View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0200_1D_low_17 (Length: 270)

Name: NF0200_1D_low_17
Description: NF0200_1D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0200_1D_low_17
NF0200_1D_low_17
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-260)||(186534-186792)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-260)||(14192793-14193052)
chr5 (1-260)||(25542774-25543033)
chr5 (1-251)||(17871618-17871868)
chr5 (1-260)||(39883162-39883421)
chr5 (1-260)||(37372915-37373174)
chr5 (1-260)||(8428555-8428814)
chr5 (1-260)||(27881063-27881322)
chr5 (1-255)||(3689961-3690215)
chr5 (1-255)||(3876572-3876826)
chr5 (72-260)||(37261294-37261482)
chr5 (113-260)||(24629954-24630101)
chr5 (113-260)||(10025042-10025189)
chr5 (113-260)||(30346637-30346784)
chr5 (217-250)||(6089199-6089232)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (1-260)||(1860656-1860915)
chr4 (1-260)||(49710152-49710410)
chr4 (1-260)||(35855886-35856145)
chr4 (1-260)||(38518075-38518334)
chr4 (1-260)||(49786809-49787068)
chr4 (1-154)||(13337320-13337473)
chr4 (113-260)||(55559131-55559278)
chr4 (1-66)||(618205-618270)
[»] scaffold1139 (1 HSPs)
scaffold1139 (1-256)||(983-1238)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (1-260)||(24269051-24269310)
chr2 (4-260)||(27509353-27509609)
chr2 (1-252)||(24245812-24246063)
chr2 (1-260)||(27192468-27192727)
chr2 (1-260)||(27842282-27842541)
chr2 (2-260)||(17683811-17684069)
chr2 (1-260)||(21395349-21395608)
chr2 (1-260)||(41920154-41920413)
chr2 (1-260)||(28666153-28666412)
chr2 (59-260)||(35609664-35609865)
chr2 (1-260)||(37824987-37825246)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-260)||(5241-5499)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (1-257)||(18988-19244)
[»] chr7 (9 HSPs)
chr7 (1-260)||(5828536-5828795)
chr7 (1-260)||(21070043-21070302)
chr7 (1-251)||(22843792-22844042)
chr7 (1-260)||(7036699-7036958)
chr7 (1-260)||(12781129-12781389)
chr7 (1-260)||(9001126-9001385)
chr7 (1-260)||(12785959-12786218)
chr7 (113-260)||(42232063-42232210)
chr7 (65-110)||(18939139-18939184)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (1-260)||(21113725-21113984)
chr8 (1-260)||(25218546-25218805)
chr8 (1-260)||(30307156-30307415)
chr8 (1-260)||(7821817-7822076)
chr8 (26-260)||(31978533-31978767)
chr8 (1-260)||(25209028-25209272)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (1-260)||(2202160-2202419)
chr6 (1-251)||(30881315-30881565)
chr6 (2-260)||(10187523-10187781)
chr6 (1-260)||(18344104-18344363)
chr6 (1-260)||(15333622-15333881)
chr6 (1-258)||(29640009-29640266)
chr6 (1-258)||(31510180-31510437)
chr6 (105-260)||(12517367-12517522)
[»] chr3 (13 HSPs)
chr3 (1-260)||(10110579-10110838)
chr3 (12-260)||(50410151-50410399)
chr3 (1-260)||(10000386-10000645)
chr3 (1-260)||(13530018-13530277)
chr3 (1-260)||(52918045-52918303)
chr3 (1-260)||(10968763-10969021)
chr3 (1-260)||(32750-33009)
chr3 (9-260)||(10237535-10237785)
chr3 (1-260)||(11368625-11368886)
chr3 (1-258)||(11362239-11362497)
chr3 (65-260)||(46913050-46913245)
chr3 (23-256)||(10038623-10038846)
chr3 (93-260)||(47692948-47693115)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-260)||(2453098-2453357)
chr1 (2-260)||(2329148-2329403)
chr1 (1-260)||(16042004-16042263)
chr1 (1-260)||(18148667-18148926)
chr1 (5-260)||(36207194-36207449)
chr1 (1-257)||(37390133-37390389)
chr1 (1-260)||(6310975-6311235)
chr1 (1-260)||(48775316-48775575)
chr1 (62-260)||(48238519-48238717)
chr1 (113-260)||(52500648-52500795)
chr1 (1-119)||(48233498-48233616)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (1-260)||(31912-32170)
scaffold0073 (26-260)||(19436-19670)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (1-260)||(17857-18109)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (1-260)||(321317-321576)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (1-260)||(553-812)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (34-260)||(16663-16889)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-256)||(182794-183049)
scaffold0003 (1-258)||(165511-165769)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-260)||(48917-49176)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (113-260)||(28727-28874)
[»] scaffold0888 (1 HSPs)
scaffold0888 (142-260)||(24-142)
[»] scaffold1424 (1 HSPs)
scaffold1424 (184-260)||(1627-1703)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (1-58)||(39937-39994)


Alignment Details
Target: scaffold0017 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 186792 - 186534
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186792 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgtacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 186693  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  186692 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 186593  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  186592 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtg-aaattctgatgtcca 186534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 14192793 - 14193052
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14192793 gaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 14192892  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  14192893 ttggtgatccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 14192992  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14192993 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 14193052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 25542774 - 25543033
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25542774 gaaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 25542873  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  25542874 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 25542973  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25542974 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtcca 25543033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 17871618 - 17871868
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17871618 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataacc 17871717  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  17871718 ttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 17871817  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17871818 agagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 17871868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 39883421 - 39883162
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39883421 gaaatgaaggtagatattcctaaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 39883322  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || ||   ||||||| ||||    
T  39883321 ttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaagtga 39883222  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||    
T  39883221 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgacaattatgatgtcca 39883162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37373174 - 37372915
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37373174 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacataacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 37373075  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| || |||| ||||||||||||    
T  37373074 ttggtgaccaactatttttcgaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaaccaatttatgatgtcactgattccaggtga 37372975  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||    
T  37372974 agagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgataattctgatgtcca 37372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 8428555 - 8428814
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8428555 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 8428654  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  8428655 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 8428754  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||    
T  8428755 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaatattctgatgtcca 8428814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27881322 - 27881063
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||| |||||||||  |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27881322 gaaataaaggtagaaactcctgaagatttgctgatatcggacccaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 27881223  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| || || | ||||||| ||||    
T  27881222 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagctgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtga 27881123  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  27881122 agagaaagagtatttaagctctgattctatttgtagatcgggtgaaaattatgatgtcca 27881063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3690215 - 3689961
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3690215 gaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataaca 3690116  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| || ||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||| |||     
T  3690115 ttggtgacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgg 3690016  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3690015 agagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgat 3689961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 3876572 - 3876826
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||     
T  3876572 gaaatgaaggtagaaattcccaaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatggactttgtatatcccgatttgaatgataaca 3876671  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||| ||||| || ||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||| |||     
T  3876672 ttggggacccactcttttttcaagaaaagtgaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtgg 3876771  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgat 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3876772 agagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaattctgat 3876826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 72 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37261482 - 37261294
Alignment:
Q  72 ctttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaac 171  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37261482 ctttgtgtatcccaatttgaatgataaccttaatgacccgttattttttcaagaaaggggaatacttgcgccaacacttgattcagttgagcatattaat 37261383  T
Q  172 gcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    | |||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  37261382 gaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 37261294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 24629954 - 24630101
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24629954 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 24630053  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24630054 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 24630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10025189 - 10025042
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  10025189 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcattgattccaagtgaagagaaagagta 10025090  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10025089 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 10025042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 30346637 - 30346784
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30346637 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgattaagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 30346736  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30346737 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 30346784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6089232 - 6089199
Alignment:
Q  217 agctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaatt 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6089232 agctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaatt 6089199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1860915 - 1860656
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1860915 gaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 1860816  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||  |||||    
T  1860815 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattctgggtga 1860716  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  1860715 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtcca 1860656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 49710410 - 49710152
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49710410 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatcc-ttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 49710312  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  49710311 ttggtgaccagctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 49710212  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49710211 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 49710152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35856145 - 35855886
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35856145 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 35856046  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  35856045 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 35855946  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  35855945 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 35855886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 38518334 - 38518075
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  38518334 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctaaatgataacc 38518235  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  38518234 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 38518135  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  38518134 agagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 38518075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 49786809 - 49787068
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  49786809 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataacc 49786908  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  49786909 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatattaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 49787008  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  49787009 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49787068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13337473 - 13337320
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13337473 gaaatgaaggtagaaattcatgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgtttatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 13337374  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgatt 154  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13337373 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgatt 13337320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 55559131 - 55559278
