  |||||| ||||||||||| ||||||   |  |||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||    
T  23648661 tattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 23648563  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    ||| |||||    
T  23648562 atgttgatg 23648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 23760893 - 23760962
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  23760893 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Original strand, 25363053 - 25363123
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 97  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  25363053 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtggtataatgttttatgcattacttga 25363123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 226
Target Start/End: Original strand, 13508108 - 13508199
Alignment:
Q  137 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatg 226  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13508108 gatattattatatcatgatgttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 17612159 - 17612231
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20498681 - 20498578
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||    
T  20498681 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 20498582  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  20498581 gatg 20498578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 14409495 - 14409606
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  14409495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14409592  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  14409593 gattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249384
Alignment:
Q  183 ttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255222
Alignment:
Q  183 ttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 983455 - 983500
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  983455 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtc 983500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21285716 - 21285624
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21285716 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtc 21285624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 26355747 - 26355815
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  26355747 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1484513 - 1484402
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  1484513 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1484416  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  1484415 gattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 5853343 - 5853454
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  5853343 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 5853440  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  5853441 gattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413454
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 16413454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20403338 - 20403227
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20403338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20403241  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  20403240 gattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22001864 - 22001753
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  22001864 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 22001767  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  22001766 gattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353036
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 24353036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37116418 - 37116363
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 37116363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 164 - 226
Target Start/End: Original strand, 13597669 - 13597731
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatg 226  Q
    |||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  13597669 ctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Original strand, 15203295 - 15203393
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  15203295 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatg 15203392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 19154935 - 19154981
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19154935 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 19154981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32121853 - 32121734
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg---tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattc 210  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||  ||||||| ||||||||   ||  ||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32121853 taagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcattc 32121755  T
Q  211 taagatgttgaagatgatgat 231  Q
    |||| || | |||||| ||||    
T  32121754 taagttgattaagatgttgat 32121734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 17267044 - 17267099
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17267044 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 17267099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 20046246 - 20046357
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20046246 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20046343  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  20046344 gattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542535
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896265
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 20856491 - 20856529
Alignment:
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20856491 tttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 20856529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 39094991 - 39095029
Alignment:
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39094991 tttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 39095029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 17926773 - 17926810
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17926773 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 17926810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Original strand, 17439557 - 17439601
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 17439601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51806 - 51582
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  51806 ttaagagtgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgaatatgaagtgttataatgtttatgcatttcttgaaggatatttgt 51707  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  51706 atacataagatgttgatgaattgaatttgttataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 51607  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  51606 tctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 27847727 - 27847951
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27847727 ttaataatgagattaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgtgataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 27847826  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||      
T  27847827 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatactgttgtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcgg 27847926  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27847927 tctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 16 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40443609 - 40443393
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  40443609 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataccta 40443510  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  40443509 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T
Q  215 atgttgaagatgatgat 231  Q
    |||||||||||||||||    
T  40443409 atgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 16386149 - 16386369
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||  ||    
T  16386149 gaggttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtaatataatgttttatgcattacttgagaattgtttgaatattta 16386248  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  16386349 agttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12699040 - 12698831
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  12699040 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 12698941  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaa 222  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||    
T  12698940 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 12698842  T
Q  223 gatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||    
T  12698841 gatgatgatgt 12698831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9509397 - 9509189
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  9509397 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 9509298  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  9509297 aattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 9509199  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  9509198 atgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10589258 - 10589039
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |   |    
T  10589258 tgaggttaattataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgctgattatgatgtgatataatgtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattga 10589159  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatcta 10589060  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  10589059 agttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26212215 - 26211995
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  26212215 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 26212116  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||  ||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtcta 26212017  T
Q  213 agatgttgaag-atgatgatgt 233  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  26212016 agttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 18456326 - 18456530
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  18456326 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 18456425  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||    
T  18456426 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 18456524  T
Q  225 tgatga 230  Q
    ||||||    
T  18456525 tgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38227671 - 38227481
Alignment:
Q  45 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 143  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||| | | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  38227671 taagatatgttgatgttgattaagatgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatta 38227572  T
Q  144 ttatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||||||    
T  38227571 ttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagatgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Original strand, 3564294 - 3564482
Alignment:
Q  45 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||  ||||||||| |    
T  3564294 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatatta 3564393  T
Q  144 ttatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||    
T  3564394 ttatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12187227 - 12187113
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||   ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12187227 gttaactgcaatctgtgaagctga-taagagatgtttgagttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 12187129  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  12187128 gttgatgaattgaatt 12187113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 17137969 - 17138083
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  17137969 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 17138067  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  17138068 gttgatgaattgaatt 17138083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13647440 - 13647325
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13647440 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 13647342  T
Q  217 gttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  13647341 gttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16495474 - 16495402
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16495474 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 28505347 - 28505419
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  28505347 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34200858 - 34200786
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  34200858 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 67817 - 67745
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  67817 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 15754936 - 15755008
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15754936 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48273508 - 48273392
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  48273508 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtcta 48273410  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  48273409 agttgattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 11996076 - 11996148
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11996076 atactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 16219717 - 16219835
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  16219717 taagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtct 16219816  T
Q  212 aagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||   |||||||||||||||||    
T  16219817 aa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22073033 - 22072913
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22073033 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtcta 22072934  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || || | |||||||||||||    
T  22072933 agttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Original strand, 2280121 - 2280213
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2280121 agatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 2280213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 811180 - 811248
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  811180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18005718 - 18005650
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  18005718 atactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44014250 - 44014182
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  44014250 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47831879 - 47831807
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  47831879 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16213831 - 16213684
Alignment:
Q  84 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    |||||||||||||||  || | || |||  ||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | ||||||||    
T  16213831 tatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 16213733  T
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  16213732 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 17061966 - 17062077
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||  | || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  17061966 gttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgtatactgctgagtt-gctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17062064  T
Q  218 ttgaagatgatga 230  Q
     | ||||||||||    
T  17062065 attaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 456432 - 456321
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  456432 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 456335  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  456334 gattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 10063841 - 10063939
Alignment:
Q  137 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  |||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| || ||||||    
T  10063841 gatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11972607 - 11972496
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  11972607 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11972510  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  11972509 gattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 14949173 - 14949284
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  14949173 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14949270  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  14949271 gattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 15376764 - 15376875
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  15376764 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15376861  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  15376862 gattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16232631 - 16232520
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  16232631 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16232534  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  16232533 gattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16410170 - 16410059
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  16410170 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16410073  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  16410072 gattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18640383 - 18640272
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18640383 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18640286  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  18640285 gattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 20385174 - 20385285
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20385174 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20385271  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  20385272 gattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 21189646 - 21189757
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  21189646 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21189743  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  21189744 gattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275195
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 24275195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32125602 - 32125491
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  32125602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32125505  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  32125504 gattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41523028 - 41522917
