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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
Legend |
| Query |
| Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0197AE28 (Length: 264)
Name: NF0197AE28
Description: NF0197
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
[»] NF0197AE28 |
 |  |
|
[»] chr6 (29 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr2 (32 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr1 (23 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr4 (43 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr3 (27 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr8 (32 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr5 (30 HSPs) |
 |  |
|
[»] chr7 (33 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0054 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0002 (2 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0352 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0057 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0690 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0240 (1 HSPs) |
 |  |
|
[»] scaffold0595 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
[»] scaffold0011 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 29)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 11559277 - 11559536
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
11559277 |
acataaaatagaacacacacattggtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataattgtaattattatttttattcg |
11559376 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
11559377 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
11559476 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11559477 |
ttcctccacttgtgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
11559536 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 11533767 - 11534026
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
11533767 |
acataaaatagaacacacacattggtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataattgtaattattatttttattcg |
11533866 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
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||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
11533867 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttacttcattcaaatccaatagtttgt |
11533966 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
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||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11533967 |
ttcctccacttgtgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
11534026 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5857015 - 5856756
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
T |
5857015 |
acataaactagaacatacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaataattgataatgataaaaataatagtaattgttatttttattcg |
5856916 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
5856915 |
agaatatcacttcccaaaaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
5856816 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
5856815 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcatatccataagtgttgttgatctgat |
5856756 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 16835228 - 16835484
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16835228 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
16835327 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16835328 |
agaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
16835424 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
16835425 |
tacctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
16835484 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 6406927 - 6407181
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
6406927 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcga |
6407025 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
6407026 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgtt |
6407122 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
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||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6407123 |
tcctccatttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
6407181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 11569757 - 11570017
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
11569757 |
acataaaatagaacacacacattggaagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
11569856 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatag-tttg |
203 |
Q |
|
|
||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
11569857 |
agaatatcactgtccataaatttagcttatggtcgttgtgaaaagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagttttg |
11569956 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
11569957 |
tttcctccacttgggtggatttgtttcttttgatcctatctacaagtattgttgaactgat |
11570017 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 20747363 - 20747622
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
20747363 |
acataaaatagaacttacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataacgataaaaacaatagtaattattatttttattcg |
20747462 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
20747463 |
tgaatatcacttcccataaatttagcatatggttgttgtggtaagaacaaggatttaattgaatttcttatatttccttcattcaaattcaatagtttgt |
20747562 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20747563 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
20747622 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 17963624 - 17963879
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |
|
|
T |
17963624 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattgtta-ttttattcg |
17963722 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
17963723 |
agaatatcacttttcataaatttagcttatggcggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
17963819 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17963820 |
ttcctccactattgtggatttgtttcttttaatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
17963879 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 11612969 - 11613229
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaatt-attatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |
|
|
T |
11612969 |
acataaaataaaacacacacattagtagtgtttaaatttcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtgattaattaattttattc |
11613068 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agttt |
202 |
Q |
|
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||| || |||| ||||| |
|
|
T |
11613069 |
gtgaatatcattttccataaatttagcttatggt-gttgtgataagaataagaattcaattgaatttcttatctttcattcattcaaattcaatgagttt |
11613167 |
T |
 |
Q |
203 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11613168 |
gtttcctccacttttgtggatttatttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
11613229 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 14509982 - 14509748
Alignment:
Q |
30 |
tagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttag |
129 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
14509982 |
tagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttaataataataaaaataatagtaattattttttttatttgagaatatcacttctcataaatttag |
14509883 |
T |
 |
Q |
130 |
cttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgttt |
229 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
14509882 |
tttatggtggttgcgataagaataggaatttaattaaatttcttatatttccatcattcaaatctaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgttt |
14509783 |
T |
 |
Q |
230 |
cttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
14509782 |
ctttttatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
14509748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 12405428 - 12405687
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgag |
106 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
12405428 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgattaaattgaggtacttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcgtg |
12405527 |
T |
 |
Q |
107 |
aatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtt |
205 |
Q |
|
|
||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
T |
12405528 |
aatatcacttcccataaatttagcttatggtgattgtgataagaataagaattcaattgaatttcttatctttccatcattcaaatccaatgagtttgtt |
12405627 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtgga-tttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12405628 |
tcctccatttttgtggattttttttcttttaatcctatctgcaagtgttgttgaactgat |
12405687 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 33686709 - 33686968
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33686709 |
acataaaataaaacttacaaattagtagtgtttaaactgtggtatttagttttaaatacttggtaatgataaaaataatagtaattattatttttattca |
33686808 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
33686809 |
ataatatcactttccataaatttagtttagggtgattgtgataagaataataattaaattgaatttcttatatttcattcattcaaatctaatagtttgt |
33686908 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||| |
|
|
T |
33686909 |
ttcctccacttttgtggatctgtttcttttgatcatatccacaactgttgtcgaactgat |
33686968 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17914622 - 17914361
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17914622 |
acataaaatggaacacacacattaatagtgttttaattacggtatttaattttaaatacctgatgatgataaaaataatagcaattattatttttatttg |
17914523 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
T |
17914522 |
tgaatatcacttcccataaatttaggttatggtggttgtgataagaataagaattcaattcaatttcatatctttccttcattcaaatctaatgagtttg |
17914423 |
T |
 |
Q |
204 |
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264 |
Q |
|
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|
T |
17914422 |
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17914361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 264
Target Start/End: Original strand, 19994453 - 19994717
Alignment:
Q |
8 |
taaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgaga |
107 |
Q |
|
|
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T |
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19994552 |
T |
 |
Q |
108 |
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200 |
Q |
|
|
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T |
19994553 |
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19994652 |
T |
 |
Q |
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264 |
Q |
|
|
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|
|
T |
19994653 |
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19994717 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 25313539 - 25313734
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaa--ataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
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|
|
T |
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25313638 |
T |
 |
Q |
103 |
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198 |
Q |
|
|
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|
|
T |
25313639 |
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25313734 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 26201033 - 26201228
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaa--ataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
26201033 |
acataaaatagaacacatatattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaaaataatagtaattattatttttatt |
26201132 |
T |
 |
Q |
103 |
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198 |
Q |
|
|
|||||||||| || | |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
T |
26201133 |
cgagaatatcacttcctataaatttagcttatgatagttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatattttcttcattctaatccaata |
26201228 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 11428926 - 11428736
Alignment:
Q |
75 |
aaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttctta |
174 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |
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|
T |
11428926 |
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11428827 |
T |
 |
Q |
175 |
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264 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
11428826 |
tatttccttcattcaaaatcaaataatttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
11428736 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 2699181 - 2699378
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
2699181 |
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2699280 |
T |
 |
Q |
105 |
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202 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
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|
T |
2699281 |
agaatatcacttcccataaatttagcttataatagttgtaataagaataagaatttaattgaatttcttatattttcttcattccaatcaaatagttt |
2699378 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Original strand, 4156480 - 4156655
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Q |
84 |
agtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttcctt |
183 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4156480 |
agtaattattatttttattcgagaatatcacttccgataaatttagcttatggtggttgtaataagaataagaatttaattaaatttcttatatttcctt |
4156579 |
T |
 |
Q |
184 |
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259 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
4156580 |
tattcaaatccaatagtttgtttcctccatttttgtggatttgtttattttgagtctatccacaagtgttgttgaa |
4156655 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8748708 - 8748535
Alignment:
Q |
87 |
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186 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
8748708 |
aattattatttt-atttgagaatatcatttttcataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcat |
8748613 |
T |
 |
Q |
187 |
tcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
8748612 |
tcaaattcaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaattgttgttgaactgat |
8748535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17600407 - 17600147
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||| || | |
|
|
T |
17600407 |
acataaaatagaacacaaacattagt---gtttaaattgtggtatttaattttaaataattgataatgataaaaataacagtagtagttattttttttag |
17600311 |
T |
 |
Q |
105 |
--agaatatcattttccataaatttagcttatggtg---gttgcga---taagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa |
196 |
Q |
|
|
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|
T |
17600310 |
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17600211 |
T |
 |
Q |
197 |
t-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
| | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17600210 |
taaatttgtttccttca-----atggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
17600147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 22610541 - 22610356
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattt-ttatt- |
102 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
22610541 |
acataaaataaaacacacacattagtagtgtttaaattttggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataattgtaattattatttattactc |
22610442 |
T |
 |
Q |
103 |
-tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
||| |||||| | |||||| ||||| ||||| ||||||| |||||| | ||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
22610441 |
atgaatatatcactacccataattttagtttatgttggttgcaataagattgagaatctaactgaattttctatctttccttcatt |
22610356 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 22694518 - 22694664
Alignment:
Q |
94 |
atttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataa------gaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
||||||||| | |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
22694518 |
atttttattcgtgaatatcacttaccatatatttagcttatgatggttgtgataagaataagaataagaattcaattgaatttcttatttttccttcatt |
22694617 |
T |
 |
Q |
188 |
cagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttt |
233 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
22694618 |
caaatccaatgagtttgtttcctccacttttgtagatttgtttcttt |
22694664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 5 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 12689999 - 12689911
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattatt |
93 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
T |
12689999 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagcggtatttaattttaaataactgatattgatgaaaataataataattatt |
12689911 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19674803 - 19674620
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
19674803 |
acataaaatagaacacacacatcagtagtgtttaaataatgatatttaattttaaatacctaataatgatgaaaataataaatattattattctttattc |
19674704 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| |||||| || |||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| | ||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
19674703 |
atggatatcacttcccataattttaggttatgtttgttttgataagattgagaatccaactgaatttcctatctttccttcatt |
19674620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 264
Target Start/End: Original strand, 32530273 - 32530449
Alignment:
Q |
87 |
aattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcat |
186 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || || |
|
|
T |
32530273 |
aattgttatttttatttt-gaatatcacttcccataaatttagattacattggttctgctaagaataagaataaaattgaatttcctatatttcatttat |
32530371 |
T |
 |
Q |
187 |
tcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttct-tttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||| ||||| |||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
32530372 |
tcagatacaataaattgttttctcca-ttttgtaggtttatttctctttgatcttatccacaaacattgttgaactgat |
32530449 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 12797864 - 12797929
Alignment:
Q |
17 |
acacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa |
82 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
12797864 |
acacacacactagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacttgacaacgataaaaataa |
12797929 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 73
Target Start/End: Original strand, 22694449 - 22694517
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacat-tagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatga |
73 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
T |
22694449 |
acataaaatagaacacacacatctag-agtgtttaaattgccgtatttaattataaaaacttgataatga |
22694517 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 2699375 - 2699413
Alignment:
Q |
226 |
gtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
2699375 |
gtttcttttaatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
2699413 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 25477355 - 25477614
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
25477355 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
25477454 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
25477455 |
agaatatcactttctataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