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  55559131 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 55559230  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  55559231 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 55559278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 618205 - 618270
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcactt 66  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  618205 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcactt 618270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1139 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold1139
Description:

Target: scaffold1139; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1238 - 983
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1238 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 1139  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| || |||| ||||||| ||||    
T  1138 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaagtga 1039  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1038 agagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcaatcgggcgaaaattctgatg 983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 24269051 - 24269310
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24269051 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 24269150  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  24269151 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 24269250  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24269251 agagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 24269310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27509609 - 27509353
Alignment:
Q  4 atgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27509609 atgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatgtcggacacaacaaattcgttgatatcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttg 27509510  T
Q  104 gtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaaga 203  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||    
T  27509509 gtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaaga 27509410  T
Q  204 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27509409 gaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctaatgtcca 27509353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24246063 - 24245812
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24246063 gaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcataacggacacaacaaatccgtggatgtcacttatagaccttgtgtatcccgatttgaatgataacc 24245964  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  24245963 ttggtgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 24245864  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattct 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24245863 agagaaagagtatttaagatctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattct 24245812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27192727 - 27192468
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192727 gaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 27192628  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || | ||||| ||||||    
T  27192627 ttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtga 27192528  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  27192527 agagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtcca 27192468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 27842541 - 27842282
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27842541 gaaatgaaggtagaaattcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 27842442  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || | ||||| ||||||    
T  27842441 ttggtgaccctctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattctaggtga 27842342  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  27842341 agagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaatttttgatgtcca 27842282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Original strand, 17683811 - 17684069
Alignment:
Q  2 aaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacct 101  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17683811 aaatgaaggtagaaattcctgaatattcgctcatattggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacct 17683910  T
Q  102 tggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  17683911 tggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgctccaacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaa 17684010  T
Q  202 gagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  17684011 gagaaagagtatttaagctatgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 17684069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21395608 - 21395349
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21395608 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtatatcccgatctgaatgataacc 21395509  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  21395508 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 21395409  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21395408 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 21395349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 41920154 - 41920413
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41920154 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 41920253  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| || ||| || ||   ||||||||||||    
T  41920254 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattaagcatgttaacgaatttatgatgtcgttgattccaggtga 41920353  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  41920354 agataaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 41920413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 28666153 - 28666412
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28666153 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataacc 28666252  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||| ||||||    
T  28666253 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtga 28666352  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  28666353 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 28666412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 59 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 35609865 - 35609664
Alignment:
Q  59 tgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35609865 tgtcacttatagactttgtgtattccgatttgaatgataacattggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagt 35609766  T
Q  159 tgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtc 258  Q
    |||| || |||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  35609765 tgagtatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattatgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgtc 35609666  T
Q  259 ca 260  Q
    ||    
T  35609665 ca 35609664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 37824987 - 37825246
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  37824987 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctaaatgataacc 37825086  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||| ||||||    