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  41523028 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41522931  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  41522930 gattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 41525490 - 41525379
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  41525490 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 41525393  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  41525392 gattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 11393338 - 11393448
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  11393338 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11393435  T
Q  217 gttgaagatgatg 229  Q
    | | |||||||||    
T  11393436 gattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18430827 - 18430709
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  18430827 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 18430730  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || || | |||||||||||||    
T  18430729 agttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24704796 - 24704688
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgtt 219  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || | ||||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |    
T  24704796 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T
Q  220 gaagatgatga 230  Q
     ||||||||||    
T  24704698 taagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 12255842 - 12255887
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255842 atactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12255887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12901399 - 12901350
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12901399 ttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 12901350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16056446 - 16056355
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| | ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16056446 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttgcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtc 16056355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24702349 - 24702238
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  24702349 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24702252  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  24702251 gattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| |    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Original strand, 2530139 - 2530205
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||    
T  2530139 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgttgcctatgttgctgtt 2530205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386333
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48991253 - 48991207
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  48991253 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 48991207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Original strand, 2832509 - 2832561
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  2832509 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044773
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtc 14044773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354803
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtc 14354803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 20569665 - 20569701
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20569665 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 20569701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17046711 - 17046487
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17046711 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaagaatgtttgt 17046612  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17046611 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttctatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 17046512  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17046511 tctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 14053203 - 14053422
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14053203 tgaggttaattataatctgtgaagccgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatgcata 14053302  T
Q  116 ag-atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  14053303 agaatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaa 14053402  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14053403 gatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12902976 - 12902757
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||    
T  12902976 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattta 12902877  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12902876 agatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12902778  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12902777 agttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7089096 - 7088877
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||  |||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||    
T  7089096 gaggttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgttgctaattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgta 7088997  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 7088898  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || || |||||||||||||||    
T  7088897 agttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 226
Target Start/End: Original strand, 23374261 - 23374473
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  23374261 gaggttaactataatctctgaagctttttaagatctgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 23374360  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttcta 23374459  T
Q  213 agatgttgaagatg 226  Q
    || |||||||||||    
T  23374460 agttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22636642 - 22636437
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  22636642 taatctgtgaagctgt-taagatgtgttgatgtcgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22636544  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||| |||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  22636543 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 22636445  T
Q  224 atgatgat 231  Q
    ||||||||    
T  22636444 atgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44053037 - 44052829
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  44053037 taatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgttgattatgatgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 44052938  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || |||||    
T  44052937 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatg-ttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaag 44052839  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  44052838 atgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 16270149 - 16270356
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  16270149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 16270248  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  || ||||||    
T  16270249 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 16270347  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  16270348 tgatgatgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 16377436 - 16377639
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||| |||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  16377436 taatctgtggagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 16377535  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagat 225  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  16377536 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 16377634  T
Q  226 gatga 230  Q
     ||||    
T  16377635 aatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7798958 - 7798774
Alignment:
Q  52 tgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtc 150  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || |||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||    
T  7798958 tgttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtc 7798859  T
Q  151 atgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  7798858 atgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 16239883 - 16240090
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||| |||||||  |||||| ||||| ||||||||||||  || ||||||||| | |||||||||| ||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  16239883 taatctgcgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatatgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttg 16239982  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||   |||||| || ||||||    
T  16239983 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgct-attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaaga 16240081  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  16240082 tgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14038856 - 14038653
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  14038856 taatctgtgaagctgtttaacatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 14038757  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  14038756 acttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 14038658  T
Q  224 atgat 228  Q
    |||||    
T  14038657 atgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Original strand, 15121709 - 15121834
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  15121709 gttaactgcaatctgtgaggctga-tatgagatgtttgagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 15121807  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattat 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  15121808 gttgatgaattgaa-ttgatataattat 15121834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15551889 - 15551817
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  15551889 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 52873367 - 52873488
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattc 210  Q
    ||||||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  52873367 taagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52873465  T
Q  211 taagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  52873466 taagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7893908 - 7893703
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||   ||||||| |||  |||||| | | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  7893908 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctg---attatgatgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 7893812  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||| || |||||    
T  7893811 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaag 7893713  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  7893712 atgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 157 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3096368 - 3096293
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3096368 ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6900062 - 6899891
Alignment:
Q  64 ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gt 160  Q
    |||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||  ||| ||||  ||    
T  6900062 ttatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgt 6899963  T
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  6899962 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 13853 - 13956
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  13853 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13952  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  13953 gatg 13956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12774079 - 12774011
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  12774079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 39706337 - 39706409
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  39706337 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3096863 - 3096772
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttg 107  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3096863 tgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgctgattatgatgagatacaatgtttatgcattacttgaagaatatttg 3096772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 206
Target Start/End: Original strand, 12288211 - 12288304
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  |||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288211 gatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 12288304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 54798756 - 54798872
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  54798756 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg-ttgttattcaactaagctgcatgagtcggtcta 54798854  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  54798855 agttgattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 52243245 - 52243290
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243245 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 52243290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14280431 - 14280316
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14280431 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 14280334  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  14280333 agttgattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 18215325 - 18215436
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18215325 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18215422  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  18215423 gattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 44928926 - 44929042
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||  ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44928926 agatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 44929024  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  44929025 agttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 97
Target Start/End: Original strand, 17047989 - 17048055
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 97  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17047989 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 17048055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8846428 - 8846360
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||| || ||| |||||||    
T  8846428 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 12358 - 12469
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  12358 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12455  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  12456 gattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 15118403 - 15118514
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  15118403 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 15118500  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  15118501 gattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353835
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44615399 - 44615288
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44615399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44615302  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  44615301 gattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 44773138 - 44773249
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  44773138 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 44773235  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  44773236 gattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52312621 - 52312510
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  52312621 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 52312524  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  52312523 gattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 205
Target Start/End: Original strand, 14970758 - 14970844
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14970758 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 14970844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Original strand, 43198611 - 43198649
Alignment:
Q  168 ctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198611 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 43198649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Original strand, 43256161 - 43256227
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  43256161 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttggtatgctgcctatgttgctgtt 43256227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19242810 - 19242693
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19242810 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19242713  T
Q  217 gttgaagatgatgatgtcca 236  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19242712 gattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  217 gttgaagatgatgatg 232  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 46640504 - 46640561
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  46640504 tatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 46640561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190479
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 6190479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 1837560 - 1837671
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  1837560 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1837657  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  1837658 gattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 3515118 - 3515007
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| | | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  3515118 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3515021  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  3515020 gattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 18239470 - 18239581
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18239470 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18239567  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  18239568 gattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 50222390 - 50222501
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  50222390 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50222487  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  50222488 gattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082257
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 53082257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641344
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610950
