View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0201_low_25 (Length: 231)

Name: NF0201_low_25
Description: NF0201
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0201_low_25
NF0201_low_25
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (1-231)||(16413237-16413467)
chr8 (1-231)||(14409365-14409595)
chr8 (1-231)||(1484413-1484643)
chr8 (1-231)||(5853213-5853443)
chr8 (1-231)||(20403238-20403468)
chr8 (1-231)||(15203152-15203382)
chr8 (1-231)||(22001764-22001994)
chr8 (1-231)||(4483292-4483521)
chr8 (1-231)||(20046116-20046346)
chr8 (1-231)||(4542294-4542524)
chr8 (1-231)||(19896276-19896510)
chr8 (1-231)||(45290615-45290846)
chr8 (1-231)||(14823785-14824016)
chr8 (1-229)||(15070571-15070801)
chr8 (63-231)||(41598199-41598367)
chr8 (1-231)||(19936924-19937157)
chr8 (65-226)||(19801367-19801527)
chr8 (63-231)||(26223930-26224098)
chr8 (50-231)||(25484245-25484419)
chr8 (1-129)||(24485965-24486093)
chr8 (65-231)||(18818348-18818516)
chr8 (1-119)||(32810054-32810172)
chr8 (80-231)||(16092297-16092449)
chr8 (93-231)||(7372792-7372931)
chr8 (80-231)||(6759272-6759421)
chr8 (80-231)||(20536222-20536374)
chr8 (80-229)||(21918955-21919105)
chr8 (79-231)||(23406393-23406548)
chr8 (80-231)||(28648999-28649151)
chr8 (97-231)||(21923900-21924035)
chr8 (100-231)||(26219728-26219858)
chr8 (80-231)||(22875079-22875230)
chr8 (80-231)||(22626750-22626901)
chr8 (63-227)||(13508022-13508188)
chr8 (63-227)||(13597554-13597720)
chr8 (100-231)||(26225268-26225398)
chr8 (80-231)||(18879191-18879338)
chr8 (74-227)||(17612059-17612213)
chr8 (80-229)||(31971273-31971421)
chr8 (63-226)||(20498581-20498746)
chr8 (144-226)||(45131017-45131098)
chr8 (1-59)||(38550032-38550090)
chr8 (1-58)||(32121912-32121969)
chr8 (63-226)||(37116366-37116532)
chr8 (1-59)||(27472338-27472395)
chr8 (84-231)||(38855212-38855358)
chr8 (144-226)||(16199664-16199746)
chr8 (84-231)||(21285611-21285758)
chr8 (80-231)||(23648567-23648719)
chr8 (74-226)||(5866227-5866376)
chr8 (74-229)||(17140932-17141084)
chr8 (117-231)||(18678094-18678209)
chr8 (74-229)||(21491011-21491163)
chr8 (1-79)||(1326958-1327042)
chr8 (1-58)||(18677986-18678043)
chr8 (184-231)||(6520382-6520430)
chr8 (184-230)||(983465-983512)
chr8 (184-230)||(23760903-23760950)
chr8 (117-231)||(32121746-32121861)
chr8 (1-68)||(16401951-16402020)
chr8 (63-226)||(17266930-17267096)
chr8 (1-59)||(20982648-20982710)
chr8 (146-226)||(21389473-21389552)
chr8 (146-226)||(21396003-21396082)
chr8 (146-226)||(21778799-21778878)
chr8 (146-226)||(21790496-21790575)
chr8 (80-226)||(17439461-17439609)
chr8 (192-231)||(26355766-26355805)
chr8 (195-229)||(21249400-21249434)
chr8 (195-229)||(21255238-21255272)
chr8 (33-79)||(35026849-35026895)
chr8 (1-32)||(13425274-13425305)
chr8 (1-32)||(13425380-13425411)
chr8 (1-32)||(20982542-20982573)
chr8 (192-231)||(21673718-21673757)
chr8 (33-79)||(2418860-2418906)
chr8 (2-32)||(19936820-19936850)
chr8 (63-115)||(17438154-17438207)
chr8 (63-115)||(22364792-22364845)
chr8 (63-115)||(37515835-37515888)
chr8 (2-30)||(16401847-16401875)
[»] chr6 (76 HSPs)
chr6 (1-231)||(30676631-30676861)
chr6 (1-231)||(34963384-34963614)
chr6 (1-231)||(22782238-22782468)
chr6 (1-231)||(24422558-24422788)
chr6 (1-231)||(33861805-33862035)
chr6 (1-231)||(33864289-33864519)
chr6 (1-231)||(8055040-8055270)
chr6 (5-231)||(12742328-12742554)
chr6 (1-231)||(18334513-18334743)
chr6 (1-231)||(19005057-19005287)
chr6 (1-231)||(19858840-19859070)
chr6 (1-231)||(1540832-1541062)
chr6 (1-231)||(2291101-2291331)
chr6 (1-231)||(26924561-26924791)
chr6 (1-231)||(25656640-25656870)
chr6 (1-231)||(25688513-25688743)
chr6 (28-231)||(1595560-1595763)
chr6 (50-231)||(25754820-25755001)
chr6 (63-226)||(18456735-18456898)
chr6 (50-231)||(20556864-20557043)
chr6 (68-231)||(16448514-16448678)
chr6 (64-231)||(3852001-3852168)
chr6 (90-226)||(18461895-18462031)
chr6 (80-231)||(20360915-20361067)
chr6 (80-231)||(25629310-25629462)
chr6 (80-230)||(25644335-25644487)
chr6 (83-231)||(29060554-29060703)
chr6 (80-231)||(18409782-18409934)
chr6 (97-231)||(17287768-17287903)
chr6 (80-229)||(16496260-16496410)
chr6 (80-231)||(20593787-20593939)
chr6 (63-231)||(19847932-19848102)
chr6 (80-226)||(18821801-18821946)
chr6 (80-231)||(19303496-19303647)
chr6 (65-231)||(22780166-22780334)
chr6 (1-80)||(12942363-12942442)
chr6 (80-231)||(20076714-20076862)
chr6 (1-79)||(28289256-28289334)
chr6 (143-231)||(20638301-20638390)
chr6 (65-230)||(20109153-20109322)
chr6 (1-75)||(18913994-18914068)
chr6 (63-229)||(8227448-8227616)
chr6 (10-75)||(18937252-18937317)
chr6 (1-79)||(15875469-15875547)
chr6 (1-59)||(31630568-31630626)
chr6 (184-231)||(25714431-25714478)
chr6 (2-46)||(17377770-17377814)
chr6 (84-226)||(23019425-23019567)
chr6 (1-58)||(23992604-23992664)
chr6 (74-228)||(28496424-28496575)
chr6 (74-228)||(29808835-29808986)
chr6 (184-231)||(27333277-27333325)
chr6 (184-231)||(27394017-27394065)
chr6 (184-230)||(9098573-9098620)
chr6 (95-226)||(35245605-35245735)
chr6 (1-43)||(19847889-19847931)
chr6 (192-231)||(19652209-19652248)
chr6 (184-230)||(19668386-19668433)
chr6 (133-231)||(23992441-23992540)
chr6 (192-226)||(11185524-11185558)
chr6 (192-229)||(1561319-1561356)
chr6 (184-224)||(22831524-22831565)
chr6 (63-115)||(23076862-23076915)
chr6 (184-224)||(33443068-33443108)
chr6 (1-32)||(15875621-15875652)
chr6 (1-32)||(18914142-18914173)
chr6 (192-222)||(16920698-16920728)
chr6 (63-115)||(18177609-18177662)
chr6 (63-115)||(18199353-18199406)
chr6 (63-115)||(18204209-18204262)
chr6 (63-115)||(18696617-18696670)
chr6 (63-115)||(18706435-18706488)
chr6 (198-231)||(22080799-22080832)
chr6 (63-115)||(28103836-28103889)
chr6 (1-33)||(1598266-1598298)
chr6 (184-231)||(4185880-4185928)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (1-231)||(32214842-32215072)
chr2 (1-231)||(6726006-6726236)
chr2 (1-231)||(21154981-21155211)
chr2 (1-231)||(18808954-18809184)
chr2 (1-231)||(23709453-23709683)
chr2 (1-231)||(23711934-23712164)
chr2 (1-231)||(39682324-39682554)
chr2 (1-231)||(23130873-23131103)
chr2 (1-231)||(23133340-23133570)
chr2 (1-231)||(34402443-34402673)
chr2 (1-231)||(571408-571638)
chr2 (1-231)||(23135601-23135831)
chr2 (1-231)||(26505390-26505620)
chr2 (1-231)||(26507868-26508098)
chr2 (1-231)||(24898116-24898347)
chr2 (1-231)||(24900599-24900830)
chr2 (1-231)||(24903076-24903307)
chr2 (1-231)||(24905553-24905784)
chr2 (1-231)||(24908028-24908259)
chr2 (1-231)||(24367785-24368015)
chr2 (1-231)||(32039419-32039649)
chr2 (2-231)||(28577110-28577339)
chr2 (1-231)||(22105423-22105654)
chr2 (10-231)||(45029784-45030005)
chr2 (1-231)||(38967385-38967615)
chr2 (64-231)||(43137310-43137477)
chr2 (63-231)||(24529511-24529680)
chr2 (1-157)||(24642775-24642933)
chr2 (80-231)||(23060527-23060679)
chr2 (80-227)||(23076460-23076608)
chr2 (80-231)||(22337129-22337281)
chr2 (65-227)||(19671848-19672010)
chr2 (80-231)||(22731189-22731341)
chr2 (80-231)||(22738135-22738286)
chr2 (65-230)||(23708558-23708725)
chr2 (1-80)||(20261381-20261460)
chr2 (80-231)||(23285879-23286027)
chr2 (80-231)||(298769-298922)
chr2 (144-229)||(38134-38219)
chr2 (80-229)||(23654341-23654491)
chr2 (164-231)||(24643034-24643101)
chr2 (50-119)||(22173799-22173868)
chr2 (80-231)||(23660037-23660188)
chr2 (80-226)||(7688-7835)
chr2 (1-79)||(10684684-10684764)
chr2 (1-79)||(23707243-23707323)
chr2 (1-79)||(24918196-24918276)
chr2 (97-226)||(23103369-23103497)
chr2 (1-58)||(25616365-25616422)
chr2 (184-231)||(23040249-23040296)
chr2 (63-226)||(20520130-20520295)
chr2 (1-79)||(24671081-24671161)
chr2 (124-231)||(28405990-28406099)
chr2 (74-150)||(22459511-22459587)
chr2 (169-231)||(8946671-8946734)
chr2 (91-226)||(32451894-32452031)
chr2 (63-226)||(23207296-23207461)
chr2 (1-79)||(24681500-24681580)
chr2 (146-226)||(20309127-20309206)
chr2 (117-231)||(25616199-25616314)
chr2 (131-231)||(7679599-7679699)
chr2 (192-230)||(18786971-18787009)
chr2 (63-164)||(23791357-23791458)
chr2 (184-224)||(22134266-22134306)
chr2 (63-103)||(29601478-29601518)
chr2 (1-43)||(24529468-24529510)
chr2 (124-231)||(25175864-25175972)
chr2 (184-224)||(23287384-23287424)
chr2 (184-224)||(26392403-26392443)
chr2 (63-113)||(22413073-22413124)
chr2 (194-229)||(23072019-23072054)
chr2 (2-32)||(23707139-23707169)
chr2 (2-32)||(24642671-24642701)
chr2 (2-32)||(24671235-24671265)
chr2 (2-32)||(24681654-24681684)
chr2 (63-164)||(24697543-24697644)
chr2 (2-32)||(24918350-24918380)
chr2 (63-115)||(21237883-21237936)
chr2 (63-115)||(25109019-25109072)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-231)||(4705-4935)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (1-231)||(3515018-3515248)
chr4 (1-231)||(18215195-18215425)
chr4 (1-231)||(15118273-15118503)
chr4 (1-231)||(19618093-19618323)
chr4 (1-231)||(12228-12458)
chr4 (1-231)||(52312521-52312751)
chr4 (1-231)||(14970628-14970858)
chr4 (1-231)||(44615299-44615529)
chr4 (1-231)||(18239340-18239570)
chr4 (1-231)||(50222260-50222490)
chr4 (1-231)||(15355245-15355476)
chr4 (1-231)||(19242710-19242941)
chr4 (1-231)||(1837430-1837660)
chr4 (1-231)||(44773004-44773238)
chr4 (50-231)||(51463838-51464019)
chr4 (50-231)||(23803235-23803416)
chr4 (1-231)||(7641107-7641333)
chr4 (63-231)||(44102225-44102393)
chr4 (50-231)||(12610961-12611135)
chr4 (63-226)||(21815568-21815731)
chr4 (74-231)||(44928873-44929031)
chr4 (63-227)||(15367708-15367873)
chr4 (63-227)||(15402721-15402886)
chr4 (63-227)||(15371220-15371385)
chr4 (63-227)||(15373501-15373666)
chr4 (63-227)||(15370036-15370200)
chr4 (66-227)||(16223550-16223712)
chr4 (68-231)||(20149840-20150004)
chr4 (80-229)||(12902773-12902923)
chr4 (65-231)||(7798788-7798956)
chr4 (69-226)||(22353852-22354010)
chr4 (80-231)||(7088891-7089043)
chr4 (80-231)||(16377478-16377628)
chr4 (80-231)||(7893717-7893869)
chr4 (80-231)||(14038662-14038814)
chr4 (80-231)||(22636449-22636601)
chr4 (100-231)||(54798729-54798861)
chr4 (124-231)||(14280327-14280434)
chr4 (133-231)||(52873375-52873474)
chr4 (100-228)||(8574844-8574971)
chr4 (80-231)||(44052843-44052995)
chr4 (63-226)||(13788-13953)
chr4 (63-230)||(52243131-52243302)
chr4 (80-231)||(16270191-16270342)
chr4 (1-80)||(15534343-15534422)
chr4 (80-229)||(23374314-23374464)
chr4 (1-79)||(36038033-36038111)
chr4 (1-79)||(14048740-14048818)
chr4 (1-79)||(15496992-15497070)
chr4 (65-230)||(43198492-43198661)
chr4 (1-78)||(52873099-52873176)
chr4 (80-231)||(6899905-6900056)
chr4 (82-231)||(16239927-16240076)
chr4 (1-79)||(49547695-49547773)
chr4 (160-229)||(3096309-3096379)
chr4 (2-59)||(362268-362325)
chr4 (1-79)||(14746538-14746618)
chr4 (91-226)||(6190481-6190618)
chr4 (82-171)||(15464888-15464977)
chr4 (63-226)||(46640393-46640558)
chr4 (184-231)||(12774021-12774069)
chr4 (27-79)||(19857607-19857659)
chr4 (184-230)||(12288269-12288316)
chr4 (74-229)||(15551833-15551985)
chr4 (192-231)||(39706356-39706395)
chr4 (144-226)||(14053321-14053403)
chr4 (63-226)||(53082089-53082254)
chr4 (184-226)||(17046506-17046549)
chr4 (184-231)||(8846370-8846418)
chr4 (1-32)||(362390-362421)
chr4 (1-32)||(15355140-15355171)
chr4 (1-32)||(15496095-15496126)
chr4 (1-32)||(18215090-18215121)
chr4 (1-32)||(19857798-19857829)
chr4 (2-32)||(19617989-19618019)
chr4 (63-115)||(16043142-16043195)
chr4 (63-114)||(15791905-15791957)
chr4 (184-224)||(17333298-17333338)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-231)||(10784-11014)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-231)||(20758-20988)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-231)||(37832-38062)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-231)||(17361-17591)
scaffold0023 (1-231)||(94422-94652)
scaffold0023 (83-231)||(44465-44614)
scaffold0023 (84-231)||(100388-100534)
scaffold0023 (184-229)||(119891-119937)
scaffold0023 (84-231)||(40135-40281)
scaffold0023 (192-231)||(101513-101552)
scaffold0023 (63-115)||(105210-105263)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (1-231)||(456332-456562)
chr7 (1-231)||(11393208-11393438)
chr7 (1-231)||(15376634-15376864)
chr7 (1-231)||(16232531-16232761)
chr7 (1-231)||(20385044-20385274)
chr7 (1-231)||(21189516-21189746)
chr7 (1-231)||(24702249-24702479)
chr7 (1-231)||(32125502-32125732)
chr7 (1-231)||(41522928-41523158)
chr7 (1-231)||(41525390-41525620)
chr7 (1-231)||(14949043-14949273)
chr7 (1-231)||(27216871-27217101)
chr7 (1-231)||(18640283-18640513)
chr7 (1-231)||(11972507-11972737)
chr7 (1-231)||(16213695-16213925)
chr7 (1-231)||(16410070-16410300)
chr7 (1-231)||(24704699-24704926)
chr7 (1-231)||(18430723-18430953)
chr7 (1-231)||(13869357-13869589)
chr7 (63-231)||(44116520-44116688)
chr7 (50-226)||(13647344-13647521)
chr7 (1-187)||(26355902-26356090)
chr7 (1-187)||(26358354-26358542)
chr7 (64-231)||(3386344-3386511)
chr7 (93-231)||(24275182-24275320)
chr7 (63-231)||(17061898-17062066)
chr7 (63-226)||(12756654-12756817)
chr7 (65-231)||(20110567-20110723)
chr7 (63-231)||(38898359-38898528)
chr7 (80-231)||(3564319-3564471)
chr7 (1-130)||(15081868-15081999)
chr7 (80-231)||(12698845-12698998)
chr7 (123-231)||(48273403-48273512)
chr7 (1-97)||(13841157-13841253)
chr7 (116-231)||(13831384-13831499)
chr7 (80-231)||(9509203-9509355)
chr7 (80-231)||(18456368-18456519)
chr7 (74-229)||(26212012-26212168)
chr7 (63-230)||(2280056-2280225)
chr7 (80-227)||(38227499-38227646)
chr7 (1-80)||(11303409-11303488)
chr7 (80-229)||(10589055-10589204)
chr7 (12-91)||(18627717-18627796)
chr7 (1-79)||(14269983-14270061)
chr7 (2-79)||(16108611-16108688)
chr7 (1-79)||(8468803-8468881)
chr7 (80-230)||(15143993-15144143)
chr7 (63-227)||(19486681-19486847)
chr7 (1-79)||(23664874-23664952)
chr7 (1-79)||(8940335-8940415)
chr7 (1-79)||(29796771-29796851)
chr7 (1-79)||(29800590-29800670)
chr7 (1-79)||(38898149-38898229)
chr7 (63-226)||(16495421-16495581)
chr7 (65-223)||(12255730-12255892)
chr7 (141-229)||(16386263-16386353)
chr7 (124-231)||(22072927-22073036)
chr7 (80-226)||(40443410-40443555)
chr7 (74-229)||(34200802-34200954)
chr7 (1-59)||(45847682-45847739)
chr7 (63-230)||(1867932-1868101)
chr7 (74-158)||(15116568-15116651)
chr7 (123-231)||(67759-67868)
chr7 (84-231)||(18005660-18005806)
chr7 (84-230)||(16056343-16056488)
chr7 (74-158)||(15113031-15113114)
chr7 (192-231)||(811199-811238)
chr7 (192-231)||(44014192-44014231)
chr7 (192-231)||(47831821-47831860)
chr7 (63-115)||(15008436-15008489)
chr7 (63-115)||(20220127-20220180)
chr7 (148-231)||(28505321-28505405)
chr7 (84-230)||(16219677-16219823)
chr7 (184-227)||(18154901-18154944)
chr7 (192-229)||(15754955-15754992)
chr7 (199-230)||(14044761-14044792)
chr7 (1-32)||(14269878-14269909)
chr7 (199-230)||(14354791-14354822)
chr7 (117-218)||(15211484-15211586)
chr7 (2-32)||(8940489-8940519)
chr7 (2-32)||(15081764-15081794)
chr7 (2-32)||(38898045-38898075)
chr7 (63-115)||(9033283-9033336)
chr7 (192-229)||(11996095-11996132)
chr7 (63-115)||(20619511-20619564)
chr7 (1-30)||(45847576-45847605)
chr7 (146-226)||(27847853-27847932)
[»] chr5 (68 HSPs)
chr5 (1-231)||(264689-264919)
chr5 (1-231)||(39363395-39363625)
chr5 (1-231)||(20909023-20909253)
chr5 (1-231)||(29345991-29346221)
chr5 (1-231)||(42245286-42245516)
chr5 (5-231)||(10732865-10733091)
chr5 (1-231)||(29348464-29348694)
chr5 (1-231)||(29350937-29351167)
chr5 (1-231)||(39245147-39245377)
chr5 (1-231)||(32027404-32027634)
chr5 (1-231)||(29329945-29330172)
chr5 (5-231)||(20917877-20918099)
chr5 (1-231)||(38619445-38619677)
chr5 (1-231)||(23064522-23064754)
chr5 (63-230)||(20901991-20902159)
chr5 (63-231)||(36154766-36154931)
chr5 (63-231)||(2154596-2154765)
chr5 (65-231)||(11581184-11581350)
chr5 (68-231)||(18319021-18319185)
chr5 (63-231)||(10775659-10775827)
chr5 (63-231)||(31061079-31061248)
chr5 (68-231)||(24067118-24067282)
chr5 (80-231)||(23390451-23390603)
chr5 (80-231)||(25421546-25421698)
chr5 (80-231)||(9077966-9078118)
chr5 (80-229)||(21729019-21729169)
chr5 (80-229)||(21808344-21808494)
chr5 (80-225)||(25431414-25431560)
chr5 (80-231)||(1096481-1096633)
chr5 (80-231)||(8286797-8286950)
chr5 (80-231)||(24529234-24529386)
chr5 (80-226)||(22144068-22144215)
chr5 (80-231)||(24493583-24493734)
chr5 (146-231)||(21997555-21997641)
chr5 (80-229)||(22075035-22075185)
chr5 (80-231)||(13025325-13025476)
chr5 (80-231)||(13095509-13095660)
chr5 (100-231)||(22412198-22412329)
chr5 (1-79)||(9776521-9776599)
chr5 (63-227)||(40725871-40726037)
chr5 (1-79)||(37804824-37804902)
chr5 (1-58)||(17517085-17517142)
chr5 (65-231)||(21565556-21565723)
chr5 (145-226)||(21292991-21293071)
chr5 (97-226)||(37723922-37724050)
chr5 (84-230)||(26011995-26012141)
chr5 (100-187)||(20766095-20766181)
chr5 (131-226)||(20026945-20027043)
chr5 (184-231)||(21329556-21329604)
chr5 (184-231)||(22959591-22959639)
chr5 (147-231)||(18418594-18418678)
chr5 (184-229)||(19660894-19660940)
chr5 (1-43)||(20901948-20901990)
chr5 (67-226)||(22178161-22178323)
chr5 (183-231)||(20806845-20806893)
chr5 (93-231)||(17517169-17517308)
chr5 (184-226)||(36314596-36314639)
chr5 (1-43)||(2154553-2154595)
chr5 (184-226)||(26740705-26740747)
chr5 (84-231)||(21502116-21502263)
chr5 (184-229)||(26732892-26732937)
chr5 (187-227)||(26704089-26704129)
chr5 (187-227)||(26973822-26973862)
chr5 (192-231)||(19668912-19668951)
chr5 (1-32)||(20901842-20901873)
chr5 (145-218)||(21873277-21873351)
chr5 (63-104)||(36314689-36314730)
chr5 (74-170)||(18356389-18356485)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (1-231)||(17463189-17463419)
chr3 (1-231)||(45606828-45607058)
chr3 (1-231)||(7781268-7781498)
chr3 (1-231)||(8899105-8899335)
chr3 (1-231)||(9707528-9707758)
chr3 (1-231)||(12567571-12567801)
chr3 (1-231)||(13544036-13544266)
chr3 (1-231)||(34159337-34159567)
chr3 (1-231)||(55476502-55476732)
chr3 (1-231)||(6469055-6469285)
chr3 (1-231)||(10247644-10247874)
chr3 (1-231)||(16282732-16282962)
chr3 (1-231)||(16454202-16454432)
chr3 (1-231)||(38961812-38962042)
chr3 (1-231)||(13154176-13154407)
chr3 (1-231)||(28848532-28848762)
chr3 (1-231)||(41123901-41124128)
chr3 (1-231)||(13151711-13151942)
chr3 (1-231)||(8499529-8499761)
chr3 (1-231)||(15412440-15412672)
chr3 (39-231)||(17446614-17446805)
chr3 (63-231)||(29172565-29172734)
chr3 (50-231)||(50242833-50243014)
chr3 (63-231)||(17672637-17672805)
chr3 (63-226)||(53070636-53070799)
chr3 (63-231)||(12119707-12119876)
chr3 (1-231)||(27165261-27165493)
chr3 (50-226)||(43550448-43550625)
chr3 (1-231)||(53301425-53301658)
chr3 (111-231)||(15977526-15977646)
chr3 (80-231)||(14972868-14973020)
chr3 (80-231)||(17487870-17488022)
chr3 (80-231)||(17499352-17499504)
chr3 (65-231)||(43840946-43841114)
chr3 (65-230)||(26686902-26687069)
chr3 (80-231)||(40213676-40213827)
chr3 (64-227)||(42386428-42386593)
chr3 (131-231)||(55500953-55501053)
chr3 (100-231)||(36166609-36166739)
chr3 (80-231)||(13442288-13442440)
chr3 (80-231)||(14576788-14576939)
chr3 (80-231)||(20698391-20698542)
chr3 (80-231)||(23083316-23083468)
chr3 (80-231)||(25476340-25476492)
chr3 (100-231)||(21618460-21618590)
chr3 (99-231)||(14572603-14572735)
chr3 (80-231)||(18438548-18438700)
chr3 (95-229)||(12399225-12399360)
chr3 (63-227)||(24340660-24340826)
chr3 (146-231)||(44494820-44494905)
chr3 (80-231)||(11424718-11424866)
chr3 (1-79)||(54520985-54521063)
chr3 (146-231)||(10556996-10557081)
chr3 (80-231)||(24153164-24153315)
chr3 (1-77)||(29544763-29544839)
chr3 (65-226)||(52523666-52523831)
chr3 (146-231)||(17737247-17737335)
chr3 (1-72)||(12305315-12305386)
chr3 (63-227)||(23274705-23274871)
chr3 (63-227)||(37642202-37642368)
chr3 (63-126)||(17248224-17248287)
chr3 (1-79)||(15977696-15977774)
chr3 (1-79)||(11913971-11914051)
chr3 (74-171)||(22147474-22147571)
chr3 (65-164)||(2051138-2051238)
chr3 (1-58)||(46822445-46822502)
chr3 (84-230)||(15470939-15471085)
chr3 (1-59)||(10557091-10557149)
chr3 (65-231)||(16097342-16097509)
chr3 (63-226)||(37251105-37251270)
chr3 (189-231)||(45577947-45577989)
chr3 (65-231)||(16103794-16103960)
chr3 (120-231)||(32307691-32307802)
chr3 (184-231)||(12174318-12174366)
chr3 (184-231)||(28194704-28194752)
chr3 (117-231)||(46822279-46822394)
chr3 (117-230)||(30029855-30029968)
chr3 (192-229)||(13210395-13210432)
chr3 (184-231)||(49668135-49668183)
chr3 (131-231)||(12511071-12511172)
chr3 (84-231)||(14234501-14234648)
chr3 (184-231)||(9512934-9512982)
chr3 (184-231)||(9520909-9520957)
chr3 (184-224)||(13919350-13919390)
chr3 (1-37)||(17444737-17444773)
chr3 (2-32)||(11913867-11913897)
chr3 (63-112)||(15207070-15207120)
chr3 (63-112)||(15246152-15246202)
chr3 (63-112)||(15265273-15265323)
chr3 (33-70)||(15977663-15977700)
chr3 (63-115)||(23318653-23318706)
chr3 (63-115)||(28194822-28194875)
[»] chr1 (58 HSPs)
chr1 (1-231)||(13988877-13989107)
chr1 (1-231)||(21840778-21841008)
chr1 (1-231)||(21923212-21923442)
chr1 (1-231)||(21475008-21475238)
chr1 (1-231)||(23593655-23593886)
chr1 (1-231)||(29776699-29776929)
chr1 (1-231)||(29298148-29298377)
chr1 (1-231)||(16361928-16362159)
chr1 (2-231)||(31612324-31612553)
chr1 (1-227)||(22122988-22123215)
chr1 (1-231)||(16275284-16275515)
chr1 (1-231)||(15859929-15860160)
chr1 (50-226)||(45574812-45574989)
chr1 (63-231)||(13212844-13213013)
chr1 (63-231)||(21346972-21347141)
chr1 (63-231)||(21342107-21342276)
chr1 (63-231)||(21707178-21707346)
chr1 (63-231)||(21711720-21711888)
chr1 (63-231)||(433023-433190)
chr1 (68-231)||(40389165-40389329)
chr1 (80-229)||(27250684-27250834)
chr1 (80-231)||(50210168-50210320)
chr1 (80-231)||(34509794-34509946)
chr1 (80-231)||(22532283-22532435)
chr1 (63-226)||(21896193-21896358)
chr1 (66-226)||(21861510-21861672)
chr1 (80-229)||(21026696-21026846)
chr1 (80-231)||(22468651-22468803)
chr1 (63-226)||(35261018-35261180)
chr1 (146-229)||(20847175-20847259)
chr1 (74-230)||(16758664-16758822)
chr1 (1-57)||(22050810-22050866)
chr1 (63-225)||(14295493-14295652)
chr1 (65-230)||(33681022-33681188)
chr1 (184-231)||(20454613-20454660)
chr1 (65-229)||(20918620-20918782)
chr1 (26-79)||(43543214-43543267)
chr1 (63-226)||(41049973-41050138)
chr1 (82-231)||(20135201-20135351)
chr1 (120-231)||(21754059-21754170)
chr1 (1-46)||(27161560-27161605)
chr1 (84-230)||(22237642-22237788)
chr1 (192-230)||(52928038-52928076)
chr1 (80-169)||(22354527-22354616)
chr1 (63-226)||(50614053-50614219)
chr1 (63-226)||(50621881-50622047)
chr1 (187-231)||(21714556-21714600)
chr1 (192-231)||(22921937-22921976)
chr1 (63-114)||(16368224-16368276)
chr1 (1-32)||(16275178-16275209)
chr1 (192-231)||(20248293-20248332)
chr1 (63-109)||(21477653-21477700)
chr1 (63-164)||(51130646-51130743)
chr1 (67-164)||(50686695-50686792)
chr1 (63-115)||(22124415-22124468)
chr1 (63-196)||(22130848-22130978)
chr1 (74-158)||(12271642-12271725)
chr1 (184-219)||(38801447-38801483)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-231)||(13958-14188)
scaffold0230 (1-33)||(23452-23484)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-231)||(136691-136921)
scaffold0028 (1-231)||(139160-139390)
scaffold0028 (1-231)||(144098-144328)
scaffold0028 (1-231)||(134222-134452)
scaffold0028 (1-231)||(141629-141859)
scaffold0028 (120-231)||(132672-132784)
scaffold0028 (148-227)||(62216-62296)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-231)||(501095-501325)
scaffold0001 (63-231)||(85562-85731)
scaffold0001 (65-231)||(160698-160864)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-231)||(11299-11530)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-231)||(13403-13633)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-231)||(9253-9483)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (1-231)||(40411-40641)
[»] scaffold0494 (2 HSPs)
scaffold0494 (25-231)||(12194-12400)
scaffold0494 (1-32)||(551-582)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (63-231)||(158433-158601)
scaffold0003 (80-230)||(339905-340053)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (63-228)||(29946-30111)
scaffold0149 (1-43)||(30112-30154)
scaffold0149 (1-32)||(30229-30260)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (50-231)||(82083-82264)
scaffold0037 (65-230)||(22610-22776)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (63-231)||(16795-16963)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (50-231)||(117-298)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (63-231)||(9760-9929)
scaffold0145 (80-231)||(32956-33107)
scaffold0145 (80-231)||(38775-38926)
scaffold0145 (1-41)||(9932-9972)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-231)||(4308-4476)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (50-231)||(12075-12250)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (63-226)||(79267-79430)
scaffold0056 (80-231)||(17170-17324)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-231)||(38577-38809)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (63-226)||(20363-20524)
scaffold0031 (80-231)||(128765-128916)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (50-231)||(1250-1432)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (63-231)||(4225-4393)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (63-231)||(2111-2280)
scaffold0247 (63-227)||(17964-18130)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (63-229)||(161072-161239)
scaffold0007 (63-163)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (80-231)||(22897-23048)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (1-119)||(6070-6188)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (80-231)||(26020-26172)
scaffold0122 (100-231)||(44682-44814)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (74-231)||(51927-52085)
scaffold0011 (80-229)||(167934-168083)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (80-231)||(13225-13377)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (80-231)||(3141-3293)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (80-231)||(3106-3257)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (80-231)||(4522-4673)
scaffold0228 (80-231)||(12104-12255)
scaffold0228 (80-231)||(22056-22207)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (80-231)||(16555-16707)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (80-231)||(1865-2017)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (80-229)||(1004-1153)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (80-231)||(39491-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (80-231)||(75170-75321)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (80-231)||(3484-3636)
scaffold0292 (80-227)||(361-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (80-231)||(32913-33063)
scaffold0120 (80-231)||(45942-46092)
scaffold0120 (81-231)||(16127-16278)
scaffold0120 (183-231)||(17388-17436)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (100-231)||(116441-116571)
scaffold0022 (2-79)||(53794-53873)
scaffold0022 (63-114)||(78453-78505)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (63-230)||(27686-27855)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (65-231)||(8472-8636)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (80-227)||(24257-24406)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (65-230)||(8481-8650)
scaffold0621 (84-231)||(6549-6695)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (80-229)||(4865-5015)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (80-231)||(6076-6231)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (131-231)||(28428-28529)
scaffold0046 (131-229)||(11308-11407)
scaffold0046 (74-229)||(2013-2165)
scaffold0046 (192-229)||(4568-4605)
scaffold0046 (63-115)||(26016-26069)
scaffold0046 (68-115)||(16861-16909)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (80-231)||(25910-26061)
scaffold0026 (80-231)||(39872-40023)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (97-231)||(8493-8628)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (63-227)||(11482-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (63-227)||(38193-38359)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (63-230)||(16037-16206)
scaffold0357 (63-226)||(13147-13313)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (95-226)||(1971-2103)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (1-79)||(1591-1669)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-79)||(3186-3264)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (63-226)||(53486-53651)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (80-181)||(3485-3586)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (65-193)||(13144-13274)
scaffold0175 (74-229)||(34139-34291)
scaffold0175 (189-231)||(287-329)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (1-73)||(27958-28030)
scaffold0114 (144-229)||(15483-15568)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (155-229)||(4728-4803)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (80-229)||(32083-32230)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (144-229)||(13513-13598)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (63-226)||(12587-12751)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (144-229)||(11462-11548)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (63-136)||(12039-12112)
scaffold0503 (166-226)||(11982-12042)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (85-158)||(13092-13165)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (63-171)||(225482-225590)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (80-231)||(39927-40078)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (95-229)||(10395-10528)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-79)||(645-725)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (1-79)||(1247-1327)
scaffold0599 (2-32)||(1143-1173)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (65-231)||(45732-45899)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (97-226)||(174785-174913)
scaffold0021 (184-231)||(121780-121827)
scaffold0021 (80-156)||(124675-124751)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (63-226)||(60652-60818)
scaffold0010 (84-231)||(129919-130066)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (2-79)||(4225-4304)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (65-230)||(10481-10647)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (2-79)||(15083-15162)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (2-79)||(15194-15273)
scaffold0106 (184-231)||(15298-15345)
scaffold0106 (146-226)||(1308-1387)
scaffold0106 (192-226)||(7285-7319)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (63-226)||(1011-1171)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (1-79)||(35986-36065)
scaffold0100 (184-230)||(23942-23989)
[»] scaffold0513 (2 HSPs)
scaffold0513 (1-79)||(10808-10886)
scaffold0513 (1-32)||(10703-10734)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (74-231)||(15675-15829)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (80-227)||(20928-21077)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (63-230)||(25121-25289)
scaffold0123 (63-115)||(667-720)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (63-224)||(7996-8161)
scaffold0507 (63-115)||(2608-2661)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (84-231)||(19278-19424)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (95-224)||(4545-4675)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (63-226)||(6220-6386)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (80-165)||(27911-27996)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (2-79)||(6858-6937)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (146-226)||(1051-1132)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (84-231)||(5657-5803)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (84-231)||(143-290)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (80-226)||(51839-51985)
scaffold0034 (84-230)||(32551-32696)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (63-226)||(97024-97190)
scaffold0006 (63-226)||(106302-106468)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (146-226)||(16301-16380)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (192-231)||(1096-1135)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (192-231)||(1102-1141)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (184-231)||(4893-4940)
scaffold0395 (80-169)||(918-1006)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (192-231)||(6625-6664)
scaffold0333 (192-231)||(14005-14044)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (192-231)||(6191-6230)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (192-231)||(2713-2752)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (192-231)||(15845-15884)
scaffold0020 (187-227)||(178912-178952)
scaffold0020 (63-115)||(142712-142765)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (95-181)||(6675-6761)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (84-231)||(14658-14804)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (124-231)||(2805-2913)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (120-231)||(32112-32224)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (171-226)||(51601-51658)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (187-231)||(23853-23897)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (84-171)||(8090-8176)
scaffold0556 (184-231)||(6826-6874)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (192-231)||(12780-12819)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (80-222)||(38339-38483)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (192-231)||(36464-36503)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (192-226)||(5196-5230)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (170-230)||(8118-8180)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (193-231)||(28839-28877)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (64-153)||(18176-18265)
scaffold0138 (192-230)||(12954-12992)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (144-226)||(47014-47095)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (63-226)||(267679-267844)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (84-230)||(10542-10688)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (95-226)||(1021-1151)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (1-32)||(10001-10032)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (117-218)||(192968-193070)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (63-115)||(547-600)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (63-115)||(1069-1122)
[»] scaffold1419 (1 HSPs)
scaffold1419 (63-103)||(165-206)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (63-115)||(136-189)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (63-115)||(3087-3140)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (63-115)||(7560-7613)
scaffold0111 (63-115)||(14679-14732)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (63-115)||(30462-30515)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (1-33)||(416-448)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (184-224)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16413237 - 16413467
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16413237 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 16413336  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413337 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 16413436  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413437 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16413467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14409365 - 14409595
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409365 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 14409464  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409465 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 14409564  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409565 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14409595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1484643 - 1484413
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484643 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 1484544  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1484543 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1484444  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484443 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1484413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 5853213 - 5853443
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853213 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 5853312  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5853313 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 5853412  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853413 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5853443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20403468 - 20403238
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20403369  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20403368 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20403269  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403268 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20403238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15203152 - 15203382
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203152 gatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15203251  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15203252 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 15203351  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15203352 aactaagctgcatgagtcgctctaagttgat 15203382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22001994 - 22001764