25477554 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
25477555 |
ttcctctacttgtgtggatttgtttcttttgatcctatctacaagtgttgttgaactgat |
25477614 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12797959 - 12797700
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
12797959 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
12797860 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
12797859 |
agaatatcacttcctataaatttaccttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
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T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
12797759 |
ttcctccgcttttgtggatttgtttcttttgatcatatccacaagtgttgttgaaatgat |
12797700 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 258
Target Start/End: Original strand, 25496450 - 25496703
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5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
25496450 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
25496549 |
T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
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|
|
T |
25496550 |
agaatatcactttctataaatttaacttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
25496649 |
T |
 |
Q |
205 |
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258 |
Q |
|
|
|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
25496650 |
ttcctcgacttgtgtggatttgtttcttttgatcctatctacaagtgttgttga |
25496703 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
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Target Start/End: Complemental strand, 30651943 - 30651689
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6 |
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105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
30651943 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attcga |
30651845 |
T |
 |
Q |
106 |
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205 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
30651844 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgtt |
30651748 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
30651747 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
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Alignment:
Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
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acataaaatagaagacaca--ttagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaataattgataatgataaaaataatagtaattatt---tttattcg |
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T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
|
||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
12361182 |
agagtatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
12361083 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12361082 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcaacaagtgttgttgaactgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
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Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 9179794 - 9180044
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
9179794 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattta-aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
9179891 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9179892 |
agaatatcactttcgataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
9179988 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
9179989 |
ttcctcca-ttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaact |
9180044 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
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Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 17974416 - 17974672
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Q |
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acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatactt-gataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
17974416 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatactttgataatgataaaaataattgtaattattatttt-attc |
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T |
 |
Q |
104 |
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203 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
17974515 |
gagaatatcactttccataaatttagcttatggtagttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaaaccaatagtttg |
17974611 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17974612 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 17968029 - 17968283
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Q |
5 |
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103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17968029 |
acataaaatagaacacacatattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatactttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attt |
17968127 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
17968128 |
gagaatatcaat--ccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttg |
17968222 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17968223 |
tttcctccacttttgtggatttgttccttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
17968283 |
T |
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Back To:
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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Original strand, 9184485 - 9184735
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Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
9184485 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattta-aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
9184582 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
9184583 |
agaataccactttcgataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
9184679 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
9184680 |
ttcctcca-ttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaact |
9184735 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 40846648 - 40846910
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Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
40846648 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataataataaaaataatagtaatttttatttttatttg |
40846747 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||| |
|
|
T |
40846748 |
tgaatatcacttcctataaatttagtttatgatggttgtgataagaataagaattcaattgaatttcttatctttccttcattcaaatttaatgagtttg |
40846847 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttc--ttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
40846848 |
tttcctccacttttgtggatttgtttctttttttatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
40846910 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Original strand, 1934098 - 1934312
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Q |
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145 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
1934098 |
gtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attagagaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtga |
1934196 |
T |
 |
Q |
146 |
taagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1934197 |
taagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttggttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
1934293 |
T |
 |
Q |
246 |
taagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1934294 |
taagtgttgttgaactgat |
1934312 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 18345446 - 18345187
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Q |
5 |
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95 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
18345446 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttaataatgataaaaaaaaaaaaaataatagtaattattat |
18345347 |
T |
 |
Q |
96 |
ttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatcca |
195 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
18345346 |
ttt-atttgagaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatcca |
18345251 |
T |
 |
Q |
196 |
atagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactga |
263 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
T |
18345250 |
atagtttgtttcctccact----tggatttgtttcttttgatcctattcacaagtgttgttgaactga |
18345187 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29678708 - 29678511
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Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
29678708 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
29678609 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagttt |
202 |
Q |
|
|
| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |
|
|
T |
29678608 |
aaaatatcacttcccataaatttagcttacggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaactctaatagttt |
29678511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Original strand, 19891573 - 19891719
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Q |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
19891573 |
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19891669 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataa |
154 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19891670 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttctgataagaataa |
19891719 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 24537089 - 24537342
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104 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
24537089 |
acataaaatataacacatacattagtagtgtttaaactacggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
24537188 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaat------ttaatttaatttcttatatttccttcattcaga-tccaat |
197 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||| |
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|
T |
24537189 |
tgaatatcatttcccatacatttaacttctagtggttgtgataagaatatgaataagatttcaattgaatttcttatctttccttcattcaaaatccaat |
24537288 |
T |
 |
Q |
198 |
agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
24537289 |
g-------------acttttgtggatttgtttctcttgatcctatctacaagtgtttttgaactgat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 34495183 - 34495398
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115 |
Q |
|
|
|||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| | |
|
|
T |
34495183 |
aacacacatattattagtgtttaaattgcagtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtcattattatt----ttagtggatatcact |
34495278 |
T |
 |
Q |
116 |
ttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccact |
214 |
Q |
|
|
|| || ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||||| |
|
|
T |
34495279 |
tttcaaaaatttaatttatgttggctgtgataagaataagaatttaactgaatttctcatctttccttcattcatattcaataaatttgtttgctccact |
34495378 |
T |
 |
Q |
215 |
tttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| |||| |
|
|
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34495379 |
tttgtagatttgtttatttt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 12001965 - 12002174
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12001965 |
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tatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat- |
197 |
Q |
|
|
|||| | | |||||| || ||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |
|
|
T |
12002065 |
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12002164 |
T |
 |
Q |
198 |
agtttgtttc |
207 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
12002165 |
agtttgtttc |
12002174 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Original strand, 25637831 - 25638058
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt- |
102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
25637831 |
acataaaatagaacacaca--ttagtagtgtttaaactgcggtatttaatttttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattc |
25637928 |
T |
 |
Q |
103 |
tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttct-tatatttccttcattcagatccaa-tagt |
200 |
Q |
|
|
| || |||||| || ||||||||||| ||| | | |||| ||||||||||| |||| || ||| |||| ||| |||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
T |
25637929 |
ttaggatatcacttctcataaatttagttta-gttagttgtgataagaataaaaattcaa-ctaagttctctatctttccttcgttcatatccaacaagt |
25638026 |
T |
 |
Q |
201 |
ttgtttcctccacttttgtggatttgtttctt |
232 |
Q |
|
|
||||||||| ||||| ||| | |||||||||| |
|
|
T |
25638027 |
ttgtttccttcacttatgttgttttgtttctt |
25638058 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 32080407 - 32080146
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
T |
32080407 |
acataaaatagaacacacatattaatagtatttatattatgatatttaatttttaagtacctgataatgataaaaataatagtaattattttttttattc |
32080308 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa-tagttt |
202 |
Q |
|
|
|| ||| || ||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||| | ||||| | || | |||||||| | || |||||||| |||||| | |||| |
|
|
T |
32080307 |
aagcataccactttccataatttttgcttacgttggttgtgataagattgagaatccatttgattttcttatctctcattcattcatatccaatttgttt |
32080208 |
T |
 |
Q |
203 |
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264 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||| ||||||| |||| || |||||| ||| || |||||||||| |
|
|
T |
32080207 |
gtttcttccccttttgtgggtttgtttatttttgtcatatccacaagagtccttgaactgat |
32080146 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Original strand, 15446348 - 15446542
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| || |
|
|
T |
15446348 |
acataaaatagaacacatacattagtagtgtttaaattgtggtatttaatttttaaatacttgataatggtaaaagtagtaataattattattttttatt |
15446447 |
T |
 |
Q |
104 |
ga-gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat |
197 |
Q |
|
|
| | |||||| || ||||| ||||||||||| ||| | ||||||| | ||||| || | | |||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
15446448 |
catggatatcacttcacataattttagcttatgtaggtcgtgataagattgagaatcgaactgagtttcttatcgttccttcattcatatccaat |
15446542 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19896978 - 19896903
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa |
82 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19896978 |
acataaaatagaacacaca--ttagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataa |
19896903 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 261
Target Start/End: Original strand, 19891721 - 19891797
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Q |
185 |
attcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
19891721 |
attcaaatcaaatagtttgtttcctccacttttgtagatttgtttcttttgattttatccacaagtgttgttgaact |
19891797 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 44630514 - 44630605
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| |
|
|
T |
44630514 |
acataaaatagaacacacacattagtattgtttaaatagtggtgtttaattttaaatacctgataatgataataataattattattattatt |
44630605 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Original strand, 42925754 - 42925831
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Q |
19 |
acacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
42925754 |
acacacattagtagtgtttaaatagtgatatttaattttaaatacctgataatgatgaaaataataataattattatt |
42925831 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19896913 - 19896822
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Q |
144 |
gataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |
|
|
T |
19896913 |
gataaaaataaaaattcaattgaatttcttatatttcattcattcaaattcaatgagtttgtttccttcacttttgtggattcgtttttttt |
19896822 |
T |
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Target: chr2; HSP #26
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Target Start/End: Original strand, 20103259 - 20103329
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Q |
89 |
ttattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtgg-ttgcgataagaataagaat |
158 |
Q |
|
|
|||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
20103259 |
ttattatttttagtggtgaatatcactttccataaatttagcttatggtggtttgtgataagaataagaat |
20103329 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 31329089 - 31329017
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Q |
8 |
taaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaat |
80 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
31329089 |
taaaatagaacaaacacgttagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacatgataatgatgaaaat |
31329017 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 31335810 - 31335738
Alignment:
Q |
8 |
taaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaat |
80 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
T |
31335810 |
taaaatagaacaaacacgttagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacatgataatgatgaaaat |
31335738 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 28604116 - 28603933
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-tttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
T |
28604116 |
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28604017 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| |||||| || |||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| | ||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
28604016 |
atggatatcacttcccataattttaggttatgttcgttatgataagattgagaatccaactgaatttcctatctttccttcatt |
28603933 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 7735557 - 7735433
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Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| | |
|
|
T |
7735557 |
ataaaatataacacatatattagtagtgtttatattatgatatttaattttcaagtacccgataataataaaaataatagtaa-tattttttttattcgt |
7735459 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagct |
131 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||| ||||||| |
|
|
T |
7735458 |
gcatatcagtttccataattttagct |
7735433 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 20101716 - 20101768
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaatttt |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
20101716 |
acataaaatagaacatacacattagtagtatttaaattactgtatttaatttt |
20101768 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 83 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38592192 - 38592040
Alignment:
Q |
83 |
tagtaattattattttt-atttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttcc |
181 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||| | || || ||||| | | || ||||||||| |
|
|
T |
38592192 |
tagtaattatcattttttattcaagcatatcgctttccataattttaacttatgttgattgtgataagattgagtatctaattgagtatcctatatttcc |
38592093 |
T |
 |
Q |
182 |
ttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttt |
233 |
Q |
|
|
| |||||| || || | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
38592092 |
tccattcatattcatttagtttgtttcctccatttttacggattagtttcttt |
38592040 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 16648696 - 16648955
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
16648696 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