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 16348731 - 16348768
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16348731 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 16348768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 16357019 - 16357056
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16357019 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 16357056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 11250630 - 11250666
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11250630 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 11250666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25555528 - 25555492
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25555528 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 25555492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 953 - 1170
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  953 tgaggttaactataatctgtgaagctgtataaaatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 1052  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1053 agatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 1152  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1153 tgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 16920534 - 16920751
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920534 tgaggttaactataatctatgaagctgaataagataagttgttgttgattatgatgtggtataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacata 16920633  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  16920634 agatgttgatgaatggaatttgatatacttatgtcatgatgttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaaga 16920733  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16920734 tgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11185729 - 11185517
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185729 ttaatagtgaggttaaccgtaatctgtgaagatgaataagatatgttgttgctgattatgaagtgttataaagtttatgcattacttgaagaatgtttgt 11185630  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  11185629 atacaaaagatgctgatgaattgaatttgatataattatgtcatgttgttgtacactgcacatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 11185530  T
Q  209 tctaagatgttga 221  Q
    |||||||||||||    
T  11185529 tctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22831722 - 22831503
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtataca-- 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  22831722 tgaggttaactataatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacatc 22831623  T
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  22831622 taagatgttgatgaattgaatttgatatgattatgtcatgtcgttgaacagtgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctac 22831523  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
     |||||||||||||||||||    
T  22831522 tatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35245758 - 35245586
Alignment:
Q  61 tgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt 160  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  35245758 tgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttgt 35245659  T
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 20360861 - 20361081
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacat 114  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |    
T  20360861 tgaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatattt 20360960  T
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20360961 aagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatct 20361059  T
Q  212 aagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||| || |||| ||||||||||    
T  20361060 aagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 20638196 - 20638404
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||     
T  20638196 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaagaatgtttgaatattaaagatgttgata 20638295  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||   |||||| || |||||    
T  20638296 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaag 20638394  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  20638395 atgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29060748 - 29060540
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||    
T  29060748 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgagatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 29060649  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  29060648 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaag 29060550  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  29060549 atgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16496397 - 16496244
Alignment:
Q  82 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctg 178  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  16496397 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 16496298  T
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  16496297 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 19303454 - 19303661
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  19303454 taatctgtgaagctgttgaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttg 19303553  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  19303554 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaaga 19303652  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  19303653 tgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20593981 - 20593773
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| || |||||||||||   ||| |||||||  | |||||||| ||    
T  20593981 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttg 20593882  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||||| || |||||    
T  20593881 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgatgaag 20593783  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  20593782 atgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 25629268 - 25629476
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  25629268 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttg 25629367  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||| | | || ||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  25629368 acttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgtt-gtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25629466  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  25629467 atgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22780140 - 22780348
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||||||   |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  22780140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 22780239  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  22780240 acttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 22780338  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  22780339 atgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 18409740 - 18409947
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| |||||  |||  || ||   | |||||||| ||    
T  18409740 taatatgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttg 18409839  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||    
T  18409840 acttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 18409938  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    |||||||||    
T  18409939 atgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20076817 - 20076700
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    ||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  20076817 taagatgttgat---ttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 20076722  T
Q  212 aagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  20076721 aagttgatgaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 17287713 - 17287917
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||   ||  |||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||| ||    
T  17287713 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgaggttgattatgttatgacataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgactt 17287812  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||    
T  17287813 gcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 17287911  T
Q  228 tgatgt 233  Q
    ||||||    
T  17287912 tgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1561375 - 1561303
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  1561375 atactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 27333267 - 27333339
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  27333267 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 27394007 - 27394079
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  27394007 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 28496520 - 28496592
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  28496520 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 29808931 - 29809003
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  29808931 atactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1595660 - 1595549
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  1595660 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 1595563  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  1595562 gattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22782374 - 22782227
Alignment:
Q  84 tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||    
T  22782374 tatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 22782276  T
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  22782275 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25656727 - 25656629
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  25656727 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 25656630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25644440 - 25644347
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||  |||| ||| |||||| |   ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25644440 agatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtc 25644347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 9098563 - 9098608
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098563 atactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 9098608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20109257 - 20109165
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| | ||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20109257 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 20109165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19652267 - 19652199
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  19652267 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12742428 - 12742317
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  12742428 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12742331  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  12742330 gattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 18334643 - 18334754
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  18334643 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 18334740  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  18334741 gattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19005157 - 19005046
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19005157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19005060  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  19005059 gattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 19858970 - 19859081
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  19858970 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19859067  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  19859068 gattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24422658 - 24422547
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  24422658 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24422561  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  24422560 gattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33861905 - 33861794
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  33861905 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33861808  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  33861807 gattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33864389 - 33864278
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  33864389 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 33864292  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  33864291 gattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Original strand, 27415942 - 27416008
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  27415942 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 27416008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185915
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtc 4185915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23019525 - 23019408
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||||    
T  23019525 agatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaa 23019426  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||   |||||||||||||    
T  23019425 gatg--aaagatgatgatgt 23019408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714417
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  217 gttgaagatgatgatg 232  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25688598 - 25688526
Alignment:
Q  135 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25688598 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 25688526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 1540962 - 1541073
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  1540962 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagtt 1541059  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  1541060 gattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 2291231 - 2291342
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  2291231 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 2291328  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  2291329 gattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8055140 - 8055029
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  8055140 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8055043  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  8055042 gattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  186 tttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 26924691 - 26924802
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  26924691 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26924788  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  26924789 gattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18456830 - 18456732
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18456830 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18456733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18461990 - 18461892
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18461990 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 18461893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 19668436 - 19668398
Alignment:
Q  168 ctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19668436 ctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtc 19668398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821949
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 18821949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 19790847 - 19790884
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19790847 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 19790884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21766744 - 21766707
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21766744 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 21766707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076748
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 23076748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008166
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaaga 35008166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5017 - 5246
Alignment:
Q  1 attaatatttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaaga 100  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5017 attaagatttaataataaggttaattataatatgtgaaactgaataaaatatgttgttgttgattaagatgtgttataatgtttatacattacttgaaga 5116  T
Q  101 atgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5117 atgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgatgttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgca 5216  T
Q  201 tgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  5217 tgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 38801285 - 38801508
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  38801285 ttaataatgagattaactataatttgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattacgatgtgttataatgtttatgcattacttgaagaataattgt 38801384  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  38801385 atatataatatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcttgctgttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-g 38801483  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38801484 tctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 27250631 - 27250850
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||    
T  27250631 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatattta 27250730  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 27250829  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27250830 agttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21026899 - 21026680
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  21026899 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgctgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 21026800  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21026701  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || |||||| |||||||||||    
T  21026700 agttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 50210126 - 50210333
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||    
T  50210126 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 50210225  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  50210226 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 50210324  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    |||||||||    
T  50210325 atgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34509988 - 34509783
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||||||| ||    