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001994 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 22001895  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22001894 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 22001795  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001794 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22001764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4483521 - 4483292
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483521 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 4483422  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  4483421 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtta-tt 4483323  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483322 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4483292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20046116 - 20046346
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046116 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20046215  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20046216 ttacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20046315  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046316 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20046346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 4542294 - 4542524
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4542294 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 4542393  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  4542394 ttacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgttgttattt 4542493  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542494 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4542524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19896510 - 19896276
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttt-aagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896510 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatatttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 19896411  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatta---ttatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19896410 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgctgttgtt 19896311  T
Q  197 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896310 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19896276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45290615 - 45290846
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  45290615 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgacgttgttatactgtgatataattgtatctgca 45290714  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45290715 ttaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 45290814  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290815 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45290846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14824016 - 14823785
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14824016 gatattatccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 14823917  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14823916 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttat 14823817  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  14823816 ttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgat 14823785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15070801 - 15070571
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  15070801 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatttatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattcagatataattgtatatgc 15070702  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15070701 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 15070602  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070601 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41598367 - 41598199
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41598367 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 41598268  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598267 tgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41598199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19936924 - 19937157
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19936924 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataactgtatgtg 19937023  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtta 197  Q
    ||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19937024 cattgattgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgtta 19937123  T
Q  198 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19937124 tttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 19937157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Original strand, 19801367 - 19801527
Alignment:
Q  65 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  19801367 ttgatgttgttatattgtgttataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatg 19801466  T
Q  165 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801467 ctg-ttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26224098 - 26223930
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26224098 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 26223999  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26223998 tgctatttttgtatattgctttattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgat 26223930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 25484245 - 25484419
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25484245 gatgttgattatgatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25484344  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25484345 tattattatgtcatgctgtttttgtatac-------tagctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgat 25484419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 24485965 - 24486093
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24485965 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttctaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24486064  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgaga 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24486065 ttacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 18818348 - 18818516
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818348 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcat 18818447  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818448 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18818516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32810172 - 32810054
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32810172 gatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32810073  T
Q  101 ttacttgaattatatgtga 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32810072 ttacttgaattatatgtga 32810054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 16092297 - 16092449
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092297 tgtgatataatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 16092396  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092397 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16092449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372792
Alignment:
Q  93 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg 191  Q
    |||| |||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7372792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6759421 - 6759272
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| |||||| |||||||||  ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6759421 tgtgatataatgttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 6759325  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759324 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6759272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20536374 - 20536222
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536374 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 20536275  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536274 gcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20536222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 21918955 - 21919105
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattat-atgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 178  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  || || |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21918955 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 21919053  T
Q  179 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919054 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21919105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23406548 - 23406393
Alignment:
Q  79 ttgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgtt--gttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtat 176  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | |  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23406548 ttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtat 23406449  T
Q  177 actgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406448 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 28648999 - 28649151
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || |||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28648999 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 28649098  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649099 gcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28649151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 21923900 - 21924035
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 195  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  21923900 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgt 21923999  T
Q  196 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21924000 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21924035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26219858 - 26219728
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26219858 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactatttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 26219760  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219759 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26219728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22875230 - 22875079
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22875230 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 22875132  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875131 gcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 22875079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22626901 - 22626750
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22626901 tgtgatataatgttatacacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 22626803  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626802 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22626750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 13508022 - 13508188
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  13508022 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13508121  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || || || ||| || || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13508122 atgatg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13508188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 13597554 - 13597720
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  13597554 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 13597653  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || ||||| || |||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13597654 atgatg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 13597720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 26225268 - 26225398
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  26225268 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgtttt-gtatattgttgtgtcgctgttgttatt 26225366  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225367 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26225398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 18879191 - 18879338
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879191 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatact 18879285  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879286 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18879338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612213
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| || |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttg 17612157  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
     |||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17612158 catactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 17612213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 31971421 - 31971273
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31971421 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattggaattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 31971324  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971323 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 31971273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20498746 - 20498581
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  20498746 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 20498647  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||  ||||  |||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20498646 atgct-attttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 45131017 - 45131098
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131017 aattgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45131098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 38550032 - 38550090
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550032 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 38550090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 32121969 - 32121912
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32121969 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 32121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37116532 - 37116366
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  37116532 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37116434  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116433 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 27472338 - 27472395
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472338 gatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 27472395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 38855212 - 38855358
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  38855212 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 38855308  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855309 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38855358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 16199664 - 16199746
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  | |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16199664 aattgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16199746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21285758 - 21285611
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  21285758 atataattgtatatacattacatgaactatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 21285661  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21285660 atgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21285611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23648719 - 23648567
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 178  Q
    |||||||||||  | | ||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  23648719 tgtgatataatgttgtgtgcattacttgaagttttat-tgaatatttaagatgttgttgtattgcaaatgatattattatgtcatgttgttgttgtaatc 23648621  T
Q  179 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23648620 tgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23648567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 226
Target Start/End: Original strand, 5866227 - 5866376
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  5866227 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 5866321  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
     |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866322 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5866376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17141084 - 17140932
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||  || |    
T  17141084 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggatt-g 17140990  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140989 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 17140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Original strand, 18678094 - 18678209
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  18678094 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 18678193  T
Q  216 gtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18678194 gtcagtctaagttgat 18678209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21491163 - 21491011
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| |  |||||||||| ||||| ||  ||||    
T  21491163 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatg-gtttg 21491069  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491068 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21491011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 1326958 - 1327042
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttata------tgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1326958 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatgtatatacgatgttttgagatgttgattattatttgatgttgttatat 1327042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 18677986 - 18678043
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18677986 gatattatccatgattgatgaagtgttatatttatgtatgatgttttaagatgttgat 18678043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6520430 - 6520382
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520430 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6520382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983512
Alignment:
Q  184 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 983512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23760950
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 23760950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32121861 - 32121746
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32121861 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 32121762  T
Q  216 gtcggtctaagttgat 231  Q
    |||  |||||||||||    
T  32121761 gtcattctaagttgat 32121746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 16401951 - 16402020
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttga 68  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||    
T  16401951 gatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttga 16402020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 17266930 - 17267096
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  17266930 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 17267028  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  | | |||| | ||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267029 atgaaccg-ttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 20982648 - 20982710
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgt----tatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20982648 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatatatatatatatgatgttttaagatgttgatt 20982710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 21389473 - 21389552
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389473 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 21396003 - 21396082
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396003 ttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 21778799 - 21778878
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778799 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21778878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 21790496 - 21790575
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790496 ttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 21790575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 17439461 - 17439609
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| |||||  ||| |||| | ||    
T  17439461 tgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactg-ttttatgta 17439558  T
Q  178 ctg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||| || ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439559 ctgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355805
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26355805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249400
Alignment:
Q  195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21249400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 195 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255238
Alignment:
Q  195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21255238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 35026849 - 35026895
Alignment:
Q  33 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  35026849 tatatatgatgttttaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 35026895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 13425274 - 13425305
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425274 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 13425380 - 13425411
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13425380 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 13425411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 20982542 - 20982573
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20982542 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673718
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat 21673718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 2418860 - 2418906
Alignment:
Q  33 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  2418860 tatatatgatgtttcaagatgttgattatcgtttgatattgttatat 2418906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 19936820 - 19936850
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936820 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19936850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 17438154 - 17438207
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17438154 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 17438207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22364845 - 22364792
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22364845 atttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 22364792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37515888 - 37515835
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37515888 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 37515835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 30
Target Start/End: Original strand, 16401847 - 16401875
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttata 30  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401847 atattgttcatgattgatgaagtgttata 16401875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 76)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 30676631 - 30676861
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30676631 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 30676730  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676731 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 30676830  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676831 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 30676861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34963614 - 34963384
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34963614 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 34963515  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34963514 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34963415  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34963414 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 34963384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22782468 - 22782238
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 22782369  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782368 ttacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 22782269  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782268 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22782238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24422788 - 24422558
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422788 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24422689  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24422688 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24422589  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422588 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24422558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33862035 - 33861805
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33862035 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 33861936  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33861935 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 33861836  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861835 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33861805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33864519 - 33864289
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864519 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 33864420  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33864419 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 33864320  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864319 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33864289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8055270 - 8055040
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055270 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 8055171  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8055170 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgttgttattt 8055071  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055070 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8055040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12742554 - 12742328
Alignment:
Q  5 ttgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742554 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 12742455  T
Q  105 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12742454 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 12742355  T
Q  205 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12742354 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 12742328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18334513 - 18334743
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334513 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 18334612  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18334613 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18334712  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334713 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18334743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19005287 - 19005057
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005287 gatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19005188  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19005187 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 19005088  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005087 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19858840 - 19859070
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858840 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattgttatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 19858939  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19858940 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 19859039  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859040 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1540832 - 1541062
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1540832 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgca 1540931  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1540932 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1541031  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1541032 aactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 1541062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 2291101 - 2291331
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291101 gatattgtccatgactgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 2291200  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2291201 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 2291300  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291301 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2291331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 26924561 - 26924791
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26924561 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtacatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26924660  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  26924661 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattt 26924760  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924761 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26924791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25656870 - 25656640
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  25656870 gatattgtccaagattgatgaagtgttatatgtatataagatgttttaagatgttgattaccatttgatgtttttatattgtgatataattatatatgta 25656771  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25656770 ttagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgttgttattt 25656671  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656670 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25688743 - 25688513
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  25688743 gatattgtccatgattgaggaagtgttatatgtataaatgatgttttaagatgttgattaccatttggtgttgttatattgtgatatgattatatatgta 25688644  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25688643 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgttgttattt 25688544  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25688543 aactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 25688513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1595763 - 1595560
Alignment:
Q  28 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595763 atatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattga 1595664  T
Q  128 gacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1595663 gacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 1595564  T
Q  228 tgat 231  Q
    ||||    
T  1595563 tgat 1595560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25755001 - 25754820
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  25755001 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 25754902  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754901 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25754820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18456898 - 18456735
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18456898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 18456799  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456798 tgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 20556864 - 20557043
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||    
T  20556864 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttga 20556961  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20556962 tattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20557043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 16448514 - 16448678
Alignment:
Q  68 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16448514 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 16448613  T
Q  167 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16448614 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 16448678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Original strand, 3852001 - 3852168
Alignment:
Q  64 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||    
T  3852001 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcat 3852100  T
Q  164 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3852101 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3852168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 90 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18462031 - 18461895
Alignment:
Q  90 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18462031 ttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgc 18461932  T
Q  190 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461931 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 20360915 - 20361067
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20360915 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgct 20361014  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20361015 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 20361067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 25629310 - 25629462
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629310 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatact 25629409  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629410 gcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25629462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25644487 - 25644335
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  25644487 tgtgatataattgtatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatact 25644388  T
Q  180 g-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644387 gcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25644335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29060703 - 29060554
Alignment:
Q  83 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-c 181  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  29060703 gatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcc 29060604  T
Q  182 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29060603 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgat 29060554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 18409782 - 18409934
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||| |||| |||||||||   || || ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18409782 tgtgatataatgttatatgtattatttgaattatgaatggatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatact 18409881  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409882 gcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagttgat 18409934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Original strand, 17287768 - 17287903
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 195  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||||    
T  17287768 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgt 17287867  T
Q  196 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287868 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17287903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16496410 - 16496260
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16496410 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 16496311  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496310 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16496260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20593939 - 20593787
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20593939 tgtgatatattgttatacgcattacttgatttatgattgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 20593840  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  20593839 gcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtctaagttgat 20593787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 19847932 - 19848102
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtg-aataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||  ||||||| || ||||||||||| ||||||     
T  19847932 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtg 19848031  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||  ||||  ||| || || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19848032 ttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 19848102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 18821801 - 18821946
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 178  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18821801 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcg-ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatac 18821898  T
Q  179 tgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821899 tgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 19303496 - 19303647
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19303496 tgtgatataatgttatgtacattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 19303594  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303595 tcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 19303647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 22780166 - 22780334
