View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0201_low_18 (Length: 251)

Name: NF0201_low_18
Description: NF0201
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0201_low_18
NF0201_low_18
[»] chr8 (103 HSPs)
chr8 (12-251)||(27472131-27472370)
chr8 (12-251)||(16413030-16413269)
chr8 (12-251)||(24485758-24485997)
chr8 (12-249)||(18677779-18678016)
chr8 (12-251)||(1484611-1484849)
chr8 (12-251)||(4483489-4483728)
chr8 (12-251)||(14409159-14409397)
chr8 (15-239)||(16198115-16198339)
chr8 (12-251)||(5853007-5853245)
chr8 (16-251)||(32121937-32122172)
chr8 (12-251)||(15070769-15071008)
chr8 (15-226)||(24048845-24049055)
chr8 (12-250)||(1326646-1326884)
chr8 (12-250)||(38549719-38549957)
chr8 (12-251)||(14823984-14824222)
chr8 (12-251)||(22001962-22002200)
chr8 (12-248)||(16401639-16401875)
chr8 (12-251)||(4542088-4542326)
chr8 (14-240)||(15202895-15203121)
chr8 (38-239)||(25657893-25658094)
chr8 (15-251)||(20045913-20046148)
chr8 (12-240)||(20403499-20403727)
chr8 (12-240)||(19896541-19896769)
chr8 (12-250)||(19936622-19936850)
chr8 (41-240)||(45290385-45290584)
chr8 (12-167)||(19896807-19896962)
chr8 (12-167)||(27471938-27472093)
chr8 (12-166)||(14397455-14397609)
chr8 (12-168)||(15202700-15202856)
chr8 (12-167)||(20403765-20403920)
chr8 (12-167)||(32122214-32122369)
chr8 (16-167)||(16401450-16401601)
chr8 (12-167)||(38549526-38549681)
chr8 (12-156)||(38549334-38549478)
chr8 (12-139)||(45290262-45290389)
chr8 (12-167)||(15202507-15202662)
chr8 (12-167)||(16401254-16401408)
chr8 (15-167)||(15071046-15071198)
chr8 (12-167)||(16412837-16412992)
chr8 (20-159)||(24049104-24049243)
chr8 (12-167)||(19897000-19897155)
chr8 (12-167)||(19936429-19936584)
chr8 (12-145)||(11361024-11361157)
chr8 (176-250)||(13425337-13425411)
chr8 (176-250)||(20982499-20982573)
chr8 (176-249)||(20982605-20982678)
chr8 (176-251)||(38549989-38550064)
chr8 (186-250)||(13425241-13425305)
chr8 (176-251)||(20403436-20403510)
chr8 (176-251)||(45290573-45290647)
chr8 (175-251)||(19936881-19936956)
chr8 (176-251)||(19896478-19896552)
chr8 (176-251)||(32810140-32810214)
chr8 (23-93)||(32810263-32810333)
chr8 (176-249)||(1326916-1326988)
chr8 (176-251)||(15203110-15203184)
chr8 (176-251)||(16401909-16401983)
chr8 (38-147)||(15319989-15320098)
chr8 (38-147)||(15500358-15500467)
chr8 (49-147)||(24717722-24717820)
chr8 (78-147)||(29759429-29759498)
chr8 (49-167)||(1484887-1485005)
chr8 (49-147)||(22007097-22007195)
chr8 (78-147)||(13663129-13663198)
chr8 (50-147)||(17150628-17150725)
chr8 (175-250)||(18815608-18815683)
chr8 (179-250)||(21513636-21513707)
chr8 (49-167)||(5852851-5852969)
chr8 (49-167)||(14409003-14409121)
chr8 (53-167)||(20045758-20045872)
chr8 (38-147)||(223305-223414)
chr8 (38-147)||(272164-272273)
chr8 (38-147)||(643576-643685)
chr8 (38-147)||(688076-688185)
chr8 (38-147)||(736928-737037)
chr8 (38-147)||(829382-829491)
chr8 (38-147)||(860823-860932)
chr8 (38-147)||(22089373-22089482)
chr8 (175-240)||(38549935-38550000)
chr8 (51-147)||(39114415-39114511)
chr8 (175-250)||(36733301-36733376)
chr8 (175-250)||(38988730-38988805)
chr8 (175-250)||(39019827-39019902)
chr8 (175-240)||(13425283-13425348)
chr8 (175-240)||(13425389-13425454)
chr8 (175-240)||(20982551-20982616)
chr8 (188-240)||(32810203-32810255)
chr8 (176-251)||(1326863-1326938)
chr8 (128-167)||(4483765-4483804)
chr8 (183-250)||(5083001-5083068)
chr8 (128-167)||(14824260-14824299)
chr8 (60-147)||(21493050-21493137)
chr8 (97-147)||(18611952-18612002)
chr8 (49-119)||(39364118-39364188)
chr8 (49-119)||(44522814-44522884)
chr8 (175-240)||(16401855-16401920)
chr8 (78-147)||(18618830-18618899)
chr8 (175-240)||(19936828-19936893)
chr8 (78-147)||(22146977-22147046)
chr8 (52-109)||(24678771-24678828)
chr8 (38-119)||(44477018-44477099)
chr8 (38-119)||(44480280-44480361)
chr8 (53-105)||(19866496-19866548)
[»] chr4 (90 HSPs)
chr4 (12-250)||(52872787-52873025)
chr4 (12-250)||(362390-362628)
chr4 (12-251)||(14970421-14970660)
chr4 (12-251)||(3515216-3515455)
chr4 (12-251)||(15534390-15534629)
chr4 (12-251)||(15118067-15118305)
chr4 (12-251)||(44615497-44615736)
chr4 (12-251)||(44772798-44773036)
chr4 (12-250)||(15495888-15496126)
chr4 (12-250)||(19617781-19618019)
chr4 (12-243)||(29267570-29267801)
chr4 (12-251)||(36038079-36038318)
chr4 (12-251)||(49547488-49547727)
chr4 (12-251)||(50222054-50222292)
chr4 (12-250)||(14746226-14746464)
chr4 (14-251)||(19242909-19243146)
chr4 (12-240)||(11969-12197)
chr4 (12-240)||(52312782-52313009)
chr4 (12-250)||(19857798-19858026)
chr4 (12-249)||(7640901-7641137)
chr4 (12-251)||(14048786-14049025)
chr4 (12-198)||(1837234-1837420)
chr4 (12-159)||(362674-362821)
chr4 (12-167)||(52872594-52872749)
chr4 (12-155)||(14746033-14746176)
chr4 (12-167)||(19858064-19858219)
chr4 (12-167)||(14970228-14970383)
chr4 (12-167)||(18214725-18214880)
chr4 (12-167)||(19617588-19617743)
chr4 (20-167)||(362859-363006)
chr4 (12-167)||(3515493-3515648)
chr4 (121-250)||(18214992-18215121)
chr4 (12-167)||(52313240-52313395)
chr4 (33-167)||(15495716-15495850)
chr4 (12-167)||(52313047-52313202)
chr4 (57-167)||(14185621-14185731)
chr4 (12-186)||(30147189-30147363)
chr4 (147-250)||(15355068-15355171)
chr4 (128-251)||(18239250-18239372)
chr4 (49-167)||(22725284-22725401)
chr4 (176-251)||(12186-12260)
chr4 (176-251)||(18215153-18215227)
chr4 (176-242)||(19857700-19857766)
chr4 (12-75)||(12778397-12778460)
chr4 (176-251)||(15355203-15355277)
chr4 (176-251)||(52312719-52312793)
chr4 (50-147)||(14951270-14951367)
chr4 (176-251)||(14746496-14746570)
chr4 (176-251)||(15496950-15497024)
chr4 (176-251)||(19618051-19618125)
chr4 (176-251)||(52873057-52873131)
chr4 (38-147)||(14995644-14995753)
chr4 (97-161)||(14745925-14745989)
chr4 (49-145)||(55377197-55377293)
chr4 (15-118)||(14185477-14185580)
chr4 (49-147)||(25120046-25120144)
chr4 (46-147)||(43281694-43281795)
chr4 (12-59)||(18214918-18214965)
chr4 (49-167)||(15117911-15118029)
chr4 (49-147)||(18293667-18293765)
chr4 (38-147)||(18247739-18247848)
chr4 (38-147)||(47357183-47357292)
chr4 (38-145)||(15287859-15287966)
chr4 (38-145)||(15294969-15295076)
chr4 (49-147)||(5683367-5683465)
chr4 (45-159)||(9198544-9198658)
chr4 (49-147)||(22355071-22355169)
chr4 (38-147)||(10643746-10643855)
chr4 (38-135)||(16731688-16731785)
chr4 (175-251)||(19617997-19618073)
chr4 (49-167)||(7640745-7640863)
chr4 (175-240)||(362347-362412)
chr4 (175-240)||(14746442-14746507)
chr4 (175-240)||(15355149-15355214)
chr4 (78-147)||(17146320-17146389)
chr4 (78-147)||(18168293-18168362)
chr4 (38-147)||(19020009-19020118)
chr4 (175-240)||(19857755-19857820)
chr4 (130-167)||(44772723-44772760)
chr4 (19-59)||(15489677-15489717)
chr4 (209-251)||(362294-362336)
chr4 (97-147)||(19698032-19698082)
chr4 (97-147)||(19708617-19708667)
chr4 (38-119)||(630280-630361)
chr4 (38-147)||(8374040-8374149)
chr4 (175-240)||(18215099-18215164)
chr4 (50-87)||(18218875-18218912)
chr4 (175-240)||(52873003-52873068)
chr4 (49-93)||(8808350-8808394)
chr4 (49-93)||(11557892-11557936)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (12-251)||(17516878-17517117)
chr5 (12-250)||(20901635-20901873)
chr5 (12-251)||(2154346-2154585)
chr5 (15-251)||(38619645-38619881)
chr5 (12-251)||(20909221-20909459)
chr5 (12-251)||(39363593-39363832)
chr5 (12-251)||(10732655-10732893)
chr5 (12-251)||(39245345-39245583)
chr5 (12-251)||(264483-264721)
chr5 (12-240)||(20917561-20917789)
chr5 (15-251)||(23064722-23064958)
chr5 (12-251)||(37804617-37804856)
chr5 (12-240)||(32027665-32027893)
chr5 (12-251)||(42245080-42245318)
chr5 (12-251)||(29346189-29346427)
chr5 (12-251)||(29348662-29348900)
chr5 (12-251)||(29351135-29351373)
chr5 (15-240)||(29330203-29330427)
chr5 (38-251)||(9776567-9776780)
chr5 (12-167)||(20901442-20901597)
chr5 (12-167)||(17516492-17516647)
chr5 (12-167)||(295989-296144)
chr5 (12-167)||(17516685-17516840)
chr5 (12-159)||(32028519-32028666)
chr5 (12-160)||(2154153-2154301)
chr5 (12-159)||(32028132-32028280)
chr5 (12-167)||(32028318-32028473)
chr5 (12-167)||(20917368-20917523)
chr5 (12-167)||(29330468-29330623)
chr5 (12-167)||(295796-295951)
chr5 (12-167)||(32027931-32028086)
chr5 (176-251)||(20901905-20901980)
chr5 (176-251)||(29330140-29330214)
chr5 (176-251)||(32027602-32027676)
chr5 (176-251)||(20917831-20917905)
chr5 (49-147)||(27183180-27183278)
chr5 (38-147)||(22883904-22884013)
chr5 (38-147)||(43444009-43444118)
chr5 (38-147)||(11903-12012)
chr5 (78-147)||(1220384-1220453)
chr5 (78-147)||(10778832-10778901)
chr5 (38-147)||(25426177-25426286)
chr5 (176-240)||(20917778-20917842)
chr5 (38-145)||(7424879-7424986)
chr5 (179-250)||(18743965-18744036)
chr5 (49-167)||(264327-264445)
chr5 (176-250)||(1628169-1628243)
chr5 (49-167)||(20909497-20909615)
chr5 (50-147)||(11342190-11342287)
chr5 (38-147)||(21933243-21933352)
chr5 (38-147)||(21939413-21939522)
chr5 (38-147)||(22367095-22367204)
chr5 (38-147)||(35581340-35581449)
chr5 (38-147)||(36990639-36990748)
chr5 (79-147)||(23511127-23511195)
chr5 (128-167)||(39245621-39245660)
chr5 (128-167)||(39363869-39363908)
chr5 (49-167)||(23064999-23065117)
chr5 (128-166)||(38619922-38619960)
chr5 (78-147)||(1168832-1168901)
chr5 (78-147)||(11212734-11212803)
chr5 (38-147)||(18778606-18778715)
chr5 (175-240)||(20901851-20901916)
chr5 (78-147)||(21074249-21074318)
chr5 (178-250)||(21399896-21399968)
chr5 (49-105)||(22755214-22755270)
chr5 (174-217)||(24067282-24067325)
chr5 (49-124)||(31478959-31479034)
chr5 (49-147)||(19499428-19499526)
chr5 (77-147)||(32950213-32950283)
chr5 (49-147)||(35791736-35791834)
chr5 (38-119)||(19511781-19511862)
chr5 (38-107)||(37804450-37804519)
chr5 (78-138)||(28901495-28901555)
chr5 (78-138)||(28937890-28937950)
[»] chr6 (89 HSPs)
chr6 (12-251)||(30676424-30676663)
chr6 (12-251)||(34963582-34963821)
chr6 (12-251)||(1598266-1598504)
chr6 (12-251)||(8055238-8055477)
chr6 (12-251)||(18334307-18334545)
chr6 (12-251)||(24422756-24422994)
chr6 (12-251)||(33862003-33862241)
chr6 (12-251)||(33864487-33864725)
chr6 (12-250)||(18914142-18914380)
chr6 (12-251)||(19847686-19847921)
chr6 (12-250)||(31630255-31630493)
chr6 (26-251)||(17377576-17377801)
chr6 (12-251)||(12742526-12742765)
chr6 (12-251)||(26924355-26924593)
chr6 (12-250)||(19005361-19005599)
chr6 (12-226)||(25535641-25535855)
chr6 (16-251)||(1540630-1540864)
chr6 (12-251)||(28289051-28289288)
chr6 (12-251)||(2290895-2291133)
chr6 (15-251)||(25688711-25688947)
chr6 (12-251)||(23992632-23992870)
chr6 (12-251)||(19858637-19858872)
chr6 (12-251)||(22782436-22782674)
chr6 (12-251)||(12942410-12942637)
chr6 (12-167)||(1879-2034)
chr6 (12-167)||(8838-8993)
chr6 (12-167)||(1598542-1598697)
chr6 (20-167)||(19005637-19005784)
chr6 (12-167)||(19847493-19847648)
chr6 (12-159)||(27557023-27557170)
chr6 (12-161)||(26924162-26924311)
chr6 (12-160)||(23415264-23415412)
chr6 (18-161)||(18914424-18914567)
chr6 (12-159)||(25688996-25689143)
chr6 (12-167)||(30676231-30676386)
chr6 (12-161)||(31630062-31630211)
chr6 (12-159)||(87-234)
chr6 (12-161)||(18914617-18914766)
chr6 (12-120)||(15892123-15892231)
chr6 (12-167)||(1598735-1598890)
chr6 (38-159)||(25689189-25689310)
chr6 (48-167)||(25737128-25737247)
chr6 (12-105)||(17883212-17883305)
chr6 (124-250)||(15875621-15875737)
chr6 (176-251)||(31630525-31630600)
chr6 (72-167)||(22981321-22981416)
chr6 (72-167)||(23806992-23807087)
chr6 (176-251)||(18914036-18914110)
chr6 (176-251)||(19005255-19005329)
chr6 (12-74)||(25737028-25737090)
chr6 (176-251)||(15875515-15875589)
chr6 (12-66)||(9031-9085)
chr6 (49-147)||(19984130-19984228)
chr6 (38-147)||(16240296-16240405)
chr6 (38-147)||(16556945-16557054)
chr6 (38-147)||(16633501-16633610)
chr6 (38-147)||(16650175-16650284)
chr6 (49-167)||(18334151-18334269)
chr6 (49-167)||(24423032-24423150)
chr6 (38-147)||(25904474-25904584)
chr6 (49-147)||(35016015-35016113)
chr6 (38-147)||(27654597-27654706)
chr6 (49-147)||(22226580-22226679)
chr6 (192-251)||(25656838-25656897)
chr6 (49-147)||(21776107-21776205)
chr6 (49-167)||(33864763-33864881)
chr6 (38-147)||(10487971-10488080)
chr6 (38-147)||(16377248-16377357)
chr6 (38-147)||(16384572-16384681)
chr6 (38-147)||(16826368-16826477)
chr6 (46-147)||(22593590-22593691)
chr6 (49-93)||(10905416-10905460)
chr6 (175-251)||(15875567-15875643)
chr6 (38-145)||(19609582-19609689)
chr6 (175-250)||(35056707-35056782)
chr6 (78-147)||(1555527-1555596)
chr6 (175-240)||(18914099-18914164)
chr6 (78-147)||(33315116-33315185)
chr6 (128-167)||(2290818-2290857)
chr6 (128-167)||(22782712-22782751)
chr6 (128-167)||(26924085-26924124)
chr6 (175-234)||(32259078-32259137)
chr6 (78-136)||(16133087-16133145)
chr6 (38-119)||(18455449-18455530)
chr6 (179-240)||(19005318-19005379)
chr6 (38-147)||(25175112-25175221)
chr6 (175-240)||(31630471-31630536)
chr6 (12-44)||(22981454-22981486)
chr6 (12-44)||(23806922-23806954)
[»] chr3 (104 HSPs)
chr3 (12-251)||(46822470-46822709)
chr3 (15-251)||(53301221-53301457)
chr3 (15-250)||(12119371-12119606)
chr3 (12-239)||(13436520-13436747)
chr3 (12-251)||(17463387-17463625)
chr3 (12-251)||(27165461-27165700)
chr3 (12-251)||(34159535-34159773)
chr3 (12-251)||(45606621-45606860)
chr3 (12-251)||(54521031-54521270)
chr3 (12-251)||(15412640-15412879)
chr3 (12-251)||(7781061-7781300)
chr3 (12-251)||(8499729-8499968)
chr3 (12-251)||(10557117-10557356)
chr3 (12-251)||(13544234-13544471)
chr3 (12-251)||(15977742-15977980)
chr3 (15-251)||(55476700-55476935)
chr3 (12-251)||(6468849-6469087)
chr3 (12-251)||(12567769-12568007)
chr3 (12-251)||(16453995-16454234)
chr3 (12-251)||(13153970-13154208)
chr3 (7-240)||(41124159-41124392)
chr3 (12-251)||(29544556-29544795)
chr3 (12-240)||(16282472-16282701)
chr3 (12-240)||(38961552-38961781)
chr3 (12-240)||(17444478-17444706)
chr3 (12-226)||(24513910-24514124)
chr3 (12-251)||(10247438-10247676)
chr3 (12-240)||(25237063-25237291)
chr3 (12-251)||(13151505-13151743)
chr3 (12-240)||(20629906-20630138)
chr3 (12-251)||(28848336-28848564)
chr3 (12-240)||(25229476-25229704)
chr3 (15-174)||(10379613-10379772)
chr3 (12-167)||(46822747-46822902)
chr3 (89-251)||(12305354-12305516)
chr3 (12-167)||(41124425-41124580)
chr3 (12-167)||(55319018-55319173)
chr3 (12-166)||(15465448-15465602)
chr3 (22-167)||(53301035-53301180)
chr3 (14-166)||(26054981-26055133)
chr3 (15-167)||(27165738-27165890)
chr3 (20-167)||(10557394-10557541)
chr3 (20-167)||(38961367-38961514)
chr3 (12-166)||(5223677-5223831)
chr3 (12-167)||(55318825-55318980)
chr3 (12-156)||(13937494-13937638)
chr3 (12-159)||(20629713-20629860)
chr3 (15-161)||(8500012-8500158)
chr3 (38-167)||(14567432-14567561)
chr3 (12-167)||(16282279-16282434)
chr3 (12-159)||(17444285-17444432)
chr3 (46-168)||(36528447-36528569)
chr3 (57-167)||(16358234-16358344)
chr3 (23-159)||(17393209-17393345)
chr3 (60-168)||(3264323-3264431)
chr3 (176-251)||(9707485-9707560)
chr3 (18-91)||(15007868-15007941)
chr3 (176-251)||(8899303-8899377)
chr3 (176-251)||(16282690-16282764)
chr3 (176-251)||(17444695-17444769)
chr3 (103-167)||(15007988-15008052)
chr3 (12-88)||(16358382-16358458)
chr3 (176-251)||(38961770-38961844)
chr3 (176-251)||(41124096-41124170)
chr3 (12-82)||(36528340-36528410)
chr3 (176-251)||(11913929-11914003)
chr3 (38-159)||(25058286-25058407)
chr3 (22-68)||(10555766-10555812)
chr3 (176-242)||(25237009-25237074)
chr3 (51-147)||(16934824-16934920)
chr3 (49-167)||(34159811-34159929)
chr3 (49-147)||(49231768-49231866)
chr3 (77-147)||(51158683-51158753)
chr3 (38-147)||(14528625-14528734)
chr3 (12-67)||(8899418-8899473)
chr3 (128-167)||(15412916-15412955)
chr3 (49-167)||(17463663-17463781)
chr3 (49-167)||(55476976-55477094)
chr3 (38-147)||(1468614-1468723)
chr3 (38-147)||(8276474-8276583)
chr3 (12-57)||(12305525-12305570)
chr3 (50-147)||(30152450-30152547)
chr3 (60-151)||(21026092-21026183)
chr3 (175-250)||(25201323-25201398)
chr3 (78-145)||(54039167-54039234)
chr3 (45-147)||(2281000-2281102)
chr3 (12-82)||(3264468-3264538)
chr3 (49-147)||(14263640-14263738)
chr3 (38-147)||(8269363-8269472)
chr3 (175-240)||(11913875-11913940)
chr3 (175-240)||(12119584-12119649)
chr3 (38-147)||(12808505-12808614)
chr3 (78-147)||(17956869-17956938)
chr3 (128-167)||(6468772-6468811)
chr3 (175-234)||(15025933-15025992)
chr3 (12-66)||(14567599-14567653)
chr3 (175-221)||(18700199-18700245)
chr3 (49-147)||(28557370-28557468)
chr3 (192-250)||(40812144-40812202)
chr3 (38-119)||(16979504-16979585)
chr3 (38-119)||(18889958-18890039)
chr3 (77-157)||(8023778-8023858)
chr3 (49-113)||(11833119-11833183)
chr3 (176-240)||(17044330-17044394)
[»] scaffold0494 (3 HSPs)
scaffold0494 (12-250)||(238-476)
scaffold0494 (176-250)||(508-582)
scaffold0494 (175-240)||(454-519)
[»] chr2 (107 HSPs)
chr2 (12-250)||(23706931-23707169)
chr2 (16-250)||(24671235-24671469)
chr2 (12-250)||(24681654-24681892)
chr2 (12-251)||(39682522-39682761)
chr2 (14-250)||(24642465-24642701)
chr2 (12-251)||(20261428-20261667)
chr2 (12-251)||(23131071-23131310)
chr2 (12-251)||(23133538-23133777)
chr2 (12-251)||(34402236-34402475)
chr2 (12-250)||(24918350-24918588)
chr2 (15-251)||(571606-571842)
chr2 (12-251)||(18809152-18809390)
chr2 (12-251)||(23711728-23711966)
chr2 (12-251)||(28577308-28577546)
chr2 (12-250)||(38967689-38967927)
chr2 (18-251)||(23709253-23709485)
chr2 (12-251)||(24529261-24529500)
chr2 (12-251)||(24897910-24898148)
chr2 (12-251)||(24905347-24905585)
chr2 (12-240)||(22105685-22105913)
chr2 (12-251)||(24900393-24900631)
chr2 (12-251)||(24902870-24903108)
chr2 (12-251)||(24907822-24908060)
chr2 (12-251)||(10684477-10684716)
chr2 (12-251)||(26505588-26505826)
chr2 (12-251)||(26508066-26508304)
chr2 (12-240)||(6726267-6726495)
chr2 (12-240)||(24368046-24368274)
chr2 (12-240)||(41523787-41524015)
chr2 (12-226)||(45027619-45027832)
chr2 (12-240)||(21154722-21154950)
chr2 (12-251)||(32214645-32214874)
chr2 (60-251)||(25616390-25616581)
chr2 (12-251)||(23135799-23136027)
chr2 (12-251)||(32039213-32039451)
chr2 (12-145)||(23931775-23931908)
chr2 (12-161)||(41523401-41523550)
chr2 (15-167)||(41523597-41523749)
chr2 (12-167)||(22105951-22106106)
chr2 (12-167)||(24529068-24529223)
chr2 (12-167)||(21154529-21154684)
chr2 (12-167)||(24368312-24368467)
chr2 (12-167)||(24918626-24918781)
chr2 (38-159)||(6726541-6726662)
chr2 (12-161)||(23931952-23932101)
chr2 (12-161)||(32214451-32214600)
chr2 (12-167)||(23709054-23709209)
chr2 (12-167)||(21154336-21154491)
chr2 (12-167)||(23706547-23706702)
chr2 (12-167)||(24671511-24671666)
chr2 (12-167)||(24681930-24682085)
chr2 (12-161)||(23706739-23706888)
chr2 (19-161)||(45027433-45027575)
chr2 (176-251)||(6726204-6726278)
chr2 (179-251)||(21154942-21155013)
chr2 (176-251)||(22105622-22105696)
chr2 (176-251)||(23707201-23707275)
chr2 (176-251)||(24642733-24642807)
chr2 (176-251)||(38967583-38967657)
chr2 (102-166)||(31345490-31345554)
chr2 (176-251)||(24367983-24368057)
chr2 (176-251)||(24918244-24918318)
chr2 (178-251)||(24671129-24671201)
chr2 (12-69)||(31345570-31345627)
chr2 (176-251)||(24681548-24681622)
chr2 (49-167)||(28577584-28577702)
chr2 (46-147)||(67339-67440)
chr2 (78-159)||(16900803-16900884)
chr2 (78-159)||(16994194-16994275)
chr2 (38-147)||(24686598-24686707)
chr2 (49-167)||(18809428-18809546)
chr2 (38-147)||(19887275-19887384)
chr2 (38-147)||(27261332-27261441)
chr2 (78-147)||(34823750-34823819)
chr2 (51-147)||(12727711-12727807)
chr2 (115-167)||(24642373-24642425)
chr2 (175-250)||(21368365-21368440)
chr2 (49-167)||(23711572-23711690)
chr2 (49-167)||(26505864-26505982)
chr2 (49-167)||(26508342-26508460)
chr2 (49-167)||(27920323-27920441)
chr2 (49-167)||(32039057-32039175)
chr2 (38-147)||(11232213-11232322)
chr2 (38-147)||(22514060-22514169)
chr2 (38-147)||(28776662-28776771)
chr2 (49-109)||(34135059-34135119)
chr2 (128-167)||(23131347-23131386)
chr2 (175-250)||(23799457-23799532)
chr2 (128-167)||(34402160-34402199)
chr2 (176-218)||(41524004-41524045)
chr2 (175-240)||(23707147-23707212)
chr2 (175-240)||(24642679-24642744)
chr2 (175-240)||(24918307-24918372)
chr2 (51-167)||(571883-571999)
chr2 (79-147)||(22274022-22274090)
chr2 (49-93)||(24788042-24788086)
chr2 (49-93)||(44584588-44584632)
chr2 (128-167)||(23133814-23133853)
chr2 (128-167)||(39682799-39682838)
chr2 (38-119)||(6483113-6483194)
chr2 (38-119)||(21081348-21081429)
chr2 (175-224)||(22686062-22686111)
chr2 (181-250)||(22686152-22686221)
chr2 (175-240)||(24671192-24671257)
chr2 (175-240)||(24681611-24681676)
chr2 (79-147)||(22283255-22283323)
chr2 (131-167)||(23708980-23709016)
[»] scaffold0230 (4 HSPs)
scaffold0230 (12-251)||(14156-14395)
scaffold0230 (12-251)||(23245-23484)
scaffold0230 (12-167)||(22892-23047)
scaffold0230 (81-167)||(23121-23207)
[»] chr1 (51 HSPs)
chr1 (12-250)||(16274970-16275209)
chr1 (12-240)||(27161301-27161529)
chr1 (12-240)||(29776960-29777188)
chr1 (12-251)||(13989075-13989313)
chr1 (12-251)||(21474801-21475040)
chr1 (12-251)||(21923006-21923244)
chr1 (12-251)||(16362127-16362366)
chr1 (12-251)||(21840976-21841214)
chr1 (12-240)||(29298461-29298689)
chr1 (12-240)||(31612585-31612813)
chr1 (12-251)||(15859723-15859961)
chr1 (12-251)||(22122729-22122968)
chr1 (12-251)||(23593448-23593687)
chr1 (12-240)||(22050551-22050779)
chr1 (12-194)||(29535317-29535499)
chr1 (12-194)||(13227129-13227311)
chr1 (13-167)||(31612851-31613005)
chr1 (15-167)||(15859520-15859672)
chr1 (20-167)||(31613044-31613191)
chr1 (12-167)||(29298727-29298882)
chr1 (15-167)||(29777226-29777378)
chr1 (15-160)||(9044722-9044867)
chr1 (19-159)||(16274784-16274924)
chr1 (12-167)||(22122535-22122691)
chr1 (22-167)||(27161118-27161263)
chr1 (15-167)||(16401407-16401559)
chr1 (20-157)||(40129387-40129524)
chr1 (12-92)||(43543269-43543349)
chr1 (176-251)||(16275241-16275316)
chr1 (176-251)||(22050768-22050842)
chr1 (176-251)||(29776897-29776971)
chr1 (176-251)||(29298345-29298419)
chr1 (97-167)||(10812612-10812682)
chr1 (176-251)||(22122946-22123020)
chr1 (176-251)||(27161518-27161592)
chr1 (176-251)||(31612522-31612596)
chr1 (176-240)||(29298408-29298472)
chr1 (49-167)||(13989351-13989469)
chr1 (49-147)||(21858592-21858690)
chr1 (49-147)||(44035830-44035928)
chr1 (38-147)||(17003909-17004018)
chr1 (51-147)||(21650883-21650979)
chr1 (40-147)||(18060577-18060684)
chr1 (15-108)||(10812723-10812816)
chr1 (175-240)||(16275187-16275252)
chr1 (78-147)||(22366527-22366596)
chr1 (128-167)||(21474724-21474763)
chr1 (175-224)||(22824135-22824184)
chr1 (175-227)||(12710160-12710212)
chr1 (78-138)||(16655942-16656002)
chr1 (51-119)||(24815242-24815310)
[»] chr7 (102 HSPs)
chr7 (12-250)||(14269671-14269909)
chr7 (12-251)||(13869557-13869796)
chr7 (12-251)||(16213893-16214132)
chr7 (12-251)||(27217069-27217308)
chr7 (12-250)||(8940489-8940731)
chr7 (12-251)||(456530-456769)
chr7 (12-251)||(11303456-11303695)
chr7 (12-251)||(15376428-15376666)
chr7 (12-251)||(20384838-20385076)
chr7 (12-250)||(15081556-15081794)
chr7 (12-251)||(14948837-14949075)
chr7 (12-251)||(16232729-16232968)
chr7 (12-251)||(16410268-16410506)
chr7 (12-251)||(41523126-41523365)
chr7 (12-251)||(41525588-41525827)
chr7 (12-251)||(32125700-32125938)
chr7 (12-250)||(8468945-8469183)
chr7 (12-251)||(21189310-21189548)
chr7 (12-251)||(16108403-16108642)
chr7 (12-251)||(23664667-23664906)
chr7 (12-251)||(29796819-29797058)
chr7 (12-251)||(29800638-29800877)
chr7 (12-251)||(18627775-18628013)
chr7 (12-251)||(18640481-18640719)
chr7 (23-248)||(45847380-45847605)
chr7 (12-251)||(24702447-24702676)
chr7 (12-251)||(24704894-24705123)
chr7 (15-251)||(26355699-26355934)
chr7 (15-251)||(26358151-26358386)
chr7 (12-251)||(18430921-18431159)
chr7 (52-251)||(11393041-11393240)
chr7 (12-240)||(11972768-11972996)
chr7 (68-240)||(13841274-13841446)
chr7 (12-167)||(8940769-8940923)
chr7 (12-159)||(10501108-10501255)
chr7 (12-167)||(38897749-38897904)
chr7 (12-166)||(25926844-25926998)
chr7 (12-167)||(14269285-14269440)
chr7 (12-167)||(14156793-14156944)
chr7 (15-167)||(14156603-14156755)
chr7 (15-166)||(1856947-1857097)
chr7 (20-163)||(15081371-15081514)
chr7 (12-159)||(14269478-14269625)
chr7 (20-167)||(16214170-16214317)
chr7 (12-159)||(13918117-13918265)
chr7 (12-167)||(8940962-8941117)
chr7 (12-159)||(21189117-21189264)
chr7 (15-134)||(10500945-10501064)
chr7 (12-159)||(17985099-17985246)
chr7 (49-167)||(45847213-45847331)
chr7 (170-250)||(38897995-38898075)
chr7 (176-251)||(45847639-45847714)
chr7 (176-251)||(14269941-14270015)
chr7 (176-251)||(15081826-15081900)
chr7 (176-251)||(38898107-38898181)
chr7 (80-168)||(11310239-11310327)
chr7 (176-251)||(8940383-8940457)
chr7 (176-251)||(11972705-11972779)
chr7 (50-147)||(11286976-11287073)
chr7 (49-167)||(15376272-15376390)
chr7 (49-167)||(20384682-20384800)
chr7 (78-147)||(125965-126034)
chr7 (128-167)||(13869833-13869872)
chr7 (19-70)||(23461813-23461864)
chr7 (38-147)||(7822013-7822122)
chr7 (38-147)||(7829324-7829433)
chr7 (38-147)||(27102512-27102621)
chr7 (38-147)||(27109860-27109969)
chr7 (38-147)||(27175705-27175814)
chr7 (38-147)||(38784604-38784713)
chr7 (170-250)||(13745563-13745643)
chr7 (51-147)||(15951607-15951703)
chr7 (128-167)||(16410544-16410583)
chr7 (128-167)||(18628051-18628090)
chr7 (128-167)||(18640757-18640796)
chr7 (128-167)||(26355619-26355658)
chr7 (128-167)||(26358071-26358110)
chr7 (49-167)||(456807-456925)
chr7 (209-251)||(8468849-8468891)
chr7 (12-82)||(11310133-11310202)
chr7 (201-251)||(13841221-13841270)
chr7 (176-250)||(15119919-15119993)
chr7 (49-135)||(16202766-16202852)
chr7 (49-167)||(27217346-27217464)
chr7 (49-147)||(32495062-32495160)
chr7 (175-240)||(8468902-8468967)
chr7 (175-240)||(8940446-8940511)
chr7 (175-240)||(14269887-14269952)
chr7 (175-240)||(15081772-15081837)
chr7 (78-147)||(15760779-15760848)
chr7 (175-240)||(38294567-38294632)
chr7 (175-240)||(38898053-38898118)
chr7 (49-129)||(10000996-10001076)
chr7 (38-70)||(20110747-20110779)
chr7 (175-226)||(9743794-9743845)
chr7 (38-119)||(10896371-10896452)
chr7 (38-107)||(23664500-23664569)
chr7 (175-224)||(25941523-25941572)
chr7 (50-119)||(29004416-29004485)
chr7 (175-240)||(45847585-45847650)
chr7 (49-93)||(13475728-13475772)
chr7 (38-158)||(15167530-15167650)
[»] scaffold0741 (4 HSPs)
scaffold0741 (12-251)||(4017-4256)
scaffold0741 (12-167)||(3824-3979)
scaffold0741 (12-161)||(3631-3780)
scaffold0741 (115-160)||(3541-3586)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (12-251)||(4903-5142)
scaffold0716 (12-167)||(5180-5335)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (12-251)||(38030-38269)
scaffold0134 (49-167)||(38307-38425)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (12-251)||(94620-94858)
scaffold0023 (12-251)||(17154-17393)
scaffold0023 (12-159)||(16961-17108)
scaffold0023 (49-167)||(94896-95014)
scaffold0023 (78-147)||(154892-154961)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-251)||(20956-21193)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (12-251)||(6156-6394)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (12-251)||(3232-3471)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (12-251)||(11498-11737)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (12-250)||(30229-30467)
scaffold0149 (12-167)||(30505-30660)
scaffold0149 (177-251)||(30122-30196)
[»] scaffold0043 (5 HSPs)
scaffold0043 (12-250)||(10001-10239)
scaffold0043 (12-167)||(10277-10432)
scaffold0043 (13-167)||(10470-10624)
scaffold0043 (176-209)||(9936-9969)
scaffold0043 (175-240)||(9958-10023)
[»] scaffold1792 (3 HSPs)
scaffold1792 (12-251)||(416-655)
scaffold1792 (12-167)||(853-1008)
scaffold1792 (81-167)||(693-779)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (12-251)||(13601-13840)
scaffold0444 (127-167)||(13878-13918)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (12-251)||(134420-134658)
scaffold0028 (12-251)||(136889-137127)
scaffold0028 (12-251)||(139358-139596)
scaffold0028 (12-251)||(141827-142065)
scaffold0028 (12-251)||(144296-144534)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (15-251)||(40609-40844)
scaffold0044 (38-159)||(37848-37968)
scaffold0044 (127-167)||(40885-40925)
[»] scaffold0747 (5 HSPs)
scaffold0747 (15-250)||(799-1034)
scaffold0747 (18-159)||(1083-1224)
scaffold0747 (23-137)||(1225-1338)
scaffold0747 (176-251)||(693-767)
scaffold0747 (175-237)||(759-821)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (12-251)||(9451-9689)
[»] scaffold0317 (2 HSPs)
scaffold0317 (12-251)||(6650-6889)
scaffold0317 (20-167)||(6465-6612)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (38-251)||(53612-53825)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (12-239)||(6682-6899)
scaffold0574 (12-167)||(6937-7092)
[»] scaffold0306 (4 HSPs)
scaffold0306 (30-251)||(15131-15352)
scaffold0306 (12-209)||(11054-11251)
scaffold0306 (20-167)||(10869-11016)
scaffold0306 (12-167)||(15398-15552)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (38-251)||(38396-38609)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (12-203)||(7996-8187)
scaffold0278 (7-167)||(8225-8385)
scaffold0278 (16-161)||(8424-8569)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (57-251)||(1637-1831)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (50-242)||(13379-13571)
scaffold0040 (12-197)||(43002-43187)
scaffold0040 (12-167)||(43225-43380)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (12-194)||(68227-68409)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (12-167)||(1740-1895)
scaffold1296 (12-80)||(1634-1702)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (76-233)||(57708-57865)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (12-167)||(18423-18578)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (12-251)||(501293-501512)
scaffold0001 (12-167)||(501550-501705)
scaffold0001 (49-105)||(139589-139645)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (12-160)||(33471-33619)
[»] scaffold0200 (1 HSPs)
scaffold0200 (12-166)||(17947-18101)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (12-166)||(31497-31651)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (12-167)||(8311-8466)
[»] scaffold0711 (3 HSPs)
scaffold0711 (16-166)||(7408-7558)
scaffold0711 (19-167)||(7219-7367)
scaffold0711 (72-161)||(7079-7168)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (90-251)||(10982-11142)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (41-167)||(36749-36875)
scaffold0151 (12-155)||(36913-37056)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (12-166)||(39626-39780)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (12-159)||(19803-19950)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (111-240)||(28061-28190)
scaffold0114 (176-251)||(27998-28072)
[»] scaffold0513 (3 HSPs)
scaffold0513 (163-250)||(10647-10734)
scaffold0513 (176-251)||(10766-10840)
scaffold0513 (175-240)||(10712-10777)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (15-159)||(113317-113461)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (12-82)||(75619-75689)
[»] scaffold0145 (2 HSPs)
scaffold0145 (176-251)||(9940-10015)
scaffold0145 (177-239)||(10005-10067)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (38-147)||(6196-6305)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (176-251)||(15151-15225)
scaffold0106 (201-250)||(15070-15119)
scaffold0106 (179-240)||(15101-15162)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (38-147)||(8566-8675)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (38-147)||(30470-30579)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (38-147)||(725-834)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (76-147)||(12519-12590)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (49-147)||(6941-7039)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (49-147)||(32118-32216)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (49-147)||(40628-40726)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (19-81)||(398-460)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (38-147)||(1375-1484)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (38-147)||(110065-110174)
scaffold0035 (38-147)||(118566-118675)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (49-145)||(15780-15876)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (49-147)||(53946-54044)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (49-147)||(19911-20009)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (77-147)||(39965-40035)
scaffold0034 (77-147)||(45448-45518)
scaffold0034 (77-147)||(79003-79073)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (78-147)||(1296-1365)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (38-147)||(18205-18314)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (38-147)||(28469-28578)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (187-251)||(35955-36019)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (38-147)||(38375-38484)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (78-145)||(912-979)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (175-250)||(15287-15362)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (177-240)||(16263-16326)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (77-147)||(868-938)
[»] scaffold0959 (1 HSPs)
scaffold0959 (45-159)||(1219-1333)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (176-251)||(1205-1279)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (52-147)||(8097-8192)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (49-88)||(53939-53978)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (127-167)||(233-273)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 103)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 27472131 - 27472370
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27472131 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27472230  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27472231 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27472330  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27472331 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 27472370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16413030 - 16413269
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  16413030 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgacagttgtaggtatggatgttagcttgctaatgccgttggtttgacttcaa 16413129  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413130 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16413229  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413230 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 16413269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24485758 - 24485997
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24485758 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24485857  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485858 aatgatttataaaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24485957  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24485958 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 24485997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Original strand, 18677779 - 18678016
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18677779 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 18677878  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  18677879 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatgtatatgtatatgtttg 18677978  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatat 249  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  18677979 tgaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatat 18678016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1484849 - 1484611
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1484849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1484750  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  1484749 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 1484651  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1484650 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1484611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4483728 - 4483489
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  4483728 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 4483629  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4483628 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 4483529  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4483528 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 4483489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 14409159 - 14409397
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14409159 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14409258  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14409259 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14409357  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14409358 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14409397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16198339 - 16198115
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  16198339 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgactttaaaaa 16198240  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16198239 tatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 16198140  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatga 239  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  16198139 atacgatattgttcatgattgatga 16198115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 5853007 - 5853245
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5853007 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 5853106  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  5853107 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 5853205  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  5853206 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 5853245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32122172 - 32121937
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  32122172 aaactgatattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaatgttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaaaatg 32122073  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32122072 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtttgtgaa 32121973  T
Q  216 tacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32121972 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32121937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15071008 - 15070769
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15071008 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttaaa 15070909  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070908 aatgatttatacaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15070809  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15070808 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 15070769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24049055 - 24048845
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24049055 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaac 24048956  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24048955 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca-gtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 24048857  T
Q  215 atacgatattgt 226  Q
    ||||||||||||    
T  24048856 atacgatattgt 24048845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 1326646 - 1326884
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1326646 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaaaacgaaagttgtaggtatgaatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1326745  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1326746 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtttg 1326845  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1326846 taaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 1326884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 38549719 - 38549957
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38549719 atgaaatctggtattgattggtaaagaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38549818  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549819 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtatgtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38549918  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  38549919 tgaatacgatattgttcatgattgatgaatttttatatg 38549957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14824222 - 14823984
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14824222 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14824123  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  14824122 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14824024  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  14824023 taaatacgatattatccatgattgatgaagtgttatatgt 14823984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22002200 - 22001962
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22002200 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 22002101  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  22002100 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacattgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 22002002  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22002001 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22001962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 16401639 - 16401875
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  16401639 atgaaaactgatattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 16401738  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16401739 aaggatttataaaacttgagttatagtcagattacagcaggtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 16401838  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttata 248  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16401839 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 4542088 - 4542326