T  37825087 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtga 37825186  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  37825187 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 37825246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 5241 - 5499
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5241 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatctattgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 5340  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||| |||||||    
T  5341 ttggtgacccgctatttt-ccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgatttcaggtga 5439  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5440 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 5499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19244 - 18988
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19244 gaaatgaaggtagaaatttctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatatgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataacc 19145  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  19144 ttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 19045  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  19044 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgagtgaaaattctgatgt 18988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 9)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 5828536 - 5828795
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5828536 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatcttttgatgtcacttatagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 5828635  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  5828636 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttgactcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 5828735  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  5828736 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattatgatgtcca 5828795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 21070043 - 21070302
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21070043 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 21070142  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| |||||| |||||    
T  21070143 ttggtaacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattcctggtga 21070242  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||    
T  21070243 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgttgatcgggtgaaaatttagatgtcca 21070302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22844042 - 22843792
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  22844042 gaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgctcatatctgacacaacaaatctgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataacc 22843943  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  22843942 ttggtgacctgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 22843843  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattc 251  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  22843842 agagaaagagtatttaagttctgtttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 22843792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7036958 - 7036699
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7036958 gaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 7036859  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  7036858 ttggtgaccaactacttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 7036759  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  7036758 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 7036699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12781129 - 12781389
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12781129 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatataagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 12781228  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  12781229 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 12781328  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  12781329 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtcca 12781389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 9001126 - 9001385
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  9001126 gaaatgaaggtagaaattcttgaagatttgttgatatcggacacaacaaatccgttgatgtctcttatagactttgtttatcccgatctgattgataacc 9001225  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||| ||||||    
T  9001226 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcactaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtga 9001325  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9001326 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 9001385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 12785959 - 12786218
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  12785959 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataacc 12786058  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||| ||||||    
T  12786059 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtga 12786158  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  12786159 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 12786218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 42232210 - 42232063
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42232210 tatttttccaagaaaggggaatactctcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 42232111  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42232110 tttaaactctgattttgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 42232063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 18939184 - 18939139
Alignment:
Q  65 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgaccc 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18939184 ttataaactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtaaccc 18939139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 21113725 - 21113984
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21113725 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgcttatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcttgatttgaatgataacc 21113824  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  21113825 ttggtgacccgctatttttccaaaaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 21113924  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21113925 agagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 21113984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 25218546 - 25218805
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25218546 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 25218645  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  25218646 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 25218745  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  25218746 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 25218805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30307415 - 30307156
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  30307415 gaaatgaatgtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaacgataacc 30307316  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  30307315 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 30307216  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  30307215 agagaaagagtatttaagctccgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 30307156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 7822076 - 7821817