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |   ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  22780166 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttgcgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaa 22780265  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22780266 gctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 22780334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12942442 - 12942363
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 80  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942442 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 12942363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20076862 - 20076714
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||  || |||   |||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20076862 tgtgatataatgttatacgcattacttgaagtataattgaatttttaaga---tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtttact 20076767  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076766 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 28289256 - 28289334
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  28289256 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgtcgttatat 28289334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 231
Target Start/End: Original strand, 20638301 - 20638390
Alignment:
Q  143 caattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20638301 caattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgat 20638390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20109322 - 20109153
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |     
T  20109322 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatt 20109223  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109222 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20109153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18914068 - 18913994
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 75  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18914068 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18913994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 8227448 - 8227616
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  8227448 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 8227547  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||| || ||||| |||||| ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8227548 atgatg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttg 8227616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 18937317 - 18937252
Alignment:
Q  10 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18937317 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgtt 18937252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15875547 - 15875469
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15875547 gatattgtaaatgattaatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15875469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 31630568 - 31630626
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630568 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 31630626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714431
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25714431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 17377770 - 17377814
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377770 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 17377814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23019567 - 23019425
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 183  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  23019567 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgctt 23019470  T
Q  184 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019469 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23992664 - 23992604
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat---gatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  23992664 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgatgttttaagatgttgat 23992604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 28496424 - 28496575
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  28496424 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 28496518  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
     ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496519 catactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28496575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 228
Target Start/End: Original strand, 29808835 - 29808986
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| || |||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  29808835 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttga-tatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 29808929  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
     ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808930 catactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29808986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333325
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27333325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394065
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27394065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098620
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 9098620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35245735 - 35245605
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 193  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  35245735 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtt 35245639  T
Q  194 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245638 tgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35245605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 19847889 - 19847931
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 43  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847889 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 19847931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652209
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19652209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19668433 - 19668386
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668433 tgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 19668386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992441
Alignment:
Q  133 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185524
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11185524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561319
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 1561319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831524
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22831524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 23076915 - 23076862
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23076915 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatat 23076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33443068
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 15875652 - 15875621
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15875652 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15875621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 18914173 - 18914142
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18914173 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18914142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 222
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920728
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16920728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 18177609 - 18177662
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18177609 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18177662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 18199353 - 18199406
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18199353 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18199406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18204262 - 18204209
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  18204262 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtgaattatat 18204209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18696670 - 18696617
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18696670 atttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18696617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18706488 - 18706435
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18706488 atttgatgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaattatat 18706435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 198 - 231
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080832
Alignment:
Q  198 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22080832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 28103836 - 28103889
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  28103836 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattatgtgaattatat 28103889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 1598298 - 1598266
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 33  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1598298 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 1598266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4185928
Alignment:
Q  184 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat 4185928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32214842 - 32215072
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32214842 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 32214941  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32214942 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgttgttattt 32215041  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215042 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32215072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6726236 - 6726006
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726236 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 6726137  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6726136 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 6726037  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726036 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6726006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21154981 - 21155211
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21154981 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21155080  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21155081 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21155180  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155181 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21155211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18809184 - 18808954
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809184 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 18809085  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18809084 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18808985  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808984 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18808954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23709453 - 23709683
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709453 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 23709552  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23709553 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23709652  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709653 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23709683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23711934 - 23712164
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711934 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 23712033  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23712034 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23712133  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712134 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23712164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39682554 - 39682324
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682554 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 39682455  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39682454 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39682355  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682354 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39682324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23131103 - 23130873
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23131103 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 23131004  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23131003 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23130904  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130903 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23130873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23133570 - 23133340
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133570 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 23133471  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23133470 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23133371  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133370 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23133340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 34402443 - 34402673
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402443 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 34402542  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34402543 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34402642  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402643 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34402673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 571638 - 571408
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571638 gatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 571539  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  571538 ttacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 571439  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571438 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 571408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23135831 - 23135601
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23135831 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgctgattatcatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 23135732  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23135731 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 23135632  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135631 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23135601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26505620 - 26505390
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26505620 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26505521  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505520 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 26505421  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505420 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26505390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26508098 - 26507868
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26508098 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 26507999  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507998 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 26507899  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507898 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26507868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24898116 - 24898347
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898116 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24898215  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24898216 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24898315  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24898316 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24898347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24900599 - 24900830
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900599 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24900698  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24900699 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24900798  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24900799 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24900830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24903076 - 24903307
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903076 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24903175  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24903176 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24903275  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24903276 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24903307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24905553 - 24905784
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905553 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24905652  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24905653 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24905752  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24905753 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24905784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 24908028 - 24908259
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908028 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 24908127  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24908128 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24908227  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24908228 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24908259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24368015 - 24367785
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24368015 gatattttccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24367916  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24367915 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24367816  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367815 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24367785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 32039419 - 32039649
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039419 gatattgtccatgatcgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32039518  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  32039519 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgttgttattt 32039618  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32039619 aactaagctgcatgagccggtctaagttgat 32039649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28577339 - 28577110
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577339 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 28577240  T
Q  102 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28577239 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgttgttattta 28577140  T
Q  202 actaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577139 actaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28577110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22105654 - 22105423
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105654 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattataatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 22105555  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  22105554 ttacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatt 22105455  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105454 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 45029784 - 45030005
Alignment:
Q  10 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45029784 catgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgatgattattatttcatgttgttatattgtgatataaatgtatatgcattacttgaa 45029883  T
Q  110 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagct 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45029884 ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgttgttatttaactaagct 45029983  T
Q  210 gcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  45029984 gcatgagtcggtctaagttgat 45030005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38967615 - 38967385
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38967615 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattattatttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgca 38967517  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||| | ||||||||||    
T  38967516 ttaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatgttgttatt 38967417  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967416 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43137477 - 43137310
Alignment:
Q  64 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43137477 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat 43137378  T
Q  164 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137377 gttgtttttgtatattactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 43137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 24529511 - 24529680
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  24529511 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtc 24529610  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24529611 atgctgtttttgtatactgatgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 24529680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 24642775 - 24642933
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642775 gatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 24642874  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatta 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24642875 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23060679 - 23060527
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23060679 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23060580  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060579 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23060527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23076608 - 23076460
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076608 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 23076509  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076508 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 23076460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22337281 - 22337129
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22337281 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatataca 22337182  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337181 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22337129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19672010 - 19671848
Alignment:
Q  65 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| |||||    
T  19672010 ttgatgttgttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-attgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatg 19671912  T
Q  165 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
     || ||||| |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19671911 atg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 19671848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 22731189 - 22731341
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || | | |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22731189 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22731288  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22731289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgat 22731341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 22738135 - 22738286
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22738135 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22738234  T
Q  180 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738235 gcctatttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22738286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 23708558 - 23708725
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | ||| || ||||||||||| |||| ||||    
T  23708558 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcat 23708657  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    | || ||||| |||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23708658 gttg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga 23708725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20261460 - 20261381
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 80  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261460 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 20261381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23286027 - 23285879
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||  | || |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23286027 tgtgatataatgttttatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatact 23285932  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285931 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23285879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 298769 - 298922
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  298769 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 298868  T
Q  180 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298869 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 298922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 38134 - 38219
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38134 aattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 23654341 - 23654491
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||| | |||  |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  23654341 tgtgatataatgttttatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgct 23654440  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654441 gcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23654491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 164 - 231
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643101
Alignment:
Q  164 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24643101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 119
Target Start/End: Original strand, 22173799 - 22173868
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 119  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173799 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtga 22173868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23660188 - 23660037
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  23660188 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatact 23660090  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  23660089 gcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgat 23660037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 7688 - 7835
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||    
T  7688 tgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatact 7786  T
Q  180 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    | || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7787 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 10684684 - 10684764
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10684684 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 10684764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 23707243 - 23707323
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23707243 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 23707323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24918276 - 24918196
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24918276 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 24918196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103497
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgt 195  Q
    ||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || ||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  196 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 23103497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25616422 - 25616365
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25616422 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 25616365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040296
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23040296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 20520130 - 20520295
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||| |||| ||    
T  20520130 atttgatgtcgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattgttatatc 20520227  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520228 atgaactg-ttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24671161 - 24671081
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24671161 gatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatattgttatat 24671081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405990
Alignment:
Q  124 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 221  Q
    |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  222 ctaagttgat 231  Q
    ||||||||||    
T  28405999 ctaagttgat 28405990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 150
Target Start/End: Original strand, 22459511 - 22459587
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgat 150  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||    
T  22459511 ttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatgtgaatatttgagatgttgatgactttcatttgat 22459587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 169 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8946734 - 8946671
Alignment:
Q  169 ttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8946734 ttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8946671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Original strand, 32451894 - 32452031
Alignment:
Q  91 tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg 188  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||    
T  32451894 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 32451992  T
Q  189 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451993 ctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23207461 - 23207296
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||  |||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||    
T  23207461 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttat-aat-gttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatc 23207364  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207363 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24681580 - 24681500
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |   ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24681580 gatattgtccatgattgatgaagtattagatgtatatatgatgtttaagttgatgttgatcatcatttgatgttgttatat 24681500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20309206 - 20309127
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309206 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20309127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25616314 - 25616199
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  25616314 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatga 25616215  T
Q  216 gtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| ||||||||||||    
T  25616214 gtcagtctaagttgat 25616199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7679699 - 7679599
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7679699 gttgatgacttaca-ttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 7679602  T
Q  229 gat 231  Q
    |||    
T  7679601 gat 7679599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787009
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18787009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 23791458 - 23791357
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  23791458 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatc 23791360  T
Q  162 atg 164  Q
    |||    
T  23791359 atg 23791357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134306
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29601518 - 29601478
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcatta 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29601518 atttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcatta 29601478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 24529468 - 24529510
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 43  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24529468 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtgtatatgatg 24529510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175864
Alignment:
Q  124 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 221  Q
    |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  222 ctaagttgat 231  Q
    ||||||||||    
T  25175873 ctaagttgat 25175864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392403
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 113
Target Start/End: Original strand, 22413073 - 22413124
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattat 113  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22413073 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattat 22413124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 229
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072054
Alignment:
Q  194 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttg 23072054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 23707139 - 23707169
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707139 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 23707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 24642671 - 24642701
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642671 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24642701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 24671265 - 24671235
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24671265 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24671235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 24681684 - 24681654
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24681684 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24681654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Original strand, 24697543 - 24697644
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||   |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  24697543 attttatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgaa-gtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatc 24697641  T
Q  162 atg 164  Q
    |||    
T  24697642 atg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 24918380 - 24918350
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918380 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 24918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 21237936 - 21237883
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  21237936 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 21237883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 25109072 - 25109019
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25109072 atttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 25109019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4935 - 4705
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4935 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgttgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 4836  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4835 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 4736  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4735 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3515248 - 3515018
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3515248 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 3515149  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3515148 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtttttt 3515049  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515048 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18215195 - 18215425
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215195 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 18215294  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215295 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 18215394  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215395 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18215425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15118273 - 15118503
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118273 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15118372  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15118373 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 15118472  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118473 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15118503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 19618093 - 19618323