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  4542088 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttcgcttgacttcaa 4542187  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  4542188 aatgatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 4542286  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4542287 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 4542326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 15202895 - 15203121
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15202895 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 15202994  T
Q  114 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15202995 gaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgaatgtatatgtttatg 15203094  T
Q  214 aatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    | || ||| || |||||||||||||||    
T  15203095 agtatgatgttatttatgattgatgaa 15203121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 38 - 239
Target Start/End: Original strand, 25657893 - 25658094
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657893 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgtttgtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 25657992  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  25657993 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatttgatattgttcatgattgat 25658092  T
Q  238 ga 239  Q
    ||    
T  25658093 ga 25658094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 20045913 - 20046148
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20045913 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttcacttcaaaag 20046012  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  20046013 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtga 20046111  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  20046112 atacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgt 20046148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20403727 - 20403499
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20403727 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttgaa 20403628  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  20403627 aaggatttatagaacttgagttattgtcatattactgcgcgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 20403528  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20403527 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20403499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19896769 - 19896541
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  19896769 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaaattgtaggtatgaattttaactttctagcgccgttggtttgacttcaa 19896670  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  19896669 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatgtgattgatgaattaggatatgaatgtatatgttta 19896570  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19896569 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19896541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 19936622 - 19936850
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19936622 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcattggtttgacttcaa 19936721  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||          |||||||||||    
T  19936722 aaggatttatagaacttgaggtatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgtttatgattgatgaatta----------gtatatgtttg 19936811  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19936812 tgaatattatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 41 - 240
Target Start/End: Original strand, 45290385 - 45290584
Alignment:
Q  41 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290385 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 45290484  T
Q  141 aattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  45290485 aattactgcacgtagatcatagtgaataattgaatatgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45290584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19896962 - 19896807
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19896962 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19896863  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19896862 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaat 19896807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 27471938 - 27472093
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27471938 atgaaaactgatattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 27472037  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27472038 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27472093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 14397455 - 14397609
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14397455 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagctgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14397554  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14397555 aatgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 14397609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 168
Target Start/End: Original strand, 15202700 - 15202856
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15202700 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 15202799  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaata 168  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15202800 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaata 15202856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20403920 - 20403765
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20403920 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20403821  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20403820 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20403765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32122369 - 32122214
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  32122369 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 32122270  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32122269 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 32122214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 167
Target Start/End: Original strand, 16401450 - 16401601
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |    
T  16401450 aaactggtattgattggtacgtaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaacgccgttggtttgacttcaaaatg 16401549  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||    
T  16401550 atttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtatgccacaatgaat 16401601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 38549526 - 38549681
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38549526 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtataaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttttaattccgttggtttgacttcaa 38549625  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38549626 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38549681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 38549334 - 38549478
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38549334 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctaatgtcgttggtatgacgtcaa 38549433  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38549434 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 38549478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 139
Target Start/End: Original strand, 45290262 - 45290389
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45290262 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45290361  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290362 aaggatttatagaacttgagttatggtc 45290389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 15202507 - 15202662
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  15202507 atgaaatctggtattgatagatccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaa 15202606  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15202607 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 16401254 - 16401408
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16401254 atgaaatctggtattgataggtccagaattggt-ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 16401352  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16401353 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattacagcacgtaggtcacagtgaat 16401408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15071198 - 15071046
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  15071198 aaaactggtattgatcggtaaagaattgatcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaaa 15071099  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15071098 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 15071046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 16412837 - 16412992
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||    
T  16412837 atgaaaattggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 16412936  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  16412937 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactatacgtaggtcacagtgaat 16412992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24049243 - 24049104
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  24049243 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 24049144  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24049143 ataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 24049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19897155 - 19897000
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  19897155 atgaaatctggtattgataggtccaaaattggtcttagctgtaaatacaaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 19897056  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897055 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19897000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 19936429 - 19936584
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||| || | | ||    
T  19936429 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtagctatggatattagctttctaattccgttggtctggcgttaa 19936528  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936529 aacgatttatagaacttgagttatgctcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 19936584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 11361157 - 11361024
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||    
T  11361157 atgaaatctagtattgataggtgcataattggtcttaggtgtaaacacaaaacttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaa 11361058  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    || |||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  11361057 aacgatttatagaacttaagttatagttaaatta 11361024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 13425337 - 13425411
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13425337 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 20982499 - 20982573
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20982499 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 20982605 - 20982678
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20982605 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 20982678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 38549989 - 38550064
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38549989 atgattgatgaattagtatacgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38550064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 250
Target Start/End: Original strand, 13425241 - 13425305
Alignment:
Q  186 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13425241 aattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20403510 - 20403436
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20403510 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20403436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 45290573 - 45290647
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45290573 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 45290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Original strand, 19936881 - 19936956
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19936881 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19936956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19896552 - 19896478
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19896552 atgattgatgaattagtatatgtatatatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19896478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32810214 - 32810140
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32810214 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgt 32810140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 32810333 - 32810263
Alignment:
Q  23 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32810333 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatg 32810263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 176 - 249
Target Start/End: Original strand, 1326916 - 1326988
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatat 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1326916 atgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatat 1326988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 15203110 - 15203184
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  15203110 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaataagatattatccatgattgatgaagtgttatatgt 15203184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 16401909 - 16401983
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  16401909 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 16401983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 15319989 - 15320098
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15319989 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15320088  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  15320089 tcaaattact 15320098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 15500358 - 15500467
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  15500358 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataactatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 15500457  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  15500458 tcaaattact 15500467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 24717722 - 24717820
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24717722 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagatttctaatgcctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 24717820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 29759498 - 29759429
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29759498 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 29759429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1485005 - 1484887
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  1485005 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 1484906  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  1484905 cacgtaggtcacagtgaat 1484887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 22007097 - 22007195
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22007097 ggtgtaaacatgaaagttatagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22007195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 13663129 - 13663198
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13663129 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 13663198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Original strand, 17150628 - 17150725
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17150628 gtgtaaacatgaaagttgcagataattatgttagctttctaatggctttggttggacttccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 17150725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Original strand, 18815608 - 18815683
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18815608 catgattgatgaattattatgtgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18815683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21513707 - 21513636
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21513707 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 21513636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 5852851 - 5852969
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  5852851 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 5852950  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5852951 cacgtaggtcacagtgaat 5852969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 14409003 - 14409121
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  14409003 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 14409102  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  14409103 cacgtaggtcacagtgaat 14409121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 167
Target Start/End: Original strand, 20045758 - 20045872
Alignment:
Q  53 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacg 152  Q
    |||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||||||    
T  20045758 taaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactgcacg 20045857  T
Q  153 taggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||| |||||    
T  20045858 taggtcacagtgaat 20045872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 223305 - 223414
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  223305 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 223404  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  223405 ttaaattact 223414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 272164 - 272273
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  272164 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 272263  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  272264 tcaaattact 272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 643685 - 643576
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  643685 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 643586  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  643585 tcaaattact 643576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 688076 - 688185
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  688076 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 688175  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  688176 ttaaattact 688185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 736928 - 737037
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  736928 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 737027  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  737028 ttaaattact 737037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 829491 - 829382
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  829491 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 829392  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  829391 tcaaattact 829382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 860823 - 860932
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  860823 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 860922  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  860923 ttaaattact 860932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22089373 - 22089482
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||| |  |||||||||||||||     
T  22089373 aattggcctttggtttaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatattaagaacttgagttatga 22089472  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22089473 tcaaattact 22089482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 38549935 - 38550000
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  38549935 catgattgatgaatttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38550000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 39114511 - 39114415
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  39114511 tgtaaacatgaaagttttagataattatgttagttttctaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcagattact 39114415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Original strand, 36733301 - 36733376
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  36733301 catgattgatgatttattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaagtattatatg 36733376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38988805 - 38988730
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  |||| |||||||||||| | |||||||    
T  38988805 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 38988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39019902 - 39019827
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||  |||| |||||||||||| | |||||||    
T  39019902 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgatgttcatgattgatgaattattatatg 39019827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 13425283 - 13425348
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  13425283 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 13425389 - 13425454
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  13425389 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13425454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 20982551 - 20982616
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20982551 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20982616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32810255 - 32810203
Alignment:
Q  188 ttagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  32810255 ttagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 32810203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 1326863 - 1326938
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || | | |||||||||||||||||| || |||||||    
T  1326863 atgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgcttttgtttatgattgatgaattggtatatgt 1326938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4483804 - 4483765
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4483804 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 4483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 250
Target Start/End: Original strand, 5083001 - 5083068
Alignment:
Q  183 atgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  5083001 atgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 5083068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14824299 - 14824260
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  14824299 tgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 14824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 147
Target Start/End: Original strand, 21493050 - 21493137
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||   || | |||||| |||||||    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21493050 gaaagttgaagatatggatgttagctttcatttgccattggttggacttcatttagatttatagaacttgagttatgatcaaaatact 21493137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18612002 - 18611952
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18612002 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18611952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39364188 - 39364118
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  39364188 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 39364118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 119
Target Start/End: Original strand, 44522814 - 44522884
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  44522814 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 44522884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 16401855 - 16401920
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16401855 catgattgatgaagtgttatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 16401920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18618899 - 18618830
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| | || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  18618899 tgttagctttctaatggctttggtttgccgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 18618830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 19936828 - 19936893
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  19936828 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgttcatgattgatgaa 19936893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22147046 - 22146977
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||  || | |||||||||| || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22147046 tgttagctttcttttggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 22146977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 52 - 109
Target Start/End: Original strand, 24678771 - 24678828
Alignment:
Q  52 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||   |||||||||||||    
T  24678771 gtaaacatgaaagttgtaggtatggaagttaaatttctaatgaatttggtttgacttc 24678828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44477099 - 44477018
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44477099 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44477018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 44480361 - 44480280
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  44480361 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 44480280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19866548 - 19866496
Alignment:
Q  53 taaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19866548 taaacatgaaagttgtaggtatgaaagttagatttctaatggctttggtttga 19866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 90)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 52872787 - 52873025
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52872787 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 52872886  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52872887 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 52872986  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52872987 tgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatg 52873025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 362628 - 362390
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  362628 atgaaaactggtattgattgatacaaaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttagtttgacttcaa 362529  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362528 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 362429  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  362428 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 14970421 - 14970660
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14970421 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14970520  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14970521 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 14970620  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14970621 tgaatacgatattgttcataattgatgaagtgttatatgt 14970660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3515455 - 3515216
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3515455 atgaaaactggtattgatcggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3515356  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3515355 aatgatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgtatgtatatttttg 3515256  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515255 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 3515216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15534629 - 15534390
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15534629 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15534530  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15534529 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 15534430  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15534429 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 15534390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 15118067 - 15118305
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15118067 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15118166  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15118167 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15118265  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15118266 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15118305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44615736 - 44615497
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44615736 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaatttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 44615637  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44615636 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttg 44615537  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44615536 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 44615497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 44772798 - 44773036
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44772798 atgaaaactggtatttattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 44772897  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||    
T  44772898 aaagatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatg-ttg 44772996  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  44772997 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 44773036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 15495888 - 15496126
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |    
T  15495888 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttaaattcga 15495987  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15495988 aaggttttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttc 15496087  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15496088 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 19617781 - 19618019
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  19617781 atgaaaactggtattgattggtacagagttggtcttaggtgttaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgctgttggtgtgacttcaa 19617880  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617881 aaggatttatagaagttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19617980  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19617981 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29267801 - 29267570
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29267801 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 29267702  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267701 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 29267602  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtg 243  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29267601 cgaatacgatattgtccatgattgatgaagtg 29267570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36038318 - 36038079
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36038318 atgaaaactggtattgattggtacagaattggccttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 36038219  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  36038218 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaagatatgtatgtatatatttg 36038119  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36038118 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 36038079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 49547488 - 49547727
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49547488 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 49547587  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49547588 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaagaattatttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 49547687  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49547688 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 49547727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 50222054 - 50222292
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50222054 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagatgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 50222153  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  50222154 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 50222252  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  50222253 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 50222292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 14746226 - 14746464
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  14746226 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaggacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgactttaa 14746325  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14746326 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatatatgtatatgtttg 14746425  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14746426 tgaatactattatgttcatgattgatgaagtgttatatg 14746464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19243146 - 19242909
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  19243146 gaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtataaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaa 19243047  T
Q  114 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 213  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19243046 cgatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 19242947  T
Q  214 aatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19242946 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19242909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 11969 - 12197
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11969 atgaaatctggtattgataggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatcaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12068  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12069 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 12168  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||  ||  || ||||||||||||||||||    
T  12169 tgtgtattatgttgtttatgattgatgaa 12197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52313009 - 52312782
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  52313009 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggttttacttcaa 52312910  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  52312909 aaggatttatagaacttgagttatagtc-aattactgcacgcaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 52312811  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52312810 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 52312782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19858026 - 19857798
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19858026 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19857927  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||    
T  19857926 aataatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttg 19857837  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19857836 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 249
Target Start/End: Original strand, 7640901 - 7641137
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  7640901 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccattggtttcacttcaa 7641000  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  7641001 aaggatttatagaacttgagttatagttaaattactgcctgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttg 7641099  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatat 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7641100 tgaatacgatatttttcatgattgatgaagtgttatat 7641137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14049025 - 14048786
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14049025 atgaaaactagtattgattggtacataattggttttaggtgtaaacatgaaagttgtgggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14048926  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  14048925 aaggatttacagaacttgtgttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgataaattaatatatgtatgtatatgtttg 14048826  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  14048825 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgt 14048786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 198
Target Start/End: Original strand, 1837234 - 1837420
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  1837234 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttaaa 1837333  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgt 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1837334 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgt 1837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 362821 - 362674
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  362821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacatcaa 362722  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362721 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 362674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 52872594 - 52872749
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| ||||    
T  52872594 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattctgttggtctgacgtcaa 52872693  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52872694 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 14746033 - 14746176
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14746033 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 14746132  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 155  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746133 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 14746176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19858219 - 19858064
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19858219 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgcaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 19858120  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19858119 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 19858064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 14970228 - 14970383
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14970228 atgaaaactggtattgatttgtacacaattggtcttaggtgataacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 14970327  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14970328 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14970383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 18214725 - 18214880
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  18214725 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 18214824  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18214825 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 18214880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 19617588 - 19617743
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||    
T  19617588 atgaaatctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtagacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctaacgccaa 19617687  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19617688 aatgatttattgaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19617743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 363006 - 362859
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  363006 tggtattgatttgtatagaattggtcttaggtgtaaacccgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaaagattt 362907  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  362906 atagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 362859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3515648 - 3515493
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||    
T  3515648 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggcgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctcacgtcaa 3515549  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3515548 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3515493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 18214992 - 18215121
Alignment:
Q  121 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  18214992 tagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttattaatacga 18215091  T
Q  221 tattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18215092 tattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52313395 - 52313240
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  52313395 atgaaatctggtattgataggtcaagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 52313296  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52313295 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 15495716 - 15495850
Alignment:
Q  33 tacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagt 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  15495716 tacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacttgagt 15495815  T
Q  133 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15495816 tatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15495850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52313202 - 52313047
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  52313202 atgaaatctggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgcctttggtatgacgtcaa 52313103  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52313102 aacgatttatagaacttgatttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 52313047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 57 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14185731 - 14185621
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14185731 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgaacgtagg 14185632  T
Q  157 tcacaatgaat 167  Q
    ||||| |||||    
T  14185631 tcacagtgaat 14185621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30147363 - 30147189
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |  ||   |||| | ||||| ||||  |||    
T  30147363 atgaaaaatggaattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaagtatggatataaaattaaaaatgacattggtatgacaacaa 30147264  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatga 186  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30147263 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatga 30147189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 250
Target Start/End: Original strand, 15355068 - 15355171
Alignment:
Q  147 tgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgtta 246  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15355068 tgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtta 15355167  T
Q  247 tatg 250  Q
    ||||    
T  15355168 tatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 128 - 251
Target Start/End: Original strand, 18239250 - 18239372