16648795 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
16648796 |
ataatatcactttccataaatttaacttacggtggttgtgataagaataaaaatttaactaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
16648895 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
16648896 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctattcacaagtgttgttgaactgat |
16648955 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 19798061 - 19798320
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
19798061 |
acataaaatagaactcgcatattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaataattatttttatttg |
19798160 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |
|
|
T |
19798161 |
agaatatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcaaatctaatattttgt |
19798260 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |
|
|
T |
19798261 |
ttcctctacttttgtggatttgtttcttttgatcctattcacatgtgttgttgaactgat |
19798320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10136355 - 10136100
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
10136355 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
10136257 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
10136256 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
10136160 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
10136159 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
10136100 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 51040587 - 51040842
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
51040587 |
acatgaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtgttatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
51040685 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
51040686 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatattttcttcattcaaatccaatagtttgt |
51040782 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
51040783 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcatttgatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
51040842 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25844785 - 25844531
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Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
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Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
25844785 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattatta-ttttattaga |
25844687 |
T |
 |
Q |
106 |
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205 |
Q |
|
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|
|
T |
25844686 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatattttcttcattcaaatccaatagtttggt |
25844590 |
T |
 |
Q |
206 |
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264 |
Q |
|
|
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|
|
T |
25844589 |
tcctccacttttgtggatttgtttcctttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
25844531 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 26926784 - 26927041
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgttt-aaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
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|
|
T |
26926784 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgttttaaattgtggtatttaatttttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-att |
26926882 |
T |
 |
Q |
103 |
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202 |
Q |
|
|
||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
26926883 |
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26926979 |
T |
 |
Q |
203 |
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264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26926980 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
26927041 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 10141098 - 10140868
Alignment:
Q |
30 |
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129 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
10141098 |
tagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcgagaatatcacttcccataaatttag |
10141000 |
T |
 |
Q |
130 |
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229 |
Q |
|
|
||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10140999 |
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10140903 |
T |
 |
Q |
230 |
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264 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
10140902 |
cttttgatcatatccacaagtgttattgaactgat |
10140868 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 11807249 - 11806986
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
11807249 |
acataaaatagaacacacacattagcagtgtttaaattgtggtatttaaatttaaatacttgataatgataaaaacaatattaattattatttttattcc |
11807150 |
T |
 |
Q |
105 |
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197 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||| |||| |||||||| ||||||| |
|
|
T |
11807149 |
ggaatatcatttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataaaaataagaattcaattgaa-ttcttatctttctttcattcaaatccaatg |
11807051 |
T |
 |
Q |
198 |
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261 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |
|
|
T |
11807050 |
agtttgtttcatccacttttgtggatttgtttctttttgatcttatccacaagcgttgtcgaact |
11806986 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 86 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 38621661 - 38621483
Alignment:
Q |
86 |
taattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttca |
185 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||| |
|
|
T |
38621661 |
taattattatttttatttgagaatatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttgattgaagtttttatatttccttcg |
38621562 |
T |
 |
Q |
186 |
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264 |
Q |
|
|
|||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
38621561 |
ttcaaatccaatagtttgtttcctccacttctgtggatttgtttcttttgatcatatctacaagtgttgttgaactgat |
38621483 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 39199833 - 39200082
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgt----ttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
39199833 |
acataaaatagaacacacacattaatagtgtgtgtttaaattgcagtatttacttttaaatacttaataatgataaaaataatag--------------a |
39199918 |
T |
 |
Q |
101 |
tttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagt |
200 |
Q |
|
|
|| |||||||| || |||||||||| ||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
39199919 |
ttcatgaatatcacttcccataaatttggcttatggtagctgtgattagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatcaaatagt |
39200018 |
T |
 |
Q |
201 |
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264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39200019 |
ttgtttcctccacttttgtcgatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
39200082 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 59 - 207
Target Start/End: Original strand, 33300381 - 33300529
Alignment:
Q |
59 |
aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaat |
158 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
33300381 |
aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcgtgaatatcaattctcataaatttagcttatcgtgtttgtgataagaataagaat |
33300480 |
T |
 |
Q |
159 |
ttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttc |
207 |
Q |
|
|
|||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |
|
|
T |
33300481 |
ttaattgaattttttatatttacttcattcaaatctaataatttgtttc |
33300529 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 150 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16834364 - 16834250
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Q |
150 |
aataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataag |
249 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
T |
16834364 |
aataagaatttaattgaatttcttatatttcctttatttaaatccaatagtttgtttcctctacttttgtggatttgtttcctttgatcctatccacaaa |
16834265 |
T |
 |
Q |
250 |
tgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |
|
|
T |
16834264 |
tgttgttgaactgat |
16834250 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 168 - 264
Target Start/End: Original strand, 47450448 - 47450544
Alignment:
Q |
168 |
tttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
47450448 |
tttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgtttcctccactttcgtggatttgtttcttttgattctatccacaagtgttgttgaactgat |
47450544 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12261006 - 12260860
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
12261006 |
acataaaatagaacacactcattagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttttattc |
12260907 |
T |
 |
Q |
105 |
a-gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataaga |
150 |
Q |
|
|
| | |||||| || ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
12260906 |
atggatatcacttctcataattttagcttatgttggttgtgataaga |
12260860 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16036636 - 16036453
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
T |
16036636 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagtggtatttaaatttaaatacctgataatgatgaaaataataattattattattctttattc |
16036537 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||| || | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
16036536 |
atgaatatcactttccataattttaggttatgtttgttgtgataagattgagaatccaactgaatttcttatctttccttcatt |
16036453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8138593 - 8138396
Alignment:
Q |
75 |
aaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataa----------gaatttaatt |
164 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || | |
|
|
T |
8138593 |
aaaaataatagtaattattatttttattcgtgaatatcacttcccataaatttagcttatggtggtcgtaataagaataagaataagaatgaattcaact |
8138494 |
T |
 |
Q |
165 |
taatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||| ||| |||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |
|
|
T |
8138493 |
gaatttcctatctttccttcgtccatatccaatgaatttgtttcctccacttttgtggttttatttcttttgatcttatctacaagtgttgttgaact |
8138396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 38622219 - 38622135
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaat |
89 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
38622219 |
acataaaatagaactcacatattagtagtgtttaaaatgcagtatttgattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaat |
38622135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 121
Target Start/End: Original strand, 47450279 - 47450375
Alignment:
Q |
25 |
attagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccat |
121 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
47450279 |
attagtagtgtttaaactgcgttatttaattttaaatacttgataatgataaaaataataattattattatttttattcgagaatatcactttccat |
47450375 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 23191903 - 23191994
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
23191903 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaagtagtggtatttaattttaaatacctgataatgataaaaataataattattattatt |
23191994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20108238 - 20108129
Alignment:
Q |
155 |
gaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatcc-aat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtg |
251 |
Q |
|
|
||||| |||| |||||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
20108238 |
gaattcaattgaatttcttatctttcctccattcaaattgtaatgagtttgtttcctccacttttggggatttgtttctttttgatcttattcataagtg |
20108139 |
T |
 |
Q |
252 |
ttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||||||| |
|
|
T |
20108138 |
ttgttgaact |
20108129 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40166968 - 40166891
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataata |
84 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40166968 |
ataaaatagaagacacacatcagtagtgtttaaacagtggtatttaattttaaatacctgataatgataaaaataata |
40166891 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Original strand, 39586186 - 39586235
Alignment:
Q |
47 |
tatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
39586186 |
tatttaattttaaatacctgataatgataaaaataataataattattatt |
39586235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 59 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 46697311 - 46697271
Alignment:
Q |
59 |
aatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
99 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
46697311 |
aatacttgaaaatgataaaaataatagtaattattattttt |
46697271 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16422076 - 16421817
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
16422076 |
acataaaatagaacacacgcattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttcaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
16421977 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
T |
16421976 |
agaatatcactttccataaatttaacttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttattatatttccttcattcaaatcaaatagtttgt |
16421877 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
16421876 |
ttcctccacttttgaggatttgtttcttttgatcctattcacaagtgttgttgaattgat |
16421817 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 51698959 - 51698697
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa--tagtaattattattttt-at |
101 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |
|
|
T |
51698959 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatgcttgataatgataaaaaaaaaatagtaattattattttttat |
51698860 |
T |
 |
Q |
102 |
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201 |
Q |
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|
T |
51698859 |
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51698760 |
T |
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Q |
202 |
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264 |
Q |
|
|
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|
|
T |
51698759 |
tgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttaaactgat |
51698697 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 33468068 - 33468320
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
33468068 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtagtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttta---- |
33468163 |
T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
|
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|
|
T |
33468164 |
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33468262 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactg |
262 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
33468263 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcatatccacaagtgttgttgaactg |
33468320 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13060496 - 13060237
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
13060496 |
acataaaaaagaactcacacattggtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataacaataatagtaattcttatttttatttg |
13060397 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
T |
13060396 |
agaatatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataaaaataagaatttaattgaatttcttatatttccttcattcaaatccaatactttgt |
13060297 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
13060296 |
ttcctccacttttgttgatttgtttcttttcatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
13060237 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 37263630 - 37263884
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
37263630 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attcga |
37263728 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
37263729 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttggt |
37263825 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
37263826 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
37263884 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 8 - 264
Target Start/End: Original strand, 32081234 - 32081489
Alignment:
Q |
8 |
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107 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
32081234 |
taaaatagaactcacacattagtagtgtttaaattgtgatatttaattttaaatacttgataattataaaaataatagtaattattatttttattcgaga |
32081333 |
T |
 |
Q |
108 |
atatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttc |
207 |
Q |
|
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|||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |
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|
T |
32081334 |
atatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattgaattttttatattttcttcattca-atccaacagtttgtttc |
32081432 |
T |
 |
Q |
208 |
ctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
32081433 |
ctccacttttgtggatttgtttcagttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
32081489 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 37258930 - 37259184
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |
|
|
T |
37258930 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattatta-ttttattaga |
37259028 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
37259029 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttcctttattcaaatccaatagtttggt |
37259125 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
37259126 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
37259184 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19907268 - 19907016
Alignment:
Q |
15 |
gaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcat |
114 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
T |
19907268 |
gaacacacacattagcagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgatgatgataaaaataatagaaattattatttttattcgtgaatatcac |
19907169 |
T |
 |
Q |
115 |
tttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcct---cc |
211 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
19907168 |
ttcccataaatttagcttatgattgttgcgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcgttcaaatccaatagtttgtttcctccacc |
19907069 |
T |
 |
Q |
212 |
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264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
19907068 |
acttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
19907016 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8694743 - 8694488
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
8694743 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
8694645 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
8694644 |
agaatatcactttccataaatttaggttatggtggttgtgataagaataatattttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
8694548 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
8694547 |
ttcctccacttttgtgaatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttaaactgat |
8694488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 31728431 - 31728686
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
31728431 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttcataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
31728529 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
31728530 |
agaatatcacttttcataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
31728626 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
31728627 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcatatccacaagtgttattgaactgat |
31728686 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31274543 - 31274289
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Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
31274543 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgacagtgataaaaataatagtaattattatttt-attcga |
31274445 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
31274444 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttggt |
31274348 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
31274347 |
tcctccatttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
31274289 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 5270488 - 5270744
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatactt-gataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |
|
|
T |
5270488 |
acataaaatagaacacacacattagtagtatttaaattgtggtatttaattttaaatactttgataatgataaaaataatagtagttattatttt-attc |
5270586 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
5270587 |
tcgaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaaaaataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttg |
5270683 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
5270684 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
5270744 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #13
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Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31766902 - 31766647
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
31766902 |
acataaaatagaacacacacattaatagtgtt-aaattgtggtatttaatttttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attc |
31766805 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
31766804 |
gagaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgttataaaaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttg |
31766708 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
31766707 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
31766647 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Original strand, 33462434 - 33462678
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Q |
19 |
acacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttc |
118 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |
|
|
T |
33462434 |
acacacattagtagtgtttaaattgcagtgtttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt-----agaatatcacttcc |
33462528 |
T |
 |
Q |
119 |
cataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctcc----act |
214 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||| |
|
|
T |
33462529 |
cataaatttagcttacggtggttgtgataagaataataatttaattgaattttttatatttccttcattcaaatccaataatttgtttccttcctttact |
33462628 |
T |
 |
Q |
215 |
tttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
33462629 |
tttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
33462678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 32220630 - 32220887
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
32220630 |
acataaaatagaacatacacattattagtgtttaaattccgatatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
32220729 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| | |
|
|
T |
32220730 |
a--atatcacttttcataaatttaacttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatctaatggtttct |
32220827 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
32220828 |
ttccttcatttttgtggatttgtttcttttgatcctatatacaagtgttgttgaaatgat |
32220887 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 55252674 - 55252482
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |
|
|
T |
55252674 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagcaattattatttttattgg |
55252575 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat |
197 |
Q |
|
|
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
55252574 |
agaatattactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaat |
55252482 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 245
Target Start/End: Original strand, 29349271 - 29349513
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaa-taatagtaattattattttt-att |
102 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |
|
|
T |
29349271 |
acataaaatagaactcacacattagcagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatactggataatgataaaaaataatattaattattattttttatt |
29349370 |
T |
 |
Q |
103 |
tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagttt |
202 |
Q |
|
|
| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |
|
|
T |
29349371 |
cgtgaatatcatttcccataaatttagcttatggttgttatgataagaataaaaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaataattt |
29349470 |
T |
 |
Q |
203 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
29349471 |
gtttcctccacttttgtgaatttgtttcttttgatcttatcca |
29349513 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 252
Target Start/End: Original strand, 13064876 - 13065125
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
13064876 |
acataaaatagaacacacacatcaatagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
13064975 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatt-taatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |
|
|
T |
13064976 |
tgaatatcacttcccat-aatttagcttatggtggttgtgataagaataagaattcaattgaaatttcttatattttcttcattcaaatcaatgagtttg |
13065074 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttc--ttttgatcctatccataagtgt |
252 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
13065075 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttttgatcttatccacaagtgt |
13065125 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 264
Target Start/End: Original strand, 5927363 - 5927538
Alignment:
Q |
85 |
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184 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
T |
5927363 |
gtaattattatttt-attcgagaatatcactttccataaatttagcttatgatgattgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttc |
5927458 |
T |
 |
Q |
185 |
attcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
5927459 |
attcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
5927538 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2820822 - 2820670
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
2820822 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaattatttgataatgataaaaataatagtaattattattttta-ttg |
2820724 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaat |
158 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
2820723 |
tgaatatcacttcccataaatttagcttatgttggttgtgataagattaagaat |
2820670 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23094139 - 23093925
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23094139 |
acataaaataaaacacacacattagtagtgattaaattacgagatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattta |
23094040 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||| ||| |||| || |||| |||||| |
|
|
T |
23094039 |
tagatatcacttctcgtaaatttagcttatataggttgtgataagaataagaattcaattgagttt-ttatctttctttctttcatattcaatgagtttg |
23093941 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgt |
219 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |
|
|
T |
23093940 |
tttcctccacttttgt |
23093925 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Original strand, 12822976 - 12823097
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12822976 |
acataaaatagaactcacacattagtagtgtttaaactgtggtatttaattttaaatactttataatgataaaaataatagtaattattatttttattcc |
12823075 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatt |
126 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||| |
|
|
T |
12823076 |
agaatatcacttcccataaatt |
12823097 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16949026 - 16948803
Alignment:
Q |
10 |
aaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgata-aaaataatagtaattattatttttatttgagaa |
108 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| | | |
|
|
T |
16949026 |
aaatagaacacacatattagtagtgttcaaattcttgtatttagttttgaatacttgataatgataaaaaagaatagtaattattagttttactcattga |
16948927 |
T |
 |
Q |
109 |
tatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa-tagtttgtttc |
207 |
Q |
|
|
|||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||| | ||||| || | | |||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |
|
|
T |
16948926 |
tatcatttcccataattttagcttatgttggttatgataagattgagaatcgaactgagtttcctatatctccttcatccatatccaattagtttgtttc |
16948827 |
T |
 |
Q |
208 |
ctccacttttgtggatttgtttct |
231 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
16948826 |
attcacttttgtggatttgtttct |
16948803 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Original strand, 12823099 - 12823208
Alignment:
Q |
153 |
aagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgt |
252 |
Q |
|
|
|||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
T |
12823099 |
aagaatttgattgaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttt--tggatttgtttcttttgatcatatccacaagtgt |
12823196 |
T |
 |
Q |
253 |
tgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||| |||| |
|
|
T |
12823197 |
tgttgaattgat |
12823208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 234
Target Start/End: Original strand, 39216233 - 39216394
Alignment:
Q |
74 |
taaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttctt |
173 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | |
|
|
T |
39216233 |
taaaaataatagtaattattatttttattcgtgtatatcacttcgcataaatttatcttatgttggttgtgataagaataagaattcaattgagttttct |
39216332 |
T |
 |
Q |
174 |
atatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
|| ||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39216333 |
atctttccttggttcatattcaatgagtttgtttcctacacttttgtggatttgtttctttt |
39216394 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6943814 - 6943549
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaa----------taatagtaattatta |
94 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
T |
6943814 |
acataaaatagaacacatacattagtaatgtttaaattgctgtatttaatttcaaatacttgataatgataaaaaaaaataatagtagtagtaattatta |
6943715 |
T |
 |
Q |
95 |
tttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaa---tttaatttaatttcttatatttccttcattcaga |
191 |
Q |
|
|
|||||||| | |||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||| || || | |||||| ||| || |||||||||| | |
|
|
T |
6943714 |
tttttattggtgaatatcacttcccataaatcta---------tgttgtgataagaataagaatatttcaactgaatttcctatcttcccttcattcata |
6943624 |
T |
 |
Q |
192 |
tccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6943623 |
tccaatgagtttgtttcctcaacttttgtgtattcttttctttttgatcttgtccagaagtgttgttgaactgat |
6943549 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40408975 - 40408782
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa------tagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
40408975 |
ataaaatagaacacacatattattagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatatttgat-atggtaaaaataatagtagtagtaattattattttta |
40408877 |
T |
 |
Q |
101 |
tttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcg------ataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattca |
189 |
Q |
|
|
|| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| |||||||| |
|
|
T |
40408876 |
ttagtgaatatcacttcccatacatttagcttatggtggtagtgatagaaataagaataagaattcaattgaattttttatttttctttcattca |
40408782 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
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Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
19107608 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacctgataatgatgaaaataataataattattattcttatt |
19107511 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Original strand, 5925863 - 5925943
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagta |
87 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
5925863 |
acataaaatagaacac--acattagtagtgtttaaattatggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagta |
5925943 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12875433 - 12875290
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattat-ttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
T |
12875433 |
cataaaatagaacccacacattagtaatatttaaatagtggtatttgattttaaatatttgataatgataaacataatagtaattattattttttactca |
12875334 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataa |
148 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||| ||||| ||||| |||||| ||||| |
|
|
T |
12875333 |
tgaatatcacttcccataattttaggttatgttggttgtgataa |
12875290 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19102996 - 19102905
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
19102996 |
acataaaatagaacacacacattaatagtgtttaaatagtgatatttaattttaaatacctgataatgatgaaaataataataattattatt |
19102905 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27183263 - 27183183
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagta |
87 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
27183263 |
acataaaatagaacacaca--ttagtagtgtttaaattatggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagta |
27183183 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 83
Target Start/End: Original strand, 8028215 - 8028292
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Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataat |
83 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
8028215 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagttgtatttaattttaaataactaataatgataaaaataat |
8028292 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
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Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||| ||||||| ||| |||||| |
|
|
T |
47245158 |
ataaaatagaacacacacattattagtgtttaaatagcgatatttaattttaaataactgatattgatgaaaataattataattataattctttattcat |
47245059 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
||||||||| |||||| ||||| ||||| | |||| |||| || | ||||| || | |||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
47245058 |
agatatcatttcccataattttaggttatgtttgttgtgatatgattgagaatccaactgaatttcctatacttccttcatt |
47244977 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
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Target Start/End: Complemental strand, 19907319 - 19907269
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Q |
5 |
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
19907319 |
acataaaatagaacacacacattagcagtgtttaaattgcggtatttaatt |
19907269 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 7 - 96
Target Start/End: Original strand, 48275906 - 48275993
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
48275906 |
ataaaatataacacacac--tagcagtgtttaaatagtggtatttatttttaaatacttaataatgatgaaaataataataattattatt |
48275993 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 39216186 - 39216234
Alignment:
Q |
52 |
aattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
39216186 |
aatttttaatatttgataatgataaaaataatcgtaattattattttta |
39216234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 187
Target Start/End: Original strand, 8029477 - 8029604
Alignment:
Q |
61 |
tacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatt |
159 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||| | |||||| || |||||| |||| ||||| | ||||| |||||| | |||||| |
|
|
T |
8029477 |
tacttgataatgatgaaaataataataataattattctttattcatggatatcacttcccataatcttaggttatgtttgttgcaataagattgagaatt |
8029576 |
T |
 |
Q |
160 |
taatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
|| | |||||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
8029577 |
caactgaatttcttatgtttccttcatt |
8029604 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 55252483 - 55252441
Alignment:
Q |
222 |
atttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
55252483 |
atttgtttattttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
55252441 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 8 - 96
Target Start/End: Original strand, 29985050 - 29985139
Alignment:
Q |
8 |
taaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
||||||||| || ||| |||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
29985050 |
taaaatagagcaaacaaattagtagtgtttacaatgttgtatttaattttttagtacccgataatgataaaaatgatagtaattattatt |
29985139 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 12878931 - 12878856
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaata |
81 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12878931 |
acataaaatagaacatacacattaatagtgtttaaataatgatattt-attataaatacttgataatgataaaaata |
12878856 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2820644 - 2820585
Alignment:
Q |
200 |
tttgtttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtgttgttga |
258 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||| |
|
|
T |
2820644 |
tttgtttcctccacttttgcgtatttgtttctttttgatcttattcacaagtgttgttga |
2820585 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 168 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16955190 - 16955123
Alignment:
Q |
168 |
tttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
16955190 |
tttctaatctttccttcattcatgtcaaattagtttgtttcatccacttttgtggatttgttactttt |
16955123 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 27)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20520991 - 20520732
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
20520991 |
acataaaatagaatacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaactttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
20520892 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |
|
|
T |
20520891 |
agaatatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttcctttattcaaacccaatagtttgt |
20520792 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
20520791 |
ttcctctgcttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
20520732 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 14437756 - 14438020
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |
|
|
T |
14437756 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataataataattattatttttattcg |
14437855 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaattt-----aatttcttatatttccttcattcagatccaatag |
199 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
14437856 |
agaatatcactttccataaatttagcttacggttgttgtgataagaataagaatttaatttaattgaatttcttatatttccttcattcaaatccaatag |
14437955 |
T |
 |
Q |
200 |
tttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |
|
|
T |
14437956 |
tttgtttcctccgcttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagttttgttgaactgat |
14438020 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 12970874 - 12971135
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaa-ataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12970874 |
acataaaatagaacacacactttagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaaatactggataatgataaaaaataatagtaattattatttttatt |
12970973 |
T |
 |
Q |
103 |
tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagttt |
202 |
Q |
|
|
| |||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
12970974 |
cgtgaatatcacttcccataaatttagcttatgatggttgtgataataataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagttt |
12971073 |
T |
 |
Q |
203 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12971074 |
gtttcgtccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
12971135 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 7570282 - 7570535
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
7570282 |
cataaaatagaacacacatattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcga |
7570380 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
7570381 |
gaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaattatatt----atatttccttcattcaaatccaatagtttgtt |
7570476 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
7570477 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
7570535 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Original strand, 23665189 - 23665442
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgag |
106 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
T |
23665189 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attagag |
23665287 |
T |
 |
Q |
107 |
aatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgttt |
206 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
T |
23665288 |
aatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttggtt |
23665384 |
T |
 |
Q |
207 |
cctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23665385 |
cctccacttttgtggatttgtttcttttgattctatccataagtgttgttgaactgat |
23665442 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18473036 - 18472781
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
18473036 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
18472938 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | ||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
18472937 |
agaatatcactttccataaatttagcttatgatggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccattattcaaattcaatagtttgt |
18472841 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18472840 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
18472781 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 23660555 - 23660810
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
23660555 |
acataaaataaaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attag |
23660653 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
23660654 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttgg |
23660750 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23660751 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgattctatccataagtgttgttgaactgat |
23660810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 55326807 - 55326555
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |
|
|
T |
55326807 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtagttatta-ttttattcg |
55326709 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
55326708 |
agaatatcactttcgataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttcattcattcaaatccaatagtttgt |
55326612 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
55326611 |
ttcctcaacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaact |
55326555 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 18468242 - 18467987
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |
|
|
T |
18468242 |
acataatatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttaatcg |
18468144 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||| | |
|
|
T |
18468143 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaacccaatagttttt |
18468047 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18468046 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcatatccgcaagtgttgttgaactgat |
18467987 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27709959 - 27709706
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
27709959 |
acataaaatagaacatacg--ttagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
27709863 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
27709862 |
agaatatcacttttcataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
27709766 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
27709765 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
27709706 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 55432243 - 55432004
Alignment:
Q |
19 |
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118 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
55432243 |
acacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttaaatatttgataatgataaaaattatattaattattatttttattcgagaatatcatttcc |
55432144 |
T |
 |
Q |
119 |
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218 |
Q |
|
|
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|
|
T |
55432143 |
cataaatttaacttatggtggttgtg------ataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgtttcctccgcttttg |
55432050 |
T |
 |
Q |
219 |
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264 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
55432049 |
tggatttatttcttttgatcatatccacaagtgttgttgaactgat |
55432004 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 46965042 - 46964794
Alignment:
Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |
|
|
T |
46965042 |
acataaaatagaactcacacatta-tagtgtttaaactgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataataataataattatttttattcg |
46964944 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
46964943 |
agaatatcacttcacataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttcattcaaatccagtagtttgt |
46964844 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttg |
254 |
Q |
|
|
|| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
|
|
T |
46964843 |
tttctccactcttgtggatttgtttcttttgatcttatccacgagtgttg |
46964794 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 757430 - 757683
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
757430 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattta-aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttta--tag |
757526 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
757527 |
agaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagcttgt |
757623 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
757624 |
tacctccacttttgtggatttgtttcttttgatactatccacaagtgttgttgaactgat |
757683 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 240
Target Start/End: Original strand, 39774891 - 39775122
Alignment:
Q |
5 |
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104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
39774891 |
acataaaatagaacacacatattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
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T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
T |
39774990 |
agaatatcactttccataaatttagcttatgatggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttcattcattcaaatataatagtttgt |
39775086 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcct |
240 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
39775087 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcct |
39775122 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 12964950 - 12965206
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
12964950 |
acataaaata-aacacaaactttagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-atac |
12965047 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |
|
|
T |
12965048 |
ataaatatcacttcccataaatttagcttatgatggatgtgataagaataagaatttaattcaatttcttatatttccttcattcaaatccagtagttcg |
12965147 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactg |
262 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
12965148 |
tttcctccgcttttgtcgatctatttcttttgatcttatccacaagtgttgttgaactg |
12965206 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 68 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3419960 - 3419764
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Q |
68 |
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167 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
3419960 |
taatgataaaaataatagtaattattatttttattcgagaatatcacttcgcataaatttagcatatggtagttgtgataagaataagaatttaattgaa |
3419861 |
T |
 |
Q |
168 |
tttcttatatttccttcattcaga-tccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |
|
|
T |
3419860 |
tttcttatatttccttcattcaaattcaaatagtttgtttcctccacttttgtgaattt-tttcttttgatcctatccacaactgttgtcgaactgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 264
Target Start/End: Original strand, 32473187 - 32473344
Alignment:
Q |
104 |
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203 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
32473187 |
gagaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttg |
32473283 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
32473284 |
tttcctccacttttgtgaatttgtttcttttgatcctatccacaaatgttgttgaactgat |
32473344 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 264
Target Start/End: Original strand, 12111679 - 12111928
Alignment:
Q |
33 |
tgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataa----attta |
128 |
Q |
|
|
|||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||| ||||| |
|
|
T |
12111679 |
tgtttaaatttcggtatttaattttaaatgcttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcgtgaatatcacttcccataattaaattta |
12111778 |
T |
 |
Q |
129 |
gcttatggtggttgcgataagaata------------agaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccactt |
215 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
12111779 |
gcttatggtgattgtgctaagaatatgaatatgaataagaatttaattgaatttcttatatttacttcgttcaaatccaatgaatttgtttcctccactt |
12111878 |
T |
 |
Q |
216 |
ttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12111879 |
ttgtggatttgtttctttttgatcctatctacaagtgttgttgaactgat |
12111928 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29351257 - 29351074
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
29351257 |
acataaaataaaacacacacattattagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatatctgataatgatgaaaataataataattattattctttattc |
29351158 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| |||||| || ||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | | |||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
29351157 |
atggatatcacttctcataattttagattatgtttgttgtgataagattgaaaattcaactgaatttcctatctttccttcatt |
29351074 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 96
Target Start/End: Original strand, 3656323 - 3656414
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt |
96 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
3656323 |
acataaaatagaacacggacattagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacctgataatgatgaaaataataattattattatt |
3656414 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7860738 - 7860642
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgat-aaaaataatagtaattattattttt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||| | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |
|
|
T |
7860738 |
acataaaatagaacacacacattaatagtgtttaaattatggtatttaatttttaaatatcttataatgataaaaaaaaatagtatttattattttt |
7860642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20175421 - 20175371
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaatttt |
57 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20175421 |
acataaaatagaacacaca--ttagtagtatttaaattgcagtatttaatttt |
20175371 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 3426103 - 3426051
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaatttt |
57 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |
|
|
T |
3426103 |
acataaaatagaactcacacattagtagtgtttaaactgcggtattcaatttt |
3426051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 82
Target Start/End: Original strand, 2206909 - 2206970
Alignment:
Q |
21 |
acacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa |
82 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
2206909 |
acacatcagtagtgtttaaatagcagtatttaattttacatatctgataatgatgaaaataa |
2206970 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20508465 - 20508416
Alignment:
Q |
197 |
tagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
20508465 |
tagtttgtttcctccacttttgtgggtttgtttcattttgatcttatcca |
20508416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
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Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgat---aaaaataatagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
|||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12565199 |
ataaaatataacatatacattagtagtttttaaattatgatattcaatttttaaatacctgataatgataaaaaaaataatagtaattattattttta |
12565296 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 13259598 - 13259695
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgat---aaaaataatagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
|||||||| |||| | ||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
13259598 |
ataaaatataacatatacattagtagtttttaaattatgatattcaatttttaaatacctgataatgataaaaaaaataatagtaattattattttta |
13259695 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 7 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1808479 - 1808222
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Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgag |
106 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
1808479 |
ataaaatagaacacacacattagaagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgaa |
1808380 |
T |
 |
Q |
107 |
aatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgttt |
206 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
1808379 |
aatatcattttctataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaattttttatatttccttcattcaaatctaatagtttgttt |
1808280 |
T |
 |
Q |
207 |
cctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
1808279 |
gctccacttgtgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaattgat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 40124961 - 40125215
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
T |
40124961 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-atttga |
40125059 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
40125060 |
gaatatcactttccataaatttagcttatggttgttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgtt |
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T |
 |
Q |
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tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
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Q |
|
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
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tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Original strand, 38181348 - 38181605
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
38181348 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
38181447 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||| || || ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
38181448 |
agaataccacttcccataaatttaacttagggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttcctttattcaaattcaatagtttgt |
38181547 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactg |
262 |
Q |
|
|
||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |
|
|
T |
38181548 |
ttcctccgcttttatgcatttgtttcttttgatcatatccacaagtgttgtcgaactg |
38181605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 18875451 - 18875709
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
T |
18875451 |
acatacaatagaacacacatattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgatacaaataatagtaattattgtttttattcg |
18875550 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
18875551 |
agaatatcattttccataaatttaacttatgatggttgtgatatgaataagaattaaattaaatttcttatatttccttcattcatatccaatagtttgt |
18875650 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
18875651 |
ttcctccac-aaagtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
18875709 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33417560 - 33417305
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
T |
33417560 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattatta-ttttattcg |
33417462 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
33417461 |
agaatatcactttctataaatttagcttatggcggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
33417365 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
33417364 |
ttcctccactattgtggatttgtttcttttgattctatccacaagtgttgttgaactgat |
33417305 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 1910013 - 1910273
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaa-ataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |
|
|
T |
1910013 |
acatgaaatagagctcacacattagtagtgtttaaacagtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaaataatagtaattgctatttttattc |
1910112 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
1910113 |
gagaatatcacttctcataaatttaatttatggtggttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagttta |
1910212 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
1910213 |
tttcctcaacttttgtggatttgtttcttttgatcatatccacaagtgttgttgaactgat |
1910273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17027130 - 17026916
Alignment:
Q |
46 |
gtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcga |
145 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
17027130 |
gtatttaattttaaatacttgataatcataaaaataatactaattattatttttattcgagaatatcacttttcataaatttagcttaaggtggttgtga |
17027031 |
T |
 |
Q |
146 |
taagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17027030 |
taagaataagaatttaatt---attattatattttcttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgat-ctatcca |
17026935 |
T |
 |
Q |
246 |
taagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |
|
|
T |
17026934 |
caagtgttgttgaactgat |
17026916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 46 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17557622 - 17557408
Alignment:
Q |
46 |
gtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcga |
145 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
T |
17557622 |
gtatttaattttaaatacttgataatcataaaaataatactaattattatttttattcgagaatatcacttttcataaatttagcttaaggtggttgtga |
17557523 |
T |
 |
Q |
146 |
taagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
17557522 |
taagaataagaatttaatt---attattatattttcttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgat-ctatcca |
17557427 |
T |
 |
Q |
246 |
taagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |
|
|
T |
17557426 |
caagtgttgttgaactgat |
17557408 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 7 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 2966613 - 2966373