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19618093 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 19618192  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618193 ttacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 19618292  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618293 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19618323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 12228 - 12458
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12228 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattggatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 12327  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12328 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 12427  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12428 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52312751 - 52312521
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312751 gatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 52312652  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52312651 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 52312552  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312551 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52312521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14970628 - 14970858
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14970628 gatattgttcataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgta 14970727  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14970728 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgttgttattt 14970827  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970828 aactaagctgcatgagttggtctaagttgat 14970858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44615529 - 44615299
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44615529 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 44615430  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44615429 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 44615330  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615329 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44615299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 18239340 - 18239570
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18239340 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 18239439  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18239440 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattt 18239539  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239540 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18239570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 50222260 - 50222490
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50222260 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatattgttatactgtgatataattgtatatgca 50222359  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50222360 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgttgttattt 50222459  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222460 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50222490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15355245 - 15355476
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355245 gatattgtccatgattgatgaaatgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15355344  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15355345 ttaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 15355444  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355445 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15355476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19242941 - 19242710
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19242941 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttggagttgtttatattgtgatataattatatatgc 19242842  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19242841 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatt 19242742  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242741 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19242710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 1837430 - 1837660
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1837430 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttataatgtgatataatcgtatatgca 1837529  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1837530 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 1837629  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837630 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1837660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 44773004 - 44773238
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat----gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtata 96  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773004 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtata 44773103  T
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgtt 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44773104 tgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgtt 44773203  T
Q  197 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773204 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44773238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 51463838 - 51464019
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  51463838 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 51463937  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463938 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51464019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 23803235 - 23803416
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || || ||||    
T  23803235 gatgttgattatgattttatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttga 23803334  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803335 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23803416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7641107 - 7641333
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat------gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgta 94  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||      ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641107 gatatttttcatgattgatgaagtgttatatatatatatatatatgatattttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgta 7641206  T
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||          |||||||||||||    
T  7641207 tatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttt----------tgtgttgctgttg 7641296  T
Q  195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641297 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7641333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44102393 - 44102225
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  44102393 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 44102294  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102293 tgctgtttttgtatactactgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44102225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12611135 - 12610961
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  12611135 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 12611036  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611035 tattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12610961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 21815568 - 21815731
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21815568 atttgatgttgttatattatgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtca 21815667  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815668 tgctgtttttgtatacagttgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Original strand, 44928873 - 44929031
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  44928873 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttg 44928972  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928973 tatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44929031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15367873 - 15367708
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15367873 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15367774  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15367773 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15367708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15402886 - 15402721
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15402886 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15402787  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15402786 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15402721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15371385 - 15371220
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15371385 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15371286  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15371285 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15371220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15373666 - 15373501
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15373666 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtc 15373567  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15373566 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15373501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15370200 - 15370036
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  15370200 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcgt-agttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 15370102  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15370101 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 15370036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16223712 - 16223550
Alignment:
Q  66 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16223712 tgatgttgttatattgtgatataattgtatatgggttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatg 16223613  T
Q  165 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16223612 ctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagt 16223550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20150004 - 20149840
Alignment:
Q  68 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20150004 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 20149905  T
Q  167 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20149904 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20149840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12902923 - 12902773
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902923 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 12902824  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902823 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12902773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7798956 - 7798788
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7798956 ttgatgttgattatgttgtgatacaatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcat 7798857  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798856 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7798788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22354010 - 22353852
Alignment:
Q  69 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt 168  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| |||    
T  22354010 tgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgt 22353911  T
Q  169 ttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |  |  |  ||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22353910 tgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaag 22353852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7089043 - 7088891
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| ||||||  | ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7089043 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7088944  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088943 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7088891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 16377478 - 16377628
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16377478 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatact 16377575  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377576 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16377628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7893869 - 7893717
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893869 tgtgaaataatggtatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 7893770  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893769 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 7893717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14038814 - 14038662
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14038814 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaaatatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatact 14038715  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14038714 gcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 14038662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22636601 - 22636449
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22636601 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaact 22636502  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636501 gtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22636449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 54798729 - 54798861
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttat 198  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  54798729 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttat 54798828  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798829 tcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 54798861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14280434 - 14280327
Alignment:
Q  124 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 223  Q
    |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280434 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14280335  T
Q  224 aagttgat 231  Q
    ||||||||    
T  14280334 aagttgat 14280327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 231
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873474
Alignment:
Q  133 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 228
Target Start/End: Original strand, 8574844 - 8574971
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8574844 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 8574942  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574943 taactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44052995 - 44052843
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052995 tgtgatataatgttatgagcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 44052896  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44052895 gcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgat 44052843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 13788 - 13953
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  13788 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 13887  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13888 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 52243131 - 52243302
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  52243131 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatc 52243230  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||  |||  |||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243231 atgaactg-atttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52243302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 16270191 - 16270342
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16270191 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 16270289  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16270290 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgat 16270342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15534422 - 15534343
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 80  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534422 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 15534343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 23374314 - 23374464
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  23374314 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatact 23374413  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23374414 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 36038111 - 36038033
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038111 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 36038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14048818 - 14048740
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14048818 gatattgtcaatgattgatgaggtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 14048740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 15496992 - 15497070
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15496992 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 15497070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 43198492 - 43198661
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||  |||| ||||    
T  43198492 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T
Q  164 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |  |  ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198592 gaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 43198661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 52873099 - 52873176
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttata 78  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  52873099 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttata 52873176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6900056 - 6899905
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||    
T  6900056 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgtttt-gtatact 6899958  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6899957 gcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 6899905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Original strand, 16239927 - 16240076
Alignment:
Q  82 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg- 180  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| || ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  16239927 tgatataatgttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc 16240025  T
Q  181 ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16240026 ctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgat 16240076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 49547695 - 49547773
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49547695 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatctatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatat 49547773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096309
Alignment:
Q  160 tcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3096309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 362325 - 362268
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362325 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 362268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 14746538 - 14746618
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14746538 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 14746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 6190618 - 6190481
Alignment:
Q  91 tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttg 188  Q
    |||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||| | |||||    
T  6190618 tgtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttcgcttaca-ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttg 6190520  T
Q  189 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190519 ctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 171
Target Start/End: Original strand, 15464888 - 15464977
Alignment:
Q  82 tgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15464888 tgatataattgtatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctatttt 15464977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 46640393 - 46640558
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||| |||| || || |||||||| |||| ||    
T  46640393 atttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatc 46640490  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640491 atgaactg-ttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12774069 - 12774021
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12774069 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12774021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 19857659 - 19857607
Alignment:
Q  27 tatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19857659 tatatatatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 19857607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 12288269 - 12288316
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288269 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 12288316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15551985 - 15551833
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||  | ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15551985 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggatt-g 15551891  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551890 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15551833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706395
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39706395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Original strand, 14053321 - 14053403
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || || || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14053321 aattgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaag 14053403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 53082089 - 53082254
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| ||| |||| || |  |||||||| |||| ||    
T  53082089 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatc 53082186  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082187 atgaactg-ttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046506
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17046506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846370
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat 8846370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 362421 - 362390
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362421 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15355140 - 15355171
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355140 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15355171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 15496095 - 15496126
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15496095 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15496126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 18215090 - 18215121
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215090 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 18215121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 19857829 - 19857798
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19857829 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19857798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 19617989 - 19618019
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19617989 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 19618019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 16043195 - 16043142
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  16043195 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 16043142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 15791957 - 15791905
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 114  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15791957 atttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattata 15791905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11014 - 10784
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11014 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 10915  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 10815  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10814 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20988 - 20758
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20889  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20888 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20789  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20788 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38062 - 37832
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38062 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 37963  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37962 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 37863  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 37832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 17361 - 17591
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17361 gatattgttcatgattgatgaagtgtcatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatactgtgatataattatatatgca 17460  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17461 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctattgttattt 17560  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17561 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 94652 - 94422
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94652 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 94553  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  94552 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 94453  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94452 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 94422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44614 - 44465
Alignment:
Q  83 gatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatactgc 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  44614 gatataattctatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt 44515  T
Q  182 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44514 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 100534 - 100388
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  || |||| |||||| |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  100534 atataattgtatatacattatatgaattat--gttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgattt-gcatactgcct 100438  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100437 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 100388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119891
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 119891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 40135 - 40281
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| |  |||||| |    
T  40135 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcctactgcct 40231  T
Q  183 gtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40232 atgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 40281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101513
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 101513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 105263 - 105210
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  105263 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattttttgaattatat 105210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 456562 - 456332
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456562 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 456463  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  456462 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 456363  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456362 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 456332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 11393208 - 11393438
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393208 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 11393307  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11393308 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 11393407  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393408 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11393438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15376634 - 15376864
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376634 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 15376733  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15376734 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 15376833  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376834 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15376864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16232761 - 16232531
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232761 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 16232662  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16232661 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16232562  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232561 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16232531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 20385044 - 20385274
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385044 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 20385143  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20385144 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 20385243  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385244 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20385274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21189516 - 21189746
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189516 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21189615  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21189616 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21189715  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189716 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21189746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24702479 - 24702249
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702479 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24702380  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24702379 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24702280  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702279 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24702249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32125732 - 32125502
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125732 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32125633  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32125632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 32125533  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125532 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 32125502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41523158 - 41522928
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523158 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 41523059  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41523058 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 41522959  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522958 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41522928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41525620 - 41525390
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525620 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 41525521  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41525520 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 41525421  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525420 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41525390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 14949043 - 14949273
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949043 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 14949142  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14949143 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 14949242  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949243 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27217101 - 27216871
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217101 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 27217002  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27217001 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 27216902  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27216901 aactaagctgcatgagttggtctaagttgat 27216871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18640513 - 18640283
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640513 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattattttatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 18640414  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18640413 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 18640314  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640313 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18640283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11972737 - 11972507
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972737 gatattgcccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 11972638  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972637 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 11972538  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972537 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11972507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16213925 - 16213695
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16213925 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttcatatgttgattaccatttgatgttgttatgttgtgatataattatatatgca 16213826  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213825 ttacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 16213726  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213725 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16213695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16410300 - 16410070
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16410300 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactatgatataattgtatatgta 16410201  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16410200 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16410101  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410100 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16410070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24704926 - 24704699
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704926 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 24704827  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24704826 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc---ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 24704730  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704729 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24704699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18430953 - 18430723
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18430953 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 18430854  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18430853 ttacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattt 18430754  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430753 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18430723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13869589 - 13869357
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13869589 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 13869490  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    || | ||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13869489 atcaattagattatctttgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 13869390  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869389 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13869357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44116688 - 44116520
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44116688 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 44116589  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44116588 tgttgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44116520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13647521 - 13647344
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13647521 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 13647422  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647421 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 13647344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26355902 - 26356090
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355902 gatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 26356001  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26356002 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26356090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 26358354 - 26358542
