View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0208-INSERTION-21 (Length: 845)

Name: NF0208-INSERTION-21
Description: NF0208
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0208-INSERTION-21
NF0208-INSERTION-21
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (6-845)||(27328648-27329481)
chr5 (67-250)||(38879538-38879721)
chr5 (64-249)||(4619102-4619287)
chr5 (66-248)||(43334158-43334340)
chr5 (67-248)||(24448847-24449026)
chr5 (67-250)||(41014276-41014456)
chr5 (70-248)||(8169983-8170157)
chr5 (67-243)||(22187242-22187418)
chr5 (67-248)||(35710270-35710447)
chr5 (120-243)||(13801771-13801894)
chr5 (129-243)||(20135623-20135737)
chr5 (97-249)||(32703411-32703559)
chr5 (67-227)||(22600411-22600569)
chr5 (65-243)||(12006332-12006510)
chr5 (67-243)||(1565388-1565562)
chr5 (125-248)||(43574621-43574742)
chr5 (130-257)||(29334415-29334541)
chr5 (63-233)||(22861683-22861848)
chr5 (70-247)||(30006285-30006460)
chr5 (85-233)||(19142957-19143102)
chr5 (86-238)||(208936-209086)
chr5 (125-243)||(7368413-7368527)
chr5 (135-240)||(16880654-16880757)
chr5 (86-248)||(28516432-28516593)
chr5 (67-175)||(37024626-37024732)
chr5 (134-233)||(7097774-7097870)
chr5 (67-224)||(2838735-2838890)
chr5 (87-250)||(3771318-3771477)
chr5 (73-238)||(39301087-39301249)
chr5 (170-249)||(16957374-16957451)
chr5 (90-225)||(34074584-34074717)
chr5 (67-170)||(23974738-23974840)
chr5 (176-243)||(25622524-25622591)
chr5 (105-233)||(42924844-42924974)
chr5 (159-243)||(34154818-34154900)
chr5 (93-248)||(1405170-1405323)
chr5 (128-243)||(12575664-12575779)
chr5 (125-243)||(5873326-5873441)
chr5 (87-233)||(31694122-31694266)
chr5 (103-168)||(22025536-22025601)
chr5 (94-233)||(1850624-1850760)
chr5 (88-235)||(18426017-18426162)
chr5 (172-228)||(10306493-10306548)
chr5 (160-248)||(11657698-11657785)
chr5 (161-233)||(12477134-12477205)
chr5 (88-250)||(24313569-24313732)
chr5 (88-227)||(24323725-24323862)
chr5 (88-250)||(24355906-24356069)
chr5 (88-227)||(24360349-24360486)
chr5 (187-249)||(39801591-39801653)
chr5 (86-238)||(24903705-24903855)
chr5 (188-248)||(16028623-16028683)
chr5 (144-203)||(41425982-41426039)
chr5 (185-243)||(21784336-21784394)
chr5 (196-250)||(32354211-32354265)
chr5 (147-240)||(2432302-2432395)
chr5 (95-199)||(22907913-22908014)
chr5 (185-233)||(4654429-4654477)
chr5 (206-242)||(18684367-18684403)
chr5 (183-243)||(30877568-30877628)
chr5 (73-180)||(10634211-10634317)
chr5 (170-233)||(37225975-37226037)
chr5 (170-233)||(39079765-39079827)
chr5 (69-147)||(31299591-31299669)
chr5 (166-238)||(13774921-13774991)
chr5 (185-225)||(21542489-21542529)
chr5 (67-102)||(19438706-19438741)
chr5 (191-248)||(10943844-10943900)
chr5 (185-230)||(15141953-15141998)
chr5 (210-243)||(29184065-29184098)
chr5 (85-138)||(36200167-36200220)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (67-249)||(39460992-39461174)
chr8 (67-248)||(28817625-28817804)
chr8 (67-240)||(7136534-7136707)
chr8 (68-241)||(20284075-20284250)
chr8 (68-241)||(21070703-21070879)
chr8 (67-248)||(35261636-35261815)
chr8 (67-249)||(36720753-36720933)
chr8 (68-248)||(25250480-25250660)
chr8 (67-248)||(30454096-30454273)
chr8 (67-240)||(12670257-12670426)
chr8 (74-248)||(6760786-6760960)
chr8 (67-241)||(44530106-44530278)
chr8 (67-243)||(13160659-13160832)
chr8 (67-242)||(29521690-29521863)
chr8 (67-243)||(17823533-17823707)
chr8 (67-243)||(45071222-45071395)
chr8 (128-248)||(20869941-20870061)
chr8 (67-249)||(26954089-26954272)
chr8 (67-248)||(18164759-18164937)
chr8 (64-248)||(8897763-8897945)
chr8 (67-233)||(2626476-2626643)
chr8 (73-233)||(44781518-44781677)
chr8 (70-224)||(20869523-20869671)
chr8 (78-249)||(12625857-12626027)
chr8 (125-243)||(17250880-17250997)
chr8 (127-233)||(29877111-29877215)
chr8 (73-243)||(42083702-42083870)
chr8 (105-238)||(8483947-8484078)
chr8 (87-227)||(24365079-24365218)
chr8 (120-248)||(5135289-5135414)
chr8 (136-241)||(16225045-16225150)
chr8 (67-228)||(24245408-24245565)
chr8 (86-243)||(44742522-44742678)
chr8 (115-242)||(5689636-5689761)
chr8 (86-233)||(22598133-22598277)
chr8 (73-243)||(28407379-28407534)
chr8 (92-249)||(31457155-31457309)
chr8 (73-226)||(14017989-14018140)
chr8 (127-248)||(10857845-10857965)
chr8 (67-218)||(11748256-11748407)
chr8 (109-248)||(389642-389781)
chr8 (131-233)||(19729363-19729461)
chr8 (67-233)||(40604920-40605083)
chr8 (187-241)||(27507985-27508039)
chr8 (89-202)||(35105902-35106014)
chr8 (134-203)||(43942348-43942417)
chr8 (167-249)||(16013511-16013594)
chr8 (86-226)||(11000970-11001109)
chr8 (96-204)||(23000262-23000365)
chr8 (171-248)||(26102578-26102653)
chr8 (88-233)||(36918102-36918245)
chr8 (192-248)||(18595918-18595974)
chr8 (159-248)||(26457778-26457863)
chr8 (144-243)||(33866983-33867083)
chr8 (185-248)||(35107310-35107373)
chr8 (198-248)||(27468091-27468141)
chr8 (89-171)||(30962847-30962929)
chr8 (161-234)||(30231343-30231415)
chr8 (152-239)||(31454236-31454323)
chr8 (186-243)||(36486570-36486627)
chr8 (67-103)||(23286435-23286471)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (67-243)||(14530275-14530451)
chr2 (67-243)||(10543655-10543831)
chr2 (67-249)||(8455314-8455494)
chr2 (67-248)||(24200622-24200803)
chr2 (67-249)||(11514393-11514572)
chr2 (67-248)||(25249737-25249915)
chr2 (67-248)||(7214491-7214672)
chr2 (67-249)||(9671137-9671316)
chr2 (67-249)||(21779259-21779437)
chr2 (67-233)||(12023933-12024096)
chr2 (67-248)||(17896216-17896396)
chr2 (70-248)||(27573581-27573756)
chr2 (67-249)||(5840985-5841167)
chr2 (67-243)||(23397723-23397895)
chr2 (67-243)||(25079721-25079896)
chr2 (81-248)||(17623535-17623700)
chr2 (81-248)||(17667973-17668138)
chr2 (79-249)||(26684617-26684788)
chr2 (105-248)||(10546157-10546299)
chr2 (67-233)||(19977728-19977892)
chr2 (79-249)||(39914304-39914472)
chr2 (67-233)||(14544020-14544187)
chr2 (105-248)||(14444724-14444864)
chr2 (73-231)||(4516367-4516522)
chr2 (74-248)||(24859987-24860157)
chr2 (99-233)||(19614981-19615114)
chr2 (86-227)||(21377093-21377232)
chr2 (88-230)||(31158456-31158598)
chr2 (67-216)||(22371014-22371158)
chr2 (126-248)||(36871509-36871627)
chr2 (87-231)||(99281-99421)
chr2 (130-243)||(40762238-40762349)
chr2 (85-243)||(40416875-40417031)
chr2 (95-231)||(25641487-25641620)
chr2 (71-227)||(32781308-32781461)
chr2 (88-202)||(5450263-5450376)
chr2 (150-233)||(24890451-24890532)
chr2 (86-227)||(33795261-33795400)
chr2 (67-182)||(17705452-17705567)
chr2 (145-243)||(25632544-25632640)
chr2 (86-209)||(23145736-23145857)
chr2 (86-209)||(23557526-23557647)
chr2 (85-250)||(44643497-44643661)
chr2 (166-242)||(23488537-23488613)
chr2 (86-228)||(44521392-44521532)
chr2 (120-232)||(15296421-15296532)
chr2 (90-227)||(17380257-17380391)
chr2 (87-231)||(45235833-45235976)
chr2 (159-243)||(13245099-13245181)
chr2 (187-240)||(34766330-34766383)
chr2 (186-243)||(40579753-40579810)
chr2 (106-233)||(17471544-17471671)
chr2 (86-183)||(29419947-29420048)
chr2 (82-154)||(44604826-44604898)
chr2 (153-236)||(19185754-19185837)
chr2 (145-247)||(31821343-31821443)
chr2 (87-248)||(4795730-4795891)
chr2 (124-233)||(30826051-30826156)
chr2 (187-249)||(34080176-34080238)
chr2 (151-233)||(44449397-44449478)
chr2 (186-243)||(41409936-41409993)
chr2 (199-247)||(124914-124962)
chr2 (159-233)||(39499244-39499316)
chr2 (199-249)||(22371199-22371249)
chr2 (123-226)||(30864438-30864538)
chr2 (192-243)||(8575975-8576026)
chr2 (67-110)||(39189556-39189599)
chr2 (186-231)||(24059012-24059057)
chr2 (73-233)||(35017781-35017941)
chr2 (69-113)||(27466262-27466306)
chr2 (185-233)||(31523304-31523352)
chr2 (196-248)||(39189503-39189555)
chr2 (105-179)||(2003602-2003677)
chr2 (68-169)||(4852290-4852388)
chr2 (183-248)||(1289093-1289159)
chr2 (193-243)||(3633712-3633762)
chr2 (67-157)||(17472928-17473018)
chr2 (193-235)||(22363507-22363549)
[»] chr1 (98 HSPs)
chr1 (67-248)||(18944623-18944805)
chr1 (67-249)||(10668200-10668387)
chr1 (67-249)||(41319804-41319984)
chr1 (67-249)||(20004088-20004270)
chr1 (70-249)||(30395724-30395903)
chr1 (67-248)||(27201627-27201808)
chr1 (66-242)||(23768325-23768499)
chr1 (61-249)||(34725096-34725280)
chr1 (67-248)||(46247952-46248131)
chr1 (67-250)||(14617018-14617199)
chr1 (67-248)||(45812536-45812713)
chr1 (67-243)||(46991784-46991958)
chr1 (67-233)||(32632571-32632734)
chr1 (67-249)||(27474261-27474440)
chr1 (69-240)||(18741964-18742137)
chr1 (83-248)||(6925096-6925259)
chr1 (105-250)||(35005141-35005286)
chr1 (67-233)||(47214491-47214653)
chr1 (67-248)||(38478281-38478458)
chr1 (67-243)||(19932757-19932930)
chr1 (70-250)||(9939443-9939625)
chr1 (68-252)||(19414420-19414600)
chr1 (86-238)||(35117774-35117927)
chr1 (67-248)||(8197023-8197202)
chr1 (86-227)||(18724565-18724704)
chr1 (87-233)||(19701570-19701715)
chr1 (70-233)||(12126851-12127010)
chr1 (73-233)||(2435800-2435958)
chr1 (86-233)||(17470361-17470505)
chr1 (69-243)||(45402077-45402250)
chr1 (87-225)||(25468285-25468421)
chr1 (85-249)||(6983809-6983969)
chr1 (67-212)||(22930104-22930245)
chr1 (85-243)||(15511152-15511311)
chr1 (148-243)||(4349699-4349792)
chr1 (105-248)||(35253186-35253325)
chr1 (87-227)||(44485129-44485267)
chr1 (86-227)||(11596512-11596650)
chr1 (89-248)||(22327101-22327255)
chr1 (74-183)||(4430088-4430197)
chr1 (73-233)||(50811926-50812084)
chr1 (74-198)||(33222971-33223093)
chr1 (87-243)||(39214962-39215117)
chr1 (120-233)||(22324926-22325037)
chr1 (128-248)||(31382213-31382330)
chr1 (151-248)||(42304206-42304303)
chr1 (108-233)||(45264413-45264537)
chr1 (85-223)||(20036218-20036355)
chr1 (129-248)||(23796507-23796624)
chr1 (73-248)||(35019217-35019388)
chr1 (143-249)||(20999848-20999952)
chr1 (64-203)||(25290140-25290286)
chr1 (141-248)||(1517310-1517416)
chr1 (68-230)||(18335305-18335465)
chr1 (173-248)||(50606487-50606562)
chr1 (159-227)||(15505636-15505702)
chr1 (152-243)||(10378739-10378828)
chr1 (150-240)||(31442396-31442485)
chr1 (86-184)||(50760287-50760385)
chr1 (67-183)||(24564324-24564440)
chr1 (86-202)||(27136696-27136811)
chr1 (153-248)||(43768205-43768298)
chr1 (68-135)||(21006125-21006192)
chr1 (67-142)||(34714603-34714678)
chr1 (86-233)||(52910216-52910368)
chr1 (73-248)||(43207476-43207655)
chr1 (127-227)||(20169109-20169207)
chr1 (105-231)||(31272397-31272514)
chr1 (131-249)||(19656103-19656220)
chr1 (105-238)||(23371142-23371271)
chr1 (185-242)||(4587568-4587625)
chr1 (105-250)||(19974071-19974214)
chr1 (159-231)||(6358193-6358264)
chr1 (79-151)||(22151496-22151568)
chr1 (67-131)||(40424722-40424786)
chr1 (80-175)||(14987989-14988084)
chr1 (168-233)||(4249457-4249520)
chr1 (168-233)||(4249781-4249844)
chr1 (168-233)||(4250105-4250168)
chr1 (67-177)||(18335914-18336024)
chr1 (159-224)||(21910673-21910735)
chr1 (187-233)||(33594145-33594191)
chr1 (129-238)||(34148969-34149076)
chr1 (86-155)||(2435983-2436052)
chr1 (185-238)||(30555211-30555264)
chr1 (193-233)||(25554756-25554796)
chr1 (128-227)||(30682855-30682950)
chr1 (86-243)||(34679219-34679378)
chr1 (164-232)||(4430014-4430080)
chr1 (156-233)||(7074585-7074661)
chr1 (67-151)||(21723644-21723727)
chr1 (200-248)||(50760239-50760287)
chr1 (150-224)||(20982773-20982845)
chr1 (150-230)||(5549580-5549661)
chr1 (133-174)||(25027989-25028030)
chr1 (85-150)||(25554817-25554882)
chr1 (128-176)||(44745854-44745900)
chr1 (150-195)||(46859129-46859173)
[»] chr3 (81 HSPs)
chr3 (61-248)||(40272811-40272996)
chr3 (67-249)||(13628788-13628971)
chr3 (67-248)||(46421033-46421215)
chr3 (67-248)||(13730601-13730782)
chr3 (67-249)||(29366718-29366900)
chr3 (67-228)||(8247706-8247867)
chr3 (67-230)||(9607182-9607345)
chr3 (79-248)||(26869698-26869864)
chr3 (67-248)||(1217069-1217246)
chr3 (67-249)||(12914033-12914213)
chr3 (62-243)||(39203490-39203667)
chr3 (68-243)||(22122921-22123092)
chr3 (67-233)||(6411836-6411999)
chr3 (67-248)||(5173718-5173899)
chr3 (87-233)||(34420657-34420802)
chr3 (67-243)||(22609746-22609918)
chr3 (73-233)||(26573113-26573270)
chr3 (67-248)||(52926218-52926388)
chr3 (96-248)||(516417-516570)
chr3 (120-240)||(14986989-14987109)
chr3 (67-249)||(16735420-16735599)
chr3 (128-248)||(54484730-54484849)
chr3 (131-248)||(49013472-49013589)
chr3 (120-243)||(10795427-10795550)
chr3 (134-243)||(45786218-45786327)
chr3 (70-249)||(25517168-25517348)
chr3 (67-240)||(7696899-7697063)
chr3 (87-229)||(25944468-25944609)
chr3 (86-248)||(53996564-53996725)
chr3 (146-243)||(353353-353450)
chr3 (105-230)||(54374362-54374486)
chr3 (90-227)||(30928167-30928302)
chr3 (67-248)||(4495675-4495842)
chr3 (99-231)||(33926094-33926224)
chr3 (91-248)||(7942993-7943148)
chr3 (86-248)||(44403554-44403715)
chr3 (73-233)||(45948852-45949012)
chr3 (67-172)||(10870025-10870129)
chr3 (120-243)||(31592881-31593000)
chr3 (67-226)||(12525389-12525543)
chr3 (86-243)||(19731000-19731155)
chr3 (110-247)||(55401198-55401334)
chr3 (86-231)||(28904941-28905084)
chr3 (99-227)||(45139497-45139624)
chr3 (73-184)||(45620889-45621000)
chr3 (152-248)||(15797284-15797378)
chr3 (66-183)||(26782344-26782461)
chr3 (152-248)||(34771363-34771457)
chr3 (141-233)||(829456-829547)
chr3 (141-228)||(9276317-9276401)
chr3 (125-246)||(43114869-43114990)
chr3 (99-249)||(54032569-54032705)
chr3 (77-228)||(11461653-11461809)
chr3 (125-243)||(19751615-19751731)
chr3 (71-243)||(33235513-33235684)
chr3 (134-216)||(47624088-47624167)
chr3 (107-183)||(52428539-52428616)
chr3 (185-248)||(24851300-24851363)
chr3 (126-248)||(50624952-50625072)
chr3 (187-249)||(30452892-30452954)
chr3 (192-249)||(10484614-10484671)
chr3 (90-179)||(39211992-39212081)
chr3 (67-180)||(21874999-21875106)
chr3 (127-233)||(31904870-31904975)
chr3 (86-162)||(53062036-53062112)
chr3 (94-227)||(8410887-8411016)
chr3 (152-249)||(26292394-26292490)
chr3 (107-217)||(1121254-1121363)
chr3 (87-225)||(32418221-32418359)
chr3 (202-248)||(40390353-40390399)
chr3 (199-248)||(47624208-47624257)
chr3 (187-243)||(14266376-14266431)
chr3 (127-233)||(31672732-31672837)
chr3 (73-157)||(35417902-35417985)
chr3 (185-243)||(35417999-35418057)
chr3 (85-154)||(9627712-9627781)
chr3 (151-235)||(8325011-8325095)
chr3 (185-235)||(46169979-46170029)
chr3 (142-243)||(16130329-16130429)
chr3 (66-103)||(23871417-23871454)
chr3 (185-250)||(40968613-40968678)
[»] chr7 (80 HSPs)
chr7 (67-248)||(43557429-43557611)
chr7 (67-248)||(42798626-42798805)
chr7 (67-248)||(42805481-42805662)
chr7 (67-240)||(22698974-22699148)
chr7 (67-243)||(47716416-47716592)
chr7 (67-240)||(2541026-2541198)
chr7 (67-248)||(32758218-32758395)
chr7 (67-250)||(21172006-21172185)
chr7 (79-243)||(11617592-11617754)
chr7 (67-218)||(46354151-46354302)
chr7 (67-243)||(48735126-48735299)
chr7 (67-248)||(34626207-34626385)
chr7 (67-248)||(47077854-47078031)
chr7 (111-248)||(7879639-7879774)
chr7 (71-243)||(10693077-10693245)
chr7 (68-233)||(14732835-14732999)
chr7 (72-248)||(27629596-27629770)
chr7 (70-240)||(35334823-35334989)
chr7 (70-250)||(40463837-40464014)
chr7 (79-248)||(19426889-19427055)
chr7 (92-248)||(42391099-42391251)
chr7 (84-247)||(33871910-33872070)
chr7 (73-243)||(23419678-23419845)
chr7 (67-233)||(5180169-5180335)
chr7 (86-223)||(14099030-14099165)
chr7 (86-223)||(14409047-14409182)
chr7 (62-243)||(42476825-42477002)
chr7 (86-226)||(19266426-19266564)
chr7 (86-243)||(29907393-29907549)
chr7 (105-248)||(38262195-38262336)
chr7 (73-227)||(28362165-28362316)
chr7 (73-232)||(3469190-3469350)
chr7 (96-243)||(18747472-18747618)
chr7 (85-233)||(39123865-39124016)
chr7 (114-248)||(21566439-21566572)
chr7 (125-248)||(1408472-1408593)
chr7 (61-228)||(28078151-28078315)
chr7 (108-228)||(35203437-35203557)
chr7 (67-225)||(2662958-2663109)
chr7 (85-222)||(7644931-7645066)
chr7 (89-243)||(11741774-11741924)
chr7 (126-233)||(23231573-23231678)
chr7 (85-227)||(13805077-13805216)
chr7 (109-243)||(18512457-18512588)
chr7 (86-248)||(19265791-19265949)
chr7 (73-223)||(48123508-48123655)
chr7 (67-183)||(12473261-12473377)
chr7 (129-228)||(38604546-38604642)
chr7 (70-188)||(1423967-1424085)
chr7 (86-232)||(42101899-42102044)
chr7 (86-243)||(16341254-16341410)
chr7 (107-249)||(31591107-31591245)
chr7 (105-248)||(32233134-32233274)
chr7 (162-248)||(27889315-27889399)
chr7 (135-249)||(35787267-35787378)
chr7 (67-154)||(42495926-42496013)
chr7 (67-235)||(8148958-8149124)
chr7 (67-242)||(25198679-25198856)
chr7 (67-168)||(18326991-18327091)
chr7 (67-168)||(7193042-7193143)
chr7 (87-183)||(6736867-6736962)
chr7 (162-243)||(45018927-45019010)
chr7 (153-232)||(33500556-33500635)
chr7 (69-155)||(7794596-7794682)
chr7 (125-217)||(15108427-15108516)
chr7 (146-233)||(13792164-13792250)
chr7 (66-167)||(29140438-29140539)
chr7 (86-228)||(44123641-44123780)
chr7 (163-233)||(36267831-36267900)
chr7 (140-233)||(21139762-21139852)
chr7 (147-231)||(17048831-17048914)
chr7 (125-243)||(27697452-27697570)
chr7 (206-248)||(36602541-36602583)
chr7 (67-156)||(21447547-21447636)
chr7 (141-249)||(23065923-23066029)
chr7 (140-233)||(25434049-25434141)
chr7 (196-233)||(42495876-42495913)
chr7 (85-231)||(22065563-22065706)
chr7 (185-248)||(23618976-23619039)
chr7 (153-248)||(39093438-39093532)
[»] chr6 (54 HSPs)
chr6 (74-248)||(12221913-12222088)
chr6 (62-248)||(29355854-29356041)
chr6 (67-250)||(1354754-1354933)
chr6 (67-248)||(9161080-9161260)
chr6 (67-248)||(1346921-1347098)
chr6 (67-240)||(3815084-3815255)
chr6 (69-248)||(2166409-2166587)
chr6 (69-248)||(2178042-2178220)
chr6 (70-243)||(14975094-14975255)
chr6 (67-233)||(15866053-15866215)
chr6 (75-209)||(6024198-6024332)
chr6 (67-178)||(8409200-8409311)
chr6 (68-233)||(20400625-20400788)
chr6 (80-225)||(14553482-14553626)
chr6 (105-233)||(7947385-7947512)
chr6 (68-249)||(23930125-23930303)
chr6 (67-248)||(1941812-1941991)
chr6 (71-216)||(13905011-13905152)
chr6 (81-231)||(24097552-24097696)
chr6 (68-229)||(24734591-24734760)
chr6 (128-248)||(26097178-26097294)
chr6 (86-243)||(12889402-12889558)
chr6 (86-233)||(2755434-2755583)
chr6 (128-248)||(25557743-25557859)
chr6 (167-248)||(12892064-12892145)
chr6 (166-250)||(12885967-12886051)
chr6 (96-233)||(23240838-23240971)
chr6 (105-243)||(17432335-17432479)
chr6 (134-248)||(9671083-9671196)
chr6 (120-233)||(33138843-33138954)
chr6 (102-248)||(3116128-3116266)
chr6 (125-238)||(19340843-19340954)
chr6 (184-248)||(6808467-6808531)
chr6 (66-233)||(32728171-32728335)
chr6 (95-241)||(18277199-18277343)
chr6 (120-230)||(32579436-32579543)
chr6 (86-231)||(11849031-11849173)
chr6 (88-233)||(28007604-28007746)
chr6 (173-248)||(13267788-13267861)
chr6 (143-248)||(24751067-24751176)
chr6 (88-200)||(32068074-32068182)
chr6 (66-155)||(12063423-12063512)
chr6 (109-233)||(15865871-15865992)
chr6 (194-248)||(30786373-30786427)
chr6 (67-137)||(33922936-33923006)
chr6 (168-243)||(383764-383837)
chr6 (187-243)||(10734909-10734965)
chr6 (185-241)||(34850609-34850665)
chr6 (187-230)||(11395836-11395879)
chr6 (82-182)||(27855500-27855601)
chr6 (131-235)||(31990095-31990198)
chr6 (80-142)||(8417442-8417504)
chr6 (167-196)||(20908877-20908906)
chr6 (167-196)||(20923325-20923354)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (71-248)||(16408600-16408777)
chr4 (70-243)||(21646924-21647097)
chr4 (66-249)||(16911518-16911701)
chr4 (67-248)||(13256398-13256575)
chr4 (67-248)||(5648216-5648394)
chr4 (67-243)||(20224941-20225113)
chr4 (67-248)||(23501750-23501925)
chr4 (67-243)||(6430630-6430803)
chr4 (62-248)||(30639332-30639515)
chr4 (67-248)||(47528529-47528706)
chr4 (67-248)||(48598824-48599001)
chr4 (83-243)||(44363134-44363294)
chr4 (67-234)||(37494808-37494973)
chr4 (67-248)||(11054147-11054324)
chr4 (86-248)||(35567146-35567306)
chr4 (67-248)||(5306659-5306841)
chr4 (67-243)||(10660361-10660537)
chr4 (67-243)||(10874506-10874682)
chr4 (127-248)||(20639657-20639777)
chr4 (83-243)||(40915802-40915959)
chr4 (67-243)||(20405050-20405220)
chr4 (69-248)||(30352579-30352767)
chr4 (67-233)||(54730206-54730373)
chr4 (90-228)||(17043413-17043549)
chr4 (128-243)||(7909284-7909397)
chr4 (74-233)||(19027813-19027969)
chr4 (86-233)||(20908650-20908797)
chr4 (86-229)||(39029078-39029220)
chr4 (85-248)||(47443928-47444093)
chr4 (85-229)||(25343162-25343306)
chr4 (90-248)||(54175043-54175201)
chr4 (130-248)||(25629069-25629185)
chr4 (66-231)||(14983790-14983953)
chr4 (125-242)||(21489102-21489218)
chr4 (105-243)||(29207902-29208036)
chr4 (88-233)||(30690190-30690340)
chr4 (88-248)||(9832312-9832468)
chr4 (86-227)||(47441550-47441689)
chr4 (134-250)||(51865035-51865149)
chr4 (71-227)||(54966983-54967135)
chr4 (159-243)||(20225123-20225207)
chr4 (96-227)||(25463108-25463237)
chr4 (91-248)||(39077795-39077948)
chr4 (89-229)||(49938611-49938746)
chr4 (67-243)||(55766470-55766644)
chr4 (86-238)||(487135-487294)
chr4 (79-243)||(8473624-8473786)
chr4 (171-248)||(33836486-33836563)
chr4 (130-226)||(49796818-49796911)
chr4 (137-240)||(48327770-48327873)
chr4 (68-196)||(14590795-14590922)
chr4 (73-243)||(36589708-36589875)
chr4 (93-224)||(7385499-7385628)
chr4 (67-233)||(55830735-55830899)
chr4 (98-249)||(7038041-7038189)
chr4 (125-248)||(9987833-9987954)
chr4 (88-231)||(30581481-30581624)
chr4 (88-227)||(32478811-32478942)
chr4 (67-169)||(17315375-17315476)
chr4 (182-243)||(38755912-38755973)
chr4 (154-228)||(2813169-2813243)
chr4 (74-233)||(30496336-30496491)
chr4 (93-233)||(41018808-41018945)
chr4 (87-227)||(3580860-3580994)
chr4 (85-188)||(11579819-11579922)
chr4 (185-243)||(11394925-11394983)
chr4 (185-243)||(11404652-11404710)
chr4 (186-248)||(32484307-32484369)
chr4 (88-233)||(23580222-23580365)
chr4 (151-248)||(36816383-36816479)
chr4 (186-243)||(40553941-40553998)
chr4 (95-231)||(32629285-32629418)
chr4 (152-231)||(16494259-16494338)
chr4 (185-248)||(38786682-38786745)
chr4 (86-169)||(43035224-43035307)
chr4 (185-243)||(25388249-25388307)
chr4 (179-233)||(47482864-47482918)
chr4 (73-182)||(51420537-51420646)
chr4 (144-204)||(35894504-35894563)
chr4 (86-170)||(42164224-42164307)
chr4 (197-248)||(35532077-35532128)
chr4 (182-248)||(50555655-50555721)
chr4 (182-235)||(8820578-8820631)
chr4 (186-243)||(44718641-44718698)
chr4 (67-139)||(5313100-5313172)
chr4 (185-248)||(28494224-28494287)
chr4 (85-236)||(44357195-44357345)
chr4 (89-195)||(49938490-49938594)
chr4 (73-155)||(54640429-54640510)
chr4 (150-206)||(4222069-4222123)
chr4 (66-103)||(18969697-18969734)
chr4 (161-248)||(10277756-10277841)
chr4 (120-202)||(17079696-17079776)
chr4 (198-233)||(37038137-37038172)
chr4 (73-150)||(12257688-12257764)
chr4 (142-233)||(12711463-12711553)
chr4 (187-248)||(19027986-19028047)
chr4 (197-234)||(48202395-48202432)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (67-248)||(24771-24945)
scaffold0057 (73-248)||(46794-46967)
scaffold0057 (125-233)||(43674-43779)
scaffold0057 (159-235)||(46719-46794)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (69-243)||(58936-59110)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (67-248)||(30536-30713)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (67-248)||(13023-13201)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (66-243)||(10054-10227)
scaffold0187 (66-243)||(20382-20555)
scaffold0187 (67-129)||(8902-8964)
scaffold0187 (67-129)||(19230-19292)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (72-247)||(1587-1758)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (80-242)||(10780-10940)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (71-243)||(11093-11260)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (69-210)||(4117-4258)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (131-249)||(48632-48746)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (72-243)||(72871-73034)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (126-233)||(3560-3665)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (68-196)||(226456-226583)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (159-248)||(24132-24219)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (80-202)||(35062-35184)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (67-138)||(83832-83903)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (67-154)||(8851-8935)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (120-237)||(23609-23723)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (79-154)||(43098-43173)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (67-139)||(24621-24693)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 703; Significance: 0; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 703; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 845
Target Start/End: Original strand, 27328648 - 27329481
Alignment:
Q  6 caagctatgaagcacggacacagatacagacacgaacactagatacaacactgacactgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27328648 caagctatgaagcacggacacagatacagacacgaacactagatacaacactaacactgaagggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtg 27328747  T
Q  106 actgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccga 205  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328748 actgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccga 27328847  T
Q  206 accctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaacataattaaatgcaaatcacaaatgtcagtgtcgtgacggtgtctgacacgatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  27328848 accctgcgtatgcgggagctttaatgcatcggattgcctttttaacataattaaatgtaa-tcacaagtgtcaatgttatgacggtgtctgacacgatat 27328946  T
Q  306 gtgtctgacacctagacatttcttcgattagaagtgtctgtgcaagcaaagtttatgctttcattatagaaattatcaaaattgattttaattatcctta 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27328947 gtgtctgacacctagacatttcttcgattagaagtgtctgttcaagcaaagtttatgctttcattatagaaattatcaaaattgattttaattatcctaa 27329046  T
Q  406 ccaaacctgtttttgttaaagaaacacataattggctaattgatgttccatatttgtcttcagataattaccaatgggaaatacaggagtattgttcatc 505  Q
    |||||| |||||  || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27329047 ccaaacatgtttcggt-aaagaaaaacataagtagctaattgatgttccatatttgtcttcagataattaccaatgggaaatacaagagtattgttcatc 27329145  T
Q  506 gtgctgtggtgatgaataagaaagctgcaagaatttctgttggtacagcacatgggcccacacttgacaccattgtcacccctgcaccagagctgcttag 605  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27329146 gtgctgtggtgatgaataagaaagctgcaagaatttctgttgggacagcacatgggcccactcttgacaccattgtcacccctgcaccagagctgcttag 27329245  T
Q  606 caaggataacccctcagcatatagaggcattacatacagagattacttgcagcttcaacaaagtcgtgaattagcgagaaattcttgcttagattatatt 705  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27329246 caaggataacccctcagcatatagaggcattacatacagagattacttgcagcttcaacaaagtcgtgaattagcaagaaattcttgcttagattatatt 27329345  T
Q  706 cgaatttaaataaaaactttgttatgcttgcttgcataagtaataattgtaagtttggtctttcaaaatttagttttaacttgtaaattaatgcgtggaa 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27329346 cgaatttaaataaaaactttgtta----tgcttgcataagtaataattgtaagtttggtctttcaaaatttagttttaacttgtaaattaatgcgtggaa 27329441  T
Q  806 ttataatttggtgtatggttatgtaatgtggtttttgcta 845  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27329442 ttataatttggtgtatggttatgtaacgtggtttttgcta 27329481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Original strand, 38879538 - 38879721
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38879538 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggc 38879637  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38879638 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttaa 38879721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 64 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4619287 - 4619102
Alignment:
Q  64 gaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 163  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  4619287 gaagggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 4619188  T
Q  164 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4619187 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttta 4619102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 66 - 248
Target Start/End: Original strand, 43334158 - 43334340
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaag 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||    
T  43334158 agggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaag 43334257  T
Q  165 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  43334258 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcg-atgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 43334340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 24448847 - 24449026
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||    
T  24448847 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaaggc 24448946  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24448947 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgccctttt 24449026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Original strand, 41014276 - 41014456
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41014276 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggc 41014374  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  41014375 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttaa 41014456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8170157 - 8169983
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||| |||||||||||    
T  8170157 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 8170060  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  8170059 gtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgccctttt 8169983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 22187242 - 22187418
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |    
T  22187242 gggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataagac 22187341  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||| ||   || ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22187342 tgcgtacaatacaccaaaaacaatgagaccccttcccaaaccctacatatgcaggagctttagtgcatcaggttgcc 22187418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 35710270 - 35710447
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||    
T  35710270 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggc 35710367  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  35710368 tgcgttcaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 35710447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13801894 - 13801771
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  13801894 ggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcg 13801795  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
T  13801794 agagctttagtgcaccgggttgcc 13801771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 129 - 243
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135737
Alignment:
Q  129 cctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||| |    
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcaggagcttca 20135722  T
Q  229 gtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||| |||||||||    
T  20135723 gtgcaccgggttgcc 20135737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 249
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703559
Alignment:
Q  97 tgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 196  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggacc 32703506  T
Q  197 ccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  32703507 ccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttta 32703559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 22600411 - 22600569
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||    
T  22600411 gggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaaggc 22600510  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    || |||||||||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  22600511 tgtgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggatcctgcgtatgcgggagcttt 22600569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12006510 - 12006332
Alignment:
Q  65 aagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggttt-aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 163  Q
    ||||||| | ||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||| ||||||||  ||||| ||||||||| | |||||    
T  12006510 aagggtagctttggcgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaa 12006412  T
Q  164 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12006411 ggctccatacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcc 12006332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 1565388 - 1565562