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7822076 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtattccgatctgaatgataacc 7821977  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | |||| |||||||    
T  7821976 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgatttcaggtga 7821877  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  7821876 agagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 7821817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Original strand, 31978533 - 31978767
Alignment:
Q  26 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaata 125  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  31978533 atttgctgatatcgggcacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 31978632  T
Q  126 aaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 225  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  || ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31978633 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 31978732  T
Q  226 tctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  31978733 tctgtttgtagatcgggggaaaattcagatgtcca 31978767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 25209028 - 25209272
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||    
T  25209028 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatgtcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacttt---------------aatgataacc 25209112  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  25209113 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 25209212  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25209213 agagaaagagtatttaagctctgattctatttttagatcgggcgaaaattctgatgtcca 25209272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 2202160 - 2202419
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    |||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2202160 gaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatcgaacacaataaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 2202259  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  2202260 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttaattcagtagaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 2202359  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2202360 agagaaagagtatttaagctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 2202419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30881565 - 30881315
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30881565 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagacattgtgtatctcgatttaaatgataacc 30881466  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  30881465 ttggtgacccgctatttttccaagaaagggaaatactcgcaccaacgcttgattctgttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 30881366  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattc 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  30881365 agagaaagagtatttaagctctggttctgtttgtcgatcgggtgaaaattc 30881315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10187781 - 10187523
Alignment:
Q  2 aaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacct 101  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10187781 aaatgaaggtagaaattcctgaatatttgctcatattggacacaaaaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacct 10187682  T
Q  102 tggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaa 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  10187681 tggtgacccgctatttttccaagaaaagggaatactcgctccaacacttgattcaattgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaa 10187582  T
Q  202 gagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10187581 gagaaagagtatttaagctatgattctgtttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 10187523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18344363 - 18344104
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18344363 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttcatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 18344264  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| || || | ||||||||| ||    
T  18344263 ttggtgaccatctatttttccaagaaaggggaatacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttgacgaatatatgatgtcgctgattccaggcga 18344164  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  18344163 agagaaagagtatttaagctttgattctatttgtcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 18344104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 15333881 - 15333622
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15333881 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgttgatatcgtacgtaacaaatccgttgatgtcactaatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 15333782  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  15333781 ttggtgaccagctatttttccaacaaatgggaatactcgcaccaacacttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 15333682  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  15333681 agagaaagagtatttaggctctgattctgtttgtagatcaggtgaaaattctgatgtcca 15333622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 29640009 - 29640266
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  29640009 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctgatctgaatgataacc 29640108  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  29640109 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 29640208  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  29640209 agagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtc 29640266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 31510180 - 31510437
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  31510180 gaaatgaaggtagaaatttcttaagatttgctgatatcaaccacaacaaatctgttgatgtcacttatagactttgtgtatcctaatctgaatgataacc 31510279  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  31510280 ttggtgaccaactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 31510379  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtc 258  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  31510380 agagaaagagtatttaacctctaattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtc 31510437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 12517522 - 12517367
Alignment:
Q  105 tgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagag 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||||||    
T  12517522 tgaccagctatttttccaagaaaggggaatatttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagag 12517423  T
Q  205 aaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||    
T  12517422 aaagagtatttaagctctgattctgtttgatgatggggtgaaaattctgatgtcca 12517367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 13)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10110838 - 10110579
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10110838 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 10110739  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  10110738 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 10110639  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10110638 agagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtcca 10110579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 50410399 - 50410151
Alignment:
Q  12 agaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccg 111  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  50410399 agaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccca 50410300  T