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtata--tatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26358354 gatattgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatatgatgttttaagatgttgattattatttaatgttgttatattgtgatataattgtatatg 26358453  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26358454 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtt 26358542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 64 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3386511 - 3386344
Alignment:
Q  64 tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  3386511 tttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcat 3386412  T
Q  164 gctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386411 gctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3386344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275182
Alignment:
Q  93 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  193 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24275182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 17061898 - 17062066
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  17061898 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtca 17061997  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061998 tgct-attttgtatactgctgagttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17062066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 12756654 - 12756817
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  12756654 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtca 12756753  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756754 tgttgtttttgtatattgttgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20110723 - 20110567
Alignment:
Q  65 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20110723 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 20110624  T
Q  165 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110623 ctgtttttgtata----------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20110567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 38898359 - 38898528
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  38898359 atttgacgttgttatactgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 38898458  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38898459 atgctgtttttatatactgctgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 38898528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 3564319 - 3564471
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||| ||||  |||| ||||||||||||||||   || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3564319 tgtgatctaatgttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 3564418  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564419 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3564471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Original strand, 15081868 - 15081999
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaa--gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081868 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatg 15081967  T
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagac 130  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15081968 cattaattgaattatatgtgaataattgagac 15081999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12698998 - 12698845
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698998 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatac 12698899  T
Q  179 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698898 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12698845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273403
Alignment:
Q  123 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 221  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  222 ctaagttgat 231  Q
    ||||||||||    
T  48273412 ctaagttgat 48273403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13841253 - 13841157
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 97  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841253 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatat 13841157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13831499 - 13831384
Alignment:
Q  116 gtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13831499 gtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatga 13831400  T
Q  216 gtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| |||||    
T  13831399 gtcggtctaaattgat 13831384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9509355 - 9509203
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9509355 tgtgatatagtgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatact 9509256  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509255 gcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9509203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 18456368 - 18456519
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18456368 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 18456466  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456467 gcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18456519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26212168 - 26212012
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26212168 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttg 26212069  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212068 tatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 2280056 - 2280225
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  2280056 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 2280155  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280156 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 2280225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38227646 - 38227499
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38227646 tgtgatataatgatatgtacattaattgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 38227548  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227547 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 38227499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 11303488 - 11303409
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 80  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303488 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatatt 11303409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10589204 - 10589055
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||  |||| |||| | |  ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10589204 tgtgatataat-gtttatgcattgcttgaagaatatttgaacattgaagatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatact 10589106  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589105 gcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18627796 - 18627717
Alignment:
Q  12 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataatt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18627796 tgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattagtatttgatcttgttatattgtgatataatt 18627717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 14269983 - 14270061
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14269983 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 14270061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 16108611 - 16108688
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16108611 atattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccgtttgatgttgttatat 16108688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8468881 - 8468803
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8468881 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttatgatgttgattattatttgatgttgttatat 8468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 15143993 - 15144143
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||   || ||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||| || || ||||||| ||| |||||    
T  15143993 tgtgatatgatgttatacgcattacttaaattatgaatgtatacttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatact 15144092  T
Q  180 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144093 gagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15144143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 19486681 - 19486847
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  19486681 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 19486780  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19486781 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 19486847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 23664874 - 23664952
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23664874 gatattgtcaatgattgatgaaaggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 23664952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 8940415 - 8940335
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8940415 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 8940335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 29796851 - 29796771
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29796851 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29796771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 29800670 - 29800590
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat--gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29800670 gatattgtcaatgattgatgaagggttatatgtatatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 29800590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 38898149 - 38898229
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38898149 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 38898229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16495581 - 16495421
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  16495581 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 16495486  T
Q  163 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495485 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16495421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 223
Target Start/End: Original strand, 12255730 - 12255892
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| || || || |||||||| |||| ||||    
T  12255730 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcat 12255829  T
Q  164 g-ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 223  Q
    |  |   |||| |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255830 gaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 229
Target Start/End: Original strand, 16386263 - 16386353
Alignment:
Q  141 tacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386263 tacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16386353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072927
Alignment:
Q  124 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 221  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  222 ctaagttgat 231  Q
    ||||||||||    
T  22072936 ctaagttgat 22072927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 40443555 - 40443410
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||  || ||||    
T  40443555 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgctgttt--gtttact 40443459  T
Q  180 gc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443458 gcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 40443410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34200954 - 34200802
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  34200954 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 34200860  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200859 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 34200802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 45847682 - 45847739
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847682 gatattgttcatgattgatgaagttttatatgtatatatgatg-tttaagatgttgatt 45847739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 1867932 - 1868101
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||| | || | ||||||||| |||| ||    
T  1867932 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttcatttgc-attgatattgttatatc 1868029  T
Q  162 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||  |||| |||| ||||||| || ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868030 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15116651 - 15116568
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15116651 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcaattgatattgttat 15116568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67759
Alignment:
Q  123 attgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 220  Q
    ||||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  221 tctaagttgat 231  Q
    |||||||||||    
T  67769 tctaagttgat 67759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18005806 - 18005660
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg 183  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || |||   ||||||||     
T  18005806 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttcc-atactgctt 18005710  T
Q  184 -tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005709 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 18005660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16056488 - 16056343
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||  | ||| || ||    
T  16056488 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtct 16056392  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16056391 atgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga 16056343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15113114 - 15113031
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  15113114 ttataatgtgatataattgtatatatattacttgagttatatgtgaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811238
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 811238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014192
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 44014192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831821
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 47831821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 15008436 - 15008489
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15008436 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatat 15008489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 20220127 - 20220180
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20220127 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatat 20220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 231
Target Start/End: Original strand, 28505321 - 28505405
Alignment:
Q  148 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28505321 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 28505405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Original strand, 16219677 - 16219823
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  16219677 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 16219774  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16219775 atgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 16219823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154944
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15754992
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15754992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044761
Alignment:
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14044761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14269878 - 14269909
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14269878 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 14269909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354791
Alignment:
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 14354791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15211586 - 15211484
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 214  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15211586 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 15211488  T
Q  215 agtc 218  Q
    ||||    
T  15211487 agtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 8940519 - 8940489
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940519 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 8940489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 15081764 - 15081794
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081764 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 15081794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 38898045 - 38898075
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898045 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 38898075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 9033283 - 9033336
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  9033283 atttgatgttgttaataatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 9033336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996132
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 11996132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 20619564 - 20619511
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  20619564 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 20619511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 30
Target Start/End: Original strand, 45847576 - 45847605
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttata 30  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45847576 gatattgttcatgattgatgaagtgttata 45847605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Original strand, 27847853 - 27847932
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27847853 ttgatataattatgtcatactgtt---gtacactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 27847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 68)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 264689 - 264919
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264689 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 264788  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  264789 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 264888  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264889 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 264919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39363625 - 39363395
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363625 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 39363526  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39363525 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39363426  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363425 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39363395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20909253 - 20909023
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20909253 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 20909154  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20909153 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttttgttattt 20909054  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909053 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20909023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29346221 - 29345991
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346221 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29346122  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  29346121 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttgttattt 29346022  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29346021 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29345991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 42245286 - 42245516
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245286 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 42245385  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42245386 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 42245485  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42245486 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 42245516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 10732865 - 10733091
Alignment:
Q  5 ttgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10732865 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatacggtgatataattgtatatgcattac 10732964  T
Q  105 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10732965 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 10733064  T
Q  205 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  10733065 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 10733091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29348694 - 29348464
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348694 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29348595  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  29348594 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattt 29348495  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29348494 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29348464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29351167 - 29350937
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351167 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29351068  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  29351067 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgttcttattt 29350968  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29350967 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 29350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39245377 - 39245147
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39245377 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgca 39245278  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39245277 ttacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 39245178  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245177 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39245147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32027634 - 32027404
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027634 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 32027535  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  32027534 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgttgttattt 32027435  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  32027434 aactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 32027404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29330172 - 29329945
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330172 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgattatta---tttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29330076  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29330075 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 29329976  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329975 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29329945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 5 - 231
Target Start/End: Original strand, 20917877 - 20918099
Alignment:
Q  5 ttgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  20917877 ttgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgctttac 20917976  T
Q  105 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaact 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20917977 ttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaact 20918072  T
Q  205 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20918073 aagctgcatgagtcggtctaagttgat 20918099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38619677 - 38619445
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  38619677 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattggaatataattgtatatgc 38619578  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  38619577 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttat 38619478  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619477 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38619445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23064754 - 23064522
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23064754 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatattatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 23064655  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  23064654 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttat 23064555  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23064554 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23064522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 20901991 - 20902159
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  20901991 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 20902090  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902091 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 20902159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 36154766 - 36154931
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  36154766 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 36154865  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154866 tgctgtttttgtatactgctgtgt---tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36154931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 2154596 - 2154765
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2154596 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtc 2154695  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154696 atgctgtttttgtatactgttgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2154765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 11581184 - 11581350
Alignment:
Q  65 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11581184 ttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatg 11581283  T
Q  165 ctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581284 ttgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 11581350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Original strand, 18319021 - 18319185
Alignment:
Q  68 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18319021 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 18319120  T
Q  167 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18319121 gtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 18319185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 10775659 - 10775827
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  10775659 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 10775757  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775758 atgctggttttatatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10775827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31061248 - 31061079
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31061248 atttgatgttgttatattgtgatataattttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 31061149  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31061148 atgctgtttttgtatactactgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 31061079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24067282 - 24067118
Alignment:
Q  68 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  24067282 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgtt 24067183  T
Q  167 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24067182 gtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgat 24067118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 23390451 - 23390603
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23390451 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 23390550  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390551 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23390603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421546
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25421698 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25421599  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421598 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 25421546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9078118 - 9077966
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| ||||   || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9078118 tgtgatataatgttatacgcattacttgagttatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 9078019  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9078018 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgat 9077966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 21729019 - 21729169
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21729019 tgtgatataatattttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21729118  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729119 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21729169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 21808344 - 21808494
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21808344 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatact 21808443  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808444 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21808494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25431560 - 25431414
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||| | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25431560 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 25431461  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 225  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431460 gcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1096633 - 1096481
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  1096633 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatact 1096534  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096533 acctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 8286797 - 8286950
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt-gtatac 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  || | ||| || || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8286797 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatgtttgattatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatac 8286896  T
Q  179 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286897 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8286950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24529386 - 24529234
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24529386 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatact 24529287  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529286 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24529234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22144215 - 22144068
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| |||||| | |||||    
T  22144215 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgtttt-gcatact 22144117  T
Q  180 gc-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
     | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144116 acctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24493734 - 24493583
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24493734 tgtgatataatgttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24493636  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24493635 gcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24493583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Original strand, 21997555 - 21997641
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997555 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21997641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22075185 - 22075035
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22075185 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatact 22075086  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075085 tcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13025476 - 13025325
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13025476 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13025378  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13025377 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 13025325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13095660 - 13095509
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  13095660 tgtgatataatgttatgtacattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgtttt-gtatact 13095562  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13095561 gcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgat 13095509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22412329 - 22412198
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 198  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | | |||||    
T  22412329 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttat 22412231  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412230 ttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 22412198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 9776599 - 9776521
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9776599 gatattgtcaatgattggtgaagggttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattaccatttgatgttgttatat 9776521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40726037 - 40725871
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  40726037 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 40725938  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| ||  |||| |||||| ||  ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40725937 atgatg-ctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 40725871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 37804824 - 37804902
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37804824 gatattgtcaatgattaatgaagcgttatatgtatatatgatgttttaagatgttaattagaatttgatgttgttatat 37804902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 17517085 - 17517142
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17517085 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 17517142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21565723 - 21565556
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | || ||| |||| | |||| |||||| || | |||||| |||| ||||    
T  21565723 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttg-atatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 21565625  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | ||  |||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21565624 gatg-atttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21565556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 226
Target Start/End: Original strand, 21292991 - 21293071
Alignment:
Q  145 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21292991 attgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaag 21293071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723922
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgt-tg 194  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||| ||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaag 37723922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Original strand, 26011995 - 26012141
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| | ||| |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  26011995 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgcttt-gcatactgcct 26012092  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012093 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26012141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 187
Target Start/End: Original strand, 20766095 - 20766181
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtt 187  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20766095 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 226
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027043
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttgg-atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329604
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21329604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959639
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22959639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  147 tgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19660940
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19660940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 20901948 - 20901990
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 43  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901948 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 20901990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 22178161 - 22178323
Alignment:
Q  67 gatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat-- 163  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| | || ||||      
T  22178161 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatga 22178259  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178260 gctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806893
Alignment:
Q  183 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgat 20806893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 231
Target Start/End: Original strand, 17517169 - 17517308
Alignment:
Q  93 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg 191  Q
    ||| ||||||||||||  |||   |||||| || ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||| | || ||||     