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||| || ||||||||   |||||    
T  1565388 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatattaagg 1565487  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  1565488 ctgcgtacaatgcacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc-ttagtgcaccgggttgcc 1565562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Original strand, 43574621 - 43574742
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43574621 aagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatataccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagc 43574718  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| ||| |||| ||| |||||    
T  43574719 tttagagcaccgggatgctttttt 43574742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 257
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334541
Alignment:
Q  130 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||     
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggacccattcccggaccctgcgtatgtgggatctttaa 29334513  T
Q  230 tgcatcgggttgcctttttaacataatt 257  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||||    
T  29334514 tgcaccgggctgcccttttaacttaatt 29334541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22861848 - 22861683
Alignment:
Q  63 tgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta 162  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||    
T  22861848 tgaagggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgt--aaaacaa-gta 22861752  T
Q  163 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || ||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  22861751 agactgctcacaatacatca--aatggtgggaccccttctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgca 22861683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 70 - 247
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006460
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | |||||  ||||| | |||| |||| ||||||||||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttt 247  Q
    ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30006385 gtacattacacta--aatggtgggaccccttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttt 30006460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142957
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||| | || ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||     
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacagtacaccaa- 19143005  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19143004 -atggtgggaccccttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgca 19142957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||| |    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacaccaa-a 208989  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  208988 atggtgggaccccttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368527
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagc 7368508  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  7368509 tctagtgcaccgggttgcc 7368527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16880757 - 16880654
Alignment:
Q  135 aacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16880757 aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgtgaccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcac 16880660  T
Q  235 cgggtt 240  Q
    ||||||    
T  16880659 cgggtt 16880654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516432
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||| |    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatcaa-a 28516495  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||| ||||    
T  28516494 atggtgggacccattcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgccctttt 28516432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 37024732 - 37024626
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  37024732 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 37024635  T
Q  167 tgcgtacaa 175  Q
    |||||||||    
T  37024634 tgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7097870 - 7097774
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7097870 aaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgagaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 7097774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 224
Target Start/End: Original strand, 2838735 - 2838890
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactg-aaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | | |||||   |||||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  2838735 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgtaaaaa-cagggtaagg 2838833  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  2838834 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 250
Target Start/End: Original strand, 3771318 - 3771477
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||   |||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||     
T  3771318 gtaatgttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtct---gtgtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat- 3771413  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
     |||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  3771414 -tggtgggaccccttcccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttttaa 3771477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 238
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301249
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
     ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  39301186 taatgcaccaa-aaaggtgggaccccttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 249
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957451
Alignment:
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16957374 gtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 16957451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 90 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34074717 - 34074584
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatgg 189  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  34074717 aagttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacacca--aatgg 34074620  T
Q  190 tgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
      || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34074619 cagggccccttcccaaaccctgcgtatgggggagct 34074584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 170
Target Start/End: Original strand, 23974738 - 23974840
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||    
T  23974738 gggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaaggc 23974836  T
Q  167 tgcg 170  Q
    ||||    
T  23974837 tgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622591
Alignment:
Q  176 tacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcc 25622591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42924974 - 42924844
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccc- 203  Q
    |||||||||||||   ||| |||||||| |||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||     
T  42924974 gactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttccca 42924875  T
Q  204 ga-accctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42924874 gacaccctgcgtatgcggaagctttagtgca 42924844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34154900 - 34154818
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  34154900 ggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgcc 34154818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 248
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405323
Alignment:
Q  93 ttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 192  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||| | ||||||| |  |||||  |||||||||||||||||  |||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacaccaa--atggtgg 1405267  T
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||    
T  1405268 gaccctttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgccctttt 1405323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575664
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaa-aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggagctt 12575681  T
Q  227 tagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | ||||| |||| ||||    
T  12575680 tggtgcaccgggctgcc 12575664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 5873441 - 5873326
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  ||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||    
T  5873441 aagtcgtggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggctaagtacactacaccaat--tggtgggactcctccccggacactgcgtatgcgggagc 5873345  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5873344 tttagtgcatcgggatgcc 5873326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694122
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||| || ||| |||| || |||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||  ||     
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacc--tat 31694169  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || |||||| |||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31694168 tgatgggactccttcccagaccttgcgtatgcgggagatttagtgca 31694122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 168
Target Start/End: Original strand, 22025536 - 22025601
Alignment:
Q  103 gcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22025536 gcgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctg 22025601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 233
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850760
Alignment:
Q  94 tgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggg 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||| |  ||||||||| |||||||   ||||| ||||||||||||| ||  |||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatca--aatggtggg 1850720  T
Q  194 accccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1850721 accacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgca 1850760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 235
Target Start/End: Original strand, 18426017 - 18426162
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||| | | | |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |  | |||| || |||||||||| |   |||    
T  18426017 taaagttgttattacgtgactgaaatgtcacaggtttaagtcttgaaaacaatctcttgtgtaaaaaatagagaaaggttgtgtacaatacatc--gaat 18426114  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18426115 ggtgagaccccttttcgaactctgcgtatgcgagagctttagtgcatc 18426162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10306548 - 10306493
Alignment:
Q  172 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10306548 acaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 10306493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11657785 - 11657698
Alignment:
Q  160 gtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||| || |||| |||| ||||    
T  11657785 gtaaggctgcatacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcacacgcgggaactttagttcaccgggctgccctttt 11657698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12477205 - 12477134
Alignment:
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||    
T  12477205 taaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggattctgcgtatgcaagagctttagtgca 12477134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24313732 - 24313569
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaac-agtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |  | ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24313732 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24313634  T
Q  187 tggtgggaccccttccc-gaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||| |  || || |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24313633 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttttaa 24313569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323725
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||| | ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||  |||    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcca--aat 24323765  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
     |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  24323764 agtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24323725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24356069 - 24355906
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaac-agtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |  | ||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  24356069 taaagttgttgtcacatgactgaaaggtcatgtgttcaagtcttggaaacaacccccttctgtagaaaacaagataaggttgcgttcaatacaccaa-aa 24355971  T
Q  187 tggtgggaccccttccc-gaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||| |  || || |||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  24355970 tggtgggaccccttcccggcgccatgtgtatgctgtagctttagtgcaccgggctgcccttttaa 24355906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360349
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||| || || |||||||| |||| | ||| |||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||||| |||  |||    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcca--aat 24360389  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
     |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  24360388 agtgggaccccttcccagaccctgtatatgcgggagcttt 24360349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 39801591 - 39801653
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39801591 tggtgggaccccttcccagaccctacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttta 39801653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903705
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| ||||| ||   |||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||||  || ||||||| |||||||     
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaat- 24903757  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
     ||||| |||||||||||| || |||| || |||||| |||| ||||| ||||    
T  24903756 -tggtgagaccccttcccggacactgcatacgcgggaactttggtgcaccggg 24903705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 188 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16028683 - 16028623
Alignment:
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  16028683 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 16028623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 203
Target Start/End: Original strand, 41425982 - 41426039
Alignment:
Q  144 ttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41425982 ttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttccc 41426039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21784394 - 21784336
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  21784394 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggaggtttagtgcaccgagttgcc 21784336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 250
Target Start/End: Original strand, 32354211 - 32354265
Alignment:
Q  196 cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32354211 cccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttttaa 32354265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2432395 - 2432302
Alignment:
Q  147 tgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||| |||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  2432395 tgtaaaaaacaaggcaagggtgcatataatacaccaaaaatggtggaaccccttaccgtatcctacgtatgcgagaactttattgcatcaggtt 2432302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907913
Alignment:
Q  95 gttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga 194  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||  ||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgta-aaaacagagtaaggttgcatacaatacacca--aatggtggga 22907918  T
Q  195 cccct 199  Q
    |||||    
T  22907917 cccct 22907913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4654477 - 4654429
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4654477 aatggtgggatcccttctcgaaccctgcatatgcgggagctttagtgca 4654429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 242
Target Start/End: Original strand, 18684367 - 18684403
Alignment:
Q  206 accctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18684367 accctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 18684403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30877628 - 30877568
Alignment:
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30877628 ataaaggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcc 30877568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10634317 - 10634211
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||  ||| |||| ||||| || |||||||||  |||    
T  10634317 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaaggctcggta 10634219  T
Q  173 caatacac 180  Q
     |||||||    
T  10634218 aaatacac 10634211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37226037 - 37225975
Alignment:
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||    
T  37226037 gtacaatacaacaa-aatggtgggaccccttcccgaaccatgcgtatgccagaggtttagtgca 37225975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 170 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39079827 - 39079765
Alignment:
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||||||||    
T  39079827 gtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccatgtgtatacgggagttttagtgca 39079765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 147
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299669
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgt 147  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||   ||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgt 31299669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 13774921 - 13774991
Alignment:
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13774921 ctgcgcacaatacaccaa--atggcaggatccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 13774991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21542529 - 21542489
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21542529 aatggtgggaccccttcccggactctgcgtatgcgggagct 21542489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 102
Target Start/End: Original strand, 19438706 - 19438741
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcat 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19438706 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcat 19438741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 191 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10943900 - 10943844
Alignment:
Q  191 gggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  10943900 gggaccccttcccggaccctgca-atgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 10943844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 230
Target Start/End: Original strand, 15141953 - 15141998
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15141953 aatggtgggaccccttcttgaaccctgcttatacgggagctttagt 15141998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29184098 - 29184065
Alignment:
Q  210 tgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29184098 tgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 29184065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 138
Target Start/End: Original strand, 36200167 - 36200220
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaaca 138  Q
    ||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36200167 tggtaaagttgttgtctcgtgattgaaaagtcataggtttaagtcttggaaaca 36200220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 135; Significance: 7e-70; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39461174 - 39460992
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  39461174 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggc 39461075  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39461074 tgcgtacaatacaccaataatggtgagaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 39460992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28817804 - 28817625
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28817804 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 28817705  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28817704 tgcgtacaatacacc--caatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 28817625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7136707 - 7136534
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||    
T  7136707 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggtaaggc 7136608  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||    
T  7136607 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 7136534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20284250 - 20284075
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaa--ggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||  |||||||    
T  20284250 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaagggtaagg 20284151  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20284150 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 20284075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 68 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21070879 - 21070703
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaa---ggtaag 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||   ||||||    
T  21070879 ggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaagggtaag 21070780  T
Q  165 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21070779 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggttg 21070703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 35261636 - 35261815
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  35261636 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 35261735  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35261736 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 35261815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 36720753 - 36720933
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36720753 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 36720852  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||    
T  36720853 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgccctttta 36720933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 68 - 248
Target Start/End: Original strand, 25250480 - 25250660
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||    
T  25250480 ggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggct 25250579  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25250580 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgccctttt 25250660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30454273 - 30454096
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  30454273 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggtaaggc 30454176  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  30454175 tgcgtacgatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30454096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 12670426 - 12670257
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  12670426 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 12670329  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12670328 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 12670257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Original strand, 6760786 - 6760960
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6760786 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggcttcgtac 6760885  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6760886 aatacaccaataatggtgggaccccttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 6760960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 241
Target Start/End: Original strand, 44530106 - 44530278
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  44530106 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 44530205  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44530206 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttg 44530278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 13160659 - 13160832
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13160659 gggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggc 13160757  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  13160758 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcc 13160832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29521863 - 29521690
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29521863 gggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacagggtaaggc 29521764  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29521763 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaacccatcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgc 29521690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 17823533 - 17823707
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |    
T  17823533 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataagac 17823632  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17823633 tgcgtaaaatacacca--aatggtggaaccccttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcc 17823707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 45071222 - 45071395
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  45071222 gggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggc 45071320  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  45071321 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcc 45071395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870061
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||    
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccaggaccccgcatatgcgggagcttt 20870040  T
Q  228 agtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  20870041 agtgcaccgggttgccctttt 20870061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 26954089 - 26954272
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaagg 165  Q
    ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| || |  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||    
T  26954089 gggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagg 26954188  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  26954189 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttta 26954272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18164937 - 18164759
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||     
T  18164937 gggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggt 18164839  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||  | | || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18164838 tgcgtacaatacaccaa--aggatgtgaccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccatttt 18164759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 64 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8897945 - 8897763
Alignment:
Q  64 gaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaa 163  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||  |||| ||||||||||||||  | ||||||||||||| | |||||    
T  8897945 gaagagtaaccctggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaa 8897846  T
Q  164 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  8897845 ggctacgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgccctttt 8897763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 2626476 - 2626643
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt---aaaaaacaaggtaa 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||   |||||||| |||||    
T  2626476 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacagggtaa 2626575  T
Q  164 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2626576 gactgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgca 2626643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781518
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccccgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 44781518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 70 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20869671 - 20869523
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||     
T  20869671 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgt 20869574  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20869573 gtacaatacaccaa----ggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagc 20869523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 249
Target Start/End: Original strand, 12625857 - 12626027
Alignment:
Q  78 acgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||  || | ||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  12625857 acgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactgcatacaat 12625956  T
Q  177 acaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12625957 acaccaa--atggtgggaccccctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 12626027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17250997 - 17250880
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||    
T  17250997 aagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccctttcccgaaccctgcgtatgaaggagc 17250898  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  17250897 tttagtgca-cgggttgcc 17250880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877215
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcgt 29877208  T
Q  227 tagtgca 233  Q
    |||||||    
T  29877209 tagtgca 29877215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083702
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||   || |||||||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||    
T  42083771 cagtataccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgcattgggctgcc 42083702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8484078 - 8483947
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||     
T  8484078 gacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccatccca 8483981  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  8483980 gaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365079
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||  |||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||      
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacaccaa-- 24365121  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  24365120 atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagcttt 24365079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5135414 - 5135289
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  5135414 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgca 5135317  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  5135316 ggagcttt-gtgcaccgggctgccctttt 5135289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 136 - 241
Target Start/End: Original strand, 16225045 - 16225150
Alignment:
Q  136 acagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16225045 acagcctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcacc 16225144  T
Q  236 gggttg 241  Q
    ||||||    
T  16225145 gggttg 16225150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Original strand, 24245408 - 24245565
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| |||    |||| |||||| |    
T  24245408 gggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaac-gtctcttatgt----aacagggtaagac 24245502  T
Q  167 tgcgtacaatacacc-aataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    | |||||||| |||| || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  24245503 tacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttta 24245565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44742678 - 44742522
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||  | || || ||||||||  ||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  44742678 ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-a 44742580  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44742579 atggtgggaccccttcttggaccctacggatgcgggagcattagtgcaccggggtgcc 44742522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Original strand, 5689636 - 5689761
Alignment:
Q  115 tcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgt 214  Q