T  34509988 taatctttgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttg 34509889  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  34509888 acttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 34509790  T
Q  224 atgatga 230  Q
    |||||||    
T  34509789 atgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22532473 - 22532269
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  || |||  |||||||||| ||||||    
T  22532473 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaatt 22532374  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
    | | | ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||   |||||| || |||||||||    
T  22532373 gcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatga 22532275  T
Q  228 tgatgt 233  Q
    ||||||    
T  22532274 tgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 22354485 - 22354616
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  22354485 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 22354584  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 158  Q
    ||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  22354585 aattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847275
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatg 20847271  T
Q  230 atgt 233  Q
    ||||    
T  20847272 atgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 45574893 - 45575008
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45574893 gttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 45574991  T
Q  217 gttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  45574992 gttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 14295600 - 14295672
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  14295600 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20135395 - 20135188
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||  || ||||||||| ||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||||| ||    
T  20135395 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttcattatgatatgatataatgttgtatgcattacttgaagttttattgaatacttaagatgttgttg 20135296  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||   |  ||||||||  |||| || ||| |||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||    
T  20135295 aattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctatt-gttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 20135197  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    ||| |||||    
T  20135196 atgttgatg 20135188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 21896258 - 21896361
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||    
T  21896258 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa 21896357  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  21896358 gatg 21896361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 21861572 - 21861675
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  |||||    
T  21861572 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaa 21861671  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  21861672 gatg 21861675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 22921918 - 22921986
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  22921918 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 22468610 - 22468816
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| || || |||  ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||   ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  22468610 taatctgtgaagctgtttaagatgtgctgatgta-attatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttg 22468708  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| || |||||||||||||||   |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||    
T  22468709 aattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag 22468807  T
Q  224 atgatgatg 232  Q
    ||| |||||    
T  22468808 atgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33681079 - 33681010
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  33681079 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 48603722 - 48603652
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 97  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48603722 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 48603652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 217
Target Start/End: Original strand, 35261097 - 35261183
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35261097 atttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 35261183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22237746 - 22237630
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22237746 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa 22237647  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
       |||||||||||||||||    
T  22237646 ---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 16758721 - 16758676
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16758721 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtc 16758676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20918676 - 20918631
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918676 atactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtc 20918631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21754117 - 21754072
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754117 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 21754072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13988977 - 13988866
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  13988977 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13988880  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  13988879 gattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 21923342 - 21923453
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  21923342 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21923439  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  21923440 gattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 23593786 - 23593897
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  23593786 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23593883  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  23593884 gattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31612428 - 31612313
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  31612428 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 31612331  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  31612330 agttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 50614167 - 50614222
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50614167 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50614222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 50621995 - 50622050
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50621995 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 50622050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 22356087 - 22356185
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttga 124  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  22356087 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22356185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 124
Target Start/End: Original strand, 22357773 - 22357871
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttg-ttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttga 124  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||    
T  22357773 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgaatatttatgatgttga 22357871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 52928019 - 52928088
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||   |||||||||| ||||||    
T  52928019 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatggtgatgt 52928088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Original strand, 16368338 - 16368391
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16368338 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 16368391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20248351 - 20248283
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  20248351 atactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  217 gttgaagatgatgat 231  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 433125 - 433012
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||||| | |||| |||    ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  433125 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtcta 433030  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  433029 agttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 22123131 - 22123206
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||   ||||||||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22123131 atttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtc 22123206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298137
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29776738 - 29776688
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  29776738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 33797639 - 33797573
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||    
T  33797639 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtatgctgcatatgttgctgtt 33797573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 41050084 - 41050141
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41050084 tatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 41050141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 236
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgtcca 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || ||| || | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 18394034 - 18394070
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18394034 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 18394070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47200 - 46995
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47200 taatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgtttatgatgtgatataatgtttatgcattacttggagaatatttgtatacataagatgttgatga 47101  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  47100 attgaaattgatattattatgtcatgctgctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatga 47001  T
Q  228 tgatgt 233  Q
    ||||||    
T  47000 tgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 10320 - 10544
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  10320 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgatgattatgatgtgatataatgattatgcattacttgaagaatatttgt 10419  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcat 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      
T  10420 atacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcgg 10519  T
Q  209 tctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  10520 tctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32284 - 32067
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32284 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtataccta 32185  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  32184 agatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 32086  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     ||||||||||||||||||    
T  32085 ttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13715 - 13497
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13715 tgaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgtcgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 13616  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  13615 agatgttgatgaatcgaaattgatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13517  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  13516 gttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 15359 - 15584
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| | ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  15359 ttaataataaggttaattataatctgtgaagctgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatatttatgcattacttgaagaatattttt 15458  T
Q  109 atacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15459 atacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgct-cttgttatttaactaagctgcatgagtc 15557  T
Q  207 attctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||    
T  15558 agtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7465 - 7378
Alignment:
Q  59 gttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattat 147  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7465 gttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatttg-tataattat 7378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4931 - 4712
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  4931 tgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacata 4832  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  4831 agattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 4733  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  4732 agttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 16 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 13
Alignment:
Q  16 tgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  155 tgaggttaagtataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgttgattatgatgtgatataatgtttatgccttacttgaagaatatttgtatacata 56  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 158  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  55 agattttgatgaattgcaattgatgtatttatgtcatgctgtt 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 54)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 21292864 - 21293090
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgt 108  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21292864 ttaataatgaggttaattataatctgtgaagttgtataagatatgttgttgatgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaataattgt 21292963  T
Q  109 atacataagatgttgatgaa-ttgaat-ttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  21292964 atacctaagatgttgatgaatttgaatattgatattattatgtcatactgtttgtttactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgaat 21293062  T
Q  206 cattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21293063 cggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 8286760 - 8286964
Alignment:
Q  33 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  8286760 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattg 8286859  T
Q  132 aatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
     | ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  8286860 caattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 8286958  T
Q  228 tgatgt 233  Q
    ||||||    
T  8286959 tgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37724117 - 37723910
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |  || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | ||    
T  37724117 gttaactgcaatctgtgaagctgtttt-gagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgtttaattgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 37724019  T
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37724018 atgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatg 37723919  T
Q  218 ttgaagatg 226  Q
    |||||||||    
T  37723918 ttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 23390409 - 23390617
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  23390409 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 23390508  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  23390509 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 23390607  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  23390608 atgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24493795 - 24493569
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 107  Q
    |||||| ||| ||||| | ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||  |||    
T  24493795 ttaataatgatgttaattataatctgtgaagctatttaagatatgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattg 24493696  T
Q  108 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
     |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24493695 aatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttacttaaccaagctgcatgagt 24493597  T
Q  206 cattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |  |||||| || |||||||||||||||    
T  24493596 cggtctaagttgatgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9078160 - 9077952
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  9078160 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttg 9078061  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  9078060 acttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaag 9077962  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  9077961 atgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22075238 - 22075018
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  22075238 gaggttaattataatatgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatattta 22075139  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgaatgagtcggtcta 22075040  T
Q  213 agatgttgaag-atgatgatgt 233  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  22075039 agttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24529436 - 24529223
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||   |||  ||||||  |||||    
T  24529436 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaaga 24529337  T
Q  119 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  24529336 tgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24529238  T
Q  216 tgttgaagatgatga 230  Q
    || ||||||||||||    
T  24529237 tgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 21729032 - 21729185
Alignment:
Q  82 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctg 178  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  21729032 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21729131  T
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21729132 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 233
Target Start/End: Original strand, 21808357 - 21808510
Alignment:
Q  82 tttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctg 178  Q
    ||||||||||||||||  | | |||| |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||    
T  21808357 tttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg 21808456  T
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21808457 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25421740 - 25421532
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  25421740 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttg 25421641  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  25421640 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 25421542  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  25421541 atgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13025518 - 13025311