T  17517169 tatgtgcattacttgagatattattgaatatttaagatgttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgcta 17517268  T
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17517269 ttgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 17517308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314596
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 36314596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 2154553 - 2154595
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 43  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154553 gatactgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 2154595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 226
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740747
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 26740747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 21502116 - 21502263
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  || ||| | || |||||| || | |||||| |||| |||||||| |||   ||||||| |    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttac-atactgcct 21502213  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502214 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21502263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 229
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704089
Alignment:
Q  187 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26704089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973822
Alignment:
Q  187 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 26973822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668912
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgat 19668912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 20901842 - 20901873
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901842 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 20901873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21873351 - 21873277
Alignment:
Q  145 attgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 218  Q
    ||||||||||| | ||||||||| | |||||| |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21873351 attgatattatgaagtcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 36314730 - 36314689
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattac 104  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  36314730 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattac 36314689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18356485 - 18356389
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttt 170  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||||||||| |   |||| |||||| |  ||| |||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18356485 ttataatgtgatataatgttttatgcattacttaagaaatatttgaatattcaagatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctgttt 18356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17463419 - 17463189
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463419 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 17463320  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17463319 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 17463220  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463219 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17463189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 45606828 - 45607058
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606828 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 45606927  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45606928 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 45607027  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607028 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45607058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 7781268 - 7781498
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781268 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 7781367  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7781368 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 7781467  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781468 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 7781498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8899335 - 8899105
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899335 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 8899236  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8899235 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 8899136  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899135 aactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 8899105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 9707528 - 9707758
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707528 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 9707627  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707628 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 9707727  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707728 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9707758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12567801 - 12567571
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12567801 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 12567702  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12567701 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 12567602  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567601 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12567571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13544266 - 13544036
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13544266 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 13544167  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13544166 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 13544067  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544066 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13544036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34159567 - 34159337
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159567 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 34159468  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34159467 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 34159368  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159367 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34159337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55476732 - 55476502
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476732 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 55476633  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55476632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 55476533  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476532 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 55476502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 6469055 - 6469285
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469055 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 6469154  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6469155 ttacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 6469254  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469255 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6469285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 10247644 - 10247874
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247644 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 10247743  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10247744 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgttgttattt 10247843  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10247844 aactaagctgtatgagtcggtctaagttgat 10247874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16282732 - 16282962
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282732 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 16282831  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16282832 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16282931  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282932 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16282962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16454202 - 16454432
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454202 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 16454301  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16454302 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 16454401  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16454402 aactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 16454432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38961812 - 38962042
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961812 gatattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 38961911  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38961912 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 38962011  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962012 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 38962042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13154176 - 13154407
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154176 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 13154275  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13154276 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13154375  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13154376 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13154407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 28848532 - 28848762
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  28848532 gatattttccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 28848631  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28848632 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 28848731  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848732 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28848762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 41124128 - 41123901
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124128 gatattgtccatgattggtgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 41124029  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||    
T  41124028 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgt---tgttgttattt 41123932  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123931 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 41123901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 13151711 - 13151942
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13151711 gatattgtccatgcctgatgaagtgtgatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 13151810  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13151811 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13151910  T
Q  201 aact-aagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13151911 aactaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13151942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8499761 - 8499529
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8499761 gatattgtccatgattaatgaagttttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgc 8499662  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    |||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  8499661 attaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 8499562  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8499561 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8499529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15412672 - 15412440
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15412672 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattatcatttgatgttgtttatattgggatataattgtatatgc 15412573  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttat 198  Q
    || | ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  15412572 atcaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttat 15412473  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412472 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15412440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 39 - 231
Target Start/End: Original strand, 17446614 - 17446805
Alignment:
Q  39 tgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttga 138  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17446614 tgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttga 17446713  T
Q  139 cttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17446714 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgat 17446805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 29172565 - 29172734
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  29172565 atttgatgttgatagtattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 29172664  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172665 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29172734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 50243014 - 50242833
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  50243014 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 50242915  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242914 tattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50242833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17672805 - 17672637
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17672805 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtca 17672706  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672705 tgctgtttttgtatactgctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17672637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 53070636 - 53070799
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  53070636 atttgatgttgttagattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtct 53070735  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070736 tgttgtttttgtatactgttatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 12119707 - 12119876
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  12119707 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 12119806  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12119807 atgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12119876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27165493 - 27165261
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27165493 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgc 27165394  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtta 197  Q
    | ||||| |||||||| |||||| ||||||  ||| |||||| || ||||||||  ||| ||||| || ||||| |||||| || | |||||| ||||||    
T  27165393 aatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgtta 27165295  T
Q  198 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165294 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 27165261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 43550448 - 43550625
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  43550448 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 43550547  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550548 tattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 43550625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 53301425 - 53301658
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  53301425 gatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccattttatgttgtttatattgtgatataattgtatacgt 53301524  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtt 196  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||  |||  |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  53301525 aatacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtt 53301623  T
Q  197 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  53301624 atttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 53301658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 111 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977526
Alignment:
Q  111 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctg 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  211 catgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgat 15977526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14973020 - 14972868
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || |||  ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973020 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 14972921  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972920 gcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14972868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17488022 - 17487870
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488022 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17487923  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487922 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17487870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17499504 - 17499352
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499504 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 17499405  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499404 gtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17499352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43841114 - 43840946
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43841114 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 43841015  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43841014 gctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgat 43840946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26687069 - 26686902
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26687069 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 26686970  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686969 gctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 26686902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 40213676 - 40213827
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||| |||||   || |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40213676 tgtgatataatgttatacgcattacttggattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatact 40213775  T
Q  180 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40213776 gctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 40213827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42386593 - 42386428
Alignment:
Q  64 tttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  42386593 tttgatgttgattatgatgtgatataatgttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtca 42386494  T
Q  163 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386493 tgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500953
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  231 t 231  Q
    |    
T  55500953 t 55500953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36166739 - 36166609
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166739 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgctgtgtcgctgttgttatt 36166641  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166640 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36166609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13442440 - 13442288
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13442440 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 13442341  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442340 gcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13442288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 14576788 - 14576939
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  14576788 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtt-tatact 14576886  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14576887 gtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat 14576939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 20698391 - 20698542
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| ||||||  | ||| |||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20698391 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatact 20698489  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698490 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20698542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 23083316 - 23083468
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| ||| || |  |||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083316 tgtgatataatgttatgtgcattactagaagtaaaattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatact 23083415  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083416 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23083468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 25476340 - 25476492
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||  ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476340 tgtgatataatgttatgcgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 25476439  T
Q  180 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25476440 acctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 25476492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21618590 - 21618460
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21618590 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 21618492  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618491 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21618460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14572735 - 14572603
Alignment:
Q  99 cattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtta 197  Q
    ||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  14572735 cattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatactgtctatgttgctgttgtta 14572637  T
Q  198 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572636 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14572603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18438700 - 18438548
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||   || ||||   ||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438700 tgtgatataatgttatatgcattacttgagatatgaatgtataaaaaagatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 18438601  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18438600 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 18438548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12399360 - 12399225
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 193  Q
    ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  12399360 tatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt 12399261  T
Q  194 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399260 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12399225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 24340660 - 24340826
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  24340660 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 24340759  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || || || ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24340760 atgatg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 24340826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 44494905 - 44494820
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44494905 ttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgat 44494820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 11424718 - 11424866
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||||||||||   |||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424718 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgtttt-gtatact 11424813  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11424814 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 11424866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 54521063 - 54520985
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54521063 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 54520985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10557081 - 10556996
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557081 ttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 10556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 24153164 - 24153315
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||| ||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24153164 tgtgatattatgttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 24153262  T
Q  180 -gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
      || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153263 acctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 24153315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 29544763 - 29544839
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 77  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544763 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttat 29544839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 226
Target Start/End: Original strand, 52523666 - 52523831
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||    
T  52523666 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T
Q  164 g--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |  ||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523766 gaactg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17737335 - 17737247
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgta---tactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737335 ttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17737247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12305386 - 12305315
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 72  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305386 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgtt 12305315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23274871 - 23274705
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  23274871 atttgatgttgtttataatgtgatgtaattgtatattctttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 23274772  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274771 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 37642202 - 37642368
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  37642202 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 37642301  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| |||||| | ||||||| | |||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37642302 atgatgtttt-gcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagt 37642368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 126
Target Start/End: Original strand, 17248224 - 17248287
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17248224 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaataattg 17248287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15977774 - 15977696
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15977774 gatattgtccatgattgataaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttggttattatttgatgttgttatat 15977696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 11913971 - 11914051
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11913971 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 11914051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 171
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147571
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgtttt 22147571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 164
Target Start/End: Original strand, 2051138 - 2051238
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||    
T  2051138 ttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T
Q  164 g 164  Q
    |    
T  2051238 g 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 46822502 - 46822445
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46822502 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatgtatgatgttttaagatgttgat 46822445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15471085 - 15470939
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  15471085 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 15470988  T
Q  183 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470987 atgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 15470939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 10557149 - 10557091
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgatt 59  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10557149 gatattgtccatgattgatgaagttttatatgtatatatgatgttttgagatgttgatt 10557091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16097509 - 16097342
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| | ||    
T  16097509 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgat 16097411  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||| | ||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097410 gatgattt-gcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16097342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 37251105 - 37251270
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  37251105 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 37251202  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251203 atgaactg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45577989
Alignment:
Q  189 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45577989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16103960 - 16103794
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| | ||| || |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||    
T  16103960 ttgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcat 16103863  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103862 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16103794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307691
Alignment:
Q  120 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 217  Q
    |||||||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  218 cggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||    
T  32307704 cggtctaagttgat 32307691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174366
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12174366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194704
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28194704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46822394 - 46822279
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  46822394 tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatga 46822295  T
Q  216 gtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| ||||||||||||    
T  46822294 gtcagtctaagttgat 46822279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30029968 - 30029855
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatga 215  Q
    |||||| || ||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| || || |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  30029968 tgaatatttaagacgttgt-gaattgcaaatgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatga 30029870  T
Q  216 gtcggtctaagttga 230  Q
    ||| |||||||||||    
T  30029869 gtcagtctaagttga 30029855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Original strand, 13210395 - 13210432
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210395 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13210432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668183
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 49668183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12511071
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  230 at 231  Q
    ||    
T  12511072 at 12511071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14234648 - 14234501
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  ||  || |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  14234648 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 14234551  T
Q  183 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14234550 atgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgat 14234501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512934
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9512934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520909
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 9520909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919350
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 17444737 - 17444773
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatat 37  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17444737 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatat 17444773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 11913867 - 11913897
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11913867 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 11913897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15207120 - 15207070
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15207120 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15207070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15246202 - 15246152
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15246202 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15246152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 15265323 - 15265273
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaatta 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15265323 atttgatgttgttattaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaatta 15265273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15977700 - 15977663
Alignment:
Q  33 tatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15977700 tatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatg 15977663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 23318653 - 23318706
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23318653 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 23318706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28194875 - 28194822
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  28194875 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 28194822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 58)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13989107 - 13988877
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989107 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 13989008  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13989007 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13988908  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988907 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13988877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21841008 - 21840778
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21841008 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 21840909  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840908 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 21840809  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840808 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21840778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21923212 - 21923442
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923212 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21923311  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21923312 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21923411  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923412 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21923442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 21475008 - 21475238
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475008 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 21475107  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21475108 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 21475207  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21475208 aactaagctgcatgagttggtctaagttgat 21475238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 23593655 - 23593886
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23593655 gatattgtccatgattaatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgc 23593754  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23593755 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatt 23593854  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593855 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23593886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29776929 - 29776699
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776929 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 29776830  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776829 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 29776730  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776729 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29776699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29298377 - 29298148
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29298377 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttattatattgtgatataattgtatatgca 29298278  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29298277 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 29298179  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298178 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 29298148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16362159 - 16361928