    |||| |||| ||||| || ||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  5689636 tcatgggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtggaaccccttcccgaaccatgcgt 5689733  T
Q  215 atgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5689734 atgtgggagctttagtgcaccggtttgc 5689761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598277
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacaccaat- 22598231  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     ||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22598232 -tggtgagaccctttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgca 22598277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407534
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||           
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaagg------- 28407470  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
         |||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  28407471 -----cacca--aatggtgggaccccttcccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcc 28407534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 249
Target Start/End: Original strand, 31457155 - 31457309
Alignment:
Q  92 gttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtg 191  Q
    |||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||  | |  |||||||||||||||||| |||  |||||     
T  31457155 gttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgtaaaaat-aggaaaaggctgcgtacaatacatcaa--atggta 31457251  T
Q  192 ggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  31457252 ggaccccttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttta 31457309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 14018140 - 14017989
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| | || ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  14018140 ccttggcgcaac-ggtaatgttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgta 14018042  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    |||||||| || | |||||||||| ||||| | |||||||  |||||| |||||    
T  14018041 caatacactaa-attggtgggaccacttcctggaccctgcagatgcggtagctt 14017989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Original strand, 10857845 - 10857965
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10857845 gtccaggaaaccgcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccacttcctggaccttgcgtatgcgggagct 10857942  T
Q  226 ttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  10857943 ttagtgcaccgggttgccctttt 10857965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Original strand, 11748256 - 11748407
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| |||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |    
T  11748256 gggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaagac 11748355  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgc 218  Q
     |||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  11748356 agcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccccttcccgaatcctgcatatgc 11748407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 248
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389781
Alignment:
Q  109 gaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaa 206  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||  |    
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atgatgggatccctttcctga 389739  T
Q  207 ccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||    
T  389740 ccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggattaccttttt 389781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 131 - 233
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729461
Alignment:
Q  131 tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaa--cagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatacgggagctctagt 19729458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40605083 - 40604920
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || | | | || |||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||   | |||||     
T  40605083 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataaggt 40604984  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||| |  |||| | ||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40604983 tgcgtacaatacacta--aatgat-ggatcccttccgaaaccctacgtatgcgggagctttagtgca 40604920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508039
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27507985 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttg 27508039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 202
Target Start/End: Original strand, 35105902 - 35106014
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  35105902 aaagttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatg 35106000  T
Q  189 gtgggaccccttcc 202  Q
    |||||||| |||||    
T  35106001 gtgggacctcttcc 35106014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Original strand, 43942348 - 43942417
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 203  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43942348 aaacagcctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttccc 43942417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 249
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013594
Alignment:
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg-ccttttta 249  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccccttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggttgtccttttta 16013594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000970
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||   |||| || | ||| |||||  ||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||     
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacaccaa- 11001011  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
     |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||    
T  11001010 -atggtgggacccctacccgaaccctgtttatgcaggagctt 11000970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000262
Alignment:
Q  96 ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggac 195  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacacggtaaggttccatacaatacacca--aatggtgggac 23000271  T
Q  196 cccttcccg 204  Q
    |||||||||    
T  23000270 cccttcccg 23000262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102653
Alignment:
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  26102578 tacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 26102653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918245
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacca--aat 36918199  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     || |||  ||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||||    
T  36918200 agtaggattccttcccaaaccctatgtatgcgagagctttaatgca 36918245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 18595918 - 18595974
Alignment:
Q  192 ggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18595918 ggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagttttagtgcatcgggttgccttttt 18595974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Original strand, 26457778 - 26457863
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  26457778 ggtaaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggacccct--cctgaccttgcgtatgagggagctttagtgcaccgggtttccttttt 26457863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 243
Target Start/End: Original strand, 33866983 - 33867083
Alignment:
Q  144 ttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||  || |||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  33866983 ttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtgacacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgcaccgggttgc 33867082  T
Q  243 c 243  Q
    |    
T  33867083 c 33867083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35107373 - 35107310
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35107373 aatggtgggaccccttcccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgccctttt 35107310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27468141 - 27468091
Alignment:
Q  198 cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27468141 cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 27468091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 30962929 - 30962847
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgt 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||    || ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  30962929 aaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgcgt 30962847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30231415 - 30231343
Alignment:
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcat 234  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||| | || | ||||||||||||||||    
T  30231415 taaggctgcgtacaatataccaa-aatggtgggacccttacccgaaccctccatacgtgggagctttagtgcat 30231343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 239
Target Start/End: Original strand, 31454236 - 31454323
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggt 239  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| || ||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31454236 aaaacatggtaagactgcgtataatacacaaaaaatgatgagaccctttttcaaaccctgcgtatgcgggagatttagtacatcgggt 31454323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 36486627 - 36486570
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  36486627 atggtgggacctcttcccggaccttgcgtatgcaggagctttagtgccccgggttgcc 36486570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23286471 - 23286435
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23286471 gggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatg 23286435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 14530275 - 14530451
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14530275 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggc 14530374  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14530375 tacgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 14530451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 10543655 - 10543831
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10543655 gggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 10543754  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10543755 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 10543831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8455494 - 8455314
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8455494 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggtaaggc 8455395  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8455394 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgccctttta 8455314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24200803 - 24200622
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24200803 gggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 24200704  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24200703 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacccttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgccctttt 24200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 11514393 - 11514572
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  11514393 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaaggc 11514492  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  11514493 tgcgtacaatacacca--aatggtggga-cccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttta 11514572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249737
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggtaaggc 25249817  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25249816 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgccctttt 25249737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 7214491 - 7214672
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7214491 gggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggtaaggc 7214590  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || |||||| || || ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  7214591 tgcgtacaatacacaaaaaatggtgagatcccttctcggacactgcgtatgcgagagttttagtgcaccaggttgccttttt 7214672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 9671137 - 9671316
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactg-aaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||| || |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||    
T  9671137 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagg 9671234  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9671235 ctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 9671316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21779437 - 21779259
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||     
T  21779437 gggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggt 21779340  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  21779339 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttta 21779259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12024096 - 12023933
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  12024096 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggc 12023998  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||  || ||||||| ||||    
T  12023997 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccctcccggaccctgcgtatttggaagctttaatgca 12023933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 17896216 - 17896396
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||| | |||||||    
T  17896216 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaagg 17896315  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17896316 ctgcgtacaatatacca--aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgccctttt 17896396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 248
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573756
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgc 27573679  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27573680 gtacaatacacca--aatggtggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgccctttt 27573756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 5840985 - 5841167
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||     
T  5840985 gggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagga 5841084  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  5841085 tgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttta 5841167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 23397723 - 23397895
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||    
T  23397723 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggc 23397820  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23397821 tacgtacaatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 23397895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25079896 - 25079721
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaa-aaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25079896 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggtaagg 25079797  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25079796 atgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcc 25079721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623700
Alignment:
Q  81 caactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  17623635 ca--aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgccctttt 17623700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 81 - 248
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668138
Alignment:
Q  81 caactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17668073 ca--aatggtggaaccccttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 17668138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26684788 - 26684617
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacag-tctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaat 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  26684788 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggtaaggctgcgtacaat 26684689  T
Q  177 acaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg-ccttttta 249  Q
    | || |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||    
T  26684688 atacta--aatggtgggacctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccggattgtccttttta 26684617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Original strand, 10546157 - 10546299
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 203  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  10546157 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttccc 10546254  T
Q  204 gaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10546255 ggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 10546299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19977892 - 19977728
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | | |||||     
T  19977892 gggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataaggt 19977793  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19977792 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgca 19977728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39914472 - 39914304
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaata 177  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | |||| |||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||    
T  39914472 cgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaata 39914373  T
Q  178 caccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39914372 caccga--atggtgggaccccttcctga-ccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttta 39914304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 14544020 - 14544187
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgta-aaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | || |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||     
T  14544020 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaaga 14544119  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||| |||||  | || |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14544120 ctgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccccttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 14544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Original strand, 14444724 - 14444864
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14444724 gactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgtgtacgatacaccaa--atggtgggaccccttcccg 14444820  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  14444821 gaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccctttt 14444864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516367
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |  || |||| || ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  4516423 caatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtg 4516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859987
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggta-ggctgcgtac 24860060  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||  ||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24860059 aatacaccaa--atggtagaaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccttttt 24859987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 233
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615114
Alignment:
Q  99 tcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagt-ggacccc 19615079  T
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19615080 ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 19615114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377093
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |   ||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacca--a 21377135  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21377134 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgtgggagcttt 21377093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158456
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| |  |||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||| ||||| |||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31158498 ggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagt 31158456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 22371014 - 22371158
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  |||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||| ||||||||    
T  22371014 gggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacagggtaaggc 22371110  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtat 216  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22371111 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 22371158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871627
Alignment:
Q  126 agtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggacc-tgcgtatgcgggagct 36871604  T
Q  226 ttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| ||||||||| ||||    
T  36871605 ttagtgcaccgggttgccctttt 36871627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||    
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctct--tgtaaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacacca--aa 99326  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||| |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcagaccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 130 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762238
Alignment:
Q  130 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacaccaa--atggtgggaccctttcctggaccctgcgtatgtgggagctttag 40762252  T
Q  230 tgcatcgggttgcc 243  Q
    |||| |||||||||    
T  40762251 tgcaccgggttgcc 40762238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416875
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
      || |||||||| ||   | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttggaccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcc 40416875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641620
Alignment:
Q  95 gttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||  | |||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||  || ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgtgaaaa-cagggtaaagttgcgtacaatacaccaa--attgtggga 25641583  T
Q  195 ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25641584 ccccttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtg 25641620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32781461 - 32781308
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||   |||||||||||   ||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  32781461 aaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 32781363  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  32781362 tacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 32781308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 202
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450376
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 5450360  T
Q  187 tggtgggaccccttcc 202  Q
     |||||||||||||||    
T  5450361 gggtgggaccccttcc 5450376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890532
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 24890532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795400
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac-aatacaccaat 184  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||  |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
     ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgggagcttt 33795400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 182
Target Start/End: Original strand, 17705452 - 17705567
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||  |||||||    
T  17705452 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaaggc 17705551  T
Q  167 tgcgtacaatacacca 182  Q
    || |||||||||||||    
T  17705552 tgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 243
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632640
Alignment:
Q  145 tgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggattccttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 25632640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145736
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||  |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23145759  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccc 209  Q
     ||||||||||| |||||| ||||    
T  23145758 -tggtgggaccctttcccggaccc 23145736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557526
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||  |||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||     
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacaccaat- 23557549  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccc 209  Q
     ||||||||||| |||||| ||||    
T  23557548 -tggtgggaccctttcccggaccc 23557526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643661
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaag-gtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||   ||| |||| || |||| || |||||  ||||||||  || |||||||||||||||||  |||||    
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtaccaa 44643596  T
Q  184 taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
      ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  44643597 --atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttttaa 44643661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 166 - 242
Target Start/End: Original strand, 23488537 - 23488613
Alignment:
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23488537 ctgcgtgcaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggttgc 23488613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521392
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||   ||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacacca--a 44521435  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    |||| |||| ||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||    
T  44521434 atggcgggagcccttcccagacattgcatatacgggagcttta 44521392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15296532 - 15296421
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| |||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||| || |||||||||||| |    
T  15296532 ggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaa-aatagtgggatcccttctcggaccctgcgtatgtg 15296434  T
Q  220 ggagctttagtgc 232  Q
    | |||||| ||||    
T  15296433 gaagctttggtgc 15296421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17380391 - 17380257
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatgg 189  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| ||||||| || || ||||||||||  ||||     
T  17380391 aagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatga 17380295  T
Q  190 tgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  17380294 tggaaccccttcctggaccctgcggatgcgggagcttt 17380257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235833
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa-aacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||   ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| || | ||||||||| |||  |||||||  | |    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacac--aaa 45235879  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45235878 atggtgggaccccttaccagaccctacgtatgcaggagctttagtg 45235833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13245181 - 13245099
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  13245181 ggtaaggctgcgtacattacactaa--atggtgggaccccttcccggaccatgcatatacgggagctttagtgtatcgggttgcc 13245099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 240
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766383
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34766330 tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtt 34766383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579753
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40579810 atggtgggaccccttcccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 40579753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Original strand, 17471544 - 17471671
Alignment:
Q  106 actgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||     
T  17471544 actgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaa-aatgatgagaccccttccct 17471642  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  17471643 gaccctgcctatgcgggagttttagtgca 17471671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419947
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaaca----aggtaaggctgcgtacaatacacc 181  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  182 aa 183  Q
    ||    
T  29419948 aa 29419947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 154
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604898
Alignment:
Q  82 aactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa 154  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa 44604898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19185837 - 19185754
Alignment:
Q  153 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcg 236  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19185837 aaacatggtaaagttgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcg 19185754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 145 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31821443 - 31821343
Alignment:
Q  145 tgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcct 244  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||| | || |||||    
T  31821443 tgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacaccaa--atgatgggacccctttccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacctggctgcct 31821346  T
Q  245 ttt 247  Q
    |||    
T  31821345 ttt 31821343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 248
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795891
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||   ||| ||||| || |||||| ||| || |||||||| |||| | || |||||| ||||||||||| |    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacaccaa-a 4795828  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||  |||||| ||| || |||||| | ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  4795829 atggtgggaccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgccctttt 4795891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 233
Target Start/End: Original strand, 30826051 - 30826156
Alignment:
Q  124 taagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||  ||||| | ||||||||||    
T  30826051 taagtcttggaaacagcctcttgtgt-aaaaatagggtaaggttgcgtacaatacacca--aatggt-ggaacccttcccagaccctacatatgcgggag 30826146  T
Q  224 ctttagtgca 233  Q
    ||||||||||    
T  30826147 ctttagtgca 30826156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 34080176 - 34080238
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  34080176 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgccctttta 34080238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44449478 - 44449397
Alignment:
Q  151 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  44449478 aaaaacaggataaggctgcgtacaatacaccaa-aatagtgggaccccttcccggaccctgcgtttgtgggagttttaatgca 44449397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 41409936 - 41409993
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  41409936 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcc 41409993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 124962 - 124914
Alignment:
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttt 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  124962 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcctttt 124914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39499316 - 39499244
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39499316 ggtaaagctgcgtacaatacatcaa--atggtgggatcccttttcgaatcctgcgtatgcgggagctttagtgca 39499244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 249
Target Start/End: Original strand, 22371199 - 22371249
Alignment:
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22371199 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 22371249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 30864538 - 30864438
Alignment:
Q  123 ttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 222  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  || || ||||| |||||||||||||||| |    
T  30864538 ttaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaatagggtaagggtgcgtacaatatacca--aatggtaagatcctttcccaaaccctgcgtatgcggaa 30864442  T
Q  223 gctt 226  Q
    ||||    
T  30864441 gctt 30864438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 243
Target Start/End: Original strand, 8575975 - 8576026
Alignment:
Q  192 ggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  8575975 ggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccaggttgcc 8576026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 39189599 - 39189556
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactga 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39189599 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 24059057 - 24059012
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24059057 atggtgggacccctttccggaccctgcgtatgtgggagctttagtg 24059012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017941
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgact-gaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtc--tcttgtgtaaaaa-acaaggtaaggctg 168  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| |   ||  | |||||| ||| |||||   ||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctgaaaacagccagcctcatataaaaagacatggtaaaattg 35017879  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  35017880 cctacaatacaccaa-aatggtgggacccctgccag-actctgcgtatgc-ggagctttagtgca 35017941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 27466306 - 27466262
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaag 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27466306 gtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 233
Target Start/End: Original strand, 31523304 - 31523352
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31523304 aatggtggaaccctttcccaaaccctgcatatgcgggagctttagtgca 31523352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39189555 - 39189503
Alignment:
Q  196 cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39189555 cccttcccggaccccgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttt 39189503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2003677 - 2003602
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 179  Q
    |||||||||||||  |||  ||||||||||||||| | |||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2003677 gactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaataca 2003602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852290
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||   |||| ||| |||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||| |||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaagttgt---catgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaaaaataggtaaagct 4852292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 183 - 248
Target Start/End: Original strand, 1289093 - 1289159
Alignment:
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc-tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||    
T  1289093 ataatggtgggaccccttcccggatcatgcatatgcgggagcttttagtgcaccggattgccctttt 1289159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3633762 - 3633712
Alignment:
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3633762 gaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcc 3633712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 157
Target Start/End: Original strand, 17472928 - 17473018
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaaca 157  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||   || ||||||||||  |||| | ||| | |||| || || ||||||||||||||    
T  17472928 gggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaaaaca 17473018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22363549 - 22363507
Alignment:
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22363549 gaccctttctcgaaccctgcgtacgcgggagctttagtgcatc 22363507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 98)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 18944623 - 18944805
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18944623 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 18944722  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc-tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  18944723 tgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 18944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 10668200 - 10668387
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcga-----ctgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggt 161  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10668200 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggt 10668299  T
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10668300 aaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 10668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 41319984 - 41319804
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41319984 gggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 41319885  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || ||||||  |||||||| |||||    
T  41319884 tgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgccctttta 41319804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20004270 - 20004088
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20004270 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggtaaggc 20004171  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20004170 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 20004088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395724
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttta 30395724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 27201627 - 27201808
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||    
T  27201627 gggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaaggc 27201726  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27201727 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgccctttt 27201808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23768499 - 23768325
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23768499 agggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 23768400  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  23768399 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggacaccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagcggattgc 23768325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 34725280 - 34725096
Alignment:
Q  61 actgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  34725280 actgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 34725183  T
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  34725182 taaggctgcgtacaatacacta--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttta 34725096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46248131 - 46247952
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  46248131 gggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 46248032  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  46248031 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttt 46247952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Original strand, 14617018 - 14617199
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  14617018 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaaggt 14617117  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  14617118 tgcgtacaatacacca--aatggtgggatcccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttaa 14617199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 45812713 - 45812536
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||| | ||||||||    
T  45812713 gggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaagagggtaaggc 45812616  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45812615 tgcatacaatacacca--aatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttt 45812536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 46991784 - 46991958
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46991784 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 46991883  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    || ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46991884 tgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcc 46991958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32632734 - 32632571
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  32632734 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggc 32632636  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32632635 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgca 32632571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 27474261 - 27474440
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || || ||    
T  27474261 gggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgt-aaaaacagggcaaagc 27474359  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  27474360 tgcgtacaatacac--tgaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttta 27474440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 69 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741964
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctgg-aaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggc 166  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || || ||| ||||||||| |||| ||||||| || ||||||||    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtt 18741964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 248
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925259
Alignment:
Q  83 actggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
      ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgagttgccttttt 6925259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Original strand, 35005141 - 35005286
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35005141 gactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccg 35005240  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  35005241 gaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttttaa 35005286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 47214491 - 47214653
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||     
T  47214491 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgttt--aaaacagggtaaggt 47214588  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  47214589 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgca 47214653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38478458 - 38478281
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  38478458 gggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 38478361  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  38478360 tgcgtacaatacacca--aatggtggaaccccttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 38478281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 19932930 - 19932757
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||  || |||||||||||||| ||||||||    
T  19932930 gggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaaggc 19932834  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| | |||||||    
T  19932833 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaagatcattagtgcaccaggttgcc 19932757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939625
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaa-gttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||||| ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttttaa 9939625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 68 - 252
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414600
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||  || | |||||||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgtaaaa--caggttaaggct 19414517  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaaca 252  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19414518 gcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttaaca 19414600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117774
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgt-atgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  35117827 atgatgggaccccttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccggg 35117774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 8197023 - 8197202
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8197023 gggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggc 8197122  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    | |||||| |||||||  |||||| |||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8197123 tacgtacagtacacca--aatggtaggaccccttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgccctttt 8197202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724565
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 18724607  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||  ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  18724606 atcttgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagcttt 18724565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701715
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacaccaa-aa 19701668  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19701669 tggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 19701715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126851
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 12126913  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12126912 gtacaatacacca--aattgtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgca 12126851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435800
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | |||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  2435859 caatacaccaa-aatggtgggacccctttccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgca 2435800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470361
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-a 17470407  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || ||||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  17470406 atagtgggacccgttcctga--cctgcgtatgtgggagctttagtgca 17470361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402250
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggt--aagg- 165  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||      
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggttcaagtt 45402174  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45402175 ctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 45402250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacca--aa 25468324  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25468323 tggttggacctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983809
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||      
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacacca-- 6983874  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| || |||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  6983873 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgccctttta 6983809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 22930245 - 22930104
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||     
T  22930245 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggtaaggt 22930147  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgc 212  Q
    || | |||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||    
T  22930146 tgtg-acaatacacca--aatggtgggaccccttcctggaccctgc 22930104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511152
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg--tacaatacacca 182  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacca 15511212  T
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||    
T  15511211 a-aatggtggtaccccttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccgggctgcc 15511152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 243
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349792
Alignment:
Q  148 gtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 4349792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 35253325 - 35253186
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35253325 gactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccg 35253230  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  35253229 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 35253186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485129
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aa 44485170  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  44485169 tggttggaccccttcccggatcctacgtatgcgggagcttt 44485129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 11596512 - 11596650
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||      
T  11596512 ggtaaagtggctgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtataatacaccaa-- 11596608  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11596609 atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 11596650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 248
Target Start/End: Original strand, 22327101 - 22327255
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  22327101 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcaccaa-aatg 22327199  T
Q  189 gtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||     ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  22327200 gtggg----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgccttttt 22327255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 4430197 - 4430088
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4430197 cttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 4430098  T
Q  174 aatacaccaa 183  Q
    ||||||||||    
T  4430097 aatacaccaa 4430088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812084
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgt 171  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |  | | |||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  172 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50812025 acaatacaccaa-aatggtgg-accccttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgca 50812084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 198
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223093
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtac 33223069  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  33223070 aatacaccaa-aatggtgggacccc 33223093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214962
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    |||||||| |||||| | |||| |||||||  | ||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattccaa-aa 39215019  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  39215018 tggtgggtccccttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccgggctgcc 39214962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 22324926 - 22325037
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  22324926 ggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtggagccccgtcccg-accctgcgtatgcg 22325023  T
Q  220 ggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||    
T  22325024 ggagctttagtgca 22325037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382213
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcatatgcgggagcttt 31382234  T
Q  228 agtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    | || | ||||||||| ||||    
T  31382233 actgtaccgggttgccctttt 31382213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304206
Alignment:
Q  151 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgccctttt 42304206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45264537 - 45264413
Alignment:
Q  108 tgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaac 207  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||    
T  45264537 tgaaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacaccaa-aatggtgggaccccttctcagac 45264439  T
Q  208 cctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45264438 cctgcatatgcgggagctttagtgca 45264413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 223
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036355
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaa-aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||| | | | ||||||  ||||| ||||||||||     
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacca- 20036316  T
Q  184 taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20036317 -aatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796624
Alignment:
Q  129 cctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta 23796604  T
Q  229 gtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| |||| |||| ||||    
T  23796605 gtgcaccgggctgccctttt 23796624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 248
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019388
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| || || |||||||| |||||  ||||||| |||||| ||   ||||||||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  35019316 caatacaccaat--tggtgggacccc-tcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggctgccatttt 35019388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 143 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999848
Alignment:
Q  143 cttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacacca--aatgatggggccccttccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctgc 20999855  T
Q  243 cttttta 249  Q
    | |||||    
T  20999854 cctttta 20999848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Original strand, 25290140 - 25290286
Alignment:
Q  64 gaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaaca--gtctcttgtgtaaaaaacaaggt 161  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||    
T  25290140 gaagggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 25290239  T
Q  162 aaggc-----tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttccc 203  Q
    |||||     || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  25290240 aaggcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccccttccc 25290286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1517416 - 1517310
Alignment:
Q  141 ctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggt 239  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1517416 ctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggt 1517319  T
Q  240 tgccttttt 248  Q
    |||| ||||    
T  1517318 tgccctttt 1517310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 68 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335305
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||| | |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||   ||| || |||| |||||||||||||    
T  18335365 gcgtacaatacatca--aatgatgggaccctttcctagaccatgtgtatacgggagctttagt 18335305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606562
Alignment:
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 50606562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Original strand, 15505636 - 15505702
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15505636 ggtaagactgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 15505702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10378828 - 10378739
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10378828 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcc 10378739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442396
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 86 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760287
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaat 50760287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Original strand, 24564324 - 24564440
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| || || |||||||||  || || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  24564324 gggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggg 24564423  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||||||||| ||||||    
T  24564424 tgcgtacaattcaccaa 24564440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136696
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | || || |||| ||   ||| |||| |||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacaccaa-a 27136713  T
Q  186 atggtgggaccccttcc 202  Q
    |||||||||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccccttcc 27136696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768298
Alignment:
Q  153 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacaccaat--tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgccctttt 43768298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 135
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006192
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaa 135  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagtactggaa 21006192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 142
Target Start/End: Original strand, 34714603 - 34714678
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtct 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||    
T  34714603 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtct 34714678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910368
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||  || |||||||| |||| | ||| |||||||||||| |     
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacctaa 52910315  T
Q  184 ---taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
       | ||||||||||||||||| | | ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  52910316 tggttatggtgggaccccttcctggaacctccgtatgtgggaactttagtgca 52910368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 73 - 248
Target Start/End: Original strand, 43207476 - 43207655
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaagg------tcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||      ||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  43207476 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggacacactcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagac 43207574  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  43207575 ggcatacaatacaccaa-attggtgggacctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtgcattggtttgccatttt 43207655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 127 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20169207 - 20169109
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20169207 gtcctgaaaacaccctcttgtgtaaaaaaaaaggtaagactgtgtacaataccccaat--cggtgggactccttcccggaccctgcatatgcgggagctt 20169110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 105 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 31272514 - 31272397
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| ||  |||||||||      | |||    
T  31272514 gactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtacagcacatca--aatggtggg------ttccg 31272424  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  31272423 gaccctgcgtatgcgggagctttagtg 31272397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 19656220 - 19656103
Alignment:
Q  131 tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||| |||||| |||  | ||||||| |||||  |||||||| |    
T  19656220 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacaccaa-aatggtaggaccctttcttggaccctgcatatgcaagagctttaat 19656122  T
Q  231 gcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||| |||| |||| |||||    
T  19656121 gcaccgggctgccctttta 19656103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Original strand, 23371142 - 23371271
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||||  || |||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||| |    
T  23371142 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacacca--aatgctgggaccccttccag 23371238  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
     |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  23371239 -accctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4587625 - 4587568
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4587625 aatggtgggaccccttcccggaccctgcctatgcgggagcttcagtgcaccgggttgc 4587568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19974214 - 19974071
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||  |||||||||  | || |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  19974214 gactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgtaaaaat-agggcaaggttgcgtacaatacaccaa-aatgatgggacccattcccg 19974117  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
     || ||  |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  19974116 gactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttttaa 19974071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Original strand, 6358193 - 6358264
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6358193 ggtaaagctgcgtacaaaacaccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcaggatctttagtg 6358264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 151
Target Start/End: Original strand, 22151496 - 22151568
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaa 151  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||    
T  22151496 cgcaactgataaagttgttgtcatctgactgtaaggtcataggttcaagttctggaaacagcctcttatgtaa 22151568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 131
Target Start/End: Original strand, 40424722 - 40424786
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcct 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||    
T  40424722 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14988084 - 14987989
Alignment:
Q  80 gcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaa 175  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  || |||| | ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  14988084 gcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249457
Alignment:
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgca 4249457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249781
Alignment:
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgca 4249781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250105
Alignment:
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaa--atggtgggatcccttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgca 4250105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18336024 - 18335914
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||| | ||| |||| ||| ||| | ||| |||| |||| |||| ||||||||    
T  18336024 gggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaaggc 18335925  T
Q  167 tgcgtacaata 177  Q
    |||||||||||    
T  18335924 tgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21910735 - 21910673
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21910735 ggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctacgt-tgcgggagc 21910673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33594191 - 33594145
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33594191 tggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 33594145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 34149076 - 34148969
Alignment:
Q  129 cctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||  ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||  ||    
T  34149076 cctggaaacagcctcttgtgtagaaaatagggtaaggttgcgtacaaaagacca--aatggtgagaccccttcctggaccctgcatatgcaggagcgcta 34148979  T
Q  229 gtgcatcggg 238  Q
    ||||| ||||    
T  34148978 gtgcaacggg 34148969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435983
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa 155  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 30555211 - 30555264
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30555211 aatggtgggaccccttcacggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 30555264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25554796 - 25554756
Alignment:
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25554796 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcattagtgca 25554756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Original strand, 30682855 - 30682950