Q  112 ctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagt 211  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  50410299 ctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacaaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagt 50410200  T
Q  212 atttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50410199 atttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 50410151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10000645 - 10000386
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10000645 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcagatgcaacaaatctgttgatatcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataacc 10000546  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  10000545 ttggtgacccgctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 10000446  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10000445 agagaaagagtatttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtcca 10000386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13530277 - 13530018
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530277 gaaatgaaggtagaaattctagaagatttggtcatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 13530178  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||| || |||||||||    
T  13530177 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacacttcattcagttgagcattttaacgaatatatgatgtcactgagtccaggtga 13530078  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| || ||||||    
T  13530077 agagaaagagtatttaagctctggttctgcttgtcgatcaggtgaaaattttggtgtcca 13530018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52918303 - 52918045
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||   || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52918303 gaaatgaaggtagaaattcctga-gatttgccgttaccggacacaacaaatctgttgatgccacttatagacttcgtgtatcccgatttgaatgataacc 52918205  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  52918204 ttggtgactcgctatttttccaagaaaggggaatacccgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 52918105  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52918104 agagaaagagtatttaagctctgattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 52918045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 10968763 - 10969021
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10968763 gaaatgaaggtagaaatttctga-gatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgccacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaac 10968861  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    || |||||| |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  10968862 ttcgtgacctgctatttttctaagcaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtttagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 10968961  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10968962 agagaaagagtatttaagctcttattttgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 10969021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 33009 - 32750
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33009 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatggactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 32910  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||| ||||    
T  32909 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtga 32810  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  32809 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgtcca 32750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 10237785 - 10237535
Alignment:
Q  9 ggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgac 108  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10237785 ggtagaaattcctgaagaattgctcatatcagacgcaacaaatctgttgatgtcacttacagactttgtgtatctcgatttgaatgataaccttggtgac 10237686  T
Q  109 ccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaag 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || | || ||||||||||||||||||||    
T  10237685 ccgctattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgttactgattccaggtgaagagaaag 10237586  T
Q  209 agtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  10237585 agta-ttaagctttgattatgtttgttgatcgggtgaaaattctgatgtcca 10237535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 11368886 - 11368625
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  11368886 gaaatgaatgtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcactcatagactttgtatatcccgatttgaatgataaca 11368787  T
Q  101 ttggtgacccgct-atttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtg 199  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  11368786 ttggtgacccgctcttttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtg 11368687  T
Q  200 aagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcg-aaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||| |||||||||||    
T  11368686 aagagaaagagtatttaagctctgattcaatttgtcgattgggtgaaaaagtctgatgtcca 11368625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11362497 - 11362239
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  11362497 gaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataaca 11362398  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||||||    
T  11362397 ttggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtga 11362298  T
Q  201 agagaaaga-gtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtc 258  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11362297 agagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtc 11362239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 46913245 - 46913050
Alignment:
Q  65 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46913245 ttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggcgacccgctatttttccaagaaaggagaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagca 46913146  T
Q  165 tattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    | |||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  46913145 tgttaacgaatatatgatgtcaccaattccaggtgaagaaaaatagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcggggggaaattctgatgtcca 46913050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10038846 - 10038623
Alignment:
Q  23 aagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttcca 122  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||          |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10038846 aagatttgcttatatcagacacaacaaatctgttgatgtc----------tttgtgtatcccaatttgaatgataaccttagtgacccgctatttttcca 10038757  T
Q  123 ataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctct 222  Q
    | ||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  10038756 agaaaggggaatactcgcgccaacacttgattcaattgagcatattaatgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaatattatttaagctct 10038657  T
Q  223 gattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatg 256  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10038656 cattctgtttgtcgatcgggtgaaaattctgatg 10038623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 47693115 - 47692948
Alignment:
Q  93 tgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgatt 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || || ||||  |||    
T  47693115 tgataaccttggtgacccacaattttcccaagaaaggggaatcctcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatacatgatgtcactaatt 47693016  T