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 227  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  18239250 tgagttattgtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaatttttgaatatgattgatgaatgagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtc 18239348  T
Q  228 tatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18239349 catgattgatgaagtgttatatgt 18239372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 22725284 - 22725401
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22725284 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctaatc-cgttggtttgacatcaaaatgatttataggacttgagttatggtcaaattactg 22725382  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22725383 cacgtaggtcacactgaat 22725401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 12186 - 12260
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12186 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 12260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 18215153 - 18215227
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18215153 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18215227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 19857766 - 19857700
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagt 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19857766 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 19857700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Original strand, 12778397 - 12778460
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 75  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12778397 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatg 12778460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 15355203 - 15355277
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  15355203 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 15355277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 52312793 - 52312719
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  52312793 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgt 52312719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14951367 - 14951270
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14951367 gtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 14951270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 14746496 - 14746570
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14746496 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14746570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 15496950 - 15497024
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15496950 atgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15497024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 19618051 - 19618125
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19618051 atgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19618125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 52873057 - 52873131
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  52873057 atgattgatgaattaatatacgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 52873131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14995753 - 14995644
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  14995753 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatgtcgttggtttgaggtctaaatgatttttagaacttgagttatga 14995654  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  14995653 tcaaattact 14995644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 161
Target Start/End: Original strand, 14745925 - 14745989
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745925 ttggtctgacgtcaaaacgatttatagcacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 14745989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Original strand, 55377197 - 55377293
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  55377197 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 55377293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14185580 - 14185477
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |  ||||||||||| | || | ||||| |||||| ||||     
T  14185580 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgttaacatgaaagttgtagataagtgtgttagctttccagtggctttggtgtgacttgaaaat 14185481  T
Q  115 gatt 118  Q
    ||||    
T  14185480 gatt 14185477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 25120046 - 25120144
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  25120046 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 25120144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 43281694 - 43281795
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||| |||| |||| ||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  43281694 ttaggtgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggctatggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 43281793  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  43281794 ct 43281795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Original strand, 18214918 - 18214965
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18214918 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacac 18214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 15117911 - 15118029
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15117911 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15118010  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15118011 cacgtaggtcacagtgaat 15118029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 18293667 - 18293765
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18293667 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagatttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 18293765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18247848 - 18247739
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  18247848 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18247749  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  18247748 ttaaattact 18247739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 47357292 - 47357183
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  47357292 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggccttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 47357193  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  47357192 ttaaattact 47357183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 15287859 - 15287966
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15287859 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15287958  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  15287959 tcaaatta 15287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 15294969 - 15295076
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  15294969 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 15295068  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  15295069 tcaaatta 15295076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 5683367 - 5683465
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  5683367 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttccaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 5683465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9198658 - 9198544
Alignment:
Q  45 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  9198658 cttagttgtaaacatgaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtcttacttcaaaatgatttctacaacttgatttatggtcaaatt 9198559  T
Q  145 actgcacgtaggtca 159  Q
    | | |||||| ||||    
T  9198558 aatacacgtatgtca 9198544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 22355071 - 22355169
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22355071 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22355169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10643855 - 10643746
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| ||   |||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  10643855 aattggactttggtgcaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaatggttttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagatatga 10643756  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  10643755 ttaaattact 10643746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16731785 - 16731688
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 135  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||    
T  16731785 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctctctaatggctttggtttgacttccaaatgattttttgaacttgagttat 16731688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Original strand, 19617997 - 19618073
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  19617997 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgt 19618073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 7640745 - 7640863
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    ||||||||||| |||||||||    
T  7640745 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggttaaattactg 7640844  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  7640845 cacgtaggtcacagtgaat 7640863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 362412 - 362347
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  362412 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 362347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 14746442 - 14746507
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14746442 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 14746507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 15355149 - 15355214
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15355149 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 15355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 17146320 - 17146389
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  17146320 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 17146389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18168362 - 18168293
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  18168362 tgttagctttctaatggcgttgatttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 18168293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19020118 - 19020009
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||||   |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  19020118 aattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggttttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19020019  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  19020018 ttaaattact 19020009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19857820 - 19857755
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19857820 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19857755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 167
Target Start/End: Original strand, 44772723 - 44772760
Alignment:
Q  130 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44772723 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 44772760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 59
Target Start/End: Original strand, 15489677 - 15489717
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac 59  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15489677 ctggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacac 15489717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 362336 - 362294
Alignment:
Q  209 ttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  362336 ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 362294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Original strand, 19698032 - 19698082
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19698032 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19698082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 147
Target Start/End: Original strand, 19708617 - 19708667
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19708617 ttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19708667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 630280 - 630361
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  630280 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgactttggtttgacttgaaaatgattt 630361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8374149 - 8374040
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||| | ||| ||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8374149 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttaactttctaatggctttgattttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 8374050  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  8374049 ttaaattact 8374040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 18215099 - 18215164
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  18215099 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagcatgatgttgtttatgattgatgaa 18215164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 87
Target Start/End: Original strand, 18218875 - 18218912
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttt 87  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  18218875 gtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagcttt 18218912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 52873003 - 52873068
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||  |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  52873003 catgattgatgatgtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 52873068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8808394 - 8808350
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8808394 ggtgtaaacatgaaaattgtaggtatggatgttatctttccaatg 8808350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 11557936 - 11557892
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11557936 ggtgtaaacattcaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 11557892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 17516878 - 17517117
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17516878 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17516977  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17516978 aaggatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 17517077  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17517078 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 17517117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 20901635 - 20901873
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20901635 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 20901734  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901735 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 20901834  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20901835 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 2154346 - 2154585
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2154346 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2154445  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154446 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 2154545  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  2154546 tgaatacgatactgtccatgattgatgaagtgttatatgt 2154585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38619881 - 38619645
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  38619881 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 38619782  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619781 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 38619682  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38619681 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 38619645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20909459 - 20909221
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20909459 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20909360  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20909359 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 20909261  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20909260 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20909221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39363832 - 39363593
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  39363832 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttgatttgacttcaa 39363733  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39363732 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacactgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 39363633  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39363632 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 39363593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 10732655 - 10732893
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10732655 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10732754  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  10732755 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 10732853  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10732854 tgaatacgattttgtccatgattgatgaagtgttatatgt 10732893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39245583 - 39245345
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39245583 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39245484  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  39245483 aaggatttatagaacttgatttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 39245385  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39245384 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 39245345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 264483 - 264721
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  264483 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 264582  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  264583 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 264681  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  264682 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 264721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 20917561 - 20917789
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20917561 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20917660  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  20917661 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaagtcacggtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 20917760  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20917761 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20917789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23064958 - 23064722
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  23064958 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttagatataaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctagtgccgttcgtttgacttcaaaag 23064859  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064858 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 23064759  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  23064758 atacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 23064722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 37804617 - 37804856
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37804617 atgaaaactggcattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 37804716  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  37804717 aaggatttataaaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 37804816  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||    
T  37804817 tgaatacgatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgt 37804856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 32027893 - 32027665
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  32027893 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 32027794  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  32027793 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 32027694  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  32027693 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 32027665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 42245080 - 42245318
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42245080 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 42245179  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    | ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  42245180 atggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 42245278  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42245279 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 42245318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29346427 - 29346189
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29346427 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29346328  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  29346327 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29346229  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29346228 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29346189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29348900 - 29348662
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29348900 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29348801  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  29348800 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29348702  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29348701 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29348662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29351373 - 29351135
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29351373 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttcaaatgccgttggtttgacttcaa 29351274  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  29351273 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 29351175  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29351174 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29351135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29330427 - 29330203
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  29330427 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgctgttggtttgatttcaaaag 29330328  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  29330327 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaa-aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttacga 29330229  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
     || ||| ||||||||||||||||||    
T  29330228 gtatgatgttgtttatgattgatgaa 29330203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9776780 - 9776567
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9776780 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagctatgg 9776681  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  9776680 tcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattggt 9776581  T
Q  238 gaagtgttatatgt 251  Q
    |||| |||||||||    
T  9776580 gaagggttatatgt 9776567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 20901442 - 20901597
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  20901442 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtatggatgtcagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 20901541  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20901542 aacgatttatagaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 20901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 17516492 - 17516647
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  17516492 atgaaaaccggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 17516591  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17516592 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaat 17516647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 295989 - 296144
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  295989 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgacgttggtctgacgtcaa 296088  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  296089 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacactgaat 296144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 17516685 - 17516840
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17516685 atgaaaaatggtattgattggcacagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 17516784  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17516785 aaagatttatagaacttgagttatcgtcgaattactgcacataggtcacagtgaat 17516840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32028666 - 32028519
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  32028666 atgaaatctggtattgataggtcaaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcgttggtctgacatcaa 32028567  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028566 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32028519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Original strand, 2154153 - 2154301
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  2154153 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttttaatgtcgttggtctgacgtcaa 2154252  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2154253 aacgatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacgtatgtcac 2154301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32028280 - 32028132
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgg-tttgacttca 110  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  32028280 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttgacgtca 32028181  T
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028180 aaacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 32028132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028473 - 32028318
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||    
T  32028473 atgaaaactggtattgattggtacagaattggttttaggtgaaaacacgaaagttgtaggtatatatgttagctttctagtgctgttggtctgacgtcaa 32028374  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32028373 aacaatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 32028318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 20917368 - 20917523
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||    
T  20917368 atgaaatcaggtattgataggtccataattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaa 20917467  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20917468 aatcatttataaaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacaatgaat 20917523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29330623 - 29330468
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||    
T  29330623 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaggccgttggtctgacgtcaa 29330524  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  29330523 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattaatgcacgtatgtcacagtgaat 29330468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 295796 - 295951
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||  || |  ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  295796 atgaaatctggtattgataagtccggaataggtcttaggtgtaaccatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttgatctgacatcaa 295895  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  295896 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 295951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32028086 - 32027931
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||    
T  32028086 atgaaaattgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaaattgtatttatggatgttagctttctaatgccattggtcggacgtcaa 32027987  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027986 aacgatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcacaatgaat 32027931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 20901905 - 20901980
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20901905 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20901980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29330214 - 29330140
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29330214 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29330140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32027676 - 32027602
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32027676 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32027602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 20917831 - 20917905
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20917831 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatcttgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20917905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 27183180 - 27183278
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27183180 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 27183278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22883904 - 22884013
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  22883904 aattggccttgggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgttcaaatgatttttagaacttgagttatga 22884003  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22884004 tcaaattact 22884013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 43444009 - 43444118
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  43444009 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 43444108  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  43444109 ttaaattact 43444118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12012 - 11903
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  12012 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 11913  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  11912 ttaaattact 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1220384 - 1220453
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1220384 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1220453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 10778832 - 10778901
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  10778832 tgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 10778901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25426286 - 25426177
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  25426286 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 25426187  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  25426186 ttaaattact 25426177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Original strand, 20917778 - 20917842
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  20917778 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtattatgttgtttatgattgatgaa 20917842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7424986 - 7424879
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  7424986 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 7424887  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  7424886 tcaaatta 7424879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 179 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18744036 - 18743965
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18744036 attgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaagtattatatg 18743965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 264327 - 264445
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  264327 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtgccgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 264426  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  264427 cacgtaggtcacagtgaat 264445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 1628169 - 1628243
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1628169 atgattgatgaactattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttaatgattgatgaagtattatatg 1628243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20909615 - 20909497
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20909615 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20909516  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20909515 cacgtaggtcacagtgaat 20909497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11342287 - 11342190
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  11342287 gtgtaaacatgaaagttgtagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 11342190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 21933243 - 21933352
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  21933243 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21933342  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  21933343 tcaaattact 21933352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 21939413 - 21939522
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  21939413 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 21939512  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  21939513 tcaaattact 21939522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22367095 - 22367204
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||| ||||     
T  22367095 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaaaacttgagatatga 22367194  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  22367195 ttaaattact 22367204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 35581449 - 35581340
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  35581449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 35581350  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  35581349 tcaaattact 35581340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 36990639 - 36990748
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  36990639 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 36990738  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  36990739 tcaaattact 36990748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23511195 - 23511127
Alignment:
Q  79 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23511195 gttagctttttaatggctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 23511127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39245660 - 39245621
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39245660 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39245621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39363908 - 39363869
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39363908 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39363869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23065117 - 23064999
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    |||||||||||| ||||||||    
T  23065117 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtccaattactg 23065018  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23065017 cacgtaggtcacagtgaat 23064999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38619960 - 38619922
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38619960 tgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacaatgaa 38619922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1168832 - 1168901
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||||    
T  1168832 tgttagctttctaatggctttggtttggcttccaaatgattttttggacttgagttatgatcaaattact 1168901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 11212734 - 11212803
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11212734 tgttagctttcttatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11212803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 18778606 - 18778715
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||| ||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  18778606 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagatttctaatggctttggttttacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 18778705  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  18778706 ttaaattact 18778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 20901851 - 20901916
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20901851 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20901916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 21074249 - 21074318
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21074249 tgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21074318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 250
Target Start/End: Original strand, 21399896 - 21399968
Alignment:
Q  178 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  21399896 gattgatgaattattatatgaatgtatatgttaatgaatatgatgttgttcatggttgatgaattattatatg 21399968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22755270 - 22755214
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||  |||||||||    
T  22755270 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatggatgttagctttcatatgtatttggtttga 22755214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24067325 - 24067282
Alignment:
Q  174 acatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  24067325 acatgattgatgaattattatatgaatgtatatgtttatgaata 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31479034 - 31478959
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttataga 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  31479034 ggtgtaaacatgaaagttttagataaagatgttagctttataatgactttggtttgacttaaaaagaatttttaga 31478959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 19499526 - 19499428
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||  | |||||||||| || ||| || || ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  19499526 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatagctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagatatgattaaattact 19499428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 32950283 - 32950213
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| |||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32950283 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaatgtgagttatgatcaaattact 32950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 35791736 - 35791834
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| |  |||  |||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35791736 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgttcaaataatttttagaacttgagatatgattaaattact 35791834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 19511862 - 19511781
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  19511862 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 19511781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 107
Target Start/End: Original strand, 37804450 - 37804519
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| |||| | || ||||||||    
T  37804450 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataatgttgttagctttccaatggctttagtttgact 37804519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28901555 - 28901495
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 138  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28901555 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28901495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 28937950 - 28937890
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 138  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28937950 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 28937890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 89)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 30676424 - 30676663
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30676424 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 30676523  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676524 aataatttatagaacttgagttatggtaaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30676623  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30676624 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 30676663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34963821 - 34963582
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963821 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 34963722  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963721 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 34963622  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963621 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 34963582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1598504 - 1598266
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1598504 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 1598405  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1598404 aaggatttatagaacttgagtcatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 1598306  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1598305 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8055477 - 8055238
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8055477 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 8055378  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055377 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8055278  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8055277 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 18334307 - 18334545
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18334307 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18334406  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18334407 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18334505  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18334506 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18334545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24422994 - 24422756
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24422994 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24422895  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24422894 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24422796  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24422795 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24422756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33862241 - 33862003
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33862241 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33862142  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33862141 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 33862043  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33862042 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 33862003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33864725 - 33864487