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||  || ||||| |||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30682855 tcctgaaaatagcctcttgtgtaaaaa-caaggtaagattgtgtaca-tacaacaa--atggtgggaccccttcccggaccgtgcgtatgcgggagcttt 30682950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34679378 - 34679219
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||  ||| | |||  | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||  |    
T  34679378 ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatca--a 34679281  T
Q  186 atggtgg-gaccccttcccgaac---cctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||| | ||| |||| || |   ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  34679280 atggtggagccccgttccagacccggcctgcgtatgcgggagctttagtacaccgggctgcc 34679219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4430080 - 4430014
Alignment:
Q  164 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgc 232  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  4430080 ggctgcgtacaatacaccaa--atggtggaacccctttctggatcctgtgtatgcgggagctttagtgc 4430014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 233
Target Start/End: Original strand, 7074585 - 7074661
Alignment:
Q  156 caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |   ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7074585 caaggtatggctgcgtacaatacaccaa-aattgtgggacctctttctagaccctgcatatccgggagctttagtgca 7074661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Original strand, 21723644 - 21723727
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaa 151  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| | | | || |||||||||||||| |||||||||||    
T  21723644 gggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaag-ttcagtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50760287 - 50760239
Alignment:
Q  200 tcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  50760287 tcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccgggctgccctttt 50760239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20982845 - 20982773
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||    
T  20982845 aaaaaatagggtaaggctgccaacaatacacc--taatggtgggatctcttctcggaccctgcgtatgcgggagc 20982773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 230
Target Start/End: Original strand, 5549580 - 5549661
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-aataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| | | || |||| ||||| |||||||||||    
T  5549580 aaaaaacagggtaaagctgcgcacaatacaccaaaaaatgatgggacccctttctggactctgcctatgcaggagctttagt 5549661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 174
Target Start/End: Original strand, 25027989 - 25028030
Alignment:
Q  133 gaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 174  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25027989 gaaacagcctcttgtgtaaaaaacgaggtaaggctgcataca 25028030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25554882 - 25554817
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgta 150  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||   ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25554882 tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44745900 - 44745854
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaat 176  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  44745900 tcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggtaaagctgcgtacaat 44745854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 195
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859173
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggac 195  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtgggac 46859173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 129; Significance: 3e-66; HSPs: 81)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 61 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40272996 - 40272811
Alignment:
Q  61 actgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg 160  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  40272996 actgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 40272897  T
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40272896 taaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 40272811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13628971 - 13628788
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaa-gttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  13628971 gggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggtaagg 13628872  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13628871 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 13628788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 46421215 - 46421033
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46421215 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 46421116  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-agtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||    
T  46421115 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgccctttt 46421033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13730782 - 13730601
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13730782 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 13730683  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13730682 tgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13730601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 29366900 - 29366718
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29366900 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaaggc 29366801  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  29366800 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgccctttta 29366718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8247867 - 8247706
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  8247867 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 8247768  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8247767 tgcgtacaatacaccaataatggtgggactccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttta 8247706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 9607182 - 9607345
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  9607182 gggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggc 9607281  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  9607282 tgcgtagaatacaccaataatgttgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagt 9607345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Original strand, 26869698 - 26869864
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26869698 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 26869796  T
Q  179 accaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  26869797 acca--aatggtgggaccccttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctttt 26869864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 1217069 - 1217246
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  1217069 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 1217166  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1217167 tgcgtacaatacacca--aatggcgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1217246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12914213 - 12914033
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12914213 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 12914114  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
     |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  12914113 ggcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgccctttta 12914033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 39203490 - 39203667
Alignment:
Q  62 ctgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggt 161  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  |||||| |||    
T  39203490 ctgaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggt 39203587  T
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39203588 aaggttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 39203667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 68 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122921
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggct 22122995  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  22122994 gcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgcc 22122921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6411999 - 6411836
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  6411999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggc 6411901  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6411900 tgcgtacaatacacca--aatgatgggaccccttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgca 6411836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5173899 - 5173718
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaa-gttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||    
T  5173899 gggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaa-caaagtaagg 5173801  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
     ||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5173800 ttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccccttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 5173718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420657
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacaccaa-aa 34420704  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  34420703 tggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgca 34420657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 22609746 - 22609918
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  22609746 gggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggc 22609843  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22609844 tgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcc 22609918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Original strand, 26573113 - 26573270
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26573113 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgta 26573211  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26573212 caatacaccaat--tggtgggaccccatcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgca 26573270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 52926388 - 52926218
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||         |||||||    
T  52926388 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaaggc 52926298  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  52926297 tgcgtacaatacaccaa--atggtgggacaccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctttt 52926218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516570
Alignment:
Q  96 ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-aataatggtggga 194  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  195 ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  516517 ccccttccccgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 516570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 120 - 240
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987109
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccattcccggaccttgcatatgcg 14987088  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  14987089 ggagctttagtgcaccgggtt 14987109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Original strand, 16735420 - 16735599
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||   ||||||| ||||||||    
T  16735420 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaaggc 16735518  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| |||||    
T  16735519 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgccctttta 16735599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484849
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 54484827  T
Q  227 tagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  54484828 tagtgcaccgggttgccctttt 54484849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013472
Alignment:
Q  131 tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatacgcgggagctttagt 49013490  T
Q  231 gcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  49013489 gcaccgggttgccctttt 49013472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10795550 - 10795427
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  10795550 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcg 10795451  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||| |||||| | |||||||    
T  10795450 ggagcttcagtgcaccaggttgcc 10795427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45786327 - 45786218
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  45786327 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgca 45786228  T
Q  234 tcgggttgcc 243  Q
     |||||||||    
T  45786227 ccgggttgcc 45786218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25517348 - 25517168
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagt--cctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggc 166  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | | |   ||||||||||  ||||||||||||||| |||| || |||    
T  25517348 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagatatggc 25517249  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25517248 tgcgtacaatacacaaa--atggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgccctttta 25517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 7697063 - 7696899
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  7697063 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 7696966  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||||||  |||||     |||||||||| || |||| |||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  7696965 tgcgtacaatacacca--aatgg-----ccccttcccggacactgcatatgtgggagctctagtgcaccgggtt 7696899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 229
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944609
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| ||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacaccaa-aa 25944566  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  25944567 tggtgggaccccttccctgaccctgcgtatgtgggagctttag 25944609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996564
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacaccaa-a 53996627  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  53996626 atggtgggaccccttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 53996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353353
Alignment:
Q  146 gtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 353353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 54374486 - 54374362
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  54374486 gactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccaccaa-aatggtgggaccccttcccg 54374388  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
     ||||||| |||||||||||||||||    
T  54374387 gaccctgcatatgcgggagctttagt 54374362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30928302 - 30928167
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatgg 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||  |||    
T  30928302 aagttcttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaat--tgg 30928205  T
Q  190 tgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
     |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  30928204 cgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 30928167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4495842 - 4495675
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||||||    
T  4495842 gggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaaggc 4495743  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||            |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4495742 tgcgtacaatacacca--aatggtggg------------accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 4495675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 231
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926224
Alignment:
Q  99 tcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc-ataatggtgggacccc 33926191  T
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  33926192 ttcctggaccctgcatatgcgagagctttagtg 33926224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 91 - 248
Target Start/End: Original strand, 7942993 - 7943148
Alignment:
Q  91 agttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggt 190  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||  | || |||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||  ||||||    
T  7942993 agttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatca--aatggt 7943090  T
Q  191 gggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7943091 gggatccctttccagaccatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgccttttt 7943148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403554
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||| |||||| | | || |||||||| ||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||| |    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaataccacaa-a 44403617  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  44403616 atggtgggaccccttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccgggctgccttttt 44403554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 73 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45949012 - 45948852
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaa---aggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   ||||||  |||| || |||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45949012 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgc 45948914  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45948913 atacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 45948852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10870129 - 10870025
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  10870129 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggc 10870031  T
Q  167 tgcgta 172  Q
    ||||||    
T  10870030 tgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 243
Target Start/End: Original strand, 31592881 - 31593000
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  31592881 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggactccttcccggaccctgcatatgcg 31592976  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| ||||||| |||||||||    
T  31592977 ggagctctagtgcaccgggttgcc 31593000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 226
Target Start/End: Original strand, 12525389 - 12525543
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  12525389 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgt---catatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggc 12525485  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    ||||   | |||||||| ||||||||||| ||||||   |||||| |||| |||||||||    
T  12525486 tgcg--aagtacaccaaaaatggtgggacaccttcctagaccctgtgtatacgggagctt 12525543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731155
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||| ||||||||| | || ||||||||||  | |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     ||||||||||| |||||  || ||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  19731098 ttggtgggaccctttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccgggctgcc 19731155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 247
Target Start/End: Original strand, 55401198 - 55401334
Alignment:
Q  110 aaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccc 209  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||     
T  55401198 aaaggccatcggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacaccaa-aatggtgggaccccttctcggacct 55401296  T
Q  210 tgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttt 247  Q
    | ||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||    
T  55401297 tccgtatgcgggagcttttttgcaccgggctgcctttt 55401334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905084
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaa-aacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||     
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
     |   |||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28905041 ta---tgggaccctttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtg 28905084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139497
Alignment:
Q  99 tcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggacccc 45139525  T
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  45139524 ttccc-agacctgcgtatgcgggaacttt 45139497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45621000 - 45620889
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaa-aaaacaaggtaaggctgcgt 171  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  45621000 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgt 45620902  T
Q  172 acaatacaccaat 184  Q
    |||||||||||||    
T  45620901 acaatacaccaat 45620889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Original strand, 15797284 - 15797378
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  15797284 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 15797378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 183
Target Start/End: Original strand, 26782344 - 26782461
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| |    
T  26782344 agggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatg 26782443  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||  || ||||||||||    
T  26782444 ctgtataaaatacaccaa 26782461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771363
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgccctttt 34771363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 829547 - 829456
Alignment:
Q  141 ctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| |||| ||||  |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  829547 ctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 829456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 228
Target Start/End: Original strand, 9276317 - 9276401
Alignment:
Q  141 ctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9276317 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggt-ggaccctttcccggaccctgcgtatgcgggaacttta 9276401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 125 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 43114990 - 43114869
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaagg-ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 222  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || | |||||||||||||  |||||||||||| | |  || ||||||||||||||||    
T  43114990 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaa--atggtgggacccttcctggacccctgcgtatgcggga 43114893  T
Q  223 gctttagtgcatcgggttgccttt 246  Q
    |||||||||||| || ||||||||    
T  43114892 gctttagtgcattggattgccttt 43114869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032569
Alignment:
Q  99 tcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||         
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtggg----- 54032613  T
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
           |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  54032612 -------accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 54032569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11461809 - 11461653
Alignment:
Q  77 gacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaa---aaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||| | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||   ||||||||| |||  ||| |||    
T  11461809 gacgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaaaaaaacaaggaaagattgcatac 11461710  T
Q  174 aatacacca--ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||| |  | |||||||| |||  |||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  11461709 aatacactagtaaaatggtggaaccttttcccggactctgcgtatgtgggagcttta 11461653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 19751615 - 19751731
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||  ||  || ||||||  ||||    
T  19751615 aagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--tattggtgggaccctttcccagactttgtgtatgcatgagc 19751712  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||| |||| ||||    
T  19751713 tttagtgcaccgggctgcc 19751731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235684
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgac-tgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctg 168  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||| || || || ||| || ||||||||||||||| || |||||| |||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     ||||||||||| ||  ||||||||||||||  | || || | ||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  33235613 tgtacaatacactaa--atggtgggacccctcgcaga-ccttacgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcc 33235684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Original strand, 47624088 - 47624167
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtat 216  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47624088 aaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgtgtat 47624167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428539
Alignment:
Q  107 ctgaaaggtcataggtttaagtc-ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa 52428539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24851363 - 24851300
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24851363 aatggtgggaccccttcccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 24851300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50625072 - 50624952
Alignment:
Q  126 agtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| | |||||||  ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| |  ||||||||| | |||||||    
T  50625072 agtcctagaaacagcctcttgtgtataaaaaagggtaaggtagcgtacaatacaccatt--tggtgggacgccttcctgggccctgcgtaagtgggagct 50624975  T
Q  226 ttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| |||| |||| ||||    
T  50624974 ttagtgcaccgggctgccctttt 50624952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 187 - 249
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452954
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  30452892 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttta 30452954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10484671 - 10484614
Alignment:
Q  192 ggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10484671 ggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttta 10484614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 179
Target Start/End: Original strand, 39211992 - 39212081
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 179  Q
    ||||||| || ||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39211992 aagttgtcgttatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 180
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtg-taaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |  |||| || | |||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||    
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  166 ctgcgtacaatacac 180  Q
    |||||||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904870
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga-ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  | | | ||| ||||||||||    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacca--aatggtgggacccccttcccagatcttacgtgtgcgggagct 31904878  T
Q  226 ttagtgca 233  Q
    ||||||||    
T  31904877 ttagtgca 31904870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta 162  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410887
Alignment:
Q  94 tgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggg 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||| | ||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  | |||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacacca--actggtggg 8410921  T
Q  194 accccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||| |||| |  ||||||| || |||| ||||||    
T  8410920 acctcttctcagaccctgcataggcggaagcttt 8410887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 249
Target Start/End: Original strand, 26292394 - 26292490
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg-ccttttta 249  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||    
T  26292394 aaaacagggtaagaccgcgtacgatacaccaa--atgatgggatcccttcccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcaccgggttgtccttttta 26292490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1121363 - 1121254
Alignment:
Q  107 ctgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaa 206  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||   |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||| |  |    
T  1121363 ctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaa-aatggcgggagcctttctcaga 1121265  T
Q  207 ccctgcgtatg 217  Q
    |||||||||||    
T  1121264 ccctgcgtatg 1121254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 225
Target Start/End: Original strand, 32418221 - 32418359
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||||||||| | ||||||  |||||   |||||| || | |||| |||| ||||||| || || ||    
T  32418221 gtaaagttgttgtcaagtgactgaaatgtcattagtttaagtcatagaaacaacctcttacataaaaatcaggataagactgcatacaataaacaaaaaa 32418320  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  32418321 tggtgggacttcttctcgaactctacgtatgcgggagct 32418359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 40390353 - 40390399
Alignment:
Q  202 ccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40390353 ccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 40390399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 199 - 248
Target Start/End: Original strand, 47624208 - 47624257
Alignment:
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47624208 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 47624257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266376
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14266431 tggtgggaccc-ttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcc 14266376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672837
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggac-cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||  | | | ||| ||||||||||    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacacca--aatggtgggactctcttcccatatcttacgtgtgcgggagct 31672829  T
Q  226 ttagtgca 233  Q
    ||||||||    
T  31672830 ttagtgca 31672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 157
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35417985
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaaca 157  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||   ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 35417985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 35417999 - 35418057
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  35417999 aatggtgggaccccttcccggaccccgcaaatgcgagagctttagtgcatcgggctgcc 35418057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 154
Target Start/End: Original strand, 9627712 - 9627781
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa 154  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||||||||  || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  9627712 tggtaacgttggtgtcacgtgactgaaagggtatgggtttaagtcctagaaacagactcttgtgtaaaaa 9627781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8325095 - 8325011
Alignment:
Q  151 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| || |||  ||| ||   |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  8325095 aaaatcaaggtgaggctgcgtacaatacactaaaaataatggaactttttcccgaaccttgcgtatgcgagaactttagtgcatc 8325011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46170029 - 46169979
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  46170029 aatggtaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttcagtgcatc 46169979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 243
Target Start/End: Original strand, 16130329 - 16130429
Alignment:
Q  142 tcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    |||| |||||||| || | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||   ||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| ||    