Q  193 ccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47693015 ccaggtgaagagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtcgatcggacgaaaattctgatgtcca 47692948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 2453098 - 2453357
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  2453098 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctcatatcgaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgaattccgatttgaatgataacc 2453197  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| || ||||  |||||||||||    
T  2453198 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgctttattgagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactaattccaggtga 2453297  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2453298 agagaaagagtatttaggctctgattctatttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 2453357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 2329403 - 2329148
Alignment:
Q  2 aaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacct 101  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  2329403 aaatgaaggtagaaattcctgaagattttctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagac---gtgtatcccgatttgaatgataacct 2329307  T
Q  102 tggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaa 201  Q
    |||||| || |||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || |||| |||||||||||||    
T  2329306 tggtgatccactattttttcaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagtcgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaa 2329207  T
Q  202 gagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2329206 gagaaagagtatttaagctctgattctctttgtcgatcgggtgaaaattctgatgtcca 2329148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16042263 - 16042004
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16042263 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcgcttatagactttgtgtatcccaatctgaatgataacc 16042164  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||| || |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||| ||||    
T  16042163 ttggtgcccagctattttgccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaagtga 16042064  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16042063 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 16042004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18148926 - 18148667
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18148926 gaaatgaaggtagaaatttatgaagattttctcatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttatcgactttgtgtatctcaatttgaatgataacc 18148827  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  18148826 ttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcatttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 18148727  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  18148726 agagaaagagtatttaagctcttattctgtttgtcgatcggatgaaaattcttatgtcca 18148667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 36207449 - 36207194
Alignment:
Q  5 tgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 104  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36207449 tgaaggtagaaattcctgatgattttctcatatccgacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttgg 36207350  T
Q  105 tgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagag 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  36207349 tgacccgctattttttcaagaaaggggaatactcgccccaacaattgattcagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagag 36207250  T
Q  205 aaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  36207249 aaagagtatttaagctttgattatgtttgtcgatcgggtgaaaattatgatgtcca 36207194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 37390133 - 37390389
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37390133 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 37390232  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  37390233 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 37390332  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  37390333 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcgggtgaaaattctgatgt 37390389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 6310975 - 6311235
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6310975 gaaatgaaggtagaaattcctgaagattcgctgatatcagacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 6311074  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | ||||||||||||    
T  6311075 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 6311174  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgt-cgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  6311175 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttgagatcgggtgaaaattctgatgtcca 6311235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 48775316 - 48775575
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||     
T  48775316 gaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgacacaacaaattctttgatgtcactaatacactttgtatatcccgattagaatgataaca 48775415  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || | |  ||||||||||||    
T  48775416 ttggtgacctgctctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtaaatgattccaggtga 48775515  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  48775516 agagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcaaaaagtctgatgtcca 48775575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 62 - 260
Target Start/End: Original strand, 48238519 - 48238717
Alignment:
Q  62 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttga 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48238519 cacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggcgaccctctatttttccaagaaagaggaatactcgcaccaacgcttgattcagttga 48238618  T
Q  162 gcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||| |||||| |||||| || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  48238619 gcatgttaacgaatatatgatgtcgctgattccaggcgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggtgaaaactttgatgtcca 48238717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 52500795 - 52500648
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52500795 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaagagta 52500696  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  52500695 tttaaactctgattctgtttgtcgctcgggtgaaaattctgatgtcca 52500648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48233616 - 48233498
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48233616 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttactcatatcgaacacaacaaatccgctgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 48233517  T
Q  101 ttggtgacccgctattttt 119  Q
    |||| ||||| ||||||||    
T  48233516 ttggcgaccctctattttt 48233498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 32170 - 31912
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32170 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatctgaatgataacc 32071  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| || |  | ||||||||||||    
T  32070 ttggtgaccagctatttttccaagaaagggg-atacttgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatgttgctgattccaggtga 31972  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  31971 agagaaagagtatttaaactctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 31912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19670 - 19436
Alignment:
Q  26 atttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaata 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19670 atttgctgatatcggacacaacaaatctgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctgaatgataaccttggtgaccagctatttttccaaga 19571  T
Q  126 aaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 225  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||  || ||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570 aaggggaatactcgcatcaacgcttgattcagttgagcatgtcaacaaatttatgatgtcgctgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgat 19471  T
Q  226 tctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19470 tctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 19436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 17857 - 18109
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857 gaaatgaaggtagaagttcctgaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 17956  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||| |||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  17957 ttggtgatccgct-------caagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgatttagttgagcatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtga 18049  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||    
T  18050 agagaaagagtatttaagctttgattctgtttgccgatcgggtgaaaattatgatgtcca 18109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 176; Significance: 7e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 321317 - 321576
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  321317 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcggacaaaacaaatccgttgatgtcacttatagactttttgtatcccgatctgaatgataacc 321416  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || ||| || || | |||| |||||||    
T  321417 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaatgcttgattcagttgagcatgttaacgaatttatgatatcgctgatttcaggtga 321516  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  321517 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtagatcgggtgaaaattctgatgtcca 321576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 553 - 812
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  553 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcagacacaacaaacccgttgatgtcacttataaactttgtgtatcccgatctaaatgataacc 652  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| || || | ||||||||||||    
T  653 ttggtgaccagctatttttccaataaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatgttaatgaatttatgatgtcgctgattccaggtga 752  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  753 aaagaaagagtatttaacctctgattctgtttgtagattgggtgaaaattctgatgtcca 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16889 - 16663
Alignment:
Q  34 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataaccttggtgacccgctatttttccaataaaggggca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16889 atatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataactttggtgacccgctatttttccaagaaaggggaa 16790  T
Q  134 tactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttg 233  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  16789 tactcgcaccaacgcttaatttagtggagtatgttaacgcatatatgatttcactgattctaggtgaagagaaagagtttttaagctatgattctgtttt 16690  T
Q  234 tcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    || |||| |||||||||||||||||||    
T  16689 tcaatcgagcgaaaattctgatgtcca 16663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 183049 - 182794
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |     
T  183049 gaaatgaaggtagaaattcccgaagatttgctcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttgaatgatatca 182950  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||| ||||    
T  182949 ttggtgacccactctttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaagtga 182850  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  182849 agagaaagagtatttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaaatctgatg 182794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 165769 - 165511
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
T  165769 gaaatgaagggggaaattcccgaagatttactcatatccgatacaacaaattcgttgatgtcactaatagactttgtatatcccgatttaaatgataaca 165670  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| || |||  ||||||||||||    
T  165669 ttggtgacccactatttttccaagaaaagggaatactcgcaccaacgcttgattcggttgagcatgttaacgaatatatgatgtcagtgattccaggtga 165570  T
Q  201 agagaaaga-gtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtc 258  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  165569 agagaaagatttttttaagctctgattcagtttgtcgatcgggcgaaaagtctgatgtc 165511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 260
Target Start/End: Original strand, 48917 - 49176
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactttgtgtatcccgatttgaatgataacc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48917 gaaatgaaggtagaaattcctgaagatttgctgatatcaaacacaacaaatccgttgatgtcacttatagactctgtgtatcccgatctgaatgataacc 49016  T
Q  101 ttggtgacccgctatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtga 200  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||| || || | ||||| ||||||    
T  49017 ttggtgaccaactatttttccaagaaaggggaatactcgcacccacgcttgattcaattgagcatgttaacgaatttatgatgtcgctgattctaggtga 49116  T
Q  201 agagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  49117 agagaaagagtatttaacctctgattctatttttagatcaggtgaaaattctgatgtcca 49176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 260
Target Start/End: Original strand, 28727 - 28874
Alignment:
Q  113 tatttttccaataaaggggcatactcgcaccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagta 212  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  28727 tatttttccaagaaaggggaatactcgcaccaacgcttgattcagttgaacatgttaacgaatatatgatgtcactgattccaggtgaagagaaaaagta 28826  T
Q  213 tttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  28827 tttaaactctgattctgtttgtcgcttgggtgaaaattttgatgtcca 28874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0888 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0888
Description:

Target: scaffold0888; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 260
Target Start/End: Original strand, 24 - 142
Alignment:
Q  142 ccaacgcttgattcagttgagcatattaacgcatatataatttcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgg 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||  || |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24 ccaaggcttgattcagttgagcatgttaacgaatatacgatgtcactgatttcaggtggcgagaaagagtatttaagctctgattttgtatgtcgatcgg 123  T
Q  242 gcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    | |||||||||||| ||||    
T  124 gtgaaaattctgatttcca 142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1424 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1424
Description:

Target: scaffold1424; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1703 - 1627
Alignment:
Q  184 tcaccgattccaggtgaagagaaagagtatttaagctctgattctgtttgtcgatcgggcgaaaattctgatgtcca 260  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1703 tcactgattccaggtgaagagaaagcgtatttaaactctgattatgtttatcgatcgggtgaaaattttgatgtcca 1627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 39994 - 39937
Alignment:
Q  1 gaaatgaaggtagaagttcctaaagatttgctcatatcggacacaacaaatccgttga 58  Q
    ||||| ||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39994 gaaataaaggtagaaattcttgaagatttgctgatatcggacacaacaaatccgttga 39937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1692 times since January 2019
Visitors: 2393