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33864725 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 33864626  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  33864625 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 33864527  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33864526 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 33864487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18914380 - 18914142
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||    
T  18914380 atgaaaactggtatttattggtacataattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgctgttggtttaacttcaa 18914281  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914280 aaggatgtatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 18914181  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18914180 taaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 19847686 - 19847921
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19847686 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgc----tagatttctaatgccgttggtttgacttcaa 19847781  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847782 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 19847881  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19847882 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19847921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 31630255 - 31630493
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31630255 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaatttgtaggtatagacgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 31630354  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630355 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcacgtatgtcacaatgaataattaaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 31630454  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31630455 tgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 31630493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 251
Target Start/End: Original strand, 17377576 - 17377801
Alignment:
Q  26 tgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaa 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17377576 tgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaaaagtatttatagaa 17377675  T
Q  126 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17377676 cttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaaatagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattg 17377775  T
Q  226 tttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  17377776 ttcatgattgatgaagtgttatatgt 17377801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12742765 - 12742526
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12742765 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12742666  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742665 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcaagtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 12742566  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12742565 tgaatacgaccttgtccatgattgatgaagtgttatatgt 12742526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 26924355 - 26924593
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26924355 atgaaaactagtattgattggtacagaattgttcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26924454  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26924455 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtacgtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 26924553  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26924554 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 26924593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19005599 - 19005361
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005599 atgaaaactggtattgattggtacataattagtcttaggtgtaaacacaaaaattgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 19005500  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19005499 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattactataggtatgtatatgtttg 19005400  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  19005399 tgaatgcgatattgttcataattgatgaaatgttatatg 19005361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25535855 - 25535641
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535855 atgaaaactggtattgattggtagagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 25535756  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25535755 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 25535656  T
Q  212 tgaatacgatattgt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  25535655 tgaatacgatattgt 25535641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 1540630 - 1540864
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1540630 aaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaagg 1540729  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1540730 atttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaa 1540828  T
Q  216 tacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1540829 tacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1540864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 28289051 - 28289288
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289051 atgaaaactggtattgattggtacataattggtctcaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 28289150  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28289151 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 28289250  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28289251 tga--gcgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 28289288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 2290895 - 2291133
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2290895 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 2290994  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  2290995 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 2291093  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2291094 tgaatacgatattgtccatgactgatgaagtgttatatgt 2291133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25688947 - 25688711
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25688947 aaaactggtatttattggtaccgaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttgtaatgccgttggtttgacttcaaaag 25688848  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688847 gatttataaaaattgagttatggtcaaattactgcacgtaggtgacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatttttgtga 25688748  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  25688747 atacgatattgtccatgattgaggaagtgttatatgt 25688711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23992870 - 23992632
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  23992870 atgaaatccggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtcagctttctaatgttgttggtctgacgtcaa 23992771  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23992770 aacgatttatagaacttgagttatggtcaatttactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 23992672  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23992671 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23992632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 19858637 - 19858872
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19858637 atgaaaactggtattgattggtacataattgatcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgt---ctttctaatgccgttggtttgacttcaa 19858733  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||    
T  19858734 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ctg 19858832  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19858833 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 19858872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22782674 - 22782436
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22782674 atgaaaaatggtattaattggtacagaattggtcttaggtgtaagtaggaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22782575  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22782574 aagaatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 22782476  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22782475 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22782436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12942637 - 12942410
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942637 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta------------agctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 12942550  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12942549 aaggatttatagaacttgagttatggtcgaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 12942450  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12942449 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 12942410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 1879 - 2034
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 1978  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1979 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 8838 - 8993
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8838 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtacacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 8937  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8938 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1598697 - 1598542
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1598697 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 1598598  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598597 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19005784 - 19005637
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19005784 tggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacttcaaaacgattt 19005685  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19005684 atagaacttgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19005637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 19847493 - 19847648
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||| ||||    
T  19847493 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcctaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattagtctgacgtcaa 19847592  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19847593 aacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 19847648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27557170 - 27557023
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| | ||    
T  27557170 atgaaaactgctattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgttaa 27557071  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27557070 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 27557023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 26924162 - 26924311
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26924162 atgaaaactggtattgattggtacagaattagcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 26924261  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924262 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 26924311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23415412 - 23415264
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  23415412 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccattggtctgacgtcaa 23415313  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23415312 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcac 23415264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18914567 - 18914424
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  18914567 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaataccgttggtctgaagtcaaaacgat 18914468  T
Q  118 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18914467 tgatagaacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtcaca 18914424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25689143 - 25688996
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||    
T  25689143 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaa 25689044  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25689043 aaaaatttatagaacttgcgttatggtcatattactgcacgtaggtca 25688996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 30676231 - 30676386
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||    
T  30676231 atgaaaactggtattgaatggtacataattggtcttaggtgataagactaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttgctctgacgtcaa 30676330  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30676331 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30676386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 31630062 - 31630211
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  31630062 atgaaatctggtattgataagtacatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 31630161  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  31630162 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacatgtatgtcaca 31630211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 87 - 234
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  87 atgaaaactggtattgagttgtacaaaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgaaggtatggatgttagttttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 186  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  187 aacgatttatataacttgagttatggtcaaagtactgcacgtaggtca 234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18914766 - 18914617
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18914766 atgaaatctggtattgataagtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagatttctaatgtcgttggtctgacatcaa 18914667  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914666 aaaaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 18914617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Original strand, 15892123 - 15892231
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15892123 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15892222  T
Q  112 aaggattta 120  Q
    |||||||||    
T  15892223 aaggattta 15892231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1598890 - 1598735
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | ||    
T  1598890 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcataagtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgacgttaa 1598791  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1598790 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1598735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25689310 - 25689189
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25689310 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtgtggatgtcagcattctaatgacgttggtctgacatcaaaacaatttatagaacttgagttatgg 25689211  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  25689210 tcaaattactgcacgtaggtca 25689189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 48 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25737247 - 25737128
Alignment:
Q  48 aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  25737247 aggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatttatagaacatgagttatggtcatattact 25737148  T
Q  148 gcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  25737147 gcatgtaggtcacagtgaat 25737128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 105
Target Start/End: Original strand, 17883212 - 17883305
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17883212 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcattctaatgtcgttggtttga 17883305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15875737 - 15875621
Alignment:
Q  124 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatat 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||    
T  15875737 aacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtaaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttgtgaatacgatat 15875648  T
Q  224 tgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15875647 tgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 31630525 - 31630600
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31630525 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 31630600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 22981321 - 22981416
Alignment:
Q  72 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22981321 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 22981416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23807087 - 23806992
Alignment:
Q  72 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23807087 tatggatgttagctttctaatgccgttggtcgggcgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23806992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18914110 - 18914036
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18914110 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttatgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18914036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19005329 - 19005255
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  19005329 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaaatgttatatgt 19005255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25737090 - 25737028
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25737090 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtat 25737028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15875589 - 15875515
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  15875589 atgattgatgaattattatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgt 15875515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 9031 - 9085
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 66  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9031 atgaaaactggtaatgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 9085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 19984130 - 19984228
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19984130 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatgactttggtttgacctccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 19984228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 16240405 - 16240296
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||| ||||||||||||     
T  16240405 aattggacttcggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttaggacttgagttatga 16240306  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16240305 tcaaattact 16240296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16556945 - 16557054
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16556945 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16557044  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16557045 tcaaattact 16557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16633501 - 16633610
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  16633501 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 16633600  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16633601 tcaaattact 16633610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16650175 - 16650284
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||     
T  16650175 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgaattttagaacttgagttatga 16650274  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16650275 tcaaattact 16650284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 18334151 - 18334269
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18334151 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18334250  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  18334251 cacgtaggtcacagtgaat 18334269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24423150 - 24423032
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  24423150 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 24423051  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  24423050 cacgtaggtcacagtgaat 24423032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25904584 - 25904474
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatg 136  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| ||||||||||||||||    
T  25904584 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatg 25904485  T
Q  137 gtcaaattact 147  Q
     ||||||||||    
T  25904484 atcaaattact 25904474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 35016015 - 35016113
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35016015 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttgctttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 35016113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 27654597 - 27654706
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  27654597 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 27654696  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  27654697 ttaaattact 27654706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 22226580 - 22226679
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagga-tttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22226580 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttttagaacttgagttatgatcaaattact 22226679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25656897 - 25656838
Alignment:
Q  192 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  25656897 tatatgtatgtatatatttgtgactacgatattgtccaagattgatgaagtgttatatgt 25656838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 21776107 - 21776205
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  21776107 ggtgtaaacatgaaagttgtagataactttgttagctttctaatggctttggtttgacgccaaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 21776205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33864881 - 33864763
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  33864881 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 33864782  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  33864781 cacgtaggtcacagtgaat 33864763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 10488080 - 10487971
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  10488080 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 10487981  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  10487980 tcaaattact 10487971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16377248 - 16377357
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  16377248 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16377347  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16377348 tcaaattact 16377357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16384572 - 16384681
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  16384572 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 16384671  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  16384672 tcaaattact 16384681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 16826368 - 16826477
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||  |    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  16826368 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagacaattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 16826467  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  16826468 ttaaattact 16826477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Original strand, 22593590 - 22593691
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||||||   ||||||||||||||||||   || |||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  22593590 ttaggtgttaacataaaaattgtaggttaagatgttagctttctaatggatttagtttgacttccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaatta 22593689  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  22593690 ct 22593691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 10905416 - 10905460
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10905416 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatg 10905460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15875643 - 15875567
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15875643 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaattattatatgt 15875567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19609689 - 19609582
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || |||  |||| ||||||||||| ||||     
T  19609689 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtccaaataatttttagaacttgagatatga 19609590  T
Q  138 tcaaatta 145  Q
    ||||||||    
T  19609589 tcaaatta 19609582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 35056782 - 35056707
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| || ||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  35056782 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgattatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 35056707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1555596 - 1555527
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  1555596 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 1555527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18914164 - 18914099
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  18914164 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 18914099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 33315116 - 33315185
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  33315116 tgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 33315185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 2290818 - 2290857
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2290818 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 2290857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22782751 - 22782712
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  22782751 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 22782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 26924085 - 26924124
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26924085 tgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 26924124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32259137 - 32259078
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgatt 234  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||    
T  32259137 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgatt 32259078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 136
Target Start/End: Original strand, 16133087 - 16133145
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatg 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   ||||||||||    
T  16133087 tgttagctttccaatgtcgttggtttgacttgaaaatgatttttagtttttgagttatg 16133145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 18455449 - 18455530
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||    
T  18455449 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtaggtaattgtgttagctttccagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 18455530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19005379 - 19005318
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19005379 attgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 19005318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 25175221 - 25175112
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||  ||||| ||||     
T  25175221 aattggactttggtgtaaacatcaaagttgtagataattttgttagctttctaatggcattggtttgacgtccaaatgatttttagatattgagatatga 25175122  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  25175121 ttaaattact 25175112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 31630471 - 31630536
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||| || |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  31630471 catgattgataaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 31630536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Original strand, 22981454 - 22981486
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22981454 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 22981486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 23806954 - 23806922
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23806954 atgaaaactggtattgattggtacagaattggt 23806922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 104)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46822709 - 46822470
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46822709 atgaaaagtggtattgattggtaaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 46822610  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822609 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 46822510  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46822509 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 46822470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 53301221 - 53301457
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53301221 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 53301320  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301321 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 53301420  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  53301421 atacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgt 53301457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Original strand, 12119371 - 12119606
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  12119371 aaaactggtattgatcagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaaaag 12119470  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119471 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 12119570  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12119571 atacgatattgttcatgattgatgaagtattatatg 12119606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13436747 - 13436520
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13436747 atgaaaacttgtattgattggtacataattggtcttaggtataaatacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13436648  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13436647 aaggatttatagaacttgagttatggtccaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatatatatgtttg 13436548  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatga 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13436547 tgaatacgatattgttcatgattgatga 13436520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17463625 - 17463387
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17463625 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17463526  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17463525 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 17463427  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17463426 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 17463387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27165700 - 27165461
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27165700 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatggatcttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 27165601  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165600 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27165501  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27165500 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27165461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34159773 - 34159535
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34159773 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 34159674  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  34159673 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 34159575  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34159574 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 34159535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 45606621 - 45606860
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45606621 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 45606720  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606721 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaatgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 45606820  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45606821 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 45606860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54521270 - 54521031
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54521270 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtgggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 54521171  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  54521170 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 54521071  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  54521070 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 54521031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15412879 - 15412640
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  15412879 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 15412780  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412779 aaggatttatagaacttgatttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgtataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15412680  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15412679 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 15412640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 7781061 - 7781300
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7781061 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaacgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 7781160  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781161 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacataggtcacagtgaataattgattatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 7781260  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7781261 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 7781300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8499968 - 8499729
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8499968 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatatggaagttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 8499869  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499868 aaggatttatagaacttgagttatggtgaaattacggaacataggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 8499769  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  8499768 tgaatacgatattgtccatgattaatgaagttttatatgt 8499729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10557356 - 10557117
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  10557356 atgaaaactggtattgattggtaaataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttagttttacttcaa 10557257  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10557256 aaggatttatagaacttgagttatggtcagattactgcacataggtcactgtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 10557157  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  10557156 tgaattcgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 10557117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13544471 - 13544234
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13544471 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13544372  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13544371 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaa-tactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 13544274  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13544273 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 13544234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15977980 - 15977742
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15977980 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15977881  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15977880 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15977782  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  15977781 tgaatacgatattgtccatgattgataaagtgttatatgt 15977742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 55476935 - 55476700
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55476935 aaaactggtattgactggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 55476836  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  55476835 gatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtga 55476737  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  55476736 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 55476700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 6468849 - 6469087
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6468849 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttggaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6468948  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6468949 aagaatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 6469047  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6469048 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 6469087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12568007 - 12567769
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12568007 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 12567908  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12567907 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 12567809  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12567808 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 12567769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16453995 - 16454234
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16453995 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16454094  T
Q  112 aa-ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 210  Q
    || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  16454095 aatggatttatagaactatagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-tt 16454193  T
Q  211 gtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16454194 gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16454234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 13153970 - 13154208
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13153970 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13154069  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13154070 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 13154168  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13154169 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 13154208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 7 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 41124392 - 41124159
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 106  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  41124392 gtgaaatgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttgatttgac 41124293  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatat 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  41124292 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaactagtatatgaatgtatat 41124193  T
Q  207 gtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  41124192 gtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 29544556 - 29544795
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29544556 atgaaaactgttattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgatttcaa 29544655  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  29544656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatctatatatttg 29544755  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    | || | ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29544756 ttaaaatgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 29544795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 16282472 - 16282701
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||    
T  16282472 atgaaaactagtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgccattggtttgacttcaa 16282571  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16282572 aaggatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 16282671  T
Q  212 tgaatacgatattg-tttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||| |||||||||||||||    
T  16282672 tgagtatgatgttgttttatgattgatgaa 16282701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 38961552 - 38961781
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtc-gttggtttgacttca 110  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  38961552 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagccttctaatggccgttggtttgacttca 38961651  T
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38961652 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 38961751  T
Q  211 gtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
     ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  38961752 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38961781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 17444478 - 17444706
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 17444577  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  17444578 aaggatttattgaacttgagttatagtcaaatttttgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 17444677  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17444678 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 17444706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24514124 - 24513910
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24514124 atgaaatctggtattgatagctccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 24514025  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24514024 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24513925  T
Q  212 tgaatacgatattgt 226  Q
    ||||||| |||||||    
T  24513924 tgaatactatattgt 24513910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 10247438 - 10247676
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10247438 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10247537  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||    
T  10247538 aatgatttatagaacttgatttatactcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgatggatcaactagtatatgaatgtatatg-ttg 10247636  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10247637 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 10247676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25237291 - 25237063
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||    