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgag |
106 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |
|
|
T |
2966613 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttaataatgataaaaattatagtaattattatttttattcgtg |
2966514 |
T |
 |
Q |
107 |
aatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaa-tttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||| || | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| || | || ||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
T |
2966513 |
aatatcacttcctataaatttaccttacagtggttctaataagaataagaattcaactaaatttttttatctttccttcattcatatccaatgagtttgt |
2966414 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcca |
245 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
2966413 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatccgatcca |
2966373 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 44924987 - 44925235
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
44924987 |
acataaaatagaaaacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataacagtaattattatttttattcg |
44925086 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||| |
|
|
T |
44925087 |
agaatatcatttcccataaatttatcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttattatttttcc---------------tagtttgt |
44925171 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttg----tggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
44925172 |
ttcctccacttgtgtgtatggatttgtttctttttatcatatccagaagtgttgttgaactgat |
44925235 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Original strand, 15950638 - 15950838
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatga---taaaaataatagtaattattatttttat |
101 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15950638 |
acataaaatagaacacacacattaatagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgatgataaaaataatagtaattattatttttat |
15950737 |
T |
 |
Q |
102 |
ttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtt |
201 |
Q |
|
|
| |||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
T |
15950738 |
tcgagaatatcacttcccatatatttagcttatagtagttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttgattccaatccaatagtt |
15950837 |
T |
 |
Q |
202 |
t |
202 |
Q |
|
|
| |
|
|
T |
15950838 |
t |
15950838 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 26780134 - 26779957
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
26780134 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaacaatagtaattattatttttattcg |
26780035 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttcct |
182 |
Q |
|
|
||||||| || |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |
|
|
T |
26780034 |
tgaatatctcttctcataaatttaacttatgatggttgtgataagaataagaattcaattgaatttcttatctttcct |
26779957 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 23547700 - 23547931
Alignment:
Q |
35 |
tttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttat |
134 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
T |
23547700 |
tttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattgtttttattcatgaatatca-tttctataaatttagtttat |
23547798 |
T |
 |
Q |
135 |
ggtggttgcg------ataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattc-agatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttg |
226 |
Q |
|
|
|||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
T |
23547799 |
ggtggttgtgataagaataagaataagaattcaatggaatttcttatctttccttcattcaaaattcaatgagtttgtttcctccacttttgtggatctg |
23547898 |
T |
 |
Q |
227 |
tttcttttgatcctatccataagtgttgttgaa |
259 |
Q |
|
|
|| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
T |
23547899 |
ttccttttgatcctatccatatgtgttattgaa |
23547931 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19168712 - 19168560
Alignment:
Q |
88 |
attattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatgg--tggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttca |
185 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |
|
|
T |
19168712 |
attattatttttattctagaatatcacttcccataaatttagcttatggcatggttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttta |
19168613 |
T |
 |
Q |
186 |
ttcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatc |
238 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19168612 |
ttcaaatctaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatc |
19168560 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 28559182 - 28559279
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28559182 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
28559279 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17021250 - 17021127
Alignment:
Q |
140 |
ttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcc |
239 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17021250 |
ttgcggtaagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaaaagtt-gtttcctccatttttatggatttgtttcttttgatcc |
17021152 |
T |
 |
Q |
240 |
tatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17021151 |
tatccacaagtgttgttgaattgat |
17021127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 140 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17551687 - 17551564
Alignment:
Q |
140 |
ttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcc |
239 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17551687 |
ttgcggtaagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaaaagtt-gtttcctccatttttatggatttgtttcttttgatcc |
17551589 |
T |
 |
Q |
240 |
tatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
17551588 |
tatccacaagtgttgttgaattgat |
17551564 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17026833 - 17026694
Alignment:
Q |
120 |
ataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgt |
219 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17026833 |
ataaatttagcttaaggtggttgtgataagaataagaatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgt |
17026737 |
T |
 |
Q |
220 |
ggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17026736 |
ggatttatttcttttgat-ctat-cacaagtgttgttgaactgat |
17026694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17557325 - 17557186
Alignment:
Q |
120 |
ataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgt |
219 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17557325 |
ataaatttagcttaaggtggttgtgataagaataagaatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgt |
17557229 |
T |
 |
Q |
220 |
ggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
17557228 |
ggatttatttcttttgat-ctat-cacaagtgttgttgaactgat |
17557186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 28564361 - 28564458
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
28564361 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattacggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
28564458 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Original strand, 22714109 - 22714294
Alignment:
Q |
50 |
ttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataag |
149 |
Q |
|
|
|||||| | |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||| ||| || |||||| |
|
|
T |
22714109 |
ttaattgtaaatactagataatgatacaagtaatagtaattattatttttattcatggatatcacttcccataaatttagcttatgttggctgtgataag |
22714208 |
T |
 |
Q |
150 |
aataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| | |||||| | ||| |||||||| || |||| |||||||||| || | |||| ||| |||||||||||| |
|
|
T |
22714209 |
aataagaattcaattgagtttcttgtcattctttcattcatattcaatgagtttgtttcatctaattttttgggtttgtttctttt |
22714294 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 262
Target Start/End: Original strand, 24672387 - 24672645
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgag |
106 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| || || | |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | || |||||||||||| | | |
|
|
T |
24672387 |
ataaaatagagcacgcagatcaatagtgtttaaattgtgatatttaattgtaaatacttaataatgatagaaataataattatgattatttttattcgtg |
24672486 |
T |
 |
Q |
107 |
aatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagat-ccaat-agtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||| || | |||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || | | ||| ||| |||| |||||| | || ||||| ||||||| |
|
|
T |
24672487 |
gatatcacttcctataaatgtagtttatgttggttgtcataagaataagaattcaactgagttttctatctttcattcatttatatcccaatgagtttgt |
24672586 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgttt-cttttgatcctatccataagtgttgttgaactg |
262 |
Q |
|
|
||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||||||| |
|
|
T |
24672587 |
ttcctccacttatgtgggtttgtttattttttatcttatccatgagatttgttgaactg |
24672645 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33100356 - 33100199
Alignment:
Q |
78 |
aataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtgg-ttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttata |
176 |
Q |
|
|
|||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||| || | | |||| ||| |
|
|
T |
33100356 |
aataatagtaattattttttttattcatggatatcattttccataaatttaccttacatttgattgtgataagaataagaattcaact-agtttcctatc |
33100258 |
T |
 |
Q |
177 |
tttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt |
234 |
Q |
|
|
||| ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
33100257 |
ttttcttcattcataaccaatgagtttgttttctccatttttgtggttttgtttctttt |
33100199 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 17021286 - 17021247
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgc |
44 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17021286 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgc |
17021247 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 17551723 - 17551684
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgc |
44 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
17551723 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgc |
17551684 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 7002675 - 7002594
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattt--tgaatacttgataatgataaaaataata |
84 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
7002675 |
acataaaatagaatacatacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttctaaatacccgataaagataaaaataata |
7002594 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 187
Target Start/End: Original strand, 17953216 - 17953390
Alignment:
Q |
9 |
aaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaa |
108 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| | | |
|
|
T |
17953216 |
aaaatagaacacacacatcagtagtgttt-aatagtggtattttattttaaatgcctgattatgataaaaataa---taatttttttttttattcatgga |
17953311 |
T |
 |
Q |
109 |
tatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
||||| | ||||||| |||| |||||| | |||||||||| | | ||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
17953312 |
tatcactctccataattttatcttatgtttgttgcgataatattgagaatccaactgaatttcctatctttccttcatt |
17953390 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33100617 - 33100541
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgataaaaataa |
82 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
33100617 |
acataaaatagaatacaca--ttaataatctttaaattgcagtatttaatttttaaatacttgataatgataacaataa |
33100541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 264
Target Start/End: Original strand, 15950835 - 15950873
Alignment:
Q |
226 |
gtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
15950835 |
gtttcttttgatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
15950873 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 31440254 - 31440200
Alignment:
Q |
9 |
aaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatac |
63 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
T |
31440254 |
aaaatagaacacaatcattagtagtgtttaaattgtgatatttaattttaaatac |
31440200 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19167461 - 19167428
Alignment:
Q |
226 |
gtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaa |
259 |
Q |
|
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
19167461 |
gtttcgtttgatcctatccataagtgttgttgaa |
19167428 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26779962 - 26779899
Alignment:
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccata--agtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| |
|
|
T |
26779962 |
tttcctccacttttgtggatctgtttcttttttatcttatccacaatagtgttgttgaactgat |
26779899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 30)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 6154498 - 6154754
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
6154498 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
6154597 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
6154598 |
agaatatcactttacataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
6154694 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6154695 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttaaactgat |
6154754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 20180219 - 20180475
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
20180219 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattacggtatttaattttaaat---tgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
20180315 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |
|
|
T |
20180316 |
agaatatcacttcctataaatttagcttatggtggttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttcgttcaaattcaatagtttgt |
20180415 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
20180416 |
ttcctccacttatgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
20180475 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26668308 - 26668053
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
26668308 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
26668210 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
26668209 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
26668113 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26668112 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
26668053 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26939905 - 26939650
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
26939905 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
26939807 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
26939806 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
26939710 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26939709 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
26939650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Original strand, 37247866 - 37248121
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
37247866 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
37247965 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
37247966 |
gaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaatt---attattatatttcattcattcaaatccaatagtttgtt |
37248062 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
37248063 |
acctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
37248121 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 37537002 - 37537259
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacat--tagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatt |
102 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
37537002 |
acataaaatagaacacacacatattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-att |
37537100 |
T |
 |
Q |
103 |
tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagttt |
202 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
T |
37537101 |
cgagaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagttt |
37537197 |
T |
 |
Q |
203 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
37537198 |
ttttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
37537259 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 37646121 - 37646378
Alignment:
Q |
5 |
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102 |
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37646219 |
T |
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T |
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T |
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Q |
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264 |
Q |
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T |
37646317 |
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37646378 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 7452785 - 7452528
Alignment:
Q |
5 |
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103 |
Q |
|
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T |
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7452687 |
T |
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Q |
104 |
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202 |
Q |
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T |
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7452590 |
T |
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Q |
203 |
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264 |
Q |
|
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||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
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T |
7452589 |
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7452528 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 29167039 - 29167294
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
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T |
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29167137 |
T |
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Q |
105 |
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204 |
Q |
|
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T |
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29167234 |
T |
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Q |
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264 |
Q |
|
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|
|
T |
29167235 |
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29167294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36424668 - 36424413
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
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|
|
T |
36424668 |
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36424570 |
T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
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|
|
T |
36424569 |
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36424473 |
T |
 |
Q |
205 |
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264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
36424472 |
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36424413 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12104084 - 12103878
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
T |
12104084 |
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12103985 |
T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
|
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|