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16362159 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattatatatgc 16362060  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16362059 attacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgtcgttatt 16361960  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361959 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16361928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31612553 - 31612324
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612553 atattgtccatgattgatgaagtattatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcat 31612454  T
Q  102 tacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattta 201  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  31612453 tacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgttgttattta 31612354  T
Q  202 actaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612353 actaagctgcatgagtcggtctaagttgat 31612324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22122988 - 22123215
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22122988 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 22123087  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg-ttgttatt 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  22123088 ttacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgtttgctatt 22123187  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123188 taactaagctgcatgagtcggtctaagt 22123215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 16275284 - 16275515
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16275284 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttcaagatattgattattatttgatgttgttatattgtgatataatggtatatgca 16275383  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  16275384 ttaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttgttgttatt 16275483  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16275484 taactaagttgtatgagtcggtctaagttgat 16275515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 15859929 - 15860160
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15859929 gatattgtccatggttgatgaagtgttatatgtatatatgatgtcttaagatgttgattaccatctgatgttgttatattgtgatataattgtatgtgca 15860028  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15860029 ttgattgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatt 15860128  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15860129 taactaagctgcatgagtcggtccaagttgat 15860160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 226
Target Start/End: Original strand, 45574812 - 45574989
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||     
T  45574812 gatgttgattatgatttgatgttcttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttgg 45574911  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45574912 tattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 45574989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 13212844 - 13213013
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  13212844 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 13212943  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212944 atgttgtttttgtatactgttgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13213013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21347141 - 21346972
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  21347141 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21347042  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347041 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21346972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21342276 - 21342107
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  21342276 atttgatgttgttatattgtgatgtaattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 21342177  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342176 atgttgtttttgtatactgctgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21342107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21707346 - 21707178
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21707346 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21707247  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21707246 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21711888 - 21711720
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  21711888 atttgatgatgttatattgtgatataattgtataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtca 21711789  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711788 tgctttttttgtatactattgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21711720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 433190 - 433023
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  433190 atttgatgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtc 433091  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     || ||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  433090 ttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc---cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 433023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40389329 - 40389165
Alignment:
Q  68 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtcatgct 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40389329 atgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgct 40389230  T
Q  167 gtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  40389229 gtttttgtatactgatgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgat 40389165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 27250684 - 27250834
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250684 tgtgatataatgttttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 27250783  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250784 gcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27250834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 50210168 - 50210320
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50210168 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 50210267  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210268 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 50210320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 34509946 - 34509794
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||  |||   || |||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34509946 tgtgatataatgttataagcattacttgagatatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatact 34509847  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509846 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 34509794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22532435 - 22532283
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532435 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22532336  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  22532335 gcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgat 22532283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 21896193 - 21896358
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  21896193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 21896292  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896293 atgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 226
Target Start/End: Original strand, 21861510 - 21861672
Alignment:
Q  66 tgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| |||||    
T  21861510 tgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg 21861609  T
Q  165 ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861610 ctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21026846 - 21026696
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21026846 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatact 21026747  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026746 gcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 22468651 - 22468803
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||   ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||    
T  22468651 tgtgatataatgttatgtgcattacttgagatattattgaataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatct 22468750  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22468751 gcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 22468803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 35261018 - 35261180
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||   |||||| || || |||||||| |||| ||    
T  35261018 atttgatgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatc 35261114  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261115 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 229
Target Start/End: Original strand, 20847175 - 20847259
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847175 ttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20847259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16758822 - 16758664
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttt 171  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| || |||||||  ||  | |||||||| |||| |||||  |||  ||    
T  16758822 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaat-gttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactg-gtt 16758725  T
Q  172 tgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    || |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758724 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 16758664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 22050810 - 22050866
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 57  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050810 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttga 22050866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 63 - 225
Target Start/End: Original strand, 14295493 - 14295652
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  14295493 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatca 14295588  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 225  Q
    || || ||| | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295589 tgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 33681188 - 33681022
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| ||||  ||||| || | |||||| |||| ||||    
T  33681188 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcat 33681090  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33681089 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga 33681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454660
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20454660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20918782 - 20918620
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    
T  20918782 ttgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcat 20918687  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    | ||  |||| |||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918686 gatg-gtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 43543267 - 43543214
Alignment:
Q  26 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43543267 ttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatat 43543214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 41049973 - 41050138
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  41049973 atttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatga--tgttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 41050070  T
Q  162 atgctgt-ttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||   | |||| ||||||| || |||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050071 atgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20135351 - 20135201
Alignment:
Q  82 tgatataattgtatatgcattacttgaa-ttatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 180  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| || ||| |||||| || ||| |||||||| || ||  |||||||||||||||||| |||| |||||  |||    
T  20135351 tgatataatgttgtatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctg 20135253  T
Q  181 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | | || |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20135252 cctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgat 20135201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21754059
Alignment:
Q  120 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 217  Q
    |||||||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  218 cggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||    
T  21754072 cggtctaagttgat 21754059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 27161560 - 27161605
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 46  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161560 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttt 27161605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22237788 - 22237642
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||| ||| |    
T  22237788 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcct 22237691  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22237690 atgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttga 22237642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928076
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 52928076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 22354527 - 22354616
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 169  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354527 tgtgatataatgttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 50614053 - 50614219
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  50614053 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50614151  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614152 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 50621881 - 50622047
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||   | ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  50621881 atttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaag-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 50621979  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621980 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714556
Alignment:
Q  187 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 21714556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 22921937 - 22921976
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22921937 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 22921976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Original strand, 16368224 - 16368276
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  16368224 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 16368276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 16275178 - 16275209
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275178 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 16275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248293
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 20248293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 21477700 - 21477653
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaa 109  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21477700 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatacgcattacttgaa 21477653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51130743 - 51130646
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  51130743 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 51130648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 50686792 - 50686695
Alignment:
Q  67 gatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg 164  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||| ||| |||| |||||    
T  50686792 gatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatg 50686695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 22124468 - 22124415
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  22124468 atttgatgttgttagtaatgtgatatagttgtatatgcattatgtgaattatat 22124415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 196
Target Start/End: Original strand, 22130848 - 22130978
Alignment:
Q  63 atttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||    
T  22130848 atttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatc 22130943  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgtt 196  Q
    ||| ||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  22130944 atgatg-gtttggatactgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 12271725 - 12271642
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 158  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||| || ||| ||||||| |||| |||||| || |||||||| ||||    
T  12271725 ttataatgtgatataattgtatatatattactttagttatacgtaaat-attgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 12271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 219
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801483
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 38801483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14188 - 13958
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 14089  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14088 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13989  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988 atctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 23452 - 23484
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 33  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23452 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 23484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 136921 - 136691
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  136921 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 136822  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  136821 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 136722  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136721 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 136691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 139390 - 139160
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  139390 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 139291  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  139290 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 139191  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139190 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 139160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 144328 - 144098
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  144328 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 144229  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  144228 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 144129  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144128 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 144098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 134452 - 134222
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  134452 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 134353  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  134352 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 134253  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  134252 aactaagctgcatgagtcggtctatgttgat 134222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 141859 - 141629
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141859 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 141760  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  141759 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 141660  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  141659 aactaagctacatgagtcggtctaagttgat 141629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132672
Alignment:
Q  120 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| || | ||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  218 cggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| ||||    
T  132685 cggtctaagatgat 132672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 62296 - 62216
Alignment:
Q  148 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||||||||||  |||| |||||||  ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62296 gatattattataccatgatgtttttc-atactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 501325 - 501095
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  501325 gatattgttcatgattgatgatgtgttatatgtatatataatgttttaagatgttgattactatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 501226  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  501225 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgttgttattt 501126  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501125 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 501095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 85562 - 85731
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  85562 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 85661  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  85662 atgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat 85731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 160864 - 160698
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||| |||| | ||| || |||| | |||||||| || || |||||||| |||| ||||    
T  160864 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttga-tatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcat 160767  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160766 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 160698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11530 - 11299
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatat-gatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11530 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatattgatgttttaagatgttgattaccatttgattttgttatattgtgatataattatatatgc 11431  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11430 attacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 11331  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11330 taactaagttgcatgagtcggtctaatttgat 11299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13633 - 13403
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  13633 gatattgtccatgattgatgaagtgttacatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatgtaattgtatatgca 13534  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13533 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 13434  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13433 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 13403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9483 - 9253
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9483 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatttgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgca 9384  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9383 ttacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgttgttattt 9284  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9283 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40641 - 40411
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40641 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgaagttttaagatgttgattattatttgatgttgttatactgtgatataattgtatatgca 40542  T
Q  101 ttacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttattt 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40541 ttacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttattt 40442  T
Q  201 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40441 aactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 40411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Original strand, 12194 - 12400
Alignment:
Q  25 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataat 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12194 gttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattaaatgtgaataat 12293  T
Q  125 tgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12294 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtcta 12393  T
Q  225 agttgat 231  Q
    |||||||    
T  12394 agttgat 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 551 - 582
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  551 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 158433 - 158601
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  158433 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 158532  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158533 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 158601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 230
Target Start/End: Original strand, 339905 - 340053
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||||  |||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  339905 tgtgatataatgttatacacattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 340002  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340003 gcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30111 - 29946
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtca 30012  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30011 tgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 30154 - 30112
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 43  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30154 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatg 30112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 30260 - 30229
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30260 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 30229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 82264 - 82083
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  82264 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 82165  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82164 tattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 82083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 22610 - 22776
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||    
T  22610 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 22708  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    | || ||| | |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709 gatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 22776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16795
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16963 atttgatgatgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 16864  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16863 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 298 - 117
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||    
T  298 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttga 199  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  198 tattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgat 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9929 - 9760
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaa-taattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  9929 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtc 9830  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9829 attctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33107 - 32956
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33107 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 33009  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  33008 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgat 32956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 38926 - 38775
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38926 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 38828  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38827 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgat 38775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 9972 - 9932
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 41  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9972 gatattgtacatgattgatgaagtgttatatgtatatatga 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4476 - 4308
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4476 atttgatgatgttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtca 4377  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376 tgttgtttttgtatactactgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 4308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12250 - 12075
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattga 149  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  12250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttga 12151  T
Q  150 tattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12150 tattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctg------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 79267 - 79430
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  79267 atttgatgttgttatattgtgatatacttgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtca 79366  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79367 tgctgtttttatatactgtcgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 17170 - 17324
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgttttt--gtata 177  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17170 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtata 17269  T
Q  178 ctgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17270 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 17324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Original strand, 38577 - 38809
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38577 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgtttatattgtgatataattgtatacgc 38676  T
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgtta 197  Q
    | |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| || |||||||| ||||||    
T  38677 aatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgtta 38775  T
Q  198 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38776 tttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgat 38809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 20363 - 20524
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  20363 atttgatgtt-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtca 20461  T
Q  163 tgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20462 tgttg-ttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 128916 - 128765
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |  |    
T  128916 tgtgatataatgttatgtacattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttt 128817  T
Q  180 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
      | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  128816 tttttgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgat 128765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 50 - 231
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1432
Alignment:
Q  50 gatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattg 148  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||    
T  1250 gatgttgattatgatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttg 1349  T
Q  149 atattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1350 atattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4393 - 4225
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  4393 atttgatgttgt-atattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 4295  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4294 atgctggttttgtatactgctgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 231
Target Start/End: Original strand, 2111 - 2280
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||    
T  2111 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtc 2210  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2211 atgttgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgat 2280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 17964 - 18130
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  17964 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatc 18063  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || || || ||| ||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18064 atgatg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagt 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 63 - 229
Target Start/End: Original strand, 161072 - 161239
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  161072 atttgatattgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 161171  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  161172 attatgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 161239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 163
Target Start/End: Original strand, 164573 - 164674
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttg-ttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  164573 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtc 164672  T
Q  162 at 163  Q
    ||    
T  164673 at 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23048 - 22897
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23048 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 22949  T
Q  180 gctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948 ggtgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 22897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 6188 - 6070
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgca 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6188 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttgttatattgtgatttaattgcatatgca 6089  T
Q  101 ttacttgaattatatgtga 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6088 ttacttgaattatatgtga 6070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 26020 - 26172
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26020 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 26119  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 26172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Original strand, 44682 - 44814
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttat 198  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44682 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttat 44781  T
Q  199 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44782 ttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 44814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 52085 - 51927
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52085 ttatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg 51986  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51985 tatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 51927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 167934 - 168083
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167934 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 168032  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168033 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 168083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 13377 - 13225
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13377 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 13278  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13277 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat 13225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 3141 - 3293
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3141 tgtgatataatgttaaacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatact 3240  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3241 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 3106 - 3257
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3106 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatact 3204  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3205 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4673 - 4522
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4673 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 4574  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4573 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12255 - 12104
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12255 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 12156  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12155 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 12104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22207 - 22056
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22207 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatact 22108  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22107 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgat 22056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 16555 - 16707
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||   || ||| |||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16555 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatact 16654  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16655 gcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgat 16707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2017 - 1865
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2017 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatact 1918  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1917 gtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Original strand, 1004 - 1153