T  25237291 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25237192  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25237191 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 25237092  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  25237091 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25237063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 13151505 - 13151743
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13151505 atgaaaactggtattgattggaacagaattggtcataggtgtaaacacgaaagttttaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 13151604  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||    
T  13151605 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaaggtatatg-ttg 13151703  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||    
T  13151704 tgaatacgatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgt 13151743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 20629906 - 20630138
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20629906 atgaaaacttgtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20630005  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgat----tgatgaattagtatatgtatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    ||||||| |  ||| || |||||||||    
T  20630006 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattgatgaagtgttatctgaatgtatatg 20630105  T
Q  208 tttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  20630106 tttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 20630138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 28848336 - 28848564
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28848336 atgaaaactggtattgattggtactgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28848435  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||    
T  28848436 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttg 28848524  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  28848525 tgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgt 28848564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 25229704 - 25229476
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||  |||| |||||||    
T  25229704 atgaaaattggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgttggtatgaatgttaggtttctaatgccgtgtgtttaacttcaa 25229605  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  25229604 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 25229505  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  25229504 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 25229476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10379772 - 10379613
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  10379772 aaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaac 10379673  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaa 174  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10379672 aatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaa 10379613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46822902 - 46822747
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  46822902 atgaaaactggtattgattgctacataattggtcttaggtgtaaacacggaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 46822803  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822802 aacgatttataaaacttgagttatcgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 46822747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 89 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12305516 - 12305354
Alignment:
Q  89 taatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaat 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   |||||||||||||    
T  12305516 taatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaat 12305417  T
Q  189 tagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12305416 taatatatgtatgtatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 12305354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41124580 - 41124425
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41124580 atgaaaactggtattgattggtaaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41124481  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41124480 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41124425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 55319018 - 55319173
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  55319018 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 55319117  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  55319118 aacgatttatagaacttgaattatggtcaaattactgcacgtaagtcacagtgaat 55319173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15465602 - 15465448
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  15465602 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 15465503  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15465502 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 15465448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 53301035 - 53301180
Alignment:
Q  22 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat 121  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  53301035 gtattgatcggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttat 53301134  T
Q  122 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  53301135 agaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaat 53301180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 26054981 - 26055133
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||    
T  26054981 gaaaattggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtctgacgtcaaaa 26055080  T
Q  114 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26055081 cgatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 26055133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27165890 - 27165738
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  27165890 aaaactagtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 27165791  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27165790 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 27165738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10557541 - 10557394
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||    
T  10557541 tggtattgattggtacagaattggtcttagttgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtcggacgtcaaaacgattt 10557442  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10557441 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10557394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 38961367 - 38961514
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  38961367 tggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgattt 38961466  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38961467 atagaacttgagttatggtcaaattgctgcacgtaggtcacagtgaat 38961514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5223831 - 5223677
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  5223831 atgaaaactggtattgattggtacagaattcgtcttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 5223732  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  5223731 aacgatttatagaacttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaa 5223677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 55318825 - 55318980
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  55318825 atgaaatctggtattgataggtccagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatggtagctttctaatgccgttggtatgacatcaa 55318924  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  55318925 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcgcagtgaat 55318980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 156
Target Start/End: Original strand, 13937494 - 13937638
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  13937494 atgaaatctggtattgataggacaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 13937593  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13937594 aacgatttatagaacttgtgttatggtcaaattactgcacgtagg 13937638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 20629713 - 20629860
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  20629713 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttataggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacattaa 20629812  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629813 agcgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 20629860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8500158 - 8500012
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||     
T  8500158 aaaactggtattgatcgatatagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaac 8500059  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8500058 gatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcaca 8500012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 14567432 - 14567561
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14567432 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctaacatcaaaaggatttatagaacttgagttatag 14567531  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14567532 tcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 14567561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 16282279 - 16282434
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| || |||  ||||    
T  16282279 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttatctttttaatgttgttagtctgatgtcaa 16282378  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282379 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 16282434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 17444285 - 17444432
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||    
T  17444285 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaagtatggatgttatctttctaatgtcgttggtctaacgtcaa 17444384  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17444385 aacaatttatacaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtca 17444432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 46 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 36528569 - 36528447
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528569 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaatta 36528470  T
Q  146 ctgcacgtaggtcacaatgaata 168  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  36528469 ctgcacgtaggtcatagtgaata 36528447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 57 - 167
Target Start/End: Original strand, 16358234 - 16358344
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16358234 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaacggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcgcatagg 16358333  T
Q  157 tcacaatgaat 167  Q
    ||||| |||||    
T  16358334 tcacattgaat 16358344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17393345 - 17393209
Alignment:
Q  23 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttata 122  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  17393345 tattgatcggtacagaattggtcttagatgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttccaatggcgttggtttgactccaaaatgattttta 17393246  T
Q  123 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||| | |||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  17393245 gaacattagttatagtcaaattactacacataggtca 17393209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 168
Target Start/End: Original strand, 3264323 - 3264431
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3264323 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaaggccgttgatttgacgtctaaatgaattatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtca 3264422  T
Q  160 caatgaata 168  Q
    || ||||||    
T  3264423 cagtgaata 3264431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 9707485 - 9707560
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  9707485 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 9707560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 15007941 - 15007868
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa 91  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15007941 actggtattgattggtacaaaattggttttaggtgtaaacacgaaagttataggtatggatgttagctttctaa 15007868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8899377 - 8899303
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8899377 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8899303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 16282690 - 16282764
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16282690 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16282764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 17444695 - 17444769
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17444695 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 17444769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15008052 - 15007988
Alignment:
Q  103 tgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15008052 tgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15007988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 16358382 - 16358458
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16358382 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttttagatatagatgttagctttc 16358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 38961770 - 38961844
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  38961770 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 38961844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41124170 - 41124096
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  41124170 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattggtgaagtgttatatgt 41124096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 36528410 - 36528340
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 82  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36528410 atgaaaactggtattgataagtacagaattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 36528340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 11913929 - 11914003
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11913929 atgattgatgaattagtatatgtatgtacatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11914003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25058407 - 25058286
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  25058407 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatga 25058308  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  25058307 tcaaattactacacataggtca 25058286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 10555812 - 10555766
Alignment:
Q  22 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10555812 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgt 10555766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25237074 - 25237009
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagt 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25237074 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagt 25237009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 16934824 - 16934920
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934824 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 16934920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34159929 - 34159811
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  34159929 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 34159830  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  34159829 cacgtaggtcacagtgaat 34159811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 49231866 - 49231768
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49231866 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 49231768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Original strand, 51158683 - 51158753
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51158683 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 51158753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 14528625 - 14528734
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||     
T  14528625 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggatttggtttgacttccaaatgatttttagaactttagttatga 14528724  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  14528725 ttaaattact 14528734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8899473 - 8899418
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 67  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899473 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttg 8899418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15412955 - 15412916
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412955 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 15412916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17463781 - 17463663
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  17463781 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 17463682  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  17463681 cacgtaggtcacagtgaat 17463663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 55477094 - 55476976
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| |||||   |    |||||||||||||||||||||    
T  55477094 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgattttcggtttatgagttatggtcaaattactg 55476995  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  55476994 cacgtaggtcacagtgaat 55476976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 1468614 - 1468723
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  1468614 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 1468713  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  1468714 tcaaattact 1468723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 8276474 - 8276583
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8276474 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggctttggtttgacgtcgaaatgatttttagaacttgagatatga 8276573  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  8276574 ttaaattact 8276583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 12305570 - 12305525
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaac 57  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12305570 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaac 12305525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30152547 - 30152450
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30152547 gtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaatttgagttatgatcaaattact 30152450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 21026183 - 21026092
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||  ||| || ||| |  ||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21026183 gaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatggctttgttttgaagtcataatgatgttcagatcttgagttatgatcaaaatactgcac 21026092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25201398 - 25201323
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  25201398 catgattgatgaattattatatgaatgtatatattgatgaatatgatattgttcatgattaatgaattattatatg 25201323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Original strand, 54039167 - 54039234
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  54039167 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgatcaaatta 54039234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2281102 - 2281000
Alignment:
Q  45 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 144  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||| | | ||||||||||||||  |  |||| || ||||||||||||| | |||||    
T  2281102 cttagttgtaaacatgaaagttttaggtatgtatgttacctttgtaaaggctttggtttgacttcattattatttctataacttgagttatgattaaatt 2281003  T
Q  145 act 147  Q
    |||    
T  2281002 act 2281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 3264468 - 3264538
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 82  Q
    ||||||| ||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  3264468 atgaaaattggtattgataagtatagaattgatcttaggtgtcttcacgaaagttgtaggtatggatgtta 3264538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 14263738 - 14263640
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||||   |   ||||||||||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14263738 ggtgtaaacattaaatttgtatctatggatgttagctttctttggggtttggtttgactccattatgatttctagaacttgagttatggtcaaattact 14263640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 8269363 - 8269472
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||||||||||||| | | |||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  8269363 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttattagctttctaatggcttgggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 8269462  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  8269463 ttaaattact 8269472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 11913875 - 11913940
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  11913875 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 11913940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 12119584 - 12119649
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12119584 catgattgatgaagtattatatgaatgtatatatttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 12119649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12808614 - 12808505
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||| |||| |  || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  12808614 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttagtttcaggtccaaacgatttttagaacttgagatatga 12808515  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  12808514 ttaaattact 12808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 17956869 - 17956938
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||| || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17956869 tgttagctttccaatggctttggtttgacatctaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 17956938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 6468772 - 6468811
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6468772 tgagttatggtcaaattactgcacgtatgtcacagtgaat 6468811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 234
Target Start/End: Original strand, 15025933 - 15025992
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgatt 234  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||    
T  15025933 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgatgatgaatatgatattgttcatgatt 15025992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 66
Target Start/End: Original strand, 14567599 - 14567653
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagtt 66  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  14567599 atgaaaactggtattggtaggtacagaattggcctttggtgtaaacatgaaagtt 14567653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 221
Target Start/End: Original strand, 18700199 - 18700245
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgat 221  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18700199 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatacgat 18700245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28557468 - 28557370
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||| |||||  || ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28557468 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttgatttgaagtccaaatgatatttagaacttgagttatgatcaaattact 28557370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40812202 - 40812144
Alignment:
Q  192 tatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  40812202 tatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtttatgattgatgaatttttatatg 40812144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16979585 - 16979504
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  16979585 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttgaaaatgattt 16979504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 18890039 - 18889958
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  18890039 aattggactttggtgtaaacacgaaagttttagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttgaaaatgattt 18889958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8023858 - 8023778
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 157  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||| | ||| |||| || ||||||    
T  8023858 atgttagctttctaatggcttgggtttgacttaaaaatgatttctagattttgagttatgatgaaaatactacaagtaggt 8023778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 113
Target Start/End: Original strand, 11833119 - 11833183
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| || |||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  11833119 ggtgtaaacatgaaagttgtagatatgggtgctagggttctaatggctttggtttgacttaaaaa 11833183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17044394 - 17044330
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||   ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  17044394 atgattgatgaattattatatgaatgtatatattgacgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 17044330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 238 - 476
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  238 atgaaaactggtattgattggtacataaatggtcttaggtgtaaacaagaaagttataggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 337  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  338 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 437  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  438 tgaatacgatattgttcatgattgataaagtgttatatg 476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 508 - 582
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  508 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 454 - 519
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||| || |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  454 catgattgataaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 107)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 23706931 - 23707169
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23706931 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 23707030  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707031 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23707130  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23707131 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24671469 - 24671235
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24671469 aaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaaaacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgttgttggtttgacttcaaaagg 24671370  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671369 atttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaa 24671270  T
Q  216 tacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24671269 tactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24681892 - 24681654
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  24681892 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggttgggcttcca 24681793  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681792 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24681693  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24681692 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39682761 - 39682522
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39682761 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 39682662  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682661 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 39682562  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  39682561 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 39682522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 24642465 - 24642701
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642465 gaaaactggtattgattggtacagaattgctcttaggtgtaaacccaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 24642564  T
Q  114 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642565 ggatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 24642664  T
Q  214 aatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24642665 aatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20261667 - 20261428
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20261667 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20261568  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20261567 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 20261468  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20261467 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 20261428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23131310 - 23131071
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23131310 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23131211  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23131210 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23131111  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23131110 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23131071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23133777 - 23133538
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23133777 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 23133678  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23133677 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 23133578  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23133577 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23133538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 34402236 - 34402475
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  34402236 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 34402335  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34402336 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttg 34402435  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34402436 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 34402475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24918588 - 24918350
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24918588 atgaaaactgatattgattggtagagaattggtcttaagtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 24918489  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918488 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24918389  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24918388 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 571842 - 571606
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  571842 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacgtcaaaag 571743  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571742 gatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 571643  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  571642 atacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgt 571606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18809390 - 18809152
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18809390 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18809291  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18809290 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18809192  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18809191 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18809152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 23711728 - 23711966
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23711728 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23711827  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23711828 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 23711926  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23711927 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23711966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28577546 - 28577308
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28577546 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 28577447  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28577446 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 28577348  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28577347 tgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 28577308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38967927 - 38967689
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38967927 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaatacgaaagttgtagatatggatgttaggtttctaatgtcgttggtttgacttcaa 38967828  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967827 aagtatttatagaacttgagttatagtgaaattactgcacgcagctcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38967728  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  38967727 tgaatactatattgttcatgattgttgaagtgttatatg 38967689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 23709253 - 23709485
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23709253 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgcagttggtttgacttcaaaaggat 23709352  T
Q  118 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaata 217  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23709353 ttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaagaattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtgaata 23709451  T
Q  218 cgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23709452 cgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23709485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24529261 - 24529500
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24529261 atgaaaacttgtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttacctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24529360  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529361 aaggatttatagcacttgagatatggtgaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 24529460  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24529461 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24529500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24897910 - 24898148
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24897910 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24898009  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24898010 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24898108  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24898109 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24905347 - 24905585
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24905347 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24905446  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24905447 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24905545  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24905546 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24905585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22105913 - 22105685
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22105913 atgaaaactggtattgattggtgcagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22105814  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22105813 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 22105714  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  22105713 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22105685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24900393 - 24900631
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24900393 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24900492  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  24900493 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttg 24900591  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24900592 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24900631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24902870 - 24903108
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24902870 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24902969  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  24902970 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatttatatg-ttg 24903068  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24903069 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24903108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 24907822 - 24908060
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  24907822 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcataggtgtaaacatgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 24907921  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24907922 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgtatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 24908020  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24908021 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24908060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 10684477 - 10684716
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10684477 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 10684576  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10684577 aaggatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 10684676  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  10684677 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgt 10684716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26505826 - 26505588
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26505826 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 26505727  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26505726 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 26505628  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26505627 tgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgt 26505588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26508304 - 26508066
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26508304 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttagtttgacttcaa 26508205  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  26508204 aagaatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 26508106  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  26508105 tgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgt 26508066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 6726495 - 6726267
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726495 atgaaaactggtattgattgatacataagtggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 6726396  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  6726395 aaggatttatagaacttaagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagcatatgaatgtatatgttta 6726296  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  6726295 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 6726267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24368274 - 24368046
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24368274 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24368175  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  24368174 aatgatttatagaacttgagttatagttaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 24368075  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||||||    
T  24368074 tgagtatcatgttgtttatgattgatgaa 24368046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 41523787 - 41524015
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41523787 atgaaaactggtattgattggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaacgtcgttggtttgacttcaa 41523886  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||     
T  41523887 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatacgaatgtatatgttta 41523986  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  41523987 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 41524015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Original strand, 45027619 - 45027832
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45027619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 45027718  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45027719 aaggatttatagaacttgaattatagtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 45027817  T
Q  212 tgaatacgatattgt 226  Q
    |||||||||||||||    
T  45027818 tgaatacgatattgt 45027832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 21154722 - 21154950
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21154722 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtcttaggggtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21154821  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21154822 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 21154921  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  21154922 tgagtatgatgttgtttataattgatgaa 21154950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 32214645 - 32214874
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  32214645 atgaaaactggtattgattggtacaaaattgttcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 32214744  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||          |||||||||||    
T  32214745 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaatta----------gtatatgtttg 32214834  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32214835 tgtatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 32214874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 60 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25616581 - 25616390
Alignment:
Q  60 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25616581 gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatcgtcaaattacttcacgtaggtca 25616482  T
Q  160 caatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  25616481 caatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 25616390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23136027 - 23135799
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23136027 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatcccgttggtttgacttcaa 23135928  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||           |||    
T  23135927 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatg-----------ttg 23135839  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23135838 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23135799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 32039213 - 32039451