|
T |
12103984 |
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12103885 |
T |
 |
Q |
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211 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
12103884 |
ttcctcc |
12103878 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Original strand, 6511740 - 6511957
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146 |
Q |
|
|
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|
|
T |
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T |
 |
Q |
147 |
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246 |
Q |
|
|
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|
|
T |
6511840 |
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6511939 |
T |
 |
Q |
247 |
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264 |
Q |
|
|
|||||||||| ||||||| |
|
|
T |
6511940 |
aagtgttgttaaactgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39519394 - 39519170
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Q |
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135 |
Q |
|
|
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|
|
T |
39519394 |
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39519296 |
T |
 |
Q |
136 |
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235 |
Q |
|
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|
|
T |
39519295 |
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39519199 |
T |
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Q |
236 |
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264 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39519198 |
atcctatccacaagtgttgttgaactgat |
39519170 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 36 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 39524033 - 39523809
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Q |
36 |
ttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatg |
135 |
Q |
|
|
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|
|
T |
39524033 |
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39523935 |
T |
 |
Q |
136 |
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235 |
Q |
|
|
|| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
T |
39523934 |
gtagttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttggttcctccacttttgtggatttgtttattttg |
39523838 |
T |
 |
Q |
236 |
atcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
39523837 |
atcctatccacaagtgttgttgaactgat |
39523809 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36430548 - 36430294
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |
|
|
T |
36430548 |
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36430450 |
T |
 |
Q |
105 |
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204 |
Q |
|
|
||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
36430449 |
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36430354 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
36430353 |
ttcctccacttttgtggatttgtttctttacatcctacccacaagtgttgttgaactgat |
36430294 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Original strand, 10759427 - 10759531
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
10759427 |
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10759526 |
T |
 |
Q |
105 |
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109 |
Q |
|
|
||||| |
|
|
T |
10759527 |
agaat |
10759531 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 16115295 - 16115553
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||| | |
|
|
T |
16115295 |
acataaaatgaaacacacacattagtaatgtttaaattacggtgtttaattttaaatacttgctaatgat-gaaataaaagtcattgttatttatattcg |
16115393 |
T |
 |
Q |
105 |
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203 |
Q |
|
|
| |||||| || |||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||| | | |||| | ||||||||||||| ||||||| |||| | |
|
|
T |
16115394 |
tggatatcacttcccataaatttagcttacgttggttgtgataaaaacaagaatttaactgagtttc--ctctttccttcattcatatccaatgagttcg |
16115491 |
T |
 |
Q |
204 |
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264 |
Q |
|
|
||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||| || ||||||||||||||| |
|
|
T |
16115492 |
ttttctccacttttgtggatttctttcttttttatcatttccacaattgttgttgaactgat |
16115553 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 40148798 - 40148674
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Q |
132 |
tatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtggatttgtttct |
231 |
Q |
|
|
|||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
T |
40148798 |
tatggtcgttgtgataagaataagaatttaattt-----cttatattttcttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttgtgtgaatttgtttct |
40148704 |
T |
 |
Q |
232 |
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261 |
Q |
|
|
|||||| ||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
40148703 |
tttgattctatccacaagggttgttgaact |
40148674 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
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Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt--tttatt |
102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| || |
|
|
T |
23689101 |
acataaaatagaacacacacattcgtagtgttaaaattgtggtatttaattttaaataccttataatggtaaaaataatagtaattataatttgtttttt |
23689002 |
T |
 |
Q |
103 |
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200 |
Q |
|
|
||| | ||||||||| ||| || ||||| |||| |||||||||||||| | ||||| || || ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
T |
23689001 |
tgatggatatcatttcccaaaacattagcctatgttggttgcgataagatttagaatccaacgtagttttctatatttccttcattcatatccaattagt |
23688902 |
T |
 |
Q |
201 |
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207 |
Q |
|
|
||||||| |
|
|
T |
23688901 |
ttgtttc |
23688895 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17162887 - 17162769
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
T |
17162887 |
acataaaatagaacacacacattagtggtgtttaaattgaggtatttaatttttaaatacctgataatgataaaaataatagtaatgattttttttattc |
17162788 |
T |
 |
Q |
104 |
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122 |
Q |
|
|
|| |||||| |||||||| |
|
|
T |
17162787 |
aaggatatcactttccata |
17162769 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 40148873 - 40148797
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaata |
81 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40148873 |
acataaaatagaacaaacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaata |
40148797 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 17159407 - 17159312
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaa-ttttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
99 |
Q |
|
|
||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
17159407 |
acataaaatagaagacacacattagtagtgttttaattgaggtatttaatttttaaatacctgataatgataaaaataatagtaatgattattttt |
17159312 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Original strand, 35678964 - 35679147
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Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |
|
|
T |
35678964 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagtggtattttattttaaatacctgataatgatgcaaataataattattattattttttattc |
35679063 |
T |
 |
Q |
105 |
a-gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| | |||| | || |||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| ||||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
35679064 |
atggatattacttcccataattttaggttatgtttgttgtgataagattaagaatccaactgaatttcatatctttccttcatt |
35679147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 6511669 - 6511726
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaata |
62 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
T |
6511669 |
acataaaatagaactcacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttaaata |
6511726 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Original strand, 40567670 - 40567754
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaatta |
91 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
40567670 |
ataaaataaaacacacacgttagtagtgattaaattgtggtatttaattttaaatatcttataatgataaaaataatagtaatta |
40567754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 22832639 - 22832786
Alignment:
Q |
59 |
aatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaat |
158 |
Q |
|
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||| |||| |
|
|
T |
22832639 |
aatacttgataatgttaaaaataatagtaattattattttttattcatggtatcactttccatagttttagtttatgttgtttgtgataagaatgtgaat |
22832738 |
T |
 |
Q |
159 |
ttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa-tagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| |
|
|
T |
22832739 |
ccaattgaatatcttatctttccttcattcatacccaattagtttgtt |
22832786 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 199 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12103866 - 12103801
Alignment:
Q |
199 |
gtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12103866 |
gtttgtttcctccgcttttgtggacttgtttcttttgatcatatctacaagtgttgttgaactgat |
12103801 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15149692 - 15149601
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttga-atacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
99 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
15149692 |
ataaaatagaacacaca--ttaatagtgtttaaattaagatatttaatttttagatatctgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
15149601 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 4872910 - 4872734
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatt-tttatttga |
105 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |
|
|
T |
4872910 |
ataaaatagaacacacacaatagtagtgtttaaatagtgatatttaattttaaatac-----aatgatgaaaataataataattattattctttattcat |
4872816 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| |||||| | |||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||| || | |||||| |||||||| |||||| |
|
|
T |
4872815 |
ggatatcactccccataactttaggttatgtttgttgtgataagattgagaatccaactgaatttcctatatttcattcatt |
4872734 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 15413861 - 15413940
Alignment:
Q |
108 |
atatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
|||||| || ||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
15413861 |
atatcacttcccataaatttaacttacgttggttgtgataagaataagaattcaagtgaatttcctatctttccttcatt |
15413940 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 42625644 - 42625908
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgc-----agtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
99 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
42625644 |
acataaaatagaactcacacattagtagtgtttaaattgcggtgcagtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattattttt |
42625743 |
T |
 |
Q |
100 |
atttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatag |
199 |
Q |
|
|
||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
42625744 |
attcgagaatatcactttccataaatttaacttatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcatttacatccaatag |
42625843 |
T |
 |
Q |
200 |
tttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
42625844 |
tttatttcctccacttgtgtggatttatttcttttgatcctatccataagtgttgttaaactgat |
42625908 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 26342237 - 26341982
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |
|
|
T |
26342237 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtgatatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttt-attcg |
26342139 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
T |
26342138 |
agaatatcactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
26342042 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
26342041 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
26341982 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12800405 - 12800161
Alignment:
Q |
20 |
cacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttcc |
119 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |
|
|
T |
12800405 |
cacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcgaaaatataactttcc |
12800306 |
T |
 |
Q |
120 |
ataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgt |
219 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
T |
12800305 |
ataaatttaggttatagtggttgtaataagaataagaattttattgaatttcttaaatttccttcattcaaatctaatagtttgtttccttcacttttgt |
12800206 |
T |
 |
Q |
220 |
ggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
12800205 |
ggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
12800161 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 3881001 - 3880739
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacat---tagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttat |
101 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3881001 |
acataaaatagaacacacacatcattagtagtgcttaaattgtgatatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttat |
3880902 |
T |
 |
Q |
102 |
ttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtt |
201 |
Q |
|
|
||| |||||||| || |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |
|
|
T |
3880901 |
ttgtgaatatcacttcccataaatttagcttatgattgttgtgataagaataataatttaattgaatttcttatatttcattcattcaaattcaatagtt |
3880802 |
T |
 |
Q |
202 |
tgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |
|
|
T |
3880801 |
tgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaggtgttgttgaactgat |
3880739 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4931252 - 4930998
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |
|
|
T |
4931252 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-atctga |
4931154 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
4931153 |
gaatatcactttccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttcattcattcaaatccaatagtttgtt |
4931057 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4931056 |
acctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
4930998 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 12257052 - 12256812
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
12257052 |
acataaaatagaacacacgcattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
12256953 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
T |
12256952 |
tgaatatcacttcccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataggaattcaattgaatttcttatttttccttcattcaaatccaatgagtttg |
12256853 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcc |
244 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
12256852 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatcc |
12256812 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 23 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 8269312 - 8269071
Alignment:
Q |
23 |
acattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccata |
122 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |
|
|
T |
8269312 |
acattagaagtgtttaaactgcgatatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcgtgaatatcactttccata |
8269213 |
T |
 |
Q |
123 |
aatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtttcctccacttttgtgga |
222 |
Q |
|
|
|||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
8269212 |
aatttaacttatggtggttgtgataaggataagaatttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgtttcctccacttttgtgga |
8269113 |
T |
 |
Q |
223 |
tttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
8269112 |
atcgtttcttttgatccaattcacaagtgttgttgaactgat |
8269071 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3046604 - 3046346
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| | |
|
|
T |
3046604 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataataattactataatttttattcg |
3046505 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
T |
3046504 |
tgaatatcacttcctataaatttaacttatggtggttgtgataagaataagaattcaattgaatgtcttatctttccttcattcaaatctaatgagtttg |
3046405 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgttt-cttttgatcctatccataagtgttgttgaact |
261 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||| |
|
|
T |
3046404 |
tttcctccacttttgtggatttgtttatttttaatattatccacaagtgttgttgaact |
3046346 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 10392155 - 10392416
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataata-gtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||| |
|
|
T |
10392155 |
acataaaatagaacacacatgttatcagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataataataaaaaaaaaatgtaattattatttttattc |
10392254 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agttt |
202 |
Q |
|
|
|||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
10392255 |
atgaatatcacttcccataaatttaggttatggtgattgtgataagaataagaattcaattgaatttcttatctttccttcattcaaatccaatgagttt |
10392354 |
T |
 |
Q |
203 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
T |
10392355 |
gtttcctccacttttgtggatttgtttcttttaattctatccacaagtgttattgaactgat |
10392416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 12181818 - 12182088
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatag---taattattatttttat |
101 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |
|
|
T |
12181818 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaataatcattttttttat |
12181917 |
T |
 |
Q |
102 |
ttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaat-----ttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa |
196 |
Q |
|
|
| | |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || | |||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
T |
12181918 |
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264 |
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T |
12182018 |
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12182088 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21672235 - 21671969
Alignment:
Q |
5 |
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104 |
Q |
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T |
21672235 |
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21672136 |
T |
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197 |
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T |
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264 |
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21671969 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 261
Target Start/End: Original strand, 10387417 - 10387674
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtag-tgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaa-aataatagtaattattatttttattt- |
103 |
Q |
|
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T |
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T |
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Q |
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202 |
Q |
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T |
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10387615 |
T |