T  16130329 tcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacaccaa-aatggtgggaccctgtcctagaccttgcgtacacaggagctttagtgcattgggctg 16130427  T
Q  242 cc 243  Q
    ||    
T  16130428 cc 16130429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 23871417 - 23871454
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatg 103  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23871417 agggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatg 23871454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Original strand, 40968613 - 40968678
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  40968613 aatggtgagaccccttcctagaccctacatatgcgggagctttagtgcatcgagctgcccttttaa 40968678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 80)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 43557429 - 43557611
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  43557429 gggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaaggc 43557528  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc-tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  43557529 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 43557611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 42798626 - 42798805
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42798626 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 42798725  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  42798726 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgccctttt 42798805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 42805481 - 42805662
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  42805481 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 42805580  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42805581 tgtgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 42805662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22699148 - 22698974
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  22699148 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 22699049  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  22699048 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 22698974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 47716416 - 47716592
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47716416 gggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 47716515  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  47716516 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgcc 47716592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2541198 - 2541026
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactg-aaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  2541198 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagg 2541099  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2541098 ctgcgtactatacacca--aatggtgggaccccttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 2541026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 32758218 - 32758395
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  32758218 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 32758315  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  32758316 tgtgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 32758395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21172185 - 21172006
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  21172185 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 21172088  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  21172087 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttaa 21172006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11617754 - 11617592
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11617754 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 11617655  T
Q  179 accaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  11617654 acca--aatggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgcc 11617592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 218
Target Start/End: Original strand, 46354151 - 46354302
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  46354151 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 46354250  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  46354251 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgc 46354302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 48735299 - 48735126
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcc-tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||| ||||||||  |||||||||  |||||| |||||||    
T  48735299 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgt--aaaacacggtaagg 48735202  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48735201 ctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 48735126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34626385 - 34626207
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || || || ||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||    
T  34626385 gggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaa-cagggtaaggc 34626287  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34626286 tgcgttcaatacaccaa--atggtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgccctttt 34626207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47078031 - 47077854
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||| |     
T  47078031 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaataga--gtaaagt 47077934  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  47077933 tgcgtacaatacac--aaaatggtgggaccccttcccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccggattgccttttt 47077854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 248
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879774
Alignment:
Q  111 aaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccct 210  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccct 7879736  T
Q  211 gcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7879737 gcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctttt 7879774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693077
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaagagggtaaggctgcg 10693148  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  10693147 tacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcc 10693077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732835
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactccttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgca 14732835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 248
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629770
Alignment:
Q  72 accttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgt 171  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  172 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27629696 aaaatacacca--aatggtgggaccccttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgccctttt 27629770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 70 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 35334989 - 35334823
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||     
T  35334989 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc--gtgtaaaaaacagggtaagactgt 35334892  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35334891 gtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtt 35334823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 70 - 250
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464014
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgc 40463935  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  40463936 gtataatacacca--aatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttttaa 40464014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19427055 - 19426889
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19427055 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatac 19426956  T
Q  179 accaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||  |||||||||| |||||| || ||||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  19426955 acca--aatggtggga-cccttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgccctttt 19426889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 92 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 42391251 - 42391099
Alignment:
Q  92 gttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtg 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  42391251 gttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtg 42391156  T
Q  192 ggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42391155 ggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 42391099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 84 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871910
Alignment:
Q  84 ctggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||     
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacca- 33871973  T
Q  184 taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttt 247  Q
     |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  33871972 -aatggtgggaccccttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgcctttt 33871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419678
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  23419746 caatacacca--aatggtgggaccccttcctagaccttgcgtgtgcgggggctttagtgcatcgggctgcc 23419678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5180335 - 5180169
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || | |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |    
T  5180335 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaagac 5180236  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || |||||| ||||||| |||| | ||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  5180235 tgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctttccaaatcctacgtatgcaggagctttaatgca 5180169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14099068  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14099067 atggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 86 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacca--a 14409085  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14409084 atggtgggaccccttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 42476825 - 42477002
Alignment:
Q  62 ctgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggt 161  Q
    |||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  | || |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42476825 ctgaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggt 42476922  T
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    | |||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  42476923 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcctaggctctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 42477002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 226
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266564
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||||| ||| || | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19266523  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19266524 attgtgggatcccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 19266564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Original strand, 29907393 - 29907549
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgt--catgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  29907393 ggtaaagttgttgtatcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacaccaa 29907492  T
Q  184 taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29907493 -aatggtgggaccccatcccggaccct--gtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 29907549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38262336 - 38262195
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  38262336 gactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacaccaa--atgatgggaccccttcccg 38262239  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  38262238 aacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgccctttt 38262195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362165
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||    
T  28362217 caatacacca--aatggtgggaccccttcccagaccttgcatatgtgggagcttt 28362165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 73 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469190
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa--caaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||| || ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgc 232  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccccttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgc 3469190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 96 - 243
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747618
Alignment:
Q  96 ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga 194  Q
    |||||| | |||||||||||||  || | ||||| ||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacaccaat--tggtggga 18747569  T
Q  195 ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18747570 ccccttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggctgcc 18747618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 233
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124016
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta----aggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | ||  |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||    |||||||||| |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgtaaaaa-cagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgca 39124016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566572
Alignment:
Q  114 gtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcg 213  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||     
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacaccaa-aatggtaggaccccttcccgaaccctgca 21566537  T
Q  214 tatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  21566538 tatgcgggagctttagtgcaccgggctaccttttt 21566572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Original strand, 1408472 - 1408593
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |    
T  1408472 aagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcagaatc 1408569  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| || ||| ||||||||||    
T  1408570 tttagttcaccggattgccttttt 1408593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 61 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28078315 - 28078151
Alignment:
Q  61 actgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg 160  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||    
T  28078315 actgaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgt-aaaaaaacaggg 28078217  T
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  28078216 taaggttgcatgcaatacacca--aatggtgggaccccttcccgaatcctgcatatgcgagagcttta 28078151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 228
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203557
Alignment:
Q  108 tgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaac 207  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtgggatcccttcctgaac 35203536  T
Q  208 cctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
     || |||||||||||||||||    
T  35203537 tctacgtatgcgggagcttta 35203557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2663109 - 2662958
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| | ||||||||    
T  2663109 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaaggc 2663014  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||    
T  2663013 tgcgtacaatacacca--aatggtgggacccttttcag-accctgcatatgcgggagct 2662958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 85 - 222
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645066
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||| ||||||| | | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||     
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaa- 7645029  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggga 222  Q
    ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7645030 aattgtgggaccccttcctg-accctgcgtatgcggga 7645066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 243
Target Start/End: Original strand, 11741774 - 11741924
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||  ||| ||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  11741774 aaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatg 11741869  T
Q  189 gtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| ||||||||| |  ||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11741870 gtgggatcccttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 11741924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 23231573 - 23231678
Alignment:
Q  126 agtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23231573 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagct 23231670  T
Q  226 ttagtgca 233  Q
    ||||||||    
T  23231671 ttagtgca 23231678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 13805077 - 13805216
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||| || |||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||      
T  13805077 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggtaaggctgtgtacaatacacca-- 13805173  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13805174 aatggtgggaccacttcctggaccctgcgtatgcgggagcttt 13805216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 109 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512457
Alignment:
Q  109 gaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaacc 208  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaat-agggtaaggctgcgtacaatacaccga--atggtgggaccccttcccggacc 18512492  T
Q  209 ctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  18512491 ctgcgtatgcgggagctttggtgcactgggttgcc 18512457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265949
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||| |||| |||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||  |    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacca--a 19265887  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19265888 atggtgggaccccttcccgga-cctacatatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 19265949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123508
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||    
T  48123556 caatacacca--aatggtgggacccctttctggaccatgcatatgcgggag 48123508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 183
Target Start/End: Original strand, 12473261 - 12473377
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||| |||||||     
T  12473261 gggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaagga 12473360  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||    
T  12473361 tgcgtacaatacaccaa 12473377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 228
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604642
Alignment:
Q  129 cctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgagacccctttccggaccctgcgtatgcgggagcttta 38604642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 70 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423967
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  | || || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  170 gtacaatacaccaataatg 188  Q
     |||| |||||||||||||    
T  1423985 atacactacaccaataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||  ||||||||| ||| | || |    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtactctaa-a 42101946  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgc 232  Q
     ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42101945 gtggtgggaccctttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341410
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||| |||||    ||||||||||  |||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacaccaa-a 16341352  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||| || ||||||| |||   | |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16341353 atggtgggccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccgggctgcc 16341410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 107 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591107
Alignment:
Q  107 ctgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaa 206  Q
    |||||||||||   ||| ||||||||||||||  ||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |    
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaacaga--gtaaggctgcgtacaatacaataa--atggtgggaccccttcccgga 31591150  T
Q  207 ccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  31591149 ccttgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttta 31591107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32233274 - 32233134
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||| | |||||||  ||||||||||  |||||||     
T  32233274 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggcagcgtatattacacca--aatggtgggattccttccca 32233178  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  32233177 aaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgccctttt 32233134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27889399 - 27889315
Alignment:
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||    
T  27889399 aaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgccctttt 27889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35787378 - 35787267
Alignment:
Q  135 aacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcat 234  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  35787378 aacagcctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggcgggaccccttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcac 35787282  T
Q  235 cgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||| |||||    
T  35787281 cgggttgccctttta 35787267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 42496013 - 42495926
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa 154  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  42496013 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaa 42495926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8149124 - 8148958
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtg-taaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||   ||| |||||||| ||||   |||||||| ||||||| | |||||||    
T  8149124 gggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaagg 8149025  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
     ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| |||||||||||    
T  8149024 ttgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttccc-agacttgcgtatgcgagagttttagtgcatc 8148958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 242
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198856
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtt---taagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggta 162  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || |    ||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  163 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    || | ||||| ||| ||| |  |||||| ||| ||||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  25198779 agaccgcgtataatgcacta--aatggtaggatcccttcccagacccttcgtatgtgagagctttagtgcaccgggttgc 25198856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 18326991 - 18327091
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18326991 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggc 18327089  T
Q  167 tg 168  Q
    ||    
T  18327090 tg 18327091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 168
Target Start/End: Original strand, 7193042 - 7193143
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||| ||||||  |||||||||||| || | ||||||||    
T  7193042 gggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaacaatatggtaaggc 7193141  T
Q  167 tg 168  Q
    ||    
T  7193142 tg 7193143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736962
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||  ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaa 6736962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 45019010 - 45018927
Alignment:
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataa--tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  45019010 aaggctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 45018927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 232
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500635
Alignment:
Q  153 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgc 232  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggatcttcagtgc 33500635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794596
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa 155  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaa 7794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15108516 - 15108427
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatg 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||| |||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  15108516 aagtcctggaaacagtttcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatca--aatagtgggatcccttcccaaaccctgtgtatg 15108427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792164
Alignment:
Q  146 gtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacaccca-aatggcgggaccccttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgca 13792164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29140539 - 29140438
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  || ||||  || ||||| ||||||  |||||||| |||||||||    
T  29140539 agggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacacattcaagttttgaaaacaatctcttaggtaaaaaataaggtaagg 29140440  T
Q  166 ct 167  Q
    ||    
T  29140439 ct 29140438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123641
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca-at 184  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | |  |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgta-aaaacaaggtaaggttgcatgaaatacaccatat 44123682  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||   |||||||| ||| || || |||||||||| |||||||||    
T  44123681 aa---tgggacccgttctcggacactgcgtatgcaggagcttta 44123641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36267900 - 36267831
Alignment:
Q  163 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36267900 aggctgcgtacaatacaccaa--atggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgca 36267831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21139852 - 21139762
Alignment:
Q  140 tctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  21139852 tctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaa--atggtgggaccccttcccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgca 21139762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17048914 - 17048831
Alignment:
Q  147 tgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | ||| ||||  ||||||||||||    
T  17048914 tgtaaaaaacagggtaaggttacgtacaatacaccaa-aatggtggaaccccttcccggaacttgcttatgtaggagctttagtg 17048831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 243
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697570
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggt--gggaccccttcccga-accctgcgtatgcggg 221  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||||| ||  |||||||||| ||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctgtgt--aatacaccaa-aatggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcggg 27697548  T
Q  222 agctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||| | |||| |||| ||||    
T  27697549 agcttaaatgcaccgggatgcc 27697570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 248
Target Start/End: Original strand, 36602541 - 36602583
Alignment:
Q  206 accctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36602541 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 36602583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Original strand, 21447547 - 21447636
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaac 156  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  | || |||||||  | || ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  21447547 gggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23066029 - 23065923
Alignment:
Q  141 ctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| ||    
T  23066029 ctcttgtttaaaaaacaggataaagttgcgtacaatacacca--tatgatgggatccctttccgaatcctgcatatgtgggagctttggtgcaccggatt 23065932  T
Q  241 gccttttta 249  Q
    ||| |||||    
T  23065931 gccctttta 23065923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Original strand, 25434049 - 25434141
Alignment:
Q  140 tctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||  |||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25434049 tctcttgtgcaaaaaacatggtaagagtgcatacaacacaccaa-aatggtatgacttcttcttggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 25434141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 42495913 - 42495876
Alignment:
Q  196 cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42495913 cccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 42495876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 231
Target Start/End: Original strand, 22065563 - 22065706
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| |||||  ||| ||||  ||||||||  ||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||| | ||      
T  22065563 tggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaagtcatgagttcaagttttggaaacaacctcttgtgt-aaaaatagggtaaagctgcatacaataaagca-- 22065659  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||| ||| |||||||||||||||  || |||||| |||| |||||||    
T  22065660 aatagtgagaccccttcccgaactatgtgtatgcaggagttttagtg 22065706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23619039 - 23618976
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23619039 aatggtgggaccccttcgcagaccttgcgtttgcaggagctttagtgcagcgggttgccctttt 23618976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39093532 - 39093438
Alignment:
Q  153 aaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | | ||| ||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||    
T  39093532 aaacagggtaagactgtgtacaatacacca-taatagtgggaacccttcccggaacttgcatatgcagaagctttagtgcaccgggctgccctttt 39093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 54)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 74 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221913
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc-tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgccctttt 12221913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 62 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29356041 - 29355854
Alignment:
Q  62 ctgaagggtaaccttgacgcaactggtaaag-ttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg 160  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||    
T  29356041 ctgaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacaggg 29355942  T
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  29355941 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 29355854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1354933 - 1354754
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  1354933 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 1354836  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  1354835 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttttaa 1354754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 9161080 - 9161260
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||    
T  9161080 gggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagagtaaggc 9161178  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||    
T  9161179 tgcgtacaatacatcaataatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgccctttt 9161260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 1346921 - 1347098
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||| ||||||||    
T  1346921 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt--aaaacagggtaaggc 1347018  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  1347019 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 1347098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3815255 - 3815084