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  32039213 atgaaaactggtattgattggtaaaggattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaattttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 32039312  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32039313 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 32039411  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  32039412 tgaatctgatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgt 32039451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 23931908 - 23931775
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23931908 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtattgatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23931809  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23931808 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 23931775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 41523401 - 41523550
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  41523401 atgaaatctggtattgataggtccataattggtcttacgtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 41523500  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523501 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 41523550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 41523597 - 41523749
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  41523597 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtatggatgttatctttataatgcccttggtttgacttcaaaat 41523696  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41523697 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 41523749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22106106 - 22105951
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  22106106 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 22106007  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22106006 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 22105951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 24529068 - 24529223
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  24529068 atgaaatctggtattgataggtccttaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 24529167  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  24529168 aatgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 21154529 - 21154684
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  21154529 atgaaaactggtattgattgttatagaattggtcctaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 21154628  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21154629 aacgatttatagaatttgagttacggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaat 21154684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24368467 - 24368312
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  24368467 atgaaatctggtattgataggtcaatagttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 24368368  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24368367 aacgatttatagaacttaagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24368312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24918781 - 24918626
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||| ||||    
T  24918781 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttatctttctaataccgttggtctgacgtcaa 24918682  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24918681 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24918626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6726662 - 6726541
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6726662 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatgg 6726563  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6726562 tcaaattactgcacgtaggtca 6726541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 23932101 - 23931952
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23932101 atgaaagctggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatttcgttggtctgacgtcaa 23932002  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  23932001 aacgatttatagaactttagttatggtcaatttacttcacttaggtcaca 23931952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 32214451 - 32214600
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  32214451 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgctctgacgtcaa 32214550  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32214551 aacaatttatagaacttaagttatggtcaaattacagcacgtaggtcaca 32214600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 23709054 - 23709209
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23709054 atgaaaactggtattgattggcacagaattcgtcctaggtgtaaacacgtaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23709153  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23709154 aacgatttatagaacttgagttatggtctaattactgcacataggtcacagtgaat 23709209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 21154336 - 21154491
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  21154336 atgaaatctagtattgataggtctagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 21154435  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154436 aatgatttatagaacttgacttttagtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 21154491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 23706547 - 23706702
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |  ||||    
T  23706547 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatggtgttggttctatgtcaa 23706646  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23706647 aacaatttatagaacttgagttatggtcaagttactgcacgtaggtcacagtgaat 23706702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24671666 - 24671511
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||    
T  24671666 atgaaatctggtattgatatgtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagctttctaatgccatttatttgacatcaa 24671567  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671566 aaatatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 24671511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24682085 - 24681930
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || |||| ||||    
T  24682085 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtgtggatgttagcattctaatgccgttagtctgacatcaa 24681986  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24681985 aaagatttatagagcttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 24681930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 23706739 - 23706888
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||| ||||    
T  23706739 atgaaaacggctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttatagttatggatgttacctttctaatgccgtaggtctgacgtcaa 23706838  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23706839 aacgaattatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaagtcaca 23706888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 45027433 - 45027575
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatt 118  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  45027433 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttcgaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatt 45027532  T
Q  119 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45027533 tatagaactttagttatggtcaaattactacacgtaggtcaca 45027575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6726278 - 6726204
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6726278 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 6726204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 251
Target Start/End: Original strand, 21154942 - 21155013
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21154942 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21155013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22105696 - 22105622
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22105696 atgattgatgaattagtatatgtatgtaaatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22105622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 23707201 - 23707275
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23707201 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23707275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 24642733 - 24642807
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24642733 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgt 24642807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38967657 - 38967583
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38967657 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38967583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31345554 - 31345490
Alignment:
Q  102 ttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31345554 ttgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31345490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24368057 - 24367983
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24368057 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattttccatgattgatgaagtattatatgt 24367983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24918318 - 24918244
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24918318 atgattgatgaattagtatatgtatgcatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 24918244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24671201 - 24671129
Alignment:
Q  178 gattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  24671201 gattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 24671129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 31345627 - 31345570
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgta 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31345627 atgaaaactggtattgattggtacagaattgatcttaggtgtaaacacgaaagttgta 31345570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24681622 - 24681548
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||    
T  24681622 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtattagatgt 24681548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28577702 - 28577584
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  28577702 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 28577603  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28577602 cacgtaggtcacaatgaat 28577584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 67440 - 67339
Alignment:
Q  46 ttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||| ||| |||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  67440 ttagttgttaacatgaaaattgtaggttaagatgttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 67341  T
Q  146 ct 147  Q
    ||    
T  67340 ct 67339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16900884 - 16900803
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16900884 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16900803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 78 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16994275 - 16994194
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  16994275 tgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattactacacgtgggtca 16994194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 24686598 - 24686707
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||     
T  24686598 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgcgttatga 24686697  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  24686698 tcaaattact 24686707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18809546 - 18809428
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  18809546 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 18809447  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  18809446 cacgtaggtcacagtgaat 18809428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 19887275 - 19887384
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||     
T  19887275 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatga 19887374  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    | ||||||||    
T  19887375 ttaaattact 19887384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27261441 - 27261332
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||| || ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||     
T  27261441 aattggcctttggtgtaaacatgaaaattttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaataatttttataacttgagttatga 27261342  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27261341 tcaaattact 27261332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 34823819 - 34823750
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34823819 tgttagctttctaatgacgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 34823750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 12727807 - 12727711
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12727807 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttgggttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12727711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 24642373 - 24642425
Alignment:
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  24642373 gatttatagaacttgagttatggtcaaataactacacgtaggtcacagtgaat 24642425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21368440 - 21368365
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  21368440 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 21368365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 23711572 - 23711690
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  23711572 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 23711671  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  23711672 cacgtaggtcacagtgaat 23711690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26505982 - 26505864
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  26505982 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26505883  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  26505882 cacgtaggtcacagtgaat 26505864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26508460 - 26508342
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  26508460 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 26508361  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  26508360 cacgtaggtcacagtgaat 26508342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 27920323 - 27920441
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  27920323 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 27920422  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27920423 cacgtaggtcacagtgaat 27920441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 32039057 - 32039175
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  32039057 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 32039156  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  32039157 cacgtaggtcacagtgaat 32039175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 11232213 - 11232322
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  11232213 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 11232312  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  11232313 tcaaattact 11232322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 22514060 - 22514169
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  22514060 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 22514159  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  22514160 tcaaattact 22514169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 28776662 - 28776771
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  28776662 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 28776761  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  28776762 tcaaattact 28776771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 49 - 109
Target Start/End: Original strand, 34135059 - 34135119
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttc 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  34135059 ggtgtacacatgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaattgctttggtttgacttc 34135119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23131386 - 23131347
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23131386 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 23131347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23799532 - 23799457
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || || |||||||||||| | |||||||    
T  23799532 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgttgaatatgatgttattcatgattgatgaattattatatg 23799457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 34402160 - 34402199
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34402160 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 34402199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 218
Target Start/End: Original strand, 41524004 - 41524045
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatac 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41524004 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatac 41524045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 23707147 - 23707212
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  23707147 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 23707212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 24642679 - 24642744
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  24642679 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 24642744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24918372 - 24918307
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  24918372 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 24918307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 571999 - 571883
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgca 150  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||||    
T  571999 tgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactgca 571900  T
Q  151 cgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||| |||||    
T  571899 cgtaggtcacagtgaat 571883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22274090 - 22274022
Alignment:
Q  79 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  22274090 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaaaacttgagttatgatcaaattact 22274022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24788086 - 24788042
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24788086 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttatctttccaatg 24788042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 44584588 - 44584632
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44584588 ggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 44584632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23133853 - 23133814
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23133853 tgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 23133814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39682838 - 39682799
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39682838 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 39682799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6483194 - 6483113
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||||||| ||    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  6483194 aattggcctttggtgtaaacataaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgacttcaaaatgattt 6483113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 21081348 - 21081429
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  21081348 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttctagtggctttggtttgacttaaaaatgattt 21081429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22686111 - 22686062
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22686111 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22686062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22686221 - 22686152
Alignment:
Q  181 tgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| || || |||||||||||| | |||||||    
T  22686221 tgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgtttttcatgattgatgaattattatatg 22686152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24671257 - 24671192
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||| ||||||||||    
T  24671257 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttacgattgatgaa 24671192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24681676 - 24681611
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  24681676 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatttgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 24681611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22283323 - 22283255
Alignment:
Q  79 gttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22283323 gttagctttctaatggccttggtttgatgtctaaatgatttttaatacttgagttatgatcaaattact 22283255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 23708980 - 23709016
Alignment:
Q  131 gttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23708980 gttatggtcaaattactgcacttaggtcacagtgaat 23709016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14395 - 14156
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14395 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaacgttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14296  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14196  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14195 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 23245 - 23484
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23245 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23344  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23345 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23444  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  23445 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 22892 - 23047
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  22892 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 22991  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22992 aacgatttatagaacatgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 23047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 167
Target Start/End: Original strand, 23121 - 23207
Alignment:
Q  81 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23121 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 23207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 51)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 16274970 - 16275209
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaa-tgtcgttggtttgacttca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  16274970 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaaatgtcattggtttcacttca 16275069  T
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16275070 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatacgattgatgaattaatatatgtatgtatatgttt 16275169  T
Q  211 gtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16275170 gtgaattcgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 27161301 - 27161529
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161301 atgaaaacaggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 27161400  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27161401 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttta 27161500  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  27161501 tgaataaaatattgttaatgattgatgaa 27161529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29777188 - 29776960
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29777188 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaatcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttgggttgacttcaa 29777089  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29777088 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 29776989  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  29776988 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29776960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13989313 - 13989075
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13989313 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13989214  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  13989213 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 13989115  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13989114 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 13989075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21474801 - 21475040
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21474801 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21474900  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21474901 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 21475000  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21475001 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21475040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21923006 - 21923244
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21923006 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21923105  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  21923106 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 21923204  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21923205 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21923244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16362366 - 16362127
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  16362366 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggaagttagctttctaatgcggttggtttgacttcaa 16362267  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362266 aaggatttatagaatttaagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataatttattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16362167  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16362166 ttaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16362127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21841214 - 21840976
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21841214 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 21841115  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21841114 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 21841016  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21841015 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21840976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29298689 - 29298461
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29298689 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccattggtttgacttcaa 29298590  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  29298589 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacataagtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 29298490  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  29298489 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31612813 - 31612585
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31612813 atgaaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttcaaatgtcgttggtttgacttcaa 31612714  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  31612713 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcaaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 31612614  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||    
T  31612613 tcagtatgatattgtttatgattgatgaa 31612585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 15859723 - 15859961
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15859723 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtttgacttcaa 15859822  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15859823 aagaatttatacaacttgagttatggtcaaataactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatat-cttg 15859921  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
     ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15859922 cgaatacgatattgtccatggttgatgaagtgttatatgt 15859961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 22122729 - 22122968
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22122729 atgaaaactggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgctagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 22122828  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22122829 aacgatttatagaacttgggttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 22122928  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||| || |||||||    
T  22122929 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaattggtatatgt 22122968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 23593448 - 23593687
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  23593448 atgaaaactggtattgattggtgcataattagtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 23593547  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593548 aataatttatagaacttgcgttatagttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 23593647  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  23593648 tgaatacgatattgtccatgattaatgaagtgttatatgt 23593687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Original strand, 22050551 - 22050779
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |  ||||    
T  22050551 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcaatggtctaatgtcaa 22050650  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22050651 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttta 22050750  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  22050751 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 22050779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29535499 - 29535317
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29535499 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgtcgttggtttgacttcaa 29535400  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtat 194  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29535399 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 29535317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13227311 - 13227129
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13227311 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttttatgtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13227212  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13227211 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 13227129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31613005 - 31612851
Alignment:
Q  13 tgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31613005 tgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacactaaagttataggtatggatttaagctttctaatgccgttggtttgacttcaaa 31612906  T
Q  113 aggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31612905 acgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 31612851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 15859520 - 15859672
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  15859520 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtatacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacctcaaaac 15859619  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15859620 tatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15859672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31613191 - 31613044
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| |||||    
T  31613191 tggtattgataggttcataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaggtttctaataccgttggtctgacgtcaaaacgattt 31613092  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31613091 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 31613044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29298882 - 29298727
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||    
T  29298882 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttgttctgacgtcaa 29298783  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29298782 aacgatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 29298727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29777378 - 29777226
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||     
T  29777378 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgtatgttagctttctaatgccgttggtctgacgttaaaac 29777279  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29777278 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacaatgaat 29777226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 9044722 - 9044867
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| | || ||||||     
T  9044722 aaaactggtattgatcggtacagaattagtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgtatgttagttttctaatgccgttggtctaacgtcaaaac 9044821  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9044822 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 9044867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 16274784 - 16274924
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatt 118  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||  |||    
T  16274784 ctggtgttgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatatcattggtctgacgtcaaaactatt 16274883  T
Q  119 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16274884 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 16274924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 22122535 - 22122691
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaa-gttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttca 110  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22122535 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacactaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggttttacttca 22122634  T
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  22122635 aaacgatttgtagaacttgagttatggtcaaattactgcacatagatcacagtgaat 22122691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 167
Target Start/End: Original strand, 27161118 - 27161263
Alignment:
Q  22 gtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttat 121  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||| |||||||    
T  27161118 gtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaggaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatactgttggtctgacgtcaaaacgatttat 27161217  T
Q  122 agaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27161218 agaacttgaattatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 27161263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16401559 - 16401407
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| | || |  ||||    
T  16401559 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtagacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctatttccattggtctaacgtggaaag 16401460  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16401459 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16401407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40129524 - 40129387
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| |||||    
T  40129524 tggtattgataggtccagaattgatcttaggtgtaaacactaaagttgtaggtatgaatgttagatttctaatgtcgttggtctggcatcaaaacgattt 40129425  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggt 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40129424 atagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggt 40129387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 43543349 - 43543269
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43543349 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaat 43543269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 16275241 - 16275316
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16275241 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16275316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 22050768 - 22050842
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22050768 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22050842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29776971 - 29776897
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29776971 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29776897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29298419 - 29298345
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29298419 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 29298345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 167
Target Start/End: Original strand, 10812612 - 10812682
Alignment:
Q  97 ttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10812612 ttggtttgacttcaaaatgatttataaaacttgagctatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10812682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 22122946 - 22123020
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22122946 atgattgatgaattggtatatgtatgtttatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 22123020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 27161518 - 27161592
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27161518 atgattgatgaattagtatatatatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27161592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31612596 - 31612522
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  31612596 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacaatattgtccatgattgatgaagtattatatgt 31612522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29298472 - 29298408
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  29298472 atgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 29298408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13989469 - 13989351
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  13989469 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 13989370  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  13989369 cacgtaggtcacagtgaat 13989351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21858690 - 21858592
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||| | | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21858690 ggtgtaaacatgaaagttttagatagttatgttagctttctaacggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 21858592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 44035830 - 44035928
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||   | ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  44035830 ggtgtaaacatcaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatgatcaaattact 44035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17004018 - 17003909
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  17004018 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 17003919  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  17003918 tcaaattact 17003909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650979
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||    
T  21650883 tgtaaacatgaaagttttaggtaattttgttagctttctaatggccttggtttgacgtccaaatgatttttaaaactagagttatgatcaaattact 21650979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 40 - 147
Target Start/End: Original strand, 18060577 - 18060684
Alignment:
Q  40 ttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtc 139  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| |||||  | |||||||| |||| |     
T  18060577 ttggcctttggtgtaaacatgaaagttttaggtaattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgattttaaaaacttgagatatgatt 18060676  T
Q  140 aaattact 147  Q
    ||||||||    
T  18060677 aaattact 18060684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 10812723 - 10812816
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgactt 108  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| |||| ||    ||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  10812723 aaaactggtattgatcggtactgaattgatcttaggtgtaaacatgaaagtcgtagataattgtgttagctttccagtgcctttggtttgactt 10812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 16275187 - 16275252
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  16275187 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 16275252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 22366596 - 22366527
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22366596 tgttagctttctaatgactttggtttgacatcgaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 22366527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 21474724 - 21474763
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21474724 tgagttaaggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 21474763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Original strand, 22824135 - 22824184
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  22824135 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 22824184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12710212 - 12710160
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtt 227  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| |||||    
T  12710212 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgtt 12710160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 16656002 - 16655942
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggt 138  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  16656002 tgttaggtttctaatgactttggtttgacttaaaaatgatttatagattttgagatatggt 16655942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 119
Target Start/End: Original strand, 24815242 - 24815310
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  24815242 tgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatgtctttggtttgacttgaaaatgattt 24815310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 102)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 14269671 - 14269909
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  14269671 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggttcgacttcaa 14269770  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269771 aaggatttatagaaattgagttatggtcaaatttttgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 14269870  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14269871 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13869796 - 13869557
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  13869796 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtataaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctagtgccgttggtttgacttcaa 13869697  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869696 aaggatttatagaacttgagttatggttaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13869597  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13869596 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagttttatatgt 13869557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16214132 - 16213893