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Q |
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261 |
Q |
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T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 76 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27239114 - 27238926
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175 |
Q |
|
|
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T |
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27239015 |
T |
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Q |
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264 |
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|
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T |
27239014 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2595778 - 2595598
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Q |
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182 |
Q |
|
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T |
2595778 |
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T |
 |
Q |
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264 |
Q |
|
|
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|
T |
2595678 |
tcattcaaatctaatag-ttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 27246614 - 27246873
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Q |
5 |
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104 |
Q |
|
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T |
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T |
 |
Q |
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203 |
Q |
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T |
27246712 |
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27246811 |
T |
 |
Q |
204 |
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264 |
Q |
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|
T |
27246812 |
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T |
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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 6590099 - 6590307
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Q |
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124 |
Q |
|
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T |
6590099 |
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6590198 |
T |
 |
Q |
125 |
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223 |
Q |
|
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|
T |
6590199 |
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6590298 |
T |
 |
Q |
224 |
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232 |
Q |
|
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||||||||| |
|
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T |
6590299 |
ttgtttctt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 9814938 - 9815206
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Q |
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100 |
Q |
|
|
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|
T |
9814938 |
ccaacataaaatagaacacatacattagtagtttttaaattgcggtatttaatttttaaatacttgataataatgaaaataatagtaattattattttta |
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T |
 |
Q |
101 |
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197 |
Q |
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T |
9815038 |
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9815137 |
T |
 |
Q |
198 |
agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttg--atcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
9815138 |
agcttgtttcctacacttatgtgcgtttgtttctttttttatcttagtcacaagtgttgttgaactgat |
9815206 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 264
Target Start/End: Original strand, 10716863 - 10717131
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Q |
2 |
ccaacataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaa-tacttgataatgataaaaataatagtaattattattttta |
100 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
10716863 |
ccaacataaaatagaacacatacattagtagtttttaaattgcggtatttaatttttaaatacttgataataatgaaaataatagtaattattattttta |
10716962 |
T |
 |
Q |
101 |
tttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataa--gaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat- |
197 |
Q |
|
|
|| ||||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| || | |||| ||| ||| ||||||||| ||||||| |
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T |
10716963 |
ttcatcaatatcacttctcataaatttagcttacgttggttgtgataagaataaaagaattcaaccaagtttcctatttttacttcattcatatccaatg |
10717062 |
T |
 |
Q |
198 |
agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttg--atcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| |
|
|
T |
10717063 |
agcttgtttcctacacttatgtgcgtttgtttctttttttatcttagtcacaagtgttgttgaactgat |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Original strand, 23247877 - 23248018
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Q |
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175 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
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T |
23247877 |
aaaataatagtaattattatttttattcgtaaatatcacttcccataaattgagcttatggtgattgtgataagaataaaaatttaattgaattttttat |
23247976 |
T |
 |
Q |
176 |
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217 |
Q |
|
|
||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23247977 |
atttcattcgttcaaattcaatagtttgtttcctccactttt |
23248018 |
T |
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Target: chr7; HSP #20
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acacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttc |
118 |
Q |
|
|
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T |
16373364 |
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T |
 |
Q |
119 |
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135 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |
|
|
T |
16373264 |
cataaatttagcttatg |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #21
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atttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgata |
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Q |
|
|
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|
|
T |
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T |
 |
Q |
148 |
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179 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| |||||||||||||| |
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|
T |
23152277 |
agaataagaatttaattgaatttcttatattt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #22
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Q |
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||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |
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T |
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T |
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99 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |
|
|
T |
13313380 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagtggtatttaattttaaatacttgataatgatgaaaataataacaattatttttttt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||| |
|
|
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
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Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
23247627 |
taaaatagaaaacaaacattagtagtgtttaaattacggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataa |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
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102 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |
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|
T |
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acataaaatagaacacacacattagtagtatttatattatggtattttaatttttaaataccggataatgataaaaataatagtaa--attttctttatt |
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T |
 |
Q |
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tgagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaa-tagtt |
201 |
Q |
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T |
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T |
 |
Q |
202 |
tgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatc |
238 |
Q |
|
|
|||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |
|
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T |
15973555 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
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|
|
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|
T |
4580493 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #28
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|
|
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T |
23319870 |
tagtaattattacttttattcgtggatatcacttgccataaatttggtttatgttggttgtgacaagaataagagttcaactgagtttcctatcttttcc |
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ttcattcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
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Q |
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|
|||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
23319770 |
ttcattcatatccaatgagtttgtttcctc------agtgagtttgtttttttttatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
23319693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 16373246 - 16373166
Alignment:
Q |
186 |
ttcagatccaat-agtttgtttcctccacttttgtggatttgtttctttt-gatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| |
|
|
T |
16373246 |
ttcacatccaatgagtttgtttcctctacttttgtggttttgtttcttttggatcttatccacaagtgttgctaaactgat |
16373166 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 43
Target Start/End: Original strand, 44508364 - 44508400
Alignment:
Q |
7 |
ataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattg |
43 |
Q |
|
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44508364 |
ataaaatagaacacacatattagtagtgtttaaattg |
44508400 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 44508427 - 44508472
Alignment:
Q |
37 |
taaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataa |
82 |
Q |
|
|
||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |
|
|
T |
44508427 |
taaattgtggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataa |
44508472 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Original strand, 23151753 - 23151792
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacat--tagtagtgtttaaattg |
43 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
T |
23151753 |
cataaaatagaacacacacatattagtagtgtttaaattg |
23151792 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 30259292 - 30259240
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaatttt |
57 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
T |
30259292 |
acataaaatagatcacatacattagtagtgtttaaatagtgatatttaatttt |
30259240 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0054 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0054
Description:
Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 30207 - 29950
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
30207 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcggtatttaattttaactacatgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
30108 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
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||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||| |
|
|
T |
30107 |
agaatatcacttcccataaatttagtttatggtggttgtgataagaataagaatttaattgaatttcttatatttccttcgttgaaatccaataatttgt |
30008 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
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|| ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
30007 |
tt-ctctacttttgtggatttgttt-tttttatcctatccacaagtgttgttgaattgat |
29950 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26471 - 26288
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattatt-atttttattt |
103 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| | |||||| || |||||| |
|
|
T |
26471 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaatagaggtatttaattttaaatacctgataataatgaaaataattattattattaatatttattc |
26372 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcatt |
187 |
Q |
|
|
| |||||| ||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||| | ||||| || | ||||| ||| ||||||||||| |
|
|
T |
26371 |
atggatatcactttccataattttaggttatgtttgttgtgataagattgagaatccaactgaattttctatctttccttcatt |
26288 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:
Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 6 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5093 - 4839
Alignment:
Q |
6 |
cataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttga |
105 |
Q |
|
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |
|
|
T |
5093 |
cataaaatagaacactcacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgatagtgataaaaataatagtaattattatttt-attaga |
4995 |
T |
 |
Q |
106 |
gaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgtt |
205 |
Q |
|
|
|||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |
|
|
T |
4994 |
gaatattactttccataaatttagcttatggtggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatattttcttcattcaaatccaatagtttggt |
4898 |
T |
 |
Q |
206 |
tcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4897 |
tcctccacttttgtggatttgtttcctttgatcctatccacaagtgttgttgaactgat |
4839 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Original strand, 443005 - 443263
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
443005 |
acataaaatagaacacacacattagttgggtttaaattgtggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattag |
443104 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
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|
|
T |
443105 |
agaatatcattttcaataaatttaacttatgatggttgtgataaaaataatagtttaattaaatttcttatatttccttcattcaaatccaatagtttgt |
443204 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| ||||| | |||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
443205 |
ttccttcacttgtatggatttg-tacctttgatcttatccataagtgttgttgaactgat |
443263 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0352 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:
Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 8139 - 7885
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaa-taatagtaattattatttttattt |
103 |
Q |
|
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
T |
8139 |
acataagatagaacacacacattagtagtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaaataatagtaattattatttt-attc |
8041 |
T |
 |
Q |
104 |
gagaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |
|
|
T |
8040 |
gagaatatcacttttcataaatttagcttatggcggttgtgataagaataataatttaatta---ttattatatttcattcattcaaatccaatagtttg |
7944 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactg |
262 |
Q |
|
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
T |
7943 |
tttcctccactattgtggatttgtttcttttgatcctatccacaagtgttgttgaactg |
7885 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0057 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:
Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 36152 - 35899
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
36152 |
acataaaatagaactcacgcattagtagtgtttaaactgcggtatttaattttaaatatttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
36053 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaatagtttgt |
204 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |
|
|
T |
36052 |
tgaatatcacttcccataaatttagc-tatggtggttgtgataagaataagaatttaattaaatttcttatatttccttcatttaaatctaatagtttgt |
35954 |
T |
 |
Q |
205 |
ttcctccacttttgtggatttgtttcttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
|||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |
|
|
T |
35953 |
ttcctccatttt----gatttgttt-ttttgatcctatccacaagtgttgttgaaatgat |
35899 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0690 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:
Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 6262 - 6001
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttatttg |
104 |
Q |
|
|
|||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
T |
6262 |
acataagatagaatacacacattagtggtgtttaaattgtggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaataatagtaattattatttttattcg |
6163 |
T |
 |
Q |
105 |
agaatatcattttccataaatttagcttatggtggttgcgataagaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttg |
203 |
Q |
|
|
|||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||| |
|
|
T |
6162 |
tgaatatcacttcccataaatttagcttatggaggttgtgataagaataagaattcacctaaatttcttatctttccttcattcaaatcaaatgagtttg |
6063 |
T |
 |
Q |
204 |
tttcctccacttttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
6062 |
tttcctccacttttgtggatttgtttcttttttaccttatccacaagtgttgttgaactgat |
6001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0240 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:
Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4748
Alignment:
Q |
19 |
acacacattagtagtgtttaaattgcagtatttaattttgaatacttgataatgata-aaaataatagtaattattatttttatttgagaatatcatttt |
117 |
Q |
|
|
||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || |
|
|
T |
4988 |
acacatattagttgtgtttaagttgcggtatttaattttaaatacttgataatgataaaaaataatagtaattattatttttattcgtgaatatcacttc |
4889 |
T |
 |
Q |
118 |
ccataaatttagcttatggtggttgcgata-agaataagaatttaatttaatttcttatatttccttcattcagatccaat-agtttgtttcctccactt |
215 |
Q |
|
|
|||||||||||| |||| || | | ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| ||| |
|
|
T |
4888 |
ccataaatttagtttat--tgaataccatataaaataa----tta---gaatttcttatatttcctgtattcaattccaatgagttcgtttcctcctctt |
4798 |
T |
 |
Q |
216 |
ttgtggatttgtttc-ttttgatcctatccataagtgttgttgaactgat |
264 |
Q |
|
|
||||| ||||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |
|
|
T |
4797 |
ttgtgaatttgtttctttttaatcttatccacaagtgttgttgaactgat |
4748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0595 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0595
Description:
Target: scaffold0595; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 84
Target Start/End: Original strand, 3904 - 3948
Alignment:
Q |
40 |
attgcagtatttaattttgaatacttgataatgataaaaataata |
84 |
Q |
|
|
||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
T |
3904 |
attgcggtatttaatttcaaatacttgataatgataaaaataata |
3948 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0011 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:
Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 41
Target Start/End: Original strand, 64960 - 64996
Alignment:
Q |
5 |
acataaaatagaacacacacattagtagtgtttaaat |
41 |
Q |
|
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
T |
64960 |
acataaaatagaacacacacattagtagtctttaaat |
64996 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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