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  13025518 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13025419  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  13025418 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13025320  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  13025319 tgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13095702 - 13095495
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | ||||| |||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  13095702 taatatgtgaagttgtttaagatatgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 13095603  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  13095602 acttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 13095504  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  13095503 tgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 18769910 - 18770024
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  18769910 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 18770008  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  18770009 gttgatgaattgaatt 18770024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 22032529 - 22032415
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  22032529 gttaactgcaatctgtgaagctga-tacgagatgtttgtgttgaatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 22032431  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  22032430 gttgatgaattgaatt 22032415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25431602 - 25431421
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| | |  |||||||||| ||    
T  25431602 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttg 25431503  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25431502 acttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagatgcatgagtc 25431421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1096668 - 1096467
Alignment:
Q  35 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaa 133  Q
    ||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| |    
T  1096668 tgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgca 1096569  T
Q  134 tttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |   ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||| |||    
T  1096568 tttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttga 1096470  T
Q  231 tgt 233  Q
    |||    
T  1096469 tgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 19660884 - 19660956
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  19660884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 23572254 - 23572178
Alignment:
Q  59 gttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23572254 gttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagatgttgatgaattgaatt 23572178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36314649 - 36314577
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36314649 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Original strand, 21997553 - 21997655
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||    
T  21997553 atttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 21997651  T
Q  230 atgt 233  Q
    ||||    
T  21997652 atgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Original strand, 21329500 - 21329618
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21329500 gatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21329599  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     || | |||||||||||||    
T  21329600 ttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 217
Target Start/End: Original strand, 20026942 - 20027046
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  20026942 gatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20027041  T
Q  213 agatg 217  Q
    |||||    
T  20027042 agatg 20027046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 22959581 - 22959649
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  22959581 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Original strand, 21502156 - 21502277
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgta--tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    ||||||| |||||| ||| ||| |||||  |||| |||||||| | ||  |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||    
T  21502156 taagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtct 21502255  T
Q  212 aagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||| || | |||||||||||||    
T  21502256 aagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21565659 - 21565546
Alignment:
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  21565659 atgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 21565560  T
Q  216 tgttgaagatgatg 229  Q
    || ||| |||||||    
T  21565559 tgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22412302 - 22412187
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |  | |||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22412302 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttg-ttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 22412204  T
Q  214 gatgttgaagatgatga 230  Q
    | || | ||||||||||    
T  22412203 gttgattaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 98
Target Start/End: Original strand, 22107275 - 22107357
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaa 98  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22107275 gaggttaattataatctgtgaagctgtttaaggtgtgttgttgttgattatgatgtgatataatatattatgcattacttgaa 22107357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 264819 - 264930
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  264819 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 264916  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  264917 gattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 10732991 - 10733102
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  10732991 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10733088  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  10733089 gattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20909123 - 20909012
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20909123 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20909026  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  20909025 gattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39363495 - 39363384
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  39363495 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 39363398  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  39363397 gattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 18418699 - 18418599
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-gtatactgcctattttgctgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||| |||||| |||    
T  18418699 taagatgttg-tgaattgcaaatgatattattatgtcatgctgtttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtct 18418602  T
Q  212 aag 214  Q
    |||    
T  18418601 aag 18418599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Original strand, 20910800 - 20910866
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||    
T  20910800 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgtctatgttgctgtt 20910866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31061166 - 31061068
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  31061166 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 31061069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39245234 - 39245136
Alignment:
Q  133 atttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  39245234 atttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 39245137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Original strand, 26012084 - 26012129
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26012084 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 26012129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19668970 - 19668898
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  19668970 atactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Original strand, 20902075 - 20902147
Alignment:
Q  135 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20902075 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 20902147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22144121 - 22144065
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22144121 atactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22144065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 220
Target Start/End: Original strand, 17919220 - 17919259
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttg 220  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17919220 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgttg 17919259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29330045 - 29329934
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  29330045 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29329948  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  29329947 gattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581361
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918110
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21873327 - 21873266
Alignment:
Q  155 tgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21873327 tgttgtatcctgcctatgctgct-tttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatg 21873266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20767023 - 20766986
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20767023 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 20766986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20805601 - 20805564
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20805601 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 20805564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 22178269 - 22178326
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  22178269 tatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 22178326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 230
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  182 gttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 12028634 - 12028670
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12028634 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 12028670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13211
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  13419 taatttgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13320  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  13319 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaag 13221  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  13220 atgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12399428 - 12399209
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacata 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||  | | |||| |||  ||    
T  12399428 gaggttaactataatctgtgaagctatttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgtcttatgcattacttgagaattatttgaatattta 12399329  T
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12399230  T
Q  213 agatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  12399229 agttgttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 20698349 - 20698556
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  20698349 taatctgtgaagctgttcaagatgtgttgaagttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatga 20698448  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    |||| | ||||||| |||| |||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  20698449 attgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 20698547  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  20698548 tgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17488064 - 17487856
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  17488064 taatctgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17487965  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  17487964 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17487866  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  17487865 atgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13442482 - 13442274
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  13442482 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 13442383  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  13442382 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 13442284  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  13442283 atgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17499546 - 17499338
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| |||||| |||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  17499546 taatttgtgaatctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 17499447  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  17499446 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 17499348  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  17499347 atgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14973062 - 14972854
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||    
T  14973062 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttg 14972963  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  14972962 atttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 14972864  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  14972863 atgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18438750 - 18438534
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataaga 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  |||||| | ||||    
T  18438750 gttaactataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaatatgatgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaaga 18438651  T
Q  119 tgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaaga 215  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||     
T  18438650 tgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt 18438552  T
Q  216 tgttgaagatgatgatgt 233  Q
    || |||||||||||||||    
T  18438551 tgatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 14576719 - 14576926
Alignment:
Q  1 attaatatttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaag 99  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||| | |||||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14576719 attaagatttaatgatgatgttaattataatctgtgaagttgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaag 14576818  T
Q  100 aatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttg--tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagct 197  Q
     ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  14576819 tataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagtt 14576917  T
Q  198 gcatgagtc 206  Q
    | |||||||    
T  14576918 gaatgagtc 14576926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26687095 - 26686887
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  ||||||| || ||    
T  26687095 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttg 26686996  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||    
T  26686995 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaag 26686897  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  26686896 atgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 23083275 - 23083482
Alignment:
Q  29 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||| |||| |   ||| |||  |||||||||| |||    
T  23083275 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatattgattatgatgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttga 23083374  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  23083375 cttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 23083473  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  23083474 tgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 24153122 - 24153326
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| | ||||||| |||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  24153122 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 24153221  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||    
T  24153222 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgct-atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 24153320  T
Q  225 tgatga 230  Q
    ||||||    
T  24153321 tgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 11424676 - 11424880
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  || |||  | ||||||||||     
T  11424676 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgaagttgtttatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgagatgttgat- 11424774  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
      |||   |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11424775 --ttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaaga 11424871  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  11424872 tgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43841140 - 43840932
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  43841140 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 43841041  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | |||| || |||||    
T  43841040 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaag 43840942  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    || |||||||    
T  43840941 ataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 25476299 - 25476506
Alignment:
Q  29 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||| || |||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| |||    
T  25476299 aatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgatgataatgatgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttga 25476398  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||    
T  25476399 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctg-ttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaaga 25476497  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  25476498 tgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 42386619 - 42386437
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaat-aagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 125  Q
    |||||||||||||||  | ||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||  || |||  | |||||||| |    
T  42386619 taatctgtgaagctgttttaagatgttttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgtt 42386520  T