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| | |    
T  3815255 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacgac 3815156  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggtt 240  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3815155 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccctttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166409
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 2166409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178042
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 2178042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14975255 - 14975094
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||  | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||             
T  14975255 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaagg--------- 14975165  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  14975164 ---caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggttgcc 14975094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15866215 - 15866053
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| || |||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||    
T  15866215 gggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaaagc 15866116  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||  |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||    
T  15866115 tgcgt--aatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgca 15866053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 209
Target Start/End: Original strand, 6024198 - 6024332
Alignment:
Q  75 ttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtaca 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  | || || |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6024198 ttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaagactgcgtaca 6024297  T
Q  175 atacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccc 209  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  6024298 atacaccaataatgatgggacctcttcccggaccc 6024332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 178
Target Start/End: Original strand, 8409200 - 8409311
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8409200 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 8409299  T
Q  167 tgcgtacaatac 178  Q
    ||||||||||||    
T  8409300 tgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 20400625 - 20400788
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggct 167  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20400625 ggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 20400724  T
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| ||||| |  ||| | ||||||| || ||||||||| ||||||| | | ||||||||||    
T  20400725 gcgtacagtacacta--aatagcgggacccttttccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgca 20400788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 80 - 225
Target Start/End: Original strand, 14553482 - 14553626
Alignment:
Q  80 gcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||    
T  14553482 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataataca 14553580  T
Q  180 ccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    |||| | |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||    
T  14553581 ccaaaactggtgggaccccttcgtagaccctgtgtatgcgggagct 14553626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7947512 - 7947385
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||  |||| || |||||||||||  ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  7947512 gactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggcccccttcccg 7947414  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7947413 gaccttgcgtatgtgggagctttagtgca 7947385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23930303 - 23930125
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggttt-aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||||| | || ||||||||   |||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |     
T  23930303 ggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagata--gt 23930206  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  23930205 tgcgtacaatacaccag--atggtgggaccccttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgccctttta 23930125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 1941812 - 1941991
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||   | || ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1941812 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 1941911  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||| ||| | | | || ||||||||||| ||| ||||| || |||||| ||||    
T  1941912 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccatcctggatcttgtgtatgcgggagtttttgtgcaccgtgttgccctttt 1941991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 71 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13905152 - 13905011
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  || | |||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13905152 aaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgca 13905054  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtat 216  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13905053 tacaattcacca--aatggt-ggaccctttcccgaaccctgcgtat 13905011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 81 - 231
Target Start/End: Original strand, 24097552 - 24097696
Alignment:
Q  81 caactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||   ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    ||    
T  24097552 caactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----ac 24097647  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24097648 ca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtg 24097696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 229
Target Start/End: Original strand, 24734591 - 24734760
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt---------aaaaaacaa 158  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||  |||||||||         ||||||||     
T  24734591 ggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaaaacag 24734690  T
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  24734691 ggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgc-ggagctttag 24734760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097294
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaagggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 26097273  T
Q  228 agtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  26097274 agtgcaccgggttgccctttt 26097294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 243
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889558
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||| | |    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacaccta-a 12889500  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | | ||||||||||| ||| |||||  || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  12889501 acgatgggacccctttccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgcc 12889558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755434
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| || |||||  ||||| |   ||||| | | ||||||||||||||||||||||| |    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtat--gcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||  ||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  2755483 atggtgggagtccttcccaaatcctgcatatgcgcgggagctttagtgca 2755434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 248
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557859
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||  || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atgaaggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctct 25557838  T
Q  228 agtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  25557839 agtgcaccgggttgccctttt 25557859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 248
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892145
Alignment:
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 12892145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886051
Alignment:
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttttaa 250  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttttaa 12886051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240838
Alignment:
Q  96 ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggac 195  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaat--tggtgggac 23240876  T
Q  196 cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23240875 cccttctaggacaatgcgtatgcgggagctttagtgca 23240838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 105 - 243
Target Start/End: Original strand, 17432335 - 17432479
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg------ctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc 198  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||      ||| ||||||||||| || ||||||| ||||      
T  17432335 gactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagacctt 17432434  T
Q  199 ttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| | |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17432435 ttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 17432479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9671196 - 9671083
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||    
T  9671196 aaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcctactttacatcaa-aatggtaggacccctttccgaaccctgcaaatacgggagctttaatgca 9671098  T
Q  234 tcgggttgccttttt 248  Q
    ||||| |||| ||||    
T  9671097 tcgggctgccctttt 9671083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 233
Target Start/End: Original strand, 33138843 - 33138954
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||| ||||||     
T  33138843 ggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacca--aatggtgggacccttttccggaccctgtgtatgca 33138940  T
Q  220 ggagctttagtgca 233  Q
    | ||||||||||||    
T  33138941 gtagctttagtgca 33138954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3116266 - 3116128
Alignment:
Q  102 tgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttc 201  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||| ||||||  |        ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3116266 tgcgactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaatga--------ctgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccccttc 3116175  T
Q  202 ccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  3116174 tcggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgccctttt 3116128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Original strand, 19340843 - 19340954
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  19340843 aagtcctagaaccagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgca-acaatacaccaa-aatgatgggaccccttcctggacccggcgtatgcggaagc 19340940  T
Q  225 tttagtgcatcggg 238  Q
    ||||||||| ||||    
T  19340941 tttagtgcaacggg 19340954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 248
Target Start/End: Original strand, 6808467 - 6808531
Alignment:
Q  184 taatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6808467 taatggtgggaccccttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 6808531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32728335 - 32728171
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||     
T  32728335 agggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaaga 32728236  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||| |||||||| ||||  ||| || || ||| |||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  32728235 ctgtgtacaatatacca--aatagt-ggtccctttcccagaccctacgtatgcgggaactttagtgca 32728171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277199
Alignment:
Q  95 gttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga 194  Q
    |||||| || |||| ||||||||  |||| || || ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| || |||||  |||||||  |||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacaccaa--atggtggga 18277246  T
Q  195 ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    ||||||||   || || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  18277245 ccccttcctagactctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttg 18277199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 230
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtataaaaat-acggtaagcctgcgtacaataccccaa--atggtgggaccccttcccagaccctgcatatgcg 32579532  T
Q  220 ggagctttagt 230  Q
    |||||||||||    
T  32579533 ggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 231
Target Start/End: Original strand, 11849031 - 11849173
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| ||  | |||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | ||| | |||  |||||||||||| |    
T  11849031 ggtaaagttattgtcacgtgactgaaatgt--ttggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgttaaaaacaggataaagttgcccacaatacaccaa-a 11849127  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||    
T  11849128 atggtgggaccccttcccgaactctgcgtatgtgagatctttagtg 11849173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007746
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgac-tgaaa-ggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||| |||||||||||| || |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgt--aaaacagggtcaggctgcgtacaatacacca--a 28007699  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| | ||||||| |||| |||||||    
T  28007700 atgctgggaccccttccctaa-cctccatatgcggaagctctagtgca 28007746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 248
Target Start/End: Original strand, 13267788 - 13267861
Alignment:
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13267788 caatacaccaa--atggtgggaccccttcctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctttt 13267861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751067
Alignment:
Q  143 cttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg-----ggagctttagtgcatcgg 237  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     | |||||||||||| |||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaa-aatggtgagaccccttcacgaaccgtgcgtatgcgtatgagcagctttagtgcaccgg 24751078  T
Q  238 gttgccttttt 248  Q
    |||||| ||||    
T  24751077 gttgccatttt 24751067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 200
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068182
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||| | ||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| | ||| ||||  ||||||||||||| |||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaac---ctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacaccaa-aat 32068169  T
Q  188 ggtgggacccctt 200  Q
    |||||||||||||    
T  32068170 ggtgggacccctt 32068182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 12063423 - 12063512
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa 155  Q
    ||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || ||||||| |||||||    
T  12063423 agggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaaaa 12063512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15865992 - 15865871
Alignment:
Q  109 gaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaac 207  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||| |||||  |||||||| || ||||| ||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||| | ||    
T  15865992 gaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttacgtaaaaaaacagggtaaagctgcgta--atacaccaa--atggtgggaccccttcctggac 15865897  T
Q  208 cctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| |||| || || |||||||    
T  15865896 cctgcgtttgcgtgatctatagtgca 15865871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30786427 - 30786373
Alignment:
Q  194 accccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30786427 accccttcctggaccgtgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccttttt 30786373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 33923006 - 33922936
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaac 137  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  33923006 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaac 33922936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 383837 - 383764
Alignment:
Q  168 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  383837 gcgtacaatacaccaa--attgtgggaccccttctcagaccctgcgtatgcgggagcttcagtccaccgggttgcc 383764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10734965 - 10734909
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  10734965 tggtgggcccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtccaccgggctgcc 10734909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 34850609 - 34850665
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttg 241  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  34850609 aatggtggaaccccttcccgaatcctgcgtatataggagctttagtgcatcgggttg 34850665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 187 - 230
Target Start/End: Original strand, 11395836 - 11395879
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11395836 tggtgggaccccttcccggatcctgcgtatgcgggagctttagt 11395879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855500
Alignment:
Q  82 aactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    |||||||||| | ||||||  || ||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T
Q  181 ca 182  Q
    ||    
T  27855501 ca 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 235
Target Start/End: Original strand, 31990095 - 31990198
Alignment:
Q  131 tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   | |||  ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| || || ||| |||||||  ||| ||||||    
T  31990095 tggaaacaatctcttgtgtaaaaaacggagcaagcttgcatacaatacaccaa-aatggcgggacccctttccaaaacctacgtatgcaagagttttagt 31990193  T
Q  231 gcatc 235  Q
    |||||    
T  31990194 gcatc 31990198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 142
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417504
Alignment:
Q  80 gcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtct 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||| | ||| ||||||||||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacagtct 8417504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20908906 - 20908877
Alignment:
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908906 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 20908877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20923354 - 20923325
Alignment:
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20923354 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 20923325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 118; Significance: 9e-60; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 71 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408600
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 16408600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 70 - 243
Target Start/End: Original strand, 21646924 - 21647097
Alignment:
Q  70 taaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  21646924 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgc 21647023  T
Q  170 gtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21647024 gtacaatataccaataatggtgggaccccttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 21647097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 66 - 249
Target Start/End: Original strand, 16911518 - 16911701
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||| || |||||||    
T  16911518 agggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaagg 16911617  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| |||||    
T  16911618 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgccctttta 16911701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13256575 - 13256398
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  13256575 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgga----gcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 13256480  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13256479 tgcgtacaatacaccaataatagtgggaccccttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 13256398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 5648216 - 5648394
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5648216 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggc 5648314  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  5648315 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgccctttt 5648394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 20224941 - 20225113
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||||||    
T  20224941 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 20225038  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  20225039 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 20225113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 23501750 - 23501925
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||      |||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  23501750 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 23501843  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23501844 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 23501925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 6430803 - 6430630
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  6430803 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaaggc 6430705  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6430704 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcc 6430630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 248
Target Start/End: Original strand, 30639332 - 30639515
Alignment:
Q  62 ctgaagggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggt 161  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  30639332 ctgaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgt-aaaaacagggt 30639430  T
Q  162 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  30639431 aaggctgcgtacaatacacca--aatggtgagaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgccctttt 30639515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 47528706 - 47528529
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  47528706 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 47528609  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  47528608 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 47528529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 48599001 - 48598824
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  48599001 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggc 48598904  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  48598903 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgccctttt 48598824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363134
Alignment:
Q  83 actggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 44363134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 67 - 234
Target Start/End: Original strand, 37494808 - 37494973
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||     
T  37494808 gggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggt 37494907  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcat 234  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37494908 tgcatacaatatacca--aatggtgggacccctttcgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcat 37494973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 11054324 - 11054147
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |    
T  11054324 gggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaagac 11054227  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11054226 tgcgtacaatacacca--aatggcggaaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 11054147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 86 - 248
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567306
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  |    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacca--a 35567243  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  35567244 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 35567306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5306841 - 5306659
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||     
T  5306841 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagggtaaggt 5306743  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatg----cgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  5306742 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgccctttt 5306659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 10660361 - 10660537
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  10660361 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggc 10660460  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-agtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10660461 tgcatacaatacaccaataatggtgagacccctt-ccaagacctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcc 10660537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 10874506 - 10874682
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  10874506 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtatggc 10874605  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt-agtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10874606 tgcatacaatacaccaataatggtgagacccctt-ccaagacctgcgtatgcgggagctttaagtgcatcgggttgcc 10874682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639657
Alignment:
Q  127 gtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctt 20639679  T
Q  227 tagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| ||||||||| ||||    
T  20639678 tagtgcaccgggttgccctttt 20639657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 243
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915959
Alignment:
Q  83 actggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacca 40915900  T
Q  183 ataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
      |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  40915901 --aatggtgggagcccttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgcc 40915959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Original strand, 20405050 - 20405220
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||       ||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||     
T  20405050 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaaga 20405142  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20405143 ttgcgtacaatacactaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcc 20405220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 69 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352579
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaa-----ggtaa 163  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||     |||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  164 g----gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctttt 30352579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 54730206 - 54730373
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaagg-taagg 165  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||    
T  54730206 gggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataagg 54730305  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54730306 ctgcgtataatacaccaataatgatggaaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 54730373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17043549 - 17043413
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatgg 189  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17043549 aagttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacca--aatgg 17043452  T
Q  190 tgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  17043451 tgggaccccttcccagaccctgcatatgctggagcttta 17043413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909284
Alignment:
Q  128 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgc-gggagctt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggggagctt 7909301  T
Q  227 tagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||    
T  7909300 tagtgcatcgggttgcc 7909284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Original strand, 19027813 - 19027969
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19027813 cttgacgcaa-tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 19027911  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  19027912 aatacaccaat--tggtgggacccctttccagactctgcgtatgtgggagctttagtgca 19027969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908650
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaag-gtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  || | | ||| ||||| ||||||||   |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaa- 20908699  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908698 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 20908650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 86 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029078
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacgaa-a 39029122  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccactttccggaccctgcatatgcgggagctttag 39029078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 248
Target Start/End: Original strand, 47443928 - 47444093
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatg----cgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    ||||||||||||| |||||    |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47443928 tggtaaagttgttctcatgtgaccgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacac 47444027  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||    
T  47444028 ca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgccctttt 47444093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 229
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343306
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    || ||| |||||||||||   | |||||||||| | |||||||||    
T  25343262 aagggttggaccccttcctagatcctgcgtatgtgagagctttag 25343306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 90 - 248
Target Start/End: Original strand, 54175043 - 54175201
Alignment:
Q  90 aagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaa-cagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||  | || |||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54175043 aagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa-aatg 54175140  T
Q  189 gtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54175141 gtgggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 54175201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 130 - 248
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629185
Alignment:
Q  130 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctacatatgcgggagctttag 25629166  T
Q  230 tgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  25629167 tgcaccgggttgccctttt 25629185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 231
Target Start/End: Original strand, 14983790 - 14983953
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||  || || |||||||  | || ||||| | ||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  14983790 agggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagg 14983889  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
     ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14983890 ttgcctacaatacacta--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 14983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 125 - 242
Target Start/End: Original strand, 21489102 - 21489218
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21489102 aagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcaccaa-aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 21489200  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgc 242  Q
    ||| |||||  |||||||    
T  21489201 tttcgtgcactgggttgc 21489218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 29208036 - 29207902
Alignment:
Q  105 gactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||  | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29208036 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccg 29207941  T