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1004 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatact 1102  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1103 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 39642 - 39491
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39642 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 39544  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39543 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 39491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 75170 - 75321
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  75170 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatact 75268  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75269 gcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 75321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3636 - 3484
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636 tgtgatataatgttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3537  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3536 gcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 508 - 361
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  508 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgct-attttgtatact 410  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    | || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  409 gcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33063
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32913 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 33010  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33011 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 33063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 46092 - 45942
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||  |||||| || ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46092 tgtgttataatgttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttt-gtatact 45995  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45994 gcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16278 - 16127
Alignment:
Q  81 gtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 180  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| ||||   || ||| |||||| | ||||| ||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  16278 gtgatataatgttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactg 16179  T
Q  181 c-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16178 cctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 16127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17436
Alignment:
Q  183 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgat 17436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 116571 - 116441
Alignment:
Q  100 attacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatt 199  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  116571 attacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgtttt-gtatactgttgtgtcgctgttgttatt 116473  T
Q  200 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116472 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 116441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 53794 - 53873
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53794 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagtagatgttgattatcatttgatgttgttatat 53873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 78505 - 78453
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattata 114  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  78505 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattata 78453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 27686 - 27855
Alignment:
Q  63 atttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  27686 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 27785  T
Q  162 atgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| | ||||| | | ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27786 atgctgtttt-gcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 27855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 8472 - 8636
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8472 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 8571  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8572 gctgtttttg-atactgcctatgttgc---tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Original strand, 24257 - 24406
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgt-ttttgtatac 178  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24257 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatac 24356  T
Q  179 tgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24357 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8481
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataat--tgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  8650 ttgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 8551  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8550 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6695 - 6549
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  6695 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 6599  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 5015 - 4865
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||    ||| |||||| || ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5015 tgtgatataatgttttatgcattacttgagaattatttgaatacttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatact 4916  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4915 gcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttg 4865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6231
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||  |||| |||||| || ||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6076 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatact 6175  T
Q  180 gc---tg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |   || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6176 acctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 131 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28428
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  230 at 231  Q
    ||    
T  28429 at 28428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 131 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11308
Alignment:
Q  131 gttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 228  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2165 - 2013
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  2165 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 2071  T
Q  174 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
     ||||||| | ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2070 catactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4568
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 26016 - 26069
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26016 atttaatgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 26069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 115
Target Start/End: Original strand, 16861 - 16909
Alignment:
Q  68 atgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16861 atgttgttagtaatgtgatataattgtatatgcattatgtgaattatat 16909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26061 - 25910
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  26061 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 25963  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25962 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgat 25910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40023 - 39872
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  40023 tgtgatataatgttaaatgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgat-attttgtatact 39925  T
Q  180 g-ctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39924 gcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgat 39872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8493
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-gctgtgttgctgttgt 195  Q
    ||||||||||||| || |  |||||  || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  8628 tgcattacttgaagtacacttgaatgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgt 8529  T
Q  196 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8528 tatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11648 - 11482
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  11648 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 11549  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  11548 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 38193 - 38359
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||    ||||||||||| ||    
T  38193 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatc 38292  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38293 atgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagt 38359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Original strand, 16037 - 16206
Alignment:
Q  63 atttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  16037 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatc 16136  T
Q  162 atgctgtttttgtatact-gctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||| || ||||| |||||  || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16137 atgttg-ttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 16206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13313 - 13147
Alignment:
Q  63 atttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaat-aattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgt 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| |||||||| || || |||||||| |||| |    
T  13313 atttgatgttggttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatggtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatat 13214  T
Q  161 catgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213 catgctg-ttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1971
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 193  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  194 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 1669 - 1591
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1669 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtatatatgattttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3186
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3264 gatattgtcaatgattgatgaagtgttatatgtagatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 3186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 53486 - 53651
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  53486 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 53585  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||| || ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  53586 atgttg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 181
Target Start/End: Original strand, 3485 - 3586
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3485 tgtgatataatgttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 3584  T
Q  180 gc 181  Q
    ||    
T  3585 gc 3586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13274 - 13144
Alignment:
Q  65 ttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||  |||||| || ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13274 ttgatgttgattatgttgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcat 13175  T
Q  164 gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctgtt 193  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  13174 gctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34291 - 34139
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||  ||||||||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||   |||    
T  34291 ttataatgttatataattgtatatatattacttgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttg 34197  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34196 tatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttg 34139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 287
Alignment:
Q  189 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 28030 - 27958
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttg 73  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28030 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattatttgatgttg 27958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 15483 - 15568
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15483 aattgatattattatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttg 15568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 155 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4728
Alignment:
Q  155 ttatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 4728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 32230 - 32083
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||    
T  32230 tgtgatataat-gtttatgcattacttgaagaatatttgtatacctaagatgttgatgaattgaaattgatattattatgtcatgttgttt--gtttact 32134  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32133 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13598 - 13513
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13598 aattgatattatcatgtcatgttgtttt-gtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 13513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12751 - 12587
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||| || |||||||| |||| ||    
T  12751 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12653  T
Q  162 atgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12652 atgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 229
Target Start/End: Original strand, 11462 - 11548
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11462 aattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 11548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 12112 - 12039
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtt 136  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12112 atttgatactgttatattgtgatataattgtatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12042 - 11982
Alignment:
Q  166 tgtttttgtatactgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12042 tgttttggtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13165 - 13092
Alignment:
Q  85 tataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattat 158  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13165 tataattatatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 63 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 225590 - 225482
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  225590 atttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatc 225492  T
Q  162 atgctgtttt 171  Q
    | ||||||||    
T  225491 acgctgtttt 225482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 40078 - 39927
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  40078 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgtttt-gtatact 39980  T
Q  180 gc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39979 gcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgat 39927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 95 - 229
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10528
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-t 192  Q
    |||||||||||||||  |||| || ||| || ||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||||||| |    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  193 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 229  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 10528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 725 - 645
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  725 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 1247 - 1327
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1247 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 32
Target Start/End: Original strand, 1143 - 1173
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143 atattgttcatgattgatgaagtgttatatg 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 231
Target Start/End: Original strand, 45732 - 45899
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||| || |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||| |||| ||||    
T  45732 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttga-taattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcat 45830  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    | || ||| | ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45831 gatgattt-gcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 45899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174785
Alignment:
Q  97 tgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-g 194  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||| ||  | ||||||| || |||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  195 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 174785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121780
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 121780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 124751 - 124675
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattatt 156  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| || | |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  124751 tgtgatataatgttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaaaacgttgatgaattgcaattgatattatt 124675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 60652 - 60818
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatat-tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| || | |||||||||  ||| ||    
T  60652 atttgatgttgttaattatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgc-attgatattggtatatc 60750  T
Q  162 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||  |||| |||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60751 atgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 130066 - 129919
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  130066 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 129969  T
Q  183 gtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  129968 atgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat 129919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 4225 - 4304
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4225 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 10481 - 10647
Alignment:
Q  65 ttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcat 163  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||    
T  10481 ttgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcat 10579  T
Q  164 gctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    | || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10580 gatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttga 10647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15162 - 15083
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15162 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 15194 - 15273
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15194 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatat 15273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15345
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgat 15345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1387 - 1308
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1387 ttgatataattatgtcatgatgtt---gtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7285
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 7285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 1011 - 1171
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| |||    
T  1011 atttgatgttgttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatca 1106  T
Q  163 tgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1107 tgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 35986 - 36065
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaa-gtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  35986 gatattgtccatgattgatgaaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattattttttgatgttcttatat 36065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Original strand, 23942 - 23989
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttga 23989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 10808 - 10886
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaagatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10808 gatactgtccataattgatgaagtgttatatgtatatatgatgttttaaaatgttgagtattatttgatgttgttatat 10886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 10703 - 10734
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10703 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 74 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15829 - 15675
Alignment:
Q  74 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttg 173  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  15829 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 15735  T
Q  174 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15734 tatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgat 15675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21077 - 20928
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatact 179  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||| |  | || ||||||  | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  21077 tgtgatataatgttttatgcattacttgtagaacatttgaatatataagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatatt 20978  T
Q  180 g-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    | || |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20977 gcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagt 20928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25289 - 25121
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtca 162  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || | ||||||||  |||| |||    
T  25289 atttgatgttgtaataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgc-attgatatcgttatatca 25192  T
Q  163 t--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |  |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25191 tgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 720 - 667
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  720 atttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatat 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 63 - 224
Target Start/End: Original strand, 7996 - 8161
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtt-atattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  7996 atttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatc 8095  T
Q  162 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    ||  ||||  |||| |||||| || || ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8096 atgagctg-atttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Original strand, 2608 - 2661
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  2608 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 2661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19424 - 19278
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  19424 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 19328  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19327 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 19278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4545
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 193  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| || ||| |||||||| ||| | |||||||||| || || ||||| | ||| ||||||| | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  194 gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Original strand, 6220 - 6386
Alignment:
Q  63 atttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| | || ||    
T  6220 atttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatc 6318  T
Q  162 at--gctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||  |||| |||| ||||||| || |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6319 atgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27996 - 27911
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgc 165  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27996 tgtgatataatgttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 79
Target Start/End: Original strand, 6858 - 6937
Alignment:
Q  2 atattgttcatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttta--agatgttgattaccatttgatgttgttatat 79  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  6858 atattgtccatgattgatgaagtgttatatgtatatatgatgtttaagttgatgttgagtatcatttaatgttgttatat 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1051
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1132 ttgatattgttatatcatgctgtttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5803 - 5657
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||||  ||||||| |    
T  5803 atataattgtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcct 5707  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5706 atgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 143
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| || |||||| |||||||| || || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  290 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 193  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  192 atgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 226
Target Start/End: Original strand, 51839 - 51985
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacg-ttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatac 178  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||||||| |||| |||||| || |    
T  51839 tgtgatataat-gtatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgca-ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgc 51936  T
Q  179 tg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    || || || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51937 tgcctatg-tgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 32696 - 32551
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| |    
T  32696 atatagttgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgtttt-gcatactgcct 32600  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32599 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 32551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 97190 - 97024
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  97190 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 97092  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97091 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 106468 - 106302
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  106468 atttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatc 106370  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| | ||||| || |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106369 atgaactg-ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 16380 - 16301
Alignment:
Q  146 ttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16380 ttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 16301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 1096
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1141
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 1141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 4893 - 4940
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgat 4940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 80 - 169
Target Start/End: Original strand, 918 - 1006
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtt 169  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  918 tgtgatataatgttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgc-attgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6625
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 14005
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6230
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2752
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 2752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Original strand, 15845 - 15884
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 15884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178912
Alignment:
Q  187 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 227  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 178912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 142765 - 142712
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  142765 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 142712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6675
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc 181  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| || ||| |||||||| || | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgc 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 231
Target Start/End: Original strand, 14658 - 14804
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    ||||||| |||||| |||||  ||||||||  ||  ||| |||||| |||||||| || || | ||||||| ||| ||||| || |||| | |||||| |    
T  14658 atataatagtatatacattatatgaattat--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcct 14754  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14755 atgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 14804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 231
Target Start/End: Original strand, 2805 - 2913
Alignment:
Q  124 ttgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 221  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  222 ctaagttgat 231  Q
    ||||| ||||    
T  2904 ctaagatgat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 32112
Alignment:
Q  120 ataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 217  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  218 cggtctaagttgat 231  Q
    ||||||||| ||||    
T  32125 cggtctaagatgat 32112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 51658 - 51601
Alignment:
Q  171 ttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51658 ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23853
Alignment:
Q  187 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 8176 - 8090
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttt 171  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||    
T  8176 atataattgtatatacattacatgaattatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgtttt 8090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6826
Alignment:
Q  184 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6874 tgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagatgat 6826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12780
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgat 12780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 38483 - 38339
Alignment:
Q  80 tgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatg--ctgtttttgtata 177  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| |  |||||| |||||||| || || |||||||| | || |||||  |||||||  ||||    
T  38483 tgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgtttta-tata 38386  T
Q  178 ctgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 222  Q
    |||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38385 ctgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36464
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgat 36464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5230
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 5230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 230
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8180
Alignment:
Q  170 tttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8118 tttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 8180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 231
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28877
Alignment:
Q  193 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 231  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 28877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 153
Target Start/End: Original strand, 18176 - 18265
Alignment:
Q  64 tttgatgttgttat-attgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatatt 153  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||  |||||| |||||||| || || ||||||||    
T  18176 tttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatg-atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatt 18265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 12992 - 12954
Alignment:
Q  192 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12992 ttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttga 12954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47095 - 47014
Alignment:
Q  144 aattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47095 aattgatattattatgtcatgctgct---gtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaag 47014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 267844 - 267679
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtc 161  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||  ||||||| || || |||||||| |||| ||    
T  267844 atttgatggtgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatga--tgttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatc 267747  T
Q  162 atg--ctgtttttgtatactgc-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
    |||  ||| |||| |||||||| | ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267746 atgaactg-ttttatatactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 10688 - 10542
Alignment:
Q  84 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 182  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |  || |  |||||| |||| |||||| || | |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||| |    
T  10688 atataattgtatatacattacatgaattatgttcga-tgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 10591  T
Q  183 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 230  Q
     ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10590 atgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga 10542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 226
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1151
Alignment:
Q  95 tatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt 193  Q
    |||||||||||||||  |||| || |||  | ||| |||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||| | ||||| ||||    
T  1021 tatgcattacttgaagaatatttgtatacataagatgttgatgaattgaaattgatataattatgtcatgatgtt---gtatactgcctatgttgatgtt 1117  T
Q  194 g-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 226  Q
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1118 tattaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 1151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Complemental strand, 10032 - 10001
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10032 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatg 10001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 218
Target Start/End: Original strand, 192968 - 193070
Alignment:
Q  117 tgaataattgagacgttgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgt-atactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatg 214  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||| || ||||||| |||||||||| |||| |||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  192968 tgaataattgagatgttgt-gaattataaatgatattgttatgtcatgatgttgttgtgattctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatg 193066  T
Q  215 agtc 218  Q
    ||||    
T  193067 agtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 600 - 547
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  600 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 1122 - 1069
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  1122 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 206 - 165
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcatta 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  206 atttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 189 - 136
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  189 atttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatgaattatat 136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3140 - 3087
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  3140 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 3087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7613 - 7560
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  7613 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 7560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 14732 - 14679
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  14732 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 14679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 63 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 30515 - 30462
Alignment:
Q  63 atttgatgttgtta-tattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatat 115  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  30515 atttgatgttgttagtaatgtgatatatttgtatatgcattatgtgaattatat 30462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 416
Alignment:
Q  1 gatattgttcatgattgatgaagtgttatatgt 33  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  448 gatattgtccatgattgatgaagtgttatatgt 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 224
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  184 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 224  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1789 times since January 2019
Visitors: 2393