Q  126 gaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    || ||| |||||||||  |||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  42386519 gacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtc 42386437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 13210376 - 13210448
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  13210376 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 856348 - 856140
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || || |||||  ||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  856348 gttaactgcaatctgtgaagctta-tatgagatgtttgtgtcgaatatgatgtattataatgtttatgtattacttgaagattaattgtatacataagat 856250  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattat-gtca-tgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||| ||||||||| ||| |||||||||  | | || |||||||  |||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||||    
T  856249 gttgttgaattgaa-ttggtataattatcatgattgttgttgtaatctgcctatgttgct-attgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatg 856152  T
Q  218 ttgaagatgatg 229  Q
     | |||||||||    
T  856151 attaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 40213634 - 40213838
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||| |  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  40213634 taatctgtaaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttg 40213733  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || | |||    
T  40213734 acttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactg-ctgtgttgatg-ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaag 40213831  T
Q  224 atgatga 230  Q
    |||||||    
T  40213832 atgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 49668125 - 49668193
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  49668125 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14234605 - 14234487
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14234605 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaag 14234506  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     || | |||||||||||||    
T  14234505 ttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15471043 - 15470927
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  15471043 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 15470944  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
       |||||||||||||||||    
T  15470943 ---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9512992 - 9512924
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  9512992 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 9520967 - 9520899
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  9520967 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 12174308 - 12174376
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  12174308 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 24340746 - 24340844
Alignment:
Q  137 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  24340746 gatattattatatcatgatgttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 14179640 - 14179570
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 97  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14179640 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 14179570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 14572688 - 14572616
Alignment:
Q  135 ttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14572688 ttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 14572616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 43550529 - 43550644
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt---atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |   ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43550529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtca-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 43550627  T
Q  217 gttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| ||||||||||    
T  43550628 gttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27165319 - 27165250
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  27165319 atactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32307749 - 32307704
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32307749 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 32307704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36166712 - 36166598
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  36166712 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 36166615  T
Q  214 gatgttgaagatgatga 230  Q
    | || | ||||||||||    
T  36166614 gttgattaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Original strand, 52523778 - 52523834
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  52523778 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 52523834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 9707658 - 9707769
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  9707658 gttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 9707755  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  9707756 gattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 29172634 - 29172745
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  29172634 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29172731  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  29172732 gattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  168 ctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500942
Alignment:
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 55500958  T
Q  215 atgttgaagatgatga 230  Q
     || | ||||||||||    
T  55500957 ttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16097396 - 16097332
Alignment:
Q  165 tgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  16097396 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16103852 - 16103784
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  16103852 atactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 6469185 - 6469296
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  6469185 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6469282  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  6469283 gattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 7781398 - 7781509
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  7781398 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 7781495  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  7781496 gattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17463289 - 17463178
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  17463289 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17463192  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  17463191 gattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 22110402 - 22110457
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22110402 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 22110457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 28848662 - 28848773
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  28848662 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28848759  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  28848760 gattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 34159437 - 34159326
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  34159437 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34159340  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  34159339 gattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43926029 - 43925974
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43926029 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 43925974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 45606958 - 45607069
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  45606958 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 45607055  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  45607056 gattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 55476602 - 55476491
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  55476602 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 55476505  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  55476504 gattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Original strand, 37251216 - 37251283
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||  |||||||||  ||||||||||    
T  37251216 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg--gaagatgatg 37251283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23274759 - 23274706
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23274759 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaag 23274706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 230
Target Start/End: Original strand, 53301600 - 53301669
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  53301600 atactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12511110 - 12511059
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgat 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||    
T  12511110 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgat 12511059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606420
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 606420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12496307 - 12496269
Alignment:
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12496307 tttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 12496269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977515
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16796755 - 16796685
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttga 97  Q
    |||| ||||||| ||  |||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16796755 taatatgtgaagttgtttaagatgtgttgtttttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 16796685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737236
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 53070704 - 53070802
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  53070704 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 53070801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 3390004 - 3390041
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3390004 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 3390041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 3403024 - 3403061
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3403024 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 3403061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 11298595 - 11298632
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11298595 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 11298632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 19725978 - 19726015
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19725978 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 19726015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 11595208 - 11595244
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11595208 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 11595244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12377994 - 12377938
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  12377994 tatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaagat 12377938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14665450 - 14665398
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14665450 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14668606 - 14668554
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatg 232  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||||||||||    
T  14668606 ttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Original strand, 16282923 - 16282971
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||    
T  16282923 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5066 - 4849
Alignment:
Q  19 ggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 117  Q
    ||||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||  | | |||| |||| ||||    
T  5066 ggttagctataatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaag 4967  T
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  4966 atgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaag 4868  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     ||||||||||||||||||    
T  4867 ttgttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 951 - 1169
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataa 116  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||    
T  951 gaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 1050  T
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1051 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1149  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  1150 gttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 17 - 233
Target Start/End: Original strand, 167881 - 168099
Alignment:
Q  17 gaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataa 116  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||  |||    
T  167881 gaggttaattataatctttgaagctgtttaagatgtgttttggttgattatgatgtgatataatgtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaa 167980  T
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgc---tgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||   | ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  167981 gatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 168079  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  168080 gttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 52121 - 51913
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  52121 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtagattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 52022  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  52021 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 51923  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  51922 atgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 174980 - 174767
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta--tgcattacttgaagaatgtttgtatacataag 117  Q
    |||||||| ||||||||||||| | || || |||||  |||||| ||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||  || ||   | ||    
T  174980 gttaactgaaatctgtgaagct-attatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattacttgaattatgaatgaatgattgag 174882  T
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  174881 atgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 174782  T
Q  218 ttgaagatgatgatg 232  Q
    |||||| ||||||||    
T  174781 ttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 124793 - 124679
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| | |||||||    
T  124793 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatg 124694  T
Q  127 aattgaatttgatat 141  Q
    ||||| | |||||||    
T  124693 aattgcaattgatat 124679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  163 actgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2160 - 1952
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  2160 taatatgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgagatataatgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 2061  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2060 aattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaag 1962  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  1961 atgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3678 - 3470
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  3678 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 3579  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||||    
T  3578 aattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaag 3480  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  3479 atgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 343
Alignment:
Q  35 tgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaa 133  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  | | |||  |||||||||| ||| ||  |    
T  543 tgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttcca 444  T
Q  134 tttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgat 231  Q
     ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||  | | |||||||||||    
T  443 attgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgat 345  T
Q  232 gt 233  Q
    ||    
T  344 gt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1851
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  2059 taatctgtgaagctatttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatg 1960  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  1959 aattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 1861  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||||||||    
T  1860 atgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Original strand, 6039 - 6245
Alignment:
Q  33 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||    
T  6039 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattg 6138  T
Q  132 aatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgt--ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatg 226  Q
     | ||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||    
T  6139 caattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 6238  T
Q  227 atgatgt 233  Q
    |||||||    
T  6239 atgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Original strand, 3068 - 3271
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  3068 ctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 3167  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgat 228  Q
    | ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  3168 gcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3266  T
Q  229 gatgt 233  Q
    |||||    
T  3267 gatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 24214 - 24397
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttga-ttatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgat 125  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||    
T  24214 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgaattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgat 24313  T
Q  126 gaattgaatttgatataattatgtcatgctg----ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||| | |||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24314 gaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtc 24397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 232
Target Start/End: Original strand, 3103 - 3306
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||||||    
T  3103 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaatt 3202  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||    