Q  205 aaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29207940 gaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcc 29207902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30690340 - 30690190
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaa-------ggtaaggctgcgtacaatacac 180  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||       ||||||||||| ||||||||||    
T  30690340 taaagtggttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacac 30690241  T
Q  181 caataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30690240 caat--tggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 30690190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832312
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||| ||||||| ||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--at 9832373  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||| ||||    
T  9832372 ggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgccctttt 9832312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441550
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||  |    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacacca--a 47441592  T
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  47441591 atggttggaccccttcccggaccctgagtaagcaggagcttt 47441550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 51865149 - 51865035
Alignment:
Q  134 aaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51865149 aaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtggggccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgca 51865052  T
Q  234 tcgggttgcctttttaa 250  Q
     |||  |||| ||||||    
T  51865051 ccggactgcccttttaa 51865035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 71 - 227
Target Start/End: Original strand, 54966983 - 54967135
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  54966983 aaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgc- 54967080  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  54967081 tacaatatacca--aatggtgggaccccttcccgtaccctacatatgcgggagcttt 54967135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 243
Target Start/End: Original strand, 20225123 - 20225207
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20225123 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 20225207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 227
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463237
Alignment:
Q  96 ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggac 195  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacca--aatggtgggac 25463205  T
Q  196 cccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25463206 cccttcccggaccctgcatatgcgggagcttt 25463237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39077948 - 39077795
Alignment:
Q  91 agttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggt 190  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  39077948 agttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggttgcgtacaatatacca--aatggt 39077853  T
Q  191 gggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    | |||  ||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  39077852 gagacatctttccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccttttt 39077795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 89 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 49938746 - 49938611
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||    |||||||||||||| ||||    
T  49938746 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-cggggtaaggt---gtacaatacaccaa-aatg 49938652  T
Q  189 gtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttag 229  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  49938651 gtgggaccccttcccataccctgcatatgcgggagctttag 49938611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 55766644 - 55766470
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtca-taggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||   |||| ||||  |||||||||| ||||||||   ||||| |||||||    
T  55766644 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggtaagg 55766546  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  55766545 ctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcc 55766470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487135
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaata 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaatacactaaaa 487195  T
Q  186 -------atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcggg 238  Q
           |||| |||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  487194 tggtgggatggcgggaccccttcccggattctgcgaatgcgggagctttagtgcaccggg 487135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 8473786 - 8473624
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||    |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  || ||||||||||| ||||||||    
T  8473786 cgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtttaa--cagggtaaggctgcatacaatac 8473689  T
Q  179 accaataatggtgggaccccttccc--gaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||  ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8473688 accaa--atggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 8473624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836486
Alignment:
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgccctttt 33836486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 130 - 226
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796911
Alignment:
Q  130 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 226  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctt 49796911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 48327873 - 48327770
Alignment:
Q  137 cagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcg 236  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||| || ||||||||| ||    
T  48327873 cagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtgggacctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccg 48327774  T
Q  237 ggtt 240  Q
    ||||    
T  48327773 ggtt 48327770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 196
Target Start/End: Original strand, 14590795 - 14590922
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  14590795 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 14590894  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 196  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  14590895 tgcatacaatacatca--aatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 243
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589875
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||   |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtcc-aggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  36589806 cagtacaccaa-aatggtgggaccccttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccgggctgcc 36589875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  93 ttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 192  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| || || ||||||||||  ||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacca--aatggtgg 7385531  T
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  7385530 gaccctttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55830899 - 55830735
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcatag-gtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||  | ||| ||||  |||||||||||||||||||  ||| || ||||| |    
T  55830899 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgtgtaaa-cagggtaatg 55830801  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||||||  |  ||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  55830800 ctgcgtacaatacactga--atggtggaaccccatcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgca 55830735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 249
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038189
Alignment:
Q  98 gtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc 197  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaa-aatggtggggcac 7038138  T
Q  198 cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttta 249  Q
    || |||| ||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  7038139 ctacccggaccctgcgtatac-ggagctttagtgcactgggttgccctttta 7038189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9987954 - 9987833
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagc 224  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  9987954 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacca--aatggtgggaccccttccttgaccttgcatatgcgggagc 9987857  T
Q  225 tttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||| |||| |||| |||||||||    
T  9987856 tttaatgcaccgggctgccttttt 9987833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581481
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa-caaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||    ||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||| ||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacaccaa-aa 30581526  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccccttcccggaccctgcatatgtaggagctttagtg 30581481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478811
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||| || ||||||||||     ||||||||||  ||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgtaaaaa-cagggtaaggctg-----aatacaccaa--at 32478851  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  32478850 ggtgggaccccttcccggacccagcgtatgcgggagcttt 32478811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315375
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgta-aaaacaaggtaaggc 17315378  T
Q  167 tgc 169  Q
    |||    
T  17315377 tgc 17315375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 38755973 - 38755912
Alignment:
Q  182 aataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38755973 aataatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 38755912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813243
Alignment:
Q  154 aacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttta 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccctttcccgaacgatgcgtatgcgggagcttta 2813243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496336
Alignment:
Q  74 cttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtac 173  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |    ||||||||||| |||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaacacg--ggtaaggctgcatac 30496394  T
Q  174 aatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||    
T  30496393 aatacaccaa--atggggggactccttcccggaccgtgcttatgatggagctttagtgca 30496336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018808
Alignment:
Q  93 ttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgg 192  Q
    ||||||||| | |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||  | ||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacacca--aatagtgg 41018849  T
Q  193 gaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||  || |||||||||||    
T  41018848 gaccccttcccagaccttgcgtatggaggggctttagtgca 41018808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580860
Alignment:
Q  87 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataa 186  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||   ||| ||||| |||||||   |||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||  ||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagtc-tggaaac---ctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacacca--aa 3580901  T
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagcttt 227  Q
    || | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  3580900 tgctaggaccccttcccggaccctgcatatgtgggagcttt 3580860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 85 - 188
Target Start/End: Original strand, 11579819 - 11579922
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||  |||  |||| |||||||||||||     
T  11579819 tggtaaagttgttgtcatgtgattgaaatggcataggtttaagtcttggaaacaatctattgtataaaaaacaatataaaactgcatacaatacaccaaa 11579918  T
Q  185 aatg 188  Q
    ||||    
T  11579919 aatg 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 11394925 - 11394983
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11394925 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 11394983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 11404652 - 11404710
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11404652 aatggtgggacccctttccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 11404710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484369
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32484307 atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 32484369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580222
Alignment:
Q  88 taaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataat 187  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||| || |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||||||| |||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaa-aat 23580267  T
Q  188 ggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    || | |||||||||  | | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  23580266 ggcgagaccccttcttgga-cctgtgtatgtgggagctttagtgca 23580222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816383
Alignment:
Q  151 aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||| || | |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactccttcctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgccctttt 36816383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40553998 - 40553941
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40553998 atggtgtgaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 40553941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629285
Alignment:
Q  95 gttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtggga 194  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||| || |||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||| || |||| |||||||| | ||| ||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgta-aaaaaacagggtaaggccgcctaca-tacaccaa-attggcggga 32629322  T
Q  195 ccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  32629321 ccccttcccggaccttgcgtatgtgggagttttagtg 32629285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494338
Alignment:
Q  152 aaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtg 231  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccctttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtg 16494338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Original strand, 38786682 - 38786745
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  38786682 aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 38786745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 169
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgc 169  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388307
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  25388249 aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgcc 25388307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47482918 - 47482864
Alignment:
Q  179 accaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47482918 accaaaaatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttggtgca 47482864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 51420537 - 51420646
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtca-taggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgt 171  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  51420537 ccttggcgcaac-ggtgaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggt 51420635  T
Q  172 acaatacacca 182  Q
    |||||||||||    
T  51420636 acaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 144 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894504
Alignment:
Q  144 ttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccg 204  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacaccaa-aatggtgggaccccttcccg 35894504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164224
Alignment:
Q  86 ggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 248
Target Start/End: Original strand, 35532077 - 35532128
Alignment:
Q  197 ccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35532077 ccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 35532128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 50555721 - 50555655
Alignment:
Q  182 aataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  50555721 aataatggtggaaccccttcccggaccctgcgtatgcaggagttttagtgcaccgggctgccctttt 50555655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 235
Target Start/End: Original strand, 8820578 - 8820631
Alignment:
Q  182 aataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8820578 aataatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgagagttttagtgcatc 8820631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 243
Target Start/End: Original strand, 44718641 - 44718698
Alignment:
Q  186 atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  44718641 atggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagcacaccgggttgcc 44718698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313100
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacag 139  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| || ||||| ||||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctgaaaacag 5313100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Original strand, 28494224 - 28494287
Alignment:
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28494224 aatggtgggaccccttcccagatcctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgccttttt 28494287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 236
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357345
Alignment:
Q  85 tggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaat 184  Q
    |||||||||| |||| |||  |||||||||||||  ||| ||||||| ||||||  || |||||||| ||| |  ||||| |  |||||||||||||||     
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaa- 44357293  T
Q  185 aatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcg 236  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||| || ||||| ||  ||||||||||||    
T  44357294 aatggcgggacctcttcccagaccctacgcatgcgagaattttagtgcatcg 44357345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49938594 - 49938490
Alignment:
Q  89 aaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatg 188  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||  | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||    
T  49938594 aaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtccaattcatcaa-aatg 49938497  T
Q  189 gtgggac 195  Q
    |||||||    
T  49938496 gtgggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640429
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaa 155  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| | | |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 4222123 - 4222069
Alignment:
Q  150 aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaa 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  4222123 aaaaaacaaagtaaggctgcgtagaatacacaaat--tggtgggaccccttcccgaa 4222069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 103
Target Start/End: Original strand, 18969697 - 18969734
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatg 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18969697 agggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatg 18969734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10277841 - 10277756
Alignment:
Q  161 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| ||||    
T  10277841 taaggctgcgtacaatacacca--aatggtgaaaccccttcccagaccctgcatatgcgggagttctagtgaaccggattgccctttt 10277756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17079776 - 17079696
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcc 202  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||| ||||    
T  17079776 ggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgcta--aatggtgggaccctttcc 17079696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37038172 - 37038137
Alignment:
Q  198 cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37038172 cttcccgtaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 37038137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 12257764 - 12257688
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgta 150  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||  |||| || |||| |||||||  |||||||||    
T  12257764 ccttgacgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12711553 - 12711463
Alignment:
Q  142 tcttgtgtaaaaaacaagg-taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 233  Q
    ||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |  |||  |||||||||| | ||||||||||    
T  12711553 tcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacacca--aatggcgggaccccttctcagacctagcgtatgcggaaactttagtgca 12711463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 248
Target Start/End: Original strand, 19027986 - 19028047
Alignment:
Q  187 tggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  19027986 tggtgggactccttcccggaccccacttatgcgggagctttagtgcaccgggctgccctttt 19028047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 234
Target Start/End: Original strand, 48202395 - 48202432
Alignment:
Q  197 ccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcat 234  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48202395 ccttaccgaaccccgcgtatgcgggagctttagtgcat 48202432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24945 - 24771
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||     ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24945 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 24851  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  24850 tgcgtacaacacaccaa--atggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgccctttt 24771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 248
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46967
Alignment:
Q  73 ccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgta 172  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  173 caatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  46894 caatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttt 46967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 233
Target Start/End: Original strand, 43674 - 43779
Alignment:
Q  125 aagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggacccc-ttcccgaaccctgcgtatgcgggag 223  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  43674 aagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacacca--aatggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcgggag 43769  T
Q  224 ctttagtgca 233  Q
    || |||||||    
T  43770 ctctagtgca 43779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46794 - 46719
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatc 235  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46794 ggtaaggatgcatacaatataccaa-aatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggagctttaatgcatc 46719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 69 - 243
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59110
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  169 cgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccccttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 59110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Original strand, 30536 - 30713
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||| |||    
T  30536 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtagggc 30633  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  30634 tgcgtacaatacacca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttt 30713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 67 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13201 - 13023
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  13201 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgt-aaaaacaaggtaaggc 13103  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13102 tgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccccttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgccctttt 13023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10227 - 10054
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||     
T  10227 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaaga 10130  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  10129 ctgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgcc 10054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20555 - 20382
Alignment:
Q  66 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaagg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||     
T  20555 agggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaaga 20458  T
Q  166 ctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||    
T  20457 ctgcgtacaatacacca--aatagtgggaccccttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgcc 20382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 129
Target Start/End: Original strand, 8902 - 8964
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  8902 gggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 129
Target Start/End: Original strand, 19230 - 19292
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtc 129  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  19230 gggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 94; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1587
Alignment:
Q  72 accttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgt 171  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||  |||||| | ||||||||| |    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcat 1661  T
Q  172 acaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcctttt 247  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1660 acaatacacca--aatgatgggaccccttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcctttt 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 88; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 80 - 242
Target Start/End: Original strand, 10780 - 10940
Alignment:
Q  80 gcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaataca 179  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||  ||| |||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  10780 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtccaataca 10879  T
Q  180 ccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgc 242  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10880 cca--aatggtgggaccccttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgc 10940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 83; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11260
Alignment:
Q  71 aaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||     
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--caaagtaaggctgct 11189  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  11190 tacaatacaccaa--atggtgggacaccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcc 11260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 210
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4258
Alignment:
Q  69 gtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctg 168  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||| ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  169 cgtacaatacaccaataa-tggtgggaccccttcccgaaccct 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccccttcccggaccct 4258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 131 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 48746 - 48632
Alignment:
Q  131 tggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  48746 tggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagt 48651  T
Q  231 gcatcgggttgccttttta 249  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  48650 gcaccgggttgccctttta 48632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72871
Alignment:
Q  72 accttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaaca-gtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcg 170  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  171 tacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcc 243  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  72941 tacaatacacca--aatggtagtaccccttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcc 72871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 65; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 126 - 233
Target Start/End: Original strand, 3560 - 3665
Alignment:
Q  126 agtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 225  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3560 agtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccga--atgatgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcggcagct 3657  T
Q  226 ttagtgca 233  Q
    ||||||||    
T  3658 ttagtgca 3665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 63; Significance: 6e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 226583 - 226456
Alignment:
Q  68 ggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggc 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | || ||||||| ||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    
T  226583 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 226484  T
Q  167 tgcgtacaatacaccaataatggtgggacc 196  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||||||    
T  226483 tgcatacaatacatca--aatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24219 - 24132
Alignment:
Q  159 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccttttt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  24219 ggtaaggctgcgtacaatacaccaa--atggtgggaccccttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgccctttt 24132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 35184 - 35062
Alignment:
Q  80 gcaactggtaaagttg-ttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgt-aaaaaacaaggtaaggctgcgtacaata 177  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  35184 gcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaata 35085  T
Q  178 caccaataatggtgggaccccttcc 202  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||    
T  35084 cacca--aatggtgggaccctttcc 35062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 138
Target Start/End: Original strand, 83832 - 83903
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaaca 138  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  83832 gggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaaca 83903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 154
Target Start/End: Original strand, 8851 - 8935
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa 154  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |||||||||||   |||||||||||||    
T  8851 gggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 237
Target Start/End: Original strand, 23609 - 23723
Alignment:
Q  120 ggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccccttcccgaaccctgcgtatgcg 219  Q
    |||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||  ||| || ||||| |    
T  23609 ggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaatgtagca--aatggtgggaccccttcccagaccttgagtatgtg 23706  T
Q  220 ggagctttagtgcatcgg 237  Q
    |||||||| |||||||||    
T  23707 ggagcttt-gtgcatcgg 23723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 79 - 154
Target Start/End: Original strand, 43098 - 43173
Alignment:
Q  79 cgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa 154  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43098 cgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 139
Target Start/End: Original strand, 24621 - 24693
Alignment:
Q  67 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcataggtttaagtcctggaaacag 139  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||||||||||| | ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||    
T  24621 gggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacag 24693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1578 times since January 2019
Visitors: 2392