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16214132 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16214033  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16214032 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaatgactgcacgtaggtcacagtgaataattgaataagattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16213933  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16213932 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 16213893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27217308 - 27217069
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27217308 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 27217209  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217208 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 27217109  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  27217108 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27217069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8940731 - 8940489
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacac----gaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8940731 atgaaaactgctattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgact 8940632  T
Q  108 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940631 tcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg 8940532  T
Q  208 tttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8940531 tttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 456769 - 456530
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  456769 atgaaaaccggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 456670  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456669 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 456570  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  456569 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11303695 - 11303456
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11303695 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11303596  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11303595 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 11303496  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11303495 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 11303456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 15376428 - 15376666
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15376428 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15376527  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  15376528 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 15376626  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15376627 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15376666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 20384838 - 20385076
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20384838 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 20384937  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  20384938 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 20385036  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20385037 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20385076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 15081556 - 15081794
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15081556 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 15081655  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081656 aagaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtctaagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 15081755  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15081756 tgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 14948837 - 14949075
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14948837 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 14948936  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  14948937 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 14949035  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14949036 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14949075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16232968 - 16232729
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  16232968 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgaattcaa 16232869  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232868 aaggatttatagaatttgagttattgtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 16232769  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16232768 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16232729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16410506 - 16410268
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16410506 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 16410407  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  16410406 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatcaatgtatatg-ttg 16410308  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16410307 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 16410268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41523365 - 41523126
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41523365 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41523266  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523265 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41523166  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41523165 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 41523126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41525827 - 41525588
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41525827 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacataaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 41525728  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525727 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 41525628  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41525627 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 41525588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32125938 - 32125700
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32125938 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaataccgttggtttgacttcaa 32125839  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32125838 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 32125740  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32125739 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 32125700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8469183 - 8468945
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  8469183 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatagatgttagttttctaatgacgttggtttgacttcaa 8469084  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8469083 aaggatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcatgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttt 8468984  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8468983 tgaatacgatattgttcatgattgatgaaatgttatatg 8468945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21189310 - 21189548
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21189310 atgaaaactggtatttattggtacagagttggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatgaatgttagctttttaatgccgttggtttgacttcaa 21189409  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21189410 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtata-gtttg 21189508  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21189509 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 21189548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16108403 - 16108642
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  16108403 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgctgttggtttgacttcaa 16108502  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16108503 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtacgtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 16108602  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16108603 tgaatacaatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 16108642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 23664667 - 23664906
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23664667 atgaaaaatggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 23664766  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23664767 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattattgcatgtaggtcacagtgaagaattgttgatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 23664866  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  23664867 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgt 23664906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29797058 - 29796819
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29797058 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29796959  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29796958 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29796859  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  29796858 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgt 29796819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29800877 - 29800638
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800877 atgaaaactggtattgattgatacagaattggtcttaggtgtaagcacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 29800778  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  29800777 aagaatttatagaacttgagctatggtcaaattactgcacgtagatcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatatttg 29800678  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  29800677 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagggttatatgt 29800638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18628013 - 18627775
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18628013 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 18627914  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  18627913 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattattatatgaatgtatatg-ttg 18627815  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||    
T  18627814 tgaatacgatattttccgtgattgatgaagtgttatatgt 18627775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18640719 - 18640481
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18640719 atgaaaactgatattgattggcacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttataatgccgttggtttgacttcaa 18640620  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  18640619 aaggatttatagaacttgatttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattactatatgaatgtatatg-ttg 18640521  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  18640520 tgaatacgatattttccatgattgatgaagtgttatatgt 18640481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 248
Target Start/End: Original strand, 45847380 - 45847605
Alignment:
Q  23 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttata 122  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45847380 tattgattggtacaaaattggtcttaggtataaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaactctgttagtttgacttcaaaatgatttata 45847479  T
Q  123 gaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgata 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45847480 gaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattggtatatgtatgtatatgtctgtgaatacgata 45847579  T
Q  223 ttgtttatgattgatgaagtgttata 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45847580 ttgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24702676 - 24702447
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702676 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24702577  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||          |||||||    
T  24702576 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttg 24702487  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24702486 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 24702447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24705123 - 24704894
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24705123 atgaaaactggtattggttggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaggttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 24705024  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||          |||||||    
T  24705023 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattcatgaattagtat----------atgtttg 24704934  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24704933 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 24704894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 26355699 - 26355934
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26355699 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26355798  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  26355799 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaa 26355897  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  26355898 atacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgt 26355934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 26358151 - 26358386
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26358151 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttatgtgttaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaag 26358250  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |    
T  26358251 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgattaattagtatatgaatgtatatg-ttgtaa 26358349  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  26358350 atacgatattgtccataattgatgaagtgttatatgt 26358386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18431159 - 18430921
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18431159 atgaaaactggtattgattggtacagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatcttaggtttctaatgccgttggtttgacttcaa 18431060  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  18431059 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtagaacatagtgaataattgaatctgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 18430961  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18430960 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 18430921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Original strand, 11393041 - 11393240
Alignment:
Q  52 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11393041 gtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaac 11393140  T
Q  152 gtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11393141 gtaggtcatagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 11393240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 11972996 - 11972768
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11972996 atgaaatctggtattgataggtccagaatttgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 11972897  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  11972896 aaggatctatagaacttgagttatagtcaaattactgtacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgcatatgttta 11972797  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  11972796 tgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 11972768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 68 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13841446 - 13841274
Alignment:
Q  68 taggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13841446 taggtatgaatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 13841347  T
Q  168 aattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  13841346 aattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 13841274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8940923 - 8940769
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  8940923 atgaaaactggtattgattgatacataattggtcttaggtgtaaacaa-aaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 8940825  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8940824 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 8940769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 10501108 - 10501255
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10501108 atgaaaactggtattgattgatacagagttggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtttgacttcaa 10501207  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10501208 atggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgaaggtca 10501255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 38897749 - 38897904
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38897749 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaactcgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacgtcaa 38897848  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38897849 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 38897904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 25926844 - 25926998
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  25926844 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 25926943  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25926944 aaagagttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 25926998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 14269285 - 14269440
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  14269285 atgaaatctggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgatgtcaa 14269384  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14269385 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14269440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 14156793 - 14156944
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14156793 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggt----acactaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 14156888  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14156889 aaggatttatagaacgtgagttatgttcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 14156944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 167
Target Start/End: Original strand, 14156603 - 14156755
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14156603 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 14156702  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  14156703 gatttatagaacttgacttatgatcaaattaccgcatgtaggtcacagtgaat 14156755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 166
Target Start/End: Original strand, 1856947 - 1857097
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  1856947 aaaactggtattgattggtaccgaattggtcttaggtgtaaacacgaa-gttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaaaac 1857045  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1857046 gatttatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 1857097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 163
Target Start/End: Original strand, 15081371 - 15081514
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  15081371 tggtattgataggtccataattggtcttagaagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaaaacgattt 15081470  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaat 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15081471 atagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacaat 15081514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 14269478 - 14269625
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  14269478 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgcctttggtatgacgtcaa 14269577  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  14269578 aaaaatttatagaacttgagttatcatcaaattattgcacgcaggtca 14269625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16214317 - 16214170
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  16214317 tggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacaaaggttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaaaaagattt 16214218  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16214217 atagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 16214170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 13918117 - 13918265
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtctt-aggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||  | ||||| |||| |||    
T  13918117 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtctttaggtgtaaacacgaaaactgtaggtatgaatgttagctttctaattccattggtctgacgtca 13918216  T
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918217 aaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 13918265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8941117 - 8940962
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  8941117 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgaagtcaa 8941018  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||    
T  8941017 aatgatttatagaacttgagttatgctcaaactactgcacataggtcgcagtgaat 8940962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 21189117 - 21189264
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||    
T  21189117 atgaaatctggtattgataggtcaacaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatattagctttttaatgccgttggtctgacgtcaa 21189216  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189217 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 21189264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 10500945 - 10501064
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10500945 aaaactggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgataacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 10501044  T
Q  115 gatttatagaacttgagtta 134  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10501045 gatttatagaacttgagtta 10501064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 17985099 - 17985246
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||| | |||    
T  17985099 atgaaatctggtattgatcggtacagaattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtaaggatgttaaatttctaatggagttggtttgattccaa 17985198  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17985199 aatgatatttagaacttgagttatagtcaaattactacacgtaggtca 17985246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 45847213 - 45847331
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847213 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttaactttctaatgtcgttggtatgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 45847312  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  45847313 cacgtaggtcacagtgaat 45847331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 38897995 - 38898075
Alignment:
Q  170 ttgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38897995 ttgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatactatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 45847639 - 45847714
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  45847639 atgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagttttatatgt 45847714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 14269941 - 14270015
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14269941 atgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 14270015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 15081826 - 15081900
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15081826 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15081900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 38898107 - 38898181
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38898107 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38898181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 11310327 - 11310239
Alignment:
Q  80 ttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaata 168  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11310327 ttagctttctaatgccattggtttgacgtctaaatgaattatataacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaata 11310239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8940457 - 8940383
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8940457 atgattgatgaattagtatatttatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8940383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11972779 - 11972705
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  11972779 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatattgcccatgattgatgaagtgttacatgt 11972705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 50 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 11287073 - 11286976
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11287073 gtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgtcttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 11286976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 15376272 - 15376390
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  15376272 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 15376371  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15376372 cacgtaggtcacagtgaat 15376390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Original strand, 20384682 - 20384800
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  20384682 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 20384781  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20384782 cacgtaggtcacagtgaat 20384800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 126034 - 125965
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  126034 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgagttttagaacttgagttatgatcaaattact 125965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13869872 - 13869833
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869872 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 13869833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 23461813 - 23461864
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 70  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23461813 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 23461864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7822122 - 7822013
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  7822122 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7822023  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  7822022 tcaaattact 7822013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7829433 - 7829324
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  7829433 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 7829334  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  7829333 tcaaattact 7829324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 27102512 - 27102621
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27102512 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27102611  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27102612 tcaaattact 27102621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 27109860 - 27109969
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27109860 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27109959  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27109960 tcaaattact 27109969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 27175814 - 27175705
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  27175814 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 27175715  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  27175714 tcaaattact 27175705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 38784604 - 38784713
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  38784604 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38784703  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  38784704 tcaaattact 38784713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 170 - 250
Target Start/End: Original strand, 13745563 - 13745643
Alignment:
Q  170 ttgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||| | |||||||    
T  13745563 ttgatcatgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattaatgaattattatatg 13745643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 51 - 147
Target Start/End: Original strand, 15951607 - 15951703
Alignment:
Q  51 tgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| ||| ||    || ||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15951607 tgtaaacacgaaagttttagataattttggtagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 15951703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16410583 - 16410544
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16410583 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 16410544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18628090 - 18628051
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18628090 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18628051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18640796 - 18640757
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18640796 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 18640757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 26355619 - 26355658
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355619 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26355658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 167
Target Start/End: Original strand, 26358071 - 26358110
Alignment:
Q  128 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26358071 tgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 26358110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 456925 - 456807
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||| || || | |    ||||||| |||||||||||||    
T  456925 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccaatggcgtcggttggacttgaaaatgaattttggtttatgagttaaggtcaaattactg 456826  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  456825 cacgtaggtcacattgaat 456807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 209 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8468891 - 8468849
Alignment:
Q  209 ttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8468891 ttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 8468849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11310202 - 11310133
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 82  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||    
T  11310202 atgaaaactg-tattgataagtacataattggtcttaggtgttttcacaaaagttgtaggtatagatgtta 11310133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13841270 - 13841221
Alignment:
Q  201 gtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  13841270 gtatatgttt-tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 13841221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 176 - 250
Target Start/End: Original strand, 15119919 - 15119993
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15119919 atgatttatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaattattatatg 15119993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 135
Target Start/End: Original strand, 16202766 - 16202852
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttat 135  Q
    ||||||||||  |||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  16202766 ggtgtaaacataaaagttgtaggtagtgatgttagatttctaatggctttggttttacttcatgatgatttctagaatttgagttat 16202852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27217464 - 27217346
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||  | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    ||||||||||||||||||||     
T  27217464 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttacagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattacta 27217365  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  27217364 cacgtaggtcacagtgaat 27217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 32495062 - 32495160
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | |||| |||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  32495062 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttatctttctaatggctttggtttgatgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcatattact 32495160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8468967 - 8468902
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  8468967 catgattgatgaaatgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8940511 - 8940446
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  8940511 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 8940446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 14269887 - 14269952
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  14269887 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 14269952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 15081772 - 15081837
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15081772 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 15081837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 15760779 - 15760848
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15760779 tgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 15760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 38294632 - 38294567
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  38294632 catgattgatgaattattctatgaatgtatatgttggcgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 38294567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 38898053 - 38898118
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  38898053 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 38898118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 129
Target Start/End: Original strand, 10000996 - 10001076
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 129  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||    
T  10000996 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatgactttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttg 10001076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 20110779 - 20110747
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 70  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110779 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtag 20110747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 9743794 - 9743845
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgt 226  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  9743794 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatattgt 9743845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 119
Target Start/End: Original strand, 10896371 - 10896452
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||    
T  10896371 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggctttggtttgactttaaaatgattt 10896452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 107
Target Start/End: Original strand, 23664500 - 23664569
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgact 107  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||||||| | || ||||||||    
T  23664500 aattggtctttggtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttctaatggctttagtttgact 23664569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25941572 - 25941523
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatatt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  25941572 catgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatatt 25941523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 29004485 - 29004416
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  29004485 gtgtaaacatgaaagttgtagataattttgttagctttccaatggcgttggtttgacttgaaaatgattt 29004416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 45847585 - 45847650
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||| | |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  45847585 catgattgatgaagtgttatacgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 45847650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 93
Target Start/End: Original strand, 13475728 - 13475772
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatg 93  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13475728 ggtgtaaacacaaaggttgtaggtatgtatgttagctttccaatg 13475772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15167650 - 15167530
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||| || || |||   ||||||||||     
T  15167650 aattggactttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacttgaaaatgacttttagtttttgagttatga 15167551  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtc 158  Q
    | ||| |||| || |||||||    
T  15167550 tgaaaatactccaagtaggtc 15167530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 4)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 4017 - 4256
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4017 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcataggtgtaaacatgaaaggtgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 4116  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4117 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtgggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4216  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4217 tgaatattatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 4256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Original strand, 3824 - 3979
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |||  ||||    
T  3824 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtggaaacacgaaagttgtaggtattgatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaa 3923  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3924 aacgatttatgaaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 3979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 3631 - 3780
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  3631 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttagctgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgaggtcaa 3730  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3731 aacgatttatgtaacttgagttatgctcaaattactgaacgtaggtcaca 3780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 160
Target Start/End: Original strand, 3541 - 3586
Alignment:
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3541 gatttatagaacttgagttatggtcaaaatactgcacgtaggtcac 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5142 - 4903
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||    
T  5142 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccaatggtttgacttcaa 5043  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5042 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacagcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 4943  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4942 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5335 - 5180
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||    
T  5335 atgaaaactgatattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagttttcttatgccgttggtctgacgtcaa 5236  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5235 aacgatatatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 5180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38269 - 38030
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38269 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 38170  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38169 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 38070  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38069 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 38030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38425 - 38307
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  38425 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 38326  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  38325 cacgtaggtcacagtgaat 38307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 94858 - 94620
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  94858 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 94759  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  94758 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 94660  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  94659 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 94620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 17154 - 17393
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17154 atgaaaacttgtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatttttgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 17253  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17254 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatagttgaatatgatcgatgaattagtatatgtatgtatatgcttg 17353  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  17354 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgt 17393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 16961 - 17108
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  16961 atgaaaactggtattgattggtacagaatttgtgttaggggataacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtctgatatcaa 17060  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17061 aaaggtttatagaacttgagttatgatcaaattaatgcacgtaggtca 17108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 95014 - 94896
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactg 148  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||    ||||||||||| | || ||| |||||||||| |||| ||||| | |    |||||||||||||||||||||    
T  95014 ggtgtaaacatgaaagttgtagataattgtgttagctttccagtggcgtcggtttgacttgaaaatgatttttggtttatgagttatggtcaaattactg 94915  T
Q  149 cacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  94914 cacgtaggtcacagtgaat 94896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 154892 - 154961
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||  || |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  154892 tgttagctttataatgacgttggtttgaggtccaaatcatttttagaacttgagttatgatcaaattact 154961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21193 - 20956
Alignment:
Q  14 gaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaa 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21193 gaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaa 21094  T
Q  114 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21093 ggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtg 20994  T
Q  214 aatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20993 aatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 20956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6394 - 6156