T  3203 acatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatga 3301  T
Q  228 tgatg 232  Q
    |||||    
T  3302 tgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39703 - 39479
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 107  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||    
T  39703 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 39604  T
Q  108 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39603 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 39505  T
Q  206 cattctaagatgttgaagatgatgat 231  Q
    |  |||||| || |||||| ||||||    
T  39504 cggtctaagttgatgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 75109 - 75333
Alignment:
Q  9 ttaatagtgaggttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttg 107  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||  |||  ||    
T  75109 ttaataatgatgttaattataatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatg 75208  T
Q  108 tatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 205  Q
    ||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  75209 tatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 75307  T
Q  206 cattctaagatgttgaagatgatgat 231  Q
    |  |||||| || |||||| ||||||    
T  75308 cggtctaagttgatgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33149 - 32942
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  33149 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtta 33050  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||  || ||||||    
T  33049 acttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaaga 32951  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  32950 tgatgatgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38968 - 38761
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| |     
T  38968 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttt 38869  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||| || ||||||    
T  38868 atttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgct-attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaaga 38770  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  38769 tgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9744
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgtcc 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||| ||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27036 - 26911
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || |||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27036 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagat 26938  T
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattat 147  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26937 gttgatgaattgaa-ttgatataattat 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 17128 - 17337
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||| ||||||  |||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||    
T  17128 taatctgtaaagctgtttaagacgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 17227  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt-----gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttga 221  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||||     ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  17228 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 17326  T
Q  222 agatgatgatg 232  Q
    |||||||||||    
T  17327 agatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79433
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 79433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 226
Target Start/End: Original strand, 25978 - 26179
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttat-gcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||  ||||||| | ||| |||| ||    
T  25978 taatctatgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttg 26077  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||    
T  26078 aattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 26176  T
Q  224 atg 226  Q
    |||    
T  26177 atg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 44709 - 44825
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattcta 212  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44709 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtcta 44807  T
Q  213 agatgttgaagatgatga 230  Q
    || || | ||||||||||    
T  44808 agttgattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 8446 - 8650
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  8446 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 8545  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| | ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  8546 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8641  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  8642 tgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21115 - 20910
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  21115 ctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgctgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaatt 21016  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatga 227  Q
    | | ||||||| ||||||||||| ||   ||| ||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||  |||||||  ||||||  ||||||||||     
T  21015 gcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgt 20916  T
Q  228 tgatgt 233  Q
    ||||||    
T  20915 tgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Original strand, 339863 - 340065
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||  |||||||||||  |||  ||||||| | |||||||| ||    
T  339863 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttg 339962  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||    
T  339963 acttg-atttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttg--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaaga 340059  T
Q  225 tgatga 230  Q
    ||||||    
T  340060 tgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 158501 - 158612
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  158501 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 158598  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  158599 gattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 71419 - 71353
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  71419 aagatgttgttgaattgaaattgataatattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgctgtt 71353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23090 - 22886
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||    
T  23090 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttg 22991  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||    
T  22990 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-gtgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 22893  T
Q  224 atgatga 230  Q
    |||||||    
T  22892 atgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 16516 - 16721
Alignment:
Q  31 tctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaat 129  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||| | ||||| || ||| |    
T  16516 tctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattttgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgact 16615  T
Q  130 tgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatg 226  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||||||||    
T  16616 tccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatg 16714  T
Q  227 atgatgt 233  Q
    |||||||    
T  16715 atgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 32901 - 33077
Alignment:
Q  58 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 156  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  32901 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 32999  T
Q  157 tt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||  ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  33000 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46104 - 45928
Alignment:
Q  58 tgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg 156  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  | | |||  |||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  46104 tgttgatcatgatgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataat-gaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg 46006  T
Q  157 tt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||  ||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  46005 ttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16298 - 16113
Alignment:
Q  51 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 149  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||  ||||||| | ||||| || ||  ||| ||||||||| || || |    
T  16298 atgttgatgttgatcatgacgtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatat 16199  T
Q  150 catgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    | |||||||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  16198 cttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17450
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 12971 - 12857
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  12971 gttaactgcaatttgtgaagct-aatatgagatgttggagttgattatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 12873  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  12872 gttgatgaattgaatt 12857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11312
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtc 11312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6671
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttt-atgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| ||    
T  6818 taatctgtaaagctgtatatgatatgttgttgttgattatgatgtgatataacgttttatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttg 6719  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctat 171  Q
    |||||   ||||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||    
T  6718 aattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctat 6671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26103 - 25896
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||| |     
T  26103 taatctgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 26004  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||  |||||| || ||||||    
T  26003 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaaga 25905  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    | |||||||    
T  25904 taatgatgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40065 - 39858
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgttta-tgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||| ||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  | |||||||| |     
T  40065 taatttgtgaagctgtttaagatgcgttgatgttgattatgatgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgttt 39966  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||   |||||| || ||||||    
T  39965 acttgcatttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaaga 39867  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  39866 tgatgatgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 2089 - 1975
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || || |||||   ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  2089 gttaactgcaatctgtgaagctga-tatgagatgtttgcgttggatatgatgtattataatgtttatgcattacttgaagaataattgtatacataagat 1991  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  1990 gttgatgaattgaatt 1975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4715 - 4508
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  4715 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 4616  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||     
T  4615 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 4518  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||    
T  4517 atgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12297 - 12090
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  12297 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 12198  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||     
T  12197 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 12100  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||    
T  12099 atgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22249 - 22042
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||    
T  22249 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttg 22150  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaag 223  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| | | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||     
T  22149 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctg-ttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaa 22052  T
Q  224 atgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||    
T  22051 atgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 21712 - 21826
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  21712 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 21810  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  21811 gttgatgaattgaatt 21826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 20 - 135
Target Start/End: Original strand, 29604 - 29718
Alignment:
Q  20 gttaactgtaatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagat 119  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || || |||||  ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29604 gttaactgcaatctgtgaagctgt-tatgagatgtttgtgttgattaagatgtattataatgtttatgcattacttgaagattaattgtatacataagat 29702  T
Q  120 gttgatgaattgaatt 135  Q
    ||||||||||||||||    
T  29703 gttgatgaattgaatt 29718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28545 - 28414
Alignment:
Q  104 tttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgca 200  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28545 tttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgca 28447  T
Q  201 tgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||  |||||| || |||||||||||||||    
T  28446 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11364 - 11292
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  11364 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2069 - 1997
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  2069 atactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  177 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 1118 - 1190
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1118 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Original strand, 4295 - 4331
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  4295 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 4331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 119947 - 119875
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  119947 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 100493 - 100378
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  100493 agatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 100394  T
Q  214 gatgttgaagatgatg 229  Q
    | || ||| |||||||    
T  100393 gttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 40224 - 40291
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  40224 tactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44570 - 44454
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt----gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  44570 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 44473  T
Q  212 aagatgttgaagatgatga 230  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  44472 aagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 94522 - 94411
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  94522 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 94425  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  94424 gattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 101571 - 101503
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| || ||| |||||||    
T  101571 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 229
Target Start/End: Original strand, 38547 - 38596
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  38547 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 38596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34200 - 34123
Alignment:
Q  156 gttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  34200 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13300 - 13141
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  ||| |||  ||||||| || ||    
T  13300 taatctgtgaaactgtttaagatgtgttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttg 13201  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctattttgctgtttgt 183  Q
    | ||| | ||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||    
T  13200 acttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtttgt 13141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| || ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40120 - 39913
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatg 126  Q
    ||||||||||||||   || ||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||| ||  |   |||  |||||||||  ||    
T  40120 taatctgtgaagctctttatgatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattg 40021  T
Q  127 aattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
    |  || ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||    
T  40020 acatgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaaga 39922  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  39921 tgatgatgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 19885 - 19990
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctgttgtata--ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattct 211  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||  |||| |||||  ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||    
T  19885 agatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtct 19984  T
Q  212 aagatg 217  Q
    ||||||    
T  19985 aagatg 19990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 1048
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1151 agatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1052  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  1051 gatg 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 11447 - 11564
Alignment:
Q  118 atgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  11447 atgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaag 11545  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     |||||||||||| |||||    
T  11546 ttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8585 - 8493
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8585 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6607 - 6535
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||||||    
T  6607 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 229
Target Start/End: Original strand, 2808 - 2923
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  2808 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 2907  T
Q  214 gatgttgaagatgatg 229  Q
    |||| ||| |||||||    
T  2908 gatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8682 - 8479
Alignment:
Q  29 aatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatga 127  Q
    ||||||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||| ||    ||||||| | |||||||||||||| |   ||| ||   |||||||||| |||    
T  8682 aatctgtgaagctgtttaggatgtgttgatgttgattatgatgt----taatgttatgtgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttga 8587  T
Q  128 attgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaaga 224  Q
     ||| | ||||||| |||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||    
T  8586 cttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 8488  T
Q  225 tgatgatgt 233  Q
    |||||||||    
T  8487 tgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15737 - 15664
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||||||||||    
T  15737 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11536 - 11464
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12687 - 12584
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  |||||    
T  12687 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaa 12588  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  12587 gatg 12584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6683 - 6611
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  6683 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14063 - 13991
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  14063 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 6172 - 6244
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  6172 atactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 45841 - 45909
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  45841 atactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 38305 - 38377
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19336 - 19268
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  19336 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Original strand, 53551 - 53654
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  53551 agatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaa 53650  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  53651 gatg 53654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 15826 - 15898
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  15826 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 28034 - 27911
Alignment:
Q  32 ctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaatt 130  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||    
T  28034 ctgtgaagttgtttaagatttgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgactt 27935  T
Q  131 gaatttgatataattatgtcatgc 154  Q
    | ||||||||| ||||||||||||    
T  27934 gcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 10543 - 10659
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  10543 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaa 10642  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
       |||||||||| ||||||    
T  10643 ---gttgaagatggtgatgt 10659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 158
Target Start/End: Original strand, 3460 - 3574
Alignment:
Q  45 taagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataa 143  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||  |||  ||||||  | |||||||| ||| ||| ||||||||| |    
T  3460 taagatgtgttgatgttgattatgatgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatatta 3559  T
Q  144 ttatgtcatgctgtt 158  Q
    |||||||||||||||    
T  3560 ttatgtcatgctgtt 3574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 23932 - 24001
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||   |||||||||||||||||    
T  23932 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13057 - 12942
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||     
T  13057 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa- 12959  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
      |||||||||||||||||    
T  12958 --gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6884 - 6828
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  6884 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatg 6828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Original strand, 1083 - 1155
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  1083 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13144
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa 13148  T
Q  214 gatg 217  Q
    ||||    
T  13147 gatg 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2762
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  2694 atactgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 160756 - 160688
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  160756 atactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 230
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 18050 - 18148
Alignment:
Q  137 gatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||  ||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||    
T  18050 gatattattatatcatgatgttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Original strand, 14747 - 14814
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  14747 tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1052
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatg-tttatgcattacttga 97  Q
    |||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1122 taatctgtgaagatgtttaagatgtgttgttgttgattatgatgtgatataatgttttatgcattacttga 1052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22788
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  22672 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22771  T
Q  214 gatgttgaagatgatgatgt 233  Q
       ||||||| |||||||||    
T  22772 ---gttgaaggtgatgatgt 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1109
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 1109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 5715 - 5670
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5715 atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtc 5670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 8119 - 8168
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  8119 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtc 8168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Original strand, 38704 - 38820
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| |||| |  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||    
T  38704 agatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaa 38803  T
Q  214 gatgttgaagatgatga 230  Q
    | || | ||||||||||    
T  38804 gttgattaagatgatga 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4709 - 4551
Alignment:
Q  51 atgttgttgttgattatgaagtgttataatgt-ttatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgt 149  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||   || |||  |||||||||| ||||||  ||||||||| || || |    
T  4709 atgttgatgttgatcatgatgtgatataatgtattatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatat 4610  T
Q  150 c---atgctgttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |    |||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4609 cttgctgctgttgcatactgcctatgctgttg-ttgttatttaactaagttgcatgagtc 4551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 62270 - 62225
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  62270 atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtc 62225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 132718 - 132662
Alignment:
Q  173 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  132718 ttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 136791 - 136680
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  136791 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 136694  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  136693 gattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 139260 - 139149
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  139260 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 139163  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  139162 gattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 144198 - 144087
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgt---tgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  144198 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 144101  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  144100 gattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 116544 - 116430
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaa 213  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | | |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  116544 agatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 116447  T
Q  214 gatgttgaagatgatga 230  Q
    | || | ||||||||||    
T  116446 gttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 217
Target Start/End: Original strand, 129021 - 129075
Alignment:
Q  162 tactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagatg 129075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 78391 - 78349
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  78391 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 78349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Original strand, 60761 - 60810
Alignment:
Q  157 ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  60761 ttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 60810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 130024 - 129932
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  130024 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtc 129932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12884 - 12766
Alignment:
Q  117 gatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaag 214  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||    
T  12884 gatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaag 12785  T
Q  215 atgttgaagatgatgatgt 233  Q
     || |||  ||||||||||    
T  12784 ttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13503 - 13392
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  13503 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13406  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  13405 gattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 171
Target Start/End: Original strand, 881 - 1019
Alignment:
Q  33 tgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatgaagtgttataatgtt-tatgcattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattg 131  Q
    ||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||  ||| ||| |||  | |||| ||| ||| |||    
T  881 tgtgaagctgtttaagatgtgttgatgtcgattacgatgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttg 980  T
Q  132 aatttgatataattatgtcatgctgttgtatactgcctat 171  Q
     ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  981 catt-gatattattatgccatgctgttgtatactgcctat 1019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 233
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  166 gcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatgatgt 233  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||| || |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20858 - 20747
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  20858 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 20761  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  20760 gattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 37932 - 37821
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  37932 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 37835  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  37834 gattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 38389 - 38343
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38389 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtc 38343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25179 - 25133
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25179 tatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 25133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Original strand, 15417 - 15483
Alignment:
Q  115 aagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg-ttgtatactgcctattttgctgtt 180  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||    
T  15417 aagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtttgtatgctgcctatgttgatgtt 15483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 619 - 566
Alignment:
Q  164 ctgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  619 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 6332 - 6389
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  6332 tatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaagatg 6389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10646 - 10554
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  10646 agatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtc 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32608 - 32563
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32608 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 32563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 201 - 133
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||| || ||| |||||||    
T  201 atactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  217 gttgaagatgatgat 231  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32154 - 32102
Alignment:
Q  177 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  32154 tgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 217
Target Start/End: Original strand, 20430 - 20527
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt--gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||  | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  20430 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactga-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 20527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 128897 - 128827
Alignment:
Q  88 cattacttgaagaatgtttgtatacataagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt 158  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||  |||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  128897 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 128827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4718
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 4718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16895 - 16784
Alignment:
Q  120 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagat 216  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  16895 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16798  T
Q  217 gttgaagatgatga 230  Q
    | | ||||||||||    
T  16797 gattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 202
Target Start/End: Original strand, 8059 - 8151
Alignment:
Q  114 taagatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatg--ctg--ttgtatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatg 202  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8059 taagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatg 8151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 15277 - 15315
Alignment:
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15277 tttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 15315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 217
Target Start/End: Original strand, 19799 - 19837
Alignment:
Q  179 tttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  19799 tttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 19837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11979
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Original strand, 28818 - 28887
Alignment:
Q  161 atactgcctattttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatgttgaagatgatg 229  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||    
T  28818 atactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3648
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 69  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  3689 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 3648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 28 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7753 - 7712
Alignment:
Q  28 taatctgtgaagctgaataagatatgttgttgttgattatga 69  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  7753 taatctgtgaagctgtttaagatgtgttgttgttgattatga 7712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 206
Target Start/End: Original strand, 27751 - 27843
Alignment:
Q  116 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgttgt--atactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc 206  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| |||||||||| |  ||||| ||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27751 agatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 27843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1879 - 1842
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1879 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9562 - 9525
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9562 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 9525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2748 - 2691
Alignment:
Q  160 tatactgcctattttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  2748 tatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44130 - 44093
Alignment:
Q  180 ttgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44130 ttgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 44093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8608 - 8572
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  8608 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 8572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2216 - 2180
Alignment:
Q  181 tgttatttaactaagctgcatgagtcattctaagatg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  2216 tgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatg 2180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1444 times since January 2019
Visitors: 2192