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6394 atgaaaactggtattcattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6295  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  6294 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 6196  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6195 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 6156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3471 - 3232
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3471 atgaaaactggtattgattgttacataattgttcttagttgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 3372  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3371 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatgtatatgtttg 3272  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3271 tgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 3232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11737 - 11498
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  11737 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgatacttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttgggttgacttcaa 11638  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11637 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagttaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 11538  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11537 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 11498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30467 - 30229
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  30467 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttcggtgtaaacattaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtttcacttcaa 30368  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30367 aaggatttgtagtacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 30268  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30267 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30660 - 30505
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||| ||||    
T  30660 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttccaatgccattggtgtgacgtcaa 30561  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30560 aacgatttataaaactttagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 30505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 177 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 30196 - 30122
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30196 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgcttgtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 30122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10239 - 10001
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10239 atgaaaactagtattgattggtacagtgttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctattgccgttggtttgacttcaa 10140  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10139 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattatttcatgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtgtgtatatgtttg 10040  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10039 tgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10432 - 10277
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  10432 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttatgtgtcaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgccgttggtctgacatcaa 10333  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10332 aacgatttatagaacttgagttattgtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 10277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10624 - 10470
Alignment:
Q  13 tgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaa 112  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  10624 tgaaatctggtattgataggtccataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacgtcaaa 10525  T
Q  113 aggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10524 aagatttatagaacttgcgttatggtcaaattactgcatgtaggtcacaatgaat 10470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9969 - 9936
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9969 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 9936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 10023 - 9958
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10023 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 9958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 655 - 416
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  655 atgaaaactggtatttattgatatagaattagtctaaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 556  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  555 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtaagtatatgtttg 456  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  455 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1008 - 853
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  1008 atgaaatctggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 909  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  908 aacgatttatagaacttgagttatggtcatattactgcacgtaggtcacagtgaat 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 81 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 779 - 693
Alignment:
Q  81 tagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  779 tagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcatgtaggtcacagtgaat 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13840 - 13601
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13840 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtataaatgttatctttctaatgccgttggtttgacttcaa 13741  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13740 aaggatttatagaatttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 13641  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  13640 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttacatgt 13601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13918 - 13878
Alignment:
Q  127 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13918 ttgagttatggtcaaattactgaacgtaggtcacagtgaat 13878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 134658 - 134420
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  134658 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 134559  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  134558 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 134460  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  134459 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 134420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 137127 - 136889
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  137127 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 137028  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  137027 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 136929  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  136928 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 136889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 139596 - 139358
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  139596 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 139497  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  139496 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 139398  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  139397 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 139358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 142065 - 141827
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  142065 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 141966  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  141965 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 141867  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  141866 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 141827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 144534 - 144296
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  144534 atgaaaactggtattgattagtacataattggtcttaagtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 144435  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  144434 aaggatttatagaactagagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttg 144336  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  144335 tgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 144296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 181; Significance: 7e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40844 - 40609
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40844 aaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtagatataaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaag 40745  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40744 gatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcagagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatg-ttgtga 40646  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40645 atacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 40609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37968 - 37848
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  37968 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttcaaatggctttggtttgacttccaaatgattt-tagaacttgagttatga 37870  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||| ||| |||||||    
T  37869 tcaaattactacacataggtca 37848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40925 - 40885
Alignment:
Q  127 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40925 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 40885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 5)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1034 - 799
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  1034 aaaactggtattgattggtacagcattcgtcttaggagtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaat 935  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtga 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  934 tatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaatttgtatatgtatgtatatgtttgtga 835  T
Q  215 atacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  834 atactatattgttcatgattgatgaagttttatatg 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1224 - 1083
Alignment:
Q  18 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggat 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||  |||||| |||    
T  1224 actggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtctgatgtcaaaaagat 1125  T
Q  118 ttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1124 ttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgcaggtca 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 1338 - 1225
Alignment:
Q  23 tattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttata 122  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  1338 tattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttct-atgccgttggtctgacgtctaaacgatttata 1240  T
Q  123 gaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||||||||    
T  1239 gaacttgagttatgg 1225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 693
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  767 atgattgattaattagtatatgtatgtatatgtt-gcgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 821 - 759
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgat 237  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||    
T  821 catgattgatgaagttttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgat 759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9689 - 9451
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  9689 atgaaaactggtatttattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctctctaatgccgttggtttgacttcaa 9590  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9589 aatgatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttg 9491  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9490 tgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 9451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 6650 - 6889
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| ||||    
T  6650 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 6749  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6750 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 6849  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  6850 tgaatactatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 6465 - 6612
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  6465 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 6564  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6565 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Original strand, 53612 - 53825
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  53612 aattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtttgacgtcaaagggatttatagaacttgagatatgg 53711  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  53712 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaatatgattgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatattatattgttcatgattgat 53811  T
Q  238 gaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||    
T  53812 gaagtgttatatgt 53825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6899 - 6682
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6899 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 6800  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||          |||||||    
T  6799 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat----------atgtttg 6710  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatga 239  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  6709 tgaatacgatattgttcatgattgatga 6682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7092 - 6937
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  7092 atgaaaattgctattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtatgacgtcaa 6993  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6992 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 4)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15131
Alignment:
Q  30 tggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttg 129  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15352 tggtacagatttggtcttaggtgtaaccacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgctggtctgacgtcaaaacgatttatagaacttg 15253  T
Q  130 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |    
T  15252 agttatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatttatatgtttgtgaatactatattgtcca 15153  T
Q  230 tgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15152 tgattgatgaagtgttatatgt 15131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 209
Target Start/End: Original strand, 11054 - 11251
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||| ||||    
T  11054 atgaaaattggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagatttccaatgccgttggtccgacgtcaa 11153  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 209  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11154 aacgatttatagtacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt 11251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Original strand, 10869 - 11016
Alignment:
Q  20 tggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggattt 119  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  10869 tggtattgataggtccagaattggtcttagctgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagttttctaatgccgttggtctgacgtcaaaatgattt 10968  T
Q  120 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10969 atagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 11016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15552 - 15398
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15552 atgaaatctggtattaataggtccagaattggtcttag-tgtaaacacgaaagttgtaggtatggacgttagctttctaatgtcgttggtctgacatcaa 15454  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15453 aacaatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 251
Target Start/End: Original strand, 38396 - 38609
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  38396 aattgatcttagggctaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaatgatttatagaatttgagttatgt 38495  T
Q  138 tcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgat 237  Q
    ||||||||||| | ||  |||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38496 tcaaattactgtatgtttgtcatattgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgat 38595  T
Q  238 gaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||    
T  38596 gaagtgttatatgt 38609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8187 - 7996
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8187 atgaaaactggtattgattagtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaattccgttggtttgacttcaa 8088  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgta 203  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8087 aaggatttatagaatttgaattatggtcaaattactgcacgtaggtcatagtgaataattgaatatgattgatgaattaatatatgtatgta 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8385 - 8225
Alignment:
Q  7 gtgagatgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgac 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  8385 gtgaaatgaaaactggtattgattggtacataactggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaatccccttggtttgac 8286  T
Q  107 ttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  8285 gtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 8569 - 8424
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||| |||| |||||| |    
T  8569 aaactggtattgattggtacataattggtcttacgtgtaaacacaaaagttgtagatatggatgttagctttctaattccattggtatgacgtcaaaaag 8470  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8469 atttatacaacttgagttatggtgaaattactgcacgtaggtcaca 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 151; Significance: 5e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 57 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1831 - 1637
Alignment:
Q  57 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1831 cacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtagg 1732  T
Q  157 tcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||| |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1731 tcacagtgaagaattgtttatgattgatgaattaatatatgtatttatatatttgtgaatacgatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgt 1637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 242
Target Start/End: Original strand, 13379 - 13571
Alignment:
Q  50 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgc 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  13379 gtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagcttactagtgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactga 13478  T
Q  150 acgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagt 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  13479 acgtaggtcacaatgaataattgattatgattgatgaattagtatatgtatgtgtatgtttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagt 13571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 43187 - 43002
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43187 atgaaaactggtattgattggtacatttttggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 43088  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatg 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  43087 aagggtttatagaacttgagttatagtcaaattagtgcacgtaggtcacagtgaataactgaatatgattgatgaattagtatatg 43002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43380 - 43225
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43380 atgaaatctggtattgataggtcaagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatgaatgttagctttctaatgtcgttggtctgacgtcaa 43281  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43280 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 43225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 68409 - 68227
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  68409 atgaaaactggtattgattggtacaaaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtatgtatggatgttagctttctagtgccattggtttgacttcaa 68310  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  68309 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtat 68227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1895 - 1740
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1895 atgaaatctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacaagaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 1796  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1795 aaggatttatagaacttgagttatagtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 1740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1702 - 1634
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 80  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1702 atgaaaattggtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgt 1634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 57865 - 57708
Alignment:
Q  76 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaac 175  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  57865 gatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaaaaggatttataaaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaatacttgaat 57766  T
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgat 233  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  57765 atgagtgataaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgat 57708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18578 - 18423
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  18578 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcattggtctgacgtcaa 18479  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  18478 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaat 18423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 501512 - 501293
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  501512 atgaaaagtgatattgattgttacagaattggtcttatgtgtaaacacgaaagttgtagg-atagatgttagctttctaatgccgttggtttgacttcaa 501414  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttg 211  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||                   |||||||||||||||||||    
T  501413 aatgatttatagaacttgagttatgatcaaattactgcacgtaggtcacagtgaataattga-------------------atatgtatgtatatgtttg 501333  T
Q  212 tgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  501332 tgaatacgatattgttcatgattgatgatgtgttatatgt 501293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 501705 - 501550
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||| ||||||||||| |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||    
T  501705 atgaaatctggtattgataggtcaagaactggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgatgtcaa 501606  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  501605 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacagtgaat 501550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Original strand, 139589 - 139645
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttga 105  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||    
T  139589 ggtgtaaacatgaaagtcgtaggtatgaaagttagctttctaatggctttggtttga 139645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33471
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||    
T  33619 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagatttctaatgtcgttggtctgacgtaaa 33520  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 160  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33519 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcac 33471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18101 - 17947
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||| ||||    
T  18101 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccattggtctgacgtcaa 18002  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18001 aatgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcacagtgaa 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 31651 - 31497
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  31651 atgaaaactggtattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtattaatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 31552  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31551 aacgatttatagaacttgagttatggttaaattactgcacgtaggtcacagtgaa 31497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8311
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  8466 atgaaaactgatattgattggtatagaattgctcttaggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgctattggtttgacttcaa 8367  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8366 aaggatttatagaacttgagttatggtaaaattactgcacgttggtcacagtgaat 8311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0711
Description:

Target: scaffold0711; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 166
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7558
Alignment:
Q  16 aaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaagg 115  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||| |    
T  7408 aaactggtattgattggtacagaattggtcttgggtgtaaacacaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaataccgttggtctgacatcaaaatg 7507  T
Q  116 atttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7508 atttatagaacttgagttatggtcaaattactacacgtaggtcacagtgaa 7558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 7219 - 7367
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatt 118  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||  |||    
T  7219 ctggtattgattggtaaagaatatgtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtataaatgttatccttctaatgtcgttggtctgacgtcaaaacaatt 7318  T
Q  119 tatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  7319 tataaaacttgagttatggtcaaattattgcacgtaggtcacagtgaat 7367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0711; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Original strand, 7079 - 7168
Alignment:
Q  72 tatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcaca 161  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7079 tatggatgttagctttctaatgccgttgctctgccgtcaaaacgatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacataggtcaca 7168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11142 - 10982
Alignment:
Q  90 aatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaatt 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11142 aatgccgttggtttgacttcaaaatgatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcatgtaggtaacagtgaataattgaatatgattgatgaatt 11043  T
Q  190 agtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11042 agtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 10982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 41 - 167
Target Start/End: Original strand, 36749 - 36875
Alignment:
Q  41 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtca 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36749 tggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttaactttctaatgttgttggtctgacgtcaaaaagatttatagaacttgagttatggtca 36848  T
Q  141 aattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  36849 aattactgcacgtaggtcacagtgaat 36875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 155
Target Start/End: Original strand, 36913 - 37056
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||  |||||||||| | | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  36913 atgaaaactaatattgattggaaaaaaattagtcatagatgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccgttggtctgacgtcaa 37012  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 155  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37013 aaagatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtag 37056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 39780 - 39626
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||    
T  39780 atgaaaactgatattgattggtacagaattggtcttaggtgtaaacacaaaagttgtagttatggatgttagctttctaatgccattggtctaacgtcaa 39681  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaa 166  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  39680 aacgatttatagaacttgagttatggtcaaattattacacgtaggtcacagtgaa 39626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Original strand, 19803 - 19950
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||    
T  19803 atgaaaactggtattgattggtatagaattggtcttaggtgtaaacgcaaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgccattggtctgacgtcaa 19902  T
Q  112 aaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  19903 aacgaattatataacttgagttatcgtcaaattactacacgtaggtca 19950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28190 - 28061
Alignment:
Q  111 aaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgttt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28190 aaaggatttatagaacttgagttatagtcaaattacttcacgtaggtcacagtgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgaatgtatatgttt 28091  T
Q  211 gtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
     ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  28090 atgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28072 - 27998
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28072 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtt-gtgaatacgatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 27998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Original strand, 10647 - 10734
Alignment:
Q  163 tgaataattgaacatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10647 tgaataattgaatatgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 10766 - 10840
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||    
T  10766 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatacgatactgtccataattgatgaagtgttatatgt 10840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 240
Target Start/End: Original strand, 10712 - 10777
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  10712 catgattgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 113461 - 113317
Alignment:
Q  15 aaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| ||| |  | |||| ||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  113461 aaaactggtattgatcggtgcggatttggcctttgatgtaaacatggaagttgtaggtatggatgttacatttctaatgacgttggtttgactccaaaat 113362  T
Q  115 gatttatagaacttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtca 159  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  113361 gagttttagaacttgagttatggtcaaattactaaacgtaggtca 113317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 75619 - 75689
Alignment:
Q  12 atgaaaactggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 82  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75619 atgaaaactagtattgattggtacaaaattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtta 75689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10015 - 9940
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10015 atgattgatgagttagtatatgtatgtataagtttgtgaatacgatattgtacatgattgatgaagtgttatatgt 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 10005
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatga 239  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  10067 tgattgatgaattagtatatgaatgtatatgtttatgagtacgatgttgtttatgattgatga 10005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 6196 - 6305
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6196 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttatagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctaaatgatttttagaacttgagttatga 6295  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  6296 tcaaattact 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 15151 - 15225
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15151 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatg-ttgcgaatacaatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 15225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 250
Target Start/End: Original strand, 15070 - 15119
Alignment:
Q  201 gtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15070 gtatatgtttgtgaatactatattgttcataattgatgaagtgttatatg 15119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 240
Target Start/End: Original strand, 15101 - 15162
Alignment:
Q  179 attgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    ||||||||| |  |||||| |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15101 attgatgaagtgttatatgaatgtatatgtttatgagtatgatgttgtttatgattgatgaa 15162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 8675 - 8566
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||     
T  8675 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacttctagatgatttttagaacttgagttatga 8576  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  8575 tcaaattact 8566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 30579 - 30470
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  30579 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 30480  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  30479 tcaaattact 30470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 834 - 725
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||   | ||||||||||||||| | ||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  834 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataattacgttagctttctaatggctttggtctgacgtccaaatgatttttagaacttgagttatga 735  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  734 tcaaattact 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 147
Target Start/End: Original strand, 12519 - 12590
Alignment:
Q  76 gatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12519 gatgttagctttctaatggctttgggttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 12590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 6941 - 7039
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| |||||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6941 ggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttgaggtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 32118 - 32216
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32118 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40726 - 40628
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||   | ||||||||||||||| | ||||||| || || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40726 ggtgtaaacatgaaagttttaggtaattaagttagctttctaatggctttggtttaacgtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 40628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 460 - 398
Alignment:
Q  19 ctggtattgattggtacataattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgtt 81  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  460 ctggtattgataggtccagaattggtcttaggtgtaaacacgaaagtcgtacgtatggatgtt 398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1375
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||| || ||| || || ||||||||||||||||     
T  1484 aattggccttcggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgacgtccaaatgagttttagaacttgagttatga 1385  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  1384 tcaaattact 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 110065 - 110174
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  110065 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 110164  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  110165 tcaaattact 110174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Original strand, 118566 - 118675
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||||||||||||| | ||| |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||     
T  118566 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattacgttagctttctaatggctttgatttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatga 118665  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  118666 tcaaattact 118675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15876 - 15780
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   | ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15876 ggtgtaaacatgaaagttttagataattaagttagatttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaatta 15780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 54044 - 53946
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  54044 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttaactttctaatggctttggtttgactttcaaatgatttttagaacttgagttatgattaaattact 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 147
Target Start/End: Original strand, 19911 - 20009
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||   |||||||||||| |||| | |||||||||  || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19911 ggtgtaaacatgaaagttttagataattatgttagctttccaatggctttggtttgaagtccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 20009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 40035 - 39965
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40035 atgtcagctttctaatggctttggttttacttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 39965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 45518 - 45448
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  45518 atgttagctttctaatggctttggttttacttccaaataatttttagaacttgagttatgatcaaattact 45448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 79073 - 79003
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  79073 atgttagctttctaattgctttggtttgacatccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 79003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 78 - 147
Target Start/End: Original strand, 1296 - 1365
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1296 tgttagctttctaatggttttggtttgatttccaaatgatttttagaacttgagttatgatcaaattact 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18314 - 18205
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| | |||||||||  || ||| ||||| || |||||||||||||     
T  18314 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggctttggtttgaggtccaaatgatttttataacttgagttatga 18215  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  18214 tcaaattact 18205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 28578 - 28469
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    | |||| ||||||||| | |||||||||| || ||| ||||| || |||||||||||||     
T  28578 aattggactttggtgtaaacatgaaagttgtagataatttttttagttttctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttataacttgagttatga 28479  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  28478 tcaaattact 28469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 251
Target Start/End: Original strand, 35955 - 36019
Alignment:
Q  187 attagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatg-aagtgttatatgt 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  35955 attagtatatgtatgtatatg-ttgtgaatatgatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgt 36019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 38484 - 38375
Alignment:
Q  38 aattggtcttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatgg 137  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| ||    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||| ||||| ||||||| ||||||||     
T  38484 aattggcctttggtgtaaacatgaaagttttagataattttgttagctttctaatggcgttggtttcaggtccaaatgatttttagaactcgagttatga 38385  T
Q  138 tcaaattact 147  Q
    ||||||||||    
T  38384 tcaaattact 38375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 979 - 912
Alignment:
Q  78 tgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatta 145  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||||    
T  979 tgttagctttctaatggctttggtttgacttccaaatgatttttataacttgaattatgatcaaatta 912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15362 - 15287
Alignment:
Q  175 catgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatg 250  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15362 catgattgatgaattattatttgaatgtatatgtcgatgaatatgatattgttcatgattgatgaattattatatg 15287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16326 - 16263
Alignment:
Q  177 tgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaa 240  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16326 tgattgatgaattattatatgaatgtatatgttgatgaatatgatgttgttcatgattgatgaa 16263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 938 - 868
Alignment:
Q  77 atgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  938 atgttagctttctaatggctttggtttgacgtgcaaatgatttttagaacctgagttatgatcaaattact 868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1333 - 1219
Alignment:
Q  45 cttaggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaatt 144  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||  |||||||||||  |||||||||   ||||| | ||||||||| | ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  1333 cttagatgtaaacataaaagttttatatatggatgttatatttctaatggatttggtctcacttcaaaatgttttctaaaacttgatttatggtcaaatt 1234  T
Q  145 actgcacgtaggtca 159  Q
    ||| ||| |||||||    
T  1233 actacacataggtca 1219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 1205 - 1279
Alignment:
Q  176 atgattgatgaattagtatatgtatgtatatgtttgtgaatacgatattgtttatgattgatgaagtgttatatgt 251  Q
    |||||| || |||||||||||| || || ||||| | ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1205 atgattaataaattagtatatgaatataaatgtt-gagaataagatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 52 - 147
Target Start/End: Original strand, 8097 - 8192
Alignment:
Q  52 gtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttctaatgtcgttggtttgacttcaaaaggatttatagaacttgagttatggtcaaattact 147  Q
    ||||||| |||||||||||  |   ||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  8097 gtaaacatgaaagttgtagacaattatgttagctatctaatggctttggtttgacgtccaaatgatttttagaacttgagatatgattaaattact 8192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 53978 - 53939
Alignment:
Q  49 ggtgtaaacacgaaagttgtaggtatggatgttagctttc 88  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53978 ggtgtaaacatgaaagttgtaggtatggacgttagctttc 53939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 167
Target Start/End: Original strand, 233 - 273
Alignment:
Q  127 ttgagttatggtcaaattactgcacgtaggtcacaatgaat 167  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  233 ttgatttatggtcaaactactacacgtaggtcacaatgaat 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2622 times since January 2019
Visitors: 2402